SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_138919801.1 NCBI__GCF_000224785.1:WP_138919801.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q93LQ8 Beta-glucoside kinase; EC 2.7.1.85 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
34% identity, 98% coverage: 1:293/300 of query aligns to 3:285/297 of Q93LQ8

query
sites
Q93LQ8
M
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
F
D
|
D
I
 
I
G
|
G
G
 
G
T
 
T
S
 
A
I
 
L
K
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
M
D
 
A
E
 
R
A
 
D
G
 
G
S
 
R
I
 
-
L
 
L
M
 
L
D
 
E
D
 
T
S
 
A
F
 
R
P
 
Q
S
 
S
Q
 
I
A
 
N
H
 
D
L
 
S
G
 
D
G
 
G
E
 
D
A
 
R
I
 
I
I
 
L
K
 
Q
N
 
A
V
 
M
I
 
L
A
 
S
K
 
W
S
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
L
Q
 
A
H
 
A
E
 
H
W
 
P
N
 
S
L
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
P
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I
D
 
D
N
 
P
Q
 
H
E
 
S
G
 
G
V
 
L
V
 
I
V
 
T
H
 
M
A
 
G
T
 
-
G
 
G
N
 
A
I
 
I
P
 
R
G
 
R
Y
 
F
T
 
D
G
 
N
V
 
F
Q
 
A
I
 
M
K
 
K
K
 
S
T
 
W
I
 
L
Q
 
E
D
 
T
A
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
P
V
 
V
T
 
S
A
 
V
E
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
T
 
V
A
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
R
W
 
W
K
 
Q
G
 
G
A
 
K
A
 
A
M
 
A
G
 
E
A
 
M
E
 
A
D
 
N
F
 
F
L
 
L
C
 
V
V
 
L
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
I
 
I
G
|
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
F
 
F
T
 
C
D
 
Q
G
 
H
K
 
Q
L
 
L
S
 
I
T
 
N
G
 
G
S
 
A
R
 
R
F
 
F
S
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
 
Y
-
 
M
I
 
L
N
 
T
L
 
D
Y
 
R
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
D
C
 
P
T
 
R
C
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
R
G
 
Y
C
 
S
L
 
M
E
 
N
Q
 
E
Y
 
N
A
 
C
S
 
T
S
 
L
S
 
R
A
 
V
L
 
L
Q
 
R
E
 
H
M
 
R
I
 
Y
F
 
A
E
 
Q
T
 
H
L
 
I
G
 
G
Y
 
A
K
 
P
M
 
L
E
 
D
L
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
G
K
 
E
E
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
R
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
P
K
 
V
C
 
C
T
 
Q
W
 
R
L
 
L
Y
 
V
N
 
A
R
 
E
W
 
F
I
 
F
D
 
N
D
 
G
L
 
L
T
 
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
Y
S
 
N
I
 
L
V
 
V
H
 
H
I
 
I
L
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
T
I
 
I
V
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
V
S
 
V
A
 
E
Q
 
R
G
 
P
D
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
-
N
 
-
P
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
S
 
-
K
 
T
I
 
L
M
 
L
P
 
R
N
 
Q
H
 
H
A
 
L
A
 
A
S
 
W
L
 
F
D
 
G
I
 
I
R
 
A
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
D
I
 
T
A
 
V
Q
 
S
H
 
H
A
 
G
N
 
N
Q
 
D
A
 
A
N
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
V
K
 
Y
H
 
H
F
 
F

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
32% identity, 95% coverage: 5:290/300 of query aligns to 12:316/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
D
 
D
I
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
T
I
 
I
K
 
K
Y
 
F
G
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
T
E
 
T
A
 
D
G
 
G
S
 
V
I
 
V
L
 
Q
M
 
Q
D
 
K
D
 
W
S
 
S
F
 
I
P
 
E
S
 
T
Q
 
N
A
 
I
H
 
L
L
 
E
G
 
D
G
 
G
E
 
K
A
 
H
I
 
I
I
 
V
K
 
P
N
 
S
V
 
I
I
 
I
A
 
E
K
 
S
S
 
I
R
 
R
E
 
H
L
 
R
Q
 
I
H
 
D
E
 
L
W
 
Y
N
 
N
L
 
M
D
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
G
I
 
M
S
 
G
S
 
T
A
 
P
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
D
N
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
T
V
 
V
V
 
V
H
 
G
A
 
A
T
 
Y
G
 
-
N
 
N
I
 
L
P
 
N
G
 
W
Y
 
T
T
 
T
G
 
V
V
 
Q
Q
 
P
I
 
V
K
 
K
K
 
E
T
 
Q
I
 
I
Q
 
E
D
 
S
A
 
A
T
 
L
G
 
G
L
 
I
N
 
P
V
 
F
T
 
A
A
 
L
E
 
D
N
|
N
D
 
D
V
 
A
N
|
N
C
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Y
 
R
W
 
W
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
G
M
 
E
G
 
N
A
 
N
E
 
P
D
 
D
F
 
V
L
 
I
C
 
F
V
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
I
F
 
V
T
 
A
D
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
L
S
 
L
T
 
H
G
 
G
S
 
V
R
 
A
F
 
G
S
 
C
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
G
 
G
H
|
H
I
 
V
N
 
T
L
 
V
Y
 
D
P
 
P
G
 
N
G
 
G
K
 
F
A
 
D
C
|
C
T
 
T
C
|
C
G
 
G
D
 
K
S
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
L
-
 
S
E
 
E
Q
 
E
Y
 
F
A
 
A
S
 
G
S
 
D
S
 
S
A
 
E
L
 
L
Q
 
K
E
 
Q
M
 
A
I
 
I
F
 
D
E
 
D
T
 
-
L
 
-
G
 
G
Y
 
Q
K
 
D
M
 
V
E
 
S
L
 
S
K
 
K
E
 
D
F
 
V
F
 
F
D
 
E
R
 
F
L
 
A
R
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
D
E
 
H
K
 
F
C
 
A
T
 
L
W
 
M
L
 
V
Y
 
V
N
 
D
R
 
R
W
 
V
I
 
C
D
 
F
D
 
Y
L
 
L
T
 
G
T
 
L
G
 
A
L
 
T
K
 
G
S
 
N
I
 
L
V
 
G
H
 
N
I
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
V
S
 
S
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
D
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
R
N
 
S
P
 
R
I
 
V
K
 
E
K
 
K
S
 
Y
L
 
F
S
 
Q
S
 
E
K
 
F
I
 
T
M
 
F
P
 
P
N
 
Q
H
 
V
A
 
R
A
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
K
I
 
I
R
 
K
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
A
 
G
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
N
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
34% identity, 95% coverage: 5:290/300 of query aligns to 7:306/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
D
 
D
I
 
I
G
|
G
G
 
G
T
|
T
S
x
K
I
 
I
K
 
A
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
I
L
 
L
M
 
-
D
 
-
D
 
S
S
 
T
F
 
F
P
 
K
S
 
V
Q
 
A
A
 
T
H
 
P
L
 
P
G
 
T
G
 
A
E
 
E
A
 
G
I
 
I
I
 
V
K
 
D
N
 
A
V
 
I
I
 
C
A
 
A
K
 
A
S
 
V
R
 
A
E
 
G
L
 
A
Q
 
S
H
 
E
E
 
G
W
 
H
N
 
D
L
 
V
D
 
E
G
 
A
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
A
A
 
A
G
|
G
Q
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
D
Q
 
K
E
 
R
G
 
A
V
 
T
V
 
V
V
 
L
H
 
F
A
 
A
T
x
P
G
 
-
N
 
N
I
 
I
P
 
D
G
 
-
Y
 
W
T
 
R
G
 
H
V
 
E
Q
 
P
I
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
K
I
 
V
Q
 
E
D
 
Q
A
 
R
T
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
P
V
 
V
T
 
V
A
 
V
E
 
E
N
|
N
D
|
D
V
 
A
N
 
N
C
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
W
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
W
 
R
K
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
G
M
 
Q
G
 
G
A
 
H
E
 
D
D
 
D
F
 
V
L
 
I
C
 
C
V
 
I
T
 
T
I
 
L
G
|
G
T
|
T
G
 
G
I
x
L
G
|
G
G
 
G
A
 
G
I
 
I
F
 
I
T
 
I
D
 
G
G
 
N
K
 
K
L
 
L
S
 
R
T
 
R
G
 
G
S
 
R
R
 
F
F
 
G
S
 
V
A
 
A
G
 
A
E
|
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
I
N
 
R
L
 
V
Y
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
G
K
 
L
A
 
L
C
|
C
T
 
G
C
|
C
G
 
G
D
 
S
S
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
|
E
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
S
x
G
S
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
T
Q
 
P
E
 
E
M
 
N
I
 
A
F
 
A
E
 
V
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
K
 
G
M
 
I
E
 
E
L
x
G
K
 
K
E
 
H
F
 
I
F
x
S
D
 
E
R
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
P
K
 
V
C
 
A
T
 
V
W
 
D
L
 
S
Y
 
F
N
 
R
R
 
E
W
 
L
I
 
A
D
 
R
D
 
W
L
 
A
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
A
S
 
D
I
 
L
V
 
A
H
 
S
I
 
L
L
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
A
I
 
F
V
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
x
V
S
 
S
A
 
D
Q
x
E
G
 
G
D
 
E
F
 
L
L
 
V
L
 
L
N
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
R
K
 
K
S
 
S
L
 
F
S
 
R
S
 
R
K
 
W
I
 
L
M
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
W
P
 
R
N
 
P
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
S
 
V
L
 
L
D
 
-
I
 
-
R
 
-
I
 
A
A
 
A
Q
 
Q
H
 
L
A
 
G
N
 
G
Q
 
K
A
 
A
N
 
G
L
 
L
L
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
34% identity, 95% coverage: 5:290/300 of query aligns to 7:306/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
D
 
D
I
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
K
I
 
I
K
 
A
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
I
L
 
L
M
 
-
D
 
-
D
 
S
S
 
T
F
 
F
P
 
K
S
 
V
Q
 
A
A
 
T
H
 
P
L
 
P
G
 
T
G
 
A
E
 
E
A
 
G
I
 
I
I
 
V
K
 
D
N
 
A
V
 
I
I
 
C
A
 
A
K
 
A
S
 
V
R
 
A
E
 
G
L
 
A
Q
 
S
H
 
E
E
 
G
W
 
H
N
 
D
L
 
V
D
 
E
G
 
A
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
D
Q
 
K
E
 
R
G
 
A
V
 
T
V
 
V
V
 
L
H
 
F
A
 
A
T
 
P
G
 
-
N
 
N
I
 
I
P
 
D
G
 
-
Y
 
W
T
 
R
G
 
H
V
 
E
Q
 
P
I
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
K
I
 
V
Q
 
E
D
 
Q
A
 
R
T
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
P
V
 
V
T
 
V
A
 
V
E
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
W
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
W
 
R
K
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
G
M
 
Q
G
 
G
A
 
H
E
 
D
D
 
D
F
 
V
L
 
I
C
 
C
V
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
I
F
 
I
T
 
I
D
 
G
G
 
N
K
 
K
L
 
L
S
 
R
T
 
R
G
 
G
S
 
R
R
 
F
F
 
G
S
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
I
N
 
R
L
 
V
Y
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
G
K
 
L
A
 
L
C
|
C
T
 
G
C
|
C
G
 
G
D
 
S
S
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
S
 
G
S
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
T
Q
 
P
E
 
E
M
 
N
I
 
A
F
 
A
E
 
V
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
K
 
G
M
 
I
E
 
E
L
 
G
K
 
K
E
 
H
F
 
I
F
 
S
D
 
E
R
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
E
 
P
K
 
V
C
 
A
T
 
V
W
 
D
L
 
S
Y
 
F
N
 
R
R
 
E
W
 
L
I
 
A
D
 
R
D
 
W
L
 
A
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
A
S
 
D
I
 
L
V
 
A
H
 
S
I
 
L
L
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
A
I
 
F
V
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
V
S
 
S
A
 
D
Q
 
E
G
 
G
D
 
E
F
 
L
L
 
V
L
 
L
N
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
R
K
 
K
S
 
S
L
 
F
S
 
R
S
 
R
K
 
W
I
 
L
M
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
W
P
 
R
N
 
P
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
S
 
V
L
 
L
D
 
-
I
 
-
R
 
-
I
 
A
A
 
A
Q
 
Q
H
 
L
A
 
G
N
 
G
Q
 
K
A
 
A
N
 
G
L
 
L
L
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
33% identity, 96% coverage: 4:290/300 of query aligns to 6:288/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
F
 
L
D
 
D
I
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
K
I
 
I
K
 
A
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
F
D
 
D
E
 
-
A
 
-
G
 
G
S
 
K
I
 
R
L
 
L
M
 
L
D
 
S
D
 
K
S
 
V
F
 
V
P
 
V
S
 
P
Q
 
T
A
 
P
H
 
K
L
 
E
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
R
I
 
V
I
 
A
K
 
E
N
 
A
V
 
L
I
 
A
A
 
E
K
 
A
S
 
A
R
 
E
E
 
R
L
 
A
Q
 
E
H
 
R
E
 
E
W
 
A
N
 
G
L
 
V
D
 
R
G
 
G
-
 
E
-
 
A
I
 
I
A
 
G
I
 
L
S
 
G
S
 
T
A
 
P
G
 
G
Q
 
P
I
 
L
D
 
D
N
 
F
Q
 
R
E
 
R
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
R
G
 
P
N
 
N
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
V
T
 
Q
G
 
D
V
 
F
Q
 
P
I
 
I
K
 
R
K
 
R
T
 
I
I
 
L
Q
 
E
D
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
R
N
 
P
V
 
V
T
 
F
A
 
L
E
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
H
W
 
H
K
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
A
 
E
E
 
E
D
 
S
F
 
S
L
 
L
C
 
Y
V
 
L
T
 
T
I
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
V
F
 
V
T
 
L
D
 
G
G
 
G
K
 
R
L
 
V
S
 
L
T
 
R
G
 
G
S
 
E
R
 
R
F
 
G
S
 
Q
A
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
N
 
T
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
P
A
 
A
C
|
C
T
 
G
C
|
C
G
 
G
D
 
L
S
 
E
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
Q
 
A
Y
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
G
S
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
E
 
R
M
 
D
I
 
A
F
 
T
E
 
Y
T
 
A
L
 
F
G
 
Q
Y
 
R
K
 
P
M
 
V
E
 
D
L
 
T
K
 
R
E
 
E
F
 
L
F
 
F
D
 
R
R
 
L
L
 
F
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
P
K
 
K
C
 
A
T
 
E
W
 
R
L
 
L
Y
 
V
N
 
L
R
 
Q
W
 
A
I
 
A
D
 
R
D
 
Y
L
 
V
T
 
G
T
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
A
S
 
S
I
 
L
V
 
V
H
 
K
I
 
A
L
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
G
L
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
V
S
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
W
D
 
E
F
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
E
P
 
A
I
 
Y
K
 
R
K
 
R
S
 
Y
L
 
L
S
 
Q
S
 
G
K
 
W
I
 
E
M
 
A
P
 
P
N
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
P
I
 
L
R
 
R
I
 
R
A
 
A
Q
 
R
H
 
L
A
 
G
N
 
A
Q
 
E
A
 
A
N
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
28% identity, 93% coverage: 13:290/300 of query aligns to 96:382/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
Y
 
F
G
 
A
V
 
L
V
 
T
D
 
D
E
 
L
A
 
N
G
 
A
S
 
E
I
 
I
L
 
I
M
 
E
D
 
N
D
 
T
S
 
S
F
 
I
P
 
P
-
 
F
-
 
S
-
 
S
-
 
E
S
 
K
Q
 
K
A
 
P
H
 
E
L
 
E
G
 
A
G
 
I
E
 
E
A
 
L
I
 
I
I
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
V
-
 
K
-
 
K
I
 
M
A
 
C
K
 
G
S
 
N
R
 
R
E
 
D
L
 
M
Q
 
N
H
 
H
E
 
-
W
 
-
N
 
-
L
 
L
D
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
A
S
 
I
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
I
 
V
D
 
N
N
 
R
Q
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
T
V
 
V
V
 
I
H
 
R
A
 
S
T
 
T
G
 
-
N
 
-
I
 
M
P
 
L
G
 
G
Y
 
W
T
 
E
G
 
N
V
 
V
Q
 
A
I
 
L
K
 
E
K
 
A
T
 
M
I
 
L
Q
 
H
-
 
A
D
 
H
A
 
F
T
 
P
G
 
D
L
 
I
N
 
P
V
 
V
T
 
Y
A
 
V
E
 
D
N
 
K
D
 
N
V
 
I
N
 
N
C
 
C
T
 
Y
A
 
T
L
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
W
 
W
K
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
G
M
 
K
G
 
Q
A
 
S
E
 
N
D
 
N
F
 
F
L
 
A
C
 
T
V
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
L
A
 
S
I
 
V
F
 
V
T
 
I
D
 
N
G
 
R
K
 
Q
L
 
I
S
 
Y
T
 
Y
G
 
G
S
 
A
R
 
Q
F
 
G
S
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
T
N
 
T
L
 
I
Y
 
Q
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
Y
A
 
K
C
|
C
T
 
H
C
|
C
G
 
G
D
 
Q
S
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
S
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
E
M
 
F
I
 
Y
F
 
F
E
 
R
T
 
N
L
 
R
G
 
G
Y
 
E
K
 
E
M
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
S
E
 
E
L
 
L
K
 
N
E
 
D
F
 
F
-
 
H
F
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
E
K
 
M
C
 
A
T
 
T
W
 
E
L
 
L
Y
 
M
N
 
G
R
 
K
W
 
M
I
 
G
D
 
E
D
 
Y
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
G
 
G
L
 
I
K
 
R
S
 
N
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
T
L
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
I
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
V
G
 
G
G
 
E
I
 
G
S
 
L
A
 
H
Q
 
H
G
 
R
D
 
D
F
 
L
L
 
F
L
 
L
N
 
T
P
 
K
I
 
I
K
 
D
K
 
E
S
 
I
L
 
A
S
 
S
S
 
Q
K
 
N
I
 
F
M
 
F
P
 
S
N
 
G
H
 
A
A
 
G
A
 
F
S
 
E
L
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
T
I
 
T
A
 
T
Q
 
S
H
 
L
A
 
E
N
 
D
Q
 
P
A
 
A
N
 
W
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
28% identity, 93% coverage: 13:290/300 of query aligns to 15:298/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
Y
 
F
G
 
A
V
 
L
V
 
T
D
 
D
E
 
L
A
 
N
G
 
A
S
 
E
I
 
I
L
 
I
M
 
E
D
 
N
D
 
T
S
 
S
F
 
I
P
 
P
-
 
F
-
 
S
-
 
S
-
 
E
S
 
K
Q
 
K
A
 
P
H
 
E
L
 
E
G
 
A
G
 
I
E
 
E
A
 
L
I
 
I
I
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
V
-
 
K
-
 
K
I
 
M
A
 
C
K
 
G
S
 
N
R
 
R
E
 
D
L
 
M
Q
 
N
H
 
H
E
 
-
W
 
-
N
 
-
L
 
L
D
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
A
S
 
I
A
 
S
G
|
G
Q
 
L
I
 
V
D
 
N
N
 
R
Q
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
T
V
 
V
V
 
I
H
 
R
A
 
S
T
 
T
G
 
-
N
 
-
I
 
M
P
 
L
G
 
G
Y
 
W
T
 
E
G
 
N
V
 
V
Q
 
A
I
 
L
K
 
E
K
 
A
T
 
M
I
 
L
Q
 
H
-
 
A
D
 
H
A
 
F
T
 
P
G
 
D
L
 
I
N
 
P
V
 
V
T
 
Y
A
 
V
E
 
D
N
 
K
D
x
N
V
 
I
N
 
N
C
 
C
T
 
Y
A
 
T
L
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
W
 
W
K
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
G
M
 
K
G
 
Q
A
 
S
E
 
N
D
 
N
F
 
F
L
 
A
C
 
T
V
 
V
T
x
S
I
x
V
G
 
G
T
 
A
G
|
G
I
x
L
G
|
G
G
 
L
A
 
S
I
 
V
F
 
V
T
 
I
D
 
N
G
 
R
K
 
Q
L
 
I
S
 
Y
T
 
Y
G
 
G
S
 
A
R
 
Q
F
 
G
S
 
G
A
 
A
G
 
G
E
|
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
T
N
 
T
L
 
I
Y
 
Q
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
Y
A
 
K
C
|
C
T
 
H
C
|
C
G
 
G
D
 
Q
S
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
|
E
Q
 
M
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
S
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
E
M
 
F
I
 
Y
F
 
F
E
 
R
T
 
N
L
 
R
G
 
G
Y
 
E
K
 
E
M
 
L
E
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
P
L
 
L
K
 
N
E
 
D
F
 
F
-
 
H
F
 
F
D
 
D
R
 
K
L
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
E
K
 
M
C
 
A
T
 
T
W
 
E
L
 
L
Y
 
M
N
 
G
R
 
K
W
 
M
I
 
G
D
 
E
D
 
Y
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
G
 
G
L
 
I
K
 
R
S
 
N
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
T
L
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
I
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
V
G
 
G
G
x
E
I
 
G
S
 
L
A
 
H
Q
 
H
G
 
R
D
 
D
F
 
L
L
 
F
L
 
L
N
 
T
P
 
K
I
 
I
K
 
D
K
 
E
S
 
I
L
 
A
S
 
S
S
 
Q
K
 
N
I
 
F
M
 
F
P
 
S
N
 
G
H
 
A
A
 
G
A
 
F
S
 
E
L
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
T
I
 
T
A
 
T
Q
 
S
H
 
L
A
 
E
N
 
D
Q
 
P
A
 
A
N
x
W
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7p9pAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 96% coverage: 4:290/300 of query aligns to 7:300/304 of 7p9pAAA

query
sites
7p9pAAA
F
 
F
D
 
D
I
 
I
G
 
G
G
|
G
T
|
T
S
x
K
I
 
I
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
F
D
 
D
E
 
A
A
 
D
G
 
L
S
 
V
I
 
R
L
 
V
M
 
A
D
 
R
D
 
E
S
 
R
F
 
V
-
 
A
-
 
T
P
 
P
S
 
T
Q
 
E
A
 
S
H
 
Y
L
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
A
A
 
A
I
 
F
I
 
L
K
 
D
N
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
T
K
 
L
S
 
V
R
 
N
E
 
N
L
 
A
Q
 
D
H
 
A
E
 
E
W
 
F
N
 
G
L
 
V
D
 
K
G
 
G
-
 
T
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
I
A
 
P
G
 
G
Q
 
I
I
 
A
D
 
D
N
 
V
Q
 
E
E
 
T
G
 
G
V
 
K
V
 
L
V
 
L
H
 
-
A
 
-
T
 
T
G
 
S
N
 
N
I
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
 
A
T
 
M
G
 
G
V
 
H
Q
 
T
I
 
L
K
 
Q
K
 
R
T
 
D
I
 
L
Q
 
E
D
 
E
A
 
R
T
 
L
G
 
Q
L
 
R
N
 
P
V
 
V
T
 
K
A
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
T
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
S
E
 
E
Y
 
A
W
 
W
K
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
E
E
 
P
D
 
S
F
 
V
L
 
L
C
 
G
V
 
L
T
 
I
I
 
L
G
|
G
T
|
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
L
F
 
I
T
 
F
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
R
R
 
A
F
 
N
S
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
N
 
R
L
 
L
-
 
P
Y
 
Y
P
 
D
G
 
A
G
 
L
K
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
F
A
 
P
C
|
C
T
 
G
C
|
C
G
 
K
D
 
N
S
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D
Q
 
N
Y
 
Y
A
 
L
S
 
S
S
x
G
S
 
R
A
 
G
L
 
F
Q
x
E
E
 
Q
M
 
L
I
 
Y
F
 
D
E
 
H
T
 
Y
L
 
F
G
 
S
Y
 
E
K
 
K
M
 
L
E
 
S
L
x
A
K
 
P
E
|
E
F
 
I
F
 
I
D
 
A
R
x
H
L
 
Y
R
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
E
 
R
K
 
R
C
 
A
T
 
V
W
 
Q
L
 
H
Y
 
V
N
 
E
R
 
R
W
 
F
I
 
M
D
 
E
D
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
I
G
 
C
L
 
L
K
 
A
S
 
N
I
 
I
V
 
F
H
 
T
I
 
C
L
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
I
 
L
S
 
S
A
 
-
Q
x
N
G
 
F
D
 
E
F
 
L
L
 
I
L
 
Y
N
 
Q
P
 
E
I
 
L
K
 
P
K
 
K
S
 
R
L
 
L
S
 
P
S
 
A
K
 
H
I
 
L
M
 
L
P
 
-
N
 
-
H
 
H
A
 
V
A
 
A
S
 
K
L
 
L
-
 
P
D
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
K
A
 
A
Q
 
R
H
 
H
A
 
G
N
 
D
Q
 
A
A
 
G
N
 
G
L
 
V
L
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A

7p7wBBB Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 96% coverage: 4:290/300 of query aligns to 9:302/306 of 7p7wBBB

query
sites
7p7wBBB
F
 
F
D
 
D
I
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
K
I
 
I
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
F
D
 
D
E
 
A
A
 
D
G
 
L
S
 
V
I
 
R
L
 
V
M
 
A
D
 
R
D
 
E
S
 
R
F
 
V
-
 
A
-
 
T
P
 
P
S
 
T
Q
 
E
A
 
S
H
 
Y
L
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
A
A
 
A
I
 
F
I
 
L
K
 
D
N
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
T
K
 
L
S
 
V
R
 
N
E
 
N
L
 
A
Q
 
D
H
 
A
E
 
E
W
 
F
N
 
G
L
 
V
D
 
K
G
 
G
-
 
T
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
I
A
 
P
G
 
G
Q
 
I
I
 
A
D
 
D
N
 
V
Q
 
E
E
 
T
G
 
G
V
 
K
V
 
L
V
 
L
H
 
-
A
 
-
T
 
T
G
 
S
N
 
N
I
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
 
A
T
 
M
G
 
G
V
 
H
Q
 
T
I
 
L
K
 
Q
K
 
R
T
 
D
I
 
L
Q
 
E
D
 
E
A
 
R
T
 
L
G
 
Q
L
 
R
N
 
P
V
 
V
T
 
K
A
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
T
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
S
E
 
E
Y
 
A
W
 
W
K
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
E
E
 
P
D
 
S
F
 
V
L
 
L
C
 
G
V
 
L
T
 
I
I
 
L
G
|
G
T
|
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
L
F
 
I
T
 
F
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
R
R
 
A
F
 
N
S
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
N
 
R
L
 
L
-
 
P
Y
 
Y
P
 
D
G
 
A
G
 
L
K
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
F
A
 
P
C
|
C
T
 
G
C
|
C
G
 
K
D
 
N
S
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D
Q
 
N
Y
 
Y
A
 
L
S
 
S
S
x
G
S
 
R
A
 
G
L
 
F
Q
x
E
E
 
Q
M
 
L
I
 
Y
F
 
D
E
 
H
T
 
Y
L
 
F
G
 
S
Y
 
E
K
 
K
M
 
L
E
 
S
L
 
A
K
 
P
E
 
E
F
 
I
F
 
I
D
 
A
R
 
H
L
 
Y
R
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
E
 
R
K
 
R
C
 
A
T
 
V
W
 
Q
L
 
H
Y
 
V
N
 
E
R
 
R
W
 
F
I
 
M
D
 
E
D
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
I
G
 
C
L
 
L
K
 
A
S
 
N
I
 
I
V
 
F
H
 
T
I
 
C
L
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
I
 
L
S
 
S
A
 
-
Q
x
N
G
 
F
D
 
E
F
 
L
L
 
I
L
 
Y
N
 
Q
P
 
E
I
 
L
K
 
P
K
 
K
S
 
R
L
 
L
S
 
P
S
 
A
K
 
H
I
 
L
M
 
L
P
 
-
N
 
-
H
 
H
A
 
V
A
 
A
S
 
K
L
 
L
-
 
P
D
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
K
A
 
A
Q
 
R
H
 
H
A
 
G
N
 
D
Q
 
A
A
 
G
N
 
G
L
 
V
L
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A

7p9lAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 96% coverage: 4:290/300 of query aligns to 6:299/303 of 7p9lAAA

query
sites
7p9lAAA
F
 
F
D
 
D
I
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
K
I
 
I
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
F
D
 
D
E
 
A
A
 
D
G
 
L
S
 
V
I
 
R
L
 
V
M
 
A
D
 
R
D
 
E
S
 
R
F
 
V
-
 
A
-
 
T
P
 
P
S
 
T
Q
 
E
A
 
S
H
 
Y
L
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
A
A
 
A
I
 
F
I
 
L
K
 
D
N
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
T
K
 
L
S
 
V
R
 
N
E
 
N
L
 
A
Q
 
D
H
 
A
E
 
E
W
 
F
N
 
G
L
 
V
D
 
K
G
 
G
-
 
T
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
I
A
x
P
G
|
G
Q
 
I
I
 
A
D
 
D
N
 
V
Q
 
E
E
 
T
G
 
G
V
 
K
V
 
L
V
 
L
H
 
-
A
 
-
T
 
T
G
x
S
N
 
N
I
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
 
A
T
 
M
G
 
G
V
 
H
Q
 
T
I
 
L
K
 
Q
K
 
R
T
 
D
I
 
L
Q
 
E
D
 
E
A
 
R
T
 
L
G
 
Q
L
 
R
N
 
P
V
 
V
T
 
K
A
 
I
E
 
E
N
|
N
D
|
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
T
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
S
E
 
E
Y
 
A
W
 
W
K
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
E
E
 
P
D
 
S
F
 
V
L
 
L
C
 
G
V
 
L
T
 
I
I
 
L
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
x
V
G
|
G
G
 
G
A
 
G
I
 
L
F
 
I
T
 
F
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
R
R
 
A
F
 
N
S
 
I
A
 
A
G
 
G
E
|
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
N
 
R
L
 
L
-
 
P
Y
 
Y
P
 
D
G
 
A
G
 
L
K
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
F
A
 
P
C
|
C
T
 
G
C
|
C
G
 
K
D
 
N
S
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
x
D
Q
 
N
Y
 
Y
A
 
L
S
 
S
S
 
G
S
 
R
A
 
G
L
 
F
Q
 
E
E
 
Q
M
 
L
I
 
Y
F
 
D
E
 
H
T
 
Y
L
 
F
G
 
S
Y
 
E
K
 
K
M
 
L
E
 
S
L
 
A
K
 
P
E
|
E
F
 
I
F
 
I
D
 
A
R
x
H
L
 
Y
R
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
E
 
R
K
 
R
C
 
A
T
 
V
W
 
Q
L
 
H
Y
 
V
N
 
E
R
 
R
W
 
F
I
 
M
D
 
E
D
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
I
G
 
C
L
 
L
K
 
A
S
 
N
I
 
I
V
 
F
H
 
T
I
 
C
L
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
L
S
 
S
A
 
-
Q
 
N
G
 
F
D
 
E
F
 
L
L
 
I
L
 
Y
N
 
Q
P
 
E
I
 
L
K
 
P
K
 
K
S
 
R
L
 
L
S
 
P
S
 
A
K
 
H
I
 
L
M
 
L
P
 
-
N
 
-
H
 
H
A
 
V
A
 
A
S
 
K
L
 
L
-
 
P
D
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
K
A
 
A
Q
 
R
H
 
H
A
 
G
N
 
D
Q
 
A
A
 
G
N
 
G
L
 
V
L
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
28% identity, 92% coverage: 15:290/300 of query aligns to 85:364/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
Q
S
 
E
I
 
L
L
 
A
M
 
L
D
 
K
D
 
D
S
 
D
F
 
L
P
 
P
S
 
L
Q
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
I
G
 
I
G
 
S
E
 
H
A
 
-
I
 
I
I
 
D
K
 
Q
N
 
F
V
 
F
I
 
I
A
 
R
K
 
H
S
 
Q
R
 
K
E
 
K
L
 
L
Q
 
E
H
 
-
E
 
-
W
 
-
N
 
R
L
 
L
D
 
T
G
 
S
I
 
I
A
 
A
I
 
I
S
 
T
S
 
L
A
 
P
G
 
G
Q
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
T
Q
 
E
E
 
N
G
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
H
N
 
R
I
 
M
P
 
P
G
 
F
Y
 
Y
T
 
E
G
 
D
V
 
V
Q
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
P
I
 
L
K
 
G
K
 
E
T
 
A
I
 
L
Q
 
E
D
 
Q
A
 
H
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
P
V
 
V
T
 
Y
A
 
I
E
 
Q
N
 
H
D
 
D
V
 
I
N
 
S
C
 
A
T
 
W
A
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
W
 
L
K
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
S
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
V
L
 
I
C
 
Q
V
 
V
T
 
V
I
 
I
G
 
D
T
 
H
G
 
N
I
 
V
G
 
G
G
 
A
A
 
G
I
 
V
F
 
I
T
 
T
D
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L
S
 
L
T
 
H
G
 
A
S
 
G
R
 
S
F
 
S
S
 
S
A
 
L
G
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
N
 
Q
L
 
V
Y
 
D
P
 
P
G
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
R
C
|
C
T
 
Y
C
|
C
G
 
G
D
 
N
S
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
Q
 
T
Y
 
I
A
 
A
S
 
S
S
 
V
S
 
D
A
 
S
L
 
I
Q
 
L
E
 
E
M
 
L
I
 
A
F
 
Q
E
 
L
T
 
R
L
 
L
G
 
N
Y
 
Q
K
 
S
M
 
M
E
 
S
L
 
-
K
 
S
E
 
M
F
 
L
F
 
H
D
 
G
R
 
Q
L
 
P
R
 
L
A
 
T
G
 
V
D
 
D
E
 
S
K
 
L
C
 
C
T
 
Q
W
 
A
L
 
A
Y
 
L
-
 
R
-
 
G
N
 
D
R
 
L
W
 
L
I
 
A
D
 
K
D
 
D
L
 
I
T
 
I
T
 
T
G
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
V
-
 
G
-
 
R
-
 
I
L
 
L
K
 
A
S
 
I
I
 
M
V
 
V
H
 
N
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
K
I
 
I
V
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
P
I
 
L
S
 
S
A
 
K
Q
 
A
G
 
A
D
 
D
F
 
I
L
 
L
L
 
F
N
 
P
P
 
V
I
 
I
K
 
S
K
 
D
S
 
S
L
 
I
S
 
R
S
 
Q
K
 
Q
I
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
A
H
 
Y
A
 
S
A
 
Q
S
 
H
L
 
I
D
 
S
I
 
V
R
 
E
I
 
S
A
 
T
Q
 
Q
H
 
F
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
A
 
G
N
 
T
L
 
M
L
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
28% identity, 92% coverage: 15:290/300 of query aligns to 109:388/406 of P50456

query
sites
P50456
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
Q
S
 
E
I
 
L
L
 
A
M
 
L
D
 
K
D
 
D
S
 
D
F
 
L
P
 
P
S
 
L
Q
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
I
G
 
I
G
 
S
E
 
H
A
 
-
I
 
I
I
 
D
K
 
Q
N
 
F
V
x
F
I
 
I
A
 
R
K
 
H
S
 
Q
R
 
K
E
 
K
L
 
L
Q
 
E
H
 
-
E
 
-
W
 
-
N
 
R
L
 
L
D
 
T
G
 
S
I
 
I
A
 
A
I
 
I
S
 
T
S
 
L
A
 
P
G
 
G
Q
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
T
Q
 
E
E
 
N
G
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
H
N
 
R
I
 
M
P
 
P
G
 
F
Y
 
Y
T
 
E
G
 
D
V
 
V
Q
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
P
I
 
L
K
 
G
K
 
E
T
 
A
I
 
L
Q
 
E
D
 
Q
A
 
H
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
P
V
 
V
T
 
Y
A
 
I
E
 
Q
N
 
H
D
 
D
V
 
I
N
 
S
C
 
A
T
 
W
A
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
W
 
L
K
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
S
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
V
L
 
I
C
 
Q
V
 
V
T
 
V
I
 
I
G
 
D
T
 
H
G
 
N
I
 
V
G
 
G
G
 
A
A
 
G
I
 
V
F
 
I
T
 
T
D
 
D
G
 
G
K
 
H
L
 
L
S
 
L
T
 
H
G
 
A
S
 
G
R
 
S
F
 
S
S
 
S
A
 
L
G
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
N
 
Q
L
 
V
Y
 
D
P
 
P
G
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
R
C
|
C
T
 
Y
C
|
C
G
 
G
D
 
N
S
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
Q
 
T
Y
 
I
A
 
A
S
 
S
S
 
V
S
 
D
A
 
S
L
 
I
Q
 
L
E
 
E
M
 
L
I
 
A
F
 
Q
E
 
L
T
 
R
L
 
L
G
 
N
Y
 
Q
K
 
S
M
 
M
E
 
S
L
 
-
K
 
S
E
 
M
F
 
L
F
 
H
D
 
G
R
 
Q
L
 
P
R
 
L
A
 
T
G
 
V
D
 
D
E
 
S
K
 
L
C
 
C
T
 
Q
W
 
A
L
 
A
Y
 
L
-
x
R
-
 
G
N
 
D
R
 
L
W
x
L
I
 
A
D
 
K
D
 
D
L
 
I
T
 
I
T
 
T
G
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
V
-
 
G
-
 
R
-
 
I
L
 
L
K
 
A
S
 
I
I
 
M
V
 
V
H
 
N
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
K
I
 
I
V
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
P
I
 
L
S
 
S
A
 
K
Q
 
A
G
 
A
D
 
D
F
 
I
L
 
L
L
 
F
N
 
P
P
 
V
I
 
I
K
 
S
K
 
D
S
 
S
L
 
I
S
 
R
S
 
Q
K
 
Q
I
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
A
H
 
Y
A
 
S
A
 
Q
S
 
H
L
 
I
D
 
S
I
 
V
R
 
E
I
 
S
A
 
T
Q
 
Q
H
 
F
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
A
 
G
N
 
T
L
 
M
L
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
28% identity, 82% coverage: 4:249/300 of query aligns to 8:266/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
F
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
N
I
 
L
K
 
R
Y
 
V
G
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
S
E
 
M
A
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
I
L
 
V
M
 
K
D
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
Q
-
 
F
-
 
N
-
 
P
D
 
K
S
 
T
F
 
Y
P
 
E
S
 
E
Q
 
R
A
 
I
H
 
N
L
 
L
G
 
I
G
 
L
E
 
Q
A
 
M
I
 
C
I
 
V
K
 
E
N
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
A
K
 
A
S
 
A
R
 
E
E
 
A
L
 
V
Q
 
K
H
 
L
E
 
N
W
 
C
N
 
R
L
 
I
D
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
S
S
 
T
A
 
G
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
D
 
N
N
 
P
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
 
S
T
 
T
G
 
K
N
 
L
I
 
I
P
 
Q
G
 
E
Y
 
W
T
 
N
G
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
L
K
 
R
K
 
T
T
 
P
I
 
L
Q
 
S
D
 
D
A
 
T
T
 
L
G
 
H
L
 
L
N
 
P
V
 
V
T
 
W
A
 
V
E
 
D
N
|
N
D
 
D
V
 
G
N
|
N
C
 
C
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
R
W
 
K
K
 
F
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
M
 
K
G
 
G
A
 
L
E
 
E
D
 
N
F
 
F
L
 
V
C
 
T
V
 
L
T
 
I
I
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
I
F
 
I
T
 
H
D
 
Q
G
 
H
K
 
E
L
 
L
S
 
I
T
 
H
G
 
G
S
 
S
R
 
S
F
 
F
S
 
C
A
 
A
G
x
A
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
N
 
V
L
 
V
Y
 
S
P
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
P
A
 
D
C
|
C
T
 
S
C
|
C
G
 
G
D
 
S
S
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
S
 
G
S
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
M
 
L
I
 
L
F
 
V
E
 
E
T
 
G
L
 
M
G
 
S
Y
 
V
K
 
A
M
 
V
E
 
G
L
 
A
K
 
L
E
 
H
F
 
L
F
 
I
D
 
Q
R
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
L
G
 
G
D
 
N
E
 
A
K
 
K
C
 
A
T
 
Q
W
 
S
L
 
I
Y
 
L
N
 
R
R
 
T
W
 
A
I
 
G
D
 
T
D
 
A
L
 
L
T
 
G
T
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
V
S
 
N
I
 
I
V
 
L
H
 
H
I
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
I
I
 
L
G
 
S
G
 
G
G
 
V
I
 
L
S
 
A
A
 
S
Q
 
H

4db3A 1.95 angstrom resolution crystal structure of n-acetyl-d-glucosamine kinase from vibrio vulnificus.
26% identity, 96% coverage: 4:290/300 of query aligns to 13:305/311 of 4db3A

query
sites
4db3A
F
 
F
D
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
K
I
 
I
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
A
V
 
F
D
 
N
E
 
E
A
 
K
G
 
L
S
 
E
I
 
R
L
 
V
M
 
A
D
 
T
D
 
E
S
 
R
F
 
V
P
 
P
S
 
T
Q
 
P
A
 
T
H
 
D
L
 
-
G
 
D
G
 
Y
E
 
P
A
 
L
I
 
L
I
 
L
K
 
E
N
 
T
V
 
I
I
 
A
A
 
G
K
 
L
S
 
V
R
 
A
E
 
K
L
 
Y
Q
 
D
H
 
Q
E
 
E
W
 
F
N
 
A
L
 
C
D
 
E
G
 
G
-
 
K
I
 
I
A
 
G
I
 
L
S
 
G
S
 
L
A
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
E
D
 
D
N
 
A
Q
 
D
E
 
D
G
 
A
V
 
T
V
 
V
V
 
L
H
 
-
A
 
-
T
 
T
G
 
V
N
 
N
I
 
V
P
 
P
G
 
A
Y
 
A
T
 
K
G
 
G
V
 
K
Q
 
P
I
 
L
K
 
R
K
 
A
T
 
D
I
 
L
Q
 
E
D
 
A
A
 
K
T
 
I
G
 
G
L
 
R
N
 
S
V
 
V
T
 
K
A
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
C
 
C
T
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
S
E
 
E
Y
 
A
W
 
W
K
 
D
G
 
E
A
 
E
A
 
L
M
 
Q
G
 
D
A
 
A
E
 
P
D
 
S
F
 
V
L
 
M
C
 
G
V
 
L
T
 
I
I
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
L
F
 
I
T
 
Y
D
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
V
S
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
R
R
 
N
F
 
N
S
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
M
N
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
W
-
 
F
Y
 
H
P
 
L
G
 
G
G
 
D
K
 
N
A
 
A
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
G
C
|
C
T
 
G
C
|
C
G
 
G
D
 
K
S
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
L
S
 
S
S
 
G
S
 
R
A
 
G
L
 
F
Q
 
E
E
 
L
M
 
L
I
 
Y
F
 
A
E
 
H
T
 
Y
L
 
Y
G
 
G
Y
 
E
K
 
E
M
 
K
E
 
K
L
 
A
K
 
I
E
 
D
F
 
I
F
 
I
D
 
K
R
 
A
L
 
N
R
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
E
 
E
K
 
K
C
 
A
T
 
A
W
 
E
L
 
H
Y
 
V
N
 
E
R
 
R
W
 
F
I
 
M
D
 
E
D
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
I
G
 
C
L
 
F
K
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
F
H
 
T
I
 
A
L
 
N
N
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
I
 
V
V
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
L
S
 
S
A
 
-
Q
 
N
G
 
F
D
 
E
F
 
L
L
 
I
L
 
Y
N
 
E
P
 
E
I
 
M
K
 
P
K
 
K
S
 
R
L
 
V
S
 
-
S
 
P
K
 
K
I
 
Y
M
 
L
P
 
L
N
 
S
H
 
V
A
 
A
A
 
K
S
 
C
L
 
P
D
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
K
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
A
 
G
N
 
D
Q
 
S
A
 
G
N
 
G
L
 
V
L
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
28% identity, 82% coverage: 4:249/300 of query aligns to 8:265/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
F
 
V
D
 
D
I
 
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
S
x
N
I
 
L
K
x
R
Y
 
V
G
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
S
E
 
M
A
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
I
L
 
V
M
 
K
D
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
Q
-
 
F
-
 
N
-
 
P
D
 
K
S
 
T
F
 
Y
P
 
E
S
 
E
Q
 
R
A
 
I
H
 
N
L
 
L
G
 
I
G
 
L
E
 
Q
A
 
M
I
 
C
I
 
V
K
 
E
N
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
A
K
 
A
S
 
A
R
 
E
E
 
A
L
 
V
Q
 
K
H
 
L
E
 
N
W
 
C
N
 
R
L
 
I
D
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
G
I
 
I
S
 
S
S
 
T
A
x
G
G
|
G
Q
x
R
I
 
V
D
 
N
N
 
P
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
x
S
T
|
T
G
 
K
N
x
L
I
 
I
P
 
Q
G
 
E
Y
 
W
T
 
N
G
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
L
K
 
R
K
 
T
T
 
P
I
 
L
Q
 
S
D
 
D
A
 
T
T
 
L
G
 
H
L
 
L
N
 
P
V
 
V
T
 
W
A
 
V
E
 
D
N
|
N
D
|
D
V
 
G
N
|
N
C
 
C
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
R
W
 
K
K
 
F
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
M
 
K
G
 
G
A
 
L
E
 
E
D
 
N
F
 
F
L
 
V
C
 
T
V
 
L
T
 
I
I
 
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
I
F
 
I
T
 
H
D
 
Q
G
 
H
K
 
E
L
 
L
S
 
I
T
 
H
G
 
G
S
 
S
R
 
S
F
 
F
S
 
C
A
 
A
G
x
A
E
|
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
N
 
V
L
 
V
Y
 
S
P
 
L
G
 
D
G
 
G
K
 
P
A
 
D
C
|
C
T
 
S
C
|
C
G
 
G
D
 
S
S
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
|
E
Q
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
S
x
G
S
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
R
M
 
E
I
 
A
F
 
K
E
 
K
T
 
L
L
 
H
G
 
D
Y
 
E
K
 
D
M
 
L
E
 
L
L
 
L
K
 
V
E
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
x
L
-
 
H
F
 
L
F
 
I
D
 
Q
R
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
L
G
 
G
D
 
N
E
 
A
K
 
K
C
 
A
T
 
Q
W
 
S
L
 
I
Y
 
L
N
 
R
R
 
T
W
 
A
I
 
G
D
 
T
D
 
A
L
 
L
T
 
G
T
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
V
S
 
N
I
 
I
V
 
L
H
 
H
I
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
I
I
 
L
G
 
S
G
 
G
G
x
V
I
 
L
S
 
A
A
 
S
Q
 
H

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
28% identity, 82% coverage: 4:249/300 of query aligns to 8:265/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
F
 
V
D
 
D
I
 
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
S
x
N
I
 
L
K
x
R
Y
 
V
G
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
S
E
 
M
A
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
I
L
 
V
M
 
K
D
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
Q
-
 
F
-
 
N
-
 
P
D
 
K
S
 
T
F
 
Y
P
 
E
S
 
E
Q
 
R
A
 
I
H
 
N
L
 
L
G
 
I
G
 
L
E
 
Q
A
 
M
I
 
C
I
 
V
K
 
E
N
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
A
K
 
A
S
 
A
R
 
E
E
 
A
L
 
V
Q
 
K
H
 
L
E
 
N
W
 
C
N
 
R
L
 
I
D
 
L