SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_210399131.1 NCBI__GCF_001579945.1:WP_210399131.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3triA Structure of a pyrroline-5-carboxylate reductase (proc) from coxiella burnetii (see paper)
41% identity, 88% coverage: 33:296/300 of query aligns to 5:269/272 of 3triA

query
sites
3triA
L
 
I
A
 
T
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
A
 
A
A
 
R
S
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
G
M
 
Y
P
 
D
A
 
P
G
 
N
R
 
R
I
 
I
I
 
C
V
 
V
A
 
T
D
x
N
R
|
R
V
x
S
P
 
L
E
 
D
Q
x
K
L
 
L
Q
 
D
A
 
F
L
 
F
R
 
K
T
 
E
R
 
K
F
 
C
G
 
G
I
 
V
R
 
H
T
 
T
T
 
T
S
 
Q
S
 
D
N
|
N
P
 
R
A
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
D
x
Q
L
 
I
A
 
K
S
x
M
V
 
V
S
 
C
A
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
D
V
 
I
L
 
L
A
 
S
R
 
E
R
 
T
R
 
K
P
 
I
L
 
L
L
 
V
I
 
I
S
 
S
I
x
L
A
|
A
A
x
V
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
T
R
 
P
D
 
L
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
W
V
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
A
P
 
S
-
 
R
V
 
I
V
 
V
R
 
R
C
 
A
M
|
M
P
|
P
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
S
M
 
S
Q
 
V
G
 
R
C
 
A
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
G
M
 
L
Y
 
F
A
 
A
T
 
N
H
 
E
E
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
K
T
 
D
Q
 
Q
R
 
K
E
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
V
 
I
L
 
M
G
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
L
V
 
V
L
 
I
W
 
W
L
 
V
E
 
S
R
 
S
E
 
E
E
 
D
D
 
Q
L
 
I
D
 
E
A
 
K
V
 
I
T
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
M
E
 
E
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
T
E
 
K
E
 
E
I
 
T
S
 
A
R
 
E
K
 
L
L
 
L
A
 
T
I
 
E
E
 
Q
T
 
T
A
 
V
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
R
M
 
M
A
 
A
R
 
L
V
 
E
A
 
T
R
 
E
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
A
 
V
T
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
Q
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
K
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
N
F
 
L
R
 
R
G
 
E
I
 
L
M
 
F
A
 
I
T
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
N
R
 
R
S
 
A
A
 
K
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
K

2ag8A NADP complex of pyrroline-5-carboxylate reductase from neisseria meningitidis (see paper)
38% identity, 87% coverage: 35:294/300 of query aligns to 5:258/263 of 2ag8A

query
sites
2ag8A
F
 
F
I
x
L
G
|
G
G
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
K
R
 
Q
G
 
G
M
 
-
P
 
-
A
 
G
G
 
Y
R
 
R
I
 
I
I
 
Y
V
 
I
A
|
A
D
x
N
R
|
R
V
x
G
P
 
A
E
 
E
Q
x
K
L
 
R
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
R
 
E
T
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
E
T
 
T
T
 
S
S
 
A
S
 
T
N
 
L
P
 
P
A
 
E
A
 
L
A
 
H
A
 
S
E
 
D
A
 
-
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
I
F
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
L
 
M
A
 
E
S
 
A
V
x
A
S
 
C
A
 
K
E
 
N
L
 
I
R
 
R
D
 
T
V
 
N
L
 
G
A
 
A
R
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
L
H
 
S
S
 
V
R
 
G
D
 
T
L
 
L
Q
 
S
R
 
R
W
 
Y
V
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
T
P
 
R
-
 
R
V
 
I
V
 
V
R
 
R
C
 
V
M
|
M
P
|
P
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
G
M
 
K
Q
 
I
G
 
G
C
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
S
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
A
 
A
T
 
E
H
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
E
T
 
T
Q
 
D
R
 
R
E
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
D
Q
 
R
V
 
I
L
 
M
G
 
K
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
L
V
 
T
L
 
V
W
 
W
L
 
L
E
 
D
R
 
D
E
 
E
E
 
E
D
 
K
L
 
M
D
 
H
A
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
V
F
 
F
L
 
Y
L
 
L
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
N
A
 
A
G
 
A
Q
 
I
S
 
R
L
 
Q
G
 
G
L
 
F
P
 
D
E
 
M
E
 
A
I
 
E
S
 
A
R
 
R
K
 
A
L
 
L
A
 
S
I
 
L
E
 
A
T
 
T
A
 
F
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
V
M
 
A
M
 
L
A
 
A
R
 
E
V
 
Q
A
 
T
R
 
G
E
 
E
S
 
D
A
 
F
A
 
E
T
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
Q
 
N
V
 
V
T
 
T
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
H
A
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
E
H
 
A
L
 
F
E
 
R
A
 
R
S
 
H
D
 
R
F
 
V
R
 
A
G
 
E
I
 
A
M
 
I
A
 
S
T
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
C
A
 
A
A
 
C
A
 
V
R
 
R
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
Q
 
E
L
 
M

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
38% identity, 88% coverage: 33:295/300 of query aligns to 11:272/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
L
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
G
M
 
A
P
 
V
A
 
R
G
 
S
R
 
G
I
 
V
I
 
L
V
 
S
A
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
P
 
K
E
 
T
Q
 
A
L
 
I
Q
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
P
A
 
A
L
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
A
F
 
F
-
 
E
-
 
S
-
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
V
T
 
L
S
 
S
S
 
S
N
 
N
P
 
D
A
 
D
A
 
V
A
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
S
D
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
D
 
L
L
 
L
A
 
K
S
 
D
V
 
V
S
 
V
A
 
L
E
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
D
R
 
K
P
 
-
L
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
H
 
K
S
 
M
R
 
K
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
W
V
 
A
G
 
G
G
 
H
L
 
E
P
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
R
 
T
P
 
A
A
 
A
M
 
T
Q
 
V
G
 
G
C
 
E
G
 
A
V
 
A
T
 
S
G
 
V
M
 
M
Y
 
S
A
 
L
T
 
G
H
 
G
E
 
A
V
 
A
A
 
T
A
 
E
T
 
E
Q
 
D
R
 
A
E
 
N
L
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
Q
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
T
 
K
V
 
I
L
 
-
W
 
W
L
 
K
E
 
A
R
 
D
E
 
D
E
 
K
D
 
Y
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
D
I
 
L
S
 
A
R
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
Q
T
 
T
A
 
V
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
T
V
 
Q
A
 
S
R
 
G
E
 
K
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
E
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
K
 
H
H
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
S
 
A
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
L
A
 
M
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 88% coverage: 33:295/300 of query aligns to 11:272/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
L
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
G
M
 
A
P
 
V
A
 
R
G
 
S
R
 
G
I
 
V
I
 
L
V
 
S
A
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
P
 
K
E
 
T
Q
 
A
L
 
I
Q
x
H
-
x
S
-
x
N
-
 
P
A
 
A
L
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
A
F
 
F
-
 
E
-
 
S
-
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
V
T
 
L
S
 
S
S
 
S
N
|
N
P
 
D
A
 
D
A
 
V
A
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
S
D
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
D
x
L
L
 
L
A
 
K
S
 
D
V
|
V
S
 
V
A
 
L
E
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
D
R
 
K
P
 
-
L
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
H
 
K
S
 
M
R
 
K
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
W
V
 
A
G
 
G
G
 
H
L
 
E
P
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
R
 
T
P
 
A
A
 
A
M
 
T
Q
 
V
G
 
G
C
 
E
G
 
A
V
 
A
T
 
S
G
 
V
M
 
M
Y
 
S
A
 
L
T
 
G
H
 
G
E
 
A
V
 
A
A
 
T
A
 
E
T
 
E
Q
 
D
R
 
A
E
 
N
L
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
Q
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
T
 
K
V
 
I
L
 
-
W
 
W
L
 
K
E
 
A
R
 
D
E
 
D
E
 
K
D
 
Y
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
D
I
 
L
S
 
A
R
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
Q
T
 
T
A
 
V
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
T
V
 
Q
A
 
S
R
 
G
E
 
K
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
E
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
K
 
H
H
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
S
 
A
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
L
A
 
M
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
38% identity, 88% coverage: 33:295/300 of query aligns to 11:272/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
L
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
G
M
 
A
P
 
V
A
 
R
G
 
S
R
 
G
I
 
V
I
 
L
V
 
S
A
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
P
 
K
E
 
T
Q
 
A
L
 
I
Q
x
H
-
 
S
-
 
N
-
 
P
A
 
A
L
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
A
F
 
F
-
 
E
-
 
S
-
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
V
T
 
L
S
 
S
S
 
S
N
|
N
P
 
D
A
 
D
A
 
V
A
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
S
D
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
D
x
L
L
 
L
A
 
K
S
 
D
V
|
V
S
 
V
A
 
L
E
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
D
R
 
K
P
 
-
L
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
A
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
H
 
K
S
 
M
R
 
K
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
W
V
 
A
G
 
G
G
 
H
L
 
E
P
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
R
 
T
P
 
A
A
 
A
M
 
T
Q
 
V
G
 
G
C
 
E
G
 
A
V
 
A
T
 
S
G
 
V
M
 
M
Y
 
S
A
 
L
T
 
G
H
 
G
E
 
A
V
 
A
A
 
T
A
 
E
T
 
E
Q
 
D
R
 
A
E
 
N
L
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
Q
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
T
 
K
V
 
I
L
 
-
W
 
W
L
 
K
E
 
A
R
 
D
E
 
D
E
 
K
D
 
Y
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
D
I
 
L
S
 
A
R
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
Q
T
 
T
A
 
V
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
T
V
 
Q
A
 
S
R
 
G
E
 
K
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
E
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
K
 
H
H
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
S
 
A
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
L
A
 
M
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
 
S

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
38% identity, 88% coverage: 33:295/300 of query aligns to 11:272/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
L
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
G
M
 
A
P
 
V
A
 
R
G
 
S
R
 
G
I
 
V
I
 
L
V
 
S
A
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
P
 
K
E
 
T
Q
 
A
L
 
I
Q
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
P
A
 
A
L
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
A
F
 
F
-
 
E
-
 
S
-
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
V
T
 
L
S
 
S
S
 
S
N
 
N
P
 
D
A
 
D
A
 
V
A
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
S
D
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
D
 
L
L
 
L
A
 
K
S
 
D
V
 
V
S
 
V
A
 
L
E
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
D
R
 
K
P
 
-
L
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
H
 
K
S
 
M
R
 
K
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
W
V
 
A
G
 
G
G
 
H
L
 
E
P
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
R
 
T
P
 
A
A
 
A
M
 
T
Q
 
V
G
 
G
C
 
E
G
 
A
V
 
A
T
 
S
G
 
V
M
 
M
Y
 
S
A
 
L
T
 
G
H
 
G
E
 
A
V
 
A
A
 
T
A
 
E
T
 
E
Q
 
D
R
 
A
E
 
N
L
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
Q
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
T
 
K
V
 
I
L
 
-
W
 
W
L
 
K
E
 
A
R
 
D
E
 
D
E
 
K
D
 
Y
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
D
I
 
L
S
 
A
R
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
Q
T
 
T
A
 
V
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
T
V
 
Q
A
 
S
R
 
G
E
 
K
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
E
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
K
 
H
H
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
S
 
A
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
L
A
 
M
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
 
S

Q96C36 Pyrroline-5-carboxylate reductase 2; P5C reductase 2; P5CR 2; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
35% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 3:268/320 of Q96C36

query
sites
Q96C36
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
Y
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
R
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
L
A
 
S
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
I
A
 
A
D
 
S
R
 
S
V
 
-
P
 
P
E
 
E
Q
 
M
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
N
T
 
L
T
 
T
S
 
R
S
 
S
N
 
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
K
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
D
 
I
L
 
I
A
 
P
S
 
F
V
 
I
S
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
R
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
A
 
A
R
 
R
R
 
H
R
 
-
P
 
-
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
V
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
M
G
 
A
L
 
F
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
-
 
P
P
 
K
V
 
V
V
 
I
R
|
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
Q
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
L
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
M
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
M
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
I
K
 
Q
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
D
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
C
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
C
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
G
F
 
F
R
|
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6xp0A Structure of human pycr1 complexed with n-formyl l-proline (see paper)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 5:267/272 of 6xp0A

query
sites
6xp0A
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
D
 
S
R
 
S
V
 
P
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
 
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
H
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
L
 
L

2rcyA Crystal structure of plasmodium falciparum pyrroline carboxylate reductase (mal13p1.284) with NADP bound
32% identity, 86% coverage: 33:291/300 of query aligns to 7:257/262 of 2rcyA

query
sites
2rcyA
L
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
M
G
 
G
G
 
L
G
|
G
N
x
Q
M
|
M
A
 
G
A
 
S
S
 
A
L
 
L
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
A
R
 
H
G
 
G
M
 
I
P
 
A
A
 
N
G
 
A
R
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
K
A
 
K
D
 
E
R
 
N
V
 
L
P
 
F
E
 
Y
Q
 
Y
L
 
G
Q
x
P
A
 
S
L
 
-
R
 
K
T
 
K
R
 
N
F
 
T
G
 
T
I
 
L
R
 
N
T
 
Y
T
 
M
S
 
S
S
 
S
N
|
N
P
 
E
A
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
H
A
 
C
D
 
D
T
 
I
V
 
I
L
 
V
F
 
C
A
 
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
D
D
x
I
L
 
A
A
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
L
A
 
N
E
 
N
L
 
I
R
 
K
D
 
P
V
 
Y
L
 
L
A
 
S
R
 
S
R
 
K
R
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
L
I
 
I
S
 
S
I
|
I
A
x
C
A
x
G
G
 
G
V
 
L
H
 
N
S
 
I
R
 
G
D
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
E
W
 
M
V
 
V
G
 
G
G
 
S
-
 
E
L
 
N
P
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
W
C
 
V
M
|
M
P
 
P
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
C
M
 
L
Q
 
V
G
 
G
C
 
E
G
 
G
V
 
S
T
 
F
G
 
I
M
 
Y
Y
 
C
A
 
S
T
 
N
H
 
K
E
 
N
V
 
V
A
 
N
A
 
S
T
 
T
Q
 
D
R
 
K
E
 
K
L
 
Y
A
 
V
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
L
 
F
G
 
N
A
 
S
V
 
C
G
 
G
T
 
I
V
 
I
L
 
H
W
 
E
L
 
I
E
 
-
R
 
K
E
 
E
E
 
K
D
 
D
L
 
M
D
 
D
A
 
I
V
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
F
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Q
 
I
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
N
G
 
G
L
 
L
P
 
S
E
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
S
R
 
K
K
 
N
L
 
L
A
 
V
I
 
L
E
 
Q
T
 
T
A
 
I
Y
 
K
G
 
G
A
 
S
S
 
V
M
 
E
M
 
M
A
 
V
R
 
K
V
 
K
A
 
S
R
 
D
E
 
Q
S
 
P
A
 
V
A
 
Q
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
x
I
T
 
V
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
I
T
 
T
E
 
A
A
 
V
A
 
G
L
 
L
K
 
Y
H
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
K
S
 
N
D
 
S
F
 
F
R
 
K
G
 
Y
I
 
T
M
 
V
A
 
M
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
C
R
 
E
R
 
K
S
 
S

P32322 Pyrroline-5-carboxylate reductase 1, mitochondrial; P5C reductase 1; P5CR 1; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 3:268/319 of P32322

query
sites
P32322
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
|
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
-
 
S
-
x
S
-
 
P
D
 
D
R
 
M
V
 
D
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
|
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
x
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
H
A
 
S
R
x
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
x
G
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
x
R
Q
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8tcvB Structure of pycr1 complexed with 4-bromobenzene-1,3-dicarboxylic acid (see paper)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 9:274/279 of 8tcvB

query
sites
8tcvB
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
R
 
M
V
 
D
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
 
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
H
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
L
 
L

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 10:275/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
R
 
M
V
 
D
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
 
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
H
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
L
 
L

8tcuA Structure of pycr1 complexed with 2-chloro-5-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 10:275/279 of 8tcuA

query
sites
8tcuA
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
R
 
M
V
 
D
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
 
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
H
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
L
 
L

5uavA Structure of human pycr-1 complexed with NADPH and l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 7:272/278 of 5uavA

query
sites
5uavA
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
-
 
S
-
x
S
-
x
P
D
|
D
R
 
M
V
 
D
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
|
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
x
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
R
x
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
H
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
L
 
L

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 3:268/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
R
 
M
V
 
D
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
 
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
|
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
|
E
E
|
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
H
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
L
 
L

8tcwA Structure of pycr1 complexed with 2-methyl-3-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 10:275/282 of 8tcwA

query
sites
8tcwA
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
R
 
M
V
 
D
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
 
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
 
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
Q
 
E
R
 
D
-
 
G
E
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
-
V
 
-
L
 
F
W
 
C
L
 
T
E
 
E
R
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
D
L
 
L
-
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
R
E
 
R
I
 
L
S
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
I
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
K
M
 
M
A
 
L
R
 
L
V
 
H
A
 
S
R
 
E
E
 
Q
S
 
H
A
 
P
A
 
G
T
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
K
 
H
H
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
G
D
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
S
I
 
L
M
 
L
A
 
I
T
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
R
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
L
 
L

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
34% identity, 87% coverage: 33:294/300 of query aligns to 6:271/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
L
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
H
I
 
K
I
 
I
V
 
M
A
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
R
 
M
V
 
D
P
 
L
E
 
A
Q
 
T
L
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
-
R
 
K
F
 
M
G
 
G
I
 
V
R
 
K
T
 
L
T
 
T
S
 
P
S
 
H
N
 
N
P
 
K
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
D
 
D
T
 
V
V
 
L
L
 
F
F
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
D
 
I
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
I
L
 
L
A
 
D
S
 
E
V
 
I
S
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
D
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
H
L
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
S
 
I
R
 
S
D
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
V
 
L
G
 
S
G
 
A
L
 
F
P
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
R
 
T
P
 
P
A
 
V
M
 
V
Q
 
V
G
 
R
C
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
G
 
-
M
 
V
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
H
 
G
E
 
T
V
 
H
A
 
A
A