SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3608608 FitnessBrowser__Dino:3608608 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
27% identity, 91% coverage: 28:403/414 of query aligns to 16:386/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
R
 
R
Q
 
Y
A
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
N
H
 
L
V
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
E
A
 
I
P
 
T
R
 
R
M
x
T
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
K
L
 
C
G
 
D
I
 
F
S
 
G
P
 
M
G
x
S
S
x
T
V
 
L
T
 
T
T
 
Y
L
 
I
T
 
L
S
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
Q
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
F
 
I
L
 
I
T
 
L
E
 
E
I
 
-
A
 
G
A
 
A
P
 
E
A
 
T
R
 
S
E
 
S
T
|
T
G
|
G
R
 
-
G
|
G
R
|
R
P
x
R
P
x
A
V
x
K
A
 
L
L
 
V
A
 
R
V
 
F
V
 
N
P
 
K
A
 
D
A
 
Y
R
 
G
Y
 
F
V
 
V
L
 
V
G
 
S
L
 
V
R
 
K
L
 
V
S
 
E
D
 
E
E
 
E
M
 
Q
H
 
L
T
 
L
V
 
F
S
 
A
L
 
L
S
 
T
D
 
D
F
 
L
S
 
N
G
 
A
T
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
E
T
 
I
A
 
I
H
 
E
R
 
N
A
 
T
S
 
S
Q
 
I
P
 
P
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
A
 
S
V
 
S
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
P
T
 
E
E
 
E
M
 
A
A
 
I
T
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
A
E
 
K
V
 
N
L
 
V
A
 
K
A
 
K
A
 
M
A
 
C
L
 
G
P
 
N
R
 
R
D
 
D
R
 
M
V
 
N
A
 
H
A
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
I
-
 
A
-
 
I
P
 
S
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
 
N
H
 
R
E
 
K
T
 
K
G
 
G
R
 
T
V
 
V
A
 
I
W
 
R
S
 
S
P
 
T
I
 
M
L
 
L
A
 
G
G
 
W
Q
 
E
D
 
N
H
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
L
E
 
H
D
 
A
R
 
H
F
 
F
-
 
P
G
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
V
H
 
Y
L
 
V
E
 
D
N
 
K
D
 
N
A
 
I
N
 
N
V
 
C
L
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
W
 
W
F
 
L
G
 
G
A
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
M
 
S
Q
 
N
D
 
N
F
 
F
A
 
A
V
 
T
V
 
V
T
 
S
I
 
V
E
 
G
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
S
L
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
N
 
R
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
L
 
G
G
 
A
L
 
G
E
 
E
L
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
T
K
 
T
V
 
I
Q
 
Q
L
 
P
D
 
G
G
 
G
A
 
Y
L
 
K
C
|
C
R
 
H
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
M
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
 
E
Y
 
F
A
 
Y
L
 
F
V
 
-
R
 
R
E
 
N
A
 
R
S
 
G
T
 
E
A
 
E
L
 
L
D
 
K
R
 
E
D
 
A
P
 
Y
R
 
P
S
 
T
A
 
S
Q
 
E
T
 
L
A
 
N
A
 
D
A
 
F
M
 
H
L
 
F
E
 
D
S
 
K
L
 
V
F
 
A
D
 
K
Q
 
S
A
 
A
K
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
D
G
 
E
A
 
M
A
 
A
K
 
T
A
 
E
I
 
L
F
 
M
Q
 
G
R
 
K
A
 
M
G
 
G
R
 
E
F
 
Y
L
 
L
S
 
G
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
R
N
 
N
V
 
I
V
 
I
Q
 
N
L
 
T
F
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
E
R
 
G
M
 
L
R
 
H
Y
 
H
D
 
R
Y
 
D
L
 
L
Y
 
F
A
 
L
E
 
T
E
 
K
V
 
I
L
 
D
A
 
E
E
 
I
M
 
A
Q
 
S
R
 
Q
M
 
N
T
 
F
L
 
F
H
 
S
P
 
G
A
 
A
T
 
G
P
 
F
R
 
E
S
 
T
R
 
E
V
 
I
E
 
T
I
 
T
H
 
T
A
 
S
W
 
L
G
 
E
D
 
D
Q
 
P
V
 
A
W
 
W
A
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
30% identity, 78% coverage: 31:354/414 of query aligns to 11:333/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
V
 
V
F
 
Y
E
 
K
H
 
L
V
 
I
R
 
D
A
 
Q
A
 
K
G
 
G
H
 
P
A
 
I
P
 
S
R
 
R
M
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
E
L
 
S
G
 
E
I
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
T
T
 
K
L
 
I
T
 
T
S
 
R
D
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
D
A
 
A
G
 
H
F
 
L
L
 
I
T
 
H
E
 
E
I
 
T
A
 
T
A
 
V
P
 
-
A
 
Q
R
 
E
E
 
A
T
 
I
G
 
S
R
 
R
G
 
G
R
 
R
P
 
P
P
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
Q
V
 
T
V
 
N
P
 
N
A
 
L
A
 
G
R
 
W
Y
 
Q
V
 
F
L
 
L
G
 
S
L
 
M
R
 
R
L
 
L
S
 
G
D
 
R
E
 
G
M
 
Y
H
 
L
T
 
T
V
 
I
S
 
A
L
 
L
S
 
H
D
 
E
F
 
L
S
 
G
G
 
G
T
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
I
T
 
D
A
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
I
H
 
H
R
 
E
A
 
I
S
 
D
Q
 
Q
P
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
D
A
 
D
L
 
V
L
 
L
T
 
A
E
 
R
M
 
L
A
 
L
T
 
F
L
 
E
I
 
I
D
 
E
E
 
E
V
 
F
L
 
F
A
 
Q
A
 
T
A
 
Y
A
 
A
L
 
A
P
 
Q
R
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
T
A
 
S
L
 
I
G
 
A
V
 
I
G
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
L
V
 
V
H
 
N
H
 
S
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
L
W
 
Q
S
 
M
P
 
P
I
 
H
L
 
Y
A
 
N
G
 
V
Q
 
K
D
 
N
H
 
L
A
 
A
L
 
L
Q
 
G
A
 
P
I
 
E
I
 
I
E
 
Y
D
 
K
R
 
A
F
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
V
H
 
F
L
 
V
E
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
N
 
R
V
 
A
L
 
W
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
K
W
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
H
G
 
S
R
 
Q
A
 
D
M
 
V
Q
 
D
D
 
N
F
 
S
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
S
I
 
I
E
 
H
Q
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
A
G
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
D
N
 
G
R
 
R
L
 
V
F
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
R
Q
 
H
G
 
G
L
 
N
G
 
I
L
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
I
K
 
Q
V
 
I
Q
 
D
L
 
P
D
 
Q
G
 
G
A
 
K
L
 
R
C
|
C
R
 
H
C
|
C
G
 
G
Q
 
N
R
 
Y
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
T
Y
 
V
L
 
A
A
 
S
D
 
S
Y
 
Q
A
 
A
L
 
-
V
 
I
R
 
R
E
 
D
A
 
Q
S
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
R
D
 
I
R
 
Q
-
 
A
-
 
G
D
 
E
P
 
P
R
 
S
S
 
C
A
 
L
Q
 
A
T
 
T
A
 
V
A
 
E
A
 
E
M
 
I
-
 
S
L
 
I
E
 
E
S
 
D
L
 
I
F
 
C
D
 
A
Q
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
D
G
 
G
N
 
D
G
 
P
A
 
L
A
 
A
K
 
V
A
 
D
I
 
V
F
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
S
 
G
L
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
I
V
 
V
V
 
I
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
I
 
I
I
 
L
L
 
I
S
 
G
G
 
G
A
 
V

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
27% identity, 74% coverage: 97:403/414 of query aligns to 2:302/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
Y
 
F
V
 
V
L
 
V
G
 
S
L
 
V
R
x
K
L
 
V
S
 
E
D
x
E
E
 
E
M
 
Q
H
 
L
T
 
L
V
 
F
S
 
A
L
 
L
S
 
T
D
 
D
F
 
L
S
 
N
G
 
A
T
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
E
T
 
I
A
 
I
H
 
E
R
 
N
A
 
T
S
 
S
Q
 
I
P
 
P
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
A
 
S
V
 
S
E
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
P
T
 
E
E
 
E
M
 
A
A
 
I
T
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
A
E
 
K
V
 
N
L
 
V
A
 
K
A
 
K
A
 
M
A
 
C
L
 
G
P
 
N
R
 
R
D
 
D
R
 
M
V
 
N
A
 
H
A
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
I
-
 
A
-
 
I
P
 
S
G
|
G
A
 
L
V
 
V
H
 
N
H
 
R
E
 
K
T
 
K
G
 
G
R
 
T
V
 
V
A
 
I
W
 
R
S
 
S
P
 
T
I
 
M
L
 
L
A
 
G
G
 
W
Q
 
E
D
 
N
H
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
L
E
 
H
D
 
A
R
 
H
F
 
F
-
 
P
G
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
V
H
 
Y
L
 
V
E
 
D
N
 
K
D
x
N
A
 
I
N
 
N
V
 
C
L
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
W
 
W
F
 
L
G
 
G
A
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
M
 
S
Q
 
N
D
 
N
F
 
F
A
 
A
V
 
T
V
 
V
T
x
S
I
x
V
E
 
G
Q
 
A
G
|
G
V
x
L
G
|
G
M
 
L
G
 
S
L
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
N
 
R
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
L
 
G
G
 
A
L
 
G
E
|
E
L
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
T
K
 
T
V
 
I
Q
 
Q
L
 
P
D
 
G
G
 
G
A
 
Y
L
 
K
C
|
C
R
 
H
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
|
E
A
 
M
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
 
E
Y
 
F
A
 
Y
L
 
F
V
 
R
R
 
N
E
 
R
A
 
G
S
 
E
T
 
E
A
 
L
L
 
K
D
 
E
R
 
A
D
 
Y
P
 
P
R
 
L
S
 
N
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
D
A
 
F
M
 
H
L
 
F
E
 
D
S
 
K
L
 
V
F
 
A
D
 
K
Q
 
S
A
 
A
K
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
D
G
 
E
A
 
M
A
 
A
K
 
T
A
 
E
I
 
L
F
 
M
Q
 
G
R
 
K
A
 
M
G
 
G
R
 
E
F
 
Y
L
 
L
S
 
G
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
R
N
 
N
V
 
I
V
 
I
Q
 
N
L
 
T
F
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
I
 
V
I
 
I
L
 
I
S
 
V
G
 
G
A
x
E
R
 
G
M
 
L
R
 
H
Y
 
H
D
 
R
Y
 
D
L
 
L
Y
 
F
A
 
L
E
 
T
E
 
K
V
 
I
L
 
D
A
 
E
E
 
I
M
 
A
Q
 
S
R
 
Q
M
 
N
T
 
F
L
 
F
H
 
S
P
 
G
A
 
A
T
 
G
P
 
F
R
 
E
S
 
T
R
 
E
V
 
I
E
 
T
I
 
T
H
 
T
A
 
S
W
 
L
G
 
E
D
 
D
Q
 
P
V
 
A
W
|
W
A
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
V
L
 
I

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
28% identity, 78% coverage: 30:351/414 of query aligns to 20:340/406 of P50456

query
sites
P50456
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
E
 
R
H
 
L
V
 
I
R
 
D
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
H
 
P
A
 
V
P
 
S
R
 
R
M
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
L
L
 
A
G
 
Q
I
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
T
T
 
K
L
 
I
T
 
V
S
x
R
D
 
E
L
 
M
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
H
F
 
L
L
 
V
T
 
Q
E
 
E
I
 
L
A
 
E
A
 
I
P
 
-
A
 
-
R
 
K
E
 
E
T
 
A
G
 
G
-
 
N
R
 
R
G
 
G
R
 
R
P
 
P
P
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
E
P
 
T
A
 
E
A
 
A
R
 
W
Y
x
H
V
 
Y
L
 
L
G
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
I
S
 
S
D
 
R
E
 
G
M
 
E
H
 
I
T
 
F
V
 
L
S
 
A
L
 
L
S
 
R
D
 
D
F
 
L
S
 
S
G
 
S
T
 
K
E
 
-
L
 
-
A
 
L
T
 
V
A
 
V
H
 
E
R
 
E
A
 
S
S
 
Q
Q
 
E
P
 
L
G
 
A
R
 
L
Y
 
K
A
 
D
V
 
D
E
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
D
E
 
R
M
 
I
A
 
I
T
 
S
L
 
H
I
 
I
D
 
D
E
 
Q
V
 
F
L
x
F
A
 
I
A
 
R
A
 
H
A
 
Q
L
 
K
P
 
K
R
 
L
D
 
E
R
 
R
V
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
G
 
A
V
 
I
G
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
I
V
 
I
H
 
D
H
 
T
E
 
E
T
 
N
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
H
W
 
R
S
 
M
P
 
P
I
 
F
L
 
Y
A
 
E
G
 
D
-
 
V
Q
 
K
D
 
E
H
 
M
A
 
P
L
 
L
Q
 
G
A
 
E
I
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
Q
R
 
H
F
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
V
H
 
Y
L
 
I
E
 
Q
N
 
H
D
 
D
A
 
I
N
 
S
V
 
A
L
 
W
T
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
A
W
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
S
R
 
R
A
 
G
M
 
A
Q
 
R
D
 
D
F
 
V
A
 
I
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
H
G
 
N
V
 
V
G
 
G
M
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
L
 
T
N
 
D
N
 
G
R
 
H
L
 
L
F
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
Q
 
S
G
 
S
L
 
S
G
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
K
 
Q
V
 
V
Q
 
D
L
 
P
D
 
Y
G
 
G
A
 
K
L
 
R
C
|
C
R
 
Y
C
|
C
G
 
G
Q
 
N
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
T
Y
 
I
L
 
A
A
 
S
D
 
V
Y
 
D
A
 
S
L
 
I
V
 
L
R
 
E
E
 
L
A
 
A
S
 
Q
T
 
L
A
 
R
L
 
L
D
 
N
R
 
Q
D
 
S
P
 
M
R
 
S
S
 
S
A
 
M
Q
 
L
T
 
H
A
 
G
A
 
Q
A
 
P
M
 
L
-
 
T
L
 
V
E
 
D
S
 
S
L
 
L
F
 
C
D
 
Q
Q
 
A
A
 
A
K
 
L
A
x
R
G
 
G
N
 
D
G
 
L
A
x
L
A
 
A
K
 
K
A
 
D
I
 
I
F
 
I
Q
 
T
R
 
G
A
 
V
G
 
G
R
 
A
F
 
H
L
 
V
S
 
G
L
 
R
G
 
I
L
 
L
A
 
A
N
 
I
V
 
M
V
 
V
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
K
I
 
I
I
 
L
L
 
I

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
26% identity, 78% coverage: 30:351/414 of query aligns to 9:316/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
E
 
R
H
 
L
V
 
I
R
 
D
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
H
 
P
A
 
V
P
 
S
R
 
R
M
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
L
L
 
A
G
 
Q
I
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
T
T
 
K
L
 
I
T
 
V
S
 
H
D
 
E
L
 
M
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
H
F
 
L
L
 
V
T
 
Q
E
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
E
P
 
T
A
 
E
A
 
A
R
 
W
Y
 
H
V
 
Y
L
 
L
G
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
I
S
 
S
D
 
R
E
 
G
M
 
E
H
 
I
T
 
F
V
 
L
S
 
A
L
 
L
S
 
R
D
 
D
F
 
L
S
 
S
G
 
S
T
 
K
E
 
-
L
 
-
A
 
L
T
 
V
A
 
V
H
 
E
R
 
E
A
 
S
S
 
Q
Q
 
E
P
 
L
G
 
A
R
 
L
Y
 
K
A
 
D
V
 
D
E
 
L
A
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
D
E
 
R
M
 
I
A
 
I
T
 
S
L
 
H
I
 
I
D
 
D
E
 
Q
V
 
F
L
 
F
A
 
I
A
 
R
A
 
H
A
 
Q
L
 
K
P
 
K
R
 
L
D
 
E
R
 
R
V
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
G
 
A
V
 
I
G
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
I
V
 
I
H
 
D
H
 
T
E
 
E
T
 
N
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
H
W
 
R
S
 
M
P
 
P
I
 
F
L
 
Y
A
 
E
G
 
D
-
 
V
Q
 
K
D
 
E
H
 
M
A
 
P
L
 
L
Q
 
G
A
 
E
I
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
Q
R
 
H
F
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
V
H
 
Y
L
 
I
E
 
Q
N
 
H
D
 
D
A
 
I
N
 
S
V
 
A
L
 
W
T
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
A
W
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
S
R
 
R
A
 
G
M
 
A
Q
 
R
D
 
D
F
 
V
A
 
I
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
H
G
 
N
V
 
V
G
 
G
M
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
L
 
T
N
 
D
N
 
G
R
 
H
L
 
L
F
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
Q
 
S
G
 
S
L
 
S
G
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
K
 
Q
V
 
V
Q
 
D
L
 
P
D
 
Y
G
 
G
A
 
K
L
 
R
C
|
C
R
 
Y
C
|
C
G
 
G
Q
 
N
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
T
Y
 
I
L
 
A
A
 
S
D
 
V
Y
 
D
A
 
S
L
 
I
V
 
L
R
 
E
E
 
L
A
 
A
S
 
Q
T
 
L
A
 
R
L
 
L
D
 
N
R
 
Q
D
 
S
P
 
M
R
 
S
S
 
S
A
 
M
Q
 
L
T
 
H
A
 
G
A
 
Q
A
 
P
M
 
L
-
 
T
L
 
V
E
 
D
S
 
S
L
 
L
F
 
C
D
 
Q
Q
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
R
G
 
G
N
 
D
G
 
L
A
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
D
I
 
I
F
 
I
Q
 
T
R
 
G
A
 
V
G
 
G
R
 
A
F
 
H
L
 
V
S
 
G
L
 
R
G
 
I
L
 
L
A
 
A
N
 
I
V
 
M
V
 
V
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
K
I
 
I
I
 
L
L
 
I

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
32% identity, 57% coverage: 119:353/414 of query aligns to 25:260/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
E
 
E
L
 
I
A
 
V
T
 
K
A
 
K
H
 
Y
R
 
T
A
 
Q
S
 
F
Q
 
N
P
 
P
G
 
K
R
 
T
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
E
L
 
R
L
 
I
T
 
N
E
 
L
M
 
I
A
 
L
T
 
Q
L
 
M
I
 
C
D
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
K
P
 
L
R
 
N
D
 
C
R
 
R
V
 
I
A
 
L
A
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
S
L
 
T
P
x
G
G
|
G
A
x
R
V
 
V
H
 
N
H
 
P
E
 
R
T
 
E
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
L
W
 
H
S
|
S
P
x
T
I
 
K
L
|
L
A
 
I
G
 
Q
Q
 
E
D
 
W
H
 
N
A
 
S
-
 
V
-
 
D
L
 
L
Q
 
R
A
 
T
I
 
P
I
 
L
E
 
S
D
 
D
R
 
T
F
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
V
H
 
W
L
 
V
E
 
D
N
|
N
D
|
D
A
 
G
N
|
N
V
 
C
L
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
G
M
 
L
Q
 
E
D
 
N
F
 
F
A
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
I
 
T
E
x
G
Q
x
T
G
|
G
V
x
I
G
 
G
M
x
G
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
H
N
 
Q
N
 
H
R
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
L
 
C
G
 
A
L
x
A
E
|
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
K
 
V
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
R
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
|
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
x
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
H
D
 
D
R
 
E
D
 
D
P
 
L
R
 
L
S
 
L
A
 
V
Q
 
E
T
 
G
A
 
M
A
 
S
A
 
A
M
 
V
-
 
G
L
 
A
E
x
L
S
 
H
L
 
L
F
 
I
D
 
Q
Q
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
G
N
 
N
G
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
F
 
A
L
 
L
S
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
32% identity, 57% coverage: 119:353/414 of query aligns to 25:260/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
E
 
E
L
 
I
A
 
V
T
 
K
A
 
K
H
 
Y
R
 
T
A
 
Q
S
 
F
Q
 
N
P
 
P
G
 
K
R
 
T
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
E
L
 
R
L
 
I
T
 
N
E
 
L
M
 
I
A
 
L
T
 
Q
L
 
M
I
 
C
D
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
K
P
 
L
R
 
N
D
 
C
R
 
R
V
 
I
A
 
L
A
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
S
L
 
T
P
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
H
 
N
H
 
P
E
 
R
T
 
E
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
L
W
 
H
S
 
S
P
 
T
I
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
Q
Q
 
E
D
 
W
H
 
N
A
 
S
-
 
V
-
 
D
L
 
L
Q
 
R
A
 
T
I
 
P
I
 
L
E
 
S
D
 
D
R
 
T
F
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
V
H
 
W
L
 
V
E
 
D
N
|
N
D
 
D
A
 
G
N
|
N
V
 
C
L
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
G
M
 
L
Q
 
E
D
 
N
F
 
F
A
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
I
 
T
E
 
G
Q
x
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
x
G
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
H
N
 
Q
N
 
H
R
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
L
 
C
G
 
A
L
x
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
K
 
V
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
R
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
x
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
H
D
 
D
R
 
E
D
 
D
P
 
L
R
 
L
S
 
L
A
 
V
Q
 
E
T
 
G
A
 
M
A
 
S
A
 
A
M
 
V
-
 
G
L
 
A
E
x
L
S
 
H
L
 
L
F
 
I
D
 
Q
Q
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
G
N
 
N
G
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
F
 
A
L
 
L
S
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9Y223 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 18 papers)
32% identity, 57% coverage: 119:354/414 of query aligns to 429:670/722 of Q9Y223

query
sites
Q9Y223
E
 
E
L
 
I
A
 
V
T
 
K
A
 
K
H
 
Y
R
 
T
A
 
Q
S
 
F
Q
 
N
P
 
P
G
 
K
R
 
T
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
E
L
 
R
L
 
I
T
 
N
E
 
L
M
 
I
A
 
L
T
 
Q
L
 
M
I
 
C
D
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
K
P
 
L
R
 
N
D
 
C
R
 
R
V
 
I
A
 
L
A
 
G
L
 
V
G
 
G
V
x
I
G
 
S
L
 
T
P
 
G
G
|
G
A
x
R
V
 
V
H
 
N
H
 
P
E
 
R
T
 
E
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
L
W
 
H
S
 
S
P
x
T
I
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
Q
Q
 
E
D
 
W
H
 
N
A
 
S
-
 
V
-
 
D
L
 
L
Q
 
R
A
 
T
I
 
P
I
 
L
E
 
S
D
 
D
R
 
T
F
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
V
H
 
W
L
 
V
E
 
D
N
|
N
D
|
D
A
 
G
N
|
N
V
 
C
L
 
A
T
 
A
L
 
L
A
|
A
E
 
E
L
 
R
W
 
K
F
|
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
G
M
 
L
Q
 
E
D
 
N
F
 
F
A
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
I
 
T
E
 
G
Q
 
T
G
|
G
V
 
I
G
 
G
M
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
H
N
 
Q
N
 
H
R
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
L
 
C
G
 
A
L
 
A
E
|
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
K
 
V
V
|
V
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
G
|
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
R
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
 
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
H
D
 
D
R
 
E
D
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
S
-
 
V
P
 
P
R
 
K
S
 
D
A
 
E
Q
 
A
T
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
H
L
 
L
F
 
I
D
 
Q
Q
x
A
A
|
A
K
 
K
A
 
L
G
 
G
N
 
N
G
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
F
 
A
L
 
L
S
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
V

Sites not aligning to the query:

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
31% identity, 57% coverage: 119:354/414 of query aligns to 429:670/722 of O35826

query
sites
O35826
E
|
E
L
x
I
A
x
V
T
x
K
A
x
K
H
x
Y
R
x
T
A
x
Q
S
x
F
Q
x
N
P
|
P
G
x
K
R
x
T
Y
|
Y
A
 
-
V
 
-
E
|
E
A
x
E
L
x
R
L
x
I
T
x
S
E
x
L
M
x
I
A
x
L
T
x
Q
L
x
M
I
x
C
D
x
V
E
|
E
V
x
A
L
x
A
A
|
A
A
x
E
A
|
A
A
x
V
L
x
K
P
x
L
R
x
N
D
x
C
R
|
R
V
x
I
A
x
L
A
x
G
L
x
V
G
|
G
V
x
I
G
x
S
L
x
T
P
x
G
G
|
G
A
x
R
V
|
V
H
x
N
H
x
P
E
x
Q
T
x
E
G
|
G
R
x
V
V
|
V
A
x
L
W
x
H
S
|
S
P
x
T
I
x
K
L
|
L
A
x
I
G
x
Q
Q
x
E
D
x
W
H
x
N
A
x
S
-
x
V
-
x
D
L
|
L
Q
x
R
A
x
T
I
x
P
I
x
L
E
x
S
D
|
D
R
x
T
F
x
L
G
x
H
L
|
L
P
|
P
A
x
V
H
x
W
L
x
V
E
x
D
N
|
N
D
|
D
A
x
G
N
|
N
V
x
C
L
x
A
T
x
A
L
x
M
A
|
A
E
|
E
L
x
R
W
x
K
F
|
F
G
|
G
A
x
Q
G
|
G
R
x
K
A
x
G
M
x
Q
Q
x
E
D
x
N
F
|
F
A
x
V
V
x
T
V
x
L
T
x
I
I
x
T
E
x
G
Q
x
T
G
|
G
V
x
I
G
|
G
M
x
G
G
|
G
L
x
I
V
x
I
L
x
H
N
x
Q
N
x
H
R
x
E
L
|
L
F
x
I
R
x
H
G
|
G
A
x
S
Q
x
S
G
x
F
L
x
C
G
x
A
L
x
A
E
|
E
L
|
L
G
|
G
H
|
H
T
x
L
K
x
V
V
|
V
Q
x
S
L
|
L
D
|
D
G
|
G
A
x
P
L
x
D
C
|
C
R
x
S
C
|
C
G
|
G
Q
x
S
R
x
H
G
|
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
A
|
A
Y
|
Y
L
x
A
A
x
S
D
x
G
Y
x
M
A
|
A
L
|
L
V
x
Q
R
|
R
E
|
E
A
|
A
S
x
K
T
x
K
A
x
L
L
x
H
D
|
D
R
x
E
D
|
D
-
x
L
-
x
L
-
x
L
-
x
V
-
x
E
-
x
G
-
x
M
-
x
S
-
x
V
P
|
P
R
x
K
S
x
D
A
x
E
Q
x
A
T
x
V
A
x
G
A
|
A
A
x
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
S
x
H
L
|
L
F
x
I
D
x
Q
Q
x
A
A
|
A
K
|
K
A
x
L
G
|
G
N
|
N
G
x
V
A
x
K
A
|
A
K
x
Q
A
x
S
I
|
I
F
x
L
Q
x
R
R
x
T
A
|
A
G
|
G
R
x
T
F
x
A
L
|
L
S
x
G
L
|
L
G
|
G
L
x
V
A
x
V
N
|
N
V
x
I
V
x
L
Q
x
H
L
x
T
F
x
M
D
x
N
P
|
P
E
x
S
L
|
L
I
x
V
I
|
I
L
|
L
S
|
S
G
|
G
A
x
V

Sites not aligning to the query:

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
30% identity, 60% coverage: 119:367/414 of query aligns to 25:275/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
E
 
E
L
 
I
A
 
V
T
 
K
A
 
K
H
 
Y
R
 
T
A
 
Q
S
 
F
Q
 
N
P
 
P
G
 
K
R
 
T
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
E
L
 
R
L
 
I
T
 
N
E
 
L
M
 
I
A
 
L
T
 
Q
L
 
M
I
 
C
D
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
K
P
 
L
R
 
N
D
 
C
R
 
R
V
 
I
A
 
L
A
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
S
L
 
T
P
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
H
 
N
H
 
P
E
 
R
T
 
E
G
 
G
R
 
I
V
 
V
A
 
L
W
 
H
S
 
S
P
 
T
I
 
K
L
 
L
A
 
I
G
 
Q
Q
 
E
D
 
W
H
 
N
A
 
S
-
 
V
-
 
D
L
 
L
Q
 
R
A
 
T
I
 
P
I
 
L
E
 
S
D
 
D
R
 
T
F
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
V
H
 
W
L
 
V
E
 
D
N
|
N
D
 
D
A
 
G
N
|
N
V
 
C
L
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
G
M
 
L
Q
 
E
D
 
N
F
 
F
A
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
I
 
T
E
 
G
Q
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
x
G
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
H
N
 
Q
N
 
H
R
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
L
 
C
G
 
A
L
x
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
K
 
V
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
D
 
N
G
 
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
R
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
 
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
H
D
 
D
R
 
E
D
 
D
P
 
L
R
 
L
S
 
L
A
 
V
Q
 
E
-
 
G
-
 
M
T
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
V
M
 
G
L
 
A
E
 
L
S
 
H
L
 
L
F
 
I
D
 
Q
Q
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
G
N
 
N
G
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
F
 
A
L
 
L
S
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
V
R
 
L
M
 
A
R
 
S
Y
 
H
D
 
Y
Y
 
I
L
 
H
Y
 
I
A
 
V
E
 
K
E
 
D
V
 
V
L
 
I

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
31% identity, 56% coverage: 144:375/414 of query aligns to 39:281/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
A
V
 
I
L
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
G
P
 
A
R
 
S
D
 
E
-
 
G
-
 
H
R
 
D
V
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
A
P
 
A
G
|
G
A
 
Y
V
 
V
H
 
D
H
 
D
E
 
K
T
 
R
G
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
L
W
 
F
S
 
A
P
|
P
I
 
N
L
 
I
A
 
D
G
 
W
Q
 
R
D
 
H
H
 
E
A
 
P
L
 
L
Q
 
K
A
 
D
I
 
K
I
 
V
E
 
E
D
 
Q
R
 
R
F
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
V
H
 
V
L
 
V
E
 
E
N
|
N
D
|
D
A
 
A
N
 
N
V
 
A
L
 
A
T
 
A
L
 
W
A
 
G
E
 
E
L
 
Y
W
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
M
 
H
Q
 
D
D
 
D
F
 
V
A
 
I
V
 
C
V
 
I
T
 
T
I
 
L
E
x
G
Q
x
T
G
 
G
V
x
L
G
|
G
M
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
I
N
 
G
N
 
N
R
 
K
L
 
L
F
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
Q
 
F
G
 
G
L
 
V
G
 
A
L
 
A
E
|
E
L
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
I
K
 
R
V
 
V
Q
 
V
L
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
L
C
|
C
R
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
|
E
A
 
Q
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
x
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
E
 
Y
A
 
A
S
 
K
T
 
Q
A
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
A
D
 
T
P
 
P
R
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
A
T
 
V
A
 
L
A
 
L
A
 
G
M
 
L
L
 
G
E
 
D
S
 
G
L
 
S
F
 
V
D
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
x
G
-
 
K
-
 
H
-
 
I
-
x
S
-
 
E
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
N
 
D
G
 
P
A
 
V
A
 
A
K
 
V
A
 
D
I
 
S
F
 
F
Q
 
R
R
 
E
A
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
W
L
 
A
S
 
G
L
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
D
V
 
L
V
 
A
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
A
I
 
F
I
 
I
L
 
V
S
 
G
G
 
G
A
x
G
R
x
V
M
 
S
R
 
D
Y
x
E
D
 
G
Y
 
E
L
 
L
Y
 
V
A
 
L
E
 
D
E
 
P
V
 
I
L
 
R
A
 
K
E
 
S
M
 
F
Q
 
R
R
 
R
M
 
W
T
 
L
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
31% identity, 56% coverage: 144:375/414 of query aligns to 39:281/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
A
V
 
I
L
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
G
P
 
A
R
 
S
D
 
E
-
 
G
-
 
H
R
 
D
V
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
A
P
 
A
G
 
G
A
 
Y
V
 
V
H
 
D
H
 
D
E
 
K
T
 
R
G
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
L
W
 
F
S
 
A
P
 
P
I
 
N
L
 
I
A
 
D
G
 
W
Q
 
R
D
 
H
H
 
E
A
 
P
L
 
L
Q
 
K
A
 
D
I
 
K
I
 
V
E
 
E
D
 
Q
R
 
R
F
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
V
H
 
V
L
 
V
E
 
E
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
A
L
 
A
T
 
A
L
 
W
A
 
G
E
 
E
L
 
Y
W
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
M
 
H
Q
 
D
D
 
D
F
 
V
A
 
I
V
 
C
V
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
G
Q
 
T
G
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
I
N
 
G
N
 
N
R
 
K
L
 
L
F
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
Q
 
F
G
 
G
L
 
V
G
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
I
K
 
R
V
 
V
Q
 
V
L
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
L
C
|
C
R
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
 
E
A
 
Q
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
 
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
E
 
Y
A
 
A
S
 
K
T
 
Q
A
 
R
L
 
A
D
 
N
R
 
A
D
 
T
P
 
P
R
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
A
T
 
V
A
 
L
A
 
L
A
 
G
M
 
L
L
 
G
E
 
D
S
 
G
L
 
S
F
 
V
D
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
H
-
 
I
-
 
S
-
 
E
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
N
 
D
G
 
P
A
 
V
A
 
A
K
 
V
A
 
D
I
 
S
F
 
F
Q
 
R
R
 
E
A
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
W
L
 
A
S
 
G
L
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
D
V
 
L
V
 
A
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
A
I
 
F
I
 
I
L
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
G
R
 
V
M
 
S
R
 
D
Y
 
E
D
 
G
Y
 
E
L
 
L
Y
 
V
A
 
L
E
 
D
E
 
P
V
 
I
L
 
R
A
 
K
E
 
S
M
 
F
Q
 
R
R
 
R
M
 
W
T
 
L
L
 
I

3eo3A Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein (see paper)
37% identity, 39% coverage: 194:353/414 of query aligns to 75:240/288 of 3eo3A

query
sites
3eo3A
I
 
L
E
 
S
D
 
D
R
 
T
F
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
V
H
 
W
L
 
V
E
 
D
N
 
N
D
 
D
A
 
G
N
 
N
V
 
C
L
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
G
M
 
L
Q
 
E
D
 
N
F
 
F
A
 
V
V
 
T
V
 
L
T
 
I
I
 
T
E
 
G
Q
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
H
N
 
Q
N
 
H
R
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
L
 
C
G
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
K
 
V
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
D
C
|
C
R
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
A
 
S
D
 
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
S
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
H
D
 
D
R
 
E
D
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
S
-
 
V
P
 
P
R
 
K
S
 
D
A
 
E
Q
 
A
T
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
L
M
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
H
L
 
L
F
 
I
D
 
Q
Q
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
G
N
 
N
G
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
T
F
 
A
L
 
L
S
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
I
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
F
 
M
D
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
G

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
27% identity, 67% coverage: 128:403/414 of query aligns to 41:320/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
Q
 
E
P
 
D
G
 
G
R
 
K
Y
 
H
A
 
I
V
 
V
E
 
P
A
 
S
L
 
I
L
 
I
T
 
E
E
 
S
M
 
I
A
 
R
T
 
H
L
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
L
A
 
Y
A
 
N
L
 
M
P
 
K
R
 
K
D
 
E
R
 
D
V
 
F
A
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
M
G
 
G
L
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
V
 
V
H
 
D
H
 
I
E
 
E
T
 
K
G
 
G
R
 
T
V
 
V
A
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
N
-
 
L
-
 
N
W
 
W
S
 
T
P
 
T
I
 
V
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
H
 
Q
A
 
P
L
 
V
Q
 
K
A
 
E
I
 
Q
I
 
I
E
 
E
D
 
S
R
 
A
F
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
P
A
 
F
H
 
A
L
 
L
E
 
D
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
|
N
V
 
V
L
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
R
W
 
W
F
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
E
A
 
N
M
 
N
Q
 
P
D
 
D
F
 
V
A
 
I
V
 
F
V
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
G
Q
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
x
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
A
N
 
A
N
 
G
R
 
K
L
 
L
F
 
L
R
 
H
G
 
G
A
 
V
Q
 
A
G
 
G
L
 
C
G
 
A
L
 
G
E
 
E
L
 
V
G
 
G
H
|
H
T
 
V
K
 
T
V
 
V
Q
 
D
L
 
P
D
 
N
G
 
G
A
 
F
L
 
D
C
|
C
R
 
T
C
|
C
G
 
G
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
T
Y
 
V
L
 
S
A
 
S
D
 
A
Y
 
T
A
 
G
L
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
V
A
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
L
-
 
S
-
 
E
S
 
E
T
 
F
A
 
A
L
 
G
D
 
D
R
 
S
D
 
E
P
 
L
R
 
K
S
 
Q
A
 
A
Q
 
I
T
 
D
A
 
D
A
 
G
A
 
Q
M
 
D
L
 
V
E
 
S
S
 
S
-
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
F
D
 
E
Q
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
K
G
 
G
N
 
D
G
 
H
A
 
F
A
 
A
K
 
L
A
 
M
I
 
V
F
 
V
Q
 
D
R
 
R
A
 
V
G
 
C
R
 
F
F
 
Y
L
 
L
S
 
G
L
 
L
G
 
A
L
 
T
A
 
G
N
 
N
V
 
L
V
 
G
Q
 
N
L
 
T
F
 
L
D
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
S
I
 
V
I
 
V
L
 
I
S
 
G
G
 
G
A
 
G
R
 
V
M
 
S
R
 
A
Y
 
A
D
 
G
Y
 
E
L
 
F
Y
 
L
A
 
R
E
 
S
E
 
R
V
 
V
L
 
E
A
 
K
E
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
R
 
E
M
 
F
T
 
T
L
 
F
H
 
P
P
 
Q
A
 
V
T
 
R
P
 
N
R
 
S
S
 
T
R
 
K
V
 
I
E
 
K
I
 
L
H
 
A
A
 
E
W
 
L
G
 
G
D
 
N
Q
 
E
V
 
A
W
 
G
A
 
V
R
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L

7p9pAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 65% coverage: 136:403/414 of query aligns to 40:304/304 of 7p9pAAA

query
sites
7p9pAAA
A
 
A
L
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
N
E
 
N
V
 
A
L
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
F
A
 
G
L
 
V
P
 
K
R
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
G
A
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
I
V
 
A
H
 
D
H
 
V
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
A
 
L
W
 
T
S
 
S
P
 
N
I
 
I
L
 
P
A
 
A
G
 
A
Q
 
M
D
 
G
H
 
H
A
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
I
 
D
I
 
L
E
 
E
D
 
E
R
 
R
F
 
L
G
 
Q
L
 
R
P
 
P
A
 
V
H
 
K
L
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
C
L
 
F
T
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
A
W
 
W
F
 
D
G
 
E
A
 
D
G
 
L
R
 
R
A
 
G
M
 
E
Q
 
P
D
 
S
F
 
V
A
 
L
V
 
G
V
 
L
T
 
I
I
 
L
E
x
G
Q
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
F
N
 
N
N
 
G
R
 
K
L
 
V
F
 
H
R
 
S
G
 
G
A
 
R
Q
 
A
G
 
N
L
 
I
G
 
A
L
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
K
 
R
V
 
L
Q
 
P
L
 
Y
D
 
D
G
 
A
A
 
L
L
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
P
C
|
C
R
 
G
C
|
C
G
 
K
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D
A
 
N
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
D
x
G
Y
 
R
A
 
G
L
 
F
V
x
E
R
 
Q
E
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
L
D
 
Y
R
 
D
D
 
H
P
 
Y
R
 
F
S
 
S
A
 
E
Q
 
K
T
 
L
A
 
S
A
|
A
A
 
P
M
x
E
L
 
I
E
 
I
S
 
A
L
x
H
F
 
Y
D
 
E
Q
 
Q
A
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
G
 
R
A
 
R
A
 
A
K
 
V
A
 
Q
I
 
H
F
 
V
Q
 
E
R
 
R
A
 
F
G
 
M
R
 
E
F
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
I
G
 
C
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
F
Q
 
T
L
 
C
F
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
I
 
V
I
 
V
L
 
L
S
 
G
G
|
G
A
x
G
R
 
L
M
 
S
R
x
N
Y
 
F
D
 
E
Y
 
L
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
E
-
 
L
-
 
P
-
 
K
E
 
R
V
 
L
L
 
P
A
 
A
E
 
H
M
 
L
Q
 
L
R
 
H
M
 
V
T
 
A
L
 
K
H
 
L
P
 
P
A
 
K
T
 
I
P
 
I
R
 
K
S
 
A
R
 
R
V
 
-
E
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
-
W
 
H
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
V
 
G
W
 
G
A
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
A
A
 
F
L
 
L
A
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7p9lAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 65% coverage: 136:403/414 of query aligns to 39:303/303 of 7p9lAAA

query
sites
7p9lAAA
A
 
A
L
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
N
E
 
N
V
 
A
L
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
F
A
 
G
L
 
V
P
 
K
R
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
G
A
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
I
V
 
A
H
 
D
H
 
V
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
A
 
L
W
 
T
S
|
S
P
 
N
I
 
I
L
 
P
A
 
A
G
 
A
Q
 
M
D
 
G
H
 
H
A
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
I
 
D
I
 
L
E
 
E
D
 
E
R
 
R
F
 
L
G
 
Q
L
 
R
P
 
P
A
 
V
H
 
K
L
 
I
E
 
E
N
|
N
D
|
D
A
 
A
N
 
N
V
 
C
L
 
F
T
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
A
W
 
W
F
 
D
G
 
E
A
 
D
G
 
L
R
 
R
A
 
G
M
 
E
Q
 
P
D
 
S
F
 
V
A
 
L
V
 
G
V
 
L
T
 
I
I
 
L
E
x
G
Q
x
T
G
|
G
V
|
V
G
|
G
M
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
F
N
 
N
N
 
G
R
 
K
L
 
V
F
 
H
R
 
S
G
 
G
A
 
R
Q
 
A
G
 
N
L
 
I
G
 
A
L
 
G
E
|
E
L
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
K
 
R
V
 
L
Q
 
P
L
 
Y
D
 
D
G
 
A
A
 
L
L
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
P
C
|
C
R
 
G
C
|
C
G
 
K
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
x
D
A
 
N
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
D
 
G
Y
 
R
A
 
G
L
 
F
V
 
E
R
 
Q
E
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
L
D
 
Y
R
 
D
D
 
H
P
 
Y
R
 
F
S
 
S
A
 
E
Q
 
K
T
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
P
M
x
E
L
 
I
E
 
I
S
 
A
L
x
H
F
 
Y
D
 
E
Q
 
Q
A
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
G
 
R
A
 
R
A
 
A
K
 
V
A
 
Q
I
 
H
F
 
V
Q
 
E
R
 
R
A
 
F
G
 
M
R
 
E
F
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
I
G
 
C
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
F
Q
 
T
L
 
C
F
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
I
 
V
I
 
V
L
 
L
S
 
G
G
 
G
A
 
G
R
 
L
M
 
S
R
 
N
Y
 
F
D
 
E
Y
 
L
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
E
-
 
L
-
 
P
-
 
K
E
 
R
V
 
L
L
 
P
A
 
A
E
 
H
M
 
L
Q
 
L
R
 
H
M
 
V
T
 
A
L
 
K
H
 
L
P
 
P
A
 
K
T
 
I
P
 
I
R
 
K
S
 
A
R
 
R
V
 
-
E
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
-
W
 
H
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
V
 
G
W
 
G
A
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
A
A
 
F
L
 
L
A
 
N
L
 
L

7p7wBBB Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 65% coverage: 136:403/414 of query aligns to 42:306/306 of 7p7wBBB

query
sites
7p7wBBB
A
 
A
L
 
F
L
 
L
T
 
D
E
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
N
E
 
N
V
 
A
L
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
F
A
 
G
L
 
V
P
 
K
R
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
G
A
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
I
V
 
A
H
 
D
H
 
V
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
A
 
L
W
 
T
S
 
S
P
 
N
I
 
I
L
 
P
A
 
A
G
 
A
Q
 
M
D
 
G
H
 
H
A
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
I
 
D
I
 
L
E
 
E
D
 
E
R
 
R
F
 
L
G
 
Q
L
 
R
P
 
P
A
 
V
H
 
K
L
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
C
L
 
F
T
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
A
W
 
W
F
 
D
G
 
E
A
 
D
G
 
L
R
 
R
A
 
G
M
 
E
Q
 
P
D
 
S
F
 
V
A
 
L
V
 
G
V
 
L
T
 
I
I
 
L
E
x
G
Q
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
F
N
 
N
N
 
G
R
 
K
L
 
V
F
 
H
R
 
S
G
 
G
A
 
R
Q
 
A
G
 
N
L
 
I
G
 
A
L
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
K
 
R
V
 
L
Q
 
P
L
 
Y
D
 
D
G
 
A
A
 
L
L
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
P
C
|
C
R
 
G
C
|
C
G
 
K
Q
 
N
R
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D
A
 
N
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
D
x
G
Y
 
R
A
 
G
L
 
F
V
x
E
R
 
Q
E
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
L
D
 
Y
R
 
D
D
 
H
P
 
Y
R
 
F
S
 
S
A
 
E
Q
 
K
T
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
P
M
 
E
L
 
I
E
 
I
S
 
A
L
 
H
F
 
Y
D
 
E
Q
 
Q
A
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
G
 
R
A
 
R
A
 
A
K
 
V
A
 
Q
I
 
H
F
 
V
Q
 
E
R
 
R
A
 
F
G
 
M
R
 
E
F
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
I
G
 
C
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
F
Q
 
T
L
 
C
F
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
I
 
V
I
 
V
L
 
L
S
 
G
G
|
G
A
x
G
R
 
L
M
 
S
R
x
N
Y
 
F
D
 
E
Y
 
L
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
E
-
 
L
-
 
P
-
 
K
E
 
R
V
 
L
L
 
P
A
 
A
E
 
H
M
 
L
Q
 
L
R
 
H
M
 
V
T
 
A
L
 
K
H
 
L
P
 
P
A
 
K
T
 
I
P
 
I
R
 
K
S
 
A
R
 
R
V
 
-
E
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
-
W
 
H
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
V
 
G
W
 
G
A
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
A
A
 
F
L
 
L
A
 
N
L
 
L

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
37% identity, 46% coverage: 158:346/414 of query aligns to 57:236/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
R
 
R
V
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
P
V
 
L
H
 
D
H
 
F
E
 
R
T
 
R
G
 
G
R
 
V
V
 
I
A
 
-
W
 
-
S
 
R
P
 
P
I
 
N
L
 
I
A
 
P
G
 
G
-
 
V
Q
 
Q
D
 
D
H
 
F
A
 
P
L
 
I
Q
 
R
A
 
R
I
 
I
I
 
L
E
 
E
D
 
E
R
 
A
F
 
T
G
 
G
L
 
R
P
 
P
A
 
V
H
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
A
L
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
H
W
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
A
 
G
M
 
E
Q
 
E
D
 
S
F
 
S
A
 
L
V
 
Y
V
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
S
Q
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
G
N
 
G
R
 
R
L
 
V
F
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
L
 
Q
G
 
G
L
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
K
 
T
V
 
L
Q
 
L
L
 
P
D
 
G
G
 
G
A
 
P
L
 
A
C
|
C
R
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
L
R
 
E
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
L
 
A
A
 
A
D
 
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
E
R
 
R
E
 
D
A
 
A
S
 
T
T
 
Y
A
 
A
L
 
F
D
 
Q
R
 
R
D
 
P
P
 
V
R
 
D
S
 
T
A
 
R
Q
 
E
T
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
L
F
 
F
D
 
R
Q
 
L
A
 
F
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
D
G
 
P
A
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
R
I
 
L
F
 
V
Q
 
L
R
 
Q
A
 
A
G
 
A
R
 
R
F
 
Y
L
 
V
S
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
V
 
L
V
 
V
Q
 
K
L
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P

4db3A 1.95 angstrom resolution crystal structure of n-acetyl-d-glucosamine kinase from vibrio vulnificus.
25% identity, 71% coverage: 114:405/414 of query aligns to 14:311/311 of 4db3A

query
sites
4db3A
D
 
D
F
 
V
S
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
K
L
 
I
A
 
E
T
 
F
A
 
G
H
 
A
R
 
F
A
 
N
S
 
E
Q
 
K
P
 
L
G
 
E
R
 
R
Y
 
V
A
 
A
V
 
T
E
 
E
A
 
R
L
 
V
L
 
P
T
 
T
-
 
P
-
 
T
E
 
D
M
 
D
A
 
Y
T
 
P
L
 
L
I
 
L
D
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
L
A
 
V
L
 
A
P
 
K
R
 
Y
D
 
D
R
 
Q
V
 
E
A
 
F
A
 
A
-
 
C
-
 
E
-
 
G
-
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
M
V
 
E
H
 
D
H
 
A
E
 
D
T
 
D
G
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
L
W
 
T
S
 
V
P
 
N
I
 
V
L
 
P
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
D
 
G
H
 
K
A
 
P
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
I
 
D
I
 
L
E
 
E
D
 
A
R
 
K
F
 
I
G
 
G
L
 
R
P
 
S
A
 
V
H
 
K
L
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
C
L
 
F
T
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
A
W
 
W
F
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
D
R
 
E
A
 
E
M
 
L
Q
 
Q
D
 
D
F
 
A
A
 
P
V
 
S
V
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
L
T
 
I
I
 
L
E
 
G
Q
 
T
G
 
G
V
 
F
G
 
G
M
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
Y
N
 
E
N
 
G
R
 
K
L
 
V
F
 
F
R
 
S
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
G
 
N
L
 
V
G
 
A
L
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
M
K
 
R
V
 
L
Q
 
P
L
 
L
D
 
D
G
 
A
A
 
W
L
 
F
-
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
G
C
|
C
R
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
D
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
D
 
G
Y
 
R
A
 
G
L
 
F
V
 
E
R
 
L
E
 
L
A
 
Y
S
 
A
T
 
H
A
 
Y
L
 
Y
D
 
G
R
 
E
D
 
E
P
 
K
R
 
K
S
 
A
A
 
I
Q
 
D
T
 
I
A
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
N
K
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
D
G
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
A
A
 
E
I
 
H
F
 
V
Q
 
E
R
 
R
A
 
F
G
 
M
R
 
E
F
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
I
G
 
C
L
 
F
A
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
F
Q
 
T
L
 
A
F
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
I
 
V
I
 
A
L
 
L
S
 
G
G
 
G
A
 
G
R
 
L
M
 
S
R
 
N
Y
 
F
D
 
E
Y
 
L
L
 
I
Y
 
Y
A
 
-
E
 
E
E
 
E
V
 
M
L
 
P
A
 
K
E
 
R
M
 
V
Q
 
P
R
 
K
M
 
Y
T
 
L
L
 
L
H
 
S
P
 
V
A
 
A
-
 
K
T
 
C
P
 
P
R
 
K
S
 
I
R
 
I
V
 
K
E
 
A
I
 
K
H
 
H
A
 
-
W
 
-
G
 
G
D
 
D
Q
 
S
V
 
G
W
 
G
A
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
A
A
 
F
L
 
L
A
 
N
L
 
I
S
 
K
A
 
G

6jdbA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac-6p and adp from haemophilus influenzae
30% identity, 40% coverage: 190:354/414 of query aligns to 86:241/290 of 6jdbA

query
sites
6jdbA
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
S
I
 
I
E
 
A
D
 
K
R
 
H
F
 
T
G
 
D
L
 
K
P
 
P
A
 
I
H
 
G
L
 
L
E
 
L
N
|
N
D
|
D
A
 
A
N
 
Q
V
 
A
L
 
A
T
 
T
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
W
 
Q
F
 
L
G
 
Q
A
 
N
G
 
F
R
 
E
A
 
Q
M
 
V
Q
 
S
D
 
N
F
 
F
A
 
V
V
 
F
V
 
I
T
 
T
I
 
V
E
x
S
Q
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
 
Q
R
 
I
L
 
L
F
 
Q
R
 
T
G
 
G
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
A
L
 
G
E
x
H
L
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
K
 
L
V
 
A
Q
 
D
L
 
P
D
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
I
C
|
C
R
 
G
C
|
C
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
|
E
A
 
A
Y
 
I
L
 
A
A
 
S
D
 
G
Y
 
R
A
 
A
L
 
I
V
 
-
R
 
-
E
 
E
A
 
A
S
 
V
T
 
S
A
 
S
L
 
Q
D
 
W
R
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
C
S
 
D
A
x
P
Q
x
K
T
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
E
L
 
V
F
 
F
D
 
E
Q
 
R
A
 
F
K
 
R
A
 
K
G
 
N
N
 
D
G
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
T
A
 
A
I
 
L
F
 
V
Q
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
A
R
 
K
F
 
A
L
 
I
S
 
A
L
 
N
G
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
D
V
 
L
V
 
V
Q
 
I
L
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
I
E
 
Q
L
 
K
I
 
I
I
 
A
L
 
I
S
 
G
G
 
G
A
x
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>3608608 FitnessBrowser__Dino:3608608
MPEDAATRDTPGCGPMLPDSGRNAKPLRQAVFEHVRAAGHAPRMDIARALGISPGSVTTL
TSDLIEAGFLTEIAAPARETGRGRPPVALAVVPAARYVLGLRLSDEMHTVSLSDFSGTEL
ATAHRASQPGRYAVEALLTEMATLIDEVLAAAALPRDRVAALGVGLPGAVHHETGRVAWS
PILAGQDHALQAIIEDRFGLPAHLENDANVLTLAELWFGAGRAMQDFAVVTIEQGVGMGL
VLNNRLFRGAQGLGLELGHTKVQLDGALCRCGQRGCLEAYLADYALVREASTALDRDPRS
AQTAAAMLESLFDQAKAGNGAAKAIFQRAGRFLSLGLANVVQLFDPELIILSGARMRYDY
LYAEEVLAEMQRMTLHPATPRSRVEIHAWGDQVWARGATALALSAVTDALMGER

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory