SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_156804462.1 NCBI__GCF_000299915.1:WP_156804462.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8j5qD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- translocation state (see paper)
42% identity, 96% coverage: 5:252/258 of query aligns to 348:601/611 of 8j5qD

query
sites
8j5qD
L
 
V
L
 
V
E
 
R
V
 
V
T
 
R
D
 
H
L
 
L
S
 
V
K
 
K
T
 
T
F
 
Y
V
 
R
N
 
L
R
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
V
K
 
L
R
 
R
E
 
R
T
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
V
E
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
D
P
 
G
L
 
I
S
 
S
F
 
L
S
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
C
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
V
 
T
A
 
L
K
 
H
L
 
E
L
 
I
V
 
L
G
 
E
A
 
L
E
 
A
V
 
A
P
 
P
T
 
Q
T
 
S
G
 
G
V
 
S
V
 
I
K
 
E
-
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
T
E
 
D
P
 
V
L
 
A
A
 
T
L
 
L
H
 
G
S
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
R
C
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
R
R
 
R
S
 
D
I
 
I
R
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
V
T
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
T
 
P
V
 
V
G
 
F
R
 
D
Q
 
L
L
 
I
E
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
L
 
A
N
 
N
T
 
G
T
 
-
L
 
F
T
 
G
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
R
 
T
Q
 
H
A
 
A
K
 
R
I
 
V
E
 
A
A
 
E
T
 
L
L
 
L
V
 
D
R
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
R
A
 
H
E
 
G
H
 
D
A
 
A
D
 
S
Y
 
R
Y
 
Y
P
 
P
H
 
A
M
 
E
I
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
L
G
 
Q
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
A
C
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
L
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
Q
G
 
A
Q
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
N
F
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
L
Q
 
Q
R
 
E
K
 
Q
Q
 
F
Q
 
G
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
V
 
L
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
N
 
D
M
 
L
G
 
S
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
H
I
 
L
S
 
A
D
 
H
Y
 
Q
V
 
V
L
 
A
I
 
V
M
 
M
H
 
L
H
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
P
 
D
T
 
S
K
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
H
E
 
E
V
 
Y
T
 
T
K
 
R
R
 
R
M
 
L
L
 
L
M
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8j5tD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the catalytic intermediate state (see paper)
41% identity, 96% coverage: 5:252/258 of query aligns to 348:601/608 of 8j5tD

query
sites
8j5tD
L
 
V
L
 
V
E
 
R
V
 
V
T
 
R
D
 
H
L
 
L
S
 
V
K
 
K
T
 
T
F
x
Y
V
 
R
N
 
L
R
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
V
K
 
L
R
 
R
E
 
R
T
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
V
E
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
D
P
 
G
L
 
I
S
 
S
F
 
L
S
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
C
 
V
G
 
G
E
 
E
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
T
A
 
L
K
 
H
L
 
E
L
 
I
V
 
L
G
 
E
A
 
L
E
 
A
V
 
A
P
 
P
T
 
Q
T
 
S
G
 
G
V
 
S
V
 
I
K
 
E
-
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
T
E
 
D
P
 
V
L
 
A
A
 
T
L
 
L
H
 
G
S
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
R
C
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
R
R
 
R
S
 
D
I
 
I
R
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
V
T
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
T
 
P
V
 
V
G
 
F
R
 
D
Q
 
L
L
 
I
E
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
L
 
A
N
 
N
T
 
G
T
 
-
L
 
F
T
 
G
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
R
 
T
Q
 
H
A
 
A
K
 
R
I
 
V
E
 
A
A
 
E
T
 
L
L
 
L
V
 
D
R
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
R
A
 
H
E
 
G
H
 
D
A
 
A
D
 
S
Y
x
R
Y
 
Y
P
 
P
H
 
A
M
x
E
I
 
F
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
L
G
 
Q
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
A
C
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
P
L
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
Q
G
 
A
Q
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
N
F
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
L
Q
 
Q
R
 
E
K
 
Q
Q
 
F
Q
 
G
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
V
 
L
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
|
H
N
 
D
M
 
L
G
 
S
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
H
I
 
L
S
 
A
D
 
H
Y
 
Q
V
 
V
L
 
A
I
 
V
M
 
M
H
 
L
H
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
P
 
D
T
 
S
K
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
H
E
 
E
V
 
Y
T
 
T
K
 
R
R
 
R
M
 
L
L
 
L
M
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8j5sD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- catalytic intermediate state (see paper)
41% identity, 96% coverage: 5:252/258 of query aligns to 348:601/608 of 8j5sD

query
sites
8j5sD
L
 
V
L
 
V
E
 
R
V
 
V
T
 
R
D
 
H
L
 
L
S
 
V
K
 
K
T
 
T
F
x
Y
V
 
R
N
 
L
R
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
V
K
 
L
R
 
R
E
 
R
T
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
V
E
 
R
A
|
A
V
 
V
A
 
D
P
 
G
L
 
I
S
 
S
F
 
L
S
 
E
L
 
L
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
C
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
T
A
 
L
K
 
H
L
 
E
L
 
I
V
 
L
G
 
E
A
 
L
E
 
A
V
 
A
P
 
P
T
 
Q
T
 
S
G
 
G
V
 
S
V
 
I
K
 
E
-
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
T
E
 
D
P
 
V
L
 
A
A
 
T
L
 
L
H
 
G
S
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
R
C
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
R
R
 
R
S
 
D
I
 
I
R
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
V
T
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
D
P
 
P
R
 
R
V
 
L
T
 
P
V
 
V
G
 
F
R
 
D
Q
 
L
L
 
I
E
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
L
 
A
N
 
N
T
 
G
T
 
-
L
 
F
T
 
G
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
R
 
T
Q
 
H
A
 
A
K
 
R
I
 
V
E
 
A
A
 
E
T
 
L
L
 
L
V
 
D
R
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
R
A
 
H
E
 
G
H
 
D
A
 
A
D
 
S
Y
 
R
Y
 
Y
P
 
P
H
 
A
M
 
E
I
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
L
G
 
Q
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
A
C
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
P
L
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
Q
G
 
A
Q
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
N
F
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
L
Q
 
Q
R
 
E
K
 
Q
Q
 
F
Q
 
G
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
V
 
L
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
N
 
D
M
 
L
G
 
S
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
H
I
 
L
S
 
A
D
 
H
Y
 
Q
V
 
V
L
 
A
I
 
V
M
 
M
H
 
L
H
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
P
 
D
T
 
S
K
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
H
E
 
E
V
 
Y
T
 
T
K
 
R
R
 
R
M
 
L
L
 
L
M
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
35% identity, 96% coverage: 5:252/258 of query aligns to 1:243/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
M
L
 
I
E
 
K
V
 
L
T
 
S
D
 
N
L
 
I
S
 
T
K
 
K
T
 
V
F
 
F
V
 
-
N
 
-
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
L
 
-
F
 
-
K
 
-
R
 
T
E
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
N
P
 
N
L
 
V
S
 
S
F
 
L
S
 
H
L
 
V
E
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
Y
A
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
E
 
A
T
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
A
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
V
 
N
G
 
L
A
 
L
E
 
E
V
 
R
P
 
P
T
 
T
T
 
E
G
 
G
V
 
S
V
 
V
K
 
L
L
 
V
-
 
D
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
P
 
L
L
 
T
A
 
T
L
 
L
H
 
S
S
 
E
A
 
S
E
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
K
S
 
A
C
 
R
R
 
R
S
 
Q
I
 
I
R
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
P
 
F
S
 
N
T
 
L
S
 
-
L
 
L
N
 
S
P
 
S
R
 
R
V
 
T
T
 
V
V
 
F
G
 
G
R
 
-
Q
 
N
L
 
V
E
 
A
E
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
N
 
D
T
 
N
T
 
T
L
 
-
T
 
P
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
R
 
V
Q
 
K
A
 
R
K
 
R
I
 
V
E
 
T
A
 
E
T
 
L
L
 
L
V
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
G
A
 
D
E
 
K
H
 
H
A
 
-
D
 
D
Y
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
M
 
N
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
S
G
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
C
 
C
D
 
D
E
|
E
A
 
A
L
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
A
L
 
T
R
 
T
G
 
R
Q
 
S
I
 
I
L
 
L
N
 
E
F
 
L
L
 
L
L
 
K
D
 
D
E
 
I
Q
 
N
R
 
R
K
 
R
Q
 
L
Q
 
G
L
 
L
G
 
T
Y
 
I
V
 
L
F
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
N
 
E
M
 
M
G
 
D
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
Y
 
C
V
 
V
L
 
A
I
 
V
M
 
I
H
 
S
H
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
G
 
D
P
 
T
T
 
V
K
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
H
 
T
E
 
P
V
 
L
T
 
A
K
 
Q
R
 
K
M
 
F
L
 
I
M
 
Q
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
35% identity, 96% coverage: 5:252/258 of query aligns to 2:244/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
M
L
 
I
E
 
K
V
 
L
T
 
S
D
 
N
L
 
I
S
 
T
K
 
K
T
 
V
F
|
F
V
 
-
N
 
-
R
 
H
R
x
Q
G
 
G
L
 
-
F
 
-
K
 
-
R
 
T
E
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
N
P
 
N
L
 
V
S
 
S
F
 
L
S
 
H
L
 
V
E
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
Y
A
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
E
 
A
T
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
A
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
V
 
N
G
 
L
A
 
L
E
 
E
V
 
R
P
 
P
T
 
T
T
 
E
G
 
G
V
 
S
V
 
V
K
 
L
L
 
V
-
 
D
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
P
 
L
L
 
T
A
 
T
L
 
L
H
 
S
S
 
E
A
 
S
E
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
K
S
 
A
C
 
R
R
 
R
S
 
Q
I
 
I
R
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
P
 
F
S
 
N
T
 
L
S
 
-
L
 
L
N
 
S
P
 
S
R
 
R
V
 
T
T
 
V
V
 
F
G
 
G
R
 
-
Q
 
N
L
 
V
E
 
A
E
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
N
 
D
T
 
N
T
 
T
L
 
-
T
 
P
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
R
 
V
Q
 
K
A
 
R
K
 
R
I
 
V
E
 
T
A
 
E
T
 
L
L
 
L
V
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
G
A
 
D
E
 
K
H
 
H
A
 
-
D
 
D
Y
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
M
 
N
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
S
G
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
L
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
A
L
 
T
R
 
T
G
 
R
Q
 
S
I
 
I
L
 
L
N
 
E
F
 
L
L
 
L
L
 
K
D
 
D
E
 
I
Q
 
N
R
 
R
K
 
R
Q
 
L
Q
 
G
L
 
L
G
 
T
Y
 
I
V
 
L
F
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
N
 
E
M
 
M
G
 
D
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
Y
 
C
V
 
V
L
 
A
I
 
V
M
 
I
H
 
S
H
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
G
 
D
P
 
T
T
 
V
K
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
H
 
T
E
 
P
V
 
L
T
 
A
K
 
Q
R
 
K
M
 
F
L
 
I
M
 
Q
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
35% identity, 96% coverage: 5:252/258 of query aligns to 2:244/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
M
L
 
I
E
 
K
V
 
L
T
 
S
D
 
N
L
 
I
S
 
T
K
 
K
T
 
V
F
|
F
V
 
-
N
 
-
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
L
 
-
F
 
-
K
 
-
R
 
T
E
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
N
P
 
N
L
 
V
S
 
S
F
 
L
S
 
H
L
 
V
E
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
Y
A
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
E
 
A
T
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
A
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
V
 
N
G
 
L
A
 
L
E
 
E
V
 
R
P
 
P
T
 
T
T
 
E
G
 
G
V
 
S
V
 
V
K
 
L
L
 
V
-
 
D
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
P
 
L
L
 
T
A
 
T
L
 
L
H
 
S
S
 
E
A
 
S
E
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
K
S
 
A
C
 
R
R
 
R
S
 
Q
I
 
I
R
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
P
 
F
S
 
N
T
 
L
S
 
-
L
 
L
N
 
S
P
 
S
R
 
R
V
 
T
T
 
V
V
 
F
G
 
G
R
 
-
Q
 
N
L
 
V
E
 
A
E
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
N
 
D
T
 
N
T
 
T
L
 
-
T
 
P
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
R
 
V
Q
 
K
A
 
R
K
 
R
I
 
V
E
 
T
A
 
E
T
 
L
L
 
L
V
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
G
A
 
D
E
 
K
H
 
H
A
 
-
D
 
D
Y
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
M
 
N
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
S
G
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
L
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
A
L
 
T
R
 
T
G
 
R
Q
 
S
I
 
I
L
 
L
N
 
E
F
 
L
L
 
L
L
 
K
D
 
D
E
 
I
Q
 
N
R
 
R
K
 
R
Q
 
L
Q
 
G
L
 
L
G
 
T
Y
 
I
V
 
L
F
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
N
 
E
M
 
M
G
 
D
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
Y
 
C
V
 
V
L
 
A
I
 
V
M
 
I
H
 
S
H
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
G
 
D
P
 
T
T
 
V
K
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
H
 
T
E
 
P
V
 
L
T
 
A
K
 
Q
R
 
K
M
 
F
L
 
I
M
 
Q
A
 
S

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
35% identity, 96% coverage: 5:252/258 of query aligns to 2:244/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
M
L
 
I
E
 
K
V
 
L
T
 
S
D
 
N
L
 
I
S
 
T
K
 
K
T
 
V
F
|
F
V
 
-
N
 
-
R
 
H
R
x
Q
G
 
G
L
 
-
F
 
-
K
 
-
R
 
T
E
 
R
T
 
T
I
|
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
N
P
 
N
L
 
V
S
 
S
F
 
L
S
 
H
L
 
V
E
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
Y
A
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
E
 
A
T
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
A
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
V
 
N
G
 
L
A
 
L
E
 
E
V
 
R
P
 
P
T
 
T
T
 
E
G
 
G
V
 
S
V
 
V
K
 
L
L
 
V
-
 
D
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
P
 
L
L
 
T
A
 
T
L
 
L
H
 
S
S
 
E
A
 
S
E
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
K
S
 
A
C
 
R
R
 
R
S
 
Q
I
 
I
R
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
P
 
F
S
 
N
T
 
L
S
 
-
L
 
L
N
 
S
P
 
S
R
 
R
V
 
T
T
 
V
V
 
F
G
 
G
R
 
-
Q
 
N
L
 
V
E
 
A
E
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
N
 
D
T
 
N
T
 
T
L
 
-
T
 
P
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
R
 
V
Q
 
K
A
 
R
K
 
R
I
 
V
E
 
T
A
 
E
T
 
L
L
 
L
V
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
G
A
 
D
E
 
K
H
 
H
A
 
-
D
 
D
Y
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
M
x
N
I
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
S
G
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
L
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
A
L
 
T
R
 
T
G
 
R
Q
 
S
I
 
I
L
 
L
N
 
E
F
 
L
L
 
L
L
 
K
D
 
D
E
 
I
Q
 
N
R
 
R
K
 
R
Q
 
L
Q
 
G
L
 
L
G
 
T
Y
 
I
V
 
L
F
 
L
V
 
I
S
 
T
H
|
H
N
 
E
M
 
M
G
 
D
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
Y
 
C
V
 
V
L
 
A
I
 
V
M
 
I
H
 
S
H
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
G
 
D
P
 
T
T
 
V
K
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
H
 
T
E
 
P
V
 
L
T
 
A
K
 
Q
R
 
K
M
 
F
L
 
I
M
 
Q
A
 
S

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
33% identity, 93% coverage: 4:243/258 of query aligns to 16:241/378 of P69874

query
sites
P69874
P
 
P
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
T
 
A
D
 
G
L
 
I
S
 
R
K
 
K
T
x
C
F
|
F
V
 
D
N
 
G
R
 
K
R
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
V
V
 
I
A
 
P
P
 
Q
L
 
L
S
 
D
F
 
L
S
 
T
L
 
I
E
 
N
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
x
F
L
 
L
A
 
T
I
 
L
C
 
L
G
 
G
E
 
P
T
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
V
A
x
L
K
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
L
E
 
E
V
 
T
P
 
V
T
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
R
V
 
I
K
 
M
L
|
L
G
 
D
D
 
N
E
 
E
P
 
D
L
 
I
A
 
T
L
 
H
H
 
V
S
 
P
A
 
A
E
 
E
S
 
N
C
 
-
R
 
R
S
 
Y
I
 
V
R
 
N
M
 
T
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
-
P
 
-
S
 
S
T
 
Y
S
 
A
L
 
L
N
 
F
P
 
P
R
 
H
V
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
F
R
 
E
Q
 
N
L
 
V
E
 
A
E
 
F
P
 
G
L
 
L
K
 
R
L
 
M
N
 
Q
T
 
K
T
 
T
L
 
P
T
 
A
A
 
A
A
 
E
Q
 
I
R
 
T
Q
 
P
A
 
R
K
 
V
I
 
M
E
 
E
A
 
A
T
 
-
L
 
-
V
 
L
R
 
R
V
 
M
G
x
V
L
 
Q
L
 
L
A
 
E
E
 
T
H
 
F
A
 
A
D
 
Q
Y
 
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
H
M
 
Q
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
N
G
 
K
P
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
L
C
 
L
D
|
D
E
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
Y
S
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
K
Q
 
Q
I
 
M
L
 
Q
N
 
N
F
 
E
L
 
L
L
 
K
D
 
A
E
 
L
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
Q
 
L
Q
 
G
L
 
I
G
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
T
H
 
H
N
 
D
M
 
Q
G
 
E
I
 
E
V
 
A
Q
 
L
H
 
T
I
 
M
S
 
S
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
L
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
R
H
 
D
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
V
 
E
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
P
 
T
T
 
P
K
 
R
E
 
E
V
 
I
F
 
Y
S
 
E
N
 
E
P
 
P
Q
 
K
H
 
N

Sites not aligning to the query:

7z18I E. Coli c-p lyase bound to a phnk abc dimer and atp (see paper)
32% identity, 95% coverage: 4:247/258 of query aligns to 2:241/250 of 7z18I

query
sites
7z18I
P
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
V
T
 
N
D
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
H
T
 
L
F
x
Y
V
 
A
N
 
P
R
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
F
F
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
S
P
 
D
L
 
V
S
 
S
F
 
F
S
 
D
L
 
L
E
 
W
A
 
P
G
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
G
I
 
I
C
 
V
G
 
G
E
 
E
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
A
 
L
K
 
K
L
 
S
L
 
I
V
 
S
G
 
A
A
 
R
E
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
Q
T
 
Q
G
 
G
V
 
E
V
 
I
K
 
H
L
 
Y
G
 
E
D
 
N
E
 
R
P
 
S
L
 
L
-
 
Y
A
 
A
L
 
M
H
 
S
S
 
E
A
 
A
E
 
D
S
 
R
C
 
R
R
 
R
S
 
L
I
 
L
R
 
R
-
 
T
-
 
E
-
 
W
-
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
H
Q
|
Q
D
 
H
P
 
P
S
 
L
T
 
D
S
 
G
L
 
L
N
 
R
P
 
R
R
 
Q
V
 
V
T
 
S
V
 
A
G
 
G
R
 
G
Q
 
N
L
 
I
E
 
G
E
 
E
P
 
R
L
 
L
K
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
M
L
 
A
T
 
T
A
 
G
A
 
A
Q
 
R
R
 
H
Q
 
Y
A
 
G
K
 
D
I
 
I
E
 
R
A
 
A
T
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
W
L
 
L
V
 
E
R
 
E
V
 
V
G
 
E
L
 
I
L
 
P
A
 
A
E
 
N
H
x
R
A
 
I
D
 
D
Y
 
D
Y
 
L
P
 
P
H
 
T
M
x
T
I
 
F
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
Q
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
N
L
 
L
I
 
V
L
 
T
G
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
L
L
 
V
V
 
F
C
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
P
L
 
T
A
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
Q
G
 
A
Q
 
R
I
 
L
L
 
L
N
 
D
F
 
L
L
 
L
L
 
R
D
 
G
E
 
L
Q
 
V
R
 
V
K
 
E
Q
 
L
Q
 
N
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
V
 
V
F
 
I
V
 
V
S
 
T
H
|
H
N
 
D
M
 
L
G
 
G
I
 
V
V
 
A
Q
 
R
H
 
L
I
 
L
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
V
 
L
L
 
L
I
 
V
M
 
M
H
 
K
H
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
S
G
 
G
P
 
L
T
 
T
K
 
D
E
 
R
V
 
V
F
 
L
S
 
D
N
 
D
P
 
P
Q
 
H
H
 
H
E
 
P
V
 
Y
T
 
T
K
 
Q

7z15I E. Coli c-p lyase bound to a phnk/phnl dual abc dimer and adp + pi (see paper)
32% identity, 95% coverage: 4:247/258 of query aligns to 2:241/253 of 7z15I

query
sites
7z15I
P
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
V
T
 
N
D
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
H
T
 
L
F
x
Y
V
 
A
N
 
P
R
 
G
R
x
K
G
|
G
L
 
F
F
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
S
P
 
D
L
 
V
S
 
S
F
 
F
S
 
D
L
 
L
E
 
W
A
 
P
G
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
G
I
 
I
C
 
V
G
 
G
E
 
E
T
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
A
 
L
K
 
K
L
 
S
L
 
I
V
 
S
G
 
A
A
 
R
E
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
Q
T
 
Q
G
 
G
V
 
E
V
 
I
K
 
H
L
 
Y
G
 
E
D
 
N
E
 
R
P
 
S
L
 
L
-
 
Y
A
 
A
L
 
M
H
 
S
S
 
E
A
 
A
E
 
D
S
 
R
C
 
R
R
 
R
S
 
L
I
 
L
R
 
R
-
 
T
-
 
E
-
 
W
-
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
H
Q
|
Q
D
 
H
P
 
P
S
 
L
T
 
D
S
 
G
L
 
L
N
 
R
P
 
R
R
 
Q
V
 
V
T
 
S
V
 
A
G
 
G
R
 
G
Q
 
N
L
 
I
E
 
G
E
 
E
P
 
R
L
 
L
K
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
M
L
 
A
T
 
T
A
 
G
A
 
A
Q
 
R
R
 
H
Q
 
Y
A
 
G
K
 
D
I
 
I
E
 
R
A
 
A
T
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
W
L
 
L
V
 
E
R
 
E
V
 
V
G
 
E
L
 
I
L
 
P
A
 
A
E
 
N
H
x
R
A
 
I
D
 
D
Y
 
D
Y
 
L
P
 
P
H
 
T
M
x
T
I
 
F
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
Q
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
N
L
 
L
I
 
V
L
 
T
G
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
L
L
 
V
V
 
F
C
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
P
L
 
T
A
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
Q
G
 
A
Q
 
R
I
 
L
L
 
L
N
 
D
F
 
L
L
 
L
L
 
R
D
 
G
E
 
L
Q
 
V
R
 
V
K
 
E
Q
 
L
Q
 
N
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
V
 
V
F
 
I
V
 
V
S
 
T
H
 
H
N
 
D
M
 
L
G
 
G
I
 
V
V
 
A
Q
 
R
H
 
L
I
 
L
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
V
 
L
L
 
L
I
 
V
M
 
M
H
 
K
H
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
S
G
 
G
P
 
L
T
 
T
K
 
D
E
 
R
V
 
V
F
 
L
S
 
D
N
 
D
P
 
P
Q
 
H
H
 
H
E
 
P
V
 
Y
T
 
T
K
 
Q

7z16I E. Coli c-p lyase bound to phnk/phnl dual abc dimer with amppnp and phnk e171q mutation (see paper)
32% identity, 95% coverage: 4:247/258 of query aligns to 2:241/250 of 7z16I

query
sites
7z16I
P
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
V
T
 
N
D
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
H
T
 
L
F
x
Y
V
 
A
N
 
P
R
 
G
R
x
K
G
 
G
L
 
F
F
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
S
P
 
D
L
 
V
S
 
S
F
 
F
S
 
D
L
 
L
E
 
W
A
 
P
G
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
G
I
 
I
C
 
V
G
 
G
E
 
E
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
A
 
L
K
 
K
L
 
S
L
 
I
V
 
S
G
 
A
A
 
R
E
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
Q
T
 
Q
G
 
G
V
 
E
V
 
I
K
 
H
L
 
Y
G
 
E
D
 
N
E
 
R
P
 
S
L
 
L
-
 
Y
A
 
A
L
 
M
H
 
S
S
 
E
A
 
A
E
 
D
S
 
R
C
 
R
R
 
R
S
 
L
I
 
L
R
 
R
-
 
T
-
 
E
-
 
W
-
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
H
Q
 
Q
D
 
H
P
 
P
S
 
L
T
 
D
S
 
G
L
 
L
N
 
R
P
 
R
R
 
Q
V
 
V
T
 
S
V
 
A
G
 
G
R
 
G
Q
 
N
L
 
I
E
 
G
E
 
E
P
 
R
L
 
L
K
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
M
L
 
A
T
 
T
A
 
G
A
 
A
Q
 
R
R
 
H
Q
 
Y
A
 
G
K
 
D
I
 
I
E
 
R
A
 
A
T
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
W
L
 
L
V
 
E
R
 
E
V
 
V
G
 
E
L
 
I
L
 
P
A
 
A
E
 
N
H
x
R
A
 
I
D
 
D
Y
 
D
Y
 
L
P
 
P
H
 
T
M
x
T
I
 
F
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
Q
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
N
L
 
L
I
 
V
L
 
T
G
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
L
L
 
V
V
 
F
C
 
M
D
 
D
E
 
Q
A
 
P
L
 
T
A
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
Q
G
 
A
Q
 
R
I
 
L
L
 
L
N
 
D
F
 
L
L
 
L
L
 
R
D
 
G
E
 
L
Q
 
V
R
 
V
K
 
E
Q
 
L
Q
 
N
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
V
 
V
F
 
I
V
 
V
S
 
T
H
|
H
N
 
D
M
 
L
G
 
G
I
 
V
V
 
A
Q
 
R
H
 
L
I
 
L
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
V
 
L
L
 
L
I
 
V
M
 
M
H
 
K
H
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
S
G
 
G
P
 
L
T
 
T
K
 
D
E
 
R
V
 
V
F
 
L
S
 
D
N
 
D
P
 
P
Q
 
H
H
 
H
E
 
P
V
 
Y
T
 
T
K
 
Q

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
33% identity, 85% coverage: 29:247/258 of query aligns to 41:260/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
A
x
G
V
 
V
A
 
Y
P
 
D
L
 
T
S
 
N
F
 
F
S
 
E
L
 
I
E
 
N
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
T
 
I
L
 
F
A
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
E
 
L
T
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
V
 
L
A
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
N
G
 
R
A
 
L
E
 
I
V
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
G
V
 
K
V
 
I
K
 
F
L
 
I
G
 
D
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
L
 
V
A
 
A
L
 
T
H
 
L
S
 
N
A
 
K
E
 
E
S
 
D
C
 
L
R
 
L
S
 
Q
I
 
V
R
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
M
-
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
-
P
 
-
S
 
N
T
 
F
S
 
G
L
 
L
N
 
F
P
 
P
R
 
H
V
 
R
T
 
T
V
 
I
G
 
L
R
 
E
Q
 
N
L
 
T
E
 
E
E
 
Y
P
 
G
L
 
L
K
 
E
L
 
V
N
 
Q
T
 
N
T
 
-
L
 
V
T
 
P
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
K
K
 
R
I
 
A
E
 
E
A
 
K
T
 
A
L
 
L
V
 
D
R
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
-
E
 
D
H
 
F
A
 
K
D
 
D
Y
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
H
 
K
M
 
Q
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
P
K
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
L
C
 
M
D
|
D
E
|
E
A
 
A
L
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
L
L
 
I
R
 
R
G
 
R
Q
 
E
I
 
M
L
 
Q
N
 
D
F
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
E
 
L
Q
 
Q
R
 
A
K
 
K
Q
 
F
Q
 
Q
L
 
K
G
 
T
Y
 
I
V
 
I
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
N
 
D
M
 
L
G
 
N
I
 
E
V
 
A
Q
 
L
H
 
R
I
 
I
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
L
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
K
H
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
M
E
 
Q
R
 
I
G
 
G
P
 
T
T
 
G
K
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
L
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
H
 
N
E
 
D
V
 
Y
T
 
V
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
33% identity, 85% coverage: 29:247/258 of query aligns to 41:260/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
A
 
G
V
 
V
A
 
Y
P
 
D
L
 
T
S
 
N
F
 
F
S
 
E
L
 
I
E
 
N
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
T
 
I
L
 
F
A
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
E
 
L
T
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
V
 
L
A
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
N
G
 
R
A
 
L
E
 
I
V
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
G
V
 
K
V
 
I
K
 
F
L
 
I
G
 
D
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
L
 
V
A
 
A
L
 
T
H
 
L
S
 
N
A
 
K
E
 
E
S
 
D
C
 
L
R
 
L
S
 
Q
I
 
V
R
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
M
-
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
-
P
 
-
S
 
N
T
 
F
S
 
G
L
 
L
N
 
F
P
 
P
R
 
H
V
 
R
T
 
T
V
 
I
G
 
L
R
 
E
Q
 
N
L
 
T
E
 
E
E
 
Y
P
 
G
L
 
L
K
 
E
L
 
V
N
 
Q
T
 
N
T
 
-
L
 
V
T
 
P
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
K
K
 
R
I
 
A
E
 
E
A
 
K
T
 
A
L
 
L
V
 
D
R
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
-
E
 
D
H
 
F
A
 
K
D
 
D
Y
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
H
 
K
M
 
Q
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
P
K
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
L
C
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
L
L
 
I
R
 
R
G
 
R
Q
 
E
I
 
M
L
 
Q
N
 
D
F
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
E
 
L
Q
 
Q
R
 
A
K
 
K
Q
 
F
Q
 
Q
L
 
K
G
 
T
Y
 
I
V
 
I
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
N
 
D
M
 
L
G
 
N
I
 
E
V
 
A
Q
 
L
H
 
R
I
 
I
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
L
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
K
H
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
M
E
 
Q
R
 
I
G
 
G
P
 
T
T
 
G
K
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
L
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
H
 
N
E
 
D
V
 
Y
T
 
V
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
32% identity, 85% coverage: 29:247/258 of query aligns to 41:260/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
A
 
G
V
 
V
A
 
Y
P
 
D
L
 
T
S
 
N
F
 
F
S
 
E
L
 
I
E
 
N
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
T
 
I
L
 
F
A
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
E
 
L
T
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
A
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
N
G
 
R
A
 
L
E
 
I
V
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
G
V
 
K
V
 
I
K
 
F
L
 
I
G
 
D
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
L
 
V
A
 
A
L
 
T
H
 
L
S
 
N
A
 
K
E
 
E
S
 
D
C
 
L
R
 
L
S
 
Q
I
 
V
R
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
M
-
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
D
 
-
P
 
-
S
 
N
T
 
F
S
 
G
L
 
L
N
 
F
P
 
P
R
 
H
V
 
R
T
 
T
V
 
I
G
 
L
R
 
E
Q
 
N
L
 
T
E
 
E
E
 
Y
P
 
G
L
 
L
K
 
E
L
 
V
N
 
Q
T
 
N
T
 
-
L
 
V
T
 
P
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
K
K
 
R
I
 
A
E
 
E
A
 
K
T
 
A
L
 
L
V
 
D
R
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
-
E
 
D
H
 
F
A
 
K
D
 
D
Y
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
H
x
K
M
x
Q
I
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
N
G
 
D
P
 
P
K
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
L
C
 
M
D
 
D
E
x
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
L
L
 
I
R
 
R
G
 
R
Q
 
E
I
 
M
L
 
Q
N
 
D
F
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
E
 
L
Q
 
Q
R
 
A
K
 
K
Q
 
F
Q
 
Q
L
 
K
G
 
T
Y
 
I
V
 
I
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
|
H
N
 
D
M
 
L
G
 
N
I
 
E
V
 
A
Q
 
L
H
 
R
I
 
I
S
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
I
L
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
K
H
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
V
 
M
E
 
Q
R
 
I
G
 
G
P
 
T
T
 
G
K
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
L
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
H
 
N
E
 
D
V
 
Y
T
 
V
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
31% identity, 96% coverage: 4:250/258 of query aligns to 1:236/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
L
 
I
L
 
I
E
 
R
V
 
I
T
 
R
D
 
N
L
 
L
S
 
H
K
 
K
T
 
W
F
|
F
V
 
-
N
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
G
T
 
P
I
 
L
E
 
H
A
x
V
V
 
L
A
 
K
P
 
G
L
 
I
S
 
H
F
 
L
S
 
E
L
 
V
E
 
A
A
 
P
G
 
G
Q
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
V
I
 
I
C
 
I
G
 
G
E
 
P
T
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
A
 
I
K
 
R
L
 
T
L
 
I
V
 
N
G
 
R
A
 
L
E
 
E
V
 
D
P
 
F
T
 
Q
T
 
E
G
 
G
V
 
E
V
 
V
K
 
V
L
 
V
G
 
-
D
 
-
E
 
D
P
 
G
L
 
L
A
 
S
L
 
V
H
 
K
S
 
D
A
 
D
E
 
R
S
 
A
C
 
L
R
 
R
S
 
E
I
 
I
R
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
V
-
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
-
P
 
-
S
 
Q
T
 
F
S
 
N
L
 
L
N
 
F
P
 
P
R
 
H
V
 
M
T
 
T
V
 
V
G
 
L
R
 
E
Q
 
N
L
 
V
E
 
T
-
 
L
E
 
A
P
 
P
L
 
M
K
 
R
L
 
V
N
 
R
T
 
R
T
 
W
L
 
P
T
 
R
A
 
E
A
 
K
Q
 
A
R
 
E
Q
 
K
A
 
K
K
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
-
T
 
L
L
 
L
V
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
-
E
 
D
H
 
Q
A
 
A
D
 
R
Y
 
K
Y
 
Y
P
 
P
H
 
A
M
 
Q
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
M
G
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
V
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
L
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
E
L
 
M
R
 
V
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
L
 
L
N
 
D
F
 
V
L
 
M
L
 
R
D
 
D
E
 
L
Q
 
A
R
 
-
K
 
Q
Q
 
G
Q
 
G
L
 
M
G
 
T
Y
 
M
V
 
V
F
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
N
 
E
M
 
M
G
 
G
I
 
F
V
 
A
Q
 
R
H
 
E
I
 
V
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
L
 
V
I
 
F
M
 
M
H
 
D
H
 
G
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
E
G
 
G
P
 
R
T
 
P
K
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
S
 
T
N
 
R
P
 
P
Q
 
K
H
 
E
E
 
E
V
 
R
T
 
T
K
 
R
R
 
S
M
 
F
L
 
L

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:241/258 of query aligns to 8:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
N
 
N
R
 
V
R
 
S
G
 
K
L
 
V
F
|
F
K
 
K
R
 
K
E
 
G
T
 
K
I
 
V
E
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
D
P
 
N
L
 
V
S
 
N
F
 
I
S
 
N
L
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
R
L
 
F
A
 
G
I
 
I
C
 
L
G
 
G
E
 
P
T
x
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
F
A
 
M
K
 
R
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
L
E
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
L
K
 
Y
L
 
F
G
 
D
D
 
D
E
 
R
P
 
L
L
 
V
A
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
L
 
L
H
 
I
S
 
V
A
 
P
E
 
P
S
 
E
C
 
D
R
 
R
S
 
K
I
 
I
R
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
D
 
-
P
 
-
S
 
T
T
 
W
S
 
A
L
 
L
N
 
Y
P
 
P
R
 
N
V
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
F
R
 
E
Q
 
N
L
 
I
E
 
A
E
 
F
P
 
P
L
 
L
K
 
T
L
 
-
N
 
N
T
 
M
T
 
K
L
 
M
T
 
S
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
R
 
I
Q
 
R
A
 
K
K
 
R
I
 
V
E
 
E
A
 
-
T
 
E
L
 
V
V
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
L
L
 
D
L
 
I
A
 
H
E
 
H
H
 
V
A
 
L
D
 
N
Y
 
H
Y
 
F
P
 
P
H
 
R
M
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
K
G
 
D
P
 
P
K
 
S
V
 
L
L
 
L
V
 
L
C
 
L
D
 
D
E
|
E
A
 
P
L
 
F
A
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
V
 
A
S
 
R
L
 
M
R
 
R
G
 
D
Q
 
S
I
 
A
L
 
R
N
 
A
F
 
L
L
 
V
L
 
K
D
 
E
E
 
V
Q
 
Q
R
 
S
K
 
R
Q
 
L
Q
 
G
L
 
V
G
 
T
Y
 
L
V
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
S
H
 
H
N
 
D
M
 
P
G
 
A
I
 
D
V
 
I
Q
 
F
H
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
L
 
G
I
 
V
M
 
L
H
 
V
H
 
K
G
 
G
Q
 
K
V
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
V
G
 
G
P
 
K
T
 
P
K
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
Y
S
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:241/258 of query aligns to 8:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
N
 
N
R
 
V
R
 
S
G
 
K
L
 
V
F
|
F
K
 
K
R
 
K
E
 
G
T
 
K
I
 
V
E
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
D
P
 
N
L
 
V
S
 
N
F
 
I
S
 
N
L
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
R
L
 
F
A
 
G
I
 
I
C
 
L
G
 
G
E
 
P
T
x
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
F
A
 
M
K
 
R
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
L
E
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
L
K
 
Y
L
 
F
G
 
D
D
 
D
E
 
R
P
 
L
L
 
V
A
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
L
 
L
H
 
I
S
 
V
A
 
P
E
 
P
S
 
E
C
 
D
R
 
R
S
 
K
I
 
I
R
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
-
P
 
-
S
 
T
T
 
W
S
 
A
L
 
L
N
 
Y
P
 
P
R
 
N
V
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
F
R
 
E
Q
 
N
L
 
I
E
 
A
E
 
F
P
 
P
L
 
L
K
 
T
L
 
-
N
 
N
T
 
M
T
 
K
L
 
M
T
 
S
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
R
 
I
Q
 
R
A
 
K
K
 
R
I
 
V
E
 
E
A
 
-
T
 
E
L
 
V
V
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
L
L
 
D
L
 
I
A
 
H
E
 
H
H
 
V
A
 
L
D
 
N
Y
 
H
Y
 
F
P
 
P
H
 
R
M
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
K
G
 
D
P
 
P
K
 
S
V
 
L
L
 
L
V
 
L
C
 
L
D
 
D
E
|
E
A
 
P
L
 
F
A
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
V
 
A
S
 
R
L
 
M
R
 
R
G
 
D
Q
 
S
I
 
A
L
 
R
N
 
A
F
 
L
L
 
V
L
 
K
D
 
E
E
 
V
Q
 
Q
R
 
S
K
 
R
Q
 
L
Q
 
G
L
 
V
G
 
T
Y
 
L
V
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
S
H
 
H
N
 
D
M
 
P
G
 
A
I
 
D
V
 
I
Q
 
F
H
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
L
 
G
I
 
V
M
 
L
H
 
V
H
 
K
G
 
G
Q
 
K
V
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
V
G
 
G
P
 
K
T
 
P
K
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
Y
S
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:241/258 of query aligns to 8:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
N
 
N
R
 
V
R
 
S
G
 
K
L
 
V
F
|
F
K
 
K
R
 
K
E
 
G
T
 
K
I
 
V
E
 
V
A
|
A
V
 
L
A
 
D
P
 
N
L
 
V
S
 
N
F
 
I
S
 
N
L
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
R
L
 
F
A
 
G
I
 
I
C
 
L
G
 
G
E
 
P
T
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
F
A
 
M
K
 
R
L
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
L
E
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
L
K
 
Y
L
 
F
G
 
D
D
 
D
E
 
R
P
 
L
L
 
V
A
 
A
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
L
 
L
H
 
I
S
 
V
A
 
P
E
 
P
S
 
E
C
 
D
R
 
R
S
 
K
I
 
I
R
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
-
P
 
-
S
 
T
T
 
W
S
 
A
L
 
L
N
 
Y
P
 
P
R
 
N
V
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
F
R
 
E
Q
 
N
L
 
I
E
 
A
E
 
F
P
 
P
L
 
L
K
 
T
L
 
-
N
 
N
T
 
M
T
 
K
L
 
M
T
 
S
A
 
K
A
 
E
Q
 
E
R
 
I
Q
 
R
A
 
K
K
 
R
I
 
V
E
 
E
A
 
-
T
 
E
L
 
V
V
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
L
L
 
D
L
 
I
A
 
H
E
 
H
H
 
V
A
 
L
D
 
N
Y
 
H
Y
 
F
P
 
P
H
 
R
M
 
E
I
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
K
G
 
D
P
 
P
K
 
S
V
 
L
L
 
L
V
 
L
C
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
L
 
F
A
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
V
 
A
S
 
R
L
 
M
R
 
R
G
 
D
Q
 
S
I
 
A
L
 
R
N
 
A
F
 
L
L
 
V
L
 
K
D
 
E
E
 
V
Q
 
Q
R
 
S
K
 
R
Q
 
L
Q
 
G
L
 
V
G
 
T
Y
 
L
V
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
S
H
 
H
N
 
D
M
 
P
G
 
A
I
 
D
V
 
I
Q
 
F
H
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
L
 
G
I
 
V
M
 
L
H
 
V
H
 
K
G
 
G
Q
 
K
V
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
V
G
 
G
P
 
K
T
 
P
K
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
Y
S
 
D
N
 
N
P
 
P

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:241/258 of query aligns to 8:232/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
N
 
N
R
 
V
R
 
S
G
 
K
L
 
V
F
 
F
K
 
K
R
 
K
E
 
G
T
 
K
I
 
V
E
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
D
P
 
N
L
 
V
S
 
N
F
 
I
S
 
N
L
 
I
E
 
E
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
R
L
 
F
A
 
G
I
 
I
C
 
L
G
 
G
E
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
F