SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_158211654.1 NCBI__GCF_002019605.1:WP_158211654.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

4pg7A Crystal structure of s. Aureus homoserine dehydrogenase at ph7.5 (see paper)
38% identity, 76% coverage: 2:312/410 of query aligns to 5:304/402 of 4pg7A

query
sites
4pg7A
L
 
L
S
 
N
I
 
I
G
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
Y
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
 
V
E
 
K
R
 
I
L
 
I
T
 
E
S
 
E
S
 
N
K
 
R
E
 
Q
E
 
Q
L
 
I
Q
 
Q
S
 
D
A
 
T
L
 
L
K
 
N
K
 
K
E
 
D
I
 
I
Q
 
V
V
 
I
K
 
K
K
 
H
V
 
I
L
 
L
V
 
V
R
 
R
D
 
D
C
 
K
K
 
S
K
 
K
E
 
K
R
 
R
N
 
P
N
 
L
Q
 
N
G
 
I
A
 
S
K
 
Q
Q
 
Y
C
 
H
M
 
L
T
 
T
S
 
E
D
 
D
P
 
-
V
 
V
N
 
N
F
 
E
F
 
I
Q
 
L
N
 
N
-
 
D
-
 
D
Q
 
S
Y
 
L
D
 
D
V
 
I
V
 
I
F
 
V
E
 
E
A
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
T
R
 
V
D
 
D
Y
 
W
I
 
L
I
 
R
K
 
T
L
 
A
I
 
L
Q
 
K
A
 
N
G
 
K
T
 
K
S
 
H
I
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
E
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
A
K
 
V
H
 
H
G
 
L
A
 
K
E
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
E
Y
 
N
Q
 
G
V
 
V
Y
 
A
L
 
L
G
 
K
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
S
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
P
P
 
N
I
 
N
V
 
I
N
 
S
S
 
K
F
 
F
K
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
M
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
T
 
S
N
 
N
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
T
 
S
E
 
K
M
 
M
K
 
T
E
 
K
K
 
E
N
 
Q
R
 
T
Q
 
T
F
 
F
D
 
E
D
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
R
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
D
D
 
D
I
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
A
Y
 
R
K
|
K
I
 
V
R
 
V
I
 
I
L
 
T
S
 
S
R
 
Y
L
 
L
A
 
S
F
 
F
N
 
N
E
 
Q
W
 
V
P
 
I
R
 
K
E
 
L
E
 
N
N
 
D
F
 
V
S
 
K
C
 
R
K
x
R
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
|
G
M
 
V
E
 
T
V
 
L
E
 
T
A
 
D
I
 
I
E
 
N
F
 
V
A
 
A
E
 
D
R
 
Q
Q
 
L
G
 
G
L
 
Y
T
 
K
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
G
K
 
K
T
 
G
A
 
I
N
 
Y
E
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
K
I
 
V
S
 
N
G
 
A
F
 
S
V
 
V
S
 
E
P
 
P
S
 
T
F
 
L
V
 
I
T
 
D
Q
 
K
T
 
K
H
 
H
P
 
Q
L
 
L
Y
 
A
N
 
A
I
 
V
N
 
E
G
 
D
V
 
E
T
 
Y
N
 
N
G
 
A
V
 
I
C
 
Y
I
 
V
D
 
I
G
 
G
E
 
D
T
 
A
V
 
V
D
 
G
C
 
D
I
 
T
T
 
M
M
 
F
S
 
Y
G
 
G
P
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
S
E
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
G
N
 
S
S
 
A
M
 
V
V
 
V
E
 
S
D
 
D
F
 
L
V
 
L

Sites not aligning to the query:

Q5F8J4 NAD(+)-dependent homoserine dehydrogenase; NAD(+)-dependent HSD; NgHSD; EC 1.1.1.3 from Neisseria gonorrhoeae (strain ATCC 700825 / FA 1090) (see paper)
40% identity, 71% coverage: 20:312/410 of query aligns to 22:314/435 of Q5F8J4

query
sites
Q5F8J4
L
 
L
T
 
R
S
 
D
S
 
N
K
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
I
Q
 
S
S
 
R
A
 
R
L
 
L
K
 
G
K
 
R
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
V
 
I
K
 
S
K
 
A
V
 
M
L
 
C
V
 
-
R
 
-
D
 
D
C
x
L
K
x
S
K
 
E
E
 
E
R
 
K
N
 
A
N
 
R
Q
 
Q
-
 
I
G
 
C
A
 
P
K
 
S
Q
 
A
C
 
A
M
 
F
T
 
V
S
 
K
D
 
D
P
 
P
V
 
F
N
 
E
F
 
L
F
 
V
-
 
A
Q
 
R
N
 
K
Q
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
V
E
 
E
A
 
L
I
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
T
E
 
G
P
 
I
A
 
A
R
 
K
D
 
E
Y
 
A
I
 
V
I
 
L
K
 
K
L
 
A
I
 
I
Q
 
E
A
 
N
G
 
G
T
 
K
S
 
H
I
 
I
I
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
E
 
K
L
 
L
I
 
L
A
 
A
K
 
E
H
 
Y
G
 
G
A
 
N
E
 
E
L
 
I
E
 
F
K
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
E
E
 
K
Y
 
Q
Q
 
N
V
 
V
Y
 
I
L
 
V
G
 
Q
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
K
S
 
A
F
 
L
K
 
R
T
 
E
L
 
G
F
 
L
T
 
A
T
 
A
T
 
N
P
 
R
I
 
I
R
 
K
S
 
S
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
T
T
 
S
N
 
N
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
T
 
S
E
 
E
M
 
M
K
 
R
E
 
E
K
 
K
N
 
G
R
 
S
Q
 
A
F
 
F
D
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
G
 
G
Y
 
N
D
 
D
A
 
A
L
 
G
Y
 
H
K
 
K
I
 
I
R
 
T
I
 
I
L
 
M
S
 
S
R
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
N
 
G
E
 
-
W
 
T
P
 
P
R
 
M
E
 
-
E
 
-
N
 
N
F
 
F
S
 
S
C
 
A
-
 
C
-
 
Y
-
 
L
K
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
K
M
 
L
E
 
D
V
 
S
E
 
R
A
 
D
I
 
I
E
 
K
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
Y
T
 
R
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
L
A
 
G
K
 
V
T
 
T
A
 
R
N
 
K
E
 
T
D
 
G
G
 
K
V
 
G
I
 
I
S
 
E
G
 
L
F
 
R
V
 
V
S
 
H
P
 
P
S
 
T
F
 
L
V
 
I
T
 
P
Q
 
E
T
 
S
H
 
R
P
 
L
L
 
L
Y
 
A
N
 
N
I
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
A
V
 
V
C
 
R
I
 
V
D
 
N
G
 
A
E
 
D
T
 
M
V
 
V
D
 
G
C
 
E
I
 
T
T
 
L
M
 
Y
S
 
Y
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
A
E
 
L
A
 
P
T
 
T
A
 
A
N
 
S
S
 
A
M
 
V
V
 
V
E
 
A
D
 
D
F
 
I
V
 
I

6dzsA Mycobacterial homoserine dehydrogenase thra in complex with NADP
36% identity, 78% coverage: 2:319/410 of query aligns to 5:328/431 of 6dzsA

query
sites
6dzsA
L
 
I
S
 
G
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
L
G
|
G
Y
x
L
G
|
G
T
x
N
V
|
V
G
 
G
S
 
S
G
 
E
V
 
V
Y
 
V
E
 
R
R
 
I
L
 
I
T
 
D
S
 
E
S
 
S
K
 
A
E
 
T
E
 
D
L
 
L
Q
 
A
S
 
A
A
 
R
L
 
I
K
 
G
K
 
A
E
 
P
I
 
L
Q
 
Q
V
 
L
K
 
R
K
 
G
V
 
I
L
 
G
V
|
V
R
|
R
D
x
R
C
 
V
K
 
S
K
 
A
E
 
D
R
|
R
N
 
-
N
 
-
Q
 
-
G
 
G
A
 
V
K
 
P
Q
 
V
C
 
E
M
 
L
T
 
L
S
 
T
D
 
D
P
 
N
V
x
I
N
 
E
F
 
E
F
 
L
-
 
V
-
 
S
Q
 
R
N
 
D
Q
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
V
E
 
E
A
x
L
I
x
M
G
 
G
G
 
P
V
 
V
E
 
E
P
|
P
A
 
A
R
 
R
D
 
K
Y
 
A
I
 
I
I
 
L
K
 
T
L
 
A
I
 
L
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
K
S
 
S
I
 
V
I
 
V
T
 
T
A
|
A
N
 
N
K
|
K
E
 
A
L
 
L
I
 
M
A
 
S
K
 
V
H
 
S
G
 
T
A
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
A
K
 
Q
L
 
A
A
 
A
K
 
E
E
 
A
Y
 
A
Q
 
H
V
 
V
Y
 
D
L
 
L
G
 
Y
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
A
I
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
R
S
 
P
F
 
L
K
 
T
T
 
Q
L
 
S
F
 
L
T
 
A
T
 
G
T
 
D
P
 
T
I
 
V
R
 
T
S
 
R
V
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
V
N
 
N
G
 
G
T
 
T
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
S
E
 
A
M
 
M
K
 
D
E
 
S
K
 
T
N
 
G
R
 
A
Q
 
D
F
 
Y
D
 
G
D
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
S
V
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
A
Y
 
A
K
 
K
I
 
A
R
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
A
R
 
S
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
T
W
 
R
P
 
V
R
 
T
E
 
A
E
 
D
N
 
D
F
 
V
S
 
Y
C
 
R
K
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
T
G
 
-
M
 
-
E
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
A
I
 
A
E
 
D
F
 
F
A
 
A
E
 
S
R
 
A
Q
 
R
-
 
A
-
 
L
G
 
G
L
 
C
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
L
A
 
A
-
 
I
-
 
C
-
 
E
K
 
R
T
 
L
A
 
T
N
 
S
E
 
D
D
 
D
G
 
G
-
 
H
-
 
Q
V
 
S
I
 
V
S
 
S
G
 
A
F
 
R
V
 
V
S
 
Y
P
 
P
S
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
P
Q
 
L
T
 
T
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Y
 
A
N
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
T
 
F
N
 
N
G
 
A
V
 
V
C
 
V
I
 
V
D
 
E
G
 
A
E
 
E
T
 
A
V
 
A
D
 
G
C
 
R
I
 
L
T
 
M
M
 
F
S
 
Y
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
 
G
E
 
A
A
 
P
T
|
T
A
 
A
N
 
S
S
 
A
M
 
V
V
 
M
E
 
G
D
 
D
F
 
V
V
 
V
L
 
M
-
 
A
-
 
A
H
 
R
E
 
N
Q
 
R
F
 
V
Q
 
Q
G
 
G

6a0sA Homoserine dehydrogenase from thermus thermophilus hb8 complexed with hse and NADPH (see paper)
38% identity, 67% coverage: 2:276/410 of query aligns to 4:269/331 of 6a0sA

query
sites
6a0sA
L
 
L
S
 
K
I
 
I
G
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
Y
x
G
G
|
G
T
|
T
V
|
V
G
 
G
S
 
S
G
 
A
V
 
F
Y
 
Y
E
 
N
R
 
L
L
 
V
T
 
L
S
 
E
S
 
R
K
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
-
S
 
S
A
 
A
L
 
F
K
 
G
K
 
V
E
 
V
I
 
P
Q
 
R
V
 
F
K
 
L
K
 
G
V
 
V
L
|
L
V
|
V
R
|
R
D
|
D
C
 
P
K
 
R
K
|
K
E
 
P
R
|
R
N
 
A
N
 
I
Q
 
P
G
 
-
A
 
-
K
 
Q
Q
 
E
C
 
L
M
 
L
T
 
R
S
 
A
D
 
E
P
 
P
V
 
F
N
 
D
F
 
L
F
 
L
Q
 
E
N
 
A
Q
 
-
Y
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
V
E
 
E
A
|
A
I
x
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
A
 
P
R
 
L
D
 
R
Y
 
L
I
 
V
I
 
L
K
 
P
L
 
A
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
P
I
 
L
I
 
I
T
 
T
A
|
A
N
 
N
K
|
K
E
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
A
K
 
E
H
 
A
G
 
W
A
 
E
E
 
S
L
 
L
E
 
R
K
 
P
L
 
F
A
 
A
K
 
E
E
 
E
Y
 
G
Q
 
L
V
 
I
Y
 
Y
L
 
-
G
 
-
F
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
S
V
 
V
G
 
M
G
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
P
I
 
A
V
 
L
N
 
S
S
 
F
F
 
L
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
R
T
 
G
T
 
S
T
 
E
P
 
-
I
 
L
R
 
L
S
 
E
V
 
L
S
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
|
N
G
|
G
T
|
T
T
 
T
N
 
L
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
M
 
M
K
 
-
E
 
E
K
 
K
N
 
G
R
 
R
Q
 
T
F
 
Y
D
 
A
D
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
V
 
R
L
 
L
G
|
G
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
A
 
A
D
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
L
D
|
D
I
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
I
D
|
D
A
 
A
L
 
A
Y
 
H
K
|
K
I
 
L
R
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
L
F
 
V
N
 
D
E
 
P
-
 
G
W
 
F
P
 
P
R
 
F
E
 
A
E
 
E
N
 
-
F
 
V
S
 
E
C
 
A
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
A
G
 
R
M
 
L
E
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
Q
F
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
T
 
R
I
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
S
T
 
L
A
 
F
N
 
G
E
 
E
D
 
G
G
 
G
V
 
R
I
 
W
S
 
R
G
 
A
F
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
S
 
R
F
 
R
V
 
L
T
 
P
Q
 
Q
T
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Y
 
A
N
 
R
I
 
A
N
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2ejwA Homoserine dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
38% identity, 67% coverage: 2:276/410 of query aligns to 4:269/331 of 2ejwA

query
sites
2ejwA
L
 
L
S
 
K
I
 
I
G
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
Y
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
A
V
 
F
Y
 
Y
E
 
N
R
 
L
L
 
V
T
 
L
S
 
E
S
 
R
K
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
-
S
 
S
A
 
A
L
 
F
K
 
G
K
 
V
E
 
V
I
 
P
Q
 
R
V
 
F
K
 
L
K
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
D
 
D
C
 
P
K
 
R
K
 
K
E
 
P
R
 
R
N
 
A
N
 
I
Q
 
P
G
 
-
A
 
-
K
 
Q
Q
 
E
C
 
L
M
 
L
T
 
R
S
 
A
D
 
E
P
 
P
V
 
F
N
 
D
F
 
L
F
 
L
Q
 
E
N
 
A
Q
 
-
Y
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
A
 
P
R
 
L
D
 
R
Y
 
L
I
 
V
I
 
L
K
 
P
L
 
A
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
P
I
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
E
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
A
K
 
E
H
 
A
G
 
W
A
 
E
E
 
S
L
 
L
E
 
R
K
 
P
L
 
F
A
 
A
K
 
E
E
 
E
Y
 
G
Q
 
L
V
 
I
Y
 
Y
L
 
-
G
 
-
F
 
H
E
|
E
A
 
A
A
 
S
V
|
V
G
x
M
G
x
A
G
 
G
I
x
T
P
 
P
I
 
A
V
 
L
N
 
S
S
 
F
F
 
L
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
R
T
 
G
T
 
S
T
 
E
P
 
-
I
 
L
R
 
L
S
 
E
V
 
L
S
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
T
 
T
N
 
L
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
M
 
M
K
 
-
E
 
E
K
 
K
N
 
G
R
 
R
Q
 
T
F
 
Y
D
 
A
D
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
V
 
R
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
L
D
 
D
I
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
I
D
|
D
A
 
A
L
 
A
Y
 
H
K
|
K
I
 
L
R
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
L
F
 
V
N
 
D
E
 
P
-
 
G
W
 
F
P
 
P
R
 
F
E
 
A
E
 
E
N
 
-
F
 
V
S
 
E
C
 
A
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
A
G
 
R
M
 
L
E
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
Q
F
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
T
 
R
I
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
S
T
 
L
A
 
F
N
 
G
E
 
E
D
 
G
G
 
G
V
 
R
I
 
W
S
 
R
G
 
A
F
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
S
 
R
F
 
R
V
 
L
T
 
P
Q
 
Q
T
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Y
 
A
N
 
R
I
 
A
N
 
R
G
 
G

6a0tB Homoserine dehydrogenase k99a mutant from thermus thermophilus hb8 complexed with hse and NADP+ (see paper)
38% identity, 67% coverage: 2:276/410 of query aligns to 4:269/332 of 6a0tB

query
sites
6a0tB
L
 
L
S
 
K
I
 
I
G
 
A
I
 
L
I
 
L
G
|
G
Y
x
G
G
|
G
T
|
T
V
|
V
G
 
G
S
 
S
G
 
A
V
 
F
Y
 
Y
E
 
N
R
 
L
L
 
V
T
 
L
S
 
E
S
 
R
K
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
-
S
 
S
A
 
A
L
 
F
K
 
G
K
 
V
E
 
V
I
 
P
Q
 
R
V
 
F
K
 
L
K
 
G
V
 
V
L
|
L
V
|
V
R
|
R
D
|
D
C
 
P
K
 
R
K
|
K
E
 
P
R
|
R
N
 
A
N
 
I
Q
 
P
G
 
-
A
 
-
K
 
Q
Q
 
E
C
 
L
M
 
L
T
 
R
S
 
A
D
 
E
P
 
P
V
 
F
N
 
D
F
 
L
F
 
L
Q
 
E
N
 
A
Q
 
-
Y
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
V
E
 
E
A
|
A
I
x
M
G
|
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
A
 
P
R
 
L
D
 
R
Y
 
L
I
 
V
I
 
L
K
 
P
L
 
A
I
 
L
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
P
I
 
L
I
 
I
T
 
T
A
|
A
N
|
N
K
 
K
E
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
A
K
 
E
H
 
A
G
 
W
A
 
E
E
 
S
L
 
L
E
 
R
K
 
P
L
 
F
A
 
A
K
 
E
E
 
E
Y
 
G
Q
 
L
V
 
I
Y
 
Y
L
 
-
G
 
-
F
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
S
V
 
V
G
 
M
G
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
P
I
 
A
V
 
L
N
 
S
S
 
F
F
 
L
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
R
T
 
G
T
 
S
T
 
E
P
 
-
I
 
L
R
 
L
S
 
E
V
 
L
S
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
|
N
G
|
G
T
|
T
T
 
T
N
 
L
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
M
 
M
K
 
-
E
 
E
K
 
K
N
 
G
R
 
R
Q
 
T
F
 
Y
D
 
A
D
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
V
 
R
L
 
L
G
|
G
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
A
 
A
D
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
L
D
|
D
I
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
I
D
|
D
A
 
A
L
 
A
Y
 
H
K
|
K
I
 
L
R
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
L
F
 
V
N
 
D
E
 
P
-
 
G
W
 
F
P
 
P
R
 
F
E
 
A
E
 
E
N
 
-
F
 
V
S
 
E
C
 
A
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
A
G
 
R
M
 
L
E
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
V
I
 
L
E
 
Q
F
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
L
 
E
T
 
R
I
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
S
T
 
L
A
 
F
N
 
G
E
 
E
D
 
G
G
 
G
V
 
R
I
 
W
S
 
R
G
 
A
F
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
S
 
R
F
 
R
V
 
L
T
 
P
Q
 
Q
T
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Y
 
A
N
 
R
I
 
A
N
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7f4cA The crystal structure of the immature holo-enzyme of homoserine dehydrogenase complexed with NADP and 1,4-butandiol from the hyperthermophilic archaeon sulfurisphaera tokodaii. (see paper)
36% identity, 58% coverage: 81:316/410 of query aligns to 81:297/300 of 7f4cA

query
sites
7f4cA
E
 
E
P
 
P
A
 
S
R
 
L
D
 
S
Y
 
L
I
 
Y
I
 
K
K
 
E
L
 
A
I
 
I
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
T
 
V
S
 
N
I
 
I
I
 
I
T
 
T
A
x
T
N
 
N
K
|
K
E
 
A
L
 
P
I
 
L
A
 
A
K
 
L
H
 
A
G
 
F
A
 
N
E
 
E
L
 
I
E
 
F
K
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
S
Y
 
K
Q
 
G
V
 
V
Y
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
A
x
G
A
 
T
V
 
V
G
 
M
G
x
S
G
 
G
I
 
T
P
 
P
I
 
S
V
 
I
N
 
N
S
 
L
F
 
Y
K
 
R
T
 
V
L
 
L
F
 
P
T
 
G
T
 
S
T
 
R
P
 
V
I
 
I
R
 
K
S
 
-
V
 
I
S
 
R
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
T
 
T
N
 
N
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
L
M
 
M
K
 
-
E
 
N
K
 
K
N
 
G
R
 
V
Q
 
S
F
 
F
D
 
E
D
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
V
 
R
L
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
L
D
 
D
I
 
I
E
 
N
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
A
Y
 
A
K
 
K
I
 
I
R
 
T
I
 
I
L
 
L
S
 
A
R
 
N
L
 
F
A
 
M
F
 
I
N
 
G
E
 
N
W
 
S
P
 
V
R
 
T
E
 
I
E
 
K
N
 
D
F
 
V
S
 
K
C
 
F
K
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
N
G
 
-
M
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
Q
 
R
G
 
D
L
 
L
T
 
K
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
-
T
 
Y
A
 
A
N
 
D
E
 
E
D
 
K
G
 
E
V
 
V
I
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
W
V
 
V
S
 
K
P
 
P
S
 
L
F
 
P
V
 
I
T
 
S
Q
 
Q
T
 
D
H
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
I
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
E
N
 
N
G
 
A
V
 
L
C
 
E
I
 
I
D
 
T
G
 
T
E
 
D
T
 
-
V
 
I
D
 
Q
C
 
S
I
 
I
T
 
L
M
 
I
S
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
 
P
E
 
V
A
 
N
T
x
A
A
 
A
N
 
Y
S
 
G
M
 
A
V
 
L
E
 
S
D
 
D
F
 
L
V
 
I
L
 
L
H
 
L
E
 
K
Q
 
R

Sites not aligning to the query:

5x9dA Crystal structure of homoserine dehydrogenase in complex with l- cysteine and NAD (see paper)
36% identity, 58% coverage: 81:316/410 of query aligns to 81:299/302 of 5x9dA

query
sites
5x9dA
E
 
E
P
|
P
A
 
S
R
 
L
D
 
S
Y
 
L
I
 
Y
I
 
K
K
 
E
L
 
A
I
 
I
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
T
 
V
S
 
N
I
 
I
I
 
I
T
 
T
A
x
T
N
|
N
K
|
K
E
 
A
L
 
P
I
 
L
A
 
A
K
 
L
H
 
A
G
 
F
A
 
N
E
 
E
L
 
I
E
 
F
K
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
S
Y
 
K
Q
 
G
V
 
V
Y
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
A
x
G
A
 
T
V
 
V
G
 
M
G
x
S
G
 
G
I
 
T
P
 
P
I
 
S
V
 
I
N
 
N
S
 
L
F
 
Y
K
 
R
T
 
V
L
 
L
F
 
P
T
 
G
T
 
S
T
 
R
P
 
V
I
 
I
R
 
K
S
 
-
V
 
I
S
 
R
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
|
N
G
|
G
T
|
T
T
 
T
N
 
N
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
L
M
 
M
K
 
-
E
 
N
K
 
K
N
 
G
R
 
V
Q
 
S
F
 
F
D
 
E
D
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
Q
V
 
R
L
 
R
G
 
G
Y
|
Y
A
|
A
E
|
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
T
 
T
D
 
L
D
|
D
I
 
I
E
 
N
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
A
 
A
L
 
A
Y
 
A
K
|
K
I
 
I
R
 
T
I
 
I
L
 
L
S
 
A
R
 
N
L
 
F
A
 
M
F
 
I
N
 
G
E
 
N
W
 
S
P
 
V
R
 
T
E
 
I
E
 
K
N
 
D
F
 
V
S
 
K
C
 
F
K
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
N
G
 
-
M
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
R
E
 
D
R
 
P
Q
 
K
G
 
N
L
 
E
T
 
K
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
-
T
 
Y
A
 
A
N
 
D
E
 
E
D
 
K
G
 
E
V
 
V
I
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
W
V
 
V
S
 
K
P
 
P
S
 
L
F
 
P
V
 
I
T
 
S
Q
 
Q
T
 
-
H
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
I
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
E
N
 
N
G
 
A
V
 
L
C
 
E
I
 
I
D
 
T
G
 
T
E
 
D
T
 
-
V
 
I
D
 
Q
C
 
S
I
 
I
T
 
L
M
 
I
S
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
|
A
G
|
G
K
 
P
E
 
V
A
 
N
T
x
A
A
 
A
N
 
Y
S
 
G
M
 
A
V
 
L
E
 
S
D
 
D
F
 
L
V
 
I
L
 
L
H
 
L
E
 
K
Q
 
R

Sites not aligning to the query:

4xb1A Hyperthermophilic archaeal homoserine dehydrogenase in complex with NADPH (see paper)
33% identity, 53% coverage: 94:312/410 of query aligns to 108:309/319 of 4xb1A

query
sites
4xb1A
G
 
G
T
 
I
S
 
S
I
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
S
N
 
N
K
|
K
E
 
P
L
 
P
I
 
I
A
 
A
K
 
N
H
 
Y
G
 
Y
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
M
K
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
Y
 
N
Q
 
N
V
 
A
Y
 
G
L
 
I
G
 
F
F
 
F
E
 
E
A
x
S
A
 
T
V
 
V
G
 
M
G
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
G
S
 
V
F
 
L
K
 
R
T
 
E
L
 
N
F
 
L
T
 
L
T
 
G
T
 
E
P
 
N
I
 
I
R
 
K
S
 
R
V
 
I
S
 
D
G
 
A
I
 
V
L
 
V
N
 
N
G
 
A
T
 
S
T
 
T
N
 
T
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
K
M
 
M
K
 
S
E
 
E
K
 
-
N
 
G
R
 
K
Q
 
T
F
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
A
L
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
I
A
 
L
E
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
K
D
 
D
I
 
I
E
 
D
G
 
G
Y
 
I
D
|
D
A
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
K
|
K
I
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
H
R
 
W
L
 
V
A
 
S
F
 
Y
N
 
G
E
 
E
W
 
P
P
 
P
R
 
E
E
 
E
E
 
E
N
 
-
F
 
-
S
 
-
C
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
R
I
 
L
E
 
G
F
 
I
A
 
R
E
 
E
-
 
V
R
 
R
Q
 
D
G
 
A
L
 
R
T
 
N
I
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
T
 
V
A
 
S
N
 
K
E
 
-
D
 
-
G
 
G
V
 
K
I
 
I
S
 
S
G
 
-
F
 
-
V
 
V
S
 
K
P
 
P
S
 
R
F
 
K
V
 
L
T
 
S
Q
 
S
T
 
D
H
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
N
 
-
I
 
V
N
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
N
 
N
G
 
A
V
 
A
C
 
V
I
 
I
D
 
R
G
 
T
E
 
N
T
 
N
V
 
L
D
 
G
C
 
E
I
 
V
T
 
I
M
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
x
G
G
 
G
K
 
G
E
 
R
A
 
V
T
|
T
A
 
A
N
 
S
S
 
G
M
 
V
V
 
F
E
 
T
D
 
D
F
 
I
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4xb2A Hyperthermophilic archaeal homoserine dehydrogenase mutant in complex with NADPH (see paper)
33% identity, 53% coverage: 94:312/410 of query aligns to 108:309/319 of 4xb2A

query
sites
4xb2A
G
 
G
T
 
I
S
 
S
I
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
S
N
|
N
K
|
K
E
 
P
L
 
P
I
 
I
A
 
A
K
 
N
H
 
Y
G
 
Y
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
M
K
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
Y
 
N
Q
 
N
V
 
A
Y
 
G
L
 
I
G
 
F
F
 
F
E
 
E
A
x
S
A
 
T
V
 
V
G
 
M
G
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
G
S
 
V
F
 
L
K
 
R
T
 
E
L
 
N
F
 
L
T
 
L
T
 
G
T
 
E
P
 
N
I
 
I
R
 
K
S
 
R
V
 
I
S
 
D
G
 
A
I
 
V
L
 
V
N
 
N
G
x
A
T
x
S
T
 
T
N
 
T
Y
 
F
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
K
M
 
M
K
 
S
E
 
E
K
 
-
N
 
G
R
 
K
Q
 
T
F
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
A
L
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
I
A
 
L
E
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
T
 
S
D
 
K
D
|
D
I
 
I
E
 
D
G
 
G
Y
 
I
D
|
D
A
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
K
|
K
I
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
H
R
 
W
L
 
V
A
 
S
F
 
Y
N
 
G
E
 
E
W
 
P
P
 
P
R
 
E
E
 
E
E
 
E
N
 
-
F
 
-
S
 
-
C
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
R
I
 
L
E
 
G
F
 
I
A
 
R
E
 
E
-
 
V
R
 
R
Q
 
D
G
 
A
L
 
R
T
 
N
I
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
T
 
V
A
 
S
N
 
K
E
 
-
D
 
-
G
 
G
V
 
K
I
 
I
S
 
S
G
 
-
F
 
-
V
 
V
S
 
K
P
 
P
S
 
R
F
 
K
V
 
L
T
 
S
Q
 
S
T
 
D
H
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
N
 
-
I
 
V
N
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
N
 
N
G
 
A
V
 
A
C
 
V
I
 
I
D
 
R
G
 
T
E
 
N
T
 
N
V
 
L
D
 
G
C
 
E
I
 
V
T
 
I
M
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
x
G
G
 
G
K
 
G
E
 
R
A
 
V
T
|
T
A
 
A
N
 
S
S
 
G
M
 
V
V
 
F
E
 
T
D
 
D
F
 
I
V
 
I

Sites not aligning to the query:

O81852 Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2, chloroplastic; AK-HD 2; AK-HSDH 2; Beta-aspartyl phosphate homoserine 2; EC 2.7.2.4; EC 1.1.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 78% coverage: 2:319/410 of query aligns to 558:913/916 of O81852

query
sites
O81852
L
 
L
S
 
A
I
 
M
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
P
G
 
G
T
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
T
V
 
L
Y
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
T
 
R
S
 
D
S
 
Q
K
 
A
E
 
A
E
 
V
L
 
L
Q
 
K
S
 
Q
A
 
E
L
 
F
K
 
N
K
 
I
E
 
D
I
 
L
Q
 
R
V
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
S
K
 
K
K
 
K
V
 
M
L
 
L
V
 
L
R
 
S
D
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
R
C
 
W
K
 
R
K
 
E
E
 
L
R
 
L
N
 
N
N
 
E
Q
 
K
G
 
G
A
 
T
K
 
E
Q
 
A
C
 
D
M
 
L
T
 
D
S
 
K
D
 
F
P
 
T
V
 
Q
N
 
Q
F
 
V
F
 
H
Q
 
G
N
 
N
Q
 
H
Y
 
F
-
 
I
-
 
P
-
 
N
D
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
V
E
 
D
A
 
C
I
 
T
G
 
A
G
 
D
V
 
S
E
 
A
P
 
I
A
 
A
R
 
S
D
 
R
Y
 
Y
I
 
Y
I
 
-
K
 
D
L
 
W
I
 
L
Q
 
R
A
 
K
G
 
G
T
 
I
S
 
H
I
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
 
K
E
 
K
L
 
-
I
 
-
A
 
A
K
 
N
H
 
S
G
 
G
A
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
Y
-
 
L
E
 
K
L
 
L
E
 
R
K
 
D
L
 
L
A
 
Q
K
 
R
E
 
K
Y
 
S
Q
 
Y
V
 
T
Y
 
H
L
 
Y
G
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
S
S
 
T
F
 
L
K
 
R
T
 
G
L
 
L
F
 
L
T
 
E
T
 
T
-
 
G
T
 
D
P
 
K
I
 
I
R
 
L
S
 
R
V
 
I
S
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
C
N
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
I
 
L
L
 
F
T
 
N
E
 
N
M
 
F
K
 
V
E
 
-
K
 
G
N
 
D
R
 
R
Q
 
S
F
 
F
D
 
S
D
 
E
V
 
V
L
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
N
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
A
 
T
E
 
E
A
 
P
D
 
D
P
 
P
T
 
R
D
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
S
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
A
 
V
L
 
A
Y
 
R
K
 
K
I
 
V
R
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
A
R
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
K
L
 
L
A
 
D
F
 
L
N
 
A
E
 
D
W
 
L
P
 
P
R
 
I
E
 
R
E
 
S
N
 
L
F
 
V
-
 
P
-
 
E
S
 
P
C
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
C
S
 
T
G
 
S
M
 
V
E
 
E
V
 
E
E
 
F
A
 
M
I
 
E
E
 
K
F
 
L
A
 
P
E
 
Q
R
 
Y
Q
 
D
G
 
G
L
 
D
T
 
L
I
 
A
K
 
K
-
 
E
-
 
R
L
 
L
I
 
D
A
 
A
K
 
E
T
 
N
A
 
S
N
 
G
E
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
Y
D
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
Q
-
 
K
G
 
G
F
 
T
V
 
V
S
 
E
P
 
L
S
 
R
F
 
R
V
 
Y
T
 
K
Q
 
K
T
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
F
Y
 
A
N
 
Q
I
 
L
N
 
A
G
 
G
V
 
S
T
 
D
N
 
N
G
 
I
V
 
I
C
 
A
I
 
F
D
 
T
G
 
T
E
 
T
T
 
R
V
 
Y
-
 
K
-
 
D
D
 
H
C
 
P
I
 
L
T
 
I
M
 
V
S
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
A
E
 
Q
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
G
S
 
G
M
 
I
V
 
F
E
 
S
D
 
D
F
 
I
V
 
L
L
 
R
H
 
L
E
 
A
Q
 
S
F
 
Y
Q
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P31116 Homoserine dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.3 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
25% identity, 58% coverage: 1:237/410 of query aligns to 5:258/359 of P31116

query
sites
P31116
M
 
V
L
 
V
S
 
N
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
|
I
G
|
G
Y
x
A
G
|
G
T
x
V
V
|
V
G
|
G
S
|
S
G
 
A
V
 
F
Y
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
S
 
A
S
 
M
K
 
K
E
 
S
E
 
T
L
 
I
Q
 
T
S
 
Y
A
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
L
E
 
L
I
 
A
Q
 
E
V
 
A
K
 
E
K
 
R
V
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
 
S
D
 
D
C
 
W
K
 
K
K
 
A
E
 
A
R
 
L
N
 
A
N
 
A
Q
 
S
G
 
T
A
 
T
K
 
K
Q
 
T
C
 
L
M
 
P
T
 
L
S
 
D
D
 
D
P
 
L
V
 
I
N
 
A
F
 
H
F
 
L
Q
 
K
N
 
T
Q
 
S
Y
 
P
D
 
K
V
 
P
V
 
V
F
 
I
E
 
-
A
 
L
I
 
V
G
 
D
G
 
N
V
x
T
E
 
S
P
 
S
A
 
A
-
 
Y
-
 
I
R
 
A
D
 
G
Y
 
F
I
 
Y
I
 
T
K
 
K
L
 
F
I
 
V
Q
 
E
A
 
N
G
 
G
T
 
I
S
 
S
I
 
I
I
 
A
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
|
K
E
 
K
L
 
A
I
 
F
A
 
S
K
 
S
H
 
D
G
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
W
E
 
K
K
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
S
A
 
N
K
 
K
E
 
P
Y
 
T
Q
 
N
V
 
G
Y
 
F
L
 
V
G
 
Y
F
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
S
S
 
F
F
 
L
K
 
R
T
 
E
L
 
I
F
 
I
T
 
Q
T
 
T
-
 
G
T
 
D
P
 
E
I
 
V
R
 
E
S
 
K
V
 
I
S
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
F
N
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
I
 
I
L
 
F
T
 
N
E
 
E
M
 
F
-
 
S
-
 
T
-
 
S
K
 
Q
E
 
A
K
 
N
N
 
D
R
 
V
Q
 
K
F
 
F
D
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
V
A
 
A
K
 
K
V
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
E
|
E
A
 
P
D
 
D
P
 
P
T
 
R
D
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
|
D
A
 
V
L
 
A
Y
 
R
K
|
K
I
 
V
R
 
T
I
 
I
L
 
V
S
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
S
F
 
G
N
 
V
E
 
E
W
 
V
P
 
E
R
 
S
E
 
P
E
 
T
N
 
S
F
 
F
S
 
P
C
 
V
K
 
Q
G
 
S
I
 
L
S
 
I
G
 
P
M
 
K
E
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
S
I
 
V
E
 
K
F
 
S
A
 
A
E
 
D

1tveA Homoserine dehydrogenase in complex with 4-(4-hydroxy-3- isopropylphenylthio)-2-isopropylphenol (see paper)
25% identity, 58% coverage: 1:237/410 of query aligns to 4:257/358 of 1tveA

query
sites
1tveA
M
 
V
L
 
V
S
 
N
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
A
V
 
F
Y
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
S
 
A
S
 
M
K
 
K
E
 
S
E
 
T
L
 
I
Q
 
T
S
 
Y
A
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
L
E
 
L
I
 
A
Q
 
E
V
 
A
K
 
E
K
 
R
V
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
 
S
D
 
D
C
 
W
K
 
K
K
 
A
E
 
A
R
 
L
N
 
A
N
 
A
Q
 
S
G
 
T
A
 
T
K
 
K
Q
 
T
C
 
L
M
 
P
T
 
L
S
 
D
D
 
D
P
 
L
V
 
I
N
 
A
F
 
H
F
 
L
Q
 
K
N
 
T
Q
 
S
Y
 
P
D
 
K
V
 
P
V
 
V
F
 
I
E
 
-
A
 
L
I
 
V
G
 
D
G
 
N
V
 
T
E
x
S
P
 
S
A
 
A
-
 
Y
-
 
I
R
 
A
D
 
G
Y
 
F
I
 
Y
I
 
T
K
 
K
L
 
F
I
 
V
Q
 
E
A
 
N
G
 
G
T
 
I
S
 
S
I
 
I
I
 
A
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
|
K
E
 
K
L
 
A
I
 
F
A
 
S
K
 
S
H
 
D
G
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
W
E
 
K
K
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
S
A
 
N
K
 
K
E
 
P
Y
 
T
Q
 
N
V
 
G
Y
 
F
L
 
V
G
 
Y
F
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
S
S
 
F
F
 
L
K
 
R
T
 
E
L
 
I
F
 
I
T
 
Q
T
 
T
-
 
G
T
 
D
P
 
E
I
 
V
R
 
E
S
 
K
V
 
I
S
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
F
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
I
 
I
L
 
F
T
 
N
E
 
E
M
 
F
-
 
S
-
 
T
-
 
S
K
 
Q
E
 
A
K
 
N
N
 
D
R
 
V
Q
 
K
F
 
F
D
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
V
A
 
A
K
 
K
V
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
E
 
E
A
 
P
D
 
D
P
 
P
T
 
R
D
 
D
D
|
D
I
 
L
E
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
|
D
A
 
V
L
 
A
Y
 
R
K
|
K
I
 
V
R
 
T
I
 
I
L
 
V
S
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
S
F
 
G
N
 
V
E
 
E
W
 
V
P
 
E
R
 
S
E
 
P
E
 
T
N
 
S
F
 
F
S
 
P
C
 
V
K
 
Q
G
 
S
I
 
L
S
 
I
G
 
P
M
 
K
E
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
S
I
 
V
E
 
K
F
 
S
A
 
A
E
 
D

1q7gA Homoserine dehydrogenase in complex with suicide inhibitor complex NAD-5-hydroxy-4-oxonorvaline (see paper)
25% identity, 58% coverage: 1:237/410 of query aligns to 4:257/358 of 1q7gA

query
sites
1q7gA
M
 
V
L
 
V
S
 
N
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
Y
 
A
G
|
G
T
x
V
V
|
V
G
 
G
S
 
S
G
 
A
V
 
F
Y
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
S
 
A
S
 
M
K
 
K
E
 
S
E
 
T
L
 
I
Q
 
T
S
 
Y
A
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
L
E
 
L
I
 
A
Q
x
E
V
 
A
K
 
E
K
 
R
V
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
 
S
D
 
D
C
 
W
K
 
K
K
 
A
E
 
A
R
 
L
N
 
A
N
 
A
Q
 
S
G
 
T
A
 
T
K
 
K
Q
 
T
C
 
L
M
 
P
T
 
L
S
 
D
D
 
D
P
 
L
V
 
I
N
 
A
F
 
H
F
 
L
Q
 
K
N
 
T
Q
 
S
Y
 
P
D
 
K
V
 
P
V
 
V
F
 
I
E
 
-
A
 
L
I
 
V
G
 
D
G
x
N
V
x
T
E
x
S
P
 
S
A
 
A
-
 
Y
-
x
I
R
 
A
D
 
G
Y
 
F
I
 
Y
I
 
T
K
 
K
L
 
F
I
 
V
Q
 
E
A
 
N
G
 
G
T
 
I
S
 
S
I
 
I
I
 
A
T
 
T
A
x
P
N
 
N
K
|
K
E
 
K
L
 
A
I
 
F
A
 
S
K
 
S
H
 
D
G
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
W
E
 
K
K
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
S
A
 
N
K
 
K
E
 
P
Y
 
T
Q
 
N
V
 
G
Y
 
F
L
 
V
G
 
Y
F
 
H
E
 
E
A
|
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
S
S
 
F
F
 
L
K
 
R
T
 
E
L
 
I
F
 
I
T
 
Q
T
 
T
-
 
G
T
 
D
P
 
E
I
 
V
R
 
E
S
 
K
V
 
I
S
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
F
N
x
S
G
 
G
T
 
T
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
I
 
I
L
 
F
T
 
N
E
 
E
M
 
F
-
 
S
-
 
T
-
 
S
K
 
Q
E
 
A
K
 
N
N
 
D
R
 
V
Q
 
K
F
 
F
D
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
V
A
 
A
K
 
K
V
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
E
 
E
A
 
P
D
 
D
P
 
P
T
 
R
D
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
|
D
A
 
V
L
 
A
Y
 
R
K
|
K
I
 
V
R
 
T
I
 
I
L
 
V
S
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
S
F
 
G
N
 
V
E
 
E
W
 
V
P
 
E
R
 
S
E
 
P
E
 
T
N
 
S
F
 
F
S
 
P
C
 
V
K
 
Q
G
 
S
I
 
L
S
 
I
G
 
P
M
 
K
E
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
S
I
 
V
E
 
K
F
 
S
A
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

1ebuD Homoserine dehydrogenase complex with NAD analogue and l-homoserine (see paper)
25% identity, 58% coverage: 1:237/410 of query aligns to 4:257/358 of 1ebuD

query
sites
1ebuD
M
 
V
L
 
V
S
 
N
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
G
|
G
Y
x
A
G
|
G
T
x
V
V
|
V
G
 
G
S
 
S
G
 
A
V
 
F
Y
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
S
 
A
S
 
M
K
 
K
E
 
S
E
 
T
L
 
I
Q
 
T
S
 
Y
A
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
L
E
 
L
I
 
A
Q
x
E
V
x
A
K
 
E
K
 
R
V
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
 
S
D
 
D
C
 
W
K
 
K
K
 
A
E
 
A
R
 
L
N
 
A
N
 
A
Q
 
S
G
 
T
A
 
T
K
 
K
Q
 
T
C
 
L
M
 
P
T
 
L
S
 
D
D
 
D
P
 
L
V
 
I
N
 
A
F
 
H
F
 
L
Q
 
K
N
 
T
Q
 
S
Y
 
P
D
 
K
V
 
P
V
 
V
F
 
I
E
 
-
A
 
L
I
 
V
G
 
D
G
x
N
V
 
T
E
x
S
P
 
S
A
 
A
-
 
Y
-
 
I
R
 
A
D
 
G
Y
 
F
I
 
Y
I
 
T
K
 
K
L
 
F
I
 
V
Q
 
E
A
 
N
G
 
G
T
 
I
S
 
S
I
 
I
I
 
A
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
|
K
E
 
K
L
 
A
I
 
F
A
 
S
K
 
S
H
 
D
G
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
W
E
 
K
K
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
S
A
 
N
K
 
K
E
 
P
Y
 
T
Q
 
N
V
 
G
Y
 
F
L
 
V
G
 
Y
F
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
S
S
 
F
F
 
L
K
 
R
T
 
E
L
 
I
F
 
I
T
 
Q
T
 
T
-
 
G
T
 
D
P
 
E
I
 
V
R
 
E
S
 
K
V
 
I
S
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
F
N
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
I
 
I
L
 
F
T
 
N
E
 
E
M
 
F
-
 
S
-
 
T
-
 
S
K
 
Q
E
 
A
K
 
N
N
 
D
R
 
V
Q
 
K
F
 
F
D
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
V
A
 
A
K
 
K
V
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
E
 
E
A
 
P
D
 
D
P
 
P
T
 
R
D
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
|
D
A
 
V
L
 
A
Y
 
R
K
|
K
I
 
V
R
 
T
I
 
I
L
 
V
S
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
S
F
 
G
N
 
V
E
 
E
W
 
V
P
 
E
R
 
S
E
 
P
E
 
T
N
 
S
F
 
F
S
 
P
C
 
V
K
 
Q
G
 
S
I
 
L
S
 
I
G
 
P
M
 
K
E
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
S
I
 
V
E
 
K
F
 
S
A
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

1ebfA Homoserine dehydrogenase from s. Cerevisiae complex with NAD+ (see paper)
25% identity, 58% coverage: 1:237/410 of query aligns to 4:257/358 of 1ebfA

query
sites
1ebfA
M
 
V
L
 
V
S
 
N
I
 
V
G
 
A
I
 
V
I
|
I
G
 
G
Y
x
A
G
|
G
T
x
V
V
|
V
G
 
G
S
 
S
G
 
A
V
 
F
Y
 
L
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
S
 
A
S
 
M
K
 
K
E
 
S
E
 
T
L
 
I
Q
 
T
S
 
Y
A
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
L
E
 
L
I
 
A
Q
x
E
V
x
A
K
 
E
K
 
R
V
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
 
S
D
 
D
C
 
W
K
 
K
K
 
A
E
 
A
R
 
L
N
 
A
N
 
A
Q
 
S
G
 
T
A
 
T
K
 
K
Q
 
T
C
 
L
M
 
P
T
 
L
S
 
D
D
 
D
P
 
L
V
 
I
N
 
A
F
 
H
F
 
L
Q
 
K
N
 
T
Q
 
S
Y
 
P
D
 
K
V
 
P
V
 
V
F
 
I
E
 
-
A
 
L
I
 
V
G
 
D
G
 
N
V
x
T
E
x
S
P
 
S
A
 
A
-
 
Y
-
 
I
R
 
A
D
 
G
Y
 
F
I
 
Y
I
 
T
K
 
K
L
 
F
I
 
V
Q
 
E
A
 
N
G
 
G
T
 
I
S
 
S
I
 
I
I
 
A
T
 
T
A
x
P
N
 
N
K
 
K
E
 
K
L
 
A
I
 
F
A
 
S
K
 
S
H
 
D
G
 
L
A
 
A
E
 
T
L
 
W
E
 
K
K
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
S
A
 
N
K
 
K
E
 
P
Y
 
T
Q
 
N
V
 
G
Y
 
F
L
 
V
G
 
Y
F
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
S
S
 
F
F
 
L
K
 
R
T
 
E
L
 
I
F
 
I
T
 
Q
T
 
T
-
 
G
T
 
D
P
 
E
I
 
V
R
 
E
S
 
K
V
 
I
S
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
F
N
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
L
N
 
S
Y
 
Y
I
 
I
L
 
F
T
 
N
E
 
E
M
 
F
-
 
S
-
 
T
-
 
S
K
 
Q
E
 
A
K
 
N
N
 
D
R
 
V
Q
 
K
F
 
F
D
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
V
A
 
A
K
 
K
V
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
E
 
E
A
 
P
D
 
D
P
 
P
T
 
R
D
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
|
D
A
 
V
L
 
A
Y
 
R
K
|
K
I
 
V
R
 
T
I
 
I
L
 
V
S
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
S
F
 
G
N
 
V
E
 
E
W
 
V
P
 
E
R
 
S
E
 
P
E
 
T
N
 
S
F
 
F
S
 
P
C
 
V
K
 
Q
G
 
S
I
 
L
S
 
I
G
 
P
M
 
K
E
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
S
I
 
V
E
 
K
F
 
S
A
 
A
E
 
D

O94671 Probable homoserine dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.3 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
35% identity, 30% coverage: 89:210/410 of query aligns to 110:239/376 of O94671

query
sites
O94671
K
 
K
L
 
F
I
 
L
Q
 
S
A
 
K
G
 
K
T
 
I
S
 
N
I
 
I
I
 
A
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
 
K
E
 
K
L
 
A
I
 
F
A
 
S
K
 
A
H
 
S
G
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
Y
A
 
Q
E
 
N
L
 
I
E
 
I
K
 
K
L
 
A
A
 
S
K
 
K
E
 
E
Y
 
S
Q
 
G
V
 
A
Y
 
L
L
 
L
G
 
M
F
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
S
S
 
T
F
 
L
K
 
K
T
 
E
L
 
L
F