SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing YP_004144908.1 NCBI__GCF_000185905.1:YP_004144908.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

7koeA Electron bifurcating flavoprotein fix/etfabcx (see paper)
42% identity, 94% coverage: 2:266/282 of query aligns to 3:264/282 of 7koeA

query
sites
7koeA
H
 
N
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
x
C
I
|
I
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
S
 
T
A
 
T
Q
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
I
H
 
D
P
 
R
V
 
K
T
 
T
N
 
N
T
 
N
I
 
L
M
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
Y
 
D
D
|
D
L
 
E
F
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
S
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
K
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
E
 
T
V
 
V
T
 
Y
V
 
V
L
 
I
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
P
P
 
P
M
 
Q
A
 
A
E
 
K
D
 
E
S
 
A
L
 
L
R
 
K
K
 
D
A
 
A
L
 
I
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
A
 
L
D
 
D
R
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
H
L
 
L
T
 
S
D
 
D
R
 
R
Y
 
T
F
 
F
A
 
A
G
 
G
S
x
A
D
|
D
T
|
T
L
 
L
A
 
A
T
|
T
S
 
T
L
 
Y
A
 
T
L
|
L
S
 
Y
Q
 
W
A
 
G
I
 
I
A
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
E
E
 
E
T
 
R
F
 
I
G
 
G
T
 
K
P
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
I
F
 
L
T
|
T
G
|
G
K
 
K
Q
 
Q
T
x
A
I
 
V
D
 
D
G
|
G
D
 
D
T
|
T
A
x
G
Q
 
Q
V
|
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
L
A
 
A
K
 
T
R
 
R
L
 
F
D
 
G
L
 
Y
S
 
A
Q
 
L
L
 
G
T
 
A
Y
 
Y
V
 
V
A
 
V
R
 
R
I
 
I
A
 
E
T
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
P
A
 
E
A
 
K
R
 
K
E
 
E
I
 
M
T
 
V
V
 
I
E
 
V
R
 
R
R
 
R
C
 
L
E
 
D
G
 
Q
G
 
G
T
 
F
Q
 
E
T
 
K
L
 
I
K
 
R
S
 
L
K
 
K
L
 
L
P
 
P
C
 
A
L
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
T
E
 
D
G
 
E
T
 
L
N
 
N
E
 
K
M
 
P
R
 
R
R
 
Y
G
 
A
S
 
D
I
 
L
E
 
P
D
 
N
A
 
L
L
 
I
S
 
R
A
 
A
A
 
I
R
 
R
R
 
Y
Q
 
E
V
 
P
V
 
I
K
 
V
W
 
W
S
 
T
A
 
H
A
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
-
D
 
D
L
 
P
T
 
K
K
 
K
C
 
C
G
 
G
L
 
F
R
 
F
G
 
G
S
 
S
P
 
P
T
 
T
V
 
R
V
 
V
R
 
V
R
 
S
V
 
T
F
 
N
A
 
I
P
 
P
T
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
-
E
 
-
K
 
K
A
 
G
A
 
G
Q
 
D
I
 
I
D
 
I
T
 
S
A
 
K
E
 
N
K
 
E
T
 
D
L
 
P
R
 
E
D
 
V
L
 
A
A
 
A
D
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
E
A
 
A
I
 
L

4l2iB Electron transferring flavoprotein of acidaminococcus fermentans: towards a mechanism of flavin-based electron bifurcation (see paper)
45% identity, 84% coverage: 1:238/282 of query aligns to 1:229/263 of 4l2iB

query
sites
4l2iB
M
 
M
H
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
x
C
I
x
V
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
S
 
T
A
 
A
Q
 
E
I
 
M
R
 
K
V
 
I
H
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
N
I
 
L
M
 
V
R
 
R
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
T
T
 
N
I
 
I
I
 
M
N
 
N
P
 
P
Y
|
Y
D
|
D
L
 
Q
F
x
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
D
 
D
A
 
E
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
I
T
|
T
M
|
M
G
|
G
P
|
P
P
 
P
M
 
H
A
 
A
E
 
E
D
 
S
S
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
C
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
E
A
 
A
V
 
K
L
 
L
L
 
V
T
x
S
D
|
D
R
 
R
Y
 
A
F
 
F
A
 
G
G
|
G
S
x
A
D
|
D
T
|
T
L
 
L
A
 
A
T
|
T
S
 
S
L
 
A
A
 
A
L
x
M
S
 
A
Q
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
T
 
H
F
 
F
G
 
G
T
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
L
V
 
I
F
 
L
T
x
C
G
|
G
K
 
R
Q
|
Q
T
x
A
I
 
I
D
 
D
G
|
G
D
 
D
T
|
T
A
|
A
Q
 
Q
V
|
V
G
 
G
P
 
P
G
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
E
R
 
H
L
 
L
D
 
G
L
 
L
S
 
P
Q
 
Q
L
 
V
T
 
T
Y
 
A
V
 
A
A
 
L
R
 
K
I
 
V
A
 
Q
T
 
V
I
 
K
D
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
D
E
 
T
I
 
V
T
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
R
R
 
D
C
 
N
E
 
E
G
 
Q
G
 
M
T
 
S
Q
 
M
T
 
T
L
 
F
K
 
T
S
 
M
K
 
K
L
 
M
P
 
P
C
 
C
L
 
V
I
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
M
E
 
R
G
 
-
T
 
S
N
 
K
E
 
D
M
 
L
R
 
R
R
 
F
G
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
R
D
 
G
A
 
K
L
 
M
S
 
K
A
 
A
A
 
R
R
 
K
R
 
A
Q
 
E
V
 
I
V
 
P
K
 
V
W
 
Y
S
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
L
G
 
E
I
 
I
E
 
P
D
 
-
L
 
L
T
 
D
K
 
I
C
 
I
G
 
G
L
 
K
R
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
P
T
 
T
V
 
Q
V
 
V
R
 
M
R
 
K
V
 
S
F
 
F
A
 
T
P
 
P

4kpuB Electron transferring flavoprotein of acidaminococcus fermentans: towards a mechanism of flavin-based electron bifurcation (see paper)
45% identity, 84% coverage: 1:238/282 of query aligns to 1:229/263 of 4kpuB

query
sites
4kpuB
M
 
M
H
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
x
C
I
x
V
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
S
 
T
A
 
A
Q
 
E
I
 
M
R
 
K
V
 
I
H
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
N
I
 
L
M
 
V
R
 
R
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
T
T
 
N
I
 
I
I
 
M
N
 
N
P
 
P
Y
|
Y
D
|
D
L
 
Q
F
x
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
D
 
D
A
 
E
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
I
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
P
P
 
P
M
 
H
A
 
A
E
 
E
D
 
S
S
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
C
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
E
A
 
A
V
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
S
D
 
D
R
 
R
Y
 
A
F
 
F
A
 
G
G
 
G
S
x
A
D
|
D
T
|
T
L
 
L
A
 
A
T
|
T
S
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
A
Q
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
K
T
 
H
F
 
F
G
 
G
T
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
L
V
 
I
F
 
L
T
x
C
G
|
G
K
 
R
Q
|
Q
T
x
A
I
 
I
D
 
D
G
|
G
D
 
D
T
|
T
A
|
A
Q
 
Q
V
|
V
G
 
G
P
 
P
G
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
E
R
 
H
L
 
L
D
 
G
L
 
L
S
 
P
Q
 
Q
L
 
V
T
 
T
Y
 
A
V
 
A
A
 
L
R
 
K
I
 
V
A
 
Q
T
 
V
I
 
K
D
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
D
E
 
T
I
 
V
T
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
R
R
 
D
C
 
N
E
 
E
G
 
Q
G
 
M
T
 
S
Q
 
M
T
 
T
L
 
F
K
 
T
S
 
M
K
 
K
L
 
M
P
 
P
C
 
C
L
 
V
I
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
M
E
 
R
G
 
-
T
 
S
N
 
K
E
 
D
M
 
L
R
 
R
R
 
F
G
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
R
D
 
G
A
 
K
L
 
M
S
 
K
A
 
A
A
 
R
R
 
K
R
 
A
Q
 
E
V
 
I
V
 
P
K
 
V
W
 
Y
S
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
L
G
 
E
I
 
I
E
 
P
D
 
-
L
 
L
T
 
D
K
 
I
C
 
I
G
 
G
L
 
K
R
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
P
T
 
T
V
 
Q
V
 
V
R
 
M
R
 
K
V
 
S
F
 
F
A
 
T
P
 
P

5ol2B The electron transferring flavoprotein/butyryl-coa dehydrogenase complex from clostridium difficile (see paper)
45% identity, 85% coverage: 1:241/282 of query aligns to 1:233/260 of 5ol2B

query
sites
5ol2B
M
 
M
H
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
x
C
I
|
I
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
S
 
T
A
 
T
Q
 
E
I
 
V
R
 
K
V
 
L
H
 
D
P
 
P
V
 
N
T
 
T
N
 
G
T
 
T
I
 
L
M
 
I
R
 
R
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
Y
 
D
D
|
D
L
 
K
F
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
E
Y
 
M
G
 
G
G
 
A
E
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
I
T
 
T
M
|
M
G
 
G
P
 
P
P
 
P
M
 
Q
A
 
A
E
 
D
D
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
R
 
R
Y
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
S
x
A
D
|
D
T
|
T
L
 
W
A
 
A
T
|
T
S
 
S
L
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
K
K
 
N
I
 
I
G
 
D
E
 
F
T
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
D
V
 
I
V
 
I
F
 
I
T
x
A
G
|
G
K
 
R
Q
 
Q
T
x
A
I
 
I
D
 
D
G
|
G
D
 
D
T
|
T
A
|
A
Q
 
Q
V
|
V
G
 
G
P
 
P
G
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
E
R
 
H
L
 
L
D
 
N
L
 
L
S
 
P
Q
 
S
L
 
I
T
 
T
Y
 
Y
V
 
A
A
 
E
R
 
E
I
 
I
A
 
K
T
 
T
I
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
E
A
 
G
R
 
E
E
 
Y
I
 
V
T
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
R
R
 
Q
C
 
F
E
 
E
G
 
D
G
 
C
T
 
C
Q
 
H
T
 
D
L
 
L
K
 
K
S
 
V
K
 
K
L
 
M
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
I
T
 
T
M
 
T
L
 
L
E
 
K
G
 
D
T
 
M
N
 
N
E
 
T
-
 
P
-
 
R
-
 
Y
M
 
M
R
 
K
R
 
V
G
 
G
S
 
R
I
 
I
E
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
F
S
 
E
A
 
-
A
 
-
R
 
N
R
 
D
Q
 
V
V
 
V
V
 
E
K
 
T
W
 
W
S
 
T
A
 
V
A
 
K
E
 
D
A
 
I
G
 
E
I
 
V
E
 
-
D
 
D
L
 
P
T
 
S
K
 
N
C
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
G
S
 
S
P
 
P
T
 
T
V
 
S
V
 
V
R
 
F
R
 
K
V
 
S
F
 
F
A
 
T
P
 
K
T
 
S
A
 
V
R
 
K

6fahB Molecular basis of the flavin-based electron-bifurcating caffeyl-coa reductase reaction (see paper)
43% identity, 85% coverage: 1:241/282 of query aligns to 1:234/262 of 6fahB

query
sites
6fahB
M
 
M
H
 
R
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
x
C
I
x
A
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
S
 
T
A
 
N
Q
 
E
I
 
V
R
 
K
V
 
I
H
 
D
P
 
P
V
 
K
T
 
T
N
 
G
T
 
T
I
 
M
M
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
S
I
 
I
I
 
L
N
 
N
P
 
P
Y
 
D
D
|
D
L
 
A
F
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
L
 
I
R
 
K
D
 
D
A
 
E
Y
 
N
-
 
P
G
 
G
G
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
V
L
 
M
T
|
T
M
|
M
G
 
G
P
 
P
P
 
P
M
 
Q
A
 
A
E
 
S
D
 
E
S
 
M
L
 
L
R
 
R
K
 
E
A
 
C
L
 
L
G
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
E
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
R
 
R
Y
 
A
F
 
F
A
 
G
G
 
G
S
x
A
D
|
D
T
|
T
L
 
W
A
 
A
T
|
T
S
 
S
L
 
A
A
 
T
L
|
L
S
 
A
Q
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
K
K
 
K
I
 
V
G
 
K
E
 
K
T
 
V
F
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
L
T
 
A
G
|
G
K
 
R
Q
|
Q
T
 
A
I
 
I
D
 
D
G
|
G
D
 
D
T
|
T
A
|
A
Q
 
Q
V
|
V
G
 
G
P
 
S
G
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
K
L
 
M
S
 
P
Q
 
V
L
 
V
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
A
 
E
R
 
D
I
 
I
A
 
K
T
 
I
I
 
E
D
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
K
E
 
K
I
 
A
T
 
I
V
 
V
E
 
H
R
 
R
R
 
Q
C
 
M
E
 
E
G
 
D
G
 
G
T
 
Y
Q
 
E
T
 
V
L
 
I
K
 
E
S
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
L
T
 
T
M
 
C
L
 
V
E
 
K
G
 
E
T
 
L
N
 
N
E
 
D
M
 
P
R
 
R
R
 
Y
G
 
M
S
 
S
I
 
V
E
 
G
D
 
G
A
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
A
A
 
Y
R
 
E
R
 
Q
Q
 
P
V
 
I
V
 
T
K
 
I
W
 
W
S
 
N
A
 
H
A
 
E
E
 
D
A
 
I
G
 
G
I
 
L
E
 
S
D
 
P
L
 
-
T
 
E
K
 
A
C
 
C
G
 
G
L
 
L
R
 
N
G
 
A
S
 
S
P
 
P
T
|
T
V
 
Q
V
 
V
R
 
F
R
 
R
V
 
S
F
 
F
A
 
S
P
 
P
T
 
P
A
 
A
R
 
K

7qh2B Cryo-em structure of ldh-etfab complex from acetobacterium woodii (see paper)
37% identity, 87% coverage: 2:246/282 of query aligns to 3:242/265 of 7qh2B

query
sites
7qh2B
H
 
K
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
x
C
I
 
I
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
G
S
 
T
A
 
S
Q
 
N
I
 
V
R
 
E
V
 
V
H
 
D
P
 
P
V
 
E
T
 
T
N
 
G
T
 
V
I
 
L
M
 
I
R
 
R
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
E
T
 
S
I
 
K
I
 
L
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
D
|
D
L
 
L
F
 
F
A
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
T
A
 
A
L
 
F
R
 
R
L
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
Q
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
T
V
 
I
T
 
T
V
 
T
L
 
L
T
 
S
M
|
M
G
 
G
P
 
P
P
 
M
M
 
Q
A
 
S
E
 
K
D
 
E
S
 
V
L
 
L
R
 
M
K
 
E
A
 
S
L
 
F
G
 
Y
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
E
A
 
G
V
 
C
L
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
R
 
R
Y
 
K
F
 
F
A
 
G
G
 
G
S
 
A
D
|
D
T
x
V
L
 
V
A
 
A
T
 
T
S
 
S
L
 
Y
A
 
T
L
|
L
S
 
A
Q
 
Q
A
 
G
I
 
T
A
 
K
K
 
R
I
 
L
G
 
G
E
 
D
T
 
F
F
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
I
F
 
I
T
 
C
G
|
G
K
 
K
Q
|
Q
T
|
T
I
 
T
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
|
T
A
|
A
Q
 
Q
V
|
V
G
 
G
P
 
P
G
 
E
I
 
M
A
 
A
K
 
E
R
 
F
L
 
L
D
 
G
L
 
I
S
 
P
Q
 
H
L
 
V
T
 
T
Y
 
N
V
 
V
A
 
I
R
 
K
I
 
I
A
 
L
T
 
A
I
 
A
D
 
D
L
 
-
A
 
-
A
 
E
R
 
K
E
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
L
E
 
Q
R
 
M
R
 
N
C
 
M
E
 
E
G
 
E
G
 
S
T
 
L
Q
 
E
T
 
I
L
 
Q
K
 
R
S
 
V
K
 
P
L
 
Y
P
 
P
C
 
C
L
 
L
I
 
I
T
 
T
M
 
V
L
 
D
E
 
K
G
 
D
T
 
I
N
 
Y
E
 
T
M
 
P
R
 
R
R
 
L
G
 
P
S
 
S
I
 
Y
E
 
K
D
 
R
A
 
K
L
 
L
S
 
D
A
 
I
A
 
S
R
 
K
R
 
N
Q
 
P
V
 
E
V
 
I
K
 
K
-
 
I
W
 
L
S
 
T
A
 
L
A
 
K
E
 
D
A
 
M
G
 
Y
I
 
D
E
 
T
D
 
N
L
 
E
T
 
K
K
 
K
C
 
Y
G
 
G
L
 
L
R
 
S
G
 
G
S
 
S
P
 
P
T
 
T
V
 
Q
V
 
V
R
 
E
R
 
R
V
 
I
F
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
E
A
 
S
R
 
N
S
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
T
A
 
S

Q9DCW4 Electron transfer flavoprotein subunit beta; Beta-ETF from Mus musculus (Mouse) (see paper)
32% identity, 78% coverage: 1:221/282 of query aligns to 4:219/255 of Q9DCW4

query
sites
Q9DCW4
M
 
L
H
 
R
I
 
A
V
 
L
V
 
V
S
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
I
D
 
D
S
 
F
A
 
A
-
 
V
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
H
 
K
P
 
P
V
 
D
T
 
K
N
 
S
T
 
G
I
 
V
M
 
V
R
 
T
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
H
I
 
S
I
 
M
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
D
 
C
L
 
E
F
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
K
-
 
K
Y
 
L
G
 
V
G
 
K
E
 
E
V
 
I
T
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
S
M
 
Q
A
 
C
E
 
Q
D
 
E
S
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
H
L
 
V
T
 
-
D
 
E
R
 
I
Y
 
P
F
 
G
A
 
A
G
 
Q
S
 
A
D
 
E
T
 
S
L
 
L
A
 
G
T
 
-
S
 
P
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
L
G
 
A
E
 
E
T
 
K
F
 
E
G
 
K
T
 
V
P
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
L
F
 
F
T
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
T
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
D
D
 
D
T
 
C
A
 
N
Q
 
Q
V
 
T
G
 
G
P
 
Q
G
 
M
I
 
T
A
 
A
K
 
G
R
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
W
S
 
P
Q
 
Q
L
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
A
 
S
R
 
Q
I
 
V
A
 
T
T
 
-
I
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
D
E
 
K
I
 
V
T
 
K
V
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
E
C
 
I
E
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
L
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
S
 
L
K
 
K
L
 
L
P
 
P
C
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
M
 
A
L
 
D
E
 
L
G
 
R
T
 
L
N
 
N
E
 
E
M
 
P
R
 
R
R
 
Y
G
 
A
S
 
T
I
 
L
E
 
P
D
 
N
A
 
I
L
 
M
S
x
K
A
 
A
A
 
K
R
x
K
R
 
K
Q
 
K
V
 
I
V
 
E
K
 
V
W
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
D
A
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
-
D
 
D
L
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Q2TBV3 Electron transfer flavoprotein subunit beta; Beta-ETF from Bos taurus (Bovine) (see paper)
32% identity, 78% coverage: 1:221/282 of query aligns to 4:219/255 of Q2TBV3

query
sites
Q2TBV3
M
 
L
H
 
R
I
 
A
V
 
L
V
 
V
S
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
I
D
 
D
S
 
F
A
 
A
-
 
V
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
H
 
K
P
 
P
V
 
D
T
 
K
N
 
T
T
 
G
I
 
V
M
 
V
R
 
T
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
H
I
 
S
I
 
M
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
D
 
C
L
 
E
F
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
K
-
 
K
Y
 
L
G
 
V
G
 
K
E
 
E
V
 
I
T
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
A
M
 
Q
A
 
C
E
 
Q
D
 
E
S
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
H
L
 
V
T
 
-
D
 
-
R
 
E
Y
 
V
F
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
E
D
 
A
T
 
N
L
 
H
A
 
L
T
 
G
S
 
P
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
L
G
 
A
E
 
E
T
 
K
F
 
E
G
 
K
T
 
V
P
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
L
T
 
L
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
T
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
D
D
 
D
T
 
C
A
 
N
Q
 
Q
V
 
T
G
 
G
P
 
Q
G
 
M
I
 
T
A
 
A
K
 
G
R
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
W
S
 
P
Q
 
Q
L
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
A
 
S
R
 
Q
I
 
V
A
 
T
T
 
-
I
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
D
E
 
K
I
 
I
T
 
K
V
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
E
C
 
I
E
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
L
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
S
 
L
K
 
K
L
 
L
P
 
P
C
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
M
 
A
L
 
D
E
 
L
G
 
R
T
 
L
N
 
N
E
 
E
M
 
P
R
 
R
R
 
Y
G
 
A
S
 
T
I
 
L
E
 
P
D
 
N
A
 
I
L
 
M
S
x
K
A
 
A
A
 
K
R
x
K
R
 
K
Q
 
K
V
 
I
V
 
E
K
 
V
W
 
I
S
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
D
A
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
-
D
 
D
L
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P38117 Electron transfer flavoprotein subunit beta; Beta-ETF from Homo sapiens (Human) (see 10 papers)
32% identity, 78% coverage: 1:221/282 of query aligns to 4:219/255 of P38117

query
sites
P38117
M
 
L
H
 
R
I
 
V
V
 
L
V
 
V
S
x
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
I
D
 
D
S
 
Y
A
 
A
-
 
V
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
H
 
K
P
 
P
V
 
D
T
 
R
N
 
T
T
 
G
I
 
V
M
 
V
R
 
T
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
H
I
 
S
I
 
M
N
|
N
P
|
P
Y
x
F
D
x
C
L
 
E
F
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
K
-
 
K
Y
 
L
G
 
V
G
 
K
E
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
x
C
G
 
G
P
 
P
P
 
A
M
 
Q
A
 
C
E
 
Q
D
 
E
S
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
H
L
 
V
T
 
-
D
 
E
R
 
V
Y
 
P
F
 
P
A
 
A
G
 
E
S
 
A
D
 
E
T
 
R
L
 
L
A
 
G
T
 
-
S
 
P
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
L
G
 
A
E
 
E
T
 
K
F
 
E
G
 
K
T
 
V
P
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
L
T
 
L
G
|
G
K
|
K
Q
|
Q
T
x
A
I
|
I
D
|
D
G
x
D
D
|
D
T
x
C
A
x
N
Q
|
Q
V
x
T
G
 
G
P
 
Q
G
 
M
I
 
T
A
 
A
K
 
G
R
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
W
S
 
P
Q
 
Q
L
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
A
 
S
R
 
Q
I
 
V
A
x
T
T
 
-
I
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
D
E
 
K
I
 
L
T
 
K
V
 
V
E
 
E
R
|
R
R
x
E
C
 
I
E
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
L
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
S
 
L
K
 
K
L
 
L
P
 
P
C
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
M
x
A
L
x
D
E
x
L
G
x
R
T
x
L
N
|
N
E
|
E
M
x
P
R
|
R
R
x
Y
G
x
A
S
x
T
I
x
L
E
x
P
D
x
N
A
x
I
L
x
M
S
x
K
A
|
A
A
x
K
R
x
K
R
x
K
Q
x
K
V
 
I
V
 
E
K
 
V
W
 
I
S
 
K
A
 
P
A
 
G
E
 
D
A
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
-
D
 
D
L
 
L
T
 
T

2a1uB Crystal structure of the human etf e165betaa mutant (see paper)
32% identity, 78% coverage: 1:221/282 of query aligns to 1:216/252 of 2a1uB

query
sites
2a1uB
M
 
L
H
 
R
I
 
V
V
 
L
V
 
V
S
x
A
I
x
V
K
|
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
I
D
 
D
S
 
Y
A
 
A
-
 
V
Q
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
H
 
K
P
 
P
V
 
D
T
 
R
N
 
T
T
 
G
I
 
V
M
 
V
R
 
T
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
H
I
 
S
I
 
M
N
 
N
P
|
P
Y
 
F
D
x
C
L
 
E
F
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
K
-
 
K
Y
 
L
G
 
V
G
 
K
E
 
E
V
 
V
T
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
x
C
G
 
G
P
 
P
P
 
A
M
 
Q
A
 
C
E
 
Q
D
 
E
S
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
G
V
 
I
L
 
H
L
 
V
T
 
-
D
 
E
R
 
V
Y
 
P
F
 
P
A
 
A
G
 
E
S
 
A
D
 
E
T
 
R
L
 
L
A
 
G
T
 
-
S
 
P
L
 
L
A
 
Q
L
x
V
S
 
A
Q
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
L
G
 
A
E
 
E
T
 
K
F
 
E
G
 
K
T
 
V
P
 
-
D
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
L
T
x
L
G
|
G
K
 
K
Q
|
Q
T
x
A
I
 
I
D
 
D
G
x
D
D
 
D
T
x
C
A
x
N
Q
|
Q
V
x
T
G
 
G
P
 
Q
G
 
M
I
 
T
A
 
A
K
 
G
R
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
W
S
 
P
Q
 
Q
L
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
A
 
S
R
 
Q
I
 
V
A
 
T
T
 
-
I
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
D
E
 
K
I
 
L
T
 
K
V
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
A
C
 
I
E
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
L
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
S
 
L
K
 
K
L
 
L
P
 
P
C
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
M
 
A
L
 
D
E
x
L
G
 
R
T
 
L
N
 
N
E
 
E
M
 
P
R
 
R
R
 
Y
G
 
A
S
 
T
I
 
L
E
 
P
D
 
N
A
 
I
L
 
M
S
 
K
A
 
A
A
 
K
R
 
K
R
 
K
Q
 
K
V
 
I
V
 
E
K
 
V
W
 
I
S
 
K
A
 
P
A
 
G
E
 
D
A
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
-
D
 
D
L
 
L
T
 
T

1efpB Electron transfer flavoprotein (etf) from paracoccus denitrificans (see paper)
29% identity, 77% coverage: 1:218/282 of query aligns to 1:214/246 of 1efpB

query
sites
1efpB
M
 
M
H
 
K
I
 
V
V
 
L
V
 
V
S
x
P
I
x
V
K
 
K
Q
 
R
V
 
L
P
 
I
D
 
D
-
x
Y
S
 
N
A
 
V
Q
 
K
I
 
A
R
 
R
V
 
V
H
 
K
P
 
S
V
 
D
T
 
G
N
 
S
T
 
G
I
 
V
M
 
D
R
 
L
Q
 
A
G
 
N
V
 
V
P
 
K
T
 
M
I
 
S
I
 
M
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
D
|
D
L
 
E
F
 
I
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
L
R
 
K
D
 
E
-
 
K
A
 
G
Y
 
Q
G
 
A
G
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
I
V
 
A
L
 
V
T
 
S
M
x
I
G
 
G
P
 
V
P
 
K
M
 
Q
A
 
A
E
 
A
D
 
E
S
 
T
L
 
L
R
 
R
K
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
V
D
 
A
R
 
A
Y
 
D
F
 
D
A
 
V
G
 
Q
S
 
Q
D
 
D
T
 
I
L
 
-
A
 
-
T
 
E
S
 
P
L
 
L
A
 
A
L
x
V
S
 
A
Q
 
K
A
 
I
I
 
L
A
 
A
K
 
A
I
 
V
G
 
A
E
 
R
T
 
A
F
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
-
D
 
E
V
 
L
V
 
I
F
 
I
T
x
A
G
|
G
K
 
K
Q
|
Q
T
x
A
I
 
I
D
 
D
G
x
N
D
 
D
T
x
M
A
x
N
Q
 
A
V
x
T
G
 
G
P
 
Q
G
 
M
I
 
L
A
 
A
K
 
A
R
 
I
L
 
L
D
 
G
L
 
W
S
 
A
Q
 
Q
L
 
A
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
A
 
S
R
 
K
I
 
V
A
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
E
L
 
I
A
 
E
A
 
G
R
 
A
E
 
K
I
 
A
T
 
K
V
 
V
E
 
T
R
 
R
R
 
E
C
 
V
E
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
L
Q
 
Q
T
 
T
L
 
I
K
 
A
S
 
V
K
 
S
L
 
L
P
 
P
C
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
M
 
A
L
 
D
E
x
L
G
 
R
T
 
L
N
 
N
E
 
E
M
 
P
R
 
R
R
 
Y
G
 
A
S
 
S
I
 
L
E
 
P
D
 
N
A
 
I
L
 
M
S
 
K
A
 
A
A
 
K
R
 
K
R
 
K
Q
 
P
V
 
L
V
 
D
K
 
E
W
 
K
S
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
D

1o96A Structure of electron transferring flavoprotein for methylophilus methylotrophus. (see paper)
31% identity, 73% coverage: 34:238/282 of query aligns to 34:234/261 of 1o96A

query
sites
1o96A
I
 
L
N
 
N
P
 
E
Y
 
W
D
|
D
L
 
D
F
 
F
A
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
M
R
 
K
L
 
I
R
 
K
D
 
E
A
 
S
Y
 
S
G
 
D
G
 
T
E
 
D
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
V
T
 
V
M
 
V
-
 
S
-
x
V
G
 
G
P
 
P
P
 
D
M
 
R
A
 
V
E
 
D
D
 
E
S
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
C
L
 
L
G
 
A
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
R
L
 
V
T
 
W
D
 
D
R
 
D
Y
 
A
F
 
A
A
 
E
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
A
L
 
I
A
 
V
T
x
V
S
 
G
L
 
R
A
 
I
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
K
K
 
K
I
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
-
G
 
E
T
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
M
V
 
V
F
 
F
T
x
A
G
|
G
K
 
V
Q
|
Q
T
x
S
I
 
S
D
 
D
G
 
Q
D
 
A
T
x
Y
A
|
A
Q
 
S
V
x
T
G
 
G
P
 
I
G
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
S
R
 
Y
L
 
L
D
 
N
L
 
W
S
 
P
Q
 
H
L
 
A
T
 
A
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
D
I
 
L
A
 
-
T
 
Q
I
 
Y
D
 
K
L
 
P
A
 
G
A
 
D
R
 
N
E
 
K
I
 
A
T
 
V
V
 
I
E
 
R
R
 
R
R
 
E
C
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
M
-
 
L
Q
 
Q
T
 
E
L
 
V
K
 
E
S
 
I
K
 
N
L
 
C
P
 
P
C
 
A
L
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
I
L
x
Q
E
 
L
G
 
G
T
 
I
N
 
N
E
 
K
M
 
P
R
 
R
R
 
Y
G
 
A
S
 
S
I
 
L
E
 
R
D
 
G
A
 
I
L
 
K
S
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
T
R
 
K
Q
 
P
V
 
I
V
 
E
K
 
E
W
 
V
S
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
I
G
 
G
I
 
L
E
 
S
D
 
-
L
 
A
T
 
N
K
 
D
C
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
Q
S
 
S
P
 
M
T
 
S
V
 
R
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
M
F
 
Y
A
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P53570 Electron transfer flavoprotein subunit beta; Beta-ETF; Electron transfer flavoprotein small subunit; ETFSS from Methylophilus methylotrophus (Bacterium W3A1) (see paper)
31% identity, 73% coverage: 34:238/282 of query aligns to 35:235/264 of P53570

query
sites
P53570
I
 
L
N
|
N
P
x
E
Y
x
W
D
|
D
L
 
D
F
 
F
A
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
M
R
 
K
L
 
I
R
 
K
D
 
E
A
 
S
Y
 
S
G
 
D
G
 
T
E
 
D
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
V
T
 
V
M
 
V
-
 
S
-
 
V
G
 
G
P
 
P
P
 
D
M
 
R
A
 
V
E
 
D
D
 
E
S
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
C
L
 
L
G
 
A
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
R
L
 
V
T
 
W
D
 
D
R
 
D
Y
 
A
F
 
A
A
 
E
G
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
V
S
 
G
L
 
R
A
 
I
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
K
K
 
K
I
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
-
G
 
E
T
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
M
V
 
V
F
 
F
T
 
A
G
|
G
K
x
V
Q
|
Q
T
x
S
I
 
S
D
 
D
G
 
Q
D
 
A
T
x
Y
A
|
A
Q
x
S
V
x
T
G
 
G
P
 
I
G
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
S
R
 
Y
L
 
L
D
 
N
L
 
W
S
 
P
Q
 
H
L
 
A
T
 
A
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
D
I
 
L
A
 
-
T
 
Q
I
 
Y
D
 
K
L
 
P
A
 
G
A
 
D
R
 
N
E
 
K
I
 
A
T
 
V
V
 
I
E
 
R
R
 
R
R
 
E
C
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
M
-
 
L
Q
 
Q
T
 
E
L
 
V
K
 
E
S
 
I
K
 
N
L
 
C
P
 
P
C
 
A
L
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
Q
E
 
L
G
 
G
T
 
I
N
 
N
E
 
K
M
 
P
R
 
R
R
 
Y
G
 
A
S
 
S
I
 
L
E
 
R
D
 
G
A
 
I
L
 
K
S
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
T
R
 
K
Q
 
P
V
 
I
V
 
E
K
 
E
W
 
V
S
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
I
G
 
G
I
 
L
E
 
S
D
 
-
L
 
A
T
 
N
K
 
D
C
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
Q
S
 
S
P
 
M
T
 
S
V
 
R
V
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
M
F
 
Y
A
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5ow0B Crystal structure of an electron transfer flavoprotein from geobacter metallireducens (see paper)
30% identity, 55% coverage: 1:155/282 of query aligns to 1:149/251 of 5ow0B

query
sites
5ow0B
M
 
M
H
 
Q
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
x
L
I
x
A
K
|
K
Q
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
D
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
P
S
 
S
A
 
A
Q
 
D
I
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
N
R
 
R
V
 
A
H
 
H
P
 
P
V
 
R
T
 
Y
N
 
T
T
 
R
I
 
M
M
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
I
 
-
I
 
I
N
 
G
P
x
L
Y
|
Y
D
|
D
L
 
E
F
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
L
A
 
G
L
 
V
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
K
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
D
V
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
V
T
 
S
M
x
Y
G
 
G
P
 
R
P
 
N
M
 
D
A
 
D
E
 
V
D
 
Q
S
 
F
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
E
D
 
G
R
 
D
Y
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
S
S
 
D
D
 
D
T
 
P
L
 
Y
A
 
V
T
x
I
S
 
A
L
 
A
A
 
N
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
D
T
 
R
F
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
I
F
 
L
T
x
A
G
|
G
K
 
R
Q
|
Q
T
x
S
I
 
S
D
 
D
G
 
M
D
 
D
T
x
R
A
x
G
Q
x
V
V
|
V
G
x
P
P
 
G
G
 
V
I
 
L
A
 
A
K
 
G
R
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
P
Q
 
F
L
 
V
T
 
P
Y
 
Q
V
 
A
A
 
C
R
 
S
I
 
V
A
 
E
T
 
S
I
 
V
D
 
D

Query Sequence

>YP_004144908.1 NCBI__GCF_000185905.1:YP_004144908.1
MHIVVSIKQVPDSAQIRVHPVTNTIMRQGVPTIINPYDLFALEEALRLRDAYGGEVTVLT
MGPPMAEDSLRKALGYGADRAVLLTDRYFAGSDTLATSLALSQAIAKIGETFGTPDVVFT
GKQTIDGDTAQVGPGIAKRLDLSQLTYVARIATIDLAAREITVERRCEGGTQTLKSKLPC
LITMLEGTNEMRRGSIEDALSAARRQVVKWSAAEAGIEDLTKCGLRGSPTVVRRVFAPTA
RSEKAAQIDTAEKTLRDLADELIVAIFTRQPALEPELAFDGA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory