SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_207545213.1 NCBI__GCF_900115975.1:WP_207545213.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:244/248 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
V
 
I
L
 
L
E
 
R
I
 
T
K
 
E
D
 
N
L
 
I
T
 
V
V
 
K
S
 
Y
F
|
F
D
 
G
G
 
E
F
|
F
K
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
T
 
I
A
 
S
V
 
V
K
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
D
I
 
V
H
 
T
F
 
L
F
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
D
 
N
A
 
V
I
 
I
C
 
T
G
 
G
R
 
F
V
 
L
K
 
K
P
 
A
A
 
D
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
F
 
Y
F
 
F
K
 
E
D
 
N
C
 
-
G
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
T
K
 
N
L
 
K
A
 
E
E
 
P
H
 
A
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
E
 
H
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
R
 
R
K
 
T
F
 
F
Q
 
Q
V
 
T
P
 
P
S
 
Q
V
 
P
F
 
L
N
 
K
S
 
E
I
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
E
N
 
N
M
 
L
E
 
L
L
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
C
-
 
P
A
 
G
A
 
E
E
 
S
K
 
P
K
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
L
F
 
F
S
 
Y
T
 
K
L
 
K
F
 
W
S
 
I
K
 
P
L
 
K
S
 
E
Q
 
E
E
 
E
Q
 
M
M
 
V
E
 
E
R
 
K
I
 
A
E
 
F
Y
 
K
V
 
I
L
 
L
N
 
E
I
 
F
I
 
L
G
 
K
L
 
L
Y
 
S
E
 
H
K
 
L
R
 
Y
F
 
D
E
 
R
K
 
K
P
 
A
A
 
G
A
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
M
Q
 
K
W
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
M
Q
 
T
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
M
M
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
R
 
P
K
 
G
-
 
L
E
 
A
T
 
H
D
 
D
K
 
I
T
 
F
G
 
N
E
 
H
L
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
L
I
 
K
A
 
A
K
 
K
D
 
G
C
 
I
S
 
T
V
 
F
V
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
D
 
D
F
 
I
V
 
V
R
 
L
D
 
N
F
 
Y
A
 
I
S
 
D
T
 
H
V
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
H
 
F
E
 
N
G
 
G
T
 
Q
L
 
I
L
 
I
V
 
A
E
 
E
G
 
G
D
 
R
M
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
Q
 
L
K
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:244/248 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
V
 
I
L
 
L
E
 
R
I
 
T
K
 
E
D
 
N
L
 
I
T
 
V
V
 
K
S
 
Y
F
|
F
D
 
G
G
 
E
F
|
F
K
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
T
 
I
A
 
S
V
 
V
K
 
C
K
 
K
G
 
G
D
 
D
I
 
V
H
 
T
F
 
L
F
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
D
 
N
A
 
V
I
 
I
C
 
T
G
 
G
R
 
F
V
 
L
K
 
K
P
 
A
A
 
D
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
F
 
Y
F
 
F
K
 
E
D
 
N
C
 
-
G
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
T
K
 
N
L
 
K
A
 
E
E
 
P
H
 
A
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
E
 
H
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
R
 
R
K
 
T
F
 
F
Q
 
Q
V
 
T
P
 
P
S
 
Q
V
 
P
F
 
L
N
 
K
S
 
E
I
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
E
N
 
N
M
 
L
E
 
L
L
 
I
A
 
G
-
 
E
A
 
I
E
 
N
K
 
P
K
 
G
R
 
E
T
 
S
I
 
P
F
 
L
S
 
N
T
 
S
L
 
L
F
 
F
S
 
Y
K
 
K
-
 
K
-
 
W
-
 
I
-
 
P
L
 
K
S
 
E
Q
 
E
E
 
E
Q
 
M
M
 
V
E
 
E
R
 
K
I
 
A
E
 
F
Y
 
K
V
 
I
L
 
L
N
 
E
I
 
F
I
 
L
G
 
K
L
 
L
Y
 
S
E
 
H
K
 
L
R
 
Y
F
 
D
E
 
R
K
 
K
P
 
A
A
 
G
A
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
M
Q
 
K
W
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
M
Q
 
T
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
M
M
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
R
 
P
K
 
G
-
 
L
E
 
A
T
 
H
D
 
D
K
 
I
T
 
F
G
 
N
E
 
H
L
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
L
I
 
K
A
 
A
K
 
K
D
 
G
C
 
I
S
 
T
V
 
F
V
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
D
 
D
F
 
I
V
 
V
R
 
L
D
 
N
F
 
Y
A
 
I
S
 
D
T
 
H
V
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
H
 
F
E
 
N
G
 
G
T
 
Q
L
 
I
L
 
I
V
 
A
E
 
E
G
 
G
D
 
R
M
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
Q
 
L
K
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
29% identity, 98% coverage: 2:244/248 of query aligns to 4:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
D
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
V
K
 
Q
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
S
 
Y
F
x
Y
D
 
G
G
 
A
F
 
I
K
 
H
A
 
A
V
 
I
N
 
K
D
 
G
V
 
I
S
 
D
T
 
L
A
 
K
V
 
V
K
 
P
K
 
R
G
 
G
D
 
Q
I
 
I
H
 
V
F
 
T
F
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
D
 
S
A
 
A
I
 
I
C
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
V
K
 
R
P
 
A
A
 
Q
A
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
F
 
I
F
 
F
K
 
-
D
 
N
C
 
G
G
 
Q
D
 
D
V
 
I
T
 
T
K
 
N
L
 
K
A
 
P
E
 
A
H
 
H
E
 
V
I
 
I
V
 
N
E
 
R
R
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
A
R
 
L
K
 
V
F
 
P
Q
x
E
V
 
G
P
 
R
S
 
R
V
 
I
F
 
F
N
 
P
S
 
E
I
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
L
E
 
M
L
 
M
A
 
G
A
 
A
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
Y
S
 
N
K
 
R
L
 
K
S
 
D
Q
 
K
E
 
E
Q
 
G
M
 
I
E
 
K
R
 
R
-
 
D
I
 
L
E
 
E
Y
 
W
V
 
I
L
 
F
N
 
S
I
 
L
I
 
F
G
 
P
L
 
R
Y
 
L
E
 
K
K
 
E
R
 
R
F
 
L
E
 
K
K
 
Q
-
 
L
P
 
G
A
 
G
A
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
W
 
M
L
 
L
E
 
A
I
 
I
G
 
G
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
M
Q
 
S
Q
 
R
P
 
P
E
 
K
I
 
L
M
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
A
R
 
P
K
 
I
E
 
L
T
 
V
D
 
S
K
 
E
T
 
V
G
 
F
E
 
E
L
 
V
L
 
I
K
 
Q
E
 
K
I
 
I
A
 
N
K
 
Q
D
 
E
-
 
G
C
 
T
S
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
D
 
L
F
 
G
V
 
A
R
 
L
D
 
K
F
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
Y
V
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
H
 
E
E
 
T
G
 
G
T
 
Q
L
 
I
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
G
D
 
K
M
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
L
Q
 
L
K
 
D
D
 
N
P
 
E
R
 
M
V
 
V
I
 
R
E
 
K
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
29% identity, 91% coverage: 7:232/248 of query aligns to 4:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
V
K
 
N
D
 
D
L
 
V
T
 
Y
V
 
K
S
 
N
F
|
F
D
 
G
G
 
S
F
 
L
K
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
D
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
L
A
 
K
V
 
V
K
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
I
 
V
H
 
V
F
 
V
F
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
C
I
 
I
C
 
N
G
 
L
R
 
L
V
 
E
K
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
I
K
 
D
D
 
G
C
 
V
G
 
K
D
 
I
V
 
N
T
 
N
K
 
G
L
 
K
A
 
V
E
 
N
H
 
I
E
 
N
I
 
K
V
 
V
E
 
R
R
 
Q
G
 
K
I
 
V
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
H
P
 
F
S
 
N
V
 
L
F
 
F
N
 
P
S
 
H
I
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
I
E
 
E
N
 
N
M
 
I
E
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
P
E
 
V
K
 
K
K
 
V
R
 
K
T
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
K
L
 
M
S
 
N
Q
 
K
E
 
K
Q
 
E
M
 
A
E
 
E
R
 
E
I
 
L
E
 
A
Y
 
V
-
 
D
V
 
L
L
 
L
N
 
A
I
 
K
I
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
E
 
D
K
 
K
R
 
K
F
 
D
E
 
Q
K
 
Y
P
 
P
A
 
I
A
 
K
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
W
 
R
L
 
L
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
A
Q
 
M
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
I
 
V
M
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
R
 
P
K
 
E
E
 
M
T
 
V
D
 
K
K
 
E
T
 
V
G
 
L
E
 
N
L
 
V
L
 
M
K
 
K
E
 
Q
I
 
L
A
 
A
K
 
N
D
 
E
-
 
G
C
 
M
S
 
T
V
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
D
 
G
F
 
F
V
 
A
R
 
R
D
 
E
F
 
V
A
 
G
S
 
D
T
 
R
V
 
V
T
 
I
V
 
F
L
 
M
H
 
D
E
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
I
L
 
V
V
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
T
M
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 89% coverage: 17:237/248 of query aligns to 18:233/343 of P30750

query
sites
P30750
F
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
I
H
 
Y
F
 
G
F
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
D
 
R
A
 
C
I
 
V
C
 
N
G
 
L
R
 
L
V
 
E
K
 
R
P
 
P
A
 
T
A
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
F
 
L
F
 
V
K
 
-
D
 
D
C
 
G
G
 
Q
D
 
E
V
 
L
T
 
T
K
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
E
H
 
S
E
 
E
I
 
L
V
 
T
E
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
I
F
 
F
Q
 
Q
V
 
H
P
 
F
S
 
N
V
 
L
F
 
L
N
 
S
S
 
S
I
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
N
 
N
M
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
L
E
 
E
K
 
L
K
 
D
R
 
N
T
 
T
I
 
P
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
K
Q
 
D
E
 
E
Q
 
V
M
 
K
E
 
R
R
 
R
I
 
V
E
 
T
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
S
I
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
G
E
 
D
K
 
K
R
 
H
F
 
D
E
 
S
K
 
Y
P
 
P
A
 
S
A
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
A
Q
 
S
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
R
 
P
K
 
A
E
 
T
T
 
T
D
 
R
K
 
S
T
 
I
G
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
N
K
 
R
D
 
R
-
 
L
-
 
G
C
 
L
S
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
D
F
 
V
V
 
V
R
 
K
D
 
R
F
 
I
A
 
C
S
 
D
T
 
C
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
S
E
 
N
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
Q
G
 
D
D
 
T
M
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
F
K
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
31% identity, 89% coverage: 17:237/248 of query aligns to 19:234/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
F
x
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
I
H
 
Y
F
 
G
F
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
D
 
R
A
 
C
I
 
V
C
 
N
G
 
L
R
 
L
V
 
E
K
 
R
P
 
P
A
 
T
A
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
F
 
L
F
 
V
K
 
-
D
 
D
C
 
G
G
 
Q
D
 
E
V
 
L
T
 
T
K
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
E
H
 
S
E
 
E
I
 
L
V
 
T
E
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
I
F
 
F
Q
 
Q
V
 
H
P
 
F
S
 
N
V
 
L
F
 
L
N
 
S
S
 
S
I
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
N
 
N
M
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
L
E
 
E
K
 
L
K
 
D
R
 
N
T
 
T
I
 
P
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
K
Q
 
D
E
 
E
Q
 
V
M
 
K
E
 
R
R
 
R
I
 
V
E
 
T
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
S
I
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
G
E
 
D
K
 
K
R
 
H
F
 
D
E
 
S
K
 
Y
P
 
P
A
 
S
A
x
N
L
 
L
S
|
S
H
 
G
G
 
G
E
x
Q
K
 
K
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
A
Q
 
S
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
R
 
P
K
 
A
E
 
T
T
 
T
D
 
R
K
 
S
T
 
I
G
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
N
K
 
R
D
 
R
-
 
L
-
 
G
C
 
L
S
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
D
 
D
F
 
V
V
 
V
R
 
K
D
 
R
F
 
I
A
 
C
S
 
D
T
 
C
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
S
E
 
N
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
Q
G
 
D
D
 
T
M
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
F
K
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
31% identity, 89% coverage: 17:237/248 of query aligns to 19:234/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
F
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
I
H
 
Y
F
 
G
F
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
D
 
R
A
 
C
I
 
V
C
 
N
G
 
L
R
 
L
V
 
E
K
 
R
P
 
P
A
 
T
A
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
F
 
L
F
 
V
K
 
-
D
 
D
C
 
G
G
 
Q
D
 
E
V
 
L
T
 
T
K
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
E
H
 
S
E
 
E
I
 
L
V
 
T
E
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
I
F
 
F
Q
 
Q
V
 
H
P
 
F
S
 
N
V
 
L
F
 
L
N
 
S
S
 
S
I
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
N
 
N
M
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
L
E
 
E
K
 
L
K
 
D
R
 
N
T
 
T
I
 
P
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
K
Q
 
D
E
 
E
Q
 
V
M
 
K
E
 
R
R
 
R
I
 
V
E
 
T
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
S
I
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
G
E
 
D
K
 
K
R
 
H
F
 
D
E
 
S
K
 
Y
P
 
P
A
 
S
A
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
A
Q
 
S
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
R
 
P
K
 
A
E
 
T
T
 
T
D
 
R
K
 
S
T
 
I
G
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
N
K
 
R
D
 
R
-
 
L
-
 
G
C
 
L
S
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
D
F
 
V
V
 
V
R
 
K
D
 
R
F
 
I
A
 
C
S
 
D
T
 
C
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
S
E
 
N
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
Q
G
 
D
D
 
T
M
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
F
K
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
31% identity, 89% coverage: 17:237/248 of query aligns to 19:234/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
F
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
I
H
 
Y
F
 
G
F
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
D
 
R
A
 
C
I
 
V
C
 
N
G
 
L
R
 
L
V
 
E
K
 
R
P
 
P
A
 
T
A
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
F
 
L
F
 
V
K
 
-
D
 
D
C
 
G
G
 
Q
D
 
E
V
 
L
T
 
T
K
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
E
H
 
S
E
 
E
I
 
L
V
 
T
E
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
I
F
 
F
Q
 
Q
V
 
H
P
 
F
S
 
N
V
 
L
F
 
L
N
 
S
S
 
S
I
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
N
 
N
M
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
L
E
 
E
K
 
L
K
 
D
R
 
N
T
 
T
I
 
P
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
K
Q
 
D
E
 
E
Q
 
V
M
 
K
E
 
R
R
 
R
I
 
V
E
 
T
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
S
I
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
G
E
 
D
K
 
K
R
 
H
F
 
D
E
 
S
K
 
Y
P
 
P
A
 
S
A
 
N
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
A
Q
 
S
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
R
 
P
K
 
A
E
 
T
T
 
T
D
 
R
K
 
S
T
 
I
G
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
N
K
 
R
D
 
R
-
 
L
-
 
G
C
 
L
S
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
D
F
 
V
V
 
V
R
 
K
D
 
R
F
 
I
A
 
C
S
 
D
T
 
C
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
S
E
 
N
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
Q
G
 
D
D
 
T
M
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
F
K
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
28% identity, 98% coverage: 3:244/248 of query aligns to 1:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
T
 
A
V
 
I
L
 
L
E
 
K
I
 
A
K
 
Q
D
 
H
L
 
L
T
 
A
V
 
K
S
 
S
F
 
Y
D
 
K
G
 
K
F
 
R
K
 
K
A
 
V
V
 
V
N
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
Q
V
 
V
K
 
E
K
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
I
H
 
V
F
 
G
F
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
S
L
 
F
D
 
Y
A
 
M
I
 
I
C
 
V
G
 
G
R
 
L
V
 
V
K
 
A
P
 
R
A
 
D
A
 
E
G
 
G
S
 
T
I
 
I
F
 
T
F
 
I
K
 
D
D
 
D
C
 
-
G
 
N
D
 
D
V
 
I
T
 
S
K
 
I
L
 
L
A
 
P
E
 
M
H
 
H
E
 
S
I
 
R
V
 
S
E
 
R
R
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
K
 
L
F
 
P
Q
 
Q
V
 
E
P
 
A
S
 
S
V
 
I
F
 
F
N
 
R
S
 
K
I
 
L
T
 
S
V
 
V
F
 
E
E
 
D
N
 
N
M
 
I
E
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
M
T
 
A
I
 
V
F
 
L
S
 
Q
T
 
T
L
 
R
F
 
E
S
 
E
K
 
L
L
 
T
S
 
H
Q
x
E
E
 
E
Q
 
R
M
 
Q
E
x
D
R
 
K
I
 
L
E
 
E
Y
 
D
V
 
L
L
 
L
N
 
E
I
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
I
Y
 
Q
E
 
H
K
 
I
R
 
R
F
 
K
E
 
S
K
 
A
P
 
G
A
 
M
A
 
A
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
R
W
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
A
Q
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
Q
I
 
F
M
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
D
R
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
D
 
I
K
 
D
T
 
I
G
 
K
E
 
K
L
 
I
L
 
I
K
 
E
E
 
H
I
 
L
A
 
R
-
 
D
K
 
R
D
 
G
C
 
L
S
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
F
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
D
F
 
V
A
 
C
S
 
E
T
 
K
V
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
H
 
S
E
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
E
G
 
G
D
 
T
M
 
P
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
Q
 
L
K
 
N
D
 
N
P
 
E
R
 
Q
V
 
V
I
 
K
E
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
31% identity, 95% coverage: 1:235/248 of query aligns to 1:230/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
M
 
M
D
 
T
T
 
P
V
 
I
L
 
L
E
 
A
I
 
A
K
 
E
D
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
Y
S
 
A
F
|
F
D
 
P
G
 
G
-
 
G
F
x
V
K
 
K
A
|
A
V
 
L
N
 
D
D
 
D
V
 
L
S
 
S
T
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
P
K
 
K
G
 
G
D
 
E
I
 
S
H
 
L
F
 
A
F
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
D
 
L
A
 
H
I
 
L
C
 
N
G
 
G
R
 
T
V
 
L
K
 
R
P
 
P
A
 
Q
A
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
V
F
 
L
F
 
L
K
 
-
D
 
-
C
 
G
G
 
G
D
 
T
V
 
A
T
 
T
K
 
G
L
 
H
A
 
S
E
 
R
H
 
K
E
 
D
I
 
L
V
 
T
-
 
G
-
 
W
E
 
R
R
 
R
G
 
R
I
 
V
G
 
G
R
 
L
K
 
V
F
 
L
Q
|
Q
-
 
D
V
 
A
P
 
D
S
 
D
V
 
Q
F
 
L
N
 
F
S
 
A
I
 
T
T
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
E
N
 
D
M
 
V
E
 
S
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
F
S
 
G
T
 
P
L
 
L
F
 
N
S
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
Q
 
E
-
 
A
E
 
E
Q
 
A
M
 
R
E
 
A
R
 
R
I
 
V
E
 
E
Y
 
E
V
 
A
L
 
L
N
 
A
I
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
I
Y
 
S
E
 
D
K
 
L
R
 
R
F
 
D
E
 
R
K
 
P
P
 
T
A
x
H
A
x
M
L
|
L
S
|
S
H
 
G
G
|
G
E
x
Q
K
 
K
Q
 
R
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
G
L
 
A
F
 
V
V
 
A
Q
 
M
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
I
 
V
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
V
 
T
A
 
A
G
 
G
M
 
L
G
 
D
R
 
L
K
 
A
E
 
G
T
 
T
D
 
E
K
 
Q
T
 
L
G
 
L
E
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
E
 
G
I
 
L
-
 
R
A
 
A
K
 
A
D
 
G
C
 
M
S
 
T
V
 
L
V
 
V
V
 
F
V
 
S
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
V
D
 
E
F
 
L
V
 
A
R
 
A
D
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
D
T
 
R
V
 
V
T
 
A
V
 
L
L
 
F
H
 
R
E
 
T
G
 
G
T
 
R
L
 
V
L
 
L
V
 
A
E
 
E
G
 
G
D
 
A
M
 
A
E
 
E
E
 
A
V
 
V
Q
 
L
K
 
S
D
 
D

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
29% identity, 90% coverage: 19:241/248 of query aligns to 20:237/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
A
 
A
V
 
L
N
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
T
 
I
A
 
N
V
 
I
K
 
E
K
 
N
G
 
G
D
 
E
I
 
R
H
 
F
F
 
G
F
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
D
 
R
A
 
I
I
 
I
C
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
D
K
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
Y
F
 
F
K
 
D
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
C
 
A
G
 
S
D
 
N
V
 
G
T
 
K
K
 
L
L
 
I
A
 
V
E
 
P
H
 
P
E
 
E
I
 
-
V
 
-
E
 
D
R
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
|
Q
V
 
T
P
 
W
S
 
A
V
 
L
F
 
Y
N
 
P
S
 
N
I
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
E
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
F
S
 
P
T
 
L
L
 
T
F
 
N
S
 
M
K
 
K
L
 
M
S
 
S
Q
 
K
E
 
E
Q
 
E
M
 
I
-
 
R
E
 
K
R
 
R
I
 
V
E
 
E
Y
 
E
V
 
V
L
 
A
N
 
K
I
 
I
I
 
L
G
 
D
L
 
I
Y
 
H
E
 
H
K
 
V
R
 
L
F
 
N
E
 
H
K
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
V
Q
 
K
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
R
 
A
K
 
R
E
 
M
T
 
R
D
 
D
K
 
S
T
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
Q
K
 
S
D
 
R
C
 
L
S
 
G
V
 
V
-
 
T
-
 
L
V
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
D
 
A
F
 
D
V
 
I
R
 
F
D
 
A
F
 
I
A
 
A
S
 
D
T
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
V
E
 
K
G
 
G
T
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
G
 
G
D
 
K
M
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
Y
K
 
D
D
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
29% identity, 90% coverage: 19:241/248 of query aligns to 20:237/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
A
 
A
V
 
L
N
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
T
 
I
A
 
N
V
 
I
K
 
E
K
 
N
G
 
G
D
 
E
I
 
R
H
 
F
F
 
G
F
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
D
 
R
A
 
I
I
 
I
C
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
D
K
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
Y
F
 
F
K
 
D
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
C
 
A
G
 
S
D
 
N
V
 
G
T
 
K
K
 
L
L
 
I
A
 
V
E
 
P
H
 
P
E
 
E
I
 
-
V
 
-
E
 
D
R
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
T
P
 
W
S
 
A
V
 
L
F
 
Y
N
 
P
S
 
N
I
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
E
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
F
S
 
P
T
 
L
L
 
T
F
 
N
S
 
M
K
 
K
L
 
M
S
 
S
Q
 
K
E
 
E
Q
 
E
M
 
I
-
 
R
E
 
K
R
 
R
I
 
V
E
 
E
Y
 
E
V
 
V
L
 
A
N
 
K
I
 
I
I
 
L
G
 
D
L
 
I
Y
 
H
E
 
H
K
 
V
R
 
L
F
 
N
E
 
H
K
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
V
Q
 
K
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
R
 
A
K
 
R
E
 
M
T
 
R
D
 
D
K
 
S
T
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
Q
K
 
S
D
 
R
C
 
L
S
 
G
V
 
V
-
 
T
-
 
L
V
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
D
 
A
F
 
D
V
 
I
R
 
F
D
 
A
F
 
I
A
 
A
S
 
D
T
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
V
E
 
K
G
 
G
T
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
G
 
G
D
 
K
M
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
Y
K
 
D
D
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
29% identity, 90% coverage: 19:241/248 of query aligns to 20:237/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
A
|
A
V
 
L
N
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
T
 
I
A
 
N
V
 
I
K
 
E
K
 
N
G
 
G
D
 
E
I
 
R
H
 
F
F
 
G
F
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
D
 
R
A
 
I
I
 
I
C
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
D
K
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
Y
F
 
F
K
 
D
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
C
 
A
G
 
S
D
 
N
V
 
G
T
 
K
K
 
L
L
 
I
A
 
V
E
 
P
H
 
P
E
 
E
I
 
-
V
 
-
E
 
D
R
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
T
P
 
W
S
 
A
V
 
L
F
 
Y
N
 
P
S
 
N
I
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
E
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
F
S
 
P
T
 
L
L
 
T
F
 
N
S
 
M
K
 
K
L
 
M
S
 
S
Q
 
K
E
 
E
Q
 
E
M
 
I
-
 
R
E
 
K
R
 
R
I
 
V
E
 
E
Y
 
E
V
 
V
L
 
A
N
 
K
I
 
I
I
 
L
G
 
D
L
 
I
Y
 
H
E
 
H
K
 
V
R
 
L
F
 
N
E
 
H
K
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
V
Q
 
K
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
R
 
A
K
 
R
E
 
M
T
 
R
D
 
D
K
 
S
T
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
Q
K
 
S
D
 
R
C
 
L
S
 
G
V
 
V
-
 
T
-
 
L
V
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
D
 
A
F
 
D
V
 
I
R
 
F
D
 
A
F
 
I
A
 
A
S
 
D
T
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
V
E
 
K
G
 
G
T
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
G
 
G
D
 
K
M
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
Y
K
 
D
D
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
29% identity, 90% coverage: 19:241/248 of query aligns to 20:237/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
A
 
A
V
 
L
N
 
D
D
 
N
V
 
V
S
 
N
T
 
I
A
 
N
V
 
I
K
 
E
K
 
N
G
 
G
D
 
E
I
 
R
H
 
F
F
 
G
F
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
F
L
 
M
D
 
R
A
 
I
I
 
I
C
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
D
K
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
Y
F
 
F
K
 
D
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
C
 
A
G
 
S
D
 
N
V
 
G
T
 
K
K
 
L
L
 
I
A
 
V
E
 
P
H
 
P
E
 
E
I
 
-
V
 
-
E
 
D
R
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
T
P
 
W
S
 
A
V
 
L
F
 
Y
N
 
P
S
 
N
I
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
E
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
F
S
 
P
T
 
L
L
 
T
F
 
N
S
 
M
K
 
K
L
 
M
S
 
S
Q
 
K
E
 
E
Q
 
E
M
 
I
-
 
R
E
 
K
R
 
R
I
 
V
E
 
E
Y
 
E
V
 
V
L
 
A
N
 
K
I
 
I
I
 
L
G
 
D
L
 
I
Y
 
H
E
 
H
K
 
V
R
 
L
F
 
N
E
 
H
K
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
E
L
 
L
S
|
S
H
 
G
G
|
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
V
Q
 
K
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
L
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
R
 
A
K
 
R
E
 
M
T
 
R
D
 
D
K
 
S
T
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
Q
K
 
S
D
 
R
C
 
L
S
 
G
V
 
V
-
 
T
-
 
L
V
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
D
 
A
F
 
D
V
 
I
R
 
F
D
 
A
F
 
I
A
 
A
S
 
D
T
 
R
V
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
V
E
 
K
G
 
G
T
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
G
 
G
D
 
K
M
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
Y
K
 
D
D
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
V
 
V

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
29% identity, 94% coverage: 1:234/248 of query aligns to 1:225/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
M
 
M
D
 
E
T
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
V
I
 
V
K
 
E
D
 
N
L
 
L
T
 
V
V
 
K
S
 
K
F
|
F
D
 
G
G
 
D
F
|
F
K
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
K
D
 
G
V
 
V
S
 
S
T
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
E
I
 
I
H
 
F
F
 
A
F
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
I
D
 
H
A
 
M
I
 
L
C
 
T
G
 
T
R
 
L
V
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
A
F
 
W
F
 
V
K
 
A
D
 
G
C
 
H
G
 
-
D
 
D
V
 
V
T
 
-
K
 
-
L
 
L
A
 
K
E
 
E
H
 
P
E
 
R
I
 
E
V
 
V
E
 
R
R
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
I
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
D
P
 
Q
S
 
S
V
 
L
F
 
D
N
 
R
S
 
E
I
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
M
E
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
T
 
Y
I
 
I
F
 
H
S
 
G
T
 
K
L
 
I
F
 
Y
S
 
G
K
 
Y
L
 
G
S
 
G
Q
 
E
E
 
K
Q
 
L
M
 
K
E
 
K
R
 
R
I
 
I
E
 
L
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
E
I
 
F
I
 
V
G
 
E
L
 
L
Y
 
L
E
 
E
K
 
F
R
 
K
F
 
D
E
 
K
K
 
P
P
 
V
A
 
K
A
x
T
L
x
F
S
|
S
H
 
G
G
 
G
E
 
M
K
 
A
Q
 
R
W
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
S
F
 
L
V
 
I
Q
 
H
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
V
M
 
L
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
T
A
 
I
G
 
G
M
 
L
G
 
D
R
 
P
K
 
H
E
 
T
T
 
R
D
 
A
K
 
H
T
 
M
G
 
W
E
 
E
L
 
Y
L
 
I
K
 
S
E
 
K
I
 
M
A
 
K
K
 
K
-
 
E
-
 
H
D
 
N
C
 
M
S
 
T
V
 
I
V
 
F
V
 
L
V
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
Y
M
 
M
D
 
D
F
 
E
V
 
A
R
 
E
D
 
Q
F
 
L
A
 
A
S
 
D
T
 
R
V
 
V
T
 
A
V
 
I
L
 
I
H
 
D
E
 
H
G
 
G
T
 
K
L
 
I
L
 
I
V
 
A
E
 
L
G
 
G
D
 
T
M
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
L
Q
 
K
K
 
R

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp-binding protein
28% identity, 90% coverage: 14:236/248 of query aligns to 16:234/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
F
 
F
D
 
G
G
 
D
F
 
V
K
 
T
A
 
A
V
 
V
N
 
K
D
 
D
V
 
L
S
 
S
T
 
L
A
 
E
V
 
I
K
 
K
K
 
D
G
 
G
D
 
E
I
 
F
H
 
L
F
 
V
F
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
D
 
R
A
 
M
I
 
I
C
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
E
K
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
F
 
Y
F
 
I
K
 
E
D
 
D
-
 
N
-
 
L
C
 
V
G
 
A
D
 
D
V
 
P
T
 
E
K
 
K
L
 
G
A
 
V
E
 
F
H
 
V
E
 
P
I
 
P
V
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
D
I
 
V
G
 
A
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
S
P
 
Y
S
 
A
V
 
L
F
 
Y
N
 
P
S
 
H
I
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
P
A
 
L
E
 
K
K
 
L
K
 
R
R
 
K
T
 
V
I
 
P
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
K
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
I
M
 
D
E
 
K
R
 
R
I
 
V
E
 
R
Y
 
E
V
 
V
L
 
A
N
 
E
I
 
M
I
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
T
E
 
E
K
 
L
R
 
L
F
 
N
E
 
R
K
 
K
P
 
P
A
 
R
A
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
R
L
 
A
F
 
I
V
 
I
Q
 
R
Q
 
R
P
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
R
 
A
K
 
K
E
 
L
T
 
R
D
 
V
K
 
K
T
 
M
G
 
R
E
 
A
L
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
Q
K
 
R
D
 
Q
C
 
L
S
 
G
V
 
V
-
 
T
-
 
T
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
D
 
V
F
 
E
V
 
A
R
 
M
D
 
T
F
 
M
A
 
G
S
 
D
T
 
R
V
 
I
T
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
N
E
 
K
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
Q
V
 
Q
E
 
V
G
 
G
D
 
T
M
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Y
K
 
Y
D
 
K
P
 
P

1g291 Malk (see paper)
28% identity, 92% coverage: 9:236/248 of query aligns to 8:231/372 of 1g291

query
sites
1g291
D
 
D
L
 
V
T
 
W
V
 
K
S
 
V
F
 
F
D
 
G
G
 
E
F
 
V
K
 
T
A
 
A
V
 
V
N
 
R
D
 
E
V
 
M
S
 
S
T
 
L
A
 
E
V
 
V
K
 
K
K
 
D
G
 
G
D
 
E
I
 
F
H
 
M
F
 
I
F
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
D
 
R
A
 
M
I
 
I
C
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
E
K
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
R
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
F
 
Y
F
 
I
K
 
G
D
 
D
-
 
K
-
 
L
C
 
V
G
 
A
D
|
D
V
 
P
T
x
E
K
|
K
L
 
G
A
 
I
E
 
F
H
 
V
E
 
P
I
 
P
V
x
K
E
x
D
R
 
R
G
 
D
I
 
I
G
 
A
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
S
P
 
Y
S
 
A
V
 
L
F
 
Y
N
 
P
S
 
H
I
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
P
A
 
L
E
 
K
K
 
L
K
 
R
R
 
K
T
 
V
I
 
P
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
R
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
I
M
 
D
E
 
Q
R
 
R
I
 
V
E
 
R
Y
 
E
V
 
V
L
 
A
N
 
E
I
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
T
E
 
E
K
 
L
R
 
L
F
 
N
E
 
R
K
 
K
P
 
P
A
 
R
A
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
R
L
 
A
F
 
I
V
 
V
Q
 
R
Q
 
K
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
M
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
R
 
A
K
 
K
E
 
L
T
 
R
D
 
V
K
 
R
T
 
M
G
 
R
E
 
A
L
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
Q
K
 
R
D
 
Q
C
 
L
S
 
G
V
 
V
-
 
T
-
 
T
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
D
 
V
F
 
E
V
 
A
R
 
M
D
 
T
F
 
M
A
 
G
S
 
D
T
 
R
V
 
I
T
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
N
E
 
R
G
 
G
T
 
V
L
 
L
L
 
Q
V
 
Q
E
 
V
G
 
G
D
 
S
M
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Y
K
 
D
D
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
29% identity, 95% coverage: 5:239/248 of query aligns to 7:223/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
L
 
V
E
 
K
I
 
L
K
 
E
D
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
K
S
 
R
F
|
F
D
 
G
G
 
N
F
|
F
K
 
T
A
 
A
V
 
V
N
 
N
D
 
K
V
 
L
S
 
N
T
 
L
A
 
T
V
 
I
K
 
K
K
 
D
G
 
G
D
 
E
I
 
F
H
 
L
F
 
V
F
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
D
 
R
A
 
M
I
 
I
C
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
E
K
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
I
F
 
Y
F
 
F
K
 
G
D
 
D
C
 
R
G
 
-
D
 
D
V
 
V
T
 
T
K
 
Y
L
 
L
A
 
P
E
 
P
H
 
K
E
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
D
R
 
R
G
 
N
I
 
I
G
 
S
R
 
-
K
 
-
F
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
M
V
 
V
F
 
F
N
 
Q
S
 
H
I
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
P
A
 
L
E
 
K
K
 
K
K
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
F
S
 
P
K
 
K
L
 
-
S
 
-
Q
 
D
E
 
E
Q
 
I
M
 
D
E
 
K
R
 
R
I
 
V
E
 
R
Y
 
W
V
 
A
L
 
A
N
 
E
I
 
L
I
 
L
G
 
Q
L
 
I
Y
 
E
E
 
E
K
 
L
R
 
L
F
 
N
E
 
R
K
 
Y
P
 
P
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
W
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
V
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
I
V
 
V
Q
 
V
Q
 
E
P
 
P
E
 
D
I
 
V
M
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
R
 
A
K
 
K
E
 
L
T
 
R
D
 
V
K
 
A
T
 
M
G
 
R
E
 
A
L
 
E
L
 
I
K
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
Q
K
 
Q
D
 
K
C
 
L
S
 
K
V
 
V
-
 
T
-
 
T
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
D
 
V
F
 
E
V
 
A
R
 
M
D
 
T
F
 
M
A
 
G
S
 
D
T
 
R
V
 
I
T
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
N
E
 
R
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
Q
E
 
I
G
 
G
D
 
S
M
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
V
Q
 
Y
K
 
L
D
 
R
P
 
P
R
 
N
V
 
S
I
 
V

P0AAH0 Phosphate import ATP-binding protein PstB; ABC phosphate transporter; Phosphate-transporting ATPase; EC 7.3.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 5:247/248 of query aligns to 11:257/257 of P0AAH0

query
sites
P0AAH0
L
 
I
E
 
Q
I
 
V
K
 
R
D
 
N
L
 
L
T
 
N
V
 
F
S
 
Y
F
 
Y
D
 
G
G
 
K
F
 
F
K
 
H
A
 
A
V
 
L
N
 
K
D
 
N
V
 
I
S
 
N
T
 
L
A
 
D
V
 
I
K
 
A
K
 
K
G
 
N
D
 
Q
I
 
V
H
 
T
F
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
R
A
 
T
I
 
F
C
 
N
G
 
K
R
 
M
V
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
P
-
 
E
K
 
Q
P
 
R
A
 
A
A
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
F
 
L
F
 
L
K
 
D
D
 
G
C
 
D
G
 
N
D
 
I
V
 
L
T
 
T
K
 
N
L
 
S
A
 
Q
E
 
D
H
 
I
E
 
A
I
 
L
V
 
L
E
 
R
R
 
A
G
 
K
I
 
V
G
 
G
R
 
M
K
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
K
P
 
P
S
 
T
V
 
P
F
 
F
N
 
-
S
 
P
I
 
M
T
 
S
V
 
I
F
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
G
A
 
V
E
 
R
K
 
-
K
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
L
F
 
F
S
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
E
 
A
Q
 
D
M
 
M
-
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
Q
Y
 
W
V
 
A
L
 
L
N
 
T
I
 
K
I
 
A
G
 
A
L
 
L
Y
 
W
-
 
N
-
 
E
-
 
T
-
 
K
E
 
D
K
 
K
R
 
L
F
 
H
E
 
Q
K
 
S
P
 
G
A
 
Y
A
 
S
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
W
 
R
L
 
L
E
 
C
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
G
F
 
I
V
 
A
Q
 
I
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
I
 
V
M
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
C
A
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
R
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
T
D
 
G
K
 
R
T
 
I
G
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
K
K
 
Q
D
 
D
C
 
Y
S
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
N
M
 
M
D
 
Q
F
 
Q
V
 
A
R
 
A
D
 
R
F
 
C
A
 
S
S
 
D
T
 
H
V
 
T
T
 
A
V
 
F
L
 
M
H
 
Y
E
 
L
G
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
F
G
 
S
D
 
N
M
 
T
E
 
D
E
 
D
V
 
L
Q
 
F
K
 
T
D
 
K
P
 
P
-
 
A
-
 
K
R
 
K
V
 
Q
I
 
T
E
 
E
V
 
D
Y
 
Y
L
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
Y
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
29% identity, 98% coverage: 3:244/248 of query aligns to 1:235/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
T
 
A
V
 
T
L
 
L
E
 
T
I
 
A
K
 
K
D
 
N
L
 
L
T
 
A
V
 
K
S
 
A
F
 
Y
D
 
K
G
 
G
F
 
R
K
 
R
A
 
V
V
 
V
N
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
T
V
 
V
K
 
N
K
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
I
H
 
V
F
 
G
F
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
T
L
 
F
D
 
Y
A
 
M
I
 
V
C
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
V
K
 
P
P
 
R
A
 
D
A
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
F
 
I
F
 
I
K
 
D
D
 
D
C
 
D
G
 
-
D
 
D
V
 
I
T
 
S
K
 
L
L
 
L
A
 
P
E
 
L
H
 
H
E
 
A
I
 
R
V
 
A
E
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
K
 
L
F
 
P
Q
 
Q
V
 
E
P
 
A
S
 
S
V
 
I
F
 
F
N
x
R
S
 
R
I
 
L
T
 
S
V
 
V
F
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
L
E
 
M
L
 
A
A
 
V
A
 
L
E
 
Q
K
 
I
K
 
R
R
 
D
T
 
D
I
 
L
F
 
S
S
 
A
T
 
E
L
 
Q
F
 
R
S
 
E
K
 
D
L
 
R
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
Q
 
L
M
 
M
E
 
E
-
 
E
-
 
F
R
 
H
I
 
I
E
 
E
Y
 
H
V
 
L
L
 
R
N
 
D
I
 
S
I
x
M
G
|
G
L
 
-
Y
 
-
E
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
A
x
Q
A
 
S
L
 
L
S
 
S
H
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
R
W
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
L
 
A
F
 
L
V
 
A
Q
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
F
M
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
D
R
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
D
 
I
K
 
D
T
 
I
G
 
K
E
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
E
 
H
I
 
L
A
 
R
K
 
D
D
 
S
-
 
G
C
 
L
S
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
F
 
E
V
 
T
R
 
L
D
 
A
F
 
V
A
 
C
S
 
E
T
 
R
V
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
H
 
S
E
 
Q
G
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
T
M
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
I
Q
 
L
K
 
Q
D
 
D
P
 
E
R
 
H
V
 
V
I
 
K
E
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

Query Sequence

>WP_207545213.1 NCBI__GCF_900115975.1:WP_207545213.1
MDTVLEIKDLTVSFDGFKAVNDVSTAVKKGDIHFFIGPNGAGKTTLLDAICGRVKPAAGS
IFFKDCGDVTKLAEHEIVERGIGRKFQVPSVFNSITVFENMELAAEKKRTIFSTLFSKLS
QEQMERIEYVLNIIGLYEKRFEKPAALSHGEKQWLEIGMLFVQQPEIMLLDEPVAGMGRK
ETDKTGELLKEIAKDCSVVVVEHDMDFVRDFASTVTVLHEGTLLVEGDMEEVQKDPRVIE
VYLGRGGE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory