SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_111605875.1 NCBI__GCF_003259225.1:WP_111605875.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4z9nB Abc transporter / periplasmic binding protein from brucella ovis with glutathione bound
60% identity, 93% coverage: 24:340/340 of query aligns to 5:324/324 of 4z9nB

query
sites
4z9nB
A
 
A
A
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
K
A
 
A
K
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
L
Q
 
Q
C
 
C
G
 
G
V
 
V
S
x
N
Q
x
T
G
 
G
V
 
L
P
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
A
N
 
S
A
 
P
D
 
N
S
 
D
N
 
K
G
 
G
E
 
E
W
 
W
S
 
S
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
Y
C
 
C
R
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
P
Q
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
F
 
F
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
x
N
A
|
A
K
 
K
E
 
E
R
|
R
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
I
R
|
R
N
|
N
T
|
T
T
|
T
W
 
W
T
 
T
Y
 
I
T
 
S
R
|
R
D
 
D
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
A
T
 
G
T
 
I
N
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
M
 
M
V
 
I
-
 
N
-
 
S
R
 
K
K
 
K
D
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
N
S
 
S
A
 
A
K
 
L
D
 
Q
L
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
I
C
 
C
T
 
V
E
x
Q
Q
 
A
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
N
M
 
M
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
F
 
F
R
 
R
K
 
A
N
 
N
K
 
K
L
 
M
S
 
E
Y
 
Y
V
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
F
Q
 
E
K
 
K
A
x
I
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
N
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
S
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
R
C
 
C
D
 
D
V
 
A
F
 
Y
T
 
T
T
|
T
D
|
D
K
 
Q
S
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
Y
A
 
G
H
 
V
R
 
R
S
 
L
K
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
D
A
 
D
H
 
H
V
 
V
I
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
I
I
 
I
S
 
S
K
 
K
E
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
G
P
 
L
V
 
T
V
 
V
R
 
R
H
 
Q
G
 
G
D
 
D
N
 
A
Q
 
R
W
 
W
K
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
T
 
R
W
 
W
A
 
T
M
 
H
F
 
N
V
 
A
Q
 
L
V
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
E
E
 
E
M
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
Q
K
 
A
N
 
N
V
 
V
E
 
E
K
 
E
I
 
M
K
 
K
T
 
-
E
 
K
T
 
S
I
 
D
D
 
N
P
 
P
E
 
D
I
 
I
K
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
A
D
 
D
-
 
T
-
 
K
M
 
I
G
 
G
A
 
T
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
K
S
 
D
W
 
W
A
 
V
Y
 
V
D
 
K
I
 
I
I
 
I
A
 
K
K
 
G
V
 
V
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
E
R
 
R
N
 
N
V
 
I
G
 
G
P
 
S
S
 
G
T
 
S
P
 
P
V
 
L
N
 
K
L
 
I
P
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
Q
W
 
W
T
 
N
E
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
P
 
I
P
 
P
V
 
V
R
 
R

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
32% identity, 62% coverage: 25:234/340 of query aligns to 1:200/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
E
V
 
I
K
 
M
A
 
K
K
 
R
G
 
G
F
 
T
I
 
L
Q
 
R
C
 
V
G
 
G
V
 
T
S
x
D
Q
 
A
G
 
D
V
x
Y
P
 
K
G
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
F
A
 
K
D
 
D
S
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
Q
W
 
Y
S
 
T
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
L
C
 
A
R
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
E
F
 
F
T
 
V
P
 
P
L
 
T
S
 
T
A
x
W
K
 
D
E
 
G
R
 
I
F
 
I
T
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
E
 
K
I
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
V
A
 
M
R
x
S
N
x
G
T
x
M
T
|
T
W
 
I
T
 
T
Y
 
P
T
 
E
R
|
R
D
 
K
T
 
K
S
 
K
L
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
P
N
 
Y
F
 
M
Y
 
T
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
F
 
I
M
 
L
V
 
V
R
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
N
G
 
A
-
 
D
-
 
K
V
 
I
E
 
K
S
 
S
A
 
F
K
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
N
-
 
K
-
 
P
G
 
D
A
 
V
T
 
K
V
 
V
C
 
A
T
 
V
E
x
Q
Q
 
L
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
S
E
 
E
L
 
Q
N
 
A
M
 
A
A
 
K
D
 
E
F
 
F
F
 
L
R
 
P
K
 
K
N
 
A
K
 
K
L
 
I
S
 
R
Y
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
T
V
 
F
Q
 
E
K
 
N
A
 
N
D
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
F
S
 
Q
A
 
E
Y
 
V
S
 
V
S
 
S
G
 
G
R
 
R
C
 
A
D
 
D
V
 
A
F
 
M
T
 
V
T
 
T
D
|
D
K
 
-
S
 
S
G
 
P
L
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
R
 
Y
S
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
A
H
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
V
P
 
D
E
 
E
T
 
P
I
 
F
S
 
T
K
 
H
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
F
V
 
A
V
 
I
R
 
R
H
 
K
G
 
G
D
 
D

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
32% identity, 63% coverage: 33:245/340 of query aligns to 3:206/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
K
 
R
G
 
G
F
 
T
I
 
L
Q
 
R
C
 
V
G
 
G
V
 
T
S
x
E
Q
 
A
G
 
T
V
x
F
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
G
N
 
F
A
 
K
D
 
D
S
 
E
N
 
N
G
 
G
E
 
K
W
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
L
C
 
A
R
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
K
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
E
F
 
F
T
 
K
P
 
P
L
 
M
S
 
D
A
x
F
K
 
D
E
 
G
R
 
I
F
 
I
T
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
A
 
I
R
 
A
N
x
G
T
x
M
T
|
T
W
 
I
T
 
T
Y
 
E
T
 
E
R
|
R
D
 
K
T
 
K
S
 
Q
L
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
P
N
 
Y
F
 
F
Y
 
E
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
F
 
I
M
 
V
V
 
V
R
 
K
K
 
K
-
 
G
D
 
N
L
 
D
G
 
S
V
 
I
E
 
K
S
 
S
A
 
L
K
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
T
 
K
V
 
V
C
 
G
T
 
V
E
 
Q
Q
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
T
 
S
E
 
E
L
 
Q
N
 
H
M
 
V
A
 
-
D
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
N
 
-
K
 
K
L
 
K
S
 
V
Y
 
A
V
 
A
P
 
G
V
 
V
V
 
K
V
 
V
Q
 
K
K
 
K
A
 
F
D
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
F
S
 
Q
A
 
E
Y
 
L
S
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
C
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
V
T
 
V
T
 
T
D
|
D
K
 
N
S
 
A
G
 
V
L
 
A
A
 
L
A
 
A
H
 
Y
R
 
V
S
 
K
K
 
Q
L
 
-
S
 
-
D
 
N
P
 
P
S
 
N
A
 
A
H
 
G
V
 
V
-
 
K
I
 
I
L
 
V
P
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
F
S
 
S
K
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
P
 
I
V
 
A
V
 
V
R
 
R
H
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
S
Q
 
E
W
 
L
K
 
L
D
 
E
I
 
K
V
 
I
T
 
N
W
 
K
A
 
A
M
 
L

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
32% identity, 63% coverage: 33:245/340 of query aligns to 3:208/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
K
 
R
G
 
G
F
 
T
I
 
L
Q
 
R
C
 
V
G
 
G
V
 
T
S
x
E
Q
 
A
G
 
T
V
x
F
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
G
N
 
F
A
 
K
D
 
D
S
 
E
N
 
N
G
 
G
E
 
K
W
 
L
S
 
V
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
L
C
 
A
R
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
K
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
E
F
 
F
T
 
K
P
 
P
L
 
M
S
 
D
A
x
F
K
 
D
E
 
G
R
 
I
F
 
I
T
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
A
 
I
R
x
A
N
x
G
T
x
M
T
|
T
W
 
I
T
 
T
Y
 
E
T
 
E
R
|
R
D
 
K
T
 
K
S
 
Q
L
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
P
N
 
Y
F
 
F
Y
 
E
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
F
 
I
M
 
V
V
 
V
R
 
K
K
 
K
-
 
G
D
 
N
L
 
D
G
 
S
V
 
I
E
 
K
S
 
S
A
 
L
K
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
T
 
K
V
 
V
C
 
G
T
 
V
E
x
Q
Q
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
T
 
S
E
 
E
L
 
Q
N
 
H
M
 
V
A
 
-
D
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
K
N
 
K
K
 
V
L
 
A
S
 
K
Y
 
D
V
 
A
P
 
G
V
 
V
V
 
K
V
 
V
Q
 
K
K
 
K
A
 
F
D
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
F
S
 
Q
A
 
E
Y
 
L
S
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
C
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
V
T
 
V
T
 
T
D
|
D
K
 
N
S
 
A
G
 
V
L
 
A
A
 
L
A
 
A
H
 
Y
R
 
V
S
 
K
K
 
Q
L
 
-
S
 
-
D
 
N
P
 
P
S
 
N
A
 
A
H
 
G
V
 
V
-
 
K
I
 
I
L
 
V
P
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
F
S
 
S
K
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
P
 
I
V
 
A
V
 
V
R
 
R
H
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
S
Q
 
E
W
 
L
K
 
L
D
 
E
I
 
K
V
 
I
T
 
N
W
 
K
A
 
A
M
 
L

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 64% coverage: 11:227/340 of query aligns to 28:236/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
T
 
T
A
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
R
A
 
P
T
 
F
I
 
A
S
 
T
T
 
K
G
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
D
A
 
A
T
 
A
L
 
V
D
 
A
D
 
D
V
 
I
K
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
G
F
 
R
I
 
L
Q
 
I
C
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
D
Q
 
I
G
 
G
V
 
S
P
 
N
G
 
L
F
 
F
S
 
S
N
 
F
A
 
R
D
 
D
S
 
P
-
 
I
N
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
I
C
 
A
R
 
G
A
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
D
I
 
I
F
 
F
G
 
G
D
 
V
A
 
P
Q
 
S
K
 
H
V
 
V
K
 
E
F
 
Y
T
 
R
P
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
A
K
 
A
E
 
E
R
|
R
F
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
K
G
 
S
E
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
V
A
 
V
R
 
K
N
x
T
T
 
M
T
x
S
W
 
I
T
 
T
Y
 
C
T
 
E
R
|
R
D
 
R
T
 
K
S
 
L
L
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
N
F
 
F
T
 
S
T
 
T
T
 
V
N
 
Y
F
 
L
Y
 
D
D
 
A
G
 
N
Q
 
Q
G
 
R
F
 
I
M
 
L
V
 
A
R
 
P
K
 
R
D
 
D
L
 
S
G
 
P
V
 
I
E
 
T
S
 
K
A
 
V
K
 
S
D
 
D
L
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
K
T
 
R
V
 
V
C
 
C
T
 
V
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
S
E
 
-
L
 
-
N
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
L
F
 
R
R
 
R
K
 
I
N
 
R
K
 
E
L
 
I
S
 
A
Y
 
P
V
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
Q
 
S
K
 
V
A
 
V
D
 
N
-
x
W
-
 
A
E
 
D
A
 
C
L
 
L
S
 
V
A
 
A
Y
 
L
S
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
C
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
V
T
 
S
T
 
T
D
|
D
K
 
D
S
 
T
G
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
L
R
 
V
S
 
E
K
 
E
L
 
-
S
 
-
D
 
D
P
 
P
S
 
Y
A
 
L
H
 
H
V
 
I
I
 
V
L
 
G
P
 
P
E
 
D
T
 
-
I
 
M
S
 
A
K
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
Y
G
 
G

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 64% coverage: 11:227/340 of query aligns to 28:236/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
T
 
T
A
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
R
A
 
P
T
 
F
I
 
A
S
 
T
T
 
K
G
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
D
A
 
A
T
 
A
L
 
V
D
 
A
D
 
D
V
 
I
K
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
G
F
 
R
I
 
L
Q
 
I
C
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
D
Q
 
I
G
 
G
V
 
S
P
 
N
G
 
L
F
 
F
S
 
S
N
 
F
A
 
R
D
 
D
S
 
P
-
 
I
N
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
I
C
 
A
R
 
G
A
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
D
I
 
I
F
 
F
G
 
G
D
 
V
A
 
P
Q
 
S
K
 
H
V
 
V
K
 
E
F
 
Y
T
 
R
P
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
A
K
 
A
E
 
E
R
|
R
F
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
K
G
 
S
E
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
V
A
 
V
R
 
K
N
x
T
T
 
M
T
x
S
W
 
I
T
 
T
Y
 
C
T
 
E
R
|
R
D
 
R
T
 
K
S
 
L
L
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
N
F
 
F
T
 
S
T
 
T
T
 
V
N
 
Y
F
 
L
Y
 
D
D
 
A
G
 
N
Q
 
Q
G
 
R
F
 
I
M
 
L
V
 
A
R
 
P
K
 
R
D
 
D
L
 
S
G
 
P
V
 
I
E
 
T
S
 
K
A
 
V
K
 
S
D
 
D
L
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
K
T
 
R
V
 
V
C
 
C
T
 
V
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
S
E
 
-
L
 
-
N
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
L
F
 
R
R
 
R
K
 
I
N
 
R
K
 
E
L
 
I
S
 
A
Y
 
P
V
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
Q
 
S
K
 
V
A
 
V
D
 
N
-
x
W
-
 
A
E
 
D
A
 
C
L
 
L
S
 
V
A
 
A
Y
 
L
S
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
C
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
V
T
 
S
T
 
T
D
|
D
K
 
D
S
 
T
G
x
I
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
L
R
 
V
S
 
E
K
 
E
L
 
-
S
 
-
D
 
D
P
 
P
S
 
Y
A
 
L
H
 
H
V
 
I
I
 
V
L
 
G
P
 
P
E
 
D
T
 
-
I
 
M
S
 
A
K
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
Y
G
 
G

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
30% identity, 64% coverage: 11:227/340 of query aligns to 29:237/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
T
 
T
A
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
R
A
 
P
T
 
F
I
 
A
S
 
T
T
 
K
G
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
D
A
 
A
T
 
A
L
 
V
D
 
A
D
 
D
V
 
I
K
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
G
F
 
R
I
 
L
Q
 
I
C
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
D
Q
 
I
G
 
G
V
 
S
P
 
N
G
 
L
F
 
F
S
 
S
N
 
F
A
 
R
D
 
D
S
 
P
-
 
I
N
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
I
C
 
A
R
 
G
A
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
D
I
 
I
F
 
F
G
 
G
D
 
V
A
 
P
Q
 
S
K
 
H
V
 
V
K
 
E
F
 
Y
T
 
R
P
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
A
K
 
A
E
 
E
R
|
R
F
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
K
G
 
S
E
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
V
A
 
V
R
 
K
N
x
T
T
 
M
T
x
S
W
 
I
T
 
T
Y
 
C
T
 
E
R
|
R
D
 
R
T
 
K
S
 
L
L
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
N
F
 
F
T
 
S
T
 
T
T
 
V
N
 
Y
F
 
L
Y
 
D
D
 
A
G
 
N
Q
 
Q
G
 
R
F
 
I
M
 
L
V
 
A
R
 
P
K
 
R
D
 
D
L
 
S
G
 
P
V
 
I
E
 
T
S
 
K
A
 
V
K
 
S
D
 
D
L
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
K
T
 
R
V
 
V
C
 
C
T
 
V
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
S
E
 
-
L
 
-
N
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
L
F
 
R
R
 
R
K
 
I
N
 
R
K
 
E
L
 
I
S
 
A
Y
 
P
V
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
Q
 
S
K
 
V
A
 
V
D
 
N
-
x
W
-
 
A
E
 
D
A
 
C
L
 
L
S
 
V
A
 
A
Y
 
L
S
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
C
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
V
T
 
S
T
 
T
D
|
D
K
 
D
S
 
T
G
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
L
R
 
V
S
 
E
K
 
E
L
 
-
S
 
-
D
 
D
P
 
P
S
 
Y
A
 
L
H
 
H
V
 
I
I
 
V
L
 
G
P
 
P
E
 
D
T
 
-
I
 
M
S
 
A
K
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
Y
G
 
G

1xt8B Crystal structure of cysteine-binding protein from campylobacter jejuni at 2.0 a resolution (see paper)
27% identity, 64% coverage: 26:241/340 of query aligns to 6:213/251 of 1xt8B

query
sites
1xt8B
T
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
K
V
 
I
K
 
K
A
 
Q
K
 
N
G
 
G
F
 
V
I
 
V
Q
 
R
C
 
I
G
 
G
V
 
V
S
x
F
Q
 
G
G
 
D
V
x
K
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
G
N
 
Y
A
 
V
D
 
D
S
 
E
N
 
K
G
 
G
E
 
N
W
 
N
S
 
Q
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
I
D
 
A
A
 
L
C
 
A
R
 
K
A
 
R
T
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
E
I
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
E
Q
 
N
K
 
K
V
 
V
K
 
Q
F
 
F
T
 
V
P
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
A
K
 
A
E
 
N
R
|
R
F
 
V
T
 
E
A
 
F
L
 
L
Q
 
K
S
 
S
G
 
N
E
 
K
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
L
R
 
A
N
|
N
T
 
F
T
|
T
W
 
Q
T
 
T
Y
 
P
T
 
Q
R
|
R
D
 
-
T
 
-
S
 
A
L
 
E
G
 
Q
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
C
T
 
S
T
 
P
N
 
Y
F
 
M
Y
 
K
D
 
V
G
 
A
Q
 
L
G
 
G
F
 
V
M
 
A
V
 
V
R
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
S
G
 
N
V
 
I
E
 
T
S
 
S
A
 
V
K
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
K
G
 
D
A
 
K
T
 
T
V
 
L
C
 
L
T
 
L
E
 
N
Q
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
A
E
 
D
L
 
A
N
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
Y
F
 
F
R
 
T
K
 
Q
N
 
N
K
 
Y
L
 
P
S
 
N
Y
 
I
V
 
K
P
 
T
V
 
L
V
 
K
V
 
Y
Q
 
D
K
 
Q
A
 
N
D
 
T
E
 
E
A
 
T
L
 
F
S
 
A
A
 
A
Y
 
L
S
 
M
S
 
D
G
 
K
R
 
R
C
 
G
D
 
D
V
 
A
F
 
L
T
 
S
T
x
H
D
|
D
K
 
N
S
 
T
G
 
L
L
 
L
A
 
F
A
 
A
H
 
W
R
 
V
S
 
K
K
 
-
L
 
-
S
 
D
D
 
H
P
 
P
S
 
D
A
 
F
H
 
K
V
 
M
I
 
G
L
 
I
P
 
K
E
 
E
T
 
L
I
 
G
S
 
N
K
 
K
E
 
D
P
 
V
L
 
I
G
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
K
H
 
K
G
 
G
D
 
D
N
 
K
Q
 
E
W
 
L
K
 
K
D
 
E
I
 
F
V
 
I

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
28% identity, 69% coverage: 27:260/340 of query aligns to 3:228/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
L
 
L
D
 
E
D
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
S
K
 
K
G
 
G
F
 
Q
I
 
L
Q
 
I
C
 
V
G
 
G
V
 
V
S
x
K
Q
 
N
G
 
D
V
 
V
P
 
P
G
 
H
F
 
Y
S
 
A
N
 
L
A
 
L
D
 
D
-
 
Q
S
 
A
N
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
I
S
 
K
G
 
G
I
 
F
D
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
V
C
 
A
R
 
K
A
 
L
T
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
S
I
 
I
F
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
D
Q
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
K
F
 
L
T
 
V
P
 
A
L
 
V
S
 
N
A
 
A
K
 
K
E
 
T
R
|
R
F
 
G
T
 
P
A
 
L
L
 
L
Q
 
D
S
 
N
G
 
G
E
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
-
L
 
-
A
 
A
R
 
V
N
 
I
T
 
A
T
|
T
W
 
F
T
|
T
Y
 
I
T
 
T
R
 
P
D
 
E
T
x
R
S
 
K
L
 
R
G
 
I
L
 
Y
D
 
N
F
 
F
T
 
S
T
 
E
T
 
P
N
 
Y
F
 
Y
Y
 
Q
D
 
D
G
 
A
Q
 
I
G
 
G
F
 
L
M
 
L
V
 
V
R
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
K
G
 
K
V
 
Y
E
 
K
S
 
S
A
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
M
D
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
I
C
 
G
T
 
V
E
 
A
Q
 
Q
G
 
A
T
x
A
T
|
T
T
 
T
E
 
K
L
 
K
N
 
A
M
 
I
A
 
G
D
 
E
F
 
A
F
 
A
R
 
K
K
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
D
N
 
V
K
 
K
L
 
F
S
 
S
Y
 
E
V
 
F
P
 
P
V
 
-
V
 
-
V
 
-
Q
 
-
K
 
D
A
x
Y
D
 
P
E
 
S
A
 
I
L
 
K
S
 
A
A
 
A
Y
 
L
S
 
D
S
 
A
G
 
K
R
 
R
C
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
F
T
 
S
T
 
V
D
|
D
K
 
K
S
 
S
G
x
I
L
 
L
A
 
L
A
 
G
H
 
Y
R
 
V
S
 
D
K
 
D
L
 
K
S
 
S
D
 
E
P
 
-
S
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
-
I
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
D
T
 
S
I
 
F
S
 
E
K
 
P
E
 
Q
P
 
S
L
 
Y
G
 
G
P
 
I
V
 
V
V
 
T
R
 
K
H
 
K
G
 
D
D
 
D
N
 
P
Q
 
A
W
 
F
K
 
A
D
 
K
I
 
Y
V
 
V
T
 
D
W
 
-
A
 
-
M
 
D
F
 
F
V
 
V
Q
 
K
V
 
E
N
 
H
A
 
K
E
 
N
E
 
E
M
 
I
G
 
D
I
 
A
T
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
K

2vhaA Debp (see paper)
26% identity, 65% coverage: 22:241/340 of query aligns to 3:224/276 of 2vhaA

query
sites
2vhaA
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
K
V
 
I
K
 
A
A
 
K
K
 
N
G
 
G
F
 
V
I
 
I
Q
 
V
C
 
V
G
 
G
V
 
H
S
x
R
Q
 
E
G
 
S
V
 
S
P
 
V
G
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
Y
A
 
Y
D
 
D
S
 
N
N
 
Q
G
 
Q
E
 
K
W
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
S
V
 
Q
D
 
D
A
 
Y
C
 
S
R
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
V
A
 
E
A
 
A
I
 
V
F
 
K
G
 
K
D
 
K
A
 
L
Q
 
N
K
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
Q
V
 
V
K
 
K
F
 
L
T
 
I
P
 
P
L
 
I
S
 
T
A
x
S
K
 
Q
E
 
N
R
|
R
F
 
I
T
 
P
A
 
L
L
 
L
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
E
 
T
I
 
F
D
 
D
I
 
F
L
 
E
A
 
C
R
 
G
N
x
S
T
|
T
T
|
T
W
 
N
T
 
N
Y
 
V
T
 
E
R
|
R
D
 
Q
T
 
K
S
 
Q
L
 
A
G
 
A
L
 
-
D
 
-
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
T
N
 
I
F
 
F
Y
 
V
D
 
V
G
 
G
Q
 
T
G
 
R
F
 
L
M
 
L
V
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
G
L
 
G
G
 
D
V
 
I
E
 
K
S
 
D
A
 
F
K
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
T
 
A
V
 
V
C
 
V
T
 
V
E
 
T
Q
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
S
E
 
E
L
 
V
N
 
L
M
 
L
A
 
N
D
 
K
F
 
L
F
 
N
R
 
E
K
 
E
N
 
Q
K
 
K
L
 
M
S
 
N
Y
 
M
V
 
R
P
 
I
V
 
I
V
 
S
V
 
A
Q
 
K
K
 
D
A
x
H
D
 
G
E
 
D
A
 
S
L
 
F
S
 
R
A
 
T
Y
 
L
S
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
C
 
A
D
 
V
V
 
A
F
 
F
T
 
M
T
x
M
D
|
D
K
 
D
S
 
A
G
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
E
R
 
R
S
 
A
K
 
K
L
 
A
S
 
K
D
 
K
P
 
P
S
 
D
A
 
N
H
 
W
V
 
D
I
 
I
L
 
V
P
 
G
E
 
K
T
 
P
I
 
Q
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
G
P
 
C
V
 
M
V
 
L
R
 
R
H
 
K
G
 
D
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
W
 
F
K
 
K
D
 
K
I
 
L
V
 
M

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
26% identity, 65% coverage: 22:241/340 of query aligns to 4:225/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
K
V
 
I
K
 
A
A
 
K
K
 
N
G
 
G
F
 
V
I
 
I
Q
 
V
C
 
V
G
 
G
V
 
H
S
x
R
Q
 
E
G
 
S
V
 
S
P
 
V
G
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
Y
A
 
Y
D
 
D
S
 
N
N
 
Q
G
 
Q
E
 
K
W
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
S
V
 
Q
D
 
D
A
 
Y
C
 
S
R
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
V
A
 
E
A
 
A
I
 
V
F
 
K
G
 
K
D
 
K
A
 
L
Q
 
N
K
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
Q
V
 
V
K
 
K
F
 
L
T
 
I
P
 
P
L
 
I
S
 
T
A
x
S
K
 
Q
E
 
N
R
|
R
F
 
I
T
 
P
A
 
L
L
 
L
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
E
 
T
I
 
F
D
 
D
I
 
F
L
 
E
A
 
C
R
 
G
N
x
S
T
|
T
T
|
T
W
 
N
T
 
N
Y
 
V
T
 
E
R
|
R
D
 
Q
T
 
K
S
 
Q
L
 
A
G
 
A
L
 
-
D
 
-
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
T
N
 
I
F
 
F
Y
 
V
D
 
V
G
 
G
Q
 
T
G
 
R
F
 
L
M
 
L
V
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
G
L
 
G
G
 
D
V
 
I
E
 
K
S
 
D
A
 
F
K
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
T
 
A
V
 
V
C
 
V
T
 
V
E
 
T
Q
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
S
E
 
E
L
 
V
N
 
L
M
 
L
A
 
N
D
 
K
F
 
L
F
 
N
R
 
E
K
 
E
N
 
Q
K
 
K
L
 
M
S
 
N
Y
 
M
V
 
R
P
 
I
V
 
I
V
 
S
V
 
A
Q
 
K
K
 
D
A
x
H
D
 
G
E
 
D
A
 
S
L
 
F
S
 
R
A
 
T
Y
 
L
S
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
C
 
A
D
 
V
V
 
A
F
 
F
T
 
M
T
x
M
D
|
D
K
 
D
S
 
A
G
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
E
R
 
R
S
 
A
K
 
K
L
 
A
S
 
K
D
 
K
P
 
P
S
 
D
A
 
N
H
 
W
V
 
D
I
 
I
L
 
V
P
 
G
E
 
K
T
 
P
I
 
Q
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
G
P
 
C
V
 
M
V
 
L
R
 
R
H
 
K
G
 
D
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
W
 
F
K
 
K
D
 
K
I
 
L
V
 
M

8ovoA X-ray structure of the sf-iglusnfr-s72a in complex with l-aspartate
26% identity, 65% coverage: 22:241/340 of query aligns to 1:222/503 of 8ovoA

query
sites
8ovoA
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
K
V
 
I
K
 
A
A
 
K
K
 
N
G
 
G
F
 
V
I
 
I
Q
 
V
C
 
V
G
 
G
V
 
H
S
x
R
Q
 
E
G
 
S
V
 
S
P
 
V
G
 
P
F
 
F
S
 
S
N
 
Y
A
 
Y
D
 
D
S
 
N
N
 
Q
G
 
Q
E
 
K
W
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
S
V
 
Q
D
 
D
A
 
Y
C
 
S
R
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
V
A
 
E
A
 
A
I
 
V
F
 
K
G
 
K
D
 
K
A
 
L
Q
 
N
K
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
Q
V
 
V
K
 
K
F
 
L
T
 
I
P
 
P
L
 
I
S
 
T
A
 
A
K
 
Q
E
 
N
R
|
R
F
 
I
T
 
P
A
 
L
L
 
L
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
E
 
T
I
 
F
D
 
D
I
 
F
L
 
E
A
 
C
R
 
G
N
x
S
T
 
T
T
|
T
W
 
N
T
 
N
Y
 
V
T
 
E
R
|
R
D
 
Q
T
 
K
S
 
Q
L
 
A
G
 
A
L
 
-
D
 
-
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
T
N
 
I
F
 
F
Y
 
V
D
 
V
G
 
G
Q
 
T
G
 
R
F
 
L
M
 
L
V
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
G
L
 
G
G
 
D
V
 
I
E
 
K
S
 
D
A
 
F
K
 
A
D
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
D
A
 
K
T
 
A
V
 
V
C
 
V
T
 
V
E
 
T
Q
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
S
E
 
E
L
 
V
N
 
L
M
 
L
A
 
N
D
 
K
F
 
L
F
 
N
R
 
E
K
 
E
N
 
Q
K
 
K
L
 
M
S
 
N
Y
 
M
V
 
R
P
 
I
V
 
I
V
 
S
V
 
A
Q
 
K
K
 
D
A
x
H
D
 
G
E
 
D
A
 
S
L
 
F
S
 
R
A
 
T
Y
 
L
S
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
C
 
A
D
 
V
V
 
A
F
 
F
T
 
M
T
 
M
D
|
D
K
 
D
S
 
V
G
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
E
R
 
R
S
 
A
K
 
K
L
 
A
S
 
K
D
 
K
P
 
P
S
 
D
A
 
N
H
 
W
V
 
E
I
 
I
L
 
V
P
 
G
E
 
K
T
 
P
I
 
Q
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
G
P
 
C
V
 
M
V
 
L
R
 
R
H
 
K
G
 
D
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
W
 
F
K
 
K
D
 
K
I
 
L
V
 
M

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
28% identity, 56% coverage: 57:245/340 of query aligns to 37:217/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
S
 
Q
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
I
C
 
A
R
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
T
A
 
K
A
 
K
I
 
I
F
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
N
Q
 
G
K
 
K
V
 
T
K
 
E
F
 
F
T
 
V
P
 
E
L
 
V
S
 
T
A
x
S
K
 
K
E
 
T
R
|
R
F
 
I
T
 
P
A
 
L
L
 
L
Q
 
K
S
 
N
G
 
G
E
 
N
I
 
I
D
 
D
I
 
A
L
 
I
A
 
I
R
 
-
N
 
-
T
 
A
T
|
T
W
x
M
T
|
T
Y
 
I
T
 
T
R
 
D
D
 
E
T
x
R
S
 
K
L
 
K
G
 
Q
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
V
N
 
Y
F
 
F
Y
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
F
 
L
M
 
L
V
 
V
R
 
K
K
 
K
D
 
G
L
 
S
G
 
Q
V
 
I
E
 
K
S
 
S
A
 
V
K
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
N
G
 
A
A
 
S
-
 
T
T
 
T
V
 
V
C
 
L
T
 
A
E
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
x
S
T
|
T
T
 
S
E
 
A
L
 
A
N
 
N
M
 
I
A
 
-
D
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
R
K
 
Q
N
 
H
K
 
A
L
 
P
S
 
D
Y
 
A
V
 
K
P
 
I
V
 
L
V
 
E
V
 
L
Q
 
E
K
 
N
A
x
Y
D
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
F
S
 
T
A
 
A
Y
 
L
S
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
C
 
G
D
 
D
V
 
A
F
 
M
T
 
T
T
 
T
D
|
D
K
 
N
S
 
A
G
 
I
L
 
L
A
 
L
A
 
G
H
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
I
S
 
A
D
 
D
P
 
E
S
 
N
-
 
P
A
 
E
H
 
Y
V
 
E
I
 
L
L
 
V
P
 
G
E
 
G
T
 
T
I
 
F
S
 
T
K
 
N
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
P
 
I
V
 
A
V
 
I
R
 
N
H
 
K
G
 
G
D
 
Q
N
 
E
Q
 
N
W
 
F
K
 
L
D
 
K
I
 
A
V
 
V
T
 
N
W
 
Q
A
 
A
M
 
L

2yjpA Crystal structure of the solute receptors for l-cysteine of neisseria gonorrhoeae (see paper)
26% identity, 65% coverage: 24:243/340 of query aligns to 1:209/247 of 2yjpA

query
sites
2yjpA
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
V
D
 
A
D
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
E
K
 
K
G
 
G
F
 
V
I
 
I
Q
 
R
C
 
I
G
 
G
V
 
V
S
x
F
Q
 
G
G
 
D
V
x
K
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
G
N
 
Y
A
 
V
D
 
D
S
 
A
N
 
N
G
 
G
E
 
K
W
 
N
S
 
Q
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
I
C
 
A
R
 
K
A
 
D
T
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
D
I
 
L
F
 
L
G
 
G
D
 
S
A
 
P
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
K
 
E
F
 
F
T
 
V
P
 
L
L
 
T
S
x
E
A
 
A
K
 
A
E
 
N
R
|
R
F
 
V
T
 
E
A
 
Y
L
 
V
Q
 
R
S
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
L
R
 
A
N
|
N
T
x
F
T
|
T
W
 
Q
T
 
T
Y
 
P
T
 
E
R
|
R
D
 
-
T
 
-
S
 
A
L
 
E
G
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
A
T
 
D
T
 
P
N
 
Y
F
 
M
Y
 
K
D
 
V
G
 
A
Q
 
L
G
 
G
F
 
V
M
 
V
V
 
S
R
 
P
K
 
K
D
 
N
L
 
K
G
 
P
V
 
I
E
 
T
S
 
D
A
 
M
K
 
A
D
 
Q
L
 
L
D
 
K
G
 
D
A
 
Q
T
 
T
V
 
L
C
 
L
T
 
V
E
 
N
Q
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
A
E
 
D
L
 
A
N
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
F
F
 
F
R
 
T
K
 
K
N
 
S
K
x
H
L
 
P
S
x
E
Y
 
V
V
 
K
P
 
L
V
 
L
V
 
K
V
 
F
Q
x
D
K
 
Q
A
 
N
D
 
T
E
 
E
A
 
T
L
 
F
S
 
D
A
 
A
Y
 
L
S
 
K
S
 
D
G
 
G
R
 
R
C
 
G
D
 
V
V
 
A
F
 
L
T
 
A
T
x
H
D
|
D
K
 
N
S
 
A
G
 
L
L
 
L
A
 
W
A
 
A
H
 
W
R
 
A
S
 
K
K
 
E
L
 
-
S
 
-
D
 
N
P
 
P
S
 
N
A
 
F
H
 
E
V
 
V
I
 
A
L
 
I
P
 
G
E
 
N
T
 
L
I
 
G
S
 
P
K
 
A
E
 
E
P
 
F
L
 
I
G
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
Q
H
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
-
Q
 
-
W
 
-
K
 
A
D
 
D
I
 
L
V
 
L
T
 
N
W
 
W

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
26% identity, 64% coverage: 27:245/340 of query aligns to 3:210/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
L
 
I
D
 
D
D
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
S
K
 
R
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
Q
 
L
C
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
S
Q
 
A
G
 
D
V
x
F
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
E
N
 
F
A
 
V
D
 
D
S
 
E
N
 
N
G
 
G
E
 
N
W
 
I
S
 
V
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
L
C
 
A
R
 
K
A
 
E
T
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
R
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
V
K
 
E
V
 
L
K
 
K
F
 
I
T
 
V
P
 
D
L
 
M
S
 
T
A
x
F
K
 
D
E
 
G
R
 
L
F
 
I
T
 
P
A
 
S
L
 
L
Q
 
L
S
 
T
G
 
K
E
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
I
R
x
S
N
x
G
T
x
M
T
|
T
W
 
I
T
 
T
Y
 
E
T
 
E
R
|
R
D
 
K
T
 
K
S
 
V
L
 
V
G
 
A
L
 
-
D
 
-
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
P
N
 
Y
F
 
F
Y
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
V
F
 
I
M
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
-
 
D
-
 
S
D
 
D
L
 
F
G
 
R
V
 
P
E
 
K
S
 
T
A
 
Y
K
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
V
G
 
G
A
 
K
T
 
T
V
 
V
C
 
A
T
 
V
E
x
Q
Q
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
 
G
E
 
D
L
 
I
N
 
E
M
 
V
A
 
S
D
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
N
 
-
K
 
K
L
 
Y
S
 
D
Y
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
V
V
 
V
-
 
R
V
 
F
Q
 
D
K
 
K
A
 
F
D
 
T
E
 
D
A
 
A
L
 
F
S
 
L
A
 
E
Y
 
L
S
 
K
S
 
R
G
 
G
R
 
R
C
 
A
D
 
D
V
 
A
F
 
V
T
 
V
T
 
L
D
|
D
K
 
S
S
 
A
G
 
T
L
 
A
A
 
R
A
 
A
H
 
F
R
 
V
S
 
A
K
 
K
L
 
N
S
 
P
D
 
D
P
 
-
S
 
-
A
 
-
H
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
S
P
 
S
E
 
G
T
 
V
I
 
L
S
 
S
K
 
S
E
 
E
P
 
Q
L
 
Y
G
 
G
P
 
I
V
 
A
V
 
V
R
 
R
H
 
K
G
 
E
D
 
D
N
 
T
Q
 
D
W
 
L
K
 
L
D
 
E
I
 
F
V
 
I
T
 
N
W
 
S
A
 
V
M
 
L

3vv5A Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l- cysteine (aec) (see paper)
24% identity, 65% coverage: 26:245/340 of query aligns to 5:213/237 of 3vv5A

query
sites
3vv5A
T
 
S
L
 
F
D
 
E
D
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
R
K
 
S
G
 
G
F
 
E
I
 
I
Q
 
R
C
 
I
G
 
G
V
 
T
S
x
E
Q
 
G
G
 
A
V
x
F
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
x
N
N
 
Y
A
 
F
D
 
D
S
 
E
N
 
R
G
 
N
E
 
Q
W
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
F
D
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
L
C
 
G
R
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
R
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
L
K
 
K
V
 
P
K
 
R
F
 
W
T
 
I
P
 
A
L
 
Q
S
 
S
A
x
F
K
 
D
E
 
T
R
 
L
F
 
L
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
Q
 
N
S
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
F
D
 
D
I
 
F
L
 
V
A
 
I
R
 
-
N
 
-
T
x
A
T
x
S
W
 
H
T
x
G
Y
 
I
T
 
T
R
 
E
D
 
E
T
x
R
S
 
A
L
 
R
G
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
N
T
 
P
N
 
H
F
 
Y
Y
 
C
D
 
T
G
 
G
Q
 
-
G
 
G
F
 
V
M
 
I
V
 
V
R
 
S
K
 
R
D
 
K
L
 
G
G
 
G
V
 
P
E
 
R
S
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
A
 
K
T
 
V
V
 
V
C
 
G
T
 
V
E
 
Q
Q
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
x
Y
E
 
-
L
 
M
N
 
E
M
 
A
A
 
A
D
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
N
 
Q
K
 
K
L
 
I
S
 
P
Y
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
E
V
 
V
-
 
R
-
 
T
V
 
Y
Q
 
Q
K
 
R
A
 
D
D
 
P
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
A
 
D
Y
 
L
S
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
I
D
 
D
V
 
T
F
 
W
T
 
I
T
 
T
D
 
D
K
 
R
S
 
F
G
 
-
L
 
V
A
 
A
A
 
K
H
 
E
R
 
A
S
 
I
K
 
K
L
 
E
S
 
R
D
 
K
P
 
L
S
 
E
A
 
N
H
 
T
V
 
L
I
 
Q
L
 
V
P
 
G
E
 
E
T
 
L
I
 
V
S
 
F
K
 
Q
E
 
E
P
 
R
L
 
V
G
 
A
P
 
M
V
 
A
V
 
V
R
 
A
H
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
K
Q
 
S
W
 
L
K
 
L
D
 
D
I
 
A
V
 
L
T
 
N
W
 
R
A
 
A
M
 
L

3vvfA Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine (see paper)
24% identity, 65% coverage: 26:245/340 of query aligns to 9:217/241 of 3vvfA

query
sites
3vvfA
T
 
S
L
 
F
D
 
E
D
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
R
K
 
S
G
 
G
F
 
E
I
 
I
Q
 
R
C
 
I
G
 
G
V
 
T
S
x
E
Q
 
G
G
 
A
V
x
F
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
N
N
 
Y
A
 
F
D
 
D
S
 
E
N
 
R
G
 
N
E
 
Q
W
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
F
D
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
L
C
 
G
R
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
R
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
L
K
 
K
V
 
P
K
 
R
F
 
W
T
 
I
P
 
A
L
 
Q
S
 
S
A
x
F
K
 
D
E
 
T
R
 
L
F
 
L
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
Q
 
N
S
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
F
D
 
D
I
 
F
L
 
V
A
 
I
R
 
-
N
 
-
T
x
A
T
x
S
W
x
H
T
x
G
Y
 
I
T
 
T
R
 
E
D
 
E
T
x
R
S
 
A
L
 
R
G
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
N
T
 
P
N
 
H
F
 
Y
Y
 
C
D
 
T
G
 
G
Q
 
-
G
 
G
F
 
V
M
 
I
V
 
V
R
 
S
K
 
R
D
 
K
L
 
G
G
 
G
V
 
P
E
 
R
S
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
A
 
K
T
 
V
V
 
V
C
 
G
T
 
V
E
x
Q
Q
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
x
Y
E
 
-
L
 
M
N
 
E
M
 
A
A
 
A
D
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
N
 
Q
K
 
K
L
 
I
S
 
P
Y
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
E
V
 
V
-
 
R
-
 
T
V
 
Y
Q
 
Q
K
 
R
A
 
D
D
 
P
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
A
 
D
Y
 
L
S
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
I
D
 
D
V
 
T
F
 
W
T
 
I
T
 
T
D
 
D
K
 
R
S
 
F
G
 
-
L
 
V
A
 
A
A
 
K
H
 
E
R
 
A
S
 
I
K
 
K
L
 
E
S
 
R
D
 
K
P
 
L
S
 
E
A
 
N
H
 
T
V
 
L
I
 
Q
L
 
V
P
 
G
E
 
E
T
 
L
I
 
V
S
 
F
K
 
Q
E
|
E
P
 
R
L
 
V
G
 
A
P
 
M
V
 
A
V
 
V
R
 
A
H
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
K
Q
 
S
W
 
L
K
 
L
D
 
D
I
 
A
V
 
L
T
 
N
W
 
R
A
 
A
M
 
L

3vveA Crystal structure of ttc0807 complexed with lysine (see paper)
24% identity, 65% coverage: 26:245/340 of query aligns to 9:217/241 of 3vveA

query
sites
3vveA
T
 
S
L
 
F
D
 
E
D
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
R
K
 
S
G
 
G
F
 
E
I
 
I
Q
 
R
C
 
I
G
 
G
V
 
T
S
x
E
Q
 
G
G
 
A
V
x
F
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
N
N
 
Y
A
 
F
D
 
D
S
 
E
N
 
R
G
 
N
E
 
Q
W
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
F
D
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
L
C
 
G
R
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
R
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
L
K
 
K
V
 
P
K
 
R
F
 
W
T
 
I
P
 
A
L
 
Q
S
 
S
A
x
F
K
 
D
E
 
T
R
 
L
F
 
L
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
Q
 
N
S
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
F
D
 
D
I
 
F
L
 
V
A
 
I
R
 
-
N
 
-
T
 
A
T
x
S
W
x
H
T
 
G
Y
 
I
T
 
T
R
 
E
D
 
E
T
x
R
S
 
A
L
 
R
G
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
N
T
 
P
N
 
H
F
 
Y
Y
 
C
D
 
T
G
 
G
Q
 
-
G
 
G
F
 
V
M
 
I
V
 
V
R
 
S
K
 
R
D
 
K
L
 
G
G
 
G
V
 
P
E
 
R
S
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
A
 
K
T
 
V
V
 
V
C
 
G
T
 
V
E
x
Q
Q
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
x
Y
E
 
-
L
 
M
N
 
E
M
 
A
A
 
A
D
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
N
 
Q
K
 
K
L
 
I
S
 
P
Y
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
E
V
 
V
-
 
R
-
 
T
V
 
Y
Q
 
Q
K
 
R
A
 
D
D
 
P
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
A
 
D
Y
 
L
S
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
I
D
 
D
V
 
T
F
 
W
T
 
I
T
 
T
D
 
D
K
 
R
S
 
F
G
 
-
L
 
V
A
 
A
A
 
K
H
 
E
R
 
A
S
 
I
K
 
K
L
 
E
S
 
R
D
 
K
P
 
L
S
 
E
A
 
N
H
 
T
V
 
L
I
 
Q
L
 
V
P
 
G
E
 
E
T
 
L
I
 
V
S
 
F
K
 
Q
E
|
E
P
 
R
L
 
V
G
 
A
P
 
M
V
 
A
V
 
V
R
 
A
H
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
K
Q
 
S
W
 
L
K
 
L
D
 
D
I
 
A
V
 
L
T
 
N
W
 
R
A
 
A
M
 
L

3vvdA Crystal structure of ttc0807 complexed with ornithine (see paper)
24% identity, 65% coverage: 26:245/340 of query aligns to 9:217/241 of 3vvdA

query
sites
3vvdA
T
 
S
L
 
F
D
 
E
D
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
R
K
 
S
G
 
G
F
 
E
I
 
I
Q
 
R
C
 
I
G
 
G
V
 
T
S
x
E
Q
 
G
G
 
A
V
 
F
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
N
N
 
Y
A
 
F
D
 
D
S
 
E
N
 
R
G
 
N
E
 
Q
W
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
F
D
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
L
C
 
G
R
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
R
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
L
K
 
K
V
 
P
K
 
R
F
 
W
T
 
I
P
 
A
L
 
Q
S
 
S
A
x
F
K
 
D
E
 
T
R
 
L
F
 
L
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
Q
 
N
S
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
F
D
 
D
I
 
F
L
 
V
A
 
I
R
 
-
N
 
-
T
 
A
T
x
S
W
x
H
T
x
G
Y
 
I
T
 
T
R
 
E
D
 
E
T
x
R
S
 
A
L
 
R
G
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
N
T
 
P
N
 
H
F
 
Y
Y
 
C
D
 
T
G
 
G
Q
 
-
G
 
G
F
 
V
M
 
I
V
 
V
R
 
S
K
 
R
D
 
K
L
 
G
G
 
G
V
 
P
E
 
R
S
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
A
 
K
T
 
V
V
 
V
C
 
G
T
 
V
E
x
Q
Q
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
T
x
Y
E
 
-
L
 
M
N
 
E
M
 
A
A
 
A
D
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
K
 
-
N
 
Q
K
 
K
L
 
I
S
 
P
Y
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
E
V
 
V
-
 
R
-
 
T
V
 
Y
Q
 
Q
K
 
R
A
 
D
D
 
P
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
A
 
D
Y
 
L
S
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
I
D
 
D
V
 
T
F
 
W
T
 
I
T
 
T
D
 
D
K
 
R
S
 
F
G
 
-
L
 
V
A
 
A
A
 
K
H
 
E
R
 
A
S
 
I
K
 
K
L
 
E
S
 
R
D
 
K
P
 
L
S
 
E
A
 
N
H
 
T
V
 
L
I
 
Q
L
 
V
P
 
G
E
 
E
T
 
L
I
 
V
S
 
F
K
 
Q
E
|
E
P
 
R
L
 
V
G
 
A
P
 
M
V
 
A
V
 
V
R
 
A
H
 
K
G
 
G
D
 
N
N
 
K
Q
 
S
W
 
L
K
 
L
D
 
D
I
 
A
V
 
L
T
 
N
W
 
R
A
 
A
M
 
L

4ymxA Crystal structure of the substrate binding protein of an amino acid abc transporter (see paper)
27% identity, 52% coverage: 34:210/340 of query aligns to 1:170/224 of 4ymxA

query
sites
4ymxA
G
 
G
F
 
V
I
 
I
Q
 
V
C
 
M
G
 
G
V
 
T
S
|
S
Q
 
A
G
x
D
V
x
F
P
 
P
G
 
P
F
 
F
S
 
E
N
 
F
A
 
H
D
 
K
S
 
V
N
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
D
E
 
E
W
 
I
S
 
V
G
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
I
C
 
A
R
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
K
I
 
L
F
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
 
V
K
 
K
V
 
L
K
 
E
F
 
I
T
 
K
P
 
D
L
 
M
S
 
D
A
x
F
K
 
K
E
 
G
R
 
L
F
 
I
T
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
E
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
M
L
 
V
A
 
I
R
x
A
N
x
G
T
x
M
T
|
T
W
 
P
T
 
T
Y
 
A
T
 
E
R
|
R
D
 
K
T
 
K
S
 
S
L
 
V
G
 
-
L
 
-
D
 
D
F
 
F
T
 
S
T
 
D
T
 
L
N
 
Y
F
 
Y
Y
 
D
D
 
S
G
 
R
Q
 
Q
G
 
V
F
 
V
M
 
V
V
 
V
R