SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6937359 FitnessBrowser__SB2B:6937359 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1eyyA Crystal structure of the NADP+ dependent aldehyde dehydrogenase from vibrio harveyi. (see paper)
47% identity, 95% coverage: 22:509/515 of query aligns to 5:491/504 of 1eyyA

query
sites
1eyyA
F
 
F
T
 
Y
R
 
A
F
 
T
N
 
N
P
 
A
S
 
F
T
 
T
N
 
G
S
 
E
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
L
A
 
A
F
 
F
S
 
P
Q
 
V
G
 
H
T
 
T
V
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
N
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
I
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
K
A
 
V
F
 
A
W
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
R
Q
 
R
T
 
L
S
 
N
A
 
N
D
 
S
Q
 
K
K
 
R
A
 
A
K
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
R
T
 
T
M
 
I
A
 
A
K
 
S
E
 
E
I
 
L
E
 
E
Q
 
A
D
 
R
G
 
S
D
 
D
A
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
A
C
 
R
A
 
A
M
 
H
L
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
V
R
 
R
L
 
L
K
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
D
V
 
V
L
 
V
R
 
N
E
 
S
-
 
G
P
 
S
Y
 
Y
S
 
H
P
 
Q
L
 
A
L
 
I
M
 
L
D
 
D
K
 
T
A
 
P
N
 
N
P
 
P
D
 
T
R
 
R
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
P
K
 
K
P
 
P
E
 
D
L
 
I
K
 
R
L
 
R
G
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
A
S
|
S
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
S
 
S
T
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
|
K
G
 
G
H
|
H
P
x
T
S
 
A
H
 
H
P
 
P
G
 
G
T
 
T
S
 
S
E
 
Q
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
C
M
 
I
A
 
E
R
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
K
L
 
Q
T
 
E
G
 
Q
M
 
L
P
 
P
K
 
Q
G
 
A
L
 
I
F
 
F
S
 
T
L
 
L
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
S
 
N
E
 
Q
P
x
R
A
 
A
L
 
L
S
 
G
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
V
K
 
G
V
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
F
D
 
N
R
 
L
C
 
A
A
 
H
L
 
E
R
 
R
P
 
P
E
 
E
P
 
P
I
 
I
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
A
V
 
I
N
 
N
P
 
P
Q
 
T
L
 
F
L
 
I
L
 
F
P
 
P
G
 
S
K
 
A
L
 
M
A
 
-
R
 
R
D
 
A
A
 
K
A
 
A
V
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
Q
Q
 
F
V
 
V
N
 
A
S
 
S
M
 
M
M
 
T
M
 
M
G
 
G
H
 
C
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
C
|
C
T
 
T
S
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
 
F
A
 
A
I
 
L
K
 
N
G
 
T
P
 
P
G
 
E
L
 
T
E
 
Q
S
 
A
Y
 
F
L
 
I
A
 
E
A
 
T
L
 
A
S
 
Q
D
 
S
I
 
L
A
 
I
S
 
R
R
 
Q
Q
 
Q
N
 
S
A
 
P
A
 
S
A
 
T
M
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
P
G
 
G
I
 
I
C
 
R
Q
 
D
A
 
S
F
 
Y
N
 
Q
Q
 
S
D
 
Q
V
 
V
S
 
-
I
 
-
L
 
-
V
 
V
P
 
S
R
 
R
V
 
G
N
 
S
V
 
-
I
 
-
A
 
D
Q
 
D
G
 
G
Q
 
I
A
 
D
A
 
V
E
 
T
A
 
F
A
 
S
H
 
Q
H
 
A
S
 
E
R
 
S
P
 
P
L
 
C
I
 
V
A
 
-
S
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
F
 
F
-
 
V
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
N
-
 
W
-
 
R
G
 
K
Q
 
H
P
 
P
E
 
A
L
 
W
L
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
Q
A
 
S
L
 
L
V
 
I
A
 
V
I
 
V
C
 
C
D
 
E
S
 
N
K
 
V
E
 
A
E
 
D
M
 
M
F
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
S
K
 
E
R
 
M
L
 
L
P
 
A
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
G
 
A
S
 
T
I
 
I
H
 
H
G
 
A
L
 
T
E
 
E
T
 
E
E
 
D
V
 
Y
A
 
P
D
 
Q
F
 
V
G
 
S
D
 
Q
I
 
L
I
 
I
D
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
E
F
 
E
K
 
I
V
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
M
 
V
F
 
F
N
 
N
Q
 
G
M
 
W
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
G
R
 
Y
A
 
A
M
 
M
N
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
T
D
 
H
G
 
S
R
 
A
S
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
I
K
 
H
R
 
R
F
 
W
M
 
L
R
 
R
P
 
P
I
 
V
C
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
A
M
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
D
E
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
S
 
E
S
 
N

5ur2B Crystal structure of proline utilization a (puta) from bdellovibrio bacteriovorus inactivated by n-propargylglycine (see paper)
25% identity, 92% coverage: 17:492/515 of query aligns to 483:945/959 of 5ur2B

query
sites
5ur2B
Q
 
Q
S
 
S
E
 
G
A
 
K
S
 
I
F
 
F
T
 
D
R
 
R
F
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
S
T
 
Q
N
 
S
S
 
D
V
 
Q
L
 
I
P
 
V
G
 
G
A
 
K
F
 
I
S
 
Q
Q
 
M
G
 
A
T
 
T
V
 
T
V
 
E
E
 
Q
V
 
A
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
M
I
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
T
A
 
A
F
 
Y
W
 
K
E
 
T
F
 
W
Q
 
K
Q
 
N
T
 
V
S
 
P
A
 
C
D
 
E
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
K
 
A
L
 
L
L
 
V
E
 
D
T
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
I
I
 
M
E
 
T
Q
 
R
D
 
D
G
 
R
D
 
F
A
 
K
I
 
L
V
 
I
A
 
A
C
 
T
A
 
Q
M
 
V
L
 
L
E
 
E
S
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
W
A
 
A
R
 
E
L
 
A
K
 
D
G
 
G
E
 
D
L
 
I
G
 
G
R
 
E
T
 
A
A
 
I
G
 
D
Q
 
F
L
 
C
R
 
R
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
R
V
 
H
L
 
M
R
 
R
E
 
E
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
E
 
-
L
 
L
K
 
R
L
 
V
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
H
-
 
Y
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
-
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
V
V
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
A
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
I
S
 
-
T
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
M
D
 
V
T
 
T
A
 
A
S
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
-
G
 
G
C
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
M
K
|
K
G
 
-
H
 
-
P
 
P
S
 
A
H
 
E
P
 
Q
G
 
S
T
 
T
S
 
-
E
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
W
A
 
G
M
 
L
A
 
M
R
 
K
A
 
M
I
 
I
D
 
Q
L
 
E
T
 
A
G
 
G
M
 
F
P
 
P
K
 
Q
G
 
G
L
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
F
I
 
L
Q
 
P
G
 
G
S
 
Y
E
 
G
P
 
E
A
 
E
L
 
V
S
 
G
V
 
E
A
 
Y
L
 
I
V
 
V
E
 
N
H
 
H
P
 
K
L
 
Y
V
 
T
K
 
T
A
 
T
V
 
I
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
K
K
 
A
V
 
V
G
 
G
R
 
L
L
 
H
L
 
I
A
 
M
D
 
N
R
 
R
C
 
A
A
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
R
 
Q
P
 
Q
E
 
H
P
 
V
I
 
K
P
 
R
F
 
C
Y
 
I
G
 
I
E
|
E
L
 
M
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
N
P
 
A
Q
 
-
L
 
V
L
 
I
L
 
I
P
 
D
G
 
N
K
 
D
L
 
A
A
 
D
R
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
G
Q
 
V
V
 
I
N
 
Y
S
 
S
M
 
A
M
 
F
M
 
G
G
 
F
H
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
K
C
|
C
T
 
S
S
 
A
P
 
A
G
 
S
L
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
L
K
 
D
G
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
V
Y
 
Y
L
 
D
A
 
R
A
 
F
L
 
V
S
 
D
D
 
R
I
 
L
A
 
V
S
 
E
R
 
T
Q
 
A
N
 
K
A
 
S
A
 
I
A
 
E
M
 
I
L
 
H
S
 
P
A
 
A
G
 
E
I
 
N
C
 
P
Q
 
K
A
 
A
F
 
Y
N
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
M
V
 
G
P
 
P
R
 
V
V
 
V
N
 
D
V
 
K
I
 
E
A
 
A
Q
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
L
G
 
G
Q
 
T
A
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
E
H
 
K
H
 
N
S
 
H
R
 
K
P
 
L
L
 
L
I
 
F
-
 
K
A
 
G
S
 
S
I
 
V
E
 
P
A
 
G
S
 
G
A
 
G
L
 
F
F
 
F
G
 
A
Q
 
P
P
 
P
E
 
T
L
 
I
L
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
E
 
A
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
V
A
 
V
L
 
A
V
 
V
A
 
I
I
 
R
C
 
A
D
 
K
S
 
N
K
 
L
E
 
D
E
 
Q
M
 
A
F
 
L
E
 
D
L
 
I
V
 
A
K
 
N
R
 
S
L
 
T
P
 
E
G
 
Y
Q
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
I
 
V
H
 
-
G
 
-
L
 
F
E
 
S
T
 
R
E
 
S
V
 
P
A
 
A
D
 
N
F
 
I
G
 
N
D
 
R
I
 
V
I
 
K
D
 
E
R
 
E
L
 
L
A
 
-
F
 
-
K
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
N
I
 
L
M
 
Y
F
 
V
N
 
N
Q
 
R
M
 
G
P
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
A
E
 
M
V
 
V
A
 
D
R
 
R
A
 
-
M
 
-
N
 
H
H
 
P
G
 
F
G
 
G
P
 
G
Y
 
F
P
 
K
A
 
M
S
 
S
T
 
G
D
 
I
G
 
G
R
 
S
S
 
K
T
|
T
S
 
G
V
 
-
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
Y
M
 
L
K
 
K
R
 
Q
F
 
Y
M
 
M
R
 
E
P
 
P
I
 
A
C
 
C

Sites not aligning to the query:

5gtlA NADPH complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
26% identity, 76% coverage: 21:410/515 of query aligns to 33:413/491 of 5gtlA

query
sites
5gtlA
S
 
T
F
 
F
T
 
E
R
 
T
F
 
Y
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
N
 
E
S
 
D
V
 
V
L
 
L
P
 
-
G
 
A
A
 
V
F
 
V
S
 
C
Q
 
E
G
 
A
T
 
Q
V
 
E
V
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
R
A
 
S
A
 
A
F
 
F
W
 
E
E
 
S
-
 
G
-
 
P
F
 
W
Q
 
A
Q
 
E
T
 
M
S
 
T
A
 
T
D
 
A
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
H
L
 
L
L
 
I
E
 
Y
T
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
D
 
H
G
 
R
D
 
E
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
Q
C
 
L
A
 
E
M
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
N
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
Y
E
 
Q
A
 
V
R
 
A
L
 
L
K
 
D
G
 
D
E
 
D
L
 
I
G
 
S
R
 
A
T
 
T
A
 
V
G
 
E
Q
 
N
L
 
Y
R
 
R
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
G
V
 
W
L
 
T
R
 
T
E
 
K
P
 
I
Y
 
I
S
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
P
 
P
L
 
I
L
 
S
M
 
K
D
 
D
K
 
Y
A
 
L
N
 
N
P
 
Y
D
 
T
R
 
R
Q
 
H
P
 
E
L
 
-
P
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
Q
F
x
I
G
 
I
A
x
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
V
F
 
M
S
 
S
T
 
S
A
 
W
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
M
A
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
A
 
T
V
 
I
I
 
V
V
 
L
K
|
K
G
 
P
H
x
A
P
x
E
S
x
Q
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
S
S
 
L
E
 
L
L
 
Y
V
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
L
M
 
F
A
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
F
P
 
P
K
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
F
I
 
V
Q
 
P
G
 
G
S
 
F
E
x
G
P
 
P
A
 
E
L
 
A
S
x
G
V
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
V
E
 
N
H
 
H
P
 
H
L
 
D
V
 
I
K
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
V
V
x
T
G
 
G
R
 
K
L
 
Y
L
 
I
A
 
M
D
 
R
R
 
Q
C
 
S
A
 
A
L
 
E
R
 
M
P
 
I
E
 
K
P
 
H
I
 
V
P
 
T
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
N
L
 
I
L
 
I
L
 
L
P
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
A
 
D
A
 
A
V
 
D
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
I
-
 
N
-
 
G
Q
 
A
V
 
F
N
 
Q
S
 
G
M
 
I
M
 
M
M
 
Y
G
 
N
H
 
H
G
 
G
Q
 
Q
F
 
N
C
|
C
T
 
-
S
 
S
P
 
A
G
 
G
L
 
S
V
 
R
I
 
V
A
 
F
I
 
V
K
 
H
G
 
R
P
 
K
G
 
H
L
 
Y
E
 
E
S
 
T
Y
 
V
L
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
K
I
 
M
A
 
A
S
 
N
R
 
N
Q
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
V
M
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
M
C
 
E
Q
 
K
A
 
-
F
 
-
N
 
E
Q
 
T
D
 
E
V
 
M
S
 
G
I
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
S
R
 
K
-
 
K
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
V
V
 
L
N
 
N
V
 
Y
I
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
G
A
 
A
A
 
T
E
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
G
H
 
G
S
 
E
R
 
R
P
 
A
L
 
L
I
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
E
S
 
K
A
 
G
L
 
Y
F
 
F
G
 
V
Q
 
K
P
 
P
E
 
T
L
 
V
L
 
F
-
 
T
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
F
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
L
I
 
P
C
 
F
D
 
D
S
 
S
K
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
V
F
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5gtkA NAD+ complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
26% identity, 76% coverage: 21:410/515 of query aligns to 33:413/491 of 5gtkA

query
sites
5gtkA
S
 
T
F
 
F
T
 
E
R
 
T
F
 
Y
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
N
 
E
S
 
D
V
 
V
L
 
L
P
 
-
G
 
A
A
 
V
F
 
V
S
 
C
Q
 
E
G
 
A
T
 
Q
V
 
E
V
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
R
A
 
S
A
 
A
F
 
F
W
 
E
E
 
S
-
 
G
-
 
P
F
 
W
Q
 
A
Q
 
E
T
 
M
S
 
T
A
 
T
D
 
A
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
H
L
 
L
L
 
I
E
 
Y
T
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
D
 
H
G
 
R
D
 
E
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
Q
C
 
L
A
 
E
M
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
N
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
Y
E
 
Q
A
 
V
R
 
A
L
 
L
K
 
D
G
 
D
E
 
D
L
 
I
G
 
S
R
 
A
T
 
T
A
 
V
G
 
E
Q
 
N
L
 
Y
R
 
R
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
G
V
 
W
L
 
T
R
 
T
E
 
K
P
 
I
Y
 
I
S
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
P
 
P
L
 
I
L
 
S
M
 
K
D
 
D
K
 
Y
A
 
L
N
 
N
P
 
Y
D
 
T
R
 
R
Q
 
H
P
 
E
L
 
-
P
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
Q
F
x
I
G
x
I
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
V
F
 
M
S
 
S
T
 
S
A
 
W
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
M
A
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
A
 
T
V
 
I
I
 
V
V
 
L
K
|
K
G
 
P
H
 
A
P
x
E
S
 
Q
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
S
S
 
L
E
 
L
L
 
Y
V
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
L
M
 
F
A
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
F
P
 
P
K
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
F
I
 
V
Q
 
P
G
 
G
S
 
F
E
x
G
P
 
P
A
 
E
L
 
A
S
x
G
V
x
A
A
 
A
L
 
I
V
 
V
E
 
N
H
 
H
P
 
H
L
 
D
V
 
I
K
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
V
V
x
T
G
 
G
R
 
K
L
x
Y
L
 
I
A
 
M
D
 
R
R
 
Q
C
 
S
A
 
A
L
 
E
R
 
M
P
 
I
E
 
K
P
 
H
I
 
V
P
 
T
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
N
L
 
I
L
 
I
L
 
L
P
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
E
A
 
D
A
 
A
V
 
D
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
I
-
 
N
-
 
G
Q
 
A
V
 
F
N
 
Q
S
 
G
M
 
I
M
 
M
M
 
Y
G
 
N
H
 
H
G
 
G
Q
 
Q
F
 
N
C
|
C
T
 
-
S
 
S
P
 
A
G
 
G
L
 
S
V
 
R
I
 
V
A
 
F
I
 
V
K
 
H
G
 
R
P
 
K
G
 
H
L
 
Y
E
 
E
S
 
T
Y
 
V
L
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
K
I
 
M
A
 
A
S
 
N
R
 
N
Q
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
V
M
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
M
C
 
E
Q
 
K
A
 
-
F
 
-
N
 
E
Q
 
T
D
 
E
V
 
M
S
 
G
I
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
S
R
 
K
-
 
K
-
x
Q
-
 
Q
-
 
E
-
x
R
-
 
V
V
 
L
N
 
N
V
 
Y
I
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
G
A
 
A
A
 
T
E
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
G
H
 
G
S
 
E
R
 
R
P
 
A
L
 
L
I
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
E
S
 
K
A
 
G
L
 
Y
F
 
F
G
 
V
Q
 
K
P
 
P
E
 
T
L
 
V
L
 
F
-
 
T
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
F
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
L
I
 
P
C
 
F
D
 
D
S
 
S
K
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
V
F
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5u0mA Fatty aldehyde dehydrogenase from marinobacter aquaeolei vt8 and cofactor complex (see paper)
29% identity, 64% coverage: 4:333/515 of query aligns to 1:311/488 of 5u0mA

query
sites
5u0mA
D
 
N
L
 
L
C
 
T
G
 
G
R
 
N
H
 
V
F
 
Y
I
 
I
A
 
D
H
 
G
E
 
L
W
 
W
H
 
L
Q
 
P
S
 
G
E
 
H
-
 
G
A
 
A
S
 
P
F
 
F
T
 
E
R
 
S
F
 
V
N
 
Q
P
 
P
S
 
V
T
 
T
-
 
G
N
 
E
S
 
T
V
 
V
L
 
W
P
 
D
G
 
G
A
 
-
F
 
-
S
 
N
Q
 
A
G
 
A
T
 
S
V
 
L
V
 
E
E
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
R
A
 
E
A
 
A
D
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
W
 
L
E
 
A
F
 
W
Q
 
R
Q
 
R
T
 
K
S
 
S
A
 
L
D
 
A
Q
 
E
K
 
R
A
 
Q
K
 
A
L
 
V
L
 
I
E
 
E
T
 
A
M
 
F
A
 
G
K
 
E
E
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
A
D
 
N
G
 
K
D
 
E
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
H
C
 
Q
A
 
I
M
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
W
R
 
E
L
 
S
K
 
R
G
 
T
E
 
E
L
 
V
G
 
A
R
 
A
T
 
M
A
 
M
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
R
 
P
L
 
I
F
 
S
A
 
V
S
 
K
V
 
A
L
 
Y
R
 
N
E
 
E
P
 
R
Y
 
T
S
 
G
P
 
H
L
 
T
L
 
E
M
 
S
D
 
D
K
 
V
A
 
A
N
 
G
P
 
G
D
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
H
L
 
A
K
 
V
L
 
L
G
 
R
Q
 
H
L
 
R
P
 
P
L
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
|
F
G
 
G
A
 
P
S
x
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
G
A
 
H
F
 
L
S
 
P
T
 
N
A
 
-
G
 
-
G
 
G
D
 
H
T
 
I
A
 
V
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
F
K
|
K
G
 
P
H
x
S
P
x
E
S
 
L
H
 
T
P
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
L
M
 
W
A
 
E
R
 
K
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
L
P
 
P
K
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
G
E
 
S
P
 
D
A
 
T
L
 
-
S
x
G
V
 
K
A
 
C
L
 
L
V
 
A
E
 
R
H
 
H
P
 
S
L
 
L
V
 
I
K
 
D
A
 
G
V
 
L
G
 
F
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
L
 
S
K
 
T
V
|
V
G
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
H
D
 
E
R
 
Q
C
 
F
A
 
G
L
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
-
F
 
L
Y
 
A
G
 
L
E
|
E
L
x
M
G
|
G
S
 
G
V
 
N
N
 
N
P
 
P
Q
 
-
L
 
L
L
 
I
L
 
V
P
 
Q
G
 
N
K
 
V
L
 
S
A
 
D
R
 
L
D
 
D
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
H
A
 
H
E
 
A
A
 
L
Q
 
Q
V
 
-
N
 
-
S
 
S
M
 
A
M
 
F
M
 
L
G
 
S
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T
S
 
C
P
 
A
G
 
R
L
 
R
V
 
L
I
 
L
A
 
V
I
 
P
K
 
K
G
 
G
P
 
K
G
 
K
L
 
G
E
 
D
S
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
S
 
V
D
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
R
Q
 
I
N
 
T
A
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5u0lA X-ray crystal structure of fatty aldehyde dehydrogenase enzymes from marinobacter aquaeolei vt8 complexed with a substrate (see paper)
29% identity, 64% coverage: 4:333/515 of query aligns to 1:311/488 of 5u0lA

query
sites
5u0lA
D
 
N
L
 
L
C
 
T
G
 
G
R
 
N
H
 
V
F
 
Y
I
 
I
A
 
D
H
 
G
E
 
L
W
 
W
H
 
L
Q
 
P
S
 
G
E
 
H
-
 
G
A
 
A
S
 
P
F
 
F
T
 
E
R
 
S
F
 
V
N
 
Q
P
 
P
S
 
V
T
 
T
-
 
G
N
 
E
S
 
T
V
 
V
L
 
W
P
 
D
G
 
G
A
 
-
F
 
-
S
 
N
Q
 
A
G
 
A
T
 
S
V
 
L
V
 
E
E
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
R
A
 
E
A
 
A
D
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
W
 
L
E
 
A
F
 
W
Q
 
R
Q
 
R
T
 
K
S
 
S
A
 
L
D
 
A
Q
 
E
K
 
R
A
 
Q
K
 
A
L
 
V
L
 
I
E
 
E
T
 
A
M
 
F
A
 
G
K
 
E
E
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
A
D
 
N
G
 
K
D
 
E
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
H
C
 
Q
A
 
I
M
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
W
R
 
E
L
 
S
K
 
R
G
 
T
E
 
E
L
 
V
G
 
A
R
 
A
T
 
M
A
 
M
G
 
G
Q
x
K
L
 
I
R
 
P
L
 
I
F
 
S
A
 
V
S
 
K
V
 
A
L
 
Y
R
 
N
E
 
E
P
 
R
Y
 
T
S
 
G
P
 
H
L
 
T
L
 
E
M
 
S
D
 
D
K
 
V
A
 
A
N
 
G
P
 
G
D
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
H
L
 
A
K
 
V
L
 
L
G
 
R
Q
 
H
L
 
R
P
 
P
L
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
G
A
x
H
F
x
L
S
 
P
T
 
N
A
 
-
G
 
-
G
|
G
D
x
H
T
 
I
A
 
V
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
F
K
|
K
G
 
P
H
 
S
P
 
E
S
 
L
H
 
T
P
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
L
M
 
W
A
 
E
R
 
K
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
L
P
 
P
K
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
G
E
 
S
P
 
D
A
 
T
L
 
-
S
 
G
V
 
K
A
 
C
L
 
L
V
 
A
E
 
R
H
 
H
P
 
S
L
 
L
V
 
I
K
 
D
A
 
G
V
 
L
G
 
F
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
S
K
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
H
D
 
E
R
 
Q
C
 
F
A
 
G
L
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
-
F
 
L
Y
 
A
G
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
G
S
 
G
V
 
N
N
 
N
P
 
P
Q
 
-
L
 
L
L
 
I
L
 
V
P
 
Q
G
 
N
K
 
V
L
 
S
A
 
D
R
 
L
D
 
D
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
H
A
 
H
E
 
A
A
 
L
Q
 
Q
V
 
-
N
 
-
S
 
S
M
 
A
M
 
F
M
 
L
G
 
S
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T
S
 
C
P
 
A
G
 
R
L
 
R
V
 
L
I
 
L
A
 
V
I
 
P
K
 
K
G
 
G
P
 
K
G
 
K
L
 
G
E
 
D
S
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
S
 
V
D
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
R
Q
 
I
N
 
T
A
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2d4eC Crystal structure of the hpcc from thermus thermophilus hb8
30% identity, 57% coverage: 9:304/515 of query aligns to 29:307/515 of 2d4eC

query
sites
2d4eC
H
 
H
F
 
F
I
 
I
A
 
A
H
 
G
E
 
E
W
 
F
H
 
V
Q
 
P
S
 
S
E
 
E
A
 
S
-
 
G
-
 
E
S
 
T
F
 
F
T
 
P
R
 
S
F
 
L
N
 
D
P
 
P
S
 
A
T
 
T
N
 
N
S
 
E
V
 
V
L
 
L
P
 
-
G
 
G
A
 
V
F
 
A
S
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
G
V
 
E
V
 
R
E
 
E
V
 
V
E
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
E
A
 
A
F
 
F
W
 
Q
E
 
R
F
 
W
Q
 
S
Q
 
R
T
 
T
S
 
K
A
 
A
D
 
K
Q
 
E
K
 
R
A
 
K
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
E
 
L
T
 
R
M
 
I
A
 
A
K
 
E
E
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
K
D
 
H
G
 
A
D
 
D
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
V
C
 
M
A
 
E
M
 
C
L
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
E
 
L
A
 
R
R
 
I
L
 
V
K
 
R
G
 
A
E
 
Q
L
 
V
G
 
A
R
 
R
T
 
A
A
 
A
G
 
E
Q
 
N
L
 
F
R
 
A
L
 
F
F
 
Y
A
 
A
S
 
E
V
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
Y
S
 
A
P
 
E
L
 
H
L
 
A
M
 
M
-
 
E
D
 
D
K
 
R
A
 
T
N
 
F
P
 
P
-
 
V
D
 
D
R
 
R
Q
 
D
P
 
W
L
 
L
P
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
Y
K
 
Y
L
 
T
G
 
V
Q
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
V
 
P
V
 
V
A
 
G
V
 
I
F
x
I
G
x
T
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
L
S
 
S
T
 
T
A
 
-
G
 
-
G
 
W
D
 
R
T
 
I
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
G
 
G
C
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
L
K
|
K
G
 
P
H
x
A
P
 
E
S
 
W
H
 
S
P
 
P
G
 
F
T
 
T
S
 
A
E
 
T
L
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
I
M
 
L
A
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
D
M
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
F
E
x
G
P
 
E
A
 
E
L
 
A
S
x
G
V
x
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
K
 
P
A
 
L
V
 
L
G
 
T
F
 
L
T
|
T
G
|
G
S
x
E
L
 
T
K
 
E
V
x
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
L
 
V
A
 
M
D
 
R
R
 
N
C
 
A
A
 
A
-
 
D
-
 
H
-
 
L
L
 
K
R
 
R
P
 
L
E
 
S
P
 
P
I
 
-
P
 
-
F
 
-
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
F
P
 
A
G
 
D
K
 
A
L
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
L
A
 
E
V
 
R
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
Q
 
V
V
 
V
N
 
F
S
 
Q
M
 
I
M
 
F
M
 
S
G
 
F
H
 
N
G
 
G
Q
 
E
F
 
R
C
|
C
T
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

3jz4A Crystal structure of e. Coli NADP dependent enzyme (see paper)
29% identity, 54% coverage: 26:303/515 of query aligns to 31:289/481 of 3jz4A

query
sites
3jz4A
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
N
N
 
G
S
 
D
V
 
K
L
 
L
P
 
-
G
 
G
A
 
S
F
 
V
S
 
P
Q
 
K
G
 
M
T
 
G
V
 
A
V
 
D
E
 
E
V
 
T
E
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
I
I
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
N
A
 
R
A
 
A
F
 
L
W
 
P
E
 
A
F
 
W
Q
 
R
Q
 
A
T
 
L
S
 
T
A
 
A
D
 
K
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
T
L
 
I
L
 
L
E
 
R
T
 
N
M
 
W
A
 
F
K
 
N
E
 
L
I
 
M
E
 
M
Q
 
E
D
 
H
G
 
Q
D
 
D
A
 
D
I
 
L
V
 
A
A
 
R
C
 
L
A
 
M
M
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
S
R
 
Y
T
 
A
A
 
A
G
 
S
Q
 
F
L
 
I
R
 
E
L
 
W
F
 
F
A
 
A
S
 
E
V
 
E
L
 
G
R
 
K
E
 
R
P
 
I
Y
 
Y
S
 
G
P
 
D
L
 
T
L
 
I
M
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
P
D
 
G
R
 
H
Q
 
Q
P
 
A
L
 
-
P
 
-
K
 
D
P
 
K
E
 
R
L
 
L
K
 
I
L
 
V
G
 
I
Q
 
K
L
 
Q
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
T
A
 
A
V
 
A
F
 
I
G
 
T
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
A
A
 
A
F
 
M
S
 
I
T
 
T
A
 
R
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
A
A
 
G
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
T
V
 
M
I
 
V
V
 
L
K
|
K
G
 
P
H
x
A
P
x
S
S
 
Q
H
 
T
P
 
P
G
 
F
T
 
S
S
 
A
E
 
L
L
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
L
M
 
A
A
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
I
 
V
Q
 
T
G
 
G
S
 
S
E
x
A
P
 
G
A
 
A
L
 
V
S
x
G
V
 
N
A
 
E
L
 
L
V
 
T
E
 
S
H
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
V
K
 
R
A
 
K
V
 
L
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
E
V
x
I
G
 
G
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
M
D
 
E
R
 
Q
C
 
C
A
 
A
L
 
K
R
 
D
P
 
I
E
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
N
N
 
A
P
 
P
Q
 
F
L
 
I
L
 
V
L
 
F
P
 
D
G
 
-
K
 
D
L
 
A
A
 
D
R
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
G
Q
 
A
V
 
L
N
 
A
S
 
S
M
 
K
M
 
F
M
 
R
G
 
N
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
T
C
|
C
T
 
V

Sites not aligning to the query:

P25526 Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] GabD; SSDH; Glutarate-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.79; EC 1.2.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 54% coverage: 26:303/515 of query aligns to 32:290/482 of P25526

query
sites
P25526
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
N
N
 
G
S
 
D
V
 
K
L
 
L
P
 
-
G
 
G
A
 
S
F
 
V
S
 
P
Q
 
K
G
 
M
T
 
G
V
 
A
V
 
D
E
 
E
V
 
T
E
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
I
I
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
N
A
 
R
A
 
A
F
 
L
W
 
P
E
 
A
F
 
W
Q
 
R
Q
 
A
T
 
L
S
 
T
A
 
A
D
 
K
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
T
L
 
I
L
 
L
E
 
R
T
 
N
M
 
W
A
 
F
K
 
N
E
 
L
I
 
M
E
 
M
Q
 
E
D
 
H
G
 
Q
D
 
D
A
 
D
I
 
L
V
 
A
A
 
R
C
 
L
A
 
M
M
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
S
R
 
Y
T
 
A
A
 
A
G
 
S
Q
 
F
L
 
I
R
 
E
L
 
W
F
 
F
A
 
A
S
 
E
V
 
E
L
 
G
R
 
K
E
 
R
P
 
I
Y
 
Y
S
 
G
P
 
D
L
 
T
L
 
I
M
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
P
D
 
G
R
 
H
Q
 
Q
P
 
A
L
 
-
P
 
-
K
 
D
P
 
K
E
 
R
L
 
L
K
 
I
L
 
V
G
 
I
Q
 
K
L
 
Q
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
T
A
 
A
V
 
A
F
 
I
G
 
T
A
 
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
A
A
 
A
F
 
M
S
 
I
T
 
T
A
 
R
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
A
A
 
G
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
T
V
 
M
I
 
V
V
 
L
K
|
K
G
x
P
H
x
A
P
x
S
S
 
Q
H
 
T
P
 
P
G
 
F
T
 
S
S
 
A
E
 
L
L
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
L
M
 
A
A
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
I
 
V
Q
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
P
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
G
V
 
N
A
 
E
L
 
L
V
 
T
E
 
S
H
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
V
K
 
R
A
 
K
V
 
L
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
E
V
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
M
D
 
E
R
 
Q
C
 
C
A
 
A
L
 
K
R
 
D
P
 
I
E
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
 
E
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
N
N
 
A
P
 
P
Q
 
F
L
 
I
L
 
V
L
 
F
P
 
D
G
 
-
K
 
D
L
 
A
A
 
D
R
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
G
Q
 
A
V
 
L
N
 
A
S
 
S
M
 
K
M
 
F
M
 
R
G
 
N
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
T
C
 
C
T
 
V

Sites not aligning to the query:

4go2A Crystal structure of thE C-terminal domain of 10'formyltetrahydrofolate dehydrogenase in complex with thio-NADP (see paper)
28% identity, 58% coverage: 10:306/515 of query aligns to 21:307/498 of 4go2A

query
sites
4go2A
F
 
F
I
 
I
A
 
G
H
 
G
E
 
E
W
 
F
H
 
V
Q
 
D
S
 
A
E
 
E
A
 
G
S
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
Y
T
 
N
R
 
T
F
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
T
T
 
D
N
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
P
 
C
G
 
-
A
 
Q
F
 
V
S
 
S
Q
 
L
G
 
A
T
 
Q
V
 
V
V
 
S
E
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
K
A
 
A
A
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
F
W
 
E
E
 
N
-
 
G
-
 
L
F
 
W
Q
 
G
Q
 
K
T
 
I
S
 
N
A
 
A
D
 
R
Q
 
D
K
 
R
A
 
G
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
Y
T
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
V
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
D
 
H
G
 
Q
D
 
E
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
T
C
 
I
A
 
E
M
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
G
-
 
A
L
 
V
P
 
Y
E
 
T
A
 
L
R
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
T
E
 
H
L
 
V
G
 
G
R
 
M
T
 
S
A
 
I
G
 
Q
Q
 
T
L
 
F
R
 
R
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
G
V
 
W
L
 
C
R
 
D
E
 
K
P
 
I
Y
 
Q
S
 
G
P
 
A
L
 
T
L
 
I
-
 
P
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
A
 
A
N
 
R
P
 
P
D
 
N
R
 
R
Q
 
N
-
 
L
P
 
T
L
 
L
P
 
T
K
 
K
P
 
K
E
 
E
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
C
A
 
G
V
 
I
F
x
V
G
x
I
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
M
S
 
L
T
 
S
A
 
W
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
T
A
 
A
S
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
G
 
P
H
x
A
P
x
Q
S
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
K
V
 
F
A
 
A
R
 
E
A
 
L
M
 
T
A
 
L
R
 
K
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
I
P
 
P
K
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
I
I
 
L
Q
 
P
G
 
G
S
|
S
E
x
G
P
 
S
A
 
L
L
 
V
S
x
G
V
x
Q
A
 
R
L
 
L
V
 
S
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
D
V
 
V
K
 
R
A
 
K
V
 
I
G
 
G
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
E
V
|
V
G
 
G
R
 
K
L
 
H
L
x
I
A
 
M
D
 
K
R
 
S
C
 
C
A
 
A
L
 
L
-
 
S
R
 
N
P
 
V
E
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
 
L
G
|
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
-
L
 
L
L
 
I
L
 
I
P
 
F
G
 
A
K
 
D
L
 
C
A
 
D
R
 
L
D
 
N
A
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
A
 
M
Q
 
G
V
 
M
N
 
S
S
 
S
M
 
V
M
 
F
M
 
F
G
 
N
H
 
K
G
 
G
Q
 
E
F
 
N
C
|
C
T
 
I
S
 
A
P
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2o2rA Crystal structure of thE C-terminal domain of rat 10'formyltetrahydrofolate dehydrogenase in complex with NADPH (see paper)
28% identity, 58% coverage: 10:306/515 of query aligns to 21:307/498 of 2o2rA

query
sites
2o2rA
F
 
F
I
 
I
A
 
G
H
 
G
E
 
E
W
 
F
H
 
V
Q
 
D
S
 
A
E
 
E
A
 
G
S
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
Y
T
 
N
R
 
T
F
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
T
T
 
D
N
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
P
 
C
G
 
-
A
 
Q
F
 
V
S
 
S
Q
 
L
G
 
A
T
 
Q
V
 
V
V
 
S
E
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
K
A
 
A
A
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
F
W
 
E
E
 
N
-
 
G
-
 
L
F
 
W
Q
 
G
Q
 
K
T
 
I
S
 
N
A
 
A
D
 
R
Q
 
D
K
 
R
A
 
G
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
Y
T
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
V
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
D
 
H
G
 
Q
D
 
E
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
T
C
 
I
A
 
E
M
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
G
-
 
A
L
 
V
P
 
Y
E
 
T
A
 
L
R
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
T
E
 
H
L
 
V
G
 
G
R
 
M
T
 
S
A
 
I
G
 
Q
Q
 
T
L
 
F
R
 
R
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
G
V
 
W
L
 
C
R
 
D
E
 
K
P
 
I
Y
 
Q
S
 
G
P
 
A
L
 
T
L
 
I
-
 
P
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
A
 
A
N
 
R
P
 
P
D
 
N
R
 
R
Q
 
N
-
 
L
P
 
T
L
 
L
P
 
T
K
 
K
P
 
K
E
 
E
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
C
A
 
G
V
 
I
F
x
V
G
x
I
A
 
P
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
M
S
 
L
T
 
S
A
 
W
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
T
A
 
A
S
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
G
 
P
H
x
A
P
x
Q
S
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
K
V
 
F
A
 
A
R
 
E
A
 
L
M
 
T
A
 
L
R
 
K
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
I
P
 
P
K
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
I
I
 
L
Q
 
P
G
 
G
S
|
S
E
x
G
P
 
S
A
 
L
L
 
V
S
x
G
V
x
Q
A
 
R
L
 
L
V
 
S
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
D
V
 
V
K
 
R
A
 
K
V
 
I
G
 
G
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
T
K
 
E
V
|
V
G
 
G
R
 
K
L
 
H
L
x
I
A
 
M
D
 
K
R
 
S
C
 
C
A
 
A
L
 
L
-
 
S
R
 
N
P
 
V
E
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
-
L
 
L
L
 
I
L
 
I
P
 
F
G
 
A
K
 
D
L
 
C
A
 
D
R
 
L
D
 
N
A
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
A
 
M
Q
 
G
V
 
M
N
 
S
S
 
S
M
 
V
M
 
F
M
 
F
G
 
N
H
 
K
G
 
G
Q
 
E
F
 
N
C
|
C
T
 
I
S
 
A
P
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7rluA Structure of aldh1l1 (10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase) in complex with NADP (see paper)
28% identity, 58% coverage: 10:306/515 of query aligns to 106:392/583 of 7rluA

query
sites
7rluA
F
 
F
I
 
I
A
 
G
H
 
G
E
 
E
W
 
F
H
 
V
Q
 
D
S
 
A
E
 
E
A
 
G
S
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
Y
T
 
N
R
 
T
F
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
T
T
 
D
N
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
P
 
C
G
 
-
A
 
Q
F
 
V
S
 
S
Q
 
L
G
 
A
T
 
Q
V
 
V
V
 
S
E
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
K
A
 
A
A
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
F
W
 
E
E
 
N
-
 
G
-
 
L
F
 
W
Q
 
G
Q
 
K
T
 
I
S
 
N
A
 
A
D
 
R
Q
 
D
K
 
R
A
 
G
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
Y
T
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
V
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
D
 
H
G
 
Q
D
 
E
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
T
C
 
I
A
 
E
M
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
G
-
 
A
L
 
V
P
 
Y
E
 
T
A
 
L
R
 
A
L
 
L
K
|
K
G
 
T
E
 
H
L
 
V
G
 
G
R
 
M
T
 
S
A
 
I
G
 
Q
Q
 
T
L
 
F
R
 
R
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
G
V
 
W
L
 
C
R
 
D
E
 
K
P
 
I
Y
 
Q
S
 
G
P
 
A
L
 
T
L
 
I
-
 
P
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
A
 
A
N
 
R
P
 
P
D
 
N
R
 
R
Q
 
N
-
 
L
P
 
T
L
 
L
P
 
T
K
 
K
P
 
K
E
 
E
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
C
A
 
G
V
 
I
F
 
V
G
 
I
A
 
P
S
 
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
M
S
 
L
T
 
S
A
 
-
G
 
-
G
 
W
D
 
K
T
 
T
A
 
A
S
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
G
 
P
H
 
A
P
 
Q
S
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
K
V
 
F
A
 
A
R
 
E
A
 
L
M
 
T
A
 
L
R
 
K
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
I
P
 
P
K
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
I
I
 
L
Q
 
P
G
 
G
S
|
S
E
x
G
P
 
S
A
 
L
L
 
V
S
x
G
V
 
Q
A
 
R
L
 
L
V
 
S
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
D
V
 
V
K
 
R
A
 
K
V
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
E
V
|
V
G
 
G
R
 
K
L
 
H
L
 
I
A
 
M
D
 
K
R
 
S
C
 
C
A
 
A
L
 
L
-
 
S
R
 
N
P
 
V
E
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
-
L
 
L
L
 
I
L
 
I
P
 
F
G
 
A
K
 
D
L
 
C
A
 
D
R
 
L
D
 
N
A
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
A
 
M
Q
 
G
V
 
M
N
 
S
S
 
S
M
 
V
M
 
F
M
x
F
G
 
N
H
 
K
G
 
G
Q
 
E
F
x
N
C
|
C
T
 
I
S
 
A
P
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P28037 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase; 10-FTHFDH; FDH; Aldehyde dehydrogenase family 1 member L1; FBP-CI; EC 1.5.1.6 from Rattus norvegicus (Rat) (see 5 papers)
28% identity, 58% coverage: 10:306/515 of query aligns to 425:711/902 of P28037

query
sites
P28037
F
 
F
I
 
I
A
 
G
H
 
G
E
 
E
W
 
F
H
 
V
Q
 
D
S
 
A
E
 
E
A
 
G
S
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
Y
T
 
N
R
 
T
F
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
T
T
 
D
N
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
I
P
 
C
G
 
-
A
 
Q
F
 
V
S
 
S
Q
 
L
G
 
A
T
 
Q
V
 
V
V
 
S
E
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
K
A
 
A
A
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
F
W
 
E
E
 
N
-
 
G
-
 
L
F
 
W
Q
 
G
Q
 
K
T
 
I
S
 
N
A
 
A
D
 
R
Q
 
D
K
 
R
A
 
G
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
Y
T
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
V
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
D
 
H
G
 
Q
D
 
E
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
T
C
 
I
A
 
E
M
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
G
-
 
A
L
 
V
P
 
Y
E
 
T
A
 
L
R
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
T
E
 
H
L
 
V
G
 
G
R
 
M
T
 
S
A
 
I
G
 
Q
Q
 
T
L
 
F
R
 
R
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
G
V
 
W
L
 
C
R
 
D
E
 
K
P
 
I
Y
 
Q
S
 
G
P
 
A
L
 
T
L
 
I
-
 
P
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
A
 
A
N
 
R
P
 
P
D
 
N
R
 
R
Q
 
N
-
 
L
P
 
T
L
 
L
P
 
T
K
 
K
P
 
K
E
 
E
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
C
A
 
G
V
 
I
F
 
V
G
x
I
A
x
P
S
x
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
M
S
 
L
T
 
S
A
 
W
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
T
A
 
A
S
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
G
x
P
H
x
A
P
x
Q
S
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
T
S
 
A
E
 
L
L
 
K
V
 
F
A
 
A
R
 
E
A
 
L
M
 
T
A
 
L
R
 
K
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
I
P
 
P
K
 
K
G
 
G
L
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
I
I
 
L
Q
 
P
G
 
G
S
 
S
E
x
G
P
x
S
A
x
L
L
x
V
S
x
G
V
x
Q
A
 
R
L
 
L
V
 
S
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
D
V
 
V
K
 
R
A
 
K
V
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
K
L
 
H
L
 
I
A
 
M
D
 
K
R
 
S
C
 
C
A
 
A
L
 
L
-
 
S
R
 
N
P
 
V
E
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
-
L
 
L
L
 
I
L
 
I
P
 
F
G
 
A
K
 
D
L
 
C
A
 
D
R
 
L
D
 
N
A
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
A
 
M
Q
 
G
V
 
M
N
 
S
S
 
S
M
 
V
M
 
F
M
 
F
G
 
N
H
 
K
G
 
G
Q
 
E
F
 
N
C
|
C
T
 
I
S
 
A
P
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4u3wA X-ray crystal structure of 2-aminomuconate 6-semialdehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
25% identity, 81% coverage: 8:423/515 of query aligns to 5:420/485 of 4u3wA

query
sites
4u3wA
R
 
R
H
 
H
F
 
Y
I
 
I
A
 
N
H
 
G
E
 
E
W
 
F
H
 
V
Q
 
A
S
 
S
E
 
G
A
 
T
S
 
T
F
 
F
T
 
P
R
 
N
F
 
L
N
 
S
P
 
P
S
 
V
T
 
D
N
 
G
S
 
R
V
 
K
L
 
L
P
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
G
 
A
T
 
D
V
 
V
V
 
C
E
 
E
V
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
L
I
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
H
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
K
A
 
A
F
 
G
W
 
W
E
 
-
F
 
-
Q
 
R
Q
 
D
T
 
T
S
 
T
A
 
P
D
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
K
 
A
L
 
W
L
 
L
E
 
H
T
 
K
M
 
I
A
 
A
K
 
D
E
 
G
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
D
 
R
G
 
F
D
 
D
A
 
E
I
 
F
V
 
V
A
 
A
C
 
A
A
 
E
M
 
V
L
 
A
E
 
D
S
 
T
G
 
G
L
 
R
P
 
P
E
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
A
K
 
R
G
 
T
-
 
L
E
 
D
L
 
I
G
 
A
R
 
R
T
 
G
A
 
I
G
 
A
Q
 
N
L
 
F
R
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
A
S
 
D
V
 
L
L
 
V
R
 
R
E
 
T
P
 
A
Y
 
S
S
 
G
P
 
E
L
 
Y
L
 
F
M
 
E
D
 
T
K
 
H
A
 
A
N
 
A
P
 
D
D
 
G
R
 
S
Q
 
E
P
 
L
L
 
I
P
 
N
K
 
Y
P
 
V
E
 
T
L
 
R
K
 
K
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
I
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
L
S
 
F
T
 
T
A
 
-
G
 
-
G
 
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
G
 
G
C
 
N
A
 
C
V
 
V
I
 
V
V
 
A
K
|
K
G
 
P
H
 
S
P
 
E
S
 
E
H
 
T
P
 
P
G
 
S
T
 
S
S
 
A
E
 
T
L
 
L
V
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
V
M
 
M
A
 
H
R
 
D
A
 
-
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
V
G
 
G
M
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
L
I
 
I
Q
 
H
G
 
G
-
 
H
S
 
G
E
 
Q
P
 
N
A
 
A
L
 
A
S
 
G
V
 
E
A
 
F
L
 
L
V
 
T
E
 
R
H
 
H
P
 
P
L
 
D
V
 
I
K
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
S
K
 
R
V
 
T
G
 
G
R
 
S
L
 
T
L
 
I
A
 
M
D
 
K
R
 
A
C
 
V
A
 
A
L
 
D
R
 
G
P
 
V
E
 
K
P
 
E
I
 
V
P
 
S
F
 
F
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
N
P
 
A
Q
 
A
L
 
V
L
 
V
L
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
F
L
 
A
A
 
D
R
 
A
D
 
D
A
 
F
A
 
D
V
 
A
L
 
A
A
 
V
E
 
A
A
 
G
Q
 
V
V
 
L
N
 
R
S
 
S
M
 
S
M
 
F
M
 
T
G
 
N
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
L
S
 
C
P
 
S
G
 
E
L
 
R
V
 
V
I
 
Y
A
 
-
I
 
V
K
 
E
G
 
R
P
 
P
G
 
I
L
 
F
E
 
E
S
 
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
K
D
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
R
I
 
V
A
 
G
S
 
A
R
 
P
Q
 
E
N
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
T
M
 
T
L
 
M
S
 
G
A
 
P
G
 
L
I
 
I
C
 
S
Q
 
R
A
 
G
F
 
H
N
 
R
Q
 
D
D
 
K
V
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
F
S
 
R
I
 
L
L
 
A
V
 
V
P
 
E
R
 
E
V
 
G
N
 
A
V
 
T
I
 
V
A
 
V
Q
 
T
G
 
G
Q
 
G
A
 
G
A
 
A
E
 
P
A
 
S
A
 
F
H
 
G
H
 
D
S
 
A
R
 
R
P
 
D
L
 
D
I
 
G
A
 
A
S
 
F
I
 
V
E
 
M
A
 
P
S
 
T
A
 
I
L
 
W
F
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
R
-
 
C
L
 
V
L
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
V
A
 
C
L
 
H
V
 
I
A
 
A
I
 
P
C
 
F
D
 
D
S
 
D
K
 
E
E
 
A
E
 
E
M
 
V
F
 
V
E
 
K
L
 
R
V
 
V
K
 
N
R
 
D
L
 
S
P
 
A
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
G
 
A
S
 
S
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q8NMB0 Vanillin dehydrogenase; Aromatic aldehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.67; EC 1.2.1.64; EC 1.2.1.96 from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) (see paper)
28% identity, 63% coverage: 1:326/515 of query aligns to 1:319/484 of Q8NMB0

query
sites
Q8NMB0
M
 
M
T
 
T
T
 
A
D
 
T
L
 
F
C
 
A
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
T
R
 
K
H
 
H
F
 
L
I
 
I
A
 
G
H
 
G
E
 
Q
W
 
W
H
 
V
Q
 
E
-
 
G
-
 
N
S
 
S
E
 
D
A
 
R
S
 
I
F
 
S
T
 
T
R
 
N
F
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
Y
T
 
D
N
 
D
S
 
S
V
 
V
L
 
I
P
 
A
G
 
E
A
 
S
F
 
-
S
 
K
Q
 
Q
G
 
A
T
 
S
V
 
I
V
 
A
E
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
Y
I
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
K
A
 
K
A
 
A
F
 
Q
W
 
A
E
 
E
F
 
W
Q
 
A
Q
 
A
T
 
T
S
 
P
A
 
A
D
 
A
Q
 
E
K
 
R
A
 
S
K
 
A
L
 
I
L
 
I
E
 
Y
T
 
R
M
 
A
A
 
A
K
 
E
E
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
H
G
 
R
D
 
E
A
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
E
C
 
W
A
 
L
M
 
I
L
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
-
P
 
-
E
 
S
A
 
T
R
 
R
L
 
S
K
 
K
G
 
A
E
 
N
L
 
L
G
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
E
L
 
I
R
 
T
L
 
L
F
 
A
A
 
G
S
 
N
V
 
I
L
 
T
R
 
K
E
 
E
P
 
S
Y
 
A
S
 
S
-
 
F
-
 
P
P
 
G
L
 
R
L
 
V
M
 
H
D
 
G
K
 
R
A
 
I
N
 
S
P
 
P
D
 
S
R
 
N
Q
 
T
P
 
P
L
 
-
P
 
-
K
 
G
P
 
K
E
 
E
L
 
N
K
 
R
L
 
V
G
 
Y
Q
 
R
L
 
V
P
 
A
L
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
N
F
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
R
G
 
-
G
 
-
D
 
S
T
 
V
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
C
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
G
 
P
H
 
A
P
 
S
S
 
D
H
 
T
P
 
P
G
 
V
T
 
T
S
 
G
E
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
P
R
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
A
R
 
R
A
 
I
I
 
F
D
 
E
L
x
E
T
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
I
S
 
S
L
 
T
I
 
V
Q
 
A
G
 
G
S
 
A
E
 
G
P
 
S
A
 
E
L
 
I
S
 
G
V
 
D
A
 
H
L
 
F
V
 
V
E
 
T
H
 
H
P
 
A
L
 
V
V
 
P
K
 
K
A
 
L
V
 
I
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
T
K
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
R
L
 
V
A
 
G
D
 
E
R
 
-
C
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
N
P
 
G
E
 
G
P
 
P
I
 
M
P
 
K
F
 
T
Y
 
V
G
 
A
-
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
N
N
 
A
P
 
P
Q
 
F
L
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
A
A
 
D
R
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
D
V
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
Q
 
A
V
 
A
N
 
V
S
 
G
M
 
A
M
 
F
M
 
L
G
 
H
H
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
|
C
T
 
M
S
 
S
P
 
I
G
 
N
L
 
R
V
 
V
I
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
A
A
 
A
I
 
V
K
 
H
G
 
D
P
 
E
G
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
K
Y
 
F
L
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
V
S
 
K
D
 
N
I
 
I

P17202 Aminoaldehyde dehydrogenase BADH; 4-trimethylammoniobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Aminobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Betaine aldehyde dehydrogenase; SoBADH; EC 1.2.1.-; EC 1.2.1.47; EC 1.2.1.19; EC 1.2.1.8 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 3 papers)
26% identity, 57% coverage: 10:304/515 of query aligns to 11:293/497 of P17202

query
sites
P17202
F
 
F
I
 
I
A
 
D
H
 
G
E
 
E
W
 
W
H
 
R
Q
 
E
-
 
P
-
 
I
S
 
K
E
 
K
A
 
N
S
 
R
F
 
I
T
 
P
R
 
V
F
x
I
N
 
N
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
E
S
 
E
V
 
I
L
 
I
P
 
-
G
 
G
A
 
D
F
 
I
S
 
P
Q
 
A
G
 
A
T
 
T
V
 
A
V
 
E
E
 
D
V
 
V
E
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
R
A
 
R
A
 
A
F
 
F
W
 
R
-
 
R
-
 
N
E
 
N
F
 
W
Q
 
S
Q
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
G
D
 
A
Q
 
H
K
 
R
A
 
A
K
 
T
L
 
Y
L
 
L
E
 
R
T
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
A
E
 
K
I
 
I
E
 
T
Q
 
E
D
 
K
G
 
K
D
 
D
A
 
H
I
 
F
V
 
V
A
 
K
C
 
L
A
 
E
M
 
T
L
 
I
E
x
D
S
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
F
A
 
D
R
 
E
L
 
A
K
 
V
G
 
L
E
 
D
L
 
I
G
 
D
R
 
D
T
 
V
A
 
A
G
 
S
Q
 
C
L
 
F
R
 
E
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
G
V
 
Q
L
 
A
R
 
E
E
 
A
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
D
M
 
G
D
 
K
K
 
Q
A
 
K
N
 
A
P
 
P
D
 
V
R
 
T
Q
 
L
P
 
P
L
 
M
P
 
E
K
 
R
P
 
F
E
 
K
L
 
S
K
 
H
L
 
V
G
 
L
Q
 
R
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
x
S
A
x
P
S
x
W
N
 
N
F
x
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
M
S
 
A
T
 
T
A
 
-
G
 
-
G
x
W
D
 
K
T
 
I
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
T
V
 
A
I
 
V
V
 
L
K
|
K
G
 
-
H
 
-
P
|
P
S
|
S
H
x
E
P
 
-
G
 
-
T
x
L
S
 
A
E
 
S
L
 
V
V
 
T
A
 
C
R
 
L
A
 
E
M
 
F
A
 
G
R
 
E
A
 
V
I
 
C
D
 
N
L
 
E
T
 
V
G
 
G
M
 
L
P
 
P
K
 
P
G
 
G
L
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
I
I
 
L
Q
 
T
G
 
G
S
 
L
E
 
G
P
 
P
A
 
D
L
 
A
S
 
G
V
 
A
A
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
D
V
 
V
K
 
D
A
 
K
V
 
I
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
x
S
K
x
A
V
x
T
G
 
G
R
 
S
L
 
K
L
 
V
A
 
M
D
 
A
R
 
S
C
 
A
A
 
A
L
 
Q
R
 
L
P
x
V
E
 
K
P
 
P
I
 
V
P
 
T
F
 
L
Y
 
-
G
 
-
E
 
E
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
I
L
 
V
L
 
V
L
 
F
P
 
E
G
 
D
K
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
V
D
 
D
A
 
I
A
 
D
V
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
W
Q
 
T
V
 
I
N
 
F
S
 
G
M
 
C
M
 
F
M
x
W
G
 
T
H
 
N
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
 
C
T
 
S
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4pz2B Structure of zm aldh2-6 (rf2f) in complex with NAD (see paper)
28% identity, 55% coverage: 21:304/515 of query aligns to 27:294/494 of 4pz2B

query
sites
4pz2B
S
 
T
F
 
F
T
 
D
R
 
T
F
 
R
N
 
D
P
 
P
S
 
R
T
 
T
N
 
G
S
 
G
V
 
V
L
 
I
P
 
-
G
 
A
A
 
S
F
 
V
S
 
A
Q
 
E
G
 
A
T
 
D
V
 
K
V
 
E
E
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
L
A
 
A
A
 
V
I
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
F
-
 
D
-
 
H
W
 
G
E
 
E
F
 
W
Q
 
P
Q
 
R
T
 
M
S
 
S
A
 
G
D
 
S
Q
 
E
K
 
R
A
 
G
K
 
R
L
 
I
L
 
M
E
 
A
T
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
L
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
D
 
H
G
 
A
D
 
G
A
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
A
C
 
L
A
 
E
M
 
S
L
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
G
L
 
K
P
 
H
E
 
P
A
 
A
R
 
V
L
 
T
K
 
R
G
 
A
-
 
V
E
 
D
L
 
V
G
 
G
R
 
N
T
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
G
V
 
A
L
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
I
N
 
H
P
 
G
D
 
E
R
 
T
Q
 
L
P
 
K
L
 
M
P
 
P
K
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
Q
 
Q
L
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
H
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
A
A
 
G
V
 
V
F
x
I
G
x
I
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
S
A
 
T
F
x
M
S
 
F
T
 
A
A
 
V
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
V
K
|
K
G
 
P
H
x
A
P
x
E
S
 
Q
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
S
A
 
A
R
 
L
A
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
L
I
 
A
D
 
K
L
 
Q
T
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
P
K
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
V
I
 
V
Q
 
P
G
 
G
S
 
F
E
x
G
P
 
P
A
 
T
L
 
A
S
x
G
V
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
S
H
 
H
P
 
M
L
 
D
V
 
V
K
 
D
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
E
V
|
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
M
D
 
-
R
 
K
C
 
A
A
 
S
L
 
A
R
 
E
P
 
S
E
 
N
P
 
L
I
 
K
P
 
P
F
 
V
Y
 
Y
G
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
L
L
 
I
L
 
V
L
 
F
P
 
D
G
 
D
K
 
A
L
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
L
A
 
D
V
 
M
L
 
A
A
 
V
E
 
E
A
 
L
Q
 
A
V
 
V
N
 
G
S
 
A
M
 
S
M
 
F
M
 
F
G
 
N
H
 
K
G
 
G
Q
 
E
F
 
A
C
|
C
T
 
V
S
 
A

Sites not aligning to the query:

P51649 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial; Aldehyde dehydrogenase family 5 member A1; NAD(+)-dependent succinic semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.24 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
28% identity, 59% coverage: 10:313/515 of query aligns to 64:351/535 of P51649

query
sites
P51649
F
 
F
I
 
V
A
 
G
H
 
G
E
 
R
W
 
W
H
 
L
Q
 
P
S
 
A
E
 
A
A
 
A
S
 
T
F
 
F
T
 
P
R
 
V
F
 
Q
N
 
D
P
 
P
S
 
A
T
 
S
N
 
G
S
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
-
G
 
G
A
 
M
F
 
V
S
 
A
Q
 
D
G
x
C
T
 
G
V
 
V
V
 
R
E
 
E
V
 
A
E
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
Y
A
 
E
A
 
A
F
 
F
W
 
C
E
 
R
F
 
W
Q
 
R
Q
 
E
T
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
K
Q
 
E
K
 
R
A
 
S
K
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
R
T
 
K
M
 
W
A
 
Y
K
 
N
E
 
L
I
 
M
E
 
I
Q
 
Q
D
 
N
G
 
K
D
 
D
A
 
D
I
 
L
V
 
A
A
 
R
C
 
I
A
 
I
M
 
T
L
 
A
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
K
R
 
E
L
 
A
K
 
H
G
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
L
R
 
Y
T
 
S
A
 
A
G
 
F
Q
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
W
F
 
F
A
 
S
S
 
E
V
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
R
P
 
V
Y
 
Y
S
x
G
P
 
D
L
 
I
L
 
I
M
x
H
D
 
T
K
x
P
A
 
A
N
 
K
P
 
-
D
 
D
R
 
R
Q
 
R
P
 
A
L
 
L
P
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
V
G
 
L
Q
 
K
L
 
Q
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
T
A
 
P
S
 
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
L
 
S
A
 
A
F
 
M
S
 
I
T
 
T
A
x
R
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
V
A
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
|
C
A
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
G
x
P
H
x
A
P
x
E
S
 
D
H
x
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
F
V
 
S
A
|
A
R
 
L
A
 
A
M
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
L
I
 
A
D
 
S
L
 
Q
T
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
K
 
S
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
S
x
N
L
 
V
I
 
I
Q
 
P
G
 
C
S
 
S
E
 
R
-
 
K
-
 
N
-
 
A
P
 
K
A
 
E
L
 
V
S
x
G
V
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
C
E
 
T
H
 
D
P
 
P
L
 
L
V
 
V
K
 
S
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
x
T
K
x
T
V
x
T
G
|
G
R
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
L
D
 
H
R
 
H
C
 
A
A
 
A
L
 
N
R
 
S
P
 
V
E
 
K
P
 
R
I
 
V
P
 
S
F
 
M
Y
 
-
G
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
L
N
 
A
P
 
P
Q
 
F
L
 
I
L
 
V
L
 
F
P
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
S
A
 
A
V
 
N
L
 
V
A
 
D
E
 
Q
A
 
A
Q
 
V
V
 
A
N
 
G
S
 
A
M
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
K
M
 
F
M
x
R
G
x
N
H
 
T
G
 
G
Q
 
Q
F
 
T
C
|
C
T
 
V
S
x
C
P
 
S
G
 
N
L
 
Q
V
 
F
I
 
L
A
 
V
I
 
Q
K
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5x5uA Crystal structure of alpha-ketoglutarate-semialdehyde dehydrogenase (kgsadh) complexed with NAD (see paper)
25% identity, 89% coverage: 10:467/515 of query aligns to 8:460/476 of 5x5uA

query
sites
5x5uA
F
 
L
I
 
I
A
 
D
H
 
G
E
 
E
W
 
W
H
 
V
Q
x
D
S
x
A
E
x
A
A
 
S
S
x
G
F
 
K
T
 
T
-
 
I
-
 
D
R
 
V
F
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
N
 
G
S
 
K
V
 
P
L
 
I
P
 
-
G
 
G
A
 
R
F
 
V
S
 
A
Q
 
H
G
 
A
T
 
G
V
 
I
V
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
A
 
G
F
 
F
W
 
E
E
 
A
F
 
W
Q
 
R
Q
 
K
T
 
V
S
 
P
A
 
A
D
 
H
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
A
L
 
T
L
 
M
E
 
R
T
 
K
M
 
A
A
 
A
K
 
A
E
 
L
I
 
V
E
 
R
Q
 
E
D
 
R
G
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
Q
C
 
L
A
 
M
M
 
T
L
 
Q
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
T
R
 
E
L
 
A
K
 
R
G
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
L
R
 
S
T
 
A
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
L
 
I
R
 
E
L
 
W
F
 
F
A
 
A
S
 
D
V
 
E
L
 
G
R
 
R
E
 
R
P
 
V
Y
 
Y
S
 
G
P
 
R
L
 
I
L
 
V
M
 
P
D
 
P
K
 
R
A
 
N
N
 
L
P
 
G
D
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
P
 
T
L
 
V
P
 
V
K
 
K
P
 
E
E
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
T
A
x
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
N
T
 
Q
A
 
V
G
 
V
G
 
R
D
 
K
T
 
L
A
 
S
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
A
 
S
V
 
F
I
 
L
V
 
V
K
|
K
G
 
A
H
 
P
P
 
E
S
 
E
H
 
T
P
 
P
G
 
A
T
 
S
S
 
P
E
 
A
L
 
A
V
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
A
M
 
F
A
 
V
R
 
D
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
I
S
 
G
L
 
L
I
 
V
Q
 
Y
G
 
G
S
 
D
E
x
P
P
x
A
A
 
E
L
 
I
S
|
S
V
 
S
A
 
Y
L
 
L
V
 
I
E
 
P
H
 
H
P
 
P
L
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
G
 
T
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
P
V
|
V
G
 
G
R
 
K
L
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
L
C
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
H
P
 
M
E
 
K
P
 
R
I
 
A
P
 
T
F
 
M
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
H
N
 
A
P
 
P
Q
 
V
L
 
I
L
 
V
L
 
A
P
 
E
G
 
D
K
 
A
L
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
V
A
 
A
V
 
L
L
 
A
A
 
V
E
 
K
A
 
A
Q
 
A
V
 
G
N
 
G
S
 
A
M
 
K
M
 
F
M
 
R
G
 
N
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
T
L
 
R
V
 
F
I
 
L
A
 
-
I
 
V
K
 
H
G
 
N
P
 
S
G
 
I
L
 
R
E
 
D
S
 
E
Y
 
F
L
 
T
A
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
K
I
 
H
A
 
A
S
 
E
R
 
G
Q
 
L
N
 
K
A
 
V
A
 
G
A
 
N
M
 
G
L
 
L
S
 
E
A
 
E
G
 
G
I
 
T
C
 
T
Q
 
L
A
 
G
F
 
A
N
 
L
Q
 
A
D
 
N
V
 
P
S
x
R
I
x
R
L
 
L
V
 
T
P
 
A
R
 
M
V
 
A
N
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
D
H
 
N
S
 
A
R
 
R
P
 
K
L
 
V
I
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
G
A
 
S
S
 
E
A
 
G
L
 
N
F
 
F
G
 
F
Q
 
A
P
 
P
E
 
T
L
 
V
L
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
N
E
 
N
E
|
E
I
 
P
F
|
F
G
 
G
P
 
P
F
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
R
I
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
K
K
 
L
E
 
E
E
 
E
M
 
A
F
 
I
E
 
A
L
 
E
V
 
A
K
 
N
R
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
F
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
G
 
G
S
 
-
I
 
-
H
 
Y
G
 
A
L
 
F
E
 
T
T
 
R
E
 
S
V
 
F
A
 
A
D
 
N
F
 
V
G
 
H
D
 
L
I
 
L
I
 
T
D
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
-
F
 
-
K
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
M
I
 
L
M
 
W
F
 
I
N
 
N
Q
 
Q
M
 
P
P
 
A
T
 
T
-
 
P
-
 
W
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
F
-
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
K
V
 
D
A
 
S
R
 
G
A
 
Y
M
 
G
N
 
S
H
x
E
G
 
G
G
 
G
P
 
P

5x5tA Crystal structure of alpha-ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase (kgsadh) from azospirillum brasilense (see paper)
25% identity, 89% coverage: 10:467/515 of query aligns to 8:460/476 of 5x5tA

query
sites
5x5tA
F
 
L
I
 
I
A
 
D
H
 
G
E
 
E
W
 
W
H
 
V
Q
 
D
S
 
A
E
 
A
A
 
S
S
 
G
F
 
K
T
 
T
-
 
I
-
 
D
R
 
V
F
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
N
 
G
S
 
K
V
 
P
L
 
I
P
 
-
G
 
G
A
 
R
F
 
V
S
 
A
Q
 
H
G
 
A
T
 
G
V
 
I
V
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
A
 
G
F
 
F
W
 
E
E
 
A
F
 
W
Q
 
R
Q
 
K
T
 
V
S
 
P
A
 
A
D
 
H
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
K
 
A
L
 
T
L
 
M
E
 
R
T
 
K
M
 
A
A
 
A
K
 
A
E
 
L
I
 
V
E
 
R
Q
 
E
D
 
R
G
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
Q
C
 
L
A
 
M
M
 
T
L
 
Q
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
T
R
 
E
L
 
A
K
 
R
G
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
L
R
 
S
T
 
A
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
L
 
I
R
 
E
L
 
W
F
 
F
A
 
A
S
 
D
V
 
E
L
 
G
R
 
R
E
 
R
P
 
V
Y
 
Y
S
 
G
P
 
R
L
 
I
L
 
V
M
 
P
D
 
P
K
 
R
A
 
N
N
 
L
P
 
G
D
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
P
 
T
L
 
V
P
 
V
K
 
K
P
 
E
E
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
T
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
N
T
 
Q
A
 
V
G
 
V
G
 
R
D
 
K
T
 
L
A
 
S
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
A
 
S
V
 
F
I
 
L
V
 
V
K
|
K
G
 
A
H
 
P
P
 
E
S
 
E
H
 
T
P
 
P
G
 
A
T
 
S
S
 
P
E
 
A
L
 
A
V
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
A
M
 
F
A
 
V
R
 
D
A
 
A
I
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
M
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
I
S
 
G
L
 
L
I
 
V
Q
 
Y
G
 
G
S
 
D
E
 
P
P
 
A
A
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
S
A
 
Y
L
 
L
V
 
I
E
 
P
H
 
H
P
 
P
L
 
V
V
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
G
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
T
K
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
K
L
 
Q
L
 
L
A
|
A
D
 
S
R
 
L
C
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
H
P
 
M
E
 
K
P
 
R
I
 
A
P
 
T
F
 
M
Y
 
-
G
 
-
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
H
N
 
A
P
 
P
Q
 
V
L
 
I
L
 
V
L
 
A
P
 
E
G
 
D
K
 
A
L
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
V
A
 
A
V
 
L
L
 
A
A
 
V
E
 
K
A
 
A
Q
 
A
V
 
G
N
 
G
S
 
A
M
 
K
M
 
F
M
 
R
G
 
N
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
T
L
 
R
V
 
F
I
 
L
A
 
-
I
 
V
K
 
H
G
 
N
P
 
S
G
 
I
L
 
R
E
 
D
S
 
E
Y
 
F
L
 
T
A
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
K
I
 
H
A
 
A
S
 
E
R
 
G
Q
 
L
N
 
K
A
 
V
A
 
G
A
 
N
M
 
G
L
 
L
S
 
E
A
 
E
G
 
G
I
 
T
C
 
T
Q
 
L
A
 
G
F
 
A
N
 
L
Q
 
A
D
 
N
V
 
P
S
 
R
I
 
R
L
 
L
V
 
T
P
 
A
R
 
M
V
 
A
N
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
D
H
 
N
S
 
A
R
 
R
P
 
K
L
 
V
I
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
G
A
 
S
S
 
E
A
 
G
L
 
N
F
 
F
G
 
F
Q
 
A
P
 
P
E
 
T
L
 
V
L
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
N
E
 
N
E
|
E
I
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
R
I
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
K
K
 
L
E
 
E
E
 
E
M
 
A
F
 
I
E
 
A
L
 
E
V
 
A
K
 
N
R
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
F
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
G
 
G
S
 
-
I
 
-
H
 
Y
G
 
A
L
 
F
E
 
T
T
 
R
E
 
S
V
 
F
A
 
A
D
 
N
F
 
V
G
 
H
D
 
L
I
 
L
I
 
T
D
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
-
F
 
-
K
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
M
I
 
L
M
 
W
F
 
I
N
 
N
Q
 
Q
M
 
P
P
 
A
T
 
T
-
 
P
-
 
W
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
F
-
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
K
V
 
D
A
 
S
R
 
G
A
x
Y
M
 
G
N
 
S
H
x
E
G
 
G
G
 
G
P
 
P

Query Sequence

>6937359 FitnessBrowser__SB2B:6937359
MTTDLCGRHFIAHEWHQSEASFTRFNPSTNSVLPGAFSQGTVVEVEAAAIAADAAFWEFQ
QTSADQKAKLLETMAKEIEQDGDAIVACAMLESGLPEARLKGELGRTAGQLRLFASVLRE
PYSPLLMDKANPDRQPLPKPELKLGQLPLGVVAVFGASNFPLAFSTAGGDTASALAAGCA
VIVKGHPSHPGTSELVARAMARAIDLTGMPKGLFSLIQGSEPALSVALVEHPLVKAVGFT
GSLKVGRLLADRCALRPEPIPFYGELGSVNPQLLLPGKLARDAAVLAEAQVNSMMMGHGQ
FCTSPGLVIAIKGPGLESYLAALSDIASRQNAAAMLSAGICQAFNQDVSILVPRVNVIAQ
GQAAEAAHHSRPLIASIEASALFGQPELLEEIFGPFALVAICDSKEEMFELVKRLPGQLT
GSIHGLETEVADFGDIIDRLAFKVGRIMFNQMPTGVEVARAMNHGGPYPASTDGRSTSVG
AEAMKRFMRPICYQNMPETLLPNELKASSRRLMMF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory