SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 351619 FitnessBrowser__Btheta:351619 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7reqD Methylmalonyl-coa mutase, 2-carboxypropyl-coa inhibitor complex (see paper)
29% identity, 91% coverage: 8:581/633 of query aligns to 8:564/623 of 7reqD

query
sites
7reqD
L
 
L
F
 
A
S
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
P
P
 
K
V
 
A
S
 
T
T
 
E
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
M
 
E
E
 
R
K
 
E
V
 
V
T
 
E
A
 
K
D
x
V
L
 
L
-
 
N
K
x
R
G
 
G
A
 
R
D
 
P
F
 
P
E
 
E
K
 
K
K
 
Q
L
 
L
V
 
T
W
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
C
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
V
K
 
H
T
 
T
N
 
V
E
 
D
G
 
G
F
 
I
K
 
D
V
 
I
K
 
V
P
 
P
F
 
M
Y
 
Y
R
 
R
M
 
P
E
 
K
D
 
D
L
 
A
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
P
T
 
K
T
 
K
D
 
L
A
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
K
 
T
K
 
V
S
 
R
N
 
N
N
 
G
E
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
A
W
 
W
L
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
E
x
L
I
 
H
K
 
E
V
 
D
E
 
P
C
 
D
P
 
E
K
 
K
E
 
F
A
 
T
N
 
R
A
 
K
K
 
A
A
 
I
L
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
N
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
L
F
 
L
H
 
R
V
 
V
K
 
D
A
 
P
K
 
D
E
 
A
L
 
I
N
 
A
A
 
P
E
 
E
Y
 
H
I
 
L
E
 
D
T
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
S
G
 
D
I
 
V
Q
 
L
A
 
L
E
 
E
C
 
M
-
 
T
-
 
K
V
 
V
E
 
E
L
 
V
N
 
F
F
 
S
S
 
R
T
 
Y
C
 
D
Q
 
Q
G
 
G
H
 
A
V
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
V
 
V
A
 
S
Y
 
V
F
 
Y
Q
 
E
K
 
R
K
 
S
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
V
 
A
K
 
K
K
 
D
L
 
L
R
 
A
G
 
L
S
 
N
V
 
L
N
 
G
Y
 
L
D
 
D
F
 
P
F
 
I
N
 
G
K
 
F
M
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
T
E
 
E
K
 
P
G
 
-
D
 
D
M
 
L
V
 
T
Q
 
V
T
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
W
L
 
V
I
 
R
E
 
R
A
 
L
I
 
A
Q
 
K
P
 
F
L
 
S
P
 
P
F
 
D
Y
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
V
N
 
T
V
 
I
N
 
D
A
 
A
I
x
N
S
x
I
L
 
Y
N
 
H
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
G
I
 
D
S
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
A
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
T
G
 
G
N
 
A
E
 
E
Y
 
Y
M
 
V
N
 
R
Q
 
A
L
 
L
T
 
V
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
F
P
 
T
A
 
A
A
 
T
T
 
E
V
 
A
A
 
F
K
 
D
K
 
T
I
 
I
K
 
N
F
 
F
N
 
R
F
 
V
G
 
T
I
 
A
S
 
T
S
 
H
N
 
D
Y
 
Q
F
 
F
L
 
L
E
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
R
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
M
 
E
L
 
A
W
 
W
A
 
A
N
 
R
I
 
I
V
 
G
A
 
E
S
 
V
Y
 
F
H
 
-
P
 
-
E
 
-
C
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
G
A
 
V
N
 
D
G
 
E
E
 
D
C
 
K
R
 
R
C
 
G
A
 
A
A
 
R
K
 
Q
M
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
S
T
 
W
F
 
R
N
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
R
F
 
E
D
 
D
A
 
P
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
L
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
S
T
 
I
E
 
A
A
 
T
M
 
F
S
 
S
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
S
 
S
M
 
I
T
 
T
V
 
T
V
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
T
K
 
Q
T
 
A
Y
 
L
S
 
G
T
 
L
P
 
P
-
 
E
D
 
D
E
 
D
F
 
F
S
 
P
E
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
S
 
V
H
 
N
F
 
I
D
 
G
K
 
R
V
 
V
I
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
R
S
 
S
I
 
L
A
 
A
K
 
D
Q
 
A
A
 
A
W
 
W
E
 
K
L
 
E
F
 
F
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
S
A
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
M
A
 
T
G
 
E
T
 
H
V
 
V
Q
 
T
A
 
K
A
 
V
V
 
L
N
 
D
E
 
A
S
 
C
N
 
N
K
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
A
K
 
K
A
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
N
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
V
 
P
L
 
I
L
 
T
G
 
A
T
 
V
N
 
S
Q
 
E
F
 
F
P
 
P
N
 
M
F
 
I
N
 
G
E
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
I
E
 
E
K
 
T
Q
 
K
P
 
P
I
 
F
E
 
P
A
 
A
K
 
A
C
 
P
C
 
A
C
 
R
G
 
K
G
 
G
D
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
C
 
-
E
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
A
F
 
W
D
 
H
R
 
R
A
 
D
A
 
S
S
 
E
E
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
R
 
M
L
 
D
E
 
R
T
 
S
E
 
T
A
 
S
S
 
V
G
 
S
K
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
V
F
 
F
M
 
L
L
 
A
T
 
C
I
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
R
A
 
R
M
 
D
R
 
F
Q
 
G
A
 
G
R
 
R
A
 
E
Q
 
G
Y
 
F
S
 
S
C
 
S
N
 
P
F
 
V
L
 
W
A
 
H
C
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
E
 
D
V
 
T
I
 
P
D
 
Q
N
 
V
L
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
A
 
I
G
 
-
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
F
M
 
K
A
 
K
A
 
S
K
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
V
 
A
V
 
D
L
 
L
C
 
C
S
 
S
S
 
S
D
 
A
D
 
K
E
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Q
Y
 
Q
A
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

6reqB Methylmalonyl-coa mutase, 3-carboxypropyl-coa inhibitor complex (see paper)
29% identity, 91% coverage: 8:581/633 of query aligns to 4:560/619 of 6reqB

query
sites
6reqB
L
 
L
F
 
A
S
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
P
P
 
K
V
 
A
S
 
T
T
 
E
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
M
 
E
E
 
R
K
 
E
V
 
V
T
 
E
A
 
K
D
x
V
L
 
L
-
 
N
K
x
R
G
 
G
A
 
R
D
 
P
F
 
P
E
 
E
K
 
K
K
 
Q
L
 
L
V
 
T
W
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
C
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
V
K
 
H
T
 
T
N
 
V
E
 
D
G
 
G
F
 
I
K
 
D
V
 
I
K
 
V
P
 
P
F
 
M
Y
 
Y
R
 
R
M
 
P
E
 
K
D
 
D
L
 
A
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
P
T
 
K
T
 
K
D
 
L
A
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
K
 
T
K
 
V
S
 
R
N
 
N
N
 
G
E
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
A
W
 
W
L
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
E
x
L
I
 
H
K
 
E
V
 
D
E
 
P
C
 
D
P
 
E
K
 
K
E
 
F
A
 
T
N
 
R
A
 
K
K
 
A
A
 
I
L
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
N
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
L
F
 
L
H
 
R
V
 
V
K
 
D
A
 
P
K
 
D
E
 
A
L
 
I
N
 
A
A
 
P
E
 
E
Y
 
H
I
 
L
E
 
D
T
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
S
G
 
D
I
 
V
Q
 
L
A
 
L
E
 
E
C
 
M
-
 
T
-
 
K
V
 
V
E
 
E
L
 
V
N
 
F
F
 
S
S
 
R
T
 
Y
C
 
D
Q
 
Q
G
 
G
H
 
A
V
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
V
 
V
A
 
S
Y
 
V
F
 
Y
Q
 
E
K
 
R
K
 
S
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
V
 
A
K
 
K
K
 
D
L
 
L
R
 
A
G
 
L
S
 
N
V
 
L
N
 
G
Y
 
L
D
 
D
F
 
P
F
 
I
N
 
G
K
 
F
M
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
T
E
 
E
K
 
P
G
 
-
D
 
D
M
 
L
V
 
T
Q
 
V
T
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
W
L
 
V
I
 
R
E
 
R
A
 
L
I
 
A
Q
 
K
P
 
F
L
 
S
P
 
P
F
 
D
Y
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
V
N
 
T
V
 
I
N
 
D
A
 
A
I
x
N
S
x
I
L
 
Y
N
 
H
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
G
I
 
D
S
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
A
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
T
G
 
G
N
 
A
E
 
E
Y
 
Y
M
 
V
N
 
R
Q
 
A
L
 
L
T
 
V
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
F
P
 
T
A
 
A
A
 
T
T
 
E
V
 
A
A
 
F
K
 
D
K
 
T
I
 
I
K
 
N
F
 
F
N
 
R
F
 
V
G
 
T
I
 
A
S
 
T
S
 
H
N
 
D
Y
 
Q
F
 
F
L
 
L
E
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
R
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
M
 
E
L
 
A
W
 
W
A
 
A
N
 
R
I
 
I
V
 
G
A
 
E
S
 
V
Y
 
F
H
 
-
P
 
-
E
 
-
C
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
G
A
 
V
N
 
D
G
 
E
E
 
D
C
 
K
R
 
R
C
 
G
A
 
A
A
 
R
K
 
Q
M
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
S
T
 
W
F
 
R
N
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
R
F
 
E
D
 
D
A
 
P
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
L
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
S
T
 
I
E
 
A
A
 
T
M
 
F
S
 
S
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
S
 
S
M
 
I
T
 
T
V
 
T
V
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
T
K
 
Q
T
 
A
Y
 
L
S
 
G
T
 
L
P
 
P
-
 
E
D
 
D
E
 
D
F
 
F
S
 
P
E
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
S
 
V
H
 
N
F
 
I
D
 
G
K
 
R
V
 
V
I
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
R
S
 
S
I
 
L
A
 
A
K
 
D
Q
 
A
A
 
A
W
 
W
E
 
K
L
 
E
F
 
F
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
S
A
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
M
A
 
T
G
 
E
T
 
H
V
 
V
Q
 
T
A
 
K
A
 
V
V
 
L
N
 
D
E
 
A
S
 
C
N
 
N
K
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
A
K
 
K
A
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
N
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
V
 
P
L
 
I
L
 
T
G
 
A
T
 
V
N
 
S
Q
 
E
F
 
F
P
 
P
N
 
M
F
 
I
N
 
G
E
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
I
E
 
E
K
 
T
Q
 
K
P
 
P
I
 
F
E
 
P
A
 
A
K
 
A
C
 
P
C
 
A
C
 
R
G
 
K
G
 
G
D
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
C
 
-
E
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
A
F
 
W
D
 
H
R
 
R
A
 
D
A
 
S
S
 
E
E
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
R
 
M
L
 
D
E
 
R
T
 
S
E
 
T
A
 
S
S
 
V
G
 
S
K
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
V
F
 
F
M
 
L
L
 
A
T
 
C
I
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
R
A
 
R
M
 
D
R
 
F
Q
 
G
A
 
G
R
 
R
A
 
E
Q
 
G
Y
 
F
S
 
S
C
 
S
N
 
P
F
 
V
L
 
W
A
 
H
C
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
E
 
D
V
 
T
I
 
P
D
 
Q
N
 
V
L
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
A
 
I
G
 
-
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
F
M
 
K
A
 
K
A
 
S
K
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
V
 
A
V
 
D
L
 
L
C
 
C
S
 
S
S
 
S
D
 
A
D
 
K
E
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Q
Y
 
Q
A
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

5reqD Methylmalonyl-coa mutase, y89f mutant, substrate complex (see paper)
29% identity, 91% coverage: 8:581/633 of query aligns to 4:560/619 of 5reqD

query
sites
5reqD
L
 
L
F
 
A
S
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
P
P
 
K
V
 
A
S
 
T
T
 
E
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
M
 
E
E
 
R
K
 
E
V
 
V
T
 
E
A
 
K
D
x
V
L
 
L
-
 
N
K
x
R
G
 
G
A
 
R
D
 
P
F
 
P
E
 
E
K
 
K
K
 
Q
L
 
L
V
 
T
W
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
C
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
V
K
 
H
T
 
T
N
 
V
E
 
D
G
 
G
F
 
I
K
 
D
V
 
I
K
 
V
P
 
P
F
 
M
Y
 
Y
R
 
R
M
 
P
E
 
K
D
 
D
L
 
A
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
P
T
 
K
T
 
K
D
 
L
A
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
K
 
T
K
 
V
S
 
R
N
 
N
N
 
G
E
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
A
W
 
W
L
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
E
x
L
I
 
H
K
 
E
V
 
D
E
 
P
C
 
D
P
 
E
K
 
K
E
 
F
A
 
T
N
 
R
A
 
K
K
 
A
A
 
I
L
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
N
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
L
F
 
L
H
 
R
V
 
V
K
 
D
A
 
P
K
 
D
E
 
A
L
 
I
N
 
A
A
 
P
E
 
E
Y
 
H
I
 
L
E
 
D
T
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
S
G
 
D
I
 
V
Q
 
L
A
 
L
E
 
E
C
 
M
-
 
T
-
 
K
V
 
V
E
 
E
L
 
V
N
 
F
F
 
S
S
 
R
T
 
Y
C
 
D
Q
 
Q
G
 
G
H
 
A
V
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
V
 
V
A
 
S
Y
 
V
F
 
Y
Q
 
E
K
 
R
K
 
S
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
V
 
A
K
 
K
K
 
D
L
 
L
R
 
A
G
 
L
S
 
N
V
 
L
N
 
G
Y
 
L
D
 
D
F
 
P
F
 
I
N
 
G
K
 
F
M
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
T
E
 
E
K
 
P
G
 
-
D
 
D
M
 
L
V
 
T
Q
 
V
T
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
W
L
 
V
I
 
R
E
 
R
A
 
L
I
 
A
Q
 
K
P
 
F
L
 
S
P
 
P
F
 
D
Y
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
V
N
 
T
V
 
I
N
 
D
A
 
A
I
x
N
S
x
I
L
 
Y
N
 
H
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
G
I
 
D
S
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
A
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
T
G
 
G
N
 
A
E
 
E
Y
 
Y
M
 
V
N
 
R
Q
 
A
L
 
L
T
 
V
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
F
P
 
T
A
 
A
A
 
T
T
 
E
V
 
A
A
 
F
K
 
D
K
 
T
I
 
I
K
 
N
F
 
F
N
 
R
F
 
V
G
 
T
I
 
A
S
 
T
S
 
H
N
 
D
Y
 
Q
F
 
F
L
 
L
E
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
R
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
M
 
E
L
 
A
W
 
W
A
 
A
N
 
R
I
 
I
V
 
G
A
 
E
S
 
V
Y
 
F
H
 
-
P
 
-
E
 
-
C
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
G
A
 
V
N
 
D
G
 
E
E
 
D
C
 
K
R
 
R
C
 
G
A
 
A
A
 
R
K
 
Q
M
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
S
T
 
W
F
 
R
N
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
R
F
 
E
D
 
D
A
 
P
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
L
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
S
T
 
I
E
 
A
A
 
T
M
 
F
S
 
S
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
S
 
S
M
 
I
T
 
T
V
 
T
V
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
T
K
 
Q
T
 
A
Y
 
L
S
 
G
T
 
L
P
 
P
-
 
E
D
 
D
E
 
D
F
 
F
S
 
P
E
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
S
 
V
H
 
N
F
 
I
D
 
G
K
 
R
V
 
V
I
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
R
S
 
S
I
 
L
A
 
A
K
 
D
Q
 
A
A
 
A
W
 
W
E
 
K
L
 
E
F
 
F
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
S
A
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
M
A
 
T
G
 
E
T
 
H
V
 
V
Q
 
T
A
 
K
A
 
V
V
 
L
N
 
D
E
 
A
S
 
C
N
 
N
K
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
A
K
 
K
A
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
N
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
V
 
P
L
 
I
L
 
T
G
 
A
T
 
V
N
 
S
Q
 
E
F
 
F
P
 
P
N
 
M
F
 
I
N
 
G
E
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
I
E
 
E
K
 
T
Q
 
K
P
 
P
I
 
F
E
 
P
A
 
A
K
 
A
C
 
P
C
 
A
C
 
R
G
 
K
G
 
G
D
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
C
 
-
E
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
A
F
 
W
D
 
H
R
 
R
A
 
D
A
 
S
S
 
E
E
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
R
 
M
L
 
D
E
 
R
T
 
S
E
 
T
A
 
S
S
 
V
G
 
S
K
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
V
F
 
F
M
 
L
L
 
A
T
 
C
I
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
R
A
 
R
M
 
D
R
 
F
Q
 
G
A
 
G
R
 
R
A
 
E
Q
 
G
Y
 
F
S
 
S
C
 
S
N
 
P
F
 
V
L
 
W
A
 
H
C
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
E
 
D
V
 
T
I
 
P
D
 
Q
N
 
V
L
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
A
 
I
G
 
-
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
F
M
 
K
A
 
K
A
 
S
K
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
V
 
A
V
 
D
L
 
L
C
 
C
S
 
S
S
 
S
D
 
A
D
 
K
E
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Q
Y
 
Q
A
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

1e1cB Methylmalonyl-coa mutase h244a mutant (see paper)
29% identity, 91% coverage: 8:581/633 of query aligns to 4:560/619 of 1e1cB

query
sites
1e1cB
L
 
L
F
 
A
S
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
P
P
 
K
V
 
A
S
 
T
T
 
E
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
M
 
E
E
 
R
K
 
E
V
 
V
T
 
E
A
 
K
D
x
V
L
 
L
-
 
N
K
x
R
G
 
G
A
 
R
D
 
P
F
 
P
E
 
E
K
 
K
K
 
Q
L
 
L
V
 
T
W
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
C
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
V
K
 
H
T
 
T
N
 
V
E
 
D
G
 
G
F
 
I
K
 
D
V
 
I
K
 
V
P
 
P
F
 
M
Y
 
Y
R
 
R
M
 
P
E
 
K
D
 
D
L
 
A
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
P
T
 
K
T
 
K
D
 
L
A
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
T
K
 
T
K
 
V
S
 
R
N
 
N
N
 
G
E
 
D
-
 
M
-
 
D
-
 
A
W
 
W
L
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
E
x
L
I
 
H
K
 
E
V
 
D
E
 
P
C
 
D
P
 
E
K
 
K
E
 
F
A
 
T
N
 
R
A
 
K
K
 
A
A
 
I
L
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
N
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
L
F
 
L
H
 
R
V
 
V
K
 
D
A
 
P
K
 
D
E
 
A
L
 
I
N
 
A
A
 
P
E
 
E
Y
 
H
I
 
L
E
 
D
T
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
S
G
 
D
I
 
V
Q
 
L
A
 
L
E
 
E
C
 
M
-
 
T
-
 
K
V
 
V
E
 
E
L
 
V
N
 
F
F
 
S
S
 
R
T
 
Y
C
 
D
Q
 
Q
G
 
G
H
 
A
V
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
V
 
V
A
 
S
Y
 
V
F
 
Y
Q
 
E
K
 
R
K
 
S
D
 
D
Y
 
K
D
 
P
V
 
A
K
 
K
K
 
D
L
 
L
R
 
A
G
 
L
S
 
N
V
 
L
N
 
G
Y
 
L
D
 
D
F
 
P
F
 
I
N
 
G
K
 
F
M
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
T
E
 
E
K
 
P
G
 
-
D
 
D
M
 
L
V
 
T
Q
 
V
T
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
W
L
 
V
I
 
R
E
 
R
A
 
L
I
 
A
Q
 
K
P
 
F
L
 
S
P
 
P
F
 
D
Y
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
V
N
 
T
V
 
I
N
 
D
A
 
A
I
x
N
S
x
I
L
 
Y
N
 
H
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
G
I
 
D
S
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
A
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
T
G
 
G
N
 
A
E
 
E
Y
 
Y
M
 
V
N
 
R
Q
 
A
L
 
L
T
 
V
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
F
P
 
T
A
 
A
A
 
T
T
 
E
V
 
A
A
 
F
K
 
D
K
 
T
I
 
I
K
 
N
F
 
F
N
 
R
F
 
V
G
 
T
I
 
A
S
 
T
S
 
H
N
 
D
Y
 
Q
F
 
F
L
 
L
E
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
R
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
M
 
E
L
 
A
W
 
W
A
 
A
N
 
R
I
 
I
V
 
G
A
 
E
S
 
V
Y
 
F
H
 
-
P
 
-
E
 
-
C
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
G
A
 
V
N
 
D
G
 
E
E
 
D
C
 
K
R
 
R
C
 
G
A
 
A
A
 
R
K
 
Q
M
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
S
T
 
W
F
 
R
N
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
R
F
 
E
D
 
D
A
 
P
H
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
L
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
S
T
 
I
E
 
A
A
 
T
M
 
F
S
 
S
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
E
S
 
S
M
 
I
T
 
T
V
 
T
V
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
T
K
 
Q
T
 
A
Y
 
L
S
 
G
T
 
L
P
 
P
-
 
E
D
 
D
E
 
D
F
 
F
S
 
P
E
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
G
L
 
I
L
 
V
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
S
 
V
H
 
N
F
 
I
D
 
G
K
 
R
V
 
V
I
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
R
S
 
S
I
 
L
A
 
A
K
 
D
Q
 
A
A
 
A
W
 
W
E
 
K
L
 
E
F
 
F
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
S
A
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
M
A
 
T
G
 
E
T
 
H
V
 
V
Q
 
T
A
 
K
A
 
V
V
 
L
N
 
D
E
 
A
S
 
C
N
 
N
K
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
A
K
 
K
A
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
N
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
V
 
P
L
 
I
L
 
T
G
 
A
T
 
V
N
 
S
Q
 
E
F
 
F
P
 
P
N
 
M
F
 
I
N
 
G
E
 
A
K
 
R
A
 
S
G
 
I
E
 
E
K
 
T
Q
 
K
P
 
P
I
 
F
E
 
P
A
 
A
K
 
A
C
 
P
C
 
A
C
 
R
G
 
K
G
 
G
D
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
C
 
-
E
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
A
F
 
W
D
 
H
R
 
R
A
 
D
A
 
S
S
 
E
E
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
R
 
M
L
 
D
E
 
R
T
 
S
E
 
T
A
 
S
S
 
V
G
 
S
K
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
V
F
 
F
M
 
L
L
 
A
T
 
C
I
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
R
A
 
R
M
 
D
R
 
F
Q
 
G
A
 
G
R
 
R
A
 
E
Q
 
G
Y
 
F
S
 
S
C
 
S
N
 
P
F
 
V
L
 
W
A
 
H
C
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
E
 
D
V
 
T
I
 
P
D
 
Q
N
 
V
L
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
A
 
I
G
 
-
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
F
M
 
K
A
 
K
A
 
S
K
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
V
 
A
V
 
D
L
 
L
C
 
C
S
 
S
S
 
S
D
 
A
D
 
K
E
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Q
Y
 
Q
A
 
G
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P22033 Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial; MCM; Methylmalonyl-CoA isomerase; EC 5.4.99.2 from Homo sapiens (Human) (see 28 papers)
28% identity, 71% coverage: 5:456/633 of query aligns to 29:492/750 of P22033

query
sites
P22033
K
x
Q
E
x
Q
K
x
R
L
|
L
F
x
L
S
x
H
D
x
Q
F
x
Q
S
x
Q
P
|
P
V
x
L
S
x
H
T
x
P
E
|
E
Q
 
-
W
|
W
M
x
A
E
x
A
K
x
L
V
x
A
T
x
K
A
x
K
D
x
Q
L
|
L
K
|
K
G
|
G
A
x
K
D
x
N
F
x
P
E
|
E
K
x
D
K
 
-
L
|
L
V
x
I
W
|
W
K
x
H
T
|
T
N
x
P
E
|
E
G
|
G
F
x
I
K
x
S
V
x
I
K
|
K
P
|
P
F
x
L
Y
|
Y
R
x
S
M
x
K
E
x
R
D
|
D
L
x
T
E
x
M
G
x
D
L
|
L
K
 
-
T
 
-
T
x
P
D
x
E
A
x
E
L
|
L
P
|
P
G
|
G
E
x
V
F
x
K
P
|
P
Y
x
F
L
x
T
R
|
R
G
|
G
-
x
P
-
x
Y
-
x
P
T
|
T
K
x
M
K
x
Y
S
x
T
N
x
F
N
x
R
E
x
P
W
|
W
L
x
T
V
x
I
R
|
R
Q
|
Q
E
x
Y
I
x
A
K
x
G
V
x
F
E
x
S
C
x
T
P
x
V
K
x
E
E
|
E
A
x
S
N
|
N
-
x
K
-
x
F
-
x
Y
-
x
K
-
x
D
-
x
N
-
x
I
-
x
K
-
x
A
-
x
G
-
x
Q
-
x
Q
-
x
G
-
x
L
A
x
S
K
x
V
A
|
A
L
x
F
D
|
D
I
x
L
-
x
A
L
x
T
N
x
H
K
x
R
G
|
G
V
x
Y
D
|
D
S
|
S
L
x
D
S
x
N
F
x
P
H
x
R
V
|
V
K
x
R
A
x
G
K
x
D
E
x
V
L
x
G
N
x
M
A
|
A
-
x
G
-
x
V
-
x
A
-
x
I
-
x
D
-
x
T
-
x
V
E
|
E
Y
x
D
I
x
T
E
x
K
T
x
I
L
|
L
L
x
F
N
x
D
G
|
G
I
|
I
Q
x
P
A
x
L
E
|
E
C
x
K
V
x
M
E
x
S
L
x
V
N
x
S
F
x
M
S
 
-
T
|
T
C
x
M
Q
x
N
G
|
G
H
x
A
V
|
V
V
x
I
E
x
P
L
x
V
A
x
L
G
x
A
L
x
N
L
x
F
V
x
I
A
x
V
Y
x
T
F
x
G
Q
x
E
K
x
E
K
x
Q
D
x
G
Y
x
V
D
x
P
V
x
K
K
x
E
K
|
K
L
|
L
R
x
T
G
|
G
S
x
T
V
x
I
N
x
Q
Y
x
N
D
|
D
F
x
I
F
x
L
N
x
K
K
x
E
M
x
F
L
x
M
T
x
V
R
|
R
G
x
N
-
x
T
-
x
Y
-
x
I
-
x
F
K
x
P
E
x
P
K
x
E
G
x
P
D
x
S
M
|
M
V
x
K
Q
x
I
T
x
I
A
|
A
K
x
D
A
x
I
L
x
F
I
x
E
E
x
Y
A
x
T
I
x
A
Q
x
K
P
x
H
L
x
M
P
|
P
F
x
K
Y
x
F
R
x
N
V
x
S
L
x
I
N
x
S
V
x
I
N
x
S
A
x
G
I
x
Y
S
x
H
L
x
M
N
x
Q
N
x
E
A
|
A
G
|
G
A
|
A
Y
x
D
I
x
A
S
x
I
Q
x
L
E
|
E
L
|
L
G
x
A
Y
|
Y
A
x
T
L
|
L
A
|
A
W
x
D
G
|
G
N
x
L
E
|
E
Y
|
Y
M
x
S
N
x
R
Q
x
T
L
x
G
T
x
L
D
x
Q
A
|
A
G
|
G
I
x
L
P
x
T
A
x
I
A
x
D
T
x
E
V
x
F
A
|
A
K
x
P
K
x
R
I
x
L
K
x
S
F
|
F
N
x
F
F
x
W
G
|
G
I
|
I
S
x
G
S
x
M
N
|
N
Y
x
F
F
x
Y
L
x
M
E
|
E
I
|
I
A
|
A
K
|
K
F
x
M
R
|
R
A
|
A
A
x
G
R
|
R
M
x
R
L
|
L
W
|
W
A
|
A
N
x
H
I
x
L
V
x
I
A
x
E
S
x
K
-
x
M
Y
x
F
H
x
Q
P
|
P
E
x
K
C
x
N
L
x
S
R
x
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
x
S
A
x
L
K
x
L
M
x
L
A
x
R
V
x
A
H
|
H
A
x
C
E
x
Q
T
|
T
S
|
S
T
x
G
F
x
W
N
x
S
L
|
L
T
|
T
L
x
E
F
x
Q
D
|
D
A
x
P
H
x
Y
V
x
N
N
|
N
L
x
I
L
x
V
R
|
R
T
|
T
Q
x
A
T
x
I
E
|
E
A
|
A
M
|
M
S
x
A
A
|
A
A
x
V
L
x
F
A
x
G
G
|
G
V
x
T
D
x
Q
S
|
S
M
x
L
T
x
H
V
x
T
V
x
N
P
x
S
F
|
F
D
|
D
K
x
E
T
x
A
Y
x
L
S
x
G
T
x
L
P
|
P
D
x
T
E
x
V
F
x
K
S
|
S
E
x
A
R
|
R
L
x
I
A
|
A
R
|
R
N
|
N
Q
x
T
Q
|
Q
L
x
I
L
x
I
L
x
I
K
x
Q
E
|
E
E
|
E
S
|
S
H
x
G
F
x
I
D
x
P
K
|
K
V
|
V
I
x
A
D
|
D
P
|
P
A
x
W
A
x
G
G
|
G
S
|
S
Y
|
Y
Y
x
M
I
x
M
E
|
E
N
x
C
L
|
L
T
|
T
V
x
N
S
x
D
I
x
V
A
x
Y
K
x
D
Q
x
A
A
|
A
W
x
L
E
x
K
L
|
L
F
x
I
L
x
N
A
x
E
V
x
I
E
|
E
E
|
E
A
x
M
G
|
G
G
|
G
F
x
M
Y
x
A
A
x
K
A
|
A
L
x
V
K
x
A
A
x
E
G
|
G
T
x
I
V
x
P
Q
x
K
A
x
L
A
x
R
V
x
I
N
x
E
E
|
E
S
x
C
N
x
A
K
x
A
A
x
R
R
|
R
H
x
Q
K
x
A
A
x
R
V
x
I
A
x
D
Q
x
S
R
x
G
R
x
S
E
|
E
V
|
V
L
x
I
L
x
V
G
|
G
T
x
V
N
|
N
Q
x
K
F
x
Y

Sites not aligning to the query:

2xiqA Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase in complex with adenosylcobalamin and malonyl-coa (see paper)
28% identity, 69% coverage: 19:456/633 of query aligns to 7:457/714 of 2xiqA

query
sites
2xiqA
Q
 
E
W
 
W
M
 
A
E
 
A
K
 
L
V
 
A
T
 
K
A
 
K
D
 
Q
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
K
D
 
N
F
 
P
E
 
E
K
 
D
K
 
-
L
 
L
V
 
I
W
 
W
K
 
H
T
 
T
N
 
P
E
 
E
G
 
G
F
 
I
K
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
F
 
L
Y
 
Y
R
 
S
M
 
K
E
 
R
D
 
D
L
 
T
E
 
M
G
 
D
L
 
L
K
 
-
T
 
-
T
 
P
D
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
K
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
P
T
|
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
T
N
 
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
V
K
 
E
E
 
E
A
 
S
N
 
N
-
 
K
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
A
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
F
D
 
D
I
x
L
-
 
A
L
 
T
N
x
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
R
A
 
G
K
 
D
E
 
V
L
 
G
N
 
M
A
|
A
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
T
-
 
V
E
 
E
Y
 
D
I
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
L
 
F
N
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
E
C
 
K
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
P
L
 
V
A
 
L
G
 
A
L
 
N
L
 
F
V
 
I
A
 
V
Y
 
T
F
 
G
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
P
V
 
K
K
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
T
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
 
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
 
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
F
K
 
P
E
 
P
K
 
E
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
K
Q
 
I
T
 
I
A
 
A
K
 
D
A
 
I
L
 
F
I
 
E
E
 
Y
A
 
T
I
 
A
Q
 
K
P
 
H
L
 
M
P
 
P
F
x
K
Y
 
F
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
D
I
 
A
S
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
L
E
 
E
Y
 
Y
M
 
S
N
 
R
Q
 
T
L
 
G
T
 
L
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
T
A
 
I
A
 
D
T
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
x
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
Y
L
 
M
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
R
M
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
E
S
 
K
-
 
M
Y
 
F
H
 
Q
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
S
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
L
K
 
L
M
 
L
A
x
R
V
x
A
H
|
H
A
 
C
E
x
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
E
F
 
Q
D
 
D
A
 
P
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
I
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
A
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
F
A
 
G
G
 
G
V
 
T
D
x
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
F
D
 
D
K
x
E
T
 
A
Y
 
L
S
x
G
T
x
L
P
 
P
D
 
T
E
 
V
F
 
K
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
I
L
 
I
L
 
I
K
 
Q
E
 
E
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
I
D
 
P
K
 
K
V
 
V
I
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
M
I
 
M
E
 
E
N
 
C
L
 
L
T
 
T
V
 
N
S
 
D
I
 
V
A
 
Y
K
 
D
Q
 
A
A
 
A
W
 
L
E
 
K
L
 
L
F
 
I
L
 
N
A
 
E
V
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
L
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
C
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
R
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

8dyjB Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase in complex with adp and cob(ii)alamin (see paper)
28% identity, 69% coverage: 19:456/633 of query aligns to 6:456/708 of 8dyjB

query
sites
8dyjB
Q
 
E
W
 
W
M
 
A
E
 
A
K
 
L
V
 
A
T
 
K
A
 
K
D
 
Q
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
K
D
 
N
F
 
P
E
 
E
K
 
D
K
 
-
L
 
L
V
 
I
W
 
W
K
 
H
T
 
T
N
 
P
E
 
E
G
 
G
F
 
I
K
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
F
 
L
Y
 
Y
R
 
S
M
 
K
E
 
R
D
 
D
L
 
T
E
 
M
G
 
D
L
 
L
K
 
P
T
 
-
T
 
-
D
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
K
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
T
 
T
K
 
M
K
 
Y
S
 
T
N
 
F
N
 
R
E
 
P
W
 
W
L
 
T
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
V
K
 
E
E
 
E
A
 
S
N
 
N
-
 
K
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
A
 
S
K
 
V
A
 
A
L
x
F
D
 
D
I
x
L
-
 
A
L
 
T
N
x
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
R
A
 
G
K
 
D
E
 
V
L
 
G
N
 
M
A
|
A
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
T
-
 
V
E
 
E
Y
 
D
I
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
L
 
F
N
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
E
C
 
K
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
 
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
P
L
 
V
A
 
L
G
 
A
L
 
N
L
 
F
V
 
I
A
 
V
Y
 
T
F
 
G
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
P
V
 
K
K
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
T
V
 
I
N
 
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
x
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
F
K
 
P
E
 
P
K
 
E
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
K
Q
 
I
T
 
I
A
 
A
K
 
D
A
 
I
L
 
F
I
 
E
E
 
Y
A
 
T
I
 
A
Q
 
K
P
 
H
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
F
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
D
I
 
A
S
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
L
E
 
E
Y
 
Y
M
 
S
N
 
R
Q
 
T
L
 
G
T
 
L
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
T
A
 
I
A
 
D
T
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
L
K
 
S
F
 
F
N
x
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
Y
L
 
M
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
R
M
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
E
S
 
K
-
 
M
Y
 
F
H
 
Q
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
S
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
L
K
 
L
M
 
L
A
 
R
V
 
A
H
 
H
A
 
C
E
x
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
E
F
 
Q
D
 
D
A
 
P
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
I
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
A
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
F
A
 
G
G
 
G
V
 
T
D
 
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
x
N
P
 
S
F
 
F
D
 
D
K
x
E
T
 
A
Y
 
L
S
x
G
T
x
L
P
|
P
D
 
T
E
 
V
F
 
K
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
I
L
 
I
L
 
I
K
 
Q
E
 
E
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
I
D
 
P
K
 
K
V
 
V
I
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
M
I
 
M
E
 
E
N
 
C
L
 
L
T
 
T
V
 
N
S
 
D
I
 
V
A
 
Y
K
 
D
Q
 
A
A
 
A
W
 
L
E
 
K
L
 
L
F
 
I
L
 
N
A
 
E
V
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
L
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
C
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
R
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

8gjuJ Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase (mmut) in complex with methylmalonic acidemia type a protein (mmaa), coenzyme a, and gdp (see paper)
28% identity, 69% coverage: 19:456/633 of query aligns to 7:457/689 of 8gjuJ

query
sites
8gjuJ
Q
 
E
W
 
W
M
 
A
E
 
A
K
 
L
V
 
A
T
 
K
A
 
K
D
 
Q
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
K
D
 
N
F
 
P
E
 
E
K
 
D
K
 
-
L
 
L
V
 
I
W
 
W
K
 
H
T
 
T
N
 
P
E
 
E
G
 
G
F
 
I
K
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
F
 
L
Y
 
Y
R
 
S
M
 
K
E
 
R
D
 
D
L
 
T
E
 
M
G
 
D
L
 
L
K
 
P
T
 
-
T
 
-
D
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
V
F
 
K
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
P
T
|
T
K
 
M
K
 
Y
S
 
T
N
 
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
 
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
V
K
 
E
E
 
E
A
 
S
N
 
N
-
 
K
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
A
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
F
D
 
D
I
 
L
-
 
A
L
 
T
N
 
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
R
A
 
G
K
 
D
E
 
V
L
 
G
N
 
M
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
T
-
 
V
E
 
E
Y
 
D
I
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
L
 
F
N
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
E
C
 
K
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
P
L
 
V
A
 
L
G
 
A
L
 
N
L
 
F
V
 
I
A
 
V
Y
 
T
F
 
G
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
P
V
 
K
K
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
T
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
x
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
 
V
R
 
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
F
K
 
P
E
 
P
K
 
E
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
K
Q
 
I
T
 
I
A
 
A
K
 
D
A
 
I
L
 
F
I
 
E
E
 
Y
A
 
T
I
 
A
Q
 
K
P
 
H
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
F
R
x
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
 
Y
S
 
H
L
 
M
N
 
Q
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
D
I
 
A
S
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
L
E
 
E
Y
 
Y
M
 
S
N
 
R
Q
 
T
L
 
G
T
 
L
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
T
A
 
I
A
 
D
T
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
 
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
Y
L
 
M
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
R
M
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
E
S
 
K
-
 
M
Y
 
F
H
 
Q
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
S
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
L
K
 
L
M
 
L
A
x
R
V
x
A
H
|
H
A
 
C
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
T
 
G
F
 
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
E
F
 
Q
D
 
D
A
 
P
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
I
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
A
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
F
A
 
G
G
 
G
V
 
T
D
x
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
F
D
 
D
K
 
E
T
 
A
Y
 
L
S
 
G
T
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
V
F
 
K
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
I
L
 
I
L
 
I
K
 
Q
E
 
E
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
I
D
 
P
K
 
K
V
 
V
I
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
M
I
 
M
E
 
E
N
 
C
L
 
L
T
 
T
V
 
N
S
 
D
I
 
V
A
 
Y
K
 
D
Q
 
A
A
 
A
W
 
L
E
 
K
L
 
L
F
 
I
L
 
N
A
 
E
V
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
L
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
C
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
R
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
I
L
 
V
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

6oxdA Structure of mycobacterium tuberculosis methylmalonyl-coa mutase with adenosyl cobalamin (see paper)
27% identity, 67% coverage: 35:456/633 of query aligns to 41:481/736 of 6oxdA

query
sites
6oxdA
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
H
T
 
T
N
 
P
E
 
E
G
 
G
F
 
I
K
 
D
V
 
V
K
 
T
P
 
P
F
 
V
Y
 
Y
R
 
I
M
 
A
E
 
A
D
 
D
L
 
R
E
 
A
G
 
A
L
 
A
K
 
E
T
 
A
T
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
D
 
H
A
 
S
L
 
F
P
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
R
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
P
T
|
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
V
N
 
N
N
x
Q
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
A
E
 
D
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
 
S
I
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
x
L
-
 
A
L
 
T
N
x
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
H
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
Q
A
 
G
K
 
D
E
 
V
L
 
G
N
 
M
A
|
A
E
 
G
Y
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
I
-
 
L
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
Q
L
 
L
L
 
F
N
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
D
A
 
L
E
 
S
C
 
T
V
 
V
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
A
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
A
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
 
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
 
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
K
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
D
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
K
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
F
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
I
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
L
D
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
D
A
 
I
A
 
D
T
 
S
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
x
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
R
M
 
L
L
 
L
W
 
W
A
 
S
N
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
Y
 
F
H
 
A
P
 
P
E
 
K
C
 
S
L
 
A
R
 
K
D
 
S
C
 
L
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
S
M
 
L
A
x
R
V
x
T
H
|
H
A
 
S
E
x
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
F
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
A
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
x
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
A
F
 
L
D
 
D
K
x
E
T
x
A
Y
 
L
S
x
A
T
x
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
V
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
P
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
W
L
 
L
T
 
T
V
 
H
S
 
R
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
R
A
 
A
W
 
R
E
 
A
L
 
H
F
 
I
L
 
A
A
 
E
V
 
V
E
 
A
E
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
K
 
S
A
 
D
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
L
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
E
 
Q
V
 
P
L
 
V
L
 
V
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

1e1cA Methylmalonyl-coa mutase h244a mutant (see paper)
26% identity, 66% coverage: 39:456/633 of query aligns to 37:469/727 of 1e1cA

query
sites
1e1cA
W
 
W
K
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
E
G
 
Q
F
 
I
K
 
P
V
 
V
K
 
G
P
 
T
F
 
L
Y
 
F
R
 
N
M
 
E
E
 
D
D
 
V
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
L
 
M
K
 
D
T
 
W
T
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
I
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
H
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
A
T
 
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
A
N
x
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
x
S
I
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
x
L
-
 
P
L
 
T
N
x
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
x
A
-
 
G
-
 
V
E
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
S
E
 
I
Y
 
Y
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
D
C
 
Q
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
T
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
K
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
 
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
x
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
Q
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
W
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
A
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
N
A
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
 
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
Y
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
P
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
R
V
 
T
H
|
H
A
 
S
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
x
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
L
D
 
D
K
x
E
T
x
A
Y
 
I
S
x
A
T
x
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
W
S
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
G
L
 
H
F
 
I
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
M
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
E
 
Q
V
 
P
L
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

6reqA Methylmalonyl-coa mutase, 3-carboxypropyl-coa inhibitor complex (see paper)
26% identity, 66% coverage: 39:456/633 of query aligns to 37:469/727 of 6reqA

query
sites
6reqA
W
 
W
K
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
E
G
 
Q
F
 
I
K
 
P
V
 
V
K
 
G
P
 
T
F
 
L
Y
 
F
R
 
N
M
 
E
E
 
D
D
 
V
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
L
 
M
K
 
D
T
 
W
T
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
I
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
H
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
A
T
|
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
A
N
x
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
x
S
I
 
V
-
 
A
-
x
F
-
 
D
-
x
L
-
 
P
L
 
T
N
x
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
x
A
-
 
G
-
 
V
E
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
S
E
 
I
Y
 
Y
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
D
C
 
Q
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
T
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
K
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
 
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
 
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
Q
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
W
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
N
A
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
x
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
Y
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
P
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
R
V
 
T
H
|
H
A
 
S
E
x
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
x
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
L
D
 
D
K
x
E
T
x
A
Y
 
I
S
x
A
T
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
W
S
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
G
L
 
H
F
 
I
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
M
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
E
 
Q
V
 
P
L
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

4reqA Methylmalonyl-coa mutase substrate complex (see paper)
26% identity, 66% coverage: 39:456/633 of query aligns to 36:468/726 of 4reqA

query
sites
4reqA
W
 
W
K
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
E
G
 
Q
F
 
I
K
 
P
V
 
V
K
 
G
P
 
T
F
 
L
Y
 
F
R
 
N
M
 
E
E
 
D
D
 
V
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
L
 
M
K
 
D
T
 
W
T
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
I
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
H
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
A
T
 
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
A
N
x
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
x
S
I
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
x
L
-
 
P
L
 
T
N
 
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
x
A
-
 
G
-
 
V
E
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
S
E
 
I
Y
 
Y
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
D
C
 
Q
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
T
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
K
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
x
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
x
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
Q
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
W
R
x
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
N
A
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
x
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
Y
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
P
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
M
K
 
S
M
 
L
A
x
R
V
 
T
H
|
H
A
 
S
E
x
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
x
Q
S
|
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
L
D
 
D
K
x
E
T
x
A
Y
 
I
S
x
A
T
x
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
W
S
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
G
L
 
H
F
 
I
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
M
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
E
 
Q
V
 
P
L
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

P11653 Methylmalonyl-CoA mutase large subunit; MCM-alpha; EC 5.4.99.2 from Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (see 4 papers)
26% identity, 66% coverage: 39:456/633 of query aligns to 38:470/728 of P11653

query
sites
P11653
W
 
W
K
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
E
G
 
Q
F
 
I
K
 
P
V
 
V
K
 
G
P
 
T
F
 
L
Y
 
F
R
 
N
M
 
E
E
 
D
D
 
V
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
L
 
M
K
 
D
T
 
W
T
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
I
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
H
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
A
T
 
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
A
N
 
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
x
S
I
 
V
-
 
A
-
x
F
-
 
D
-
 
L
-
 
P
L
 
T
N
 
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
x
A
-
 
G
-
 
V
E
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
S
E
 
I
Y
 
Y
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
D
C
 
Q
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
 
S
F
 
M
S
 
-
T
 
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
T
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
K
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
x
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
x
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
Q
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
W
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
 
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
N
A
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
 
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
Y
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
P
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
R
V
 
T
H
 
H
A
 
S
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
 
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
 
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
L
D
 
D
K
x
E
T
 
A
Y
 
I
S
x
A
T
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
W
S
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
G
L
 
H
F
 
I
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
M
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
E
 
Q
V
 
P
L
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

7reqA Methylmalonyl-coa mutase, 2-carboxypropyl-coa inhibitor complex (see paper)
26% identity, 66% coverage: 39:456/633 of query aligns to 35:467/725 of 7reqA

query
sites
7reqA
W
 
W
K
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
E
G
 
Q
F
 
I
K
 
P
V
 
V
K
 
G
P
 
T
F
 
L
Y
 
F
R
 
N
M
 
E
E
 
D
D
 
V
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
L
 
M
K
 
D
T
 
W
T
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
I
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
H
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
A
T
|
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
A
N
x
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
 
S
I
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
x
L
-
 
P
L
 
T
N
 
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
x
A
-
 
G
-
 
V
E
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
S
E
 
I
Y
 
Y
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
D
C
 
Q
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
T
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
K
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
 
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
 
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
Q
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
W
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
N
A
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
x
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
Y
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
P
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
R
V
 
T
H
|
H
A
 
S
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
x
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
L
D
 
D
K
x
E
T
x
A
Y
 
I
S
x
A
T
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
W
S
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
G
L
 
H
F
 
I
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
M
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
E
 
Q
V
 
P
L
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

3reqA Methylmalonyl-coa mutase, substrate-free state (poor quality structure) (see paper)
26% identity, 66% coverage: 39:456/633 of query aligns to 35:467/725 of 3reqA

query
sites
3reqA
W
 
W
K
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
E
G
 
Q
F
 
I
K
 
P
V
 
V
K
 
G
P
 
T
F
 
L
Y
 
F
R
 
N
M
 
E
E
 
D
D
 
V
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
L
 
M
K
 
D
T
 
W
T
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
I
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
H
G
 
G
-
 
P
-
 
Y
-
 
A
T
 
T
K
 
M
K
 
Y
S
 
A
N
 
F
N
 
R
E
 
P
W
 
W
L
 
T
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
 
S
I
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
x
L
-
 
P
L
 
T
N
 
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
V
E
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
S
E
 
I
Y
 
Y
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
D
C
 
Q
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
 
S
F
 
M
S
 
-
T
 
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
T
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
K
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
 
T
V
 
I
N
 
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
x
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
Q
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
W
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
N
A
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
L
K
 
S
F
 
F
N
 
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
Y
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
P
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
R
V
 
T
H
 
H
A
 
S
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
 
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
L
D
 
D
K
 
E
T
x
A
Y
 
I
S
 
A
T
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
W
S
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
G
L
 
H
F
 
I
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
M
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
E
 
Q
V
 
P
L
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

2reqA Methylmalonyl-coa mutase, non-productive coa complex, in open conformation representing substrate-free state (see paper)
26% identity, 66% coverage: 39:456/633 of query aligns to 35:467/725 of 2reqA

query
sites
2reqA
W
 
W
K
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
E
G
 
Q
F
 
I
K
 
P
V
 
V
K
 
G
P
 
T
F
 
L
Y
 
F
R
 
N
M
 
E
E
 
D
D
 
V
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
L
 
M
K
 
D
T
 
W
T
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
I
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
H
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
A
T
 
T
K
 
M
K
 
Y
S
 
A
N
 
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
 
T
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
E
x
Y
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
 
S
I
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
P
L
 
T
N
 
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
V
E
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
S
E
 
I
Y
 
Y
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
D
C
 
Q
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
 
S
F
 
M
S
 
-
T
 
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
T
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
K
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
 
T
V
 
I
N
 
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
x
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
Q
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
W
R
 
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
|
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
N
A
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
L
K
 
S
F
 
F
N
 
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
Y
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
P
R
x
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
R
V
 
T
H
 
H
A
 
S
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
T
 
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
 
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
L
D
 
D
K
 
E
T
x
A
Y
 
I
S
 
A
T
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
W
S
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
G
L
 
H
F
 
I
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
M
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
E
 
Q
V
 
P
L
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

5reqA Methylmalonyl-coa mutase, y89f mutant, substrate complex (see paper)
26% identity, 66% coverage: 39:456/633 of query aligns to 35:467/725 of 5reqA

query
sites
5reqA
W
 
W
K
 
E
T
 
T
N
 
A
E
 
E
G
 
Q
F
 
I
K
 
P
V
 
V
K
 
G
P
 
T
F
 
L
Y
 
F
R
 
N
M
 
E
E
 
D
D
 
V
L
 
Y
E
 
K
G
 
D
L
 
M
K
 
D
T
 
W
T
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
I
F
 
P
P
 
P
Y
 
F
L
 
V
R
 
H
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
A
T
|
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
A
N
 
F
N
x
R
E
 
P
W
 
W
L
x
T
V
 
I
R
|
R
Q
 
Q
E
x
F
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
S
C
 
T
P
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
N
 
N
A
 
A
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
K
 
K
A
 
G
L
 
L
D
x
S
I
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
x
L
-
 
P
L
 
T
N
 
H
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
D
S
 
N
F
 
P
H
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
G
K
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
x
A
-
 
G
-
 
V
E
 
A
L
 
I
N
 
D
A
 
S
E
 
I
Y
 
Y
-
 
D
I
 
M
E
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
F
N
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
P
A
 
L
E
 
D
C
 
Q
V
 
M
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
M
S
 
-
T
|
T
C
 
M
Q
 
N
G
 
G
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
L
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
Y
 
T
F
 
A
Q
 
E
K
 
E
K
 
Q
D
 
G
Y
 
V
D
 
K
V
 
P
K
 
E
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
G
 
G
S
x
T
V
 
I
N
x
Q
Y
 
N
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
F
L
 
M
T
 
V
R
|
R
G
 
N
-
 
T
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
K
 
P
E
 
P
K
 
Q
G
 
P
D
 
S
M
 
M
V
 
R
Q
 
I
T
 
I
A
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
A
 
T
I
 
S
Q
 
A
P
 
N
L
 
M
P
 
P
F
 
K
Y
 
W
R
x
N
V
 
S
L
 
I
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
M
N
 
Q
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
T
I
 
A
S
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
D
G
 
G
N
 
V
E
 
D
Y
 
Y
M
 
I
N
 
R
Q
 
A
L
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
P
 
N
A
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
x
F
F
 
W
G
 
G
I
 
I
S
 
G
S
 
M
N
 
N
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
A
N
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
Y
 
F
H
 
G
P
 
P
E
 
K
C
 
N
L
 
P
R
 
K
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
S
A
 
M
K
 
S
M
 
L
A
 
R
V
x
T
H
|
H
A
 
S
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
W
N
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
F
 
Q
D
 
D
A
 
V
H
 
Y
V
 
N
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
C
T
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
A
 
G
G
 
H
V
 
T
D
x
Q
S
|
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
S
F
 
L
D
 
D
K
x
E
T
x
A
Y
 
I
S
x
A
T
 
L
P
 
P
D
 
T
E
 
D
F
 
F
S
 
S
E
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
N
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
L
 
L
K
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
T
D
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
W
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
W
S
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
G
L
 
H
F
 
I
L
 
Q
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
M
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
P
Q
 
K
A
 
M
A
 
R
V
 
I
N
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
K
 
A
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
K
 
A
A
 
R
V
 
I
A
 
D
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
E
 
Q
V
 
P
L
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
K
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

I3VE77 2-hydroxyisobutanoyl-CoA mutase large subunit; 2-hydroxyisobutyryl-CoA mutase large subunit; HCM large subunit; EC 5.4.99.64 from Aquincola tertiaricarbonis (see 2 papers)
26% identity, 69% coverage: 23:456/633 of query aligns to 23:472/562 of I3VE77

query
sites
I3VE77
K
 
E
V
 
V
T
 
G
A
 
A
D
 
F
L
 
L
K
 
K
G
 
K
A
 
A
D
 
P
F
 
-
E
 
E
K
 
R
K
 
K
L
 
E
V
 
Q
W
 
F
K
 
H
T
 
T
N
 
I
E
 
G
G
 
D
F
 
F
K
 
P
V
 
V
K
 
Q
P
 
R
F
 
T
Y
 
Y
R
 
T
M
 
A
E
 
A
D
 
D
L
 
I
E
 
A
G
 
D
L
 
T
K
 
P
T
 
L
T
 
E
D
 
D
-
 
I
A
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
R
F
 
Y
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
x
P
T
|
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
R
N
 
S
N
 
R
E
 
T
W
 
W
L
x
T
V
x
M
R
|
R
Q
 
Q
E
x
I
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
G
C
 
T
P
 
G
K
 
E
E
 
D
A
 
T
N
 
N
A
 
K
K
 
R
A
 
F
L
 
K
D
 
Y
I
 
L
L
 
I
N
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
Q
D
 
T
S
 
G
L
 
I
S
 
S
F
 
T
H
x
D
V
 
F
K
 
D
A
 
M
K
 
P
E
 
T
L
 
L
-
 
M
-
 
G
-
 
Y
N
 
D
A
 
S
E
 
D
Y
 
H
-
 
P
-
 
M
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
D
I
 
M
E
 
E
T
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
D
I
 
I
Q
 
D
A
 
L
E
 
E
C
 
K
V
 
I
E
 
S
L
 
V
N
 
S
F
 
F
S
 
T
T
 
I
C
 
N
Q
 
P
G
 
S
H
 
A
V
 
W
V
 
I
E
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
-
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
F
 
G
Q
 
E
K
 
K
K
 
R
D
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
K
 
N
K
 
K
L
 
L
R
 
S
G
 
G
S
x
T
V
|
V
N
x
Q
Y
 
A
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
Y
L
 
M
T
 
A
R
 
Q
G
 
K
K
 
E
E
 
Y
K
 
I
G
 
Y
D
 
P
M
 
I
V
 
A
Q
 
P
T
 
S
A
 
V
K
 
R
A
 
I
L
 
V
I
 
R
E
 
D
A
 
I
I
 
I
-
 
T
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
Q
 
K
P
 
N
L
 
L
P
 
K
F
x
R
Y
 
Y
R
 
N
V
 
P
L
 
I
N
|
N
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
 
Y
S
x
H
L
 
I
N
 
S
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
Y
 
S
I
 
P
S
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
N
G
 
L
N
 
I
E
 
T
Y
 
Y
M
 
V
N
 
N
Q
 
E
L
 
V
T
 
T
D
 
K
A
 
T
G
 
G
I
 
M
P
 
H
A
 
V
A
 
D
T
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
 
A
F
 
F
N
 
F
F
 
F
G
 
V
I
 
S
S
 
Q
S
 
G
N
 
D
Y
 
F
F
 
F
L
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
M
 
R
L
 
C
W
 
Y
A
 
A
N
 
K
I
 
I
V
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
F
A
 
G
S
 
A
Y
 
R
H
 
N
P
 
P
E
 
E
C
 
S
L
 
M
R
 
R
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
M
 
L
A
 
R
V
 
F
H
 
H
A
 
C
E
 
Q
T
 
T
S
 
A
T
 
A
F
 
A
N
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
K
F
 
P
D
 
Q
A
 
Y
H
 
M
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
S
T
 
L
E
 
Q
A
 
A
M
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
G
F
 
Y
D
 
D
K
 
E
T
 
A
Y
 
F
S
 
A
T
 
I
P
 
P
D
 
T
E
 
E
F
 
D
S
 
A
E
 
M
R
 
K
L
 
M
A
 
A
R
 
L
N
 
R
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
Q
L
 
I
L
 
I
K
 
A
E
 
E
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
V
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
T
S
 
E
I
 
Y
A
 
E
K
 
K
Q
 
K
A
 
I
W
 
F
E
 
E
L
 
I
F
 
L
L
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
R
G
 
G
G
 
G
F
 
T
Y
 
I
A
 
K
A
 
L
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
W
V
 
F
Q
 
Q
A
 
K
A
 
Q
V
 
I
N
 
A
E
 
D
-
 
F
-
 
A
S
 
Y
N
 
E
K
 
T
A
 
A
R
 
L
H
 
R
K
 
K
A
 
Q
V
 
S
A
 
G
Q
 
Q
R
 
K
R
 
-
E
 
-
V
 
P
L
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
R
F
 
F

4r3uA Crystal structure of 2-hydroxyisobutyryl-coa mutase (see paper)
26% identity, 69% coverage: 23:456/633 of query aligns to 22:471/557 of 4r3uA

query
sites
4r3uA
K
 
E
V
 
V
T
 
G
A
 
A
D
 
F
L
 
L
K
 
K
G
 
K
A
 
A
D
 
P
F
 
-
E
 
E
K
 
R
K
 
K
L
 
E
V
 
Q
W
 
F
K
 
H
T
 
T
N
 
I
E
 
G
G
 
D
F
 
F
K
 
P
V
 
V
K
 
Q
P
 
R
F
 
T
Y
 
Y
R
 
T
M
 
A
E
 
A
D
 
D
L
 
I
E
 
A
G
 
D
L
 
T
K
 
P
T
 
L
T
 
E
D
 
D
-
 
I
A
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
R
F
 
Y
P
 
P
Y
 
F
L
 
T
R
 
R
G
 
G
-
 
P
-
x
Y
-
 
P
T
|
T
K
x
M
K
 
Y
S
 
R
N
 
S
N
x
R
E
 
T
W
 
W
L
x
T
V
 
M
R
|
R
Q
 
Q
E
x
I
I
 
A
K
 
G
V
 
F
E
 
G
C
 
T
P
 
G
K
 
E
E
 
D
A
 
T
N
 
N
A
 
K
K
 
R
A
 
F
L
 
K
D
 
Y
I
 
L
L
 
I
N
 
A
K
 
Q
G
 
G
V
 
Q
D
 
T
S
 
G
L
 
I
S
 
S
F
 
T
H
x
D
V
 
F
K
 
D
A
x
M
K
 
P
E
 
T
L
 
L
-
 
M
-
 
G
-
 
Y
N
 
D
A
 
S
E
 
D
Y
 
H
-
 
P
-
 
M
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
R
-
x
E
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
D
I
 
M
E
 
E
T
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
D
I
 
I
Q
 
D
A
 
L
E
 
E
C
 
K
V
 
I
E
 
S
L
 
V
N
x
S
F
 
F
S
x
T
T
 
I
C
 
N
Q
 
P
G
 
S
H
 
A
V
 
W
V
 
I
E
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
-
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
F
 
G
Q
 
E
K
 
K
K
 
R
D
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
K
 
N
K
 
K
L
 
L
R
 
S
G
 
G
S
x
T
V
 
V
N
x
Q
Y
 
A
D
 
D
F
 
I
F
 
L
N
 
K
K
 
E
M
 
Y
L
 
M
T
 
A
R
x
Q
G
 
K
K
x
E
E
 
Y
K
 
I
G
 
Y
D
 
P
M
 
I
V
 
A
Q
 
P
T
 
S
A
 
V
K
 
R
A
 
I
L
 
V
I
 
R
E
 
D
A
 
I
I
 
I
-
 
T
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
Q
 
K
P
 
N
L
 
L
P
 
K
F
x
R
Y
 
Y
R
x
N
V
 
P
L
 
I
N
|
N
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
I
N
 
S
N
x
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
Y
 
S
I
 
P
S
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
A
G
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
N
G
 
L
N
 
I
E
 
T
Y
 
Y
M
 
V
N
 
N
Q
 
E
L
 
V
T
 
T
D
 
K
A
 
T
G
 
G
I
 
M
P
 
H
A
 
V
A
 
D
T
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
x
R
I
 
L
K
 
A
F
 
F
N
x
F
F
 
F
G
 
V
I
 
S
S
 
Q
S
 
G
N
 
D
Y
 
F
F
 
F
L
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
L
R
 
R
M
 
R
L
 
C
W
 
Y
A
 
A
N
 
K
I
 
I
V
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
F
A
 
G
S
 
A
Y
 
R
H
 
N
P
 
P
E
 
E
C
 
S
L
 
M
R
 
R
D
 
-
C
 
-
D
 
-
N
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
C
 
-
R
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
M
 
L
A
x
R
V
x
F
H
|
H
A
 
C
E
x
Q
T
 
T
S
 
A
T
x
A
F
 
A
N
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
K
F
 
P
D
 
Q
A
 
Y
H
 
M
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
S
T
 
L
E
 
Q
A
 
A
M
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
A
D
x
Q
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
G
F
 
Y
D
 
D
K
x
E
T
x
A
Y
 
F
S
x
A
T
 
I
P
 
P
D
 
T
E
 
E
F
 
D
S
 
A
E
 
M
R
 
K
L
 
M
A
 
A
R
 
L
N
 
R
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
Q
L
 
I
L
 
I
K
 
A
E
 
E
E
 
E
S
 
S
H
 
G
F
 
V
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
N
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
T
S
 
E
I
 
Y
A
 
E
K
 
K
Q
 
K
A
 
I
W
 
F
E
 
E
L
 
I
F
 
L
L
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
R
G
 
G
G
 
G
F
 
T
Y
 
I
A
 
K
A
 
L
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
W
V
 
F
Q
 
Q
A
 
K
A
 
Q
V
 
I
N
 
A
E
 
D
-
 
F
-
 
A
S
 
Y
N
 
E
K
 
T
A
 
A
R
 
L
H
 
R
K
 
K
A
 
Q
V
 
S
A
 
G
Q
 
Q
R
 
K
R
 
-
E
 
-
V
 
P
L
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
R
F
 
F

5cjtA Isobutyryl-coa mutase fused with bound adenosylcobalamin, gdp, mg (holo-icmf/gdp), and substrate isobutyryl-coenzyme a (see paper)
26% identity, 42% coverage: 207:470/633 of query aligns to 742:987/1062 of 5cjtA

query
sites
5cjtA
F
 
F
Y
|
Y
R
 
S
V
 
V
L
 
-
N
 
S
V
 
I
N
 
S
A
 
G
I
x
Y
S
x
H
L
 
I
N
 
A
N
x
E
A
|
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
N
I
 
P
S
 
I
Q
 
S
E
 
Q
L
 
L
G
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
N
G
 
G
N
 
F
E
 
T
Y
 
Y
M
 
V
N
 
E
Q
 
A
L
 
Y
T
 
L
D
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
M
P
 
H
A
 
I
A
 
D
T
 
D
V
 
F
A
 
A
K
 
P
K
 
N
I
 
L
K
x
S
F
 
F
N
x
F
F
 
F
-
 
S
-
 
N
G
 
G
I
 
M
S
 
D
S
 
P
N
 
E
Y
 
Y
F
 
S
L
 
V
E
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
L
F
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
R
L
 
I
W
 
W
A
 
A
N
 
V
I
 
T
V
 
M
A
 
R
S
 
-
Y
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
-
C
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
D
N
 
K
K
 
Y
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
D
E
x
R
C
 
S
R
 
Q
C
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
K
M
 
L
A
x
K
V
 
Y
H
|
H
A
 
I
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
T
x
G
F
x
R
N
 
S
L
 
L
T
 
H
L
 
A
F
 
Q
D
 
E
A
 
I
H
 
D
V
 
F
N
 
N
L
 
D
L
 
I
R
 
R
T
 
T
Q
 
T
T
 
L
E
 
Q
A
 
A
M
 
L
S
 
I
A
 
A
A
 
I
L
 
Y
A
 
D
G
 
N
V
 
C
D
 
N
S
 
S
M
 
L
T
 
H
V
 
T
V
 
N
P
 
A
F
 
Y
D
 
D
K
x
E
T
x
A
Y
 
I
S
x
T
T
 
T
P
 
P
D
 
T
E
 
A
F
 
E
S
 
S
E
 
V
R
 
R
L
 
R
A
 
A
R
 
L
N
 
A
Q
 
I
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
L
 
I
K
 
N
E
 
R
E
 
E
S
 
W
H
 
G
F
 
V
D
 
A
K
 
K
V
 
C
I
 
E
D
 
N
P
 
P
A
 
N
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
Y
 
F
Y
 
L
I
 
I
E
 
E
N
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
D
S
 
L
I
 
V
A
 
E
K
 
E
Q
 
A
A
 
V
W
 
L
E
 
Q
L
 
E
F
 
F
L
 
E
A
 
R
V
 
I
E
 
A
E
 
E
A
 
R
G
 
G
G
 
G
F
 
V
Y
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
M
K
x
E
A
 
T
G
 
G
T
 
Y
V
 
Q
Q
 
R
A
 
G
A
 
K
V
 
I
N
 
Q
E
 
E
S
 
E
N
 
S
K
 
L
A
 
Y
R
 
Y
H
 
E
K
 
Q
A
 
L
V
 
K
A
x
H
Q
 
D
R
 
G
R
 
T
E
 
L
V
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
V
N
 
N
Q
 
T
F
 
F
P
 
R
N
 
N
F
 
P
N
 
N
E
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
D
K
 
P
Q
 
Q
P
 
T
I
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>351619 FitnessBrowser__Btheta:351619
MADKKEKLFSDFSPVSTEQWMEKVTADLKGADFEKKLVWKTNEGFKVKPFYRMEDLEGLK
TTDALPGEFPYLRGTKKSNNEWLVRQEIKVECPKEANAKALDILNKGVDSLSFHVKAKEL
NAEYIETLLNGIQAECVELNFSTCQGHVVELAGLLVAYFQKKDYDVKKLRGSVNYDFFNK
MLTRGKEKGDMVQTAKALIEAIQPLPFYRVLNVNAISLNNAGAYISQELGYALAWGNEYM
NQLTDAGIPAATVAKKIKFNFGISSNYFLEIAKFRAARMLWANIVASYHPECLRDCDNKG
ANGECRCAAKMAVHAETSTFNLTLFDAHVNLLRTQTEAMSAALAGVDSMTVVPFDKTYST
PDEFSERLARNQQLLLKEESHFDKVIDPAAGSYYIENLTVSIAKQAWELFLAVEEAGGFY
AALKAGTVQAAVNESNKARHKAVAQRREVLLGTNQFPNFNEKAGEKQPIEAKCCCGGDAH
TCEKDVDTLVFDRAASEFEALRLETEASGKRPKAFMLTIGNLAMRQARAQYSCNFLACAG
YEVIDNLGFETVEAGVEAAMAAKADIVVLCSSDDEYAEYAVPAFKALDGRAMFIVAGAPA
CMDELKAAGIENFIHVRVNVLDTLKEFNAKLLK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory