SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 14382 FitnessBrowser__Keio:14382 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

7wxiA Gpr domain of drosophila p5cs filament with glutamate and atpgammas (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:408/417 of query aligns to 2:403/430 of 7wxiA

query
sites
7wxiA
L
 
V
E
 
E
Q
 
V
M
 
M
G
 
A
I
 
E
A
 
N
A
 
A
K
 
R
Q
 
T
A
 
G
S
 
S
Y
 
R
K
 
Q
L
 
M
A
 
Q
Q
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
P
R
 
A
E
 
Q
K
 
R
N
 
A
R
 
S
V
 
A
L
 
V
E
 
N
K
 
T
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
S
Q
 
R
S
 
E
E
 
K
I
 
F
I
 
I
L
 
L
N
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
N
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
A
E
 
K
A
 
P
M
 
L
L
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
K
G
 
N
I
 
L
A
 
S
D
 
V
D
 
G
V
 
L
R
 
K
Q
 
Q
V
 
I
C
 
A
N
 
E
L
 
D
A
 
S
D
 
H
P
 
K
-
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
R
G
 
T
V
 
R
L
 
L
D
 
A
S
 
D
G
 
Q
L
 
L
R
 
E
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
R
 
V
R
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
L
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
A
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
V
 
P
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
C
 
A
L
 
M
K
 
A
T
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
E
T
 
A
C
 
A
R
 
H
T
 
S
N
 
N
A
 
K
A
 
A
T
 
L
V
 
M
A
 
E
V
 
L
I
 
V
Q
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
S
 
T
C
 
V
G
 
G
L
 
-
P
 
A
A
 
E
G
 
H
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
A
 
L
I
 
V
D
 
S
N
 
T
P
 
-
D
 
-
R
 
R
A
 
E
L
 
E
V
 
I
S
 
S
E
 
D
M
 
L
L
 
L
R
 
S
M
 
M
D
 
E
K
 
N
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
M
 
L
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
S
A
 
S
G
 
D
L
 
L
H
 
V
K
 
R
L
 
S
C
 
I
R
 
Q
E
 
Q
Q
 
Q
S
 
S
-
 
L
T
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
T
 
G
G
 
H
G
 
A
I
 
E
G
 
G
V
 
V
C
 
C
H
 
H
I
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
E
 
R
S
 
D
V
 
A
E
 
D
I
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
V
 
I
I
 
A
V
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
C
Q
 
D
R
 
Y
P
 
P
S
 
A
T
 
A
C
 
C
N
 
N
T
 
A
V
 
M
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
H
K
 
E
N
 
D
I
 
L
-
 
M
A
 
S
D
 
G
S
 
A
F
 
I
L
 
F
P
 
G
A
 
D
L
 
V
S
 
C
K
 
N
Q
 
M
M
 
L
A
 
K
E
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
K
L
 
I
H
 
Y
A
 
A
D
 
G
A
 
P
A
 
R
A
 
L
L
 
N
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
T
A
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
P
K
 
A
V
 
A
V
 
K
A
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
H
E
 
E
F
 
Y
L
 
G
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
C
N
 
C
V
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
V
S
 
P
D
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
N
H
 
H
I
 
I
R
 
H
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
Q
 
S
H
 
H
S
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
R
 
E
D
 
N
M
 
D
R
 
A
N
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
F
 
F
V
 
L
N
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
A
A
 
C
V
 
V
Y
 
F
V
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
S
R
|
R
F
 
F
T
 
A
D
|
D
G
 
G
G
 
F
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
G
V
 
I
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
K
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
T
Y
 
T
K
 
K
W
 
W
I
 
I

7wxgA Gpr domain closed form of drosophila p5cs filament with glutamate, atp, and NADPH (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:408/417 of query aligns to 2:403/430 of 7wxgA

query
sites
7wxgA
L
 
V
E
 
E
Q
 
V
M
 
M
G
 
A
I
 
E
A
 
N
A
 
A
K
 
R
Q
 
T
A
 
G
S
 
S
Y
 
R
K
 
Q
L
 
M
A
 
Q
Q
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
P
R
 
A
E
 
Q
K
 
R
N
 
A
R
 
S
V
 
A
L
 
V
E
 
N
K
 
T
I
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
S
Q
 
R
S
 
E
E
 
K
I
 
F
I
 
I
L
 
L
N
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
N
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
A
E
 
K
A
 
P
M
 
L
L
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
K
G
 
N
I
 
L
A
 
S
D
 
V
D
 
G
V
 
L
R
 
K
Q
 
Q
V
 
I
C
 
A
N
 
E
L
 
D
A
 
S
D
 
H
P
 
K
-
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
R
G
 
T
V
 
R
L
 
L
D
 
A
S
 
D
G
 
Q
L
 
L
R
 
E
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
R
 
V
R
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
L
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
|
E
A
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
V
 
P
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
C
 
A
L
 
M
K
 
A
T
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
E
T
 
A
C
 
A
R
 
H
T
 
S
N
 
N
A
 
K
A
 
A
T
 
L
V
 
M
A
 
E
V
 
L
I
 
V
Q
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
S
 
T
C
 
V
G
 
G
L
 
-
P
 
A
A
 
E
G
 
H
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
A
 
L
I
 
V
D
 
S
N
 
T
P
 
-
D
 
-
R
|
R
A
 
E
L
 
E
V
 
I
S
 
S
E
 
D
M
 
L
L
 
L
R
 
S
M
 
M
D
 
E
K
 
N
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
M
 
L
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
|
G
G
x
S
A
x
S
G
 
D
L
|
L
H
 
V
K
 
R
L
 
S
C
 
I
R
 
Q
E
 
Q
Q
 
Q
S
 
S
-
 
L
T
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
T
 
G
G
 
H
G
 
A
I
 
E
G
|
G
V
 
V
C
 
C
H
 
H
I
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
E
 
R
S
 
D
V
 
A
E
 
D
I
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
V
 
I
I
 
A
V
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
C
Q
 
D
R
 
Y
P
 
P
S
 
A
T
 
A
C
 
C
N
 
N
T
 
A
V
 
M
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
H
K
 
E
N
 
D
I
 
L
-
 
M
A
 
S
D
 
G
S
 
A
F
 
I
L
 
F
P
 
G
A
 
D
L
 
V
S
 
C
K
 
N
Q
 
M
M
 
L
A
 
K
E
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
K
L
 
I
H
 
Y
A
 
A
D
 
G
A
 
P
A
 
R
A
 
L
L
 
N
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
T
A
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
P
K
 
A
V
 
A
V
 
K
A
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
H
E
|
E
F
 
Y
L
 
G
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
C
N
 
C
V
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
V
S
 
P
D
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
N
H
 
H
I
 
I
R
 
H
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
Q
 
S
H
 
H
S
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
R
 
E
D
 
N
M
 
D
R
 
A
N
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
F
 
F
V
 
L
N
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
A
A
 
C
V
 
V
Y
 
F
V
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
S
R
 
R
F
 
F
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
F
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
G
V
 
I
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
K
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
T
Y
 
T
K
 
K
W
 
W
I
 
I

4jbeB 1.95 angstrom crystal structure of gamma-glutamyl phosphate reductase from saccharomonospora viridis.
31% identity, 99% coverage: 2:415/417 of query aligns to 8:407/412 of 4jbeB

query
sites
4jbeB
L
 
V
E
 
E
Q
 
E
M
 
C
G
 
A
I
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
Q
 
S
A
 
A
S
 
A
Y
 
P
K
 
S
L
 
L
A
 
S
Q
 
G
L
 
A
S
 
P
S
 
D
R
 
T
E
 
A
K
 
I
N
 
D
R
 
A
V
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
S
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
L
A
 
A
Q
 
H
S
 
R
E
 
D
I
 
A
I
 
V
L
 
L
N
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
K
A
 
A
R
 
E
A
 
A
N
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
S
E
 
A
A
 
G
M
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
T
L
 
I
T
 
T
P
 
E
A
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
T
G
 
D
I
 
M
A
 
A
D
 
D
D
 
Q
V
 
L
R
 
R
Q
 
L
V
 
L
C
 
A
N
 
G
L
 
A
A
 
P
D
 
H
P
 
P
V
 
-
G
 
Q
Q
 
R
V
 
T
I
 
V
D
 
E
G
 
L
G
 
S
V
 
T
L
 
L
D
 
D
S
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
E
 
V
R
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
R
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
A
I
 
N
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
R
P
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
Q
C
 
L
L
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
G
I
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
T
G
 
G
K
 
S
E
 
A
T
 
A
C
 
L
R
 
K
T
 
S
N
 
A
A
 
Q
A
 
R
T
 
L
V
 
L
-
 
E
A
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
R
D
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
T
S
 
D
C
 
S
G
 
G
L
 
I
P
 
D
A
 
A
G
 
N
A
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
L
I
 
V
D
 
P
N
 
R
P
 
P
D
 
E
R
 
R
A
 
E
L
 
A
V
 
A
S
 
G
E
 
A
M
 
L
L
 
V
R
 
R
M
 
L
D
 
P
K
 
D
Y
 
L
I
 
V
D
 
P
M
 
L
L
 
V
I
 
I
P
 
L
R
 
R
G
 
G
-
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
S
L
 
T
H
 
R
K
 
A
L
 
L
C
 
A
R
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
A
Q
 
Q
S
 
H
T
 
G
I
 
V
P
 
R
V
 
T
I
 
L
T
 
A
G
 
H
G
 
A
I
 
D
G
 
G
V
 
G
C
 
G
H
 
V
I
 
L
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
K
V
 
A
E
x
D
I
 
R
A
x
D
E
 
T
A
 
V
L
 
R
K
 
S
V
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
S
K
 
-
T
 
L
Q
 
D
R
 
R
P
 
L
S
 
G
T
 
V
C
 
C
N
 
N
T
 
R
V
 
L
E
 
N
T
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
H
K
 
D
N
x
A
I
 
V
A
 
Y
D
 
E
S
x
E
F
 
F
L
 
W
P
 
P
A
 
V
L
 
V
S
 
S
K
x
E
Q
 
A
M
 
L
A
 
A
E
|
E
S
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
S
L
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
P
A
 
S
G
 
L
P
 
P
A
 
P
K
 
Y
V
 
D
V
 
H
A
 
P
V
 
I
K
 
G
A
 
Y
E
 
E
E
 
W
Y
 
A
D
 
L
D
 
D
E
 
S
F
 
E
L
 
R
S
 
E
L
 
A
D
 
T
L
 
V
N
 
T
V
 
V
K
 
A
I
 
R
V
 
V
S
 
D
D
 
G
L
 
V
D
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
R
H
 
I
I
 
A
R
 
N
E
 
E
H
 
E
G
 
T
T
 
S
Q
 
G
H
 
L
S
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
L
 
A
T
 
T
R
 
E
D
 
D
M
 
A
R
 
R
N
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
F
 
F
V
 
F
N
 
D
E
 
G
V
 
Y
D
 
Q
S
 
G
S
 
T
A
 
G
V
 
V
Y
 
F
V
 
W
N
 
N
A
 
A
S
 
P
T
 
T
R
 
R
F
 
L
T
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
F
Q
 
K
F
 
L
G
 
L
L
 
G
G
 
V
A
 
P
E
 
E
V
 
T
A
 
G
V
 
I
S
 
N
T
 
L
Q
 
D
K
 
K
L
 
V
H
 
P
A
 
G
-
 
P
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V
G
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
T
Y
 
Y
K
 
P
W
 
D
I
 
L
G
 
Y
I
 
V
G
 
R
D
 
Q
Y
 
Y
T
 
A
I
 
V

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
30% identity, 42% coverage: 104:278/417 of query aligns to 97:277/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
R
 
R
L
 
D
E
 
E
R
 
E
R
 
N
R
 
R
V
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
-
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
A
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
V
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
A
L
 
L
-
 
I
C
 
A
L
 
V
K
 
K
T
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
K
 
P
E
 
S
T
 
A
C
 
A
R
 
K
T
 
C
N
 
T
A
 
A
A
 
E
T
 
A
V
 
A
A
 
R
V
 
I
I
 
M
Q
 
Q
D
 
E
A
 
A
L
 
A
K
 
E
S
 
R
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
L
V
 
I
Q
 
S
A
 
C
I
 
I
D
 
T
N
 
Q
P
 
P
D
 
T
R
 
M
A
 
A
L
 
A
V
 
T
S
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
R
 
K
M
 
-
D
 
H
K
 
K
Y
 
L
I
 
T
D
 
D
M
 
V
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
L
|
L
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
T
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
P
G
 
G
V
 
N
C
 
V
H
 
P
I
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
S
 
S
V
 
A
E
 
N
I
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
Q
V
 
L
I
 
I
V
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
T
 
T
Q
 
F
R
 
D
P
 
Y
S
 
G
T
 
T
-
 
I
C
 
C
N
 
A
T
 
S
V
 
E
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
D
K
 
E
N
 
S
I
 
I
A
 
K
D
 
E
S
 
K
F
 
V
L
 
V
P
 
A
A
 
E
L
 
L
S
 
K
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
30% identity, 42% coverage: 104:278/417 of query aligns to 96:276/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
R
 
R
L
 
D
E
 
E
R
 
E
R
 
N
R
 
R
V
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
-
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
A
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
V
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
A
L
 
L
-
 
I
C
 
A
L
 
V
K
 
K
T
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
K
x
P
E
 
S
T
 
A
C
 
A
R
 
K
T
 
C
N
 
T
A
 
A
A
 
E
T
 
A
V
 
A
A
 
R
V
 
I
I
 
M
Q
 
Q
D
 
E
A
 
A
L
 
A
K
 
E
S
 
R
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
L
V
 
I
Q
 
S
A
 
C
I
 
I
D
 
T
N
 
Q
P
 
P
D
 
T
R
 
M
A
 
A
L
 
A
V
 
T
S
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
R
 
K
M
 
-
D
 
H
K
 
K
Y
 
L
I
 
T
D
 
D
M
 
V
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
L
|
L
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
T
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
P
G
 
G
V
 
N
C
 
V
H
 
P
I
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
S
 
S
V
 
A
E
 
N
I
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
Q
V
 
L
I
 
I
V
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
T
 
T
Q
 
F
R
 
D
P
 
Y
S
 
G
T
 
T
-
 
I
C
 
C
N
 
A
T
 
S
V
 
E
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
D
K
 
E
N
 
S
I
 
I
A
 
K
D
 
E
S
 
K
F
 
V
L
 
V
P
 
A
A
 
E
L
 
L
S
 
K
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
G
A
 
A

6gvsA Engineered glycolyl-coa reductase comprising 8 mutations with bound NADP+ (see paper)
26% identity, 74% coverage: 100:406/417 of query aligns to 94:424/441 of 6gvsA

query
sites
6gvsA
D
 
D
S
 
N
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
L
E
 
V
R
 
E
R
 
Y
R
 
S
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
A
I
 
I
Y
 
T
E
x
P
A
x
T
-
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
E
T
 
T
V
 
I
D
 
V
V
 
C
A
 
N
S
 
S
L
 
I
-
 
G
C
 
M
L
 
L
K
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
K
 
G
E
 
R
T
 
A
C
 
R
R
 
Q
T
 
V
N
 
S
A
 
L
A
 
L
T
 
L
V
 
V
A
 
R
V
 
L
I
 
I
Q
 
N
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
K
 
A
S
 
A
C
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
N
A
 
L
V
 
V
Q
 
V
A
 
T
I
 
V
D
 
E
N
 
K
P
 
P
D
 
S
R
|
R
A
 
E
L
 
N
V
 
T
S
 
L
E
 
A
M
 
M
L
 
M
R
 
A
M
 
H
D
 
P
K
 
K
Y
 
-
I
 
V
D
 
R
M
 
M
L
 
L
I
 
V
P
 
A
R
x
T
G
|
G
G
|
G
A
 
P
G
 
A
L
|
L
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
V
R
 
L
E
 
S
Q
 
T
S
 
G
T
 
K
I
 
-
P
 
K
V
 
A
I
 
I
T
 
G
G
x
A
G
|
G
I
x
A
G
 
G
V
 
N
C
 
P
H
 
P
I
 
V
Y
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
A
E
 
N
I
 
I
A
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
A
K
 
C
V
 
D
I
 
I
V
 
V
N
 
N
A
 
G
-
 
C
K
 
S
T
 
F
Q
 
D
R
 
N
P
 
N
S
 
I
T
 
T
C
|
C
N
 
T
T
 
A
V
 
E
E
 
K
T
 
E
L
 
I
L
 
I
V
 
A
N
 
V
K
 
A
N
 
Q
I
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
Y
F
 
L
L
 
I
P
 
F
A
 
N
L
 
L
S
 
K
K
 
K
Q
 
-
M
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
N
G
 
G
V
 
A
T
 
Y
L
 
E
H
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
K
A
 
G
G
 
G
P
 
P
-
 
Q
A
 
T
K
 
K
V
 
C
V
 
V
A
 
G
V
 
K
K
 
S
A
 
A
E
 
V
E
 
W
Y
 
L
D
 
L
D
 
S
E
 
Q
F
 
I
-
 
G
L
 
I
S
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
A
N
 
S
V
 
I
K
 
K
I
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
E
-
x
E
-
 
L
-
 
M
-
 
M
-
 
P
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
R
V
 
V
S
 
E
D
 
T
L
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
D
-
 
L
A
 
A
H
 
I
I
 
E
R
 
V
E
 
E
H
 
H
G
 
D
T
 
N
Q
 
R
H
|
H
S
 
T
D
 
A
A
 
I
I
 
M
L
 
H
T
 
S
R
 
T
D
 
D
M
 
V
R
 
R
N
 
K
A
 
L
Q
 
T
R
 
K
F
 
M
V
 
A
N
 
K
E
 
L
V
 
I
D
 
Q
S
 
T
S
 
T
A
 
-
V
 
I
Y
 
F
V
 
V
N
 
K
A
 
N
S
 
G
T
 
P
R
 
S
F
 
Y
T
 
A
D
 
G
G
 
H
G
 
G
Q
 
A
F
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
G
A
 
Y
E
 
S
V
 
T
A
 
-
V
 
-
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
F
H
 
T
A
x
I
R
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
T
G
 
G
L
 
-
E
 
E
A
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
S
Y
 
A
K
 
K

P0A9Q7 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
30% identity, 33% coverage: 111:247/417 of query aligns to 103:239/891 of P0A9Q7

query
sites
P0A9Q7
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
-
 
C
G
 
G
V
x
I
I
x
V
Y
x
P
E
x
T
A
x
T
R
x
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
A
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
S
L
 
L
-
 
I
C
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
I
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
-
 
P
K
 
R
E
 
A
T
 
K
C
 
D
R
 
A
T
 
T
N
 
N
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
D
A
 
I
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
-
S
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
D
A
 
L
V
 
I
Q
 
G
A
 
W
I
 
I
D
 
D
N
 
Q
P
 
P
D
 
S
R
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
S
S
 
N
E
 
A
M
 
L
L
 
M
R
 
H
M
 
H
D
 
P
K
 
D
Y
 
-
I
 
I
D
 
N
M
 
L
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
|
G
A
 
P
G
 
G
L
 
M
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
I
T
 
G
G
 
V
G
|
G
I
 
A
G
 
G
V
 
N
C
 
T
H
 
P
I
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
K
E
 
R
A
 
A
L
 
V
K
 
A
V
 
S
I
 
V
V
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P0A9Q8 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli O157:H7 (see paper)
30% identity, 33% coverage: 111:247/417 of query aligns to 103:239/891 of P0A9Q8

query
sites
P0A9Q8
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
-
 
C
G
 
G
V
 
I
I
 
V
Y
 
P
E
 
T
A
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
A
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
S
L
 
L
-
 
I
C
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
I
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
-
 
P
K
 
R
E
 
A
T
 
K
C
 
D
R
 
A
T
 
T
N
 
N
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
D
A
 
I
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
-
S
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
D
A
 
L
V
 
I
Q
 
G
A
 
W
I
 
I
D
 
D
N
 
Q
P
 
P
D
 
S
R
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
S
S
 
N
E
 
A
M
 
L
L
 
M
R
 
H
M
 
H
D
 
P
K
 
D
Y
 
-
I
 
I
D
 
N
M
 
L
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
L
 
M
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
I
T
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
G
V
 
N
C
 
T
H
 
P
I
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
K
E
 
R
A
 
A
L
 
V
K
 
A
V
 
S
I
 
V
V
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7bvpA Adhe spirosome in extended conformation (see paper)
30% identity, 33% coverage: 111:247/417 of query aligns to 103:239/869 of 7bvpA

query
sites
7bvpA
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
-
 
C
G
 
G
V
 
I
I
 
V
Y
x
P
E
x
T
A
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
A
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
S
L
 
L
-
 
I
C
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
I
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
-
 
P
K
 
R
E
 
A
T
 
K
C
 
D
R
 
A
T
 
T
N
 
N
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
D
A
 
I
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
-
S
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
D
A
 
L
V
 
I
Q
 
G
A
 
W
I
 
I
D
 
D
N
 
Q
P
 
P
D
 
S
R
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
S
S
 
N
E
 
A
M
 
L
L
 
M
R
 
H
M
 
H
D
 
P
K
 
D
Y
 
-
I
 
I
D
 
N
M
 
L
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
|
G
G
|
G
A
 
P
G
 
G
L
x
M
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
I
T
 
G
G
x
V
G
|
G
I
x
A
G
 
G
V
 
N
C
 
T
H
 
P
I
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
K
E
 
R
A
 
A
L
 
V
K
 
A
V
 
S
I
 
V
V
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6tqmA Escherichia coli adhe structure in its compact conformation (see paper)
30% identity, 33% coverage: 111:247/417 of query aligns to 103:239/869 of 6tqmA

query
sites
6tqmA
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
-
 
C
G
 
G
V
 
I
I
 
V
Y
 
P
E
 
T
A
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
A
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
S
L
 
L
-
 
I
C
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
I
 
I
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
-
 
P
K
 
R
E
 
A
T
 
K
C
 
D
R
 
A
T
 
T
N
 
N
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
D
A
 
I
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
D
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
-
S
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
D
A
 
L
V
 
I
Q
 
G
A
 
W
I
 
I
D
 
D
N
 
Q
P
 
P
D
 
S
R
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
S
S
 
N
E
 
A
M
 
L
L
 
M
R
 
H
M
 
H
D
 
P
K
 
D
Y
 
-
I
 
I
D
 
N
M
 
L
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
L
 
M
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
I
T
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
G
V
 
N
C
 
T
H
 
P
I
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
K
E
 
R
A
 
A
L
 
V
K
 
A
V
 
S
I
 
V
V
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>14382 FitnessBrowser__Keio:14382
MLEQMGIAAKQASYKLAQLSSREKNRVLEKIADELEAQSEIILNANAQDVADARANGLSE
AMLDRLALTPARLKGIADDVRQVCNLADPVGQVIDGGVLDSGLRLERRRVPLGVIGVIYE
ARPNVTVDVASLCLKTGNAVILRGGKETCRTNAATVAVIQDALKSCGLPAGAVQAIDNPD
RALVSEMLRMDKYIDMLIPRGGAGLHKLCREQSTIPVITGGIGVCHIYVDESVEIAEALK
VIVNAKTQRPSTCNTVETLLVNKNIADSFLPALSKQMAESGVTLHADAAALAQLQAGPAK
VVAVKAEEYDDEFLSLDLNVKIVSDLDDAIAHIREHGTQHSDAILTRDMRNAQRFVNEVD
SSAVYVNASTRFTDGGQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEALTTYKWIGIGDYTIRA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory