SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_139385129.1 NCBI__GCF_900167915.1:WP_139385129.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

1xc3A Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis (see paper)
39% identity, 95% coverage: 6:283/293 of query aligns to 23:295/295 of 1xc3A

query
sites
1xc3A
N
 
T
V
 
I
L
 
I
A
 
D
S
 
R
A
 
I
R
 
E
V
 
F
P
 
P
T
 
T
T
 
K
T
 
M
P
 
P
N
 
D
E
 
E
T
 
T
L
 
I
R
 
E
A
 
K
I
 
V
G
 
I
D
 
Q
R
 
Y
I
 
F
E
 
S
A
 
Q
W
 
F
Q
 
S
R
 
L
E
 
Q
H
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
G
S
 
S
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
G
 
D
L
 
N
D
 
D
R
 
K
S
 
T
R
 
S
P
 
Q
D
 
T
Y
 
Y
G
 
G
H
 
T
I
 
I
T
 
T
S
 
A
T
 
T
P
 
P
K
 
K
P
 
A
G
 
G
W
 
W
R
 
R
Q
 
H
A
 
Y
D
 
P
L
 
F
V
 
L
R
 
Q
H
 
T
F
 
V
G
 
K
D
 
N
R
 
E
F
 
M
G
 
K
L
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
A
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
H
 
F
R
 
L
W
 
F
G
 
G
T
 
E
A
 
A
R
 
K
G
 
G
C
 
L
D
 
D
V
 
S
A
 
C
I
 
L
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
L
V
 
L
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
M
G
 
G
H
|
H
L
 
I
R
 
Y
V
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
H
T
 
P
G
 
D
D
 
D
D
 
V
F
 
Y
A
 
Q
G
 
G
V
 
K
C
|
C
P
 
P
F
 
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
C
|
C
L
 
F
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
I
 
I
G
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
W
G
 
G
S
 
K
D
 
K
G
 
A
A
 
A
S
 
D
I
 
L
E
 
S
D
 
D
D
 
I
H
 
A
P
 
Q
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
L
V
 
E
T
 
G
A
 
Y
E
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
Q
L
 
Y
L
 
I
L
 
L
T
 
I
V
 
L
S
 
A
P
 
P
R
 
K
R
 
K
I
 
I
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
Q
P
 
-
L
 
V
F
 
F
G
 
S
P
 
Y
L
 
I
R
 
Y
K
 
Q
R
 
Y
T
 
V
A
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
G
 
N
G
 
S
Y
 
Y
I
 
L
A
 
D
G
 
F
L
 
S
D
 
E
-
 
L
E
 
S
D
 
D
A
 
D
L
 
I
A
 
S
A
 
D
M
 
Y
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
S
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
T
I
 
L
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
H
D
 
Q
A
 
A
C
 
L
Q
 
Q
D
 
A
R
 
E
S
 
A
A
 
A
A
 
S

3lm9A Crystal structure of fructokinase with adp and fructose bound in the active site (see paper)
39% identity, 95% coverage: 6:282/293 of query aligns to 23:294/294 of 3lm9A

query
sites
3lm9A
N
 
T
V
 
I
L
 
I
A
 
D
S
 
R
A
 
I
R
 
E
V
 
F
P
 
P
T
 
T
T
 
K
T
 
M
P
 
P
N
 
D
E
 
E
T
 
T
L
 
I
R
 
E
A
 
K
I
 
V
G
 
I
D
 
Q
R
 
Y
I
 
F
E
 
S
A
 
Q
W
 
F
Q
 
S
R
 
L
E
 
Q
H
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
G
S
 
S
F
 
F
G
|
G
P
 
P
L
 
V
G
 
D
L
 
N
D
 
D
R
 
K
S
 
T
R
 
S
P
 
Q
D
 
T
Y
 
Y
G
 
G
H
 
T
I
 
I
T
 
T
S
 
A
T
 
T
P
 
P
K
 
K
P
 
A
G
 
G
W
 
W
R
 
R
Q
 
H
A
 
Y
D
 
P
L
 
F
V
 
L
R
 
Q
H
 
T
F
 
V
G
 
K
D
 
N
R
 
E
F
 
M
G
 
K
L
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
S
T
 
T
D
|
D
V
 
V
A
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
H
 
F
R
 
L
W
 
F
G
 
G
T
 
E
A
 
A
R
 
K
G
 
G
C
 
L
D
 
D
V
 
S
A
 
C
I
 
L
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
V
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
V
x
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
L
V
 
L
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
S
H
 
H
P
 
P
E
|
E
L
 
M
G
 
G
H
|
H
L
 
I
R
 
Y
V
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
H
T
 
P
G
 
D
D
 
D
D
 
V
F
 
Y
A
 
Q
G
 
G
V
 
K
C
|
C
P
 
P
F
 
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
C
|
C
L
 
F
E
|
E
G
 
G
L
 
L
V
 
A
S
 
S
G
|
G
P
|
P
A
 
A
I
 
I
G
x
E
A
 
A
R
 
R
T
 
W
G
 
G
S
 
K
D
 
K
G
x
A
A
 
A
S
 
D
I
 
L
E
 
S
D
 
D
D
 
I
H
 
A
P
 
Q
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
L
V
 
E
T
 
G
A
 
Y
E
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
Q
L
 
Y
L
 
I
L
 
L
T
 
I
V
 
L
S
 
A
P
 
P
R
 
K
R
 
K
I
 
I
V
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
Q
P
 
-
L
 
V
F
 
F
G
 
S
P
 
Y
L
 
I
R
 
Y
K
 
Q
R
 
Y
T
 
V
A
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
G
 
N
G
 
S
Y
 
Y
I
 
L
A
 
D
G
 
F
L
 
S
D
 
E
-
 
L
E
 
S
D
 
D
A
 
D
L
 
I
A
 
S
A
 
D
M
 
Y
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
S
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
T
I
 
L
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
H
D
 
Q
A
 
A
C
 
L
Q
 
Q
D
 
A
R
 
E
S
 
A
A
 
A

1woqA Crystal structure of inorganic polyphosphate/atp-glucomannokinase from arthrobacter sp. Strain km at 1.8 a resolution (see paper)
26% identity, 60% coverage: 61:235/293 of query aligns to 82:229/253 of 1woqA

query
sites
1woqA
H
 
H
I
 
S
T
 
A
S
 
A
T
 
N
P
 
V
K
 
D
P
 
K
G
 
S
W
 
W
R
 
L
Q
 
N
A
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
D
R
 
A
H
 
L
F
 
L
G
 
T
D
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
L
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
E
F
 
V
D
 
I
T
x
N
D
|
D
V
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
A
R
 
R
W
 
Y
G
 
G
T
 
A
A
 
G
R
 
A
G
 
G
C
 
V
D
 
K
-
 
G
V
 
T
A
 
V
I
 
L
Y
 
V
M
 
I
T
 
T
V
 
L
G
 
G
T
|
T
G
 
G
V
x
I
G
|
G
G
 
S
G
 
A
V
 
F
V
 
I
V
 
F
D
 
D
G
 
G
R
 
K
P
 
L
V
 
V
H
 
P
G
 
-
L
 
-
V
 
-
H
 
N
P
 
A
E
|
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
L
R
 
E
V
 
I
R
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
D
G
 
G
D
 
H
D
 
D
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
C
 
-
P
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
A
R
x
E
T
 
T
G
 
K
S
 
A
D
 
S
G
 
A
A
 
V
S
 
A
I
 
R
E
 
E
D
 
R
D
 
D
H
 
G
P
 
L
V
 
S
W
 
W
D
 
D
R
 
E
V
 
Y
T
 
S
A
 
V
E
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
A
 
Y
M
 
F
A
 
S
M
 
H
L
 
V
L
 
E
L
 
F
T
 
L
V
 
F
S
 
S
P
 
P
R
 
E
R
 
L
I
 
F
V
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
S
Q
 
K
Q
 
R
R
 
A
A
 
D
P
 
E
L
 
Y
F
 
L
G
 
P
P
 
N
L
 
L
R
 
R
K
 
L
R
 
R
T
 
T

Sites not aligning to the query:

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
27% identity, 51% coverage: 84:233/293 of query aligns to 176:347/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
F
F
 
V
D
 
A
T
 
N
D
 
D
V
 
T
A
 
R
G
 
A
A
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
K
R
 
L
W
 
F
G
 
G
T
 
H
A
 
S
R
 
Q
G
 
D
C
 
V
D
 
D
V
 
N
A
 
S
I
 
V
Y
 
L
M
 
I
T
 
S
V
 
I
G
 
H
T
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
G
R
 
R
P
 
V
V
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
N
V
 
I
H
 
-
P
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
I
R
 
Q
V
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
R
 
K
R
 
R
A
x
C
T
 
H
G
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
C
|
C
P
 
G
F
 
N
H
 
Y
G
 
G
D
 
-
C
|
C
L
 
L
E
 
E
G
 
T
L
 
V
V
 
A
S
 
S
G
 
S
P
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
R
A
 
D
R
 
Q
T
 
V
G
 
T
S
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
C
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
V
D
 
E
G
 
E
A
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
C
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
A
D
 
D
D
 
G
H
 
D
P
 
P
V
 
L
W
 
A
D
 
V
R
 
D
V
 
V
T
 
I
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
E
 
R
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
A
M
 
I
L
 
V
L
 
I
L
 
N
T
 
L
V
 
F
S
 
N
P
 
P
R
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
V
V
 
I
L
 
N
Q
 
Q
Q
 
A
R
 
K
A
 
S
P
 
I
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
P
 
S
L
 
I
R
 
E
K
 
Q

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
34% identity, 29% coverage: 38:121/293 of query aligns to 57:134/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
R
 
R
A
 
G
D
 
E
A
 
A
L
 
I
G
 
G
I
 
L
A
 
G
S
 
T
F
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
D
L
 
F
D
 
R
R
 
R
S
 
G
-
 
V
-
 
I
R
 
R
P
 
P
D
 
N
Y
 
I
G
 
-
H
 
-
I
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
P
 
P
G
 
G
W
 
V
R
 
Q
Q
 
D
A
 
F
D
 
P
L
 
I
V
 
R
R
 
R
H
 
I
F
 
L
G
 
E
D
 
E
R
 
A
F
 
T
G
 
G
L
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
F
F
 
L
D
 
E
T
 
N
D
 
D
V
 
A
A
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
H
R
 
H
W
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
C
 
E
D
 
E
V
 
S
A
 
S
I
 
L
Y
 
Y
M
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

6jdcA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac from haemophilus influenzae
25% identity, 71% coverage: 12:220/293 of query aligns to 26:222/269 of 6jdcA

query
sites
6jdcA
R
 
R
V
 
Q
P
 
Q
T
 
I
T
 
H
T
 
T
P
 
P
N
 
R
E
 
E
T
 
N
L
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
H
R
 
Q
A
 
A
I
 
L
G
 
G
D
 
K
R
 
L
I
 
L
E
 
A
A
 
D
W
 
Y
Q
 
E
R
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
G
R
 
Q
A
 
F
D
 
D
A
 
Y
L
 
V
G
 
A
I
 
V
A
 
A
S
 
S
F
 
T
G
 
G
P
 
I
L
 
I
G
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
I
L
 
L
D
 
S
R
 
A
S
 
L
R
 
N
P
 
P
-
 
K
D
 
N
Y
 
L
G
 
G
H
 
G
I
 
L
T
 
A
S
 
E
T
 
F
P
 
P
K
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
L
Q
 
K
A
 
A
D
 
S
L
 
I
V
 
A
R
 
K
H
 
H
F
 
-
G
 
T
D
 
D
R
 
K
F
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
P
I
 
I
G
 
G
F
 
L
D
 
L
T
 
N
D
 
D
V
 
A
A
 
Q
G
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
R
 
Q
W
 
L
G
 
Q
T
 
N
A
 
F
R
 
E
G
 
Q
C
 
V
D
 
S
V
 
N
A
 
F
I
 
V
Y
 
F
M
 
I
T
 
T
V
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
L
D
 
N
G
 
Q
R
 
I
P
 
L
V
 
Q
H
 
T
G
 
G
L
 
S
-
 
R
-
 
G
V
 
I
H
 
A
P
 
G
E
 
H
L
 
I
G
 
G
H
|
H
L
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
T
T
 
L
G
 
A
D
 
D
D
 
P
F
 
N
A
 
G
G
 
A
V
 
I
C
|
C
P
 
G
F
x
C
-
 
G
H
 
R
G
 
R
D
 
G
C
|
C
L
 
V
E
 
E
G
 
A
L
 
I
V
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
E
A
 
A
R
 
V
T
 
S
G
 
S
S
 
A
D
 
T
G
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
A
V
 
L
W
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
S
T
 
A
A
 
K
E
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
L
M
 
I
A
 
A
M
 
D
L
 
L
L
 
V
L
 
I
T
 
S
V
 
L
S
 
D
P
 
I
R
 
Q
R
 
K
I
 
I
V
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
S
V
 
V

Q93LQ8 Beta-glucoside kinase; EC 2.7.1.85 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
30% identity, 54% coverage: 82:240/293 of query aligns to 93:262/297 of Q93LQ8

query
sites
Q93LQ8
R
 
R
F
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
S
F
 
V
D
 
E
T
 
N
D
|
D
V
 
A
A
 
N
G
 
C
A
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
R
 
W
W
 
Q
G
 
G
T
 
K
A
 
A
R
 
A
G
 
E
C
 
M
D
 
A
V
 
N
A
 
F
I
 
L
Y
 
V
M
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
A
V
 
I
V
 
F
V
 
C
D
 
Q
G
 
H
R
 
Q
P
 
L
V
 
I
H
 
N
G
 
G
-
 
A
-
 
R
L
 
F
V
 
R
H
 
A
P
 
G
E
 
E
L
 
F
G
 
G
H
 
Y
L
 
M
R
 
L
V
 
T
R
 
D
R
 
R
A
 
P
T
 
G
G
 
G
D
 
R
D
 
D
F
 
P
A
 
R
G
 
R
V
 
Y
C
 
S
P
 
M
F
 
N
H
 
E
G
 
N
D
 
C
C
 
T
L
 
L
E
 
R
G
 
V
L
 
L
V
 
R
S
 
H
G
 
R
P
 
Y
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
P
T
 
L
G
 
D
S
 
S
-
 
V
D
 
T
G
 
G
A
 
E
S
 
L
I
 
I
E
 
F
D
 
D
D
 
R
H
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
D
P
 
P
V
 
V
W
 
C
D
 
Q
R
 
R
V
 
L
T
 
V
A
 
A
E
 
E
-
 
F
-
 
F
-
 
N
-
 
G
L
 
L
A
 
G
E
 
H
A
 
G
M
 
L
A
 
Y
M
 
N
L
 
L
L
 
V
L
 
H
T
 
I
V
 
F
S
 
D
P
 
P
R
 
Q
R
 
T
I
 
I
V
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
V
Q
 
E
Q
 
R
R
 
-
A
 
-
P
 
P
L
 
G
F
 
F
G
 
L
P
 
T
L
 
L
R
 
L
K
 
R
R
 
Q
T
 
H
A
 
L
A
 
A
L
 
W
L
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
35% identity, 41% coverage: 54:173/293 of query aligns to 73:192/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
R
 
R
S
 
V
R
 
N
P
 
P
D
 
R
Y
 
E
G
 
G
H
 
I
I
 
V
T
 
L
S
 
H
T
 
S
P
 
T
K
 
K
-
 
L
-
 
I
P
 
Q
G
 
E
W
 
W
R
 
N
Q
 
S
A
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
R
R
 
T
H
 
P
F
 
L
G
 
S
D
 
D
R
 
T
F
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
I
 
V
G
 
W
F
 
V
D
 
D
T
x
N
D
 
D
V
 
G
A
x
N
G
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
R
R
 
K
W
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
G
R
 
K
G
 
G
C
 
L
D
 
E
V
 
N
A
 
F
I
 
V
Y
 
T
M
 
L
T
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
V
 
H
D
 
Q
G
 
H
R
 
E
P
 
L
V
 
I
H
 
H
G
 
G
-
 
S
-
 
S
L
 
F
V
 
C
H
 
A
P
x
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
L
R
 
-
V
 
V
R
 
V
R
 
S
A
 
L
T
 
N
G
 
G
D
 
P
D
 
D
F
x
C
A
 
S
G
 
-
V
 
-
C
|
C
P
 
G
F
 
S
H
 
H
G
 
G
D
 
-
C
|
C
L
 
I
E
 
E
G
 
A
L
 
Y
V
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
M
A
 
A
I
 
L

Query Sequence

>WP_139385129.1 NCBI__GCF_900167915.1:WP_139385129.1
MARGRNVLASARVPTTTPNETLRAIGDRIEAWQREHGRADALGIASFGPLGLDRSRPDYG
HITSTPKPGWRQADLVRHFGDRFGLPIGFDTDVAGAALAEHRWGTARGCDVAIYMTVGTG
VGGGVVVDGRPVHGLVHPELGHLRVRRATGDDFAGVCPFHGDCLEGLVSGPAIGARTGSD
GASIEDDHPVWDRVTAELAEAMAMLLLTVSPRRIVIGGGVLQQRAPLFGPLRKRTAALLG
GYIAGLDEDALAAMIVPPELGAMAGPLGAIALAQDACQDRSAAATATSPNTCI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory