SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609639 Dshi_3022 PfkB domain protein (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3uboA The crystal structure of adenosine kinase from sinorhizobium meliloti
47% identity, 97% coverage: 9:332/333 of query aligns to 3:333/338 of 3uboA

query
sites
3uboA
Y
 
Y
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
I
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
T
 
C
D
 
D
D
 
D
S
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
E
H
 
E
M
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
I
K
 
K
G
 
G
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
N
R
 
A
P
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
R
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
V
K
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
E
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
F
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
L
Q
 
D
V
 
G
E
 
H
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
D
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
D
A
 
A
F
 
I
E
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
T
G
 
A
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
H
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
S
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
E
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
T
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
|
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
G
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
L
A
 
L
A
 
A
S
 
R
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
L
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
|
T
R
 
L
S
|
S
G
x
E
D
 
E
P
x
G
V
 
S
V
 
V
M
 
V
I
 
V
R
 
R
G
 
G
D
 
A
A
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
R
V
 
V
P
 
G
V
 
A
T
 
S
R
 
V
V
x
L
V
 
E
P
 
Q
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
E
C
 
C
G
 
S
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
x
N
I
 
L
A
 
A
G
x
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
|
I
S
 
G
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
L
T
 
V
D
 
S
V
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
R
R
 
Q
A
 
A
R
 
A
F
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
N
L
 
L

4lc4A Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with guanosine
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4lc4A

query
sites
4lc4A
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
|
T
R
 
M
S
|
S
G
x
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
x
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
|
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4kbeA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with benzoguanamine
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4kbeA

query
sites
4kbeA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
x
I
A
x
S
Q
x
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
x
P
R
x
A
V
x
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4kanA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 2-(2,5-dimethyl-1,3-thiazol-4-yl)acetic acid
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4kanA

query
sites
4kanA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
x
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
|
A
E
|
E
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
|
R
S
 
S
M
|
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
|
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
|
T
R
 
M
S
|
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4kalA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with quinoline-3-carboxylic acid
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4kalA

query
sites
4kalA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
F
|
F
C
 
C
V
 
V
D
|
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
x
S
L
 
L
Y
 
Y
E
x
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4kahA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 4-bromo-1h-pyrazole
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4kahA

query
sites
4kahA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
x
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
|
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4kadA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n1-(2.3-dihydro-1h-inden-5-yl)acetam
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4kadA

query
sites
4kadA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
|
S
G
x
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
x
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
|
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4k9iA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with norharmane
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4k9iA

query
sites
4k9iA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
F
|
F
C
 
C
V
 
V
D
|
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
x
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4k9cA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n-(hydroxymethyl)benzamide and 4-methyl-3,4- dihydro-2h-1,4-benzoxazine-7-carboxylic acid
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4k9cA

query
sites
4k9cA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
x
Q
L
|
L
G
 
G
R
x
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
|
P
T
 
T
S
 
A
R
|
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
F
|
F
C
 
C
V
 
V
D
|
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
x
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4k93A Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n-(hydroxymethyl)benzamide
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4k93A

query
sites
4k93A
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
|
L
V
x
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
x
Q
L
 
L
G
 
G
R
x
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
|
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
|
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
|
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
F
|
F
C
 
C
V
 
V
D
|
D
R
 
R
H
 
Y
R
|
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
x
L
A
x
S
L
 
L
Y
 
Y
E
x
Q
T
 
T
E
x
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
|
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4k8tA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with ethyl 3,4-diaminobenzoate
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4k8tA

query
sites
4k8tA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
x
F
A
 
P
P
|
P
T
 
T
S
 
A
R
|
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
|
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4k8cA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with adp
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4k8cA

query
sites
4k8cA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
|
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
|
T
R
 
M
S
|
S
G
x
E
D
 
N
P
x
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
x
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
x
C
I
 
L
A
 
A
G
x
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
|
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4jkuA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with quinaldic acid, nysgrc target 14306
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 4:330/330 of 4jkuA

query
sites
4jkuA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
x
S
F
|
F
C
 
C
V
 
V
D
|
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
x
S
L
 
L
Y
 
Y
E
x
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4lbxA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with cytidine
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 5:331/331 of 4lbxA

query
sites
4lbxA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
|
T
R
 
M
S
|
S
G
 
E
D
 
N
P
x
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
x
C
I
 
L
A
 
A
G
x
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
|
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4k8kA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 1-(4-methoxyphenyl)-1-cyclopropane and 2- aminoperimidine
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 5:331/331 of 4k8kA

query
sites
4k8kA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
x
A
P
 
E
R
 
R
A
|
A
E
|
E
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
x
A
D
|
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
x
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
|
P
T
 
T
S
 
A
R
|
R
S
 
S
M
|
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
|
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

4k8pA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 2-ethylbenzyl alcohol
43% identity, 98% coverage: 9:333/333 of query aligns to 6:332/332 of 4k8pA

query
sites
4k8pA
Y
 
F
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
T
I
 
V
G
 
G
N
|
N
A
 
A
I
|
I
V
 
V
D
|
D
V
 
I
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
C
D
 
N
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
I
H
 
D
M
 
N
G
 
Q
I
 
I
E
 
T
K
 
K
G
 
A
I
 
A
M
|
M
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
D
R
 
A
P
 
E
R
 
R
A
|
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
A
 
S
A
 
R
M
 
M
S
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
P
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
G
N
|
N
T
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
G
R
 
K
C
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
I
Y
 
F
A
 
T
Q
 
H
G
 
D
M
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
A
 
H
F
 
Y
P
 
Q
N
 
T
P
 
K
P
 
P
Q
 
K
Q
 
G
V
 
A
E
 
F
A
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
|
R
S
 
S
M
 
M
I
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
S
 
S
M
|
M
N
 
N
T
|
T
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
C
A
 
V
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
E
E
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
T
F
 
Y
L
 
F
E
|
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
W
D
 
D
K
 
P
V
 
P
P
 
R
G
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
I
E
 
L
A
 
D
A
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
H
G
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
R
H
 
E
A
 
M
G
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
Y
R
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
F
Q
 
L
R
 
D
L
 
L
V
 
M
-
 
R
A
 
S
D
 
G
E
 
K
L
 
V
N
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
A
N
 
N
E
 
R
H
 
Q
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
R
 
R
A
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
D
C
 
C
E
 
K
L
 
I
V
 
A
V
 
A
C
 
V
T
 
T
R
 
M
S
 
S
G
 
E
D
 
N
P
 
G
V
 
A
V
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
G
 
G
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
Y
E
 
Y
V
 
V
P
 
N
V
 
A
T
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
R
P
 
E
-
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
D
C
 
C
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
Q
F
 
I
G
 
G
A
x
P
R
 
R
P
 
P
K
 
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
R
 
S
A
 
E
R
 
A
F
 
A
V
 
K
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I

1liiA Structure of t. Gondii adenosine kinase bound to adenosine 2 and amp- pcp (see paper)
31% identity, 93% coverage: 8:316/333 of query aligns to 2:326/331 of 1liiA

query
sites
1liiA
P
 
P
Y
 
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
F
G
 
A
I
 
I
G
 
G
N
|
N
A
 
P
I
|
I
V
 
L
D
|
D
V
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
T
 
V
D
 
P
D
 
S
S
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
E
M
 
F
G
 
F
I
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
I
 
D
M
 
A
Q
 
T
L
 
L
V
 
A
E
 
-
R
 
T
P
 
P
R
 
E
A
 
Q
E
 
M
M
 
R
L
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
T
M
 
L
S
 
D
-
 
Q
-
 
F
D
 
N
R
 
P
V
 
T
Q
 
S
A
 
L
P
 
P
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
S
L
 
V
A
 
R
G
 
V
L
 
V
G
 
Q
E
 
K
L
 
L
G
 
-
L
 
L
R
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
S
C
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
M
G
 
G
R
 
A
V
 
I
K
 
G
D
 
D
D
 
D
T
 
P
L
 
R
G
 
G
R
 
Q
F
 
V
Y
 
L
A
 
K
Q
 
E
G
 
L
M
 
C
E
 
D
A
 
K
E
 
E
G
 
G
-
 
L
-
 
A
T
 
T
A
 
R
F
 
F
P
 
M
N
 
V
P
 
A
P
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
V
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
S
S
 
T
R
 
G
S
 
T
M
x
C
I
 
A
F
 
V
V
 
L
T
 
I
P
 
N
D
 
E
G
 
K
E
 
E
R
|
R
S
 
T
M
 
L
N
 
C
T
|
T
Y
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
C
G
 
G
P
 
S
E
 
F
D
 
R
V
 
I
P
 
P
E
 
E
-
 
N
-
 
W
A
 
T
V
 
T
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
V
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
I
F
 
F
L
 
Y
-
 
A
E
 
T
G
 
A
Y
|
Y
L
 
T
F
 
L
D
 
T
K
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
-
K
 
K
A
 
N
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
-
Y
 
Y
A
 
A
R
 
H
G
 
G
A
 
I
-
 
P
G
 
N
G
 
A
H
 
I
A
 
F
G
 
T
I
 
L
T
 
N
L
 
L
S
 
S
D
 
A
P
 
P
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
E
R
 
L
H
 
Y
R
 
K
A
 
D
D
 
A
F
 
M
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
V
 
L
A
 
L
D
 
-
E
 
H
L
 
T
N
 
N
F
 
I
V
 
L
I
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
H
 
E
E
 
E
Y
 
F
M
 
A
A
 
H
L
 
L
Y
 
A
E
 
K
T
 
V
E
 
H
D
 
N
L
 
L
G
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
A
R
 
L
A
 
S
A
 
V
S
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
E
-
 
H
-
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
G
V
 
A
C
 
T
E
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
C
 
M
T
|
T
R
 
R
S
x
G
G
x
H
D
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
I
M
 
A
I
 
A
R
 
E
G
 
Q
D
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
G
E
 
T
V
 
V
P
 
V
V
 
V
T
 
H
R
 
E
V
 
V
V
 
G
P
x
V
-
 
P
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
I
V
 
V
D
 
D
A
x
T
T
x
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
A
F
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
T
L
 
V
E
 
K
V
 
Q
C
 
C
G
 
I
R
 
M
M
 
C
G
 
G
V
x
N
I
 
A
A
 
C
G
x
A
S
x
Q
E
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
H
F
 
V
G
 
G

1lijA Structure of t. Gondii adenosine kinase bound to prodrug 2 7- iodotubercidin and amp-pcp (see paper)
32% identity, 93% coverage: 8:316/333 of query aligns to 2:325/330 of 1lijA

query
sites
1lijA
P
 
P
Y
 
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
F
G
 
A
I
 
I
G
 
G
N
|
N
A
 
P
I
 
I
V
 
L
D
|
D
V
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
T
 
V
D
 
P
D
 
S
S
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
E
M
 
F
G
 
F
I
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
I
 
D
M
 
A
Q
x
T
L
 
L
V
 
A
E
 
T
R
 
-
P
 
P
R
 
E
A
 
Q
E
 
M
M
 
R
L
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
T
M
 
L
S
 
D
-
 
Q
-
 
F
D
 
N
R
 
P
V
 
T
Q
 
S
A
 
L
P
 
P
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
L
N
|
N
T
 
S
L
 
V
A
 
R
G
 
V
L
 
V
G
 
Q
E
 
K
L
 
L
G
 
-
L
 
L
R
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
S
C
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
M
G
 
G
R
 
A
V
 
I
K
 
G
D
 
D
D
 
D
T
 
P
L
 
R
G
 
G
R
 
Q
F
 
V
Y
 
L
A
 
K
Q
 
E
G
 
L
M
 
C
E
 
D
A
 
K
E
 
E
G
 
G
-
 
L
-
 
A
T
 
T
A
 
R
F
 
F
P
 
M
N
 
V
P
 
A
P
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
V
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
S
S
 
T
R
 
G
S
 
T
M
 
C
I
 
A
F
 
V
V
 
L
T
 
I
P
 
N
D
 
E
G
 
K
E
 
E
R
|
R
S
 
T
M
 
L
N
 
C
T
|
T
Y
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
C
G
 
G
P
 
S
E
 
F
D
 
R
V
 
I
P
 
P
E
 
E
-
 
N
-
 
W
A
 
T
V
 
T
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
V
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
I
F
 
F
L
 
Y
-
 
A
E
 
T
G
 
A
Y
|
Y
L
 
T
F
 
L
D
 
T
K
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
-
K
 
K
A
 
N
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
-
Y
 
Y
A
 
A
R
 
H
G
 
G
A
 
I
-
 
P
G
 
N
G
 
A
H
 
I
A
 
F
G
 
T
I
 
L
T
 
N
L
 
L
S
 
S
D
 
A
P
 
P
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
E
R
 
L
H
 
Y
R
 
K
A
 
D
D
 
A
F
 
M
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
V
 
L
A
 
L
D
 
-
E
 
H
L
 
T
N
 
N
F
 
I
V
 
L
I
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
H
 
E
E
 
E
Y
 
F
M
 
A
A
 
H
L
 
L
Y
 
A
E
 
K
T
 
V
E
 
H
D
 
N
L
 
L
-
 
V
G
 
K
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
V
A
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
E
-
 
H
-
 
A
-
 
V
A
 
T
S
 
G
V
 
A
C
 
T
E
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
C
 
M
T
|
T
R
 
R
S
x
G
G
x
H
D
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
I
M
 
A
I
 
A
R
 
E
G
 
Q
D
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
G
E
 
T
V
 
V
P
 
V
V
 
V
T
 
H
R
 
E
V
 
V
V
 
G
P
x
V
-
 
P
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
A
F
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
T
L
 
V
E
 
K
V
 
Q
C
 
C
G
 
I
R
 
M
M
 
C
G
 
G
V
x
N
I
 
A
A
 
C
G
x
A
S
x
Q
E
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
H
F
 
V
G
 
G

1dgmA Crystal structure of adenosine kinase from toxoplasma gondii (see paper)
32% identity, 93% coverage: 8:316/333 of query aligns to 3:336/346 of 1dgmA

query
sites
1dgmA
P
 
P
Y
 
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
F
G
 
A
I
 
I
G
 
G
N
|
N
A
 
P
I
 
I
V
 
L
D
|
D
V
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
T
 
V
D
 
P
D
 
S
S
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
E
M
 
F
G
 
F
I
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
I
 
D
M
 
A
Q
 
T
L
 
L
V
 
A
E
 
T
R
 
-
P
 
P
R
 
E
A
 
Q
E
 
M
M
 
R
L
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
T
M
 
L
S
 
D
-
 
Q
-
 
F
D
 
N
R
 
P
V
 
T
Q
 
S
A
 
L
P
 
P
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
S
L
 
V
A
 
R
G
 
V
L
 
V
G
 
Q
E
 
K
L
 
L
G
 
-
L
 
L
R
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
S
C
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
M
G
 
G
R
 
A
V
 
I
K
 
G
D
 
D
D
 
D
T
 
P
L
 
R
G
 
G
R
 
Q
F
 
V
Y
 
L
A
 
K
Q
 
E
G
 
L
M
 
C
E
 
D
A
 
K
E
 
E
G
 
G
-
 
L
-
 
A
T
 
T
A
 
R
F
 
F
P
 
M
N
 
V
P
 
A
P
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
V
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
S
T
 
T
S
 
G
R
 
V
S
 
C
M
 
A
I
 
V
F
 
L
V
 
I
T
 
N
P
 
-
D
 
E
G
 
K
E
 
E
R
|
R
S
 
T
M
 
L
N
 
C
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
C
G
 
G
A
 
S
D
 
F
L
 
R
G
 
L
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
-
P
 
-
E
 
W
A
 
T
V
 
T
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
V
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
I
F
 
F
L
 
Y
-
 
A
E
 
T
G
 
A
Y
|
Y
L
 
T
F
 
L
D
 
T
K
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
-
K
 
K
A
 
N
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
-
Y
 
Y
A
|
A
R
 
H
G
 
G
A
x
I
-
 
P
G
 
N
G
x
A
H
 
I
A
 
F
G
 
T
I
 
L
T
 
N
L
 
L
S
 
S
D
 
A
P
 
P
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
E
R
 
L
H
 
Y
R
 
K
A
 
D
D
 
A
F
 
M
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
V
 
L
A
 
L
D
 
-
E
 
H
L
 
T
N
 
N
F
 
I
V
 
L
I
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
H
 
E
E
 
E
Y
 
F
M
 
A
A
 
H
L
 
L
Y
 
A
E
 
K
T
 
V
E
 
H
D
 
N
L
 
L
-
 
V
G
 
T
A
 
A
A
 
N
L
 
K
A
 
E
R
 
H
A
 
A
A
 
V
S
 
E
V
 
V
C
 
C
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
T
E
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
C
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
G
G
 
H
D
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
I
M
 
A
I
 
A
R
 
E
G
 
Q
D
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
G
E
 
T
V
 
V
P
 
V
V
 
V
T
 
H
R
 
E
V
 
V
V
 
G
P
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
A
F
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
A
L
 
L
A
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
T
L
 
V
E
 
K
V
 
Q
C
 
C
G
 
I
R
 
M
M
 
C
G
 
G
V
 
N
I
 
A
A
 
C
G
 
A
S
 
Q
E
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
H
F
 
V
G
 
G

2aa0A Crystal structure of t. Gondii adenosine kinase complexed with 6- methylmercaptopurine riboside (see paper)
31% identity, 93% coverage: 8:316/333 of query aligns to 3:344/351 of 2aa0A

query
sites
2aa0A
P
 
P
Y
 
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
F
G
 
A
I
 
I
G
 
G
N
|
N
A
 
P
I
|
I
V
 
L
D
|
D
V
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
T
 
V
D
 
P
D
 
S
S
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
E
M
 
F
G
 
F
I
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
I
 
D
M
 
A
Q
 
T
L
 
L
V
 
A
E
 
T
R
 
-
P
 
P
R
 
E
A
 
Q
E
 
M
M
 
R
L
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
T
M
 
L
S
 
D
-
 
Q
-
 
F
D
 
N
R
 
P
V
 
T
Q
 
S
A
 
L
P
 
P
G
 
G
G
|
G
S
 
S
V
 
A
A
 
L
N
|
N
T
 
S
L
 
V
A
 
R
G
 
V
L
 
V
G
 
Q
E
 
K
L
 
L
G
 
-
L
 
L
R
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
S
C
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
M
G
 
G
R
 
A
V
 
I
K
 
G
D
 
D
D
 
D
T
 
P
L
 
R
G
 
G
R
 
Q
F
 
V
Y
 
L
A
 
K
Q
 
E
G
 
L
M
 
C
E
 
D
A
 
K
E
 
E
G
 
G
-
 
L
-
 
A
T
 
T
A
 
R
F
 
F
P
 
M
N
 
V
P
 
A
P
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
V
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
S
T
 
T
S
 
G
R
 
V
S
 
C
M
 
A
I
 
V
F
 
L
V
 
I
T
 
N
P
 
-
D
 
E
G
 
K
E
 
E
R
|
R
S
 
T
M
 
L
N
 
C
T
|
T
Y
 
H
L
|
L
G
 
G
A
 
A
-
 
C
G
 
G
A
 
S
D
 
F
L
 
R
G
 
L
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
-
P
 
-
E
 
W
A
 
T
V
 
T
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
V
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
I
F
 
F
L
 
Y
-
 
A
E
 
T
G
 
A
Y
|
Y
L
 
T
F
 
L
D
 
T
K
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
-
K
 
K
A
 
N
A
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
-
Y
 
Y
A
 
A
R
 
H
G
 
G
A
 
I
-
 
P
G
 
N
G
 
A
H
 
I
A
 
F
G
 
T
I
 
L
T
 
N
L
 
L
S
 
S
D
 
A
P
 
P
F
 
F
C
 
C
V
 
V
D
 
E
R
 
L
H
 
Y
R
 
K
A
 
D
D
 
A
F
 
M
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
V
 
L
A
 
L
D
 
-
E
 
H
L
 
T
N
 
N
F
 
I
V
 
L
I
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
H
 
E
E
 
E
Y
 
F
M
 
A
A
 
H
L
 
L
Y
 
A
E
 
K
T
 
V
E
 
H
D
 
N
L
 
L
G
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
K
R
 
T
A
 
A
A
 
L
S
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
E
-
 
H
-
 
A
-
 
V
-
 
E
V
 
V
C
 
C
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
T
-
 
S
-
 
A
-
 
T
E
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
C
 
M
T
 
T
R
 
R
S
x
G
G
x
H
D
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
I
M
 
A
I
 
A
R
 
E
G
 
Q
D
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
G
E
 
T
V
 
V
P
 
V
V
 
V
T
 
H
R
 
E
V
 
V
V
 
G
P
x
V
-
 
P
-
 
V
-
x
V
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
Q
 
A
F
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
G
 
A
L
 
L
A
 
S
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
T
L
 
V
E
 
K
V
 
Q
C
 
C
G
 
I
R
 
M
M
 
C
G
 
G
V
x
N
I
 
A
A
 
C
G
x
A
S
x
Q
E
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
Q
H
 
H
F
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>3609639 Dshi_3022 PfkB domain protein (RefSeq)
MSDTSKDPYQVVGIGNAIVDVLAQTDDSFLDHMGIEKGIMQLVERPRAEMLYAAMSDRVQ
APGGSVANTLAGLGELGLRCAFIGRVKDDTLGRFYAQGMEAEGTAFPNPPQQVEAPTSRS
MIFVTPDGERSMNTYLGAGADLGPEDVPEAVFAQVGLLFLEGYLFDKVPGKAAFEAAARY
ARGAGGHAGITLSDPFCVDRHRADFQRLVADELNFVIGNEHEYMALYETEDLGAALARAA
SVCELVVCTRSGDPVVMIRGDARVEVPVTRVVPVDATGAGDQFAAGFLYGLATGKSLEVC
GRMGVIAGSEVISHFGARPKTDVRARFVAEGLL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory