SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_111606971.1 NCBI__GCF_003259225.1:WP_111606971.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7borA Structure of pseudomonas aeruginosa coa-bound odaa (see paper)
43% identity, 96% coverage: 10:248/250 of query aligns to 9:247/247 of 7borA

query
sites
7borA
E
 
E
S
 
T
G
 
G
I
 
L
Q
 
L
V
 
T
L
 
L
C
 
R
L
 
L
N
 
D
R
 
R
T
 
Q
D
|
D
K
|
K
K
 
K
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
T
L
 
R
D
 
A
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
S
A
 
R
L
 
M
T
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
L
S
 
E
A
 
A
E
 
Q
H
 
A
N
 
D
D
 
T
Q
 
A
V
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
V
M
 
L
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
L
 
G
G
 
D
G
 
A
D
 
C
F
 
F
S
 
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
D
 
D
I
|
I
N
 
L
E
 
D
F
|
F
V
 
L
H
 
E
I
 
-
A
 
-
Q
 
Q
T
 
P
P
 
P
E
 
S
K
 
L
M
 
R
E
x
D
A
 
S
I
 
P
M
 
V
A
x
G
-
 
R
F
 
F
L
 
M
Q
 
S
V
 
A
L
 
L
S
 
L
C
 
E
Y
 
F
K
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
P
A
 
A
V
|
V
G
 
G
V
x
I
G
 
G
A
 
T
T
|
T
M
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
H
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
F
A
 
V
S
 
G
R
 
R
E
 
N
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
F
 
M
P
 
P
F
|
F
V
 
V
Q
 
N
L
|
L
G
 
G
L
|
L
V
 
T
P
|
P
E
|
E
A
 
F
A
 
G
S
 
S
S
 
S
H
 
L
L
 
I
L
 
L
P
 
P
Q
 
R
L
 
M
V
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
A
E
 
E
I
 
L
L
 
L
V
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
V
 
D
V
 
F
S
 
S
A
 
G
T
 
E
Q
 
Q
A
 
A
H
 
A
E
 
A
M
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
N
H
 
A
L
 
A
C
 
L
E
 
E
E
 
D
G
 
G
-
 
A
E
 
T
A
 
V
Y
 
L
K
 
E
L
 
H
A
 
A
L
 
R
F
 
D
Y
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
I
 
F
A
 
L
A
 
H
L
 
L
P
 
A
V
 
P
E
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
E
S
 
S
K
 
K
D
 
R
L
 
L
L
 
M
K
 
K
F
 
A
R
 
P
G
 
F
Q
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
L
Q
 
R
M
 
R
A
 
V
L
 
I
M
x
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
D
I
 
I
F
 
F
K
 
S
D
 
T
R
 
R
L
|
L
R
 
R
S
 
S
T
 
P
E
 
E
A
 
A
H
 
I
Q
 
E
A
 
A
F
 
L
T
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
M
S
 
H
R
|
R

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
37% identity, 83% coverage: 4:210/250 of query aligns to 4:211/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
F
 
M
V
 
I
T
 
L
E
 
K
S
 
E
M
 
R
E
 
Q
S
 
D
G
 
G
I
 
V
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
C
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
 
E
K
 
K
K
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
T
 
T
L
 
G
D
 
E
M
 
L
Y
 
L
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
Y
N
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
S
 
E
A
 
G
E
 
E
H
 
E
N
 
D
D
 
R
Q
 
E
V
 
V
K
 
R
V
 
A
T
 
L
M
 
L
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
x
R
D
 
A
F
 
F
S
 
S
S
x
A
G
 
G
N
x
Q
D
|
D
I
x
L
N
 
T
E
 
E
F
|
F
V
 
G
H
 
D
I
 
-
A
 
-
Q
 
R
T
 
K
P
 
P
E
 
D
K
x
Y
M
 
E
E
 
A
A
 
H
I
x
L
M
 
R
A
 
R
F
 
Y
-
x
N
-
 
R
-
 
V
L
 
V
Q
 
E
V
 
A
L
 
L
S
 
S
C
 
G
Y
 
L
K
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
G
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
x
A
G
 
G
A
 
M
T
x
S
M
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
W
C
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
A
R
 
V
E
 
G
A
 
A
R
 
S
L
 
F
Q
 
T
F
 
T
P
x
A
F
|
F
V
 
V
Q
 
R
L
 
I
G
 
G
L
|
L
V
 
V
P
|
P
E
x
D
A
 
S
A
 
G
S
 
L
S
 
S
H
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
L
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
Q
E
 
E
I
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
P
V
 
R
V
 
L
S
 
S
A
 
A
T
 
E
Q
 
E
A
 
A
H
 
L
E
 
A
M
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
H
 
R
L
 
V
C
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
E
E
 
K
A
 
L
Y
 
M
K
 
E
L
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
S
Y
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
G
P
 
P
V
 
T
E
 
R
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
K
D
 
K
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
38% identity, 83% coverage: 4:210/250 of query aligns to 1:199/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
F
 
M
V
 
I
T
 
L
E
 
K
S
 
E
M
 
R
E
 
Q
S
 
D
G
 
G
I
 
V
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
C
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
 
E
K
 
K
K
x
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
T
 
T
L
 
G
D
 
E
M
 
L
Y
 
L
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
Y
N
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
S
 
E
A
 
G
E
 
E
H
 
E
N
 
D
D
 
R
Q
 
E
V
 
V
K
 
R
V
 
A
T
 
L
M
 
L
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
R
D
 
A
F
 
F
S
 
S
S
x
A
G
 
G
N
x
Q
D
|
D
I
x
L
N
 
T
E
 
E
F
 
-
V
 
A
H
 
H
I
x
L
A
 
R
Q
 
R
T
x
Y
P
x
N
E
 
R
K
 
V
M
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
-
M
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
S
C
 
G
Y
 
L
K
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
G
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
V
A
 
A
V
x
A
G
|
G
V
x
A
G
 
G
A
 
M
T
x
S
M
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
W
C
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
A
R
 
V
E
 
G
A
 
A
R
 
S
L
 
F
Q
 
T
F
 
T
P
x
A
F
|
F
V
 
V
Q
 
R
L
x
I
G
 
G
L
|
L
V
 
V
P
|
P
E
x
N
A
 
S
A
 
G
S
 
L
S
 
S
H
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
L
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
Q
E
 
E
I
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
P
V
 
R
V
 
L
S
 
S
A
 
A
T
 
E
Q
 
E
A
 
A
H
 
L
E
 
A
M
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
H
 
R
L
 
V
C
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
E
E
 
K
A
 
L
Y
 
M
K
 
E
L
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
S
Y
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
G
P
 
P
V
 
T
E
 
R
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
K
D
 
K
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9P4U9 Enoyl-CoA hydratase AKT3-1; AF-toxin biosynthesis protein 3-1; EC 4.2.1.17 from Alternaria alternata (Alternaria rot fungus) (Torula alternata) (see paper)
33% identity, 96% coverage: 12:250/250 of query aligns to 24:265/296 of Q9P4U9

query
sites
Q9P4U9
G
 
G
I
 
I
Q
 
A
V
 
V
L
 
I
C
 
V
L
 
L
N
 
A
R
 
R
T
 
S
D
 
Q
K
 
S
K
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
P
M
 
M
Y
 
L
Q
 
T
A
 
D
L
 
M
T
 
V
N
 
Q
A
 
L
L
 
L
R
 
S
S
 
A
A
 
M
E
 
D
H
 
A
N
 
D
D
 
D
Q
 
S
V
 
V
K
 
K
V
 
C
T
 
I
M
 
V
L
 
F
Y
 
T
G
 
G
L
 
E
G
 
G
G
 
P
D
 
F
F
 
F
S
 
C
S
 
S
G
 
G
N
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
T
E
 
E
-
 
G
F
 
F
V
 
G
H
 
E
I
 
I
A
 
G
Q
 
K
T
 
T
P
 
R
E
 
D
K
 
T
M
 
H
E
 
R
A
 
D
I
 
A
M
 
G
A
 
G
-
 
K
-
 
L
F
 
A
L
 
L
Q
 
A
V
 
I
L
 
H
S
 
N
C
 
C
Y
 
-
K
 
R
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
I
E
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
I
T
 
T
M
 
M
L
 
T
L
 
L
H
 
P
C
 
M
D
 
S
L
 
I
V
 
R
L
 
I
A
 
A
S
 
A
R
 
K
E
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
I
Q
 
S
F
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
Q
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
H
 
F
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
Y
Q
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
H
I
 
L
L
 
F
V
 
T
L
 
T
G
 
G
E
 
A
V
 
L
V
 
Y
S
 
P
A
 
A
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
H
 
-
E
 
E
M
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
L
N
 
H
H
 
G
L
 
L
C
 
F
E
 
S
E
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
A
G
 
S
E
 
S
A
 
T
Y
 
L
K
 
P
L
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
E
Y
 
V
A
 
A
Q
 
R
R
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
V
L
 
N
P
 
A
V
 
S
E
 
Q
-
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
Y
L
 
L
S
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
L
 
V
K
 
-
F
 
Y
R
 
R
G
 
S
Q
 
P
D
 
R
D
 
S
V
 
P
Q
 
E
M
 
Q
A
 
A
L
 
H
M
 
L
R
 
L
E
 
E
G
 
S
R
 
A
I
 
A
F
 
L
K
 
Y
D
 
T
R
 
R
L
 
Y
R
 
Q
S
 
S
T
 
R
E
 
D
A
 
F
H
 
E
Q
 
E
A
 
G
F
 
V
T
 
K
A
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
E
R
 
K
N
 
R
K
 
K

Sites not aligning to the query:

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
32% identity, 83% coverage: 10:216/250 of query aligns to 11:218/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
E
 
E
S
 
G
G
 
N
I
 
L
Q
 
F
V
 
W
L
 
I
C
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
 
D
K
|
K
K
x
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
L
 
A
D
 
K
M
 
L
Y
 
L
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
T
 
D
N
 
R
A
 
A
L
 
V
R
 
S
S
 
Q
A
 
A
E
 
E
H
 
S
N
 
D
D
 
P
Q
 
E
V
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
I
M
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
L
 
K
G
 
G
G
 
K
D
 
A
F
 
F
S
 
C
S
x
A
G
|
G
N
x
A
D
|
D
I
|
I
N
 
T
E
 
Q
F
|
F
V
 
N
H
 
Q
I
 
L
A
 
-
Q
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
W
-
 
K
-
 
F
-
x
S
E
 
K
K
 
K
M
 
G
E
x
R
A
 
E
I
 
I
M
 
M
A
 
D
F
 
K
L
 
I
Q
 
E
V
 
A
L
 
L
S
 
S
C
 
-
Y
 
-
K
 
-
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
M
V
 
I
E
 
N
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
L
T
x
E
M
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
I
V
 
R
L
 
I
A
 
A
S
 
A
R
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
Q
 
G
F
 
L
P
|
P
F
x
E
V
 
I
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
I
V
 
Y
P
|
P
E
x
G
A
 
Y
A
 
G
S
 
G
S
 
T
H
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
K
Q
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
E
I
 
M
L
 
M
V
 
M
L
 
T
G
 
G
E
 
D
V
x
R
V
 
I
S
 
P
A
 
G
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
H
 
E
E
 
K
M
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
H
 
R
L
 
V
C
 
V
E
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
L
E
 
E
G
 
Q
E
 
E
A
 
T
Y
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
-
L
 
-
F
 
-
Y
 
-
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
K
P
 
S
V
 
P
E
 
I
A
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
I
K
 
K
D
 
E
L
 
V
L
 
V
K
 
N
F
 
-
R
 
R
G
 
G
Q
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9Y232 Chromodomain Y-like protein; CDY-like; Crotonyl-CoA hydratase; EC 4.2.1.- from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
25% identity, 98% coverage: 3:248/250 of query aligns to 343:593/598 of Q9Y232

query
sites
Q9Y232
D
 
D
F
 
I
V
 
V
T
 
V
E
 
R
S
 
K
M
 
Q
E
 
D
S
 
G
G
 
F
I
 
T
Q
 
H
V
 
I
L
 
L
C
 
L
L
 
S
N
 
T
R
 
K
T
 
S
D
 
S
K
 
E
K
 
N
N
 
N
A
 
S
I
 
L
T
 
N
L
 
P
D
 
E
M
 
V
Y
 
M
Q
 
R
A
 
E
L
 
V
T
 
Q
N
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
S
S
 
T
A
 
A
E
 
A
H
 
A
N
 
D
D
 
D
Q
 
S
V
 
-
K
 
K
V
 
L
T
 
V
M
 
L
L
 
L
Y
 
S
G
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
S
D
 
V
F
 
F
S
 
C
S
 
C
G
 
G
N
 
L
D
 
D
I
 
F
N
 
I
E
 
Y
F
 
F
V
 
I
H
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
R
I
 
K
A
 
R
Q
 
E
T
 
S
P
 
T
E
 
K
K
 
M
M
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
M
 
R
A
 
N
F
 
F
L
 
V
Q
 
N
V
 
T
L
 
F
S
 
I
C
 
Q
Y
 
F
K
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
V
G
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
P
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
S
M
 
I
L
 
L
L
 
P
H
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
W
A
 
A
S
 
N
R
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
W
L
 
F
Q
 
Q
F
 
T
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
V
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
G
A
 
C
S
 
S
S
 
T
H
 
V
L
 
M
L
 
F
P
 
P
Q
 
K
L
 
I
V
 
M
G
 
G
H
 
G
Q
 
A
K
 
S
A
 
A
F
 
N
E
 
E
I
 
M
L
 
L
V
 
L
L
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
K
V
 
L
S
 
T
A
 
A
T
 
Q
Q
 
E
A
 
A
H
 
C
E
 
G
M
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
x
S
H
 
Q
L
 
V
C
 
F
E
 
W
E
 
P
G
 
G
E
 
T
A
 
F
Y
 
T
K
 
Q
L
 
E
A
 
V
L
 
M
F
 
V
Y
 
R
A
 
I
Q
 
K
R
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
C
P
 
N
V
 
P
E
 
V
A
 
V
V
 
L
A
 
E
L
 
E
S
 
S
K
 
K
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
R
F
 
C
R
 
N
G
 
M
Q
 
K
D
 
M
D
 
E
V
 
L
Q
 
E
M
 
Q
A
 
A
L
 
N
M
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
C
R
 
E
I
 
V
F
 
L
K
 
K
D
 
K
R
 
I
L
 
W
R
 
G
S
 
S
T
 
A
E
 
Q
A
 
G
H
 
M
Q
 
D
A
 
S
F
 
M
T
 
L
A
 
K
F
 
Y
L
 
L
S
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q9WTK2 Chromodomain Y-like protein; CDY-like; Crotonyl-CoA hydratase; Putative histone acetyltransferase Cdyl; EC 4.2.1.-; EC 2.3.1.48 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
25% identity, 98% coverage: 3:248/250 of query aligns to 338:588/593 of Q9WTK2

query
sites
Q9WTK2
D
 
D
F
 
I
V
 
V
T
 
V
E
 
R
S
 
K
M
 
Q
E
 
D
S
 
G
G
 
F
I
 
T
Q
 
H
V
 
I
L
 
L
C
 
L
L
 
S
N
 
T
R
 
K
T
 
S
D
 
S
K
 
E
K
 
N
N
 
N
A
 
S
I
 
L
T
 
N
L
 
P
D
 
E
M
 
V
Y
 
M
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
T
 
Q
N
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
S
S
 
T
A
 
A
E
 
A
H
 
A
N
 
D
D
 
D
Q
 
S
V
 
-
K
 
K
V
 
L
T
 
V
M
 
L
L
 
L
Y
 
S
G
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
S
D
 
V
F
 
F
S
 
C
S
 
C
G
 
G
N
 
L
D
 
D
I
 
F
N
 
I
E
 
Y
F
 
F
V
 
I
H
 
R
I
 
R
A
 
L
Q
 
T
T
 
D
P
 
D
E
 
R
K
 
K
M
 
R
E
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
K
-
 
M
-
 
A
-
 
D
A
 
A
I
 
I
M
 
R
A
 
N
F
 
F
L
 
V
Q
 
N
V
 
T
L
 
F
S
 
I
C
 
Q
Y
 
F
K
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
V
G
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
P
A
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
S
M
 
I
L
 
L
L
 
P
H
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
W
A
 
A
S
 
N
R
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
W
L
 
F
Q
 
Q
F
 
T
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
V
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
G
A
 
C
S
 
S
S
 
T
H
 
V
L
 
M
L
 
F
P
 
P
Q
 
K
L
 
I
V
 
M
G
 
G
H
 
G
Q
 
A
K
 
S
A
 
A
F
 
N
E
 
E
I
 
M
L
 
L
V
 
F
L
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
K
V
 
L
S
 
T
A
 
A
T
 
Q
Q
 
E
A
 
A
H
 
C
E
 
G
M
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
x
S
H
 
Q
L
 
V
C
 
F
E
 
W
E
 
P
G
 
G
E
 
T
A
 
F
Y
 
T
K
 
Q
L
 
E
A
 
V
L
 
M
F
 
V
Y
 
R
A
 
I
Q
 
K
R
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
C
P
 
N
V
 
P
E
 
V
A
 
V
V
 
L
A
 
E
L
 
E
S
 
S
K
 
K
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
R
F
 
C
R
 
N
G
 
M
Q
 
K
D
 
M
D
 
E
V
 
L
Q
 
E
M
 
Q
A
 
A
L
 
N
M
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
C
R
 
E
I
 
V
F
 
L
K
 
K
D
 
K
R
 
I
L
 
W
R
 
G
S
 
S
T
 
A
E
 
Q
A
 
G
H
 
M
Q
 
D
A
 
S
F
 
M
T
 
L
A
 
K
F
 
Y
L
 
L
S
 
Q
R
|
R

Sites not aligning to the query:

6l3pA Crystal strcuture of feruloyl-coa hydratase lyase(fchl) complexed with coa
31% identity, 67% coverage: 9:176/250 of query aligns to 14:183/244 of 6l3pA

query
sites
6l3pA
M
 
L
E
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
A
V
 
W
L
 
V
C
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
 
E
K
|
K
K
x
R
N
 
N
A
|
A
I
 
M
T
 
S
L
 
P
D
 
T
M
 
L
Y
 
N
Q
 
R
A
 
E
L
 
M
T
 
V
N
 
D
A
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
L
E
 
E
H
 
Q
N
 
D
D
 
A
Q
 
D
V
 
A
K
 
G
V
 
V
T
 
L
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
E
D
 
S
F
 
W
S
 
T
S
x
A
G
 
G
N
x
M
D
|
D
I
x
L
N
 
K
E
 
E
F
x
Y
V
 
F
H
 
R
-
 
E
-
 
E
I
 
I
A
 
L
Q
 
Q
T
 
E
P
 
K
E
 
I
K
 
R
M
x
R
E
 
E
A
 
A
I
 
S
M
x
Q
A
 
W
F
 
Q
L
 
W
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
R
C
 
L
Y
 
Y
K
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
M
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
W
A
 
C
V
 
F
G
|
G
V
x
G
G
 
G
A
 
F
T
x
S
M
 
P
L
 
L
L
 
V
H
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
A
L
 
I
A
 
C
S
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
F
Q
 
G
F
 
L
P
x
S
F
x
E
V
 
I
Q
 
N
L
 
W
G
 
G
L
x
I
V
 
P
P
|
P
E
x
G
A
 
N
A
 
L
S
 
V
S
 
S
H
 
K
L
 
A
L
 
M
P
 
A
Q
 
D
L
 
T
V
 
V
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
K
 
Q
A
 
S
F
 
L
E
 
Y
I
 
Y
L
 
I
V
 
M
L
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
T
V
 
F
S
 
D
A
 
G
T
 
R
Q
 
K
A
 
A
H
 
A
E
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N

Sites not aligning to the query:

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
27% identity, 93% coverage: 18:250/250 of query aligns to 22:254/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
x
K
K
x
A
K
x
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
L
 
D
D
 
G
M
 
L
Y
 
I
Q
 
D
A
 
E
L
 
L
T
 
N
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
S
 
I
A
 
F
E
 
E
H
 
E
N
 
D
D
 
P
Q
 
A
V
 
V
K
 
G
V
 
A
T
 
I
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
G
G
 
D
G
x
K
D
 
A
F
 
F
S
 
A
S
 
A
G
 
G
N
x
A
D
 
D
I
|
I
N
 
K
E
 
E
F
x
M
V
 
Q
H
 
N
I
 
L
A
 
S
Q
 
F
T
 
Q
P
 
D
E
 
C
K
 
Y
M
x
S
E
 
S
A
 
K
I
 
F
M
x
L
A
 
K
F
 
H
L
 
W
Q
 
D
V
 
H
L
 
L
S
 
T
C
 
Q
Y
 
V
K
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
V
x
F
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
C
T
x
E
M
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
V
 
I
L
 
Y
A
 
A
S
 
G
R
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
Q
L
 
F
Q
 
A
F
 
Q
P
|
P
F
x
E
V
 
I
Q
 
L
L
 
I
G
 
G
L
x
T
V
 
I
P
|
P
E
x
G
A
 
A
A
 
G
S
 
G
S
 
T
H
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
K
Q
 
S
K
 
L
A
 
A
F
 
M
E
 
E
I
 
M
L
 
V
V
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
R
V
 
I
S
 
S
A
 
A
T
 
Q
Q
 
D
A
 
A
H
 
K
E
 
Q
M
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
H
 
K
L
 
I
C
 
C
E
 
P
E
 
V
G
 
E
E
 
T
A
 
L
Y
 
V
K
 
E
L
 
E
A
 
A
L
 
I
F
 
Q
Y
 
C
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
N
P
 
S
V
 
K
E
 
I
A
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
M
S
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
S
L
 
V
K
 
N
F
 
A
R
 
A
G
 
F
Q
 
E
D
 
M
D
 
T
V
 
L
Q
 
T
M
 
E
A
 
G
L
 
S
M
x
K
R
 
L
E
 
E
G
 
K
R
 
K
I
 
L
F
 
F
K
 
Y
D
 
S
R
 
T
L
x
F
R
 
A
S
 
T
T
 
D
E
 
D
A
 
R
H
 
K
Q
 
E
A
 
G
F
 
M
T
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
V
S
 
E
R
 
K
N
 
R
K
 
K

O69762 Hydroxycinnamoyl-CoA hydratase-lyase; HCHL; P-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase; Trans-feruloyl-CoA hydratase/vanillin synthase; EC 4.1.2.61 from Pseudomonas fluorescens (see 2 papers)
30% identity, 69% coverage: 5:177/250 of query aligns to 11:190/276 of O69762

query
sites
O69762
V
 
V
T
 
K
E
 
V
S
 
E
M
 
I
E
 
E
S
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
A
V
 
F
L
 
V
C
 
I
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
 
E
K
|
K
K
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
M
T
 
S
L
 
P
D
 
T
M
 
L
Y
 
N
Q
 
R
A
 
E
L
 
M
T
 
I
N
 
D
A
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
L
E
 
E
H
 
Q
N
 
D
D
 
P
Q
 
A
V
 
A
K
 
G
V
 
V
T
 
L
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
E
D
 
A
F
 
W
S
 
T
S
x
A
G
 
G
N
x
M
D
 
D
I
x
L
N
 
K
E
 
E
-
x
Y
F
 
F
V
 
R
H
 
E
I
 
V
A
 
D
Q
 
A
T
 
G
P
 
P
E
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
K
-
 
I
K
 
R
M
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
S
M
 
Q
A
 
W
F
 
Q
L
 
W
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
R
C
 
M
Y
 
Y
K
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
M
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
W
A
 
C
V
 
F
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
F
T
x
S
M
 
P
L
 
L
L
 
V
H
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
A
L
 
I
A
 
C
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
F
Q
 
G
F
 
L
P
x
S
F
x
E
V
 
I
Q
 
N
L
x
W
G
 
G
L
 
I
V
 
P
P
 
P
E
x
G
A
 
N
A
 
L
S
 
V
S
 
S
H
 
K
L
 
A
L
 
M
P
 
A
Q
 
D
L
 
T
V
 
V
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
K
 
Q
A
 
S
F
 
L
E
 
Y
I
 
Y
L
 
I
V
 
M
L
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
T
V
 
F
S
 
G
A
 
G
T
 
Q
Q
 
K
A
 
A
H
 
A
E
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
H
 
E

Sites not aligning to the query:

2vssB Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
30% identity, 69% coverage: 5:177/250 of query aligns to 8:187/247 of 2vssB

query
sites
2vssB
V
 
V
T
 
K
E
 
V
S
 
E
M
 
I
E
 
E
S
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
A
V
 
F
L
 
V
C
 
I
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
x
E
K
|
K
K
x
R
N
 
N
A
|
A
I
 
M
T
 
S
L
 
P
D
 
T
M
 
L
Y
 
N
Q
 
R
A
 
E
L
 
M
T
 
I
N
 
D
A
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
L
E
 
E
H
 
Q
N
 
D
D
 
P
Q
 
A
V
 
A
K
 
G
V
 
V
T
 
L
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
E
D
 
A
F
 
W
S
 
T
S
x
A
G
 
G
N
x
M
D
|
D
I
 
L
N
 
K
E
 
E
-
x
Y
F
 
F
V
 
R
H
 
E
I
 
V
A
x
D
Q
 
A
T
 
G
P
 
P
E
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
K
-
 
I
K
 
R
M
x
R
E
 
E
A
 
A
I
 
S
M
x
Q
A
 
W
F
 
Q
L
 
W
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
R
C
 
M
Y
 
Y
K
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
M
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
x
W
A
 
C
V
x
F
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
F
T
x
S
M
 
P
L
 
L
L
 
V
H
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
A
L
 
I
A
 
C
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
F
Q
 
G
F
 
L
P
x
S
F
x
E
V
 
I
Q
 
N
L
 
W
G
 
G
L
x
I
V
 
P
P
|
P
E
x
G
A
 
N
A
 
L
S
 
V
S
 
S
H
 
K
L
 
A
L
 
M
P
 
A
Q
 
D
L
 
T
V
 
V
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
K
 
Q
A
 
S
F
 
L
E
 
Y
I
 
Y
L
 
I
V
 
M
L
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
T
V
 
F
S
 
G
A
 
G
T
 
Q
Q
 
K
A
 
A
H
 
A
E
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
H
 
E

Sites not aligning to the query:

2vssD Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
30% identity, 69% coverage: 5:177/250 of query aligns to 9:188/246 of 2vssD

query
sites
2vssD
V
 
V
T
 
K
E
 
V
S
 
E
M
 
I
E
 
E
S
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
A
V
 
F
L
 
V
C
 
I
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
x
E
K
|
K
K
x
R
N
 
N
A
|
A
I
 
M
T
 
S
L
 
P
D
 
T
M
 
L
Y
 
N
Q
 
R
A
 
E
L
 
M
T
 
I
N
 
D
A
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
L
E
 
E
H
 
Q
N
 
D
D
 
P
Q
 
A
V
 
A
K
 
G
V
 
V
T
 
L
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
E
D
 
A
F
 
W
S
 
T
S
x
A
G
 
G
N
x
M
D
|
D
I
x
L
N
 
K
E
 
E
-
x
Y
F
|
F
V
 
R
H
 
E
I
 
V
A
x
D
Q
 
A
T
 
G
P
 
P
E
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
K
-
 
I
K
 
R
M
x
R
E
 
E
A
 
A
I
 
S
M
x
Q
A
 
W
F
x
Q
L
 
W
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
R
C
 
M
Y
 
Y
K
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
M
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
x
W
A
 
C
V
x
F
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
F
T
x
S
M
 
P
L
 
L
L
 
V
H
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
A
L
 
I
A
 
C
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
F
Q
 
G
F
 
L
P
x
S
F
x
E
V
 
I
Q
 
N
L
 
W
G
 
G
L
x
I
V
 
P
P
|
P
E
x
G
A
x
N
A
 
L
S
 
V
S
 
S
H
 
K
L
 
A
L
 
M
P
 
A
Q
 
D
L
 
T
V
 
V
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
K
 
Q
A
 
S
F
 
L
E
 
Y
I
 
Y
L
 
I
V
 
M
L
 
T
G
 
G
E
 
K
V
 
T
V
 
F
S
 
G
A
 
G
T
 
Q
Q
 
K
A
 
A
H
 
A
E
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
H
 
E

Sites not aligning to the query:

6p5uE Structure of an enoyl-coa hydratase/aldolase isolated from a lignin- degrading consortium (see paper)
31% identity, 67% coverage: 10:177/250 of query aligns to 13:187/246 of 6p5uE

query
sites
6p5uE
E
 
D
S
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
A
V
 
W
L
 
V
C
 
S
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
|
D
K
|
K
K
x
R
N
 
N
A
|
A
I
 
M
T
 
S
L
 
P
D
 
T
M
 
L
Y
 
N
Q
 
R
A
 
E
L
 
M
T
 
L
N
 
Q
A
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
A
 
L
E
 
E
H
 
F
N
 
D
D
 
D
Q
 
R
V
 
C
K
 
G
V
 
V
T
 
V
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
E
G
 
G
G
 
D
D
 
S
F
 
F
S
 
S
S
x
A
G
 
G
N
x
M
D
|
D
I
x
L
N
 
K
E
 
E
-
x
Y
F
 
F
V
 
R
H
 
E
I
 
T
A
x
D
Q
 
N
T
 
A
P
 
P
E
 
A
K
 
L
M
 
I
E
 
K
A
 
A
I
 
Q
M
 
I
-
 
R
-
x
R
-
 
A
-
 
A
-
 
G
A
|
A
F
 
W
-
 
Q
L
 
W
Q
 
R
V
 
K
L
 
L
S
 
R
C
 
F
Y
 
Y
K
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
M
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
x
W
A
 
C
V
x
F
G
 
G
V
x
G
G
 
A
A
 
F
T
|
T
M
 
P
L
 
L
L
 
I
H
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
F
Q
 
G
F
 
L
P
x
S
F
x
E
V
 
I
Q
 
N
L
x
W
G
 
G
L
x
I
V
 
I
P
|
P
E
x
A
A
 
G
A
 
N
S
 
V
S
 
T
H
 
K
L
 
A
L
 
V
P
 
S
Q
 
Q
L
 
V
V
 
C
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
K
 
A
A
 
A
F
 
L
E
 
Y
I
 
Y
L
 
I
V
 
M
L
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
P
V
 
F
S
 
G
A
 
G
T
 
Q
Q
 
K
A
 
A
H
 
R
E
 
E
M
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
H
 
E

Sites not aligning to the query:

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
22% identity, 94% coverage: 13:248/250 of query aligns to 13:248/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
I
 
V
Q
 
G
V
 
I
L
 
I
C
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
 
Q
K
 
A
K
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
L
 
S
D
 
Q
M
 
V
Y
 
M
Q
 
N
A
 
E
L
 
V
T
 
T
N
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
D
H
 
D
N
 
D
D
 
P
Q
 
D
V
 
I
K
 
G
V
 
A
T
 
I
M
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
L
 
S
G
 
A
G
 
K
D
 
A
F
 
F
S
 
A
S
 
A
G
 
G
N
x
A
D
 
D
I
 
I
N
 
K
E
 
E
F
x
M
V
 
A
H
 
D
I
 
L
A
 
T
Q
 
F
T
 
A
P
 
D
E
 
A
K
 
F
M
x
T
E
 
A
A
 
D
I
 
F
M
x
F
A
 
A
F
 
T
L
 
W
Q
 
G
V
 
K
L
 
L
S
 
A
C
 
A
Y
 
V
K
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
C
T
x
E
M
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
A
R
 
D
E
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
F
Q
 
G
F
 
Q
P
|
P
F
x
E
V
 
I
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
P
|
P
E
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
G
S
 
S
H
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
H
 
K
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
D
I
 
L
L
 
I
V
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
V
 
T
V
 
M
S
 
D
A
 
A
T
 
A
Q
 
E
A
 
A
H
 
E
E
 
R
M
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
H
 
R
L
 
V
C
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
D
E
 
D
A
 
L
Y
 
L
K
 
T
L
 
E
A
 
A
L
 
R
F
 
A
Y
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
P
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
R
L
 
M
S
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
V
K
 
N
F
 
R
R
 
A
G
 
F
Q
 
E
D
 
S
D
 
S
V
 
L
Q
 
S
M
 
E
A
 
G
L
 
L
M
x
L
R
 
Y
E
 
E
G
 
R
R
 
R
I
 
L
F
 
F
K
 
H
D
 
S
R
 
A
L
x
F
R
 
A
S
 
T
T
 
E
E
 
D
A
x
Q
H
 
S
Q
 
E
A
 
G
F
 
M
T
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
R
 
K

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
22% identity, 94% coverage: 13:248/250 of query aligns to 14:249/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
I
 
V
Q
 
G
V
 
I
L
 
I
C
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
x
Q
K
x
A
K
x
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
N
L
 
S
D
 
Q
M
 
V
Y
 
M
Q
 
N
A
 
E
L
 
V
T
 
T
N
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
D
H
 
D
N
 
D
D
 
P
Q
 
D
V
 
I
K
 
G
V
 
A
T
 
I
M
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
L
 
S
G
 
A
G
 
K
D
 
A
F
 
F
S
 
A
S
x
A
G
|
G
N
x
A
D
|
D
I
|
I
N
x
K
E
 
E
F
x
M
V
 
A
H
 
D
I
 
L
A
 
T
Q
 
F
T
 
A
P
 
D
E
 
A
K
 
F
M
x
T
E
 
A
A
 
D
I
 
F
M
x
F
A
 
A
F
 
T
L
 
W
Q
 
G
V
 
K
L
 
L
S
 
A
C
 
A
Y
 
V
K
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
|
G
V
x
G
G
 
G
A
 
C
T
x
E
M
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
A
R
 
D
E
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
F
Q
 
G
F
 
Q
P
|
P
F
x
E
V
 
I
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
P
|
P
E
x
G
A
x
M
A
 
G
S
 
G
S
 
S
H
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
H
 
K
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
D
I
 
L
L
 
I
V
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
V
 
T
V
 
M
S
 
D
A
 
A
T
 
A
Q
 
E
A
 
A
H
 
E
E
 
R
M
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
H
 
R
L
 
V
C
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
D
E
 
D
A
 
L
Y
 
L
K
 
T
L
 
E
A
 
A
L
 
R
F
 
A
Y
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
P
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
R
L
 
M
S
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
V
K
 
N
F
 
R
R
 
A
G
 
F
Q
 
E
D
 
S
D
 
S
V
 
L
Q
 
S
M
 
E
A
 
G
L
 
L
M
x
L
R
 
Y
E
 
E
G
 
R
R
 
R
I
 
L
F
 
F
K
 
H
D
 
S
R
 
A
L
x
F
R
 
A
S
 
T
T
 
E
E
 
D
A
 
Q
H
 
S
Q
 
E
A
 
G
F
 
M
T
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
R
 
K

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
22% identity, 94% coverage: 13:248/250 of query aligns to 14:249/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
I
 
V
Q
 
G
V
 
I
L
 
I
C
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
 
Q
K
 
A
K
x
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
L
 
S
D
 
Q
M
 
V
Y
 
M
Q
 
N
A
 
E
L
 
V
T
 
T
N
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
D
H
 
D
N
 
D
D
 
P
Q
 
D
V
 
I
K
 
G
V
 
A
T
 
I
M
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
L
 
S
G
 
A
G
 
K
D
 
A
F
 
F
S
 
A
S
x
A
G
 
G
N
x
A
D
 
D
I
|
I
N
x
K
E
 
E
F
x
M
V
 
A
H
 
D
I
 
L
A
 
T
Q
 
F
T
 
A
P
 
D
E
 
A
K
 
F
M
x
T
E
 
A
A
 
D
I
 
F
M
x
F
A
 
A
F
 
T
L
 
W
Q
 
G
V
 
K
L
 
L
S
 
A
C
 
A
Y
 
V
K
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
x
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
C
T
x
E
M
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
A
R
 
D
E
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
F
Q
 
G
F
 
Q
P
|
P
F
x
E
V
 
I
Q
 
K
L
|
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
P
|
P
E
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
G
S
 
S
H
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
H
 
K
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
D
I
 
L
L
 
I
V
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
V
 
T
V
 
M
S
 
D
A
 
A
T
 
A
Q
 
E
A
 
A
H
 
E
E
 
R
M
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
H
 
R
L
 
V
C
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
D
E
 
D
A
 
L
Y
 
L
K
 
T
L
 
E
A
 
A
L
 
R
F
 
A
Y
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
P
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
R
L
 
M
S
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
V
K
 
N
F
 
R
R
 
A
G
 
F
Q
 
E
D
 
S
D
 
S
V
 
L
Q
 
S
M
 
E
A
 
G
L
 
L
M
x
L
R
 
Y
E
 
E
G
 
R
R
 
R
I
 
L
F
 
F
K
 
H
D
 
S
R
 
A
L
x
F
R
 
A
S
 
T
T
 
E
E
 
D
A
 
Q
H
 
S
Q
 
E
A
 
G
F
 
M
T
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
R
 
K

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
23% identity, 94% coverage: 13:248/250 of query aligns to 13:244/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
I
 
V
Q
 
G
V
 
I
L
 
I
C
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
 
Q
K
 
A
K
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
L
 
S
D
 
Q
M
 
V
Y
 
M
Q
 
N
A
 
E
L
 
V
T
 
T
N
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
D
H
 
D
N
 
D
D
 
P
Q
 
D
V
 
I
K
 
G
V
 
A
T
 
I
M
 
I
L
 
I
Y
 
T
G
 
G
L
 
S
G
 
A
G
 
K
D
 
A
F
 
F
S
 
A
S
 
A
G
 
G
N
x
A
D
 
D
I
 
I
N
 
K
E
 
E
F
x
M
V
 
F
H
 
A
I
 
D
A
 
A
Q
 
F
T
|
T
P
 
A
E
 
D
K
 
-
M
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
F
M
x
F
A
 
A
F
 
T
L
 
W
Q
 
G
V
 
K
L
 
L
S
 
A
C
 
A
Y
 
V
K
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
A
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
C
T
x
E
M
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
A
R
 
D
E
 
T
A
 
A
R
 
K
L
 
F
Q
 
G
F
 
Q
P
|
P
F
x
E
V
 
I
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
P
|
P
E
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
G
S
 
S
H
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
H
 
K
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
D
I
 
L
L
 
I
V
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
V
 
T
V
 
M
S
 
D
A
 
A
T
 
A
Q
 
E
A
 
A
H
 
E
E
 
R
M
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
H
 
R
L
 
V
C
 
V
E
 
P
E
 
A
G
 
D
E
 
D
A
 
L
Y
 
L
K
 
T
L
 
E
A
 
A
L
 
R
F
 
A
Y
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
P
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
R
L
 
M
S
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
V
K
 
N
F
 
R
R
 
A
G
 
F
Q
 
E
D
 
S
D
 
S
V
 
L
Q
 
S
M
 
E
A
 
G
L
 
L
M
x
L
R
 
Y
E
 
E
G
 
R
R
 
R
I
 
L
F
|
F
K
 
H
D
 
S
R
 
A
L
x
F
R
 
A
S
 
T
T
 
E
E
 
D
A
 
Q
H
 
S
Q
 
E
A
 
G
F
 
M
T
 
A
A
 
A
F
|
F
L
 
I
S
 
E
R
 
K

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
26% identity, 96% coverage: 11:250/250 of query aligns to 15:252/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
S
 
S
G
 
S
I
 
V
Q
 
G
V
 
L
L
 
I
C
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
x
K
K
x
A
K
x
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
L
 
N
D
 
G
M
 
L
Y
 
I
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
T
 
N
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
F
E
 
E
H
 
E
N
 
D
D
 
P
Q
 
A
V
 
V
K
 
G
V
 
A
T
 
I
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
G
G
 
E
G
 
K
D
 
A
F
 
F
S
 
A
S
x
A
G
|
G
N
x
A
D
|
D
I
|
I
N
 
K
E
 
E
F
x
M
V
 
Q
H
 
N
I
 
-
A
 
-
Q
 
R
T
 
T
P
 
F
E
 
Q
K
 
D
M
 
C
E
 
Y
A
x
S
I
 
G
M
x
L
A
 
S
F
 
H
L
 
W
Q
 
D
V
 
H
L
 
I
S
 
T
C
 
R
Y
 
I
K
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
V
x
G
G
 
G
A
 
C
T
x
E
M
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
V
 
I
L
 
Y
A
 
A
S
 
G
R
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
Q
L
 
F
Q
 
G
F
 
Q
P
|
P
F
x
E
V
 
I
Q
 
L
L
|
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
P
|
P
E
x
G
A
 
A
A
 
G
S
 
G
S
 
T
H
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
K
Q
 
S
K
 
L
A
 
A
F
 
M
E
 
E
I
 
M
L
 
V
V
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
R
V
 
I
S
 
S
A
 
A
T
 
Q
Q
 
D
A
 
A
H
 
K
E
 
Q
M
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
H
 
K
L
 
I
C
 
F
E
 
P
E
 
V
G
 
E
E
 
T
A
 
L
Y
 
V
K
 
E
L
 
E
A
 
A
L
 
I
F
 
Q
Y
 
C
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
N
P
 
S
V
 
K
E
 
I
A
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
M
S
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
S
L
 
V
K
 
N
F
 
A
R
 
A
G
 
F
Q
 
E
D
 
M
D
 
T
V
 
L
Q
 
T
M
 
E
A
 
G
L
 
N
M
x
K
R
 
L
E
 
E
G
 
K
R
 
K
I
 
L
F
 
F
K
 
Y
D
 
S
R
 
T
L
x
F
R
 
A
S
 
T
T
 
D
E
 
D
A
 
R
H
 
R
Q
 
E
A
 
G
F
 
M
T
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
S
 
E
R
 
K
N
 
R
K
 
K

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
25% identity, 96% coverage: 11:250/250 of query aligns to 15:254/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
S
 
S
G
 
S
I
 
V
Q
 
G
V
 
L
L
 
I
C
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
P
D
x
K
K
x
A
K
x
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
L
 
N
D
 
G
M
 
L
Y
 
I
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
T
 
N
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
F
E
 
E
H
 
E
N
 
D
D
 
P
Q
 
A
V
 
V
K
 
G
V
 
A
T
 
I
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
L
 
G
G
 
E
G
 
K
D
 
A
F
 
F
S
 
A
S
x
A
G
 
G
N
x
A
D
|
D
I
|
I
N
 
K
E
 
E
F
x
M
V
 
Q
H
 
N
I
 
R
A
 
T
Q
 
F
T
 
Q
P
 
D
E
 
C
K
 
Y
M
x
S
E
 
G
A
 
K
I
 
F
M
x
L
A
 
S
F
 
H
L
 
W
Q
 
D
V
 
H
L
 
I
S