SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_143156507.1 NCBI__GCF_900129305.1:WP_143156507.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
34% identity, 91% coverage: 9:259/275 of query aligns to 3:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
S
 
S
D
 
D
P
 
I
I
 
V
L
 
L
I
 
E
L
 
V
Q
 
Q
D
 
S
V
 
L
H
 
H
M
 
V
Q
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
V
 
I
T
 
H
A
 
A
L
 
I
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
D
Y
 
L
Q
 
K
V
 
V
P
 
P
R
 
R
G
 
G
I
 
Q
V
 
I
Q
 
V
S
 
T
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
S
C
 
A
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
V
H
 
R
P
 
A
T
 
Q
E
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
S
 
I
F
 
F
L
 
N
G
 
G
R
 
Q
R
 
D
V
 
I
E
 
T
R
 
N
E
 
K
P
 
P
P
 
A
H
 
H
R
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
R
L
 
M
G
 
G
M
 
I
S
 
A
R
 
L
T
 
V
F
 
P
Q
x
E
H
 
G
V
 
R
A
 
R
L
 
I
F
 
F
P
 
P
Q
 
E
M
 
L
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
M
G
 
G
R
 
A
H
 
Y
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
N
R
 
R
R
 
K
E
 
D
E
 
K
A
 
E
A
 
G
I
 
I
G
 
K
R
 
R
D
 
D
A
 
L
R
 
E
A
 
-
W
 
W
L
 
I
D
 
F
-
 
S
-
 
L
F
 
F
V
 
P
G
 
R
L
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
R
A
 
L
H
 
K
L
 
Q
P
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
M
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
S
D
 
R
P
 
P
A
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
S
G
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
A
T
 
P
R
 
I
E
 
L
T
 
V
E
 
S
E
 
E
L
 
V
G
 
F
E
 
E
L
 
V
I
 
I
G
 
Q
R
 
K
I
 
I
K
 
N
E
 
Q
R
 
E
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
N
 
L
L
 
G
V
 
A
M
 
L
T
 
K
I
 
V
S
 
A
D
 
H
R
 
Y
I
 
G
L
 
Y
V
 
V
L
 
L
Y
 
E
Y
 
T
G
 
G
Q
 
Q
P
 
I
L
 
V
A
 
L
S
 
E
G
 
G
V
 
K
P
 
A
D
 
S
E
 
E
I
 
L
K
 
L
E
 
D
N
 
N
P
 
E
E
 
M
V
 
V
I
 
R
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 91% coverage: 12:260/275 of query aligns to 4:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
I
 
I
L
 
L
I
 
R
L
 
T
Q
 
E
D
 
N
V
 
I
H
 
V
M
 
K
Q
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
T
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
S
Y
 
I
Q
 
S
V
 
V
P
 
N
R
 
K
G
 
G
I
 
D
V
 
V
Q
 
T
S
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
F
L
 
L
H
 
K
P
 
A
T
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
S
 
Y
F
 
F
L
 
E
G
 
N
R
 
K
R
 
D
V
 
I
E
 
T
R
 
N
E
 
K
P
 
E
P
 
P
H
 
A
R
 
E
I
 
L
A
 
Y
A
 
H
L
 
Y
G
 
G
M
 
I
S
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
P
 
K
Q
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
V
 
C
R
 
P
T
 
G
R
 
E
S
 
S
G
 
P
F
 
L
W
 
N
A
 
S
A
 
L
G
 
F
L
 
Y
R
 
K
T
 
K
R
 
W
S
 
I
M
 
P
R
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
M
A
 
V
I
 
-
G
 
-
R
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
F
A
 
K
W
 
I
L
 
L
D
 
E
F
 
F
V
 
L
G
 
K
L
 
L
A
 
S
D
 
H
A
 
L
A
 
Y
H
 
D
L
 
R
P
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
E
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
M
K
 
K
I
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
D
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
T
 
P
R
 
G
E
 
L
T
 
A
E
 
H
E
 
D
L
 
I
G
 
F
E
 
N
L
 
H
I
 
V
G
 
L
R
 
E
I
 
L
K
 
K
E
 
A
R
 
K
G
 
G
T
 
I
T
 
T
V
 
F
I
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
N
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
T
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
L
 
Y
V
 
V
L
 
M
Y
 
F
Y
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
R
-
 
G
P
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
E
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
D
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 90% coverage: 12:259/275 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
I
 
I
L
 
L
I
 
R
L
 
T
Q
 
E
D
 
N
V
 
I
H
 
V
M
 
K
Q
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
T
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
S
Y
 
I
Q
 
S
V
 
V
P
 
C
R
 
K
G
 
G
I
 
D
V
 
V
Q
 
T
S
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
F
L
 
L
H
 
K
P
 
A
T
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
S
 
Y
F
 
F
L
 
E
G
 
N
R
 
K
R
 
D
V
 
I
E
 
T
R
 
N
E
 
K
P
 
E
P
 
P
H
 
A
R
 
E
I
 
L
A
 
Y
A
 
H
L
 
Y
G
 
G
M
 
I
S
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
P
 
K
Q
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
V
 
N
R
 
P
T
 
G
R
 
E
S
 
S
G
 
P
F
 
L
W
 
N
A
 
S
A
 
L
G
 
F
L
 
Y
R
 
K
T
 
K
R
 
W
S
 
I
M
 
P
R
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
M
A
 
V
I
 
-
G
 
-
R
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
F
A
 
K
W
 
I
L
 
L
D
 
E
F
 
F
V
 
L
G
 
K
L
 
L
A
 
S
D
 
H
A
 
L
A
 
Y
H
 
D
L
 
R
P
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
E
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
M
K
 
K
I
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
D
 
N
P
 
P
A
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
T
 
P
R
 
G
E
 
L
T
 
A
E
 
H
E
 
D
L
 
I
G
 
F
E
 
N
L
 
H
I
 
V
G
 
L
R
 
E
I
 
L
K
 
K
E
 
A
R
 
K
G
 
G
T
 
I
T
 
T
V
 
F
I
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
N
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
T
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
L
 
Y
V
 
V
L
 
M
Y
 
F
Y
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
R
-
 
G
P
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
E
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
31% identity, 86% coverage: 12:247/275 of query aligns to 1:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
M
L
 
I
I
 
F
L
 
V
Q
 
N
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
M
 
K
Q
 
N
F
|
F
G
 
G
G
 
S
V
 
L
T
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
Y
 
L
Q
 
K
V
 
V
P
 
N
R
 
K
G
 
G
I
 
E
V
 
V
Q
 
V
S
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
I
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
H
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
K
G
 
G
R
 
E
I
 
V
S
 
F
F
 
I
L
 
D
G
 
G
R
 
V
R
 
K
V
 
I
E
 
N
-
 
N
-
 
G
R
 
K
E
 
V
P
 
N
P
 
I
H
 
N
R
 
K
I
 
V
-
 
R
A
 
Q
A
 
K
L
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
P
L
 
V
R
 
K
T
 
V
R
 
K
S
 
K
M
 
M
R
 
N
R
 
K
E
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
E
I
 
-
G
 
-
R
 
E
D
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
D
W
 
L
L
 
L
D
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
K
H
 
D
L
 
Q
P
 
Y
A
 
P
G
 
I
A
 
K
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
I
 
R
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
Q
P
 
P
A
 
E
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
E
E
 
M
T
 
V
E
 
K
E
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
N
L
 
V
I
 
M
G
 
K
R
 
Q
I
 
L
K
 
A
E
 
N
R
 
E
G
 
G
T
 
M
T
 
T
V
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
N
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
T
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
I
V
 
F
L
 
M
Y
 
D
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
P
 
I
L
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
V
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
33% identity, 88% coverage: 11:252/275 of query aligns to 1:228/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
I
 
I
L
 
I
I
 
R
L
 
I
Q
 
R
D
 
N
V
 
L
H
 
H
M
 
K
Q
 
W
F
|
F
G
 
G
G
 
P
V
 
L
T
 
H
A
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
H
Y
 
L
Q
 
E
V
 
V
P
 
A
R
 
P
G
 
G
I
 
E
V
 
K
Q
 
L
S
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
R
C
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
R
V
 
L
L
 
E
H
 
D
P
 
F
T
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
V
S
 
V
F
 
V
L
 
D
G
 
G
R
 
L
R
 
S
V
 
V
E
 
K
R
 
D
E
 
D
P
 
R
P
 
A
H
 
L
R
 
R
I
 
E
A
 
I
A
 
R
L
 
R
G
 
E
M
 
V
S
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
V
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
T
V
 
L
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
P
L
 
M
R
 
R
T
 
V
R
 
R
S
 
R
M
 
W
R
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
I
 
-
G
 
-
R
 
K
D
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
E
W
 
L
L
 
L
D
 
E
F
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
H
 
R
L
 
K
P
 
Y
A
 
P
G
 
A
A
 
Q
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
E
E
 
M
T
 
V
E
 
G
E
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
D
L
 
V
I
 
M
G
 
R
R
 
D
I
 
L
K
 
A
E
 
Q
R
 
G
G
 
G
T
 
M
T
 
T
V
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
N
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
T
 
E
I
 
V
S
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
V
V
 
F
L
 
M
Y
 
D
Y
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
I
L
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
V
 
R
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
F
E
 
T
N
 
R
P
 
P
E
 
K

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
32% identity, 88% coverage: 17:258/275 of query aligns to 5:238/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
D
 
D
V
 
V
H
 
H
M
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
K
Q
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
V
 
L
T
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
Y
 
V
Q
 
H
V
 
I
P
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
E
V
 
V
Q
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
L
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
H
 
D
P
 
F
T
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
S
 
I
F
 
I
L
 
D
G
 
G
R
 
I
R
 
N
V
 
L
E
 
K
R
 
A
E
 
K
P
 
D
P
 
T
H
 
N
R
 
L
I
 
N
A
 
K
A
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
E
L
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
P
L
 
M
R
 
K
T
 
V
R
 
R
S
 
K
M
 
W
R
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
I
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
K
A
 
A
R
 
M
A
 
E
W
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
H
L
 
A
P
 
Y
A
 
P
G
 
D
A
 
S
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
A
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
E
E
 
M
T
 
V
E
 
G
E
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
I
 
M
G
 
K
R
 
Q
I
 
L
K
 
A
E
 
N
R
 
E
G
 
G
T
 
M
T
 
T
V
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
N
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
T
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
M
Y
 
D
Y
 
G
G
 
G
Q
 
Y
P
 
I
L
 
I
A
 
E
S
 
E
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
K
 
F
E
 
D
N
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
H
E
 
E
V
 
R
I
 
T
Q
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
32% identity, 88% coverage: 17:258/275 of query aligns to 5:238/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
D
 
D
V
 
V
H
 
H
M
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
K
Q
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
V
 
L
T
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
Y
 
V
Q
 
H
V
 
I
P
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
E
V
 
V
Q
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
L
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
H
 
D
P
 
F
T
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
S
 
I
F
 
I
L
 
D
G
 
G
R
 
I
R
 
N
V
 
L
E
 
K
R
 
A
E
 
K
P
 
D
P
 
T
H
 
N
R
 
L
I
 
N
A
 
K
A
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
E
L
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
P
L
 
M
R
 
K
T
 
V
R
 
R
S
 
K
M
 
W
R
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
I
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
K
A
 
A
R
 
M
A
 
E
W
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
H
L
 
A
P
 
Y
A
 
P
G
 
D
A
 
S
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
A
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
E
E
 
M
T
 
V
E
 
G
E
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
I
 
M
G
 
K
R
 
Q
I
 
L
K
 
A
E
 
N
R
 
E
G
 
G
T
 
M
T
 
T
V
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
N
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
T
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
M
Y
 
D
Y
 
G
G
 
G
Q
 
Y
P
 
I
L
 
I
A
 
E
S
 
E
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
K
 
F
E
 
D
N
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
H
E
 
E
V
 
R
I
 
T
Q
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
32% identity, 88% coverage: 17:258/275 of query aligns to 5:238/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
D
 
D
V
 
V
H
 
H
M
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
K
Q
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
V
 
L
T
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
Y
 
V
Q
 
H
V
 
I
P
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
E
V
 
V
Q
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
L
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
H
 
D
P
 
F
T
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
S
 
I
F
 
I
L
 
D
G
 
G
R
 
I
R
 
N
V
 
L
E
 
K
R
 
A
E
 
K
P
 
D
P
 
T
H
 
N
R
 
L
I
 
N
A
 
K
A
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
E
L
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
P
L
 
M
R
 
K
T
 
V
R
 
R
S
 
K
M
 
W
R
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
I
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
K
A
 
A
R
 
M
A
 
E
W
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
H
L
 
A
P
 
Y
A
 
P
G
 
D
A
 
S
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
A
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
E
E
 
M
T
 
V
E
 
G
E
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
I
 
M
G
 
K
R
 
Q
I
 
L
K
 
A
E
 
N
R
 
E
G
 
G
T
 
M
T
 
T
V
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
N
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
T
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
M
Y
 
D
Y
 
G
G
 
G
Q
 
Y
P
 
I
L
 
I
A
 
E
S
 
E
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
K
 
F
E
 
D
N
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
H
E
 
E
V
 
R
I
 
T
Q
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
32% identity, 88% coverage: 17:258/275 of query aligns to 5:238/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
D
 
D
V
 
V
H
 
H
M
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
K
Q
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
V
 
L
T
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
Y
 
V
Q
 
H
V
 
I
P
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
E
V
 
V
Q
 
V
S
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
L
S
 
N
G
 
L
V
 
L
L
 
E
H
 
D
P
 
F
T
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
S
 
I
F
 
I
L
 
D
G
 
G
R
 
I
R
 
N
V
 
L
E
 
K
R
 
A
E
 
K
P
 
D
P
 
T
H
 
N
R
 
L
I
 
N
A
 
K
A
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
E
L
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
V
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
P
L
 
M
R
 
K
T
 
V
R
 
R
S
 
K
M
 
W
R
 
P
R
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
E
I
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
K
A
 
A
R
 
M
A
 
E
W
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
H
L
 
A
P
 
Y
A
 
P
G
 
D
A
 
S
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
A
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
E
E
 
M
T
 
V
E
 
G
E
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
I
 
M
G
 
K
R
 
Q
I
 
L
K
 
A
E
 
N
R
 
E
G
 
G
T
 
M
T
 
T
V
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
N
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
T
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
V
 
F
L
 
M
Y
 
D
Y
 
G
G
 
G
Q
 
Y
P
 
I
L
 
I
A
 
E
S
 
E
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
K
 
F
E
 
D
N
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
H
E
 
E
V
 
R
I
 
T
Q
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 84% coverage: 10:240/275 of query aligns to 2:221/501 of P04983

query
sites
P04983
D
 
E
P
 
A
I
 
L
L
 
L
I
 
Q
L
 
L
Q
 
K
D
 
G
V
 
I
H
 
D
M
 
K
Q
 
A
F
 
F
G
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
S
G
 
G
I
 
A
R
 
A
Y
 
L
Q
 
N
V
 
V
P
 
Y
R
 
P
G
 
G
I
 
R
V
 
V
Q
 
M
S
 
A
I
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
M
L
 
M
N
 
K
C
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
I
L
 
Y
H
 
T
P
 
R
T
 
D
E
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
L
S
 
L
F
 
W
L
 
L
G
 
G
R
 
K
R
 
E
V
 
T
E
 
T
R
 
F
E
 
T
P
 
G
P
 
P
H
 
K
R
 
S
I
 
S
A
 
Q
A
 
E
L
 
A
G
 
G
M
 
I
S
 
G
R
 
I
T
 
I
F
 
H
Q
 
Q
H
 
E
V
 
L
A
 
N
L
 
L
F
 
I
P
 
P
Q
 
Q
M
 
L
S
 
T
V
 
I
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
F
V
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
E
V
 
F
R
 
V
T
 
N
R
 
R
S
 
F
G
 
G
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
K
L
 
I
R
 
D
T
 
W
R
 
K
S
 
T
M
 
M
R
 
Y
R
 
A
E
 
E
E
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
A
R
 
D
A
 
K
W
 
L
L
 
L
D
 
A
F
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
L
A
 
R
D
 
F
A
 
K
A
 
S
H
 
D
L
 
K
P
 
L
A
 
V
G
 
G
A
 
D
L
 
L
P
 
S
L
 
I
G
 
G
K
 
D
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
M
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
S
T
 
F
D
 
E
P
 
S
A
 
K
L
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
D
G
 
A
L
 
L
N
 
T
T
 
D
R
 
T
E
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
S
L
 
L
G
 
F
E
 
R
L
 
V
I
 
I
G
 
R
R
 
E
I
 
L
K
 
K
E
 
S
R
 
Q
G
 
G
T
 
R
T
 
G
V
 
I
I
 
V
L
 
Y
V
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
N
 
K
L
 
E
V
 
I
M
 
F
T
 
E
I
 
I
S
 
C
D
 
D
R
 
D
I
 
V
L
 
T
V
 
V
L
 
F
Y
 
R
Y
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
L
 
I
A
 
A

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
28% identity, 87% coverage: 10:248/275 of query aligns to 2:224/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
D
 
E
P
 
D
I
 
I
L
 
I
I
 
V
L
 
V
Q
 
E
D
 
N
V
 
L
H
 
V
M
 
K
Q
 
K
F
|
F
G
 
G
G
 
D
V
x
F
T
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
S
Y
 
F
Q
 
S
V
 
V
P
 
K
R
 
K
G
 
G
I
 
E
V
 
I
Q
 
F
S
 
A
I
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
I
N
 
H
C
 
M
I
 
L
S
 
T
G
 
T
V
 
L
L
 
L
H
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
A
S
 
W
F
 
V
L
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
D
V
 
V
E
 
L
R
 
K
E
 
E
P
 
P
P
 
R
H
 
E
R
 
V
I
 
R
A
 
R
A
 
K
L
 
I
G
 
G
M
 
I
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
V
 
Q
A
 
S
L
 
L
F
 
D
P
 
R
Q
 
E
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
M
M
 
Y
V
 
I
G
 
H
R
 
G
H
 
K
V
 
I
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
Y
G
 
G
F
 
Y
W
 
G
A
 
G
A
 
E
G
 
K
L
 
L
R
 
K
T
 
K
R
 
R
S
 
I
M
 
L
R
 
E
R
 
L
E
 
L
E
 
E
A
 
F
A
 
V
I
 
E
G
 
L
R
 
L
D
 
E
A
 
F
R
 
K
A
 
D
W
 
K
L
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
P
A
 
V
G
 
K
A
x
T
L
x
F
P
x
S
L
 
G
G
 
G
K
 
M
Q
 
A
K
 
R
I
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
H
D
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
H
E
 
T
T
 
R
E
 
A
E
 
H
L
 
M
G
 
W
E
 
E
L
 
Y
I
 
I
G
 
S
R
 
K
I
 
M
-
 
K
K
 
K
E
 
E
R
 
H
G
 
N
T
 
M
T
 
T
V
 
I
I
 
F
L
 
L
V
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
Y
M
 
M
N
 
D
L
 
E
V
 
A
M
 
E
T
 
Q
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
A
V
 
I
L
 
I
Y
 
D
Y
 
H
G
 
G
Q
 
K
P
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
P
D
 
T
E
 
E
I
 
L
K
 
K

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 89% coverage: 13:256/275 of query aligns to 4:237/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
L
 
I
I
 
I
L
 
V
Q
 
K
D
 
N
V
 
V
H
 
S
M
 
K
Q
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
T
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
D
G
 
N
I
 
V
R
 
N
Y
 
I
Q
 
N
V
 
I
P
 
E
R
 
N
G
 
G
I
 
E
V
 
R
Q
 
F
S
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
D
H
 
V
P
 
P
T
 
S
E
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
S
 
Y
F
 
F
L
 
D
G
 
D
R
 
R
R
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
S
E
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
V
P
 
P
P
 
P
H
 
E
R
 
D
I
 
-
A
 
R
A
 
K
L
 
I
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
T
V
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
P
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
L
T
 
T
R
 
N
S
 
M
G
 
K
F
 
M
W
 
S
A
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
K
R
 
R
S
 
V
M
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
I
 
K
G
 
I
R
 
L
D
 
D
A
 
I
R
 
H
A
 
H
W
 
V
L
 
L
D
 
N
F
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
H
L
 
F
P
 
P
A
 
R
G
 
-
A
 
E
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
G
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
T
 
A
R
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
E
 
S
L
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
K
R
 
E
I
 
V
K
 
Q
E
 
S
R
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
N
 
A
L
 
D
V
 
I
M
 
F
T
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
G
V
 
V
L
 
L
Y
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
P
 
L
L
 
V
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
K
 
Y
E
 
D
N
 
N
P
 
P
E
 
V
V
 
S
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 89% coverage: 13:256/275 of query aligns to 4:237/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
L
 
I
I
 
I
L
 
V
Q
 
K
D
 
N
V
 
V
H
 
S
M
 
K
Q
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
T
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
D
G
 
N
I
 
V
R
 
N
Y
 
I
Q
 
N
V
 
I
P
 
E
R
 
N
G
 
G
I
 
E
V
 
R
Q
 
F
S
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
D
H
 
V
P
 
P
T
 
S
E
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
S
 
Y
F
 
F
L
 
D
G
 
D
R
 
R
R
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
S
E
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
V
P
 
P
P
 
P
H
 
E
R
 
D
I
 
-
A
 
R
A
 
K
L
 
I
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
P
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
L
T
 
T
R
 
N
S
 
M
G
 
K
F
 
M
W
 
S
A
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
K
R
 
R
S
 
V
M
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
I
 
K
G
 
I
R
 
L
D
 
D
A
 
I
R
 
H
A
 
H
W
 
V
L
 
L
D
 
N
F
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
H
L
 
F
P
 
P
A
 
R
G
 
-
A
 
E
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
G
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
T
 
A
R
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
E
 
S
L
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
K
R
 
E
I
 
V
K
 
Q
E
 
S
R
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
N
 
A
L
 
D
V
 
I
M
 
F
T
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
G
V
 
V
L
 
L
Y
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
P
 
L
L
 
V
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
K
 
Y
E
 
D
N
 
N
P
 
P
E
 
V
V
 
S
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 89% coverage: 13:256/275 of query aligns to 4:237/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
L
 
I
I
 
I
L
 
V
Q
 
K
D
 
N
V
 
V
H
 
S
M
 
K
Q
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
T
 
V
A
|
A
L
 
L
K
 
D
G
 
N
I
 
V
R
 
N
Y
 
I
Q
 
N
V
 
I
P
 
E
R
 
N
G
 
G
I
 
E
V
 
R
Q
 
F
S
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
D
H
 
V
P
 
P
T
 
S
E
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
S
 
Y
F
 
F
L
 
D
G
 
D
R
 
R
R
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
S
E
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
V
P
 
P
P
 
P
H
 
E
R
 
D
I
 
-
A
 
R
A
 
K
L
 
I
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
P
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
L
T
 
T
R
 
N
S
 
M
G
 
K
F
 
M
W
 
S
A
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
K
R
 
R
S
 
V
M
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
I
 
K
G
 
I
R
 
L
D
 
D
A
 
I
R
 
H
A
 
H
W
 
V
L
 
L
D
 
N
F
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
H
L
 
F
P
 
P
A
 
R
G
 
-
A
 
E
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
G
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
T
 
A
R
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
E
 
S
L
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
K
R
 
E
I
 
V
K
 
Q
E
 
S
R
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
N
 
A
L
 
D
V
 
I
M
 
F
T
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
G
V
 
V
L
 
L
Y
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
P
 
L
L
 
V
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
K
 
Y
E
 
D
N
 
N
P
 
P
E
 
V
V
 
S
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
33% identity, 89% coverage: 13:256/275 of query aligns to 4:237/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
L
 
I
I
 
I
L
 
V
Q
 
K
D
 
N
V
 
V
H
 
S
M
 
K
Q
 
V
F
 
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
V
T
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
D
G
 
N
I
 
V
R
 
N
Y
 
I
Q
 
N
V
 
I
P
 
E
R
 
N
G
 
G
I
 
E
V
 
R
Q
 
F
S
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
D
H
 
V
P
 
P
T
 
S
E
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
L
S
 
Y
F
 
F
L
 
D
G
 
D
R
 
R
R
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
S
E
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
V
P
 
P
P
 
P
H
 
E
R
 
D
I
 
-
A
 
R
A
 
K
L
 
I
G
 
G
M
 
M
S
 
-
R
 
-
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
W
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
Q
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
P
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
L
T
 
T
R
 
N
S
 
M
G
 
K
F
 
M
W
 
S
A
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
K
R
 
R
S
 
V
M
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
I
 
K
G
 
I
R
 
L
D
 
D
A
 
I
R
 
H
A
 
H
W
 
V
L
 
L
D
 
N
F
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
H
L
 
F
P
 
P
A
 
R
G
 
-
A
 
E
L
 
L
P
x
S
L
 
G
G
|
G
K
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
G
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
T
 
A
R
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
E
 
S
L
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
K
R
 
E
I
 
V
K
 
Q
E
 
S
R
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
N
 
A
L
 
D
V
 
I
M
 
F
T
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
G
V
 
V
L
 
L
Y
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
P
 
L
L
 
V
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
K
 
Y
E
 
D
N
 
N
P
 
P
E
 
V
V
 
S
I
 
I
Q
 
Q
A
 
V

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
28% identity, 91% coverage: 12:262/275 of query aligns to 2:238/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
I
 
I
L
 
L
I
 
K
L
 
A
Q
 
Q
D
 
H
V
 
L
H
 
A
M
 
K
Q
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
V
 
R
T
 
K
A
 
V
L
 
V
K
 
S
G
 
D
I
 
V
R
 
S
Y
 
L
Q
 
Q
V
 
V
P
 
E
R
 
S
G
 
G
I
 
Q
V
 
I
Q
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
S
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
V
H
 
A
P
 
R
T
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
T
I
 
I
S
 
T
F
 
I
L
 
D
G
 
D
R
 
N
R
 
D
V
 
I
E
 
S
R
 
I
E
 
L
P
 
P
P
 
M
H
 
H
R
 
S
I
 
R
A
 
S
A
 
R
L
 
M
G
 
G
M
 
I
S
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
H
 
E
V
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
P
 
R
Q
 
K
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
V
 
I
M
 
M
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
V
L
 
L
R
 
Q
T
 
T
R
 
R
S
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
T
I
 
H
G
x
E
R
 
E
D
 
R
A
 
Q
R
x
D
A
 
K
W
 
L
L
 
E
D
 
D
F
 
L
V
 
L
G
 
E
L
 
E
A
 
F
D
 
H
A
 
I
A
 
Q
H
 
H
L
 
I
-
 
R
-
 
K
P
 
S
A
 
A
G
 
G
-
 
M
A
 
A
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
E
Q
 
R
K
 
R
I
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
A
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
G
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
T
 
P
R
 
I
E
 
S
T
 
V
E
 
I
E
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
E
R
 
H
I
 
L
K
 
R
E
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
N
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
T
 
D
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
K
I
 
A
L
 
Y
V
 
I
L
 
V
Y
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
R
P
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
T
P
 
P
D
 
Q
E
 
D
I
 
V
K
 
L
E
 
N
N
 
N
P
 
E
E
 
Q
V
 
V
I
 
K
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E
E
 
Q
W
 
F

1g291 Malk (see paper)
31% identity, 86% coverage: 15:251/275 of query aligns to 6:231/372 of 1g291

query
sites
1g291
L
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
V
H
 
W
M
 
K
Q
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
R
G
 
E
I
 
M
R
 
S
Y
 
L
Q
 
E
V
 
V
P
 
K
R
 
D
G
 
G
I
 
E
V
 
F
Q
 
M
S
 
I
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
E
H
 
E
P
 
P
T
 
S
E
 
R
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
S
 
-
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
K
V
 
L
E
 
V
R
 
A
E
x
D
P
 
P
P
x
E
H
x
K
R
 
G
I
 
I
A
 
F
A
 
V
L
 
P
G
 
P
M
x
K
S
x
D
R
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
V
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
I
M
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
A
A
 
F
G
 
P
L
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
R
S
 
K
M
 
V
R
 
P
R
 
R
E
 
Q
E
 
E
A
 
-
A
 
-
I
 
I
G
 
D
R
 
Q
D
 
R
A
 
V
R
 
R
A
 
E
W
 
V
L
 
A
D
 
E
F
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
L
A
 
L
H
 
N
L
 
R
P
 
K
A
 
P
G
 
R
A
 
E
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
R
D
 
K
P
 
P
A
 
Q
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
L
G
 
S
G
 
N
L
 
L
N
 
D
T
 
A
R
 
K
E
 
L
T
 
R
E
 
V
E
 
R
L
 
M
-
 
R
G
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
K
G
 
K
R
 
L
I
 
Q
K
 
R
E
 
Q
R
 
L
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
T
I
 
I
L
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
N
 
V
L
 
E
V
 
A
M
 
M
T
 
T
I
 
M
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
L
 
M
Y
 
N
Y
 
R
G
 
G
Q
 
V
P
 
L
L
 
Q
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
V
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
E
I
 
V
K
 
Y
E
 
D
N
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P02915 Histidine/lysine/arginine/ornithine transport ATP-binding protein HisP; EC 7.4.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 9:252/275 of query aligns to 3:245/258 of P02915

query
sites
P02915
S
 
S
D
 
E
P
 
N
I
 
K
L
 
L
I
 
H
L
 
V
Q
 
I
D
 
D
V
 
L
H
 
H
M
 
K
Q
 
R
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
H
T
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
S
Y
 
L
Q
 
Q
V
 
A
P
 
R
R
 
A
G
 
G
I
 
D
V
 
V
Q
 
I
S
 
S
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
I
S
 
N
G
 
F
V
 
L
L
 
E
H
 
K
P
 
P
T
 
S
E
 
E
G
 
G
R
 
A
I
 
I
S
 
I
F
 
V
L
 
N
G
 
G
R
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
R
 
K
V
 
V
E
 
A
R
 
D
E
 
K
P
 
N
P
 
Q
H
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
L
A
 
R
L
 
T
G
 
R
M
 
L
S
 
T
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
M
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
E
S
 
A
G
 
P
F
 
I
W
 
Q
A
 
V
A
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
T
 
K
R
 
H
S
 
D
M
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
A
R
 
L
A
 
K
W
 
Y
L
 
L
D
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
D
D
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
Q
L
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
K
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
-
 
H
-
 
L
-
 
S
-
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
A
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
E
E
 
L
T
 
V
E
 
G
E
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
R
L
 
I
I
 
M
G
 
Q
R
 
Q
I
 
L
K
 
A
E
 
E
R
 
E
G
 
G
T
 
K
T
 
T
V
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
N
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
T
 
H
I
 
V
S
 
S
D
 
S
R
 
H
I
 
V
L
 
I
V
 
F
L
 
L
Y
 
H
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
I
L
 
E
A
 
E
S
 
E
G
 
G
V
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
V
K
 
F
E
 
G
N
 
N
P
 
P
E
 
Q

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 92% coverage: 7:260/275 of query aligns to 12:250/378 of P69874

query
sites
P69874
S
 
S
S
 
S
S
 
L
D
 
S
P
 
P
I
 
L
L
 
V
I
 
Q
L
 
L
Q
 
A
D
 
G
V
 
I
H
 
R
M
 
K
Q
x
C
F
|
F
G
 
D
G
 
G
V
 
K
T
 
E
A
 
V
L
 
I
K
 
P
G
 
Q
I
 
L
R
 
D
Y
 
L
Q
 
T
V
 
I
P
 
N
R
 
N
G
 
G
I
 
E
V
x
F
Q
 
L
S
 
T
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
V
L
|
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
E
H
 
T
P
 
V
T
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
S
 
M
F
x
L
L
 
D
G
 
N
R
 
E
R
 
D
V
 
I
E
 
T
R
 
H
E
 
V
P
 
P
P
 
A
H
 
E
R
 
N
I
 
R
A
 
Y
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
V
S
 
N
R
 
T
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
V
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
V
 
F
G
 
G
R
 
L
H
 
R
V
 
M
R
 
Q
T
 
K
R
 
T
S
 
P
G
 
-
F
 
-
W
 
-
A
 
A
A
 
A
G
 
E
L
 
I
R
 
T
T
 
P
R
 
R
S
 
V
M
 
M
R
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
E
A
 
A
A
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
L
D
 
R
F
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
A
 
E
D
 
T
A
 
F
A
 
A
H
 
Q
L
 
R
P
 
K
A
 
P
G
 
H
A
 
Q
L
 
L
P
 
S
L
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
D
 
K
P
 
P
A
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
A
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
Y
R
 
K
E
 
L
T
 
R
E
 
K
E
 
Q
L
 
M
-
 
Q
G
 
N
E
 
E
L
 
L
I
 
K
G
 
A
R
 
L
I
 
Q
K
 
R
E
 
K
R
 
L
G
 
G
T
 
I
T
 
T
V
 
F
I
 
V
L
 
F
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
N
 
E
L
 
E
V
 
A
M
 
L
T
 
T
I
 
M
S
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
M
Y
 
R
Y
 
D
G
 
G
Q
 
R
P
 
I
L
 
E
A
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
T
P
 
P
D
 
R
E
 
E
I
 
I
K
 
Y
E
 
E
N
 
E
P
 
P
E
 
K
-
 
N
-
 
L
V
 
F
I
 
V
Q
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
D
 
E

Sites not aligning to the query:

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
31% identity, 86% coverage: 17:252/275 of query aligns to 7:241/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
D
 
D
V
 
L
H
 
H
M
 
K
Q
 
R
F
x
Y
G
 
G
G
 
G
V
x
H
T
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
S
Y
 
L
Q
 
Q
V
 
A
P
 
R
R
 
A
G
 
G
I
 
D
V
 
V
Q
 
I
S
 
S
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
I
S
 
N
G
 
F
V
 
L
L
 
E
H
 
K
P
 
P
T
 
S
E
 
E
G
 
G
R
 
A
I
 
I
S
 
I
F
 
V
L
 
N
G
 
G
R
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
R
 
K
V
 
V
E
 
A
R
 
D
E
 
K
P
 
N
P
 
Q
H
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
L
A
 
R
L
 
T
G
 
R
M
 
L
S
 
T
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
Q
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
M
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
E
S
 
A
G
 
P
F
 
I
W
 
Q
A
 
V
A
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
T
 
K
R
 
H
S
 
D
M
 
A
R
 
R
R
 
E
E
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
A
R
 
L
A
 
K
W
 
Y
L
 
L
D
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
D
D
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
Q
L
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
K
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
-
 
H
-
 
L
-
 
S
-
 
G
G
 
G
K
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
I
 
R
L
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
A
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
P
R
 
E
E
 
L
T
 
V
E
 
G
E
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
R
L
 
I
I
 
M
G
 
Q
R
 
Q
I
 
L
K
 
A
E
 
E
R
 
E
G
 
G
T
 
K
T
 
T
V
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
N
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
T
 
H
I
 
V
S
 
S
D
 
S
R
 
H
I
 
V
L
 
I
V
 
F
L
 
L
Y
 
H
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
I
L
 
E
A
 
E
S
 
E
G
 
G
V
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
V
K
 
F
E
 
G
N
 
N
P
 
P
E
 
Q

Query Sequence

>WP_143156507.1 NCBI__GCF_900129305.1:WP_143156507.1
MTSPRFSSSDPILILQDVHMQFGGVTALKGIRYQVPRGIVQSIIGPNGAGKTTLLNCISG
VLHPTEGRISFLGRRVEREPPHRIAALGMSRTFQHVALFPQMSVLENVMVGRHVRTRSGF
WAAGLRTRSMRREEAAIGRDARAWLDFVGLADAAHLPAGALPLGKQKILEIARALATDPA
LLLLDEPAGGLNTRETEELGELIGRIKERGTTVILVEHDMNLVMTISDRILVLYYGQPLA
SGVPDEIKENPEVIQAYLGDEWTPDEGAPIMNGQL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory