SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_157362518.1 NCBI__GCF_000504245.1:WP_157362518.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8gy3B Cryo-em structure of membrane-bound aldehyde dehydrogenase from gluconobacter oxydans
53% identity, 65% coverage: 2:128/194 of query aligns to 21:148/154 of 8gy3B

query
sites
8gy3B
P
 
P
L
 
L
L
 
L
W
 
W
V
 
V
L
 
I
R
 
R
D
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
N
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
T
K
 
K
Y
 
F
G
|
G
C
|
C
G
|
G
V
 
I
G
|
G
L
 
E
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
H
L
 
V
N
 
G
G
 
G
N
 
R
E
 
A
I
 
T
Q
 
R
P
 
S
C
|
C
V
 
I
V
 
T
P
 
P
V
 
L
S
 
S
E
 
A
C
 
V
D
 
E
G
 
G
Q
 
A
E
 
S
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
-
D
 
D
G
 
P
D
 
A
E
 
G
L
 
N
H
 
H
P
 
V
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
V
A
 
A
W
 
W
V
 
R
D
 
D
A
 
Q
D
 
Q
V
 
V
G
 
P
Q
|
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
Q
|
Q
P
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
M
 
M
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
R
 
D
K
 
Y
S
 
P
K
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
D
A
 
D
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
E
 
M
-
 
G
-
 
G
N
 
S
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
M
T
 
T
Y
 
Y
P
 
I
R
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
I
 
A
A
 
A

5y6qA Crystal structure of an aldehyde oxidase from methylobacillus sp. Ky4400 (see paper)
45% identity, 66% coverage: 1:129/194 of query aligns to 22:153/157 of 5y6qA

query
sites
5y6qA
M
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
L
W
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
H
L
 
L
G
 
N
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
T
K
 
K
Y
 
K
G
|
G
C
|
C
G
x
D
V
 
Q
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
Q
E
 
R
I
 
V
Q
 
L
P
 
S
C
|
C
V
 
L
V
 
T
P
 
L
V
 
A
S
 
A
E
 
Q
C
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
Q
D
 
S
G
 
A
D
 
S
-
 
G
E
 
E
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
C
W
 
F
V
 
V
D
 
E
A
 
N
D
 
D
V
 
A
G
 
F
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
M
 
M
A
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
C
L
 
I
Q
 
K
R
 
E
K
 
G
S
 
H
K
 
A
P
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
D
D
 
E
I
 
I
D
 
R
A
 
E
I
 
Y
E
 
M
-
 
S
-
 
G
N
 
N
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
G
T
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
H
L
 
I
R
 
I
A
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
Q
I
 
A
A
 
A
G
 
A

4zohC Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
45% identity, 65% coverage: 3:128/194 of query aligns to 31:157/161 of 4zohC

query
sites
4zohC
L
 
L
L
 
V
W
 
H
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
-
L
 
L
G
 
G
I
 
F
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
H
Y
 
I
G
 
G
C
|
C
G
 
D
V
 
T
G
x
S
L
 
N
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
I
L
 
M
N
 
N
G
 
G
N
 
K
E
 
S
I
 
V
Q
 
K
P
 
S
C
|
C
V
 
T
V
 
V
P
 
L
V
 
A
S
 
V
E
 
E
C
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
K
G
 
D
D
 
G
E
 
K
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
W
 
F
V
 
W
D
 
E
A
 
N
D
 
H
V
 
A
G
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
W
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
K
 
K
S
 
P
K
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
E
A
 
E
D
 
E
I
 
I
-
 
R
D
 
E
A
 
G
I
 
I
E
 
S
-
 
G
N
 
N
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
R
 
N
L
 
I
R
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
A
I
 
A
A
 
A

4usaA Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with trans-cinnamaldehyde (see paper)
39% identity, 79% coverage: 6:158/194 of query aligns to 26:174/907 of 4usaA

query
sites
4usaA
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
K
Y
x
V
G
 
G
C
|
C
G
x
E
V
 
Q
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
x
R
P
 
A
C
|
C
V
 
V
V
 
T
P
 
K
V
 
M
S
 
K
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
D
 
E
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
V
 
V
D
 
L
A
 
H
D
 
G
V
 
G
G
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
T
K
 
N
S
 
A
K
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
R
N
 
N
M
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
T
P
 
D
P
 
L
E
 
E
G
 
F
K
 
K
P
 
M
P
 
P
N
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4us9A Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with 3- phenylpropionaldehyde (see paper)
39% identity, 79% coverage: 6:158/194 of query aligns to 26:174/907 of 4us9A

query
sites
4us9A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
K
Y
x
V
G
 
G
C
|
C
G
x
E
V
 
Q
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
x
R
P
 
A
C
|
C
V
 
V
V
 
T
P
 
K
V
 
M
S
 
K
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
D
 
E
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
V
 
V
D
 
L
A
 
H
D
 
G
V
 
G
G
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
T
K
 
N
S
 
A
K
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
R
N
 
N
M
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
T
P
 
D
P
 
L
E
 
E
G
 
F
K
 
K
P
 
M
P
 
P
N
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4us8A Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with benzaldehyde (see paper)
39% identity, 79% coverage: 6:158/194 of query aligns to 26:174/907 of 4us8A

query
sites
4us8A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
K
Y
x
V
G
 
G
C
|
C
G
x
E
V
 
Q
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
x
R
P
 
A
C
|
C
V
 
V
V
 
T
P
 
K
V
 
M
S
 
K
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
D
 
E
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
V
 
V
D
 
L
A
 
H
D
 
G
V
 
G
G
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
T
K
 
N
S
 
A
K
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
R
N
 
N
M
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
T
P
 
D
P
 
L
E
 
E
G
 
F
K
 
K
P
 
M
P
 
P
N
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4c7yA Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with sodium dithionite and sodium sulfide (see paper)
39% identity, 79% coverage: 6:158/194 of query aligns to 26:174/907 of 4c7yA

query
sites
4c7yA
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
K
Y
 
V
G
 
G
C
|
C
G
x
E
V
 
Q
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
x
R
P
 
A
C
|
C
V
 
V
V
 
T
P
 
K
V
 
M
S
 
K
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
D
 
E
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
V
 
V
D
 
L
A
 
H
D
 
G
V
 
G
G
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
T
K
 
N
S
 
A
K
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
R
N
 
N
M
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
T
P
 
D
P
 
L
E
 
E
G
 
F
K
 
K
P
 
M
P
 
P
N
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3fc4A Ethylene glycol inhibited form of aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (see paper)
39% identity, 79% coverage: 6:158/194 of query aligns to 26:174/907 of 3fc4A

query
sites
3fc4A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
K
Y
x
V
G
 
G
C
|
C
G
x
E
V
 
Q
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
x
R
P
 
A
C
|
C
V
 
V
V
 
T
P
 
K
V
 
M
S
 
K
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
D
 
E
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
V
 
V
D
 
L
A
 
H
D
 
G
V
 
G
G
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
T
K
 
N
S
 
A
K
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
R
N
 
N
M
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
T
P
 
D
P
 
L
E
 
E
G
 
F
K
 
K
P
 
M
P
 
P
N
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3fahA Glycerol inhibited form of aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (see paper)
39% identity, 79% coverage: 6:158/194 of query aligns to 26:174/907 of 3fahA

query
sites
3fahA
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
K
Y
x
V
G
 
G
C
|
C
G
x
E
V
 
Q
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
x
R
P
 
A
C
|
C
V
 
V
V
 
T
P
 
K
V
 
M
S
 
K
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
D
 
E
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
V
 
V
D
 
L
A
 
H
D
 
G
V
 
G
G
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
T
K
 
N
S
 
A
K
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
R
N
 
N
M
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
T
P
 
D
P
 
L
E
 
E
G
 
F
K
 
K
P
 
M
P
 
P
N
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1sijA Crystal structure of the aldehyde dehydrogenase (a.K.A. Aor or mop) of desulfovibrio gigas covalently bound to [aso3]- (see paper)
39% identity, 79% coverage: 6:158/194 of query aligns to 26:174/907 of 1sijA

query
sites
1sijA
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
K
Y
x
V
G
 
G
C
|
C
G
x
E
V
 
Q
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
x
R
P
 
A
C
|
C
V
 
V
V
 
T
P
 
K
V
 
M
S
 
K
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
D
 
E
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
V
 
V
D
 
L
A
 
H
D
 
G
V
 
G
G
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
T
K
 
N
S
 
A
K
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
R
N
 
N
M
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
T
P
 
D
P
 
L
E
 
E
G
 
F
K
 
K
P
 
M
P
 
P
N
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q46509 Aldehyde oxidoreductase; Molybdenum iron sulfur protein; EC 1.2.99.7 from Megalodesulfovibrio gigas (Desulfovibrio gigas) (see paper)
39% identity, 79% coverage: 6:158/194 of query aligns to 26:174/907 of Q46509

query
sites
Q46509
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
K
 
K
Y
 
V
G
 
G
C
|
C
G
 
E
V
 
Q
G
 
G
L
 
Q
C
|
C
R
 
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
 
R
P
 
A
C
|
C
V
 
V
V
 
T
P
 
K
V
 
M
S
 
K
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
D
 
E
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
V
 
V
D
 
L
A
 
H
D
 
G
V
 
G
G
 
A
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
T
K
 
N
S
 
A
K
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
R
N
 
N
M
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
I
T
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
K
P
 
P
K
 
E
G
 
T
P
 
D
P
 
L
E
 
E
G
 
F
K
 
K
P
 
M
P
 
P
N
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R

1dgjA Crystal structure of the aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio desulfuricans atcc 27774 (see paper)
41% identity, 66% coverage: 3:130/194 of query aligns to 23:155/906 of 1dgjA

query
sites
1dgjA
L
 
L
L
 
V
W
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
S
K
 
Q
L
 
L
G
 
Q
I
 
L
T
 
T
G
 
S
P
 
V
K
 
K
Y
x
V
G
|
G
C
|
C
G
|
G
V
 
K
G
|
G
L
x
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
V
I
 
V
Q
x
R
P
 
A
C
|
C
V
 
I
V
 
I
P
 
K
V
 
M
S
 
S
E
 
R
C
 
V
-
 
A
D
 
E
G
 
N
Q
 
A
E
 
S
V
 
V
T
 
T
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
I
A
 
G
D
 
A
G
 
P
D
 
D
E
 
C
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
H
A
 
A
W
 
W
V
 
I
D
 
Q
A
 
H
D
 
G
V
 
A
G
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
E
K
 
N
S
 
V
K
 
A
P
 
P
T
 
S
D
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
F
D
 
Q
A
 
K
I
 
H
E
 
H
N
 
N
M
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
M
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1ffuD Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
39% identity, 65% coverage: 3:128/194 of query aligns to 24:151/156 of 1ffuD

query
sites
1ffuD
L
 
L
L
 
I
W
 
H
V
 
F
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
E
L
 
L
G
 
N
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
A
K
 
H
Y
 
I
G
 
G
C
|
C
G
 
E
V
 
T
G
x
S
L
x
H
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
D
L
 
I
N
 
D
G
 
G
N
 
R
E
 
S
I
 
V
Q
 
K
P
 
S
C
|
C
V
 
T
V
 
H
P
 
L
V
 
A
S
 
V
E
 
Q
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
N
G
 
K
D
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
A
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
G
W
 
F
V
 
Y
D
 
K
A
 
E
D
 
H
V
 
G
G
 
L
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
L
M
 
M
A
 
R
A
 
A
V
 
Y
A
 
R
L
 
F
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
K
 
N
S
 
P
K
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
E
A
 
A
D
 
E
I
 
I
D
 
R
-
 
M
-
 
G
A
 
M
I
 
T
E
 
G
N
 
N
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
R
 
N
L
 
I
R
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
V
K
 
Q
E
 
Y
I
 
A
A
 
A

1ffvA Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava (see paper)
39% identity, 65% coverage: 3:128/194 of query aligns to 23:150/155 of 1ffvA

query
sites
1ffvA
L
 
L
L
 
I
W
 
H
V
 
F
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
E
L
 
L
G
 
N
I
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
A
K
 
H
Y
x
I
G
 
G
C
|
C
G
 
E
V
 
T
G
x
S
L
 
H
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
D
L
 
I
N
 
D
G
 
G
N
 
R
E
 
S
I
 
V
Q
 
K
P
 
S
C
|
C
V
 
T
V
 
H
P
 
L
V
 
A
S
 
V
E
 
Q
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
N
G
 
K
D
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
A
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
G
W
 
F
V
 
Y
D
 
K
A
 
E
D
 
H
V
 
G
G
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
L
M
 
M
A
 
R
A
 
A
V
 
Y
A
 
R
L
 
F
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
K
 
N
S
 
P
K
 
N
P
 
P
T
 
T
D
 
E
A
 
A
D
 
E
I
 
I
D
 
R
-
 
M
-
 
G
A
 
M
I
 
T
E
 
G
N
 
N
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
R
 
N
L
 
I
R
 
V
A
 
K
A
 
A
I
 
V
K
 
Q
E
 
Y
I
 
A
A
 
A

P77165 Aldehyde oxidoreductase iron-sulfur-binding subunit PaoA; EC 1.2.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
38% identity, 65% coverage: 3:129/194 of query aligns to 82:225/229 of P77165

query
sites
P77165
L
 
L
L
 
L
W
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
N
L
 
L
G
 
H
I
 
L
T
 
I
G
 
G
P
 
T
K
 
K
Y
 
K
G
 
G
C
|
C
G
 
D
V
 
H
G
 
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
R
E
 
R
I
 
L
Q
 
N
P
 
A
C
|
C
V
 
L
V
 
T
P
 
L
V
 
A
S
 
V
E
 
M
C
 
H
D
 
Q
G
 
G
Q
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
G
D
 
S
G
 
P
D
 
D
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
A
W
 
F
V
 
I
D
 
K
A
 
H
D
 
D
V
 
G
G
 
F
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
Q
 
T
P
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
M
 
C
A
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
R
 
E
K
 
I
S
 
Q
K
 
D
-
 
G
-
 
I
P
 
P
T
 
S
D
 
H
A
 
V
D
 
T
I
 
V
D
 
D
A
 
L
I
 
V
E
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
S
-
 
G
N
 
N
M
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
G
T
 
A
Y
 
Y
P
 
A
R
 
N
L
 
I
R
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
G

5g5gA Escherichia coli periplasmic aldehyde oxidase (see paper)
38% identity, 65% coverage: 3:129/194 of query aligns to 31:174/175 of 5g5gA

query
sites
5g5gA
L
 
L
L
 
L
W
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
N
L
 
L
G
 
H
I
 
L
T
 
I
G
 
G
P
 
T
K
 
K
Y
 
K
G
|
G
C
|
C
G
x
D
V
 
H
G
|
G
L
 
Q
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
R
E
 
R
I
 
L
Q
 
N
P
 
A
C
|
C
V
 
L
V
 
T
P
 
L
V
 
A
S
 
V
E
 
M
C
 
H
D
 
Q
G
 
G
Q
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
G
D
 
S
G
 
P
D
 
D
E
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
A
W
 
F
V
 
I
D
 
K
A
 
H
D
 
D
V
 
G
G
 
F
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
Q
 
T
P
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
M
 
C
A
 
S
A
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
R
 
E
K
 
I
S
 
Q
K
 
D
-
 
G
-
 
I
P
 
P
T
 
S
D
 
H
A
 
V
D
 
T
I
 
V
D
 
D
A
 
L
I
 
V
E
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
S
-
 
G
N
 
N
M
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
G
T
 
A
Y
 
Y
P
 
A
R
 
N
L
 
I
R
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
E
E
 
D
I
 
A
A
 
A
G
 
G

3hrdD Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
38% identity, 63% coverage: 3:125/194 of query aligns to 25:149/160 of 3hrdD

query
sites
3hrdD
L
 
L
L
 
L
W
 
D
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
D
L
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
S
P
 
V
K
 
K
Y
x
E
G
 
G
C
|
C
G
x
S
V
x
E
G
|
G
L
x
E
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
I
L
 
F
N
 
N
G
 
G
N
 
D
E
 
P
I
 
V
Q
 
T
P
 
T
C
|
C
V
 
C
V
 
M
P
 
L
V
 
A
S
 
G
E
 
Q
C
 
A
D
 
D
G
 
E
Q
 
S
E
 
T
V
 
I
T
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
A
D
 
E
G
 
D
D
 
G
E
 
K
L
 
P
H
 
S
P
 
L
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
W
 
F
V
 
L
D
 
E
A
 
A
D
 
G
V
 
A
G
 
V
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
I
M
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
K
K
 
N
S
 
P
K
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
D
A
 
E
D
 
E
I
 
I
D
 
T
A
 
V
I
 
A
E
 
M
-
 
S
-
 
G
N
 
N
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
I
R
 
K
L
 
I
R
 
H
A
 
A
A
 
A
I
 
V
K
 
R

Q0QLF3 Nicotinate dehydrogenase small FeS subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase small FeS subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see paper)
38% identity, 63% coverage: 3:125/194 of query aligns to 25:149/157 of Q0QLF3

query
sites
Q0QLF3
L
 
L
L
 
L
W
 
D
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
D
L
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
S
P
 
V
K
 
K
Y
 
E
G
 
G
C
|
C
G
 
S
V
 
E
G
 
G
L
 
E
C
|
C
R
 
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
I
L
 
F
N
 
N
G
 
G
N
 
D
E
 
P
I
 
V
Q
 
T
P
 
T
C
|
C
V
 
C
V
 
M
P
 
L
V
 
A
S
 
G
E
 
Q
C
 
A
D
 
D
G
 
E
Q
 
S
E
 
T
V
 
I
T
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
A
 
A
D
 
E
G
 
D
D
 
G
E
 
K
L
 
P
H
 
S
P
 
L
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
C
W
 
F
V
 
L
D
 
E
A
 
A
D
 
G
V
 
A
G
 
V
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
I
M
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
K
K
 
N
S
 
P
K
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
D
A
 
E
D
 
E
I
 
I
D
 
T
A
 
V
I
 
A
E
 
M
-
 
S
-
 
G
N
 
N
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
I
R
 
K
L
 
I
R
 
H
A
 
A
A
 
A
I
 
V
K
 
R

2e3tA Crystal structure of rat xanthine oxidoreductase mutant (w335a and f336l) (see paper)
34% identity, 74% coverage: 3:145/194 of query aligns to 24:175/1291 of 2e3tA

query
sites
2e3tA
L
 
L
L
 
L
W
 
V
V
 
Y
L
 
L
R
 
R
D
 
R
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
C
G
 
G
P
 
T
K
 
K
Y
 
L
G
|
G
C
|
C
G
|
G
V
 
E
G
|
G
L
 
G
C
|
C
R
x
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
M
L
 
I
N
 
S
G
 
K
N
 
Y
E
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
H
-
 
F
-
 
S
I
 
V
Q
x
N
P
 
A
C
|
C
V
 
L
V
 
A
P
 
P
V
 
I
S
 
C
E
 
S
C
 
L
D
 
H
G
 
H
Q
 
V
E
 
A
V
 
V
T
 
T
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
I
A
 
G
D
 
N
G
 
T
D
 
Q
E
 
K
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
R
W
 
I
V
 
A
D
 
R
A
 
S
D
 
H
V
 
G
G
 
S
Q
|
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
I
I
 
V
M
 
M
A
 
S
A
 
M
V
 
Y
A
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
N
K
 
Q
S
 
P
K
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
V
A
 
E
D
 
E
I
 
I
-
 
E
D
 
N
A
 
A
I
 
F
E
 
Q
-
 
G
N
 
N
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y
P
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
A
 
P
A
 
I
I
 
L
K
 
Q
E
 
G
I
 
F
A
 
R
G
 
T
I
 
F
P
 
A
T
 
K
D
 
D
P
 
S
P
 
P
G
 
S
N
 
L
G
 
F
E
 
N
P
 
P
P
 
E
K
 
D
G
 
F
P
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P22985 Xanthine dehydrogenase/oxidase; EC 1.17.1.4; EC 1.17.3.2 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
38% identity, 59% coverage: 3:117/194 of query aligns to 26:152/1331 of P22985

query
sites
P22985
L
 
L
L
 
L
W
 
V
V
 
Y
L
 
L
R
 
R
D
 
R
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
C
G
 
G
P
 
T
K
 
K
Y
 
L
G
 
G
C
|
C
G
 
G
V
 
E
G
 
G
L
 
G
C
|
C
R
 
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
S
 
V
H
 
M
L
 
I
N
 
S
G
 
K
N
 
Y
E
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
H
-
 
F
-
 
S
I
 
V
Q
 
N
P
 
A
C
|
C
V
 
L
V
 
A
P
 
P
V
 
I
S
 
C
E
 
S
C
 
L
D
 
H
G
 
H
Q
 
V
E
 
A
V
 
V
T
 
T
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
I
A
 
G
D
 
N
G
 
T
D
 
Q
E
 
K
L
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
R
W
 
I
V
 
A
D
 
R
A
 
S
D
 
H
V
 
G
G
 
S
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
F
C
|
C
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
I
I
 
V
M
 
M
A
 
S
A
 
M
V
 
Y
A
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
N
K
 
Q
S
 
P
K
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
V
A
 
E
D
 
E
I
 
I
-
 
E
D
 
N
A
 
A
I
 
F
E
 
Q
-
 
G
N
 
N
M
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
T
 
G
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_157362518.1 NCBI__GCF_000504245.1:WP_157362518.1
MPLLWVLRDKLGITGPKYGCGVGLCRACTSHLNGNEIQPCVVPVSECDGQEVTTIEGLAD
GDELHPVQQAWVDADVGQCGFCQPGQIMAAVALLQRKSKPTDADIDAIENMCRCGTYPRL
RAAIKEIAGIPTDPPGNGEPPKGPPEGKPPNGKGPDGRPGKQPQQGGDSSSAEGEQSGDE
KSGSLFDGIKSAFG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory