SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_111608605.1 NCBI__GCF_003259225.1:WP_111608605.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

8hqqA Crystal structure of the glucose-binding protein sar11_0769 from "candidatus pelagibacter ubique" htcc1062 bound to glucose
42% identity, 94% coverage: 11:383/397 of query aligns to 6:385/398 of 8hqqA

query
sites
8hqqA
E
 
E
V
 
V
I
 
L
H
 
H
W
|
W
W
 
W
T
 
T
S
 
G
G
 
G
G
 
G
E
|
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
L
T
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
E
 
D
E
 
E
F
 
F
N
 
-
K
 
A
L
 
A
G
 
Q
N
 
N
D
 
G
K
 
V
W
 
W
V
 
L
D
 
D
T
 
M
A
 
P
V
 
V
A
 
S
L
 
G
G
 
G
E
x
G
N
 
G
A
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
M
-
 
Q
T
 
T
M
 
L
Q
 
K
-
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
V
G
 
A
G
 
N
D
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
F
 
I
N
x
K
T
 
-
S
 
G
R
 
P
Q
 
T
F
 
I
E
 
Q
E
 
E
L
 
Y
I
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
V
-
 
A
-
 
P
L
 
Y
D
 
N
L
 
I
T
 
D
P
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
K
K
 
K
E
 
E
G
 
G
W
 
W
T
 
D
D
 
N
F
 
L
I
 
L
R
 
S
P
 
K
S
 
Q
S
 
V
I
 
A
L
 
S
N
 
H
P
 
M
C
 
K
M
 
C
K
 
D
D
 
D
G
 
G
G
 
K
I
 
A
Y
 
Y
C
 
C
V
 
A
-
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
I
 
I
H
|
H
S
 
R
A
 
I
Q
 
D
W
 
W
L
 
I
W
 
W
T
 
A
N
 
N
K
 
K
K
 
K
V
 
V
F
 
L
A
 
D
E
 
S
V
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
K
E
 
M
P
 
P
N
 
S
T
 
T
W
 
W
E
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
N
S
 
A
V
 
A
A
 
A
P
 
D
K
 
K
I
 
L
R
 
Q
E
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
S
Q
 
Q
G
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
R
 
A
H
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
E
V
 
A
V
 
V
L
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
G
D
 
G
E
 
N
A
 
D
F
 
F
W
 
Y
N
 
R
R
 
K
L
 
A
W
 
F
K
 
V
D
 
D
K
 
L
S
 
D
V
 
A
D
 
A
A
 
T
A
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
S
Q
 
T
M
 
M
R
 
T
K
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
D
T
 
Q
F
 
M
G
 
R
A
 
K
L
 
L
R
 
K
Q
 
G
F
 
Y
T
 
T
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
S
P
 
P
G
 
G
R
 
R
N
 
D
W
 
W
N
 
N
D
 
V
A
 
A
T
 
T
N
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
M
T
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
F
Q
 
Q
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
R
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
N
D
 
N
K
 
M
V
 
A
A
 
P
E
 
G
V
 
K
D
 
D
Y
 
Y
G
 
I
C
 
C
I
 
A
P
 
P
G
 
T
P
 
P
S
 
S
K
 
N
R
 
N
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
-
L
 
Y
G
 
N
G
 
V
D
|
D
A
 
S
F
 
F
I
 
I
F
 
F
P
 
Y
K
 
K
S
 
V
S
 
K
D
 
G
Q
 
K
N
 
D
L
 
K
E
 
V
A
 
E
A
 
G
Q
 
Q
M
 
K
K
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
M
 
L
M
 
M
L
 
M
S
 
G
P
 
K
Y
 
N
I
 
F
Q
 
Q
A
 
K
K
 
V
F
 
F
N
 
N
N
 
I
T
 
Y
K
|
K
G
 
G
S
 
S
L
 
I
P
 
P
V
 
A
R
 
R
A
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
M
T
 
D
V
 
E
A
 
F
D
 
D
A
 
M
C
 
C
M
 
A
K
 
K
K
 
K
G
 
S
L
 
N
A
 
A
L
 
D
L
 
L
D
 
K
D
 
T
-
 
A
-
 
G
P
 
S
K
 
K
A
 
G
S
 
G
I
 
L
T
 
L
P
 
P
A
 
S
N
 
F
A
 
A
Y
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
A
I
 
L
T
 
R
E
 
L
D
 
A
T
 
Q
N
 
K
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
Q
 
Q
D
 
D
L
 
V
V
 
V
S
 
T
T
 
E
F
 
H
W
 
F
N
 
N
E
 
S
P
 
N
S
 
M
M
 
S
S
 
S
V
 
S
D
 
D

5dvjA Crystal structure of galactose complexed periplasmic glucose binding protein (ppgbp) from p. Putida csv86 (see paper)
37% identity, 98% coverage: 10:397/397 of query aligns to 5:396/396 of 5dvjA

query
sites
5dvjA
L
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
K
E
 
Q
E
 
Q
F
 
I
N
 
Q
K
 
K
L
 
D
G
 
G
N
 
F
D
 
-
K
 
I
W
 
W
V
 
K
D
 
D
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
G
G
|
G
E
x
G
N
 
G
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
M
T
 
T
M
 
V
-
 
L
-
 
K
Q
 
T
R
 
R
I
 
A
L
 
I
G
 
S
G
 
G
D
 
N
A
 
P
P
 
P
G
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
F
 
I
N
x
K
T
 
-
S
 
G
R
 
P
Q
 
D
F
 
I
E
 
Q
E
 
E
L
 
W
I
 
G
E
 
A
E
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
E
L
 
L
T
 
D
P
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
A
K
 
A
E
 
N
G
 
K
W
 
W
T
 
D
D
 
D
F
 
L
I
 
L
R
 
-
P
 
P
S
 
R
S
 
Q
I
 
V
L
 
A
N
 
D
P
 
I
C
 
M
M
 
K
K
 
Y
D
 
D
G
 
G
G
 
H
I
 
Y
Y
 
V
C
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
I
 
I
H
 
H
S
 
R
A
 
V
Q
 
N
W
 
W
L
 
L
W
 
W
T
 
I
N
 
N
K
 
P
K
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
D
E
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
K
E
 
V
P
 
P
N
 
T
T
 
T
W
 
L
E
 
D
E
 
E
F
 
L
L
 
F
S
 
A
V
 
A
A
 
A
P
 
D
K
 
K
I
 
L
R
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
R
 
S
H
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
E
V
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
L
G
 
S
V
 
I
T
 
L
D
 
G
E
 
P
A
 
K
F
 
G
W
 
Y
N
 
H
R
 
A
L
 
A
W
 
F
K
 
V
D
 
D
K
 
L
S
 
D
V
 
E
D
 
K
A
 
T
A
 
L
G
 
T
S
 
G
A
 
P
Q
 
Q
M
 
M
R
 
T
K
 
E
V
 
A
F
 
F
E
 
A
T
 
T
F
 
L
G
 
K
A
 
R
L
 
L
R
 
G
Q
 
T
F
 
Y
T
 
M
D
 
D
A
 
P
G
 
N
A
 
R
P
 
A
G
 
G
R
 
R
N
 
D
W
|
W
N
 
N
D
 
I
A
 
A
T
 
A
N
 
A
M
 
E
V
 
V
I
 
I
T
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
M
Q
 
Q
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
R
 
K
G
 
S
E
 
E
F
 
W
A
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
G
V
 
K
D
 
D
Y
 
Y
G
 
Q
C
 
C
I
 
V
P
 
A
G
 
F
P
 
P
S
 
G
K
 
T
R
 
Q
P
 
G
Y
 
S
L
 
F
T
 
A
L
 
Y
G
 
N
G
 
I
D
|
D
A
 
S
F
 
L
I
 
A
F
 
M
P
 
F
K
 
K
S
 
L
S
 
K
D
 
D
Q
 
A
N
 
N
L
 
D
E
 
I
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
M
 
N
K
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
K
M
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
E
P
 
P
Y
 
E
I
 
F
Q
 
Q
A
 
T
K
 
V
F
 
F
N
 
N
N
 
Q
T
 
N
K
|
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
D
 
D
V
 
M
D
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
K
A
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
C
M
 
T
K
 
Q
K
 
K
G
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
D
L
 
F
D
 
K
D
 
E
P
 
A
K
 
A
A
 
K
-
 
G
-
 
D
S
 
G
I
 
L
T
 
Q
P
 
P
A
 
S
N
 
M
A
 
A
Y
x
H
-
 
N
-
 
M
-
 
A
I
 
T
T
 
T
E
 
L
D
 
A
T
 
V
N
 
Q
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
Q
 
F
D
 
D
L
 
V
V
 
V
S
 
T
T
 
N
F
 
F
W
 
L
N
 
N
E
 
D
P
 
P
S
 
Q
M
 
A
S
 
E
V
 
P
D
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
K
V
 
Q
F
 
L
K
 
N
G
 
A
I
 
A
I
 
I
E
 
K
D
 
A
A
 
A
E
 
R

5dviA High resolution crystal structure of glucose complexed periplasmic glucose binding protein (ppgbp) from p. Putida csv86 (see paper)
37% identity, 98% coverage: 10:397/397 of query aligns to 5:396/396 of 5dviA

query
sites
5dviA
L
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
K
E
 
Q
E
 
Q
F
 
I
N
 
Q
K
 
K
L
 
D
G
 
G
N
 
F
D
 
-
K
 
I
W
 
W
V
 
K
D
 
D
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
G
G
 
G
E
x
G
N
 
G
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
M
T
 
T
M
 
V
-
 
L
-
 
K
Q
 
T
R
 
R
I
 
A
L
 
I
G
 
S
G
 
G
D
 
N
A
 
P
P
 
P
G
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
F
 
I
N
x
K
T
 
-
S
 
G
R
 
P
Q
 
D
F
 
I
E
 
Q
E
 
E
L
 
W
I
 
G
E
 
A
E
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
E
L
 
L
T
 
D
P
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
A
K
 
A
E
 
N
G
 
K
W
 
W
T
 
D
D
 
D
F
 
L
I
 
L
R
 
-
P
 
P
S
 
R
S
 
Q
I
 
V
L
 
A
N
 
D
P
 
I
C
 
M
M
 
K
K
 
Y
D
 
D
G
 
G
G
 
H
I
 
Y
Y
 
V
C
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
I
 
I
H
 
H
S
 
R
A
 
V
Q
 
N
W
 
W
L
 
L
W
 
W
T
 
I
N
 
N
K
 
P
K
 
Q
V
 
V
F
 
F
A
 
D
E
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
K
E
 
V
P
 
P
N
 
T
T
 
T
W
 
L
E
 
D
E
 
E
F
 
L
L
 
F
S
 
A
V
 
A
A
 
A
P
 
D
K
 
K
I
 
L
R
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
R
 
S
H
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
E
V
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
L
G
 
S
V
 
I
T
 
L
D
 
G
E
 
P
A
 
K
F
 
G
W
 
Y
N
 
H
R
 
A
L
 
A
W
 
F
K
 
V
D
 
D
K
 
L
S
 
D
V
 
E
D
 
K
A
 
T
A
 
L
G
 
T
S
 
G
A
 
P
Q
 
Q
M
 
M
R
 
T
K
 
E
V
 
A
F
 
F
E
 
A
T
 
T
F
 
L
G
 
K
A
 
R
L
 
L
R
 
G
Q
 
T
F
 
Y
T
 
M
D
 
D
A
 
P
G
 
N
A
 
R
P
 
A
G
 
G
R
 
R
N
 
D
W
 
W
N
 
N
D
 
I
A
 
A
T
 
A
N
 
A
M
 
E
V
 
V
I
 
I
T
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
M
Q
 
Q
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
R
 
K
G
 
S
E
 
E
F
 
W
A
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
G
V
 
K
D
 
D
Y
 
Y
G
 
Q
C
 
C
I
 
V
P
 
A
G
 
F
P
 
P
S
 
G
K
 
T
R
 
Q
P
 
G
Y
 
S
L
 
F
T
 
A
L
 
Y
G
x
N
G
 
I
D
|
D
A
 
S
F
 
L
I
 
A
F
 
M
P
 
F
K
 
K
S
 
L
S
 
K
D
 
D
Q
 
A
N
 
N
L
 
D
E
 
I
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
M
 
N
K
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
K
M
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
E
P
 
P
Y
 
E
I
 
F
Q
 
Q
A
 
T
K
 
V
F
 
F
N
 
N
N
 
Q
T
 
N
K
|
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
D
 
D
V
 
M
D
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
K
A
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
C
M
 
T
K
 
Q
K
 
K
G
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
D
L
 
F
D
 
K
D
 
E
P
 
A
K
 
A
A
 
K
-
 
G
-
 
D
S
 
G
I
 
L
T
 
Q
P
 
P
A
 
S
N
 
M
A
 
A
Y
x
H
-
 
N
-
 
M
-
 
A
I
 
T
T
 
T
E
 
L
D
 
A
T
 
V
N
 
Q
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
Q
 
F
D
 
D
L
 
V
V
 
V
S
 
T
T
 
N
F
 
F
W
 
L
N
 
N
E
 
D
P
 
P
S
 
Q
M
 
A
S
 
E
V
 
P
D
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
K
V
 
Q
F
 
L
K
 
N
G
 
A
I
 
A
I
 
I
E
 
K
D
 
A
A
 
A
E
 
R

4r2bA Crystal structure of sugar transporter oant_3817 from ochrobactrum anthropi, target efi-510528, with bound glucose
39% identity, 86% coverage: 9:351/397 of query aligns to 6:343/395 of 4r2bA

query
sites
4r2bA
D
 
N
L
 
V
E
 
E
V
 
V
I
 
L
H
 
H
W
|
W
W
 
W
T
 
T
S
 
A
G
 
G
G
 
G
E
|
E
Q
 
A
K
 
A
A
 
A
V
 
L
T
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
K
E
 
D
F
 
L
N
 
E
K
 
K
L
 
K
G
 
G
N
 
I
D
 
-
K
 
S
W
 
W
V
 
T
D
 
D
T
 
M
A
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
G
G
|
G
E
x
G
N
 
G
A
 
T
R
 
E
A
 
A
L
 
M
T
 
T
M
 
V
-
 
L
-
 
R
Q
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
T
G
 
A
G
 
G
D
 
N
A
 
A
P
 
P
G
 
T
A
 
A
A
 
V
Q
 
Q
F
 
M
N
 
-
T
 
L
S
 
G
R
 
F
Q
 
D
F
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
W
I
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
L
 
A
L
 
L
L
 
G
D
 
N
L
 
L
T
 
D
P
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
N
K
 
K
E
 
E
G
 
G
W
 
W
T
 
E
D
 
K
F
 
V
I
 
I
R
 
-
P
 
P
S
 
A
S
 
P
I
 
L
L
 
Q
N
 
E
P
 
F
C
 
A
M
 
K
K
 
Y
D
 
D
G
 
G
G
 
H
I
 
W
Y
 
I
C
 
A
V
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
I
 
V
H
|
H
S
 
S
A
 
T
Q
 
N
W
 
W
L
 
M
W
 
W
T
 
I
N
 
N
K
 
K
K
 
A
V
 
A
F
 
L
A
 
D
E
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
G
K
 
K
E
 
E
P
 
P
N
 
T
T
 
N
W
 
W
E
 
D
E
 
E
F
 
L
L
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
L
P
 
D
K
 
K
I
 
F
R
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
Y
 
I
I
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
R
 
A
H
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
S
V
 
F
T
 
G
D
 
T
E
 
D
A
 
-
F
 
F
W
 
Y
N
 
K
R
 
K
L
 
A
W
 
F
K
 
I
D
 
D
K
 
L
S
 
D
V
 
P
D
 
E
A
 
T
A
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
D
Q
 
T
M
 
M
R
 
K
K
 
Q
V
 
A
F
 
F
E
 
D
T
 
R
F
 
M
G
 
T
A
 
K
L
 
L
R
 
R
Q
 
S
F
 
Y
T
 
V
D
 
D
A
 
D
G
 
N
A
 
F
P
 
S
G
 
G
R
 
R
N
 
D
W
|
W
N
 
N
D
 
L
A
 
A
T
 
S
N
 
A
M
 
M
V
 
V
I
 
I
T
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
L
Q
 
Q
V
 
F
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
R
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
A
 
V
A
 
K
A
 
A
D
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
P
E
 
G
V
 
E
D
 
D
Y
 
F
G
 
V
C
 
C
I
 
M
P
 
R
G
 
Y
P
 
P
S
 
G
K
 
T
R
 
Q
P
 
G
Y
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
F
G
 
N
G
 
S
D
|
D
A
 
M
F
 
F
I
 
A
F
 
M
P
 
F
K
 
K
S
 
V
S
 
S
D
 
E
Q
 
D
N
 
K
L
 
V
E
 
-
A
 
P
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
K
 
E
L
 
M
A
 
A
S
 
S
M
 
A
M
 
I
L
 
E
S
 
S
P
 
P
Y
 
T
I
 
F
Q
 
Q
A
 
S
K
 
A
F
 
F
N
 
N
N
 
V
T
 
V
K
|
K
G
 
G
S
 
S
L
 
A
P
 
P
V
 
A
R
 
R
A
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
P
L
 
D
T
 
T
V
 
D
A
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
C
M
 
G
K
 
K
K
 
K
G
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
-
L
 
-
D
 
D
D
 
E
P
 
K
K
 
E
A
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

2b3fA Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein bound with galactose (see paper)
29% identity, 82% coverage: 10:336/397 of query aligns to 3:328/392 of 2b3fA

query
sites
2b3fA
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
F
H
 
S
W
|
W
W
|
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
Q
 
G
K
 
P
A
 
A
V
 
L
T
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
R
E
 
L
F
 
Y
-
 
K
N
 
Q
K
 
K
L
 
Y
G
 
P
N
 
G
D
 
V
K
 
E
W
 
V
V
 
I
D
 
N
T
 
A
A
 
T
V
 
V
-
 
T
-
 
G
A
x
G
L
x
A
G
 
G
E
 
V
N
 
N
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
L
M
 
K
Q
 
T
R
 
R
I
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
P
P
 
P
G
 
D
A
 
T
A
 
F
Q
 
Q
F
 
V
N
x
H
T
 
A
S
 
G
R
 
M
Q
 
E
F
 
L
-
 
I
E
 
G
E
 
T
L
 
W
I
 
V
E
 
V
E
 
A
G
 
N
L
 
R
L
 
M
L
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
S
P
 
A
V
 
L
A
 
F
E
 
R
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
W
T
 
L
D
 
Q
F
 
A
I
 
F
R
 
-
P
 
P
S
 
K
S
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
D
P
 
L
C
 
I
M
 
S
K
 
Y
D
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
Y
 
W
C
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
I
 
I
H
 
H
S
 
R
A
 
S
Q
 
N
W
 
V
L
 
M
W
 
W
T
 
Y
N
 
L
K
 
P
K
 
A
V
 
K
F
 
L
A
 
K
E
 
G
V
 
W
G
 
G
V
 
V
K
 
N
E
 
P
P
 
P
N
 
R
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
K
F
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
T
A
 
C
P
 
Q
K
 
T
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
Y
 
L
-
 
E
I
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
-
G
 
G
Q
 
E
G
 
N
W
 
W
Q
 
T
E
 
Q
R
 
Q
H
 
H
V
 
L
F
 
W
D
 
E
V
 
S
V
 
V
L
 
A
I
 
L
G
 
A
V
 
V
T
 
L
D
 
G
E
 
P
A
 
D
F
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
N
L
 
L
W
 
W
K
 
N
D
 
G
K
 
K
S
 
L
V
 
K
D
 
F
A
 
T
A
 
D
G
 
P
S
 
K
A
 
A
Q
 
V
M
 
-
R
 
-
K
 
R
V
 
A
F
 
W
E
 
E
T
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
V
R
 
L
Q
 
D
F
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
L
N
 
S
W
 
W
N
 
Q
D
 
Q
A
 
A
T
 
V
N
 
D
M
 
R
V
 
V
I
 
V
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
F
Q
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
R
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
A
 
T
A
 
T
A
 
T
D
 
L
K
 
K
V
 
L
A
 
K
E
 
P
-
 
G
V
 
T
D
 
D
Y
 
F
G
 
A
C
 
W
I
 
A
P
 
P
G
 
S
P
 
P
S
 
G
K
 
T
R
 
Q
P
 
G
Y
 
V
L
 
F
T
 
M
L
 
M
G
 
L
G
 
S
D
|
D
A
 
S
F
 
F
I
 
G
F
 
L
P
 
P
K
 
K
S
 
G
S
 
A
D
 
K
Q
 
N
N
 
R
L
 
Q
E
 
N
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
M
 
I
K
 
N
L
 
W
A
 
L
S
 
R
M
 
L
M
 
V
L
 
G
S
 
S
P
 
K
Y
 
E
I
 
G
Q
 
Q
A
 
D
K
 
T
F
 
S
N
 
N
N
 
P
T
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
L
 
I
P
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
L
D
 
D
V
 
S
D
 
D
L
 
P
T
 
S
V
 
K
A
 
Y
D
 
N
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2b3bC Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein with bound glucose (see paper)
29% identity, 82% coverage: 10:336/397 of query aligns to 3:328/392 of 2b3bC

query
sites
2b3bC
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
F
H
 
S
W
|
W
W
 
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
Q
 
G
K
 
P
A
 
A
V
 
L
T
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
R
E
 
L
F
 
Y
-
 
K
N
 
Q
K
 
K
L
 
Y
G
 
P
N
 
G
D
 
V
K
 
E
W
 
V
V
 
I
D
 
N
T
 
A
A
 
T
V
 
V
-
 
T
-
 
G
A
 
G
L
x
A
G
 
G
E
 
V
N
 
N
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
L
M
 
K
Q
 
T
R
 
R
I
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
P
P
 
P
G
 
D
A
 
T
A
 
F
Q
 
Q
F
 
V
N
x
H
T
 
A
S
 
G
R
 
M
Q
 
E
F
 
L
-
 
I
E
 
G
E
 
T
L
 
W
I
 
V
E
 
V
E
 
A
G
 
N
L
 
R
L
 
M
L
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
S
P
 
A
V
 
L
A
 
F
E
 
R
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
W
T
 
L
D
 
Q
F
 
A
I
 
F
R
 
-
P
 
P
S
 
K
S
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
D
P
 
L
C
 
I
M
 
S
K
 
Y
D
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
Y
 
W
C
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
I
 
I
H
 
H
S
 
R
A
 
S
Q
 
N
W
 
V
L
 
M
W
 
W
T
 
Y
N
 
L
K
 
P
K
 
A
V
 
K
F
 
L
A
 
K
E
 
G
V
 
W
G
 
G
V
 
V
K
 
N
E
 
P
P
 
P
N
 
R
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
K
F
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
T
A
 
C
P
 
Q
K
 
T
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
Y
 
L
-
 
E
I
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
-
G
 
G
Q
 
E
G
 
N
W
 
W
Q
 
T
E
 
Q
R
 
Q
H
 
H
V
 
L
F
 
W
D
 
E
V
 
S
V
 
V
L
 
A
I
 
L
G
 
A
V
 
V
T
 
L
D
 
G
E
 
P
A
 
D
F
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
N
L
 
L
W
 
W
K
 
N
D
 
G
K
 
K
S
 
L
V
 
K
D
 
F
A
 
T
A
 
D
G
 
P
S
 
K
A
 
A
Q
 
V
M
 
-
R
 
-
K
 
R
V
 
A
F
 
W
E
 
E
T
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
V
R
 
L
Q
 
D
F
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
L
N
 
S
W
 
W
N
 
Q
D
 
Q
A
 
A
T
 
V
N
 
D
M
 
R
V
 
V
I
 
V
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
F
Q
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
R
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
A
 
T
A
 
T
A
 
T
D
 
L
K
 
K
V
 
L
A
 
K
E
 
P
-
 
G
V
 
T
D
 
D
Y
 
F
G
 
A
C
 
W
I
 
A
P
 
P
G
 
S
P
 
P
S
 
G
K
 
T
R
 
Q
P
 
G
Y
 
V
L
 
F
T
 
M
L
 
M
G
 
L
G
 
S
D
|
D
A
 
S
F
 
F
I
 
G
F
 
L
P
 
P
K
 
K
S
 
G
S
 
A
D
 
K
Q
 
N
N
 
R
L
 
Q
E
 
N
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
M
 
I
K
 
N
L
 
W
A
 
L
S
 
R
M
 
L
M
 
V
L
 
G
S
 
S
P
 
K
Y
 
E
I
 
G
Q
 
Q
A
 
D
K
 
T
F
 
S
N
 
N
N
 
P
T
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
L
 
I
P
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
L
D
 
D
V
 
S
D
 
D
L
 
P
T
 
S
V
 
K
A
 
Y
D
 
N
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2b3bA Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein with bound glucose (see paper)
29% identity, 82% coverage: 10:336/397 of query aligns to 3:328/392 of 2b3bA

query
sites
2b3bA
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
F
H
 
S
W
|
W
W
|
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
Q
 
G
K
 
P
A
 
A
V
 
L
T
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
R
E
 
L
F
 
Y
-
 
K
N
 
Q
K
 
K
L
 
Y
G
 
P
N
 
G
D
 
V
K
 
E
W
 
V
V
 
I
D
 
N
T
 
A
A
 
T
V
 
V
-
 
T
-
 
G
A
 
G
L
x
A
G
 
G
E
 
V
N
 
N
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
L
M
 
K
Q
 
T
R
 
R
I
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
P
P
 
P
G
 
D
A
 
T
A
 
F
Q
 
Q
F
 
V
N
x
H
T
 
A
S
 
G
R
 
M
Q
 
E
F
 
L
-
 
I
E
 
G
E
 
T
L
 
W
I
 
V
E
 
V
E
 
A
G
 
N
L
 
R
L
 
M
L
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
S
P
 
A
V
 
L
A
 
F
E
 
R
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
W
T
 
L
D
 
Q
F
 
A
I
 
F
R
 
-
P
 
P
S
 
K
S
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
D
P
 
L
C
 
I
M
 
S
K
 
Y
D
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
Y
 
W
C
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
I
 
I
H
 
H
S
 
R
A
 
S
Q
 
N
W
 
V
L
 
M
W
 
W
T
 
Y
N
 
L
K
 
P
K
 
A
V
 
K
F
 
L
A
 
K
E
 
G
V
 
W
G
 
G
V
 
V
K
 
N
E
 
P
P
 
P
N
 
R
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
K
F
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
T
A
 
C
P
 
Q
K
 
T
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
Y
 
L
-
 
E
I
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
-
G
 
G
Q
 
E
G
 
N
W
 
W
Q
 
T
E
 
Q
R
 
Q
H
 
H
V
 
L
F
 
W
D
 
E
V
 
S
V
 
V
L
 
A
I
 
L
G
 
A
V
 
V
T
 
L
D
 
G
E
 
P
A
 
D
F
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
N
L
 
L
W
 
W
K
 
N
D
 
G
K
 
K
S
 
L
V
 
K
D
 
F
A
 
T
A
 
D
G
 
P
S
 
K
A
 
A
Q
 
V
M
 
-
R
 
-
K
 
R
V
 
A
F
 
W
E
 
E
T
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
V
R
 
L
Q
 
D
F
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
A
G
 
G
R
 
L
N
 
S
W
 
W
N
 
Q
D
 
Q
A
 
A
T
 
V
N
 
D
M
 
R
V
 
V
I
 
V
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
F
Q
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
R
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
A
 
T
A
 
T
A
 
T
D
 
L
K
 
K
V
 
L
A
 
K
E
 
P
-
 
G
V
 
T
D
 
D
Y
 
F
G
 
A
C
 
W
I
 
A
P
 
P
G
 
S
P
 
P
S
 
G
K
 
T
R
 
Q
P
 
G
Y
 
V
L
 
F
T
 
M
L
 
M
G
 
L
G
 
S
D
|
D
A
 
S
F
 
F
I
 
G
F
 
L
P
 
P
K
 
K
S
 
G
S
 
A
D
 
K
Q
 
N
N
 
R
L
 
Q
E
 
N
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
M
 
I
K
 
N
L
 
W
A
 
L
S
 
R
M
 
L
M
 
V
L
 
G
S
 
S
P
 
K
Y
 
E
I
 
G
Q
 
Q
A
 
D
K
 
T
F
 
S
N
 
N
N
 
P
T
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
L
 
I
P
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
L
D
 
D
V
 
S
D
 
D
L
 
P
T
 
S
V
 
K
A
 
Y
D
 
N
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3oo6A Crystal structures and biochemical characterization of the bacterial solute receptor acbh reveal an unprecedented exclusive substrate preference for b-d-galactopyranose (see paper)
27% identity, 52% coverage: 82:289/397 of query aligns to 75:281/390 of 3oo6A

query
sites
3oo6A
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
P
L
 
I
T
 
D
P
 
D
V
 
V
A
 
W
E
 
D
K
 
K
E
 
I
G
 
G
W
 
G
T
 
T
D
 
-
F
 
F
I
 
N
R
 
D
P
 
A
S
 
A
S
 
K
I
 
S
L
 
L
N
 
S
P
 
K
C
 
G
M
 
L
K
 
-
D
 
D
G
 
G
G
 
H
I
 
Y
Y
 
Y
C
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
-
N
 
-
I
 
L
H
 
Y
S
 
N
A
x
Y
Q
 
P
W
|
W
L
 
V
-
 
V
W
 
F
T
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
Q
E
 
S
V
 
K
G
 
G
V
 
Y
K
 
E
E
 
V
P
 
P
N
 
A
T
 
S
W
 
W
E
 
E
E
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
A
P
 
R
K
 
K
I
 
M
R
 
Q
E
 
S
A
 
D
G
 
G
Y
 
L
I
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
K
-
 
D
G
 
G
W
|
W
Q
 
P
E
 
A
R
 
L
H
 
G
V
 
T
F
 
F
D
 
D
V
 
I
V
 
L
L
 
N
I
 
L
G
 
R
V
 
I
T
 
N
D
 
G
E
 
Y
A
 
D
F
 
Y
W
 
H
N
 
I
R
 
K
L
 
L
-
 
M
-
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
V
-
 
P
W
 
W
K
 
T
D
 
D
K
 
P
S
 
G
V
 
V
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
M
 
-
R
 
T
K
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
D
T
 
Q
F
 
W
G
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
A
Q
 
A
F
 
Y
T
 
Q
D
 
Q
A
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
N
G
 
G
R
 
R
N
 
T
W
 
W
N
 
Q
D
 
D
A
 
A
T
 
A
N
 
K
M
 
A
V
 
L
I
 
E
T
 
N
G
 
K
K
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
M
Q
 
M
V
 
F
M
 
Q
G
 
G
D
 
S
W
 
N
A
 
Q
R
 
V
G
 
A
E
 
A
F
 
N
A
 
Y
A
 
S
A
 
A
D
 
K
K
 
N
V
 
L
A
 
P
E
 
D
V
 
L
D
 
D
Y
 
F
G
 
F
C
 
V
I
 
F
P
 
P
G
 
A
P
 
I
S
 
N
K
 
P
R
 
Q
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
P
 
D
Y
 
Y
L
 
M
T
 
D
L
 
A
G
 
P
G
 
T
D
 
D
A
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7ehpA Chitin oligosaccharide binding protein (see paper)
24% identity, 80% coverage: 80:396/397 of query aligns to 76:392/397 of 7ehpA

query
sites
7ehpA
I
 
V
E
 
K
E
 
A
G
 
G
L
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
I
A
 
L
E
 
N
K
 
E
E
 
L
G
 
G
W
 
L
T
 
K
D
 
D
F
 
K
I
 
F
R
 
-
P
 
P
S
 
N
S
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
Q
P
 
E
C
 
F
M
 
T
K
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
C
 
G
V
 
L
P
 
P
V
 
-
N
 
T
I
 
A
H
 
Y
S
x
F
A
 
V
Q
 
E
W
 
G
L
 
V
W
 
F
T
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
Q
V
 
I
F
 
F
A
 
K
E
 
Q
V
 
L
G
 
N
V
 
V
K
 
D
E
 
V
P
 
P
N
 
R
T
 
R
W
 
W
E
 
E
E
 
D
F
 
L
L
 
M
S
 
D
V
 
V
A
 
A
P
 
A
K
 
K
I
 
A
R
 
K
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
P
 
P
L
 
F
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
S
Q
 
S
-
 
D
G
 
G
W
|
W
Q
 
V
E
 
A
R
 
N
H
 
M
V
 
M
F
 
L
D
 
N
V
 
T
V
 
L
L
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
W
N
 
V
R
 
R
L
 
T
W
 
A
K
 
G
D
 
D
K
 
D
S
 
S
V
 
V
D
 
P
A
 
G
A
 
F
G
 
V
S
 
R
A
 
G
Q
 
T
M
 
R
R
 
R
-
 
W
-
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
A
K
 
D
V
 
G
F
 
F
E
 
K
T
 
R
F
 
Y
G
 
D
A
 
T
L
 
L
-
 
L
-
 
K
R
 
K
Q
 
G
F
 
Y
T
 
L
D
 
Q
A
 
E
G
 
G
A
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
K
W
 
Y
N
 
A
D
 
E
A
 
Q
T
 
Q
N
 
Y
M
 
A
V
 
F
I
 
R
T
 
E
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
M
Q
 
M
V
 
F
M
 
D
G
 
G
D
 
S
W
|
W
A
 
A
R
 
S
G
 
A
E
 
A
F
 
L
-
 
V
-
 
D
A
 
A
A
 
G
A
 
K
D
 
T
K
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
-
D
 
D
Y
 
I
G
 
G
C
 
F
I
 
F
P
 
S
G
 
F
P
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
G
S
 
G
K
 
K
R
 
G
P
 
D
Y
 
G
L
 
M
T
 
I
L
 
N
G
 
G
G
 
G
-
 
Y
-
x
S
D
x
N
A
 
G
F
 
Y
I
 
G
F
 
F
P
 
S
K
 
A
S
 
S
S
 
L
D
 
N
Q
 
E
N
 
R
L
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
A
Q
 
A
M
 
V
K
 
E
L
 
F
A
 
I
S
 
K
M
 
I
M
 
M
L
 
Y
S
 
S
P
 
E
Y
 
E
I
 
M
Q
 
Q
A
 
K
K
 
R
F
 
Q
N
 
L
N
 
K
T
 
E
K
 
S
G
 
G
S
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
A
R
 
M
A
 
K
D
 
L
V
 
S
D
 
D
L
 
L
T
 
S
V
 
G
A
 
V
D
 
H
A
 
P
C
 
V
M
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
M
L
 
I
-
 
Q
-
 
A
A
 
S
L
 
E
L
 
L
D
 
R
D
 
Q
P
 
F
K
 
P
A
 
A
S
 
F
I
x
D
T
 
S
P
 
I
A
 
V
N
 
Q
A
 
A
Y
 
K
I
 
V
T
 
R
E
 
E
D
 
T
T
 
L
N
 
E
G
 
M
Q
 
C
I
 
M
Q
 
Q
D
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
G
T
 
G
F
 
-
W
 
-
N
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
R
M
 
M
S
 
T
V
 
V
D
 
E
N
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
D
V
 
K
F
 
M
K
 
Q
G
 
K
I
 
V
I
 
Q
E
 
E
D
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4c1tA Structure of the xylo-oligosaccharide specific solute binding protein from bifidobacterium animalis subsp. Lactis bl-04 in complex with arabinoxylotriose (see paper)
26% identity, 68% coverage: 77:346/397 of query aligns to 73:347/396 of 4c1tA

query
sites
4c1tA
E
 
K
E
 
E
L
 
M
I
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
G
L
 
Q
L
 
V
L
 
M
D
 
D
L
 
L
T
 
T
P
 
D
V
 
K
A
 
I
E
 
S
K
 
D
E
 
T
G
 
V
W
 
K
T
 
T
D
 
D
F
 
M
I
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
K
S
 
T
I
 
T
L
 
L
N
 
S
P
 
A
C
 
A
M
 
T
K
 
F
D
 
D
G
 
G
G
 
K
I
 
V
Y
 
Y
C
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
S
I
 
V
H
 
E
S
 
P
A
 
G
Q
 
G
W
 
-
L
 
M
W
 
W
T
 
Y
N
 
S
K
 
K
K
 
D
V
 
L
F
 
F
A
 
K
E
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
S
E
 
D
-
 
V
P
 
P
N
 
A
T
 
T
W
 
Y
E
 
E
E
 
E
F
 
L
L
 
L
S
 
A
V
 
D
A
 
A
P
 
K
K
 
K
I
 
L
R
 
K
E
 
D
A
 
S
G
 
G
Y
 
T
I
 
D
P
 
A
L
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
-
 
D
G
 
A
W
|
W
Q
 
P
E
 
A
R
 
A
H
|
H
V
 
W
F
 
Y
-
 
Y
-
 
W
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
C
-
 
S
-
 
P
D
 
E
V
 
V
V
 
Y
L
 
D
I
 
K
G
 
S
V
 
V
T
 
Q
D
 
D
E
 
H
A
 
D
F
 
F
W
 
S
N
 
N
R
 
A
L
 
C
W
 
W
K
 
-
D
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
V
D
 
N
A
 
A
A
 
G
G
 
K
S
 
K
A
 
L
Q
 
Q
M
 
E
R
 
L
K
 
K
V
 
D
F
 
L
E
 
K
T
 
V
F
 
F
-
 
N
-
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
R
 
T
Q
 
T
F
 
T
T
 
A
D
x
Q
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
P
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
W
 
-
N
 
N
D
 
S
A
 
S
T
 
A
N
 
G
M
 
L
V
 
L
I
 
A
T
 
N
G
 
H
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
M
Q
 
E
V
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
A
W
|
W
A
 
E
R
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
L
A
 
K
-
 
D
-
 
L
A
 
T
A
 
P
D
 
D
K
 
Q
V
 
K
A
 
P
E
 
M
V
 
A
D
 
D
Y
 
L
G
 
G
C
 
F
-
 
F
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
E
I
 
V
P
 
A
G
 
G
P
 
G
S
 
E
K
 
G
R
 
E
P
 
P
Y
 
G
L
 
A
T
 
L
L
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
V
A
 
T
F
 
Y
-
 
F
-
 
C
I
 
V
F
 
N
P
 
P
K
 
K
S
 
A
S
 
S
D
 
Q
Q
 
T
N
 
S
L
 
I
E
 
D
A
 
F
A
 
V
Q
 
N
M
 
Y
K
 
M
L
 
G
A
 
E
S
 
K
M
 
K
M
 
N
L
 
Q
S
 
E
P
 
D
Y
 
Y
I
 
A
Q
 
K
A
 
A
K
 
-
F
|
F
N
 
S
N
 
T
T
 
I
K
 
P
G
 
A
S
 
S
L
 
E
P
 
P
V
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
V
V
 
V
A
 
T
D
 
D
A
 
E
C
 
S
M
 
L
K
 
K
K
 
Q
G
 
V
L
 
I
A
 
E
L
 
Y
L
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3vxcA Crystal structure of xylobiose-bxle complex from streptomyces thermoviolaceus opc-520
27% identity, 43% coverage: 81:251/397 of query aligns to 75:249/398 of 3vxcA

query
sites
3vxcA
E
 
E
E
 
A
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
T
P
 
D
V
 
V
A
 
I
E
 
K
K
 
S
E
 
D
G
 
E
W
 
V
T
 
L
D
 
S
F
 
T
I
 
G
R
 
F
P
 
L
S
 
P
S
 
S
I
 
V
L
 
V
N
 
A
P
 
A
C
 
G
M
 
S
K
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
H
I
 
E
Y
 
Y
C
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
M
N
x
R
I
 
G
H
 
M
S
x
Q
A
 
P
Q
 
V
W
 
L
L
 
L
W
 
F
T
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
E
V
 
H
G
 
K
V
 
L
K
 
T
E
 
P
P
 
P
N
 
T
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
Q
F
 
L
L
 
L
S
 
D
V
 
N
A
 
V
P
 
A
K
 
K
I
 
L
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
I
 
T
P
 
P
L
 
F
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
V
Q
 
E
G
 
I
W
|
W
Q
 
P
E
 
E
R
 
L
H
 
M
V
 
W
F
 
L
D
 
E
V
 
Y
V
 
L
L
 
V
I
 
D
G
 
R
V
 
I
T
 
G
D
 
G
E
 
P
A
 
Q
F
 
V
W
 
F
N
 
D
R
 
K
L
 
I
W
 
-
K
 
-
D
 
-
K
 
R
S
 
N
V
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
W
A
 
G
Q
 
D
M
 
-
R
 
P
K
 
A
V
 
V
F
 
L
E
 
K
T
 
A
F
 
A
G
 
Q
A
 
T
L
 
V
R
 
K
Q
 
Q
F
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
F
G
 
G
R
 
K
N
 
G
W
 
F
N
 
S
D
 
S
-
 
V
-
 
S
-
 
Y
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
A
T
 
P
N
 
A
M
 
L
V
 
L
I
 
A
T
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
M
Q
 
H
V
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
S
W
|
W

Sites not aligning to the query:

2w7yA Structure of a streptococcus pneumoniae solute-binding protein in complex with the blood group a-trisaccharide. (see paper)
27% identity, 63% coverage: 80:331/397 of query aligns to 76:317/389 of 2w7yA

query
sites
2w7yA
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
G
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
K
P
 
P
V
 
Y
A
 
I
E
 
D
K
 
S
E
 
N
G
 
K
W
 
L
T
 
E
D
 
K
F
 
N
I
 
V
R
 
G
P
 
L
S
 
N
S
 
Y
I
 
K
L
 
Q
N
 
N
P
 
-
C
 
-
M
 
Q
K
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
C
 
T
V
 
V
P
 
H
V
 
E
N
x
Q
I
 
L
H
x
F
S
 
T
A
 
-
Q
 
M
W
 
G
L
 
L
W
 
W
T
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
D
V
 
I
F
 
F
A
 
A
E
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
K
E
 
T
P
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
W
N
 
N
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
D
F
 
F
L
 
T
S
 
Q
V
 
A
A
 
M
P
 
A
K
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
Q
G
 
D
Y
 
G
I
 
V
P
 
-
L
 
Y
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
A
Q
 
-
G
 
G
W
 
E
Q
 
P
E
 
S
R
 
I
H
 
R
V
 
L
F
 
F
D
 
N
V
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
-
G
 
G
V
 
T
T
 
T
D
 
E
E
 
N
A
 
G
F
 
-
W
 
-
N
 
-
R
 
R
L
 
K
W
 
L
K
 
L
D
 
D
K
 
K
S
 
P
V
 
L
D
 
T
A
 
K
A
 
E
G
 
G
-
 
I
-
 
E
S
 
S
A
 
K
Q
 
E
M
 
F
R
 
A
K
 
D
V
 
A
F
 
L
E
 
K
T
 
M
F
 
V
G
 
M
A
 
K
L
 
E
R
 
I
Q
 
Q
F
 
A
T
 
N
D
 
G
A
 
S
G
 
K
A
 
N
P
 
A
G
 
G
R
 
G
N
 
D
W
 
A
N
 
N
D
 
A
A
 
Y
T
 
S
N
 
K
M
 
D
V
 
F
I
 
Q
T
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
A
 
A
A
 
V
Q
 
F
V
 
F
M
 
N
G
 
G
D
 
V
W
|
W
A
 
A
R
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
M
A
 
S
A
 
K
A
 
N
D
 
P
K
 
S
V
 
L
A
 
A
E
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
-
C
 
-
I
 
-
P
 
P
G
 
G
-
 
I
-
 
Y
P
 
P
S
 
A
K
 
G
R
 
V
P
 
A
Y
 
I
L
 
S
T
 
S
L
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
G
A
 
I
F
 
T
I
 
I
F
 
S
P
 
S
K
 
K
S
 
M
S
 
S
D
 
E
Q
 
A
N
 
K
L
 
Q
E
 
K
A
 
L
A
 
A
Q
 
-
M
 
L
K
 
E
L
 
F
A
 
L
S
 
K
M
 
Y
M
 
M
L
 
T
S
 
S
P
 
D
Y
 
D
I
 
V
Q
 
Q
A
 
K
K
 
V
F
 
I
N
 
F
N
 
E
T
 
K
K
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
N
P
 
P
V
 
S
R
 
N
A
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
N
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6r1bB Crystal structure of ugpb from mycobacterium tuberculosis in complex with glycerophosphocholine (see paper)
24% identity, 64% coverage: 98:352/397 of query aligns to 95:336/395 of 6r1bB

query
sites
6r1bB
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
I
 
V
R
 
-
P
 
-
S
 
D
S
 
S
I
 
L
L
 
L
N
 
A
P
 
D
C
 
Y
M
 
E
K
 
F
D
 
N
G
 
G
G
 
R
I
 
H
Y
 
Y
C
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
Y
N
 
-
I
 
A
H
 
R
S
|
S
A
 
T
Q
 
P
W
 
L
L
 
F
W
 
Y
T
 
Y
N
 
N
K
 
K
K
 
A
V
 
A
F
 
W
A
 
Q
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
P
E
 
D
-
 
R
-
 
G
P
 
P
N
 
Q
T
 
S
W
 
W
E
 
S
E
 
E
F
 
F
L
 
D
S
 
E
V
 
W
A
 
G
P
 
P
K
 
E
I
 
L
R
 
Q
E
 
R
A
 
V
G
 
-
Y
 
-
I
 
V
P
 
G
L
 
A
A
 
G
F
 
R
G
 
S
G
 
A
Q
 
H
G
 
G
W
 
W
Q
 
A
E
 
N
R
 
A
H
 
D
V
 
L
F
 
I
D
 
S
V
x
W
V
 
T
L
 
F
I
 
Q
G
 
G
V
 
-
T
 
P
D
 
N
E
 
W
A
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
S
-
 
D
-
 
K
W
 
W
N
 
T
R
 
L
L
 
T
W
 
L
K
 
T
D
 
E
K
 
P
S
 
A
V
 
T
D
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
N
A
 
F
Q
 
Y
M
 
R
R
 
N
K
 
S
V
 
I
F
 
H
-
 
G
E
 
K
T
 
G
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
L
 
V
R
 
A
Q
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
W
 
-
N
 
N
D
 
D
A
 
I
T
 
A
N
 
N
M
 
E
V
 
F
I
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
A
V
 
V
M
 
A
G
 
-
D
 
-
W
 
-
A
x
S
R
 
T
G
 
G
E
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
I
D
 
T
K
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
R
V
 
F
D
 
D
Y
 
F
G
 
G
C
 
A
I
 
A
P
 
P
-
 
L
-
 
P
-
 
T
G
 
G
P
 
P
S
 
D
K
 
A
R
 
A
P
 
P
Y
 
A
L
 
C
T
 
P
L
 
T
G
|
G
G
|
G
D
 
A
A
 
G
F
 
L
I
 
A
F
 
I
P
 
P
K
 
A
S
 
K
S
 
L
D
 
S
Q
 
E
N
 
E
L
 
R
E
 
K
A
 
V
A
 
N
Q
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
I
S
 
A
M
 
F
M
 
V
L
 
T
S
 
N
P
 
P
Y
 
T
I
 
N
Q
 
T
A
 
A
K
 
Y
F
 
F
N
 
S
N
 
Q
T
 
Q
K
 
T
G
 
G
S
x
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
K
D
 
S
V
 
A
D
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
A
C
 
S
M
 
E
K
 
R
K
 
H
G
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
-
L
 
-
D
 
D
D
 
N
P
 
P
K
 
R
A
 
A
S
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4g68A Biochemical and structural insights into xylan utilization by the thermophilic bacteriumcaldanaerobius polysaccharolyticus (see paper)
24% identity, 52% coverage: 77:283/397 of query aligns to 70:280/392 of 4g68A

query
sites
4g68A
E
 
Q
E
 
P
L
 
F
I
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
G
L
 
K
L
 
V
L
 
L
D
 
Q
L
 
L
T
 
D
P
 
S
V
 
Y
A
 
L
E
 
N
K
 
-
E
 
D
G
 
G
W
 
T
T
 
K
D
 
D
F
 
Q
I
 
L
R
 
L
P
 
P
S
 
G
S
 
S
I
 
F
L
 
D
N
 
N
P
 
-
C
 
V
M
 
T
K
 
Y
D
 
N
G
 
G
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
C
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
F
N
 
D
I
 
-
H
 
Q
S
x
Q
A
 
A
Q
 
S
W
 
V
L
 
L
W
 
Y
T
 
I
N
 
N
K
 
K
K
 
E
V
 
L
F
 
F
A
 
D
E
 
K
V
 
Y
G
 
N
V
 
V
K
 
K
E
 
V
P
 
P
N
 
T
T
 
T
W
 
F
E
 
S
E
 
E
F
 
L
L
 
I
S
 
D
V
 
A
A
 
I
P
 
K
K
 
T
I
 
F
R
 
K
E
 
S
A
 
K
G
 
G
Y
 
V
I
 
T
P
 
P
L
 
F
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
E
Q
 
K
G
 
D
-
 
E
W
|
W
Q
 
P
E
 
G
R
 
M
H
x
W
V
 
Y
F
 
Y
D
 
D
V
 
M
V
 
I
L
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
G
I
 
V
G
 
Q
V
 
L
T
 
T
D
 
R
E
 
D
A
 
A
F
 
L
W
 
N
N
 
G
R
 
K
L
 
A
W
 
S
K
 
F
D
 
D
K
 
N
S
 
Q
V
 
A
D
 
F
A
 
T
A
 
D
G
 
A
S
 
A
A
 
Q
Q
 
K
M
 
L
R
 
Q
K
 
D
V
 
M
F
 
V
E
 
N
T
 
A
F
 
-
G
 
G
A
 
A
L
 
F
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
F
P
 
M
G
 
G
R
 
L
N
 
T
W
x
R
N
 
D
D
 
E
A
 
A
T
 
T
N
 
A
M
 
E
V
 
F
I
 
N
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
M
Q
 
Y
V
 
F
M
 
G
G
 
G
D
 
N
W
x
F
A
 
D
R
 
A
G
 
A
E
 
A
F
 
F
A
 
V
A
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
V
A
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
E
E
 
A
V
 
V
D
 
R
Y
 
F
G
 
P
C
 
T
I
 
I
P
 
E
G
 
G
P
 
G
S
 
K
K
 
G
R
 
D
P
 
P
Y
 
T
L
 
E
T
 
Y
L
 
I
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5ysdB Crystal structure of beta-1,2-glucooligosaccharide binding protein in complex with sophorotriose (see paper)
28% identity, 38% coverage: 11:161/397 of query aligns to 2:151/389 of 5ysdB

query
sites
5ysdB
E
 
K
V
 
V
I
 
L
H
 
N
W
 
V
W
 
W
T
 
A
S
 
M
G
 
G
G
 
D
E
|
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
S
V
 
L
T
 
K
V
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
K
F
 
F
N
 
T
K
 
K
L
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
D
K
 
T
W
 
G
V
 
I
D
 
E
T
 
V
A
 
K
V
 
V
A
 
Q
L
 
V
G
 
I
E
 
P
-
x
W
-
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
H
A
 
D
L
 
K
T
 
L
M
 
L
Q
 
T
R
 
A
I
 
V
L
 
A
G
 
S
G
 
K
D
 
S
A
 
G
P
 
P
G
 
D
A
 
V
A
 
V
Q
 
Q
F
 
M
N
x
G
T
|
T
S
x
T
R
 
-
Q
x
W
F
 
M
E
 
P
E
 
E
L
 
F
I
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
K
V
 
D
A
 
V
E
 
E
K
 
K
E
 
S
G
 
K
W
 
N
-
 
M
-
 
N
T
 
S
D
 
D
F
 
L
I
 
F
R
 
F
P
 
P
S
 
G
S
 
S
I
 
V
L
 
-
N
 
K
P
 
T
C
 
T
M
 
Q
K
 
F
D
 
D
G
 
G
G
 
K
I
 
T
Y
 
Y
C
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
W
N
x
Y
I
 
A
H
x
E
S
 
T
A
 
-
Q
 
R
W
 
V
L
 
L
W
 
F
T
 
Y
N
 
R
K
 
T
K
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
Y
K
 
N
E
 
E
-
 
A
P
 
P
N
 
K
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
E
F
 
L
L
 
S
S
 
D
V
 
A
A
 
A
P
 
L
K
 
K
I
 
L
R
 
S
E
 
K
A
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5ysdA Crystal structure of beta-1,2-glucooligosaccharide binding protein in complex with sophorotriose (see paper)
28% identity, 38% coverage: 11:161/397 of query aligns to 2:151/387 of 5ysdA

query
sites
5ysdA
E
 
K
V
 
V
I
 
L
H
 
N
W
 
V
W
 
W
T
 
A
S
 
M
G
 
G
G
 
D
E
|
E
Q
 
A
K
 
K
A
 
S
V
 
L
T
 
K
V
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
K
F
 
F
N
 
T
K
 
K
L
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
D
K
 
T
W
 
G
V
 
I
D
 
E
T
 
V
A
 
K
V
 
V
A
 
Q
L
 
V
G
 
I
E
 
P
-
x
W
-
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
H
A
 
D
L
 
K
T
 
L
M
 
L
Q
 
T
R
 
A
I
 
V
L
 
A
G
 
S
G
 
K
D
 
S
A
 
G
P
 
P
G
 
D
A
 
V
A
 
V
Q
 
Q
F
 
M
N
x
G
T
|
T
S
x
T
R
 
-
Q
x
W
F
 
M
E
 
P
E
 
E
L
 
F
I
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
K
V
 
D
A
 
V
E
 
E
K
 
K
E
 
S
G
 
K
W
 
N
-
 
M
-
 
N
T
 
S
D
 
D
F
 
L
I
 
F
R
 
F
P
 
P
S
 
G
S
 
S
I
 
V
L
 
-
N
 
K
P
 
T
C
 
T
M
 
Q
K
 
F
D
 
D
G
 
G
G
 
K
I
 
T
Y
 
Y
C
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
W
N
x
Y
I
 
A
H
x
E
S
 
T
A
 
-
Q
 
R
W
 
V
L
 
L
W
 
F
T
 
Y
N
 
R
K
 
T
K
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
Y
K<