SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_157619628.1 NCBI__GCF_000576635.1:WP_157619628.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
44% identity, 92% coverage: 19:317/325 of query aligns to 3:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
V
 
V
Y
 
L
V
 
V
L
 
A
D
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
H
P
 
E
S
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
T
 
V
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
S
 
A
-
 
G
C
 
L
D
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
Y
H
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
P
D
 
D
D
 
E
K
 
D
R
 
R
K
 
L
G
 
V
R
 
E
W
 
L
L
 
V
E
 
K
D
 
D
A
 
V
D
 
E
G
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
S
 
K
-
 
P
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
R
D
 
R
M
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
A
Q
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
E
V
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
S
 
S
N
 
R
A
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
M
L
 
F
A
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
F
L
 
A
D
 
D
R
 
R
M
 
K
L
 
M
R
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
V
V
 
W
T
 
A
S
 
K
P
 
K
P
 
E
P
 
A
Q
 
M
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
|
G
M
x
F
G
|
G
G
x
R
V
x
I
G
 
G
R
 
Y
R
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
F
 
A
K
 
N
A
 
A
A
 
-
F
 
L
G
 
G
S
 
M
T
 
N
I
 
I
L
 
L
A
 
L
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
Y
A
 
-
P
 
P
P
 
N
E
 
E
A
 
E
F
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
E
D
 
V
A
 
N
E
 
G
R
 
K
C
 
F
A
 
V
S
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
K
R
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
T
 
T
L
 
I
H
 
H
I
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
V
R
 
E
D
 
S
T
|
T
E
 
Y
K
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
N
A
 
E
R
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
R
 
K
D
 
T
A
 
A
M
 
I
V
 
L
L
 
I
N
 
N
L
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
T
 
N
A
 
A
L
 
L
H
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
V
 
E
Q
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
L
P
 
P
A
 
K
G
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
T
R
 
K
L
 
F
P
 
D
G
 
N
F
 
V
V
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
V
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
E
R
 
R
M
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
E
G
 
K
V
 
V
V
 
V
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
K
G
 
G

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
39% identity, 82% coverage: 51:317/325 of query aligns to 41:305/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
A
 
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
I
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
|
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G
M
 
E
G
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
V
G
 
Q
V
 
F
V
 
V
T
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
K
G
 
G

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 40:291/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
G
x
R
V
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
A
x
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
I
x
T
P
 
P
L
 
L
N
x
L
R
 
P
D
 
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 39:290/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
x
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
A
x
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
I
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
|
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 41:292/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
|
G
M
 
L
G
 
G
G
x
R
V
x
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
A
 
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
I
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
|
T
E
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 40:291/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
x
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
A
x
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
I
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
|
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 37:288/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
G
 
R
V
x
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
A
x
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
I
x
T
P
 
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
|
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
C
S
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 39:290/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
|
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
x
R
V
x
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
A
 
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
I
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
|
T
E
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 40:291/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
x
L
G
|
G
M
x
L
G
|
G
G
x
R
V
x
I
G
|
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
 
I
A
 
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
I
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 40:291/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
G
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
A
x
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
I
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
|
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 45:296/533 of O43175

query
sites
O43175
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
x
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
x
R
V
x
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
 
I
A
 
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
I
x
T
P
 
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
 
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
x
L
G
|
G
A
|
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
40% identity, 78% coverage: 51:304/325 of query aligns to 35:282/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
S
S
 
A
K
 
A
I
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
N
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
A
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
Q
L
 
A
D
 
T
R
 
A
M
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
W
T
 
E
S
 
R
P
 
K
P
 
K
P
 
F
Q
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
x
R
V
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
R
F
 
M
K
 
Q
A
 
-
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
T
L
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
A
x
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
F
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
F
D
 
G
A
 
V
E
 
Q
R
 
Q
C
 
-
A
 
L
S
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
R
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
I
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
R
 
P
D
x
S
T
 
T
E
 
T
K
 
G
L
|
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
D
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
-
P
 
P
P
 
P
A
 
R
G
 
D
H
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
D
L
 
H
P
 
E
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
M
 
C
G
 
G

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 94% coverage: 18:321/325 of query aligns to 3:308/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
L
 
V
V
 
V
Y
 
L
V
 
I
L
 
A
D
 
D
P
 
K
I
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
A
L
 
L
R
 
G
Q
 
D
S
 
Q
C
 
V
D
 
E
V
 
V
-
 
R
-
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
G
D
 
P
D
 
D
K
 
R
R
 
D
K
 
K
G
 
L
-
 
L
R
 
A
W
 
A
L
 
V
E
 
P
D
 
E
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
T
I
 
V
P
 
D
R
 
A
D
 
E
M
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
V
G
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
S
 
I
N
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
A
V
 
L
G
 
A
L
 
L
A
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
A
L
 
A
D
 
D
R
 
A
M
 
S
L
 
L
R
 
R
D
 
E
G
 
H
A
 
T
V
 
W
T
 
K
S
 
R
P
 
S
P
 
S
P
 
F
Q
 
S
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
I
T
 
F
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
Q
R
 
L
T
 
V
A
 
A
A
 
Q
L
 
R
F
 
I
K
 
-
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
A
T
 
Y
I
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
A
 
V
P
 
S
P
 
P
E
 
-
A
 
A
F
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
D
 
L
A
 
G
E
 
I
R
 
E
C
 
L
A
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
V
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
I
 
L
P
 
P
L
 
K
N
 
T
R
 
P
D
 
E
T
 
T
E
 
A
K
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
K
R
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
R
 
P
D
 
G
A
 
V
M
 
I
V
 
I
L
 
V
N
 
N
L
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
T
 
T
N
 
G
G
 
G
T
 
H
I
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
V
 
A
Q
 
T
E
|
E
P
 
-
P
 
P
P
 
C
A
 
T
G
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
A
G
 
Q
F
 
V
V
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
D
R
 
R
M
 
A
G
 
G
M
 
T
G
 
D
V
 
V
V
 
A
G
 
E
G
 
S
V
 
V
-
 
R
V
 
L
T
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
G
 
E
G
 
F
T
 
V
P
 
P
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 94% coverage: 18:321/325 of query aligns to 4:309/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
L
 
V
V
 
V
Y
 
L
V
 
I
L
 
A
D
 
D
P
 
K
I
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
S
A
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
A
L
 
L
R
 
G
Q
 
D
S
 
Q
C
 
V
D
 
E
V
 
V
-
 
R
-
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
G
D
 
P
D
 
D
K
 
R
R
 
D
K
 
K
G
 
L
-
 
L
R
 
A
W
 
A
L
 
V
E
 
P
D
 
E
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
A
S
 
T
K
 
T
I
 
V
P
 
D
R
 
A
D
 
E
M
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
V
G
 
A
K
x
R
H
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
S
 
I
N
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
A
V
 
L
G
 
A
L
 
L
A
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
L
 
A
L
 
A
D
 
D
R
 
A
M
 
S
L
 
L
R
 
R
D
 
E
G
 
H
A
 
T
V
 
W
T
 
K
S
 
R
P
 
S
P
 
S
P
 
F
Q
 
S
G
 
G
I
 
T
E
 
E
L
 
I
T
 
F
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
Q
R
 
L
T
 
V
A
 
A
A
 
Q
L
 
R
F
 
I
K
 
-
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
A
T
 
Y
I
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
A
 
V
P
 
S
P
 
P
E
 
-
A
 
A
F
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
D
 
L
A
 
G
E
 
I
R
 
E
C
 
L
A
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
A
R
 
R
V
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
I
 
L
P
 
P
L
 
K
N
 
T
R
 
P
D
 
E
T
 
T
E
 
A
K
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
K
R
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
R
 
P
D
 
G
A
 
V
M
 
I
V
 
I
L
 
V
N
 
N
L
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
T
 
T
N
 
G
G
 
G
T
 
H
I
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
V
 
A
Q
 
T
E
|
E
P
 
-
P
 
P
P
 
C
A
 
T
G
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
A
G
 
Q
F
 
V
V
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
A
|
A
A
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
A
M
x
Q
E
 
D
R
 
R
M
 
A
G
 
G
M
 
T
G
 
D
V
 
V
V
 
A
G
 
E
G
 
S
V
 
V
-
 
R
V
 
L
T
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
G
 
E
G
 
F
T
 
V
P
 
P
D
 
D

2eklA Structure of st1218 protein from sulfolobus tokodaii
34% identity, 87% coverage: 21:304/325 of query aligns to 9:295/312 of 2eklA

query
sites
2eklA
V
 
I
L
 
T
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
D
P
 
E
S
 
I
A
 
L
V
 
I
A
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
S
 
K
C
 
G
D
 
I
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
H
 
Y
D
 
M
-
 
P
D
 
E
K
 
I
R
 
S
K
 
K
G
 
E
R
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
G
D
 
N
A
 
Y
D
 
D
G
 
I
V
 
I
I
 
V
V
 
V
R
 
R
T
 
S
-
 
R
S
 
T
K
 
K
I
 
V
P
 
T
R
 
K
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
K
A
 
G
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
I
G
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
x
I
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
T
D
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
E
D
 
K
R
 
R
G
 
N
V
 
I
A
 
K
V
 
V
I
 
V
N
 
Y
T
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
A
N
x
S
S
 
T
N
 
D
A
 
S
V
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
M
L
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
I
 
M
A
 
Y
L
 
T
L
 
S
D
 
M
R
 
A
M
 
L
L
 
A
R
 
K
D
 
S
G
 
G
A
 
I
V
 
F
T
 
-
S
 
-
P
 
K
P
 
K
P
 
I
Q
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
T
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
|
G
M
 
F
G
|
G
G
x
R
V
x
I
G
 
G
R
 
T
R
 
K
T
 
-
A
 
V
A
 
G
L
 
I
F
 
I
K
 
A
A
 
N
A
 
A
F
 
M
G
 
G
S
 
M
T
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
D
|
D
P
x
I
F
x
L
A
 
D
P
 
I
P
 
R
E
 
E
A
 
K
F
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
I
D
 
N
A
 
A
E
 
-
R
 
K
C
 
A
A
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
K
R
 
N
V
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
I
T
 
S
L
 
L
H
|
H
I
x
V
P
x
T
L
 
V
N
 
S
R
 
K
D
 
D
T
 
A
E
 
K
K
 
P
L
x
I
I
 
I
D
 
D
A
 
Y
R
 
P
R
 
Q
L
 
F
A
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
R
 
D
D
 
N
A
 
V
M
 
I
V
 
I
L
 
V
N
 
N
L
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
A
G
 
V
V
 
A
V
 
V
D
 
N
E
 
G
T
 
K
A
 
A
L
 
L
H
 
L
D
 
D
A
 
Y
L
 
I
T
 
K
N
 
K
G
 
G
T
 
K
I
 
V
A
 
Y
G
 
A
A
 
Y
A
 
A
T
 
T
D
|
D
V
 
V
F
 
F
V
 
W
Q
 
N
E
|
E
P
 
P
P
 
P
P
 
K
A
 
E
G
 
E
H
 
W
-
 
E
-
 
L
P
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
H
P
 
E
G
 
R
F
 
V
V
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
T
H
|
H
I
 
I
G
|
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
K
R
 
R
M
 
V
G
 
A

8wprA Anabaena mcyi r166a with prebound NAD and malate
34% identity, 84% coverage: 51:324/325 of query aligns to 40:315/320 of 8wprA

query
sites
8wprA
L
 
I
E
 
Q
D
 
D
A
 
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
F
V
 
V
R
 
R
T
 
Y
-
 
P
S
 
T
K
 
K
I
 
L
P
 
D
R
 
A
D
 
Q
M
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
N
L
 
L
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
S
K
 
T
H
 
S
G
 
G
V
 
F
G
 
G
V
 
T
D
 
D
N
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
L
N
x
S
S
 
T
N
 
T
A
 
A
V
|
V
A
 
T
E
 
E
L
 
H
A
 
T
V
 
L
G
 
S
L
 
M
A
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
K
R
 
K
I
 
L
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
N
R
 
Q
M
 
C
L
 
V
R
 
K
D
 
A
G
 
G
-
 
N
A
 
Y
V
 
L
T
 
I
S
 
R
P
 
N
P
 
Q
P
 
V
Q
 
Q
G
 
P
I
 
I
E
 
Q
L
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
L
G
|
G
G
x
A
V
x
I
G
 
G
R
 
S
R
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
F
 
C
K
 
S
A
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
Q
S
 
M
T
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
Y
A
 
V
P
 
P
P
 
S
E
 
G
A
 
K
F
 
A
A
 
D
A
 
T
A
 
V
D
 
R
A
 
A
E
 
T
R
 
L
C
 
V
A
 
Q
S
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
Y
L
 
L
L
 
L
P
 
T
R
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
 
H
I
x
P
P
x
E
L
 
L
N
 
T
R
 
D
D
x
E
T
|
T
E
 
C
K
 
E
L
 
M
I
 
F
D
 
D
A
 
L
R
 
E
R
 
A
L
 
F
A
 
K
L
 
K
M
 
M
K
 
K
R
 
P
D
 
S
A
 
A
M
 
F
V
 
L
L
 
I
N
 
N
L
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
G
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
R
E
 
Q
T
 
P
A
 
D
L
 
L
H
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
R
N
 
E
G
 
K
T
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
E
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
P
 
P
P
 
A
A
 
I
G
 
N
H
 
N
P
 
P
L
 
L
L
 
Y
R
 
E
L
 
F
P
 
D
G
 
N
F
 
V
V
 
I
A
 
F
T
 
S
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
A
A
x
G
A
 
V
T
 
T
A
 
P
E
 
E
S
 
A
M
 
G
E
 
M
R
 
A
M
 
A
G
 
A
M
 
L
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
N
G
 
Q
V
 
I
V
 
L
T
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
Q
G
 
G
G
 
E
T
 
K
P
 
P
D
 
P
H
 
Y
R
 
I
V
 
I

8wpiA Anabaena mcyi with prebound NAD and soaked NADP
34% identity, 84% coverage: 51:322/325 of query aligns to 38:311/318 of 8wpiA

query
sites
8wpiA
L
 
I
E
 
Q
D
 
D
A
 
V
D
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
F
V
 
V
R
 
R
T
x
Y
-
 
P
S
 
T
K
 
K
I
 
L
P
 
D
R
 
A
D
 
Q
M
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
N
L
 
L
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
S
K
 
T
H
x
S
G
|
G
V
x
F
G
|
G
V
 
T
D
 
D
N
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
T
D
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
L
N
 
S
S
 
T
N
 
T
A
 
A
V
|
V
A
 
T
E
 
E
L
 
H
A
 
T
V
 
L
G
 
S
L
 
M
A
 
I
L
 
L
A
 
A
V
x
L
A
 
A
R
 
K
R
x
K
I
 
L
A
 
T
L
x
F
L
 
L
D
 
N
R
 
Q
M
 
C
L
 
V
R
 
K
D
 
A
G
 
G
-
 
N
A
 
Y
V
 
L
T
 
I
S
 
R
P
 
N
P
 
Q
P
 
V
Q
 
Q
G
 
P
I
 
I
E
 
Q
L
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
|
G
M
 
L
G
|
G
G
x
R
V
x
I
G
 
G
R
 
S
R
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
F
 
C
K
 
S
A
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
Q
S
 
M
T
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
Y
A
 
V
P
 
P
P
 
S
E
 
G
A
 
K
F
 
A
A
 
D
A
 
T
A
 
V
D
 
R
A
 
A
E
 
T
R
 
L
C
 
V
A
 
Q
S
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
Y
L
 
L
L
 
L
P
 
T
R
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
I
x
P
P
x
E
L
 
L
N
 
T
R
 
D
D
x
E
T
|
T
E
 
C
K
 
E
L
 
M
I
 
F
D
 
D
A
 
L
R
 
E
R
 
A
L
 
F
A
 
K
L
 
K
M
 
M
K
 
K
R
 
P
D
 
S
A
 
A
M
x
F
V
 
L
L
 
I
N
 
N
L
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
G
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
R
E
 
Q
T
 
P
A
 
D
L
 
L
H
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
R
N
 
E
G
 
K
T
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
E
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
P
 
P
P
 
A
A
 
I
G
 
N
H
 
N
P
 
P
L
 
L
L
 
Y
R
 
E
L
 
F
P
x
D
G
x
N
F
 
V
V
 
I
A
 
F
T
 
S
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
A
A
 
G
A
x
V
T
|
T
A
 
P
E
 
E
S
 
A
M
x
G
E
 
M
R
 
A
M
 
A
G
 
A
M
 
L
G
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
N
G
 
Q
V
 
I
V
 
L
T
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
Q
G
 
G
G
 
E
T
 
K
P
 
P
D
 
P
H
 
Y

Sites not aligning to the query:

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
37% identity, 83% coverage: 51:320/325 of query aligns to 43:317/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
L
 
V
E
 
K
D
 
D
A
 
V
D
 
D
G
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
T
R
x
M
T
x
L
S
 
S
-
 
E
K
 
R
I
 
I
P
 
D
R
 
Q
D
 
E
M
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
A
 
A
Q
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
R
V
 
I
I
 
V
G
 
A
K
 
N
H
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
T
D
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
Y
V
 
V
I
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
N
x
L
S
 
T
N
 
N
A
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
L
 
H
A
 
A
V
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
I
 
V
A
 
V
L
 
K
L
 
G
D
 
D
R
 
K
M
 
F
L
 
V
R
 
R
D
 
S
G
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
K
-
 
R
-
 
K
A
 
G
V
 
I
T
 
A
S
 
W
P
 
H
P
 
P
P
 
K
Q
 
W
-
 
F
-
 
L
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
L
 
L
T
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
 
G
M
x
F
G
|
G
G
x
R
V
x
I
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
R
L
 
R
F
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
-
F
 
F
G
 
N
S
 
M
T
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
Y
Y
 
Y
D
x
S
P
x
R
F
 
T
A
 
R
P
 
K
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
F
 
E
A
 
K
A
 
E
A
 
L
D
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
-
C
 
Y
A
 
R
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
L
P
 
K
R
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
T
 
I
L
 
L
H
x
A
I
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
K
D
 
E
T
|
T
E
 
M
K
 
Y
L
 
M
I
 
I
D
 
N
A
 
E
R
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
R
 
P
D
 
T
A
 
A
M
 
I
V
 
L
L
 
V
N
 
N
L
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
T
 
K
A
 
A
L
 
L
H
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
V
 
-
Q
 
E
E
 
E
P
x
E
P
 
P
P
 
Y
A
 
Y
G
 
N
H
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
R
 
S
L
 
L
P
 
D
G
 
N
F
 
V
V
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
A
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
F
E
 
E
S
 
A
M
 
R
E
 
E
R
 
A
M
 
M
G
 
A
M
 
E
G
 
L
V
 
V
V
 
A
G
 
R
G
 
N
V
 
L
V
 
I
T
 
A
L
 
F
L
 
K
G
 
R
G
 
G
G
 
E
T
 
I
P
 
P

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
32% identity, 96% coverage: 7:319/325 of query aligns to 46:372/466 of P87228

query
sites
P87228
R
 
R
V
 
T
L
 
L
K
 
K
S
 
P
E
 
F
M
 
A
V
 
S
E
 
E
R
 
D
S
 
I
L
 
K
V
 
I
Y
 
L
V
 
L
L
 
L
D
 
E
P
 
N
I
 
V
A
 
N
P
 
Q
S
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
S
T
 
N
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
S
 
E
C
 
G
D
 
Y
V
 
Q
V
 
V
D
 
E
H
 
F
-
 
L
-
 
K
D
 
T
D
 
S
K
 
M
R
x
S
K
 
E
G
 
D
R
 
D
W
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
I
D
 
K
G
 
G
V
 
V
-
 
H
-
 
A
-
 
I
-
 
G
I
 
I
V
 
R
R
 
S
T
 
K
S
 
T
K
 
R
I
 
L
P
 
T
R
 
R
D
 
R
M
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
R
 
S
L
 
L
K
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
C
H
 
F
G
 
C
V
 
I
G
 
G
V
 
T
D
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
F
A
 
A
R
 
A
D
 
E
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
F
N
 
N
T
 
S
P
 
P
G
 
Y
A
 
A
N
 
N
S
 
S
N
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
I
L
 
I
A
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
V
A
 
G
L
 
D
L
 
R
D
 
S
R
 
L
M
 
E
L
 
L
R
 
H
D
 
R
G
 
G
A
 
E
V
 
W
T
 
N
S
 
K
P
 
V
P
 
S
P
 
S
Q
 
G
G
 
C
I
 
W
E
 
E
L
 
I
T
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
Y
G
 
G
G
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
T
 
L
A
 
S
A
 
V
L
 
L
F
 
A
K
 
E
A
 
A
A
 
-
F
 
M
G
 
G
S
 
L
T
 
H
I
 
V
L
 
V
A
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
L
P
 
P
F
 
I
A
 
M
P
 
P
P
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
L
A
 
G
D
 
S
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
C
 
L
A
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
H
R
 
R
V
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
 
H
I
 
V
P
 
P
L
 
A
N
x
S
R
 
P
D
 
E
T
 
T
E
 
K
K
 
N
L
 
M
I
 
I
D
 
S
A
 
S
R
 
K
R
 
E
L
 
F
A
 
A
L
 
A
M
 
M
K
 
K
R
 
E
D
 
G
A
 
S
M
 
Y
V
 
L
L
 
I
N
 
N
L
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
T
 
P
A
 
A
L
 
L
H
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
S
T
 
K
N
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
V
 
P
Q
 
S
E
 
E
P
 
P
P
 
A
P
 
G
A
 
N
G
 
G
H
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
S
P
 
E
L
 
L
L
 
T
R
 
H
L
 
C
P
 
K
G
 
N
F
 
I
V
 
I
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
G
A
 
S
T
 
T
A
 
E
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
Y
R
 
N
M
 
I
G
 
G
M
 
I
G
 
E
V
 
V
V
 
S
G
 
E
G
 
A
V
 
L
V
 
T
T
 
R
L
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
E
G
 
G
T
 
N

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
33% identity, 85% coverage: 43:319/325 of query aligns to 39:316/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
D
 
D
D
 
D
K
 
E
R
 
Q
K
 
L
G
 
K
R
 
E
W
 
S
L
 
I
E
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
H
G
 
F
V
 
I
I
 
G
V
 
L
R
 
R
T
 
S
-
 
R
S
 
T
K
 
H
I
 
L
P
 
T
R
 
E
D
 
D
M
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
V
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
A
H
 
F
G
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
T
D
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
D
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
P
V
 
V
I
 
F
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
F
A
 
S
N
|
N
S
 
T
N
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
L
V
 
L
A
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
P
L
 
E
L
 
A
D
 
N
R
 
A
M
 
K
L
 
A
R
 
H
D
 
R
G
 
G
A
 
V
V
 
W
T
 
N
S
 
K
P
 
L
P
 
A
P
 
A
Q
 
G
G
 
S
I
 
F
E
 
E
L
 
A
T
 
R
G
 
G
R
 
K
T
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
Y
G
|
G
G
x
H
V
x
I
G
 
G
R
 
T
R
 
Q
T
 
L
A
 
G
A
 
I
L
 
L
F
 
A
K
 
E
A
 
S
A
 
-
F
 
L
G
 
G
S
 
M
T
 
Y
I
 
V
L
 
Y
A
 
F
Y
|
Y
D
|
D
P
x
I
F
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
E
E
 
N
A
 
K
F
 
L
A
 
P
A
 
L
A
 
G
D
 
N
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
C
 
V
A
 
Q
S
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
N
R
 
M
V
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
I
x
V
P
|
P
L
 
E
N
 
N
R
 
P
D
x
S
T
 
T
E
 
K
K
 
N
L
 
M
I
 
M
D
 
G
A
 
A
R
 
K
R
 
E
L
 
I
A
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
R
 
P
D
 
G
A
 
S
M
 
L
V
 
L
L
 
I
N
 
N
L
x
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
G
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
T
 
P
A
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
A
N
 
S
G
 
K
T
 
H
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
I
D
|
D
V
 
V
F
 
F
V
 
P
Q
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
D
P
 
P
A
 
F
G
 
T
H
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
A
R
 
E
L
 
F
P
 
D
G
 
N
F
 
V
V
 
L
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
A
 
G
A
 
S
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
S
 
A
M
 
Q
E
 
E
R
 
N
M
 
I
G
 
G
M
 
L
G
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
G
 
K
V
 
L
V
 
I
T
 
K
L
 
Y
L
 
S
G
 
D
G
 
N
G
 
G
T
 
S

Query Sequence

>WP_157619628.1 NCBI__GCF_000576635.1:WP_157619628.1
MPRPKTRVLKSEMVERSLVYVLDPIAPSAVATLRQSCDVVDHDDKRKGRWLEDADGVIVR
TSKIPRDMIAAAQRLKVIGKHGVGVDNIDLDAARDRGVAVINTPGANSNAVAELAVGLAL
AVARRIALLDRMLRDGAVTSPPPQGIELTGRTVGVVGMGGVGRRTAALFKAAFGSTILAY
DPFAPPEAFAAADAERCASLDELLPRVDVLTLHIPLNRDTEKLIDARRLALMKRDAMVLN
LSRGGVVDETALHDALTNGTIAGAATDVFVQEPPPAGHPLLRLPGFVATPHIGAATAESM
ERMGMGVVGGVVTLLGGGTPDHRVV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory