SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 349909 FitnessBrowser__Btheta:349909 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3w1vA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in complex with inihibitor (see paper)
61% identity, 97% coverage: 4:342/349 of query aligns to 11:344/347 of 3w1vA

query
sites
3w1vA
F
 
F
A
 
D
G
 
D
K
 
K
T
 
I
L
 
L
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
M
N
 
K
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
D
T
 
S
D
 
N
I
 
I
G
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
D
E
 
E
K
 
K
K
 
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
M
 
I
R
 
R
H
 
K
E
 
K
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
N
H
 
S
K
 
K
I
 
L
K
 
K
F
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
D
L
 
S
Q
 
Q
S
 
S
C
 
V
K
 
E
N
 
T
A
 
A
M
 
M
P
 
R
G
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
|
K
Q
|
Q
V
 
V
P
 
P
S
 
S
C
 
C
E
 
E
F
 
F
F
 
F
P
 
P
M
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
Q
A
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
H
A
 
Q
G
 
N
V
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
V
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
T
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
M
E
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
F
V
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
S
R
 
R
-
 
N
-
 
I
Y
 
R
S
 
S
G
 
E
K
 
Q
T
 
T
K
 
L
I
 
I
C
 
C
C
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
N
|
N
V
 
V
M
 
M
C
 
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
I
 
I
P
 
P
L
|
L
W
 
F
I
 
I
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
L
T
|
T
L
x
I
T
|
T
E
 
D
P
 
P
T
 
D
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
I
 
L
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
H
A
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
H
G
 
A
Q
 
E
N
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
M
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
S
C
 
S
T
 
T
I
x
V
Q
 
G
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
E
G
 
A
K
 
D
K
 
N
E
 
A
D
 
-
I
 
I
K
 
E
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
T
R
|
R
H
 
H
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
K
Y
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
R
E
 
E
E
 
E
C
 
Y
A
 
A
K
 
Q
A
 
C
E
 
E
D
 
D
M
 
M
G
 
G
N
 
D
F
 
Y
Y
 
F
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
N
 
S
R
 
R
G
 
D
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
D
 
S
K
 
N
F
 
Y
F
 
V
K
 
E
E
 
T
G
 
G
E
 
N
T
 
E
E
 
K
R
 
I
N
 
T
T
 
Q
L
 
S
T
 
Y
E
 
E
F
 
Y
N
 
N
S
 
S
N
 
D
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
I
 
I
L
 
L
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
I
K
 
K
V
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
L
A
 
T
L
 
L
D
 
E
Y
 
Y
I
 
V
Q
 
R
K
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
N

4g5hA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in complex with by-product (see paper)
61% identity, 97% coverage: 4:342/349 of query aligns to 11:344/346 of 4g5hA

query
sites
4g5hA
F
 
F
A
 
D
G
 
D
K
 
K
T
 
I
L
 
L
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
M
N
 
K
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
D
T
 
S
D
 
N
I
 
I
G
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
K
K
|
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
M
 
I
R
 
R
H
 
K
E
 
K
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
N
H
 
S
K
 
K
I
 
L
K
 
K
F
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
S
Q
 
Q
S
 
S
C
 
V
K
 
E
N
 
T
A
 
A
M
 
M
P
 
R
G
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
F
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
|
Q
V
|
V
P
 
P
S
 
S
C
 
C
E
 
E
F
 
F
F
 
F
P
 
P
M
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
Q
A
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
H
A
 
Q
G
 
N
V
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
V
I
 
I
C
 
C
L
|
L
S
 
S
T
|
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
T
 
S
K
|
K
A
 
A
V
 
M
E
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
F
V
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
S
R
 
R
-
 
N
-
 
I
Y
 
R
S
 
S
G
 
E
K
 
Q
T
 
T
K
 
L
I
 
I
C
 
C
C
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
|
Y
G
 
G
N
|
N
V
 
V
M
 
M
C
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
I
 
I
P
 
P
L
|
L
W
 
F
I
 
I
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
L
T
|
T
L
 
I
T
|
T
E
 
D
P
 
P
T
 
D
M
|
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
H
A
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
H
G
 
A
Q
 
E
N
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
M
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
S
C
 
S
T
 
T
I
x
V
Q
 
G
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
E
G
 
A
K
 
D
K
 
N
E
 
A
D
 
-
I
 
I
K
 
E
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
T
R
|
R
H
 
H
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
K
Y
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
R
E
 
E
E
 
E
C
x
Y
A
 
A
K
 
Q
A
 
C
E
 
E
D
 
D
M
 
M
G
 
G
N
 
D
F
 
Y
Y
 
F
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
N
 
S
R
 
R
G
 
D
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
D
 
S
K
 
N
F
 
Y
F
 
V
K
 
E
E
 
T
G
 
G
E
 
N
T
 
E
E
 
K
R
 
I
N
 
T
T
 
Q
L
x
S
T
x
Y
E
|
E
F
x
Y
N
 
N
S
 
S
N
 
D
N
|
N
T
 
T
Y
 
H
I
 
I
L
 
L
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
I
K
 
K
V
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
L
A
 
T
L
 
L
D
 
E
Y
 
Y
I
 
V
Q
 
R
K
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
N

3vvcA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape , k126e, in apo form (see paper)
60% identity, 97% coverage: 4:342/349 of query aligns to 3:316/318 of 3vvcA

query
sites
3vvcA
F
 
F
A
 
D
G
 
D
K
 
K
T
 
I
L
 
L
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
 
S
F
|
F
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
M
N
 
K
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
D
T
 
S
D
 
N
I
 
I
G
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
K
K
|
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
M
 
I
R
 
R
H
 
K
E
 
K
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
N
H
 
S
K
 
K
I
 
L
K
 
K
F
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
|
R
N
 
D
L
 
S
Q
 
Q
S
 
S
C
 
V
K
 
E
N
 
T
A
 
A
M
 
M
P
 
R
G
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
F
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
S
 
S
C
 
C
E
 
E
F
 
F
F
 
F
P
 
P
M
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
Q
A
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
H
A
 
Q
G
 
N
V
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
V
I
 
I
C
 
C
L
 
L
S
|
S
T
|
T
D
 
D
K
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
T
 
S
K
|
K
A
 
A
V
 
M
E
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
F
V
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
S
R
 
R
-
 
N
-
 
I
Y
 
R
S
 
S
G
 
E
K
 
Q
T
 
T
K
 
L
I
 
I
C
 
C
C
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
 
N
V
 
V
M
 
M
C
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
L
W
 
F
I
 
I
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
L
T
 
T
L
 
I
T
 
T
E
 
D
P
 
P
T
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
H
A
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
H
G
 
A
Q
 
E
N
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
M
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
S
C
 
S
T
 
T
I
 
V
Q
 
G
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
E
G
 
A
K
 
D
K
 
N
E
 
A
D
 
-
I
 
I
K
 
E
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
T
R
 
R
H
 
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
M
 
K
Y
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
R
E
 
E
E
 
E
C
 
Y
A
 
A
K
 
Q
A
 
C
E
 
E
D
 
D
M
 
M
G
 
G
N
 
D
F
 
Y
Y
 
F
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
N
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
Y
E
 
E
F
 
Y
N
 
N
S
 
S
N
 
D
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
I
 
I
L
 
L
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
I
K
 
K
V
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
L
A
 
T
L
 
L
D
 
E
Y
 
Y
I
 
V
Q
 
R
K
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
N

4j2oC Crystal structure of NADP-bound wbjb from a. Baumannii community strain d1279779 (see paper)
60% identity, 96% coverage: 3:338/349 of query aligns to 1:312/316 of 4j2oC

query
sites
4j2oC
I
 
M
F
 
F
A
 
K
G
 
D
K
 
K
T
 
V
L
 
L
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
K
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
E
T
 
T
D
 
D
I
 
I
G
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
K
K
|
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
M
 
M
R
 
R
H
 
K
E
 
K
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
S
H
 
A
K
 
K
I
 
L
K
 
K
F
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
Y
Q
 
N
S
 
S
C
 
I
K
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
T
P
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
S
 
S
C
 
C
E
 
E
F
 
F
F
 
H
P
 
P
M
 
M
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
T
|
T
N
 
N
V
 
V
I
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
A
 
N
G
 
H
V
 
V
G
 
K
A
 
R
V
 
V
I
 
V
C
 
C
L
|
L
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
V
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
T
 
S
K
|
K
A
 
A
V
 
M
E
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
M
V
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
S
R
 
R
-
 
N
Y
 
L
S
 
E
G
 
G
-
 
L
K
 
D
T
 
T
K
 
V
I
 
I
C
 
C
C
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
M
C
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
L
W
 
F
I
 
V
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
N
 
K
P
 
P
V
 
L
T
 
T
L
 
I
T
 
T
E
 
D
P
 
P
T
 
N
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
M
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
F
 
F
E
 
E
H
 
H
G
 
G
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
C
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
A
T
 
V
Q
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
L
C
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
L
G
 
N
G
 
V
K
 
E
K
 
D
E
 
H
D
 
P
I
 
I
K
 
S
V
 
I
I
 
M
G
 
G
I
 
T
R
 
R
H
 
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
M
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
S
N
 
R
E
 
E
E
 
E
C
 
M
A
 
V
K
 
H
A
 
A
E
 
F
D
 
D
M
 
Q
G
 
G
N
 
D
F
 
Y
Y
 
F
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
N
 
E
R
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
D
F
 
Y
N
 
N
S
 
S
N
 
H
N
 
N
T
 
T
Y
 
T
I
 
R
L
 
L
N
 
D
V
 
V
E
 
E
E
 
G
T
 
M
K
 
K
V
 
Q
K
 
L
I
 
L
A
 
L
A
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
F
I
 
V
Q
 
R

3vvbA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in apo form (see paper)
53% identity, 97% coverage: 4:341/349 of query aligns to 1:270/270 of 3vvbA

query
sites
3vvbA
F
 
F
A
 
D
G
 
D
K
 
K
T
 
I
L
 
L
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
M
N
 
K
R
 
R
F
 
F
L
 
L
R
 
D
T
 
S
D
 
N
I
 
I
G
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
R
I
 
I
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
K
K
|
K
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
M
 
I
R
 
R
H
 
K
E
 
K
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
N
H
 
S
K
 
K
I
 
L
K
 
K
F
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
S
Q
 
Q
S
 
S
C
 
V
K
 
E
N
 
T
A
 
A
M
 
M
P
 
R
G
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
S
 
S
C
 
C
E
 
E
F
 
F
F
 
F
P
 
P
M
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
Q
A
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
H
A
 
Q
G
 
N
V
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
V
I
 
I
C
 
C
L
|
L
S
 
S
T
|
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
I
 
I
T
 
S
K
|
K
A
 
A
V
 
M
E
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
F
V
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
S
R
 
R
-
 
N
-
 
I
Y
 
R
S
 
S
G
 
E
K
 
Q
T
 
T
K
 
L
I
 
I
C
 
C
C
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
 
N
V
 
V
M
 
M
C
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
T
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
H
A
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
H
G
 
A
Q
 
E
N
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
M
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
S
C
 
S
T
 
T
I
 
V
Q
 
G
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
L
C
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
K
 
-
V
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
M
 
L
Y
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
R
E
 
E
E
 
E
C
 
Y
A
 
A
K
 
Q
A
 
C
E
 
E
D
 
D
M
 
M
G
 
G
N
 
D
F
 
Y
Y
 
F
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
N
 
S
R
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
K
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
Y
E
 
E
F
 
Y
N
 
N
S
 
S
N
 
D
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
I
 
I
L
 
L
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
I
K
 
K
V
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
L
A
 
T
L
 
L
D
 
E
Y
 
Y
I
 
V
Q
 
R
K
 
N
E
 
E
L
 
L

6bwcC X-ray structure of pen from bacillus thuringiensis (see paper)
37% identity, 82% coverage: 4:290/349 of query aligns to 3:291/327 of 6bwcC

query
sites
6bwcC
F
 
F
A
 
K
G
 
D
K
 
K
T
 
N
L
 
V
M
 
L
I
 
I
T
 
I
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
x
T
F
x
I
G
 
G
N
 
K
A
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
S
R
 
N
F
 
V
L
 
L
R
 
Q
T
 
E
D
 
K
I
 
P
G
 
K
E
 
V
I
 
V
R
 
R
I
 
V
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
x
S
E
 
E
K
 
Y
K
 
N
Q
 
Q
D
 
F
D
 
L
M
 
L
R
 
Q
H
 
E
E
 
E
Y
 
F
Q
 
R
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
D
V
 
K
A
 
N
H
 
R
K
 
N
I
 
I
K
 
R
F
 
Y
F
 
L
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
N
 
N
L
 
Y
Q
 
D
S
 
R
C
 
V
K
 
F
N
 
S
A
 
A
M
 
M
P
 
E
G
 
N
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
F
H
 
H
A
x
V
A
|
A
A
 
A
L
 
M
K
|
K
Q
x
H
V
 
V
P
 
S
S
 
F
C
 
C
E
 
E
F
 
Y
F
 
N
P
 
P
M
 
F
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
L
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
Q
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
A
A
 
Q
G
 
K
V
 
V
G
 
K
A
 
K
V
 
V
I
 
V
C
 
F
L
x
T
S
 
S
T
x
S
D
x
N
K
 
A
A
 
A
A
 
I
Y
 
S
P
 
P
I
 
T
N
 
N
A
 
N
M
x
Y
G
 
G
I
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
L
V
 
T
E
 
A
E
 
E
K
 
R
I
 
L
A
 
I
V
 
T
A
 
S
K
 
A
-
 
E
-
 
Y
S
 
S
R
 
K
Y
 
G
S
 
S
G
 
S
K
 
E
T
 
T
K
 
T
I
 
F
C
 
T
C
 
S
T
 
V
R
 
R
Y
x
F
G
 
G
N
|
N
V
|
V
M
 
M
C
 
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
I
 
I
P
 
P
L
|
L
W
 
F
I
 
E
E
 
N
Q
 
Q
I
 
I
R
 
K
N
 
E
G
 
N
N
 
Q
P
 
K
V
 
I
T
|
T
L
 
V
T
|
T
E
 
D
P
 
L
T
 
S
M
|
M
T
 
S
R
|
R
F
 
F
I
 
M
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
N
E
 
Q
A
 
A
V
 
T
D
 
M
L
 
L
V
 
T
L
 
I
F
 
E
A
 
A
F
 
M
E
 
K
H
 
I
G
 
A
Q
 
K
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
T
L
 
F
V
 
I
Q
 
L
K
 
K
A
 
M
P
 
P
A
 
V
C
 
I
T
 
S
I
x
L
-
 
N
-
 
D
-
 
L
-
 
S
Q
 
E
T
 
V
Q
 
M
A
 
I
E
 
E
A
 
E
V
 
V
C
 
T
E
 
K
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
G
 
L
K
 
E
K
 
N
E
 
I
D
 
K
I
 
I
K
 
E
V
 
E
I
 
I
G
 
G
I
 
L
R
 
K
H
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
M
Y
 
Y
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
M
T
 
T
N
 
H
E
 
D
E
 
E
C
 
S
A
 
L
K
 
Q
A
 
A
E
 
F
D
 
E
M
 
L
G
 
P
N
 
D
F
 
M
Y
 
F
R
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
S

O25511 UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting); Pseudaminic acid biosynthesis protein B; UDP-GlcNAc-inverting 4,6-dehydratase; EC 4.2.1.115 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
38% identity, 82% coverage: 2:286/349 of query aligns to 6:283/333 of O25511

query
sites
O25511
S
 
N
I
 
M
F
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
Q
T
 
T
L
 
I
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
K
A
 
C
V
 
F
L
 
V
N
 
R
R
 
K
F
 
V
L
 
L
-
 
D
R
 
T
T
 
T
D
 
N
I
 
A
G
 
K
E
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
V
F
 
Y
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
|
E
K
x
L
K
|
K
Q
 
Q
D
 
S
D
 
E
M
 
M
R
 
A
H
 
M
E
 
E
Y
 
F
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
D
H
 
P
K
 
R
I
 
M
K
 
R
F
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
R
C
 
L
K
 
N
N
 
Y
A
 
A
M
 
L
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
I
I
 
C
F
 
I
H
 
H
A
|
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
I
C
 
A
E
 
E
F
 
Y
F
 
N
P
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
C
V
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
M
G
 
G
T
 
A
D
 
S
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
K
A
 
N
G
 
A
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
A
L
|
L
S
|
S
T
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
L
M
x
Y
G
 
G
I
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
L
V
 
C
E
 
S
E
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
F
V
 
V
A
 
S
K
 
A
S
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
K
 
Q
T
 
T
K
 
Q
I
 
F
C
 
S
C
 
V
T
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
|
V
M
x
V
C
x
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
V
P
 
P
L
 
F
W
 
F
I
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
R
 
Q
N
 
N
-
 
K
G
 
A
N
 
S
P
 
E
V
 
I
T
 
P
L
 
I
T
 
T
E
 
D
P
 
I
T
 
R
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
W
M
 
I
S
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
F
 
K
A
 
S
F
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
M
Q
 
H
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
P
K
 
K
A
 
I
P
 
P
A
 
S
C
 
M
T
 
K
I
 
M
Q
 
T
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
L
C
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
P
K
 
N
E
 
T
D
 
P
I
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
R
H
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
K
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
T
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
P
N
 
K
E
 
D
E
 
E
C
 
S
A
 
H
K
 
L
A
 
A
E
 
L
D
 
E
M
 
F
G
 
E
N
 
D
F
 
F
Y
 
F

2gnaA Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-gal (see paper)
38% identity, 82% coverage: 2:286/349 of query aligns to 2:279/329 of 2gnaA

query
sites
2gnaA
S
 
N
I
 
M
F
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
Q
T
 
T
L
 
I
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
K
A
 
C
V
 
F
L
 
V
N
 
R
R
 
K
F
 
V
L
 
L
-
 
D
R
 
T
T
 
T
D
 
N
I
 
A
G
 
K
E
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
V
F
 
Y
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
L
K
|
K
Q
 
Q
D
 
S
D
 
E
M
 
M
R
 
A
H
 
M
E
 
E
Y
 
F
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
D
H
 
P
K
 
R
I
 
M
K
 
R
F
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
R
C
 
L
K
 
N
N
 
Y
A
 
A
M
 
L
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
I
I
 
C
F
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
I
C
 
A
E
 
E
F
 
Y
F
 
N
P
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
C
V
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
M
G
 
G
T
 
A
D
 
S
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
K
A
 
N
G
 
A
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
A
L
|
L
S
|
S
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
L
M
x
Y
G
 
G
I
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
L
V
 
C
E
 
S
E
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
F
V
 
V
A
 
S
K
 
A
S
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
K
 
Q
T
 
T
K
 
Q
I
 
F
C
 
S
C
 
V
T
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
 
N
V
|
V
M
 
V
C
 
G
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
I
 
V
P
 
P
L
 
F
W
 
F
I
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
R
 
Q
N
 
N
-
 
K
G
 
A
N
 
S
P
 
E
V
 
I
T
 
P
L
 
I
T
|
T
E
 
D
P
 
I
T
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
I
 
W
M
 
I
S
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
F
 
K
A
 
S
F
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
M
Q
 
H
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
P
K
 
K
A
 
I
P
 
P
A
 
S
C
 
M
T
 
K
I
x
M
Q
 
T
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
L
C
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
P
K
 
N
E
 
T
D
 
P
I
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
H
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
T
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
P
N
 
K
E
 
D
E
 
E
C
 
S
A
 
H
K
 
L
A
 
A
E
 
L
D
 
E
M
 
F
G
 
E
N
 
D
F
 
F
Y
 
F

2gn9A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-glc (see paper)
38% identity, 82% coverage: 2:286/349 of query aligns to 2:279/329 of 2gn9A

query
sites
2gn9A
S
 
N
I
 
M
F
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
Q
T
 
T
L
 
I
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
K
A
 
C
V
 
F
L
 
V
N
 
R
R
 
K
F
 
V
L
 
L
-
 
D
R
 
T
T
 
T
D
 
N
I
 
A
G
 
K
E
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
V
F
 
Y
S
 
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
L
K
|
K
Q
 
Q
D
 
S
D
 
E
M
 
M
R
 
A
H
 
M
E
 
E
Y
 
F
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
D
H
 
P
K
 
R
I
 
M
K
 
R
F
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
R
C
 
L
K
 
N
N
 
Y
A
 
A
M
 
L
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
I
I
 
C
F
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
I
C
 
A
E
 
E
F
 
Y
F
 
N
P
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
C
V
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
M
G
 
G
T
 
A
D
 
S
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
K
A
 
N
G
 
A
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
A
L
|
L
S
|
S
T
|
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
L
M
x
Y
G
 
G
I
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
L
V
 
C
E
 
S
E
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
F
V
 
V
A
 
S
K
 
A
S
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
K
 
Q
T
 
T
K
 
Q
I
 
F
C
 
S
C
 
V
T
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
M
 
V
C
 
G
S
 
S
R
|
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
I
 
V
P
 
P
L
 
F
W
 
F
I
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
R
 
Q
N
 
N
-
 
K
G
 
A
N
 
S
P
 
E
V
 
I
T
x
P
L
 
I
T
|
T
E
 
D
P
 
I
T
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
I
 
W
M
 
I
S
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
F
 
K
A
 
S
F
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
M
Q
 
H
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
P
K
 
K
A
 
I
P
 
P
A
 
S
C
 
M
T
 
K
I
x
M
Q
 
T
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
L
C
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
P
K
 
N
E
 
T
D
 
P
I
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
H
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
T
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
P
N
 
K
E
 
D
E
 
E
C
 
S
A
 
H
K
 
L
A
 
A
E
 
L
D
 
E
M
 
F
G
 
E
N
 
D
F
 
F
Y
 
F

2gn6A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-glcnac (see paper)
38% identity, 82% coverage: 2:286/349 of query aligns to 2:279/329 of 2gn6A

query
sites
2gn6A
S
 
N
I
 
M
F
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
Q
T
 
T
L
 
I
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
K
A
 
C
V
 
F
L
 
V
N
 
R
R
 
K
F
 
V
L
 
L
-
 
D
R
 
T
T
 
T
D
 
N
I
 
A
G
 
K
E
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
V
F
 
Y
S
 
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
L
K
|
K
Q
 
Q
D
 
S
D
 
E
M
 
M
R
 
A
H
 
M
E
 
E
Y
 
F
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
D
H
 
P
K
 
R
I
 
M
K
 
R
F
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
R
C
 
L
K
 
N
N
 
Y
A
 
A
M
 
L
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
I
I
 
C
F
 
I
H
 
H
A
 
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
I
C
 
A
E
 
E
F
 
Y
F
 
N
P
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
C
V
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
M
G
 
G
T
 
A
D
 
S
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
K
A
 
N
G
 
A
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
A
L
 
L
S
|
S
T
 
T
D
|
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
L
M
x
Y
G
 
G
I
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
L
V
 
C
E
 
S
E
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
F
V
 
V
A
 
S
K
 
A
S
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
K
 
Q
T
 
T
K
 
Q
I
 
F
C
 
S
C
 
V
T
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
M
 
V
C
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
S
|
S
V
|
V
I
 
V
P
 
P
L
 
F
W
 
F
I
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
R
 
Q
N
 
N
-
 
K
G
 
A
N
 
S
P
 
E
V
 
I
T
x
P
L
x
I
T
 
T
E
 
D
P
 
I
T
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
I
 
W
M
 
I
S
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
F
 
K
A
 
S
F
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
M
Q
 
H
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
P
K
 
K
A
 
I
P
 
P
A
 
S
C
 
M
T
 
K
I
x
M
Q
 
T
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
L
C
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
P
K
 
N
E
 
T
D
 
P
I
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
H
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
T
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
P
N
 
K
E
 
D
E
 
E
C
 
S
A
 
H
K
 
L
A
 
A
E
 
L
D
 
E
M
 
F
G
 
E
N
 
D
F
 
F
Y
 
F

2gn4A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADPH and udp-glcnac (see paper)
38% identity, 82% coverage: 2:286/349 of query aligns to 2:279/329 of 2gn4A

query
sites
2gn4A
S
 
N
I
 
M
F
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
Q
T
 
T
L
 
I
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
K
A
 
C
V
 
F
L
 
V
N
 
R
R
 
K
F
 
V
L
 
L
-
 
D
R
 
T
T
 
T
D
 
N
I
 
A
G
 
K
E
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
V
F
 
Y
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
L
K
|
K
Q
 
Q
D
 
S
D
 
E
M
 
M
R
 
A
H
 
M
E
 
E
Y
 
F
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
D
H
 
P
K
 
R
I
 
M
K
 
R
F
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
R
C
 
L
K
 
N
N
 
Y
A
 
A
M
 
L
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
I
I
 
C
F
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
I
C
 
A
E
 
E
F
 
Y
F
 
N
P
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
C
V
 
I
K
 
K
T
|
T
N
 
N
V
 
I
I
 
M
G
 
G
T
 
A
D
 
S
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
K
A
 
N
G
 
A
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
A
L
|
L
S
|
S
T
|
T
D
|
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
L
M
x
Y
G
 
G
I
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
L
V
 
C
E
 
S
E
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
F
V
 
V
A
 
S
K
 
A
S
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
K
 
Q
T
 
T
K
 
Q
I
 
F
C
 
S
C
 
V
T
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
M
 
V
C
 
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
I
 
V
P
 
P
L
 
F
W
 
F
I
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
R
 
Q
N
 
N
-
 
K
G
 
A
N
 
S
P
 
E
V
 
I
T
x
P
L
 
I
T
|
T
E
 
D
P
 
I
T
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
I
 
W
M
 
I
S
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
F
 
K
A
 
S
F
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
M
Q
 
H
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
P
K
 
K
A
 
I
P
 
P
A
 
S
C
 
M
T
 
K
I
x
M
Q
 
T
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
L
C
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
P
K
 
N
E
 
T
D
 
P
I
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
H
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
T
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
P
N
 
K
E
 
D
E
 
E
C
 
S
A
 
H
K
 
L
A
 
A
E
 
L
D
 
E
M
 
F
G
 
E
N
 
D
F
 
F
Y
 
F

2gn8A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp (see paper)
39% identity, 80% coverage: 7:286/349 of query aligns to 5:277/327 of 2gn8A

query
sites
2gn8A
K
 
Q
T
 
T
L
 
I
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
N
 
K
A
 
C
V
 
F
L
 
V
N
 
R
R
 
K
F
 
V
L
 
L
-
 
D
R
 
T
T
 
T
D
 
N
I
 
A
G
 
K
E
 
K
I
 
I
R
 
I
I
 
V
F
 
Y
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
L
K
|
K
Q
 
Q
D
 
S
D
 
E
M
 
M
R
 
A
H
 
M
E
 
E
Y
 
F
Q
 
N
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
D
H
 
P
K
 
R
I
 
M
K
 
R
F
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
R
C
 
L
K
 
N
N
 
Y
A
 
A
M
 
L
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
I
I
 
C
F
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
I
C
 
A
E
 
E
F
 
Y
F
 
N
P
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
C
V
 
I
K
 
K
T
|
T
N
 
N
V
 
I
I
 
M
G
 
G
T
 
A
D
 
S
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
K
A
 
N
G
 
A
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
A
L
|
L
S
|
S
T
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
A
 
L
M
 
Y
G
 
G
I
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
L
V
 
C
E
 
S
E
 
D
K
 
K
I
 
L
A
 
F
V
 
V
A
 
S
K
 
A
S
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
K
 
Q
T
 
T
K
 
Q
I
 
F
C
 
S
C
 
V
T
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
M
 
V
C
 
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
|
V
I
 
V
P
 
P
L
 
F
W
 
F
I
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
R
 
Q
N
 
N
-
 
K
G
 
A
N
 
S
P
 
E
V
 
I
T
x
P
L
x
I
T
|
T
E
 
D
P
 
I
T
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
I
 
W
M
 
I
S
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
F
 
K
A
 
S
F
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
M
Q
 
H
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
P
K
 
K
A
 
I
P
 
P
A
 
S
C
 
M
T
 
K
I
x
M
Q
 
T
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
L
C
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
A
K
 
P
K
 
N
E
 
T
D
 
P
I
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
H
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
K
M
 
L
Y
 
H
E
 
E
T
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
P
N
 
K
E
 
D
E
 
E
C
 
S
A
 
H
K
 
L
A
 
A
E
 
L
D
 
E
M
 
F
G
 
E
N
 
D
F
 
F
Y
 
F

4tqgA Crystal structure of megavirus udp-glcnac 4,6-dehydratase, 5-epimerase mg534 (see paper)
33% identity, 88% coverage: 7:313/349 of query aligns to 6:288/297 of 4tqgA

query
sites
4tqgA
K
 
K
T
 
T
L
 
I
M
 
M
I
 
I
T
 
F
G
|
G
G
 
G
T
x
S
G
|
G
S
|
S
F
x
L
G
 
G
N
 
N
A
 
R
V
 
L
L
 
I
N
 
E
R
 
T
F
 
Y
L
 
I
R
 
N
T
 
N
D
 
N
I
 
I
G
 
-
E
 
-
I
 
I
R
 
V
I
 
N
F
 
Y
S
 
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
K
 
S
K
 
K
Q
 
H
D
 
W
D
 
S
M
 
M
R
 
E
H
 
L
E
 
K
Y
 
Y
Q
 
K
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
S
H
 
D
K
 
K
I
 
L
K
 
K
F
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
N
 
D
L
 
F
Q
 
E
S
 
K
C
 
V
K
 
Q
N
 
Q
A
 
S
M
 
I
P
 
M
G
 
R
V
 
I
-
 
N
-
 
P
D
 
D
Y
 
I
I
 
I
F
 
I
H
 
I
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
I
P
 
D
S
 
R
C
 
C
E
 
E
F
 
Y
F
 
E
P
 
I
M
 
N
E
 
E
A
 
C
V
 
L
K
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
Q
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
K
A
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
N
-
 
R
A
 
S
I
 
N
E
 
L
A
 
S
G
 
N
V
 
L
G
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
C
C
 
F
L
x
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
C
Y
 
S
P
 
P
I
 
V
N
 
N
A
 
S
M
x
Y
G
 
G
I
 
M
T
 
S
K
|
K
A
 
A
V
 
I
E
 
C
E
 
E
K
 
T
I
 
L
A
 
V
V
 
V
A
 
E
K
 
K
S
 
S
R
 
K
Y
 
Y
S
 
I
G
 
K
K
 
D
T
 
I
K
 
K
I
 
Y
C
 
V
C
 
C
T
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
 
N
V
|
V
M
 
L
C
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
N
V
 
F
T
 
T
L
 
L
T
 
T
E
 
H
P
 
T
T
 
S
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
I
M
 
M
S
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
D
A
 
S
V
 
V
D
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
E
F
 
Y
A
 
A
F
 
I
E
 
I
H
 
N
G
 
G
Q
 
N
N
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
V
V
 
I
Q
 
P
K
 
K
A
 
L
P
 
N
A
 
S
C
 
M
T
 
Y
I
 
I
Q
 
K
T
 
D
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
M
C
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
A
G
 
D
K
 
K
K
 
Y
E
 
P
D
 
-
I
 
I
K
 
V
V
 
I
I
 
T
G
 
G
I
 
L
R
 
R
H
 
S
G
 
G
E
 
E
K
 
R
M
 
M
Y
 
Y
E
 
E
T
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
N
N
 
D
E
 
T
E
 
Q
C
 
S
A
 
M
K
 
K
A
 
T
E
 
V
D
 
P
M
 
K
G
 
G
N
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
R
 
H
V
 
I
-
 
L
P
 
P
A
 
T
D
 
Y
N
 
D
R
 
P
G
 
T
L
 
I
N
 
V
Y
 
T
D
 
E
K
 
E
F
 
F
F
 
Y
K
 
-
E
 
E
G
 
Y
E
 
S
T
 
S
E
 
K
R
 
Q
N
 
N
T
 
I
L
 
L
T
 
S
E
 
K

5bjuA X-ray structure of the pglf dehydratase from campylobacter jejuni in complex with udp and NAD(h) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 2:305/349 of query aligns to 20:317/340 of 5bjuA

query
sites
5bjuA
S
 
A
I
 
F
F
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
K
T
 
V
L
 
V
M
 
L
I
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
A
T
 
G
G
|
G
S
x
T
F
x
I
G
 
G
N
 
S
A
 
E
V
 
L
L
 
C
N
 
K
R
 
Q
F
 
C
L
 
I
R
 
K
T
 
F
D
 
G
I
 
A
G
 
K
E
 
H
I
 
L
R
 
I
I
 
M
F
 
V
S
x
D
R
x
H
D
 
S
E
 
E
-
 
Y
-
 
N
-
 
L
-
 
Y
K
 
K
K
 
I
Q
 
N
D
 
D
D
 
D
M
 
L
R
 
N
H
 
L
E
 
-
Y
 
-
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
Y
 
Y
P
 
K
D
 
E
V
 
K
A
 
I
H
 
T
K
 
P
I
 
I
K
 
L
F
 
L
F
x
S
I
|
I
G
 
L
D
 
D
V
 
K
R
 
Q
N
 
S
L
 
L
-
 
D
Q
 
E
S
 
V
C
 
L
K
 
K
N
 
T
A
 
Y
M
 
K
P
 
P
G
 
-
V
 
-
D
 
E
Y
 
L
I
 
I
F
 
L
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
Y
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
S
 
L
C
 
C
E
 
E
F
 
Q
F
 
N
P
 
P
M
 
H
E
 
S
A
 
A
V
 
V
K
 
I
T
x
N
N
 
N
V
 
I
I
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
K
N
 
I
V
 
L
L
 
C
T
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
K
E
 
E
A
 
N
G
 
K
V
 
V
G
 
A
A
 
K
V
 
F
I
 
V
C
 
M
L
x
I
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
P
 
P
I
 
T
N
 
N
A
 
I
M
 
M
G
 
G
I
 
C
T
 
T
K
|
K
A
 
R
V
 
V
E
 
C
E
 
E
K
 
L
I
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
K
 
M
S
 
S
R
 
-
Y
 
-
S
 
D
G
 
E
K
 
N
T
 
F
K
 
E
I
 
V
C
 
A
C
 
C
T
 
V
R
 
R
Y
x
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
M
 
L
C
 
G
S
|
S
R
x
S
G
 
G
S
|
S
V
|
V
I
 
I
P
 
P
L
 
K
W
 
F
I
 
K
E
 
A
Q
 
Q
I
 
I
R
 
A
N
 
N
G
 
N
N
 
E
P
 
P
V
 
L
T
|
T
L
|
L
T
|
T
E
 
H
P
 
P
T
 
D
M
x
I
T
 
V
R
|
R
F
 
Y
I
 
F
M
 
M
S
 
L
L
 
V
E
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
L
 
L
V
 
V
L
 
L
F
 
Q
A
 
A
F
 
G
E
 
A
H
 
I
G
 
A
Q
 
K
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
L
L
 
F
V
 
V
-
 
L
Q
 
D
K
 
M
A
 
G
P
 
K
A
 
P
C
 
V
T
 
K
I
 
I
Q
 
I
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
K
V
 
M
C
 
L
E
 
L
L
 
L
F
 
S
G
 
N
G
 
R
K
 
N
K
 
D
E
 
L
D
 
E
I
 
I
K
 
K
V
 
I
I
 
T
G
 
G
I
 
L
R
 
R
H
 
K
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Y
 
Y
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
I
N
 
D
E
 
E
E
 
N
C
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
T
E
 
Q
D
 
Y
M
 
E
G
 
S
N
 
I
F
 
F
Y
 
V
R
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
A
D
 
K
N
 
N
R
 
E
G
 
K
L
 
V
N
 
D
Y
 
L
D
 
D
K
 
W
F
 
L
F
 
N
K
 
K
E
 
E
G
 
I
E
 
E

5bjvA X-ray structure of the pglf udp-n-acetylglucosamine 4,6-dehydratase from campylobacterjejuni, d396n/k397a variant in complex with udp-n- acrtylglucosamine (see paper)
32% identity, 87% coverage: 2:305/349 of query aligns to 20:317/339 of 5bjvA

query
sites
5bjvA
S
 
A
I
 
F
F
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
K
T
 
V
L
 
V
M
 
L
I
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
A
T
 
G
G
|
G
S
x
T
F
x
I
G
 
G
N
 
S
A
 
E
V
 
L
L
 
C
N
 
K
R
 
Q
F
 
C
L
 
I
R
 
K
T
 
F
D
 
G
I
 
A
G
 
K
E
 
H
I
 
L
R
 
I
I
 
M
F
 
V
S
x
D
R
x
H
D
 
S
E
 
E
-
 
Y
-
 
N
-
 
L
-
 
Y
K
 
K
K
 
I
Q
 
N
D
 
D
D
 
D
M
 
L
R
 
N
H
 
L
E
 
-
Y
 
-
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
Y
 
Y
P
 
K
D
 
E
V
 
K
A
 
I
H
 
T
K
 
P
I
 
I
K
 
L
F
 
L
F
x
S
I
|
I
G
 
L
D
 
D
V
 
K
R
 
Q
N
 
S
L
 
L
-
 
D
Q
 
E
S
 
V
C
 
L
K
 
K
N
 
T
A
 
Y
M
 
K
P
 
P
G
 
-
V
 
-
D
 
E
Y
 
L
I
 
I
F
 
L
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
Y
K
|
K
Q
x
H
V
 
V
P
 
P
S
 
L
C
 
C
E
 
E
F
 
Q
F
 
N
P
 
P
M
 
H
E
 
S
A
 
A
V
 
V
K
 
I
T
x
N
N
 
N
V
 
I
I
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
K
N
 
I
V
 
L
L
 
C
T
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
K
E
 
E
A
 
N
G
 
K
V
 
V
G
 
A
A
 
K
V
 
F
I
 
V
C
 
M
L
x
I
S
 
S
T
|
T
D
 
N
K
 
A
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
P
 
P
I
 
T
N
 
N
A
 
I
M
 
M
G
 
G
I
 
C
T
 
T
K
|
K
A
 
R
V
 
V
E
 
C
E
 
E
K
 
L
I
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
K
 
M
S
 
S
R
 
-
Y
 
-
S
 
D
G
 
E
K
 
N
T
 
F
K
 
E
I
 
V
C
 
A
C
 
C
T
 
V
R
 
R
Y
x
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
M
 
L
C
 
G
S
|
S
R
x
S
G
 
G
S
|
S
V
|
V
I
 
I
P
 
P
L
 
K
W
 
F
I
 
K
E
 
A
Q
 
Q
I
 
I
R
 
A
N
 
N
G
 
N
N
 
E
P
 
P
V
 
L
T
|
T
L
|
L
T
|
T
E
 
H
P
 
P
T
 
D
M
x
I
T
 
V
R
|
R
F
 
Y
I
 
F
M
 
M
S
 
L
L
 
V
E
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
L
 
L
V
 
V
L
 
L
F
 
Q
A
 
A
F
 
G
E
 
A
H
 
I
G
 
A
Q
 
K
N
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
L
L
 
F
V
 
V
-
 
L
Q
 
D
K
 
M
A
 
G
P
 
K
A
 
P
C
 
V
T
 
K
I
 
I
Q
 
I
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
K
V
 
M
C
 
L
E
 
L
L
 
L
F
 
S
G
 
N
G
 
R
K
 
N
K
 
D
E
 
L
D
 
E
I
 
I
K
 
K
V
 
I
I
 
T
G
 
G
I
 
L
R
|
R
H
 
K
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Y
 
Y
E
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
I
N
 
D
E
 
E
E
 
N
C
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
T
E
 
Q
D
 
Y
M
 
E
G
 
S
N
 
I
F
 
F
Y
 
V
R
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
A
D
 
K
N
 
N
R
 
E
G
 
K
L
 
V
N
 
D
Y
 
L
D
 
D
K
 
W
F
 
L
F
 
N
K
 
K
E
 
E
G
 
I
E
 
E

3pvzA Udp-n-acetylglucosamine 4,6-dehydratase from vibrio fischeri
26% identity, 66% coverage: 2:231/349 of query aligns to 26:255/372 of 3pvzA

query
sites
3pvzA
S
 
S
I
 
V
F
 
V
A
 
S
G
 
Q
K
 
S
T
 
R
L
 
F
M
 
L
I
 
V
T
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
A
G
|
G
S
|
S
F
x
I
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
T
N
 
K
R
 
E
F
 
I
L
 
F
R
 
K
T
 
R
D
 
N
I
 
P
G
 
Q
E
 
K
I
 
L
R
 
H
I
 
V
F
 
V
S
x
D
R
x
I
D
 
S
E
 
E
K
 
N
K
 
N
Q
 
M
D
 
V
D
 
E
M
 
L
R
 
V
H
 
R
E
 
D
Y
 
I
Q
 
R
V
 
S
K
 
S
Y
 
F
P
 
G
D
 
Y
V
 
I
A
 
N
H
 
G
K
 
D
I
 
F
K
 
Q
F
 
T
F
 
F
I
 
A
G
 
L
D
|
D
V
x
I
R
 
G
N
 
S
L
 
I
Q
 
E
-
 
Y
-
 
D
S
 
A
C
 
F
K
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
D
P
 
G
G
 
Q
V
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
L
H
 
N
A
x
L
A
x
S
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
R
S
 
S
C
 
E
E
 
K
-
 
D
-
 
P
F
 
F
F
 
T
P
 
L
M
 
M
E
 
R
A
 
M
V
 
I
K
 
D
T
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
F
G
 
N
T
 
T
D
 
D
N
 
K
V
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
Q
A
 
S
I
 
I
E
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
K
A
 
K
V
 
Y
I
 
F
C
 
C
L
x
V
S
 
S
T
 
T
D
|
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
I
 
V
N
 
N
A
 
M
M
 
M
G
 
G
I
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
R
V
 
I
E
 
M
E
 
E
K
 
M
I
 
F
A
 
L
V
 
M
A
 
R
K
 
K
S
 
S
R
 
E
Y
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
E
T
 
I
K
 
A
I
 
I
C
 
S
C
 
T
T
 
A
R
 
R
Y
 
F
G
 
A
N
 
N
V
|
V
M
 
A
C
 
F
S
|
S
R
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
L
I
 
L
P
 
H
L
 
G
W
 
F
I
 
N
E
 
Q
Q
 
R
I
 
I
R
 
Q
N
 
K
G
 
N
N
 
Q
P
 
P
V
 
I
T
 
-
L
 
V
T
 
A
E
 
P
P
 
N
T
 
D
M
 
I
T
 
K
R
 
R
F
 
Y
I
 
F
M
 
V
S
 
T
L
 
P
E
 
Q
E
 
E
A
 
S
V
 
G
D
 
E
L
 
L
V
 
C
L
 
L
F
 
M
A
 
S
F
 
C
E
 
I
H
 
F
G
 
G
Q
 
E
N
 
N
G
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
F
V
 
F
Q
 
P
K
 
K

3pvzB Udp-n-acetylglucosamine 4,6-dehydratase from vibrio fischeri
26% identity, 72% coverage: 2:251/349 of query aligns to 24:264/300 of 3pvzB

query
sites
3pvzB
S
 
S
I
 
V
F
 
V
A
 
S
G
 
Q
K
 
S
T
 
R
L
 
F
M
 
L
I
 
V
T
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
A
G
|
G
S
|
S
F
x
I
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
T
N
 
K
R
 
E
F
 
I
L
 
F
R
 
K
T
 
R
D
 
N
I
 
P
G
 
Q
E
 
K
I
 
L
R
 
H
I
 
V
F
 
V
S
x
D
R
x
I
D
 
S
E
 
E
K
 
N
K
 
N
Q
 
M
D
 
V
D
 
E
M
 
L
R
 
V
H
 
R
E
 
D
Y
 
I
Q
 
R
V
 
S
K
 
S
Y
 
F
P
 
G
D
 
Y
V
 
I
A
 
N
H
 
G
K
 
D
I
 
F
K
 
Q
F
 
T
F
 
F
I
 
A
G
x
L
D
|
D
V
x
I
R
 
G
N
 
S
L
 
I
Q
 
E
-
 
Y
-
 
D
S
 
A
C
 
F
K
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
D
P
 
G
G
 
Q
V
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
L
H
 
N
A
x
L
A
x
S
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
R
S
 
S
C
 
E
E
 
K
-
 
D
-
 
P
F
 
F
F
 
T
P
 
L
M
 
M
E
 
R
A
 
M
V
 
I
K
 
D
T
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
F
G
 
N
T
 
T
D
 
D
N
 
K
V
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
Q
A
 
S
I
 
I
E
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
K
A
 
K
V
 
Y
I
 
F
C
 
C
L
 
V
S
 
S
T
 
T
D
|
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
I
 
V
N
 
N
A
 
M
M
 
M
G
 
G
I
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
R
V
 
I
E
 
M
E
 
E
K
 
M
I
 
F
A
 
L
V
 
M
A
 
R
K
 
K
S
 
S
R
 
E
Y
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
E
T
 
I
K
 
A
I
 
I
C
 
S
C
 
T
T
 
A
R
 
R
Y
 
F
G
 
A
N
|
N
V
|
V
M
 
A
C
 
F
S
|
S
R
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
R
I
 
I
R
 
Q
N
 
K
G
 
N
N
 
Q
P
 
P
V
 
I
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
-
R
 
R
F
 
Y
I
 
F
M
 
V
S
 
T
L
 
P
E
 
Q
E
 
E
A
 
S
V
 
G
D
 
E
L
 
L
V
 
C
L
 
L
F
 
M
A
 
S
F
 
C
E
 
I
H
 
F
G
 
G
Q
 
E
N
 
N
G
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
F
V
 
F
Q
 
P
K
 
K
A
 
D
P
 
M
A
 
A
-
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
N
-
 
L
C
 
G
T
 
I
I
 
I
Q
 
K
T
 
N
Q
 
Y
A
 
Q
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
E
G
 
Q
K
 
K

1sb8A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-n-acetylglucosamine 4- epimerase complexed with udp-n-acetylgalactosamine (see paper)
29% identity, 62% coverage: 7:222/349 of query aligns to 17:253/341 of 1sb8A

query
sites
1sb8A
K
 
K
T
 
V
L
 
W
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
T
 
A
G
|
G
S
x
F
F
x
I
G
 
G
N
 
S
A
 
N
V
 
L
L
 
L
N
 
E
R
 
T
F
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
L
D
 
D
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
L
I
x
D
R
x
N
I
x
F
F
 
A
S
x
T
R
x
G
D
 
H
E
 
Q
K
 
R
K
 
N
Q
 
L
D
 
D
D
 
E
M
 
V
R
 
R
H
 
S
E
 
L
Y
 
V
Q
 
S
V
 
E
K
 
K
Y
 
Q
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
W
H
 
S
K
 
N
I
 
F
K
 
K
F
 
F
F
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Q
 
D
S
 
D
C
 
C
K
 
N
N
 
N
A
 
A
M
 
C
P
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
L
H
 
H
A
x
Q
A
 
A
A
|
A
L
 
L
K
 
G
Q
x
S
V
 
V
P
 
P
S
 
R
C
 
S
E
 
I
F
 
N
F
 
D
P
 
P
M
 
I
E
 
T
A
 
S
V
 
N
K
 
A
T
|
T
N
 
N
V
 
I
I
 
D
G
 
G
T
 
F
D
 
L
N
 
N
V
 
M
L
 
L
T
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
K
V
 
V
G
 
Q
A
 
S
V
 
F
I
 
T
C
 
Y
L
x
A
S
x
A
T
x
S
-
x
S
-
x
S
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
-
 
H
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
E
D
 
D
K
 
T
A
 
I
A
 
G
Y
 
K
P
 
P
I
 
L
N
 
S
A
 
P
M
x
Y
G
 
A
I
 
V
T
 
T
K
|
K
A
 
Y
V
 
V
E
 
N
E
 
E
K
 
L
I
 
Y
A
 
A
V
 
D
A
 
V
K
 
F
S
 
S
R
 
R
Y
 
C
S
 
Y
G
 
G
K
 
F
T
 
S
K
 
T
I
 
I
C
 
G
C
 
L
T
 
-
R
 
R
Y
|
Y
G
 
F
N
|
N
V
|
V
M
 
F
C
 
G
S
 
R
R
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
x
N
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
G
 
A
S
x
A
V
|
V
I
 
I
P
 
P
L
 
K
W
|
W
I
 
T
E
 
S
Q
 
S
I
 
M
R
 
I
N
 
Q
G
 
G
N
 
D
P
 
D
V
 
V
T
x
Y
L
x
I
T
x
N
-
 
G
E
 
D
P
 
G
T
 
E
M
 
T
T
 
S
R
|
R
F
 
D
I
 
F
M
 
C
S
 
Y
L
 
I
E
 
E
E
 
N
A
 
T
V
 
V
D
 
Q
L
 
A
V
 
N
L
 
L
F
 
L
A
 
A
F
 
A
E
 
T
H
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1sb9A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-n-acetylglucosamine 4- epimerase complexed with udp-glucose (see paper)
29% identity, 62% coverage: 7:222/349 of query aligns to 16:252/340 of 1sb9A

query
sites
1sb9A
K
 
K
T
 
V
L
 
W
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
T
 
A
G
|
G
S
x
F
F
x
I
G
 
G
N
 
S
A
 
N
V
 
L
L
 
L
N
 
E
R
 
T
F
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
L
D
 
D
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
L
I
x
D
R
x
N
I
x
F
F
 
A
S
x
T
R
x
G
D
 
H
E
 
Q
K
 
R
K
 
N
Q
 
L
D
 
D
D
 
E
M
 
V
R
 
R
H
 
S
E
 
L
Y
 
V
Q
 
S
V
 
E
K
 
K
Y
 
Q
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
W
H
 
S
K
 
N
I
 
F
K
 
K
F
 
F
F
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
N
 
N
L
 
L
Q
 
D
S
 
D
C
 
C
K
 
N
N
 
N
A
 
A
M
 
C
P
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
F
 
L
H
 
H
A
x
Q
A
 
A
A
|
A
L
 
L
K
 
G
Q
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
R
C
 
S
E
 
I
F
 
N
F
 
D
P
 
P
M
 
I
E
 
T
A
 
S
V
 
N
K
 
A
T
|
T
N
 
N
V
 
I
I
 
D
G
 
G
T
 
F
D
 
L
N
 
N
V
 
M
L
 
L
T
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
K
V
 
V
G
 
Q
A
 
S
V
 
F
I
 
T
C
 
Y
L
x
A
S
x
A
T
x
S
-
x
S
-
x
S
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
-
 
H
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
E
D
 
D
K
 
T
A
 
I
A
 
G
Y
 
K
P
 
P
I
 
L
N
 
S
A
 
P
M
x
Y
G
 
A
I
 
V
T
 
T
K
|
K
A
 
Y
V
 
V
E
 
N
E
 
E
K
 
L
I
 
Y
A
 
A
V
 
D
A
 
V
K
 
F
S
 
S
R
 
R
Y
 
C
S
 
Y
G
 
G
K
 
F
T
 
S
K
 
T
I
 
I
C
 
G
C
 
L
T
 
-
R
 
R
Y
|
Y
G
 
F
N
|
N
V
|
V
M
 
F
C
 
G
S
 
R
R
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
x
N
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
G
 
A
S
x
A
V
|
V
I
 
I
P
 
P
L
 
K
W
|
W
I
 
T
E
 
S
Q
 
S
I
 
M
R
 
I
N
 
Q
G
 
G
N
 
D
P
 
D
V
 
V
T
x
Y
L
x
I
T
x
N
-
 
G
E
 
D
P
 
G
T
 
E
M
 
T
T
 
S
R
 
R
F
 
D
I
 
F
M
 
C
S
 
Y
L
 
I
E
 
E
E
 
N
A
 
T
V
 
V
D
 
Q
L
 
A
V
 
N
L
 
L
F
 
L
A
 
A
F
 
A
E
 
T
H
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q7BJX9 UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase; UDP-GalNAc 4-epimerase; EC 5.1.3.7 from Plesiomonas shigelloides (Aeromonas shigelloides) (see 2 papers)
28% identity, 56% coverage: 3:196/349 of query aligns to 16:229/345 of Q7BJX9

query
sites
Q7BJX9
I
 
I
F
 
F
A
 
S
G
 
P
K
 
K
T
 
T
L
 
W
M
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
x
V
T
x
A
G
|
G
S
x
F
F
x
I
G
 
G
N
 
S
A
 
N
V
 
L
L
 
L
N
 
E
R
 
K
F
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
L
D
 
N
I
 
Q
G
 
V
E
 
V
I
 
I
R
 
G
I
 
L
F
x
D
S
x
N
R
x
F
D
x
S
E
x
T
K
x
G
K
 
H
Q
 
Q
D
 
Y
D
 
N
M
 
L
R
 
D
H
 
E
E
 
V
Y
 
K
Q
 
T
V
 
L
K
 
V
Y
 
S
P
 
T
D
 
E
V
 
Q
A
 
W
H
 
S
K
 
R
I
 
F
K
 
C
F
 
F
F
 
I
I
 
E
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
N
 
D
L
 
L
Q
 
T
S
 
T
C
 
C
K
 
E
N
 
Q
A
 
V
M
 
M
P
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
I
 
V
F
 
L
H
 
H
A
x
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
 
G
Q
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
R
C
 
S
E
 
I
F
 
V
F
 
D
P
 
P
M
 
I
E
 
T
A
 
T
V
 
N
K
 
A
T
|
T
N
 
N
V
 
I
I
 
T
G
 
G
T
 
F
D
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
T
 
H
A
 
A
A
 
A
I
 
K
E
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
G
 
Q
A
 
S
V
 
F
I
 
T
C
 
Y
L
 
A
S
 
A
T
x
S
-
x
S
-
x
S
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
D
 
D
K
 
H
A
 
P
A
 
A
Y
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
G
-
 
N
P
 
P
I
 
L
N
 
S
A
 
P
M
x
Y
G
 
A
I
 
V
T
 
T
K
|
K
A
 
Y
V
 
V
E
 
N
E
 
E
K
 
I
I
 
Y
A
 
A
V
 
Q
A
 
V
K
 
Y
S
 
A
R
 
R
Y
 
T
S
 
Y
G
 
G
K
 
-
T
 
F
K
 
K
I
 
T
C
 
I
C
 
G
T
 
L
R
 
R
Y
|
Y
G
x
F
N
|
N
V
|
V
M
 
F
C
 
G
S
 
R
R
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
G
 
A
S
 
A
V
|
V
I
|
I
P
|
P
L
x
K
W
 
W
I
 
T
E
 
A
Q
 
A
I
 
M
R
 
L
N
 
K
G
 
G
N
 
D
P
 
D
V
 
V
T
x
Y
L
x
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>349909 FitnessBrowser__Btheta:349909
MSIFAGKTLMITGGTGSFGNAVLNRFLRTDIGEIRIFSRDEKKQDDMRHEYQVKYPDVAH
KIKFFIGDVRNLQSCKNAMPGVDYIFHAAALKQVPSCEFFPMEAVKTNVIGTDNVLTAAI
EAGVGAVICLSTDKAAYPINAMGITKAVEEKIAVAKSRYSGKTKICCTRYGNVMCSRGSV
IPLWIEQIRNGNPVTLTEPTMTRFIMSLEEAVDLVLFAFEHGQNGDILVQKAPACTIQTQ
AEAVCELFGGKKEDIKVIGIRHGEKMYETLLTNEECAKAEDMGNFYRVPADNRGLNYDKF
FKEGETERNTLTEFNSNNTYILNVEETKVKIAALDYIQKELSGEGNFVQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory