SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 208271 MicrobesOnline__882:208271 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7ev5A Crystal structure of bleg-1 b3 metallo-beta-lactamase (see paper)
37% identity, 96% coverage: 4:203/208 of query aligns to 3:207/209 of 7ev5A

query
sites
7ev5A
K
 
K
T
 
Q
F
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
T
 
T
N
 
N
C
 
A
H
 
Y
L
 
V
V
 
L
H
 
Y
N
 
N
G
 
D
-
 
D
R
 
K
T
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
F
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
D
P
 
A
R
 
E
P
 
A
V
 
L
L
 
I
N
 
T
Y
 
W
L
 
L
E
 
K
M
 
R
Q
 
E
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
L
 
P
T
 
L
H
 
A
I
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
F
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
I
Y
 
G
G
 
A
N
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
R
A
 
D
A
 
T
T
 
F
G
 
S
A
 
I
P
 
P
I
 
V
-
 
Y
L
 
L
A
 
H
S
 
T
A
 
K
G
 
E
D
 
R
A
 
H
F
 
W
L
 
L
R
 
E
Q
 
D
T
 
P
E
 
A
L
 
L
-
 
N
G
 
G
K
 
S
G
 
S
G
 
R
A
 
L
F
 
T
G
 
G
F
 
R
P
 
P
A
 
I
V
 
T
D
 
T
D
 
A
F
 
K
T
 
P
S
 
A
I
 
D
D
 
H
L
 
L
E
 
L
P
 
T
G
 
N
E
 
E
H
 
K
R
 
S
F
 
L
-
 
T
-
 
I
G
 
G
D
 
T
L
 
F
A
 
T
C
 
F
T
 
S
A
 
V
F
 
F
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
V
S
 
S
F
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
P
 
Q
E
 
K
E
 
E
D
 
A
T
 
V
I
 
L
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
V
I
 
L
F
 
F
Y
 
Q
R
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
L
P
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
H
E
 
T
K
 
L
L
 
L
R
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
I
R
 
H
D
 
N
H
 
K
I
 
I
F
 
L
T
 
P
L
 
L
P
 
P
G
 
E
K
 
R
T
 
T
R
 
I
I
 
V
L
 
A
P
 
S
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
L
T
 
T
S
 
T
V
 
I
D
 
G
D
 
Q
E
 
E
T
 
M
R
 
D
N
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
L

2zwrB Crystal structure of ttha1623 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:203/208 of query aligns to 1:200/207 of 2zwrB

query
sites
2zwrB
I
 
M
K
 
R
T
 
V
F
 
F
P
 
P
-
 
V
-
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
T
 
E
N
 
N
C
 
A
H
 
Y
L
 
L
V
 
V
H
 
E
N
 
T
G
 
G
R
 
E
T
 
G
A
 
P
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
D
A
 
E
P
 
P
R
 
E
P
 
K
V
 
L
L
 
L
N
 
A
Y
 
L
L
 
F
E
 
Q
M
 
T
Q
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
I
L
 
P
T
 
L
H
 
A
I
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
F
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
G
G
 
A
N
 
V
A
 
A
A
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
L
G
 
D
A
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
Y
A
 
L
S
 
H
A
 
P
G
 
L
D
 
D
A
 
L
F
 
P
L
 
L
R
 
Y
Q
 
E
T
 
G
E
 
A
L
 
D
G
 
L
K
 
A
G
 
A
G
 
R
A
 
A
F
 
W
G
 
G
F
 
L
P
 
A
A
 
I
V
 
P
D
 
K
D
 
P
F
 
P
T
 
L
S
 
P
I
 
V
D
 
R
-
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
M
H
 
R
R
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
F
T
 
Q
A
 
V
F
 
L
A
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
L
 
V
S
 
A
F
 
F
Y
 
Y
F
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
G
D
 
A
T
 
Q
I
 
V
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
L
I
 
L
F
 
F
Y
 
R
R
 
G
S
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
F
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
P
E
 
K
K
 
A
L
 
L
R
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
L
R
 
K
D
 
-
H
 
R
I
 
L
F
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
G
T
 
T
S
 
T
V
 
L
D
 
G
D
 
L
E
 
E
T
 
A
R
 
R
N
 
T
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
L

2zziA Crystal structure of ttha1623 in a di-iron-bound form (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:203/208 of query aligns to 6:198/198 of 2zziA

query
sites
2zziA
L
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
T
 
E
N
 
N
C
 
A
H
 
Y
L
 
L
V
 
V
H
 
E
N
 
T
G
 
G
R
 
E
T
 
G
A
 
P
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
D
A
 
E
P
 
P
R
 
E
P
 
K
V
 
L
L
 
L
N
 
A
Y
 
L
L
 
F
E
 
Q
M
 
T
Q
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
I
L
 
P
T
 
L
H
 
A
I
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
F
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
G
G
 
A
N
 
V
A
 
A
A
 
P
L
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
L
G
 
D
A
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
Y
A
 
L
S
 
H
A
 
P
G
 
L
D
 
D
A
 
L
F
 
P
L
 
L
R
 
Y
Q
 
E
T
 
G
E
 
A
L
 
D
G
 
L
K
 
A
G
 
A
G
 
R
A
 
A
F
 
W
G
 
G
F
 
L
P
 
A
A
 
I
V
 
P
D
 
K
D
 
P
F
 
P
T
 
L
S
 
P
I
 
V
D
 
R
-
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
G
 
G
E
 
M
H
 
R
R
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
F
T
 
Q
A
 
V
F
 
L
A
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
L
 
V
S
 
A
F
 
F
Y
 
Y
F
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
G
D
 
A
T
 
Q
I
 
V
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
L
I
 
L
F
 
F
Y
 
R
R
 
G
S
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
F
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
P
E
 
K
K
 
A
L
 
L
R
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
L
R
 
K
D
 
-
H
 
R
I
 
L
F
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
G
T
 
T
S
 
T
V
 
L
D
 
G
D
 
L
E
 
E
T
 
A
R
 
R
N
 
T
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
L

7l0bA Crystal structure of hydroxyacyl glutathione hydrolase (glob) from staphylococcus aureus, apoenzyme (see paper)
36% identity, 96% coverage: 1:199/208 of query aligns to 2:197/202 of 7l0bA

query
sites
7l0bA
M
 
M
P
 
R
I
 
I
K
 
S
T
 
S
F
 
L
P
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
L
L
 
V
E
 
D
T
 
T
N
 
N
C
 
T
H
 
Y
L
 
F
V
 
I
H
 
E
N
 
N
G
 
D
R
 
K
T
 
A
A
 
V
V
 
I
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
S
R
 
E
P
 
K
V
 
I
L
 
I
N
 
K
Y
 
K
L
 
L
E
 
N
M
 
Q
Q
 
I
G
 
N
L
 
K
T
 
P
L
 
L
T
 
K
H
 
A
I
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
F
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
I
Y
 
G
G
 
A
N
 
V
A
 
D
A
 
D
L
 
I
A
 
V
A
 
D
A
 
R
T
 
F
G
 
D
A
 
V
P
 
P
I
 
V
-
 
Y
L
 
M
A
 
H
S
 
E
A
 
A
G
 
E
D
 
F
A
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
T
 
P
E
 
-
L
 
-
G
 
V
K
 
K
G
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
D
G
 
K
F
 
L
P
 
P
A
 
I
V
 
T
D
 
S
D
 
K
F
 
V
T
 
T
S
 
P
I
 
E
D
 
K
L
 
L
E
 
N
P
 
E
G
 
G
E
 
S
H
 
T
R
 
E
F
 
I
G
 
E
D
 
G
L
 
F
A
 
K
C
 
F
T
 
N
A
 
V
F
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
T
F
 
Y
Y
 
V
F
 
F
P
 
D
E
 
E
E
 
-
D
 
-
T
 
F
I
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
G
D
|
D
L
 
T
I
 
L
F
 
F
Y
 
N
R
 
N
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
L
P
 
Y
G
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
Y
E
 
E
K
 
T
L
 
L
R
 
V
A
 
D
S
 
S
V
 
I
R
 
Q
D
 
D
H
 
K
I
 
I
F
 
F
T
 
E
L
 
L
P
 
E
G
 
G
K
 
D
T
 
L
R
 
P
I
 
L
L
 
F
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
Y
T
 
T
S
 
T
V
 
V
D
 
D
D
 
D
E
 
E
T
 
Q
R
 
L
N
 
N

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
31% identity, 99% coverage: 1:205/208 of query aligns to 1:210/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
M
 
M
P
 
N
I
 
Y
K
 
R
T
 
I
F
 
I
P
 
P
L
 
V
G
 
T
P
 
A
L
 
F
E
 
S
T
 
Q
N
 
N
C
 
C
H
 
S
L
 
L
V
 
I
-
 
W
-
 
C
H
 
E
N
 
Q
G
 
T
R
 
R
T
 
L
A
 
A
V
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
D
P
 
A
R
 
E
P
 
K
V
 
I
L
 
K
N
 
Q
Y
 
E
L
 
V
E
 
D
M
 
A
Q
 
S
G
 
G
L
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
M
H
 
Q
I
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
 
H
L
 
G
H
 
H
F
 
L
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
G
G
 
A
N
 
A
A
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
H
T
 
Y
G
 
G
A
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
I
A
 
G
-
 
P
S
 
E
A
 
K
G
 
E
D
 
D
A
 
E
F
 
F
L
 
W
R
 
L
Q
 
Q
T
 
G
E
 
L
L
 
P
G
 
A
K
 
Q
G
 
S
G
 
R
A
 
M
F
 
F
G
 
G
F
 
L
P
 
D
A
 
E
V
 
C
D
 
Q
D
 
P
F
 
L
T
 
T
-
 
P
S
 
D
I
 
R
D
 
W
L
 
L
E
 
N
P
 
D
G
 
G
E
 
D
H
 
R
-
 
V
R
 
S
F
 
V
G
 
G
D
 
N
L
 
V
A
 
T
C
 
L
T
 
Q
A
 
V
F
 
L
A
 
H
T
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
H
L
 
V
S
 
V
F
 
F
Y
 
F
F
 
D
P
 
E
E
 
Q
E
 
S
D
 
Q
T
 
L
I
 
L
I
 
I
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
V
I
 
I
F
 
F
Y
 
K
R
 
G
S
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
R
G
 
G
D
 
D
L
 
H
E
 
T
K
 
Q
L
 
L
R
 
I
A
 
D
S
 
A
V
 
I
R
 
K
D
 
R
H
 
K
I
 
L
F
 
L
T
 
P
L
 
L
P
 
G
G
 
D
K
 
D
T
 
V
R
 
T
I
 
F
L
 
I
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
L
T
 
S
S
 
T
V
 
L
D
 
G
D
 
Y
E
 
E
T
 
R
R
 
L
N
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
L
G
 
Q
D
 
D

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
34% identity, 87% coverage: 22:201/208 of query aligns to 24:188/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
R
 
R
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
V
P
 
L
R
 
E
P
 
Q
V
 
V
L
 
D
N
 
R
Y
 
D
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
Q
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
D
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
T
H
 
H
I
 
V
L
 
F
N
 
D
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
I
Y
 
T
G
 
A
N
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
Q
A
 
A
P
 
T
I
 
V
L
 
V
A
 
G
S
 
S
A
 
V
G
 
N
D
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
C
R
 
A
Q
 
N
T
 
V
E
 
Q
L
 
V
G
 
R
K
 
H
G
 
G
G
 
D
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
E
H
 
V
R
 
R
F
 
V
G
 
G
D
 
Q
L
 
L
A
 
V
C
 
F
T
 
Q
A
 
V
F
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
D
S
 
S
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
Y
 
L
F
 
L
P
 
G
E
 
-
E
 
-
D
 
D
T
 
R
I
 
V
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
I
 
L
F
 
L
Y
 
V
R
 
R
S
 
G
I
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
N
G
 
G
D
 
N
L
 
A
E
 
S
K
 
Q
L
 
L
R
 
Y
A
 
D
S
 
S
V
 
L
R
 
T
D
 
R
H
 
V
I
 
L
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
D
K
 
E
T
 
T
R
 
L
I
 
V
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
R
P
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
S
V
 
I
D
 
A
D
 
E
E
 
E
T
 
K
R
 
R
N
 
H
N
 
N
P
 
P

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
34% identity, 89% coverage: 19:203/208 of query aligns to 43:215/254 of O95571

query
sites
O95571
H
 
R
N
 
E
G
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
-
x
L
G
 
E
G
 
T
A
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
D
V
 
A
L
 
Q
N
 
L
Y
 
I
L
 
K
E
 
E
M
 
L
Q
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
R
L
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
A
L
 
V
N
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
 
H
F
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
N
 
S
A
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
S
A
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
L
L
 
L
A
 
P
S
 
G
A
 
C
G
 
Q
D
 
S
A
 
V
F
 
I
L
 
S
R
 
R
Q
 
L
T
 
S
E
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
A
F
 
Q
G
 
A
F
 
D
P
 
L
A
 
H
V
 
I
D
 
E
D
 
D
F
 
G
T
 
D
S
 
S
I
 
I
D
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
R
 
R
F
 
F
G
 
G
D
 
R
L
 
F
A
 
A
C
 
L
T
 
E
A
 
T
F
 
R
A
 
A
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
C
L
 
V
S
 
T
F
 
F
Y
 
V
F
 
L
P
 
N
E
 
D
E
 
H
D
 
S
T
 
M
I
 
A
I
 
F
V
x
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
I
 
L
F
 
L
Y
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
|
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
L
 
A
E
 
K
K
 
T
L
 
L
R
 
Y
A
 
H
S
 
S
V
 
V
R
 
H
D
 
E
H
 
K
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
G
K
 
D
T
 
C
R
 
L
I
 
I
L
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
x
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
G
-
 
F
P
 
T
A
 
V
T
 
S
S
 
T
V
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
E
T
 
R
R
 
T
N
 
L
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
F
 
L

Sites not aligning to the query:

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
35% identity, 88% coverage: 20:201/208 of query aligns to 28:197/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
N
 
E
G
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
-
 
L
G
 
E
G
 
T
A
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
D
V
 
A
L
 
Q
N
 
L
Y
 
I
L
 
K
E
 
E
M
 
L
Q
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
R
L
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
A
L
 
V
N
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
N
 
S
A
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
S
A
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
L
L
 
L
A
 
P
S
 
G
A
 
C
G
 
Q
D
 
S
A
 
V
F
 
I
L
 
S
R
 
R
Q
 
L
T
 
S
E
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
A
F
 
Q
G
 
A
F
 
D
P
 
L
A
 
H
V
 
I
D
 
E
D
 
D
F
 
G
T
 
D
S
 
S
I
 
I
D
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
R
 
R
F
 
F
G
 
G
D
 
R
L
 
F
A
 
A
C
 
L
T
 
E
A
 
T
F
 
R
A
 
A
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
C
L
 
V
S
 
T
F
 
F
Y
 
V
F
 
L
P
 
N
E
 
D
E
 
H
D
 
S
T
 
M
I
 
A
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
I
 
L
F
 
L
Y
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
L
 
A
E
 
K
K
 
T
L
 
L
R
 
Y
A
 
H
S
 
S
V
 
V
R
 
H
D
 
E
H
 
K
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
G
K
 
D
T
 
C
R
 
L
I
 
I
L
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
G
-
 
F
P
 
T
A
 
V
T
 
S
S
 
T
V
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
E
T
 
R
R
 
T
N
 
L
N
 
N
P
 
P

5ve5A Crystal structure of persulfide dioxygenase rhodanese fusion protein with rhodanese domain inactivating mutation (c314s) from burkholderia phytofirmans in complex with glutathione (see paper)
33% identity, 88% coverage: 22:204/208 of query aligns to 27:197/350 of 5ve5A

query
sites
5ve5A
R
|
R
T
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
-
 
F
G
 
E
A
 
Q
P
 
V
R
 
R
P
 
R
V
 
D
L
 
A
N
 
A
Y
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
H
L
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
T
L
 
I
N
 
D
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
N
 
A
A
 
W
A
 
M
L
 
L
A
 
N
A
 
R
A
 
R
T
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
R
I
 
I
L
 
A
A
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
S
G
 
G
F
 
A
P
 
E
A
 
G
V
 
A
D
 
D
D
 
R
F
 
Y
T
 
L
S
 
S
I
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
H
P
 
G
G
 
D
E
 
K
H
 
V
R
 
E
F
 
F
G
 
G
D
 
T
L
 
R
A
 
Y
C
 
L
T
 
T
A
 
V
F
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
G
S
 
C
L
 
I
S
 
T
F
 
L
Y
 
V
F
 
L
P
 
D
E
 
N
E
 
E
D
 
T
T
 
M
I
 
A
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
C
I
 
L
F
 
L
Y
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
T
G
|
G
R
|
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
R
G
 
G
D
 
D
L
 
A
E
 
H
K
 
T
L
 
M
R
 
F
A
 
R
S
 
A
V
 
V
R
 
H
D
 
G
H
 
Q
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
T
K
 
A
T
 
C
R
 
L
I
 
L
L
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
-
x
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
L
P
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
S
V
 
V
D
 
G
D
 
E
E
 
E
T
 
R
R
 
R
N
 
F
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
F
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2gcuA X-ray structure of gene product from arabidopsis thaliana at1g53580 (see paper)
31% identity, 88% coverage: 19:201/208 of query aligns to 25:201/244 of 2gcuA

query
sites
2gcuA
H
 
H
N
 
P
G
 
D
R
 
K
T
 
P
A
 
A
V
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
V
P
 
D
R
 
K
P
 
T
V
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
D
L
 
L
N
 
K
Y
 
L
L
 
I
E
 
D
M
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
L
T
 
I
H
 
Y
I
 
A
L
 
M
N
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
N
 
T
A
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
-
A
 
-
T
 
T
G
 
K
A
 
L
P
 
P
I
 
G
L
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
V
G
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
I
R
 
S
Q
 
K
T
 
A
E
 
S
L
 
G
G
 
S
K
 
K
G
 
A
G
 
D
A
 
L
F
 
F
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
-
D
 
-
L
 
L
E
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
D
H
 
K
-
 
V
R
 
S
F
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
I
A
 
Y
C
 
L
T
 
E
A
 
V
F
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
S
 
C
L
 
V
S
 
T
F
 
Y
Y
 
V
F
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
P
 
P
E
 
Q
E
 
P
D
 
R
T
 
M
I
 
A
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
I
 
V
F
 
L
Y
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
S
E
 
D
K
 
Q
L
 
L
R
 
Y
A
 
E
S
 
S
V
 
V
R
 
H
D
 
S
H
 
Q
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
K
K
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
I
L
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
F
P
 
E
A
 
V
T
 
S
S
 
T
V
 
V
D
 
G
D
 
E
E
 
E
T
 
M
R
 
Q
N
 
H
N
 
N
P
 
P

Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
31% identity, 88% coverage: 19:201/208 of query aligns to 74:250/294 of Q9C8L4

query
sites
Q9C8L4
H
 
H
N
 
P
G
 
D
R
 
K
T
 
P
A
 
A
V
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
V
P
 
D
R
 
K
P
 
T
V
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
D
L
 
L
N
 
K
Y
 
L
L
 
I
E
 
D
M
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
L
T
 
I
H
 
Y
I
 
A
L
 
M
N
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
F
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
N
 
T
A
 
G
A
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
-
A
 
-
T
 
T
G
 
K
A
 
L
P
 
P
I
 
G
L
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
V
G
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
I
R
 
S
Q
 
K
T
 
A
E
 
S
L
 
G
G
 
S
K
 
K
G
 
A
G
 
D
A
 
L
F
 
F
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
-
D
 
-
L
 
L
E
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
D
H
 
K
-
 
V
R
 
S
F
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
I
A
 
Y
C
 
L
T
 
E
A
 
V
F
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
S
 
C
L
 
V
S
 
T
F
 
Y
Y
 
V
F
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
P
 
P
E
 
Q
E
 
P
D
 
R
T
 
M
I
 
A
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
I
 
V
F
 
L
Y
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
S
E
 
D
K
 
Q
L
 
L
R
 
Y
A
 
E
S
 
S
V
 
V
R
 
H
D
 
S
H
 
Q
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
K
K
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
I
L
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
F
P
 
E
A
 
V
T
 
S
S
 
T
V
 
V
D
 
G
D
 
E
E
 
E
T
 
M
R
 
Q
N
 
H
N
 
N
P
 
P

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
34% identity, 90% coverage: 1:187/208 of query aligns to 1:169/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
M
 
M
P
 
Q
I
 
I
K
 
E
T
 
L
F
 
V
P
 
P
L
 
C
G
 
-
P
 
-
L
 
L
E
 
K
T
 
D
N
 
N
-
 
Y
C
 
A
H
 
Y
L
 
I
V
 
L
H
 
H
N
 
D
G
 
E
R
 
D
T
 
T
A
 
G
V
 
T
V
 
V
-
 
G
-
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
E
A
 
A
P
 
-
R
 
E
P
 
P
V
 
I
L
 
I
N
 
D
Y
 
S
L
 
L
E
 
K
M
 
R
Q
 
S
G
 
G
L
 
R
T
 
N
L
 
L
T
 
T
H
 
Y
I
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
F
 
Y
D
|
D
H
|
H
I
 
T
Y
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
D
A
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
K
I
 
V
L
 
I
A
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
M
D
 
D
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
K
F
 
D
G
 
R
F
 
I
P
 
P
A
 
G
V
 
I
D
 
D
D
 
-
F
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
M
D
 
A
L
 
L
E
 
K
P
 
D
G
 
G
E
 
D
H
 
K
-
 
W
R
 
M
F
 
F
G
 
A
D
 
G
L
 
H
A
 
E
C
 
V
T
 
H
A
 
V
F
 
M
A
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
H
L
 
I
S
 
S
F
 
L
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
E
 
G
E
 
S
D
 
R
T
 
A
I
 
I
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
T
I
 
M
F
 
F
Y
 
S
R
 
L
S
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
-
D
 
-
F
 
L
P
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
L
 
P
E
 
K
K
 
Q
L
 
M
R
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
L
R
 
Q
D
 
-
H
 
K
I
 
I
F
 
T
T
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
D
K
 
D
T
 
T
R
 
S
I
 
I
L
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
35% identity, 79% coverage: 23:187/208 of query aligns to 94:239/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
T
 
T
A
 
V
V
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
E
A
 
A
P
 
-
R
 
E
P
 
P
V
 
I
L
 
I
N
 
D
Y
 
S
L
 
L
E
 
K
M
 
R
Q
 
S
G
 
G
L
 
R
T
 
N
L
 
L
T
 
T
H
 
Y
I
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
F
 
Y
D
|
D
H
|
H
I
 
T
Y
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
D
A
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
K
I
 
V
L
 
I
A
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
M
D
 
D
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
K
F
 
D
G
 
R
F
 
I
P
 
P
A
 
G
V
 
I
D
 
D
D
 
-
F
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
M
D
 
A
L
 
L
E
 
K
P
 
D
G
 
G
E
 
D
H
 
K
-
 
W
R
 
M
F
 
F
G
 
A
D
 
G
L
 
H
A
 
E
C
 
V
T
 
H
A
 
V
F
 
M
A
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
H
L
 
I
S
 
S
F
 
L
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
E
 
G
E
 
S
D
 
R
T
 
A
I
 
I
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
T
I
 
M
F
 
F
Y
 
S
R
 
L
S
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
-
D
 
-
F
 
L
P
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
L
 
P
E
 
K
K
 
Q
L
 
M
R
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
L
R
 
Q
D
 
-
H
 
K
I
 
I
F
 
T
T
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
D
K
 
D
T
 
T
R
 
S
I
 
I
L
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H

4yslA Crystal structure of sdoa from pseudomonas putida in complex with glutathione (see paper)
32% identity, 81% coverage: 20:187/208 of query aligns to 45:212/294 of 4yslA

query
sites
4yslA
N
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
A
 
C
V
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
P
 
S
G
 
A
G
 
S
A
 
A
P
 
D
R
 
R
P
 
L
V
 
V
L
 
E
N
 
R
Y
 
V
L
 
N
E
 
E
M
 
L
Q
 
N
G
 
A
L
 
-
T
 
S
L
 
V
T
 
R
H
 
W
I
 
V
L
 
L
N
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
F
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
Y
 
S
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
H
S
 
T
A
 
A
G
 
I
D
 
G
A
 
A
F
 
H
L
 
I
R
 
T
Q
 
Q
T
 
V
E
 
Q
L
 
K
G
 
V
K
 
F
G
 
G
G
 
A
A
 
L
F
 
F
-
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
A
A
 
R
V
 
D
D
 
G
D
 
S
F
 
Q
T
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
G
 
E
E
 
E
-
 
G
H
 
F
R
 
R
F
 
I
G
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
Q
C
 
A
T
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
C
L
 
M
S
 
S
F
 
F
Y
 
M
F
 
I
P
 
E
E
 
D
-
 
A
-
 
G
E
 
E
D
 
I
T
 
A
I
 
V
I
 
F
V
 
V
G
 
G
D
|
D
L
 
T
I
 
L
F
 
F
Y
 
M
R
 
P
S
 
D
I
 
Y
G
 
G
-
 
T
-
x
A
R
|
R
T
 
C
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
A
E
 
R
K
 
T
L
 
L
R
 
Y
A
 
R
S
 
S
V
 
I
R
 
R
D
 
-
H
 
R
I
 
L
F
 
L
T
 
A
L
 
F
P
 
P
G
 
D
K
 
Q
T
 
T
R
 
R
I
 
L
L
 
F
P
 
M
G
 
C
H
 
H

Sites not aligning to the query:

4yskA Crystal structure of apo-form sdoa from pseudomonas putida (see paper)
32% identity, 81% coverage: 20:187/208 of query aligns to 45:212/294 of 4yskA

query
sites
4yskA
N
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
A
 
C
V
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
P
 
S
G
 
A
G
 
S
A
 
A
P
 
D
R
 
R
P
 
L
V
 
V
L
 
E
N
 
R
Y
 
V
L
 
N
E
 
E
M
 
L
Q
 
N
G
 
A
L
 
-
T
 
S
L
 
V
T
 
R
H
 
W
I
 
V
L
 
L
N
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
F
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
Y
 
S
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
H
S
 
T
A
 
A
G
 
I
D
 
G
A
 
A
F
 
H
L
 
I
R
 
T
Q
 
Q
T
 
V
E
 
Q
L
 
K
G
 
V
K
 
F
G
 
G
G
 
A
A
 
L
F
 
F
-
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
A
A
 
R
V
 
D
D
 
G
D
 
S
F
 
Q
T
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
G
 
E
E
 
E
-
 
G
H
 
F
R
 
R
F
 
I
G
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
Q
C
 
A
T
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
C
L
 
M
S
 
S
F
 
F
Y
 
M
F
 
I
P
 
E
E
 
D
-
 
A
-
 
G
E
 
E
D
 
I
T
 
A
I
 
V
I
 
F
V
 
V
G
 
G
D
|
D
L
 
T
I
 
L
F
 
F
Y
 
M
R
 
P
S
 
D
I
 
Y
G
 
G
-
 
T
-
 
A
R
 
R
T
 
C
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
A
E
 
R
K
 
T
L
 
L
R
 
Y
A
 
R
S
 
S
V
 
I
R
 
R
D
 
-
H
 
R
I
 
L
F
 
L
T
 
A
L
 
F
P
 
P
G
 
D
K
 
Q
T
 
T
R
 
R
I
 
L
L
 
F
P
 
M
G
 
C
H
 
H

3r2uB 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
27% identity, 93% coverage: 1:193/208 of query aligns to 5:195/336 of 3r2uB

query
sites
3r2uB
M
 
M
P
 
F
I
 
F
K
 
K
T
 
Q
F
 
F
P
 
Y
L
 
D
G
 
K
P
 
H
L
 
L
E
 
S
T
 
Q
N
 
A
C
 
S
H
 
Y
L
 
L
V
 
I
H
 
G
N
 
C
G
 
Q
R
 
K
T
 
T
-
 
G
-
 
E
A
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
I
G
 
R
A
 
D
P
 
L
R
 
S
P
 
S
V
 
Y
L
 
I
N
 
R
Y
 
V
L
 
A
E
 
D
M
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
I
T
 
T
H
 
H
I
 
A
L
 
A
N
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
x
F
I
 
A
Y
 
S
G
 
G
N
 
I
A
 
R
A
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
I
A
 
K
T
 
L
G
 
N
A
 
A
P
 
N
I
 
I
L
 
Y
A
 
V
S
 
S
A
 
G
G
 
E
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
S
G
 
D
G
 
D
A
 
T
F
 
L
G
 
G
F
 
Y
P
 
K
A
 
N
V
 
M
D
 
P
D
 
N
F
 
H
T
 
T
S
 
H
I
 
F
D
 
V
L
 
Q
E
 
H
P
 
N
G
 
D
E
 
D
H
 
I
R
 
Y
F
 
V
G
 
G
D
 
N
L
 
I
A
 
K
C
 
L
T
 
K
A
 
V
F
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
S
 
S
L
 
I
S
 
S
F
 
F
Y
 
L
F
 
L
P
 
T
E
 
D
E
 
E
D
 
G
T
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
G
I
 
L
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
F
I
 
I
F
 
F
Y
 
V
R
 
G
S
 
D
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
F
 
L
P
 
S
G
 
E
G
 
I
D
 
G
L
 
A
E
 
K
K
 
Q
L
 
M
R
 
F
A
 
K
S
 
S
V
 
I
R
 
E
D
 
S
H
 
-
I
 
I
F
 
K
T
 
D
L
 
L
P
 
P
G
 
D
K
 
Y
T
 
I
R
 
Q
I
 
I
L
 
W
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
A
A
 
G
T
 
S
S
 
S
V
 
L

Sites not aligning to the query:

6sg9FL uS3m (see paper)
38% identity, 37% coverage: 124:200/208 of query aligns to 219:294/320 of 6sg9FL

query
sites
6sg9FL
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
L
 
M
S
 
M
F
 
L
Y
 
H
F
 
I
P
 
P
E
 
T
E
 
E
D
 
R
T
 
I
I
 
L
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
L
I
 
L
F
 
F
Y
 
F
R
 
N
S
x
K
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
V
D
 
D
F
 
L
P
 
P
G
 
W
G
 
A
D
 
T
L
 
G
E
 
V
K
 
R
L
 
L
R
 
A
A
 
E
S
 
S
V
 
L
R
 
R
D
 
-
H
 
L
I
 
L
F
 
E
T
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
D
K
 
N
T
 
T
R
 
V
I
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
|
G
P
x
R
A
 
M
T
 
T
S
 
T
V
 
L
D
 
G
D
 
R
E
 
E
T
 
R
R
 
R
N
 
E
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3r2uA 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
25% identity, 92% coverage: 1:191/208 of query aligns to 3:201/348 of 3r2uA

query
sites
3r2uA
M
 
M
P
 
F
I
 
F
K
 
K
T
 
Q
F
 
F
P
 
Y
L
 
D
G
 
K
P
 
H
L
 
L
E
 
S
T
 
Q
N
 
A
C
 
S
H
 
Y
L
 
L
V
 
I
H
 
G
N
 
C
G
 
Q
R
 
K
T
 
T
-
 
G
-
 
E
A
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
I
G
 
R
A
 
D
P
 
L
R
 
S
P
 
S
V
 
Y
L
 
I
N
 
R
Y
 
V
L
 
A
E
 
D
M
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
I
T
 
T
H
 
H
I
 
A
L
 
A
N
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
x
F
I
 
A
Y
 
S
G
 
G
N
 
I
A
 
R
A
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
I
A
 
K
T
 
L
G
 
N
A
 
A
P
 
N
I
 
I
L
 
Y
A
 
V
S
 
S
A
 
G
G
 
E
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
S
G
 
D
G
 
D
A
 
T
F
 
L
G
 
G
F
 
Y
P
 
K
A
 
N
V
 
M
D
 
P
D
 
N
F
 
H
T
 
T
S
 
H
I
 
F
D
 
V
L
 
Q
E
 
H
P
 
N
G
 
D
E
 
D
H
 
I
R
 
Y
F
 
V
G
 
G
D
 
N
L
 
I
A
 
K
C
 
L
T
 
K
A
 
V
F
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
S
 
S
L
 
I
S
 
S
F
 
F
Y
 
L
F
 
L
P
 
T
E
 
D
E
 
E
D
 
G
T
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
G
I
 
L
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
F
I
 
I
F
 
F
Y
 
V
R
 
G
S
 
D
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
F
 
L
P
 
L
G
 
E
G
 
K
D
 
A
L
 
V
E
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
A
K
 
K
L
 
Q
R
 
M
A
 
F
S
 
K
V
 
S
R
 
I
D
 
E
H
 
S
I
 
I
F
 
K
T
 
D
L
 
L
P
 
P
G
 
D
K
 
Y
T
 
I
R
 
Q
I
 
I
L
 
W
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
A
A
 
G
T
 
S

5aebB Crystal structure of the class b3 di-zinc metallo-beta-lactamase lra- 12 from an alaskan soil metagenome. (see paper)
29% identity, 65% coverage: 6:140/208 of query aligns to 27:170/266 of 5aebB

query
sites
5aebB
F
 
Y
P
 
Y
L
 
I
G
 
G
P
 
T
L
 
Y
E
 
D
T
 
L
N
 
A
C
 
C
H
 
Y
L
 
L
V
 
I
H
 
T
N
 
T
G
 
K
R
 
Q
T
 
G
A
 
N
V
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
N
P
 
T
G
 
G
G
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
S
-
 
A
-
 
L
P
 
Q
V
 
I
L
 
K
N
 
N
Y
 
N
L
 
I
E
 
K
M
 
A
Q
 
L
G
 
G
L
 
F
T
 
K
L
 
L
T
 
T
H
 
D
-
 
T
-
 
K
-
 
I
I
 
L
L
 
L
N
 
T
T
 
T
H
x
Q
L
 
A
H
|
H
F
 
Y
D
|
D
H
|
H
I
 
L
Y
 
G
G
 
A
N
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
P
 
K
I
 
L
L
 
M
A
 
A
S
 
D
A
x
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
F
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
T
 
T
E
 
V
L
 
M
G
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
D
-
 
Y
A
 
A
F
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
S
-
 
M
-
 
F
F
 
E
P
 
P
A
 
I
V
 
I
D
 
A
D
 
D
F
 
R
T
 
L
S
 
L
I
x
H
D
 
D
L
 
K
E
 
D
P
 
T
G
 
I
E
 
Q
H
 
-
R
 
-
F
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
T
A
 
K
C
 
L
T
 
V
A
 
M
F
 
L
A
 
H
T
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
C
S
 
S
F
 
F
Y
 
L
F
 
F
P
 
D
E
 
T
E
 
K
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3tp9A Crystal structure of alicyclobacillus acidocaldarius protein with beta-lactamase and rhodanese domains
27% identity, 81% coverage: 24:192/208 of query aligns to 28:203/473 of 3tp9A

query
sites
3tp9A
A
 
A
V
 
C
V
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
G
 
R
A
 
D
P
 
V
R
 
E
P
 
P
V
 
Y
L
 
L
N
 
L
Y
 
T
L
 
A
E
 
K
M
 
R
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
R
L
 
I
T
 
V
H
 
A
I
 
A
L
 
L
N
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
x
F
I
 
V
Y
 
S
G
 
G
N
 
A
A
 
R
A
 
E
L
 
M
A
 
A
A
 
D
A
 
R
T
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
I
 
I
L
 
C
A
 
V
S
 
S
A
 
D
G
 
E
D
 
G
A
 
P
F
 
P
L
 
E
R
 
W
Q
 
K
T
 
S
E
 
E
L
 
Y
G
 
V
K
 
K
G
 
A
G
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
Y
T
 
P
S
 
H
I
 
R
D
 
L
L
 
L
E
 
K
P
 
D
G
 
G
-
 
D
E
 
E
H
 
L
R
 
H
F
 
F
G
 
G
D
 
N
L
 
V
A
 
R
C
 
I
T
 
V
A
 
V
F
 
M
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
S
 
H
L
 
V
S
 
S
F
 
Y
Y
 
L
F
 
L
P
 
Y
E
 
D
E
 
G
D
 
K
T
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
A
I
 
L
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
F
I
 
V
F
 
F
Y
 
V
R
 
G
S
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
F
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
P
 
E
G
 
S
G
 
G
D
 
S
L
 
S
E
 
E
K
 
A
L
 
L
-
 
A
R
 
R
A
 
Q
S
 
M
V
 
F
R
 
R
D
 
S
-
 
L
-
 
R
H
 
K
I
 
F
F
 
E
T
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
D
K
 
H
T
 
V
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
G
P
 
A
A
 
G
T
 
S
S
 
A

Query Sequence

>208271 MicrobesOnline__882:208271
MPIKTFPLGPLETNCHLVHNGRTAVVVDPGGAPRPVLNYLEMQGLTLTHILNTHLHFDHI
YGNAALAAATGAPILASAGDAFLRQTELGKGGAFGFPAVDDFTSIDLEPGEHRFGDLACT
AFATPGHTPGSLSFYFPEEDTIIVGDLIFYRSIGRTDFPGGDLEKLRASVRDHIFTLPGK
TRILPGHGPATSVDDETRNNPYFGDFAV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory