SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 18321 b4297 KpLE2 phage-like element; predicted dehydratase (NCBI) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

6ovtA Crystal structure of ilvd from mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 78% coverage: 89:602/655 of query aligns to 52:546/562 of 6ovtA

query
sites
6ovtA
H
 
N
Y
 
L
E
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
R
Q
 
L
M
 
A
K
 
N
A
 
A
A
 
V
A
 
K
E
 
E
V
 
G
I
 
V
K
 
F
A
 
S
N
 
A
H
 
G
A
 
G
L
 
Y
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
V
 
F
Y
 
G
V
 
T
S
 
I
D
 
S
P
 
V
C
 
S
D
|
D
G
|
G
R
 
I
T
 
S
Q
 
M
G
 
G
T
 
H
T
 
E
G
 
G
M
 
M
F
 
H
D
 
F
S
 
S
L
 
L
P
 
V
Y
 
S
R
 
R
N
 
E
D
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
V
 
V
M
 
I
R
 
A
R
 
D
L
 
S
I
 
V
R
 
E
S
 
V
L
 
V
P
 
M
D
 
Q
A
 
A
K
 
E
A
 
R
V
 
L
I
 
D
G
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
L
V
 
L
A
 
A
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
G
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
G
T
 
M
M
 
L
M
 
M
A
 
A
L
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
H
 
L
N
 
D
I
 
L
A
 
A
T
 
A
V
 
V
L
 
F
V
 
L
P
 
Y
G
 
A
G
 
G
A
 
S
T
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
G
K
 
R
D
 
A
G
 
K
E
 
L
D
 
S
N
 
D
G
 
G
K
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
D
V
 
V
Q
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
D
A
 
A
R
 
F
F
 
E
A
 
A
N
 
V
G
 
G
E
 
A
L
 
C
S
 
S
L
 
R
Q
 
G
D
 
L
A
 
M
R
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
D
C
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
E
K
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
C
S
 
P
S
 
G
G
 
E
G
 
G
G
x
A
C
|
C
Q
 
G
F
 
G
L
 
M
G
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
N
T
 
T
S
 
M
Q
 
A
V
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
S
I
 
L
P
 
P
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
P
P
 
P
S
 
A
G
 
T
E
 
D
P
 
R
V
 
R
W
 
R
R
 
D
E
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
R
S
 
S
A
 
G
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
V
N
 
E
L
 
L
S
 
L
Q
 
R
K
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
T
 
A
R
 
R
E
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
D
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
A
V
 
V
H
 
V
A
 
M
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
L
P
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
H
Q
 
E
A
 
A
G
 
N
C
 
V
H
 
A
I
 
L
P
 
-
T
 
S
V
 
L
D
 
Q
D
 
D
W
 
F
I
 
S
R
 
R
I
 
I
N
 
G
K
 
S
R
 
G
V
 
V
P
 
P
R
 
H
L
 
L
V
 
A
S
 
D
V
 
V
L
 
K
P
 
P
N
 
F
G
 
G
P
 
-
V
 
-
Y
 
R
H
 
H
P
 
V
T
 
M
V
 
S
N
 
D
A
 
V
F
 
D
M
 
H
A
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
V
V
 
V
M
 
M
L
 
K
H
 
A
L
 
L
R
 
L
S
 
D
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
E
 
G
D
 
D
V
 
C
M
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
H
T
 
T
L
 
M
K
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
W
 
A
W
 
I
E
 
T
H
 
P
S
 
P
E
 
D
R
 
P
R
 
D
Q
 
G
R
 
K
F
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
N
Q
 
P
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
I
 
-
M
 
I
S
 
H
P
 
P
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
T
 
G
I
 
I
T
 
T
F
 
I
P
 
L
V
 
H
G
 
G
N
 
S
I
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
V
I
 
V
K
 
K
S
 
T
T
 
A
A
 
G
I
 
F
D
 
D
P
 
S
S
 
D
M
 
V
I
 
F
D
 
E
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
G
V
 
T
A
 
A
K
 
R
V
 
V
Y
 
F
L
 
D
S
 
G
E
 
E
K
 
R
S
 
A
A
 
A
I
 
L
Y
 
D
D
 
A
I
 
L
K
 
E
H
 
D
D
 
G
K
 
T
I
 
I
K
 
T
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
R
G
 
Y
V
 
E
G
 
G
P
 
P
S
 
K
-
 
G
G
 
G
T
 
P
G
 
G
M
 
M
E
 
R
E
|
E
T
 
M
Y
 
L
Q
 
A
V
 
I
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
I
K
 
K
H
 
G
L
 
A
S
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
K
H
 
D
V
 
V
S
 
L
L
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
L
C
 
C
I
 
V
G
 
G
H
 
H
V
 
I
G
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
A
K
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
R
I
 
I
E
 
R
I
 
L
K
 
D
I
 
V
D
 
A
C
 
G
R
 
R
E
 
V
L
 
L
H
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
A
G
 
D
E
 
P
V
 
A
N
 
E
F
 
F
L
 
A
G
 
S
T
 
R
R
 
Q
S
 
Q
D
 
D
E
 
F
Q
 
S
L
 
P
P
 
P
S
 
P
Q
 
P
E
 
R
E
 
Y
A
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
V
L
 
L
N
 
S

Sites not aligning to the query:

P9WKJ5 Dihydroxy-acid dehydratase; DAD; EC 4.2.1.9 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
34% identity, 78% coverage: 89:602/655 of query aligns to 65:559/575 of P9WKJ5

query
sites
P9WKJ5
H
 
N
Y
 
L
E
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
R
Q
 
L
M
 
A
K
 
N
A
 
A
A
 
V
A
 
K
E
 
E
V
 
G
I
 
V
K
 
F
A
 
S
N
 
A
H
 
G
A
 
G
L
 
Y
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
V
 
F
Y
 
G
V
 
T
S
 
I
D
 
S
P
 
V
C
 
S
D
|
D
G
 
G
R
 
I
T
 
S
Q
 
M
G
 
G
T
 
H
T
 
E
G
 
G
M
 
M
F
 
H
D
 
F
S
 
S
L
 
L
P
 
V
Y
 
S
R
 
R
N
 
E
D
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
V
 
V
M
 
I
R
 
A
R
 
D
L
 
S
I
 
V
R
 
E
S
 
V
L
 
V
P
 
M
D
 
Q
A
 
A
K
 
E
A
 
R
V
 
L
I
 
D
G
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
L
V
 
L
A
 
A
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
G
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
G
T
 
M
M
 
L
M
 
M
A
 
A
L
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
H
 
L
N
 
D
I
 
L
A
 
A
T
 
A
V
 
V
L
 
F
V
 
L
P
 
Y
G
 
A
G
 
G
A
 
S
T
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
G
K
 
R
D
 
A
G
 
K
E
 
L
D
 
S
N
 
D
G
 
G
K
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
D
V
 
V
Q
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
D
A
 
A
R
 
F
F
 
E
A
 
A
N
 
V
G
 
G
E
 
A
L
 
C
S
 
S
L
 
R
Q
 
G
D
 
L
A
 
M
R
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
D
C
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
E
K
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
C
S
 
P
S
 
G
G
 
E
G
 
G
G
 
A
C
|
C
Q
 
G
F
 
G
L
 
M
G
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
N
T
 
T
S
 
M
Q
 
A
V
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
S
I
 
L
P
 
P
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
P
P
 
P
S
 
A
G
 
T
E
 
D
P
 
R
V
 
R
W
 
R
R
 
D
E
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
R
S
 
S
A
 
G
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
V
N
 
E
L
 
L
S
 
L
Q
 
R
K
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
T
 
A
R
 
R
E
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
D
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
A
V
 
V
H
 
V
A
 
M
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
L
P
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
H
Q
 
E
A
 
A
G
 
N
C
 
V
H
 
A
I
 
L
P
 
-
T
 
S
V
 
L
D
 
Q
D
 
D
W
 
F
I
 
S
R
 
R
I
 
I
N
 
G
K
 
S
R
 
G
V
 
V
P
 
P
R
 
H
L
 
L
V
 
A
S
 
D
V
 
V
L
 
K
P
 
P
N
 
F
G
 
G
P
 
-
V
 
-
Y
 
R
H
 
H
P
 
V
T
 
M
V
 
S
N
 
D
A
 
V
F
 
D
M
 
H
A
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
V
V
 
V
M
 
M
L
 
K
H
 
A
L
 
L
R
 
L
S
 
D
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
E
 
G
D
 
D
V
 
C
M
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
H
T
 
T
L
 
M
K
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
A
W
 
A
W
 
I
E
 
T
H
 
P
S
 
P
E
 
D
R
 
P
R
 
D
Q
 
G
R
 
K
F
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
N
Q
 
P
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
I
 
-
M
 
I
S
 
H
P
 
P
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
T
 
G
I
 
I
T
 
T
F
 
I
P
 
L
V
 
H
G
 
G
N
 
S
I
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
V
I
 
V
K
 
K
S
 
T
T
 
A
A
 
G
I
 
F
D
 
D
P
 
S
S
 
D
M
 
V
I
 
F
D
 
E
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
G
V
 
T
A
 
A
K
 
R
V
 
V
Y
 
F
L
 
D
S
 
G
E
 
E
K
 
R
S
 
A
A
 
A
I
 
L
Y
 
D
D
 
A
I
 
L
K
 
E
H
 
D
D
 
G
K
 
T
I
 
I
K
 
T
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
R
G
 
Y
V
 
E
G
 
G
P
 
P
S
 
K
-
 
G
G
 
G
T
 
P
G
 
G
M
 
M
E
 
R
E
|
E
T
 
M
Y
 
L
Q
 
A
V
 
I
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
I
K
 
K
H
 
G
L
 
A
S
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
K
H
 
D
V
 
V
S
 
L
L
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
G
R
 
R
F
 
F
S
|
S
G
 
G
V
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
L
C
 
C
I
 
V
G
 
G
H
 
H
V
 
I
G
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
A
K
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
R
I
 
I
E
 
R
I
 
L
K
 
D
I
 
V
D
 
A
C
 
G
R
 
R
E
 
V
L
 
L
H
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
A
G
 
D
E
 
P
V
 
A
N
 
E
F
 
F
L
 
A
G
 
S
T
 
R
R
 
Q
S
 
Q
D
 
D
E
 
F
Q
 
S
L
 
P
P
 
P
S
 
P
Q
 
P
E
 
R
E
 
Y
A
 
T
T
 
T
A
 
G
I
 
V
L
 
L
N
 
S

Sites not aligning to the query:

Q9LIR4 Dihydroxy-acid dehydratase, chloroplastic; AthDHAD; DAD; EC 4.2.1.9 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 71% coverage: 120:581/655 of query aligns to 132:567/608 of Q9LIR4

query
sites
Q9LIR4
D
 
D
G
 
A
R
 
I
T
 
S
Q
 
M
G
 
G
T
 
T
T
 
R
G
 
G
M
 
M
F
 
C
D
 
F
S
 
S
L
 
L
P
 
Q
Y
 
S
R
 
R
N
 
D
D
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
V
 
L
M
 
I
R
 
A
R
 
D
L
 
S
I
 
I
R
 
E
S
 
T
L
 
V
P
 
M
D
 
S
A
 
A
K
 
Q
-
 
W
-
 
Y
-
 
D
A
 
G
V
 
N
I
 
I
G
 
S
V
 
I
A
 
P
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
G
 
N
L
 
M
P
 
P
A
 
G
T
 
T
M
 
I
M
 
M
A
 
A
L
 
M
A
 
G
A
 
-
Q
 
R
H
 
L
N
 
N
I
 
R
A
 
P
T
 
G
V
 
I
L
 
M
V
 
V
P
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
T
T
 
I
L
 
K
P
 
P
A
 
G
-
 
H
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
K
 
K
D
 
T
G
 
Y
E
 
D
D
 
I
N
 
V
G
 
S
K
 
A
V
 
F
Q
 
Q
T
 
S
I
 
Y
G
 
G
A
 
-
R
 
E
F
 
F
A
 
V
N
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
I
S
 
S
L
 
D
Q
 
E
D
 
Q
A
 
R
R
 
K
R
 
T
A
 
V
G
 
L
C
 
H
K
 
H
A
 
S
C
 
C
A
 
P
S
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
A
G
 
-
C
|
C
Q
 
G
F
 
G
L
 
M
G
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
N
T
 
T
S
 
M
Q
 
A
V
 
S
V
 
A
A
 
I
E
 
E
G
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
M
A
 
S
I
 
L
P
 
P
H
 
Y
S
 
S
A
 
S
L
 
S
A
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
E
E
 
D
P
 
P
V
 
L
W
 
K
R
 
L
E
 
D
I
 
E
A
 
C
R
 
R
A
 
L
S
 
A
A
 
G
R
 
K
A
 
Y
A
 
L
L
 
L
N
 
E
L
 
L
S
 
L
Q
 
K
K
 
M
G
 
D
I
 
L
T
 
K
T
 
P
R
 
R
E
 
D
I
 
I
L
 
I
T
 
T
D
 
P
K
 
K
A
 
S
I
 
L
E
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
M
T
 
V
V
 
S
H
 
V
A
 
M
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
L
P
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
Q
 
S
A
 
V
G
 
G
C
 
L
H
 
E
I
 
L
P
 
-
T
 
T
V
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
F
I
 
Q
R
 
K
I
 
V
N
 
S
K
 
D
R
 
A
V
 
V
P
 
P
R
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
D
V
 
L
L
 
K
P
 
P
N
 
S
G
 
G
P
 
K
V
 
Y
Y
 
V
H
 
M
P
 
E
T
 
D
V
 
I
N
 
H
A
 
K
F
 
I
M
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
V
 
T
P
 
P
E
 
A
V
 
V
M
 
L
L
 
R
H
 
Y
L
 
L
R
 
L
S
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
M
H
 
D
E
 
G
D
 
D
V
 
C
M
 
M
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
N
 
N
L
 
L
D
 
-
W
 
-
W
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
N
F
 
V
K
 
P
Q
 
S
L
 
L
L
 
T
L
 
E
D
 
G
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
I
I
 
I
N
 
R
A
 
P
D
 
-
E
 
-
V
 
-
I
 
L
M
 
S
S
 
N
P
 
P
Q
 
I
Q
 
K
A
 
E
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
T
S
 
G
T
 
H
I
 
I
T
 
Q
F
 
I
P
 
L
V
 
R
G
 
G
N
 
D
I
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
A
K
 
K
S
 
I
T
 
T
A
 
G
I
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Y
 
F
H
 
-
K
 
S
G
 
G
V
 
P
A
 
A
K
 
L
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
S
 
G
E
 
E
K
 
E
S
 
S
A
 
M
I
 
L
Y
 
A
D
 
A
I
 
I
K
 
S
H
 
A
D
 
D
K
 
P
I
 
M
K
 
S
-
 
F
A
 
K
G
 
G
D
 
T
I
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
G
P
 
P
S
 
K
G
 
G
-
 
G
T
 
P
G
 
G
M
 
M
E
 
P
E
|
E
T
 
M
Y
 
L
Q
 
T
V
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
I
K
 
M
H
 
G
L
 
A
S
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
K
H
 
E
V
 
C
S
 
A
L
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
G
S
 
S
T
 
H
G
 
G
A
 
F
C
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
H
V
 
I
G
 
C
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
I
R
 
K
T
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
E
 
T
I
 
I
K
 
D
I
 
I
D
 
G
C
 
K
R
 
K
E
 
R
L
 
I
H
 
D
G
 
T
E
 
Q
V
 
V
N
 
S

Sites not aligning to the query:

5ze4A The structure of holo- structure of dhad complex with [2fe-2s] cluster (see paper)
32% identity, 71% coverage: 120:581/655 of query aligns to 93:528/569 of 5ze4A

query
sites
5ze4A
D
|
D
G
x
A
R
 
I
T
 
S
Q
 
M
G
 
G
T
 
T
T
 
R
G
 
G
M
 
M
F
 
C
D
 
F
S
 
S
L
 
L
P
 
Q
Y
 
S
R
 
R
N
 
D
D
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
V
 
L
M
 
I
R
 
A
R
 
D
L
 
S
I
 
I
R
 
E
S
 
T
L
 
V
P
 
M
D
 
S
A
 
A
K
 
Q
-
 
W
-
 
Y
-
 
D
A
 
G
V
 
N
I
 
I
G
 
S
V
 
I
A
 
P
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
G
 
N
L
 
M
P
 
P
A
 
G
T
 
T
M
 
I
M
 
M
A
 
A
L
 
M
A
 
G
A
 
-
Q
 
R
H
 
L
N
 
N
I
 
R
A
 
P
T
 
G
V
 
I
L
 
M
V
 
V
P
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
T
T
 
I
L
 
K
P
 
P
A
 
G
-
 
H
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
K
 
K
D
 
T
G
 
Y
E
 
D
D
 
I
N
 
V
G
 
S
K
 
A
V
 
F
Q
 
Q
T
 
S
I
 
Y
G
 
G
A
 
-
R
 
E
F
 
F
A
 
V
N
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
I
S
 
S
L
 
D
Q
 
E
D
 
Q
A
 
R
R
 
K
R
 
T
A
 
V
G
 
L
C
 
H
K
 
H
A
 
S
C
 
C
A
 
P
S
 
G
S
 
A
G
 
G
G
x
A
G
 
-
C
|
C
Q
 
G
F
 
G
L
 
M
G
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
N
T
 
T
S
 
M
Q
 
A
V
 
S
V
 
A
A
 
I
E
 
E
G
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
M
A
 
S
I
 
L
P
 
P
H
 
Y
S
 
S
A
 
S
L
 
S
A
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
E
E
 
D
P
 
P
V
 
L
W
 
K
R
 
L
E
 
D
I
 
E
A
 
C
R
 
R
A
 
L
S
 
A
A
 
G
R
 
K
A
 
Y
A
 
L
L
 
L
N
 
E
L
 
L
S
 
L
Q
 
K
K
 
M
G
 
D
I
 
L
T
 
K
T
 
P
R
 
R
E
 
D
I
 
I
L
 
I
T
 
T
D
 
P
K
 
K
A
 
S
I
 
L
E
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
M
T
 
V
V
 
S
H
 
V
A
 
M
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
L
P
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
Q
 
S
A
 
V
G
 
G
C
 
L
H
 
E
I
 
L
P
 
-
T
 
T
V
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
F
I
 
Q
R
 
K
I
 
V
N
 
S
K
 
D
R
 
A
V
 
V
P
 
P
R
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
D
V
 
L
L
 
K
P
 
P
N
 
S
G
 
G
P
 
K
V
 
Y
Y
 
V
H
 
M
P
 
E
T
 
D
V
 
I
N
 
H
A
 
K
F
 
I
M
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
V
 
T
P
 
P
E
 
A
V
 
V
M
 
L
L
 
R
H
 
Y
L
 
L
R
 
L
S
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
M
H
 
D
E
 
G
D
 
D
V
 
C
M
 
M
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
T
 
T
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
N
 
N
L
 
L
D
 
-
W
 
-
W
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
N
F
 
V
K
 
P
Q
 
S
L
 
L
L
 
T
L
 
E
D
 
G
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
I
I
 
I
N
 
R
A
 
P
D
 
-
E
 
-
V
 
-
I
 
L
M
 
S
S
 
N
P
 
P
Q
 
I
Q
 
K
A
 
E
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
T
S
 
G
T
 
H
I
 
I
T
 
Q
F
 
I
P
 
L
V
 
R
G
 
G
N
 
D
I
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
A
K
 
K
S
 
I
T
 
T
A
 
G
I
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Y
 
F
H
 
-
K
 
S
G
 
G
V
 
P
A
 
A
K
 
L
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
S
 
G
E
 
E
K
 
E
S
 
S
A
 
M
I
 
L
Y
 
A
D
 
A
I
 
I
K
 
S
H
 
A
D
 
D
K
 
P
I
 
M
K
 
S
-
 
F
A
 
K
G
 
G
D
 
T
I
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
G
P
 
P
S
 
K
G
 
G
-
 
G
T
 
P
G
 
G
M
 
M
E
 
P
E
|
E
T
 
M
Y
 
L
Q
 
T
V
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
I
K
 
M
H
 
G
L
 
A
S
 
G
Y
 
L
G
 
G
K
 
K
H
 
E
V
 
C
S
 
A
L
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
G
S
 
S
T
 
H
G
 
G
A
 
F
C
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
H
V
 
I
G
 
C
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
I
R
 
K
T
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
E
 
T
I
 
I
K
 
D
I
 
I
D
 
G
C
 
A
R
 
A
E
 
R
L
 
I
H
 
D
G
 
T
E
 
Q
V
 
V
N
 
S

Sites not aligning to the query:

Q1JUQ1 L-arabonate dehydratase; L-arabinonate dehydratase; EC 4.2.1.25 from Azospirillum brasilense (see paper)
33% identity, 68% coverage: 136:580/655 of query aligns to 99:521/583 of Q1JUQ1

query
sites
Q1JUQ1
R
 
R
N
 
N
D
 
L
A
 
A
S
 
S
M
 
M
V
 
D
M
 
V
R
 
E
R
 
E
L
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
G
L
 
N
P
 
P
D
 
-
A
 
I
K
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
L
V
 
L
A
 
A
S
 
G
C
|
C
D
 
D
K
 
K
G
 
T
L
 
T
P
 
P
A
 
A
T
 
L
M
 
L
M
 
M
A
 
G
L
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
H
 
C
N
 
D
I
 
V
A
 
P
T
 
A
V
 
I
L
 
V
V
 
V
P
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
P
T
 
M
L
 
L
P
 
N
A
 
G
K
 
K
-
 
L
D
 
E
G
 
G
E
 
K
D
 
N
N
 
I
G
 
G
K
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
A
V
 
V
Q
 
W
T
 
Q
I
 
L
G
 
H
A
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
K
N
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
D
L
 
V
Q
 
H
D
 
H
A
 
F
R
 
L
R
 
S
A
 
A
G
 
E
C
 
A
K
 
-
A
 
G
C
 
M
A
 
S
S
 
R
S
 
S
G
 
A
G
 
G
G
 
T
C
|
C
Q
 
N
F
 
T
L
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
S
T
 
T
S
 
M
Q
 
A
V
 
C
V
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
A
I
 
L
P
 
P
H
 
H
S
 
N
A
 
A
L
 
A
A
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
V
E
 
D
P
 
S
V
 
R
W
 
R
R
 
Y
E
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
H
A
 
M
S
 
S
A
 
G
R
 
I
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
E
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
K
 
E
G
 
G
I
 
L
T
 
V
T
 
L
R
 
S
E
 
K
I
 
I
L
 
L
T
 
T
D
 
R
K
 
A
A
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
R
V
 
A
H
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
Q
 
R
A
 
I
G
 
G
C
 
V
H
 
P
I
 
L
P
 
-
T
 
E
V
 
L
D
 
E
D
 
D
W
 
W
I
 
M
R
 
R
I
 
I
N
 
G
K
 
R
R
 
D
V
 
T
P
 
P
R
 
T
L
 
I
V
 
V
S
 
D
V
 
L
L
 
M
P
 
P
N
 
S
G
 
G
P
 
-
V
 
-
Y
 
R
H
 
F
P
 
P
T
 
M
V
 
E
N
 
E
A
 
F
F
 
Y
M
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
A
V
 
V
M
 
L
L
 
R
H
 
R
L
 
L
R
 
G
S
 
E
L
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
-
 
P
H
 
N
E
 
P
D
 
D
V
 
A
M
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
N
G
 
G
S
 
K
T
 
S
L
 
L
K
 
W
E
 
D
N
 
N
L
 
V
D
 
-
W
 
-
W
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
R
E
 
E
Q
 
A
I
 
P
N
 
N
A
 
Y
D
 
D
E
 
E
V
 
E
I
 
V
M
 
I
S
 
R
P
 
P
Q
 
L
Q
 
D
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
R
G
 
P
L
 
L
T
 
I
S
 
A
T
 
D
-
 
G
-
 
G
I
 
I
T
 
R
F
 
I
P
 
L
V
 
R
G
 
G
N
 
N
I
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
R
G
 
G
S
 
A
V
 
V
I
 
L
K
 
K
S
 
P
T
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
S
P
 
P
S
 
E
M
 
L
I
 
L
D
 
K
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
H
K
 
R
G
 
G
V
 
R
A
 
A
K
 
V
V
 
V
Y
 
F
-
 
E
-
 
N
L
 
L
S
 
D
E
 
H
K
 
Y
S
 
K
A
 
A
I
 
T
Y
 
I
D
 
N
I
 
D
K
 
E
H
 
A
D
 
L
K
 
D
I
 
I
K
 
D
A
 
A
G
 
S
D
 
S
I
 
V
L
 
M
V
 
V
I
 
L
I
 
K
G
 
N
V
x
C
G
 
G
P
 
P
S
 
R
G
 
G
T
 
Y
-
 
P
G
 
G
M
 
M
E
 
A
E
 
E
T
 
V
Y
 
G
Q
 
N
V
 
M
T
 
G
S
 
L
A
 
P
L
 
P
K
 
K
H
 
L
L
 
L
S
 
R
Y
 
Q
G
 
G
-
 
V
K
 
K
H
 
D
V
 
M
S
 
V
L
 
R
I
 
I
T
 
S
D
 
D
A
 
A
R
 
R
F
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
T
S
 
A
T
 
Y
G
 
G
A
 
T
C
 
V
I
 
V
G
 
L
H
 
H
V
 
V
G
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
L
G
 
A
K
 
A
L
 
V
R
 
R
T
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
W
I
 
I
E
 
E
I
 
L
K
 
D
I
 
C
D
 
E
C
 
A
R
 
G
E
 
T
L
 
L
H
 
H
G
 
L
E
 
D
V
 
I

Sites not aligning to the query:

B5ZZ34 L-arabinonate dehydratase; ArDHT; D-fuconate dehydratase; Galactonate dehydratase; L-arabonate dehydratase; EC 4.2.1.25; EC 4.2.1.67; EC 4.2.1.6 from Rhizobium leguminosarum bv. trifolii (strain WSM2304) (see 2 papers)
31% identity, 81% coverage: 77:607/655 of query aligns to 42:539/579 of B5ZZ34

query
sites
B5ZZ34
D
 
D
G
 
G
K
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
I
L
 
G
A
 
I
L
 
L
H
 
N
-
 
T
-
 
W
-
 
S
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
P
-
x
C
Q
 
N
G
 
G
H
 
H
Y
 
L
E
 
R
L
 
-
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
M
 
E
K
 
K
A
 
V
A
 
K
A
 
A
E
 
G
V
 
V
I
 
W
K
 
E
A
 
A
N
 
G
H
 
-
A
 
G
L
 
F
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
V
 
V
Y
 
P
V
 
V
S
 
F
D
 
S
P
 
A
C
 
S
D
x
E
G
 
N
R
 
T
T
 
F
Q
 
R
G
 
P
T
 
T
T
 
A
G
 
M
M
 
M
F
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
D
 
L
A
 
A
S
 
A
M
 
L
V
 
A
M
 
V
R
 
E
R
 
E
L
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
G
L
 
Q
P
 
P
D
 
M
A
 
D
K
 
G
A
 
C
V
 
V
I
 
L
G
 
-
V
 
L
A
 
V
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
G
 
T
L
 
T
P
 
P
A
 
S
T
 
L
M
 
L
M
 
M
A
 
G
L
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
H
 
C
N
 
D
I
 
L
A
 
P
T
 
S
V
 
I
L
 
V
V
 
V
P
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
T
 
M
L
 
L
P
 
N
A
 
G
K
 
Y
-
 
F
D
 
R
G
 
G
E
 
E
D
 
R
N
 
V
G
 
G
K
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
H
V
 
L
Q
 
W
T
 
K
I
 
F
G
 
S
A
 
E
R
 
M
F
 
V
A
 
K
N
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
M
S
 
T
L
 
Q
Q
 
A
D
 
E
A
 
F
R
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
E
C
 
A
K
 
S
A
 
M
C
 
S
A
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
T
G
 
-
C
|
C
Q
 
N
F
 
T
L
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
S
T
 
T
S
 
M
Q
 
A
V
 
S
V
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
L
P
 
S
H
 
G
S
 
N
A
 
A
L
 
A
A
 
I
P
 
P
S
 
G
G
 
V
E
 
D
P
 
S
V
 
R
W
 
R
R
 
K
E
 
V
I
 
M
A
 
A
R
 
Q
A
 
L
S
 
T
A
 
G
R
 
R
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
L
 
M
S
 
V
Q
 
K
K
 
D
G
 
D
I
 
L
T
 
K
T
 
P
R
 
S
E
 
E
I
 
I
L
 
M
T
 
T
D
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
R
V
 
T
H
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
Q
 
R
A
 
V
G
 
G
C
 
I
H
 
D
I
 
L
P
 
-
T
 
S
V
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
W
I
 
D
R
 
R
I
 
C
N
 
G
K
 
R
R
 
D
V
 
V
P
 
P
R
 
T
L
 
I
V
 
V
S
 
N
V
 
L
L
 
M
P
 
P
N
 
S
G
 
G
P
 
K
V
 
Y
Y
 
L
H
 
M
P
 
E
T
 
E
V
 
F
N
 
-
A
 
-
F
 
F
M
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
V
V
 
V
M
 
L
L
 
K
H
 
R
L
 
L
R
 
G
S
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
E
 
K
D
 
D
V
 
A
M
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
V
K
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
W
 
-
W
 
W
E
 
D
H
 
E
S
 
V
E
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
K
E
 
D
Q
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
W
D
 
N
E
 
E
V
 
D
I
 
V
M
 
I
S
 
L
P
 
P
Q
 
A
Q
 
E
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
S
-
 
G
-
 
G
I
 
I
T
 
V
F
 
V
P
 
L
V
 
R
G
 
G
N
 
N
I
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
G
S
 
A
V
 
V
I
 
L
K
 
K
S
 
P
T
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
S
P
 
P
S
 
H
M
 
L
I
 
L
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
Y
 
V
H
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
R
A
 
A
K
 
V
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
D
S
 
D
E
 
Y
K
 
K
S
 
A
A
 
K
I
 
I
Y
 
N
D
 
D
I
 
D
K
 
N
H
 
L
D
 
D
K
 
-
I
 
I
K
 
D
A
 
E
G
 
N
D
x
C
I
 
I
L
 
M
V
 
V
I
 
M
I
 
K
G
 
N
V
x
C
G
 
G
P
 
P
S
 
K
G
 
G
T
 
Y
-
 
P
G
 
G
M
 
M
E
 
A
E
|
E
T
 
V
Y
 
G
Q
 
N
V
 
M
T
 
G
S
 
L
A
 
P
L
 
P
K
 
K
H
 
V
L
 
L
S
 
K
Y
 
K
G
 
G
-
 
I
K
 
L
H
 
D
V
 
M
S
 
V
L
 
R
I
 
I
T
 
S
D
 
D
A
 
A
R
 
R
F
 
M
S
|
S
G
 
G
V
 
T
S
 
A
T
 
Y
G
 
G
A
 
T
C
 
V
I
 
V
G
 
L
H
 
H
V
 
T
G
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
L
G
 
A
K
 
V
L
 
V
R
 
K
T
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
M
I
 
I
E
 
E
I
 
L
K
 
D
I
 
V
D
 
P
C
 
N
R
 
R
E
 
R
L
 
L
H
 
H
G
 
L
E
 
D
V
 
I
N
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
A
T
 
R
A
 
R
I
 
L
L
 
A
N
 
E
A
 
W
R
 
Q
P
 
P
S
 
N
H
 
H

5j85A Ser480ala mutant of l-arabinonate dehydratase (see paper)
30% identity, 81% coverage: 77:607/655 of query aligns to 39:536/576 of 5j85A

query
sites
5j85A
D
 
D
G
 
G
K
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
I
L
 
G
A
 
I
L
 
L
H
 
N
-
 
T
-
 
W
-
 
S
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
P
-
x
C
Q
 
N
G
 
G
H
 
H
Y
 
L
E
 
R
L
 
-
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
M
 
E
K
 
K
A
 
V
A
 
K
A
 
A
E
 
G
V
 
V
I
 
W
K
 
E
A
 
A
N
 
G
H
 
-
A
 
G
L
 
F
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
V
 
V
Y
 
P
V
 
V
S
 
F
D
 
S
P
 
A
C
 
S
D
x
E
G
x
N
R
 
T
T
 
F
Q
 
R
G
 
P
T
 
T
T
 
A
G
 
M
M
 
M
F
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
D
 
L
A
 
A
S
 
A
M
 
L
V
 
A
M
 
V
R
 
E
R
 
E
L
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
G
L
 
Q
P
 
P
D
 
M
A
 
D
K
 
G
A
 
C
V
 
V
I
 
L
G
 
-
V
 
L
A
 
V
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
G
 
T
L
 
T
P
 
P
A
 
S
T
 
L
M
 
L
M
 
M
A
 
G
L
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
H
 
C
N
 
D
I
 
L
A
 
P
T
 
S
V
 
I
L
 
V
V
 
V
P
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
T
 
M
L
 
L
P
 
N
A
 
G
K
 
Y
-
 
F
D
 
R
G
 
G
E
 
E
D
 
R
N
 
V
G
 
G
K
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
H
V
 
L
Q
 
W
T
 
K
I
 
F
G
 
S
A
 
E
R
 
M
F
 
V
A
 
K
N
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
M
S
 
T
L
 
Q
Q
 
A
D
 
E
A
 
F
R
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
E
C
 
A
K
 
S
A
 
M
C
 
S
A
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
x
T
G
 
-
C
|
C
Q
 
N
F
 
T
L
 
M
G
 
G
T
|
T
A
 
A
G
 
S
T
 
T
S
 
M
Q
 
A
V
 
S
V
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
L
P
 
S
H
 
G
S
 
N
A
 
A
L
 
A
A
 
I
P
 
P
S
 
G
G
 
V
E
 
D
P
 
S
V
 
R
W
 
R
R
 
K
E
 
V
I
 
M
A
 
A
R
 
Q
A
 
L
S
 
T
A
 
G
R
 
R
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
L
 
M
S
 
V
Q
 
K
K
 
D
G
 
D
I
 
L
T
 
K
T
 
P
R
 
S
E
 
E
I
 
I
L
 
M
T
 
T
D
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
R
V
 
T
H
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
Q
 
R
A
 
V
G
 
G
C
 
I
H
 
D
I
 
L
P
 
-
T
 
S
V
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
W
I
 
D
R
 
R
I
 
C
N
 
G
K
 
R
R
 
D
V
 
V
P
 
P
R
 
T
L
 
I
V
 
V
S
 
N
V
 
L
L
 
M
P
 
P
N
 
S
G
 
G
P
 
K
V
 
Y
Y
 
L
H
 
M
P
 
E
T
 
E
V
 
F
N
 
-
A
 
-
F
 
F
M
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
V
V
 
V
M
 
L
L
 
K
H
 
R
L
 
L
R
 
G
S
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
E
 
K
D
 
D
V
 
A
M
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
E
T
 
T
L
 
V
K
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
W
 
-
W
 
W
E
 
D
H
 
E
S
 
V
E
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
K
E
 
D
Q
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
W
D
 
N
E
 
E
V
 
D
I
 
V
M
 
I
S
 
L
P
 
P
Q
 
A
Q
 
E
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
S
 
S
T
 
S
-
 
G
-
 
G
I
 
I
T
 
V
F
 
V
P
 
L
V
 
R
G
 
G
N
 
N
I
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
G
S
 
A
V
 
V
I
 
L
K
 
K
S
 
P
T
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
S
P
 
P
S
 
H
M
 
L
I
 
L
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
Y
 
V
H
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
R
A
 
A
K
 
V
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
D
S
 
D
E
 
Y
K
 
K
S
 
A
A
 
K
I
 
I
Y
 
N
D
 
D
I
 
D
K
 
N
H
 
L
D
 
D
K
 
-
I
 
I
K
 
D
A
 
E
G
 
N
D
 
C
I
 
I
L
 
M
V
 
V
I
 
M
I
 
K
G
 
N
V
 
C
G
 
G
P
 
P
S
 
K
G
 
G
T
 
Y
-
 
P
G
 
G
M
 
M
E
 
A
E
|
E
T
 
V
Y
 
G
Q
 
N
V
 
M
T
 
G
S
 
L
A
 
P
L
 
P
K
 
K
H
 
V
L
 
L
S
 
K
Y
 
K
G
 
G
-
 
I
K
 
L
H
 
D
V
 
M
S
 
V
L
 
R
I
 
I
T
 
S
D
 
D
A
 
A
R
 
R
F
 
M
S
 
A
G
 
G
V
 
T
S
 
A
T
 
Y
G
 
G
A
 
T
C
 
V
I
 
V
G
 
L
H
 
H
V
 
T
G
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
L
G
 
A
K
 
V
L
 
V
R
 
K
T
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
M
I
 
I
E
 
E
I
 
L
K
 
D
I
 
V
D
 
P
C
 
N
R
 
R
E
 
R
L
 
L
H
 
H
G
 
L
E
 
D
V
 
I
N
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
A
T
 
R
A
 
R
I
 
L
L
 
A
N
 
E
A
 
W
R
 
Q
P
 
P
S
 
N
H
 
H

8epzA Crystal structure of fe-s cluster-dependent dehydratase from paralcaligenes ureilyticus in complex with mn
31% identity, 82% coverage: 58:597/655 of query aligns to 11:524/569 of 8epzA

query
sites
8epzA
E
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
I
 
F
L
 
I
L
 
Y
L
 
R
S
 
S
T
 
W
L
 
M
G
 
K
G
 
N
L
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Q
-
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
-
L
 
I
A
 
G
L
 
I
H
 
C
Q
 
N
G
 
T
H
 
F
Y
 
S
E
 
E
L
 
L
-
 
T
-
 
P
-
x
C
D
 
N
I
 
S
Q
 
H
M
 
F
K
 
R
A
 
T
A
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
V
K
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
W
A
 
E
N
 
S
H
 
G
A
 
G
L
 
F
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
V
 
F
Y
 
P
V
 
V
S
 
M
D
 
S
P
 
L
C
 
G
D
x
E
G
 
T
R
 
M
T
 
L
Q
 
R
G
 
P
T
 
T
T
 
A
G
 
M
M
 
L
F
 
F
D
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
R
N
 
N
D
 
L
A
 
A
S
 
S
M
 
M
V
 
D
M
 
V
R
 
E
R
 
E
L
 
S
I
 
I
R
 
R
S
 
G
L
 
N
P
 
P
D
 
-
A
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
L
V
 
L
A
 
M
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
G
 
T
L
 
T
P
 
P
A
 
S
T
 
L
M
 
M
M
 
M
A
 
G
L
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
H
 
C
N
 
D
I
 
L
A
 
P
T
 
T
V
 
I
L
 
G
V
 
V
P
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
P
T
 
M
L
 
L
P
 
S
A
 
G
K
 
K
-
 
F
D
 
R
G
 
G
E
 
R
D
 
E
N
 
L
G
 
G
K
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
D
V
 
V
Q
x
W
T
 
K
I
 
M
G
 
S
A
 
E
R
 
E
F
 
V
A
 
R
N
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
M
S
 
S
L
 
Q
Q
 
E
D
 
E
A
 
F
R
 
F
R
 
E
A
 
A
G
 
-
C
 
-
K
 
E
A
 
S
C
 
C
A
 
M
-
 
H
S
 
R
S
 
S
G
 
H
G
 
G
G
x
H
C
|
C
Q
 
M
F
 
T
L
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
S
T
 
T
S
 
M
Q
 
A
V
 
S
V
 
M
A
 
V
E
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
S
I
 
L
P
 
P
H
 
G
S
 
N
A
 
A
L
 
A
A
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
V
E
 
D
P
 
A
V
 
R
W
 
R
R
 
N
E
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
G
R
 
R
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
L
 
M
S
 
V
Q
 
K
K
 
D
G
 
D
I
 
L
T
 
V
T
 
M
R
 
S
E
 
K
I
 
I
L
 
L
T
 
T
D
 
R
K
 
Q
A
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
R
V
 
V
H
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
G
Q
 
R
A
 
I
G
 
G
C
 
V
H
 
D
I
 
L
P
 
-
T
 
T
V
 
L
D
 
A
D
 
D
W
 
W
I
 
D
R
 
A
I
 
L
N
 
G
K
 
H
R
 
K
V
 
L
P
 
P
R
 
C
L
 
L
V
 
V
S
 
D
V
 
L
L
 
Q
P
 
P
N
 
S
G
 
G
P
 
-
V
 
-
Y
 
T
H
 
H
P
 
L
T
 
M
V
 
E
N
 
D
A
 
F
F
 
Y
M
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
A
V
 
V
M
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
I
R
 
R
S
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
D
L
 
V
L
 
I
H
 
A
E
 
R
D
 
D
V
 
A
M
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
N
G
 
G
S
 
Q
T
 
T
L
 
L
K
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
W
 
-
W
 
W
E
 
D
H
 
N
S
 
C
E
 
K
R
 
D
R
 
A
Q
 
P
R
 
N
F
 
W
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
N
Q
 
R
E
 
E
Q
 
V
I
 
I
N
 
H
A
 
A
D
 
-
E
 
-
V
 
-
I
 
F
M
 
N
S
 
E
P
 
P
Q
 
F
Q
 
K
A
 
T
K
 
E
A
 
A
R
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
G
I
 
I
T
 
A
F
 
V
P
 
L
V
 
R
G
 
G
N
 
N
I
 
L
A
 
C
P
 
P
E
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
K
S
 
P
T
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
T
P
 
P
S
 
A
M
 
L
I
 
L
D
 
K
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
R
A
 
A
K
 
V
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
S
 
N
E
 
S
K
 
E
S
 
H
A
 
M
I
 
H
Y
 
E
D
 
R
I
 
M
K
 
D
H
 
D
D
 
E
K
 
N
I
 
L
K
 
D
A
 
V
G
 
D
D
 
E
-
 
N
-
 
C
I
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
L
I
 
K
G
 
N
V
 
C
G
 
G
P
 
P
S
 
R
G
 
G
T
 
Y
-
 
P
G
 
G
M
 
M
E
 
A
E
|
E
T
 
A
Y
 
G
Q
 
N
V
 
M
T
 
P
S
 
L
A
 
P
L
 
P
K
 
K
H
 
I
L
 
L
S
 
R
Y
 
K
G
 
G
-
 
I
K
 
T
H
 
D
V
 
M
S
 
V
L
 
R
I
 
V
T
 
S
D
 
D
A
 
A
R
 
R
F
 
M
S
|
S
G
 
G
V
 
T
S
 
A
T
 
Y
G
 
G
A
 
T
C
 
V
I
 
V
G
 
L
H
 
H
V
 
V
G
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
L
G
 
A
K
 
L
L
 
V
R
 
Q
T
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
L
K
 
D
I
 
V
D
 
A
C
 
A
R
 
R
E
 
K
L
 
L
H
 
H
G
 
L
E
 
H
V
 
V
N
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
S
 
R
Q
 
R
E
 
R
E
 
E
A
 
A

5oynA Crystal structure of d-xylonate dehydratase in holo-form (see paper)
31% identity, 66% coverage: 155:588/655 of query aligns to 119:542/589 of 5oynA

query
sites
5oynA
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
L
V
 
T
A
 
T
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
G
 
T
L
 
T
P
 
P
A
 
A
T
 
G
M
 
I
M
 
M
A
 
A
L
 
-
A
 
A
A
 
T
Q
 
T
H
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
P
T
 
A
V
 
I
L
 
V
V
 
L
P
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
P
A
 
M
K
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
W
D
 
H
N
 
E
G
 
N
K
 
E
V
 
L
Q
 
V
T
 
G
I
 
S
G
 
G
A
 
T
-
 
V
-
 
I
-
 
W
-
 
R
-
 
S
-
 
R
-
 
R
R
 
K
F
 
L
A
 
A
N
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
T
L
 
E
Q
 
E
D
 
E
-
 
F
A
 
I
R
 
D
R
 
R
A
 
A
G
 
A
C
 
-
K
 
-
A
 
S
C
 
S
A
 
A
S
 
P
S
 
S
G
 
A
G
 
G
G
x
H
C
|
C
Q
 
N
F
 
T
L
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
S
T
 
T
S
 
M
Q
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
S
I
 
L
P
 
T
H
 
G
S
 
C
A
 
A
L
 
A
A
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
P
E
 
Y
P
 
R
V
 
E
W
 
R
R
 
G
E
 
Q
I
 
M
A
 
A
R
 
Y
A
 
K
S
 
T
A
 
G
R
 
Q
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
D
L
 
L
S
 
A
Q
 
Y
K
 
D
G
 
D
I
 
V
T
 
K
T
 
P
R
 
L
E
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
D
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
A
V
 
L
H
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
Q
L
 
P
H
 
H
I
 
I
P
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
A
H
 
R
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
C
 
V
H
 
E
I
 
I
P
 
-
T
 
T
V
 
A
D
 
D
D
 
D
W
 
W
I
 
-
R
 
R
I
 
A
N
 
A
K
 
Y
R
 
D
V
 
I
P
 
P
R
 
L
L
 
I
V
 
V
S
 
N
V
 
M
L
 
Q
P
 
P
N
 
A
G
 
G
P
 
K
V
 
Y
Y
 
L
H
 
G
P
 
E
T
 
R
V
 
F
N
 
H
A
 
-
F
 
-
M
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
A
P
 
P
E
 
A
V
 
V
M
 
L
L
 
W
H
 
E
L
 
L
R
 
L
S
 
Q
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
L
 
L
H
 
H
E
 
G
D
 
D
V
 
V
M
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
K
T
 
T
L
 
M
K
 
S
E
 
E
N
 
N
L
 
L
D
 
Q
W
 
G
W
 
R
E
 
E
H
 
T
S
 
S
E
 
D
R
 
R
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
V
I
 
I
M
 
F
S
 
P
P
 
Y
Q
 
H
Q
 
E
A
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
I
 
-
T
 
-
F
 
-
P
 
K
V
 
A
G
 
G
N
 
F
I
 
L
A
 
V
P
 
L
E
 
K
G
 
G
S
 
N
V
 
L
I
 
F
K
 
D
S
 
F
T
 
A
A
 
I
I
 
M
D
 
K
P
 
S
S
 
S
M
 
V
I
 
I
D
 
G
E
 
E
Q
 
E
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
F
A
 
R
K
 
K
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
A
K
 
R
S
 
A
A
 
I
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
I
 
G
K
 
S
H
 
D
D
 
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
L
K
 
E
I
 
I
K
 
D
A
 
E
G
 
R
D
 
C
I
 
I
L
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
R
G
 
G
V
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
I
G
 
G
-
 
W
T
 
P
G
 
G
M
 
S
E
 
A
E
|
E
T
 
V
Y
 
V
Q
 
N
V
 
M
T
 
Q
S
 
P
A
 
P
L
 
-
K
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
L
Y
 
K
G
 
K
K
 
G
H
 
I
V
 
M
S
 
S
L
 
L
I
 
P
T
 
T
-
 
L
-
 
G
D
 
D
A
 
G
R
 
R
F
 
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
T
S
 
A
T
 
D
G
 
S
A
 
P
C
 
S
I
 
I
G
 
L
H
 
N
V
 
A
G
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
A
A
 
I
G
 
G
G
 
G
P
 
G
I
 
L
G
 
S
K
 
W
L
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
T
I
 
I
E
 
R
I
 
I
K
 
D
I
 
L
D
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
R
C
 
C
R
 
D
E
 
A
L
 
L
H
 
V
G
 
D
E
 
E
V
 
A
N
 
T
F
 
I
L
 
A
G
 
A
T
 
R
R
 
K
S
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9A9Z2 D-xylonate dehydratase; XyDHT; Gluconate dehydratase; EC 4.2.1.82; EC 4.2.1.39 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see 2 papers)
31% identity, 66% coverage: 155:588/655 of query aligns to 125:548/595 of Q9A9Z2

query
sites
Q9A9Z2
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
L
V
 
T
A
 
T
S
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
G
 
T
L
 
T
P
 
P
A
 
A
T
 
G
M
 
I
M
 
M
A
 
A
L
 
-
A
 
A
A
 
T
Q
 
T
H
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
P
T
 
A
V
 
I
L
 
V
V
 
L
P
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
P
A
 
M
K
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
W
D
 
H
N
 
E
G
 
N
K
 
E
V
 
L
Q
 
V
T
 
G
I
 
S
G
 
G
A
 
T
-
 
V
-
 
I
-
 
W
-
 
R
-
 
S
-
 
R
-
 
R
R
 
K
F
 
L
A
 
A
N
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
T
L
 
E
Q
 
E
D
 
E
-
 
F
A
 
I
R
 
D
R
 
R
A
 
A
G
 
A
C
 
-
K
 
-
A
 
S
C
 
S
A
 
A
S
 
P
S
 
S
G
 
A
G
 
G
G
 
H
C
|
C
Q
 
N
F
 
T
L
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
S
T
 
T
S
 
M
Q
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
S
I
 
L
P
 
T
H
 
G
S
 
C
A
 
A
L
 
A
A
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
P
E
 
Y
P
 
R
V
 
E
W
 
R
R
 
G
E
 
Q
I
 
M
A
 
A
R
 
Y
A
 
K
S
 
T
A
 
G
R
 
Q
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
D
L
 
L
S
 
A
Q
 
Y
K
 
D
G
 
D
I
 
V
T
 
K
T
 
P
R
 
L
E
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
D
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
A
V
 
L
H
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
L
 
A
L
 
Q
L