SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_235017227.1 NCBI__GCF_900177295.1:WP_235017227.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 18 hits to proteins with known functional sites (download)

5l26A Structure of cntnw in an inward-facing substrate-bound state (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:407/408 of query aligns to 9:412/419 of 5l26A

query
sites
5l26A
M
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
T
N
 
D
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
I
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
A
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
L
L
 
I
Q
 
Q
F
 
V
G
 
A
L
|
L
A
 
G
F
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
Q
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
M
F
 
L
L
 
G
A
 
E
L
 
A
N
 
S
G
 
K
L
x
T
V
x
I
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
A
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
N
G
 
G
T
 
V
A
 
D
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
-
P
 
E
A
 
K
P
 
M
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
-
G
 
G
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
V
L
 
F
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
M
I
 
I
L
 
V
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
x
Y
W
x
I
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
I
K
 
K
A
x
V
V
 
I
S
 
G
A
 
G
V
x
F
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
M
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
K
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
I
A
 
R
R
 
R
L
 
M
T
 
T
R
 
E
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
S
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
M
 
L
V
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
A
S
 
G
F
 
Y
L
 
V
S
 
Q
Q
 
M
V
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
P
H
 
Y
I
 
L
L
 
I
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
R
T
 
T
E
 
Q
S
 
N
D
 
D
G
 
A
S
 
E
I
 
V
P
 
L
E
 
A
L
 
E
E
 
N
Y
 
E
D
 
D
S
 
E
S
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
S
G
 
G
T
 
A
E
 
V
Q
 
T
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
I
L
 
A
I
 
I
N
 
A
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
S
L
 
L
I
 
L
V
 
A
L
 
F
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
G
L
 
V
P
 
G
P
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
G
E
 
D
L
 
L
S
 
T
L
 
L
Q
 
Q
R
 
A
V
 
I
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
S
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
Q
K
 
K
T
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
E
L
 
F
A
 
V
K
 
K
L
 
Y
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
E
P
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
Q
L
 
L
D
 
S
E
 
D
R
 
T
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
G
S
|
S
L
 
I
G
 
A
I
x
V
M
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
S
A
 
I
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
K
E
 
D
L
 
V
V
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
I
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
V
S
 
A
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
S
G
 
A
A
 
V
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
F

4pd7A Structure of vccnt bound to zebularine (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:407/408 of query aligns to 6:403/404 of 4pd7A

query
sites
4pd7A
M
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
S
N
 
N
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
L
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
F
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
W
A
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
G
L
 
F
N
 
S
G
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
N
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
S
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
M
P
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
G
G
 
-
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
I
V
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
A
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
F
 
V
A
 
P
R
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
C
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
G
V
 
V
M
 
L
V
 
A
L
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
M
L
 
G
S
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
E
H
 
Y
I
 
L
L
 
V
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
Q
L
 
D
E
 
K
Y
 
P
D
 
A
S
 
N
S
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
G
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
I
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
I
P
 
G
P
 
G
V
 
W
F
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
M
V
 
L
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
A
N
 
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
P
L
 
Y
P
 
L
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
T
 
V
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
A
I
|
I
M
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
A
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
G
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
F

3tijA Crystal structure of a concentrative nucleoside transporter from vibrio cholerae (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:407/408 of query aligns to 6:403/404 of 3tijA

query
sites
3tijA
M
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
S
N
 
N
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
L
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
F
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
W
A
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
G
L
 
F
N
 
S
G
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
N
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
S
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
M
P
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
G
G
 
-
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
I
V
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
A
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
|
N
I
 
I
F
 
F
V
|
V
G
|
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
F
 
V
A
 
P
R
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
C
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
x
S
V
x
I
A
 
A
G
 
G
T
 
G
V
 
V
M
 
L
V
 
A
L
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
M
L
 
G
S
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
E
H
 
Y
I
 
L
L
 
V
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
Q
L
 
D
E
 
K
Y
 
P
D
 
A
S
 
N
S
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
G
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
I
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
I
P
 
G
P
 
G
V
 
W
F
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
M
V
 
L
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
A
N
 
N
E
|
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
P
L
 
Y
P
 
L
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
T
 
V
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
S
S
|
S
L
 
I
G
 
A
I
|
I
M
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
A
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
G
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
F

4pd5A Crystal structure of vccnt-7c8c bound to gemcitabine (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:407/408 of query aligns to 7:402/403 of 4pd5A

query
sites
4pd5A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
S
N
 
N
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
L
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
F
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
W
A
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
G
L
 
F
N
 
S
G
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
N
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
S
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
M
P
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
G
G
 
-
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
I
V
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
A
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
F
 
V
A
 
P
R
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
C
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
G
V
 
V
M
 
L
V
 
A
L
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
M
L
 
G
S
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
E
H
 
Y
I
 
L
L
 
V
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
Q
L
 
D
E
 
K
Y
 
P
D
 
A
S
 
N
S
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
G
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
I
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
I
P
 
G
P
 
G
V
 
W
F
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
M
V
 
L
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
V
|
V
L
 
A
N
 
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
P
L
 
Y
P
 
L
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
T
 
V
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
A
I
|
I
M
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
x
A
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
G
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
F

4pdaA Structure of vccnt-7c8c bound to cytidine (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:407/408 of query aligns to 8:403/404 of 4pdaA

query
sites
4pdaA
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
S
N
 
N
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
L
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
F
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
W
A
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
G
L
 
F
N
 
S
G
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
N
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
S
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
M
P
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
G
G
 
-
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
I
V
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
A
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
F
 
V
A
 
P
R
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
C
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
G
V
 
V
M
 
L
V
 
A
L
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
M
L
 
G
S
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
E
H
 
Y
I
 
L
L
 
V
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
Q
L
 
D
E
 
K
Y
 
P
D
 
A
S
 
N
S
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
G
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
I
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
I
P
 
G
P
 
G
V
 
W
F
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
M
V
 
L
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
A
N
 
N
E
|
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
P
L
 
Y
P
 
L
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
T
 
V
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
S
S
|
S
L
 
I
G
 
A
I
|
I
M
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
A
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
G
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
F

4pd9A Structure of vccnt-7c8c bound to adenosine (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:407/408 of query aligns to 8:403/404 of 4pd9A

query
sites
4pd9A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
S
N
 
N
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
L
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
F
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
W
A
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
G
L
 
F
N
 
S
G
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
N
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
S
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
M
P
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
G
G
 
-
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
I
V
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
A
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
F
 
V
A
 
P
R
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
C
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
G
V
 
V
M
 
L
V
 
A
L
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
M
L
 
G
S
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
E
H
 
Y
I
 
L
L
 
V
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
Q
L
 
D
E
 
K
Y
 
P
D
 
A
S
 
N
S
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
G
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
I
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
I
P
 
G
P
 
G
V
 
W
F
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
M
V
 
L
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
A
N
|
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
P
L
 
Y
P
 
L
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
T
 
V
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
S
S
|
S
L
 
I
G
 
A
I
|
I
M
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
A
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
G
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
F

4pd8A Structure of vccnt-7c8c bound to pyrrolo-cytidine (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:407/408 of query aligns to 8:403/404 of 4pd8A

query
sites
4pd8A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
S
N
 
N
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
L
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
F
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
W
A
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
G
L
 
F
N
 
S
G
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
N
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
S
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
M
P
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
G
G
 
-
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
I
V
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
A
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
F
 
V
A
 
P
R
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
C
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
I
A
|
A
G
 
G
T
 
G
V
 
V
M
 
L
V
 
A
L
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
M
L
 
G
S
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
E
H
 
Y
I
 
L
L
 
V
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
Q
L
 
D
E
 
K
Y
 
P
D
 
A
S
 
N
S
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
G
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
|
L
L
 
A
I
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
I
P
 
G
P
 
G
V
 
W
F
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
M
V
 
L
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
A
N
 
N
E
|
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
P
L
 
Y
P
 
L
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
T
 
V
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
S
S
|
S
L
 
I
G
 
A
I
|
I
M
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
A
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
G
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
F

4pb2A Structure of vccnt-7c8c bound to 5-fluorouridine (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:407/408 of query aligns to 8:403/404 of 4pb2A

query
sites
4pb2A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
S
N
 
N
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
L
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
F
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
W
A
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
G
L
 
F
N
 
S
G
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
N
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
S
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
M
P
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
G
G
 
-
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
I
V
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
A
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
F
 
V
A
 
P
R
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
C
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
G
V
 
V
M
 
L
V
 
A
L
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
M
L
 
G
S
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
E
H
 
Y
I
 
L
L
 
V
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
Q
L
 
D
E
 
K
Y
 
P
D
 
A
S
 
N
S
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
G
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
I
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
I
P
 
G
P
 
G
V
 
W
F
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
M
V
 
L
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
A
N
 
N
E
|
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
P
L
 
Y
P
 
L
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
T
 
V
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
S
S
|
S
L
 
I
G
 
A
I
 
I
M
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
A
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
G
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
F

4pb1A Structure of vccnt-7c8c bound to ribavirin (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:407/408 of query aligns to 8:403/404 of 4pb1A

query
sites
4pb1A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
S
N
 
N
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
L
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
F
L
 
I
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
W
A
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
G
L
 
F
N
 
S
G
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
N
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
A
 
S
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
M
P
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
G
G
 
-
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
I
V
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
A
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
 
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
F
 
V
A
 
P
R
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
C
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
G
V
 
V
M
 
L
V
 
A
L
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
M
L
 
G
S
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
E
H
 
Y
I
 
L
L
 
V
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
Q
L
 
D
E
 
K
Y
 
P
D
 
A
S
 
N
S
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
G
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
|
L
L
 
A
I
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
G
L
 
M
L
 
L
G
 
G
L
 
G
L
 
I
P
 
G
P
 
G
V
 
W
F
 
F
G
 
G
-
 
M
A
 
P
E
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
L
Q
 
E
R
 
M
V
 
L
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
T
T
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
A
N
|
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
P
L
 
Y
P
 
L
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
V
T
 
V
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
A
I
 
I
M
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
A
Q
 
R
L
 
M
A
 
G
G
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
F

5l2aA Structure of cntnw n149s,f366a in an outward-facing state (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:407/408 of query aligns to 10:418/422 of 5l2aA

query
sites
5l2aA
M
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
W
 
V
A
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
T
N
 
D
R
 
R
K
 
K
V
 
A
F
 
I
D
 
N
W
 
I
R
 
R
G
 
T
V
 
V
V
 
A
A
 
G
G
 
A
L
 
F
A
 
L
L
 
I
Q
 
Q
F
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
G
F
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
Y
L
 
V
P
 
P
G
 
Q
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
x
M
F
 
L
L
 
G
A
x
E
L
 
A
N
 
S
G
 
K
L
x
T
V
 
I
L
 
S
A
 
N
L
 
V
Q
 
I
D
 
A
A
 
Y
T
 
G
R
 
N
Q
 
N
G
 
G
T
 
V
A
 
D
F
 
F
V
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
L
 
L
G
 
V
G
 
S
G
 
-
P
 
E
A
 
K
P
 
M
F
 
F
E
 
E
A
 
V
T
 
F
Q
 
G
P
 
-
G
 
G
N
 
G
S
 
G
F
 
F
V
 
V
L
 
F
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
M
I
 
I
L
 
V
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
I
R
 
G
I
 
V
L
 
M
P
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
I
K
 
K
A
 
V
V
 
I
S
 
G
A
 
G
V
 
F
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
M
F
 
L
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
K
A
 
A
V
 
E
G
 
S
V
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
 
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
I
A
 
R
R
 
R
L
 
M
T
 
T
R
 
E
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
F
M
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
S
C
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
M
 
L
V
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
A
S
 
G
F
 
Y
L
 
V
S
 
Q
Q
 
M
V
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
P
H
 
Y
I
 
L
L
 
I
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
x
F
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
R
T
 
T
E
 
Q
S
 
N
D
 
D
G
 
A
S
 
E
I
 
V
P
 
L
E
 
A
L
 
E
E
 
N
Y
 
E
D
 
D
S
 
E
S
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
V
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
S
G
 
G
T
 
A
E
 
V
Q
 
T
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
I
L
 
A
I
 
I
N
 
A
V
 
V
T
 
G
A
 
A
M
 
S
L
 
L
I
 
L
V
 
A
L
 
F
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
M
-
 
I
V
 
N
N
 
G
A
 
I
L
 
I
L
 
G
G
 
G
L
 
V
L
 
G
P
 
G
P
 
W
V
 
F
F
 
G
G
 
H
A
 
G
E
 
D
L
 
L
S
 
T
L
 
L
Q
 
Q
R
 
A
V
 
I
F
 
L
G
 
G
W
 
W
I
 
L
F
 
F
A
 
S
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
W
H
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
Q
K
 
K
T
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
E
 
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
Q
 
E
L
 
F
A
 
V
K
 
K
L
 
Y
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
E
P
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
Q
L
 
L
D
 
S
E
 
D
R
 
T
S
 
T
R
 
K
L
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
 
A
A
 
A
N
 
N
P
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
I
G
 
A
I
 
V
M
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
S
A
 
I
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
K
E
 
D
L
 
V
V
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
I
K
 
K
S
 
A
V
 
V
L
 
V
S
 
A
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
L
L
 
M
T
 
S
G
 
A
A
 
V
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
F

Q62674 Sodium/nucleoside cotransporter 1; Concentrative nucleoside transporter 1; CNT 1; Na(+)/nucleoside cotransporter 1; Sodium-coupled nucleoside transporter 1; Solute carrier family 28 member 1 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
32% identity, 100% coverage: 3:408/408 of query aligns to 184:591/648 of Q62674

query
sites
Q62674
G
 
G
I
 
I
A
 
C
A
 
V
I
 
F
V
 
L
A
 
V
I
 
L
A
 
L
W
 
F
A
 
A
V
 
G
S
 
S
E
 
K
N
 
H
R
 
H
K
 
R
V
 
A
F
 
V
D
 
S
W
 
W
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
S
A
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
G
 
V
L
 
L
A
 
G
F
 
L
L
 
F
L
 
V
L
 
I
R
 
R
L
 
T
P
 
E
G
 
P
A
 
G
R
 
F
D
 
I
V
 
A
F
 
F
L
 
Q
A
 
W
L
 
L
N
 
G
G
 
D
L
 
Q
V
 
I
L
 
Q
A
 
V
L
 
F
Q
 
L
D
 
S
A
 
Y
T
 
T
R
 
E
Q
 
A
G
 
G
T
 
S
A
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
V
P
 
K
G
 
D
N
 
-
S
 
-
F
 
-
V
 
V
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
I
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
C
L
 
V
S
 
M
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
L
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
L
A
 
K
V
 
I
S
 
A
A
 
W
V
 
L
L
 
M
E
 
Q
R
 
V
I
 
T
F
 
M
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
A
A
 
T
V
 
E
G
 
T
V
 
L
S
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
G
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
S
M
 
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
I
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
L
A
 
A
R
 
D
L
 
M
T
 
T
R
 
L
A
 
S
E
 
E
I
 
V
F
 
H
M
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
T
C
 
G
G
 
G
M
 
Y
A
 
A
T
 
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
L
M
 
L
V
 
G
L
 
A
Y
 
Y
A
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
G
I
 
I
P
 
D
G
 
A
A
 
A
L
 
-
G
 
-
H
 
S
I
 
L
L
 
I
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
V
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
A
V
 
L
A
 
S
R
 
K
L
 
L
M
 
V
V
 
Y
P
 
P
G
 
E
V
 
V
E
 
E
K
 
E
T
 
S
E
 
K
-
 
F
-
 
R
S
 
S
D
 
E
G
 
N
S
 
G
I
 
V
P
 
-
E
 
K
L
 
L
E
 
T
Y
 
Y
D
 
G
S
 
D
S
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
M
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
A
T
 
S
R
 
A
G
 
G
T
 
A
E
 
A
Q
 
I
G
 
S
V
 
V
Q
 
K
L
 
V
L
 
V
I
 
A
N
 
N
V
 
I
T
 
A
A
 
A
M
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
F
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
W
L
 
L
P
 
G
P
 
D
V
 
M
F
 
V
G
 
D
A
 
I
E
 
Q
-
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
Q
R
 
L
V
 
I
F
 
C
G
 
S
W
 
Y
I
 
V
F
 
L
A
 
R
P
 
P
Y
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
A
A
 
W
H
 
E
E
 
D
A
 
C
A
 
P
T
 
V
A
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
K
T
 
F
V
 
F
L
 
L
N
 
N
E
 
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
K
 
Q
L
 
Y
P
 
K
A
 
Q
D
 
R
T
 
R
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
G
D
 
D
E
 
K
-
 
K
-
 
Q
-
 
W
-
 
I
-
 
S
-
 
V
R
 
R
S
 
A
R
 
E
L
 
I
I
 
L
L
 
T
V
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
F
G
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
G
I
 
I
M
 
M
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
S
M
 
L
A
 
V
P
 
P
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
G
 
S
E
 
D
L
 
F
V
 
S
Q
 
Q
L
 
I
A
 
V
G
 
L
K
 
R
S
 
A
V
 
L
L
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
A
 
V
T
 
S
G
 
L
L
 
L
T
 
N
G
 
A
A
 
C
V
 
V
V
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

8tz7A Cryo-em structure of bovine concentrative nucleoside transporter 3 in complex with molnupiravir, condition 1, int1-int1-int1 conformation (see paper)
32% identity, 93% coverage: 29:407/408 of query aligns to 123:529/533 of 8tz7A

query
sites
8tz7A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
L
 
I
Q
 
Y
F
 
T
G
 
S
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
F
L
 
S
R
 
K
L
 
H
P
 
P
G
 
T
A
 
K
-
 
V
-
x
Y
-
 
W
R
|
R
D
 
P
V
 
V
F
 
F
L
x
W
A
 
G
L
 
I
N
x
G
G
 
L
L
 
Q
V
 
F
L
 
L
A
 
L
L
 
G
Q
 
L
D
 
L
A
 
I
T
 
L
R
 
R
Q
 
T
G
 
E
T
 
P
A
 
G
F
 
F
V
 
M
-
 
A
F
 
F
G
 
D
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
K
G
 
Q
P
 
V
A
 
Q
P
 
T
F
 
F
-
 
L
E
 
G
A
 
Y
T
 
S
Q
 
D
P
 
A
G
 
G
N
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
T
L
 
V
S
 
M
A
 
S
L
 
M
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
L
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
I
V
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
S
 
G
A
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
L
R
 
V
I
 
T
F
 
M
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
P
A
 
V
V
 
E
G
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
L
A
 
P
R
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
K
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
H
M
 
A
V
 
I
M
 
M
T
 
T
C
 
A
G
 
G
M
 
F
A
 
S
T
 
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
M
 
L
V
 
G
L
 
A
Y
 
Y
A
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
G
G
 
V
A
 
S
L
 
S
G
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
V
I
 
M
S
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
A
V
 
I
A
 
S
R
 
K
L
 
L
M
 
F
V
 
W
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
-
 
T
-
 
P
K
 
K
T
 
I
E
 
N
S
 
L
D
 
K
G
 
N
S
 
A
I
 
M
P
 
K
E
 
M
L
 
E
E
 
S
Y
 
G
D
 
D
S
 
S
S
 
R
-
 
N
-
 
L
M
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
A
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
S
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
L
 
L
L
 
V
I
 
A
N
 
N
V
x
I
T
 
A
A
 
V
M
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
F
V
 
M
N
 
N
A
 
S
L
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
W
L
 
L
P
 
G
P
 
N
V
 
M
F
 
F
G
 
D
A
 
Y
-
 
P
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
E
R
 
V
V
 
I
F
 
C
G
 
S
W
 
Y
I
 
V
F
 
F
A
 
M
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
W
 
F
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
D
A
 
W
H
 
Q
E
 
D
A
 
S
A
 
F
T
 
M
A
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
T
 
T
V
 
F
L
 
F
N
|
N
E
|
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
D
 
Q
T
 
Y
L
 
M
D
 
S
E
 
M
R
 
R
S
 
S
R
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
S
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
S
R
 
R
R
 
K
G
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
T
Q
 
A
L
 
G
A
 
A
G
 
M
K
 
R
S
 
A
V
 
L
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
A
 
A
T
 
C
G
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
C
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8tz6A Cryo-em structure of bovine concentrative nucleoside transporter 3 in complex with psi-6206 (see paper)
32% identity, 93% coverage: 29:407/408 of query aligns to 123:529/533 of 8tz6A

query
sites
8tz6A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
L
 
I
Q
 
Y
F
 
T
G
 
S
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
F
L
 
S
R
 
K
L
 
H
P
 
P
G
 
T
A
 
K
-
 
V
-
x
Y
-
x
W
R
|
R
D
 
P
V
 
V
F
|
F
L
x
W
A
 
G
L
x
I
N
x
G
G
 
L
L
 
Q
V
x
F
L
 
L
A
 
L
L
 
G
Q
 
L
D
 
L
A
 
I
T
 
L
R
 
R
Q
 
T
G
 
E
T
 
P
A
 
G
F
 
F
V
 
M
-
 
A
F
 
F
G
 
D
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
K
G
 
Q
P
 
V
A
 
Q
P
 
T
F
 
F
-
 
L
E
 
G
A
 
Y
T
 
S
Q
 
D
P
 
A
G
 
G
N
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
T
L
 
V
S
 
M
A
 
S
L
 
M
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
L
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
I
V
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
S
 
G
A
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
L
R
 
V
I
 
T
F
 
M
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
P
A
 
V
V
 
E
G
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
L
A
 
P
R
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
K
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
H
M
 
A
V
 
I
M
 
M
T
 
T
C
 
A
G
 
G
M
 
F
A
 
S
T
 
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
M
 
L
V
 
G
L
 
A
Y
 
Y
A
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
G
G
 
V
A
 
S
L
 
S
G
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
V
I
 
M
S
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
A
V
 
I
A
 
S
R
 
K
L
 
L
M
 
F
V
 
W
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
-
 
T
-
 
P
K
 
K
T
 
I
E
 
N
S
 
L
D
 
K
G
 
N
S
 
A
I
 
M
P
 
K
E
 
M
L
 
E
E
 
S
Y
 
G
D
 
D
S
 
S
S
 
R
-
 
N
-
 
L
M
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
A
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
S
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
L
|
L
L
 
V
I
 
A
N
 
N
V
 
I
T
 
A
A
 
V
M
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
F
V
 
M
N
 
N
A
 
S
L
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
W
L
 
L
P
 
G
P
 
N
V
 
M
F
 
F
G
 
D
A
 
Y
-
 
P
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
E
R
 
V
V
 
I
F
 
C
G
 
S
W
 
Y
I
 
V
F
 
F
A
 
M
P
 
P
Y
x
F
A
 
A
W
 
F
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
D
A
 
W
H
 
Q
E
 
D
A
 
S
A
 
F
T
 
M
A
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
T
 
T
V
 
F
L
 
F
N
 
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
D
 
Q
T
 
Y
L
 
M
D
 
S
E
 
M
R
 
R
S
 
S
R
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
S
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
S
R
 
R
R
 
K
G
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
T
Q
 
A
L
 
G
A
 
A
G
 
M
K
x
R
S
 
A
V
 
L
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
A
 
A
T
 
C
G
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
C
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8tz5A Cryo-em structure of bovine concentrative nucleoside transporter 3 in complex with n-hydroxycytidine (see paper)
32% identity, 93% coverage: 29:407/408 of query aligns to 123:529/533 of 8tz5A

query
sites
8tz5A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
L
 
I
Q
 
Y
F
 
T
G
 
S
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
L
L
x
F
L
 
S
R
 
K
L
 
H
P
 
P
G
 
T
A
 
K
-
 
V
-
x
Y
-
x
W
R
 
R
D
 
P
V
 
V
F
|
F
L
x
W
A
 
G
L
 
I
N
 
G
G
 
L
L
 
Q
V
x
F
L
 
L
A
 
L
L
 
G
Q
 
L
D
 
L
A
 
I
T
 
L
R
 
R
Q
 
T
G
 
E
T
 
P
A
 
G
F
 
F
V
 
M
-
 
A
F
 
F
G
 
D
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
K
G
x
Q
P
 
V
A
 
Q
P
 
T
F
|
F
-
 
L
E
 
G
A
x
Y
T
 
S
Q
 
D
P
 
A
G
 
G
N
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
T
L
 
V
S
 
M
A
 
S
L
 
M
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
L
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
I
V
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
S
 
G
A
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
L
R
 
V
I
 
T
F
 
M
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
P
A
 
V
V
 
E
G
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
L
A
 
P
R
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
K
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
H
M
 
A
V
 
I
M
 
M
T
 
T
C
 
A
G
 
G
M
 
F
A
 
S
T
 
T
V
 
I
A
|
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
M
 
L
V
 
G
L
 
A
Y
 
Y
A
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
G
G
 
V
A
 
S
L
 
S
G
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
V
I
 
M
S
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
A
V
 
I
A
 
S
R
 
K
L
 
L
M
 
F
V
 
W
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
-
 
T
-
 
P
K
 
K
T
 
I
E
 
N
S
 
L
D
 
K
G
 
N
S
 
A
I
 
M
P
 
K
E
 
M
L
 
E
E
 
S
Y
 
G
D
 
D
S
 
S
S
 
R
-
 
N
-
 
L
M
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
A
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
S
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
L
|
L
L
 
V
I
 
A
N
 
N
V
 
I
T
 
A
A
 
V
M
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
F
V
 
M
N
 
N
A
 
S
L
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
W
L
 
L
P
 
G
P
 
N
V
 
M
F
 
F
G
 
D
A
 
Y
-
 
P
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
E
R
 
V
V
 
I
F
 
C
G
 
S
W
 
Y
I
 
V
F
 
F
A
 
M
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
W
 
F
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
D
A
 
W
H
 
Q
E
 
D
A
 
S
A
 
F
T
 
M
A
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
T
 
T
V
 
F
L
 
F
N
 
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
D
 
Q
T
 
Y
L
 
M
D
 
S
E
 
M
R
 
R
S
 
S
R
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
S
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
S
R
 
R
R
 
K
G
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
T
Q
 
A
L
 
G
A
 
A
G
 
M
K
 
R
S
 
A
V
 
L
L
x
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
A
 
A
T
 
C
G
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
C
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8tz4A Cryo-em structure of bovine concentrative nucleoside transporter 3 in complex with gs-441524, subset reconstruction (see paper)
32% identity, 93% coverage: 29:407/408 of query aligns to 123:529/533 of 8tz4A

query
sites
8tz4A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
L
 
I
Q
 
Y
F
 
T
G
 
S
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
F
L
 
S
R
 
K
L
 
H
P
 
P
G
 
T
A
 
K
-
 
V
-
 
Y
-
 
W
R
 
R
D
 
P
V
 
V
F
 
F
L
 
W
A
 
G
L
 
I
N
 
G
G
 
L
L
 
Q
V
 
F
L
 
L
A
 
L
L
 
G
Q
 
L
D
 
L
A
 
I
T
 
L
R
 
R
Q
 
T
G
 
E
T
 
P
A
 
G
F
 
F
V
 
M
-
 
A
F
 
F
G
 
D
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
K
G
 
Q
P
 
V
A
 
Q
P
 
T
F
 
F
-
 
L
E
 
G
A
 
Y
T
 
S
Q
 
D
P
 
A
G
 
G
N
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
T
L
 
V
S
 
M
A
 
S
L
 
M
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
L
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
I
V
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
S
 
G
A
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
L
R
 
V
I
 
T
F
 
M
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
P
A
 
V
V
 
E
G
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
L
A
 
P
R
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
K
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
H
M
 
A
V
 
I
M
 
M
T
 
T
C
 
A
G
 
G
M
 
F
A
 
S
T
 
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
|
V
M
 
L
V
 
G
L
 
A
Y
 
Y
A
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
G
G
 
V
A
 
S
L
 
S
G
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
V
I
 
M
S
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
A
V
 
I
A
 
S
R
 
K
L
 
L
M
 
F
V
 
W
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
-
 
T
-
 
P
K
 
K
T
 
I
E
 
N
S
 
L
D
 
K
G
 
N
S
 
A
I
 
M
P
 
K
E
 
M
L
 
E
E
 
S
Y
 
G
D
 
D
S
 
S
S
 
R
-
 
N
-
 
L
M
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
A
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
S
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
L
|
L
L
 
V
I
 
A
N
 
N
V
 
I
T
 
A
A
 
V
M
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
F
V
 
M
N
 
N
A
 
S
L
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
W
L
 
L
P
 
G
P
 
N
V
 
M
F
 
F
G
 
D
A
 
Y
-
 
P
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
E
R
 
V
V
 
I
F
 
C
G
 
S
W
 
Y
I
 
V
F
 
F
A
 
M
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
W
 
F
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
D
A
 
W
H
 
Q
E
 
D
A
 
S
A
 
F
T
 
M
A
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
T
 
T
V
 
F
L
 
F
N
 
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
D
 
Q
T
 
Y
L
 
M
D
 
S
E
 
M
R
 
R
S
 
S
R
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
|
F
A
 
A
N
 
N
P
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
S
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
S
R
 
R
R
 
K
G
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
T
Q
 
A
L
 
G
A
 
A
G
 
M
K
 
R
S
 
A
V
 
L
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
A
 
A
T
 
C
G
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
C
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L

8tz1A Cryo-em structure of bovine concentrative nucleoside transporter 3 in complex with ribavirin (see paper)
32% identity, 93% coverage: 29:407/408 of query aligns to 123:529/533 of 8tz1A

query
sites
8tz1A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
L
 
I
Q
 
Y
F
 
T
G
 
S
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
F
L
 
S
R
 
K
L
 
H
P
 
P
G
 
T
A
 
K
-
 
V
-
x
Y
-
x
W
R
 
R
D
 
P
V
 
V
F
|
F
L
x
W
A
 
G
L
 
I
N
x
G
G
 
L
L
 
Q
V
x
F
L
 
L
A
 
L
L
 
G
Q
 
L
D
 
L
A
 
I
T
 
L
R
 
R
Q
 
T
G
 
E
T
 
P
A
 
G
F
 
F
V
 
M
-
 
A
F
 
F
G
 
D
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
K
G
x
Q
P
 
V
A
 
Q
P
 
T
F
|
F
-
 
L
E
 
G
A
 
Y
T
 
S
Q
 
D
P
 
A
G
 
G
N
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
I
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
T
L
 
V
S
 
M
A
 
S
L
 
M
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
L
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
I
V
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
S
 
G
A
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
L
R
 
V
I
 
T
F
 
M
A
 
G
I
 
T
G
 
S
G
 
P
A
 
V
V
 
E
G
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
M
 
Q
V
 
T
E
|
E
A
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
L
A
 
P
R
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
K
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
H
M
 
A
V
 
I
M
 
M
T
 
T
C
 
A
G
 
G
M
 
F
A
 
S
T
 
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
|
V
M
 
L
V
 
G
L
 
A
Y
 
Y
A
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
G
G
 
V
A
 
S
L
 
S
G
 
S
H
 
H
I
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
V
I
 
M
S
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
A
V
 
I
A
 
S
R
 
K
L
 
L
M
 
F
V
 
W
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
-
 
T
-
 
P
K
 
K
T
 
I
E
 
N
S
 
L
D
 
K
G
 
N
S
 
A
I
 
M
P
 
K
E
 
M
L
 
E
E
 
S
Y
 
G
D
 
D
S
 
S
S
 
R
-
 
N
-
 
L
M
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
A
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
S
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
L
|
L
L
 
V
I
 
A
N
 
N
V
 
I
T
 
A
A
 
V
M
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
F
V
 
M
N
 
N
A
 
S
L
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
W
L
 
L
P
 
G
P
 
N
V
 
M
F
 
F
G
 
D
A
 
Y
-
 
P
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
E
R
 
V
V
 
I
F
 
C
G
 
S
W
 
Y
I
 
V
F
 
F
A
 
M
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
W
 
F
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
D
A
 
W
H
 
Q
E
 
D
A
 
S
A
 
F
T
 
M
A
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
T
 
T
V
 
F
L
 
F
N
 
N
E
|
E
F
|
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
I
A
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
D
 
Q
T
 
Y
L
 
M
D
 
S
E
 
M
R
 
R
S
 
S
R
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
S
V
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
S
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
S
R
 
R
R
 
K
G
 
R
E
 
D
L
 
I
V
 
T
Q
 
A
L
 
G
A
 
A
G
 
M
K
x
R
S
 
A
V
 
L
L
x
I
S
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
I
A
 
A
T
 
C
G
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
C
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

O00337 Sodium/nucleoside cotransporter 1; Concentrative nucleoside transporter 1; CNT 1; hCNT1; Na(+)/nucleoside cotransporter 1; Sodium-coupled nucleoside transporter 1; Solute carrier family 28 member 1 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
32% identity, 100% coverage: 3:408/408 of query aligns to 184:591/649 of O00337

query
sites
O00337
G
 
G
I
 
I
A
 
C
A
 
V
I
 
F
V
|
V
A
 
A
I
 
L
A
 
L
W
 
F
A
 
A
V
 
C
S
 
S
E
 
K
N
 
H
R
 
H
K
 
C
V
 
A
F
 
V
D
 
S
W
 
W
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
S
A
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
G
 
V
L
 
L
A
 
G
F
 
L
L
 
L
L
 
V
L
 
I
R
 
R
L
 
T
P
 
E
G
 
P
A
 
G
R
 
F
D
 
I
V
 
A
F
 
F
L
 
E
A
 
W
L
 
L
N
 
G
G
 
E
L
 
Q
V
 
I
L
 
R
A
 
I
L
 
F
Q
 
L
D
 
S
A
 
Y
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
T
 
S
A
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
V
P
 
K
G
 
D
N
 
-
S
 
-
F
 
-
V
 
V
L
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
C
L
 
V
S
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
L
W
 
Y
H
 
H
W
 
V
R
 
G
I
 
L
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
V
V
 
I
K
 
L
A
 
K
V
 
I
S
 
A
A
 
W
V
 
L
L
 
M
E
 
Q
R
 
V
I
 
T
F
 
M
A
 
G
I
 
T
G
 
T
G
 
A
A
 
T
V
 
E
G
 
T
V
 
L
S
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
G
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
x
S
M
x
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
I
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
L
A
 
A
R
 
D
L
 
M
T
 
T
R
 
L
A
 
S
E
 
E
I
 
V
F
 
H
M
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
T
C
 
G
G
 
G
M
 
Y
A
 
A
T
 
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
x
S
V
 
L
M
 
L
V
 
G
L
 
A
Y
 
Y
A
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
G
S
 
I
Q
 
D
V
 
A
I
 
T
P
 
S
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
H
 
-
I
 
L
L
 
I
T
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
V
I
 
M
S
 
A
V
 
A
P
 
P
A
 
C
A
 
A
L
 
L
M
 
A
V
 
L
A
 
S
R
 
K
L
 
L
M
 
V
V
 
Y
P
 
P
G
 
E
V
 
V
E
 
E
K
 
E
T
 
S
-
 
K
-
 
F
-
 
R
-
 
R
E
 
E
S
 
E
D
 
G
G
 
V
S
 
K
I
 
L
P
 
T
E
 
Y
L
 
G
E
 
D
Y
 
A
D
 
Q
S
x
N
S
 
L
M
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
A
T
 
S
R
 
T
G
 
G
T
 
A
E
 
A
Q
 
I
G
 
S
V
 
V
Q
 
K
L
 
V
L
 
V
I
 
A
N
 
N
V
 
I
T
 
A
A
 
A
M
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
D
L
 
F
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
W
L
 
L
P
 
G
P
 
D
V
 
M
F
 
V
G
 
D
A
 
I
E
 
Q
-
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
Q
R
 
L
V
 
I
F
 
C
G
 
S
W
 
Y
I
 
I
F
 
L
A
 
R
P
 
P
Y
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
I
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
A
A
 
W
H
 
E
E
 
D
A
 
C
A
 
P
T
 
V
A
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
K
T
 
L
V
 
F
L
 
L
N
 
N
E
 
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
Q
Q
 
D
L
 
L
A
 
S
K
 
K
L
 
Y
P
 
K
A
 
Q
D
x
R
T
 
R
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
A
D
 
E
E
 
E
-
 
W
-
 
V
-
 
G
-
x
D
-
 
R
-
 
K
-
 
Q
-
 
W
-
 
I
-
 
S
-
 
V
R
 
R
S
 
A
R
 
E
L
 
V
I
 
L
L
 
T
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
F
G
 
S
S
|
S
L
 
I
G
 
G
I
 
I
M
 
M
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
S
M
 
M
A
 
V
P
 
P
Q
 
Q
R
|
R
R
 
K
G
 
S
E
 
D
L
 
F
V
 
S
Q
 
Q
L
 
I
A
 
V
G
 
L
K
 
R
S
 
A
V
 
L
L
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
C
A
 
V
T
 
S
G
 
L
L
 
V
T
 
N
G
 
A
A
 
C
V
 
M
V
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q9HAS3 Solute carrier family 28 member 3; Concentrative Na(+)-nucleoside cotransporter 3; CNT 3; hCNT3 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
32% identity, 93% coverage: 29:407/408 of query aligns to 206:612/691 of Q9HAS3

query
sites
Q9HAS3
G
 
G
L
 
L
A
 
I
L
 
M
Q
 
Y
F
 
I
G
 
V
L
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
F
L
 
S
R
 
K
L
 
Y
P
 
P
G
 
T
A
 
R
-
 
V
-
 
Y
-
 
W
R
 
R
D
 
P
V
 
V
F
 
L
L
 
W
A
 
G
L
 
I
N
 
G
G
 
L
L
 
Q
V
 
F
L
 
L
A
 
L
L
 
G
Q
 
L
D
 
L
A
 
I
T
 
L
R
 
R
Q
 
T
G
 
D
T
 
P
A
 
G
F
 
F
V
 
I
-
 
A
F
 
F
G
 
D
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
Q
P
 
V
A
 
Q
P
 
T
F
 
F
-
 
L
E
 
E
A
 
Y
T
 
T
Q
 
D
P
 
A
G
 
G
N
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
F
A
 
A
L
 
F
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
V
V
 
F
I
 
F
S
 
S
A
 
T
L
 
V
S
 
M
A
 
S
L
 
M
L
 
L
W
 
Y
H
 
Y
W
 
L
R
 
G
I
 
L
L
 
M
P
 
Q
V
 
W
V
 
I
V
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
S
 
G
A
 
W
V
 
I
L
 
M
E
 
L
R
 
V
I
 
T
F
 
T
A
 
G
I
 
S
G
 
S
G
 
P
A
x
I
V
 
E
G
 
S
V
 
V
S
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
 
Q
V
 
T
E
 
E
A
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
|
R
P
 
P
Y
 
Y
F
 
L
A
 
P
R
 
Y
L
 
I
T
 
T
R
 
K
A
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
H
M
 
A
V
 
I
M
 
M
T
 
T
C
x
A
G
|
G
M
 
F
A
 
S
T
 
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
M
 
L
V
 
G
L
 
A
Y
 
Y
A
 
I
S
 
S
F
 
F
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
S
A
 
S
L
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
V
I
 
M
S
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
L
M
 
F
V
 
W
P
 
P
G
 
E
V
 
T
E
 
E
K
 
K
T
 
P
E
 
K
-
 
I
S
 
T
D
x
L
G
 
K
S
 
N
I
 
A
P
 
M
E
 
K
L
 
M
E
 
E
Y
 
S
D
 
G
S
 
D
S
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
L
M
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
A
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
T
 
A
E
 
S
Q
 
S
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
L
 
L
L
 
V
I
 
A
N
 
N
V
 
I
T
 
A
A
 
V
M
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
F
V
 
M
N
 
N
A
 
S
L
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
W
L
 
F
P
 
G
P
 
N
V
 
M
F
 
F
G
 
D
A
 
Y
-
 
P
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
F
Q
 
E
R
 
L
V
 
I
F
 
C
G
 
S
W
 
Y
I
 
I
F
 
F
A
 
M
P
 
P
Y
 
F
A
 
S
W
 
F
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
E
A
 
W
H
 
Q
E
 
D
A
 
S
A
 
F
T
 
M
A
 
V
G
 
A
E
 
R
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
x
Y
K
 
K
T
 
T
V
 
F
L
 
F
N
 
N
E
 
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
E
Q
 
H
L
 
L
A
 
S
K
 
K
L
 
W
-
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
G
P
 
P
A
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
D
 
Q
T
 
Y
L
 
I
D
 
S
E
 
I
R
 
R
S
 
S
R
 
E
L
 
I
I
 
I
L
 
A
V
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
C
 
C
G
 
G
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
I
G
 
G
S
|
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
S
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
S
R
 
R
R
 
K
G
x
R
E
 
D
L
 
I
V
 
A
Q
 
S
L
 
G
A
 
A
G
 
V
K
 
R
S
 
A
V
 
L
L
 
I
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
A
 
A
T
x
C
G
 
F
L
 
M
T
 
T
G
 
A
A
 
C
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_235017227.1 NCBI__GCF_900177295.1:WP_235017227.1
MLGIAAIVAIAWAVSENRKVFDWRGVVAGLALQFGLAFLLLRLPGARDVFLALNGLVLAL
QDATRQGTAFVFGYLGGGPAPFEATQPGNSFVLALQALPLILVISALSALLWHWRILPVV
VKAVSAVLERIFAIGGAVGVSAAANIFVGMVEAPLLVRPYFARLTRAEIFMVMTCGMATV
AGTVMVLYASFLSQVIPGALGHILTASIISVPAALMVARLMVPGVEKTESDGSIPELEYD
SSMDAITRGTEQGVQLLINVTAMLIVLIALVALVNALLGLLPPVFGAELSLQRVFGWIFA
PYAWLIGIPAHEAATAGELLGLKTVLNEFIAYLQLAKLPADTLDERSRLILVYALCGFAN
PGSLGIMIGGLVAMAPQRRGELVQLAGKSVLSGTLATGLTGAVVGILW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory