SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_181403700.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_181403700.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3fcpA Crystal structure of muconate lactonizing enzyme from klebsiella pneumoniae
92% identity, 96% coverage: 16:386/387 of query aligns to 1:356/356 of 3fcpA

query
sites
3fcpA
M
 
L
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
I
 
I
E
 
E
S
 
S
W
 
W
I
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
I
R
 
-
P
 
-
H
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
-
M
 
-
G
 
-
C
 
C
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
S
D
 
D
G
 
G
I
 
I
C
 
C
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
T
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
I
S
 
S
S
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
A
 
A
D
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
G
A
 
A
I
 
I
R
 
K
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
W
 
W
T
|
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
E
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
R
 
R
H
 
H
T
 
T
R
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
C
 
C
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
H
D
 
D
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
H
 
Q
I
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
|
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
K
|
K
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
N
S
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
M
|
M
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
H
A
 
A
W
 
W
S
 
S
T
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
T
|
T
E
|
E
M
|
M
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
T
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
L
R
 
H
F
 
F
Y
 
Y
S
 
T
R
 
R
K
 
Q

3dgbA Crystal structure of muconate lactonizing enzyme from pseudomonas fluorescens complexed with muconolactone (see paper)
57% identity, 95% coverage: 18:385/387 of query aligns to 3:371/371 of 3dgbA

query
sites
3dgbA
A
 
S
T
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
S
I
 
I
E
 
E
S
 
T
W
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
R
 
R
P
 
P
H
|
H
K
 
K
L
 
L
S
 
A
M
 
M
T
 
H
T
 
T
M
 
M
G
 
Q
C
 
N
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
I
R
 
R
L
 
L
T
 
R
R
 
C
S
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
C
 
E
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
S
T
 
T
T
|
T
I
|
I
G
 
G
G
|
G
L
 
L
S
 
A
Y
|
Y
G
 
G
V
 
N
E
 
E
S
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
S
I
 
I
S
 
K
S
 
T
A
 
N
I
 
I
T
 
D
H
 
R
Y
 
F
L
 
V
T
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
Q
P
 
D
A
 
A
D
 
S
N
 
N
L
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
A
T
 
M
A
 
L
R
 
R
M
 
L
N
 
E
S
 
Q
A
 
S
I
 
I
R
 
R
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
S
A
 
G
I
 
I
E
 
E
T
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
V
Q
 
R
T
 
D
S
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
A
W
 
W
T
|
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
A
E
 
Q
K
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
D
E
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
H
Q
 
R
A
 
I
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
G
E
 
E
L
 
V
A
 
D
T
 
R
D
 
D
L
 
L
R
 
A
H
 
H
T
 
V
R
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
K
E
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
V
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
D
 
D
A
 
E
A
 
A
T
 
V
G
 
A
A
 
L
K
 
R
G
 
A
C
 
C
R
 
R
E
 
I
L
 
L
A
 
G
A
 
G
M
 
N
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
S
 
S
A
 
R
H
 
N
D
 
N
N
 
R
A
 
A
A
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
N
Q
 
A
H
 
S
I
 
S
E
 
P
T
 
A
A
 
P
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
x
I
A
 
E
T
 
C
A
 
V
Y
 
E
D
 
D
G
 
A
Y
 
F
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
F
 
A
T
 
A
G
 
S
A
 
V
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
|
K
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
N
G
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
R
S
 
A
V
 
T
L
 
L
A
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
M
|
M
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
G
V
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
A
H
|
H
A
 
A
W
 
F
S
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
N
P
 
K
L
 
L
Q
 
S
W
 
W
G
 
D
T
|
T
E
|
E
M
x
L
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
T
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
L
S
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
P
T
 
V
F
 
Y
A
 
R
D
 
D
G
 
F
Q
 
H
V
 
L
A
 
H
L
 
V
P
 
S
Q
 
K
T
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
A
F
 
F
Y
 
F
S
 
R
R
 
R

1f9cA Crystal structure of mle d178n variant (see paper)
54% identity, 95% coverage: 17:385/387 of query aligns to 1:360/360 of 1f9cA

query
sites
1f9cA
T
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
D
S
 
A
W
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
P
 
Q
H
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
-
M
 
-
G
 
-
C
 
-
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
V
T
 
R
R
 
C
S
 
S
D
 
D
G
 
G
I
 
V
C
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
T
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
Y
E
 
E
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
G
I
 
I
S
 
K
S
 
A
A
 
N
I
 
I
T
 
D
H
 
A
Y
 
H
L
 
L
T
 
A
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
A
A
 
A
D
 
D
N
 
N
L
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
A
T
 
M
A
 
L
R
 
K
M
 
L
N
 
D
S
 
A
A
 
L
I
 
A
R
 
K
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
S
A
 
G
I
 
I
E
 
E
T
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
V
Q
 
R
T
 
D
S
 
S
L
 
L
P
 
E
V
 
V
L
 
A
W
 
W
T
|
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
A
E
 
R
K
 
H
L
 
M
L
 
L
A
 
E
E
 
I
R
 
R
R
 
R
H
 
H
Q
 
R
A
 
V
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
N
E
 
P
L
 
V
A
 
E
T
 
Q
D
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
H
T
 
V
R
 
V
A
 
T
I
 
I
V
 
K
E
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
S
A
 
A
S
 
S
I
 
V
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
|
N
Q
 
Q
A
 
Y
W
 
W
D
 
D
A
 
E
A
 
S
T
 
Q
G
 
A
A
 
I
K
 
R
G
 
A
C
 
C
R
 
Q
E
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
D
M
 
N
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
S
 
S
A
 
R
H
 
I
D
 
N
N
 
R
A
 
G
A
 
G
L
 
Q
V
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
N
Q
 
Q
H
 
R
I
 
T
E
 
P
T
 
A
A
 
P
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
I
A
 
E
T
 
S
A
 
V
Y
 
E
D
 
D
G
 
A
Y
 
F
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
A
T
 
A
G
 
S
A
 
I
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
|
K
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
N
G
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
R
S
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
Q
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
M
|
M
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
S
V
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
A
H
 
H
A
 
A
W
 
F
S
 
L
T
 
T
L
 
L
-
 
R
P
 
Q
L
 
L
Q
 
T
W
 
W
G
 
G
T
|
T
E
|
E
M
x
L
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
T
D
 
E
D
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
N
V
 
E
P
 
P
L
 
P
T
 
Q
F
 
Y
A
 
R
D
 
D
G
 
F
Q
 
Q
V
 
L
A
 
H
L
 
I
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
D
 
A
K
 
R
L
 
L
R
 
A
F
 
R
Y
 
F
S
 
A
R
 
R

1nu5A Crystal structure of pseudomonas sp. P51 chloromuconate lactonizing enzyme (see paper)
47% identity, 95% coverage: 20:385/387 of query aligns to 3:368/369 of 1nu5A

query
sites
1nu5A
V
 
I
E
 
E
R
 
A
I
 
I
E
 
S
S
 
T
W
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
R
R
 
R
P
 
P
H
x
L
K
 
Q
L
 
M
S
 
S
M
 
F
T
 
T
T
 
T
M
 
V
G
 
H
C
 
K
Q
 
Q
T
 
S
L
 
Y
V
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
Q
L
 
V
T
 
-
R
 
K
S
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
L
C
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
G
T
 
G
T
x
S
I
 
V
G
 
G
G
|
G
L
 
P
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
V
 
S
E
 
E
S
 
S
P
 
A
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
K
S
 
V
A
 
I
I
 
I
T
 
D
H
 
N
Y
 
Y
L
 
L
T
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
D
A
 
A
D
 
S
N
 
N
L
 
L
N
 
S
A
 
Q
L
 
A
T
 
R
A
 
V
R
 
L
M
 
M
N
 
D
S
 
R
A
 
A
I
 
V
R
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
L
F
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
H
D
 
D
A
 
L
Q
 
K
G
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
M
Q
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
A
W
 
W
T
|
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
D
E
 
S
G
 
A
E
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
I
A
 
E
E
 
T
R
 
R
R
 
R
H
 
H
Q
 
N
A
 
R
F
 
F
K
|
K
L
 
V
K
|
K
I
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
T
L
 
P
A
 
A
T
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
x
E
H
 
H
T
 
I
R
 
R
A
 
S
I
 
I
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
S
 
S
I
 
V
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
D
 
D
A
 
E
A
 
Q
T
 
T
G
 
A
A
 
S
K
 
I
G
 
W
C
 
I
R
 
P
E
 
R
L
 
L
A
 
E
A
 
E
M
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
E
L
 
L
I
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
P
A
 
R
H
 
A
D
 
N
N
 
F
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
R
R
 
R
L
 
L
S
x
T
Q
 
E
H
 
Q
I
x
N
E
 
G
T
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
L
A
 
S
T
 
S
A
 
L
Y
 
S
D
 
S
G
 
A
Y
 
F
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
Q
 
D
G
 
H
F
 
A
T
 
V
G
 
D
A
 
A
Y
 
F
A
 
S
L
 
L
K
|
K
I
 
L
A
 
C
K
 
N
A
 
M
G
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
A
S
 
N
V
 
T
L
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
S
L
 
S
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
M
|
M
L
 
L
E
 
D
G
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
L
H
 
H
A
 
V
W
 
Y
S
 
A
T
 
T
L
 
L
P
 
P
-
 
S
L
 
L
Q
 
P
W
 
Y
G
 
G
T
x
C
E
|
E
M
x
L
F
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
W
L
 
V
L
 
L
K
 
G
D
 
D
D
 
R
I
 
L
V
 
T
S
 
Q
V
 
Q
P
 
D
L
 
L
T
 
E
F
 
I
A
 
K
D
 
D
G
 
F
Q
 
E
V
 
V
A
 
H
L
 
L
P
 
P
Q
 
L
T
 
G
P
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
H
D
 
D
K
 
K
L
 
V
R
 
R
F
 
H
Y
 
Y
S
 
T
R
 
R

2chrA A re-evaluation of the crystal structure of chloromuconate cycloisomerase (see paper)
43% identity, 95% coverage: 20:385/387 of query aligns to 3:368/370 of 2chrA

query
sites
2chrA
V
 
I
E
 
D
R
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
W
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
K
R
 
R
P
 
P
H
x
I
K
 
Q
L
 
M
S
 
S
M
 
I
T
 
T
T
 
T
M
 
V
G
 
H
C
 
Q
Q
 
Q
T
 
S
L
 
Y
V
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
Y
R
 
-
S
 
S
D
 
E
G
 
G
I
 
L
C
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
G
T
 
G
T
x
S
I
 
V
G
 
G
G
|
G
L
 
P
S
 
V
Y
 
W
G
 
S
V
 
A
E
 
E
S
 
C
P
 
A
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
K
S
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
E
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
T
 
A
P
 
P
L
 
H
L
 
L
K
 
L
G
 
G
L
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
F
N
 
N
L
 
V
N
 
S
A
 
G
L
 
A
T
 
L
A
 
Q
R
 
T
M
 
M
N
 
A
S
 
R
A
 
A
I
 
V
R
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
A
F
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
L
Q
 
K
G
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
V
P
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
P
L
 
L
Q
 
R
T
 
S
S
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
A
W
 
W
T
|
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
K
K
 
R
D
 
D
I
 
L
A
 
D
E
 
S
G
 
A
E
 
V
K
 
E
L
 
M
L
 
I
A
 
E
E
 
R
R
 
R
R
 
R
H
 
H
Q
 
N
A
 
R
F
 
F
K
|
K
L
 
V
K
|
K
I
 
L
G
 
G
A
 
F
R
 
R
E
 
S
L
 
P
A
 
Q
T
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
I
H
 
H
T
 
M
R
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
S
E
 
N
A
 
S
L
 
L
G
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
A
S
 
Y
I
 
L
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
D
 
D
A
 
E
A
 
Q
T
 
V
G
 
A
A
 
S
K
 
V
G
 
Y
C
 
I
R
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
E
L
 
L
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
G
A
 
R
H
 
E
D
 
N
N
 
T
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
H
 
N
I
 
N
E
 
R
T
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
L
A
 
S
T
 
T
A
 
L
Y
 
A
D
 
S
G
 
A
Y
 
F
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
Q
 
D
G
 
R
F
 
S
T
 
V
G
 
D
A
 
V
Y
 
F
A
x
S
L
 
L
K
|
K
I
 
L
A
 
C
K
 
N
A
 
M
G
 
G
G
 
G
P
 
V
N
 
S
S
 
A
V
 
T
L
 
Q
A
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
A
L
 
S
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
M
|
M
L
 
L
E
 
D
G
 
S
T
 
T
V
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
S
A
 
V
S
 
A
L
 
L
H
 
Q
A
 
L
W
 
Y
S
 
S
T
 
T
L
 
V
P
 
P
-
 
S
L
 
L
Q
 
P
W
 
F
G
 
G
T
x
C
E
|
E
M
x
L
F
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
F
L
 
V
L
 
L
K
 
A
D
 
D
D
 
T
I
 
L
V
 
S
S
 
H
V
 
E
P
 
P
L
 
L
T
 
E
F
 
I
A
 
R
D
 
D
G
 
Y
Q
 
E
V
 
L
A
 
Q
L
 
V
P
 
P
Q
 
T
T
 
G
P
 
V
G
 
G
L
 
H
G
 
G
V
 
M
E
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
V
R
 
R
F
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
R
 
R

3i4kA Crystal structure of muconate lactonizing enzyme from corynebacterium glutamicum
38% identity, 95% coverage: 19:385/387 of query aligns to 3:370/370 of 3i4kA

query
sites
3i4kA
T
 
T
V
 
I
E
 
Q
R
 
K
I
 
V
E
 
E
S
 
S
W
 
R
I
 
I
V
 
L
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
H
|
H
K
 
G
L
 
F
S
 
A
M
 
T
T
 
T
T
 
T
M
 
S
G
 
T
C
 
E
Q
 
Q
T
 
H
L
 
I
V
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
S
L
 
V
T
 
H
R
 
L
S
 
E
D
 
N
G
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
G
T
 
V
T
x
V
I
 
P
G
 
G
G
|
G
L
 
P
S
 
W
Y
 
W
G
 
G
V
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
M
S
 
K
S
 
A
A
 
L
I
 
V
T
 
D
H
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
A
P
 
P
L
 
V
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
R
P
 
A
A
 
V
D
 
S
N
 
E
L
 
L
N
 
A
A
x
G
L
 
I
T
 
M
A
 
A
R
 
D
M
 
L
N
 
E
S
 
R
A
 
V
I
 
V
R
 
A
G
 
R
N
 
A
T
 
R
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
H
D
 
D
A
 
A
Q
 
W
G
 
A
K
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
N
L
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
R
A
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
V
Q
 
R
T
 
D
S
 
K
L
 
V
P
 
D
V
 
V
L
 
T
W
 
W
T
x
A
L
 
L
A
 
G
S
 
V
G
 
L
D
 
P
T
 
L
A
 
D
K
 
V
D
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
I
E
 
E
K
 
E
L
 
R
L
 
I
A
 
E
E
 
E
R
 
F
R
 
G
H
 
N
Q
 
R
A
 
S
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
I
 
M
G
 
G
A
 
A
R
 
G
E
 
D
L
 
P
A
 
A
T
 
E
D
 
D
L
 
T
R
 
R
H
 
R
T
 
V
R
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
A
E
 
R
A
 
E
L
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
V
S
 
S
I
 
L
R
 
R
V
 
I
D
|
D
V
 
I
N
|
N
Q
 
A
A
 
R
W
 
W
D
 
D
A
 
R
A
 
R
T
 
T
G
 
A
A
 
L
K
 
H
G
 
Y
C
 
L
R
 
P
E
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
E
M
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
E
L
 
L
I
 
F
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
T
S
 
P
A
 
A
H
 
D
D
 
D
N
 
L
A
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
R
R
 
E
L
 
I
S
 
T
Q
 
R
H
 
R
I
 
T
E
 
N
T
 
V
A
 
S
I
 
V
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
V
A
 
W
T
 
T
A
 
P
Y
 
A
D
 
E
G
 
A
Y
 
L
Q
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
K
Q
 
A
G
 
Q
F
 
A
T
 
A
G
 
D
A
 
V
Y
 
I
A
|
A
L
 
L
K
|
K
I
x
T
A
 
T
K
 
K
A
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
L
N
 
L
S
 
E
V
 
S
L
 
K
A
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
V
 
L
G
 
A
L
 
C
Y
 
H
G
 
G
G
x
A
T
|
T
M
x
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
P
V
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
Q
-
 
F
A
 
A
W
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
K
P
 
A
L
 
I
Q
 
S
W
 
Y
G
 
G
T
|
T
E
|
E
M
x
L
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
D
D
 
T
I
 
Y
V
 
I
S
 
V
V
 
Q
P
 
E
L
 
F
T
 
E
F
 
Y
A
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
T
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
D
L
 
V
D
 
D
E
 
M
D
 
D
K
 
K
L
 
V
R
 
N
F
 
F
Y
 
Y
S
 
T
R
 
R

4m0xA Crystal structure of 2-chloromuconate cycloisomerase from rhodococcus opacus 1cp (see paper)
38% identity, 95% coverage: 19:385/387 of query aligns to 2:368/369 of 4m0xA

query
sites
4m0xA
T
 
T
V
 
I
E
 
T
R
 
E
I
 
M
E
 
S
S
 
A
W
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
P
T
 
S
I
 
R
R
 
R
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
F
S
 
A
M
 
A
T
 
T
T
 
T
M
 
M
G
 
H
C
 
H
Q
 
Q
T
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
R
R
 
D
S
 
S
D
 
D
G
 
G
I
 
G
C
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
V
T
|
T
I
 
P
G
 
G
G
|
G
L
 
P
S
 
W
Y
 
W
G
 
G
V
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
K
S
 
T
A
 
I
I
 
I
T
 
D
H
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
T
 
A
P
 
P
L
 
V
L
 
I
K
 
I
G
 
G
L
 
R
P
 
D
A
 
P
D
 
S
N
 
T
L
 
I
N
 
G
A
 
V
L
 
A
T
 
S
A
 
Q
R
 
S
M
 
M
N
 
D
S
 
G
A
 
L
I
 
V
R
 
F
G
 
G
N
 
N
T
 
S
F
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
W
D
 
D
A
 
D
Q
 
R
G
 
E
K
 
R
A
 
R
L
 
S
G
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
L
 
R
Q
 
R
T
 
K
S
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
T
W
 
W
T
x
A
L
 
F
A
 
S
S
 
A
G
 
G
D
 
S
T
 
A
A
 
S
K
 
D
D
 
L
I
 
I
A
 
D
E
 
E
G
 
A
E
 
A
K
 
Q
L
 
K
L
 
L
A
 
-
E
 
D
R
 
V
R
 
G
H
 
H
Q
 
R
A
 
S
F
 
F
K
|
K
L
 
F
K
|
K
I
 
M
G
 
G
A
 
A
R
 
E
E
 
P
L
 
A
A
 
D
T
 
T
D
 
D
L
 
S
R
 
R
H
 
R
T
 
V
R
 
L
A
 
D
I
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
C
L
 
I
G
 
P
D
 
D
R
 
E
A
 
C
S
 
A
I
 
V
R
 
I
V
 
V
D
|
D
V
 
P
N
|
N
Q
 
G
A
 
R
W
 
W
D
 
S
A
 
E
A
 
L
T
 
E
G
 
A
A
 
H
K
 
R
G
 
W
C
 
L
R
 
P
E
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
D
M
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
T
L
 
V
I
 
A
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
S
 
A
A
 
R
H
 
W
D
 
N
N
 
T
A
 
D
A
 
G
L
 
L
V
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
R
Q
 
D
H
 
K
I
 
L
E
 
S
T
 
I
A
 
P
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
V
A
 
T
T
 
T
A
 
V
Y
 
Q
D
 
Q
G
 
A
Y
 
I
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
Q
 
A
G
 
G
F
 
A
T
 
V
G
 
S
A
 
A
Y
 
F
A
|
A
L
 
I
K
|
K
I
 
I
A
 
P
K
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
L
N
 
S
S
 
R
V
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
L
G
 
A
L
 
C
Y
 
F
G
 
G
G
x
A
T
x
A
M
x
T
L
 
P
E
 
E
G
 
S
T
 
S
V
 
V
G
 
M
T
 
G
V
 
A
A
 
I
S
 
S
L
 
A
H
 
Q
A
 
L
W
 
Y
S
 
G
T
 
T
L
 
M
P
 
P
-
 
D
L
 
L
Q
 
S
W
 
V
G
 
G
T
x
C
E
|
E
M
x
L
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
I
D
 
D
D
 
E
I
 
V
V
 
V
S
 
T
V
 
E
P
 
P
L
 
L
T
 
K
F
 
Y
A
 
D
D
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
A
 
L
L
 
I
P
 
P
Q
 
T
T
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
R
F
 
K
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R

3my9A Crystal structure of a muconate cycloisomerase from azorhizobium caulinodans
33% identity, 94% coverage: 18:381/387 of query aligns to 4:351/357 of 3my9A

query
sites
3my9A
A
 
S
T
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
R
S
 
I
W
 
F
I
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
S
P
 
P
T
 
I
I
 
-
R
 
-
P
 
-
H
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
-
M
 
-
T
 
-
T
 
K
M
 
M
G
 
G
C
 
S
Q
 
V
T
 
K
L
 
R
V
 
V
I
 
L
V
 
L
R
 
E
L
 
V
T
 
T
R
 
S
S
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
C
 
V
G
 
G
I
 
W
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
A
T
x
P
I
x
W
G
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
A
S
 
F
S
 
S
A
 
A
I
 
L
T
 
D
H
 
I
Y
 
Y
L
 
L
T
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
I
K
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
I
D
 
K
N
 
R
L
 
V
N
 
R
A
 
E
L
 
L
T
 
M
A
 
A
R
 
R
M
 
M
N
 
D
S
 
K
A
 
M
I
 
L
R
 
V
G
 
G
N
 
H
T
 
G
F
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
S
V
 
V
S
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
V
Q
 
R
T
 
D
S
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
L
L
 
S
W
 
F
T
x
S
L
 
I
A
 
A
S
 
D
G
 
P
D
 
D
T
 
F
A
 
D
K
 
A
D
 
D
I
 
L
A
 
-
E
 
E
G
 
R
E
 
M
K
 
R
L
 
A
L
 
M
A
 
V
E
 
P
R
 
A
R
 
G
H
 
H
Q
 
T
A
 
V
F
 
F
K
|
K
L
 
M
K
|
K
I
 
T
G
 
G
A
 
V
R
 
K
E
 
P
L
 
H
A
 
A
T
 
E
D
 
E
L
 
L
R
 
R
H
 
I
T
 
L
R
 
E
A
 
T
I
 
M
V
 
R
E
 
G
A
 
E
L
 
F
G
 
G
D
 
E
R
 
R
A
 
I
S
 
D
I
 
L
R
 
R
V
 
L
D
|
D
V
 
F
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
W
 
L
D
 
T
A
 
P
A
 
F
T
 
G
G
 
A
A
 
M
K
 
K
G
 
I
C
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
V
A
 
D
A
 
A
M
 
F
G
 
R
V
 
P
D
 
T
L
 
F
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
P
A
 
R
H
 
R
D
 
H
N
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
A
R
 
G
L
 
F
S
x
A
Q
 
A
H
 
A
I
x
L
E
 
D
T
 
T
A
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
C
A
 
F
T
 
D
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
G
 
L
Y
 
M
Q
 
E
L
 
V
A
 
V
Q
 
R
Q
 
R
G
 
Q
F
 
A
T
 
A
G
 
D
A
 
A
Y
 
I
A
x
S
L
 
V
K
|
K
I
 
I
A
 
M
K
 
K
A
 
C
G
 
G
G
 
G
P
 
L
N
 
M
S
 
K
V
 
A
L
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
M
R
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
D
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
P
L
 
G
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
M
x
L
L
 
W
E
 
E
G
 
G
T
 
G
V
 
I
G
 
A
T
 
L
V
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
T
H
 
Q
A
 
L
W
 
I
S
 
A
T
 
A
L
 
T
P
 
P
-
 
G
L
 
I
Q
 
S
W
 
L
G
 
G
T
x
C
E
|
E
M
x
F
F
 
Y
G
 
M
P
 
P
-
 
H
L
 
H
L
 
V
L
 
L
K
 
T
D
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
L
S
 
E
V
 
E
P
 
R
L
 
I
T
 
A
F
 
N
A
 
S
D
 
A
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
A
 
I
L
 
V
P
 
P
Q
 
D
T
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
S
L
 
I
D
 
S
E
 
E
D
 
A
K
 
S
L
 
L
R
 
R

1tkkA The structure of a substrate-liganded complex of the l-ala-d/l-glu epimerase from bacillus subtilis (see paper)
31% identity, 91% coverage: 22:373/387 of query aligns to 5:354/359 of 1tkkA

query
sites
1tkkA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
S
 
T
W
 
S
I
 
R
V
 
I
D
 
A
V
 
V
P
 
P
T
 
L
I
 
T
R
 
K
P
 
P
H
x
F
K
 
K
L
 
T
S
 
A
M
 
L
T
x
R
T
 
T
M
 
V
G
 
Y
C
 
T
Q
 
A
T
 
E
L
 
S
V
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
R
L
 
I
T
 
T
R
 
Y
S
 
D
D
 
S
G
 
G
I
 
A
C
 
V
G
 
G
I
 
W
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
P
T
x
P
I
 
T
G
 
-
G
 
-
L
 
L
S
x
V
Y
 
I
G
 
T
V
 
G
E
 
D
S
 
S
P
 
M
E
 
D
A
 
S
I
 
I
S
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
H
H
 
H
Y
 
V
L
 
L
T
 
K
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
L
G
 
G
L
 
K
P
 
S
A
 
L
D
 
A
N
 
G
L
 
Y
N
 
E
A
 
A
L
 
I
T
 
L
A
 
H
R
 
D
M
 
I
N
 
Q
S
 
H
A
 
L
I
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
M
F
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
G
Q
 
W
G
 
A
K
 
Q
A
 
M
L
 
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
Y
A
 
Q
L
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
Q
 
R
T
 
D
S
 
T
L
 
L
P
 
E
V
 
T
L
 
D
W
 
Y
T
|
T
L
 
V
A
 
S
S
 
V
G
 
N
D
 
S
T
 
P
A
 
E
K
 
E
D
 
M
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
A
E
 
E
K
 
N
L
 
Y
L
 
L
A
 
-
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
H
 
F
Q
 
Q
A
 
T
F
 
L
K
|
K
L
 
I
K
|
K
I
 
V
G
 
G
A
 
K
R
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
I
R
 
A
H
 
R
T
 
I
R
 
Q
A
 
E
I
 
I
V
 
R
E
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
S
R
 
A
A
 
V
S
 
K
I
 
L
R
 
R
V
x
L
D
|
D
V
x
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
D
 
R
A
 
P
A
 
K
T
 
E
G
 
A
A
 
V
K
 
T
G
 
A
C
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
M
-
 
E
-
 
D
A
 
A
A
 
G
M
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
H
A
 
K
H
 
D
D
 
D
N
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
V
 
K
R
 
K
L
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
A
I
 
T
E
 
D
T
 
T
A
 
P
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
V
A
 
F
T
 
T
A
 
P
Y
 
R
D
 
Q
G
 
A
Y
 
F
Q
 
E
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
T
G
 
R
F
 
S
T
 
A
G
 
D
A
 
L
Y
 
I
A
x
N
L
 
I
K
|
K
I
 
L
A
 
M
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
S
S
 
G
V
 
A
L
 
E
A
 
K
L
 
I
A
 
N
R
 
A
V
 
M
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
C
G
 
G
V
 
V
G
 
E
L
 
C
Y
 
M
G
 
V
G
|
G
T
x
S
M
|
M
L
x
I
E
 
E
G
 
T
T
 
K
V
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
F
W
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
K
P
 
R
L
 
N
Q
 
I
W
 
T
G
 
R
T
x
F
E
x
D
M
x
F
F
x
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
T
D
 
D
I
 
V
V
 
F
S
 
N
V
 
G
P
 
G
L
 
I
T
 
T
F
 
Y
A
 
S
D
 
G
G
 
S
Q
 
T
V
 
I
A
 
S
L
 
M
P
 
P
Q
 
G
T
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I

1jpmA L-ala-d/l-glu epimerase (see paper)
31% identity, 91% coverage: 22:373/387 of query aligns to 5:354/359 of 1jpmA

query
sites
1jpmA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
S
 
T
W
 
S
I
 
R
V
 
I
D
 
A
V
 
V
P
 
P
T
 
L
I
 
T
R
 
K
P
 
P
H
x
F
K
 
K
L
 
T
S
 
A
M
 
L
T
 
R
T
 
T
M
 
V
G
 
Y
C
 
T
Q
 
A
T
 
E
L
 
S
V
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
R
L
 
I
T
 
T
R
 
Y
S
 
D
D
 
S
G
 
G
I
 
A
C
 
V
G
 
G
I
 
W
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
P
T
x
P
I
 
T
G
 
-
G
 
-
L
 
L
S
x
V
Y
 
I
G
 
T
V
 
G
E
 
D
S
 
S
P
 
M
E
 
D
A
 
S
I
 
I
S
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
H
H
 
H
Y
 
V
L
 
L
T
 
K
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
L
G
 
G
L
 
K
P
 
S
A
 
L
D
 
A
N
 
G
L
 
Y
N
 
E
A
 
A
L
 
I
T
 
L
A
 
H
R
 
D
M
 
I
N
 
Q
S
 
H
A
 
L
I
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
M
F
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
G
Q
 
W
G
 
A
K
 
Q
A
 
M
L
 
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
Y
A
 
Q
L
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
Q
 
R
T
 
D
S
 
T
L
 
L
P
 
E
V
 
T
L
 
D
W
 
Y
T
|
T
L
 
V
A
 
S
S
 
V
G
 
N
D
 
S
T
 
P
A
 
E
K
 
E
D
 
M
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
A
E
 
E
K
 
N
L
 
Y
L
 
L
A
 
-
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
H
 
F
Q
 
Q
A
 
T
F
 
L
K
|
K
L
 
I
K
|
K
I
 
V
G
 
G
A
 
K
R
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
I
R
 
A
H
 
R
T
 
I
R
 
Q
A
 
E
I
 
I
V
 
R
E
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
S
R
 
A
A
 
V
S
 
K
I
 
L
R
 
R
V
x
L
D
|
D
V
x
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
D
 
R
A
 
P
A
 
K
T
 
E
G
 
A
A
 
V
K
 
T
G
 
A
C
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
M
-
 
E
-
 
D
A
 
A
A
 
G
M
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
H
A
 
K
H
 
D
D
 
D
N
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
V
 
K
R
 
K
L
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
A
I
 
T
E
 
D
T
 
T
A
 
P
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
V
A
 
F
T
 
T
A
 
P
Y
 
R
D
 
Q
G
 
A
Y
 
F
Q
 
E
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
T
G
 
R
F
 
S
T
 
A
G
 
D
A
 
L
Y
 
I
A
x
N
L
 
I
K
|
K
I
 
L
A
 
M
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
S
S
 
G
V
 
A
L
 
E
A
 
K
L
 
I
A
 
N
R
 
A
V
 
M
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
C
G
 
G
V
 
V
G
 
E
L
 
C
Y
 
M
G
 
V
G
|
G
T
x
S
M
|
M
L
 
I
E
 
E
G
 
T
T
 
K
V
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
F
W
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
K
P
 
R
L
 
N
Q
 
I
W
 
T
G
 
R
T
x
F
E
x
D
M
x
F
F
 
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
T
D
 
D
I
 
V
V
 
F
S
 
N
V
 
G
P
 
G
L
 
I
T
 
T
F
 
Y
A
 
S
D
 
G
G
 
S
Q
 
T
V
 
I
A
 
S
L
 
M
P
 
P
Q
 
G
T
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I

O34508 L-Ala-D/L-Glu epimerase; AE epimerase; AEE; EC 5.1.1.20 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 2 papers)
31% identity, 91% coverage: 22:373/387 of query aligns to 5:354/366 of O34508

query
sites
O34508
R
 
R
I
 
I
E
 
E
S
 
T
W
 
S
I
 
R
V
 
I
D
 
A
V
 
V
P
 
P
T
 
L
I
 
T
R
 
K
P
 
P
H
 
F
K
 
K
L
 
T
S
 
A
M
 
L
T
x
R
T
 
T
M
 
V
G
 
Y
C
 
T
Q
 
A
T
 
E
L
 
S
V
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
R
L
 
I
T
 
T
R
 
Y
S
 
D
D
 
S
G
 
G
I
 
A
C
 
V
G
 
G
I
 
W
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
P
T
 
P
I
 
T
G
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
V
Y
 
I
G
 
T
V
 
G
E
 
D
S
 
S
P
 
M
E
 
D
A
 
S
I
 
I
S
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
H
H
 
H
Y
 
V
L
 
L
T
 
K
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
L
G
 
G
L
 
K
P
 
S
A
 
L
D
 
A
N
 
G
L
 
Y
N
 
E
A
 
A
L
 
I
T
 
L
A
 
H
R
 
D
M
 
I
N
 
Q
S
 
H
A
 
L
I
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
M
F
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
G
Q
 
W
G
 
A
K
 
Q
A
 
M
L
 
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
Y
A
 
Q
L
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
Q
 
R
T
 
D
S
 
T
L
 
L
P
 
E
V
 
T
L
 
D
W
 
Y
T
|
T
L
 
V
A
 
S
S
 
V
G
 
N
D
 
S
T
 
P
A
 
E
K
 
E
D
 
M
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
A
E
 
E
K
 
N
L
 
Y
L
 
L
A
 
-
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
H
 
F
Q
 
Q
A
 
T
F
 
L
K
|
K
L
 
I
K
|
K
I
 
V
G
 
G
A
 
K
R
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
I
R
 
A
H
 
R
T
 
I
R
 
Q
A
 
E
I
 
I
V
 
R
E
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
S
R
 
A
A
 
V
S
 
K
I
 
L
R
 
R
V
 
L
D
|
D
V
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
D
 
R
A
 
P
A
 
K
T
 
E
G
 
A
A
 
V
K
 
T
G
 
A
C
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
M
-
 
E
-
 
D
A
 
A
A
 
G
M
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
H
A
 
K
H
 
D
D
 
D
N
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
V
 
K
R
 
K
L
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
A
I
 
T
E
 
D
T
 
T
A
 
P
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
 
E
A
 
S
V
 
V
A
 
F
T
 
T
A
 
P
Y
 
R
D
 
Q
G
 
A
Y
 
F
Q
 
E
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
T
G
 
R
F
 
S
T
 
A
G
 
D
A
 
L
Y
 
I
A
 
N
L
 
I
K
|
K
I
 
L
A
 
M
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
S
S
 
G
V
 
A
L
 
E
A
 
K
L
 
I
A
 
N
R
 
A
V
 
M
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
C
G
 
G
V
 
V
G
 
E
L
 
C
Y
 
M
G
 
V
G
 
G
T
x
S
M
 
M
L
x
I
E
 
E
G
 
T
T
 
K
V
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
F
W
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
K
P
 
R
L
 
N
Q
 
I
W
 
T
G
 
R
T
 
F
E
x
D
M
 
F
F
x
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
T
D
 
D
I
 
V
V
 
F
S
 
N
V
 
G
P
 
G
L
 
I
T
 
T
F
 
Y
A
 
S
D
 
G
G
 
S
Q
 
T
V
 
I
A
 
S
L
 
M
P
 
P
Q
 
G
T
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I

2p8cA Crystal structure of n-succinyl arg/lys racemase from bacillus cereus atcc 14579 complexed with n-succinyl arg. (see paper)
30% identity, 93% coverage: 23:381/387 of query aligns to 6:359/369 of 2p8cA

query
sites
2p8cA
I
 
I
E
 
H
S
 
L
W
 
Y
I
 
A
V
 
I
D
 
R
V
 
L
P
 
P
T
 
L
I
 
R
R
 
N
P
 
P
H
x
F
K
 
V
L
 
I
S
 
S
M
 
Y
T
 
G
T
 
S
M
x
Y
G
 
S
C
 
D
Q
x
M
T
 
P
L
 
S
V
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
K
L
 
M
T
 
E
R
 
T
S
 
D
D
 
E
G
 
G
I
 
I
C
 
I
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
G
T
 
V
T
x
A
I
x
D
G
 
D
G
x
H
L
 
V
S
 
T
Y
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
E
S
 
S
P
 
W
E
 
E
A
 
S
I
 
T
S
 
F
S
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
K
H
 
H
Y
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
Q
P
 
N
A
 
P
D
 
M
N
 
N
L
 
I
N
 
E
A
 
K
L
 
I
T
 
H
A
 
D
R
 
M
M
 
M
N
 
D
S
 
N
A
 
T
I
 
I
R
 
Y
G
 
G
N
 
V
T
 
P
F
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
C
L
 
F
D
 
D
A
 
I
Q
 
M
G
 
G
K
 
K
A
 
K
L
 
L
G
 
N
L
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
Y
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
Y
Q
 
H
T
 
E
S
 
E
L
 
F
P
 
P
V
 
V
L
 
T
W
 
H
T
x
V
L
 
L
A
 
S
S
 
I
G
 
A
D
 
D
T
 
-
A
 
P
K
 
E
D
 
N
I
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
E
E
 
A
K
 
A
L
 
S
L
 
M
A
 
I
E
 
Q
R
 
K
R
 
G
H
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
F
|
F
K
|
K
L
x
M
K
|
K
I
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
N
E
 
-
L
 
V
A
 
K
T
 
E
D
 
D
L
 
V
R
 
K
H
 
R
T
 
I
R
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
D
A
 
I
S
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
-
 
K
D
 
N
A
 
S
A
 
A
T
 
N
G
 
T
A
 
L
K
 
T
G
 
A
C
 
L
R
 
R
E
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
H
M
 
L
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
W
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
I
A
 
A
H
 
D
D
 
D
N
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
A
R
 
H
L
 
I
S
 
R
Q
 
S
H
 
K
I
 
T
E
 
D
T
 
L
A
 
P
I
 
L
L
 
M
A
 
I
D
|
D
E
|
E
A
x
G
V
 
L
A
 
K
T
 
S
A
 
S
Y
 
R
D
 
E
G
 
M
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
I
A
 
I
Q
 
K
Q
 
L
G
 
E
F
 
A
T
 
A
G
 
D
A
 
K
Y
 
V
A
x
N
L
 
I
K
|
K
I
 
L
A
 
M
K
 
K
A
 
C
G
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
Y
S
 
P
V
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
Q
A
 
A
Q
 
E
A
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
E
L
 
C
Y
 
Q
G
 
V
G
|
G
T
x
S
M
|
M
L
 
V
E
 
E
G
 
S
T
 
S
V
 
V
G
 
A
T
 
S
V
 
S
A
 
A
S
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
V
W
 
A
S
 
F
T
 
S
L
 
K
P
 
K
L
 
I
Q
 
I
W
 
T
G
 
S
T
x
V
E
|
E
M
x
L
F
x
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
L
 
F
K
 
T
D
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
G
S
 
N
V
 
-
P
 
-
L
 
L
T
 
H
F
 
Y
A
 
D
D
 
V
G
 
P
Q
 
F
V
 
I
A
 
R
L
 
L
P
 
N
Q
 
E
T
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
N
E
 
E
D
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
Q

2p8bA Crystal structure of n-succinyl arg/lys racemase from bacillus cereus atcc 14579 complexed with n-succinyl lys. (see paper)
30% identity, 93% coverage: 23:381/387 of query aligns to 6:359/369 of 2p8bA

query
sites
2p8bA
I
 
I
E
 
H
S
 
L
W
 
Y
I
 
A
V
 
I
D
 
R
V
 
L
P
 
P
T
 
L
I
 
R
R
 
N
P
 
P
H
x
F
K
 
V
L
 
I
S
 
S
M
 
Y
T
 
G
T
 
S
M
x
Y
G
 
S
C
 
D
Q
 
M
T
 
P
L
 
S
V
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
K
L
 
M
T
 
E
R
 
T
S
 
D
D
 
E
G
 
G
I
 
I
C
 
I
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
G
T
 
V
T
x
A
I
x
D
G
 
D
G
x
H
L
 
V
S
 
T
Y
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
E
S
 
S
P
 
W
E
 
E
A
 
S
I
 
T
S
 
F
S
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
K
H
 
H
Y
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
Q
P
 
N
A
 
P
D
 
M
N
 
N
L
 
I
N
 
E
A
 
K
L
 
I
T
 
H
A
 
D
R
 
M
M
 
M
N
 
D
S
 
N
A
 
T
I
 
I
R
 
Y
G
 
G
N
 
V
T
 
P
F
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
C
L
 
F
D
 
D
A
 
I
Q
 
M
G
 
G
K
 
K
A
 
K
L
 
L
G
 
N
L
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
Y
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
Y
Q
 
H
T
 
E
S
 
E
L
 
F
P
 
P
V
 
V
L
 
T
W
 
H
T
x
V
L
 
L
A
 
S
S
 
I
G
 
A
D
 
D
T
 
-
A
 
P
K
 
E
D
 
N
I
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
E
E
 
A
K
 
A
L
 
S
L
 
M
A
 
I
E
 
Q
R
 
K
R
 
G
H
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
F
|
F
K
|
K
L
x
M
K
|
K
I
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
N
E
 
-
L
 
V
A
 
K
T
 
E
D
 
D
L
 
V
R
 
K
H
 
R
T
 
I
R
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
D
A
 
I
S
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
-
 
K
D
 
N
A
 
S
A
 
A
T
 
N
G
 
T
A
 
L
K
 
T
G
 
A
C
 
L
R
 
R
E
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
H
M
 
L
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
W
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
I
A
 
A
H
 
D
D
 
D
N
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
A
R
 
H
L
 
I
S
 
R
Q
 
S
H
 
K
I
 
T
E
 
D
T
 
L
A
 
P
I
 
L
L
 
M
A
 
I
D
|
D
E
|
E
A
x
G
V
 
L
A
 
K
T
 
S
A
 
S
Y
 
R
D
 
E
G
 
M
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
I
A
 
I
Q
 
K
Q
 
L
G
 
E
F
 
A
T
 
A
G
 
D
A
 
K
Y
 
V
A
x
N
L
 
I
K
|
K
I
 
L
A
 
M
K
 
K
A
 
C
G
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
Y
S
 
P
V
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
Q
A
 
A
Q
 
E
A
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
E
L
 
C
Y
 
Q
G
 
V
G
|
G
T
x
S
M
|
M
L
 
V
E
 
E
G
 
S
T
 
S
V
 
V
G
 
A
T
 
S
V
 
S
A
 
A
S
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
V
W
 
A
S
 
F
T
 
S
L
 
K
P
 
K
L
 
I
Q
 
I
W
 
T
G
 
S
T
x
V
E
|
E
M
x
L
F
x
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
L
 
F
K
 
T
D
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
G
S
 
N
V
 
-
P
 
-
L
 
L
T
 
H
F
 
Y
A
 
D
D
 
V
G
 
P
Q
 
F
V
 
I
A
 
R
L
 
L
P
 
N
Q
 
E
T
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
N
E
 
E
D
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
Q

2p88A Crystal structure of n-succinyl arg/lys racemase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
30% identity, 93% coverage: 23:381/387 of query aligns to 6:359/369 of 2p88A

query
sites
2p88A
I
 
I
E
 
H
S
 
L
W
 
Y
I
 
A
V
 
I
D
 
R
V
 
L
P
 
P
T
 
L
I
 
R
R
 
N
P
 
P
H
x
F
K
 
V
L
 
I
S
 
S
M
 
Y
T
 
G
T
 
S
M
 
Y
G
 
S
C
 
D
Q
 
M
T
 
P
L
 
S
V
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
K
L
 
M
T
 
E
R
 
T
S
 
D
D
 
E
G
 
G
I
 
I
C
 
I
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
G
T
 
V
T
x
A
I
 
D
G
 
D
G
x
H
L
 
V
S
 
T
Y
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
E
S
 
S
P
 
W
E
 
E
A
 
S
I
 
T
S
 
F
S
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
K
H
 
H
Y
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
Q
P
 
N
A
 
P
D
 
M
N
 
N
L
 
I
N
 
E
A
 
K
L
 
I
T
 
H
A
 
D
R
 
M
M
 
M
N
 
D
S
 
N
A
 
T
I
 
I
R
 
Y
G
 
G
N
 
V
T
 
P
F
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
C
L
 
F
D
 
D
A
 
I
Q
 
M
G
 
G
K
 
K
A
 
K
L
 
L
G
 
N
L
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
Y
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
Y
Q
 
H
T
 
E
S
 
E
L
 
F
P
 
P
V
 
V
L
 
T
W
 
H
T
x
V
L
 
L
A
 
S
S
 
I
G
 
A
D
 
D
T
 
-
A
 
P
K
 
E
D
 
N
I
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
E
E
 
A
K
 
A
L
 
S
L
 
M
A
 
I
E
 
Q
R
 
K
R
 
G
H
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
F
|
F
K
|
K
L
x
M
K
|
K
I
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
N
E
 
-
L
 
V
A
 
K
T
 
E
D
 
D
L
 
V
R
 
K
H
 
R
T
 
I
R
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
D
A
 
I
S
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
-
 
K
D
 
N
A
 
S
A
 
A
T
 
N
G
 
T
A
 
L
K
 
T
G
 
A
C
 
L
R
 
R
E
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
H
M
 
L
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
W
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
I
A
 
A
H
 
D
D
 
D
N
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
A
R
 
H
L
 
I
S
 
R
Q
 
S
H
 
K
I
 
T
E
 
D
T
 
L
A
 
P
I
 
L
L
 
M
A
 
I
D
|
D
E
|
E
A
x
G
V
 
L
A
 
K
T
 
S
A
 
S
Y
 
R
D
 
E
G
 
M
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
I
A
 
I
Q
 
K
Q
 
L
G
 
E
F
 
A
T
 
A
G
 
D
A
 
K
Y
 
V
A
x
N
L
 
I
K
|
K
I
 
L
A
 
M
K
 
K
A
 
C
G
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
Y
S
 
P
V
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
Q
A
 
A
Q
 
E
A
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
E
L
 
C
Y
 
Q
G
 
V
G
|
G
T
x
S
M
|
M
L
 
V
E
 
E
G
 
S
T
 
S
V
 
V
G
 
A
T
 
S
V
 
S
A
 
A
S
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
V
W
 
A
S
 
F
T
 
S
L
 
K
P
 
K
L
 
I
Q
 
I
W
 
T
G
 
S
T
x
V
E
|
E
M
x
L
F
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
L
 
F
K
 
T
D
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
G
S
 
N
V
 
-
P
 
-
L
 
L
T
 
H
F
 
Y
A
 
D
D
 
V
G
 
P
Q
 
F
V
 
I
A
 
R
L
 
L
P
 
N
Q
 
E
T
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
N
E
 
E
D
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
Q

Q81IL5 N-succinyl-L-Arg/Lys racemase; N-succinyl amino acid racemase; NSAR; EC 5.1.1.- from Bacillus cereus (strain ATCC 14579 / DSM 31 / CCUG 7414 / JCM 2152 / NBRC 15305 / NCIMB 9373 / NCTC 2599 / NRRL B-3711) (see paper)
30% identity, 93% coverage: 23:381/387 of query aligns to 6:359/369 of Q81IL5

query
sites
Q81IL5
I
 
I
E
 
H
S
 
L
W
 
Y
I
 
A
V
 
I
D
 
R
V
 
L
P
 
P
T
 
L
I
 
R
R
 
N
P
 
P
H
 
F
K
 
V
L
 
I
S
 
S
M
 
Y
T
 
G
T
 
S
M
 
Y
G
 
S
C
 
D
Q
 
M
T
 
P
L
 
S
V
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
K
L
 
M
T
 
E
R
 
T
S
 
D
D
 
E
G
 
G
I
 
I
C
 
I
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
G
T
 
V
T
 
A
I
 
D
G
 
D
G
 
H
L
 
V
S
 
T
Y
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
E
S
 
S
P
 
W
E
 
E
A
 
S
I
 
T
S
 
F
S
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
K
H
 
H
Y
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
Q
P
 
N
A
 
P
D
 
M
N
 
N
L
 
I
N
 
E
A
 
K
L
 
I
T
 
H
A
 
D
R
 
M
M
 
M
N
 
D
S
 
N
A
 
T
I
 
I
R
 
Y
G
 
G
N
 
V
T
 
P
F
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
C
L
 
F
D
 
D
A
 
I
Q
 
M
G
 
G
K
 
K
A
 
K
L
 
L
G
 
N
L
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
Y
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
Y
Q
 
H
T
 
E
S
 
E
L
 
F
P
 
P
V
 
V
L
 
T
W
 
H
T
 
V
L
 
L
A
 
S
S
 
I
G
 
A
D
 
D
T
 
-
A
 
P
K
 
E
D
 
N
I
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
E
E
 
A
K
 
A
L
 
S
L
 
M
A
 
I
E
 
Q
R
 
K
R
 
G
H
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
K
 
K
L
 
M
K
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
N
E
 
-
L
 
V
A
 
K
T
 
E
D
 
D
L
 
V
R
 
K
H
 
R
T
 
I
R
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
D
A
 
I
S
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
-
 
K
D
 
N
A
 
S
A
 
A
T
 
N
G
 
T
A
 
L
K
 
T
G
 
A
C
 
L
R
 
R
E
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
H
M
 
L
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
W
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
I
A
 
A
H
 
D
D
 
D
N
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
A
R
 
H
L
 
I
S
 
R
Q
 
S
H
 
K
I
 
T
E
 
D
T
 
L
A
 
P
I
 
L
L
 
M
A
 
I
D
|
D
E
 
E
A
 
G
V
 
L
A
 
K
T
 
S
A
 
S
Y
 
R
D
 
E
G
 
M
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
I
A
 
I
Q
 
K
Q
 
L
G
 
E
F
 
A
T
 
A
G
 
D
A
 
K
Y
 
V
A
 
N
L
 
I
K
 
K
I
 
L
A
 
M
K
 
K
A
 
C
G
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
Y
S
 
P
V
 
A
L
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
Q
A
 
A
Q
 
E
A
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
E
L
 
C
Y
 
Q
G
 
V
G
 
G
T
 
S
M
 
M
L
 
V
E
 
E
G
 
S
T
 
S
V
 
V
G
 
A
T
 
S
V
 
S
A
 
A
S
 
G
L
 
F
H
 
H
A
 
V
W
 
A
S
 
F
T
 
S
L
 
K
P
 
K
L
 
I
Q
 
I
W
 
T
G
 
S
T
 
V
E
 
E
M
 
L
F
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
L
 
F
K
 
T
D
 
K
D
 
D
I
 
I
V
 
G
S
 
N
V
 
-
P
 
-
L
 
L
T
 
H
F
 
Y
A
 
D
D
 
V
G
 
P
Q
 
F
V
 
I
A
 
R
L
 
L
P
 
N
Q
 
E
T
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
N
E
 
E
D
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
Q

3i6eA Crystal structure of muconate lactonizing enzyme from ruegeria pomeroyi.
33% identity, 88% coverage: 45:384/387 of query aligns to 18:353/356 of 3i6eA

query
sites
3i6eA
C
 
C
Q
 
E
T
 
-
L
 
I
V
 
V
I
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
V
R
 
A
S
 
E
D
 
G
G
 
G
I
 
A
C
 
E
G
 
G
I
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
S
T
 
P
I
 
W
G
 
A
G
 
V
L
 
F
S
 
T
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
S
S
 
Y
S
 
A
A
 
A
I
 
L
T
 
D
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
T
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
V
K
 
I
G
 
G
L
 
R
P
 
R
A
 
V
D
 
G
N
 
D
L
 
R
N
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
M
A
 
D
R
 
E
M
 
A
N
 
A
S
 
R
A
 
A
I
 
V
R
 
A
G
 
H
N
 
C
T
 
T
F
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
I
L
 
S
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
V
S
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
C
Q
 
R
T
 
D
S
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
L
L
 
S
W
 
C
T
x
S
L
 
I
A
 
A
S
 
N
G
 
P
D
 
D
T
 
F
A
 
D
K
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
L
G
 
M
E
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
D
R
 
G
R
 
V
H
 
-
Q
 
G
A
 
L
F
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
I
 
T
G
 
G
A
 
F
R
 
R
E
 
D
L
 
H
A
 
A
T
 
F
D
 
D
L
 
I
R
 
M
H
 
R
T
 
L
R
 
E
A
 
L
I
 
I
V
 
A
E
 
R
A
 
D
L
 
F
G
 
P
D
 
E
R
 
-
A
 
F
S
 
R
I
 
V
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
x
Y
N
|
N
Q
|
Q
A
 
G
W
 
L
D
 
E
A
 
I
A
 
D
T
 
E
G
 
A
A
 
V
K
 
P
G
 
R
C
 
V
R
 
L
E
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
M
 
F
G
 
Q
V
 
P
D
 
D
L
 
F
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
R
A
 
A
H
 
H
D
 
H
N
 
F
A
 
E
A
 
L
L
 
M
V
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
R
Q
 
G
H
 
L
I
 
T
E
 
D
T
 
V
A
 
P
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
V
A
 
Y
T
 
G
A
 
P
Y
 
E
D
 
D
G
 
M
Y
 
V
Q
 
R
L
 
A
A
 
A
Q
 
H
Q
 
E
G
 
G
F
 
I
T
 
C
G
 
D
A
 
G
Y
 
V
A
 
S
L
 
I
K
|
K
I
 
I
A
 
M
K
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
L
N
 
T
S
 
R
V
 
A
L
 
Q
A
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
A
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
M
L
 
A
Y
|
Y
G
 
G
G
|
G
T
x
D
M
|
M
L
 
F
E
 
E
G
 
A
T
 
G
V
 
L
G
 
A
T
 
H
V
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
T
H
 
H
A
 
M
W
 
I
S
 
A
T
 
A
L
 
T
P
 
P
-
 
E
L
 
I
Q
 
T
W
 
L
G
 
G
T
x
C
E
|
E
M
x
F
F
 
Y
-
 
Q
G
 
A
P
 
S
L
 
Y
L
 
F
L
 
L
K
 
N
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
L
S
 
E
V
 
T
P
 
P
L
 
F
T
 
R
F
 
V
A
 
E
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
I
L
 
V
P
 
P
Q
 
D
T
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
R
L
 
A
D
 
D
E
 
P
D
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
E
F
 
H
Y
 
Y
S
 
A

3i6tB Crystal structure of muconate cycloisomerase from jannaschia sp.
33% identity, 92% coverage: 26:382/387 of query aligns to 9:362/364 of 3i6tB

query
sites
3i6tB
W
 
W
I
 
H
V
 
L
D
 
S
V
 
L
P
 
P
T
 
V
I
 
T
-
 
A
-
 
R
R
|
R
P
 
D
H
 
H
K
 
G
L
 
I
S
 
G
M
 
-
T
 
S
T
 
V
M
 
A
G
 
G
C
 
A
Q
 
V
T
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
Q
R
 
A
S
 
D
D
 
S
G
 
G
I
 
A
C
 
V
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
S
T
 
P
I
 
W
G
 
V
G
 
V
L
 
F
S
 
T
Y
 
G
G
 
S
V
 
V
E
 
E
S
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
A
I
 
T
S
 
Y
S
 
A
A
 
A
I
 
L
T
 
D
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
T
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
V
K
 
L
G
 
G
L
 
R
P
 
A
A
 
V
D
 
G
N
 
D
L
 
H
N
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
M
A
 
E
R
 
D
M
 
A
N
 
R
S
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
A
G
 
H
N
 
C
T
 
T
F
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
L
Q
 
R
G
 
A
K
 
R
A
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
C
Q
 
R
T
 
D
S
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
L
L
 
S
W
 
C
T
x
S
L
 
I
A
 
A
S
 
D
G
 
P
D
 
D
T
 
F
A
 
D
K
 
K
D
 
D
I
 
L
A
 
A
E
 
L
G
 
M
E
 
Q
K
 
R
L
 
-
L
 
L
A
 
Q
E
 
D
R
 
D
R
 
D
H
 
V
Q
 
R
A
 
I
F
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
I
 
T
G
 
G
A
 
F
R
 
K
E
 
D
L
 
H
A
 
A
T
 
F
D
 
D
-
 
M
-
 
M
-
 
R
L
 
L
R
 
E
H
 
R
T
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
D
V
 
F
E
 
P
A
 
A
L
 
F
G
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
D
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
|
D
V
 
Y
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
L
D
 
H
A
 
H
A
 
D
T
 
V
G
 
A
A
 
L
K
 
A
G
 
R
C
 
V
R
 
R
E
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
T
M
 
F
G
 
K
V
 
P
D
 
T
L
 
F
I
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
K
A
 
A
H
 
H
D
 
L
N
 
R
A
 
G
A
 
L
L
 
M
V
 
A
R
 
R
L
 
I
S
 
R
Q
 
D
H
 
A
I
 
V
E
 
D
T
 
V
A
 
P
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
 
S
V
 
I
A
 
F
T
 
G
A
 
P
Y
 
E
D
 
D
G
 
M
Y
 
A
Q
 
E
L
 
H
A
 
P
Q
 
E
Q
 
-
G
 
-
F
 
I
T
 
A
G
 
D
A
 
G
Y
 
V
A
x
S
L
 
I
K
|
K
I
 
I
A
 
M
K
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
L
N
 
T
S
 
R
V
 
A
L
 
Q
A
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
M
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
L
G
 
S
L
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
x
D
M
|
M
L
 
F
E
 
E
G
 
A
T
 
G
V
 
L
G
 
A
T
 
H
V
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
A
H
 
H
A
 
M
W
 
I
S
 
A
T
 
A
L
 
T
P
 
P
-
 
E
L
 
I
Q
 
T
W
 
L
G
 
G
T
x
C
E
|
E
M
x
F
F
 
Y
-
 
Q
G
 
A
P
 
T
L
 
Y
L
 
F
L
 
L
K
 
C
D
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
L
S
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
F
T
 
P
F
 
V
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
A
 
L
L
 
V
P
 
P
Q
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
D
L
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
D
K
 
A
L
 
L
-
 
A
R
 
R
F
 
F

3dg6A Crystal structure of muconate lactonizing enzyme from mucobacterium smegmatis complexed with muconolactone (see paper)
31% identity, 91% coverage: 30:383/387 of query aligns to 13:363/366 of 3dg6A

query
sites
3dg6A
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
I
 
T
R
 
K
P
 
P
H
x
L
K
 
R
L
x
F
S
 
A
M
 
S
T
 
G
T
 
E
M
 
V
G
 
H
C
 
A
Q
 
A
T
 
E
L
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
H
R
 
T
S
 
D
D
 
D
G
 
G
I
 
I
C
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
P
T
x
P
I
 
-
G
x
R
G
 
P
L
 
F
S
x
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
-
E
 
E
S
 
T
P
 
Q
E
 
T
A
 
G
I
 
I
S
 
V
S
 
A
A
 
V
I
 
I
T
 
E
H
 
Q
Y
 
Y
L
 
F
T
 
A
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
T
A
 
L
D
 
T
N
 
E
L
 
R
N
 
E
A
 
V
L
 
A
T
 
H
A
 
T
R
 
R
M
 
M
N
 
A
S
 
R
A
 
T
I
 
V
R
 
-
G
 
G
N
 
N
T
 
P
F
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
D
T
 
M
A
 
A
L
 
M
L
 
W
D
 
D
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
K
 
Q
A
 
S
L
 
L
G
 
R
L
 
L
P
 
S
V
 
V
S
 
S
A
 
E
L
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
Q
 
T
T
 
D
S
 
R
L
 
M
P
 
R
V
 
V
L
 
S
W
 
H
T
x
M
L
 
L
A
 
G
S
 
F
G
 
D
D
 
D
T
 
P
A
 
V
K
 
K
D
 
M
I
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
A
E
 
E
K
 
R
L
 
I
L
 
R
A
 
E
E
 
T
R
 
Y
R
 
G
H
 
I
Q
 
N
A
 
T
F
 
F
K
|
K
L
 
V
K
|
K
I
 
V
G
 
G
A
 
R
R
 
R
E
 
P
L
 
V
A
 
Q
T
 
L
D
 
D
L
 
T
R
 
A
H
 
V
T
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
R
E
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
D
 
D
R
 
A
A
 
I
S
 
E
I
 
L
R
 
Y
V
 
V
D
|
D
V
 
G
N
|
N
Q
 
R
A
 
G
W
 
W
D
 
S
A
 
A
A
 
A
T
 
E
G
 
S
A
 
L
K
 
R
G
 
A
C
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
M
A
 
A
A
 
D
M
 
L
G
 
D
V
 
L
D
 
L
L
 
F
I
 
A
E
|
E
Q
 
E
P
 
L
V
 
C
S
 
P
A
 
A
H
 
D
D
 
D
N
 
V
A
 
L
A
 
S
L
 
R
V
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
V
Q
 
G
H
 
Q
I
 
L
E
 
D
T
 
M
A
 
P
I
 
F
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
V
A
 
P
T
 
T
A
 
P
Y
 
A
D
 
D
G
 
V
Y
 
T
Q
 
R
L
 
E
A
 
V
Q
 
L
Q
 
G
G
 
G
F
 
S
T
 
A
G
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
S
L
 
I
K
|
K
I
 
T
A
 
A
K
 
R
A
 
T
G
 
G
G
 
F
P
 
T
N
 
G
S
 
S
V
 
T
L
 
-
A
 
R
L
 
V
A
 
H
R
 
H
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
G
A
 
L
G
 
G
V
 
L
G
 
D
L
 
M
Y
 
V
G
 
M
G
|
G
T
x
N
M
x
Q
L
x
I
E
 
D
G
 
G
T
 
Q
V
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
A
A
 
C
S
 
T
L
 
V
H
 
S
A
 
F
W
 
G
S
 
T
T
 
A
L
 
F
P
 
E
L
 
R
-
 
T
-
 
S
Q
 
R
W
 
H
G
 
A
T
x
G
E
|
E
M
x
L
F
 
S
G
 
N
P
 
F
L
 
L
L
 
D
L
 
M
K
 
S
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
L
S
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
L
T
 
Q
F
 
I
A
 
S
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
A
 
H
L
 
R
P
 
R
Q
 
P
T
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
D
E
 
P
D
 
D
K
 
K
L
 
L
R
 
A
F
 
H
Y
 
Y

3q4dA Crystal structure of dipeptide epimerase from cytophaga hutchinsonii complexed with mg and dipeptide d-ala-l-ala (see paper)
27% identity, 93% coverage: 20:380/387 of query aligns to 3:359/368 of 3q4dA

query
sites
3q4dA
V
 
I
E
 
T
R
 
Q
I
 
V
E
 
E
S
 
L
W
 
Y
I
 
K
V
 
S
D
 
P
V
 
V
P
 
K
T
 
L
I
 
K
R
 
E
P
 
P
H
x
F
K
 
K
L
 
I
S
 
S
M
 
L
T
 
G
T
 
I
M
 
L
G
 
T
C
 
H
Q
 
A
T
 
N
L
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
R
L
 
I
T
 
H
R
 
T
S
 
A
D
 
S
G
 
G
I
 
H
C
 
I
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
C
T
 
S
-
x
P
-
 
F
-
 
M
T
|
T
I
 
I
G
 
H
G
 
G
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
S
I
 
M
S
 
D
S
 
T
A
 
A
-
 
F
-
 
I
I
 
V
T
 
G
H
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
T
 
A
P
 
K
L
 
G
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
T
P
 
S
A
 
C
D
 
L
N
 
D
L
 
I
N
 
V
A
 
S
L
 
N
T
 
S
A
 
L
R
 
L
M
 
M
N
 
D
S
 
A
A
 
I
I
 
I
R
 
Y
G
 
G
N
 
N
T
 
S
F
 
C
A
 
I
K
 
K
S
 
S
A
 
A
I
 
F
E
 
N
T
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
L
Q
 
A
G
 
A
K
 
Q
A
 
H
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
Y
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
K
Q
 
D
T
 
K
S
 
I
L
 
I
P
 
Q
V
 
T
L
 
D
W
 
Y
T
|
T
L
 
V
A
 
S
S
 
I
G
 
D
D
 
E
T
 
P
A
 
H
K
 
K
D
 
M
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
A
E
 
V
K
 
Q
L
 
I
L
 
-
A
 
K
E
 
K
R
 
N
R
 
G
H
 
F
Q
 
E
A
 
I
F
 
I
K
|
K
L
 
V
K
|
K
I
 
V
G
 
G
-
 
G
A
 
S
R
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
D
 
D
L
 
V
R
 
E
H
 
R
T
 
I
R
 
R
A
 
M
I
 
I
V
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
S
A
 
I
S
 
T
I
 
L
R
 
R
V
 
I
D
|
D
V
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
D
 
S
A
 
V
A
 
E
T
 
T
G
 
A
A
 
I
K
 
E
G
 
T
C
 
L
R
 
T
E
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
P
M
 
Y
G
 
N
V
 
I
D
 
Q
L
 
H
I
 
C
E
|
E
Q
 
E
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
R
H
 
N
D
 
L
N
 
Y
A
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
P
R
 
K
L
 
I
S
 
R
Q
 
Q
H
 
A
I
 
C
E
 
R
T
 
I
A
 
P
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
C
A
 
C
T
 
N
A
 
S
Y
 
F
D
 
D
G
 
A
Y
 
E
Q
 
R
L
 
L
A
 
I
Q
 
Q
Q
 
I
G
 
Q
F
 
A
T
 
C
G
 
D
A
 
S
Y
 
F
A
 
N
L
 
L
K
|
K
I
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
S
G
 
A
G
 
G
P
 
I
N
 
T
S
 
N
V
 
A
L
 
L
A
 
N
L
 
I
A
 
I
R
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
Q
A
 
A
G
 
H
V
 
M
G
 
P
L
 
V
Y
 
Q
G
 
V
G
|
G
T
x
G
M
x
F
L
 
L
E
 
E
G
 
S
T
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
F
V
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
V
W
 
A
S
 
L
T
 
V
L
 
S
P
 
K
L
 
T
Q
 
I
W
 
C
G
 
Y
T
x
Y
E
x
D
M
x
F
F
x
D
G
x
T
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
F
K
 
E
D
 
A
D
 
D
I
 
P
V
 
V
S
 
R
V
 
G
P
 
G
L
 
I
T
 
V
F
 
Y
A
 
Q
D
 
Q
-
 
R
G
 
G
Q
 
I
V
 
I
A
 
E
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
G
L
 
Y
D
 
Q
E
 
K
D
 
D
K
 
Y
L
 
L

3q45A Crystal structure of dipeptide epimerase from cytophaga hutchinsonii complexed with mg and dipeptide d-ala-l-val (see paper)
27% identity, 93% coverage: 20:380/387 of query aligns to 3:359/368 of 3q45A

query
sites
3q45A
V
 
I
E
 
T
R
 
Q
I
 
V
E
 
E
S
 
L
W
 
Y
I
 
K
V
 
S
D
 
P
V
 
V
P
 
K
T
 
L
I
 
K
R
 
E
P
 
P
H
x
F
K
 
K
L
 
I
S
 
S
M
 
L
T
 
G
T
 
I
M
 
L
G
 
T
C
 
H
Q
 
A
T
 
N
L
 
N
V
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
R
L
 
I
T
 
H
R
 
T
S
 
A
D
 
S
G
 
G
I
 
H
C
 
I
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
C
T
 
S
-
x
P
-
 
F
-
 
M
T
|
T
I
 
I
G
 
H
G
 
G
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
S
I
 
M
S
 
D
S
 
T
A
 
A
-
 
F
-
 
I
I
 
V
T
 
G
H
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
T
 
A
P
 
K
L
 
G
L
 
L
K
 
I
G
 
G
L
 
T
P
 
S
A
 
C
D
 
L
N
 
D
L
 
I
N
 
V
A
 
S
L
 
N
T
 
S
A
 
L
R
 
L
M
 
M
N
 
D
S
 
A
A
 
I
I
 
I
R
 
Y
G
 
G
N
 
N
T
 
S
F
 
C
A
 
I
K
 
K
S
 
S
A
 
A
I
 
F
E
 
N
T
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
L
Q
 
A
G
 
A
K
 
Q
A
 
H
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
Y
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
K
Q
 
D
T
 
K
S
 
I
L
 
I
P
 
Q
V
 
T
L
 
D
W
 
Y
T
|
T
L
 
V
A
 
S
S
 
I
G
 
D
D
 
E
T
 
P
A
 
H
K
 
K
D
 
M
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
A
E
 
V
K
 
Q
L
 
I
L
 
-
A
 
K
E
 
K
R
 
N
R
 
G
H
 
F
Q
 
E
A
 
I
F
 
I
K
|
K
L
 
V
K
|
K
I
 
V
G
 
G
-
 
G
A
 
S
R
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
D
 
D
L
 
V
R
 
E
H
 
R
T
 
I
R
 
R
A
 
M
I
 
I
V
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
S
A
 
I
S
 
T
I
 
L
R
 
R
V
 
I
D
|
D
V
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
G
W
 
W
D
 
S
A
 
V
A
 
E
T
 
T
G
 
A
A
 
I
K
 
E
G
 
T
C
 
L
R
 
T
E
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
P
M
 
Y
G
 
N
V
 
I
D
 
Q
L
 
H
I
 
C
E
|
E
Q
 
E
P
 
P
V
 
V
S
 
S
A
 
R
H
 
N
D
 
L
N
 
Y
A
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
P
R
 
K
L
 
I
S
 
R
Q
 
Q
H
 
A
I
 
C
E
 
R
T
 
I
A
 
P
I
 
I
L
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
A
x
S
V
 
C
A
 
C
T
 
N
A
 
S
Y
 
F
D
 
D
G
 
A
Y
 
E
Q
 
R
L
 
L
A
 
I
Q
 
Q
Q
 
I
G
 
Q
F
 
A
T
 
C
G
 
D
A
 
S
Y
 
F
A
 
N
L
 
L
K
|
K
I
 
L
A
 
S
K
 
K
A
 
S
G
 
A
G
 
G
P
 
I
N
 
T
S
 
N
V
 
A
L
 
L
A
 
N
L
 
I
A
 
I
R
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
Q
A
 
A
G
 
H
V
 
M
G
 
P
L
 
V
Y
 
Q
G
 
V
G
|
G
T
x
G
M
x
F
L
 
L
E
 
E
G
 
S
T
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
F
V
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
A
H
 
H
A
 
V
W
 
A
S
 
L
T
 
V
L
 
S
P
 
K
L
 
T
Q
 
I
W
 
C
G
 
Y
T
x
Y
E
x
D
M
x
F
F
x
D
G
x
T
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
F
K
 
E
D
 
A
D
 
D
I
 
P
V
 
V
S
 
R
V
 
G
P
 
G
L
 
I
T
 
V
F
 
Y
A
 
Q
D
 
Q
-
 
R
G
 
G
Q
 
I
V
 
I
A
 
E
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
G
L
 
Y
D
 
Q
E
 
K
D
 
D
K
 
Y
L
 
L

Query Sequence

>WP_181403700.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_181403700.1
MDVGTKSYTSHQEPKMTATVERIESWIVDVPTIRPHKLSMTTMGCQTLVIVRLTRSDGIC
GIGEATTIGGLSYGVESPEAISSAITHYLTPLLKGLPADNLNALTARMNSAIRGNTFAKS
AIETALLDAQGKALGLPVSALLGGALQTSLPVLWTLASGDTAKDIAEGEKLLAERRHQAF
KLKIGARELATDLRHTRAIVEALGDRASIRVDVNQAWDAATGAKGCRELAAMGVDLIEQP
VSAHDNAALVRLSQHIETAILADEAVATAYDGYQLAQQGFTGAYALKIAKAGGPNSVLAL
ARVAQAAGVGLYGGTMLEGTVGTVASLHAWSTLPLQWGTEMFGPLLLKDDIVSVPLTFAD
GQVALPQTPGLGVELDEDKLRFYSRKA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory