SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_198155988.1 NCBI__GCF_001189915.1:WP_198155988.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

P9WKJ5 Dihydroxy-acid dehydratase; DAD; EC 4.2.1.9 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 6:339/339 of query aligns to 20:358/575 of P9WKJ5

query
sites
P9WKJ5
R
 
R
S
 
S
K
 
R
N
 
D
I
 
V
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
I
 
L
S
 
E
R
 
K
S
 
A
P
 
A
N
 
A
R
 
R
S
 
G
M
 
M
Y
 
L
Y
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
G
Y
 
M
E
 
D
K
 
D
E
 
E
D
 
D
F
 
F
D
 
A
K
 
K
P
 
P
M
 
Q
I
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
S
G
 
S
H
 
W
S
 
N
T
 
E
I
 
I
T
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
L
G
 
S
L
 
L
Q
 
D
K
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
N
I
 
A
A
 
V
I
 
K
S
 
E
S
 
G
I
 
V
K
 
F
D
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
Y
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
F
 
F
G
 
G
T
 
T
P
 
I
T
 
S
I
 
V
S
 
S
D
|
D
G
 
G
M
 
I
S
 
S
M
 
M
G
 
G
T
 
H
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
H
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
I
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
S
I
 
V
E
 
E
T
 
V
A
 
V
V
 
M
N
 
Q
G
 
A
Q
 
E
W
 
R
M
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
A
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
N
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
M
M
 
L
I
 
M
A
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
L
N
 
D
V
 
L
P
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
F
V
 
L
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
T
 
S
I
 
I
K
 
L
P
 
P
G
 
G
K
 
R
W
 
A
K
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
S
G
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
V
T
 
T
I
 
I
V
 
I
S
 
D
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
A
F
 
C
S
 
S
A
 
R
G
 
G
R
 
L
M
 
M
S
 
S
Q
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
V
D
 
D
G
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
R
N
 
A
A
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
G
S
 
E
G
 
G
S
 
A
C
|
C
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
P
Y
 
G
S
 
S
S
 
A
T
 
A
M
 
P
A
 
P
N
 
A
P
 
T
D
 
D
E
 
R
E
 
R
K
 
R
T
 
D
G
 
G
S
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
S
 
S
A
 
G
K
 
Q
V
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
L
K
 
R
R
 
R
D
 
G
L
 
I
K
 
T
P
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
T
R
 
K
K
 
E
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
V
M
 
M
A
 
A
T
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
H
A
 
E
A
 
A
E
 
N
V
 
V
E
 
A
W
 
L
T
 
S
I
 
L
D
 
Q
D
 
D
F
 
F
E
 
S
R
 
R
V
 
I
R
 
G
Q
 
S
K
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
H
F
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
V
K
 
K
P
 
P
S
 
F
G
 
G
K
 
R
Y
 
H
V
 
V
A
 
M
T
 
S
D
 
D
L
 
V
H
 
D
K
 
H
A
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
V
L
 
M
K
 
K
V
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6ovtA Crystal structure of ilvd from mycobacterium tuberculosis (see paper)
47% identity, 99% coverage: 6:339/339 of query aligns to 7:345/562 of 6ovtA

query
sites
6ovtA
R
 
R
S
 
S
K
 
R
N
 
D
I
 
V
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
I
 
L
S
 
E
R
 
K
S
 
A
P
 
A
N
 
A
R
 
R
S
 
G
M
 
M
Y
 
L
Y
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
G
Y
 
M
E
 
D
K
 
D
E
 
E
D
 
D
F
 
F
D
 
A
K
 
K
P
 
P
M
 
Q
I
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
S
G
 
S
H
 
W
S
 
N
T
 
E
I
 
I
T
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
L
G
 
S
L
 
L
Q
 
D
K
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
N
I
 
A
A
 
V
I
 
K
S
 
E
S
 
G
I
 
V
K
 
F
D
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
Y
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
F
 
F
G
 
G
T
 
T
P
 
I
T
 
S
I
 
V
S
 
S
D
|
D
G
|
G
M
 
I
S
 
S
M
 
M
G
 
G
T
 
H
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
H
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
I
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
S
I
 
V
E
 
E
T
 
V
A
 
V
V
 
M
N
 
Q
G
 
A
Q
 
E
W
 
R
M
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
S
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
A
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
N
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
M
M
 
L
I
 
M
A
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
L
N
 
D
V
 
L
P
 
A
G
 
A
I
 
V
Y
 
F
V
 
L
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
T
 
S
I
 
I
K
 
L
P
 
P
G
 
G
K
 
R
W
 
A
K
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
S
G
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
V
T
 
T
I
 
I
V
 
I
S
 
D
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
A
F
 
C
S
 
S
A
 
R
G
 
G
R
 
L
M
 
M
S
 
S
Q
 
R
E
 
A
D
 
D
F
 
V
D
 
D
G
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
R
N
 
A
A
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
G
S
 
E
G
 
G
S
x
A
C
|
C
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
P
Y
 
G
S
 
S
S
 
A
T
 
A
M
 
P
A
 
P
N
 
A
P
 
T
D
 
D
E
 
R
E
 
R
K
 
R
T
 
D
G
 
G
S
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
S
 
S
A
 
G
K
 
Q
V
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
L
K
 
R
R
 
R
D
 
G
L
 
I
K
 
T
P
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
T
R
 
K
K
 
E
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
V
M
 
M
A
 
A
T
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
H
A
 
E
A
 
A
E
 
N
V
 
V
E
 
A
W
 
L
T
 
S
I
 
L
D
 
Q
D
 
D
F
 
F
E
 
S
R
 
R
V
 
I
R
 
G
Q
 
S
K
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
H
F
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
V
K
 
K
P
 
P
S
 
F
G
 
G
K
 
R
Y
 
H
V
 
V
A
 
M
T
 
S
D
 
D
L
 
V
H
 
D
K
 
H
A
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
V
L
 
M
K
 
K
V
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9LIR4 Dihydroxy-acid dehydratase, chloroplastic; AthDHAD; DAD; EC 4.2.1.9 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
48% identity, 99% coverage: 3:339/339 of query aligns to 53:389/608 of Q9LIR4

query
sites
Q9LIR4
F
 
L
N
 
N
R
 
K
R
 
Y
S
 
S
K
 
S
N
 
R
I
 
I
T
 
T
Q
 
E
G
 
P
I
 
K
S
 
S
R
 
Q
S
 
G
P
 
G
N
 
S
R
 
Q
S
 
A
M
 
I
Y
 
L
Y
 
H
A
 
G
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
S
K
 
D
E
 
D
D
 
D
F
 
L
D
 
L
K
 
K
P
 
P
M
 
Q
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
S
N
 
S
G
 
V
H
 
W
S
 
Y
T
 
E
I
 
G
T
 
N
P
 
T
C
|
C
N
 
N
S
 
M
G
 
H
L
 
L
Q
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
S
D
 
E
I
 
A
A
 
V
I
 
K
S
 
E
S
 
G
I
 
V
K
 
E
D
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
N
 
V
P
 
G
Q
 
F
V
 
R
F
 
F
G
 
N
T
 
T
P
 
I
T
 
G
I
 
V
S
 
S
D
 
D
G
 
A
M
 
I
S
 
S
M
 
M
G
 
G
T
 
T
E
 
R
G
 
G
M
 
M
K
 
C
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
I
 
Q
S
 
S
R
 
R
E
 
D
V
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
S
I
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
V
V
 
M
N
 
S
G
 
A
Q
 
Q
W
 
W
M
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
N
V
 
I
V
 
S
I
 
I
G
 
P
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
N
 
N
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
T
M
 
I
I
 
M
A
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
T
 
L
N
 
N
V
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
I
Y
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
H
W
 
F
K
 
Q
G
 
D
K
 
K
D
 
T
L
 
Y
T
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
Q
A
 
S
V
 
Y
G
 
G
E
 
E
F
 
F
S
 
V
A
 
S
G
 
G
R
 
S
M
 
I
S
 
S
Q
 
D
E
 
E
D
 
Q
F
 
R
D
 
K
G
 
T
I
 
V
E
 
L
K
 
H
N
 
H
A
 
S
C
 
C
P
 
P
S
 
G
S
 
A
G
 
G
S
 
A
C
|
C
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
A
F
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
M
G
 
G
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
P
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
T
 
S
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
E
D
 
D
E
 
P
E
 
L
K
 
K
T
 
L
G
 
D
S
 
E
A
 
C
A
 
R
Q
 
L
S
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
Y
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
L
V
 
L
K
 
K
R
 
M
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
R
 
R
D
 
D
I
 
I
I
 
I
N
 
T
R
 
P
K
 
K
S
 
S
I
 
L
E
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
V
L
 
S
I
 
V
M
 
M
A
 
A
T
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
L
L
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
S
A
 
V
E
 
G
V
 
L
E
 
E
W
 
L
T
 
T
I
 
L
D
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
Q
R
 
K
V
 
V
R
 
S
Q
 
D
K
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
F
F
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
M
T
 
E
D
 
D
L
 
I
H
 
H
K
 
K
A
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
R
V
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
M
H
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8hs0A The mutant structure of dhad v178w
48% identity, 99% coverage: 3:339/339 of query aligns to 15:351/570 of 8hs0A

query
sites
8hs0A
F
 
L
N
 
N
R
 
K
R
 
Y
S
 
S
K
 
S
N
 
R
I
 
I
T
 
T
Q
 
E
G
 
P
I
 
K
S
 
S
R
 
Q
S
 
G
P
 
G
N
 
S
R
 
Q
S
 
A
M
 
I
Y
 
L
Y
 
H
A
 
G
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
S
K
 
D
E
 
D
D
 
D
F
 
L
D
 
L
K
 
K
P
 
P
M
 
Q
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
S
N
 
S
G
 
V
H
 
W
S
 
Y
T
 
E
I
 
G
T
 
N
P
 
T
C
|
C
N
 
N
S
 
M
G
 
H
L
 
L
Q
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
S
D
 
E
I
 
A
A
 
V
I
 
K
S
 
E
S
 
G
I
 
V
K
 
E
D
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
N
 
V
P
 
G
Q
 
F
V
 
R
F
 
F
G
 
N
T
 
T
P
 
I
T
 
G
I
 
V
S
 
S
D
|
D
G
x
A
M
 
I
S
 
S
M
 
M
G
 
G
T
 
T
E
 
R
G
 
G
M
 
M
K
 
C
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
I
 
Q
S
 
S
R
 
R
E
 
D
V
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
S
I
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
V
V
 
M
N
 
S
G
 
A
Q
 
Q
W
 
W
M
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
N
V
 
I
V
 
S
I
 
I
G
 
P
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
N
 
N
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
T
M
 
I
I
 
M
A
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
T
 
L
N
 
N
V
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
I
Y
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
H
W
 
F
K
 
Q
G
 
D
K
 
K
D
 
T
L
 
Y
T
 
D
I
 
I
V
 
W
S
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
Q
A
 
S
V
 
Y
G
 
G
E
 
E
F
 
F
S
 
V
A
 
S
G
 
G
R
 
S
M
 
I
S
 
S
Q
 
D
E
 
E
D
 
Q
F
 
R
D
 
K
G
 
T
I
 
V
E
 
L
K
 
H
N
 
H
A
 
S
C
 
C
P
 
P
S
 
G
S
 
A
G
 
G
S
 
A
C
|
C
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
A
F
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
M
G
 
G
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
P
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
T
 
S
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
E
D
 
D
E
 
P
E
 
L
K
 
K
T
 
L
G
 
D
S
 
E
A
 
C
A
 
R
Q
 
L
S
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
Y
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
L
V
 
L
K
 
K
R
 
M
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
R
 
R
D
 
D
I
 
I
I
 
I
N
 
T
R
 
P
K
 
K
S
 
S
I
 
L
E
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
V
L
 
S
I
 
V
M
 
M
A
 
A
T
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
|
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
|
H
Y
 
L
L
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
S
A
 
V
E
 
G
V
 
L
E
 
E
W
 
L
T
 
T
I
 
L
D
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
Q
R
 
K
V
 
V
R
 
S
Q
 
D
K
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
F
F
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
M
T
 
E
D
 
D
L
 
I
H
 
H
K
 
K
A
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
R
V
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
M
H
 
D
G
 
G

8imuA Dihydroxyacid dehydratase (dhad) mutant-v497f
43% identity, 99% coverage: 3:339/339 of query aligns to 12:304/523 of 8imuA

query
sites
8imuA
F
 
L
N
 
N
R
 
K
R
 
Y
S
 
S
K
 
S
N
 
R
I
 
I
T
 
T
Q
 
E
G
 
P
I
 
K
S
 
S
R
 
Q
S
 
G
P
 
G
N
 
S
R
 
Q
S
 
A
M
 
I
Y
 
L
Y
 
H
A
 
G
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
S
K
 
D
E
 
D
D
 
D
F
 
L
D
 
L
K
 
K
P
 
P
M
 
Q
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
S
N
 
S
G
 
V
H
 
W
S
 
Y
T
 
E
I
 
G
T
x
N
P
 
T
C
|
C
N
 
N
S
 
M
G
 
H
L
 
L
Q
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
S
D
 
E
I
 
A
A
 
V
I
 
K
S
 
E
S
 
G
I
 
V
K
 
E
D
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
N
 
V
P
 
G
Q
 
F
V
 
R
F
 
F
G
 
N
T
 
T
P
 
I
T
 
G
I
 
V
S
 
S
D
 
D
G
 
A
M
 
I
S
 
S
M
 
M
G
 
G
T
 
T
E
 
R
G
 
G
M
 
M
K
 
C
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
I
 
Q
S
 
S
R
 
R
E
 
D
V
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
S
I
 
I
E
 
E
T
 
T
A
 
V
V
 
M
N
 
S
G
 
A
Q
 
Q
W
 
W
M
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
N
V
 
I
V
 
S
I
 
I
G
 
P
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
N
 
N
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
T
M
 
I
I
 
M
A
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
T
 
L
N
 
N
V
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
I
Y
 
M
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
-
W
 
-
K
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
C
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
C
 
-
G
 
-
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
A
F
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
M
G
 
G
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
P
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
T
 
S
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
E
D
 
D
E
 
P
E
 
L
K
 
K
T
 
L
G
 
D
S
 
E
A
 
C
A
 
R
Q
 
L
S
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
Y
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
L
V
 
L
K
 
K
R
 
M
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
R
 
R
D
 
D
I
 
I
I
 
I
N
 
T
R
 
P
K
 
K
S
 
S
I
 
L
E
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
V
L
 
S
I
 
V
M
 
M
A
 
A
T
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
L
L
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
S
A
 
V
E
 
G
V
 
L
E
 
E
W
 
L
T
 
T
I
 
L
D
 
D
D
 
D
F
 
F
E
 
Q
R
 
K
V
 
V
R
 
S
Q
 
D
K
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
F
F
 
L
C
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
M
T
 
E
D
 
D
L
 
I
H
 
H
K
 
K
A
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
R
V
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
M
H
 
D
G
 
G

5j85A Ser480ala mutant of l-arabinonate dehydratase (see paper)
37% identity, 98% coverage: 6:338/339 of query aligns to 9:340/576 of 5j85A

query
sites
5j85A
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
N
 
E
I
 
W
T
 
Y
Q
 
G
G
 
G
I
 
T
S
 
S
R
 
R
S
 
D
P
 
V
-
 
I
-
 
Y
N
 
H
R
 
R
S
 
G
M
 
W
Y
 
L
Y
 
K
A
 
N
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
E
 
P
K
 
H
E
 
D
D
 
L
F
 
F
D
 
D
-
 
G
K
 
R
P
 
P
M
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
L
N
 
N
G
 
T
H
 
W
S
 
S
T
 
D
I
 
M
T
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
G
G
 
H
L
 
L
Q
 
R
K
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
K
A
 
V
I
 
K
S
 
A
S
 
G
I
 
V
K
 
W
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
F
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
F
 
V
G
 
P
T
 
V
P
 
F
T
 
S
I
 
A
S
 
S
D
x
E
G
x
N
M
 
T
S
 
F
M
 
R
G
 
P
T
 
T
E
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
-
Y
 
-
S
 
A
L
 
M
I
 
M
S
 
Y
R
 
R
E
 
N
V
 
L
I
 
A
A
 
A
D
 
L
C
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
E
A
 
A
V
 
I
N
 
R
G
 
G
Q
 
Q
W
 
P
M
 
M
D
 
D
G
 
G
V
 
C
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
V
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
N
 
T
M
 
T
P
 
P
G
 
S
G
 
L
M
 
L
I
 
M
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
S
T
 
C
N
 
D
V
 
L
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Y
 
V
V
 
V
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
P
I
 
M
K
 
L
P
 
N
G
 
G
K
 
Y
W
 
F
K
 
R
G
 
G
K
 
E
D
 
R
L
 
V
T
 
G
I
 
S
V
 
G
S
 
T
A
 
H
F
 
L
E
 
W
A
 
K
V
 
F
G
 
S
E
 
E
F
 
M
-
 
V
S
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
E
M
 
M
S
 
T
Q
 
Q
E
 
A
D
 
E
F
 
F
D
 
L
G
 
E
I
 
A
E
 
E
K
 
A
N
 
S
A
 
M
C
 
S
P
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
G
S
x
T
C
|
C
G
 
N
G
 
T
M
 
M
Y
 
G
T
|
T
A
 
A
N
 
S
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
M
F
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
S
Y
 
G
S
 
N
S
 
A
T
 
A
M
 
I
A
 
P
N
 
G
P
 
V
D
 
D
E
 
S
E
 
R
K
 
R
T
 
K
G
 
V
S
 
M
A
 
A
A
 
Q
Q
 
L
S
 
T
A
 
G
K
 
R
V
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
A
 
M
V
 
V
K
 
K
R
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
R
 
S
D
 
E
I
 
I
I
 
M
N
 
T
R
 
K
K
 
Q
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
R
L
 
T
I
 
N
M
 
A
A
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
H
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
A
 
R
A
 
V
E
 
G
V
 
I
E
 
D
W
 
L
T
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
D
R
 
R
V
 
C
R
 
G
Q
 
R
K
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
T
F
 
I
C
 
V
D
 
N
L
 
L
K
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
V
 
L
A
 
M
T
 
E
D
 
E
L
 
F
H
 
F
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
K
V
 
R
L
 
L
L
 
G
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H

Sites not aligning to the query:

B5ZZ34 L-arabinonate dehydratase; ArDHT; D-fuconate dehydratase; Galactonate dehydratase; L-arabonate dehydratase; EC 4.2.1.25; EC 4.2.1.67; EC 4.2.1.6 from Rhizobium leguminosarum bv. trifolii (strain WSM2304) (see 2 papers)
37% identity, 98% coverage: 6:338/339 of query aligns to 12:343/579 of B5ZZ34

query
sites
B5ZZ34
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
N
 
E
I
 
W
T
 
Y
Q
 
G
G
 
G
I
 
T
S
 
S
R
 
R
S
 
D
P
 
V
-
 
I
-
 
Y
N
 
H
R
 
R
S
 
G
M
 
W
Y
 
L
Y
 
K
A
 
N
L
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
E
 
P
K
 
H
E
 
D
D
 
L
F
 
F
D
 
D
-
 
G
K
 
R
P
 
P
M
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
L
N
 
N
G
 
T
H
 
W
S
 
S
T
 
D
I
 
M
T
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
G
G
 
H
L
 
L
Q
 
R
K
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
K
A
 
V
I
 
K
S
 
A
S
 
G
I
 
V
K
 
W
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
F
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
F
 
V
G
 
P
T
 
V
P
 
F
T
 
S
I
 
A
S
 
S
D
x
E
G
 
N
M
 
T
S
 
F
M
 
R
G
 
P
T
 
T
E
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
-
Y
 
-
S
 
A
L
 
M
I
 
M
S
 
Y
R
 
R
E
 
N
V
 
L
I
 
A
A
 
A
D
 
L
C
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
E
A
 
A
V
 
I
N
 
R
G
 
G
Q
 
Q
W
 
P
M
 
M
D
 
D
G
 
G
V
 
C
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
V
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
N
 
T
M
 
T
P
 
P
G
 
S
G
 
L
M
 
L
I
 
M
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
S
T
 
C
N
 
D
V
 
L
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Y
 
V
V
 
V
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
P
I
 
M
K
 
L
P
 
N
G
 
G
K
 
Y
W
 
F
K
 
R
G
 
G
K
 
E
D
 
R
L
 
V
T
 
G
I
 
S
V
 
G
S
 
T
A
 
H
F
 
L
E
 
W
A
 
K
V
 
F
G
 
S
E
 
E
F
 
M
-
 
V
S
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
E
M
 
M
S
 
T
Q
 
Q
E
 
A
D
 
E
F
 
F
D
 
L
G
 
E
I
 
A
E
 
E
K
 
A
N
 
S
A
 
M
C
 
S
P
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
G
S
 
T
C
|
C
G
 
N
G
 
T
M
 
M
Y
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
S
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
M
F
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
S
Y
 
G
S
 
N
S
 
A
T
 
A
M
 
I
A
 
P
N
 
G
P
 
V
D
 
D
E
 
S
E
 
R
K
 
R
T
 
K
G
 
V
S
 
M
A
 
A
A
 
Q
Q
 
L
S
 
T
A
 
G
K
 
R
V
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
A
 
M
V
 
V
K
 
K
R
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
R
 
S
D
 
E
I
 
I
I
 
M
N
 
T
R
 
K
K
 
Q
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
R
L
 
T
I
 
N
M
 
A
A
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
H
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
A
 
R
A
 
V
E
 
G
V
 
I
E
 
D
W
 
L
T
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
D
R
 
R
V
 
C
R
 
G
Q
 
R
K
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
T
F
 
I
C
 
V
D
 
N
L
 
L
K
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
V
 
L
A
 
M
T
 
E
D
 
E
L
 
F
H
 
F
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
K
V
 
R
L
 
L
L
 
G
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H

Sites not aligning to the query:

8ej0A Crystal structure of fe-s cluster-dependent dehydratase from paralcaligenes ureilyticus in complex with mg
37% identity, 92% coverage: 20:331/339 of query aligns to 19:327/568 of 8ej0A

query
sites
8ej0A
R
 
R
S
 
S
M
 
W
Y
 
M
Y
 
K
A
 
N
L
 
R
G
 
G
Y
 
I
E
 
P
K
 
H
E
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
D
-
 
G
K
 
R
P
 
P
M
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
C
N
 
N
G
 
T
H
 
F
S
 
S
T
 
E
I
 
L
T
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
S
G
 
H
L
 
F
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
A
 
V
I
 
K
S
 
I
S
 
G
I
 
V
K
 
W
D
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
G
N
 
F
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
F
 
F
G
 
P
T
 
V
P
 
M
T
 
S
I
 
L
S
 
G
D
x
E
G
 
T
M
 
M
S
 
L
M
 
R
G
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
M
M
 
L
K
 
F
Y
 
R
S
 
N
L
 
L
I
 
A
S
 
S
R
 
M
E
 
D
V
 
V
I
 
-
A
 
-
D
 
-
C
 
-
I
 
-
E
 
E
T
 
E
A
 
S
V
 
I
N
 
R
G
 
G
Q
 
N
W
 
P
M
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
M
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
N
 
T
M
 
T
P
 
P
G
 
S
G
 
L
M
 
M
I
 
M
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
S
T
 
C
N
 
D
V
 
L
P
 
P
G
 
T
I
 
I
Y
 
G
V
 
V
Y
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
P
I
 
M
K
 
L
P
 
S
G
 
G
K
 
K
W
 
F
K
 
R
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
L
-
 
G
T
 
S
I
 
G
V
 
T
S
 
D
A
 
V
F
x
W
E
 
K
A
 
M
V
 
S
G
 
E
E
 
E
F
 
V
S
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
F
G
 
E
I
 
A
E
 
E
K
 
S
N
 
C
A
 
M
C
 
H
P
 
R
S
 
S
S
 
H
G
 
G
S
 
H
C
|
C
G
 
M
G
 
T
M
 
M
Y
 
G
T
|
T
A
 
A
N
 
S
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
M
F
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
P
Y
 
G
S
 
N
S
 
A
T
 
A
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
R
K
 
R
T
 
N
G
 
L
S
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
A
S
 
S
A
 
G
K
 
R
V
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
A
 
M
V
 
V
K
 
K
R
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
V
P
 
M
R
 
S
D
 
K
I
 
I
I
 
L
N
 
T
R
 
R
K
 
Q
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
R
L
 
V
I
 
N
M
 
A
A
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
H
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
A
 
R
A
 
I
E
 
G
V
 
V
E
 
D
W
 
L
T
 
T
I
 
L
D
 
A
D
 
D
F
 
W
E
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
G
Q
 
H
K
 
K
V
 
L
P
 
P
V
 
C
F
 
L
C
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
T
Y
 
H
V
 
L
A
 
M
T
 
E
D
 
D
L
 
F
H
 
Y
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
I
K
 
R
V
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8epzA Crystal structure of fe-s cluster-dependent dehydratase from paralcaligenes ureilyticus in complex with mn
37% identity, 92% coverage: 20:331/339 of query aligns to 20:328/569 of 8epzA

query
sites
8epzA
R
 
R
S
 
S
M
 
W
Y
 
M
Y
 
K
A
 
N
L
 
R
G
 
G
Y
 
I
E
 
P
K
 
H
E
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
D
-
 
G
K
 
R
P
 
P
M
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
C
N
 
N
G
 
T
H
 
F
S
 
S
T
 
E
I
 
L
T
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
S
G
 
H
L
 
F
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
A
 
V
I
 
K
S
 
I
S
 
G
I
 
V
K
 
W
D
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
G
N
 
F
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
F
 
F
G
 
P
T
 
V
P
 
M
T
 
S
I
 
L
S
 
G
D
x
E
G
 
T
M
 
M
S
 
L
M
 
R
G
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
M
M
 
L
K
 
F
Y
 
R
S
 
N
L
 
L
I
 
A
S
 
S
R
 
M
E
 
D
V
 
V
I
 
-
A
 
-
D
 
-
C
 
-
I
 
-
E
 
E
T
 
E
A
 
S
V
 
I
N
 
R
G
 
G
Q
 
N
W
 
P
M
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
M
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
N
 
T
M
 
T
P
 
P
G
 
S
G
 
L
M
 
M
I
 
M
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
S
T
 
C
N
 
D
V
 
L
P
 
P
G
 
T
I
 
I
Y
 
G
V
 
V
Y
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
P
I
 
M
K
 
L
P
 
S
G
 
G
K
 
K
W
 
F
K
 
R
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
L
-
 
G
T
 
S
I
 
G
V
 
T
S
 
D
A
 
V
F
 
W
E
 
K
A
 
M
V
 
S
G
 
E
E
 
E
F
 
V
S
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
F
G
 
E
I
 
A
E
 
E
K
 
S
N
 
C
A
 
M
C
 
H
P
 
R
S
 
S
S
 
H
G
 
G
S
 
H
C
|
C
G
 
M
G
 
T
M
 
M
Y
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
S
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
S
S
 
M
F
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
P
Y
 
G
S
 
N
S
 
A
T
 
A
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
V
D
 
D
E
 
A
E
 
R
K
 
R
T
 
N
G
 
L
S
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
A
S
 
S
A
 
G
K
 
R
V
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
A
 
M
V
 
V
K
 
K
R
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
V
P
 
M
R
 
S
D
 
K
I
 
I
I
 
L
N
 
T
R
 
R
K
 
Q
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
R
L
 
V
I
 
N
M
 
A
A
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
H
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
A
 
R
A
 
I
E
 
G
V
 
V
E
 
D
W
 
L
T
 
T
I
 
L
D
 
A
D
 
D
F
 
W
E
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
G
Q
 
H
K
 
K
V
 
L
P
 
P
V
 
C
F
 
L
C
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
T
Y
 
H
V
 
L
A
 
M
T
 
E
D
 
D
L
 
F
H
 
Y
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
I
K
 
R
V
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9A9Z2 D-xylonate dehydratase; XyDHT; Gluconate dehydratase; EC 4.2.1.82; EC 4.2.1.39 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see 2 papers)
35% identity, 94% coverage: 20:339/339 of query aligns to 34:348/595 of Q9A9Z2

query
sites
Q9A9Z2
R
 
R
S
 
F
M
 
M
Y
 
N
Y
 
Y
A
 
G
L
 
I
G
 
T
Y
 
P
E
 
E
K
 
E
E
 
L
D
 
R
F
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
I
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
N
 
Q
G
 
T
H
 
G
S
 
S
T
 
D
I
 
I
T
 
S
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
R
G
 
I
L
 
H
Q
 
L
K
 
D
L
 
L
A
 
V
D
 
Q
I
 
R
A
 
V
I
 
R
S
 
D
S
 
G
I
 
I
K
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
I
P
 
P
Q
 
M
V
 
E
F
 
F
G
 
P
T
 
V
P
 
H
T
 
P
I
 
I
S
 
F
D
x
E
G
 
N
M
 
C
S
 
R
M
 
R
G
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
A
M
 
L
K
 
D
Y
 
R
S
 
N
L
 
L
I
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
S
I
 
Y
A
 
L
D
 
G
C
 
L
I
 
V
E
 
E
T
 
T
A
 
-
V
 
L
N
 
H
G
 
G
Q
 
Y
W
 
P
M
 
I
D
 
D
G
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
T
G
 
T
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
N
 
T
M
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
G
M
 
I
I
 
M
A
 
A
L
 
A
A
 
T
R
 
T
T
 
V
N
 
N
V
 
I
P
 
P
G
 
A
I
 
I
Y
 
V
V
 
L
Y
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
P
I
 
M
K
 
L
P
 
D
G
 
G
K
 
-
W
 
W
K
 
H
G
 
E
K
 
N
D
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
G
T
 
T
I
 
V
V
 
I
S
 
-
A
 
-
F
 
W
E
 
R
A
 
S
V
 
R
G
 
R
E
 
K
F
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E
M
 
I
S
 
T
Q
 
E
E
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
I
G
 
D
I
 
R
E
 
A
K
 
A
N
 
S
A
 
S
C
 
A
P
 
P
S
 
S
S
 
A
G
 
G
S
 
H
C
|
C
G
 
N
G
 
T
M
 
M
Y
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
S
T
 
T
M
 
M
S
 
N
S
 
A
S
 
V
F
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
S
L
 
L
F
 
T
Y
 
G
S
 
C
S
 
A
T
 
A
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
P
D
 
Y
E
 
R
E
 
E
K
 
R
T
 
G
G
 
Q
S
 
M
A
 
A
A
 
Y
Q
 
K
S
 
T
A
 
G
K
 
Q
V
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
D
A
 
L
V
 
A
K
 
Y
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
K
P
 
P
R
 
L
D
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
T
R
 
K
K
 
Q
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
A
L
 
L
I
 
V
M
 
A
A
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
Q
L
 
P
H
 
H
Y
 
I
L
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
A
H
 
R
A
 
H
A
 
A
E
 
G
V
 
V
E
 
E
W
 
I
T
 
T
I
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
-
R
 
R
V
 
A
R
 
A
Q
 
Y
K
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
L
F
 
I
C
 
V
D
 
N
L
 
M
K
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
V
 
L
A
 
G
T
 
E
D
 
R
L
 
F
H
 
H
K
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
W
V
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
R
L
 
L
H
 
H
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5oynA Crystal structure of d-xylonate dehydratase in holo-form (see paper)
35% identity, 94% coverage: 20:339/339 of query aligns to 28:342/589 of 5oynA

query
sites
5oynA
R
 
R
S
 
F
M
 
M
Y
 
N
Y
 
Y
A
 
G
L
 
I
G
 
T
Y
 
P
E
 
E
K
 
E
E
 
L
D
 
R
F
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
P
M
 
I
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
N
 
Q
G
 
T
H
 
G
S
 
S
T
 
D
I
 
I
T
 
S
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
R
G
 
I
L
 
H
Q
 
L
K
 
D
L
 
L
A
 
V
D
 
Q
I
 
R
A
 
V
I
 
R
S
 
D
S
 
G
I
 
I
K
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
I
P
 
P
Q
 
M
V
 
E
F
 
F
G
 
P
T
 
V
P
 
H
T
 
P
I
 
I
S
 
F
D
x
E
G
x
N
M
 
C
S
 
R
M
 
R
G
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
A
M
 
L
K
 
D
Y
 
R
S
 
N
L
 
L
I
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
S
I
 
Y
A
 
L
D
 
G
C
 
L
I
 
V
E
 
E
T
 
T
A
 
-
V
 
L
N
 
H
G
 
G
Q
 
Y
W
 
P
M
 
I
D
 
D
G
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
T
G
 
T
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
N
 
T
M
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
G
M
 
I
I
 
M
A
 
A
L
 
A
A
 
T
R
 
T
T
 
V
N
 
N
V
 
I
P
 
P
G
 
A
I
 
I
Y
 
V
V
 
L
Y
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
P
I
 
M
K
 
L
P
 
D
G
 
G
K
 
-
W
 
W
K
 
H
G
 
E
K
 
N
D
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
G
T
 
T
I
 
V
V
 
I
S
 
-
A
 
-
F
 
W
E
 
R
A
 
S
V
 
R
G
 
R
E
 
K
F
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E
M
 
I
S
 
T
Q
 
E
E
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
I
G
 
D
I
 
R
E
 
A
K
 
A
N
 
S
A
 
S
C
 
A
P
 
P
S
 
S
S
 
A
G
 
G
S
 
H
C
|
C
G
 
N
G
 
T
M
 
M
Y
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
S
T
 
T
M
 
M
S
 
N
S
 
A
S
 
V
F
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
S
L
 
L
F
 
T
Y
 
G
S
 
C
S
 
A
T
 
A
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
P
D
 
Y
E
 
R
E
 
E
K
 
R
T
 
G
G
 
Q
S
 
M
A
 
A
A
 
Y
Q
 
K
S
 
T
A
 
G
K
 
Q
V
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
D
A
 
L
V
 
A
K
 
Y
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
K
P
 
P
R
 
L
D
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
T
R
 
K
K
 
Q
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
A
L
 
L
I
 
V
M
 
A
A
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
Q
L
 
P
H
 
H
Y
 
I
L
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
A
H
 
R
A
 
H
A
 
A
E
 
G
V
 
V
E
 
E
W
 
I
T
 
T
I
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
-
R
 
R
V
 
A
R
 
A
Q
 
Y
K
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
L
F
 
I
C
 
V
D
 
N
L
 
M
K
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
V
 
L
A
 
G
T
 
E
D
 
R
L
 
F
H
 
H
K
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
W
V
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
R
L
 
L
H
 
H
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7m3kA Crystal structure of galactonate dehydratase from brucella melitensis biovar abortus 2308
33% identity, 94% coverage: 20:338/339 of query aligns to 23:337/587 of 7m3kA

query
sites
7m3kA
R
 
R
S
 
Y
M
 
M
Y
 
N
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
G
 
S
Y
 
Q
E
 
E
K
 
E
E
 
L
D
 
Q
F
 
S
D
 
G
K
 
R
P
 
P
M
 
I
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
N
 
Q
G
 
T
H
 
G
S
 
S
T
 
D
I
 
L
T
 
S
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
R
G
 
H
L
 
H
Q
 
L
K
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
K
I
 
R
A
 
V
I
 
R
S
 
D
S
 
G
I
 
V
K
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
I
P
 
V
Q
 
I
V
 
E
F
 
F
G
 
P
T
 
V
P
 
H
T
 
P
I
 
I
S
 
Q
D
 
E
G
 
T
M
 
G
S
 
K
M
 
R
G
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
M
 
L
K
 
D
Y
 
R
S
 
N
L
 
L
I
 
A
S
 
Y
R
 
L
E
 
G
V
 
L
I
 
V
A
 
-
D
 
-
C
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
E
A
 
V
V
 
L
N
 
Y
G
 
G
Q
 
Y
W
 
P
M
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
T
G
 
I
G
 
G
C
|
C
D
 
D
K
 
K
N
 
T
M
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
C
M
 
L
I
 
M
A
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
T
T
 
V
N
 
N
V
 
I
P
 
P
G
 
A
I
 
I
Y
 
A
V
 
L
Y
 
S
G
 
V
G
 
G
T
 
P
I
 
M
K
 
L
P
 
N
G
 
G
K
 
W
W
 
F
K
 
R
G
 
G
K
 
E
D
 
R
L
 
T
-
 
G
-
 
S
-
 
G
T
 
T
I
 
I
V
 
V
S
 
-
A
 
-
F
 
W
E
 
K
A
 
A
V
 
R
G
 
E
E
 
L
F
 
L
S
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
E
M
 
I
S
 
D
Q
 
Y
E
 
Q
D
 
G
F
 
F
D
 
V
G
 
K
I
 
L
E
 
V
K
 
A
N
 
S
A
 
S
C
 
A
P
 
P
S
 
S
S
 
T
G
 
G
S
 
Y
C
 
C
G
 
N
G
 
T
M
 
M
Y
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
T
T
 
T
M
 
M
S
 
N
S
 
S
S
 
L
F
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
Q
L
 
L
F
 
P
Y
 
G
S
 
S
S
 
A
T
 
A
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
P
D
 
Y
E
 
R
E
 
D
K
 
R
T
 
Q
G
 
E
S
 
V
A
 
A
A
 
Y
Q
 
L
S
 
M
A
 
G
K
 
R
V
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
M
V
 
V
K
 
H
R
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
R
 
S
D
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
T
R
 
K
K
 
E
S
 
A
I
 
F
E
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
R
L
 
V
I
 
N
M
 
S
A
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
P
L
 
I
H
 
H
Y
 
L
L
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
R
A
 
H
A
 
I
E
 
G
V
 
V
E
 
E
W
 
L
T
 
T
I
 
V
D
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
Q
R
 
K
V
 
Y
R
 
G
Q
 
E
K
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
L
F
 
L
C
 
V
D
 
N
L
 
L
K
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
G
K
 
E
Y
 
Y
V
 
L
A
 
G
T
 
E
D
 
D
L
 
Y
H
 
Y
K
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
V
K
 
N
V
 
Q
L
 
L
L
 
M
Q
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
I
H
 
H

Q1JUQ1 L-arabonate dehydratase; L-arabinonate dehydratase; EC 4.2.1.25 from Azospirillum brasilense (see paper)
35% identity, 94% coverage: 20:337/339 of query aligns to 25:339/583 of Q1JUQ1

query
sites
Q1JUQ1
R
 
R
S
 
S
M
 
W
Y
 
M
Y
 
K
A
 
N
L
 
Q
G
 
G
Y
 
I
E
 
P
K
 
D
E
 
H
D
 
E
F
 
F
D
 
D
-
 
G
K
 
R
P
 
P
M
 
I
I
 
I
G
 
G
V
 
I
A
x
C
N
 
N
G
 
T
H
 
W
S
 
S
T
 
E
I
 
L
T
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
S
 
A
G
 
H
L
 
F
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
H
A
 
V
I
 
K
S
 
R
S
 
G
I
 
I
K
 
S
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
F
P
 
P
Q
 
V
V
 
E
F
 
F
G
 
-
T
 
-
P
 
P
T
 
V
I
 
F
S
 
S
D
 
N
G
 
G
M
 
E
S
 
S
M
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
N
G
 
L
M
 
R
K
 
P
Y
 
S
S
 
A
L
 
M
I
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
N
V
 
L
I
 
A
A
 
S
D
 
M
C
 
D
I
 
V
E
 
E
T
 
E
A
 
A
V
 
I
N
 
R
G
 
G
Q
 
N
W
 
P
M
 
I
D
 
D
G
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
A
G
 
G
C
|
C
D
 
D
K
 
K
N
 
T
M
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
L
M
 
L
I
 
M
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
S
T
 
C
N
 
D
V
 
V
P
 
P
G
 
A
I
 
I
Y
 
V
V
 
V
Y
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
P
I
 
M
K
 
L
P
 
N
G
 
G
K
 
K
W
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
D
 
N
L
 
I
T
 
G
I
 
S
V
 
G
S
 
T
A
 
A
F
 
V
E
 
W
A
 
Q
V
 
L
G
 
H
E
 
E
-
 
A
F
 
L
S
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
E
M
 
I
S
 
D
Q
 
V
E
 
H
D
 
H
F
 
F
D
 
L
G
 
S
I
 
A
E
 
E
K
 
A
N
 
G
A
 
M
C
 
S
P
 
R
S
 
S
S
 
A
G
 
G
S
 
T
C
|
C
G
 
N
G
 
T
M
 
M
Y
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
S
T
 
T
M
 
M
S
 
A
S
 
C
S
 
M
F
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
V
A
 
A
L
 
L
F
 
P
Y
 
H
S
 
N
S
 
A
T
 
A
M
 
I
A
 
P
N
 
A
P
 
V
D
 
D
E
 
S
E
 
R
K
 
R
T
 
Y
G
 
V
S
 
L
A
 
A
A
 
H
Q
 
M
S
 
S
A
 
G
K
 
I
V
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
M
V
 
A
K
 
L
R
 
E
D
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
L
R
 
S
D
 
K
I
 
I
I
 
L
N
 
T
R
 
R
K
 
A
S
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
I
T
 
R
L
 
A
I
 
N
M
 
A
A
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
H
Y
 
L
L
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
A
 
R
A
 
I
E
 
G
V
 
V
E
 
P
W
 
L
T
 
E
I
 
L
D
 
E
D
 
D
F
 
W
E
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
G
Q
 
R
K
 
D
V
 
T
P
 
P
V
 
T
F
 
I
C
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
R
Y
 
F
V
 
P
A
 
M
T
 
E
D
 
E
L
 
F
H
 
Y
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
R
V
 
R
L
 
L
L
 
G
Q
 
E
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_198155988.1 NCBI__GCF_001189915.1:WP_198155988.1
MSFNRRSKNITQGISRSPNRSMYYALGYEKEDFDKPMIGVANGHSTITPCNSGLQKLADI
AISSIKDAGANPQVFGTPTISDGMSMGTEGMKYSLISREVIADCIETAVNGQWMDGVVVI
GGCDKNMPGGMIALARTNVPGIYVYGGTIKPGKWKGKDLTIVSAFEAVGEFSAGRMSQED
FDGIEKNACPSSGSCGGMYTANTMSSSFEALGMALFYSSTMANPDEEKTGSAAQSAKVLV
EAVKRDLKPRDIINRKSIENAVTLIMATGGSTNAVLHYLAIAHAAEVEWTIDDFERVRQK
VPVFCDLKPSGKYVATDLHKAGGIPAVLKVLLQAGLLHG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory