SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 350898 FitnessBrowser__Btheta:350898 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7cgvA Full consensus l-threonine 3-dehydrogenase, fctdh-iiym (NAD+ bound form) (see paper)
57% identity, 98% coverage: 2:312/318 of query aligns to 1:307/310 of 7cgvA

query
sites
7cgvA
K
 
K
H
 
R
I
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
I
G
|
G
A
 
A
T
 
N
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
V
M
 
P
E
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
N
 
A
T
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
x
R
G
 
P
A
 
P
E
 
N
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
L
K
 
Y
E
 
E
S
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
E
V
 
Y
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
L
N
 
D
G
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
L
E
 
A
S
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
K
E
 
K
Y
 
Y
H
 
K
I
 
I
D
 
T
T
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
N
 
H
L
 
L
A
|
A
A
|
A
L
 
L
L
|
L
S
 
S
V
 
A
V
 
T
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
K
A
 
A
W
 
W
K
 
D
I
 
L
G
 
N
I
 
M
D
 
D
G
 
G
L
 
L
W
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
-
 
P
C
 
L
A
 
K
V
 
V
F
 
F
T
 
W
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
A
S
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
N
T
 
T
P
 
P
H
 
K
T
 
D
Q
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
I
 
I
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
R
 
T
T
 
T
M
 
I
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
|
K
V
 
V
T
 
A
T
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
C
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
H
N
 
T
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
|
I
I
 
I
S
 
S
N
 
Y
V
 
K
T
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
Y
S
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
K
G
 
G
E
 
G
K
 
K
F
 
Y
V
 
E
C
 
C
P
 
F
I
 
L
K
 
G
E
 
P
G
 
D
T
 
T
L
 
T
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
A
A
 
T
I
 
I
M
 
E
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
D
 
P
P
 
A
T
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
K
H
 
H
R
 
R
N
 
S
A
 
S
F
 
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
A
S
 
A
M
 
M
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
E
I
 
L
F
 
A
H
 
A
A
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
D
F
 
F
E
 
E
M
 
I
I
 
T
Y
 
Y
D
 
K
V
 
P
D
 
D
P
 
-
L
 
V
K
 
R
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
S
W
 
W
P
 
P
D
 
K
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
A
E
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
P
A
 
R
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
S
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
K
D
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
N
L
 
L

5z75A Artificial l-threonine 3-dehydrogenase designed by ancestral sequence reconstruction. (see paper)
51% identity, 97% coverage: 1:310/318 of query aligns to 2:306/306 of 5z75A

query
sites
5z75A
M
 
M
K
 
M
H
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
I
G
|
G
A
 
A
T
x
C
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
T
M
 
V
E
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
E
R
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
T
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
 
R
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
P
K
 
N
G
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
E
V
 
K
V
x
L
D
 
D
V
|
V
T
 
M
N
 
D
G
 
K
E
 
E
M
 
R
I
 
L
E
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
V
K
 
E
E
 
K
Y
 
H
H
 
K
I
 
I
D
 
T
T
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
 
A
L
 
I
L
|
L
S
 
S
V
 
A
V
 
T
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
N
P
 
P
K
 
L
L
 
F
A
 
A
W
 
W
K
 
D
I
 
L
G
 
N
I
 
M
D
 
N
G
 
S
L
 
L
W
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
G
G
 
K
C
 
I
-
 
D
A
 
K
V
 
I
F
 
F
T
 
W
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
A
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
T
T
 
T
P
 
P
H
 
K
T
 
E
Q
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
H
T
 
T
I
 
V
Q
 
M
R
 
D
P
 
P
R
 
S
T
 
T
M
 
V
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
|
K
V
 
L
T
 
A
T
 
G
E
 
E
L
 
R
L
 
W
S
 
C
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
H
N
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
I
R
 
R
F
x
Y
P
|
P
G
 
G
I
x
L
I
 
I
S
 
S
N
 
W
V
 
K
T
 
T
P
|
P
P
|
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
Y
 
F
Y
 
H
S
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
E
G
 
D
E
 
G
K
 
K
F
 
Y
V
 
T
C
 
C
P
 
F
I
 
L
K
 
S
E
 
E
G
 
D
T
 
T
L
 
A
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
A
A
 
T
I
 
I
M
 
E
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
D
 
P
P
 
A
T
 
E
K
 
N
L
 
I
I
 
K
H
 
I
R
 
R
N
 
S
A
 
S
F
 
Y
N
 
N
I
 
L
A
 
A
S
 
G
M
 
M
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
E
I
 
I
F
 
A
H
 
E
A
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
D
F
 
F
E
 
E
M
 
I
I
 
S
Y
 
Y
D
 
E
V
 
P
D
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
R
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
S
W
 
W
P
 
P
D
 
A
S
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
P
A
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
D
S
 
K
M
 
M
T
 
T
V
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
K

7eprB Partial consensus l-threonine 3-dehydrogenase (c-change) (see paper)
48% identity, 98% coverage: 2:313/318 of query aligns to 2:309/310 of 7eprB

query
sites
7eprB
K
 
E
H
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
V
G
|
G
A
 
A
T
 
C
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
A
M
 
L
E
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
T
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
T
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
x
R
G
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
K
 
E
G
 
G
E
 
G
L
 
R
K
 
H
E
 
N
S
 
S
G
 
G
P
 
T
S
 
H
A
 
E
V
 
M
V
 
L
D
|
D
V
x
A
T
 
T
N
 
D
G
 
R
E
 
G
M
 
E
I
 
L
E
 
A
S
 
T
V
 
V
V
 
V
K
 
E
E
 
R
Y
 
H
H
 
K
I
 
I
D
 
T
T
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
N
 
L
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
T
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
W
A
 
A
W
 
W
K
 
N
I
x
L
G
 
N
I
 
M
D
 
T
G
 
S
L
 
L
W
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
Q
 
T
G
 
K
C
 
I
A
 
K
-
 
R
V
 
V
F
 
F
T
 
W
P
|
P
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
A
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
T
T
 
T
P
 
P
H
 
K
T
 
E
Q
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
Y
T
 
T
I
 
V
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
R
 
S
T
 
T
M
 
V
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
|
K
V
 
Q
T
 
A
T
 
G
E
 
E
L
 
G
L
 
W
S
 
C
D
 
R
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
H
N
 
A
K
 
N
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
x
L
I
 
I
S
 
S
N
 
W
V
 
K
T
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
Y
 
F
Y
 
H
S
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
G
K
 
K
F
 
Y
V
 
T
C
 
C
P
 
F
I
 
L
K
 
S
E
 
E
G
 
D
T
 
T
L
 
A
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
A
A
 
T
I
 
I
M
 
E
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
D
 
P
P
 
A
T
 
D
K
 
K
L
 
I
I
 
K
H
 
I
R
 
R
N
 
S
A
 
S
F
 
Y
N
 
N
I
 
L
A
 
A
S
 
G
M
 
M
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
A
T
 
Q
I
 
I
F
 
A
H
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
R
K
 
E
H
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
 
D
F
 
F
E
 
K
M
 
I
I
 
S
Y
 
Y
D
 
E
V
 
P
D
 
D
P
 
-
L
 
Y
K
 
R
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
S
W
 
W
P
 
P
D
 
A
S
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
A
E
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
P
A
 
E
Y
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
K
S
 
E
M
 
M
T
 
V
V
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
A
K
 
N
L
 
L
R
 
K

7epsA Partial consensus l-threonine 3-dehydrogenase (e-change) (see paper)
48% identity, 97% coverage: 4:313/318 of query aligns to 3:308/310 of 7epsA

query
sites
7epsA
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
x
N
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
A
M
 
L
E
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
N
 
R
T
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
x
V
Q
 
V
G
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
P
K
 
T
G
 
G
E
 
R
L
 
H
K
 
V
E
 
H
S
 
L
G
 
-
P
 
P
S
 
F
A
 
E
V
 
V
V
x
L
D
 
N
V
x
A
T
 
T
N
 
D
G
 
R
E
 
G
M
 
E
I
 
L
E
 
A
S
 
T
V
 
V
V
 
V
K
 
E
E
 
R
Y
 
H
H
 
G
I
 
I
D
 
T
T
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
N
 
L
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
A
L
 
L
S
|
S
V
 
A
V
 
T
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
A
P
 
P
K
 
Q
L
 
W
A
 
A
W
 
W
K
 
N
I
x
L
G
 
N
I
 
M
D
 
T
G
 
S
L
 
L
W
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
Q
 
T
G
 
G
C
 
L
-
 
E
A
 
K
V
 
I
F
 
F
T
 
W
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
A
S
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
T
T
 
T
P
 
P
H
 
A
T
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
K
T
 
T
I
 
V
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
R
 
T
T
 
T
M
 
V
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
|
K
V
 
Q
T
 
A
T
 
G
E
 
E
L
 
G
L
 
W
S
 
C
D
 
R
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
H
N
 
A
K
 
N
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
I
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
x
L
I
 
I
S
 
S
N
 
H
V
 
K
T
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
Y
 
F
Y
 
H
S
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
E
K
 
P
F
 
Y
V
 
T
C
 
C
P
 
F
I
 
L
K
 
K
E
 
E
G
 
D
T
 
E
L
 
A
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
A
A
 
T
I
 
I
M
 
E
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
D
 
P
P
 
A
T
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
S
H
 
E
R
 
R
N
 
G
A
 
S
F
 
Y
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
G
M
 
M
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
A
T
 
Q
I
 
I
F
 
A
H
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
R
K
 
E
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
G
F
 
F
E
 
Q
M
 
I
I
 
R
Y
 
Y
D
 
E
V
 
P
D
 
D
P
 
-
L
 
Y
K
 
R
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
S
 
G
W
 
W
P
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
A
E
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
A
A
 
Q
Y
 
Y
D
 
G
L
 
L
E
 
K
S
 
E
M
 
M
T
 
V
V
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
A
K
 
N
L
 
L
R
 
K

2yy7A Crystal structure of thermolabile l-threonine dehydrogenase from flavobacterium frigidimaris kuc-1 (see paper)
49% identity, 97% coverage: 4:312/318 of query aligns to 5:311/312 of 2yy7A

query
sites
2yy7A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
x
C
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
T
M
 
Q
E
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
K
R
 
L
Y
 
Y
G
 
G
N
 
T
T
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
x
R
G
 
K
A
 
L
E
 
-
P
 
-
K
 
N
G
 
T
E
 
D
L
 
V
K
 
V
E
 
N
S
 
S
G
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
E
V
 
V
V
|
V
D
x
N
V
x
A
T
 
L
N
 
D
G
 
F
E
 
N
M
 
Q
I
 
I
E
 
E
S
 
H
V
 
L
V
 
V
K
 
E
E
 
V
Y
 
H
H
 
K
I
 
I
D
 
T
T
 
D
I
 
I
Y
 
Y
N
 
L
L
x
M
A
|
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
K
K
 
N
P
 
P
K
 
A
L
 
F
A
 
A
W
 
W
K
 
D
I
x
L
G
 
N
I
 
M
D
 
N
G
 
S
L
 
L
W
 
F
N
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
N
V
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
A
Q
 
K
G
 
K
C
 
I
A
 
K
V
 
K
-
 
I
F
 
F
T
 
W
P
|
P
S
 
S
S
|
S
I
 
I
G
 
A
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
T
T
 
T
P
 
P
H
 
K
T
 
E
Q
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
R
 
S
T
 
T
M
 
V
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
|
K
V
 
Q
T
 
A
T
 
G
E
 
E
L
 
R
L
 
W
S
 
C
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
H
N
 
N
K
 
I
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
I
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
x
L
I
 
I
S
 
S
N
 
W
V
 
S
T
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
Y
 
F
Y
 
Y
S
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
A
G
 
D
E
 
K
K
 
K
F
 
Y
V
 
E
C
 
C
P
 
F
I
 
L
K
 
S
E
 
S
G
 
E
T
 
T
L
 
K
M
 
M
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
A
A
 
T
I
 
I
M
 
N
L
 
I
M
 
M
E
 
K
A
 
A
D
 
P
P
 
V
T
 
E
K
 
K
L
 
I
I
 
K
H
 
I
R
 
H
N
 
S
A
 
S
F
 
Y
N
 
N
I
 
L
A
 
A
S
 
A
M
 
M
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
T
T
 
E
I
 
I
F
 
A
H
 
N
A
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
E
F
 
F
E
 
T
M
 
I
I
 
T
Y
 
Y
D
 
E
V
 
P
D
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
R
Q
 
Q
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
S
W
|
W
P
 
P
D
 
A
S
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
Q
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
D
W
 
W
G
 
D
W
 
W
K
 
K
P
 
H
A
 
T
Y
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
M
T
 
T
V
 
K
D
 
D
M
 
M
L
 
I
E
 
E
K
 
H
L
 
L

3a1nA Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
44% identity, 98% coverage: 4:316/318 of query aligns to 2:309/315 of 3a1nA

query
sites
3a1nA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
S
T
x
S
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
M
 
P
E
 
Y
L
 
L
R
 
A
R
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
N
 
K
T
 
K
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
 
V
G
 
Q
A
 
R
E
 
D
P
 
T
K
 
G
G
 
G
E
 
-
L
 
I
K
 
K
E
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
F
A
 
I
V
 
T
V
x
L
D
|
D
V
 
V
T
 
S
N
 
N
G
 
R
E
 
D
M
 
E
I
 
I
E
 
D
S
 
R
V
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
K
Y
 
Y
H
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
A
I
 
I
Y
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
G
L
 
I
L
|
L
S
 
S
V
 
A
V
 
K
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
Y
K
 
K
I
 
V
G
 
N
I
 
M
D
 
N
G
 
G
L
 
T
W
 
Y
N
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
H
G
 
R
C
 
V
-
 
E
A
 
K
V
 
V
F
 
V
T
 
I
P
 
P
S
|
S
S
x
T
I
 
I
G
 
G
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
E
T
 
T
P
 
P
H
 
K
T
 
N
Q
 
K
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
D
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
T
R
 
R
P
 
P
R
 
R
T
 
T
M
 
M
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
V
 
I
T
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
L
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
N
 
Y
V
 
K
T
 
A
P
 
E
P
 
P
G
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
Y
S
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
R
E
 
E
K
 
K
F
 
Y
V
 
K
C
 
C
P
 
Y
I
 
L
K
 
A
E
 
P
G
 
N
T
 
R
L
 
A
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
A
A
 
L
I
 
V
M
 
D
L
 
L
M
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
R
T
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
V
H
 
L
R
 
R
N
 
N
A
 
G
F
 
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
T
S
 
A
M
 
Y
S
 
T
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
S
T
 
E
I
 
L
F
 
Y
H
 
S
A
 
K
I
 
I
K
 
K
K
 
E
H
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
E
F
 
F
E
 
E
M
 
I
I
 
E
Y
 
Y
D
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
R
Q
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
S
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
S
T
 
S
C
 
E
A
 
A
R
 
S
E
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
F
K
 
S
P
 
I
A
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
D
S
 
R
M
 
T
T
 
I
V
 
D
D
 
D
M
 
M
L
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
I
R
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L

3a4vA Crystal structure of pyruvate bound l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
44% identity, 98% coverage: 4:316/318 of query aligns to 2:309/311 of 3a4vA

query
sites
3a4vA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
S
T
x
S
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
M
 
P
E
 
Y
L
 
L
R
 
A
R
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
N
 
K
T
 
K
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
 
V
G
 
Q
A
 
R
E
 
D
P
 
T
K
 
G
G
 
G
E
 
-
L
 
I
K
 
K
E
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
F
A
 
I
V
 
T
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
N
G
 
R
E
 
D
M
 
E
I
 
I
E
 
D
S
 
R
V
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
K
Y
 
Y
H
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
A
I
 
I
Y
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
G
L
 
I
L
|
L
S
|
S
V
 
A
V
 
K
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
Y
K
 
K
I
 
V
G
 
N
I
 
M
D
 
N
G
 
G
L
 
T
W
 
Y
N
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
H
G
 
R
C
 
V
-
 
E
A
 
K
V
 
V
F
 
V
T
 
I
P
|
P
S
|
S
S
x
T
I
 
I
G
 
G
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
E
T
 
T
P
 
P
H
 
K
T
 
N
Q
 
K
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
D
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
T
R
 
R
P
 
P
R
 
R
T
 
T
M
 
M
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
V
 
I
T
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
L
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
|
I
I
 
I
S
 
S
N
 
Y
V
 
K
T
 
A
P
 
E
P
 
P
G
 
T
G
 
A
G
 
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
Y
S
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
R
E
 
E
K
 
K
F
 
Y
V
 
K
C
 
C
P
 
Y
I
 
L
K
 
A
E
 
P
G
 
N
T
 
R
L
 
A
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
A
A
 
L
I
 
V
M
 
D
L
 
L
M
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
R
T
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
V
H
 
L
R
 
R
N
 
N
A
 
G
F
 
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
T
S
 
A
M
 
Y
S
 
T
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
S
T
 
E
I
 
L
F
 
Y
H
 
S
A
 
K
I
 
I
K
 
K
K
 
E
H
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
E
F
 
F
E
 
E
M
 
I
I
 
E
Y
 
Y
D
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
R
Q
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
S
 
T
W
|
W
P
 
P
D
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
S
T
 
S
C
 
E
A
 
A
R
 
S
E
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
F
K
 
S
P
 
I
A
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
D
S
 
R
M
 
T
T
 
I
V
 
D
D
 
D
M
 
M
L
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
I
R
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L

6jygD Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from phytophthora infestans (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:316/318 of query aligns to 2:307/307 of 6jygD

query
sites
6jygD
H
 
R
I
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
T
G
|
G
A
 
G
T
|
T
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
M
E
 
E
L
 
L
T
 
V
M
 
P
E
 
Y
L
 
M
R
 
R
R
 
Q
R
 
L
Y
 
F
G
 
G
N
 
A
T
 
D
N
 
T
V
 
I
V
 
V
A
 
N
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
x
K
G
 
A
A
 
P
E
 
G
P
 
R
K
 
D
G
 
G
E
 
N
L
 
F
K
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
V
V
 
Y
V
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
Q
N
 
D
G
 
R
E
 
D
M
 
S
I
 
M
E
 
A
S
 
R
V
 
I
V
 
V
K
 
T
E
 
E
Y
 
Q
H
 
G
I
 
V
D
 
D
T
 
T
I
 
I
Y
 
V
N
 
H
L
x
M
A
|
A
A
x
S
L
 
L
L
|
L
S
|
S
V
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
E
S
 
A
K
 
N
P
 
P
K
 
S
L
 
L
A
 
A
W
 
L
K
 
S
I
x
V
G
 
N
I
 
T
D
 
R
G
 
G
L
 
I
W
 
Q
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
Y
G
 
Q
C
 
L
A
 
R
V
 
V
F
 
F
T
 
A
P
|
P
S
|
S
S
x
T
I
 
I
G
 
A
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
Q
T
 
D
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
Q
 
D
D
 
T
T
 
T
I
 
I
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
R
 
T
T
 
T
M
 
M
Y
|
Y
G
 
G
V
 
L
T
 
T
K
|
K
V
 
V
T
 
H
T
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
G
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
N
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
F
R
 
R
A
 
S
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
x
V
I
 
I
S
 
S
N
 
S
V
 
E
T
 
A
P
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
|
G
T
 
T
T
|
T
D
|
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
Y
S
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
K
G
 
H
E
 
G
K
 
K
F
 
Y
V
 
T
C
 
C
P
 
F
I
 
L
K
 
N
E
 
R
G
 
D
T
 
A
L
 
K
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
C
L
 
L
N
 
K
A
 
A
A
 
T
I
 
M
M
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
N
A
 
A
D
 
-
P
 
P
T
 
N
K
 
D
L
 
C
I
 
L
H
 
S
R
 
Q
N
 
R
A
 
T
F
 
Y
N
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
A
M
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
E
I
 
I
F
 
V
H
 
A
A
 
S
I
 
I
K
 
Q
K
 
K
H
 
V
V
 
M
P
 
P
A
 
S
F
 
F
E
 
Q
M
 
C
I
 
D
Y
 
Y
D
 
K
V
 
P
D
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
D
 
E
S
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
R
S
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
W
G
 
N
W
 
W
K
 
Q
P
 
H
A
 
D
Y
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
D
S
 
S
M
 
M
T
 
V
V
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
V
K
 
K
L
 
L
R
 
D
E
 
A
K
 
K
L
 
L

3ajrA Crystal structure of l-3-hydroxynorvaline bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
44% identity, 98% coverage: 4:316/318 of query aligns to 2:309/314 of 3ajrA

query
sites
3ajrA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
S
T
x
S
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
M
 
P
E
 
Y
L
 
L
R
 
A
R
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
N
 
K
T
 
K
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
 
V
G
 
Q
A
 
R
E
 
D
P
 
T
K
 
G
G
 
G
E
 
-
L
 
I
K
 
K
E
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
F
A
 
I
V
 
T
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
N
G
 
R
E
 
D
M
 
E
I
 
I
E
 
D
S
 
R
V
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
K
Y
 
Y
H
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
A
I
 
I
Y
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
G
L
 
I
L
|
L
S
|
S
V
 
A
V
 
K
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
Y
K
 
K
I
 
V
G
 
N
I
 
M
D
 
N
G
 
G
L
 
T
W
 
Y
N
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
H
G
 
R
C
 
V
-
 
E
A
 
K
V
 
V
F
 
V
T
 
I
P
|
P
S
|
S
S
x
T
I
|
I
G
 
G
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
E
T
 
T
P
 
P
H
 
K
T
 
N
Q
 
K
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
D
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
T
R
 
R
P
 
P
R
 
R
T
 
T
M
 
M
Y
x
F
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
V
 
I
T
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
L
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
|
I
I
 
I
S
 
S
N
 
Y
V
 
K
T
 
A
P
 
E
P
 
P
G
 
T
G
 
A
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
Y
S
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
R
E
 
E
K
 
K
F
 
Y
V
 
K
C
 
C
P
 
Y
I
 
L
K
 
A
E
 
P
G
 
N
T
 
R
L
 
A
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
A
A
 
L
I
 
V
M
 
D
L
 
L
M
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
R
T
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
V
H
 
L
R
 
R
N
 
N
A
 
G
F
 
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
T
S
 
A
M
 
Y
S
 
T
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
S
T
 
E
I
 
L
F
 
Y
H
 
S
A
 
K
I
 
I
K
 
K
K
 
E
H
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
E
F
 
F
E
 
E
M
 
I
I
 
E
Y
 
Y
D
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
R
Q
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
S
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
S
T
 
S
C
 
E
A
 
A
R
 
S
E
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
F
K
 
S
P
 
I
A
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
D
S
 
R
M
 
T
T
 
I
V
 
D
D
 
D
M
 
M
L
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
I
R
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L

3a9wA Crystal structure of l-threonine bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
44% identity, 98% coverage: 4:316/318 of query aligns to 2:309/315 of 3a9wA

query
sites
3a9wA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
S
T
x
S
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
M
 
P
E
 
Y
L
 
L
R
 
A
R
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
N
 
K
T
 
K
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
 
V
G
 
Q
A
 
R
E
 
D
P
 
T
K
 
G
G
 
G
E
 
-
L
 
I
K
 
K
E
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
F
A
 
I
V
 
T
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
N
G
 
R
E
 
D
M
 
E
I
 
I
E
 
D
S
 
R
V
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
K
Y
 
Y
H
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
A
I
 
I
Y
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
 
G
L
 
I
L
|
L
S
|
S
V
 
A
V
 
K
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
D
P
 
P
K
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
Y
K
 
K
I
x
V
G
 
N
I
 
M
D
 
N
G
 
G
L
 
T
W
 
Y
N
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
Q
 
H
G
 
R
C
 
V
-
 
E
A
 
K
V
 
V
F
 
V
T
 
I
P
|
P
S
|
S
S
x
T
I
 
I
G
 
G
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
E
T
 
T
P
 
P
H
 
K
T
 
N
Q
 
K
T
 
V
P
 
P
Q
 
S
D
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
T
R
 
R
P
 
P
R
 
R
T
 
T
M
 
M
Y
x
F
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
V
 
I
T
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
L
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
|
I
I
 
I
S
 
S
N
 
Y
V
 
K
T
 
A
P
 
E
P
 
P
G
 
T
G
 
A
G
|
G
T
|
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
Y
S
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
R
E
 
E
K
 
K
F
 
Y
V
 
K
C
 
C
P
 
Y
I
 
L
K
 
A
E
 
P
G
 
N
T
 
R
L
 
A
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
A
A
 
L
I
 
V
M
 
D
L
 
L
M
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
R
T
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
V
H
 
L
R
 
R
N
 
N
A
 
G
F
 
Y
N
 
N
I
 
V
A
 
T
S
 
A
M
 
Y
S
 
T
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
S
T
 
E
I
 
L
F
 
Y
H
 
S
A
 
K
I
 
I
K
 
K
K
 
E
H
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
E
F
 
F
E
 
E
M
 
I
I
 
E
Y
 
Y
D
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
-
L
 
F
K
 
R
Q
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
S
 
T
W
 
W
P
 
P
D
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
S
T
 
S
C
 
E
A
 
A
R
 
S
E
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
G
W
 
F
K
 
S
P
 
I
A
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
D
S
 
R
M
 
T
T
 
I
V
 
D
D
 
D
M
 
M
L
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
I
R
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L

3wmwB Gale-like l-threonine dehydrogenase from cupriavidus necator (apo form) (see paper)
46% identity, 97% coverage: 4:313/318 of query aligns to 4:278/278 of 3wmwB

query
sites
3wmwB
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
-
T
 
-
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
A
M
 
L
E
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
N
 
R
T
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
T
T
 
S
N
 
D
G
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
-
E
 
A
S
 
T
V
 
V
V
 
V
K
 
E
E
 
R
Y
 
H
H
 
G
I
 
I
D
 
T
T
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
N
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
K
 
-
P
 
P
K
 
Q
L
 
W
A
 
A
W
 
W
K
 
N
I
 
L
G
 
N
I
 
M
D
 
T
G
 
S
L
 
L
W
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
Q
 
T
G
 
G
C
 
L
A
 
E
-
 
R
V
 
V
F
 
F
T
 
W
P
 
P
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
A
S
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
T
T
 
T
P
 
P
H
 
A
T
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
K
T
 
T
I
 
V
Q
 
M
R
 
E
P
 
P
R
 
T
T
 
T
M
 
V
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
 
K
V
 
Q
T
 
A
T
 
G
E
 
E
L
 
G
L
 
W
S
 
C
D
x
R
Y
 
W
Y
 
Y
F
 
H
N
 
A
K
 
N
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
V
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
L
I
 
I
S
 
S
N
 
H
V
 
K
T
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
Y
 
F
Y
 
H
S
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
E
K
 
P
F
 
Y
V
 
T
C
 
C
P
 
F
I
 
L
K
 
K
E
 
E
G
 
D
T
x
E
L
x
A
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
A
A
 
T
I
 
I
M
 
E
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
D
 
P
P
 
A
T
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
S
H
x
E
R
|
R
N
 
G
A
 
S
F
 
Y
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
G
M
 
M
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
A
T
 
Q
I
 
I
F
 
A
H
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
R
K
 
E
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
G
F
 
F
E
 
Q
M
 
I
I
 
R
Y
 
Y
D
 
E
V
 
P
D
 
D
P
 
-
L
 
Y
K
 
R
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
S
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
S
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
A
E
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
A
A
 
Q
Y
 
Y
D
 
G
L
 
L
E
 
K
S
 
E
M
 
M
T
 
V
V
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
A
K
 
N
L
 
L
R
 
K

Q8K3F7 L-threonine 3-dehydrogenase, mitochondrial; EC 1.1.1.103 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
44% identity, 91% coverage: 21:310/318 of query aligns to 75:361/373 of Q8K3F7

query
sites
Q8K3F7
L
 
L
R
 
R
R
 
K
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
N
 
K
T
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
L
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
x
R
G
 
-
A
 
-
E
 
K
P
 
P
K
 
P
G
 
A
E
 
H
L
 
V
K
 
F
E
 
H
S
 
S
G
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
V
V
 
Y
V
 
A
D
x
N
V
x
I
T
 
L
N
 
D
G
 
Y
E
 
K
M
 
S
I
 
L
E
 
R
S
 
E
V
 
I
V
 
V
K
 
V
E
 
N
Y
 
H
H
 
R
I
 
I
D
 
S
T
 
W
I
 
L
Y
 
F
N
 
H
L
 
Y
A
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
|
S
V
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
E
S
 
A
K
 
N
P
 
V
K
 
S
L
 
L
A
 
A
W
 
R
K
 
D
I
 
V
G
 
N
I
 
I
D
 
T
G
 
G
L
 
L
W
 
H
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
E
Q
 
Y
G
 
N
C
 
V
A
 
R
V
 
L
F
 
F
T
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
T
T
 
S
P
 
P
H
x
R
T
 
N
Q
 
P
T
 
A
P
 
P
Q
 
D
D
 
L
T
 
C
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
R
 
R
T
 
T
M
 
I
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
S
K
|
K
V
 
V
T
 
H
T
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
M
S
 
G
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
Y
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
F
R
 
R
A
 
C
V
 
L
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
|
I
I
 
I
S
 
S
N
 
A
V
 
D
T
 
S
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
I
 
I
Y
 
F
Y
 
H
S
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
K
G
 
N
E
 
G
K
 
T
F
 
F
V
 
E
C
 
C
P
 
N
I
 
L
K
 
E
E
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
R
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
I
P
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
T
I
 
L
M
 
E
L
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
D
 
-
P
 
P
T
 
A
K
 
E
L
 
R
I
 
L
H
 
S
R
 
M
N
 
R
A
 
T
F
 
Y
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
 
A
M
 
M
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
E
I
 
L
F
 
A
H
 
Q
A
 
A
I
 
L
K
 
R
K
 
K
H
 
H
V
 
A
P
 
P
A
 
D
F
 
F
E
 
Q
M
 
I
I
 
T
Y
 
Y
D
 
C
V
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
L
K
 
R
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
S
 
S
W
 
W
P
 
P
D
x
M
S
 
I
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
N
A
 
A
R
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
H
A
 
D
Y
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
P
S
 
E
M
 
L
T
 
V
V
 
A
D
 
T
M
 
M
L
 
L
E
 
N

Sites not aligning to the query:

4yr9A Mouse tdh with NAD+ bound (see paper)
44% identity, 91% coverage: 21:310/318 of query aligns to 21:306/308 of 4yr9A

query
sites
4yr9A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
N
 
K
T
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
L
G
 
S
Y
x
D
I
|
I
Q
x
R
G
 
-
A
 
-
E
 
K
P
 
P
K
 
P
G
 
A
E
 
H
L
 
V
K
 
F
E
 
H
S
 
S
G
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
V
V
 
Y
V
x
A
D
x
N
V
x
I
T
 
L
N
 
D
G
 
Y
E
 
K
M
 
S
I
 
L
E
 
R
S
 
E
V
 
I
V
 
V
K
 
V
E
 
N
Y
 
H
H
 
R
I
 
I
D
 
S
T
 
W
I
 
L
Y
 
F
N
 
H
L
x
Y
A
x
S
A
|
A
L
 
L
L
|
L
S
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
E
S
 
A
K
 
N
P
 
V
K
 
S
L
 
L
A
 
A
W
 
R
K
 
D
I
 
V
G
 
N
I
 
I
D
 
T
G
 
G
L
 
L
W
 
H
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
E
Q
 
Y
G
 
N
C
 
V
A
 
R
V
 
L
F
 
F
T
 
V
P
|
P
S
 
S
S
x
T
I
 
I
G
 
G
S
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
T
T
 
S
P
 
P
H
 
R
T
 
N
Q
 
P
T
 
A
P
 
P
Q
 
D
D
 
L
T
 
C
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
R
 
R
T
 
T
M
 
I
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
S
K
|
K
V
 
V
T
 
H
T
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
M
S
 
G
D
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
Y
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
D
 
D
T
 
F
R
 
R
A
 
C
V
 
L
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
|
I
I
 
I
S
 
S
N
 
-
V
 
A
T
 
D
P
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
I
 
I
Y
 
F
Y
 
H
S
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
K
G
 
N
E
 
G
K
 
T
F
 
F
V
 
E
C
 
C
P
 
N
I
 
L
K
 
E
E
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
R
M
 
L
D
 
P
M
 
M
M
 
M
Y
 
Y
M
 
I
P
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
T
I
 
L
M
 
E
L
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
D
 
-
P
 
P
T
 
A
K
 
E
L
 
R
I
 
L
H
 
S
R
 
M
N
 
R
A
 
T
F
 
Y
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
 
A
M
 
M
S
 
S
F
 
F
D
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
E
I
 
L
F
 
A
H
 
Q
A
 
A
I
 
L
K
 
R
K
 
K
H
 
H
V
 
A
P
 
P
A
 
D
F
 
F
E
 
Q
M
 
I
I
 
T
Y
 
Y
D
 
C
V
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
L
K
 
R
Q
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
S
 
S
W
|
W
P
 
P
D
 
M
S
 
I
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
S
C
 
N
A
 
A
R
 
R
E
 
K
E
 
D
W
 
W
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
H
A
 
D
Y
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
P
S
 
E
M
 
L
T
 
V
V
 
A
D
 
T
M
 
M
L
 
L
E
 
N

Sites not aligning to the query:

5y1gA Monomeric l-threonine 3-dehydrogenase from metagenome database (akb and nadh bound form) (see paper)
40% identity, 97% coverage: 4:313/318 of query aligns to 4:306/310 of 5y1gA

query
sites
5y1gA
I
 
I
L
 
L
I
 
V
I
 
T
G
|
G
A
 
A
T
 
L
G
|
G
Q
|
Q
I
|
I
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
T
 
V
M
 
L
E
 
A
L
 
L
R
 
Q
R
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
T
 
D
N
 
K
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
S
Y
x
D
I
x
L
Q
 
K
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
P
K
 
E
G
 
N
E
 
Y
L
 
H
K
 
C
E
 
K
S
 
F
G
 
E
P
 
K
S
 
C
A
x
D
V
x
I
V
 
R
D
 
D
V
 
I
T
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
E
M
 
T
I
 
Y
E
 
E
S
 
R
V
 
I
V
 
N
K
 
N
E
 
E
Y
 
N
H
 
K
I
 
I
D
 
E
T
 
I
I
 
V
Y
 
Y
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
I
L
|
L
S
|
S
V
 
A
V
 
A
A
 
G
E
 
E
S
 
K
K
 
N
P
 
P
K
 
E
L
 
L
A
 
C
W
 
H
K
 
D
I
 
V
G
 
N
I
 
Y
D
 
N
G
 
G
L
 
L
W
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
K
V
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
K
Q
 
Y
G
 
N
C
 
Q
A
 
K
V
 
L
F
 
F
T
 
C
P
 
P
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
A
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
D
T
 
V
P
 
P
H
 
K
T
 
E
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
N
T
 
V
I
 
E
Q
 
L
R
 
N
P
 
P
R
 
K
T
 
T
M
 
V
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
T
K
|
K
V
 
V
T
 
K
T
 
G
E
 
E
L
 
E
L
 
L
S
 
C
D
 
D
Y
 
T
Y
 
Y
F
 
F
N
 
K
K
 
E
Y
 
H
G
 
G
V
 
I
D
 
D
T
 
V
R
 
R
A
 
G
V
 
I
R
 
R
F
x
Y
P
 
P
G
 
G
I
x
L
I
 
I
S
 
S