SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8502142 FitnessBrowser__Miya:8502142 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2zwrB Crystal structure of ttha1623 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 4:206/210 of query aligns to 2:201/207 of 2zwrB

query
sites
2zwrB
R
 
R
I
 
V
S
 
F
T
 
P
F
 
V
P
 
T
M
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
T
 
E
N
 
N
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
H
 
E
L
 
T
N
 
G
G
 
E
A
 
G
A
 
P
V
 
V
A
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
D
T
 
E
P
 
P
R
 
E
P
 
K
M
 
L
L
 
L
Q
 
A
Y
 
L
A
 
F
E
 
Q
K
 
T
N
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
L
 
P
T
 
L
H
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
F
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
G
G
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
L
G
 
D
A
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
Y
A
 
L
S
 
H
A
 
P
A
 
L
D
 
D
A
 
L
F
 
P
L
 
L
M
 
Y
E
 
E
T
 
G
E
 
A
-
 
D
-
 
L
L
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
A
G
 
W
A
 
G
F
 
L
G
 
A
F
 
I
P
 
P
R
 
K
V
 
-
T
 
P
P
 
P
F
 
L
S
 
P
Y
 
V
Q
 
R
P
 
P
V
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
M
L
 
R
D
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
-
I
 
-
T
 
-
C
 
F
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
L
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
Y
F
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
G
G
 
A
A
 
Q
V
 
V
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
H
 
R
R
 
G
S
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
F
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
P
D
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
F
R
 
A
S
 
S
V
 
-
V
 
L
Q
 
K
K
 
R
I
 
L
F
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
E
T
 
T
V
 
R
V
 
V
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
R
 
P
E
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
L
G
 
G
S
 
L
E
 
E
K
 
A
L
 
R
N
 
T
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
L
T
 
T

7ev5A Crystal structure of bleg-1 b3 metallo-beta-lactamase (see paper)
36% identity, 95% coverage: 8:206/210 of query aligns to 5:208/209 of 7ev5A

query
sites
7ev5A
F
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
T
 
T
N
 
N
G
 
A
Y
 
Y
L
 
V
V
 
L
H
 
Y
L
 
N
N
 
D
G
 
D
A
 
K
-
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
I
V
 
F
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
D
P
 
A
R
 
E
P
 
A
M
 
L
L
 
I
Q
 
T
Y
 
W
A
 
L
E
 
K
K
 
R
N
 
E
G
 
Q
L
 
L
A
 
T
L
 
P
T
 
L
H
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
F
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
I
Y
 
G
G
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
R
E
 
D
A
 
T
S
 
F
G
 
S
A
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
Y
A
 
L
S
 
H
A
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
R
F
 
H
L
 
W
M
 
L
E
 
E
T
 
D
E
 
P
L
 
A
G
 
L
R
 
N
G
 
G
G
 
S
A
 
S
-
 
R
-
 
L
F
 
T
G
 
G
F
 
R
P
 
P
R
 
I
V
 
T
T
 
T
-
 
A
-
 
K
P
 
P
F
 
A
S
 
D
Y
 
H
Q
 
L
P
 
L
V
 
T
E
 
N
E
 
E
G
 
K
D
 
S
L
 
L
D
 
T
L
 
I
G
 
G
A
 
T
I
 
F
T
 
T
C
 
F
R
 
S
A
 
V
L
 
F
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
V
S
 
S
F
 
Y
H
 
Y
F
 
Y
P
 
Q
Q
 
K
V
 
E
G
 
A
A
 
V
V
 
L
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
V
L
 
L
F
 
F
H
 
Q
R
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
L
P
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
H
D
 
T
A
 
L
L
 
L
R
 
L
R
 
A
S
 
S
V
 
I
V
 
H
Q
 
N
K
 
K
I
 
I
F
 
L
T
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
R
T
 
T
V
 
I
V
 
V
Y
 
A
P
 
S
G
 
G
H
|
H
G
 
G
R
 
P
E
 
L
T
 
T
T
 
T
V
 
I
G
 
G
S
 
Q
E
 
E
K
 
M
L
 
D
N
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
L
T
 
T

2zziA Crystal structure of ttha1623 in a di-iron-bound form (see paper)
40% identity, 93% coverage: 10:205/210 of query aligns to 6:198/198 of 2zziA

query
sites
2zziA
M
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
T
 
E
N
 
N
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
H
 
E
L
 
T
N
 
G
G
 
E
A
 
G
A
 
P
V
 
V
A
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
D
T
 
E
P
 
P
R
 
E
P
 
K
M
 
L
L
 
L
Q
 
A
Y
 
L
A
 
F
E
 
Q
K
 
T
N
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
I
L
 
P
T
 
L
H
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
F
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
G
G
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
L
G
 
D
A
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
Y
A
 
L
S
 
H
A
 
P
A
 
L
D
 
D
A
 
L
F
 
P
L
 
L
M
 
Y
E
 
E
T
 
G
E
 
A
-
 
D
-
 
L
L
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
A
G
 
W
A
 
G
F
 
L
G
 
A
F
 
I
P
 
P
R
 
K
V
 
-
T
 
P
P
 
P
F
 
L
S
 
P
Y
 
V
Q
 
R
P
 
P
V
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
M
L
 
R
D
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
-
I
 
-
T
 
-
C
 
F
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
L
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
Y
F
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
G
G
 
A
A
 
Q
V
 
V
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
H
 
R
R
 
G
S
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
F
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
P
D
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
F
R
 
A
S
 
S
V
 
-
V
 
L
Q
 
K
K
 
R
I
 
L
F
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
E
T
 
T
V
 
R
V
 
V
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
R
 
P
E
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
L
G
 
G
S
 
L
E
 
E
K
 
A
L
 
R
N
 
T
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
L

7l0bA Crystal structure of hydroxyacyl glutathione hydrolase (glob) from staphylococcus aureus, apoenzyme (see paper)
35% identity, 94% coverage: 4:201/210 of query aligns to 3:197/202 of 7l0bA

query
sites
7l0bA
R
 
R
I
 
I
S
 
S
T
 
S
F
 
L
P
 
T
M
 
L
G
 
G
P
 
L
L
 
V
E
 
D
T
 
T
N
 
N
G
 
T
Y
 
Y
L
 
F
V
 
I
H
 
E
L
 
N
N
 
D
G
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
I
A
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
G
T
 
E
P
 
S
R
 
E
P
 
K
M
 
I
L
 
I
Q
 
K
Y
 
K
A
 
L
E
 
N
K
 
Q
N
 
I
G
 
N
L
 
K
A
 
P
L
 
L
T
 
K
H
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
F
 
F
D
|
D
H
|
H
I
 
I
Y
 
G
G
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
D
A
 
R
S
 
F
G
 
D
A
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
Y
A
 
M
S
 
H
A
 
E
A
 
A
D
 
E
A
 
F
F
 
D
L
 
F
M
 
L
E
 
K
T
 
D
E
 
P
L
 
V
G
 
-
R
 
K
G
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
D
G
 
K
F
 
L
P
 
P
R
 
I
V
 
T
T
 
S
P
 
K
F
 
V
S
 
T
Y
 
P
Q
 
E
P
 
K
V
 
L
E
 
N
E
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
T
D
 
E
L
 
I
G
 
E
A
 
G
I
 
F
T
 
K
C
 
F
R
 
N
A
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
T
F
 
Y
H
 
V
F
 
F
P
 
D
Q
 
E
V
 
F
G
 
A
A
 
-
V
 
-
I
 
V
V
 
V
G
 
G
D
|
D
L
 
T
L
 
L
F
 
F
H
 
N
R
 
N
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
L
P
 
Y
G
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
Y
D
 
E
A
 
T
L
 
L
R
 
V
R
 
D
S
 
S
V
 
I
V
 
Q
Q
 
D
K
 
K
I
 
I
F
 
F
T
 
E
L
 
L
P
 
E
D
 
G
D
 
D
T
 
L
V
 
P
V
 
L
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
R
 
P
E
 
Y
T
 
T
T
 
T
V
 
V
G
 
D
S
 
D
E
 
E
K
 
Q
L
 
L
N
 
N

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:207/210 of query aligns to 1:210/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
M
 
M
K
 
N
P
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
-
T
 
-
F
 
I
P
 
P
M
 
V
G
 
T
P
 
A
L
 
F
E
 
S
T
 
Q
N
 
N
G
 
C
Y
 
S
L
 
L
V
 
I
H
 
W
L
 
C
N
 
E
G
 
Q
A
 
T
A
 
R
V
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
D
P
 
A
R
 
E
P
 
K
M
 
I
L
 
K
Q
 
Q
Y
 
E
A
 
V
E
 
D
K
 
A
N
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
T
L
 
L
T
 
M
H
 
Q
I
 
I
L
 
L
I
 
L
T
 
T
H
 
H
L
 
G
H
 
H
F
 
L
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
G
G
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
Q
A
 
H
S
 
Y
G
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
G
-
 
P
S
 
E
A
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
E
F
 
F
L
 
W
M
 
L
E
 
Q
T
 
G
E
 
L
L
 
P
G
 
A
R
 
Q
G
 
S
G
 
R
A
 
M
F
 
F
G
 
G
F
 
L
P
 
D
R
 
E
V
 
C
T
 
Q
P
 
P
F
 
L
S
 
T
-
 
P
Y
 
D
Q
 
R
P
 
W
V
 
L
E
 
N
E
 
D
G
 
G
D
 
D
-
 
R
L
 
V
D
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
N
I
 
V
T
 
T
C
 
L
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
H
L
 
V
S
 
V
F
 
F
H
 
F
F
 
D
P
 
E
Q
 
Q
V
 
S
G
 
Q
A
 
L
V
 
L
I
 
I
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
V
L
 
I
F
 
F
H
 
K
R
 
G
S
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
R
G
 
G
D
 
D
L
 
H
D
 
T
A
 
Q
L
 
L
R
 
I
R
 
D
S
 
A
V
 
I
V
 
K
Q
 
R
K
 
K
I
 
L
F
 
L
T
 
P
L
 
L
P
 
G
D
 
D
D
 
D
T
 
V
V
 
T
V
 
F
Y
 
I
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
R
 
P
E
 
L
T
 
S
T
 
T
V
 
L
G
 
G
S
 
Y
E
 
E
K
 
R
L
 
L
N
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
F
 
L
T
 
Q
E
 
D

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
36% identity, 85% coverage: 26:203/210 of query aligns to 26:188/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
A
 
A
V
 
V
A
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
-
 
L
G
 
E
G
 
Q
T
 
V
P
 
D
R
 
R
P
 
D
M
 
L
L
 
Q
Q
 
M
Y
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
L
N
 
D
G
 
-
L
 
L
A
 
T
L
 
L
T
 
T
H
 
H
I
 
V
L
 
F
I
 
D
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
I
Y
 
T
G
 
A
A
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
R
E
 
E
A
 
R
S
 
T
G
 
Q
A
 
A
P
 
T
V
 
V
L
 
V
A
 
G
S
 
S
A
 
V
A
 
N
D
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
C
M
 
A
E
 
N
T
 
V
E
 
Q
L
 
V
G
 
R
R
 
H
G
 
G
G
 
D
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
E
L
 
V
D
 
R
L
 
V
G
 
G
A
 
Q
I
 
L
T
 
V
C
 
F
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
D
S
 
S
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
H
 
L
F
 
L
P
 
G
Q
 
D
V
 
-
G
 
-
A
 
R
V
 
V
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
L
 
L
F
 
L
H
 
V
R
 
R
S
 
G
I
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
N
G
 
G
D
 
N
L
 
A
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
R
 
Y
R
 
D
S
 
S
V
 
L
V
 
T
Q
 
R
K
 
V
I
 
L
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
E
T
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
H
|
H
-
 
D
-
 
Y
-
 
K
G
 
G
R
 
R
E
 
T
-
 
V
T
 
T
T
 
S
V
 
I
G
 
A
S
 
E
E
 
E
K
 
K
L
 
R
N
 
H
N
 
N
P
 
P

Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 89% coverage: 21:207/210 of query aligns to 74:254/294 of Q9C8L4

query
sites
Q9C8L4
H
 
H
L
 
P
N
 
D
G
 
K
A
 
P
A
 
A
V
 
L
A
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
G
 
D
G
 
K
T
 
T
P
 
V
R
 
D
P
 
R
M
 
D
L
 
L
Q
 
K
Y
 
L
A
 
I
E
 
D
K
 
E
N
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
I
H
 
Y
I
 
A
L
 
M
I
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
F
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
A
 
T
A
 
G
A
 
L
L
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
G
V
 
V
E
 
K
A
 
S
S
 
V
G
 
I
A
 
S
P
 
K
V
 
A
L
 
S
A
 
G
S
 
S
A
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
L
F
 
F
L
 
L
M
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
E
E
 
P
G
 
G
D
 
D
-
 
K
L
 
V
D
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
D
I
 
I
T
 
Y
C
 
L
R
 
E
A
 
V
L
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
S
 
C
L
 
V
S
 
T
F
 
Y
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
H
 
D
F
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
V
 
P
G
 
R
A
 
M
V
 
A
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
L
 
V
F
 
L
H
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
S
D
 
D
A
 
Q
L
 
L
R
 
Y
R
 
E
S
 
S
V
 
V
V
 
H
Q
 
S
K
 
Q
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
D
 
D
T
 
T
V
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
D
R
 
Y
E
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
V
T
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
E
E
 
E
K
 
M
L
 
Q
N
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
F
 
L
T
 
T
E
 
K

2gcuA X-ray structure of gene product from arabidopsis thaliana at1g53580 (see paper)
32% identity, 89% coverage: 21:207/210 of query aligns to 25:205/244 of 2gcuA

query
sites
2gcuA
H
 
H
L
 
P
N
 
D
G
 
K
A
 
P
A
 
A
V
 
L
A
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
G
 
D
G
 
K
T
 
T
P
 
V
R
 
D
P
 
R
M
 
D
L
 
L
Q
 
K
Y
 
L
A
 
I
E
 
D
K
 
E
N
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
I
H
 
Y
I
 
A
L
 
M
I
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
A
 
T
A
 
G
A
 
L
L
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
G
V
 
V
E
 
K
A
 
S
S
 
V
G
 
I
A
 
S
P
 
K
V
 
A
L
 
S
A
 
G
S
 
S
A
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
L
F
 
F
L
 
L
M
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
E
E
 
P
G
 
G
D
 
D
-
 
K
L
 
V
D
 
S
L
 
I
G
 
G
A
 
D
I
 
I
T
 
Y
C
 
L
R
 
E
A
 
V
L
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
S
 
C
L
 
V
S
 
T
F
 
Y
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
H
 
D
F
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
V
 
P
G
 
R
A
 
M
V
 
A
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
L
 
V
F
 
L
H
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
S
D
 
D
A
 
Q
L
 
L
R
 
Y
R
 
E
S
 
S
V
 
V
V
 
H
Q
 
S
K
 
Q
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
D
 
D
T
 
T
V
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
R
 
Y
E
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
V
T
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
E
E
 
E
K
 
M
L
 
Q
N
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
F
 
L
T
 
T
E
 
K

6sg9FL uS3m (see paper)
29% identity, 77% coverage: 47:207/210 of query aligns to 99:299/320 of 6sg9FL

query
sites
6sg9FL
L
 
L
A
 
T
L
 
L
T
 
T
H
 
H
I
 
V
L
 
F
I
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
|
H
F
 
I
D
|
D
H
 
N
I
 
I
Y
 
I
G
 
N
A
 
L
A
 
N
A
 
A
L
 
F
V
 
L
E
 
T
A
 
I
S
 
C
G
 
G
A
 
S
P
 
R
-
 
Q
-
 
K
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
G
V
 
V
L
 
M
A
 
W
S
 
C
A
 
P
A
 
A
D
 
E
A
 
E
F
 
C
L
 
W
M
 
V
E
 
Q
T
 
N
-
 
F
-
 
K
-
 
R
E
 
S
L
 
C
G
 
E
R
 
R
G
 
Y
G
 
G
A
 
R
F
 
F
G
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
H
-
 
Q
-
 
V
F
 
L
P
 
P
R
 
M
V
 
M
T
 
C
P
 
R
F
 
S
S
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
P
 
P
-
 
Q
-
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
N
-
 
A
-
 
R
-
 
H
V
 
L
E
 
R
E
 
R
G
 
N
D
 
D
L
 
V
D
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
A
I
 
A
T
 
T
C
 
N
R
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
S
-
 
F
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
Y
-
 
Y
-
 
I
-
 
F
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
L
 
M
S
 
M
F
 
L
H
 
H
F
 
I
P
 
P
Q
 
T
V
 
E
G
 
R
A
 
I
V
 
L
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
H
 
F
R
 
N
S
x
K
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
V
D
 
D
F
 
L
P
 
P
G
 
W
G
 
A
D
 
T
L
 
G
D
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
A
R
 
E
S
 
S
V
 
-
V
 
L
Q
 
R
K
 
L
I
 
L
F
 
E
T
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
|
G
R
|
R
E
 
M
T
 
T
T
 
T
V
 
L
G
 
G
S
 
R
E
 
E
K
 
R
L
 
R
N
 
E
N
 
N
P
 
K
Y
 
A
F
 
L
T
 
Q
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

5ve5A Crystal structure of persulfide dioxygenase rhodanese fusion protein with rhodanese domain inactivating mutation (c314s) from burkholderia phytofirmans in complex with glutathione (see paper)
34% identity, 77% coverage: 43:203/210 of query aligns to 47:194/350 of 5ve5A

query
sites
5ve5A
E
 
E
K
 
E
N
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
H
L
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
T
L
 
I
I
 
D
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
W
A
 
M
L
 
L
V
 
N
E
 
R
A
 
R
S
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
R
V
 
I
L
 
A
A
 
I
S
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
E
G
 
G
F
 
A
P
 
D
R
 
R
V
 
Y
T
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
L
E
 
S
E
 
H
G
 
G
D
 
D
-
 
K
L
 
V
D
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
T
I
 
R
T
 
Y
C
 
L
R
 
T
A
 
V
L
 
R
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
G
S
 
C
L
 
I
S
 
T
F
 
L
H
 
V
F
 
L
P
 
D
Q
 
N
V
 
E
G
 
T
A
 
M
V
 
A
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
C
L
 
L
F
 
L
H
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
T
G
|
G
R
|
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
R
G
 
G
D
 
D
L
 
A
D
 
H
A
 
T
L
 
M
R
 
F
R
 
R
S
 
A
V
 
V
V
 
H
Q
 
G
K
 
Q
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
T
D
 
A
T
 
C
V
 
L
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
R
x
Y
E
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
T
 
T
T
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
E
E
 
E
K
 
R
L
 
R
N
 
F
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
33% identity, 88% coverage: 17:200/210 of query aligns to 84:248/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
G
 
A
Y
 
Y
L
 
I
V
 
L
H
 
H
L
 
D
N
 
E
-
 
D
-
 
T
G
 
G
A
 
T
A
 
V
V
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
-
T
 
E
P
 
A
R
 
E
P
 
P
M
 
I
L
 
I
Q
 
D
Y
 
S
A
 
L
E
 
K
K
 
R
N
 
S
G
 
G
L
 
R
A
 
N
L
 
L
T
 
T
H
 
Y
I
 
I
L
 
L
I
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
F
 
Y
D
|
D
H
|
H
I
 
T
Y
 
G
G
 
G
A
 
N
A
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
K
E
 
D
A
 
R
S
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
M
D
 
D
A
 
K
F
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
D
R
 
R
V
 
I
T
 
-
P
 
P
F
 
G
S
 
I
Y
 
D
Q
 
M
P
 
A
V
 
L
E
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
K
D
 
W
L
 
M
G
 
F
A
 
A
-
 
G
I
 
H
T
 
E
C
 
V
R
 
H
A
 
V
L
 
M
A
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
H
L
 
I
S
 
S
F
 
L
H
 
Y
F
 
F
P
 
P
Q
 
G
V
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
I
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
T
L
 
M
F
 
F
H
 
S
R
 
L
S
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
L
D
 
-
F
 
F
P
 
E
G
 
G
G
 
T
D
 
P
L
 
K
D
 
Q
A
 
M
L
 
L
R
 
-
R
 
-
S
 
A
V
 
S
V
 
L
Q
 
Q
K
 
K
I
 
I
F
 
T
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
D
T
 
T
V
 
S
V
 
I
Y
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
G
 
-
R
 
-
E
 
E
T
 
Y
T
 
T
V
 
L
G
 
S
S
 
N
E
 
S
K
 
K
L
 
F

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
33% identity, 88% coverage: 17:200/210 of query aligns to 14:178/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
G
 
A
Y
 
Y
L
 
I
V
 
L
H
 
H
L
 
D
N
 
E
-
 
D
-
 
T
G
 
G
A
 
T
A
 
V
V
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
-
T
 
E
P
 
A
R
 
E
P
 
P
M
 
I
L
 
I
Q
 
D
Y
 
S
A
 
L
E
 
K
K
 
R
N
 
S
G
 
G
L
 
R
A
 
N
L
 
L
T
 
T
H
 
Y
I
 
I
L
 
L
I
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
F
 
Y
D
|
D
H
|
H
I
 
T
Y
 
G
G
 
G
A
 
N
A
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
K
E
 
D
A
 
R
S
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
M
D
 
D
A
 
K
F
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
D
R
 
R
V
 
I
T
 
-
P
 
P
F
 
G
S
 
I
Y
 
D
Q
 
M
P
 
A
V
 
L
E
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
K
D
 
W
L
 
M
G
 
F
A
 
A
-
 
G
I
 
H
T
 
E
C
 
V
R
 
H
A
 
V
L
 
M
A
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
H
L
 
I
S
 
S
F
 
L
H
 
Y
F
 
F
P
 
P
Q
 
G
V
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
I
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
T
L
 
M
F
 
F
H
 
S
R
 
L
S
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
L
D
 
-
F
 
F
P
 
E
G
 
G
G
 
T
D
 
P
L
 
K
D
 
Q
A
 
M
L
 
L
R
 
-
R
 
-
S
 
A
V
 
S
V
 
L
Q
 
Q
K
 
K
I
 
I
F
 
T
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
D
T
 
T
V
 
S
V
 
I
Y
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
G
 
-
R
 
-
E
 
E
T
 
Y
T
 
T
V
 
L
G
 
S
S
 
N
E
 
S
K
 
K
L
 
F

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
32% identity, 86% coverage: 26:206/210 of query aligns to 48:216/254 of O95571

query
sites
O95571
A
 
A
V
 
V
A
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
x
L
T
 
E
P
 
T
R
 
A
P
 
P
M
 
R
-
 
D
L
 
A
Q
 
Q
Y
 
L
A
 
I
E
 
K
K
 
E
N
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
R
L
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
A
L
 
V
I
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
 
H
F
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
G
A
 
L
L
 
L
V
 
R
E
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
G
A
 
C
S
 
Q
G
 
S
A
 
V
P
 
I
V
 
S
L
 
R
A
 
L
S
 
S
A
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
F
 
D
L
 
L
M
 
H
E
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
I
E
 
E
E
 
D
G
 
G
D
 
D
-
 
S
L
 
I
D
 
R
L
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
F
T
 
A
C
 
L
R
 
E
A
 
T
L
 
R
A
 
A
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
C
L
 
V
S
 
T
F
 
F
H
 
V
F
 
L
P
 
N
Q
 
D
V
 
H
G
 
S
A
 
M
V
 
A
I
 
F
V
x
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
L
 
L
F
 
L
H
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
|
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
L
 
A
D
 
K
A
 
T
L
 
L
R
 
Y
R
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
H
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
D
 
D
T
 
C
V
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
x
D
R
 
Y
E
 
H
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
V
T
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
E
S
 
E
E
 
E
K
 
R
L
 
T
N
 
L
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
F
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
32% identity, 86% coverage: 26:206/210 of query aligns to 32:200/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
A
 
A
V
 
V
A
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
L
T
 
E
P
 
T
R
 
A
P
 
P
M
 
R
-
 
D
L
 
A
Q
 
Q
Y
 
L
A
 
I
E
 
K
K
 
E
N
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
R
L
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
A
L
 
V
I
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
|
H
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
G
A
 
L
L
 
L
V
 
R
E
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
G
A
 
C
S
 
Q
G
 
S
A
 
V
P
 
I
V
 
S
L
 
R
A
 
L
S
 
S
A
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
F
 
D
L
 
L
M
 
H
E
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
I
E
 
E
E
 
D
G
 
G
D
 
D
-
 
S
L
 
I
D
 
R
L
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
F
T
 
A
C
 
L
R
 
E
A
 
T
L
 
R
A
 
A
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
C
L
 
V
S
 
T
F
 
F
H
 
V
F
 
L
P
 
N
Q
 
D
V
 
H
G
 
S
A
 
M
V
 
A
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
A
L
 
L
F
 
L
H
 
I
R
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
L
 
A
D
 
K
A
 
T
L
 
L
R
 
Y
R
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
H
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
D
 
D
T
 
C
V
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
R
 
Y
E
 
H
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
V
T
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
E
S
 
E
E
 
E
K
 
R
L
 
T
N
 
L
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
F
 
L
T
 
T

4yslA Crystal structure of sdoa from pseudomonas putida in complex with glutathione (see paper)
35% identity, 74% coverage: 48:202/210 of query aligns to 66:234/294 of 4yslA

query
sites
4yslA
A
 
S
L
 
V
T
 
R
H
 
W
I
 
V
L
 
L
I
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
F
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
Y
 
S
G
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
V
 
K
E
 
E
A
 
K
S
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
H
S
 
T
A
 
A
A
 
I
D
 
G
A
 
A
F
 
H
L
 
I
M
 
T
E
 
Q
T
 
V
E
 
Q
L
 
K
G
 
V
R
 
F
G
 
G
G
 
A
A
 
L
F
 
F
-
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
A
R
 
R
V
 
D
-
 
G
T
 
S
P
 
Q
F
 
F
S
 
D
Y
 
V
Q
 
L
P
 
L
V
 
E
E
 
D
E
 
E
G
 
E
D
 
G
L
 
F
D
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
N
I
 
L
T
 
Q
C
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
C
L
 
M
S
 
S
F
 
F
H
 
M
F
 
I
P
 
E
Q
 
D
V
 
A
G
 
G
-
 
E
-
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
V
G
 
G
D
|
D
L
 
T
L
 
L
F
 
F
H
 
M
R
 
P
S
 
D
I
 
Y
G
 
G
-
 
T
-
x
A
R
|
R
T
 
C
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
A
D
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
Y
R
 
R
S
 
S
V
 
-
V
 
I
Q
 
R
K
 
R
I
 
L
F
 
L
T
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
D
D
 
Q
T
 
T
V
 
R
V
 
L
Y
 
F
P
 
M
G
 
C
H
 
H
-
 
D
-
x
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
D
-
 
M
-
 
Q
-
 
Y
-
 
V
T
 
T
T
 
T
V
 
V
G
 
A
S
 
E
E
 
Q
K
 
R
L
 
A
N
 
S
N
 
N

Sites not aligning to the query:

4yskA Crystal structure of apo-form sdoa from pseudomonas putida (see paper)
35% identity, 74% coverage: 48:202/210 of query aligns to 66:234/294 of 4yskA

query
sites
4yskA
A
 
S
L
 
V
T
 
R
H
 
W
I
 
V
L
 
L
I
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
F
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
Y
 
S
G
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
V
 
K
E
 
E
A
 
K
S
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
H
S
 
T
A
 
A
A
 
I
D
 
G
A
 
A
F
 
H
L
 
I
M
 
T
E
 
Q
T
 
V
E
 
Q
L
 
K
G
 
V
R
 
F
G
 
G
G
 
A
A
 
L
F
 
F
-
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
A
R
 
R
V
 
D
-
 
G
T
 
S
P
 
Q
F
 
F
S
 
D
Y
 
V
Q
 
L
P
 
L
V
 
E
E
 
D
E
 
E
G
 
E
D
 
G
L
 
F
D
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
N
I
 
L
T
 
Q
C
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
C
L
 
M
S
 
S
F
 
F
H
 
M
F
 
I
P
 
E
Q
 
D
V
 
A
G
 
G
-
 
E
-
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
V
G
 
G
D
|
D
L
 
T
L
 
L
F
 
F
H
 
M
R
 
P
S
 
D
I
 
Y
G
 
G
-
 
T
-
 
A
R
 
R
T
 
C
D
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
A
D
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
Y
R
 
R
S
 
S
V
 
-
V
 
I
Q
 
R
K
 
R
I
 
L
F
 
L
T
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
D
D
 
Q
T
 
T
V
 
R
V
 
L
Y
 
F
P
 
M
G
 
C
H
 
H
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
D
-
 
M
-
 
Q
-
 
Y
-
 
V
T
 
T
T
 
T
V
 
V
G
 
A
S
 
E
E
 
Q
K
 
R
L
 
A
N
 
S
N
 
N

3r2uB 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
28% identity, 88% coverage: 24:207/210 of query aligns to 28:215/336 of 3r2uB

query
sites
3r2uB
G
 
G
A
 
E
A
 
A
V
 
M
A
 
I
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
I
G
 
R
T
 
D
P
 
L
R
 
S
P
 
S
M
 
Y
L
 
I
Q
 
R
Y
 
V
A
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
I
T
 
T
H
 
H
I
 
A
L
 
A
I
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
F
 
A
D
|
D
H
x
F
I
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
I
A
 
R
A
 
D
L
 
V
V
 
A
E
 
I
A
 
K
S
 
L
G
 
N
A
 
A
P
 
N
V
 
I
L
 
Y
A
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
E
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
M
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
S
G
 
D
G
 
D
A
 
T
F
 
L
G
 
G
F
 
Y
P
 
K
R
 
N
V
 
M
T
 
P
P
 
N
F
 
H
S
 
T
Y
 
H
Q
 
F
P
 
V
V
 
Q
E
 
H
E
 
N
G
 
D
D
 
D
L
 
I
D
 
Y
L
 
V
G
 
G
A
 
N
I
 
I
T
 
K
C
 
L
R
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
S
 
S
L
 
I
S
 
S
F
 
F
H
 
L
F
 
L
P
 
T
Q
 
D
V
 
E
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
G
V
 
L
I
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
L
 
F
L
 
I
F
 
F
H
 
V
R
 
G
S
 
D
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
F
 
L
P
 
S
G
 
E
G
 
I
D
 
G
L
 
A
D
 
K
A
 
Q
L
 
M
R
 
F
R
 
K
S
 
S
V
 
-
V
 
I
Q
 
E
K
 
S
I
 
I
F
 
K
T
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
Y
T
 
I
V
 
Q
V
 
I
Y
 
W
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
R
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
P
E
 
T
T
 
S
T
 
T
V
 
L
G
 
G
S
 
Y
E
 
E
K
 
K
L
 
Q
N
 
T
N
 
N
P
 
W
Y
 
A
F
 
F
T
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q16775 Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Homo sapiens (Human) (see paper)
31% identity, 83% coverage: 26:200/210 of query aligns to 73:230/308 of Q16775

query
sites
Q16775
A
 
A
V
 
A
A
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
-
T
 
Q
P
 
P
R
 
Q
P
 
K
M
 
V
L
 
V
Q
 
D
Y
 
A
A
 
A
E
 
R
K
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
K
L
 
L
T
 
T
H
 
T
I
 
V
L
 
L
I
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
F
 
W
D
|
D
H
|
H
I
 
A
Y
 
G
G
 
G
A
 
N
A
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
K
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
M
 
L
E
 
E
T
 
S
E
 
G
L
 
L
G
 
K
R
 
V
G
 
Y
G
 
G
A
 
-
F
 
-
G
 
G
F
 
D
P
 
D
R
 
R
V
 
I
T
 
G
P
 
A
F
 
L
S
 
T
Y
 
H
Q
 
K
P
 
I
V
 
T
E
 
H
E
 
L
G
 
S
D
 
T
L
 
L
D
 
Q
L
 
V
G
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
N
C
 
V
R
 
K
A
 
C
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
G
 
G
S
 
H
L
 
I
S
 
C
F
 
Y
H
 
F
F
 
V
P
 
S
Q
 
K
V
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
P
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
T
L
 
L
F
 
F
H
 
V
R
 
A
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
x
K
T
 
-
D
 
-
F
|
F
P
x
Y
G
 
E
G
 
G
D
 
T
L
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
M
R
 
C
R
 
K
S
 
A
V
 
L
V
 
L
Q
 
E
K
 
V
I
 
L
F
 
G
T
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
G
 
-
R
 
-
E
|
E
T
x
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
N
S
 
N
E
 
L
K
 
K
L
 
F

Sites not aligning to the query:

1qh5B Human glyoxalase ii with s-(n-hydroxy-n-bromophenylcarbamoyl) glutathione (see paper)
31% identity, 83% coverage: 26:200/210 of query aligns to 25:182/260 of 1qh5B

query
sites
1qh5B
A
 
A
V
 
A
A
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
-
T
 
Q
P
 
P
R
 
Q
P
 
K
M
 
V
L
 
V
Q
 
D
Y
 
A
A
 
A
E
 
R
K
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
K
L
 
L
T
 
T
H
 
T
I
 
V
L
 
L
I
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
F
 
W
D
|
D
H
|
H
I
 
A
Y
 
G
G
 
G
A
 
N
A
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
K
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
M
 
L
E
 
E
T
 
S
E
 
G
L
 
L
G
 
K
R
 
V
G
 
Y
G
 
G
A
 
-
F
 
-
G
 
G
F
 
D
P
 
D
R
 
R
V
 
I
T
 
G
P
 
A
F
 
L
S
 
T
Y
 
H
Q
 
K
P
 
I
V
 
T
E
 
H
E
 
L
G
 
S
D
 
T
L
 
L
D
 
Q
L
 
V
G
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
N
C
 
V
R
 
K
A
 
C
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
G
 
G
S
 
H
L
 
I
S
 
C
F
 
Y
H
 
F
F
 
V
P
 
S
Q
 
K
V
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
P
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
T
L
 
L
F
 
F
H
 
V
R
 
A
S
 
G
I
x
C
G
 
G
R
x
K
T
 
-
D
 
-
F
 
F
P
x
Y
G
 
E
G
 
G
D
 
T
L
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
M
R
 
C
R
 
K
S
 
A
V
 
L
V
 
L
Q
 
E
K
 
V
I
 
L
F
 
G
T
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
G
 
-
R
 
-
E
 
E
T
x
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
N
S
 
N
E
 
L
K
 
K
L
 
F

Sites not aligning to the query:

1qh5A Human glyoxalase ii with s-(n-hydroxy-n-bromophenylcarbamoyl) glutathione (see paper)
31% identity, 83% coverage: 26:200/210 of query aligns to 25:182/260 of 1qh5A

query
sites
1qh5A
A
 
A
V
 
A
A
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
-
T
 
Q
P
 
P
R
 
Q
P
 
K
M
 
V
L
 
V
Q
 
D
Y
 
A
A
 
A
E
 
R
K
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
K
L
 
L
T
 
T
H
 
T
I
 
V
L
 
L
I
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
F
 
W
D
|
D
H
|
H
I
 
A
Y
 
G
G
 
G
A
 
N
A
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
K
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
M
 
L
E
 
E
T
 
S
E
 
G
L
 
L
G
 
K
R
 
V
G
 
Y
G
 
G
A
 
-
F
 
-
G
 
G
F
 
D
P
 
D
R
 
R
V
 
I
T
 
G
P
 
A
F
 
L
S
 
T
Y
 
H
Q
 
K
P
 
I
V
 
T
E
 
H
E
 
L
G
 
S
D
 
T
L
 
L
D
 
Q
L
 
V
G
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
N
C
 
V
R
 
K
A
 
C
L
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
G
 
G
S
 
H
L
 
I
S
 
C
F
 
Y
H
 
F
F
 
V
P
 
S
Q
 
K
V
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
P
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
L
 
T
L
 
L
F
 
F
H
 
V
R
 
A
S
 
G
I
x
C
G
 
G
R
x
K
T
 
-
D
 
-
F
 
F
P
 
Y
G
 
E
G
 
G
D
 
T
L
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
M
R
 
C
R
 
K
S
 
A
V
 
L
V
 
L
Q
 
E
K
 
V
I
 
L
F
 
G
T
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H
G
 
-
R
 
-
E
 
E
T
x
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
N
S
 
N
E
 
L
K
 
K
L
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>8502142 FitnessBrowser__Miya:8502142
MKPRISTFPMGPLETNGYLVHLNGAAVAVDPGGTPRPMLQYAEKNGLALTHILITHLHFD
HIYGAAALVEASGAPVLASAADAFLMETELGRGGAFGFPRVTPFSYQPVEEGDLDLGAIT
CRALATPGHTPGSLSFHFPQVGAVIVGDLLFHRSIGRTDFPGGDLDALRRSVVQKIFTLP
DDTVVYPGHGRETTVGSEKLNNPYFTEFSL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory