SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 15434 FitnessBrowser__Keio:15434 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6wn6B Crystal structure of 3-keto-d-glucoside 4-epimerase, ycjr, from e. Coli, apo form (see paper)
100% identity, 100% coverage: 1:262/262 of query aligns to 3:264/264 of 6wn6B

query
sites
6wn6B
M
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
K
F
 
F
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
D
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
E
I
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
T
 
T
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
W
 
W
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
F
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
W
 
W
G
 
G
M
 
M
F
 
F
T
 
T
F
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
P
M
 
M
T
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
R
K
 
K
M
 
M
V
 
V
S
 
S
D
 
D
S
 
S
L
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
|
E
P
 
P
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
D
 
D
H
 
H
M
 
M
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
E
 
E
N
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
K
H
 
H
V
|
V
Q
 
Q
I
 
I
I
 
I
G
 
G
D
|
D
F
 
F
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
H
 
H
D
 
D
N
 
N
R
 
R
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
H
|
H
I
 
I
A
 
A
D
 
D
N
 
N
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
L
|
L
D
 
D
F
 
F
H
 
H
A
 
A
L
|
L
F
|
F
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
E
|
E
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
L
R
 
R
T
 
T
C
 
C

3kwsA Crystal structure of putative sugar isomerase (yp_001305149.1) from parabacteroides distasonis atcc 8503 at 1.68 a resolution
30% identity, 87% coverage: 13:240/262 of query aligns to 16:240/265 of 3kwsA

query
sites
3kwsA
E
 
E
N
 
S
I
 
L
L
 
N
E
 
E
K
 
K
F
 
L
R
 
D
Y
 
F
I
 
M
K
 
E
E
 
K
M
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
I
 
P
D
 
G
G
 
G
K
 
G
L
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
G
N
 
R
I
 
V
E
 
N
E
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
Q
A
 
A
I
 
L
K
 
N
E
 
G
T
 
R
G
 
N
L
 
I
P
 
K
V
 
V
T
 
S
T
 
A
A
 
I
C
 
C
G
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
K
G
 
G
W
 
F
I
 
I
G
 
L
D
 
S
F
 
T
I
 
D
E
 
P
E
 
A
R
 
I
R
 
R
L
 
K
N
 
E
G
 
C
L
 
M
K
 
D
Q
 
T
I
 
M
E
 
K
R
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
G
E
 
E
V
 
L
G
 
G
G
 
S
K
 
T
G
 
G
-
 
V
I
 
I
V
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
-
W
 
-
G
 
-
M
 
-
F
 
F
T
 
N
F
 
G
R
 
Q
L
 
V
P
 
P
P
 
A
M
 
L
T
 
-
S
 
-
P
 
P
R
 
H
S
 
T
L
 
M
D
 
E
G
 
-
D
 
T
R
 
R
K
 
D
M
 
F
V
 
L
S
 
C
D
 
E
S
 
Q
L
 
F
R
 
N
V
 
E
L
 
M
E
 
G
Q
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
T
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
S
V
 
V
Y
 
I
L
 
F
E
|
E
P
 
P
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
K
Q
 
E
D
 
C
H
 
F
M
 
Y
I
 
L
N
 
R
T
 
Q
L
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
S
Y
 
L
I
 
C
V
 
R
E
 
D
N
 
I
D
 
N
L
 
N
K
 
P
H
 
G
V
 
V
Q
 
R
I
 
C
I
 
M
G
 
G
D
|
D
F
 
F
Y
 
W
H
 
H
M
 
M
N
 
T
I
 
W
E
 
E
E
 
E
D
 
T
N
 
S
L
 
D
A
 
M
Q
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
I
D
 
S
N
 
G
R
 
G
D
 
E
L
 
Y
L
 
L
G
 
Q
H
 
H
V
 
V
H
|
H
I
 
V
A
 
A
D
 
S
-
 
R
N
 
K
H
 
R
R
 
R
Y
 
S
Q
 
M
P
 
P
G
 
G
S
 
E
-
 
D
G
 
G
T
 
D
L
 
A
D
 
D
-
 
N
F
 
Y
H
 
I
A
 
N
L
 
G
F
 
F
E
 
K
Q
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
M
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
N
Y
 
Y
V
 
V
V
 
S
Y
 
F
E
|
E

8xivA Production of d-psicose
27% identity, 93% coverage: 16:258/262 of query aligns to 19:261/290 of 8xivA

query
sites
8xivA
L
 
F
E
 
E
K
 
K
F
 
Y
-
 
V
R
 
R
Y
 
K
I
 
V
K
 
K
E
 
K
M
 
L
G
 
G
F
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
V
D
 
A
G
 
A
K
 
L
L
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
Q
N
 
K
I
 
L
E
 
E
E
 
R
V
 
L
K
 
K
A
 
Q
A
 
L
I
 
A
K
 
E
E
 
Q
T
 
H
G
 
D
L
 
I
P
 
I
V
 
L
T
 
T
T
 
A
A
 
G
C
x
I
G
|
G
-
 
L
-
 
P
-
 
K
G
 
E
Y
 
Y
D
 
D
G
 
-
W
 
-
I
 
V
G
 
S
D
 
S
F
 
T
I
 
D
E
 
K
E
 
T
R
 
V
R
 
R
L
 
R
N
 
N
G
 
G
L
 
I
K
 
T
Q
 
F
I
 
V
E
 
K
R
 
K
I
 
V
L
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
M
A
 
H
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
G
 
I
K
 
H
G
 
R
I
 
I
V
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
G
W
 
G
G
 
T
M
 
V
F
 
Y
T
 
S
F
 
Y
R
 
W
L
 
P
P
 
V
P
 
D
M
 
Y
T
 
S
S
 
G
P
 
P
R
 
F
S
 
D
L
 
K
D
 
P
G
 
A
D
 
A
R
 
R
K
 
K
M
 
H
V
 
S
S
 
I
D
 
E
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
E
L
 
L
E
 
A
Q
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
R
R
 
Q
T
 
Y
G
 
N
T
 
I
V
 
T
V
 
L
Y
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
Q
H
 
F
M
 
L
I
 
L
N
 
N
T
 
D
L
 
A
A
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
V
R
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
K
E
 
E
N
 
V
D
 
N
L
 
K
K
 
P
H
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
H
L
 
I
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
Y
N
 
T
R
 
G
D
 
D
L
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
Q
V
 
L
H
|
H
I
 
I
A
 
G
D
 
E
N
 
A
H
 
N
R
|
R
Y
 
K
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
G
T
 
S
L
 
M
D
 
P
F
 
W
H
 
T
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
Q
Q
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
D
D
 
I
N
 
R
Y
 
Y
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
Y
 
M
E
|
E
G
 
P
R
 
F
I
 
V
R
 
K
A
 
T
E
 
-
D
 
-
P
 
G
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
G
R
 
R
D
 
D
S
 
I
L
 
K
A
 
L
W
 
W

Sites not aligning to the query:

5b80A Crystal structure of hyperthermophilic thermotoga maritima l-ketose-3- epimerase with cu2+ (see paper)
30% identity, 91% coverage: 3:240/262 of query aligns to 7:243/269 of 5b80A

query
sites
5b80A
I
 
I
G
 
S
T
 
T
Q
 
S
N
 
D
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
F
 
F
P
 
K
E
 
G
N
 
D
I
 
L
L
 
R
E
 
K
K
 
G
F
 
M
R
 
E
Y
 
L
I
 
A
K
 
K
E
 
R
M
 
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
Q
G
 
A
F
 
V
E
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
R
D
 
D
G
 
P
K
 
S
L
 
I
L
 
V
V
 
D
N
 
W
N
 
N
I
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
V
K
 
K
A
 
I
A
 
L
I
 
S
K
 
E
E
 
E
T
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
C
T
 
-
A
 
A
C
 
I
G
 
G
G
 
T
Y
 
G
D
 
Q
G
 
A
W
 
Y
I
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
G
I
 
L
E
 
S
E
 
L
R
 
T
R
 
H
L
 
P
N
 
N
G
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
R
L
 
K
K
 
K
Q
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
V
L
 
V
E
 
K
A
 
H
L
 
T
A
 
E
E
 
V
V
 
A
G
 
G
G
 
M
K
 
F
G
 
G
I
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
-
A
 
-
A
 
I
W
 
I
G
 
G
M
 
L
F
 
V
T
 
R
F
 
G
R
 
R
L
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
T
 
R
S
 
E
P
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
Y
D
 
E
G
 
E
D
 
T
R
 
E
K
 
E
M
 
L
V
 
F
S
 
I
D
 
E
S
 
S
L
 
M
R
 
K
V
 
R
L
 
L
E
 
L
Q
 
E
V
 
L
A
 
T
A
 
E
R
 
H
T
 
A
G
 
K
T
 
F
V
 
V
V
 
I
Y
 
-
L
 
-
E
|
E
P
 
P
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
T
H
 
D
M
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
I
A
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
L
R
 
R
Y
 
I
I
 
L
V
 
R
E
 
K
N
 
I
D
 
N
L
 
S
K
 
N
H
 
R
V
 
V
Q
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
A
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
 
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
P
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
H
 
K
D
 
R
N
 
A
R
 
G
D
 
E
L
 
K
L
 
L
G
 
Y
H
 
H
V
 
F
H
|
H
I
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
S
H
 
N
R
 
R
Y
 
W
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
C
G
 
G
T
 
H
L
 
F
D
 
D
F
 
F
H
 
R
A
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
N
Q
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
E
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
S
Y
 
V
E
|
E

5b7yA Crystal structure of hyperthermophilic thermotoga maritima l-ketose-3- epimerase with co2+ (see paper)
30% identity, 91% coverage: 3:240/262 of query aligns to 7:243/269 of 5b7yA

query
sites
5b7yA
I
 
I
G
 
S
T
 
T
Q
 
S
N
 
D
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
F
 
F
P
 
K
E
 
G
N
 
D
I
 
L
L
 
R
E
 
K
K
 
G
F
 
M
R
 
E
Y
 
L
I
 
A
K
 
K
E
 
R
M
 
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
Q
G
 
A
F
 
V
E
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
R
D
 
D
G
 
P
K
 
S
L
 
I
L
 
V
V
 
D
N
 
W
N
 
N
I
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
V
K
 
K
A
 
I
A
 
L
I
 
S
K
 
E
E
 
E
T
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
C
T
 
-
A
 
A
C
 
I
G
 
G
G
 
T
Y
 
G
D
 
Q
G
 
A
W
 
Y
I
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
G
I
 
L
E
 
S
E
 
L
R
 
T
R
 
H
L
 
P
N
 
N
G
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
R
L
 
K
K
 
K
Q
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
V
L
 
V
E
 
K
A
 
H
L
 
T
A
 
E
E
 
V
V
 
A
G
 
G
G
 
M
K
 
F
G
 
G
I
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
-
A
 
-
A
 
I
W
 
I
G
 
G
M
 
L
F
 
V
T
 
R
F
 
G
R
 
R
L
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
T
 
R
S
 
E
P
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
Y
D
 
E
G
 
E
D
 
T
R
 
E
K
 
E
M
 
L
V
 
F
S
 
I
D
 
E
S
 
S
L
 
M
R
 
K
V
 
R
L
 
L
E
 
L
Q
 
E
V
 
L
A
 
T
A
 
E
R
 
H
T
 
A
G
 
K
T
 
F
V
 
V
V
 
I
Y
 
-
L
 
-
E
|
E
P
 
P
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
T
H
 
D
M
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
I
A
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
L
R
 
R
Y
 
I
I
 
L
V
 
R
E
 
K
N
 
I
D
 
N
L
 
S
K
 
N
H
 
R
V
 
V
Q
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
A
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
 
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
P
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
H
 
K
D
 
R
N
 
A
R
 
G
D
 
E
L
 
K
L
 
L
G
 
Y
H
 
H
V
 
F
H
|
H
I
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
S
H
 
N
R
 
R
Y
 
W
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
C
G
 
G
T
 
H
L
 
F
D
 
D
F
 
F
H
 
R
A
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
N
Q
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
E
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
S
Y
 
V
E
|
E

5h1wA Crystal structure of hyperthermophilic thermotoga maritima l-ketose-3- epimerase with mn2+ and l(+)-erythrulose (see paper)
30% identity, 91% coverage: 3:240/262 of query aligns to 8:244/270 of 5h1wA

query
sites
5h1wA
I
 
I
G
 
S
T
 
T
Q
 
S
N
 
D
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
F
 
F
P
 
K
E
 
G
N
 
D
I
 
L
L
 
R
E
 
K
K
 
G
F
 
M
R
 
E
Y
 
L
I
 
A
K
 
K
E
 
R
M
 
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
Q
G
 
A
F
 
V
E
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
R
D
 
D
G
 
P
K
 
S
L
 
I
L
 
V
V
 
D
N
 
W
N
 
N
I
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
V
K
 
K
A
 
I
A
 
L
I
 
S
K
 
E
E
 
E
T
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
C
T
 
-
A
 
A
C
 
I
G
 
G
G
 
T
Y
 
G
D
 
Q
G
 
A
W
 
Y
I
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
G
I
 
L
E
 
S
E
 
L
R
 
T
R
 
H
L
 
P
N
 
N
G
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
R
L
 
K
K
 
K
Q
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
V
L
 
V
E
 
K
A
 
H
L
 
T
A
 
E
E
 
V
V
 
A
G
 
G
G
 
M
K
 
F
G
 
G
I
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
-
A
 
-
A
 
I
W
 
I
G
 
G
M
 
L
F
 
V
T
 
R
F
 
G
R
 
R
L
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
T
 
R
S
 
E
P
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
Y
D
 
E
G
 
E
D
 
T
R
 
E
K
 
E
M
 
L
V
 
F
S
 
I
D
 
E
S
 
S
L
 
M
R
 
K
V
 
R
L
 
L
E
 
L
Q
 
E
V
 
L
A
 
T
A
 
E
R
 
H
T
 
A
G
 
K
T
 
F
V
 
V
V
 
I
Y
 
-
L
 
-
E
|
E
P
 
P
L
|
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
x
E
D
 
T
H
 
D
M
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
I
A
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
L
R
 
R
Y
 
I
I
 
L
V
 
R
E
 
K
N
 
I
D
 
N
L
 
S
K
 
N
H
 
R
V
 
V
Q
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
A
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
P
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
H
 
K
D
 
R
N
 
A
R
 
G
D
 
E
L
 
K
L
 
L
G
 
Y
H
 
H
V
 
F
H
|
H
I
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
S
H
 
N
R
|
R
Y
 
W
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
C
G
 
G
T
 
H
L
 
F
D
 
D
F
 
F
H
 
R
A
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
N
Q
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
E
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
S
Y
 
V
E
|
E

Q9WYP7 5-keto-L-gluconate epimerase; Bifunctional nonphosphorylated sugar isomerase; D-erythrose/D-threose isomerase; L-ribulose 3-epimerase; R3E; Nonphosphorylated sugar 3-epimerase; Nonphosphorylated sugar aldose-ketose isomerase; EC 5.1.3.-; EC 5.1.3.-; EC 5.3.1.- from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
30% identity, 91% coverage: 3:240/262 of query aligns to 7:243/270 of Q9WYP7

query
sites
Q9WYP7
I
 
I
G
 
S
T
 
T
Q
 
S
N
 
D
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
F
 
F
P
 
K
E
 
G
N
 
D
I
 
L
L
 
R
E
 
K
K
 
G
F
 
M
R
 
E
Y
 
L
I
 
A
K
 
K
E
 
R
M
 
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
Q
G
 
A
F
 
V
E
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
R
D
 
D
G
 
P
K
 
S
L
 
I
L
 
V
V
 
D
N
 
W
N
 
N
I
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
V
K
 
K
A
 
I
A
 
L
I
 
S
K
 
E
E
 
E
T
 
L
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
C
T
 
-
A
 
A
C
 
I
G
 
G
G
 
T
Y
 
G
D
 
Q
G
 
A
W
 
Y
I
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
G
I
 
L
E
 
S
E
 
L
R
 
T
R
 
H
L
 
P
N
 
N
G
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
R
L
 
K
K
 
K
Q
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
V
L
 
V
E
 
K
A
 
H
L
 
T
A
 
E
E
 
V
V
 
A
G
 
G
G
 
M
K
 
F
G
 
G
I
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
-
A
 
-
A
 
I
W
 
I
G
 
G
M
 
L
F
 
V
T
 
R
F
 
G
R
 
R
L
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
T
 
R
S
 
E
P
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
Y
D
 
E
G
 
E
D
 
T
R
 
E
K
 
E
M
 
L
V
 
F
S
 
I
D
 
E
S
 
S
L
 
M
R
 
K
V
 
R
L
 
L
E
 
L
Q
 
E
V
 
L
A
 
T
A
 
E
R
 
H
T
 
A
G
 
K
T
 
F
V
 
V
V
 
I
Y
 
-
L
 
-
E
|
E
P
 
P
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
x
E
D
 
T
H
 
D
M
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
I
A
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
L
R
 
R
Y
 
I
I
 
L
V
 
R
E
 
K
N
 
I
D
 
N
L
 
S
K
 
N
H
 
R
V
 
V
Q
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
A
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
P
Q
 
E
A
 
S
L
 
L
H
 
K
D
 
R
N
 
A
R
 
G
D
 
E
L
 
K
L
 
L
G
 
Y
H
 
H
V
 
F
H
|
H
I
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
S
H
 
N
R
|
R
Y
 
W
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
C
G
 
G
T
 
H
L
 
F
D
 
D
F
 
F
H
 
R
A
 
S
L
 
V
F
 
F
E
 
N
Q
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
E
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
S
Y
 
V
E
|
E

A0A1L7NQ96 Ketose 3-epimerase; D-allulose 3-epimerase; D-AE; L-ribulose 3-epimerase; EC 5.1.3.- from Arthrobacter globiformis (see paper)
29% identity, 92% coverage: 1:240/262 of query aligns to 1:240/289 of A0A1L7NQ96

query
sites
A0A1L7NQ96
M
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
C
Q
 
H
N
 
G
Q
 
L
A
 
V
F
 
W
F
 
T
P
 
G
E
 
H
N
 
F
I
 
D
L
 
A
E
 
E
K
 
G
F
 
I
R
 
R
Y
 
Y
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
I
 
T
K
 
R
E
 
E
M
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
D
G
 
L
F
 
V
E
 
E
I
 
F
D
 
P
-
 
L
G
 
M
K
 
D
L
 
P
L
 
F
V
 
S
N
 
F
N
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
T
V
 
A
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
L
K
 
A
E
 
E
T
 
H
G
 
G
L
 
L
P
 
A
V
 
A
T
 
S
T
 
A
A
 
S
C
 
L
G
 
G
G
 
L
Y
 
S
D
 
D
G
 
A
W
 
-
I
 
-
G
 
T
D
 
D
F
 
V
I
 
S
E
 
S
E
 
E
R
 
D
R
 
P
L
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
K
N
 
A
G
 
G
L
 
E
K
 
E
Q
 
L
I
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
T
G
 
D
I
 
F
V
 
C
V
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
M
 
V
F
 
I
T
 
Y
F
 
S
R
 
A
L
 
M
P
 
K
P
 
K
M
 
Y
T
 
M
S
 
E
P
 
P
R
 
A
S
 
T
L
 
A
D
 
A
G
 
G
D
 
L
R
 
A
K
 
N
M
 
S
V
 
K
S
 
A
D
 
A
S
 
V
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
A
E
 
D
Q
 
R
V
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
D
T
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
N
V
 
V
Y
 
S
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
V
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
T
H
 
N
M
 
V
I
 
L
N
 
N
T
 
T
L
 
G
A
 
R
D
 
Q
A
 
A
R
 
L
R
 
A
Y
 
Y
I
 
L
V
 
E
E
 
E
N
 
L
D
 
N
L
 
R
K
 
P
H
 
N
V
 
L
Q
 
G
I
 
I
I
 
H
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
S
N
 
D
L
 
M
A
 
F
Q
 
S
A
 
P
L
 
I
H
 
L
D
 
D
N
 
T
R
 
A
D
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
R
H
 
Y
V
 
V
H
|
H
I
 
I
A
 
G
D
 
E
N
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
G
Q
 
Y
P
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
G
T
 
S
L
 
V
D
 
D
F
 
F
H
 
D
A
 
T
L
 
F
F
 
F
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
R
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
G
 
G
Y
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
E
|
E

5zfsA Crystal structure of arthrobacter globiformis m30 sugar epimerase which can produce d-allulose from d-fructose (see paper)
29% identity, 92% coverage: 1:240/262 of query aligns to 1:240/291 of 5zfsA

query
sites
5zfsA
M
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
C
Q
 
H
N
 
G
Q
 
L
A
 
V
F
 
W
F
 
T
P
 
G
E
 
H
N
 
F
I
 
D
L
 
A
E
 
E
K
 
G
F
 
I
R
 
R
Y
 
Y
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
I
 
T
K
 
R
E
 
E
M
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
D
G
 
L
F
 
V
E
 
E
I
 
F
D
 
P
-
 
L
G
 
M
K
 
D
L
 
P
L
 
F
V
 
S
N
 
F
N
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
T
V
 
A
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
L
K
 
A
E
 
E
T
 
H
G
 
G
L
 
L
P
 
A
V
 
A
T
 
S
T
 
A
A
 
S
C
 
L
G
 
G
G
 
L
Y
 
S
D
 
D
G
 
A
W
 
-
I
 
-
G
 
T
D
 
D
F
 
V
I
 
S
E
 
S
E
 
E
R
 
D
R
 
P
L
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
K
N
 
A
G
 
G
L
 
E
K
 
E
Q
 
L
I
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
T
G
 
D
I
 
F
V
 
C
V
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
M
 
V
F
 
I
T
 
Y
F
 
S
R
 
A
L
 
M
P
 
K
P
 
K
M
 
Y
T
 
M
S
 
E
P
 
P
R
 
A
S
 
T
L
 
A
D
 
A
G
 
G
D
 
L
R
 
A
K
 
N
M
 
S
V
 
K
S
 
A
D
 
A
S
 
V
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
A
E
 
D
Q
 
R
V
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
D
T
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
N
V
 
V
Y
 
S
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
V
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
T
H
 
N
M
 
V
I
 
L
N
 
N
T
 
T
L
 
G
A
 
R
D
 
Q
A
 
A
R
 
L
R
 
A
Y
 
Y
I
 
L
V
 
E
E
 
E
N
 
L
D
 
N
L
 
R
K
 
P
H
 
N
V
 
L
Q
 
G
I
 
I
I
 
H
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
Y
H
 
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
S
N
 
D
L
 
M
A
 
F
Q
 
S
A
 
P
L
 
I
H
 
L
D
 
D
N
 
T
R
 
A
D
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
R
H
 
Y
V
 
V
H
|
H
I
 
I
A
 
G
D
 
E
N
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
G
Q
 
Y
P
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
G
T
 
S
L
 
V
D
 
D
F
 
F
H
 
D
A
 
T
L
 
F
F
 
F
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
R
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
G
 
G
Y
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
E
|
E

8yecC Crystal structure of l-ribulose 3-epimerase in complex with d-allulose
29% identity, 92% coverage: 1:240/262 of query aligns to 9:248/297 of 8yecC

query
sites
8yecC
M
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
C
Q
x
H
N
 
G
Q
 
L
A
 
V
F
 
W
F
 
T
P
 
G
E
 
H
N
 
F
I
 
D
L
 
A
E
 
E
K
 
G
F
 
I
R
 
R
Y
 
Y
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
I
 
T
K
 
R
E
 
E
M
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
D
G
 
L
F
 
V
E
 
E
I
 
F
D
 
P
-
 
L
G
 
M
K
 
D
L
 
P
L
 
F
V
 
S
N
 
F
N
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
T
V
 
A
K
 
K
A
 
S
A
 
A
I
 
L
K
 
A
E
 
E
T
 
H
G
 
G
L
 
L
P
 
A
V
 
A
T
 
S
T
 
A
A
x
S
C
x
L
G
 
G
G
 
L
Y
 
S
D
 
D
G
 
A
W
 
-
I
 
-
G
 
T
D
 
D
F
 
V
I
 
S
E
 
S
E
 
E
R
 
D
R
 
P
L
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
K
N
 
A
G
 
G
L
 
E
K
 
E
Q
 
L
I
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
T
G
 
D
I
 
F
V
 
C
V
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
M
 
V
F
 
I
T
 
Y
F
 
S
R
 
A
L
x
M
P
 
K
P
 
K
M
 
Y
T
 
M
S
 
E
P
 
P
R
 
A
S
 
T
L
 
A
D
 
A
G
 
G
D
 
L
R
 
A
K
 
N
M
 
S
V
 
K
S
 
A
D
 
A
S
 
V
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
A
E
 
D
Q
 
R
V
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
D
T
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
N
V
 
V
Y
 
S
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
V
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
x
E
D
 
T
H
 
N
M
 
V
I
 
L
N
 
N
T
 
T
L
 
G
A
 
R
D
 
Q
A
 
A
R
 
L
R
 
A
Y
 
Y
I
 
L
V
 
E
E
 
E
N
 
L
D
 
N
L
 
R
K
 
P
H
 
N
V
 
L
Q
 
G
I
 
I
I
 
H
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
Y
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
S
N
 
D
L
 
M
A
 
F
Q
 
S
A
 
P
L
 
I
H
 
L
D
 
D
N
 
T
R
 
A
D
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
R
H
 
Y
V
 
V
H
|
H
I
 
I
A
 
G
D
 
E
N
 
S
H
 
H
R
|
R
Y
 
G
Q
 
Y
P
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
G
T
 
S
L
 
V
D
 
D
F
 
F
H
 
D
A
 
T
L
 
F
F
 
F
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
R
 
G
A
 
R
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
G
 
G
Y
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
E
|
E

3vnmA Crystal structures of d-psicose 3-epimerase with d-sorbose from clostridium cellulolyticum h10 (see paper)
32% identity, 51% coverage: 111:244/262 of query aligns to 113:248/289 of 3vnmA

query
sites
3vnmA
P
 
P
M
 
I
T
 
D
S
 
Y
P
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
W
K
 
E
M
 
R
V
 
S
S
 
V
D
 
E
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
E
L
 
V
E
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
A
T
 
C
G
 
G
T
 
V
V
 
D
V
 
F
Y
 
C
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
N
H
 
Y
M
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
A
A
 
Q
D
 
E
A
 
G
R
 
V
R
 
D
Y
 
F
I
 
V
V
 
K
E
 
Q
N
 
V
D
 
D
L
 
H
K
 
N
H
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
T
N
 
A
R
 
G
D
 
S
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
|
H
I
 
T
A
 
G
D
 
E
N
 
C
H
 
N
R
|
R
Y
 
K
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
R
L
 
I
D
 
P
F
 
W
H
 
V
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
D
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
G
Y
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
M
E
|
E
G
 
P
R
 
F
I
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3vnjA Crystal structures of d-psicose 3-epimerase with d-psicose from clostridium cellulolyticum h10 (see paper)
32% identity, 51% coverage: 111:244/262 of query aligns to 114:249/290 of 3vnjA

query
sites
3vnjA
P
 
P
M
 
I
T
 
D
S
 
Y
P
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
W
K
 
E
M
 
R
V
 
S
S
 
V
D
 
E
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
E
L
 
V
E
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
A
T
 
C
G
 
G
T
 
V
V
 
D
V
 
F
Y
 
C
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
N
H
 
Y
M
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
A
A
 
Q
D
 
E
A
 
G
R
 
V
R
 
D
Y
 
F
I
 
V
V
 
K
E
 
Q
N
 
V
D
 
D
L
 
H
K
 
N
H
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
T
N
 
A
R
 
G
D
 
S
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
|
H
I
 
T
A
 
G
D
 
E
N
 
C
H
 
N
R
|
R
Y
 
K
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
R
L
 
I
D
 
P
F
 
W
H
 
V
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
D
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
G
Y
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
M
E
|
E
G
 
P
R
 
F
I
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3vnkA Crystal structures of d-psicose 3-epimerase with d-fructose from clostridium cellulolyticum h10 (see paper)
32% identity, 51% coverage: 111:244/262 of query aligns to 113:248/290 of 3vnkA

query
sites
3vnkA
P
 
P
M
 
I
T
 
D
S
 
Y
P
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
W
K
 
E
M
 
R
V
 
S
S
 
V
D
 
E
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
E
L
 
V
E
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
A
T
 
C
G
 
G
T
 
V
V
 
D
V
 
F
Y
 
C
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
N
H
 
Y
M
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
A
A
 
Q
D
 
E
A
 
G
R
 
V
R
 
D
Y
 
F
I
 
V
V
 
K
E
 
Q
N
 
V
D
 
D
L
 
H
K
 
N
H
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
T
N
 
A
R
 
G
D
 
S
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
|
H
I
 
T
A
 
G
D
 
E
N
 
C
H
 
N
R
|
R
Y
 
K
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
R
L
 
I
D
 
P
F
 
W
H
 
V
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
D
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
G
Y
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
M
E
|
E
G
 
P
R
 
F
I
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3vnlA Crystal structures of d-psicose 3-epimerase with d-tagatose from clostridium cellulolyticum h10 (see paper)
32% identity, 51% coverage: 111:244/262 of query aligns to 114:249/291 of 3vnlA

query
sites
3vnlA
P
 
P
M
 
I
T
 
D
S
 
Y
P
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
W
K
 
E
M
 
R
V
 
S
S
 
V
D
 
E
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
E
L
 
V
E
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
A
T
 
C
G
 
G
T
 
V
V
 
D
V
 
F
Y
 
C
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
N
H
 
Y
M
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
A
A
 
Q
D
 
E
A
 
G
R
 
V
R
 
D
Y
 
F
I
 
V
V
 
K
E
 
Q
N
 
V
D
 
D
L
 
H
K
 
N
H
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
T
N
 
A
R
 
G
D
 
S
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
|
H
I
 
T
A
 
G
D
 
E
N
 
C
H
 
N
R
|
R
Y
 
K
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
R
L
 
I
D
 
P
F
 
W
H
 
V
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
D
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
G
Y
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
M
E
|
E
G
 
P
R
x
F
I
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

B8I944 D-psicose 3-epimerase; DPEase; EC 5.1.3.30 from Ruminiclostridium cellulolyticum (strain ATCC 35319 / DSM 5812 / JCM 6584 / H10) (Clostridium cellulolyticum) (see paper)
32% identity, 51% coverage: 111:244/262 of query aligns to 113:248/293 of B8I944

query
sites
B8I944
P
 
P
M
 
I
T
 
D
S
 
Y
P
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
W
K
 
E
M
 
R
V
 
S
S
 
V
D
 
E
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
E
L
 
V
E
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
A
T
 
C
G
 
G
T
 
V
V
 
D
V
 
F
Y
 
C
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
N
H
 
Y
M
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
L
 
A
A
 
Q
D
 
E
A
 
G
R
 
V
R
 
D
Y
 
F
I
 
V
V
 
K
E
 
Q
N
 
V
D
 
D
L
 
H
K
 
N
H
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
x
T
Y
x
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
T
N
 
A
R
 
G
D
 
S
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
|
H
I
 
T
A
 
G
D
 
E
N
 
C
H
 
N
R
|
R
Y
 
K
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
R
L
 
I
D
 
P
F
 
W
H
 
V
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
D
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
G
 
G
Y
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
M
E
|
E
G
 
P
R
 
F
I
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2hk1A Crystal structure of d-psicose 3-epimerase (dpease) in the presence of d-fructose (see paper)
31% identity, 49% coverage: 113:240/262 of query aligns to 117:244/289 of 2hk1A

query
sites
2hk1A
T
 
S
S
 
Q
P
 
P
R
 
V
S
 
D
L
 
K
D
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
K
 
A
M
 
R
V
 
G
S
 
V
D
 
E
S
 
G
L
 
I
R
 
N
V
 
G
L
 
I
E
 
A
Q
 
D
V
 
F
A
 
A
A
 
N
R
 
D
T
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
N
V
 
L
Y
 
C
L
 
I
E
|
E
P
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
N
H
 
H
M
 
V
I
 
L
N
 
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
G
R
 
V
R
 
A
Y
 
F
I
 
V
V
 
K
E
 
D
N
 
V
D
 
G
L
 
K
K
 
N
H
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
S
L
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
T
N
 
A
R
 
G
D
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
F
H
|
H
I
 
T
A
 
G
D
 
E
N
 
S
H
 
N
R
|
R
Y
 
R
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
G
T
 
R
L
 
M
D
 
P
F
 
W
H
 
H
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
I
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
Y
 
M
E
|
E

Sites not aligning to the query:

A9CH28 D-psicose 3-epimerase; DPEase; EC 5.1.3.30 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
31% identity, 49% coverage: 113:240/262 of query aligns to 117:244/289 of A9CH28

query
sites
A9CH28
T
 
S
S
 
Q
P
 
P
R
 
V
S
 
D
L
 
K
D
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
K
 
A
M
 
R
V
 
G
S
 
V
D
 
E
S
 
G
L
 
I
R
 
N
V
 
G
L
 
I
E
 
A
Q
 
D
V
 
F
A
 
A
A
 
N
R
 
D
T
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
N
V
 
L
Y
 
C
L
 
I
E
|
E
P
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
N
H
 
H
M
 
V
I
 
L
N
 
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
G
R
 
V
R
 
A
Y
 
F
I
 
V
V
 
K
E
 
D
N
 
V
D
 
G
L
 
K
K
 
N
H
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
x
T
Y
x
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
S
L
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
T
N
 
A
R
 
G
D
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
F
H
|
H
I
 
T
A
 
G
D
 
E
N
 
S
H
 
N
R
|
R
Y
 
R
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
G
T
 
R
L
 
M
D
 
P
F
 
W
H
 
H
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
I
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
Y
 
A
V
 
V
V
 
I
Y
 
M
E
|
E

Sites not aligning to the query:

7x7wA The x-ray crystallographic structure of d-psicose 3-epimerase from clostridia bacterium
26% identity, 84% coverage: 24:244/262 of query aligns to 27:248/288 of 7x7wA

query
sites
7x7wA
E
 
Q
M
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
D
G
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
I
D
 
A
G
 
A
K
 
S
L
 
P
L
 
L
V
 
P
-
 
F
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
N
 
Q
N
 
Q
I
 
M
E
 
K
E
 
D
V
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
C
I
 
A
K
 
E
E
 
A
T
 
N
G
 
G
L
 
I
P
 
T
V
 
L
T
 
T
T
 
C
A
 
G
C
 
H
G
 
G
-
 
P
G
 
S
Y
 
P
D
 
D
G
 
Q
W
 
N
I
 
L
G
 
A
D
 
S
F
 
S
I
 
D
E
 
P
E
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
A
N
 
H
G
 
A
L
 
K
K
 
S
Q
 
F
I
 
F
E
 
T
R
 
D
I
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
R
L
 
L
A
 
E
E
 
K
-
 
M
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
-
G
 
-
I
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
M
 
I
F
 
Y
T
 
S
F
 
Y
R
 
W
L
 
P
P
 
V
P
 
D
M
 
Y
T
 
S
S
 
M
P
 
P
R
 
I
S
 
D
L
 
K
D
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
W
K
 
A
M
 
R
V
 
S
S
 
V
D
 
E
S
 
G
L
 
V
R
 
A
V
 
E
L
 
M
E
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
S
T
 
C
G
 
G
T
 
V
V
 
D
V
 
Y
Y
 
C
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
L
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
D
 
G
H
 
Y
M
 
L
I
 
L
N
 
N
T
 
T
L
 
A
A
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
V
R
 
Q
Y
 
F
I
 
V
V
 
Q
E
 
E
N
 
V
D
 
N
L
 
H
K
 
P
H
 
R
V
 
V
Q
 
K
I
 
I
I
 
M
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
 
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
D
N
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
L
 
I
H
 
R
D
 
R
N
 
A
R
 
G
D
 
Q
L
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
F
H
|
H
I
 
T
A
 
G
D
 
E
N
 
C
H
 
N
R
 
R
Y
 
R
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
R
G
 
G
T
 
R
L
 
T
D
 
P
F
 
W
H
 
R
A
 
E
L
 
I
F
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
T
G
 
G
Y
 
A
V
 
V
V
 
V
Y
 
M
E
|
E
G
 
P
R
 
F
I
 
V
R
 
R

7cj9D Crystal structure of n-terminal his-tagged d-allulose 3-epimerase from methylomonas sp. With additional c-terminal residues (see paper)
27% identity, 85% coverage: 19:240/262 of query aligns to 37:246/289 of 7cj9D

query
sites
7cj9D
F
 
F
R
 
D
Y
 
Y
I
 
I
K
 
E
E
 
I
M
 
A
G
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
P
F
 
W
E
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
V
K
 
A
L
 
L
L
 
T
V
 
K
N
 
D
N
 
L
I
 
L
E
 
Q
E
 
E
V
 
Y
K
 
N
A
 
L
-
 
R
A
 
A
I
 
H
K
 
A
E
x
S
T
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
S
V
 
A
T
 
A
T
 
T
A
 
D
C
 
V
G
 
T
G
 
S
Y
 
T
D
 
D
G
 
P
W
 
A
I
 
I
G
 
-
D
 
-
F
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
V
L
 
A
N
 
K
G
 
G
L
 
D
K
 
E
Q
 
L
I
 
L
E
 
R
R
 
K
I
 
A
L
 
T
E
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
Y
E
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
S
G
 
E
I
 
L
V
 
C
V
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
M
 
V
F
 
I
T
 
Y
F
 
C
R
 
A
L
 
L
P
 
G
P
 
K
M
 
Y
T
 
P
S
 
G
P
 
P
R
 
A
S
 
S
L
 
R
D
 
E
G
 
N
D
 
R
R
 
A
K
 
N
M
 
S
V
 
V
S
 
A
D
 
-
S
 
A
L
 
M
R
 
Q
V
 
R
L
 
L
E
 
A
Q
 
D
V
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
N
V
 
I
Y
 
D
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
V
N
 
N
R
 
R
Y
 
Y
Q
x
E
D
 
T
H
 
N
M
 
I
I
 
M
N
 
N
T
 
T
L
 
G
A
 
L
D
 
E
A
 
G
R
 
L
R
 
A
Y
 
F
I
 
L
V
 
D
E
 
E
N
 
V
D
 
N
L
 
R
K
 
P
H
 
N
V
 
A
Q
 
F
I
 
L
I
 
H
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
Y
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
N
N
 
G
L
 
M
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
V
H
 
L
D
 
A
N
 
A
R
 
G
D
 
D
L
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
H
|
H
I
 
I
A
 
G
D
 
E
N
 
S
H
 
H
R
|
R
Y
 
G
Q
 
Y
P
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
G
T
 
N
L
 
V
D
 
D
F
 
F
H
 
A
A
 
S
L
 
F
F
 
F
E
 
A
Q
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
Q
D
 
I
N
 
D
Y
 
Y
Q
 
R
G
 
G
Y
 
P
V
 
I
V
 
T
Y
 
F
E
|
E

Sites not aligning to the query:

2qumA Crystal structure of d-tagatose 3-epimerase from pseudomonas cichorii with d-tagatose (see paper)
28% identity, 86% coverage: 20:244/262 of query aligns to 24:250/290 of 2qumA

query
sites
2qumA
R
 
K
Y
 
R
I
 
I
K
 
A
E
 
G
M
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
D
G
 
L
F
 
M
E
 
E
I
 
I
D
 
S
G
 
L
K
 
G
L
 
E
L
 
F
V
 
H
N
 
N
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
A
N
 
K
I
 
K
E
 
R
E
 
E
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
V
I
 
A
K
 
D
E
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
T
V
 
V
T
 
M
T
 
C
A
x
C
C
 
I
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
S
G
 
E
Y
 
Y
D
 
D
G
 
F
W
 
A
I
 
S
G
 
P
D
 
D
F
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
S
R
 
V
R
 
R
L
 
D
N
 
A
G
 
G
L
 
T
K
 
E
Q
 
Y
I
 
V
E
 
K
R
 
R
I
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
D
L
 
C
A
 
H
E
 
L
V
 
L
G
 
G
G
 
A
K
 
-
G
 
-
I
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
P
A
 
V
A
 
F
W
 
A
G
 
G
M
 
L
F
 
-
T
 
T
F
 
F
R
 
C
L
 
A
P
 
W
P
 
P
M
 
Q
T
 
S
S
 
P
P
 
P
R
 
L
S
 
D
L
 
M
D
 
K
G
 
D
D
 
K
R
 
R
K
 
P
M
 
Y
V
 
V
S
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
I
D
 
E
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
R
L
 
V
E
 
I
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
D
T
 
Y
G
 
G
T
 
I
V
 
I
V
 
Y
Y
 
A
L
 
L
E
|
E
P
 
V
L
 
V
N
 
N
R
 
R
Y
 
F
Q
x
E
D
 
Q
H
 
W
M
 
L
I
 
C
N
 
N
T
 
D
L
 
A
A
 
K
D
 
E
A
 
A
R
 
I
R
 
A
Y
 
F
I
 
A
V
 
D
E
 
A
N
 
V
D
 
D
L
 
S
K
 
P
H
 
A
V
 
C
Q
 
K
I
 
V
I
 
Q
G
 
L
D
|
D
F
 
T
Y
 
F
H
|
H
M
 
M
N
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
E
D
 
T
N
 
S
L
 
F
A
 
R
Q
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
L
D
 
A
N
 
C
R
 
K
D
 
G
L
 
K
L
 
M
G
 
G
H
 
H
V
 
F
H
|
H
I
 
L
A
 
G
D
 
E
N
 
A
H
 
N
R
|
R
Y
 
L
Q
 
P
P
 
P
G
 
G
S
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
L
D
 
P
F
 
W
H
 
D
A
 
E
L
 
I
F
 
F
E
 
G
Q
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
D
 
I
N
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
G
 
G
Y
 
T
V
 
I
V
 
V
Y
 
M
E
|
E
G
 
P
R
 
F
I
 
M
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>15434 FitnessBrowser__Keio:15434
MKIGTQNQAFFPENILEKFRYIKEMGFDGFEIDGKLLVNNIEEVKAAIKETGLPVTTACG
GYDGWIGDFIEERRLNGLKQIERILEALAEVGGKGIVVPAAWGMFTFRLPPMTSPRSLDG
DRKMVSDSLRVLEQVAARTGTVVYLEPLNRYQDHMINTLADARRYIVENDLKHVQIIGDF
YHMNIEEDNLAQALHDNRDLLGHVHIADNHRYQPGSGTLDFHALFEQLRADNYQGYVVYE
GRIRAEDPAQAYRDSLAWLRTC

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory