SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 351507 FitnessBrowser__Btheta:351507 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

8hp3A Crystal structure of meso-diaminopimelate dehydrogenase from prevotella timonensis (see paper)
71% identity, 100% coverage: 2:299/299 of query aligns to 1:298/298 of 8hp3A

query
sites
8hp3A
K
 
K
K
 
K
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
|
G
N
|
N
I
|
I
G
 
G
H
 
K
Y
 
F
V
 
T
L
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
P
 
E
D
 
D
F
 
F
E
 
E
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
R
|
R
R
|
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
N
 
N
K
 
K
P
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
P
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
V
 
V
K
 
Q
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
C
x
A
T
|
T
P
|
P
T
x
S
R
|
R
S
 
S
V
 
C
E
 
K
K
 
E
Y
|
Y
A
 
A
K
 
E
E
 
K
Y
 
I
L
 
L
A
 
P
M
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
N
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
|
S
F
 
F
D
|
D
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
D
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
Y
R
 
R
R
 
S
T
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
P
T
 
L
A
 
C
K
 
K
E
 
E
H
 
H
K
 
H
A
 
A
V
 
V
S
 
S
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
W
 
W
D
|
D
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
 
R
T
 
T
M
 
L
L
 
M
E
 
Q
A
 
S
I
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
L
T
 
S
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
M
S
 
S
M
 
M
G
 
G
H
 
H
T
 
S
V
 
V
A
 
C
V
 
A
K
 
R
A
 
S
I
 
K
D
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
G
T
 
E
G
 
G
I
 
I
H
 
H
R
 
R
R
 
R
M
 
M
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
E
D
 
E
G
 
G
Y
 
A
K
 
T
F
 
L
E
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
T
A
 
K
A
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
V
 
A
N
 
H
D
 
D
E
 
E
T
 
T
H
 
H
V
 
V
K
 
M
L
 
A
V
 
V
P
 
D
S
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
K
D
 
D
M
 
M
G
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
H
L
 
L
T
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
Q
 
Q
L
 
R
F
 
M
E
 
E
F
 
F
N
 
S
M
 
M
R
 
S
I
 
I
N
 
N
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
|
T
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
S
M
 
M
K
 
H
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
V
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
A
G
 
G
D
 
E
R
 
R
E
 
E
E
 
D
W
 
L
I
 
I
G
 
K
H
 
A
L
 
L
V
 
V

3wbfA Crystal structure of meso-diaminopimelate dehydrogenase from symbiobacterium thermophilum co-crystallized with NADP+ and dap (see paper)
66% identity, 99% coverage: 3:299/299 of query aligns to 1:297/297 of 3wbfA

query
sites
3wbfA
K
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
V
G
 
G
H
 
R
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
|
R
R
|
R
A
 
K
G
 
V
A
 
L
E
 
A
N
 
A
K
 
T
P
 
P
E
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
T
N
 
G
Y
 
V
A
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
S
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
V
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
C
|
C
T
x
V
P
|
P
T
|
T
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
P
K
 
E
Y
 
Y
A
 
A
K
 
E
E
 
A
Y
 
M
L
 
L
A
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
H
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
|
S
F
 
Y
D
|
D
I
 
I
H
 
H
T
 
G
G
 
D
I
 
L
V
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
P
T
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
G
A
 
A
V
 
A
S
 
A
I
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
W
|
W
D
|
D
P
|
P
G
 
G
S
 
T
D
 
D
S
 
S
I
 
I
V
 
I
R
 
R
T
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
F
I
 
M
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
F
|
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
M
S
|
S
M
|
M
G
|
G
H
 
H
T
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
S
M
 
M
T
|
T
I
 
I
P
 
P
T
 
A
G
 
G
T
 
M
G
 
G
I
 
V
H
 
H
R
 
K
R
|
R
M
 
A
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
E
D
 
P
G
 
G
Y
 
A
K
 
D
F
 
F
E
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
E
A
 
R
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
N
 
R
D
 
D
E
 
E
T
 
T
H
 
R
V
 
V
K
 
T
L
 
Q
V
 
V
P
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
M
D
 
D
M
 
V
G
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
V
L
 
M
T
 
E
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
A
T
 
T
Q
 
H
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
E
 
R
F
 
F
N
 
E
M
 
M
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
|
T
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
M
V
 
V
C
 
A
V
 
A
A
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
A
M
 
A
K
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
E
 
E
E
 
A
W
 
W
I
 
I
G
 
R
H
 
K
L
 
L
V
 
V

3wbbA Crystal structures of meso-diaminopimelate dehydrogenase from symbiobacterium thermophilum (see paper)
66% identity, 99% coverage: 3:299/299 of query aligns to 1:297/297 of 3wbbA

query
sites
3wbbA
K
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
V
G
 
G
H
 
R
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
|
R
R
|
R
A
 
K
G
 
V
A
 
L
E
 
A
N
 
A
K
 
T
P
 
P
E
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
T
N
 
G
Y
 
V
A
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
S
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
V
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
C
|
C
T
x
V
P
|
P
T
|
T
R
 
R
S
 
S
V
 
V
E
 
P
K
 
E
Y
 
Y
A
 
A
K
 
E
E
 
A
Y
 
M
L
 
L
A
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
H
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
|
S
F
 
Y
D
|
D
I
 
I
H
 
H
T
 
G
G
 
D
I
 
L
V
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
P
T
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
G
A
 
A
V
 
A
S
 
A
I
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
W
|
W
D
|
D
P
|
P
G
 
G
S
 
T
D
 
D
S
 
S
I
 
I
V
 
I
R
 
R
T
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
F
I
 
M
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
F
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
M
S
 
S
M
 
M
G
 
G
H
 
H
T
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
P
 
P
T
 
A
G
 
G
T
 
M
G
 
G
I
 
V
H
 
H
R
 
K
R
 
R
M
 
A
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
E
D
 
P
G
 
G
Y
 
A
K
 
D
F
 
F
E
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
E
A
 
R
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
N
 
R
D
 
D
E
 
E
T
 
T
H
 
R
V
 
V
K
 
T
L
 
Q
V
 
V
P
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
M
D
 
D
M
 
V
G
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
V
L
 
M
T
 
E
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
A
T
 
T
Q
 
H
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
E
 
R
F
 
F
N
 
E
M
 
M
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
|
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
|
T
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
M
V
 
V
C
 
A
V
 
A
A
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
A
M
 
A
K
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
E
 
E
E
 
A
W
 
W
I
 
I
G
 
R
H
 
K
L
 
L
V
 
V

8i7hA Meso-diaminopimelate dehydrogenase
65% identity, 99% coverage: 3:299/299 of query aligns to 2:297/297 of 8i7hA

query
sites
8i7hA
K
 
K
V
 
I
R
 
K
A
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
H
 
R
Y
 
F
V
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
P
 
Q
D
 
D
F
 
F
E
 
E
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
-
G
 
D
A
 
I
E
 
N
N
 
N
K
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
N
 
N
Y
 
I
A
 
T
V
 
V
V
 
T
K
 
N
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
T
L
 
L
E
 
G
G
 
D
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
L
C
 
C
T
 
S
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
I
E
 
K
K
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
S
Y
 
I
L
 
L
A
 
S
M
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
N
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
V
H
 
H
T
 
S
G
 
E
I
 
I
V
 
V
D
 
S
L
 
L
R
 
K
R
 
T
T
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
D
T
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
K
H
 
H
K
 
D
A
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
W
|
W
D
|
D
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
S
 
S
I
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
T
M
 
L
L
 
M
E
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
F
|
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
M
S
|
S
M
|
M
G
|
G
H
|
H
T
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
H
 
H
R
 
R
R
 
R
M
 
M
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
L
K
 
E
D
 
A
G
 
G
Y
 
A
K
 
N
F
 
F
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
S
Y
 
Y
F
 
F
V
 
S
N
 
S
D
 
D
E
 
E
T
 
T
H
 
H
V
 
V
K
 
K
L
 
Q
V
 
V
P
 
D
S
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
L
 
K
D
 
D
M
 
V
G
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
H
L
 
M
T
 
T
R
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Q
 
H
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
E
 
E
F
 
Y
N
 
S
M
 
M
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
|
T
A
 
S
Q
 
Q
V
 
F
L
 
M
V
 
V
C
 
S
V
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
S
M
 
M
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
R
P
 
A
G
 
G
C
 
A
Y
 
Y
T
 
T
M
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
P
I
 
V
D
 
D
L
 
F
L
 
L
P
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
L
E
 
N
E
 
T
W
 
L
I
 
I
G
 
A
H
 
K
L
 
L
V
 
V

3wycA Structure of a meso-diaminopimelate dehydrogenase in complex with nadp (see paper)
33% identity, 97% coverage: 3:293/299 of query aligns to 2:319/327 of 3wycA

query
sites
3wycA
K
 
K
V
 
I
R
 
R
A
 
I
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
L
G
 
G
H
 
R
Y
 
G
V
 
V
L
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
V
G
 
A
V
 
V
V
 
F
R
x
T
R
|
R
A
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
N
x
R
K
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
T
L
 
V
A
 
A
N
 
V
Y
 
K
A
 
S
V
 
N
V
 
V
K
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
H
-
x
V
-
x
D
D
 
D
I
 
A
K
 
Q
E
 
S
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
-
 
E
V
 
I
E
 
D
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
L
C
|
C
T
x
G
P
x
G
T
x
S
R
 
A
S
 
T
V
 
D
E
 
L
K
 
P
Y
 
E
A
x
Q
K
 
G
E
 
P
Y
|
Y
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
G
 
Y
I
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
I
D
 
D
S
|
S
F
 
F
D
|
D
I
 
T
H
 
H
T
 
A
G
 
R
I
 
I
V
 
P
D
 
D
L
 
Y
R
 
F
R
 
D
T
 
A
L
 
V
D
 
N
A
 
A
T
 
A
A
 
A
K
 
E
E
 
Q
H
 
S
K
 
G
A
 
K
V
 
V
S
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
V
G
 
G
W
|
W
D
|
D
P
|
P
G
 
G
S
 
L
D
 
F
S
 
S
I
 
L
V
 
N
R
 
R
T
 
L
M
 
L
L
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
V
A
 
L
P
 
P
K
 
V
G
 
G
I
 
N
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
N
 
F
F
x
W
G
 
G
P
 
K
G
 
G
M
 
V
S
|
S
M
 
Q
G
 
G
H
 
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
I
K
 
R
A
 
R
I
 
I
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
M
 
Y
T
|
T
I
 
I
P
 
P
T
 
I
G
 
D
T
 
E
G
 
A
I
 
V
H
 
N
R
 
R
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
A
R
|
R
M
 
E
V
 
C
Y
 
F
I
 
V
E
 
V
L
 
L
K
 
E
D
 
E
G
 
G
Y
 
A
K
 
D
F
 
P
E
 
A
E
 
K
V
 
V
A
 
E
A
 
H
A
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
N
Y
 
Y
F
 
F
V
 
D
N
 
E
D
 
Y
E
 
D
T
 
T
H
 
T
V
 
V
K
 
H
L
 
F
V
 
I
P
 
S
S
 
E
V
 
E
D
 
E
A
 
L
L
 
K
L
 
Q
D
 
N
-
 
H
-
 
S
-
 
G
M
 
M
G
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
G
N
 
F
L
 
V
T
 
I
R
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
K
S
 
S
G
 
D
K
 
E
T
 
G
Q
 
H
N
 
K
Q
 
Q
L
 
I
F
 
I
E
 
E
F
 
F
N
 
S
M
 
L
R
 
N
I
 
L
-
 
E
N
 
S
N
|
N
P
 
P
A
 
M
L
 
F
T
|
T
A
 
S
Q
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
C
 
A
V
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
A
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
S
 
S
M
 
Q
K
 
N
Q
 
G
Q
 
D
P
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
K
T
 
T
M
 
V
V
 
F
E
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
F
I
 
G
D
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
K
D
 
S
R
 
P
E
 
E
E
 
D

3wgqA Crystal structure of meso-dapdh q154l/t173i/r199m/p248s/h249n/n276s mutant with dap of from clostridium tetani e88
31% identity, 97% coverage: 3:293/299 of query aligns to 1:317/323 of 3wgqA

query
sites
3wgqA
K
 
K
V
 
I
R
 
R
A
 
I
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
H
 
K
Y
 
G
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
I
Q
 
K
A
 
Q
A
 
N
P
 
D
D
 
D
F
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
E
G
 
A
V
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
D
A
 
I
E
 
-
N
 
N
K
 
K
P
 
V
E
 
D
E
 
-
L
 
-
A
 
S
N
 
N
Y
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
L
K
 
V
D
 
H
I
 
I
K
 
S
E
 
R
L
 
L
E
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
K
-
 
D
G
 
T
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
C
-
 
G
-
 
G
T
 
S
P
 
A
T
 
T
R
 
D
S
 
L
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
Y
 
-
A
 
-
K
 
G
E
 
P
Y
 
M
L
 
I
A
 
A
M
 
S
G
 
Q
I
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
N
H
|
H
T
 
G
G
 
R
I
 
I
V
 
P
D
 
Q
L
 
H
R
 
F
R
 
E
T
 
R
L
 
M
D
 
D
A
 
E
T
 
I
A
 
S
K
 
K
E
 
K
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
I
S
 
S
I
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
T
G
 
G
W
 
W
D
 
D
P
 
P
G
 
G
S
 
L
D
 
F
S
 
S
I
 
L
V
 
N
R
|
R
T
 
L
M
 
L
L
 
G
E
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
T
Y
 
H
T
|
T
N
 
F
F
 
W
G
 
G
P
 
K
G
 
G
M
 
V
S
 
S
M
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
I
K
 
R
A
 
R
I
 
V
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
N
A
 
G
L
 
I
S
 
Q
M
 
Y
T
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
I
G
 
K
T
 
G
G
 
A
I
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
C
-
 
D
-
 
F
-
 
T
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
K
H
 
H
R
 
E
R
 
M
M
 
V
V
 
C
Y
 
Y
I
 
V
E
 
V
L
 
P
K
 
E
D
 
E
G
 
N
Y
 
A
K
 
D
F
 
L
E
 
K
E
 
K
V
 
I
A
 
E
A
 
Q
A
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
A
N
 
D
D
 
Y
E
 
N
T
 
T
H
 
T
V
 
V
K
 
H
L
 
F
V
 
I
P
 
T
S
 
E
V
 
E
D
 
E
A
 
L
L
 
K
L
 
L
D
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
G
M
 
L
G
 
S
H
 
N
G
 
G
V
 
G
N
 
F
L
 
V
T
 
I
R
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
N
S
 
T
G
 
Q
K
 
G
T
 
G
Q
 
A
N
 
K
Q
 
Q
L
 
V
F
 
M
E
 
E
F
 
F
N
 
N
M
 
L
R
 
N
I
 
L
N
 
E
N
 
S
P
 
S
A
 
A
-
 
E
L
 
F
T
 
T
A
 
S
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
A
V
 
Y
A
 
S
R
 
R
A
 
A
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
S
 
S
M
 
K
K
 
E
Q
 
G
Q
 
K
P
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
F
I
 
S
D
 
Y
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
K
D
 
T
R
 
P
E
 
E
E
 
E

3wgzB Crystal structure of meso-dapdh q154l/t173i/r199m/p248s/h249n/n276s mutant with d-leucine of from clostridium tetani e88
31% identity, 97% coverage: 3:293/299 of query aligns to 2:318/324 of 3wgzB

query
sites
3wgzB
K
 
K
V
 
I
R
 
R
A
 
I
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
H
 
K
Y
 
G
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
I
Q
 
K
A
 
Q
A
 
N
P
 
D
D
 
D
F
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
E
G
 
A
V
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
D
A
 
I
E
 
-
N
 
N
K
 
K
P
 
V
E
 
D
E
 
-
L
 
-
A
 
S
N
 
N
Y
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
L
K
 
V
D
 
H
I
 
I
K
 
S
E
 
R
L
 
L
E
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
K
-
 
D
G
 
T
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
C
-
 
G
-
 
G
T
 
S
P
 
A
T
 
T
R
 
D
S
 
L
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
Y
 
-
A
 
-
K
 
G
E
 
P
Y
 
M
L
 
I
A
 
A
M
 
S
G
 
Q
I
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
N
H
 
H
T
 
G
G
 
R
I
 
I
V
 
P
D
 
Q
L
 
H
R
 
F
R
 
E
T
 
R
L
 
M
D
 
D
A
 
E
T
 
I
A
 
S
K
 
K
E
 
K
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
I
S
 
S
I
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
T
G
 
G
W
 
W
D
 
D
P
 
P
G
 
G
S
 
L
D
 
F
S
 
S
I
 
L
V
 
N
R
 
R
T
 
L
M
 
L
L
 
G
E
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
T
Y
 
H
T
 
T
N
 
F
F
 
W
G
 
G
P
 
K
G
 
G
M
 
V
S
|
S
M
x
L
G
|
G
H
 
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
I
K
 
R
A
 
R
I
 
V
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
N
A
 
G
L
 
I
S
 
Q
M
 
Y
T
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
I
G
 
K
T
 
G
G
 
A
I
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
C
-
 
D
-
 
F
-
 
T
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
K
H
 
H
R
 
E
R
 
M
M
 
V
V
 
C
Y
 
Y
I
 
V
E
 
V
L
 
P
K
 
E
D
 
E
G
 
N
Y
 
A
K
 
D
F
 
L
E
 
K
E
 
K
V
 
I
A
 
E
A
 
Q
A
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
A
N
 
D
D
 
Y
E
 
N
T
 
T
H
 
T
V
 
V
K
 
H
L
 
F
V
 
I
P
 
T
S
 
E
V
 
E
D
 
E
A
 
L
L
 
K
L
 
L
D
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
G
M
 
L
G
 
S
H
 
N
G
 
G
V
 
G
N
 
F
L
 
V
T
 
I
R
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
N
S
 
T
G
 
Q
K
 
G
T
 
G
Q
 
A
N
 
K
Q
 
Q
L
 
V
F
 
M
E
 
E
F
 
F
N
 
N
M
 
L
R
 
N
I
 
L
N
 
E
N
 
S
P
 
S
A
 
A
-
 
E
L
 
F
T
 
T
A
 
S
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
A
V
 
Y
A
 
S
R
 
R
A
 
A
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
S
 
S
M
 
K
K
 
E
Q
 
G
Q
 
K
P
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
F
I
 
S
D
 
Y
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
K
D
 
T
R
 
P
E
 
E
E
 
E

3wgyB Crystal structure of meso-dapdh q154l/t173i/r199m/p248s/h249n/n276s mutant with 4-methyl-2-oxovalerate of from clostridium tetani e88
31% identity, 97% coverage: 3:293/299 of query aligns to 2:318/324 of 3wgyB

query
sites
3wgyB
K
 
K
V
 
I
R
 
R
A
 
I
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
H
 
K
Y
 
G
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
I
Q
 
K
A
 
Q
A
 
N
P
 
D
D
 
D
F
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
E
G
 
A
V
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
D
A
 
I
E
 
-
N
 
N
K
 
K
P
 
V
E
 
D
E
 
-
L
 
-
A
 
S
N
 
N
Y
 
N
A
 
S
V
 
K
V
 
L
K
 
V
D
 
H
I
 
I
K
 
S
E
 
R
L
 
L
E
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
K
-
 
D
G
 
T
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
C
-
 
G
-
 
G
T
 
S
P
 
A
T
 
T
R
 
D
S
 
L
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
Y
 
-
A
 
-
K
 
G
E
 
P
Y
 
M
L
 
I
A
 
A
M
 
S
G
 
Q
I
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
N
H
 
H
T
 
G
G
 
R
I
 
I
V
 
P
D
 
Q
L
 
H
R
 
F
R
 
E
T
 
R
L
 
M
D
 
D
A
 
E
T
 
I
A
 
S
K
 
K
E
 
K
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
I
S
 
S
I
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
T
G
 
G
W
 
W
D
 
D
P
 
P
G
 
G
S
 
L
D
 
F
S
 
S
I
 
L
V
 
N
R
 
R
T
 
L
M
 
L
L
 
G
E
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
K
T
 
T
Y
 
H
T
 
T
N
 
F
F
 
W
G
 
G
P
 
K
G
 
G
M
 
V
S
|
S
M
x
L
G
|
G
H
|
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
I
K
 
R
A
 
R
I
 
V
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
N
A
 
G
L
 
I
S
 
Q
M
 
Y
T
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
I
G
 
K
T
 
G
G
 
A
I
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
C
-
 
D
-
 
F
-
 
T
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
K
H
 
H
R
 
E
R
 
M
M
 
V
V
 
C
Y
 
Y
I
 
V
E
 
V
L
 
P
K
 
E
D
 
E
G
 
N
Y
 
A
K
 
D
F
 
L
E
 
K
E
 
K
V
 
I
A
 
E
A
 
Q
A
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
A
N
 
D
D
 
Y
E
 
N
T
 
T
H
 
T
V
 
V
K
 
H
L
 
F
V
 
I
P
 
T
S
 
E
V
 
E
D
 
E
A
 
L
L
 
K
L
 
L
D
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
G
M
 
L
G
 
S
H
 
N
G
 
G
V
 
G
N
 
F
L
 
V
T
 
I
R
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
N
S
 
T
G
 
Q
K
 
G
T
 
G
Q
 
A
N
 
K
Q
 
Q
L
 
V
F
 
M
E
 
E
F
 
F
N
 
N
M
 
L
R
 
N
I
 
L
N
 
E
N
 
S
P
 
S
A
 
A
-
 
E
L
 
F
T
 
T
A
 
S
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
C
 
A
V
 
Y
A
 
S
R
 
R
A
 
A
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
S
 
S
M
 
K
K
 
E
Q
 
G
Q
 
K
P
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
F
I
 
S
D
 
Y
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
K
D
 
T
R
 
P
E
 
E
E
 
E

3dapB C. Glutamicum dap dehydrogenase in complex with NADP+ and the inhibitor 5s-isoxazoline (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:295/299 of query aligns to 1:316/320 of 3dapB

query
sites
3dapB
M
 
M
K
 
T
K
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
|
G
Y
 
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
L
G
 
G
H
 
R
Y
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
L
L
 
I
Q
 
A
A
 
K
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
F
R
x
S
R
|
R
A
x
R
G
 
A
A
 
T
E
 
L
N
 
D
K
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
F
N
 
D
Y
 
V
A
 
A
V
 
D
V
 
V
K
 
D
D
 
-
I
 
-
K
 
K
E
 
H
L
 
A
E
 
D
G
 
D
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
M
P
x
G
T
x
S
R
 
A
S
 
T
V
 
D
E
 
I
K
 
P
Y
 
E
A
 
Q
K
 
A
E
 
P
Y
 
K
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
G
 
F
I
 
A
N
 
C
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
x
T
F
 
Y
D
|
D
I
 
N
H
 
H
T
 
R
G
 
D
I
 
I
V
 
P
D
 
R
L
 
H
R
 
R
R
 
Q
T
 
V
L
 
M
D
 
N
A
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
T
E
 
A
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
V
S
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
T
G
 
G
W
|
W
D
|
D
P
|
P
G
 
G
S
 
M
D
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
N
R
 
R
T
 
V
M
 
Y
L
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
A
K
 
E
G
 
H
I
 
Q
T
 
Q
Y
 
H
T
 
T
N
 
F
F
x
W
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
L
S
|
S
M
x
Q
G
|
G
H
 
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
L
K
x
R
A
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
M
 
Y
T
|
T
I
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
K
G
 
Q
I
 
T
H
 
H
R
 
K
R
|
R
M
 
Q
V
 
C
Y
 
F
I
 
V
E
 
-
L
 
V
K
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
A
K
 
D
F
 
H
E
 
E
E
 
R
V
 
I
A
 
E
A
 
N
A
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
N
 
G
D
 
Y
E
 
E
T
 
V
H
 
E
V
 
V
K
 
N
L
 
F
V
 
I
P
 
D
S
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
L
 
T
L
 
F
D
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
T
-
 
G
M
 
M
G
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
G
N
 
H
L
 
V
T
 
I
R
 
T
K
 
T
G
 
G
V
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
F
Q
 
-
N
 
N
Q
 
H
L
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
Y
N
 
I
M
 
L
R
 
K
I
 
L
N
 
D
-
 
R
N
 
N
P
 
P
A
 
D
L
 
F
T
|
T
A
 
A
Q
 
S
V
 
S
L
 
Q
V
 
I
C
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
A
-
 
H
-
 
R
M
 
M
K
 
K
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
G
Q
 
Q
P
 
S
G
 
G
C
 
A
Y
 
F
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
A
V
 
P
I
 
Y
D
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
E
D
 
N
R
 
L
E
 
D
E
 
D
W
 
L
I
 
I

2dapA C. Glutamicum dap dehydrogenase in complex with dap (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:295/299 of query aligns to 1:316/320 of 2dapA

query
sites
2dapA
M
 
M
K
 
T
K
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
I
 
L
G
 
G
H
 
R
Y
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
L
L
 
I
Q
 
A
A
 
K
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
F
R
 
S
R
 
R
A
 
R
G
 
A
A
 
T
E
 
L
N
 
D
K
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
F
N
 
D
Y
 
V
A
 
A
V
 
D
V
 
V
K
 
D
D
 
-
I
 
-
K
 
K
E
 
H
L
 
A
E
 
D
G
 
D
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
M
P
 
G
T
 
S
R
 
A
S
 
T
V
 
D
E
 
I
K
 
P
Y
 
E
A
 
Q
K
 
A
E
 
P
Y
 
K
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
G
 
F
I
 
A
N
 
C
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
F
 
Y
D
 
D
I
 
N
H
 
H
T
 
R
G
 
D
I
 
I
V
 
P
D
 
R
L
 
H
R
 
R
R
 
Q
T
 
V
L
 
M
D
 
N
A
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
T
E
 
A
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
V
S
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
T
G
 
G
W
|
W
D
|
D
P
 
P
G
 
G
S
 
M
D
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
N
R
 
R
T
 
V
M
 
Y
L
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
A
K
 
E
G
 
H
I
 
Q
T
 
Q
Y
 
H
T
 
T
N
 
F
F
x
W
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
L
S
|
S
M
x
Q
G
 
G
H
 
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
M
 
Y
T
|
T
I
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
K
G
 
Q
I
 
T
H
 
H
R
 
K
R
|
R
M
 
Q
V
 
C
Y
 
F
I
 
V
E
 
-
L
 
V
K
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
A
K
 
D
F
 
H
E
 
E
E
 
R
V
 
I
A
 
E
A
 
N
A
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
N
 
G
D
 
Y
E
 
E
T
 
V
H
 
E
V
 
V
K
 
N
L
 
F
V
 
I
P
 
D
S
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
L
 
T
L
 
F
D
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
T
-
 
G
M
 
M
G
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
G
N
 
H
L
 
V
T
 
I
R
 
T
K
 
T
G
 
G
V
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
F
Q
 
-
N
 
N
Q
 
H
L
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
Y
N
 
I
M
 
L
R
 
K
I
 
L
N
 
D
-
 
R
N
 
N
P
 
P
A
 
D
L
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
V
 
S
L
 
Q
V
 
I
C
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
A
-
 
H
-
 
R
M
 
M
K
 
K
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
G
Q
 
Q
P
 
S
G
 
G
C
 
A
Y
 
F
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
A
V
 
P
I
 
Y
D
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
E
D
 
N
R
 
L
E
 
D
E
 
D
W
 
L
I
 
I

1f06B Three dimensional structure of the ternary complex of corynebacterium glutamicum diaminopimelate dehydrogenase NADPH-l-2-amino-6-methylene- pimelate (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:295/299 of query aligns to 1:316/320 of 1f06B

query
sites
1f06B
M
 
M
K
 
T
K
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
|
G
Y
 
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
L
G
 
G
H
 
R
Y
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
L
L
 
I
Q
 
A
A
 
K
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
F
R
x
S
R
|
R
A
x
R
G
 
A
A
 
T
E
 
L
N
 
D
K
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
F
N
 
D
Y
 
V
A
 
A
V
 
D
V
 
V
K
 
D
D
 
-
I
 
-
K
 
K
E
 
H
L
 
A
E
 
D
G
 
D
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
C
|
C
T
 
M
P
 
G
T
x
S
R
 
A
S
 
T
V
 
D
E
 
I
K
 
P
Y
 
E
A
 
Q
K
 
A
E
 
P
Y
 
K
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
G
 
F
I
 
A
N
 
C
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
x
T
F
 
Y
D
|
D
I
 
N
H
 
H
T
 
R
G
 
D
I
 
I
V
 
P
D
 
R
L
 
H
R
 
R
R
 
Q
T
 
V
L
 
M
D
 
N
A
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
T
E
 
A
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
V
S
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
A
x
T
G
|
G
W
|
W
D
 
D
P
 
P
G
 
G
S
 
M
D
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
N
R
 
R
T
 
V
M
 
Y
L
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
A
K
 
E
G
 
H
I
 
Q
T
 
Q
Y
 
H
T
 
T
N
 
F
F
x
W
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
L
S
|
S
M
x
Q
G
|
G
H
|
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
M
 
Y
T
|
T
I
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
K
G
 
Q
I
 
T
H
 
H
R
 
K
R
|
R
M
 
Q
V
 
C
Y
 
F
I
 
V
E
 
-
L
 
V
K
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
A
K
 
D
F
 
H
E
 
E
E
 
R
V
 
I
A
 
E
A
 
N
A
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
N
 
G
D
 
Y
E
 
E
T
 
V
H
 
E
V
 
V
K
 
N
L
 
F
V
 
I
P
 
D
S
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
L
 
T
L
 
F
D
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
T
-
 
G
M
 
M
G
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
G
N
 
H
L
 
V
T
 
I
R
 
T
K
 
T
G
 
G
V
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
F
Q
 
-
N
 
N
Q
 
H
L
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
Y
N
 
I
M
 
L
R
 
K
I
 
L
N
 
D
-
 
R
N
|
N
P
 
P
A
 
D
L
 
F
T
|
T
A
 
A
Q
 
S
V
 
S
L
 
Q
V
 
I
C
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
A
-
 
H
-
 
R
M
 
M
K
 
K
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
G
Q
 
Q
P
 
S
G
 
G
C
 
A
Y
 
F
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
A
V
 
P
I
 
Y
D
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
E
D
 
N
R
 
L
E
 
D
E
 
D
W
 
L
I
 
I

1dapB C. Glutamicum dap dehydrogenase in complex with NADP+ (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:295/299 of query aligns to 1:316/320 of 1dapB

query
sites
1dapB
M
 
M
K
 
T
K
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
L
G
 
G
H
 
R
Y
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
L
L
 
I
Q
 
A
A
 
K
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
F
R
x
S
R
|
R
A
x
R
G
 
A
A
 
T
E
 
L
N
 
D
K
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
F
N
 
D
Y
 
V
A
 
A
V
 
D
V
 
V
K
 
D
D
 
-
I
 
-
K
 
K
E
 
H
L
 
A
E
 
D
G
 
D
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
M
P
 
G
T
x
S
R
 
A
S
 
T
V
 
D
E
 
I
K
 
P
Y
 
E
A
 
Q
K
 
A
E
 
P
Y
 
K
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
G
 
F
I
 
A
N
 
C
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
x
T
F
 
Y
D
|
D
I
 
N
H
 
H
T
 
R
G
 
D
I
 
I
V
 
P
D
 
R
L
 
H
R
 
R
R
 
Q
T
 
V
L
 
M
D
 
N
A
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
T
E
 
A
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
V
S
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
A
x
T
G
|
G
W
|
W
D
|
D
P
|
P
G
 
G
S
 
M
D
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
N
R
 
R
T
 
V
M
 
Y
L
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
A
K
 
E
G
 
H
I
 
Q
T
 
Q
Y
 
H
T
 
T
N
 
F
F
x
W
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
L
S
 
S
M
x
Q
G
|
G
H
 
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
M
 
Y
T
|
T
I
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
K
G
 
Q
I
 
T
H
 
H
R
 
K
R
|
R
M
 
Q
V
 
C
Y
 
F
I
 
V
E
 
-
L
 
V
K
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
A
K
 
D
F
 
H
E
 
E
E
 
R
V
 
I
A
 
E
A
 
N
A
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
N
 
G
D
 
Y
E
 
E
T
 
V
H
 
E
V
 
V
K
 
N
L
 
F
V
 
I
P
 
D
S
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
L
 
T
L
 
F
D
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
T
-
 
G
M
 
M
G
 
P
H
|
H
G
 
G
V
 
G
N
 
H
L
 
V
T
 
I
R
 
T
K
 
T
G
 
G
V
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
F
Q
 
-
N
 
N
Q
 
H
L
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
Y
N
 
I
M
 
L
R
 
K
I
 
L
N
 
D
-
 
R
N
 
N
P
 
P
A
 
D
L
 
F
T
|
T
A
 
A
Q
 
S
V
 
S
L
 
Q
V
 
I
C
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
A
-
 
H
-
 
R
M
 
M
K
 
K
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
G
Q
 
Q
P
 
S
G
 
G
C
 
A
Y
 
F
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
A
V
 
P
I
 
Y
D
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
E
D
 
N
R
 
L
E
 
D
E
 
D
W
 
L
I
 
I

1dapA C. Glutamicum dap dehydrogenase in complex with NADP+ (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:295/299 of query aligns to 1:316/320 of 1dapA

query
sites
1dapA
M
 
M
K
 
T
K
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
L
G
 
G
H
 
R
Y
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
L
L
 
I
Q
 
A
A
 
K
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
F
R
x
S
R
|
R
A
x
R
G
 
A
A
 
T
E
 
L
N
 
D
K
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
F
N
 
D
Y
 
V
A
 
A
V
 
D
V
 
V
K
 
D
D
 
-
I
 
-
K
 
K
E
 
H
L
 
A
E
 
D
G
 
D
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
C
|
C
T
x
M
P
 
G
T
x
S
R
 
A
S
 
T
V
 
D
E
 
I
K
 
P
Y
 
E
A
 
Q
K
 
A
E
 
P
Y
 
K
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
G
 
F
I
 
A
N
 
C
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
x
T
F
 
Y
D
|
D
I
 
N
H
 
H
T
 
R
G
 
D
I
 
I
V
 
P
D
 
R
L
 
H
R
 
R
R
 
Q
T
 
V
L
 
M
D
 
N
A
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
T
E
 
A
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
V
S
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
T
G
|
G
W
|
W
D
|
D
P
|
P
G
 
G
S
 
M
D
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
N
R
 
R
T
 
V
M
 
Y
L
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
A
K
 
E
G
 
H
I
 
Q
T
 
Q
Y
 
H
T
 
T
N
 
F
F
 
W
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
L
S
 
S
M
 
Q
G
 
G
H
 
H
T
 
S
V
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
M
 
Y
T
 
T
I
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
K
G
 
Q
I
 
T
H
 
H
R
 
K
R
 
R
M
 
Q
V
 
C
Y
 
F
I
 
V
E
 
-
L
 
V
K
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
A
K
 
D
F
 
H
E
 
E
E
 
R
V
 
I
A
 
E
A
 
N
A
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
N
 
G
D
 
Y
E
 
E
T
 
V
H
 
E
V
 
V
K
 
N
L
 
F
V
 
I
P
 
D
S
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
L
 
T
L
 
F
D
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
T
-
 
G
M
 
M
G
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
G
N
 
H
L
 
V
T
 
I
R
 
T
K
 
T
G
 
G
V
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
F
Q
 
-
N
 
N
Q
 
H
L
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
Y
N
 
I
M
 
L
R
 
K
I
 
L
N
 
D
-
 
R
N
|
N
P
 
P
A
 
D
L
 
F
T
|
T
A
 
A
Q
 
S
V
 
S
L
 
Q
V
 
I
C
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
A
-
 
H
-
 
R
M
 
M
K
 
K
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
G
Q
 
Q
P
 
S
G
 
G
C
 
A
Y
 
F
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
A
V
 
P
I
 
Y
D
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
E
D
 
N
R
 
L
E
 
D
E
 
D
W
 
L
I
 
I

5gz6A Structure of d-amino acid dehydrogenase in complex with NADPH and 2- keto-6-aminocapronic acid (see paper)
31% identity, 97% coverage: 3:293/299 of query aligns to 2:312/318 of 5gz6A

query
sites
5gz6A
K
 
K
V
 
I
R
 
R
A
 
I
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
L
G
 
G
H
 
R
Y
 
G
V
 
V
L
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
V
G
 
A
V
 
V
V
 
F
R
x
T
R
|
R
A
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
N
x
R
K
 
D
P
 
P
E
 
K
E
 
T
L
 
V
A
 
A
N
 
V
Y
 
K
A
 
S
V
 
N
V
 
V
K
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
H
-
 
V
-
 
D
D
 
D
I
 
A
K
 
Q
E
 
S
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
-
 
E
V
 
I
E
 
D
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
C
T
x
G
P
x
G
T
x
S
R
 
A
S
 
T
V
 
D
E
 
L
K
 
P
Y
 
E
A
 
Q
K
 
G
E
 
P
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
G
 
Y
I
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
I
D
 
D
S
|
S
F
 
F
D
x
A
I
 
T
H
 
H
T
 
A
G
 
R
I
 
I
V
 
P
D
 
D
L
 
Y
R
 
F
R
 
D
T
 
A
L
 
V
D
 
N
A
 
A
T
 
A
A
 
A
K
 
E
E
 
Q
H
 
S
K
 
G
A
 
K
V
 
V
S
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
V
G
|
G
W
|
W
D
|
D
P
|
P
G
 
G
S
 
L
D
 
F
S
 
S
I
 
L
V
 
N
R
 
R
T
 
L
M
 
L
L
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
V
A
 
L
P
 
P
K
 
V
G
 
G
I
 
N
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
N
 
F
F
x
W
G
 
G
P
x
K
G
 
G
M
 
V
S
 
S
M
 
L
G
 
G
H
 
G
T
 
-
V
 
-
A
 
A
V
 
I
K
 
R
A
 
R
I
 
I
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
M
 
Y
T
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
I
G
 
D
T
 
E
G
 
A
I
 
V
H
 
N
R
 
R
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
A
R
 
M
M
 
E
V
 
C
Y
 
F
I
 
V
E
 
V
L
 
L
K
 
E
D
 
E
G
 
G
Y
 
A
K
 
D
F
 
P
E
 
A
E
 
K
V
 
V
A
 
E
A
 
H
A
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
T
D
 
M
P
 
P
Y
 
N
F
 
F
V
 
F
N
 
D
D
 
E
-
 
Y
E
 
D
T
 
T
H
 
T
V
 
V
K
 
H
L
 
F
V
 
I
P
 
S
S
 
E
V
 
E
D
 
E
A
 
L
L
 
K
L
 
Q
D
 
N
-
 
H
-
 
S
-
 
G
M
 
M
G
 
P
H
 
N
G
 
G
V
 
G
N
 
F
L
 
V
T
 
I
R
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
Q
 
K
N
 
K
Q
 
Q
L
 
I
F
 
I
E
 
E
F
 
F
N
 
S
M
 
L
R
 
N
I
 
L
-
 
E
N
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
M
L
 
F
T
|
T
A
 
S
Q
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
C
 
A
V
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
A
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
S
 
S
M
 
Q
K
 
N
Q
 
G
Q
 
D
P
 
K
G
 
G
C
 
A
Y
 
K
T
 
T
M
 
V
V
 
F
E
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
F
I
 
G
D
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
K
D
 
S
R
 
P
E
 
E
E
 
D

5loaA Crystal structure of the engineered d-amino acid dehydrogenase (daadh) bound to NADP+
28% identity, 98% coverage: 3:295/299 of query aligns to 2:315/319 of 5loaA

query
sites
5loaA
K
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
I
x
L
G
 
G
H
 
R
Y
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
K
A
 
L
L
 
I
Q
 
A
A
 
K
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
F
R
x
S
R
|
R
A
x
R
G
 
A
A
 
T
E
 
L
N
 
D
K
 
T
P
 
K
E
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
F
N
 
D
Y
 
V
A
 
A
V
 
D
V
 
V
K
 
D
D
 
-
I
 
-
K
 
K
E
 
H
L
 
A
E
 
D
G
 
D
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
C
|
C
T
 
M
P
 
G
T
x
S
R
 
A
S
 
T
V
 
D
E
 
I
K
 
P
Y
 
E
A
 
Q
K
 
A
E
 
P
Y
 
K
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
G
 
F
I
 
A
N
 
C
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
x
T
F
 
Y
D
|
D
I
 
N
H
 
H
T
 
R
G
 
D
I
 
I
V
 
P
D
 
R
L
 
H
R
 
R
R
 
Q
T
 
V
L
 
M
D
 
N
A
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
T
E
 
A
H
 
A
K
 
G
A
 
N
V
 
V
S
 
A
I
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
T
G
 
G
W
|
W
D
|
D
P
|
P
G
 
G
S
 
M
D
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
N
R
 
R
T
 
V
M
 
Y
L
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
A
K
 
E
G
 
H
I
 
Q
T
 
Q
Y
 
H
T
 
T
N
 
F
F
 
W
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
L
S
 
S
M
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
S
V
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
M
 
Y
T
 
I
I
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
K
G
 
Q
I
 
T
H
 
H
R
 
K
R
 
M
M
 
Q
V
 
C
Y
 
F
I
 
V
E
 
-
L
 
V
K
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
A
K
 
D
F
 
H
E
 
E
E
 
R
V
 
I
A
 
E
A
 
N
A
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
T
D
 
M
P
 
P
-
 
D
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
N
 
G
D
 
Y
E
 
E
T
 
V
H
 
E
V
 
V
K
 
N
L
 
F
V
 
I
P
 
D
S
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
L
 
T
L
 
F
D
 
D
M
 
S
G
 
E
H
 
H
-
 
T
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
N
G
 
G
V
 
G
N
 
H
L
 
V
T
 
I
R
 
T
K
 
T
G
 
G
V
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
F
Q
 
-
N
 
N
Q
 
H
L
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
Y
N
 
I
M
 
L
R
 
K
I
 
L
N
 
D
-
 
R
N
|
N
P
 
P
A
 
D
L
 
F
T
|
T
A
 
A
Q
 
S
V
 
S
L
 
Q
V
 
I
C
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
A
-
 
H
-
 
R
M
 
M
K
 
K
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
G
Q
 
Q
P
 
S
G
 
G
C
 
A
Y
 
F
T
 
T
M
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
P
 
A
V
 
P
I
 
Y
D
 
L
L
 
L
L
 
S
P
 
P
G
 
E
D
 
N
R
 
L
E
 
D
E
 
D
W
 
L
I
 
I

Query Sequence

>351507 FitnessBrowser__Btheta:351507
MKKVRAAIVGYGNIGHYVLEALQAAPDFEIAGVVRRAGAENKPEELANYAVVKDIKELEG
VEVAILCTPTRSVEKYAKEYLAMGINTVDSFDIHTGIVDLRRTLDATAKEHKAVSIISAG
WDPGSDSIVRTMLEAIAPKGITYTNFGPGMSMGHTVAVKAIDGVKAALSMTIPTGTGIHR
RMVYIELKDGYKFEEVAAAIKADPYFVNDETHVKLVPSVDALLDMGHGVNLTRKGVSGKT
QNQLFEFNMRINNPALTAQVLVCVARASMKQQPGCYTMVEVPVIDLLPGDREEWIGHLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory