SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_111608314.1 NCBI__GCF_003259225.1:WP_111608314.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1eyyA Crystal structure of the NADP+ dependent aldehyde dehydrogenase from vibrio harveyi. (see paper)
47% identity, 96% coverage: 21:526/528 of query aligns to 1:502/504 of 1eyyA

query
sites
1eyyA
T
 
T
Q
 
D
P
 
N
A
 
V
I
 
F
H
 
Y
A
 
A
I
 
T
N
 
N
P
 
A
A
 
F
T
 
T
N
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
L
E
 
P
P
 
L
A
 
A
Y
 
F
H
 
P
G
 
V
G
 
H
T
 
T
K
 
E
A
 
V
D
 
E
V
 
V
E
 
N
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
T
A
 
A
A
 
A
W
 
A
R
 
K
A
 
V
F
 
A
D
 
R
A
 
D
Y
 
F
R
 
R
S
 
R
I
 
L
S
 
N
T
 
N
E
 
S
K
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
R
C
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
S
E
 
E
I
 
L
L
 
E
A
 
A
L
 
R
G
 
S
D
 
D
V
 
D
L
 
I
V
 
I
E
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
H
A
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
E
A
 
V
R
 
R
I
 
L
E
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
I
G
 
A
R
 
R
T
 
T
M
 
A
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
N
L
 
S
G
 
G
K
 
S
A
 
Y
T
 
H
D
 
Q
A
 
A
R
 
I
I
 
L
D
 
D
P
 
T
A
 
P
M
 
N
P
 
P
D
 
T
R
 
R
T
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
K
S
 
P
D
 
D
L
 
I
R
 
R
F
 
R
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
A
S
|
S
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
K
|
K
A
 
G
H
|
H
S
x
T
A
 
A
H
 
H
P
 
P
G
 
G
T
 
T
S
 
S
E
 
Q
L
 
I
V
 
V
G
 
A
R
 
E
A
 
C
V
 
I
T
 
E
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
K
 
K
K
 
Q
C
 
E
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
Q
G
 
A
V
 
I
F
 
F
S
 
T
L
 
L
L
 
L
Y
 
Q
G
 
G
S
 
N
G
 
Q
R
|
R
E
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
S
H
 
H
S
 
P
S
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
R
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
F
N
 
N
I
 
L
A
 
A
A
 
H
N
 
E
R
 
R
P
 
P
E
 
E
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
F
Y
 
Y
A
 
G
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
A
I
 
I
N
 
N
P
 
P
V
 
T
F
 
F
I
 
I
M
 
F
P
 
P
N
 
S
K
 
A
L
 
M
T
 
R
N
 
A
D
 
K
A
 
A
P
 
-
A
 
D
V
 
L
A
 
A
K
 
D
G
 
Q
F
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
M
A
 
T
M
 
M
G
 
G
A
 
C
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
C
|
C
T
 
T
N
 
K
P
 
P
G
 
G
M
 
V
V
 
V
V
 
F
L
 
A
L
 
L
K
 
N
G
 
T
E
 
P
A
 
E
A
 
T
D
 
Q
R
 
A
F
 
F
K
 
I
A
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
Q
S
 
S
E
 
L
V
 
I
Q
 
R
A
 
Q
L
 
Q
G
 
S
T
 
P
Q
 
S
T
 
T
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
Y
 
R
Q
 
D
A
 
S
Y
 
Y
C
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
-
N
 
-
S
 
-
A
 
Q
T
 
S
Q
 
Q
L
 
V
L
 
V
A
 
S
K
 
R
G
 
G
N
 
S
D
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
F
S
 
S
D
 
Q
Q
 
A
P
 
E
N
 
S
Q
 
P
C
 
C
C
 
V
P
 
A
H
 
S
-
 
A
V
 
L
F
 
F
A
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
S
K
 
E
A
 
N
F
 
W
L
 
R
A
 
K
D
 
H
A
 
P
S
 
A
M
 
W
E
 
E
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
S
 
P
T
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
I
 
V
E
 
V
C
 
C
D
 
E
T
 
N
L
 
V
E
 
A
E
 
D
Y
 
M
K
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
S
E
 
E
H
 
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
I
Q
 
H
M
 
A
S
 
T
D
 
E
A
 
E
D
 
D
V
 
Y
E
 
P
A
 
Q
V
 
V
R
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
P
 
P
T
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
E
K
 
I
V
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
L
 
V
C
 
F
N
 
N
G
 
G
Y
 
W
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
E
V
 
V
C
 
G
H
 
Y
S
 
A
M
 
M
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
A
 
A
T
 
S
S
 
T
D
 
H
S
 
S
R
 
A
S
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
H
R
 
R
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
C
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
D
 
A
F
 
L
P
 
P
S
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
S
I
 
L
Q
 
K
D
 
A
K
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
L
N
 
E
V
 
I
P
 
A
Q
 
R
L
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
K

4cazA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa in complex with nadh
29% identity, 61% coverage: 11:334/528 of query aligns to 8:312/489 of 4cazA

query
sites
4cazA
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
A
 
G
G
 
G
N
 
R
D
 
Y
I
 
V
T
 
E
G
 
A
T
 
S
Q
 
S
P
 
G
A
 
A
-
 
T
I
 
F
H
 
E
A
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
N
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
A
P
 
K
A
 
V
Y
 
Q
H
 
R
G
 
A
G
 
-
T
 
S
K
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
S
 
Q
A
 
S
A
 
A
W
 
V
R
 
E
A
 
G
F
 
Q
D
 
K
A
 
V
Y
 
W
R
 
A
S
 
A
I
 
M
S
 
T
T
 
A
E
 
M
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
A
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
C
 
R
I
 
A
A
 
V
D
 
D
E
 
I
I
 
L
L
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
V
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
A
R
 
L
A
 
E
M
 
T
A
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
T
E
 
R
G
 
S
E
 
V
R
 
D
G
 
I
R
 
V
T
 
T
M
 
G
G
 
A
Q
 
D
-
 
V
L
 
L
R
 
E
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
A
M
 
I
P
 
E
-
 
G
D
 
E
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
P
 
R
R
 
E
S
 
T
D
 
S
L
 
F
R
 
V
F
 
Y
-
 
T
Q
 
R
K
 
R
I
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
G
F
x
I
G
|
G
A
 
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
L
G
 
W
D
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
x
E
A
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
K
V
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
I
V
 
Y
T
 
T
A
 
E
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
I
 
V
G
|
G
S
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
A
 
E
H
 
H
S
 
P
S
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
R
 
T
S
 
S
G
x
T
G
 
G
V
 
K
A
 
K
L
x
V
M
 
M
N
 
-
I
 
A
A
 
S
A
 
A
N
 
S
R
 
S
P
 
S
E
 
S
P
 
L
I
 
K
P
 
E
V
 
V
Y
 
T
A
 
M
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
F
 
I
I
 
I
M
 
F
P
 
P
N
 
D
K
 
A
L
 
D
T
 
L
N
 
D
D
 
R
A
 
A
P
 
A
A
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
V
A
 
M
S
 
A
L
 
N
A
 
F
M
 
F
G
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
G
G
 
T
M
 
R
V
 
V
V
 
F
L
 
I
L
 
H
K
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
D
 
-
R
 
R
F
 
F
K
 
E
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
L
S
 
E
E
 
R
V
 
V
Q
 
Q
A
 
R
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2woxA Betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with NAD(p) h-catalytic thiol adduct. (see paper)
29% identity, 61% coverage: 11:334/528 of query aligns to 8:312/489 of 2woxA

query
sites
2woxA
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
A
 
G
G
 
G
N
 
R
D
 
Y
I
 
V
T
 
E
G
 
A
T
 
S
Q
 
S
P
 
G
A
 
A
-
 
T
I
 
F
H
 
E
A
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
N
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
A
P
 
K
A
 
V
Y
 
Q
H
 
R
G
 
A
G
 
-
T
 
S
K
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
S
 
Q
A
 
S
A
 
A
W
 
V
R
 
E
A
 
G
F
 
Q
D
 
K
A
 
V
Y
 
W
R
 
A
S
 
A
I
 
M
S
 
T
T
 
A
E
 
M
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
A
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
C
 
R
I
 
A
A
 
V
D
 
D
E
 
I
I
 
L
L
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
V
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
A
R
 
L
A
 
E
M
 
T
A
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
T
E
 
R
G
 
S
E
 
V
R
 
D
G
 
I
R
 
V
T
 
T
M
 
G
G
 
A
Q
 
D
-
 
V
L
 
L
R
 
E
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
A
M
 
I
P
 
E
-
 
G
D
 
E
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
P
 
R
R
 
E
S
 
T
D
 
S
L
 
F
R
 
V
F
 
Y
-
 
T
Q
 
R
K
 
R
I
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
G
F
x
I
G
|
G
A
 
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
L
G
 
W
D
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
x
E
A
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
K
V
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
I
V
 
Y
T
 
T
A
 
E
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
I
 
V
G
|
G
S
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
A
 
E
H
 
H
S
 
P
S
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
R
 
T
S
 
S
G
x
T
G
 
G
V
 
K
A
 
K
L
x
V
M
 
M
N
 
-
I
 
A
A
 
S
A
 
A
N
 
S
R
 
S
P
 
S
E
 
S
P
 
L
I
 
K
P
 
E
V
 
V
Y
 
T
A
 
M
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
F
 
I
I
 
I
M
 
F
P
 
P
N
 
D
K
 
A
L
 
D
T
 
L
N
 
D
D
 
R
A
 
A
P
 
A
A
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
V
A
 
M
S
 
A
L
 
N
A
 
F
M
 
F
G
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
G
G
 
T
M
 
R
V
 
V
V
 
F
L
 
I
L
 
H
K
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
D
 
-
R
 
R
F
 
F
K
 
E
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
L
S
 
E
E
 
R
V
 
V
Q
 
Q
A
 
R
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2wmeA Crystallographic structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
29% identity, 61% coverage: 11:334/528 of query aligns to 8:312/489 of 2wmeA

query
sites
2wmeA
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
A
 
G
G
 
G
N
 
R
D
 
Y
I
 
V
T
 
E
G
 
A
T
 
S
Q
 
S
P
 
G
A
 
A
-
 
T
I
 
F
H
 
E
A
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
N
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
A
P
 
K
A
 
V
Y
 
Q
H
 
R
G
 
A
G
 
-
T
 
S
K
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
S
 
Q
A
 
S
A
 
A
W
 
V
R
 
E
A
 
G
F
 
Q
D
 
K
A
 
V
Y
 
W
R
 
A
S
 
A
I
 
M
S
 
T
T
 
A
E
 
M
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
A
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
C
 
R
I
 
A
A
 
V
D
 
D
E
 
I
I
 
L
L
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
V
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
A
R
 
L
A
 
E
M
 
T
A
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
T
E
 
R
G
 
S
E
 
V
R
 
D
G
 
I
R
 
V
T
 
T
M
 
G
G
 
A
Q
 
D
-
 
V
L
 
L
R
 
E
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
A
M
 
I
P
 
E
-
 
G
D
 
E
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
P
 
R
R
 
E
S
 
T
D
 
S
L
 
F
R
 
V
F
 
Y
-
 
T
Q
 
R
K
 
R
I
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
G
F
 
I
G
|
G
A
 
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
L
G
 
W
D
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
x
E
A
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
K
V
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
I
V
 
Y
T
 
T
A
 
E
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
I
 
V
G
|
G
S
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
A
 
E
H
 
H
S
 
P
S
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
R
 
T
S
 
S
G
x
T
G
 
G
V
 
K
A
 
K
L
x
V
M
 
M
N
 
-
I
 
A
A
 
S
A
 
A
N
 
S
R
 
S
P
 
S
E
 
S
P
 
L
I
 
K
P
 
E
V
 
V
Y
 
T
A
 
M
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
F
 
I
I
 
I
M
 
F
P
 
P
N
 
D
K
 
A
L
 
D
T
 
L
N
 
D
D
 
R
A
 
A
P
 
A
A
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
V
A
 
M
S
 
A
L
 
N
A
 
F
M
 
F
G
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
G
G
 
T
M
 
R
V
 
V
V
 
F
L
 
I
L
 
H
K
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
D
 
-
R
 
R
F
 
F
K
 
E
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
L
S
 
E
E
 
R
V
 
V
Q
 
Q
A
 
R
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Q9HTJ1 NAD/NADP-dependent betaine aldehyde dehydrogenase; BADH; EC 1.2.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
29% identity, 61% coverage: 11:334/528 of query aligns to 9:313/490 of Q9HTJ1

query
sites
Q9HTJ1
L
 
L
L
 
Y
V
 
I
A
 
G
G
 
G
N
 
R
D
 
Y
I
 
V
T
 
E
G
 
A
T
 
S
Q
 
S
P
 
G
A
 
A
-
 
T
I
 
F
H
 
E
A
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
N
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
A
P
 
K
A
 
V
Y
 
Q
H
 
R
G
 
A
G
 
-
T
 
S
K
 
R
A
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
S
 
Q
A
 
S
A
 
A
W
 
V
R
 
E
A
 
G
F
 
Q
D
 
K
A
 
V
Y
 
W
R
 
A
S
 
A
I
 
M
S
 
T
T
 
A
E
 
M
K
 
Q
R
 
R
A
 
S
A
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
C
 
R
I
 
A
A
 
V
D
 
D
E
 
I
I
 
L
L
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
V
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
A
R
 
L
A
 
E
M
 
T
A
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
T
E
 
R
G
 
S
E
 
V
R
 
D
G
 
I
R
 
V
T
 
T
M
 
G
G
 
A
Q
 
D
-
 
V
L
 
L
R
 
E
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
A
M
 
I
P
 
E
-
 
G
D
 
E
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
P
 
R
R
 
E
S
 
T
D
 
S
L
 
F
R
 
V
F
 
Y
-
 
T
Q
 
R
K
 
R
I
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
G
F
 
I
G
|
G
A
|
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
L
G
 
W
D
x
K
T
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
A
x
P
H
x
S
S
x
E
A
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
K
V
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
I
V
 
Y
T
 
T
A
 
E
A
 
A
V
 
-
K
 
-
K
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
A
 
E
H
 
H
S
 
P
S
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
x
G
R
x
T
S
|
S
G
x
T
G
 
G
V
 
K
A
 
K
L
 
V
M
 
M
N
 
-
I
 
A
A
 
S
A
 
A
N
 
S
R
 
S
P
 
S
E
 
S
P
 
L
I
 
K
P
 
E
V
 
V
Y
 
T
A
 
M
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
F
 
I
I
 
I
M
 
F
P
 
P
N
 
D
K
 
A
L
 
D
T
 
L
N
 
D
D
 
R
A
 
A
P
 
A
A
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
V
A
 
M
S
 
A
L
 
N
A
 
F
M
 
F
G
 
S
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
G
G
 
T
M
 
R
V
 
V
V
 
F
L
 
I
L
 
H
K
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
D
 
-
R
 
R
F
 
F
K
 
E
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
L
S
 
E
E
 
R
V
 
V
Q
 
Q
A
 
R
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3ty7B Crystal structure of aldehyde dehydrogenase family protein from staphylococcus aureus
27% identity, 75% coverage: 19:413/528 of query aligns to 17:396/454 of 3ty7B

query
sites
3ty7B
T
 
S
G
 
N
T
 
S
Q
 
N
P
 
E
A
 
T
I
 
I
H
 
E
A
 
V
I
|
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
N
 
E
E
 
E
T
 
V
L
 
I
E
 
G
P
 
K
A
 
V
Y
 
A
H
 
K
G
 
G
G
 
-
T
 
N
K
 
K
A
 
A
D
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
A
W
 
D
R
 
D
A
 
V
F
 
Y
D
 
L
A
 
E
Y
 
F
R
 
R
S
 
H
I
 
T
S
 
S
T
 
V
E
 
K
K
 
E
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
F
 
L
L
 
L
E
 
D
C
 
K
I
 
I
A
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
 
E
A
 
N
L
 
R
G
 
K
D
 
D
V
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
R
 
A
A
 
I
M
 
T
A
 
D
E
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
P
K
 
L
A
 
S
R
 
L
I
 
S
E
 
E
G
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
V
M
 
H
G
 
Y
Q
 
Q
L
 
M
R
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
G
V
 
L
V
 
N
R
 
H
L
 
F
G
 
V
K
 
A
A
 
A
T
 
R
D
 
D
A
 
A
R
 
L
I
 
D
D
 
N
P
 
Y
A
 
E
M
 
F
P
 
E
D
 
E
R
 
R
T
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
R
S
 
G
D
 
D
L
 
D
R
 
L
F
 
V
Q
 
V
K
 
K
I
 
E
A
 
A
L
 
I
G
 
G
P
 
V
V
 
S
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
 
T
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
T
A
 
-
F
 
-
S
 
N
V
 
Q
A
 
T
G
 
S
G
 
L
D
 
K
T
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
L
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
A
x
E
H
 
T
P
 
P
G
 
F
T
 
A
S
 
A
E
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
I
V
 
F
T
 
D
A
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
K
C
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
N
G
 
G
S
 
D
G
 
G
R
 
A
E
 
G
I
 
V
G
 
G
S
 
N
A
 
P
L
 
L
V
 
S
A
 
E
H
 
H
S
 
P
S
 
K
I
 
V
K
 
R
A
 
M
V
 
M
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
G
S
 
P
G
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
K
L
 
I
M
 
M
N
 
E
I
 
K
A
 
A
A
 
A
N
 
K
R
 
D
P
 
F
E
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
V
 
L
Y
 
-
A
 
-
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
Y
F
 
I
I
 
V
M
 
L
P
 
D
N
 
D
K
 
V
L
 
-
T
 
-
N
 
-
D
 
D
A
 
I
P
 
K
A
 
E
V
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
A
F
 
T
V
 
T
A
 
G
S
 
K
L
 
V
A
 
V
M
 
N
G
 
N
A
 
T
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
-
P
 
A
G
 
G
M
 
T
V
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
V
K
 
P
G
 
N
E
 
K
A
 
I
A
 
K
D
 
D
R
 
A
F
 
F
K
 
L
A
 
A
T
 
E
V
 
L
A
 
K
S
 
E
E
 
Q
V
 
F
Q
 
S
A
 
Q
L
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
D
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
T
 
-
M
 
-
L
 
V
T
 
G
P
 
P
G
 
I
I
 
I
Y
 
S
Q
 
K
A
 
K
Y
 
Q
C
 
F
D
 
D
G
 
Q
V
 
V
E
 
Q
K
 
N
L
 
Y
N
 
I
N
 
N
N
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
E
S
 
E
A
 
G
T
 
A
Q
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
Y
K
 
G
G
 
G
N
 
-
D
 
-
S
 
P
D
 
G
Q
 
K
P
 
P
N
 
E
Q
 
G
C
 
L
C
 
E
P
 
K
H
 
G
V
 
Y
F
 
F
A
 
A
T
 
R
S
 
P
A
 
T
K
 
I
A
 
F
F
 
I
L
 
N
A
 
V
D
 
D
A
 
N
S
 
Q
M
 
M
-
 
T
-
 
I
-
 
A
E
 
Q
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
S
 
P
T
 
V
S
 
M
L
 
S
I
 
V
I
 
I
E
 
T
C
 
Y
D
 
N
T
 
D
L
 
L
E
 
D
E
 
E

5u0mA Fatty aldehyde dehydrogenase from marinobacter aquaeolei vt8 and cofactor complex (see paper)
29% identity, 61% coverage: 7:327/528 of query aligns to 2:301/488 of 5u0mA

query
sites
5u0mA
L
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
N
L
 
V
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
G
N
 
L
D
 
W
I
 
L
T
 
P
G
 
G
T
 
H
Q
 
G
P
 
A
A
 
P
I
 
F
H
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Q
P
 
P
A
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
W
P
 
D
A
 
G
Y
 
-
H
 
N
G
 
A
G
 
A
T
 
S
K
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
R
A
 
E
A
 
A
W
 
R
R
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
L
A
 
A
Y
 
W
R
 
R
S
 
R
I
 
K
S
 
S
T
 
L
E
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
E
C
 
A
I
 
F
A
 
G
D
 
E
E
 
L
I
 
L
L
 
E
A
 
A
L
 
N
G
 
K
D
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
H
R
 
Q
A
 
I
M
 
G
A
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
W
R
 
E
I
 
S
E
 
R
G
 
T
E
 
E
R
 
V
G
 
A
R
 
A
T
 
M
M
 
M
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
R
 
P
L
 
I
F
 
S
A
 
V
G
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
K
A
 
A
M
 
Y
P
 
N
D
 
E
R
 
R
T
 
T
P
 
G
L
 
H
P
 
T
R
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
V
R
 
A
F
 
G
Q
 
G
K
 
H
I
 
A
A
 
V
L
 
L
-
 
R
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
H
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
|
F
G
 
G
A
 
P
S
x
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
G
S
 
H
V
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
G
D
 
H
T
 
I
A
 
V
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
x
E
A
 
L
H
 
T
P
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
G
 
V
R
 
R
A
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
L
V
 
W
K
 
E
K
 
K
C
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
Q
G
 
G
S
 
-
G
 
G
R
 
S
E
 
D
I
 
T
G
|
G
S
 
K
A
 
C
L
 
L
V
 
A
A
 
R
H
 
H
S
 
S
S
 
L
I
 
I
K
 
D
A
 
G
V
 
L
G
 
F
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
R
 
S
S
 
T
G
x
V
G
 
G
V
 
H
A
 
L
L
 
L
M
 
H
N
 
E
I
 
Q
A
 
F
A
 
G
N
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
-
V
 
L
Y
 
A
A
 
L
E
|
E
M
|
M
S
x
G
S
 
G
I
 
N
N
 
N
P
 
P
V
 
L
F
 
I
I
 
V
M
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
Q
L
 
N
T
 
V
N
 
S
D
 
D
A
 
L
P
 
D
A
 
G
V
 
A
A
 
V
K
 
H
G
 
H
F
 
A
V
 
L
A
 
Q
S
 
S
L
 
A
A
 
F
M
 
L
G
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
C
P
 
A
G
 
R
M
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
V
L
 
P
K
 
K
G
 
G
E
 
K
A
 
K
A
 
G
D
 
D
R
 
E
F
 
F
K
 
L
A
 
A
T
 
R
V
 
L

Sites not aligning to the query:

5u0lA X-ray crystal structure of fatty aldehyde dehydrogenase enzymes from marinobacter aquaeolei vt8 complexed with a substrate (see paper)
29% identity, 61% coverage: 7:327/528 of query aligns to 2:301/488 of 5u0lA

query
sites
5u0lA
L
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
N
L
 
V
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
G
N
 
L
D
 
W
I
 
L
T
 
P
G
 
G
T
 
H
Q
 
G
P
 
A
A
 
P
I
 
F
H
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Q
P
 
P
A
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
W
P
 
D
A
 
G
Y
 
-
H
 
N
G
 
A
G
 
A
T
 
S
K
 
L
A
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
R
A
 
E
A
 
A
W
 
R
R
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
L
A
 
A
Y
 
W
R
 
R
S
 
R
I
 
K
S
 
S
T
 
L
E
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
E
C
 
A
I
 
F
A
 
G
D
 
E
E
 
L
I
 
L
L
 
E
A
 
A
L
 
N
G
 
K
D
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
H
R
 
Q
A
 
I
M
 
G
A
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
W
R
 
E
I
 
S
E
 
R
G
 
T
E
 
E
R
 
V
G
 
A
R
 
A
T
 
M
M
 
M
G
 
G
Q
x
K
L
 
I
R
 
P
L
 
I
F
 
S
A
 
V
G
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
K
A
 
A
M
 
Y
P
 
N
D
 
E
R
 
R
T
 
T
P
 
G
L
 
H
P
 
T
R
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
V
R
 
A
F
 
G
Q
 
G
K
 
H
I
 
A
A
 
V
L
 
L
-
 
R
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
H
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
G
S
x
H
V
x
L
A
 
P
G
 
N
G
|
G
D
x
H
T
 
I
A
 
V
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
A
 
L
H
 
T
P
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
G
 
V
R
 
R
A
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
L
V
 
W
K
 
E
K
 
K
C
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
Q
G
 
G
S
 
-
G
 
G
R
 
S
E
 
D
I
 
T
G
 
G
S
 
K
A
 
C
L
 
L
V
 
A
A
 
R
H
 
H
S
 
S
S
 
L
I
 
I
K
 
D
A
 
G
V
 
L
G
 
F
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
S
S
 
T
G
 
V
G
 
G
V
 
H
A
 
L
L
 
L
M
 
H
N
 
E
I
 
Q
A
 
F
A
 
G
N
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
-
V
 
L
Y
 
A
A
 
L
E
|
E
M
 
M
S
 
G
S
 
G
I
 
N
N
 
N
P
 
P
V
 
L
F
 
I
I
 
V
M
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
Q
L
 
N
T
 
V
N
 
S
D
 
D
A
 
L
P
 
D
A
 
G
V
 
A
A
 
V
K
 
H
G
 
H
F
 
A
V
 
L
A
 
Q
S
 
S
L
 
A
A
 
F
M
 
L
G
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
C
P
 
A
G
 
R
M
 
R
V
 
L
V
 
L
L
 
V
L
 
P
K
 
K
G
 
G
E
 
K
A
 
K
A
 
G
D
 
D
R
 
E
F
 
F
K
 
L
A
 
A
T
 
R
V
 
L

Sites not aligning to the query:

5ur2B Crystal structure of proline utilization a (puta) from bdellovibrio bacteriovorus inactivated by n-propargylglycine (see paper)
26% identity, 89% coverage: 28:498/528 of query aligns to 491:945/959 of 5ur2B

query
sites
5ur2B
I
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
S
T
 
Q
N
 
S
E
 
D
T
 
Q
L
 
I
E
 
V
P
 
G
A
 
K
Y
 
I
H
 
Q
G
 
M
G
 
A
T
 
T
K
 
T
A
 
E
D
 
Q
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
V
 
M
S
 
Q
A
 
A
A
 
A
W
 
Q
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
D
 
K
A
 
T
Y
 
W
R
 
K
S
 
N
I
 
V
S
 
P
T
 
C
E
 
E
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
V
E
 
D
C
 
K
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
I
I
 
M
L
 
T
A
 
R
L
 
D
G
 
R
D
 
F
V
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
A
R
 
T
A
 
Q
M
 
V
A
 
L
E
 
E
S
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
W
A
 
A
R
 
E
I
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
D
R
 
I
G
 
G
R
 
E
T
 
A
M
 
I
G
 
D
Q
 
F
L
 
C
R
 
R
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
V
 
H
V
 
M
R
 
R
L
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
E
P
 
L
A
 
Q
M
 
K
P
 
P
D
 
L
R
 
R
T
 
V
P
 
G
-
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
G
S
 
E
D
 
L
L
 
S
R
 
H
F
 
Y
Q
 
I
K
 
Y
I
 
K
A
 
S
L
 
R
G
 
G
P
 
V
V
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
A
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
I
S
 
-
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
M
D
 
V
T
 
T
A
 
A
S
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
G
G
 
N
C
 
T
P
 
V
V
 
V
V
 
M
V
x
K
K
 
P
A
 
A
H
 
E
S
 
Q
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
S
E
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
A
R
 
W
A
 
G
V
 
L
T
 
M
A
 
K
A
 
M
V
 
I
K
 
Q
K
 
E
C
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
F
L
 
L
Y
 
P
G
 
G
S
 
Y
G
 
G
R
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
Y
L
 
I
V
 
V
A
 
N
H
 
H
S
 
K
S
 
Y
I
 
T
K
 
T
A
 
T
V
 
I
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
K
S
 
A
G
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
H
L
 
I
M
 
M
N
 
N
I
 
R
A
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
Q
-
 
P
N
 
G
R
 
Q
P
 
Q
E
 
H
P
 
V
I
 
K
P
 
R
V
 
C
Y
 
I
A
 
I
E
|
E
M
 
M
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
A
V
 
V
F
 
I
I
 
I
M
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
D
N
 
N
D
 
D
A
 
A
-
 
D
-
 
L
P
 
D
A
 
E
V
 
A
A
 
V
K
 
D
G
 
G
F
 
V
V
 
I
A
 
Y
S
 
S
L
 
A
A
 
F
M
 
G
G
 
F
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
K
C
|
C
T
 
S
N
 
A
P
 
A
G
 
S
M
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
V
L
 
L
K
 
-
G
 
D
E
 
E
A
 
V
A
 
Y
D
 
D
R
 
R
F
 
F
K
 
V
A
 
D
T
 
R
V
 
L
A
 
V
S
 
E
E
 
T
V
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
I
G
 
E
T
 
I
Q
 
H
T
 
P
M
 
A
L
 
E
T
 
N
P
 
P
G
 
K
I
 
A
Y
 
Y
Q
 
M
A
 
G
Y
 
P
C
 
V
D
 
V
G
 
D
V
 
K
E
 
E
K
 
A
L
 
Y
N
 
D
N
 
R
N
 
I
S
 
L
A
 
G
T
 
T
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
N
-
 
H
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
S
D
 
V
S
 
P
D
 
G
Q
 
G
P
 
G
N
 
F
Q
 
F
C
 
A
C
 
P
P
 
P
H
 
T
V
 
I
F
 
F
A
 
G
-
 
D
T
 
V
S
 
P
A
 
G
K
 
D
A
 
A
F
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
S
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
S
 
P
T
 
V
S
 
V
L
 
A
I
 
V
I
 
I
E
 
R
C
 
A
D
 
K
T
 
N
L
 
L
E
 
D
E
 
Q
Y
 
A
K
 
L
V
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
H
 
S
L
 
T
E
 
E
G
 
Y
Q
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
G
T
 
G
V
 
V
-
 
F
Q
 
S
M
 
R
S
 
S
D
 
P
A
 
A
D
 
N
V
 
I
E
 
N
A
 
R
V
 
V
R
 
K
A
 
E
L
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
L
K
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
N
I
 
L
L
 
Y
C
 
V
N
 
N
G
 
R
Y
 
G
P
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
-
E
 
-
V
 
-
C
 
-
H
 
-
S
 
A
M
 
M
V
 
V
H
 
D
G
 
R
G
 
H
P
 
P
F
 
F
P
 
G
A
 
G
-
 
F
-
 
K
T
 
M
S
 
S
D
 
G
S
 
I
R
 
G
S
 
S
T
 
K
S
x
T
V
 
G
G
 
G
S
 
P
A
 
D
A
 
Y
I
 
L
D
 
K
R
 
Q
F
 
Y
L
 
M
R
 
E
P
 
P
V
 
A
C
 
C

Sites not aligning to the query:

3rhdA Crystal structure of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gapn from methanocaldococcus jannaschii dsm 2661 complexed with NADP
26% identity, 63% coverage: 25:355/528 of query aligns to 6:321/456 of 3rhdA

query
sites
3rhdA
I
 
M
H
 
D
A
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
Y
T
 
S
N
 
L
E
 
E
T
 
V
L
 
I
E
 
K
-
 
K
-
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
L
H
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
S
K
 
R
A
 
E
D
 
E
V
 
A
E
 
K
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
D
A
 
T
A
 
A
W
 
E
R
 
K
A
 
Y
F
 
K
D
 
E
A
 
V
Y
 
M
R
 
K
S
 
N
I
 
L
S
 
P
T
 
I
E
 
T
K
 
K
R
 
R
A
 
Y
A
 
N
F
 
I
L
 
L
E
 
M
C
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
K
E
 
Q
I
 
I
L
 
K
A
 
E
L
 
K
G
 
K
D
 
E
V
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
I
A
 
L
M
 
A
A
 
I
E
 
D
S
 
A
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
I
-
 
K
K
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
V
E
 
E
G
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
-
R
 
-
T
 
S
M
 
I
G
 
G
Q
 
T
L
 
F
R
 
K
L
 
L
F
 
A
A
 
A
G
 
F
V
 
Y
V
 
V
R
 
K
L
 
E
G
 
H
K
 
R
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
E
A
 
V
M
 
I
P
 
P
-
 
S
-
 
D
D
 
D
R
 
R
T
 
L
P
 
I
L
 
F
P
 
T
R
 
R
S
 
R
D
 
E
L
 
-
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
P
V
 
V
A
 
G
V
 
I
F
 
V
G
 
G
A
 
A
S
x
I
-
x
T
-
 
P
-
x
F
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
N
F
 
L
S
 
S
V
 
-
A
 
-
G
 
A
G
 
H
D
 
K
T
 
I
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
N
P
 
V
V
 
I
V
 
V
V
 
H
K
x
H
A
 
P
H
x
S
S
|
S
A
x
K
H
 
A
P
 
P
G
 
L
T
 
V
S
 
C
E
 
I
L
 
E
V
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
I
T
 
E
A
 
N
A
 
A
V
 
L
K
 
K
K
 
K
C
 
Y
G
 
N
L
 
V
P
 
P
A
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
S
 
N
L
 
L
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
A
G
|
G
R
x
E
E
 
V
I
 
V
G
|
G
S
x
D
A
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
V
H
 
N
S
 
E
S
 
K
I
 
V
K
 
N
A
 
M
V
 
I
G
 
S
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
R
 
S
S
 
K
G
x
V
G
 
G
V
 
E
A
 
L
L
 
I
M
 
T
N
 
K
I
 
K
A
 
A
A
 
G
N
 
F
R
 
K
P
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
K
V
 
I
Y
 
A
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
N
F
 
I
I
 
V
M
 
L
P
 
K
N
 
D
K
 
A
L
 
D
T
 
L
N
 
N
D
 
K
A
 
A
P
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
V
K
 
N
G
 
A
F
 
L
V
 
I
A
 
K
S
 
G
L
 
S
A
 
F
M
 
I
G
 
Y
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
I
N
 
S
P
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
-
V
 
I
L
 
L
L
 
V
K
 
D
G
 
E
E
 
S
A
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
K
F
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
M
-
 
F
-
 
V
-
 
N
K
 
K
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
L
S
 
N
E
 
V
V
 
G
Q
 
N
A
 
P
L
 
L
G
 
D
T
 
E
Q
 
K
T
 
T
M
 
D
L
 
V
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
I
Y
 
S
Q
 
V
A
 
E
Y
 
H
C
 
A
D
 
E
G
 
W
V
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4neaA 1.90 angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from staphylococcus aureus in complex with NAD+ and bme-free cys289 (see paper)
27% identity, 58% coverage: 28:334/528 of query aligns to 38:325/505 of 4neaA

query
sites
4neaA
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
Y
T
 
N
N
 
Q
E
 
E
T
 
V
L
 
I
E
 
F
P
 
T
A
 
V
Y
 
S
H
 
E
G
 
G
G
 
-
T
 
T
K
 
K
A
 
E
D
 
D
V
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
V
 
I
S
 
L
A
 
A
A
 
A
W
 
R
R
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
E
A
 
S
-
 
G
-
 
E
Y
 
W
R
 
S
S
 
Q
I
 
E
S
 
T
T
 
A
E
 
E
K
 
T
R
 
R
A
 
G
A
 
K
F
 
K
L
 
V
E
 
R
C
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
L
 
K
A
 
E
L
 
H
G
 
R
D
 
E
V
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
R
R
 
L
A
 
E
M
 
T
A
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
T
K
 
L
A
 
E
R
 
E
I
 
S
E
 
Y
G
 
A
E
 
D
R
 
M
G
 
D
R
 
D
T
 
I
M
 
H
G
 
N
Q
 
V
L
 
F
R
 
M
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
A
R
 
-
L
 
-
G
 
D
K
 
K
A
 
D
T
 
G
D
 
G
A
 
E
R
 
M
I
 
I
D
 
D
P
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
S
P
 
P
L
 
I
P
 
P
R
 
D
S
 
T
D
 
E
L
 
S
R
 
K
F
 
I
Q
 
V
K
 
K
I
 
E
A
 
P
L
 
V
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
T
V
 
Q
F
 
I
G
 
T
A
x
P
S
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
-
S
 
-
V
 
Q
A
 
A
G
 
S
G
 
W
D
 
K
T
 
I
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
P
 
S
V
 
L
V
 
V
V
 
M
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
x
E
A
 
I
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
T
R
 
I
A
 
R
V
 
V
T
 
F
A
 
E
A
 
L
V
 
M
K
 
E
K
 
E
C
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
I
S
 
N
L
 
L
L
 
I
Y
 
L
G
 
G
S
 
A
G
|
G
R
 
S
E
 
E
I
 
V
G
|
G
S
 
D
A
 
V
L
 
M
V
 
S
A
 
G
H
 
H
S
 
K
S
 
E
I
 
V
K
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
R
 
I
S
 
E
G
x
T
G
 
G
V
 
K
A
x
H
L
x
I
M
 
M
N
 
K
I
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
N
P
 
V
E
 
T
P
 
N
I
 
I
P
 
A
V
 
L
Y
 
-
A
 
-
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
P
V
 
N
F
 
I
I
 
I
M
 
F
P
 
D
N
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
F
K
 
E
L
 
L
T
 
A
N
 
V
D
 
D
A
 
Q
P
 
-
A
 
A
V
 
L
A
 
N
K
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
F
G
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
S
N
 
-
P
 
A
G
 
G
M
 
S
V
 
R
V
 
I
L
 
L
L
 
V
K
 
Q
G
 
N
E
 
S
A
 
I
A
 
K
D
 
D
R
 
K
F
 
F
K
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
I
S
 
D
E
 
R
V
 
V
Q
 
K
A
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2d4eC Crystal structure of the hpcc from thermus thermophilus hb8
25% identity, 94% coverage: 27:522/528 of query aligns to 46:513/515 of 2d4eC

query
sites
2d4eC
A
 
S
I
 
L
N
 
D
P
 
P
A
 
A
T
 
T
N
 
N
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
G
P
 
V
A
 
A
Y
 
A
H
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
E
K
 
R
A
 
-
D
 
E
V
 
V
E
 
D
Q
 
R
A
 
A
V
 
A
S
 
K
A
 
A
A
 
A
W
 
H
R
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
Q
A
 
R
Y
 
W
R
 
S
S
 
R
I
 
T
S
 
K
T
 
A
E
 
K
K
 
E
R
 
R
A
 
K
A
 
R
F
 
Y
L
 
L
E
 
L
C
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
L
I
 
I
L
 
E
A
 
K
L
 
H
G
 
A
D
 
D
V
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
V
R
 
M
A
 
E
M
 
C
A
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
K
 
L
A
 
R
R
 
I
I
 
V
E
 
R
G
 
A
E
 
Q
R
 
V
G
 
A
R
 
R
T
 
A
M
 
A
G
 
E
Q
 
N
L
 
F
R
 
A
L
 
F
F
 
Y
A
 
A
G
 
E
V
 
Y
V
 
A
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
E
P
 
H
A
 
A
M
 
M
P
 
E
D
 
D
R
 
R
T
 
T
-
 
F
P
 
P
L
 
V
P
 
D
R
 
R
S
 
D
D
 
W
L
 
L
R
 
Y
F
 
Y
Q
 
T
-
 
V
K
 
R
I
 
V
A
 
P
L
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
G
V
 
I
F
x
I
G
x
T
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
L
S
 
S
V
 
T
A
 
-
G
 
-
G
 
W
D
 
R
T
 
I
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
L
K
|
K
A
 
P
H
x
A
S
 
E
A
 
W
H
 
S
P
 
P
G
 
F
T
 
T
S
 
A
E
 
T
L
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
K
V
 
L
T
 
A
A
 
E
A
 
I
V
 
L
K
 
K
K
 
E
C
 
A
G
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
Q
G
 
G
S
 
F
G
|
G
R
 
E
E
 
E
I
 
A
G
|
G
S
x
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
P
S
 
L
I
 
V
K
 
P
A
 
L
V
 
L
G
 
T
F
 
L
T
|
T
G
|
G
S
x
E
R
 
T
S
 
E
G
x
T
G
 
G
V
 
K
A
 
I
L
 
V
M
 
M
N
 
R
I
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
D
R
 
H
P
 
L
E
 
K
P
 
R
I
 
L
P
 
S
V
 
-
Y
 
-
A
 
P
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
A
F
 
L
I
 
V
M
 
F
P
 
A
N
 
D
K
 
A
L
 
-
T
 
-
N
 
-
D
 
D
A
 
L
P
 
E
A
 
R
V
 
A
A
 
L
K
 
D
G
 
A
F
 
V
V
 
V
A
 
F
S
 
Q
L
 
I
A
 
F
M
 
S
G
 
F
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
F
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
A
P
 
S
G
 
S
M
 
R
V
 
-
V
 
L
L
 
L
L
 
V
K
 
E
G
 
E
E
 
K
A
 
I
A
 
F
D
 
E
R
 
D
F
 
F
K
 
V
A
 
G
T
 
K
V
 
V
A
 
V
S
 
E
E
 
R
V
 
A
Q
 
R
A
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
H
-
 
P
L
 
L
G
 
D
T
 
P
Q
 
E
T
 
T
M
 
E
L
 
V
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
I
Y
 
H
Q
 
P
A
 
E
Y
 
H
C
 
L
D
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
L
G
 
G
V
 
Y
E
 
V
K
 
E
L
 
A
N
 
G
N
 
K
N
 
R
S
 
E
A
 
G
T
 
A
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
S
-
 
F
K
 
R
G
 
G
N
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
S
Q
 
R
P
 
G
N
 
N
Q
 
Y
C
 
L
C
 
L
P
 
P
H
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
V
T
 
G
S
 
E
A
 
N
K
 
H
A
 
M
F
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
E
 
Q
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
S
 
P
T
 
V
S
 
L
L
 
V
I
 
A
I
 
I
E
 
P
C
 
F
D
 
K
T
 
D
L
 
E
E
 
E
E
 
E
Y
 
A
K
 
L
V
 
R
V
 
K
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
T
E
 
K
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
Y
V
 
V
Q
 
F
M
 
T
S
 
R
D
 
D
A
 
L
D
 
E
V
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
A
L
 
H
L
 
R
P
 
L
T
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
L
K
 
E
V
 
A
G
 
G
R
 
M
I
 
V
L
 
Y
C
 
L
N
 
N
G
 
S
Y
 
H
P
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
N
V
 
V
C