SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_111606234.1 NCBI__GCF_003259225.1:WP_111606234.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

2y4oB Crystal structure of paak2 in complex with phenylacetyl adenylate (see paper)
67% identity, 97% coverage: 12:436/439 of query aligns to 6:432/432 of 2y4oB

query
sites
2y4oB
L
 
L
D
 
E
P
 
P
M
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
H
 
L
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
W
 
W
T
 
S
V
 
L
R
 
R
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
N
 
N
V
 
V
P
 
P
M
 
H
Y
 
Y
K
 
R
Q
 
R
R
 
T
F
 
F
D
 
D
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
S
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
S
T
 
T
K
 
K
S
 
N
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
V
P
 
P
M
 
R
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
A
N
 
R
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
T
W
 
W
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
K
 
P
G
 
G
D
 
D
M
 
T
L
 
L
H
 
H
N
 
N
A
 
A
Y
x
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
|
F
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
I
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
L
G
 
G
C
 
C
T
 
M
V
 
V
I
 
V
P
 
P
M
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
E
P
 
P
D
 
K
I
 
I
I
 
I
M
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
I
D
 
D
E
 
E
M
 
M
E
 
V
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
M
D
 
D
P
 
P
L
 
A
G
 
E
L
x
S
K
 
S
L
 
L
R
 
K
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
|
G
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
W
T
 
T
Q
 
Q
E
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
N
S
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
T
R
 
R
A
x
V
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
M
 
L
D
 
D
I
|
I
Y
 
Y
G
|
G
L
|
L
S
|
S
E
 
E
I
 
V
M
 
M
G
 
G
P
|
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
M
 
C
E
 
E
C
 
C
A
 
V
E
 
E
S
 
T
Q
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
V
V
 
I
W
 
W
E
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
N
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
E
 
S
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
M
P
 
P
M
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
R
 
R
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
P
T
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
|
R
S
 
S
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
L
I
|
I
I
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
N
|
N
V
 
V
F
 
F
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
E
 
E
E
 
I
V
 
V
I
 
V
K
 
A
V
 
L
N
 
P
H
 
L
F
 
L
S
 
S
E
 
G
S
 
Q
Y
 
F
E
 
Q
I
 
I
H
 
T
L
 
L
Y
 
S
R
 
R
K
 
D
G
 
G
N
 
H
M
 
M
D
 
D
S
 
R
M
 
L
D
 
D
V
 
L
H
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
R
P
 
S
D
 
E
C
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
S
F
 
V
D
 
T
E
 
D
Q
 
G
E
 
E
I
 
R
N
 
A
D
 
A
A
 
L
I
 
A
N
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
H
 
R
V
 
I
K
 
K
S
 
T
S
 
M
V
 
V
G
 
G
I
 
V
S
 
S
I
 
S
S
 
G
V
 
V
K
 
T
L
 
V
R
 
L
E
 
A
I
 
A
G
 
G
S
 
G
I
 
I
-
 
P
A
 
A
R
 
T
S
 
A
E
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
K
 
R
H
 
R
V
 
V
Y
 
I
D
 
D
E
 
R
R
 
R

2y4oA Crystal structure of paak2 in complex with phenylacetyl adenylate (see paper)
67% identity, 97% coverage: 12:436/439 of query aligns to 6:432/433 of 2y4oA

query
sites
2y4oA
L
 
L
D
 
E
P
 
P
M
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
H
 
L
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
W
 
W
T
 
S
V
 
L
R
 
R
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
N
 
N
V
 
V
P
 
P
M
 
H
Y
 
Y
K
 
R
Q
 
R
R
 
T
F
 
F
D
 
D
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
S
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
S
T
 
T
K
 
K
S
 
N
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
V
P
 
P
M
 
R
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
A
N
 
R
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
T
W
 
W
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
K
 
P
G
 
G
D
 
D
M
 
T
L
 
L
H
 
H
N
 
N
A
 
A
Y
x
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
|
F
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
I
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
L
G
 
G
C
 
C
T
 
M
V
 
V
I
 
V
P
 
P
M
 
M
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
E
P
 
P
D
 
K
I
 
I
I
 
I
M
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
I
D
 
D
E
 
E
M
 
M
E
 
V
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
M
D
 
D
P
 
P
L
 
A
G
 
E
L
 
S
K
 
S
L
 
L
R
 
K
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
G
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
W
T
 
T
Q
 
Q
E
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
N
S
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
T
R
 
R
A
 
V
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
M
 
L
D
 
D
I
|
I
Y
 
Y
G
|
G
L
|
L
S
|
S
E
 
E
I
 
V
M
 
M
G
 
G
P
|
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
M
 
C
E
 
E
C
 
C
A
 
V
E
 
E
S
 
T
Q
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
V
V
 
I
W
 
W
E
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
N
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
E
 
S
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
M
P
 
P
M
 
V
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
R
 
R
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
P
T
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
|
R
S
 
S
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
L
I
|
I
I
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
N
|
N
V
 
V
F
 
F
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
E
 
E
E
 
I
V
 
V
I
 
V
K
 
A
V
 
L
N
 
P
H
 
L
F
 
L
S
 
S
E
 
G
S
 
Q
Y
 
F
E
 
Q
I
 
I
H
 
T
L
 
L
Y
 
S
R
 
R
K
 
D
G
 
G
N
 
H
M
 
M
D
 
D
S
 
R
M
 
L
D
 
D
V
 
L
H
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
R
P
 
S
D
 
E
C
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
S
F
 
V
D
 
T
E
 
D
Q
 
G
E
 
E
I
 
R
N
 
A
D
 
A
A
 
L
I
 
A
N
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
H
 
R
V
 
I
K
 
K
S
 
T
S
 
M
V
 
V
G
 
G
I
 
V
S
 
S
I
 
S
S
 
G
V
 
V
K
 
T
L
 
V
R
 
L
E
 
A
I
 
A
G
 
G
S
 
G
I
 
I
-
 
P
A
 
A
R
 
T
S
 
A
E
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
K
 
R
H
 
R
V
 
V
Y
 
I
D
 
D
E
 
R
R
 
R

2y27B Crystal structure of paak1 in complex with atp from burkholderia cenocepacia (see paper)
66% identity, 97% coverage: 9:436/439 of query aligns to 1:427/427 of 2y27B

query
sites
2y27B
P
 
P
D
 
L
Q
 
P
L
 
L
D
 
E
P
 
P
M
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
A
H
 
L
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
W
 
W
T
 
S
V
 
L
R
 
R
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
N
 
H
V
 
S
P
 
P
M
 
V
Y
 
Y
K
 
R
Q
 
R
R
 
K
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
S
K
 
R
L
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
T
T
 
T
K
|
K
S
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
S
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
V
P
 
P
M
 
Q
N
 
D
Q
 
R
V
 
I
V
 
S
R
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
A
N
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
T
W
 
W
A
 
A
N
 
N
I
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
R
 
R
K
 
R
G
 
G
D
 
D
M
 
K
L
 
V
H
 
H
N
 
V
A
 
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
|
F
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
A
G
 
G
C
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
I
P
 
P
M
 
F
S
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
N
 
S
L
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
M
 
I
E
 
E
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
P
L
x
V
G
 
Q
L
x
S
K
 
S
L
|
L
R
 
R
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
G
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
W
T
 
T
Q
 
N
E
 
D
L
 
M
R
 
R
R
 
V
S
 
A
V
 
I
E
 
E
E
 
Q
R
 
R
A
x
M
G
|
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
M
 
V
D
|
D
I
|
I
Y
|
Y
G
|
G
L
|
L
S
|
S
E
 
E
I
 
V
M
 
M
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
M
 
S
E
 
E
C
 
C
A
 
V
E
 
E
S
 
T
Q
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
V
 
I
W
 
W
E
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
N
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
E
 
E
M
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
I
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
R
 
R
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
T
M
 
M
R
 
R
R
 
R
I
 
M
D
 
E
K
 
K
I
|
I
T
 
T
G
 
G
R
|
R
S
 
S
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
M
I
 
I
I
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
F
 
F
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
L
K
 
K
V
x
Q
N
 
R
H
 
A
F
x
L
S
 
A
E
 
P
S
 
H
Y
 
Y
E
 
Q
I
 
I
H
 
V
L
 
L
Y
 
T
R
 
K
K
 
E
G
 
G
N
 
P
M
 
L
D
 
D
S
 
V
M
 
L
D
 
T
V
 
L
H
 
N
V
 
V
E
 
E
L
 
P
R
 
C
P
 
P
D
 
E
C
 
T
A
 
A
G
 
P
F
 
-
D
 
D
E
 
T
Q
 
A
E
 
A
I
 
I
N
 
Q
D
 
V
A
 
A
I
 
K
N
 
Q
E
 
A
L
 
L
R
 
A
H
 
Y
H
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
S
S
 
L
V
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
A
S
 
V
V
 
I
K
 
N
L
 
V
R
 
L
E
 
P
I
 
V
G
 
N
S
 
G
I
 
I
A
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
K
 
R
H
 
R
V
 
V
Y
 
V
D
 
D
E
 
K
R
 
R

2y4nA Paak1 in complex with phenylacetyl adenylate (see paper)
65% identity, 97% coverage: 9:436/439 of query aligns to 1:425/426 of 2y4nA

query
sites
2y4nA
P
 
P
D
 
L
Q
 
P
L
 
L
D
 
E
P
 
P
M
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
T
A
 
A
H
 
L
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
W
 
W
T
 
S
V
 
L
R
 
R
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
N
 
H
V
 
S
P
 
P
M
 
V
Y
 
Y
K
 
R
Q
 
R
R
 
K
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
S
K
 
R
L
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
T
T
 
T
K
 
K
S
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
S
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
V
P
 
P
M
 
Q
N
 
D
Q
 
R
V
 
I
V
 
S
R
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
-
T
 
-
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
A
N
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
T
W
 
W
A
 
A
N
 
N
I
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
R
 
R
K
 
R
G
 
G
D
 
D
M
 
K
L
 
V
H
 
H
N
 
V
A
 
S
Y
|
Y
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
|
F
T
 
T
G
|
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
A
G
 
G
C
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
I
P
 
P
M
 
F
S
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
N
 
S
L
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
M
 
I
E
 
E
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
P
L
x
V
G
 
Q
L
x
S
K
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
|
G
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
W
T
 
T
Q
 
N
E
 
D
L
 
M
R
 
R
R
 
V
S
 
A
V
 
I
E
 
E
E
 
Q
R
 
R
A
 
M
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
M
 
V
D
 
D
I
|
I
Y
|
Y
G
|
G
L
|
L
S
|
S
E
 
E
I
 
V
M
 
M
G
 
G
P
|
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
M
 
S
E
 
E
C
 
C
A
 
V
E
 
E
S
 
T
Q
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
V
 
I
W
 
W
E
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
N
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
E
 
E
M
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
M
 
I
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
R
 
R
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
T
M
 
M
R
 
R
R
 
R
I
 
M
D
 
E
K
 
K
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
|
R
S
 
S
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
M
I
 
I
I
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
F
 
F
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
I
 
L
K
 
K
V
x
Q
N
 
R
H
 
A
F
x
L
S
 
A
E
 
P
S
 
H
Y
 
Y
E
 
Q
I
 
I
H
 
V
L
 
L
Y
 
T
R
 
K
K
 
E
G
 
G
N
 
P
M
 
L
D
 
D
S
 
V
M
 
L
D
 
T
V
 
L
H
 
N
V
 
V
E
 
E
L
 
P
R
 
C
P
 
P
D
 
E
C
 
T
A
 
A
G
 
P
F
 
-
D
 
D
E
 
T
Q
 
A
E
 
A
I
 
I
N
 
Q
D
 
V
A
 
A
I
 
K
N
 
Q
E
 
A
L
 
L
R
 
A
H
 
Y
H
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
S
S
 
L
V
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
A
S
 
V
V
 
I
K
 
N
L
 
V
R
 
L
E
 
P
I
 
V
G
 
N
S
 
G
I
 
I
A
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
K
 
R
H
 
R
V
 
V
Y
 
V
D
 
D
E
 
K
R
 
R

4r1mA Crystal structure of a putative acyl-coa ligase (bt_0428) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 2.48 a resolution
46% identity, 97% coverage: 13:436/439 of query aligns to 9:433/435 of 4r1mA

query
sites
4r1mA
D
 
E
P
 
E
M
 
I
E
 
E
T
 
I
A
 
M
S
 
S
I
 
R
D
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
E
H
 
L
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
W
 
K
T
 
T
V
 
I
R
 
N
H
 
I
A
 
A
Y
 
A
N
 
N
N
 
S
V
 
-
P
 
P
M
 
Y
Y
 
Y
K
 
K
Q
 
E
R
 
V
F
 
F
D
 
S
Q
 
K
L
 
N
G
 
G
L
 
I
H
 
T
P
 
G
D
 
D
D
 
S
I
 
I
K
 
Q
T
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
L
 
I
A
 
R
K
 
K
L
 
I
P
 
P
F
 
F
T
 
T
T
 
T
K
 
K
S
 
S
D
 
D
L
 
M
R
 
R
D
 
A
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
L
F
 
V
A
 
A
T
 
G
P
 
D
M
 
M
N
 
K
Q
 
R
-
 
D
V
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
S
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
K
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
V
Y
 
H
T
 
S
Q
 
Q
N
 
H
D
 
D
I
 
L
D
 
D
N
 
S
W
 
W
A
 
A
N
 
N
I
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
C
I
 
L
R
 
Y
A
 
M
A
 
V
G
 
G
G
 
I
R
 
R
K
 
K
G
 
T
D
 
D
M
 
V
L
 
F
H
 
Q
N
 
N
A
 
S
Y
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
H
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
L
G
 
G
C
 
C
T
 
L
V
 
T
I
 
V
P
 
P
M
 
A
S
 
A
G
 
A
G
 
G
Q
 
N
T
 
S
E
 
K
K
 
R
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
L
 
F
I
 
I
Q
 
S
D
 
D
F
 
F
Q
 
K
P
 
T
D
 
T
I
 
A
I
 
L
M
 
H
V
 
A
T
 
I
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
M
 
A
L
 
I
N
 
R
L
 
L
L
 
A
D
 
E
E
 
V
M
 
F
E
 
Q
K
 
E
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
R
G
 
E
L
 
T
K
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
T
G
 
L
I
 
V
F
 
I
G
 
G
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
H
T
 
T
Q
 
D
E
 
E
L
 
Q
R
 
R
R
 
R
S
 
K
V
 
I
E
 
E
E
 
R
R
 
M
A
 
L
G
 
N
I
 
V
R
 
K
A
 
A
M
 
Y
D
x
N
I
x
S
Y
x
F
G
|
G
L
x
M
S
x
T
E
 
E
I
 
M
M
 
N
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
M
 
F
E
 
E
C
|
C
A
 
Q
E
 
E
S
 
-
Q
 
Q
D
 
N
G
 
G
P
 
M
T
x
H
V
 
F
W
 
W
E
 
E
D
 
D
H
 
C
F
 
Y
Y
 
L
P
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
N
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
P
L
 
V
P
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
L
T
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
D
K
 
R
E
 
E
A
 
M
L
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
R
 
R
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
G
-
 
K
-
x
C
-
 
P
T
x
C
A
 
G
R
 
R
R
 
T
M
 
H
R
 
L
R
 
R
I
 
I
D
 
D
K
 
R
I
 
I
T
 
K
G
 
G
R
|
R
S
 
S
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
F
I
|
I
I
 
I
R
 
K
G
 
G
V
 
V
N
|
N
V
 
I
F
 
F
P
 
P
T
 
M
Q
 
Q
I
 
V
E
 
E
E
 
K
E
 
I
V
 
L
I
 
V
K
 
Q
V
 
F
N
 
P
H
 
E
F
 
L
S
 
G
E
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
L
I
 
I
H
 
T
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
K
 
V
G
 
N
N
 
N
M
 
Q
D
 
D
S
 
E
M
 
M
D
 
I
V
 
V
H
 
E
V
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
-
P
 
S
D
 
D
C
 
L
A
 
S
G
 
T
F
 
D
D
 
N
E
 
Y
Q
 
I
E
 
E
I
 
L
N
 
E
D
 
K
A
 
I
I
 
R
N
 
R
E
 
D
L
 
I
R
 
I
H
 
R
H
 
Q
V
 
L
K
 
K
S
 
D
S
 
E
V
 
I
G
 
L
I
 
V
S
 
T
I
 
P
S
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
R
 
V
E
 
K
I
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
L
A
 
P
R
 
Q
S
 
S
E
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
K
 
V
H
 
R
V
 
V
Y
 
K
D
 
D
E
 
L
R
 
R

4r1lA Crystal structure of a putative acyl-coa ligase (bt_0428) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 2.42 a resolution
45% identity, 95% coverage: 13:427/439 of query aligns to 9:424/433 of 4r1lA

query
sites
4r1lA
D
 
E
P
 
E
M
 
I
E
 
E
T
 
I
A
 
M
S
 
S
I
 
R
D
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
E
H
 
L
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
W
 
K
T
 
T
V
 
I
R
 
N
H
 
I
A
 
A
Y
 
A
N
 
N
N
 
S
V
 
-
P
 
P
M
 
Y
Y
 
Y
K
 
K
Q
 
E
R
 
V
F
 
F
D
 
S
Q
 
K
L
 
N
G
 
G
L
 
I
H
 
T
P
 
G
D
 
D
D
 
S
I
 
I
K
 
Q
T
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
L
 
I
A
 
R
K
 
K
L
 
I
P
 
P
F
 
F
T
 
T
T
 
T
K
 
K
S
 
S
D
 
D
L
 
M
R
 
R
D
 
A
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
L
F
 
V
A
 
A
T
 
G
P
 
D
M
 
M
N
 
K
Q
 
R
-
 
D
V
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
S
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
K
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
V
Y
 
H
T
 
S
Q
 
Q
N
 
H
D
 
D
I
 
L
D
 
D
N
 
S
W
 
W
A
 
A
N
 
N
I
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
C
I
 
L
R
 
Y
A
 
M
A
 
V
G
 
G
G
 
I
R
 
R
K
 
K
G
 
T
D
 
D
M
 
V
L
 
F
H
 
Q
N
 
N
A
x
S
Y
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
H
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
L
G
 
G
C
 
C
T
 
L
V
 
T
I
 
V
P
 
P
M
 
A
S
 
A
G
x
A
G
|
G
Q
x
N
T
x
S
E
 
K
K
 
R
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
L
 
F
I
 
I
Q
 
S
D
 
D
F
 
F
Q
 
K
P
 
T
D
 
T
I
 
A
I
 
L
M
 
H
V
 
A
T
x
I
P
 
P
S
 
S
Y
|
Y
M
 
A
L
 
I
N
 
R
L
 
L
L
 
A
D
 
E
E
 
V
M
 
F
E
 
Q
K
 
E
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
R
G
 
E
L
 
T
K
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
T
G
 
L
I
 
V
F
 
I
G
 
G
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
H
T
 
T
Q
 
D
E
 
E
L
 
Q
R
 
R
R
 
R
S
 
K
V
 
I
E
 
E
E
 
R
R
 
M
A
 
L
G
 
N
I
 
V
R
 
K
A
 
A
M
 
Y
D
 
N
I
x
S
Y
x
F
G
|
G
L
x
M
S
x
T
E
 
E
I
 
M
M
 
N
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
M
 
F
E
 
E
C
|
C
A
 
Q
E
 
E
S
 
-
Q
 
Q
D
 
N
G
 
G
P
 
M
T
x
H
V
 
F
W
 
W
E
 
E
D
 
D
H
 
C
F
 
Y
Y
 
L
P
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
N
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
P
L
 
V
P
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
F
 
L
T
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
D
K
 
R
E
 
E
A
 
M
L
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
R
 
R
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
G
-
 
K
-
x
C
-
 
P
T
x
C
A
 
G
R
 
R
R
 
T
M
 
H
R
 
L
R
 
R
I
 
I
D
 
D
K
 
R
I
 
I
T
 
K
G
 
G
R
|
R
S
 
S
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
F
I
 
I
I
 
I
R
x
K
G
 
G
V
 
V
N
|
N
V
 
I
F
 
F
P
 
P
T
 
M
Q
 
Q
I
 
V
E
 
E
E
 
K
E
 
I
V
 
L
I
 
V
K
 
Q
V
 
F
N
 
P
H
 
E
F
 
L
S
 
G
E
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
L
I
 
I
H
 
T
L
 
L
Y
 
E
R
 
T
K
 
V
G
 
N
N
 
N
M
 
Q
D
 
D
S
 
E
M
 
M
D
 
I
V
 
V
H
 
E
V
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
-
P
 
S
D
 
D
C
 
L
A
 
S
G
 
T
F
 
D
D
 
N
E
 
Y
Q
 
I
E
 
E
I
 
L
N
 
E
D
 
K
A
 
I
I
 
R
N
 
R
E
 
D
L
 
I
R
 
I
H
 
R
H
 
Q
V
 
L
K
 
K
S
 
D
S
 
E
V
 
I
G
 
L
I
 
V
S
x
T
I
 
P
S
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
R
 
V
E
 
K
I
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
L
A
 
P
R
 
Q
S
 
S
E
 
E
G
 
A

6he0A Crystal structure of 2-hydroxyisobutyryl-coa ligase (hcl) in complex with 2-hib-amp and coa in the thioesterfication state (see paper)
30% identity, 96% coverage: 16:436/439 of query aligns to 30:464/477 of 6he0A

query
sites
6he0A
E
 
E
T
 
T
A
 
M
S
 
P
I
 
A
D
 
A
E
 
E
L
 
R
R
 
D
A
 
K
H
 
A
Q
 
I
L
 
L
E
 
G
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
W
 
Q
T
 
V
V
 
C
R
 
Q
H
 
Y
A
 
A
Y
 
W
N
 
E
N
 
H
V
 
A
P
 
P
M
 
F
Y
 
Y
K
 
R
Q
 
R
R
 
K
F
 
W
D
 
E
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
F
H
 
Q
P
 
P
D
 
S
D
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
S
L
 
L
D
 
E
D
 
D
L
 
F
-
 
E
A
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
P
F
 
V
T
 
V
T
 
K
K
 
K
S
 
T
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
E
N
 
S
Y
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
D
F
 
Y
-
 
V
A
 
C
T
 
V
P
 
P
M
 
N
N
 
S
Q
 
E
V
 
I
V
 
F
R
 
H
L
 
V
H
 
H
A
 
G
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
P
T
 
T
V
 
A
V
 
F
G
 
G
Y
 
I
T
 
G
Q
 
R
N
 
A
D
 
D
I
 
W
D
 
R
N
 
A
W
 
I
A
 
A
N
 
N
I
 
A
V
 
H
A
 
A
R
 
R
S
 
I
I
 
M
R
 
W
A
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
I
R
 
R
K
 
P
G
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
V
H
 
C
N
 
V
A
 
A
Y
 
A
G
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
F
x
Y
T
 
M
G
 
G
G
 
S
L
 
W
G
 
G
A
 
A
H
 
L
Y
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
L
G
 
R
C
 
A
T
 
K
V
 
A
I
 
F
P
 
P
M
 
F
S
 
G
G
x
A
G
|
G
Q
 
A
T
x
P
E
 
G
K
 
M
Q
x
S
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
-
 
W
-
 
L
-
 
D
D
 
T
F
 
M
Q
 
K
P
 
P
D
 
A
I
 
A
I
 
F
M
x
Y
V
x
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
Y
|
Y
M
 
A
L
 
I
N
x
H
L
 
L
L
 
A
D
 
E
E
 
V
M
 
A
E
 
R
K
 
E
Q
 
E
G
 
K
I
 
L
D
 
N
P
 
P
L
 
R
G
 
N
L
 
F
K
 
G
L
 
L
R
 
K
L
 
C
G
 
L
I
 
F
F
 
F
G
x
S
A
x
G
E
|
E
P
|
P
W
 
G
T
 
A
Q
 
S
-
 
V
-
 
P
E
 
G
L
 
V
R
 
K
R
 
D
S
 
R
V
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
A
A
 
Y
G
 
G
I
 
A
R
 
K
A
 
V
M
 
Y
D
 
D
I
x
C
Y
x
G
G
x
S
L
x
M
S
x
A
E
|
E
I
 
-
M
 
M
G
 
S
P
 
P
G
 
F
V
 
M
A
 
N
M
 
V
E
 
A
C
 
G
A
 
T
E
 
E
-
 
Q
S
 
S
Q
 
N
D
 
D
G
 
G
P
 
M
T
 
L
V
 
C
W
 
W
E
 
Q
D
 
D
H
 
I
F
 
I
Y
 
Y
P
 
T
E
 
E
I
 
V
V
 
C
D
 
D
P
 
P
N
 
A
T
 
N
G
 
M
E
 
R
V
 
R
L
 
V
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
E
 
Q
M
 
R
G
 
G
E
 
T
L
 
P
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
S
 
H
L
 
L
S
 
E
K
 
R
E
 
T
A
 
S
L
 
Q
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
Y
 
L
R
 
L
T
 
S
R
 
G
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
L
L
 
W
L
 
T
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
N
P
 
P
G
 
C
T
 
G
A
 
R
R
 
T
R
 
Y
M
 
P
R
 
R
R
 
L
I
 
P
D
 
Q
K
 
G
I
|
I
T
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
F
I
 
T
I
 
I
R
|
R
G
|
G
V
 
E
N
|
N
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
T
 
S
Q
 
E
I
 
I
E
 
D
E
 
A
E
 
A
V
 
L
I
 
N
K
 
Q
V
 
M
N
 
S
H
 
G
F
 
Y
S
 
G
E
 
G
S
 
E
Y
 
H
E
 
R
I
 
I
H
 
V
L
 
I
Y
 
T
R
 
R
K
 
E
G
 
S
N
 
A
M
|
M
D
 
D
S
 
E
M
 
L
D
 
L
V
 
L
H
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
P
R
 
S
P
 
E
D
 
S
C
 
V
A
 
H
G
 
A
F
 
A
D
 
G
E
 
A
Q
 
A
E
 
A
I
 
L
N
 
E
D
 
T
A
 
F
I
 
R
N
 
T
E
 
E
L
 
A
R
 
S
H
 
H
H
 
R
V
 
V
K
 
Q
S
 
T
S
 
V
V
 
L
G
 
G
I
x
V
S
x
R
I
 
A
S
 
K
V
 
V
K
 
E
L
 
L
R
 
V
E
 
A
I
 
P
G
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
T
E
 
D
G
 
-
K
 
K
A
 
A
K
 
R
H
 
R
V
 
V
Y
 
I
D
 
D
E
 
D
R
 
R

6hdyA Crystal structure of 2-hydroxyisobutyryl-coa ligase (hcl) in the postadenylation state in complex with s3-hb-amp (see paper)
30% identity, 93% coverage: 28:436/439 of query aligns to 42:461/474 of 6hdyA

query
sites
6hdyA
L
 
L
E
 
G
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
W
 
Q
T
 
V
V
 
C
R
 
Q
H
 
Y
A
 
A
Y
 
W
N
 
E
N
 
H
V
 
A
P
 
P
M
 
F
Y
 
Y
K
 
R
Q
 
R
R
 
K
F
 
W
D
 
E
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
F
H
 
Q
P
 
P
D
 
S
D
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
S
L
 
L
D
 
E
D
 
D
L
 
F
-
 
E
A
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
P
F
 
V
T
 
V
T
 
K
K
 
K
S
 
T
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
E
N
 
S
Y
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
D
F
 
Y
-
 
V
A
 
C
T
 
V
P
 
P
M
 
N
N
 
S
Q
 
E
V
 
I
V
 
F
R
 
H
L
 
V
H
 
H
A
 
G
S
 
T
S
 
S
G
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
R
P
 
P
T
 
T
V
 
A
V
 
F
G
 
G
Y
 
I
T
 
G
Q
 
R
N
 
A
D
 
D
I
 
W
D
 
R
N
 
A
W
 
I
A
 
A
N
 
N
I
 
A
V
 
H
A
 
A
R
 
R
S
 
I
I
 
M
R
 
W
A
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
I
R
 
R
K
 
P
G
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
V
H
 
C
N
 
V
A
 
A
Y
 
A
G
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
F
x
Y
T
 
M
G
|
G
G
 
S
L
 
W
G
 
G
A
 
A
H
 
L
Y
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
L
G
 
R
C
 
A
T
 
K
V
 
A
I
 
F
P
 
P
M
 
F
S
 
G
G
 
A
G
 
G
Q
 
A
T
 
P
E
 
G
K
 
M
Q
 
S
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
-
 
W
-
 
L
-
 
D
D
 
T
F
 
M
Q
 
K
P
 
P
D
 
A
I
 
A
I
 
F
M
 
Y
V
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
M
 
A
L
 
I
N
 
H
L
 
L
L
 
A
D
 
E
E
 
V
M
 
A
E
 
R
K
 
E
Q
 
E
G
 
K
I
 
L
D
 
N
P
 
P
L
 
R
G
 
N
L
 
F
K
 
G
L
 
L
R
 
K
L
 
C
G
 
L
I
 
F
F
 
F
G
x
S
A
x
G
E
|
E
P
|
P
W
 
G
T
 
A
Q
 
S
-
 
V
-
 
P
E
 
G
L
 
V
R
 
K
R
 
D
S
 
R
V
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
A
A
 
Y
G
 
G
I
 
A
R
 
K
A
 
V
M
 
Y
D
 
D
I
x
C
Y
x
G
G
x
S
L
x
M
S
x
A
E
 
E
I
 
-
M
 
M
G
 
S
P
 
P
G
x
F
V
 
M
A
 
N
M
 
V
E
 
A
C
 
G
A
 
T
E
 
E
-
 
Q
S
 
S
Q
 
N
D
 
D
G
 
G
P
 
M
T
 
L
V
 
C
W
 
W
E
 
Q
D
 
D
H
 
I
F
 
I
Y
 
Y
P
 
T
E
 
E
I
 
V
V
 
C
D
 
D
P
 
P
N
 
A
T
 
N
G
 
M
E
 
R
V
 
R
L
 
V
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
E
 
Q
M
 
R
G
 
G
E
 
T
L
 
P
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
S
 
H
L
 
L
S
 
E
K
 
R
E
 
T
A
 
S
L
 
Q
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
Y
 
L
R
 
L
T
 
S
R
 
G
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
L
L
 
W
L
 
T
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
N
P
 
P
G
 
C
T
 
G
A
 
R
R
 
T
R
 
Y
M
 
P
R
 
R
R
 
L
I
 
P
D
 
Q
K
 
G
I
|
I
T
 
F
G
 
G
R
|
R
S
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
F
I
 
T
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
T
 
S
Q
 
E
I
 
I
E
 
D
E
 
A
E
 
A
V
 
L
I
 
N
K
 
Q
V
 
M
N
 
S
H
 
G
F
 
Y
S
 
G
E
 
G
S
 
E
Y
 
H
E
 
R
I
 
I
H
 
V
L
 
I
Y
 
T
R
 
R
K
 
E
G
 
S
N
 
A
M
 
M
D
 
D
S
 
E
M
 
L
D
 
L
V
 
L
H
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
P
R
 
S
P
 
E
D
 
S
C
 
V
A
 
H
G
 
A
F
 
A
D
 
G
E
 
A
Q
 
A
E
 
A
I
 
L
N
 
E
D
 
T
A
 
F
I
 
R
N
 
T
E
 
E
L
 
A
R
 
S
H
 
H
H
 
R
V
 
V
K
 
Q
S
 
T
S
 
V
V
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
R
I
 
A
S
 
K
V
 
V
K
 
E
L
 
L
R
 
V
E
 
A
I
 
P
G
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
T
E
 
D
G
 
F
K
|
K
A
 
A
K
 
R
H
 
R
V
 
V
Y
 
I
D
 
D
E
 
D
R
 
R

6hdxA Crystal structure of 2-hydroxyisobutyryl-coa ligase (hcl) in the postadenylation state in complex with r3-hib-amp (see paper)
30% identity, 93% coverage: 28:436/439 of query aligns to 42:461/474 of 6hdxA

query
sites
6hdxA
L
 
L
E
 
G
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
W
 
Q
T
 
V
V
 
C
R
 
Q
H
 
Y
A
 
A
Y
 
W
N
 
E
N
 
H
V
 
A
P
 
P
M
 
F
Y
 
Y
K
 
R
Q
 
R
R
 
K
F
 
W
D
 
E
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
F
H
 
Q
P
 
P
D
 
S
D
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
S
L
 
L
D
 
E
D
 
D
L
 
F
-
 
E
A
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
P
F
 
V
T
 
V
T
 
K
K
 
K
S
 
T
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
E
N
 
S
Y
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
D
F
 
Y
-
 
V
A
 
C
T
 
V
P
 
P
M
 
N
N
 
S
Q
 
E
V
 
I
V
 
F
R
 
H
L
 
V
H
 
H
A
 
G
S
 
T
S
 
S
G
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
R
P
 
P
T
 
T
V
 
A
V
 
F
G
 
G
Y
 
I
T
 
G
Q
 
R
N
 
A
D
 
D
I
 
W
D
 
R
N
 
A
W
 
I
A
 
A
N
 
N
I
 
A
V
 
H
A
 
A
R
 
R
S
 
I
I
 
M
R
 
W
A
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
I
R
 
R
K
 
P
G
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
V
H
 
C
N
 
V
A
 
A
Y
 
A
G
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
F
x
Y
T
 
M
G
|
G
G
 
S
L
 
W
G
 
G
A
 
A
H
 
L
Y
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
L
G
 
R
C
 
A
T
 
K
V
 
A
I
 
F
P
 
P
M
 
F
S
 
G
G
 
A
G
 
G
Q
 
A
T
 
P
E
 
G
K
 
M
Q
 
S
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
-
 
W
-
 
L
-
 
D
D
 
T
F
 
M
Q
 
K
P
 
P
D
 
A
I
 
A
I
 
F
M
 
Y
V
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
M
 
A
L
 
I
N
 
H
L
 
L
L
 
A
D
 
E
E
 
V
M
 
A
E
 
R
K
 
E
Q
 
E
G
 
K
I
 
L
D
 
N
P
 
P
L
 
R
G
 
N
L
 
F
K
 
G
L
 
L
R
 
K
L
 
C
G
 
L
I
 
F
F
 
F
G
x
S
A
x
G
E
|
E
P
|
P
W
 
G
T
 
A
Q
 
S
-
 
V
-
 
P
E
 
G
L
 
V
R
 
K
R
 
D
S
 
R
V
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
A
A
 
Y
G
 
G
I
 
A
R
 
K
A
 
V
M
 
Y
D
 
D
I
x
C
Y
x
G
G
x
S
L
 
M
S
x
A
E
 
E
I
 
-
M
 
M
G
 
S
P
 
P
G
x
F
V
 
M
A
 
N
M
 
V
E
 
A
C
 
G
A
 
T
E
 
E
-
 
Q
S
 
S
Q
 
N
D
 
D
G
 
G
P
 
M
T
 
L
V
 
C
W
 
W
E
 
Q
D
 
D
H
 
I
F
 
I
Y
 
Y
P
 
T
E
 
E
I
 
V
V
 
C
D
 
D
P
 
P
N
 
A
T
 
N
G
 
M
E
 
R
V
 
R
L
 
V
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
E
 
Q
M
 
R
G
 
G
E
 
T
L
 
P
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
S
 
H
L
 
L
S
 
E
K
 
R
E
 
T
A
 
S
L
 
Q
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
Y
 
L
R
 
L
T
 
S
R
 
G
D
|
D
L
 
L
T
 
T
R
 
L
L
 
W
L
 
T
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
N
P
 
P
G
 
C
T
 
G
A
 
R
R
 
T
R
 
Y
M
 
P
R
 
R
R
 
L
I
 
P
D
 
Q
K
 
G
I
|
I
T
 
F
G
 
G
R
|
R
S
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
M
M
 
F
I
 
T
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
T
 
S
Q
 
E
I
 
I
E
 
D
E
 
A
E
 
A
V
 
L
I
 
N
K
 
Q
V
 
M
N
 
S
H
 
G
F
 
Y
S
 
G
E
 
G
S
 
E
Y
 
H
E
 
R
I
 
I
H
 
V
L
 
I
Y
 
T
R
 
R
K
 
E
G
 
S
N
 
A
M
 
M
D
 
D
S
 
E
M
 
L
D
 
L
V
 
L
H
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
P
R
 
S
P
 
E
D
 
S
C
 
V
A
 
H
G
 
A
F
 
A
D
 
G
E
 
A
Q
 
A
E
 
A
I
 
L
N
 
E
D
 
T
A
 
F
I
 
R
N
 
T
E
 
E
L
 
A
R
 
S
H
 
H
H
 
R
V
 
V
K
 
Q
S
 
T
S
 
V
V
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
R
I
 
A
S
 
K
V
 
V
K
 
E
L
 
L
R
 
V
E
 
A
I
 
P
G
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
T
E
 
D
G
 
F
K
|
K
A
 
A
K
 
R
H
 
R
V
 
V
Y
 
I
D
 
D
E
 
D
R
 
R

6sixB Paak family amp-ligase with anp (see paper)
27% identity, 98% coverage: 5:435/439 of query aligns to 3:426/437 of 6sixB

query
sites
6sixB
S
 
S
R
 
R
F
 
S
N
 
R
P
 
P
D
 
E
Q
 
L
L
 
G
D
 
D
P
 
W
M
 
S
E
 
S
T
 
P
A
 
A
S
 
E
I
 
L
D
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
Q
A
 
R
H
 
S
Q
 
Q
L
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
V
Q
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
L
R
 
A
H
 
Q
A
 
A
Y
 
L
N
 
R
N
 
S
V
 
-
P
 
P
M
 
F
Y
 
Y
K
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
Y
D
 
R
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
L
 
T
H
 
T
P
 
P
D
 
P
D
 
-
I
 
-
K
 
R
T
 
T
L
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
G
L
 
V
P
 
E
F
 
V
T
 
T
T
 
A
K
 
K
S
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
M
F
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
G
M
x
R
N
x
E
Q
 
H
V
 
L
V
 
A
R
 
T
L
 
Y
H
 
H
A
 
E
S
|
S
S
|
S
G
 
G
T
 
T
T
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
N
 
E
D
 
D
I
 
-
D
 
-
N
 
-
W
 
W
A
 
T
N
 
D
I
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
R
S
 
F
I
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
W
G
 
T
G
 
G
-
 
I
R
 
H
K
x
P
G
 
S
D
 
D
M
 
T
L
 
F
H
 
L
N
 
V
A
 
R
Y
 
T
G
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
 
V
T
 
I
G
 
T
G
 
G
L
 
H
G
 
L
A
 
A
H
 
Q
Y
 
A
G
 
A
A
 
G
E
 
R
R
 
L
L
 
R
G
 
G
C
 
A
T
|
T
V
 
V
I
 
V
P
 
P
M
 
G
S
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
L
G
 
A
G
 
T
Q
 
P
T
 
L
E
 
S
K
 
R
Q
 
M
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
L
Q
 
K
D
 
T
F
 
L
Q
 
D
P
 
V
D
 
T
I
 
L
I
 
T
M
 
W
V
 
C
T
 
N
P
 
P
S
 
T
Y
 
E
M
 
I
L
 
T
N
 
M
L
 
L
L
 
A
D
 
A
E
 
A
M
 
A
E
 
K
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
D
 
R
P
 
P
L
 
D
G
 
Q
-
 
D
-
 
F
L
 
P
K
 
H
L
 
L
R
 
R
L
 
A
G
 
M
I
 
F
F
 
T
G
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
L
T
 
T
Q
 
E
E
 
V
L
 
R
R
 
R
R
 
R
S
 
R
V
 
L
E
 
S
E
 
E
-
 
I
R
 
W
A
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
P
A
 
V
M
 
V
D
 
E
I
x
E
Y
|
Y
G
|
G
L
x
S
S
x
T
E
|
E
I
 
T
M
 
G
G
 
-
P
 
-
G
 
T
V
 
I
A
 
A
M
 
G
E
 
Q
C
|
C
A
 
P
E
 
E
S
 
G
Q
 
R
D
 
M
G
 
-
P
 
-
T
x
H
V
 
L
W
 
W
E
 
A
D
 
D
H
 
R
F
 
A
Y
 
I
P
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
-
V
 
T
L
 
L
P
 
S
D
 
E
G
 
A
E
 
G
M
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
M
V
 
V
F
 
V
T
 
T
S
 
P
L
 
L
S
 
Y
K
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
L
R
 
R
Y
 
Y
R
 
N
T
 
L
R
 
A
D
|
D
L
 
D
T
 
V
R
 
E
L
 
V
L
 
S
-
 
T
-
 
D
P
 
P
G
x
C
T
 
G
A
x
C
R
 
G
R
 
W
M
 
L
R
 
L
R
 
P
I
 
T
D
 
V
K
 
T
I
x
V
T
 
L
G
 
G
R
|
R
S
 
A
D
 
G
D
 
T
M
 
G
M
 
H
I
 
R
I
 
I
R
 
G
G
 
P
V
 
A
N
 
T
V
 
V
F
 
T
P
 
Q
T
 
Q
Q
 
R
I
 
L
E
 
E
E
 
E
E
 
L
V
 
V
I
 
F
K
 
S
V
 
L
N
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
P
E
 
A
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
I
 
V
H
 
M
L
 
F
Y
 
W
R
 
R
-
 
A
K
 
K
G
 
A
N
 
H
M
 
P
D
 
D
S
 
V
M
 
L
D
 
E
V
 
L
H
 
E
V
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
-
P
 
-
D
 
-
C
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
D
 
P
E
 
E
Q
 
P
E
 
V
I
 
R
N
 
Q
D
 
R
A
 
A
I
 
V
N
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
G
H
 
A
H
 
A
V
 
L
K
 
D
S
 
R
S
 
E
V
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
P
I
 
H
S
 
R
V
 
I
K
 
T
L
 
G
R
 
L
E
 
A
I
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
L
A
 
V
R
 
P
S
 
A
E
 
E
G
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
R
H
 
Y
V
 
L
Y
 
F
D
 
A
E
 
E

6siyA Paak family amp-ligase with amp and substrate (see paper)
26% identity, 97% coverage: 8:435/439 of query aligns to 2:422/433 of 6siyA

query
sites
6siyA
N
 
R
P
 
P
D
 
E
Q
 
L
L
 
G
D
 
D
P
 
W
M
 
S
E
 
S
T
 
P
A
 
A
S
 
E
I
 
L
D
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
Q
A
 
R
H
 
S
Q
 
Q
L
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
V
Q
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
L
R
 
A
H
 
Q
A
 
A
Y
 
L
N
 
R
N
 
S
V
 
-
P
 
P
M
 
F
Y
 
Y
K
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
Y
D
 
R
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
L
 
T
H
 
T
P
 
P
D
 
P
D
 
-
I
 
-
K
 
R
T
 
T
L
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
G
L
 
V
P
 
E
F
 
V
T
 
T
T
 
A
K
 
K
S
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
M
F
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
G
M
x
R
N
x
E
Q
 
H
V
x
L
V
 
A
R
 
T
L
 
Y
H
 
H
A
 
E
S
 
S
S
|
S
G
 
G
T
 
T
T
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
N
 
E
D
 
D
I
 
-
D
 
-
N
 
-
W
 
W
A
 
T
N
 
D
I
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
R
S
 
F
I
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
W
G
 
T
G
 
G
-
 
I
R
 
H
K
x
P
G
 
S
D
 
D
M
 
T
L
 
F
H
 
L
N
 
V
A
 
R
Y
x
T
G
x
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
 
V
T
 
I
G
x
T
G
 
G
L
 
H
G
x
L
A
 
A
H
 
Q
Y
 
A
G
 
A
A
 
G
E
 
R
R
 
L
L
 
R
G
|
G
C
x
A
T
|
T
V
 
V
I
 
V
P
 
P
M
 
G
S
 
D
-
 
A
-
x
R
-
 
S
-
 
L
G
 
A
G
 
T
Q
 
P
T
 
L
E
 
S
K
 
R
Q
 
M
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
L
Q
 
K
D
 
T
F
 
L
Q
 
D
P
 
V
D
 
T
I
 
L
I
 
T
M
 
W
V
 
C
T
x
N
P
 
P
S
 
T
Y
 
E
M
 
I
L
 
T
N
 
M
L
 
L
L
 
A
D
 
A
E
 
A
M
 
A
E
 
K
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
D
 
R
P
 
P
L
 
D
G
 
Q
-
 
D
-
 
F
L
 
P
K
 
H
L
 
L
R
 
R
L
 
A
G
 
M
I
 
F
F
 
T
G
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
L
T
 
T
Q
 
E
E
 
V
L
 
R
R
 
R
R
 
R
S
 
R
V
 
L
E
 
S
E
 
E
-
 
I
R
 
W
A
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
P
A
 
V
M
 
V
D
 
E
I
x
E
Y
|
Y
G
|
G
L
x
S
S
x
T
E
 
E
I
 
T
M
 
G
G
 
-
P
 
-
G
 
T
V
 
I
A
 
A
M
 
G
E
 
Q
C
 
C
A
 
P
E
 
E
S
 
G
Q
 
R
D
 
M
G
 
-
P
 
-
T
 
H
V
 
L
W
 
W
E
 
A
D
 
D
H
 
R
F
 
A
Y
 
I
P
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
-
V
 
T
L
 
L
P
 
S
D
 
E
G
 
A
E
 
G
M
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
M
V
 
V
F
 
V
T
 
T
S
 
P
L
 
L
S
 
Y
K
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
L
R
 
R
Y
 
Y
R
 
N
T
 
L
R
 
A
D
|
D
L
 
D
T
 
V
R
 
E
L
 
V
L
 
S
-
 
T
-
 
D
P
 
P
G
 
C
T
 
G
A
 
C
R
 
G
R
 
W
M
 
L
R
 
L
R
 
P
I
 
T
D
 
V
K
 
T
I
x
V
T
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
A
D
 
G
D
 
T
M
 
G
M
 
H
I
 
R
I
 
I
R
 
G
G
 
P
V
 
A
N
 
T
V
 
V
F
 
T
P
 
Q
T
 
Q
Q
 
R
I
 
L
E
 
E
E
 
E
E
 
L
V
 
V
I
 
F
K
 
S
V
 
L
N
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
P
E
 
A
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
I
 
V
H
 
M
L
 
F
Y
 
W
R
 
R
-
 
A
K
 
K
G
 
A
N
 
H
M
 
P
D
 
D
S
 
V
M
 
L
D
 
E
V
 
L
H
 
E
V
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
-
P
 
-
D
 
-
C
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
D
 
P
E
 
E
Q
 
P
E
 
V
I
 
R
N
 
Q
D
 
R
A
 
A
I
 
V
N
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
G
H
 
A
H
 
A
V
 
L
K
 
D
S
 
R
S
 
E
V
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
P
I
 
H
S
 
R
V
 
I
K
 
T
L
 
G
R
 
L
E
 
A
I
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
L
A
 
V
R
 
P
S
 
A
E
 
E
G
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
R
H
 
Y
V
 
L
Y
 
F
D
 
A
E
 
E

6siwA Paak family amp-ligase with amp (see paper)
26% identity, 97% coverage: 8:435/439 of query aligns to 1:421/432 of 6siwA

query
sites
6siwA
N
 
R
P
 
P
D
 
E
Q
 
L
L
 
G
D
 
D
P
 
W
M
 
S
E
 
S
T
 
P
A
 
A
S
 
E
I
 
L
D
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
Q
A
 
R
H
 
S
Q
 
Q
L
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
V
Q
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
L
R
 
A
H
 
Q
A
 
A
Y
 
L
N
 
R
N
 
S
V
 
-
P
 
P
M
 
F
Y
 
Y
K
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
Y
D
 
R
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
L
 
T
H
 
T
P
 
P
D
 
P
D
 
-
I
 
-
K
 
R
T
 
T
L
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
G
L
 
V
P
 
E
F
 
V
T
 
T
T
 
A
K
 
K
S
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
N
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
M
 
M
F
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
G
M
 
R
N
x
E
Q
 
H
V
x
L
V
 
A
R
 
T
L
 
Y
H
 
H
A
 
E
S
|
S
S
|
S
G
 
G
T
 
T
T
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
N
 
E
D
 
D
I
 
-
D
 
-
N
 
-
W
 
W
A
 
T
N
 
D
I
 
L
V
 
A
A
 
E
R
 
R
S
 
F
I
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
W
G
 
T
G
 
G
-
 
I
R
 
H
K
x
P
G
 
S
D
 
D
M
 
T
L
 
F
H
 
L
N
 
V
A
 
R
Y
 
T
G
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
 
V
T
 
I
G
 
T
G
 
G
L
 
H
G
 
L
A
 
A
H
 
Q
Y
 
A
G
 
A
A
 
G
E
 
R
R
 
L
L
 
R
G
|
G
C
 
A
T
|
T
V
 
V
I
 
V
P
 
P
M
 
G
S
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
L
G
 
A
G
 
T
Q
 
P
T
 
L
E
 
S
K
 
R
Q
 
M
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
L
Q
 
K
D
 
T
F
 
L
Q
 
D
P
 
V
D
 
T
I
 
L
I
 
T
M
 
W
V
 
C
T
 
N
P
 
P
S
 
T
Y
 
E
M
 
I
L
 
T
N
 
M
L
 
L
L
 
A
D
 
A
E
 
A
M
 
A
E
 
K
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
D
 
R
P
 
P
L
 
D
G
 
Q
-
 
D
-
 
F
L
 
P
K
 
H
L
 
L
R
 
R
L
 
A
G
 
M
I
 
F
F
 
T
G
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
W
 
L
T
 
T
Q
 
E
E
 
V
L
 
R
R
 
R
R
 
R
S
 
R
V
 
L
E
 
S
E
 
E
-
 
I
R
 
W
A
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
P
A
 
V
M
 
V
D
 
E
I
x
E
Y
|
Y
G
|
G
L
x
S
S
x
T
E
|
E
I
 
T
M
 
G
G
 
-
P
 
-
G
 
T
V
 
I
A
 
A
M
 
G
E
 
Q
C
|
C
A
 
P
E
 
E
S
 
G
Q
 
R
D
 
M
G
 
-
P
 
-
T
x
H
V
 
L
W
 
W
E
 
A
D
 
D
H
 
R
F
 
A
Y
 
I
P
 
F
E
 
E
I
 
V
V
 
Y
D
 
D
P
 
P
N
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
-
V
 
T
L
 
L
P
 
S
D
 
E
G
 
A
E
 
G
M
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
M
V
 
V
F
 
V
T
 
T
S
 
P
L
 
L
S
 
Y
K
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
L
R
 
R
Y
 
Y
R
 
N
T
 
L
R
 
A
D
|
D
L
 
D
T
 
V
R
 
E
L
 
V
L
 
S
-
 
T
-
 
D
P
 
P
G
x
C
T
 
G
A
x
C
R
 
G
R
 
W
M
 
L
R
 
L
R
 
P
I
 
T
D
 
V
K
 
T
I
x
V
T
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
A
D
 
G
D
 
T
M
 
G
M
 
H
I
 
R
I
 
I
R
 
G
G
 
P
V
 
A
N
 
T
V
 
V
F
 
T
P
 
Q
T
 
Q
Q
 
R
I
 
L
E
 
E
E
 
E
E
 
L
V
 
V
I
 
F
K
 
S
V
 
L
N
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
P
E
 
A
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
I
 
V
H
 
M
L
 
F
Y
 
W
R
 
R
-
 
A
K
 
K
G
 
A
N
 
H
M
 
P
D
 
D
S
 
V
M
 
L
D
 
E
V
 
L
H
 
E
V
 
F
E
 
E
L
 
A
R
 
-
P
 
-
D
 
-
C
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
D
 
P
E
 
E
Q
 
P
E
 
V
I
 
R
N
 
Q
D
 
R
A
 
A
I
 
V
N
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
G
H
 
A
H
 
A
V
 
L
K
 
D
S
 
R
S
 
E
V
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
P
I
 
H
S
 
R
V
 
I
K
 
T
L
 
G
R
 
L
E
 
A
I
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
L
A
 
V
R
 
P
S
 
A
E
 
E
G
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
L
K
 
K
A
 
A
K
 
R
H
 
Y
V
 
L
Y
 
F
D
 
A
E
 
E

P40806 Polyketide synthase PksJ; PKS from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
24% identity, 75% coverage: 98:428/439 of query aligns to 195:555/5043 of P40806

query
sites
P40806
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
T
P
 
P
T
 
K
V
 
A
V
 
V
G
 
M
Y
 
L
T
 
N
Q
 
H
N
 
R
D
 
N
I
 
I
D
 
-
N
 
-
W
 
-
A
 
M
N
 
S
I
 
M
V
 
V
A
 
K
R
 
G
S
 
I
I
 
I
R
 
Q
A
 
M
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
R
 
T
K
 
R
G
 
E
D
 
D
M
 
I
L
 
T
H
 
F
N
 
N
A
 
W
Y
 
M
G
 
P
Y
 
F
G
 
D
L
 
-
F
 
H
T
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
M
-
 
L
H
 
H
Y
 
L
G
 
R
A
 
D
E
 
V
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
C
 
C
T
 
Q
V
 
E
I
 
I
P
 
N
M
 
V
S
 
S
G
 
S
G
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
M
Q
 
E
T
 
P
E
 
L
K
 
K
Q
 
W
V
 
L
R
 
D
L
 
W
I
 
I
Q
 
D
D
 
H
F
 
Y
Q
 
R
P
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
T
M
 
W
V
 
A
T
 
-
P
 
P
S
 
N
Y
 
F
M
 
A
L
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
V
D
 
T
E
 
D
M
 
F
E
 
A
K
 
E
Q
 
E
G
 
I
I
 
K
D
 
D
P
 
K
L
 
K
G
 
W
-
 
D
-
 
L
L
 
S
K
 
S
L
 
M
R
 
R
L
 
Y
G
 
M
I
 
L
F
 
N
G
 
G
A
 
G
E
 
E
P
 
A
W
 
M
T
 
V
Q
 
A
E
 
K
L
 
V
-
 
G
R
 
R
R
 
R
S
 
I
V
 
L
E
 
E
-
 
L
-
 
L
E
 
E
R
 
P
A
 
H
G
 
G
I
 
L
R
 
P
A
 
A
M
 
D
D
 
A
I
 
I
-
 
R
-
 
P
-
 
A
Y
 
W
G
 
G
L
 
M
S
 
S
E
 
E
I
 
-
M
 
T
G
 
S
P
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
I
M
 
F
E
 
S
C
 
H
A
 
E
E
 
F
S
 
T
Q
 
R
D
 
A
G
 
G
P
 
-
T
 
T
V
 
S
W
 
D
E
 
D
D
 
D
H
 
H
F
 
F
Y
 
V
P
 
-
E
 
E
I
 
I
V
 
G
D
 
S
P
 
P
N
 
I
T
 
P
G
 
G
-
 
F
-
 
S
-
 
M
-
 
R
-
 
I
-
 
V
-
 
N
-
 
D
-
 
H
-
 
N
E
 
E
V
 
L
L
 
V
P
 
E
D
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
I
G
 
G
E
 
R
L
 
F
V
 
Q
F
 
V
T
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
S
K
 
V
E
 
T
A
 
S
L
 
G
P
 
Y
M
 
Y
I
 
Q
R
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
W
Y
 
F
R
 
E
T
 
T
R
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
G
R
 
F
L
 
L
L
 
R
P
 
N
G
 
G
T
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
R
M
 
L
R
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
K
 
T
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
T
D
 
K
D
 
D
M
 
A
M
 
I
I
 
I
I
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
Y
F
 
Y
P
 
S
T
 
H
Q
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
S
E
 
A
V
 
V
I
 
E
K
 
E
V
 
L
N
 
P
H
 
E
F
 
I
S
 
E
E
 
T
S
 
S
Y
 
Y
E
 
T
I
 
A
H
 
A
L
 
C
Y
 
A
R
 
V
K
 
R
G
 
L
N
 
G
M
 
Q
D
 
N
S
 
S
M
 
T
D
 
D
V
 
Q
H
 
L
V
 
A
E
 
I
L
 
F
R
 
F
P
 
V
D
 
T
C
 
S
A
 
A
G
 
K
F
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
E
E
 
Q
I
 
M
N
 
S
D
 
Q
A
 
L
I
 
L
N
 
R
E
 
N
L
 
I
R
 
Q
H
 
S
H
 
H
V
 
V
K
 
S
S
 
Q
S
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
I
 
L
S
 
P
V
 
V
K
 
Q
L
 
K
R
 
E
E
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
K
-
 
T
-
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
K
I
 
I
A
 
Q
R
 
R
S
 
T
E
 
Q
G
 
L
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_111606234.1 NCBI__GCF_003259225.1:WP_111606234.1
MDIRSRFNPDQLDPMETASIDELRAHQLERLQWTVRHAYNNVPMYKQRFDQLGLHPDDIK
TLDDLAKLPFTTKSDLRDNYPYGMFATPMNQVVRLHASSGTTGKPTVVGYTQNDIDNWAN
IVARSIRAAGGRKGDMLHNAYGYGLFTGGLGAHYGAERLGCTVIPMSGGQTEKQVRLIQD
FQPDIIMVTPSYMLNLLDEMEKQGIDPLGLKLRLGIFGAEPWTQELRRSVEERAGIRAMD
IYGLSEIMGPGVAMECAESQDGPTVWEDHFYPEIVDPNTGEVLPDGEMGELVFTSLSKEA
LPMIRYRTRDLTRLLPGTARRMRRIDKITGRSDDMMIIRGVNVFPTQIEEEVIKVNHFSE
SYEIHLYRKGNMDSMDVHVELRPDCAGFDEQEINDAINELRHHVKSSVGISISVKLREIG
SIARSEGKAKHVYDERISV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory