SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_156966353.1 NCBI__GCF_000733765.1:WP_156966353.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 86% coverage: 17:268/292 of query aligns to 8:256/265 of P07821

query
sites
P07821
S
 
S
D
 
D
T
 
T
P
 
-
V
 
T
L
 
F
E
 
A
A
 
L
R
 
R
N
 
N
L
 
I
R
 
S
V
 
F
A
 
R
A
 
V
G
 
P
G
 
G
A
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
H
G
 
P
V
 
L
S
 
S
L
 
L
R
 
T
L
 
F
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
K
C
 
V
L
 
T
M
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
K
V
 
M
L
 
L
A
 
G
G
 
R
E
 
H
L
 
Q
K
 
P
P
 
P
G
 
S
Q
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
L
V
 
L
L
 
D
G
 
A
H
 
Q
P
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
S
W
 
W
D
 
S
G
 
S
R
 
K
E
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
R
V
 
K
R
 
V
G
 
A
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
C
 
L
A
 
P
V
 
P
Q
 
A
F
 
E
P
 
G
V
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
R
E
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
A
L
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
Y
-
 
P
-
 
W
-
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
L
T
 
G
T
 
R
L
 
F
R
 
G
G
 
A
D
 
A
A
 
D
R
 
R
A
 
E
R
 
K
V
 
V
R
 
E
A
 
-
E
 
E
L
 
A
L
 
I
D
 
S
W
 
L
L
 
V
E
 
G
V
 
L
A
 
K
H
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
H
R
 
R
I
 
L
Y
 
V
P
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
A
Q
 
W
I
 
I
A
 
A
R
 
M
V
 
L
L
 
V
G
 
A
Q
 
Q
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
D
P
 
S
R
 
R
L
 
C
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
C
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
I
A
 
A
Q
 
H
Q
 
Q
H
 
V
A
 
D
V
 
V
M
 
L
A
 
S
M
 
L
L
 
V
K
 
H
S
 
R
L
 
L
S
 
S
R
 
Q
A
 
E
A
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
T
 
V
S
 
L
H
 
H
D
 
D
L
 
I
G
 
N
L
 
M
A
 
A
A
 
A
T
 
R
Y
 
Y
A
 
C
D
 
D
R
 
Y
V
 
L
A
 
V
L
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
G
G
 
G
R
 
E
I
 
M
I
 
I
T
 
A
D
 
Q
A
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
A
E
 
E
A
 
I
L
 
M
T
 
R
T
 
G
H
 
E
K
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
M
V
 
I
Y
 
Y
D
 
G
L
 
I
Q
 
P
A
 
M
R
 
G
V
 
I
R
 
L
W
 
-
E
 
-
P
 
P
H
 
H
P
 
P
S
 
A

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
35% identity, 83% coverage: 20:261/292 of query aligns to 1:239/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
V
 
I
L
 
I
E
 
R
A
 
I
R
 
R
N
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
K
A
 
W
A
x
F
G
 
G
G
 
P
A
 
L
T
 
H
L
x
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
H
L
 
L
R
 
E
L
 
V
Q
 
A
A
 
P
G
 
G
E
 
E
C
 
K
L
 
L
M
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
I
A
 
N
G
 
R
E
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
G
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
V
L
 
D
G
 
G
H
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
S
A
 
V
W
 
K
D
 
D
G
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
E
V
 
I
R
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
C
 
F
A
 
N
V
 
L
Q
 
-
F
 
F
P
 
P
-
 
H
V
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
E
V
 
N
V
 
V
D
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
P
L
 
M
T
 
R
T
 
V
L
 
R
R
 
R
G
 
W
-
 
P
D
 
R
A
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
E
V
 
K
R
 
K
A
 
A
-
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
W
 
R
L
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
L
H
 
D
L
 
Q
A
 
A
R
 
R
R
 
K
I
 
Y
Y
 
P
P
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
M
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
C
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
E
Q
 
M
Q
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
D
M
 
V
L
 
M
K
 
R
S
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
Q
A
 
-
A
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
T
V
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
T
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
V
L
 
F
M
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
I
 
V
T
 
E
D
 
E
A
 
G
T
 
R
P
 
P
R
 
E
E
 
E
A
 
I
L
 
F
T
 
T
T
 
R
H
 
P
K
 
K
L
 
E
A
 
E
A
 
R
V
 
T
Y
 
R
D
 
S
L
 
F
Q
 
L
A
 
Q
R
 
R
V
 
V

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 82% coverage: 7:244/292 of query aligns to 3:234/378 of P69874

query
sites
P69874
Q
 
Q
V
 
S
Q
 
K
V
 
K
L
 
L
P
 
N
P
 
K
Q
 
Q
V
 
P
A
 
S
S
 
S
D
 
L
T
 
S
P
 
P
V
 
L
L
 
V
E
 
Q
A
 
L
R
 
A
N
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
K
A
x
C
A
x
F
G
 
D
G
 
G
A
 
K
T
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
P
G
 
Q
V
 
L
S
 
D
L
 
L
R
 
T
L
 
I
Q
 
N
A
 
N
G
 
G
E
 
E
C
x
F
L
 
L
M
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
L
|
L
R
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
L
L
 
E
K
 
T
P
 
V
G
 
D
Q
 
S
G
 
G
S
 
R
V
 
I
A
 
M
V
 
-
L
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
L
|
L
D
 
D
A
 
N
W
 
E
D
 
D
G
 
I
R
 
T
E
 
H
L
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
E
A
 
N
R
 
R
V
 
Y
R
 
V
G
 
N
V
 
T
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
C
 
Y
A
 
A
V
 
L
Q
 
-
F
 
F
P
 
P
-
 
H
V
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
E
V
 
N
V
 
V
D
 
A
L
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
R
T
 
M
T
 
Q
L
 
K
R
 
T
G
 
P
D
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
I
R
 
T
V
 
P
R
 
R
A
 
V
-
 
M
E
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
W
 
M
L
x
V
E
 
Q
V
 
L
A
 
E
H
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
I
 
K
Y
 
P
P
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
V
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
V
P
 
N
G
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
C
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
A
 
K
Q
 
L
Q
 
R
H
 
K
A
 
Q
V
 
M
M
 
Q
A
 
N
M
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
A
 
K
A
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
F
T
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
L
T
 
T
Y
 
M
A
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
V
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
E
T
 
Q
D
 
D
A
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4fi3C Structure of vitamin b12 transporter btucd-f in a nucleotide-bound state (see paper)
39% identity, 78% coverage: 34:260/292 of query aligns to 12:234/248 of 4fi3C

query
sites
4fi3C
A
 
S
T
 
T
L
x
R
L
 
L
D
 
G
G
 
P
V
 
L
S
 
S
L
 
G
R
 
E
L
 
V
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
E
C
 
I
L
 
L
M
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
A
V
 
R
L
 
M
A
 
A
G
 
G
E
 
-
L
 
M
K
 
T
P
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
Q
V
 
F
L
 
A
G
 
G
H
 
Q
P
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
A
W
 
W
D
 
S
G
 
A
R
 
T
E
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
L
V
 
H
R
 
R
G
 
A
V
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
|
Q
Q
 
Q
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
F
 
T
P
 
P
V
 
P
T
 
F
A
 
A
A
 
T
E
 
P
V
 
V
V
 
W
D
 
H
L
 
-
G
 
-
L
 
Y
L
 
L
T
 
T
T
 
L
L
 
H
R
 
Q
G
 
H
D
 
D
A
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
K
V
 
T
R
 
R
A
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
G
W
 
A
L
 
L
E
 
A
V
 
L
A
 
D
H
 
D
L
 
K
A
 
L
R
 
G
R
|
R
I
 
S
Y
 
T
P
 
N
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
L
Q
 
Q
V
 
I
-
 
T
-
 
P
W
 
Q
K
 
A
T
 
N
P
 
P
G
 
A
P
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
C
 
P
T
 
M
S
 
C
A
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
H
 
S
A
 
A
V
 
L
M
 
D
A
 
K
M
 
I
L
 
L
K
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
S
R
 
Q
A
 
-
A
 
Q
G
 
G
I
 
L
G
 
A
V
 
I
I
 
V
V
 
M
T
 
S
S
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
G
 
N
L
 
H
A
 
T
A
 
L
T
 
R
Y
 
H
A
 
A
D
 
H
R
 
R
V
 
A
A
 
W
L
 
L
M
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
M
I
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
G
T
 
R
P
 
R
R
 
E
E
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
P
H
 
P
K
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
D
 
G
L
 
M
Q
 
N
A
 
F
R
 
R

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
40% identity, 78% coverage: 19:247/292 of query aligns to 2:229/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
L
E
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
A
L
 
L
R
 
T
V
 
Y
A
 
A
A
x
F
-
 
P
G
 
G
G
 
G
A
x
V
T
 
K
L
x
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
V
 
L
S
 
S
L
 
L
R
 
A
L
 
V
Q
 
P
A
 
K
G
 
G
E
 
E
C
 
S
L
 
L
M
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
L
V
 
H
L
 
L
A
 
N
G
 
G
E
 
T
L
 
L
K
 
R
P
 
P
G
 
Q
Q
 
S
G
 
G
S
 
R
V
 
V
A
 
-
V
 
L
L
 
L
G
 
G
H
 
G
P
 
T
L
 
A
D
 
T
A
 
G
W
 
H
D
 
S
G
 
R
R
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
T
-
 
G
-
 
W
-
 
R
R
 
R
V
 
R
R
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
V
P
 
L
Q
|
Q
Q
 
D
C
 
A
A
 
D
V
 
D
Q
 
Q
-
 
L
F
 
F
P
 
A
V
 
T
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
E
V
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
F
G
 
G
L
 
P
L
 
L
T
 
N
T
 
L
L
 
G
R
 
L
G
 
S
D
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
R
V
 
A
R
 
R
A
 
V
-
 
E
E
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
A
W
 
A
L
 
L
E
 
S
V
 
I
A
 
S
H
 
D
L
 
L
A
 
R
R
 
D
R
 
R
I
 
P
Y
 
T
P
x
H
S
x
M
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
K
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
V
 
A
L
 
V
G
 
A
Q
 
M
V
 
R
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
P
R
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
C
 
P
T
 
T
S
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
L
A
 
A
Q
 
G
Q
 
T
H
 
E
A
 
Q
V
 
L
M
 
L
A
 
T
M
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
L
S
 
-
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
M
G
 
T
V
 
L
I
 
V
V
 
F
T
 
S
S
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
V
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
F
R
 
R
D
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
L
T
 
A
D
 
E
A
 
G
T
 
A
P
 
A
R
 
E
E
 
A
A
 
V
L
 
L
T
 
S

1l7vC Bacterial abc transporter involved in b12 uptake (see paper)
39% identity, 77% coverage: 34:257/292 of query aligns to 12:231/231 of 1l7vC

query
sites
1l7vC
A
 
S
T
 
T
L
 
R
L
 
L
D
 
G
G
 
P
V
 
L
S
 
S
L
 
G
R
 
E
L
 
V
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
E
C
 
I
L
 
L
M
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
A
V
 
R
L
 
M
A
 
A
G
 
G
E
 
-
L
 
M
K
 
T
P
 
S
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
Q
V
 
F
L
 
A
G
 
G
H
 
Q
P
 
P
L
 
L
D
 
E
A
 
A
W
 
W
D
 
S
G
 
A
R
 
T
E
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
L
V
 
H
R
 
R
G
 
A
V
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
F
 
T
P
 
P
V
 
P
T
 
F
A
 
A
A
 
T
E
 
P
V
 
V
V
 
W
D
 
H
L
 
-
G
 
-
L
 
Y
L
 
L
T
 
T
T
 
L
L
 
H
R
 
Q
G
 
H
D
 
D
A
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
K
V
 
T
R
 
R
A
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
G
W
 
A
L
 
L
E
 
A
V
 
L
A
 
D
H
 
D
L
 
K
A
 
L
R
 
G
R
 
R
I
 
S
Y
 
T
P
 
N
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
L
Q
 
Q
V
 
I
-
 
T
-
 
P
W
 
Q
K
 
A
T
 
N
P
 
P
G
 
A
P
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
C
 
P
T
 
M
S
 
N
A
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
H
 
S
A
 
A
V
 
L
M
 
D
A
 
K
M
 
I
L
 
L
K
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
C
R
 
Q
A
 
-
A
 
Q
G
 
G
I
 
L
G
 
A
V
 
I
I
 
V
V
 
M
T
 
S
S
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
G
 
N
L
 
H
A
 
T
A
 
L
T
 
R
Y
 
H
A
 
A
D
 
H
R
 
R
V
 
A
A
 
W
L
 
L
M
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
M
I
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
G
T
 
R
P
 
R
R
 
E
E
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
P
H
 
P
K
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
D
 
G
L
 
M

8y5iA Cryo-em structure of e.Coli spermidine transporter potd-potabc in translocation intermidiate state (see paper)
37% identity, 77% coverage: 20:244/292 of query aligns to 1:219/358 of 8y5iA

query
sites
8y5iA
P
 
P
V
 
L
L
 
V
E
 
Q
A
 
L
R
 
A
N
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
K
A
 
C
A
x
F
G
 
D
G
 
G
A
x
K
T
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
P
G
 
Q
V
 
L
S
 
D
L
 
L
R
 
T
L
 
I
Q
 
N
A
 
N
G
 
G
E
 
E
C
 
F
L
 
L
M
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
C
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
V
L
 
L
R
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
L
L
 
E
K
 
T
P
 
V
G
 
D
Q
 
S
G
 
G
S
 
R
V
 
I
A
 
M
V
 
-
L
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
D
A
 
N
W
 
E
D
 
D
G
 
I
R
 
T
E
 
H
L
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
E
A
 
N
R
 
R
V
 
Y
R
 
V
G
 
N
V
 
T
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
C
 
Y
A
 
A
V
 
L
Q
 
-
F
 
F
P
 
P
-
 
H
V
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
E
V
 
N
V
 
V
D
 
A
L
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
R
T
 
M
T
 
Q
L
 
K
R
 
T
G
 
P
D
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
I
R
 
T
V
 
P
R
 
R
A
 
V
-
 
M
E
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
W
 
M
L
 
V
E
 
Q
V
 
L
A
 
E
H
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
R
|
R
I
 
K
Y
 
P
P
 
H
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
V
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
V
P
 
N
G
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
C
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
A
 
K
Q
 
L
Q
 
R
H
 
K
A
 
Q
V
 
M
M
 
Q
A
 
N
M
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
A
 
K
A
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
F
T
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
G
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
L
T
 
T
Y
 
M
A
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
V
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
E
T
 
Q
D
 
D
A
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
E
 
E

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
34% identity, 68% coverage: 37:236/292 of query aligns to 21:223/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
L
 
L
D
 
K
G
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
L
R
 
N
L
 
I
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
E
 
E
C
 
F
L
 
V
M
 
S
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
R
 
N
V
 
I
L
 
I
A
 
G
G
 
C
E
 
L
L
 
D
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
Y
V
 
I
L
 
D
G
 
N
H
 
I
P
 
K
L
 
T
D
 
N
A
 
D
W
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
V
 
I
R
 
R
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
I
G
 
G
V
 
F
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
C
 
F
A
 
N
V
 
L
Q
 
I
F
 
P
P
 
L
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
L
E
 
E
V
 
N
V
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
P
L
 
L
L
 
I
T
 
F
T
 
K
L
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
A
A
 
M
R
 
S
A
 
G
R
 
E
V
 
E
R
 
R
A
 
R
E
 
K
-
 
R
L
 
A
L
 
L
D
 
E
W
 
C
L
 
L
E
 
K
V
 
M
A
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
E
R
 
E
R
 
R
I
 
F
Y
 
A
-
 
N
-
 
H
-
 
K
-
 
P
P
 
N
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
N
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
N
P
 
P
R
 
P
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
C
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
A
 
K
Q
 
T
Q
 
G
H
 
E
A
 
K
V
 
I
M
 
M
A
 
Q
M
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
K
L
 
L
S
 
N
R
 
E
A
 
E
A
 
D
G
 
G
I
 
K
G
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
I
G
 
N
L
 
V
A
 
-
A
 
A
T
 
R
Y
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
I
L
 
Y
M
 
L
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
33% identity, 68% coverage: 37:236/292 of query aligns to 21:223/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
L
 
L
D
 
K
G
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
L
R
 
N
L
 
I
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
E
 
E
C
 
F
L
 
V
M
 
S
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
R
 
N
V
 
I
L
 
I
A
 
G
G
 
C
E
 
L
L
 
D
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
Y
V
 
I
L
 
D
G
 
N
H
 
I
P
 
K
L
 
T
D
 
N
A
 
D
W
 
L
D
 
D
G
 
D
R
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
V
 
I
R
 
R
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
I
G
 
G
V
 
F
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
C
 
F
A
 
N
V
 
L
Q
 
I
F
 
P
P
 
L
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
L
E
 
E
V
 
N
V
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
P
L
 
L
L
 
I
T
 
F
T
 
K
L
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
A
A
 
M
R
 
S
A
 
G
R
 
E
V
 
E
R
 
R
A
 
R
E
 
K
-
 
R
L
 
A
L
 
L
D
 
E
W
 
C
L
 
L
E
 
K
V
 
M
A
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
E
R
 
E
R
 
R
I
x
F
Y
 
A
-
 
N
-
 
H
-
 
K
-
 
P
P
 
N
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
N
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
N
P
 
P
R
 
P
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
C
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
A
 
K
Q
 
T
Q
 
G
H
 
E
A
 
K
V
 
I
M
 
M
A
 
Q
M
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
K
L
 
L
S
 
N
R
 
E
A
 
E
A
 
D
G
 
G
I
 
K
G
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
I
G
 
N
L
 
V
A
 
-
A
 
A
T
 
R
Y
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
I
L
 
Y
M
 
L
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
35% identity, 75% coverage: 32:250/292 of query aligns to 12:228/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
G
 
G
G
 
S
A
 
L
T
 
E
L
x
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
V
Q
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
E
C
 
V
L
 
V
M
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
I
A
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
K
 
E
P
 
P
G
 
T
Q
 
K
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
F
V
 
I
L
 
D
G
 
G
H
 
V
P
 
K
L
 
I
D
 
N
A
 
-
W
 
-
D
 
N
G
 
G
R
 
K
-
 
V
E
 
N
L
 
I
A
 
N
R
 
K
V
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
C
 
F
A
 
N
V
 
L
Q
 
-
F
 
F
P
 
P
-
 
H
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
I
E
 
E
V
 
N
V
 
I
D
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
P
L
 
V
T
 
K
T
 
V
L
 
K
R
 
K
G
 
M
D
 
N
A
 
K
R
 
K
A
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
E
A
 
A
E
 
E
L
 
E
L
 
L
-
 
A
-
 
V
D
 
D
W
 
L
L
 
L
-
 
A
E
 
K
V
 
V
A
 
G
H
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
K
R
 
K
-
 
D
I
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
-
 
I
S
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
M
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
Q
P
 
P
R
 
E
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
C
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
E
Q
 
M
Q
 
V
H
 
K
A
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
N
M
 
V
L
 
M
K
 
K
S
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
N
A
 
-
A
 
E
G
 
G
I
 
M
G
 
T
V
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
T
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
I
L
 
F
M
 
M
R
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
T
 
E
D
 
E
A
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
E
E
 
E
A
 
I
L
 
F
T
 
Y
T
 
R
H
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
32% identity, 78% coverage: 37:265/292 of query aligns to 21:261/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
L
D
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
H
L
 
V
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
C
 
I
L
 
Y
M
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
C
L
 
V
A
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
D
G
 
G
H
 
Q
P
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
W
 
L
D
 
S
G
 
E
R
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
V
 
A
R
 
R
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
G
 
G
V
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
F
 
F
P
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
S
A
 
S
E
 
R
V
 
T
V
 
V
-
 
F
-
 
G
D
 
N
L
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
P
T
 
L
T
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
N
D
 
T
A
 
P
R
 
K
A
 
D
R
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
R
E
 
R
L
 
V
L
 
T
D
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
L
A
 
V
H
 
G
L
 
L
A
 
G
R
 
D
R
 
K
-
 
H
-
 
D
I
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
-
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
S
G
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
C
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
S
V
 
I
M
 
L
A
 
E
M
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
I
S
 
N
R
 
R
A
 
R
A
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
L
T
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
G
 
D
L
 
V
A
 
V
A
 
K
T
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
I
 
I
T
 
E
D
 
Q
A
 
D
T
 
T
P
 
V
R
 
S
E
 
E
A
 
V
L
 
F
T
 
S
T
 
H
H
 
P
K
 
K
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
K
Y
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
Q
A
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
Q
W
 
A
E
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
31% identity, 77% coverage: 21:244/292 of query aligns to 3:225/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
V
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
M
R
 
R
N
 
D
L
 
V
-
 
V
R
 
K
V
 
K
A
x
Y
A
 
D
G
 
N
G
 
G
A
x
T
T
 
T
L
x
A
L
 
L
D
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
E
 
E
C
 
F
L
 
A
M
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
V
 
S
L
 
L
A
 
Y
G
 
R
E
 
E
L
 
V
K
 
K
P
 
I
G
 
D
Q
 
K
G
 
G
S
 
S
V
 
L
A
 
S
V
 
V
L
 
A
G
 
G
H
 
F
P
 
N
L
 
L
D
 
V
A
 
K
W
 
I
D
 
K
G
 
K
R
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
A
 
R
R
 
R
V
 
S
R
 
V
G
 
G
V
 
V
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
K
Q
 
K
C
 
T
A
 
V
V
 
Y
Q
 
E
F
 
N
P
 
I
V
 
A
T
 
Y
A
 
A
A
 
M
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
G
D
 
E
A
 
N
R
 
R
A
 
R
R
 
N
V
 
I
R
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
V
A
 
M
E
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
D
W
 
L
L
 
V
E
 
G
V
 
L
A
 
K
H
 
H
L
 
K
A
 
V
R
 
R
R
 
S
I
 
F
Y
 
P
P
 
N
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
V
P
 
N
G
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
C
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
D
Q
 
N
Q
 
S
H
 
W
A
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
N
M
 
L
L
 
L
K
 
E
S
 
R
L
 
I
S
 
N
R
 
-
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
I
 
T
G
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
M
T
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
N
L
 
S
G
 
Q
L
 
I
A
 
V
A
 
N
T
 
T
Y
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
I
L
 
A
M
 
I
R
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
V
T
 
R
D
 
D
A
 
E
T
 
S
P
 
K
R
 
G
E
 
E

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
31% identity, 77% coverage: 21:244/292 of query aligns to 3:225/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
V
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
M
R
 
R
N
 
D
L
 
V
-
 
V
R
 
K
V
 
K
A
 
Y
A
 
D
G
 
N
G
 
G
A
 
T
T
 
T
L
 
A
L
 
L
D
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
E
 
E
C
 
F
L
 
A
M
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
V
 
S
L
 
L
A
 
Y
G
 
R
E
 
E
L
 
V
K
 
K
P
 
I
G
 
D
Q
 
K
G
 
G
S
 
S
V
 
L
A
 
S
V
 
V
L
 
A
G
 
G
H
 
F
P
 
N
L
 
L
D
 
V
A
 
K
W
 
I
D
 
K
G
 
K
R
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
A
 
R
R
 
R
V
 
S
R
 
V
G
 
G
V
 
V
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
K
Q
 
K
C
 
T
A
 
V
V
 
Y
Q
 
E
F
 
N
P
 
I
V
 
A
T
 
Y
A
 
A
A
 
M
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
G
D
 
E
A
 
N
R
 
R
A
 
R
R
 
N
V
 
I
R
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
V
A
 
M
E
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
D
W
 
L
L
 
V
E
 
G
V
 
L
A
 
K
H
 
H
L
 
K
A
 
V
R
 
R
R
 
S
I
 
F
Y
 
P
P
 
N
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
V
P
 
N
G
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
D
|
D
E
|
E
C
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
D
Q
 
N
Q
 
S
H
 
W
A
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
N
M
 
L
L
 
L
K
 
E
S
 
R
L
 
I
S
 
N
R
 
-
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
I
 
T
G
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
M
T
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
N
L
 
S
G
 
Q
L
 
I
A
 
V
A
 
N
T
 
T
Y
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
I
L
 
A
M
 
I
R
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
V
T
 
R
D
 
D
A
 
E
T
 
S
P
 
K
R
 
G
E
 
E

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
31% identity, 77% coverage: 21:244/292 of query aligns to 3:225/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
V
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
M
R
 
R
N
 
D
L
 
V
-
 
V
R
 
K
V
 
K
A
x
Y
A
 
D
G
 
N
G
|
G
A
 
T
T
 
T
L
x
A
L
 
L
D
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
S
L
 
V
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
E
 
E
C
 
F
L
 
A
M
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
V
 
S
L
 
L
A
 
Y
G
 
R
E
 
E
L
 
V
K
 
K
P
 
I
G
 
D
Q
 
K
G
 
G
S
 
S
V
 
L
A
 
S
V
 
V
L
 
A
G
 
G
H
 
F
P
 
N
L
 
L
D
 
V
A
 
K
W
 
I
D
 
K
G
 
K
R
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
A
 
R
R
 
R
V
 
S
R
 
V
G
 
G
V
 
V
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
K
Q
 
K
C
 
T
A
 
V
V
 
Y
Q
 
E
F
 
N
P
 
I
V
 
A
T
 
Y
A
 
A
A
 
M
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
G
D
 
E
A
 
N
R
 
R
A
 
R
R
 
N
V
 
I
R
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
V
A
 
M
E
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
D
W
 
L
L
 
V
E
 
G
V
 
L
A
 
K
H
 
H
L
 
K
A
 
V
R
 
R
R
 
S
I
 
F
Y
 
P
P
 
N
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
V
P
 
N
G
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
C
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
D
Q
 
N
Q
 
S
H
 
W
A
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
N
M
 
L
L
 
L
K
 
E
S
 
R
L
 
I
S
 
N
R
 
-
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
I
 
T
G
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
M
T
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
N
L
 
S
G
 
Q
L
 
I
A
 
V
A
 
N
T
 
T
Y
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
I
L
 
A
M
 
I
R
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
V
T
 
R
D
 
D
A
 
E
T
 
S
P
 
K
R
 
G
E
 
E

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
32% identity, 78% coverage: 37:265/292 of query aligns to 22:262/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
L
D
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
H
L
 
V
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
C
 
I
L
 
Y
M
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
C
L
 
V
A
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
D
G
 
G
H
 
Q
P
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
W
 
L
D
 
S
G
 
E
R
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
V
 
A
R
 
R
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
G
 
G
V
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
F
 
F
P
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
S
A
 
S
E
 
R
V
 
T
V
 
V
-
 
F
-
 
G
D
 
N
L
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
P
T
 
L
T
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
N
D
 
T
A
 
P
R
 
K
A
 
D
R
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
R
E
 
R
L
 
V
L
 
T
D
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
L
A
 
V
H
 
G
L
 
L
A
 
G
R
 
D
R
 
K
-
 
H
-
 
D
I
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
-
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
S
G
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
C
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
S
V
 
I
M
 
L
A
 
E
M
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
I
S
 
N
R
 
R
A
 
R
A
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
L
T
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
G
 
D
L
 
V
A
 
V
A
 
K
T
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
I
 
I
T
 
E
D
 
Q
A
 
D
T
 
T
P
 
V
R
 
S
E
 
E
A
 
V
L
 
F
T
 
S
T
 
H
H
 
P
K
 
K
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
K
Y
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
Q
A
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
Q
W
 
A
E
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
32% identity, 78% coverage: 37:265/292 of query aligns to 22:262/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
L
D
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
H
L
 
V
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
C
 
I
L
 
Y
M
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
C
L
 
V
A
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
D
G
 
G
H
 
Q
P
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
W
 
L
D
 
S
G
 
E
R
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
V
 
A
R
 
R
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
G
 
G
V
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
F
 
F
P
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
S
A
 
S
E
 
R
V
 
T
V
 
V
-
 
F
-
 
G
D
 
N
L
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
P
T
 
L
T
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
N
D
 
T
A
 
P
R
 
K
A
 
D
R
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
R
E
 
R
L
 
V
L
 
T
D
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
L
A
 
V
H
 
G
L
 
L
A
 
G
R
 
D
R
 
K
-
 
H
-
 
D
I
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
-
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
S
G
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
C
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
S
V
 
I
M
 
L
A
 
E
M
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
I
S
 
N
R
 
R
A
 
R
A
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
L
T
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
G
 
D
L
 
V
A
 
V
A
 
K
T
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
I
 
I
T
 
E
D
 
Q
A
 
D
T
 
T
P
 
V
R
 
S
E
 
E
A
 
V
L
 
F
T
 
S
T
 
H
H
 
P
K
 
K
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
K
Y
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
Q
A
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
Q
W
 
A
E
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
32% identity, 78% coverage: 37:265/292 of query aligns to 22:262/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
L
D
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
H
L
 
V
Q
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
C
 
I
L
 
Y
M
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
C
L
 
V
A
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
D
G
 
G
H
 
Q
P
 
E
L
 
L
D
 
T
A
 
T
W
 
L
D
 
S
G
 
E
R
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
V
 
A
R
 
R
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
G
 
G
V
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
F
 
F
P
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
S
A
 
S
E
 
R
V
 
T
V
 
V
-
 
F
-
 
G
D
 
N
L
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
P
T
 
L
T
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
N
D
 
T
A
 
P
R
 
K
A
 
D
R
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
R
E
 
R
L
 
V
L
 
T
D
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
L
A
 
V
H
 
G
L
 
L
A
 
G
R
 
D
R
 
K
-
 
H
-
 
D
I
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
S
-
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
-
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
S
G
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
C
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
Q
 
T
H
 
R
A
 
S
V
 
I
M
 
L
A
 
E
M
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
I
S
 
N
R
 
R
A
 
R
A
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
L
T
 
I
S
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
G
 
D
L
 
V
A
 
V
A
 
K
T
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
I
 
I
T
 
E
D
 
Q
A
 
D
T
 
T
P
 
V
R
 
S
E
 
E
A
 
V
L
 
F
T
 
S
T
 
H
H
 
P
K
 
K
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
K
Y
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
E
D
 
D
L
 
Y
Q
 
Q
A
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
Q
W
 
A
E
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
32% identity, 77% coverage: 21:246/292 of query aligns to 3:226/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
V
 
M
L
 
I
E
 
D
A
 
V
R
 
H
N
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
K
A
 
S
A
x
F
G
 
G
G
 
S
A
 
L
T
 
E
L
x
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
R
 
H
L
 
I
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
E
 
E
C
 
V
L
 
V
M
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
L
A
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
G
 
D
Q
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
I
V
 
I
L
 
D
G
 
G
H
 
I
P
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
W
 
K
D
 
D
G
 
T
R
 
N
E
 
-
L
 
L
A
 
N
R
 
K
V
 
V
R
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
F
A
 
N
V
 
L
Q
 
-
F
 
F
P
 
P
-
 
H
V
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
N
V
 
N
V
 
I
D
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
P
L
 
M
T
 
-
T
 
K
L
 
V
R
 
R
G
 
K
D
 
W
A
 
P
R
 
R
A
 
E
R
 
K
V
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
K
L
 
A
L
 
M
D
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
D
V
 
K
A
 
V
H
 
G
L
 
L
A
 
K
R
 
D
R
 
K
-
 
A
-
 
H
I
 
A
Y
 
Y
P
 
P
-
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
M
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
C
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
E
Q
 
M
Q
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
M
K
 
K
S
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
N
A
 
-
A
 
E
G
 
G
I
 
M
G
 
T
V
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
T
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
L
L
 
F
M
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
I
 
I
T
 
E
D
 
E
A
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
E
E
 
D
A
 
L
L
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
32% identity, 77% coverage: 21:246/292 of query aligns to 3:226/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
V
 
M
L
 
I
E
 
D
A
 
V
R
 
H
N
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
K
A
 
S
A
x
F
G
 
G
G
 
S
A
 
L
T
 
E
L
x
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
R
 
H
L
 
I
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
E
 
E
C
 
V
L
 
V
M
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
L
A
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
G
 
D
Q
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
I
V
 
I
L
 
D
G
 
G
H
 
I
P
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
W
 
K
D
 
D
G
 
T
R
 
N
E
 
-
L
 
L
A
 
N
R
 
K
V
 
V
R
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
F
A
 
N
V
 
L
Q
 
-
F
 
F
P
 
P
-
 
H
V
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
N
V
 
N
V
 
I
D
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
P
L
 
M
T
 
-
T
 
K
L
 
V
R
 
R
G
 
K
D
 
W
A
 
P
R
 
R
A
 
E
R
 
K
V
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
K
L
 
A
L
 
M
D
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
D
V
 
K
A
 
V
H
 
G
L
 
L
A
 
K
R
 
D
R
 
K
-
 
A
-
 
H
I
 
A
Y
 
Y
P
 
P
-
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
M
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
C
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
E
Q
 
M
Q
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
M
K
 
K
S
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
N
A
 
-
A
 
E
G
 
G
I
 
M
G
 
T
V
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
T
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
L
L
 
F
M
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
I
 
I
T
 
E
D
 
E
A
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
E
E
 
D
A
 
L
L
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
32% identity, 77% coverage: 21:246/292 of query aligns to 3:226/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
V
 
M
L
 
I
E
 
D
A
 
V
R
 
H
N
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
K
A
 
S
A
x
F
G
 
G
G
 
S
A
 
L
T
 
E
L
x
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
R
 
H
L
 
I
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
E
 
E
C
 
V
L
 
V
M
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
L
A
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
G
 
D
Q
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
I
V
 
I
L
 
D
G
 
G
H
 
I
P
 
N
L
 
L
D
 
K
A
 
A
W
 
K
D
 
D
G
 
T
R
 
N
E
 
-
L
 
L
A
 
N
R
 
K
V
 
V
R
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
C
 
F
A
 
N
V
 
L
Q
 
-
F
 
F
P
 
P
-
 
H
V
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
N
V
 
N
V
 
I
D
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
P
L
 
M
T
 
-
T
 
K
L
 
V
R
 
R
G
 
K
D
 
W
A
 
P
R
 
R
A
 
E
R
 
K
V
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
K
L
 
A
L
 
M
D
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
D
V
 
K
A
 
V
H
 
G
L
 
L
A
 
K
R
 
D
R
 
K
-
 
A
-
 
H
I
 
A
Y
 
Y
P
 
P
-
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
M
V
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
C
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
E
Q
 
M
Q
 
V
H
 
G
A
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
S
M
 
V
L
 
M
K
 
K
S
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
N
A
 
-
A
 
E
G
 
G
I
 
M
G
 
T
V
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
T
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
L
L
 
F
M
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
I
 
I
T
 
E
D
 
E
A
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
E
E
 
D
A
 
L
L
 
F

Query Sequence

>WP_156966353.1 NCBI__GCF_000733765.1:WP_156966353.1
MMDGLPQVQVLPPQVASDTPVLEARNLRVAAGGATLLDGVSLRLQAGECLMLLGPNGAGK
STLLRVLAGELKPGQGSVAVLGHPLDAWDGRELARVRGVLPQQCAVQFPVTAAEVVDLGL
LTTLRGDARARVRAELLDWLEVAHLARRIYPSLSGGEQQRVQIARVLGQVWKTPGPRLLL
LDECTSALDPAQQHAVMAMLKSLSRAAGIGVIVTSHDLGLAATYADRVALMRDGRIITDA
TPREALTTHKLAAVYDLQARVRWEPHPSVEIQGALNTRNPTPPPTLETTNTP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory