SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 14810 FitnessBrowser__Keio:14810 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P00962 Glutamine--tRNA ligase; Glutaminyl-tRNA synthetase; GlnRS; EC 6.1.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
100% identity, 100% coverage: 1:554/554 of query aligns to 1:554/554 of P00962

query
sites
P00962
M
|
M
S
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
R
P
 
P
T
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
H
T
 
T
T
 
T
V
 
V
H
 
H
T
 
T
R
|
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
|
E
P
|
P
N
|
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
|
I
G
|
G
H
|
H
A
|
A
K
|
K
S
|
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
W
 
W
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
T
 
T
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
A
C
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
H
C
 
C
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
|
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Q
|
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
|
M
S
|
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
K
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
K
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
K
|
K
Q
|
Q
D
|
D
N
|
N
T
|
T
I
|
I
E
|
E
M
 
M
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
N
H
 
H
P
 
P
N
 
N
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
F
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
R
 
R
H
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
E
 
E

4jyzA Crystal structure of e. Coli glutaminyl-tRNA synthetase bound to atp and native tRNA(gln) containing the cmnm5s2u34 anticodon wobble base (see paper)
100% identity, 98% coverage: 8:549/554 of query aligns to 1:542/542 of 4jyzA

query
sites
4jyzA
P
 
P
T
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
H
T
 
T
T
 
T
V
 
V
H
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
|
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
W
 
W
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
|
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
E
 
E
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
T
|
T
L
|
L
T
 
T
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
E
 
E
G
|
G
K
 
K
A
 
A
C
|
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
F
|
F
I
|
I
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
|
V
L
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
H
C
 
C
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
 
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
F
|
F
Q
|
Q
D
|
D
N
 
N
R
 
R
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
|
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
K
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
K
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
K
|
K
Q
|
Q
D
|
D
N
|
N
T
|
T
I
 
I
E
|
E
M
 
M
A
|
A
S
|
S
L
 
L
E
 
E
S
|
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
R
|
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
N
H
 
H
P
 
P
N
|
N
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
|
Q
Y
 
Y
K
|
K
R
|
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
|
R
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
F
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
S
|
S
K
|
K
D
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
|
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
|
Q
F
 
F
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
R
 
R
H
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
|
L
R
|
R
D
 
D
T
|
T
W
|
W

1o0cA Crystal structure of l-glutamate and ampcpp bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
98% identity, 97% coverage: 9:548/554 of query aligns to 1:529/529 of 1o0cA

query
sites
1o0cA
T
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
H
T
 
T
T
 
T
V
 
V
H
 
H
T
 
T
R
|
R
F
|
F
P
 
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
|
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
W
 
W
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
|
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
E
 
E
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
T
|
T
L
|
L
T
|
T
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
E
 
E
G
|
G
K
 
K
A
 
A
C
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
F
|
F
I
|
I
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
|
H
C
 
C
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
|
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
F
|
F
Q
|
Q
D
|
D
N
 
N
R
 
R
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
K
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
K
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
K
|
K
Q
|
Q
D
 
D
N
|
N
T
|
T
I
 
I
E
|
E
M
 
M
A
|
A
S
|
S
L
 
L
E
 
E
S
|
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
R
|
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
N
H
 
H
P
|
P
N
 
N
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
|
Q
Y
 
Y
K
|
K
R
|
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
|
R
N
|
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
F
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
|
L
S
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
|
Q
F
 
F
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
R
 
R
H
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
|
R
D
 
D
T
 
T

1o0bA Crystal structure of l-glutamine and ampcpp bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
98% identity, 97% coverage: 9:548/554 of query aligns to 1:529/529 of 1o0bA

query
sites
1o0bA
T
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
H
T
 
T
T
 
T
V
 
V
H
 
H
T
 
T
R
 
R
F
|
F
P
|
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
|
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
W
 
W
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
|
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
E
 
E
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
T
|
T
L
|
L
T
|
T
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
E
 
E
G
|
G
K
 
K
A
 
A
C
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
F
|
F
I
|
I
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
|
V
L
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
|
H
C
 
C
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
|
C
T
 
T
L
 
L
E
 
E
F
|
F
Q
|
Q
D
|
D
N
 
N
R
 
R
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
K
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
K
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
K
|
K
Q
|
Q
D
|
D
N
|
N
T
|
T
I
 
I
E
|
E
M
 
M
A
|
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
|
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
R
|
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
N
H
 
H
P
|
P
N
|
N
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
|
Q
Y
 
Y
K
|
K
R
|
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
|
R
N
|
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
F
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
|
L
S
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
G
V
|
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
|
Q
F
 
F
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
R
 
R
H
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
|
R
D
 
D
T
 
T

1gtsA Structural basis for transfer RNA aminoaceylation by escherichia coli glutaminyl-tRNA synthetase (see paper)
98% identity, 97% coverage: 9:548/554 of query aligns to 1:529/529 of 1gtsA

query
sites
1gtsA
T
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
H
T
 
T
T
 
T
V
 
V
H
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
|
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
W
 
W
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
|
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
E
 
E
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
T
 
T
L
|
L
T
 
T
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
E
 
E
G
|
G
K
 
K
A
 
A
C
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
F
|
F
I
|
I
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
|
V
L
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
H
C
 
C
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
 
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
F
|
F
Q
|
Q
D
|
D
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
K
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
K
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
K
|
K
Q
|
Q
D
 
D
N
|
N
T
|
T
I
 
I
E
|
E
M
 
M
A
|
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
|
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
R
|
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
N
H
 
H
P
 
P
N
 
N
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
|
Q
Y
|
Y
K
|
K
R
|
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
|
R
N
|
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
F
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
S
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
G
V
|
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
F
 
F
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
R
 
R
H
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
|
R
D
 
D
T
|
T

1exdA Crystal structure of a tight-binding glutamine tRNA bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
98% identity, 97% coverage: 9:548/554 of query aligns to 1:529/529 of 1exdA

query
sites
1exdA
T
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
H
T
 
T
T
 
T
V
 
V
H
 
H
T
 
T
R
 
R
F
|
F
P
 
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
|
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
W
 
W
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
|
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
E
 
E
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
T
 
T
L
|
L
T
|
T
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
E
 
E
G
|
G
K
 
K
A
 
A
C
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
F
|
F
I
|
I
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
|
V
L
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
H
C
 
C
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
 
C
T
 
T
L
 
L
E
 
E
F
|
F
Q
|
Q
D
|
D
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
V
|
V
M
|
M
S
|
S
K
|
K
R
 
R
K
|
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
K
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
K
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
K
|
K
Q
|
Q
D
|
D
N
|
N
T
|
T
I
 
I
E
|
E
M
 
M
A
|
A
S
|
S
L
 
L
E
 
E
S
|
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
R
|
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
N
H
 
H
P
|
P
N
 
N
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
|
Q
Y
 
Y
K
|
K
R
|
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
|
R
N
|
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
F
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
S
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
G
V
|
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
|
Q
F
 
F
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
R
 
R
H
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
|
L
R
|
R
D
 
D
T
 
T

1euqA Crystal structure of glutaminyl-tRNA synthetase complexed with a tRNA- gln mutant and an active-site inhibitor (see paper)
98% identity, 97% coverage: 9:548/554 of query aligns to 1:529/529 of 1euqA

query
sites
1euqA
T
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
H
T
 
T
T
 
T
V
 
V
H
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
|
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
W
 
W
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
|
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
E
 
E
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
T
 
T
L
|
L
T
 
T
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
E
 
E
G
|
G
K
 
K
A
 
A
C
|
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
F
|
F
I
|
I
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
|
V
L
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
|
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
|
H
C
 
C
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
|
C
T
 
T
L
 
L
E
 
E
F
|
F
Q
 
Q
D
 
D
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
K
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
K
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
K
|
K
Q
|
Q
D
 
D
N
|
N
T
|
T
I
 
I
E
|
E
M
 
M
A
|
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
|
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
R
|
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
N
H
 
H
P
 
P
N
|
N
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
|
Q
Y
 
Y
K
|
K
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
|
R
N
|
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
F
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
S
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
G
V
|
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
|
Q
F
 
F
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
R
 
R
H
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
|
L
R
|
R
D
 
D
T
 
T

2re8A Glutaminyl-tRNA synthetase mutant c229r with bound analog 5'-o-[n-(l- glutamyl)-sulfamoyl]adenosine (see paper)
98% identity, 97% coverage: 9:548/554 of query aligns to 1:529/529 of 2re8A

query
sites
2re8A
T
 
T
N
 
N
F
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
I
 
I
I
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
H
T
 
T
T
 
T
V
 
V
H
 
H
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
|
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
 
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
|
D
D
 
D
T
|
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
W
 
W
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
|
L
T
 
T
P
|
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
E
 
E
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
T
|
T
L
|
L
T
 
T
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
E
 
E
G
|
G
K
 
K
A
 
A
C
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
S
 
S
P
|
P
F
|
F
I
|
I
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
|
V
L
 
L
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
Y
|
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
|
H
C
 
C
I
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
x
R
T
|
T
L
 
L
E
 
E
F
|
F
Q
 
Q
D
|
D
N
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
K
H
 
H
V
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
M
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
C
K
 
K
R
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
T
|
T
K
|
K
Q
|
Q
D
 
D
N
|
N
T
|
T
I
 
I
E
|
E
M
 
M
A
 
A
S
|
S
L
 
L
E
 
E
S
|
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
|
N
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
R
|
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
N
H
 
H
P
|
P
N
|
N
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
W
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
Q
|
Q
Y
 
Y
K
|
K
R
|
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
|
R
N
|
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
F
 
F
C
 
C
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
|
L
S
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
I
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
Q
|
Q
F
 
F
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
R
 
R
H
 
H
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
R
|
R
D
 
D
T
 
T

5zdkA Crystal structure analysis of ttqrs in complex with atp (see paper)
52% identity, 97% coverage: 8:546/554 of query aligns to 5:543/543 of 5zdkA

query
sites
5zdkA
P
 
P
T
 
E
N
 
C
F
 
F
I
 
I
R
 
T
Q
 
E
I
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
K
S
 
E
G
 
G
K
 
K
H
 
Y
T
 
A
T
 
K
V
 
L
H
 
V
T
 
T
R
 
R
F
|
F
P
 
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
R
S
 
S
I
 
I
C
 
V
L
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
G
G
 
G
Q
 
E
C
 
C
N
 
N
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
E
K
 
T
E
 
E
D
 
K
I
 
E
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
E
 
R
S
 
A
I
 
I
K
 
E
N
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
R
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
R
W
 
-
S
 
P
G
 
T
N
 
R
V
 
V
R
 
L
Y
 
Y
S
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
E
Q
 
T
L
 
M
H
 
Y
A
 
Q
Y
 
C
A
 
A
I
 
L
E
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
Q
K
 
E
G
 
G
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
D
L
 
L
T
 
P
P
 
E
E
 
E
Q
 
E
I
 
M
R
 
S
E
 
E
Y
 
L
R
 
R
G
 
A
T
 
Q
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
G
K
 
K
N
 
P
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
R
M
 
M
R
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
E
F
 
F
E
 
P
E
 
T
G
 
G
K
 
S
A
 
R
C
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
P
A
 
A
S
 
H
P
 
P
F
 
N
I
 
F
V
 
K
M
 
L
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
K
 
V
F
 
H
A
 
A
E
 
P
H
 
H
H
 
Y
Q
 
H
T
 
V
G
 
G
N
 
D
K
 
R
W
 
W
C
 
V
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
A
H
 
H
C
 
P
I
 
L
S
 
E
D
 
D
A
 
F
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
 
C
T
|
T
L
 
L
E
 
E
F
 
F
Q
 
E
D
 
N
N
 
N
R
 
R
R
 
T
L
 
V
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
I
D
 
E
N
 
N
I
 
L
T
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
C
-
 
G
I
 
L
P
 
P
V
 
T
H
 
S
P
 
P
R
 
R
-
 
P
-
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
A
R
|
R
L
|
L
N
 
D
L
 
L
E
 
S
Y
 
H
T
 
T
V
 
V
M
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
I
L
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
E
D
 
G
K
 
G
H
 
Y
V
 
V
E
 
S
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
L
S
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
V
T
 
R
A
 
P
A
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
V
E
 
E
F
 
F
C
 
V
K
 
R
R
 
K
I
 
T
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
 
R
Q
 
N
D
 
E
N
 
A
T
 
Q
I
 
I
E
 
E
M
 
M
A
 
D
S
 
L
L
 
F
E
 
E
S
 
E
C
 
V
I
 
V
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
N
 
N
E
 
P
N
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
V
M
 
L
A
 
G
V
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
L
K
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
G
 
-
E
 
E
M
 
W
V
 
I
T
 
E
M
 
A
P
 
P
N
 
Y
H
x
W
P
|
P
-
 
R
N
 
D
K
x
I
P
 
P
E
 
K
M
x
E
G
 
G
S
 
T
R
 
R
Q
 
P
V
 
L
P
 
P
F
 
F
S
 
S
G
 
P
E
 
E
I
 
L
W
 
Y
I
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
T
D
 
D
F
 
F
R
 
S
E
 
L
E
 
N
A
 
P
N
 
P
K
 
K
Q
 
G
Y
 
W
K
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
A
L
 
P
G
 
G
K
 
Q
E
 
R
V
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
H
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
E
A
 
L
E
 
E
R
 
D
V
 
V
E
 
V
K
 
E
D
 
E
A
 
G
E
 
-
G
 
G
N
 
E
I
 
V
T
 
R
T
 
L
I
 
L
F
 
K
C
 
A
T
 
R
Y
 
I
D
 
V
A
 
P
D
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
G
K
 
A
D
 
N
P
 
P
A
 
E
D
 
D
G
 
G
R
 
V
K
 
R
V
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
R
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
F
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
R
V
 
T
P
 
K
N
 
D
P
 
P
G
 
E
A
 
E
A
 
G
D
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
L
S
 
Q
V
 
N
I
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
V
K
 
K
Q
 
R
G
 
G
F
 
F
A
 
I
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
V
K
 
A
D
 
Q
A
 
D
V
 
P
A
 
E
G
 
D
K
 
T
A
 
R
F
 
Y
Q
 
Q
F
 
L
E
 
E
R
 
R
E
 
L
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
W
L
 
R
D
 
D
S
 
P
R
 
V
H
 
D
S
 
S
T
 
R
A
 
P
E
 
E
K
 
A
P
 
L
V
 
V
F
 
M
N
 
N
R
 
R
T
 
I
V
 
V
G
 
P
L
 
L
R
 
K

P47897 Glutamine--tRNA ligase; Glutaminyl-tRNA synthetase; GlnRS; EC 6.1.1.18 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
46% identity, 95% coverage: 28:552/554 of query aligns to 264:775/775 of P47897

query
sites
P47897
V
 
V
H
 
R
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
I
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
I
C
 
N
L
 
F
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
Y
A
 
A
Q
 
K
D
 
A
Y
 
N
K
 
N
G
 
G
Q
 
I
C
 
C
N
 
F
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
E
K
 
K
E
 
E
D
 
E
I
 
A
E
 
K
Y
 
F
V
 
F
E
 
T
S
 
A
I
 
I
K
 
C
N
 
D
D
 
M
V
 
V
E
 
A
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
H
 
T
W
 
-
S
 
P
G
 
Y
N
 
K
V
 
V
R
 
T
Y
 
Y
S
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
H
 
Y
A
 
A
Y
 
W
A
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
C
P
 
H
E
 
Q
Q
 
R
I
 
G
R
 
E
E
 
E
Y
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
H
L
 
N
T
 
T
Q
 
L
P
 
P
G
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
S
P
 
P
Y
 
W
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
P
V
 
M
E
 
E
E
 
E
N
 
S
L
 
L
A
 
L
L
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
A
M
 
M
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
K
F
 
F
E
 
S
E
 
E
G
 
G
K
 
E
A
 
A
C
 
T
L
 
L
R
|
R
A
 
M
K
 
K
I
 
L
D
 
V
M
 
M
A
 
E
S
 
D
P
 
G
F
 
K
I
 
M
V
 
-
M
 
-
R
 
-
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
A
Y
 
Y
R
 
R
I
 
V
K
 
K
F
 
Y
A
 
T
E
 
P
H
 
H
H
 
H
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
D
K
 
K
W
 
W
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
T
 
T
H
 
H
C
 
C
I
 
L
S
 
C
D
 
D
A
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
H
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
 
C
T
 
T
L
 
K
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
D
 
A
N
 
R
R
 
R
R
 
S
L
 
S
Y
 
Y
D
 
F
W
 
W
V
 
L
L
 
C
D
 
N
N
 
A
I
 
L
T
 
D
I
 
V
P
 
Y
V
 
C
H
 
-
P
 
P
R
 
V
Q
 
Q
Y
 
W
E
 
E
F
 
Y
S
 
G
R
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
E
 
H
Y
 
Y
T
 
A
V
 
V
M
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
I
N
 
L
L
 
Q
L
 
L
V
 
V
T
 
A
D
 
T
K
 
G
H
 
A
V
 
V
E
 
R
G
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
|
R
M
 
L
P
 
F
T
 
T
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
T
 
P
A
 
P
A
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
N
E
 
N
F
 
F
C
 
C
K
 
A
R
 
R
I
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
 
V
Q
 
A
D
 
Q
N
 
T
T
 
T
I
 
M
E
 
E
M
 
P
A
 
H
S
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
C
 
C
I
 
V
R
 
R
E
 
D
D
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
D
N
 
T
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
E
P
 
S
V
 
L
K
 
R
L
 
V
V
 
I
I
 
I
E
 
T
N
 
N
Y
 
F
Q
 
P
G
 
A
E
 
A
G
 
K
E
 
S
M
 
L
-
 
D
V
 
I
T
 
Q
M
 
V
P
 
P
N
 
N
H
 
F
P
 
P
N
 
A
K
 
D
P
 
E
E
 
T
M
 
K
G
 
G
S
 
F
R
 
H
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
A
G
 
P
E
 
I
I
 
V
W
 
F
I
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
T
D
 
D
F
 
F
R
 
K
E
 
E
E
 
E
A
 
P
N
 
E
K
 
P
Q
 
G
Y
 
F
K
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
A
L
 
W
G
 
G
K
 
Q
E
 
P
V
 
V
R
 
G
L
 
L
R
 
R
N
 
H
-
 
T
A
 
G
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
E
A
 
L
E
 
Q
R
 
H
V
 
V
E
 
V
K
 
K
D
 
G
A
 
P
E
 
S
G
 
G
N
 
-
I
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
F
 
-
C
 
C
T
 
V
Y
 
E
D
 
S
A
 
L
D
 
E
T
 
V
L
 
T
S
 
C
K
 
R
D
 
R
P
 
A
A
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
E
K
 
K
V
 
P
K
 
K
G
 
A
V
 
F
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
S
A
 
-
A
 
-
H
 
Q
A
 
P
L
 
L
P
 
M
V
 
C
E
 
E
I
 
V
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
R
 
R
L
 
L
F
 
F
S
 
Q
V
 
H
P
 
K
N
 
N
P
 
P
G
 
E
A
 
D
A
 
P
D
 
T
D
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
D
I
 
L
N
 
N
P
 
L
E
 
A
S
 
S
L
 
L
-
 
H
V
 
V
I
 
V
K
 
D
Q
 
A
G
 
A
F
 
L
A
 
V
E
 
D
P
 
C
S
 
S
L
 
V
K
 
A
D
 
L
A
 
A
V
 
K
A
 
P
G
 
F
K
 
D
A
 
K
F
 
F
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
L
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
S
L
 
V
D
 
D
S
 
P
R
 
-
H
 
D
S
 
S
T
 
H
A
 
Q
E
 
G
K
 
K
P
 
L
V
 
V
F
 
F
N
 
N
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
E
T
 
D
W
 
P
A
 
G
K
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4h3sA The structure of glutaminyl-tRNA synthetase from saccharomyces cerevisiae (see paper)
42% identity, 95% coverage: 28:551/554 of query aligns to 38:585/585 of 4h3sA

query
sites
4h3sA
V
 
V
H
 
R
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
|
E
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
S
K
 
K
S
 
A
I
 
I
C
 
M
L
 
V
N
 
N
F
 
F
G
 
G
I
 
Y
A
 
A
Q
 
K
D
 
Y
Y
 
H
K
 
N
G
 
G
Q
 
T
C
 
C
N
 
Y
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
E
K
 
K
E
 
E
D
 
A
I
 
P
E
 
E
Y
 
Y
V
 
F
E
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
R
D
 
M
V
 
V
E
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
K
-
 
P
W
 
W
S
 
K
G
 
-
N
 
-
V
 
I
R
 
T
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
H
 
Y
A
 
R
Y
 
L
A
 
A
I
 
E
E
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
K
K
 
N
G
 
G
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
x
C
E
 
H
L
x
C
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
E
I
 
I
R
 
K
E
 
R
Y
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
G
T
 
T
Q
 
P
P
 
G
G
 
G
K
 
E
N
 
R
-
 
Y
-
 
A
S
x
C
P
 
K
Y
x
H
R
 
R
D
 
D
R
 
Q
S
 
S
V
 
I
E
 
E
E
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
Q
L
 
E
F
 
F
E
 
R
K
 
D
M
 
M
R
 
R
A
 
D
G
 
G
G
 
K
F
 
Y
E
 
K
E
 
P
G
 
G
K
 
E
A
 
A
C
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
M
K
 
K
I
 
Q
D
 
D
M
 
L
A
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
S
I
 
P
V
 
Q
M
 
M
R
 
W
D
 
D
P
 
L
V
 
I
L
 
A
Y
 
Y
R
 
R
I
 
V
K
 
L
F
 
N
A
 
A
E
 
P
H
 
H
H
 
P
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
T
K
 
K
W
 
W
C
 
R
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
T
H
 
H
C
 
C
I
 
L
S
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
M
E
 
E
G
 
N
I
 
I
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
 
L
C
 
C
T
 
T
L
 
T
E
 
E
F
 
F
Q
 
Y
D
 
L
N
 
S
R
 
R
R
 
E
L
 
S
Y
 
Y
D
 
E
W
 
W
V
 
L
L
 
C
D
 
D
N
 
Q
I
 
V
T
 
H
I
 
V
P
 
-
V
 
F
H
 
R
P
 
P
R
 
A
Q
 
Q
Y
 
R
E
 
E
F
 
Y
S
 
G
R
|
R
L
 
L
N
 
N
L
 
I
E
 
T
Y
 
G
T
 
T
V
 
V
M
 
L
S
 
S
K
|
K
R
 
R
K
 
K
L
 
I
N
 
A
L
 
Q
L
 
L
V
 
V
T
 
D
D
 
E
K
 
K
H
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
L
P
 
F
T
 
T
I
 
L
S
 
E
G
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
V
T
 
P
A
 
P
A
 
G
S
 
A
I
 
I
R
 
L
E
 
S
F
 
F
C
 
I
K
 
N
R
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
 
T
Q
 
S
D
 
T
N
 
T
T
 
N
I
 
I
E
 
Q
M
 
V
A
 
V
S
 
R
L
 
F
E
 
E
S
 
S
C
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
K
D
 
Y
L
 
L
N
 
E
E
 
D
N
 
T
A
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
L
M
 
M
A
 
F
V
 
V
I
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
V
E
 
D
N
 
N
Y
 
L
Q
 
S
G
 
D
E
 
D
-
 
Y
G
 
E
E
 
E
M
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
I
P
 
P
N
 
Y
H
 
R
P
 
P
N
 
G
K
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
F
G
 
G
S
 
E
R
 
R
Q
 
T
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
T
G
 
N
E
 
K
I
 
F
W
 
Y
I
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
D
F
 
F
R
 
S
E
 
E
E
 
N
A
 
V
-
 
D
N
 
D
K
 
K
Q
 
E
Y
 
F
K
 
F
R
 
R
L
 
L
V
 
T
L
 
P
G
 
N
K
 
Q
E
 
P
V
 
V
R
 
G
L
 
L
-
 
I
R
 
K
N
 
V
A
 
S
Y
 
H
V
 
T
I
 
V
K
 
S
A
 
F
E
 
K
R
 
S
V
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
D
A
 
E
E
 
A
G
 
G
N
 
K
I
 
I
T
 
I
T
 
R
I
 
I
F
 
H
C
 
V
T
 
N
Y
 
Y
D
 
D
A
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
N
G
 
K
R
 
K
K
 
K
V
 
P
K
 
K
G
 
T
V
 
Y
I
 
I
H
 
Q
W
 
W
V
 
V
-
 
P
-
 
I
S
 
S
A
 
S
A
 
K
H
 
Y
A
 
N
L
 
S
P
 
P
V
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
T
E
 
E
I
 
T
R
 
R
L
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
Q
L
 
L
F
 
F
S
 
K
V
 
S
P
 
E
N
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
S
-
 
H
A
 
P
D
 
E
D
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
V
 
D
I
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
E
S
 
S
-
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
Y
K
 
K
Q
 
E
G
 
S
F
 
V
A
 
M
E
 
E
P
 
H
S
 
N
L
 
F
K
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
V
A
 
K
G
 
N
K
 
S
A
 
P
-
 
W
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
F
-
 
Y
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
C
-
 
R
F
 
F
Q
 
Q
F
 
A
E
 
M
R
 
R
E
 
V
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
T
L
 
L
D
 
D
S
 
-
R
 
K
H
 
E
S
 
S
T
 
T
A
 
T
E
 
S
K
 
K
P
 
V
V
 
I
F
 
L
N
 
N
R
 
R
T
 
I
V
 
V
G
 
S
L
 
L
R
 
K
D
 
D
T
 
A
W
 
T
A
 
S
K
 
K

P46655 Glutamate--tRNA ligase, cytoplasmic; Glutamyl-tRNA synthetase; (c)ERS; GluRS; P85; EC 6.1.1.17 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
36% identity, 94% coverage: 19:539/554 of query aligns to 193:692/708 of P46655

query
sites
P46655
D
 
D
L
 
L
A
 
P
S
 
D
G
 
A
K
 
K
H
 
M
T
 
G
T
 
E
V
 
V
H
 
V
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
E
P
 
P
N
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
A
C
 
L
L
 
L
N
 
N
F
 
Q
G
 
Y
I
 
F
A
 
A
Q
 
Q
D
 
A
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
K
C
 
L
N
 
I
L
 
I
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
S
K
 
K
E
 
E
D
 
K
I
 
E
E
 
E
Y
 
F
V
 
Q
E
 
D
S
 
S
I
 
I
K
 
L
N
 
E
D
 
D
V
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
I
H
 
K
W
 
-
S
 
G
G
 
D
N
 
R
V
 
I
R
 
T
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
Q
Q
 
E
L
 
M
H
 
Y
A
 
D
Y
 
Y
A
 
C
I
 
V
E
 
Q
L
 
M
I
 
I
N
 
K
K
 
D
G
 
G
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
C
D
 
D
E
 
D
L
 
T
T
 
P
P
 
T
E
 
E
Q
 
K
I
 
M
R
 
R
E
 
E
Y
 
E
R
 
R
G
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
M
P
 
D
G
 
G
K
 
V
N
 
A
S
 
S
P
 
A
Y
 
R
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
R
L
 
I
F
 
F
E
 
T
K
 
E
M
 
E
R
 
M
A
 
K
G
 
N
G
 
G
F
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
-
 
L
K
 
K
A
 
N
C
 
C
L
 
V
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
Y
A
 
K
S
 
A
P
 
L
F
 
N
I
 
K
V
 
T
M
 
L
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
R
 
R
I
 
C
K
 
N
F
 
L
A
 
T
E
 
P
H
 
H
H
 
H
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
S
K
 
T
W
 
W
C
 
K
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
C
H
 
V
C
 
P
I
 
I
S
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
A
L
 
L
C
 
R
T
 
T
L
 
I
E
 
E
F
 
Y
Q
 
R
D
 
D
N
 
R
R
 
N
R
 
A
L
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
V
 
M
L
 
L
D
 
Q
N
 
A
I
 
L
T
 
R
I
 
L
-
 
R
P
 
K
V
 
V
H
 
H
P
 
-
R
 
-
Q
 
I
Y
 
W
E
 
D
F
 
F
S
 
A
R
 
R
L
 
I
N
 
N
L
 
F
E
 
V
Y
 
R
T
 
T
V
 
L
M
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
Q
L
 
W
L
 
M
V
 
V
T
 
D
D
 
K
K
 
D
H
 
L
V
 
V
E
 
G
G
 
N
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
I
 
V
S
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
E
S
 
G
I
 
L
R
 
R
E
 
N
F
 
F
C
 
V
K
 
L
R
 
S
I
 
Q
G
 
G
V
 
P
T
 
S
K
 
R
Q
 
N
D
 
V
N
 
I
T
 
N
I
 
L
E
 
E
M
 
W
A
 
N
S
 
L
L
 
I
E
 
W
S
 
A
C
 
F
I
 
N
R
 
K
E
 
K
D
 
V
L
 
I
N
 
D
E
 
P
N
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
H
M
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
V
D
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
I
V
 
H
I
 
L
E
 
E
N
 
G
Y
 
S
Q
 
E
G
 
A
-
 
P
-
 
Q
E
 
E
G
 
P
E
 
K
M
 
I
V
 
E
T
 
M
M
 
K
P
 
P
N
 
K
H
 
H
P
 
K
N
 
K
K
 
N
P
 
P
E
 
A
M
 
V
G
 
G
S
 
E
R
 
K
Q
 
K
V
 
V
P
 
I
F
 
Y
S
 
Y
G
 
K
E
 
D
I
 
I
W
 
V
I
 
V
D
 
D
R
 
K
A
 
D
D
 
D
F
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
A
Y
 
D
V
 
V
I
 
I
K
 
N
A
 
V
-
 
D
E
 
E
R
 
E
V
 
V
E
 
T
K
 
L
D
 
M
A
 
D
E
 
W
G
 
G
N
 
N
I
 
V
T
 
I
T
 
I
I
 
T
F
 
K
C
 
K
T
 
N
Y
 
D
D
 
D
A
 
G
D
 
S
T
 
M
L
 
V
S
 
A
K
 
K
D
 
L
P
 
N
A
 
L
D
 
E
G
 
G
-
 
D
-
 
F
R
 
K
K
 
K
V
 
T
K
 
K
G
 
H
V
 
K
I
 
L
H
 
T
W
 
W
V
 
L
S
 
A
-
 
D
A
 
T
A
 
K
H
 
D
A
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
L
R
 
V
L
 
D
Y
 
F
D
 
D
R
 
H
L
 
L
F
 
I
S
 
T
V
 
K
P
 
D
N
 
R
P
 
L
G
 
E
A
 
E
A
 
D
D
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
E
S
 
D
V
 
F
I
 
L
N
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
T
L
 
E
V
 
F
I
 
H
K
 
T
Q
 
D
G
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
D
P
 
L
S
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
M
V
 
K
A
 
I
G
 
G
K
 
D
A
 
I
F
 
I
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
C
 
R
L
 
L
D
 
D
S
 
A
R
 
L
H
 
P
S
 
K
T
 
D
A
 
G
E
 
K
K
 
P
P
 
Y
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

O13775 Probable glutamate--tRNA ligase, cytoplasmic; Glutamyl-tRNA synthetase; GluRS; EC 6.1.1.17 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
36% identity, 93% coverage: 28:540/554 of query aligns to 207:702/716 of O13775

query
sites
O13775
V
 
V
H
 
V
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
E
P
 
P
N
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
A
C
 
L
L
 
L
N
 
N
F
 
Q
G
 
Y
I
 
F
A
 
A
Q
 
N
D
 
K
Y
 
Y
K
 
H
G
 
G
Q
 
K
C
 
L
N
 
I
L
 
V
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
S
K
 
K
E
 
E
D
 
N
I
 
S
E
 
E
Y
 
F
V
 
Q
E
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
L
N
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
A
W
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
I
H
 
K
W
 
-
S
 
P
G
 
D
N
 
V
V
 
V
R
 
T
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
F
 
L
D
 
D
Q
 
T
L
 
I
H
 
H
A
 
Q
Y
 
Y
A
 
C
I
 
V
E
 
D
L
 
M
I
 
I
N
 
K
K
 
S
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
E
 
D
L
 
T
T
 
D
P
 
V
E
 
E
Q
 
T
I
 
M
R
 
R
E
 
H
Y
 
E
R
 
R
G
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
T
P
 
E
G
 
G
K
 
I
N
 
P
S
 
S
P
 
K
Y
 
H
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
E
N
 
S
L
 
L
A
 
E
L
 
I
F
 
L
E
 
S
K
 
E
M
 
M
R
 
D
A
 
K
G
 
G
G
 
S
F
 
D
E
 
V
E
 
G
G
 
L
K
 
K
A
 
N
C
 
C
L
 
I
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
S
M
 
Y
A
 
E
S
 
N
P
 
P
F
 
N
I
 
K
V
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
R
 
R
I
 
C
K
 
N
F
 
L
A
 
L
E
 
P
H
 
H
H
 
H
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
T
K
 
K
W
 
Y
C
 
R
I
 
A
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
A
H
 
C
C
 
P
I
 
I
S
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
A
L
 
L
C
 
R
T
 
T
L
 
T
E
 
E
F
 
Y
Q
 
R
D
 
D
N
 
R
R
 
N
R
 
P
L
 
L
Y
 
Y
D
 
Q
W
 
W
V
 
M
L
 
I
D
 
K
N
 
A
I
 
M
T
 
N
I
 
L
-
 
R
P
 
K
V
 
I
H
 
H
P
 
-
R
 
-
Q
 
V
Y
 
W
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
 
R
L
 
M
N
 
N
L
 
F
E
 
V
Y
 
R
T
 
T
V
 
L
M
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
T
L
 
E
L
 
I
V
 
V
T
 
D
D
 
H
K
 
G
H
 
L
V
 
V
E
 
W
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
I
 
V
S
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
M
T
 
T
A
 
I
A
 
E
S
 
A
I
 
L
R
 
Q
E
 
Q
F
 
Y
C
 
I
K
 
V
R
 
S
I
 
Q
G
 
G
V
 
P
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
D
 
I
N
 
L
T
 
T
I
 
L
E
 
D
M
 
W
A
 
T
S
 
S
L
 
F
E
 
W
S
 
A
C
 
T
I
 
N
R
 
K
E
 
K
D
 
I
L
 
I
N
 
D
E
 
P
N
 
V
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
H
M
 
T
A
 
A
V
 
V
-
 
E
-
 
S
I
 
G
D
 
D
P
 
V
V
 
V
K
 
K
L
 
A
V
 
T
I
 
I
E
 
V
N
 
N
Y
 
G
Q
 
P
G
 
A
E
 
A
G
 
P
E
 
Y
M
 
A
V
 
E
T
 
D
M
 
R
P
 
P
N
 
R
H
 
H
P
 
K
N
 
K
K
 
N
P
 
P
E
 
E
M
 
L
G
 
G
S
 
N
R
 
K
Q
 
K
V
 
S
P
 
I
F
 
F
S
 
A
G
 
N
E
 
E
I
 
I
W
 
L
I
 
I
D
 
E
R
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
 
-
R
 
-
E
 
A
E
 
Q
A
 
S
N
 
F
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
D
K
 
E
R
 
E
L
 
V
V
 
T
L
 
L
G
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
M
R
 
D
L
 
W
R
 
G
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
I
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
R
R
 
E
V
 
I
E
 
N
K
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
S
G
 
G
N
 
K
I
 
V
T
 
T
T
 
S
I
 
L
F
 
K
C
 
L
T
 
E
Y
 
L
D
 
H
A
 
L
D
 
D
T
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
G
D
 
D
G
 
F
R
 
K
K
 
K
V
 
T
K
 
E
G
 
K
V
 
K
I
 
V
H
 
T
W
 
W
V
 
L
S
 
A
A
 
D
A
 
T
H
 
E
-
 
D
A
 
K
L
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
L
R
 
V
L
 
D
Y
 
F
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
F
 
I
S
 
T
V
 
K
P
 
D
N
 
K
P
 
L
G
 
E
A
 
E
A
 
G
D
 
E
D
 
N
F
 
Y
L
 
K
S
 
D
V
 
F
I
 
L
N
 
T
P
 
P
E
 
Q
S
 
T
L
 
E
V
 
F
I
 
H
K
 
S
Q
 
P
G
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
D
P
 
V
S
 
G
L
 
I
K
 
K
D
 
N
A
 
L
V
 
K
A
 
K
G
 
G
K
 
D
A
 
I
F
 
I
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
C
 
I
L
 
V
D
 
D
S
 
V
R
 
P
H
 
F
S
 
D
T
 
G
A
 
T
E
 
Q
K
 
A
P
 
V
V
 
L
F
 
F
N
 
N

Sites not aligning to the query:

Q8CGC7 Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase; Bifunctional aminoacyl-tRNA synthetase; EC 6.1.1.17; EC 6.1.1.15 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
36% identity, 92% coverage: 19:528/554 of query aligns to 189:681/1512 of Q8CGC7

query
sites
Q8CGC7
D
 
E
L
 
L
A
 
P
S
 
G
G
 
A
K
 
E
H
 
M
T
 
G
T
 
K
V
 
V
H
 
T
T
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
E
P
 
A
N
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
A
C
 
L
L
 
L
N
 
N
F
 
Q
G
 
H
I
 
Y
A
 
Q
Q
 
V
D
 
N
Y
 
F
K
 
K
G
 
G
Q
 
K
C
 
L
N
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
E
K
 
K
E
 
E
D
 
K
I
 
E
E
 
D
Y
 
F
V
 
E
E
 
K
S
 
V
I
 
I
K
 
L
N
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
A
W
 
M
L
 
L
G
 
H
F
 
I
H
 
K
W
 
-
S
 
P
G
 
D
N
 
Q
V
 
F
R
 
T
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
F
 
F
D
 
E
Q
 
T
L
 
I
H
 
M
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
I
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
Q
K
 
E
G
 
G
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
D
L
 
T
T
 
P
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
M
R
 
K
E
 
A
Y
 
E
R
 
R
G
 
E
T
 
Q
L
 
R
T
 
T
Q
 
E
P
 
-
G
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
S
P
 
K
Y
 
H
R
 
R
D
 
K
R
 
N
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
Q
L
 
M
F
 
W
E
 
E
K
 
E
M
 
M
R
 
K
A
 
K
G
 
G
G
 
S
F
 
Q
E
 
F
E
 
G
G
 
Q
K
 
S
A
 
C
C
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
S
S
 
S
P
 
N
F
 
N
I
 
G
V
 
C
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
C
K
 
K
F
 
I
A
 
Q
E
 
P
H
 
H
H
 
P
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
C
 
N
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
A
H
 
C
C
 
P
I
 
I
S
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
A
L
 
L
C
 
R
T
 
T
L
 
T
E
 
E
F
 
Y
Q
 
H
D
 
D
N
 
R
R
 
D
R
 
E
L
 
Q
Y
 
F
D
 
Y
W
 
W
V
 
I
L
 
I
D
 
E
N
 
A
I
 
L
T
 
G
I
 
I
P
 
R
V
 
-
H
 
K
P
 
P
R
 
Y
Q
 
I
Y
 
W
E
 
E
F
 
Y
S
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
E
 
N
Y
 
N
T
 
T
V
 
V
M
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
T
L
 
W
L
 
F
V
 
V
T
 
N
D
 
E
K
 
G
H
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
I
 
V
S
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
E
S
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
F
 
F
C
 
I
K
 
A
R
 
A
I
 
Q
G
 
G
V
 
S
T
 
S
K
 
R
Q
 
S
D
 
V
N
 
V
T
 
N
I
 
M
E
 
E
M
 
W
A
 
D
S
 
K
L
 
I
E
 
W
S
 
A
C
 
F
I
 
N
R
 
K
E
 
K
D
 
V
L
 
I
N
 
D
E
 
P
N
 
V
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
M
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
L
D
 
K
P
 
K
V
 
E
K
 
V
L
 
V
V
 
P
I
 
V
E
 
N
N
 
V
Y
 
L
Q
 
D
G
 
A
E
 
Q
G
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
K
T
 
E
M
 
V
P
 
A
N
 
R
H
 
H
P
 
P
N
 
K
K
 
N
P
 
P
E
 
D
M
 
V
G
 
G
S
 
L
R
 
K
Q
 
P
V
 
V
P
 
W
F
 
Y
S
 
S
G
 
P
E
 
K
I
 
V
W
 
F
I
 
I
D
 
E
R
 
G
A
 
A
D
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
T
F
 
F
R
 
S
E
 
E
E
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
G
K
 
E
E
 
M
V
 
V
R
 
T
L
 
F
R
 
I
N
 
N
A
 
W
Y
 
G
V
 
N
I
 
I
K
 
N
A
 
I
E
 
T
R
 
K
V
 
I
E
 
H
K
 
K
D
 
N
A
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
K
I
 
I
T
 
T
T
 
S
I
 
L
F
 
-
C
 
-
T
 
-
Y
 
-
D
 
D
A
 
A
D
 
K
T
 
-
L
 
L
S
 
N
K
 
L
D
 
E
P
 
N
A
 
K
D
 
D
G
 
Y
R
 
K
K
 
K
V
 
T
K
 
T
G
 
K
V
 
I
I
 
T
H
 
W
W
 
L
V
 
A
S
 
E
A
 
S
A
 
T
H
 
H
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
I
P
 
P
V
 
A
E
 
V
I
 
C
R
 
V
L
 
T
Y
 
Y
D
 
E
R
 
H
L
 
L
F
 
I
S
 
T
V
 
K
P
 
P
N
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
A
 
D
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
K
S
 
Q
V
 
Y
I
 
I
N
 
N
P
 
K
E
 
D
S
 
S
L
 
K
V
 
H
I
 
E
K
 
E
Q
 
L
G
 
M
F
 
L
A
 
G
E
 
D
P
 
P
S
 
C
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
K
A
 
K
G
 
G
K
 
D
A
 
I
F
 
I
Q
 
Q
F
 
L
E
 
Q
R
 
R
E
 
R
G
 
G
Y
 
F
F
 
F
C
 
I
L
 
C
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P07814 Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase; Bifunctional aminoacyl-tRNA synthetase; Cell proliferation-inducing gene 32 protein; Glutamatyl-prolyl-tRNA synthetase; EC 6.1.1.17; EC 6.1.1.15 from Homo sapiens (Human) (see 13 papers)
35% identity, 94% coverage: 19:537/554 of query aligns to 189:696/1512 of P07814

query
sites
P07814
D
 
E
L
 
L
A
 
P
S
 
G
G
 
A
K
 
E
H
 
M
T
 
G
T
 
K
V
 
V
H
 
T
T
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
E
P
 
A
N
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
A
C
 
L
L
 
L
N
 
N
F
 
Q
G
 
H
I
 
Y
A
 
Q
Q
 
V
D
 
N
Y
 
F
K
 
K
G
 
G
Q
 
K
C
 
L
N
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
E
K
 
K
E
 
E
D
 
K
I
 
E
E
 
D
Y
 
F
V
 
E
E
 
K
S
 
V
I
 
I
K
 
L
N
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
A
W
 
M
L
 
L
G
 
H
F
 
I
H
 
K
W
 
-
S
 
P
G
 
D
N
 
Q
V
 
F
R
 
T
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
F
 
F
D
 
E
Q
 
T
L
 
I
H
 
M
A
 
K
Y
 
Y
A
 
A
I
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
Q
K
 
E
G
 
G
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
D
L
 
T
T
 
P
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
M
R
x
K
E
 
A
Y
 
E
R
 
R
G
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
E
P
 
Q
G
 
R
K
 
I
N
x
D
S
 
S
P
 
K
Y
 
H
R
 
R
D
 
K
R
 
N
S
 
P
V
 
I
E
 
E
E
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
Q
L
 
M
F
 
W
E
 
E
K
 
E
M
 
M
R
 
K
A
 
K
G
 
G
G
 
S
F
 
Q
E
 
F
E
 
G
G
x
Q
K
 
S
A
 
C
C
 
C
L
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
S
S
 
S
P
 
N
F
 
N
I
 
G
V
 
C
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
C
K
 
K
F
 
I
A
 
Q
E
 
P
H
 
H
H
 
P
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
C
 
N
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
A
H
 
C
C
 
P
I
 
I
S
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
A
L
 
L
C
 
R
T
 
T
L
 
T
E
 
E
F
 
Y
Q
 
H
D
 
D
N
 
R
R
 
D
R
 
E
L
 
Q
Y
 
F
D
 
Y
W
 
W
V
 
I
L
 
I
D
 
E
N
 
A
I
 
L
T
 
G
I
 
I
P
 
-
V
 
R
H
 
K
P
 
P
R
 
Y
Q
 
I
Y
 
W
E
 
E
F
 
Y
S
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
E
 
N
Y
 
N
T
 
T
V
 
V
M
 
L
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
T
L
 
W
L
 
F
V
 
V
T
 
N
D
 
E
K
 
G
H
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
I
 
V
S
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
E
S
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
F
 
F
C
 
I
K
 
A
R
 
A
I
 
Q
G
 
G
V
 
S
T
 
S
K
 
R
Q
 
S
D
 
V
N
 
V
T
 
N
I
 
M
E
 
E
M
 
W
A
 
D
S
 
K
L
 
I
E
 
W
S
 
A
C
 
F
I
 
N
R
 
K
E
 
K
D
 
V
L
 
I
N
 
D
E
 
P
N
 
V
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
M
 
V
A
 
A
V
 
L
I
 
L
D
 
K
P
 
K
V
 
E
K
 
V
L
 
I
V
 
P
I
 
V
E
 
N
N
 
V
Y
 
P
Q
 
E
G
 
A
E
 
Q
G
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
K
T
 
E
M
 
V
P
 
A
N
 
K
H
 
H
P
 
P
N
 
K
K
 
N
P
 
P
E
 
E
M
 
V
G
 
G
S
 
L
R
 
K
Q
 
P
V
 
V
P
 
W
F
 
Y
S
 
S
G
 
P
E
 
K
I
 
V
W
 
F
I
 
I
D
 
E
R
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
A
R
 
E
E
 
T
E
 
F
A
 
S
N
 
E
K
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
G
K
 
E
E
 
M
V
 
V
R
 
T
L
 
F
R
 
I
N
 
N
A
 
W
Y
 
G
V
 
N
I
 
L
K
 
N
A
 
I
E
 
T
R
 
K
V
 
I
E
 
H
K
 
K
D
 
N
A
 
A
E
 
D
G
 
G
N
 
K
I
 
I
T
 
I
T
 
S
I
 
L
F
 
-
C
 
-
T
 
-
Y
 
-
D
 
D
A
 
A
D
 
K
T
 
-
L
 
L
S
 
N
K
 
L
D
 
E
P
 
N
A
 
K
D
 
D
G
 
Y
R
 
K
K
 
K
V
 
T
K
 
T
G
 
K
V
 
V
I
 
T
H
 
W
W
 
L
V
 
A
S
 
E
A
 
T
A
 
T
H
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
P
I
 
V
-
 
I
-
 
C
R
 
V
L
 
T
Y
 
Y
D
 
E
R
 
H
L
 
L
F
 
I
S
 
T
V
 
K
P
 
P
N
 
V
P
 
L
G
 
G
A
 
K
A
 
D
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
K
S
 
Q
V
 
Y
I
 
V
N
 
N
P
 
K
E
 
N
S
 
S
L
 
K
V
 
H
I
 
E
K
 
E
Q
 
L
G
 
M
F
 
L
A
 
G
E
 
D
P
 
P
S
 
C
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
K
A
 
K
G
 
G
K
 
D
A
 
I
F
 
I
Q
 
Q
F
 
L
E
 
Q
R
 
R
E
 
R
G
 
G
Y
 
F
F
 
F
C
 
I
L
 
C
D
 
D
-
 
Q
-
 
P
-
 
Y
-
 
E
-
 
P
-
 
V
S
 
S
R
 
P
H
 
Y
S
 
S
T
 
C
A
 
K
E
 
E
K
 
A
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P28668 Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase; Bifunctional aminoacyl-tRNA synthetase; EC 6.1.1.17; EC 6.1.1.15 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
35% identity, 93% coverage: 19:532/554 of query aligns to 195:692/1714 of P28668

query
sites
P28668
D
|
D
L
|
L
A
x
P
S
x
G
G
x
A
K
x
E
H
x
M
T
x
G
T
x
K
V
|
V
H
x
V
T
x
V
R
|
R
F
|
F
P
|
P
P
|
P
E
|
E
P
x
A
N
x
S
G
|
G
Y
|
Y
L
|
L
H
|
H
I
|
I
G
|
G
H
|
H
A
|
A
K
|
K
S
x
A
I
x
A
C
x
L
L
|
L
N
|
N
F
x
Q
G
x
Y
I
x
Y
A
|
A
Q
x
L
D
x
A
Y
x
F
K
x
Q
G
|
G
Q
x
T
C
x
L
N
x
I
L
x
M
R
|
R
F
|
F
D
|
D
D
|
D
T
|
T
N
|
N
P
|
P
V
x
A
K
|
K
E
|
E
D
x
T
I
x
V
E
|
E
Y
x
F
V
x
E
E
x
N
S
x
V
I
|
I
K
x
L
N
x
G
D
|
D
V
x
L
E
|
E
W
x
Q
L
|
L
G
x
Q
F
x
I
H
x
K
W
 
-
S
x
P
G
x
D
N
x
V
V
x
F
R
x
T
Y
x
H
S
x
T
S
|
S
D
x
N
Y
|
Y
F
|
F
D
|
D
Q
x
L
L
x
M
H
x
L
A
x
D
Y
|
Y
A
x
C
I
x
V
E
x
R
L
|
L
I
|
I
N
x
K
K
x
E
G
x
S
L
x
K
A
|
A
Y
|
Y
V
|
V
D
|
D
E
x
D
L
x
T
T
x
P
P
|
P
E
|
E
Q
|
Q
I
x
M
R
x
K
E
x
L
Y
x
E
R
|
R
G
x
E
T
x
Q
L
x
R
T
x
V
Q
x
E
P
 
-
G
 
-
K
 
-
N
 
-
S
|
S
P
x
A
Y
x
N
R
|
R
D
x
S
R
x
N
S
|
S
V
|
V
E
|
E
E
x
K
N
|
N
L
|
L
A
x
S
L
|
L
F
x
W
E
|
E
K
x
E
M
|
M
R
x
V
A
x
K
G
|
G
G
x
S
F
x
E
E
x
K
E
x
G
G
x
Q
K
|
K
A
x
Y
C
|
C
L
x
V
R
|
R
A
|
A
K
|
K
I
|
I
D
|
D
M
|
M
A
x
S
S
|
S
P
|
P
F
x
N
I
x
G
V
x
C
M
|
M
R
|
R
D
|
D
P
|
P
V
x
T
L
x
I
Y
|
Y
R
|
R
I
x
C
K
|
K
F
x
N
A
x
E
E
x
P
H
|
H
H
x
P
Q
x
R
T
|
T
G
|
G
N
x
T
K
|
K
W
x
Y
C
x
K
I
x
V
Y
|
Y
P
|
P
M
x
T
Y
|
Y
D
|
D
F
|
F
T
x
A
H
x
C
C
x
P
I
|
I
S
x
V
D
|
D
A
|
A
L
x
I
E
|
E
G
x
N
I
x
V
T
|
T
H
|
H
S
x
T
L
|
L
C
x
R
T
|
T
L
x
T
E
|
E
F
x
Y
Q
x
H
D
|
D
N
x
R
R
x
D
R
x
D
L
x
Q
Y
x
F
D
x
Y
W
|
W
V
x
F
L
x
I
D
|
D
N
x
A
I
x
L
T
x
K
I
x
L
P
 
-
V
x
R
H
x
K
P
|
P
R
x
Y
Q
x
I
Y
x
W
E
x
S
F
x
Y
S
|
S
R
|
R
L
|
L
N
|
N
L
x
M
E
x
T
Y
x
N
T
|
T
V
|
V
M
x
L
S
|
S
K
|
K
R
|
R
K
|
K
L
|
L
N
x
T
L
x
W
L
x
F
V
|
V
T
x
D
D
x
S
K
x
G
H
x
L
V
|
V
E
x
D
G
|
G
W
|
W
D
|
D
D
|
D
P
|
P
R
|
R
M
x
F
P
|
P
T
|
T
I
x
V
S
x
R
G
|
G
L
x
I
R
x
I
R
|
R
R
|
R
G
|
G
Y
x
M
T
|
T
A
x
V
A
x
E
S
x
G
I
x
L
R
x
K
E
|
E
F
|
F
C
x
I
K
x
I
R
x
A
I
x
Q
G
|
G
V
x
S
T
x
S
K
|
K
Q
x
S
D
x
V
N
x
V
T
x
F
I
x
M
E
x
N
M
x
W
A
x
D
S
x
K
L
x
I
E
x
W
S
x
A
C
x
F
I
x
N
R
x
K
E
x
K
D
x
V
L
x
I
N
x
D
E
x
P
N
x
I
A
|
A
P
|
P
R
|
R
A
x
Y
M
x
T
A
|
A
V
x
L
I
x
E
D
x
K
P
x
E
V
x
K
K
x
R
L
x
V
V
x
I
I
x
V
E
x
N
N
x
V
Y
x
A
Q
x
G
G
x
A
E
x
K
G
x
V
E
|
E
M
x
R
V
x
I
T
x
Q
M
x
V
P
x
S
N
x
V
H
|
H
P
|
P
N
x
K
K
x
D
P
x
E
E
x
S
M
x
L
G
|
G
S
x
K
R
x
K
Q
x
T
V
|
V
P
x
L
F
x
L
S
x
G
G
x
P
E
x
R
I
|
I
W
x
Y
I
|
I
D
|
D
R
x
Y
A
x
V
D
|
D
F
 
-
R
 
-
E
x
A
E
|
E
A
|
A
N
x
L
K
|
K
Q
x
E
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
G
|
G
K
x
E
E
x
N
V
x
A
R
x
T
L
x
F
R
x
I
N
|
N
A
x
W
Y
x
G
V
x
N
I
|
I
K
x
L
A
x
I
E
x
R
R
x
K
V
|
V
E
x
N
K
|
K
D
|
D
A
|
A
E
x
S
G
|
G
N
|
N
I
|
I
T
|
T
T
x
S
I
x
V
F
 
-
C
 
-
T
 
-
Y
 
-
D
|
D
A
|
A
D
 
-
T
x
A
L
|
L
S
x
N
K
x
L
D
x
E
P
x
N
A
x
K
D
|
D
G
x
F
R
x
K
K
|
K
V
x
T
K
x
L
G
x
K
V
 
-
I
x
L
H
x
T
W
|
W
V
x
L
S
x
A
A
x
V
-
x
E
-
x
D
-
x
D
A
x
P
H
x
S
A
|
A
L
x
Y
P
|
P
V
x
P
E
x
T
I
x
F
R
x
C
L
x
V
Y
|
Y
-
x
F
D
|
D
R
x
N
L
x
I
F
x
I
S
|
S
V
x
K
P
x
A
N
x
V
P
x
L
G
|
G
A
x
K
A
x
D
D
x
E
D
|
D
F
|
F
L
x
K
S
x
Q
V
x
F
I
|
I
N
x
G
P
x
H
E
x
K
S
x
T
L
x
R
V
x
D
I
x
E
K
x
V
Q
x
P
G
x
M
F
x
L
A
x
G
E
x
D
P
|
P
S
x
E
L
|
L
K
|
K
D
x
K
A
x
C
V
x
K
A
x
K
G
|
G
K
x
D
A
x
I
F
x
I
Q
|
Q
F
x
L
E
x
Q
R
|
R
E
x
R
G
|
G
Y
x
F
F
|
F
C
x
K
L
x
V
D
|
D
S
x
V
R
x
A
H
x
Y
S
x
A

Sites not aligning to the query:

7waoA Glutamyl-tRNA synthetase from plasmodium falciparum (pfers) in complex with mn (see paper)
36% identity, 92% coverage: 20:528/554 of query aligns to 2:485/502 of 7waoA

query
sites
7waoA
L
 
M
A
 
A
S
 
N
G
 
A
K
 
V
H
 
I
T
 
G
T
 
N
V
 
V
H
 
V
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
E
P
 
P
N
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
A
C
 
F
L
 
L
N
 
N
F
 
N
G
 
Y
I
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
D
 
M
Y
 
Y
K
 
E
G
 
G
Q
 
K
C
 
M
N
 
L
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
L
E
|
E
D
 
D
I
 
I
E
 
K
Y
 
Y
V
x
E
E
 
K
S
 
S
I
 
I
K
 
I
N
 
E
D
 
D
V
 
L
E
 
E
W
 
N
L
 
L
G
 
G
F
 
L
H
 
K
W
 
Y
S
 
E
G
 
-
N
 
K
V
 
I
R
 
S
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
Q
 
L
L
 
L
H
 
E
A
 
K
Y
 
Y
A
 
C
I
 
I
E
 
D
L
 
M
I
 
I
N
 
K
K
 
M
G
 
N
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
E
 
D
L
 
T
T
 
G
P
 
V
E
 
E
Q
 
D
I
 
M
R
 
R
E
 
N
Y
 
Q
R
 
R
G
 
G
T
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
E
G
 
G
K
 
I
N
 
E
S
 
S
P
 
I
Y
 
N
R
 
R
D
 
N
R
 
N
S
 
S
V
 
I
E
 
E
E
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
N
K
 
E
M
 
M
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
T
F
 
E
E
 
I
E
 
G
G
 
Q
K
 
K
A
 
N
C
 
C
L
 
I
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
N
M
 
M
A
 
Q
S
 
S
P
 
K
F
 
N
I
 
K
V
 
C
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
M
Y
 
Y
R
 
R
-
 
C
I
 
I
K
 
V
F
 
D
A
 
V
E
 
P
H
 
H
H
|
H
Q
 
K
T
 
H
G
 
Q
N
 
F
K
 
K
W
 
Y
C
 
K
I
 
C
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
A
H
 
C
C
 
P
I
 
I
S
 
I
D
 
D
A
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
A
L
 
L
C
 
R
T
 
T
L
 
N
E
 
E
F
 
Y
Q
 
S
D
 
D
N
 
R
R
 
I
R
 
E
L
 
Q
Y
 
Y
D
 
N
W
 
W
V
 
F
L
 
I
D
 
S
N
 
T
I
 
L
T
 
N
I
 
L
P
 
R
V
 
-
H
 
K
P
 
V
R
 
Y
Q
 
I
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
A
L
 
F
E
 
V
Y
 
K
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
K
L
 
W
L
 
F
V
 
V
T
 
E
D
 
N
K
 
N
H
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
S
W
 
W
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
K
G
 
G
L
 
I
R
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
A
 
K
A
 
E
S
 
A
I
 
L
R
 
F
E
 
Q
F
 
F
C
 
I
K
 
L
R
 
E
I
 
Q
G
 
G
V
 
P
T
 
S
K
 
K
Q
 
A
D
 
G
N
 
N
T
 
L
I
 
M
E
 
Q
M
 
W
A
 
D
S
 
K
L
 
L
E
 
W
S
 
S
C
 
I
I
 
N
R
 
K
E
 
Q
D
 
I
L
 
I
N
 
D
E
 
P
N
 
I
A
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
M
 
A
A
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
K
I
 
N
D
 
S
P
 
S
V
 
I
K
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
E
 
T
N
 
D
Y
 
L
Q
 
T
G
 
D
E
 
Q
G
 
V
E
 
I
M
 
Q
V
 
K
T
 
E
M
 
R
P
 
D
N
 
L
H
 
H
P
 
M
N
 
K
K
 
N
P
 
K
E
 
S
M
 
L
G
 
G
S
 
T
R
 
C
Q
 
N
V
 
M
P
 
Y
F
 
Y
S
 
N
G
 
N
E
 
K
I
 
Y
W
 
L
I
 
I
D
 
E
R
 
L
A
 
E
D
 
D
F
 
A
R
 
Q
E
 
T
E
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
L
V
 
L
L
 
E
G
 
N
K
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
T
L
 
L
R
 
-
N
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
I
K
 
K
A
 
L
E
 
G
R
 
N
V
 
I
E
 
I
K
 
I
D
 
K
A
 
N
E
 
I
G
 
E
N
 
I
I
 
K
T
 
Q
T
 
-
I
 
-
F
 
-
C
 
-
T
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
I
D
 
N
T
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
N
D
 
F
P
 
H
A
 
G
D
 
D
G
 
F
R
 
K
K
 
T
V
 
T
K
 
K
G
 
K
V
 
K
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
L
S
 
P
-
 
Y
-
 
L
A
 
P
A
 
Q
H
 
Q
A
 
L
L
 
I
P
 
T
V
 
C
E
 
T
I
 
L
R
 
Y
L
 
E
Y
 
Y
D
|
D
R
 
H
L
 
L
F
 
I
S
 
T
V
 
V
P
 
D
N
 
K
P
 
F
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
D
F
 
W
L
 
T
S
 
N
V
 
F
I
 
I
N
 
N
P
 
F
E
 
N
S
 
S
L
 
K
V
x
H
I
 
E
K
 
T
Q
 
L
G
 
V
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
I
K
 
S
D
 
S
A
 
L
V
 
K
A
 
V
G
 
S
K
 
D
A
 
K
F
 
F
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
R
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
I
L
 
L
D
 
D

7wajA Glutamyl-tRNA synthetase from plasmodium falciparum (pfers) complexed with atp and co (see paper)
36% identity, 92% coverage: 20:528/554 of query aligns to 2:476/492 of 7wajA

query
sites
7wajA
L
 
M
A
 
A
S
 
N
G
 
A
K
 
V
H
 
I
T
 
G
T
 
N
V
 
V
H
 
V
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
|
P
E
|
E
P
 
P
N
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
V
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
x
A
I
 
A
C
 
F
L
 
L
N
 
N
F
 
N
G
 
Y
I
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
D
 
M
Y
 
Y
K
 
E
G
 
G
Q
 
K
C
 
M
N
 
L
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
Y
 
Y
V
 
E
E
 
K
S
 
S
I
 
I
K
 
I
N
 
E
D
 
D
V
 
L
E
 
E
W
 
N
L
 
L
G
 
G
F
 
L
H
 
K
W
 
Y
S
 
E
G
 
-
N
 
K
V
 
I
R
 
S
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
Q
 
L
L
 
L
H
 
E
A
 
K
Y
 
Y
A
 
C
I
 
I
E
 
D
L
 
M
I
 
I
N
 
K
K
 
M
G
 
N
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
E
 
D
L
 
T
T
 
G
P
 
V
E
 
E
Q
 
D
I
 
M
R
 
R
E
 
N
Y
 
Q
R
 
R
G
 
G
T
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
E
G
 
G
K
 
I
N
 
E
S
 
S
P
 
I
Y
 
N
R
 
R
D
 
N
R
 
N
S
 
S
V
 
I
E
 
E
E
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
N
K
 
E
M
 
M
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
T
F
x
E
E
 
I
E
 
G
G
x
Q
K
 
K
A
 
N
C
 
C
L
 
I
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
N
M
 
M
A
 
Q
S
 
S
P
 
K
F
 
N
I
 
K
V
 
C
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
M
Y
 
Y
R
 
R
I
 
C
K
 
I
F
 
V
A
 
D
E
 
V
H
 
P
H
 
H
Q
 
F
T
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
K
W
 
Y
C
 
K
I
 
C
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
A
H
 
C
C
 
P
I
 
I
S
 
I
D
 
D
A
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
A
L
 
L
C
 
R
T
 
T
L
 
N
E
 
E
F
 
Y
Q
 
S
D
 
D
N
 
R
R
 
I
R
 
E
L
 
Q
Y
 
Y
D
 
N
W
 
W
V
 
F
L
 
I
D
 
S
N
 
T
I
 
L
T
 
N
I
 
L
P
 
R
V
 
-
H
 
K
P
 
V
R
 
Y
Q
 
I
Y
 
Y
E
 
E
F
|
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
A
L
 
F
E
 
V
Y
 
K
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
K
L
 
W
L
 
F
V
 
V
T
 
E
D
 
N
K
 
N
H
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
S
W
 
W
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
K
G
 
G
L
 
I
R
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
A
 
K
A
 
E
S
 
A
I
 
L
R
 
F
E
 
Q
F
 
F
C
 
-
K
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
I
K
 
L
Q
 
E
D
 
Q
N
 
N
T
 
L
I
 
M
E
 
Q
M
 
W
A
 
D
S
 
K
L
 
L
E
 
W
S
 
S
C
 
I
I
 
N
R
 
K
E
 
Q
D
 
I
L
 
I
N
 
D
E
 
P
N
 
I
A
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
M
 
A
A
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
K
I
 
N
D
 
S
P
 
S
V
 
I
K
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
E
 
T
N
 
D
Y
 
L
Q
 
T
G
 
D
E
 
Q
G
 
V
E
 
I
M
 
Q
V
 
K
T
 
E
M
 
R
P
 
D
N
 
L
H
 
H
P
 
M
N
 
K
K
 
N
P
 
K
E
 
S
M
 
L
G
 
G
S
 
T
R
 
C
Q
 
N
V
 
M
P
 
Y
F
 
Y
S
 
N
G
 
N
E
 
K
I
 
Y
W
 
L
I
 
I
D
 
E
R
 
L
A
 
E
D
 
D
F
 
A
R
 
Q
E
 
T
E
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
L
V
 
L
L
 
E
G
 
N
K
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
T
L
 
L
R
 
I
N
 
K
A
 
L
Y
 
G
V
 
N
I
 
I
K
 
I
A
 
I
E
 
K
R
 
N
V
 
I
E
 
E
K
 
K
D
 
E
A
 
-
E
 
N
G
 
G
N
 
K
I
 
I
T
 
K
T
 
Q
I
 
I
F
 
-
C
 
-
T
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
N
T
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
N
D
 
F
P
 
H
A
 
G
D
 
D
G
 
F
R
 
K
K
 
T
V
 
T
K
 
K
G
 
K
V
 
K
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
L
S
 
P
-
 
Y
-
 
L
A
 
P
A
 
Q
H
 
Q
A
 
L
L
 
I
P
 
T
V
 
C
E
 
T
I
 
L
R
 
Y
L
 
E
Y
 
Y
D
 
D
R
 
H
L
 
L
F
 
I
S
 
T
V
 
V
P
 
D
N
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
W
L
 
T
S
 
N
V
 
F
I
 
I
N
 
N
P
 
F
E
 
N
S
 
S
L
 
K
V
 
H
I
 
E
K
 
T
Q
 
L
G
 
V
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
I
K
 
S
D
 
S
A
 
L
V
 
K
A
 
V
G
 
S
K
 
D
A
 
K
F
 
F
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
R
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
I
L
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7wakA Glutamyl-tRNA synthetase from plasmodium falciparum (pfers) in complex with adp (see paper)
35% identity, 92% coverage: 20:528/554 of query aligns to 1:465/481 of 7wakA

query
sites
7wakA
L
 
M
A
 
A
S
 
N
G
 
A
K
 
V
H
 
I
T
 
G
T
 
N
V
 
V
H
 
V
T
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
E
P
 
P
N
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
V
G
|
G
H
|
H
A
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
A
C
 
F
L
 
L
N
 
N
F
 
N
G
 
Y
I
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
D
 
M
Y
 
Y
K
 
E
G
 
G
Q
 
K
C
 
M
N
 
L
L
 
L
R
 
R
F
 
F
D
 
D
D
 
D
T
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
-
K
 
-
E
 
-
D
 
D
I
 
I
E
 
K
Y
 
Y
V
 
E
E
 
K
S
 
S
I
 
I
K
 
I
N
 
E
D
 
D
V
 
L
E
 
E
W
 
N
L
 
L
G
 
G
F
 
L
H
 
K
W
 
Y
S
 
E
G
 
-
N
 
K
V
 
I
R
 
S
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
Q
 
L
L
 
L
H
 
E
A
 
K
Y
 
Y
A
 
C
I
 
I
E
 
D
L
 
M
I
 
I
N
 
K
K
 
M
G
 
N
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
D
 
D
E
 
D
L
 
T
T
 
G
P
 
V
E
 
E
Q
 
D
I
 
M
R
 
R
E
 
N
Y
 
Q
R
 
R
G
 
G
T
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
E
G
 
G
K
 
I
N
 
E
S
 
S
P
 
I
Y
 
N
R
 
R
D
 
N
R
 
N
S
 
S
V
 
I
E
 
E
E
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
N
K
 
E
M
 
M
R
 
R
A
 
K
G
 
G
G
 
T
F
 
E
E
 
I
E
 
G
G
 
Q
K
 
K
A
 
N
C
 
C
L
 
I
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
N
M
 
M
A
 
Q
S
 
S
P
 
K
F
 
N
I
 
K
V
 
C
M
 
M
R
 
R
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
M
Y
 
Y
R
 
R
I
 
C
K
 
I
F
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
K
W
 
Y
C
 
K
I
 
C
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
A
H
 
C
C
 
P
I
 
I
S
 
I
D
 
D
A
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
A
L
 
L
C
 
R
T
|
T
L
 
N
E
 
E
F
 
Y
Q
 
S
D
 
D
N
 
R
R
 
I
R
 
E
L
 
Q
Y
 
Y
D
 
N
W
 
W
V
 
F
L
 
I
D
 
S
N
 
T
I
 
L
T
 
N
I
 
L
P
 
R
V
 
-
H
 
K
P
 
V
R
 
Y
Q
 
I
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
|
R
L
|
L
N
 
A
L
 
F
E
 
V
Y
 
K
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
S
K
 
K
R
 
R
K
 
K
L
 
L
N
 
K
L
 
W
L
 
F
V
 
V
T
 
E
D
 
N
K
 
N
H
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
S
W
 
W
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
F
P
 
P
T
 
T
I
 
I
S
 
K
G
 
G
L
 
I
R
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
A
 
K
A
 
E
S
 
A
I
 
L
R
 
F
E
 
Q
F
 
F
C
 
-
K
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
I
K
 
L
Q
 
E
D
 
Q
N
 
N
T
 
L
I
 
M
E
 
Q
M
 
W
A
 
D
S
 
K
L
 
L
E
 
W
S
 
S
C
 
I
I
 
N
R
 
K
E
 
Q
D
 
I
L
 
I
N
 
D
E
 
P
N
 
I
A
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
Y
M
 
A
A
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
K
I
 
N
D
 
S
P
 
S
V
 
I
K
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
L
E
 
T
N
 
D
Y
 
L
Q
 
T
G
 
D
E
 
Q
G
 
V
E
 
I
M
 
Q
V
 
K
T
 
E
M
 
R
P
 
D
N
 
L
H
 
H
P
 
M
N
 
K
K
 
N
P
 
K
E
 
S
M
 
L
G
 
G
S
 
T
R
 
C
Q
 
N
V
 
M
P
 
Y
F
 
Y
S
 
N
G
 
N
E
 
K
I
 
Y
W
 
L
I
 
I
D
 
E
R
 
L
A
 
E
D
 
D
F
 
A
R
 
Q
E
 
T
E
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
L
V
 
L
L
 
E
G
 
N
K
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
T
L
 
L
R
 
I
N
 
K
A
 
L
Y
 
G
V
 
N
I
 
I
K
 
I
A
 
I
E
 
K
R
 
N
V
 
I
E
 
E
K
 
K
D
 
E
A
 
-
E
 
N
G
 
G
N
 
K
I
 
I
T
 
K
T
 
Q
I
 
I
F
 
N
C
 
A
T
 
L
Y
 
S
D
 
N
A
 
F
D
 
H
T
 
T
L
 
K
S
 
K
K
 
K
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
L
S
 
P
-
 
Y
-
 
L
A
 
P
A
 
Q
H
 
Q
A
 
L
L
 
I
P
 
T
V
 
C
E
 
T
I
 
L
R
 
Y
L
 
E
Y
 
Y
D
 
D
R
 
H
L
 
L
F
 
I
S
 
T
V
 
V
P
 
D
N
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
W
L
 
T
S
 
N
V
 
F
I
 
I
N
 
N
P
 
F
E
 
N
S
 
S
L
 
K
V
 
H
I
 
E
K
 
T
Q
 
L
G
 
V
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
I
K
 
S
D
 
S
A
 
L
V
 
K
A
 
V
G
 
S
K
 
D
A
 
K
F
 
F
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
R
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
C
 
I
L
 
L
D
 
D

3aiiA Archaeal non-discriminating glutamyl-tRNA synthetase from methanothermobacter thermautotrophicus (see paper)
29% identity, 92% coverage: 22:529/554 of query aligns to 5:443/455 of 3aiiA

query
sites
3aiiA
S
 
A
G
 
G
K
 
V
H
 
K
T
 
G
T
 
E
V
 
V
H
 
V
T
 
L
R
 
R
F
 
F
P
 
A
P
 
P
E
x
N
P
 
P
N
 
S
G
 
G
Y
 
P
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
K
 
R
S
 
A
I
 
A
C
 
I
L
 
L
N
 
N
F
 
H
G
 
E
I
 
Y
A
 
A
Q
 
R
D
 
K
Y
 
Y
K
 
D
G
 
G
Q
 
R
C
 
L
N
 
I
L
 
L
R
 
R
F
 
I
D
 
E
D
 
D
T
 
T
N
 
D
P
 
P
V
 
R
K
 
R
E
 
V
D
 
D
I
 
P
E
 
E
Y
 
A
V
 
Y
E
 
D
S
 
M
I
 
I
K
 
P
N
 
A
D
 
D
V
 
L
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
V
H
 
E
W
 
W
S
 
D
G
 
E
N
 
T
V
 
V
R
 
-
Y
 
I
S
 
Q
S
 
S
D
 
D
Y
 
R
F
 
M
D
 
E
Q
 
T
L
 
Y
H
 
Y
A
 
E
Y
 
Y
A
 
T
I
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
E
K
 
R
G
 
G
L
 
G
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
x
C
E
 
T
L
x
C
T
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
F
R
 
R
E
 
E
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
L
T
 
K
Q
 
N
P
 
R
G
 
G
K
 
E
N
 
A
S
x
C
P
 
H
Y
x
C
R
 
R
D
 
S
R
 
L
S
 
G
V
 
F
E
 
R
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
Q
L
 
R
F
 
W
E
 
R
K
 
E
M
 
M
R
 
F
A
 
E
G
 
-
G
 
-
F
 
M
E
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
S
A
 
A
C
 
V
L
 
V
R
 
R
A
 
V
K
 
K
I
 
T
D
 
D
M
 
L
A
 
N
S
 
H
P
 
P
F
 
N
I
 
P
V
 
A
M
 
I
R
 
R
D
 
D
P
 
W
V
 
V
L
 
S
Y
 
M
R
 
R
I
 
I
K
 
V
F
 
E
A
 
A
E
 
E
H
 
H
H
 
P
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
T
K
 
R
W
 
Y
C
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
Y
 
M
D
 
N
F
 
F
T
 
S
H
 
V
C
 
A
I
 
V
S
 
D
D
 
D
A
 
H
L
 
L
E
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
V
L
 
L
C
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
F
 
-
Q
 
R
D
 
A
N
 
N
R
 
R
R
 
E
L
 
K
Y
 
Q
D
 
E
W
 
Y
V
 
L
L
 
Y
D
 
R
N
 
H
I
 
L
T
 
G
I
 
W
P
 
-
V
 
-
H
 
E
P
 
P
R
 
P
Q
 
E
Y
 
F
E
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
I
E
 
H
Y
 
Y
T
 
G
V
x
R
M
 
L
S
 
K
K
x
T
R
 
S
K
 
G
L
 
A
N
 
R
L
 
E
L
 
G
V
 
I
T
 
L
D
 
R
K
 
G
H
 
E
V
 
Y
E
 
S
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
M
 
L
P
 
G
T
 
T
I
 
L
S
 
R
G
 
A
L
 
I
R
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
I
T
 
R
A
 
P
A
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
R
E
 
K
F
 
L
C
 
M
K
 
V
R
 
E
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
K
K
 
I
Q
 
A
D
 
D
N
 
S
T
 
T
I
 
M
E
 
S
M
 
W
A
 
K
S
 
K
L
 
I
E
 
Y
S
 
G
C
 
L
I
 
N
R
 
R
E
 
S
D
 
I
L
 
L
N
 
E
E
 
E
N
 
E
A
 
A
P
 
R
R
 
R
A
 
Y
M
 
F
A
 
F
V
 
A
I
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
E
I
 
V
E
 
V
N
 
G
Y
 
L
Q
 
P
G
 
G
E
 
P
G
 
V
E
 
R
M
 
-
V
 
V
T
 
E
M
 
R
P
 
P
N
 
L
H
 
H
P
 
P
N
 
D
K
 
H
P
 
P
E
 
E
M
 
I
G
 
G
S
 
N
R
 
R
Q
 
V
V
 
L
P
 
E
F
 
L
S
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
V
W
 
Y
I
 
L
D
 
P
R
 
G
A
 
D
D
 
D
F
 
L
R
 
G
E
 
E
E
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
Q
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
G
E
 
P
V
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
I
N
 
D
A
 
A
Y
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
V
T
 
N
T
 
V
I
 
I
F
 
Y
C
 
S
T
 
G
Y
 
G
D
 
E
A
 
L
D
 
R
T
 
Y
L
 
H
S
 
S
K
 
E
D
 
G
P
 
I
A
 
E
D
 
E
G
 
A
R
 
R
K
 
E
V
 
L
K
 
G
G
 
A
-
 
S
V
 
M
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
S
 
P
A
 
A
A
 
E
H
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
E
V
 
A
E
 
E
I
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
V
I
 
I
N
 
M
P
 
P
E
 
D
S
 
A
L
 
S
V
 
R
I
 
V
K
 
R
Q
 
-
G
 
G
F
 
V
A
 
I
E
 
E
P
 
A
S
 
D
L
 
A
K
 
S
D
 
E
A
 
L
V
 
E
A
 
V
G
 
D
K
 
D
A
 
V
F
 
V
Q
 
Q
F
 
L
E
 
E
R
 
R
E
 
F
G
 
G
Y
 
F
F
 
A
C
 
R
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Query Sequence

>14810 FitnessBrowser__Keio:14810
MSEAEARPTNFIRQIIDEDLASGKHTTVHTRFPPEPNGYLHIGHAKSICLNFGIAQDYKG
QCNLRFDDTNPVKEDIEYVESIKNDVEWLGFHWSGNVRYSSDYFDQLHAYAIELINKGLA
YVDELTPEQIREYRGTLTQPGKNSPYRDRSVEENLALFEKMRAGGFEEGKACLRAKIDMA
SPFIVMRDPVLYRIKFAEHHQTGNKWCIYPMYDFTHCISDALEGITHSLCTLEFQDNRRL
YDWVLDNITIPVHPRQYEFSRLNLEYTVMSKRKLNLLVTDKHVEGWDDPRMPTISGLRRR
GYTAASIREFCKRIGVTKQDNTIEMASLESCIREDLNENAPRAMAVIDPVKLVIENYQGE
GEMVTMPNHPNKPEMGSRQVPFSGEIWIDRADFREEANKQYKRLVLGKEVRLRNAYVIKA
ERVEKDAEGNITTIFCTYDADTLSKDPADGRKVKGVIHWVSAAHALPVEIRLYDRLFSVP
NPGAADDFLSVINPESLVIKQGFAEPSLKDAVAGKAFQFEREGYFCLDSRHSTAEKPVFN
RTVGLRDTWAKVGE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory