SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_111607943.1 NCBI__GCF_003259225.1:WP_111607943.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6rl5G The first crystal structure of the daba aminotransferase ectb in the ectoine biosynthesis pathway of the model organism chromohalobacter salexigens dsm 3034 (see paper)
59% identity, 95% coverage: 2:415/437 of query aligns to 3:418/422 of 6rl5G

query
sites
6rl5G
K
 
Q
I
 
I
F
 
L
D
 
E
E
 
R
I
 
M
E
 
E
S
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
R
S
 
T
Y
 
Y
A
x
S
R
 
R
S
 
S
F
 
F
P
 
P
R
 
T
V
 
V
F
 
F
H
 
T
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
L
 
L
F
 
H
D
 
A
Q
 
E
E
 
D
G
 
G
N
 
N
K
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
N
 
N
N
 
H
P
 
P
I
 
K
F
 
L
K
 
K
E
 
Q
K
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
D
Y
 
Y
I
 
I
L
 
A
E
 
S
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
M
H
 
W
T
 
S
K
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
R
E
 
D
F
 
Y
L
 
L
E
 
E
V
 
T
F
 
L
K
 
E
K
 
E
H
 
V
I
 
I
L
 
L
E
 
K
P
 
P
R
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
D
Y
 
Y
M
 
K
V
 
V
Q
 
H
F
 
L
T
 
P
G
 
G
P
 
P
T
 
T
G
|
G
T
|
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
N
 
N
V
 
A
T
 
K
G
 
G
R
 
R
E
 
H
N
 
N
I
 
I
I
 
V
S
 
T
F
 
F
T
 
T
N
 
N
G
 
G
F
|
F
H
|
H
G
 
G
C
 
V
S
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
A
V
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
R
H
 
K
H
 
F
R
 
R
G
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
G
T
 
G
S
 
I
L
 
P
G
 
T
A
 
Q
G
 
G
V
 
A
S
 
S
T
 
F
V
 
M
P
 
P
F
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
G
 
G
D
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
T
T
 
L
E
 
S
Y
 
Y
L
 
F
D
 
E
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
G
D
 
D
S
 
N
S
 
S
S
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
I
E
 
E
T
 
T
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
A
 
P
A
 
A
S
 
G
F
 
I
G
 
P
W
 
W
L
 
L
Q
 
Q
N
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
I
C
 
C
K
 
R
K
 
D
H
 
H
G
 
D
V
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
V
D
|
D
D
 
D
I
|
I
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
F
 
F
F
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
D
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
V
 
V
T
 
T
M
 
N
S
 
S
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
F
A
 
A
V
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
I
W
 
W
K
 
K
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
H
 
Y
N
 
N
G
|
G
T
|
T
F
 
F
R
 
R
G
 
G
N
 
F
N
 
N
L
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
T
A
 
A
K
 
A
V
 
A
A
 
A
I
 
M
E
 
R
T
 
H
Y
 
F
W
 
W
K
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
T
F
 
F
E
 
E
K
 
R
E
 
D
I
 
V
K
 
Q
R
 
R
K
 
K
G
 
G
E
 
R
Y
 
V
I
 
V
H
 
E
E
 
D
R
 
R
T
 
F
Q
 
Q
A
 
K
I
 
L
V
 
A
N
 
S
E
 
F
F
 
M
G
 
T
E
 
E
G
 
K
N
 
G
F
 
H
-
 
P
-
 
A
T
 
S
L
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
L
M
 
M
R
 
R
G
 
G
I
 
L
N
 
D
C
 
V
V
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
D
L
 
M
A
 
A
G
 
D
K
 
K
I
 
I
T
 
T
K
 
A
K
 
Q
C
 
A
F
 
F
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
I
I
 
I
E
 
E
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
H
D
 
S
D
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
K
F
 
C
L
 
L
C
 
C
P
 
P
L
 
L
I
 
T
I
 
I
S
 
T
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
V
Q
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
A
 
S
I
 
V
R
 
K
D
 
E
V
 
V

O66442 Acetylornithine aminotransferase; ACOAT; EC 2.6.1.11 from Aquifex aeolicus (strain VF5)
33% identity, 92% coverage: 11:412/437 of query aligns to 5:376/376 of O66442

query
sites
O66442
V
 
M
Q
 
N
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
-
F
 
L
P
 
P
R
 
V
V
 
K
F
 
F
H
 
V
R
 
R
A
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
F
 
Y
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
N
 
K
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
V
L
 
N
N
 
S
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
A
N
 
Y
P
 
P
I
 
K
F
 
L
K
 
T
E
 
E
K
 
A
L
 
L
V
 
K
E
 
E
Y
 
Q
I
 
V
L
 
-
E
 
-
D
 
E
G
 
K
I
 
L
T
 
L
H
 
H
G
 
V
L
 
S
D
 
N
M
 
L
H
 
Y
T
 
E
K
 
N
A
 
P
-
 
W
K
 
Q
G
 
E
E
 
E
F
 
L
L
 
A
E
 
H
V
 
K
F
 
L
K
 
V
K
 
K
H
 
H
I
 
F
L
 
W
E
 
T
P
 
E
R
 
G
G
 
K
L
 
V
E
 
-
Y
 
-
M
 
-
V
 
-
Q
 
-
F
 
F
T
 
F
G
 
A
P
 
N
T
 
S
G
|
G
T
|
T
N
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
N
 
K
V
 
Y
-
 
W
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
G
T
 
K
G
 
N
R
 
K
E
 
W
N
 
K
I
 
F
I
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
E
N
 
N
G
 
S
F
 
F
H
 
H
G
 
G
C
 
R
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
S
 
P
H
 
K
-
 
F
H
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
F
A
 
E
G
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
P
T
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
-
D
 
-
G
 
G
Y
 
F
L
 
S
G
 
Y
D
 
A
G
 
K
I
 
L
E
 
N
T
 
D
T
 
I
E
 
D
Y
 
S
L
 
V
D
 
Y
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
E
S
 
E
S
 
T
S
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
I
V
 
I
E
 
E
T
 
V
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
N
A
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
E
G
 
D
W
 
F
L
 
L
Q
 
S
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
V
 
I
C
 
C
K
 
K
K
 
E
H
 
K
G
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
I
D
 
D
D
 
E
I
 
V
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
E
F
 
F
F
 
Y
S
 
A
F
 
Y
E
 
Q
D
 
H
A
 
F
G
 
N
I
 
L
K
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
V
V
 
I
T
 
A
M
 
L
S
 
A
K
|
K
S
 
G
L
 
L
S
 
G
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
I
A
 
G
V
 
A
V
 
I
L
 
L
M
 
A
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
A
E
 
Q
-
 
S
W
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
S
H
 
H
N
 
G
G
 
S
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
C
V
 
R
T
 
A
A
 
G
K
 
T
V
 
V
A
 
V
I
 
V
E
 
D
T
 
E
Y
 
V
W
 
E
K
 
K
D
 
L
D
 
L
A
 
P
F
 
H
E
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
K
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
I
 
F
H
 
K
E
 
E
R
 
K
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
V
 
L
N
 
K
E
 
E
F
 
L
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
K
F
 
-
T
 
-
L
 
V
Q
 
K
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
L
M
 
M
R
 
L
G
 
G
I
 
L
N
 
E
C
 
-
V
 
L
S
 
E
G
 
R
E
 
E
L
 
C
A
 
K
G
 
D
K
 
Y
I
 
V
T
 
L
K
 
-
K
 
K
C
 
A
F
 
L
Q
 
E
N
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
L
I
 
I
E
 
N
T
 
C
S
 
T
G
 
A
A
 
G
D
 
-
D
 
-
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
K
 
R
F
 
F
L
 
L
C
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
Q
D
 
K
E
 
E
D
 
H
L
 
I
K
 
D
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
D
 
S
I
 
V
L
 
L
E
 
R
R
 
E
A
 
I
I
 
L

2eh6A Crystal structure of acetylornithine aminotransferase from aquifex aeolicus vf5
33% identity, 92% coverage: 11:412/437 of query aligns to 4:375/375 of 2eh6A

query
sites
2eh6A
V
 
M
Q
 
N
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
S
 
-
F
 
L
P
 
P
R
 
V
V
 
K
F
 
F
H
 
V
R
 
R
A
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
F
 
Y
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
N
 
K
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
V
L
 
N
N
 
S
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
A
N
 
Y
P
 
P
I
 
K
F
 
L
K
 
T
E
 
E
K
 
A
L
 
L
V
 
K
E
 
E
Y
 
Q
I
 
V
L
 
-
E
 
-
D
 
E
G
 
K
I
 
L
T
 
L
H
 
H
G
 
V
L
 
S
D
 
N
M
 
L
H
 
Y
T
 
E
K
 
N
A
 
P
-
 
W
K
 
Q
G
 
E
E
 
E
F
 
L
L
 
A
E
 
H
V
 
K
F
 
L
K
 
V
K
 
K
H
 
H
I
 
F
L
 
W
E
 
T
P
 
E
R
 
G
G
 
K
L
 
V
E
 
-
Y
 
-
M
 
-
V
 
-
Q
 
-
F
 
F
T
 
F
G
 
A
P
 
N
T
 
S
G
|
G
T
|
T
N
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
N
 
K
V
 
Y
-
 
W
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
G
T
 
K
G
 
N
R
 
K
E
 
W
N
 
K
I
 
F
I
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
E
N
 
N
G
 
S
F
|
F
H
|
H
G
 
G
C
 
R
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
S
 
P
H
 
K
-
 
F
H
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
F
A
 
E
G
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
P
T
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
-
D
 
-
G
 
G
Y
 
F
L
 
S
G
 
Y
D
 
A
G
 
K
I
 
L
E
 
N
T
 
D
T
 
I
E
 
D
Y
 
S
L
 
V
D
 
Y
K
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
E
S
 
E
S
 
T
S
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
I
V
 
I
E
|
E
T
 
V
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
N
A
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
E
G
 
D
W
 
F
L
 
L
Q
 
S
N
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
V
 
I
C
 
C
K
 
K
K
 
E
H
 
K
G
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
I
D
|
D
D
 
E
I
x
V
Q
|
Q
A
 
T
G
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
E
F
 
F
F
 
Y
S
 
A
F
 
Y
E
 
Q
D
 
H
A
 
F
G
 
N
I
 
L
K
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
V
V
 
I
T
 
A
M
 
L
S
 
A
K
|
K
S
 
G
L
 
L
S
 
G
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
I
A
 
G
V
 
A
V
 
I
L
 
L
M
 
A
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
A
E
 
Q
-
 
S
W
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
S
H
 
H
N
 
G
G
 
S
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
C
V
 
R
T
 
A
A
 
G
K
 
T
V
 
V
A
 
V
I
 
V
E
 
D
T
 
E
Y
 
V
W
 
E
K
 
K
D
 
L
D
 
L
A
 
P
F
 
H
E
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
K
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
I
 
F
H
 
K
E
 
E
R
 
K
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
V
 
L
N
 
K
E
 
E
F
 
L
G
 
G
E
 
K
G
 
G
N
 
K
F
 
-
T
 
-
L
 
V
Q
 
K
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
L
M
 
M
R
 
L
G
 
G
I
 
L
N
 
E
C
 
-
V
 
L
S
 
E
G
 
R
E
 
E
L
 
C
A
 
K
G
 
D
K
 
Y
I
 
V
T
 
L
K
 
-
K
 
K
C
 
A
F
 
L
Q
 
E
N
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
L
I
 
I
E
 
N
T
 
C
S
 
T
G
 
A
A
 
G
D
 
-
D
 
-
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
K
x
R
F
 
F
L
 
L
C
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
Q
D
 
K
E
 
E
D
 
H
L
 
I
K
 
D
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
D
 
S
I
 
V
L
 
L
E
 
R
R
 
E
A
 
I
I
 
L

8ht4B Crystal structure of acetylornithine aminotransferase complex with plp from corynebacterium glutamicum (see paper)
33% identity, 89% coverage: 26:412/437 of query aligns to 25:389/390 of 8ht4B

query
sites
8ht4B
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
L
 
V
F
 
T
D
 
D
Q
 
D
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
K
 
V
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
I
G
 
A
T
 
V
L
 
N
N
 
A
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
A
N
 
H
P
 
P
I
 
A
F
 
I
K
 
I
E
 
E
K
 
A
L
 
V
V
 
T
E
 
N
Y
 
Q
I
 
I
L
 
G
E
 
Q
D
 
L
G
 
G
I
 
H
T
 
V
H
 
S
G
 
N
L
 
L
D
 
F
M
 
A
H
 
S
T
 
R
K
 
P
A
 
V
K
 
V
G
 
E
E
 
V
F
 
A
L
 
E
E
 
E
V
 
L
F
 
I
K
 
K
K
 
R
H
 
F
I
 
S
L
 
L
E
 
D
P
 
D
R
 
A
G
 
T
L
 
L
E
 
A
Y
 
A
M
 
Q
V
 
T
Q
 
R
-
 
V
F
 
F
T
 
F
G
 
C
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
x
A
N
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
F
K
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
-
V
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
S
N
 
R
I
 
I
I
 
L
S
 
A
F
 
A
T
 
V
N
 
H
G
 
G
F
|
F
H
|
H
G
 
G
C
 
R
S
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
A
V
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
S
 
P
H
 
D
H
 
K
R
 
R
G
 
-
A
 
E
A
 
A
G
 
F
T
 
L
S
 
P
L
 
M
G
 
P
A
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
E
T
 
F
V
 
Y
P
 
P
F
 
Y
D
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
G
D
 
D
G
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
T
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
D
 
R
K
 
K
V
 
M
L
 
V
S
 
E
D
 
T
S
 
N
S
 
P
S
 
T
G
 
D
V
 
V
D
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
I
I
 
F
V
 
L
E
|
E
T
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
T
G
 
G
I
 
V
N
 
V
A
 
P
A
 
A
S
 
P
F
 
E
G
 
G
W
 
F
L
 
L
Q
 
K
N
 
A
L
 
V
E
 
R
A
 
E
V
 
L
C
 
C
K
 
D
K
 
E
H
 
Y
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
M
I
 
I
V
 
T
D
|
D
D
 
E
I
x
V
Q
|
Q
A
 
T
G
 
G
C
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
D
F
 
F
F
 
F
S
 
A
F
 
H
E
 
Q
D
 
H
A
 
D
G
 
G
I
 
V
K
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
V
V
 
V
T
 
T
M
 
M
S
 
A
K
|
K
S
 
G
L
 
L
S
 
G
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
I
A
 
G
V
 
A
V
 
C
L
 
L
M
 
A
R
 
T
P
 
G
E
 
R
L
 
A
D
 
A
E
 
E
-
 
L
W
 
M
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
K
H
 
H
N
 
G
G
 
T
T
 
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
V
A
 
A
F
 
C
V
 
A
T
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
A
A
 
V
I
 
L
E
 
S
T
 
V
Y
 
V
W
 
-
K
 
-
D
 
D
D
 
D
A
 
A
F
 
F
E
 
C
K
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
L
I
 
F
H
 
K
E
 
E
R
 
L
T
 
L
Q
 
A
A
 
K
I
 
V
V
 
-
N
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
D
G
 
G
N
 
V
F
 
V
T
 
D
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
L
M
 
M
R
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
-
C
 
V
V
 
L
S
 
E
G
 
R
E
 
D
L
 
V
A
 
A
G
 
K
K
 
Q
I
 
A
T
 
V
K
 
L
K
 
D
C
 
G
F
 
F
Q
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
V
M
 
I
I
 
L
E
 
N
T
 
A
S
 
P
G
 
A
A
 
-
D
 
-
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
V
 
I
K
 
R
F
 
L
L
 
T
C
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
T
D
 
D
E
 
E
D
 
E
L
 
I
K
 
A
Q
 
D
G
 
A
I
 
V
D
 
K
I
 
A
L
 
I
E
 
A
R
 
E
A
 
T
I
 
I

1wkhA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
34% identity, 90% coverage: 24:417/437 of query aligns to 25:387/387 of 1wkhA

query
sites
1wkhA
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
L
 
V
F
 
W
D
 
D
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
K
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
C
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
x
Y
G
 
G
T
 
V
L
 
A
N
 
N
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
G
N
 
N
P
 
P
I
 
E
F
 
V
K
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
-
V
 
V
E
 
K
Y
 
R
I
 
Q
L
 
A
E
 
E
D
 
T
G
 
L
I
 
M
T
 
A
H
 
M
G
 
P
L
 
Q
D
 
T
M
 
L
H
 
P
T
 
T
K
 
P
A
 
M
K
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
Y
E
 
R
V
 
T
F
 
L
K
 
T
K
 
A
H
 
-
I
 
I
L
 
L
E
 
P
P
 
P
R
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
E
Y
 
L
M
 
N
V
 
R
Q
 
V
F
 
F
T
 
P
G
 
V
P
 
N
T
x
S
G
|
G
T
|
T
N
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
N
 
A
V
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
K
N
 
K
I
 
F
I
 
V
S
 
A
F
 
A
T
 
M
N
 
R
G
 
G
F
|
F
H
x
S
G
 
G
C
 
R
S
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
W
N
 
E
S
 
P
H
 
K
H
 
Y
R
 
R
G
 
-
A
 
E
A
 
P
G
 
F
T
 
L
S
 
P
L
 
L
G
 
V
A
 
E
G
 
P
V
 
V
S
 
E
T
 
F
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
N
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
D
T
 
V
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
R
V
 
A
L
 
V
S
 
D
D
 
E
S
 
E
S
 
T
S
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
T
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
R
A
 
P
A
 
A
S
 
T
F
 
P
G
 
E
W
 
F
L
 
L
Q
 
R
N
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
E
V
 
I
C
 
T
K
 
Q
K
 
E
H
 
K
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
D
 
E
I
|
I
Q
|
Q
A
 
T
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
F
 
R
F
 
F
S
 
A
F
 
F
E
 
E
D
 
H
A
 
F
G
 
G
I
 
I
K
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
V
 
L
T
 
T
M
 
L
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
L
S
 
G
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
A
L
 
V
M
 
M
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
A
E
 
R
W
 
S
K
 
M
P
 
P
-
 
K
G
 
G
E
 
G
H
 
H
N
 
G
G
 
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
M
V
 
A
T
 
A
A
 
G
K
 
V
V
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
R
T
 
Y
Y
 
L
W
 
E
K
 
R
D
 
T
D
 
R
A
 
L
F
 
W
E
 
E
K
 
R
E
 
A
I
 
A
K
 
E
R
 
-
K
 
L
G
 
G
E
 
P
Y
 
W
I
 
F
H
 
M
E
 
E
R
 
K
T
 
L
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
P
N
 
S
E
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
P
G
 
K
N
 
I
F
 
R
T
 
E
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
M
 
L
M
 
M
R
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
E
C
 
-
V
 
L
S
 
K
G
 
E
E
 
K
L
 
A
A
 
A
G
 
P
K
 
Y
I
 
I
T
 
A
K
 
R
K
 
L
C
 
E
F
 
K
Q
 
E
N
 
H
G
 
R
L
 
V
M
 
L
I
 
A
E
 
L
T
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
-
D
 
-
D
 
P
Q
 
T
V
 
V
V
 
I
K
x
R
F
 
F
L
 
L
C
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
E
D
 
K
E
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
R
G
 
V
I
 
V
D
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
I
 
V
R
 
R
D
 
A
V
 
V
C
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1wkgA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
34% identity, 90% coverage: 24:417/437 of query aligns to 25:387/387 of 1wkgA

query
sites
1wkgA
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
L
 
V
F
 
W
D
 
D
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
K
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
C
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
x
Y
G
 
G
T
 
V
L
 
A
N
 
N
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
G
N
 
N
P
 
P
I
 
E
F
 
V
K
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
-
V
 
V
E
 
K
Y
 
R
I
 
Q
L
 
A
E
 
E
D
 
T
G
 
L
I
 
M
T
 
A
H
 
M
G
 
P
L
 
Q
D
 
T
M
 
L
H
 
P
T
 
T
K
 
P
A
 
M
K
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
Y
E
 
R
V
 
T
F
 
L
K
 
T
K
 
A
H
 
-
I
 
I
L
 
L
E
 
P
P
 
P
R
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
E
Y
 
L
M
 
N
V
 
R
Q
 
V
F
 
F
T
 
P
G
 
V
P
 
N
T
 
S
G
|
G
T
|
T
N
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
N
 
A
V
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
K
N
 
K
I
 
F
I
 
V
S
 
A
F
 
A
T
 
M
N
 
R
G
 
G
F
|
F
H
x
S
G
 
G
C
x
R
S
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
W
N
 
E
S
 
P
H
 
K
H
 
Y
R
 
R
G
 
-
A
 
E
A
 
P
G
 
F
T
 
L
S
 
P
L
 
L
G
 
V
A
 
E
G
 
P
V
 
V
S
 
E
T
 
F
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
N
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
D
T
 
V
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
R
V
 
A
L
 
V
S
 
D
D
 
E
S
 
E
S
 
T
S
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
T
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
R
A
 
P
A
 
A
S
 
T
F
 
P
G
 
E
W
 
F
L
 
L
Q
 
R
N
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
E
V
 
I
C
 
T
K
 
Q
K
 
E
H
 
K
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
D
 
E
I
|
I
Q
|
Q
A
 
T
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
F
 
R
F
 
F
S
 
A
F
 
F
E
 
E
D
 
H
A
 
F
G
 
G
I
 
I
K
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
V
 
L
T
 
T
M
 
L
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
L
S
 
G
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
A
L
 
V
M
 
M
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
A
E
 
R
W
 
S
K
 
M
P
 
P
-
 
K
G
 
G
E
 
G
H
 
H
N
x
G
G
x
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
M
V
 
A
T
 
A
A
 
G
K
 
V
V
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
R
T
 
Y
Y
 
L
W
 
E
K
 
R
D
 
T
D
 
R
A
 
L
F
 
W
E
 
E
K
 
R
E
 
A
I
 
A
K
 
E
R
 
-
K
 
L
G
 
G
E
 
P
Y
 
W
I
 
F
H
 
M
E
 
E
R
 
K
T
 
L
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
P
N
 
S
E
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
P
G
 
K
N
 
I
F
 
R
T
 
E
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
M
 
L
M
 
M
R
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
E
C
 
-
V
 
L
S
 
K
G
 
E
E
 
K
L
 
A
A
 
A
G
 
P
K
 
Y
I
 
I
T
 
A
K
 
R
K
 
L
C
 
E
F
 
K
Q
 
E
N
 
H
G
 
R
L
 
V
M
 
L
I
 
A
E
 
L
T
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
-
D
 
-
D
 
P
Q
 
T
V
 
V
V
 
I
K
x
R
F
 
F
L
 
L
C
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
E
D
 
K
E
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
R
G
 
V
I
 
V
D
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
I
 
V
R
 
R
D
 
A
V
 
V
C
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1vefA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
34% identity, 90% coverage: 24:417/437 of query aligns to 25:387/387 of 1vefA

query
sites
1vefA
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
L
 
V
F
 
W
D
 
D
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
K
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
C
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
V
L
 
A
N
 
N
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
G
N
 
N
P
 
P
I
 
E
F
 
V
K
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
-
V
 
V
E
 
K
Y
 
R
I
 
Q
L
 
A
E
 
E
D
 
T
G
 
L
I
 
M
T
 
A
H
 
M
G
 
P
L
 
Q
D
 
T
M
 
L
H
 
P
T
 
T
K
 
P
A
 
M
K
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
Y
E
 
R
V
 
T
F
 
L
K
 
T
K
 
A
H
 
-
I
 
I
L
 
L
E
 
P
P
 
P
R
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
E
Y
 
L
M
 
N
V
 
R
Q
 
V
F
 
F
T
 
P
G
 
V
P
 
N
T
 
S
G
|
G
T
|
T
N
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
N
 
A
V
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
K
N
 
K
I
 
F
I
 
V
S
 
A
F
 
A
T
 
M
N
 
R
G
 
G
F
|
F
H
x
S
G
 
G
C
 
R
S
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
W
N
 
E
S
 
P
H
 
K
H
 
Y
R
 
R
G
 
-
A
 
E
A
 
P
G
 
F
T
 
L
S
 
P
L
 
L
G
 
V
A
 
E
G
 
P
V
 
V
S
 
E
T
 
F
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
N
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
D
T
 
V
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
R
V
 
A
L
 
V
S
 
D
D
 
E
S
 
E
S
 
T
S
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
T
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
R
A
 
P
A
 
A
S
 
T
F
 
P
G
 
E
W
 
F
L
 
L
Q
 
R
N
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
E
V
 
I
C
 
T
K
 
Q
K
 
E
H
 
K
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
D
 
E
I
|
I
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
F
 
R
F
 
F
S
 
A
F
 
F
E
 
E
D
 
H
A
 
F
G
 
G
I
 
I
K
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
V
 
L
T
 
T
M
 
L
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
L
S
 
G
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
A
L
 
V
M
 
M
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
A
E
 
R
W
 
S
K
 
M
P
 
P
-
 
K
G
 
G
E
 
G
H
 
H
N
 
G
G
 
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
M
V
 
A
T
 
A
A
 
G
K
 
V
V
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
R
T
 
Y
Y
 
L
W
 
E
K
 
R
D
 
T
D
 
R
A
 
L
F
 
W
E
 
E
K
 
R
E
 
A
I
 
A
K
 
E
R
 
-
K
 
L
G
 
G
E
 
P
Y
 
W
I
 
F
H
 
M
E
 
E
R
 
K
T
 
L
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
P
N
 
S
E
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
P
G
 
K
N
 
I
F
 
R
T
 
E
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
M
 
L
M
 
M
R
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
E
C
 
-
V
 
L
S
 
K
G
 
E
E
 
K
L
 
A
A
 
A
G
 
P
K
 
Y
I
 
I
T
 
A
K
 
R
K
 
L
C
 
E
F
 
K
Q
 
E
N
 
H
G
 
R
L
 
V
M
 
L
I
 
A
E
 
L
T
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
-
D
 
-
D
 
P
Q
 
T
V
 
V
V
 
I
K
x
R
F
 
F
L
 
L
C
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
E
D
 
K
E
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
R
G
 
V
I
 
V
D
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
I
 
V
R
 
R
D
 
A
V
 
V
C
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q5SHH5 [LysW]-aminoadipate semialdehyde transaminase; EC 2.6.1.118 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
34% identity, 90% coverage: 24:417/437 of query aligns to 33:395/395 of Q5SHH5

query
sites
Q5SHH5
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
L
 
V
F
 
W
D
 
D
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
K
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
C
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
V
L
 
A
N
 
N
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
G
N
 
N
P
 
P
I
 
E
F
 
V
K
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
-
V
 
V
E
 
K
Y
 
R
I
 
Q
L
 
A
E
 
E
D
 
T
G
 
L
I
 
M
T
 
A
H
 
M
G
 
P
L
 
Q
D
 
T
M
 
L
H
 
P
T
 
T
K
 
P
A
 
M
K
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
Y
E
 
R
V
 
T
F
 
L
K
 
T
K
 
A
H
 
-
I
 
I
L
 
L
E
 
P
P
 
P
R
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
E
Y
 
L
M
 
N
V
 
R
Q
 
V
F
 
F
T
 
P
G
 
V
P
 
N
T
 
S
G
|
G
T
|
T
N
 
E
A
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
N
 
A
V
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
K
N
 
K
I
 
F
I
 
V
S
 
A
F
 
A
T
 
M
N
 
R
G
 
G
F
 
F
H
 
S
G
 
G
C
 
R
S
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
W
N
 
E
S
 
P
H
 
K
H
 
Y
R
 
R
G
 
-
A
 
E
A
 
P
G
 
F
T
 
L
S
 
P
L
 
L
G
 
V
A
 
E
G
 
P
V
 
V
S
 
E
T
 
F
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
N
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
D
T
 
V
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
R
V
 
A
L
 
V
S
 
D
D
 
E
S
 
E
S
 
T
S
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
R
A
 
P
A
 
A
S
 
T
F
 
P
G
 
E
W
 
F
L
 
L
Q
 
R
N
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
E
V
 
I
C
 
T
K
 
Q
K
 
E
H
 
K
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
D
D
 
E
I
 
I
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
F
 
R
F
 
F
S
 
A
F
 
F
E
 
E
D
 
H
A
 
F
G
 
G
I
 
I
K
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
V
 
L
T
 
T
M
 
L
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
L
S
 
G
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
L
A
 
G
V
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
A
E
 
R
W
 
S
K
 
M
P
 
P
-
 
K
G
 
G
E
 
G
H
 
H
N
 
G
G
 
T
T
|
T
F
 
F
R
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
M
V
 
A
T
 
A
A
 
G
K
 
V
V
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
R
T
 
Y
Y
 
L
W
 
E
K
 
R
D
 
T
D
 
R
A
 
L
F
 
W
E
 
E
K
 
R
E
 
A
I
 
A
K
 
E
R
 
-
K
 
L
G
 
G
E
 
P
Y
 
W
I
 
F
H
 
M
E
 
E
R
 
K
T
 
L
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
P
N
 
S
E
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
P
G
 
K
N
 
I
F
 
R
T
 
E
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
M
 
L
M
 
M
R
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
E
C
 
-
V
 
L
S
 
K
G
 
E
E
 
K
L
 
A
A
 
A
G
 
P
K
 
Y
I
 
I
T
 
A
K
 
R
K
 
L
C
 
E
F
 
K
Q
 
E
N
 
H
G
 
R
L
 
V
M
 
L
I
 
A
E
 
L
T
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
-
D
 
-
D
 
P
Q
 
T
V
 
V
V
 
I
K
 
R
F
 
F
L
 
L
C
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
E
D
 
K
E
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
R
G
 
V
I
 
V
D
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
I
 
V
R
 
R
D
 
A
V
 
V
C
 
L
A
 
A

3nx3A Crystal structure of acetylornithine aminotransferase (argd) from campylobacter jejuni
30% identity, 92% coverage: 11:413/437 of query aligns to 5:386/388 of 3nx3A

query
sites
3nx3A
V
 
I
Q
 
P
S
 
T
Y
 
Y
A
 
K
R
 
R
S
 
-
F
 
F
P
 
D
R
 
I
V
 
V
F
 
L
H
 
E
R
 
K
A
 
G
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
D
 
D
Q
 
D
E
 
K
G
 
A
N
 
K
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
S
A
 
S
G
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
V
L
 
C
N
 
A
Y
 
L
G
 
G
H
 
Y
N
 
N
N
 
H
P
 
A
I
 
K
F
 
F
K
 
N
E
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
K
E
 
A
Y
 
Q
I
 
V
L
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
K
I
 
L
T
 
L
H
 
H
G
 
T
L
 
S
D
 
N
M
 
L
H
 
Y
T
 
Y
K
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
N
E
 
E
F
 
N
L
 
I
E
 
A
V
 
A
F
 
A
K
 
A
K
 
K
H
 
N
I
 
L
L
 
A
E
 
K
P
 
A
R
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
R
M
 
V
V
 
-
Q
 
-
F
 
F
T
 
F
G
 
T
P
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
N
 
E
A
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
M
K
 
K
L
 
T
A
 
A
R
 
R
N
 
K
V
 
Y
T
 
A
G
 
F
R
 
N
E
 
K
N
 
G
I
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
F
I
 
I
S
 
A
F
 
F
T
 
K
N
 
H
G
 
S
F
|
F
H
 
H
G
 
G
C
 
R
S
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
L
T
 
T
G
 
A
N
 
N
S
 
E
H
 
K
H
 
Y
R
 
Q
G
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
K
S
 
P
L
 
F
G
 
K
A
 
P
G
 
L
V
 
I
S
 
S
T
 
G
V
 
V
P
 
K
F
 
F
D
 
A
G
 
K
Y
 
Y
L
 
-
G
 
-
D
 
N
G
 
D
I
 
I
E
 
S
T
 
S
T
 
V
E
 
E
Y
 
K
L
 
L
D
 
V
K
 
N
V
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
E
T
 
K
P
 
T
A
 
C
A
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
L
E
|
E
T
 
S
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
A
 
P
A
 
A
S
x
N
F
 
K
G
 
D
W
x
F
L
 
Y
Q
 
K
N
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
K
V
 
L
C
 
C
K
 
D
K
 
E
H
 
K
G
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
A
D
|
D
D
 
E
I
 
I
Q
|
Q
A
 
C
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
G
T
 
K
F
 
F
F
 
F
S
 
A
F
 
Y
E
 
E
D
 
H
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
K
 
L
P
 
P
D
 
D
I
 
I
V
 
M
T
 
T
M
 
S
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
L
S
 
-
G
 
G
Y
 
C
G
 
G
L
 
L
P
 
S
F
 
V
A
 
G
V
 
A
V
 
F
L
 
V
M
 
I
R
 
N
P
 
Q
E
 
K
L
 
V
-
 
A
-
 
S
D
 
N
E
 
S
W
 
L
K
 
E
P
 
A
G
 
G
E
 
D
H
 
H
N
 
G
G
 
S
T
|
T
F
 
Y
R
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
L
A
 
V
F
 
C
V
 
A
T
 
G
A
 
V
K
 
N
V
 
A
A
 
V
I
 
F
E
 
E
T
 
I
Y
 
F
W
 
K
K
 
E
D
 
E
D
 
K
A
 
I
F
 
L
E
 
E
K
 
-
E
 
N
I
 
V
K
 
N
R
 
K
K
 
L
G
 
T
E
 
P
Y
 
Y
I
 
L
H
 
E
E
 
Q
R
 
S
T
 
L
Q
 
D
A
 
E
I
 
L
V
x
I
N
 
N
E
 
E
F
|
F
G
x
D
E
 
F
G
x
C
N
 
K
F
 
-
T
 
K
L
 
R
Q
 
K
G
 
G
R
 
L
G
 
G
M
 
F
M
 
M
R
 
Q
G
 
G
I
 
L
N
 
S
C
 
L
V
 
D
S
 
K
G
 
S
E
 
V
L
 
K
A
 
V
G
 
A
K
 
K
I
 
V
T
 
I
K
 
Q
K
 
K
C
 
C
F
 
Q
Q
 
E
N
 
N
G
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
E
 
I
T
 
S
S
 
C
G
 
G
A
 
E
D
 
N
D
 
D
Q
 
-
V
 
-
V
 
L
K
x
R
F
 
F
L
 
L
C
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
L
S
x
Q
D
x
K
E
 
E
D
 
H
L
 
I
K
 
D
Q
 
E
G
 
M
I
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
L
E
 
R
R
 
K
A
 
A
I
 
L
R
 
K

1sffA Structure of gamma-aminobutyrate aminotransferase complex with aminooxyacetate (see paper)
31% identity, 92% coverage: 11:410/437 of query aligns to 7:418/425 of 1sffA

query
sites
1sffA
V
 
M
Q
 
Q
S
 
R
Y
 
R
A
 
S
R
 
Q
S
 
A
F
 
I
P
 
P
R
 
R
-
 
G
-
x
V
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
H
-
 
P
V
 
I
F
 
F
-
 
A
H
 
D
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
N
A
 
C
Y
 
R
L
 
V
F
 
W
D
 
D
Q
 
V
E
 
E
G
 
G
N
 
R
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
I
G
 
A
T
 
V
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
G
 
G
H
 
H
N
 
L
N
 
H
P
 
P
I
 
K
F
 
V
K
 
V
E
 
A
K
 
A
L
 
-
V
 
V
E
 
E
Y
 
A
I
 
Q
L
 
L
E
 
K
D
 
K
G
 
-
I
 
L
T
 
S
H
 
H
G
 
T
L
 
C
D
 
-
M
 
F
H
x
Q
T
 
V
K
 
L
A
 
A
K
 
Y
G
 
E
E
 
P
F
 
Y
L
 
L
E
 
E
V
 
L
F
 
C
K
 
E
K
 
I
H
 
M
I
 
N
L
 
Q
E
 
K
P
 
V
R
 
P
G
 
G
L
 
D
E
 
F
Y
 
A
M
 
K
V
 
K
Q
 
T
F
 
L
T
 
L
G
 
V
P
 
T
T
 
T
G
|
G
T
x
S
N
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
N
A
 
A
L
 
V
K
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
V
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
E
 
S
N
 
G
I
 
T
I
 
I
S
 
A
F
 
F
T
 
S
N
 
G
G
 
A
F
x
Y
H
|
H
G
 
G
C
x
R
S
 
T
L
 
H
G
 
Y
A
 
T
L
 
L
S
 
A
V
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
S
 
V
H
x
N
H
 
P
R
 
Y
G
 
-
A
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
M
S
 
G
L
 
L
G
 
M
A
 
P
G
 
G
-
 
H
-
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
V
 
L
S
 
Y
T
 
P
V
 
C
P
 
P
F
 
L
D
 
H
G
 
G
Y
 
I
L
 
S
G
 
E
D
 
D
G
 
-
I
 
-
E
 
D
T
 
A
T
 
I
E
 
A
Y
 
S
L
 
I
D
 
H
K
 
R
V
 
I
L
 
F
S
 
K
D
 
N
S
 
D
S
 
A
S
 
A
G
 
P
V
 
E
D
 
D
T
 
I
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
I
I
 
V
V
 
I
E
|
E
T
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
F
N
 
Y
A
 
A
A
 
S
S
 
S
F
 
P
G
 
A
W
 
F
L
 
M
Q
 
Q
N
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
L
C
 
C
K
 
D
K
 
E
H
 
H
G
 
G
V
 
I
L
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
D
|
D
D
 
E
I
x
V
Q
|
Q
A
 
S
G
 
G
C
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
L
F
 
F
S
 
A
F
 
M
E
 
E
D
 
Q
A
 
M
G
 
G
I
 
V
K
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
L
V
 
T
T
 
T
M
 
F
S
 
A
K
|
K
S
 
S
L
 
I
S
 
A
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
F
P
 
P
F
 
L
A
 
A
V
 
G
V
 
V
L
 
T
M
 
G
R
 
R
P
 
A
E
 
E
-
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
A
W
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
G
H
 
L
N
 
G
G
 
G
T
|
T
F
 
Y
R
 
A
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
C
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
L
V
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
K
T
 
V
Y
 
F
W
 
E
K
 
Q
D
 
E
D
 
N
A
 
L
F
 
L
E
 
Q
K
 
K
E
 
A
I
 
-
K
 
N
R
 
D
K
 
L
G
 
G
E
 
Q
Y
 
K
I
 
L
H
 
K
E
 
D
R
 
G
T
 
L
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
E
E
 
K
F
 
H
G
 
P
E
 
E
G
 
I
N
 
G
F
 
-
T
 
D
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
M
 
A
M
 
M
R
 
I
G
 
A
I
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
D
-
 
H
N
 
N
C
 
K
V
 
P
S
 
D
G
 
A
E
 
K
L
 
L
A
 
T
G
 
A
K
 
E
I
 
I
T
 
V
K
 
A
K
 
R
C
 
A
F
 
R
Q
 
D
N
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
I
I
 
L
E
 
L
T
 
S
S
 
C
G
 
G
A
 
P
D
 
Y
D
x
Y
Q
 
N
V
 
V
V
 
L
K
x
R
F
 
I
L
 
L
C
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
T
I
 
I
S
 
E
D
 
D
E
 
A
D
 
Q
L
 
I
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
S
R
 
Q

1sf2A Structure of e. Coli gamma-aminobutyrate aminotransferase (see paper)
31% identity, 92% coverage: 11:410/437 of query aligns to 7:418/425 of 1sf2A

query
sites
1sf2A
V
 
M
Q
 
Q
S
 
R
Y
 
R
A
 
S
R
 
Q
S
 
A
F
 
I
P
 
P
R
 
R
-
 
G
-
x
V
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
H
-
 
P
V
 
I
F
 
F
-
 
A
H
 
D
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
N
A
 
C
Y
 
R
L
 
V
F
 
W
D
 
D
Q
 
V
E
 
E
G
 
G
N
 
R
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
I
G
 
A
T
 
V
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
G
 
G
H
 
H
N
 
L
N
 
H
P
 
P
I
 
K
F
 
V
K
 
V
E
 
A
K
 
A
L
 
-
V
 
V
E
 
E
Y
 
A
I
 
Q
L
 
L
E
 
K
D
 
K
G
 
-
I
 
L
T
 
S
H
 
H
G
 
T
L
 
C
D
 
-
M
 
F
H
 
Q
T
 
V
K
 
L
A
 
A
K
 
Y
G
 
E
E
 
P
F
 
Y
L
 
L
E
 
E
V
 
L
F
 
C
K
 
E
K
 
I
H
 
M
I
 
N
L
 
Q
E
 
K
P
 
V
R
 
P
G
 
G
L
 
D
E
 
F
Y
 
A
M
 
K
V
 
K
Q
 
T
F
 
L
T
 
L
G
 
V
P
 
T
T
 
T
G
|
G
T
x
S
N
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
N
A
 
A
L
 
V
K
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
V
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
E
 
S
N
 
G
I
 
T
I
 
I
S
 
A
F
 
F
T
 
S
N
 
G
G
 
A
F
x
Y
H
|
H
G
 
G
C
 
R
S
 
T
L
 
H
G
 
Y
A
 
T
L
 
L
S
 
A
V
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
S
 
V
H
x
N
H
 
P
R
 
Y
G
 
-
A
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
M
S
 
G
L
 
L
G
 
M
A
 
P
G
 
G
-
 
H
-
 
V
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
V
 
L
S
 
Y
T
 
P
V
 
C
P
 
P
F
 
L
D
 
H
G
 
G
Y
 
I
L
 
S
G
 
E
D
 
D
G
 
-
I
 
-
E
 
D
T
 
A
T
 
I
E
 
A
Y
 
S
L
 
I
D
 
H
K
 
R
V
 
I
L
 
F
S
 
K
D
 
N
S
 
D
S
 
A
S
 
A
G
 
P
V
 
E
D
 
D
T
 
I
P
 
-
A
 
A
A
 
A
V
 
I
I
 
V
V
 
I
E
|
E
T
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
F
N
 
Y
A
 
A
A
 
S
S
 
S
F
 
P
G
 
A
W
 
F
L
 
M
Q
 
Q
N
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
L
C
 
C
K
 
D
K
 
E
H
 
H
G
 
G
V
 
I
L
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
D
|
D
D
 
E
I
x
V
Q
|
Q
A
 
S
G
 
G
C
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
L
F
 
F
S
 
A
F
 
M
E
 
E
D
 
Q
A
 
M
G
 
G
I
 
V
K
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
L
V
 
T
T
 
T
M
 
F
S
 
A
K
|
K
S
 
S
L
 
I
S
 
A
G
 
G
Y
 
-
G
 
G
L
 
F
P
 
P
F
 
L
A
 
A
V
 
G
V
 
V
L
 
T
M
 
G
R
 
R
P
 
A
E
 
E
-
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
A
W
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
G
H
 
L
N
 
G
G
 
G
T
|
T
F
 
Y
R
 
A
G
 
G
N
 
N
N
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
C
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
L
V
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
K
T
 
V
Y
 
F
W
 
E
K
 
Q
D
 
E
D
 
N
A
 
L
F
 
L
E
 
Q
K
 
K
E
 
A
I
 
-
K
 
N
R
 
D
K
 
L
G
 
G
E
 
Q
Y
 
K
I
 
L
H
 
K
E
 
D
R
 
G
T
 
L
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
E
E
 
K
F
 
H
G
 
P
E
 
E
G
 
I
N
 
G
F
 
-
T
 
D
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
M
 
A
M
 
M
R
 
I
G
 
A
I
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
D
-
 
H
N
 
N
C
 
K
V
 
P
S
 
D
G
 
A
E
 
K
L
 
L
A
 
T
G
 
A
K
 
E
I
 
I
T
 
V
K
 
A
K
 
R
C
 
A
F
 
R
Q
 
D
N
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
I
I
 
L
E
 
L
T
 
S
S
 
C
G
 
G
A
 
P
D
 
Y
D
x
Y
Q
 
N
V
 
V
V
 
L
K
x
R
F
 
I
L
 
L
C
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
T
I
 
I
S
 
E
D
 
D
E
 
A
D
 
Q
L
 
I
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
S
R
 
Q

P22256 4-aminobutyrate aminotransferase GabT; 5-aminovalerate transaminase; GABA aminotransferase; GABA-AT; Gamma-amino-N-butyrate transaminase; GABA transaminase; Glutamate:succinic semialdehyde transaminase; L-AIBAT; EC 2.6.1.19; EC 2.6.1.48 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
31% identity, 92% coverage: 11:410/437 of query aligns to 8:419/426 of P22256

query
sites
P22256
V
 
M
Q
 
Q
S
 
R
Y
 
R
A
 
S
R
 
Q
S
 
A
F
 
I
P
 
P
R
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
H
-
 
P
V
 
I
F
 
F
-
 
A
H
 
D
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
N
A
 
C
Y
 
R
L
 
V
F
 
W
D
 
D
Q
 
V
E
 
E
G
 
G
N
 
R
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
L
 
A
A
 
G
G
 
G
A
x
I
G
 
A
T
 
V
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
G
 
G
H
 
H
N
 
L
N
 
H
P
 
P
I
 
K
F
 
V
K
 
V
E
 
A
K
 
A
L
 
-
V
 
V
E
 
E
Y
 
A
I
 
Q
L
 
L
E
 
K
D
 
K
G
 
-
I
 
L
T
 
S
H
 
H
G
 
T
L
 
C
D
 
-
M
 
F
H
 
Q
T
 
V
K
 
L
A
 
A
K
 
Y
G
 
E
E
 
P
F
 
Y
L
 
L
E
 
E
V
 
L
F
 
C
K
 
E
K
 
I
H
 
M
I
 
N
L
 
Q