SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_07635 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_07635 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P46154 Glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase; FALDH; FDH; Formaldehyde dismutase; EC 1.2.1.46; EC 1.2.98.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
93% identity, 100% coverage: 1:399/399 of query aligns to 1:399/399 of P46154

query
sites
P46154
M
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
K
 
K
I
 
I
E
 
E
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
S
T
 
T
N
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
|
D
Q
|
Q
H
|
H
M
 
M
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
G
 
G
S
 
R
G
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
C
|
C
G
 
G
R
 
R
C
|
C
R
 
R
S
 
S
C
|
C
K
 
K
E
 
E
Q
 
M
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
C
|
C
L
 
L
S
 
T
V
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
P
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
 
W
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
L
F
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
D
R
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
D
 
D
L
 
L
T
 
T
C
 
C
L
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
L
N
 
N
P
 
P
I
 
A
R
|
R
L
 
L
A
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
H
 
H
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
E
 
E
V
 
V
D
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
|
R
G
|
G
H
|
H
G
 
G
H
 
H
A
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
K
H
 
H
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
L
M
 
M
G
 
Q
V
 
V
V
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
G
 
G
I
 
I
P
|
P
G
|
G
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
S
I
 
I
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
A
K
 
K
S
 
S
H
 
H
S
 
S
F
 
F
H
 
H
T
 
T
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
P
 
P
V
 
V
M
 
M
K
 
K
Y
 
Y
N
 
N
R
 
R
Q
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
M
 
M
W
 
W
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
P
 
P
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
K
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
T
F
 
F
S
 
S
A
 
A
A
 
A

1kolA Crystal structure of formaldehyde dehydrogenase (see paper)
93% identity, 99% coverage: 3:398/399 of query aligns to 1:396/396 of 1kolA

query
sites
1kolA
G
 
G
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
K
 
K
I
 
I
E
 
E
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
S
T
 
T
N
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
Q
 
Q
H
|
H
M
 
M
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
G
 
G
S
 
R
G
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
|
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
C
|
C
G
 
G
R
 
R
C
|
C
R
 
R
S
 
S
C
|
C
K
 
K
E
 
E
Q
 
M
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
C
|
C
L
 
L
S
 
T
V
 
V
N
|
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
P
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
 
W
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
F
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
D
R
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
D
 
D
L
 
L
T
 
T
C
 
C
L
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
G
D
|
D
V
x
L
N
 
N
P
 
P
I
 
A
R
|
R
L
 
L
A
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
H
 
H
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
E
 
E
V
 
V
D
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
|
A
V
|
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
|
R
G
 
G
H
|
H
G
 
G
H
 
H
A
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
K
H
 
H
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
T
V
|
V
L
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
L
M
 
M
G
 
Q
V
 
V
V
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
G
 
G
I
 
I
P
|
P
G
 
G
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
S
I
 
I
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
A
K
 
K
S
 
S
H
 
H
S
 
S
F
 
F
H
 
H
T
 
T
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
P
 
P
V
 
V
M
 
M
K
 
K
Y
 
Y
N
 
N
R
 
R
Q
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
M
 
M
W
 
W
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
P
 
P
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
K
 
K
K
|
K
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
T
F
 
F
S
 
S
A
 
A

4jlwA Crystal structure of formaldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
90% identity, 99% coverage: 3:396/399 of query aligns to 1:394/395 of 4jlwA

query
sites
4jlwA
G
 
G
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
K
 
N
I
 
I
D
 
P
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
E
 
D
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
V
S
 
S
T
 
T
N
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
Q
 
Q
H
|
H
M
 
M
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
Q
 
P
T
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
K
 
I
G
 
G
S
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
N
 
T
L
 
M
Q
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
C
|
C
G
 
G
R
 
H
C
|
C
R
 
R
S
 
T
C
|
C
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
C
|
C
L
 
L
S
 
T
V
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
P
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
M
 
M
G
 
G
D
 
G
W
 
W
T
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
F
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
N
R
 
R
D
 
E
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
D
 
D
L
 
L
T
 
T
C
 
C
L
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
P
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
S
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
V
N
 
N
P
 
P
I
 
T
R
|
R
L
 
L
A
 
A
H
 
H
A
 
A
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
K
D
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
H
 
H
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
E
 
E
V
 
V
D
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
|
R
G
 
G
H
|
H
G
 
G
H
 
H
A
 
S
G
 
G
V
 
S
K
 
Q
H
 
Q
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
T
V
|
V
L
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
L
M
 
M
G
 
G
V
 
I
V
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
G
 
G
I
 
I
P
|
P
G
 
G
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
H
G
 
G
S
 
A
L
 
L
S
 
S
I
 
I
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
A
K
 
K
S
 
S
H
 
H
S
 
S
F
 
F
H
 
H
T
 
T
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
P
 
P
V
 
V
M
 
M
K
 
K
Y
 
Y
N
 
N
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
M
 
M
W
 
W
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
P
 
P
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
K
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
N
L
 
L
F
 
F

Q52078 Formaldehyde dismutase; EC 1.2.98.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
58% identity, 99% coverage: 1:397/399 of query aligns to 1:397/399 of Q52078

query
sites
Q52078
M
|
M
S
x
A
G
|
G
N
|
N
R
x
K
G
x
S
V
|
V
V
|
V
Y
|
Y
L
x
H
G
|
G
A
x
T
G
x
R
K
x
D
V
x
L
E
x
R
V
|
V
Q
x
E
K
x
T
I
x
V
D
x
P
Y
|
Y
P
|
P
K
|
K
M
x
L
Q
x
E
D
x
H
P
 
-
R
x
N
G
x
N
R
|
R
K
|
K
I
x
L
E
|
E
H
|
H
G
x
A
V
|
V
I
|
I
L
|
L
R
x
K
V
|
V
V
|
V
S
|
S
T
|
T
N
|
N
I
|
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
|
D
Q
|
Q
H
|
H
M
x
I
V
x
Y
R
|
R
G
|
G
R
|
R
T
x
F
T
x
I
A
x
V
Q
x
P
T
x
K
G
|
G
L
x
H
V
|
V
L
|
L
G
|
G
H
|
H
E
|
E
I
|
I
T
|
T
G
|
G
E
|
E
V
|
V
I
x
V
E
|
E
K
|
K
G
|
G
S
|
S
G
x
D
V
|
V
E
|
E
N
x
L
L
x
M
Q
x
D
I
|
I
G
|
G
D
|
D
L
|
L
V
|
V
S
|
S
V
|
V
P
|
P
F
|
F
N
|
N
V
|
V
A
|
A
C
|
C
G
|
G
R
|
R
C
|
C
R
|
R
S
x
N
C
|
C
K
|
K
E
|
E
Q
x
A
H
x
R
T
x
S
G
x
D
V
|
V
C
|
C
L
x
E
S
x
N
-
x
N
-
x
L
V
|
V
N
|
N
P
|
P
A
x
D
R
x
A
P
x
D
G
x
L
G
|
G
A
|
A
Y
x
F
G
|
G
Y
x
F
V
 
-
D
|
D
M
x
L
G
x
K
D
x
G
W
|
W
T
x
S
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
A
|
A
E
|
E
Y
|
Y
A
x
V
F
x
L
V
|
V
P
|
P
Y
|
Y
A
|
A
D
|
D
F
x
Y
N
x
M
L
|
L
L
|
L
K
|
K
L
x
F
P
x
G
D
|
D
R
x
K
D
x
E
R
x
Q
A
|
A
M
|
M
E
|
E
K
|
K
I
|
I
R
x
K
D
|
D
L
|
L
T
|
T
C
x
L
L
x
I
S
|
S
D
|
D
I
|
I
L
|
L
P
|
P
T
|
T
G
|
G
Y
x
F
H
|
H
G
|
G
A
x
C
V
|
V
T
x
S
A
|
A
G
|
G
V
|
V
G
x
K
P
|
P
G
|
G
S
|
S
T
x
H
V
|
V
Y
|
Y
V
x
I
A
|
A
G
|
G
A
|
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
|
G
L
x
R
A
x
C
A
|
A
A
|
A
A
|
A
S
x
G
A
|
A
R
|
R
L
|
L
L
|
L
G
|
G
A
|
A
A
|
A
V
x
C
V
|
V
I
|
I
I
x
V
G
|
G
D
|
D
V
x
Q
N
|
N
P
|
P
I
x
E
R
|
R
L
|
L
A
x
K
H
x
L
A
x
L
K
x
S
A
x
D
Q
x
A
G
|
G
F
|
F
E
|
E
I
x
T
A
x
I
D
|
D
L
|
L
S
x
R
T
x
N
D
x
S
T
x
A
P
|
P
L
|
L
H
x
R
E
x
D
Q
|
Q
I
|
I
A
x
D
A
x
Q
L
x
I
L
|
L
G
|
G
E
x
K
P
|
P
E
|
E
V
|
V
D
|
D
C
|
C
A
x
G
V
|
V
D
|
D
A
|
A
V
|
V
G
|
G
F
|
F
E
|
E
A
|
A
R
x
H
G
|
G
H
x
L
G
|
G
H
x
D
A
x
E
G
x
A
V
 
-
K
x
N
H
x
T
E
|
E
A
x
T
P
|
P
A
x
N
T
x
G
V
x
A
L
|
L
N
|
N
S
|
S
L
|
L
M
x
F
G
x
D
V
|
V
V
|
V
R
|
R
V
x
A
A
x
G
G
|
G
K
x
A
I
|
I
G
|
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
L
x
I
Y
|
Y
V
|
V
T
x
G
E
x
S
D
|
D
P
|
P
G
x
D
A
x
P
V
|
V
D
x
N
A
x
K
A
x
D
A
|
A
K
x
G
M
x
S
G
|
G
S
x
R
L
|
L
S
x
H
I
x
L
R
x
D
F
|
F
G
|
G
L
x
K
G
x
M
W
|
W
A
x
T
K
|
K
S
|
S
H
x
I
S
x
R
F
x
I
H
x
M
T
|
T
G
|
G
Q
x
M
T
x
A
P
|
P
V
|
V
M
x
T
K
x
N
Y
|
Y
N
|
N
R
|
R
Q
x
H
L
|
L
M
x
T
Q
x
E
A
|
A
I
|
I
M
x
L
W
|
W
D
|
D
R
x
Q
I
x
M
K
x
P
-
x
Y
I
x
L
A
x
S
D
x
K
I
x
V
V
x
M
G
x
N
V
x
I
E
|
E
V
|
V
I
|
I
S
x
T
L
|
L
D
|
D
D
x
Q
A
|
A
P
|
P
R
x
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
A
E
x
K
F
|
F
D
|
D
A
x
K
G
|
G
V
x
S
P
|
P
K
x
A
K
|
K
F
|
F
V
|
V
I
|
I
D
|
D
P
|
P
H
|
H
K
x
G
L
x
M
F
x
L
S
x
K

Sites not aligning to the query:

2dphA Crystal structure of formaldehyde dismutase
58% identity, 99% coverage: 2:397/399 of query aligns to 1:396/398 of 2dphA

query
sites
2dphA
S
 
A
G
 
G
N
 
N
R
 
K
G
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
H
G
 
G
A
 
T
G
 
R
K
 
D
V
 
L
E
 
R
V
 
V
Q
 
E
K
 
T
I
 
V
D
 
P
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
M
 
L
Q
 
E
D
 
H
P
 
-
R
 
N
G
 
N
R
 
R
K
 
K
I
 
L
E
 
E
H
 
H
G
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
S
T
 
T
N
 
N
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
Q
 
Q
H
|
H
M
 
I
V
 
Y
R
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
F
T
 
I
A
 
V
Q
 
P
T
 
K
G
 
G
L
 
H
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
S
 
S
G
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
L
L
 
M
Q
 
D
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
|
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
C
|
C
G
 
G
R
 
R
C
|
C
R
 
R
S
 
N
C
|
C
K
 
K
E
 
E
Q
 
A
H
 
R
T
 
S
G
 
D
V
 
V
C
|
C
L
 
E
S
 
N
-
 
N
-
x
L
V
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
D
R
 
A
P
 
D
G
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
Y
 
F
V
 
-
D
 
D
M
 
L
G
 
K
D
 
G
W
 
W
T
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
F
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
N
 
M
L
 
L
L
 
L
K
 
K
L
 
F
P
 
G
D
 
D
R
 
K
D
 
E
R
 
Q
A
 
A
M
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
K
D
 
D
L
 
L
T
 
T
C
 
L
L
 
I
S
|
S
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
|
P
T
|
T
G
 
G
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
C
V
 
V
T
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
K
P
 
P
G
 
G
S
 
S
T
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
A
|
A
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
R
A
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
C
V
 
V
I
 
I
I
 
V
G
|
G
D
|
D
V
x
Q
N
 
N
P
 
P
I
 
E
R
|
R
L
 
L
A
 
K
H
 
L
A
 
L
K
 
S
A
 
D
Q
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
E
I
 
T
A
 
I
D
 
D
L
|
L
S
 
R
T
 
N
D
 
S
T
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
R
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
A
 
D
A
 
Q
L
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
V
D
 
D
C
 
C
A
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
x
H
G
 
G
H
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
E
G
 
A
V
 
-
K
 
N
H
 
T
E
 
E
A
 
T
P
 
P
A
 
N
T
 
G
V
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
L
M
 
F
G
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
P
|
P
G
|
G
L
x
I
Y
 
Y
V
 
V
T
 
G
E
 
S
D
 
D
P
 
P
G
 
D
A
 
P
V
 
V
D
 
N
A
 
K
A
 
D
A
 
A
K
 
G
M
 
S
G
 
G
S
 
R
L
 
L
S
 
H
I
 
L
R
 
D
F
 
F
G
 
G
L
 
K
G
 
M
W
 
W
A
 
T
K
 
K
S
 
S
H
 
I
S
 
R
F
 
I
H
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
M
T
x
A
P
 
P
V
 
V
M
 
T
K
 
N
Y
 
Y
N
 
N
R
 
R
Q
 
H
L
 
L
M
 
T
Q
 
E
A
 
A
I
 
I
M
 
L
W
 
W
D
 
D
R
 
Q
I
 
M
K
 
P
-
 
Y
I
 
L
A
 
S
D
 
K
I
 
V
V
 
M
G
 
N
V
 
I
E
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
P
 
P
R
 
D
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
K
G
 
G
V
 
S
P
 
P
K
 
A
K
|
K
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
G
L
 
M
F
 
L
S
 
K

4cpdA Alcohol dehydrogenase tadh from thermus sp. Atn1
31% identity, 94% coverage: 5:381/399 of query aligns to 2:334/346 of 4cpdA

query
sites
4cpdA
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
G
 
N
A
 
K
G
 
E
K
 
R
V
 
V
E
 
A
V
 
V
Q
 
K
K
 
E
I
 
V
D
 
N
Y
 
A
P
 
P
K
 
R
M
 
L
Q
 
Q
D
 
H
P
 
P
R
 
L
G
 
D
R
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
A
I
 
L
L
 
V
R
 
R
V
 
V
V
 
H
S
 
L
T
 
A
N
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
Q
 
L
H
|
H
M
 
L
V
 
Y
R
 
H
G
 
G
R
 
K
T
 
I
T
 
P
A
 
V
Q
 
L
T
 
P
G
 
G
L
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
I
 
E
E
 
A
K
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
I
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
W
V
 
V
S
 
V
V
 
G
P
 
P
F
 
F
N
 
H
V
 
I
A
 
A
C
|
C
G
 
G
R
 
T
C
|
C
R
 
P
S
 
Y
C
|
C
K
 
R
E
 
R
Q
 
H
H
 
Q
T
 
Y
G
 
N
V
 
L
C
|
C
L
 
-
S
 
-
V
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
E
P
 
R
G
 
G
G
|
G
A
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
G
D
 
P
M
 
M
-
 
F
G
 
G
D
 
N
W
 
L
T
 
Q
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
I
A
 
L
F
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
A
 
S
D
 
N
F
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
R
K
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
P
R
 
N
D
 
L
R
 
S
A
 
P
M
 
E
E
 
R
K
 
A
I
 
I
R
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
C
 
F
L
 
A
S
 
G
D
|
D
I
 
I
L
 
L
P
 
S
T
|
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
G
G
 
G
A
 
L
V
 
I
T
 
Q
A
 
G
G
 
Q
V
 
L
G
 
R
P
 
P
G
 
G
S
 
D
T
 
S
V
 
V
Y
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
A
 
M
A
 
A
A
 
I
A
 
E
S
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
A
G
 
I
D
|
D
V
x
R
N
 
I
P
 
P
I
 
E
R
|
R
L
 
L
A
 
E
H
 
R
A
 
A
K
 
A
A
 
S
Q
 
L
G
 
G
F
 
A
E
 
I
I
 
P
A
 
I
D
 
N
L
 
A
S
 
E
T
 
Q
D
 
E
T
 
N
P
 
P
L
 
V
H
 
R
E
 
-
Q
 
R
I
 
V
A
 
R
A
 
S
L
 
E
L
 
T
G
 
N
E
 
D
P
 
E
E
 
G
V
 
P
D
 
D
C
 
L
A
 
V
V
 
L
D
 
E
A
|
A
V
|
V
G
 
G
F
 
G
E
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
H
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
T
 
A
V
 
T
L
 
L
N
 
S
S
 
L
L
 
A
M
 
L
G
 
E
V
 
M
V
 
V
R
 
R
V
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
R
I
 
V
G
 
S
I
 
A
P
x
V
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
V
|
V
D
 
D
A
 
N
A
 
A
A
 
P
K
 
-
M
 
-
G
 
-
S
 
S
L
 
F
S
 
P
I
 
F
R
 
P
F
 
L
G
 
A
L
 
S
G
 
G
W
 
L
A
 
V
K
 
K
S
 
D
H
 
L
S
 
T
F
 
F
H
 
R
T
 
I
G
 
G
Q
x
L
T
x
A
P
 
N
V
 
V
M
 
H
K
 
L
Y
 
Y
N
 
I
R
 
D
Q
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
A
A
 
L
I
 
L
M
 
A
W
 
S
D
 
G
R
 
R
I
 
L
K
 
Q
I
 
P
A
 
E
D
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
S
V
 
-
E
 
H
V
 
Y
I
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
A
P
 
P
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
E
E
 
L
F
|
F
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5ylnA Zinc dependent alcohol dehydrogenase 2 from streptococcus pneumonia - apo form
35% identity, 67% coverage: 1:267/399 of query aligns to 2:246/348 of 5ylnA

query
sites
5ylnA
M
 
M
S
 
G
G
 
S
N
 
M
R
 
K
G
 
A
V
 
Y
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
G
 
K
A
 
P
G
 
G
K
 
L
V
 
A
E
 
S
V
 
F
Q
 
V
K
 
D
I
 
V
D
 
D
Y
 
K
P
 
P
K
 
V
M
 
I
Q
 
R
D
 
K
P
 
P
R
 
T
G
 
A
R
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
I
L
 
V
R
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
K
T
 
T
N
 
T
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
Q
 
L
H
|
H
M
 
I
V
 
I
R
 
K
G
 
G
R
 
D
T
 
V
-
 
P
T
 
T
A
 
C
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
L
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
I
 
G
T
 
I
G
 
G
E
 
I
V
 
V
I
 
E
E
 
E
K
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
S
N
 
N
L
 
F
Q
 
K
I
 
K
G
 
G
D
 
D
L
 
K
V
 
V
S
 
L
V
 
I
P
 
S
F
 
C
N
 
V
V
 
C
A
 
A
C
|
C
G
 
G
R
 
K
C
|
C
R
 
Y
S
 
Y
C
|
C
K
 
K
E
 
K
Q
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
C
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
I
Y
 
Y
G
 
A
Y
 
H
V
x
C
-
 
E
D
 
D
M
 
E
G
 
G
D
 
G
W
 
W
T
 
I
-
 
F
-
 
I
-
 
D
G
 
G
G
 
M
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
L
F
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
H
A
 
A
D
 
D
F
 
N
N
 
T
L
 
L
L
 
Y
K
 
H
L
 
T
P
 
P
D
 
-
R
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
E
K
 
D
I
 
L
R
 
S
D
 
D
L
 
-
T
 
E
C
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
M
I
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
H
 
E
-
 
I
G
 
G
A
 
V
V
 
L
T
 
K
A
 
G
G
 
K
V
 
V
G
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
C
T
 
S
V
 
V
Y
 
A
V
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
L
S
 
T
A
 
A
R
 
Q
L
 
F
L
 
Y
G
 
S
A
 
P
A
 
A
V
 
K
V
 
L
I
 
I
I
 
M
G
 
V
D
 
D
V
 
L
N
 
D
P
 
D
I
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
E
H
 
T
A
 
A
K
 
L
A
 
S
Q
 
F
G
 
G
F
 
A
E
 
T
I
 
H
A
 
K
D
 
V
L
 
N
S
 
S
T
 
S
D
 
D
-
 
P
T
 
E
P
 
K
L
 
A
H
 
I
E
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
Y
A
 
D
L
 
L
L
 
T
G
 
D
E
 
G
P
 
R
E
 
G
V
 
V
D
 
D
C
 
V
A
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
I
E
 
P
A
 
A

P07913 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 54% coverage: 37:250/399 of query aligns to 28:227/341 of P07913

query
sites
P07913
V
 
L
I
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
I
V
 
R
S
 
K
T
 
T
N
 
A
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
T
D
 
D
Q
 
V
H
 
H
M
 
I
V
 
Y
R
 
N
G
 
W
R
 
D
T
 
E
T
 
W
A
 
S
Q
 
Q
T
 
K
G
 
T
-
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
P
L
 
M
V
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
E
 
E
I
 
Y
T
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
G
K
 
I
G
 
G
S
 
Q
G
 
E
V
 
V
E
 
K
N
 
G
L
 
F
Q
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
R
V
 
V
S
 
S
V
 
G
P
 
E
F
 
G
N
 
H
V
 
I
A
 
T
C
 
C
G
 
G
R
 
H
C
 
C
R
 
R
S
 
N
C
 
C
K
 
R
E
 
G
Q
 
G
H
 
R
T
 
T
G
 
H
V
 
L
C
 
C
-
 
R
-
 
N
-
 
T
L
 
I
S
 
G
V
 
V
N
 
G
P
 
V
A
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
G
G
 
C
A
 
F
Y
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
L
F
 
V
V
 
I
P
 
P
Y
 
A
A
 
-
D
 
-
F
 
F
N
 
N
L
 
A
L
 
F
K
 
K
L
 
I
P
 
P
D
 
D
R
 
N
D
 
I
R
 
S
A
 
-
M
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
C
 
A
L
 
I
S
 
F
D
 
D
I
 
P
L
 
F
P
 
G
T
 
N
G
 
A
Y
 
V
H
 
H
G
 
T
A
 
A
V
 
L
T
 
S
A
 
F
G
 
D
V
 
L
G
 
-
P
 
V
G
 
G
S
 
E
T
 
D
V
 
V
Y
 
L
V
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
H
L
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
P
 
E
I
 
Y
R
 
R
L
 
L
A
 
E
H
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
F
 
I
E
 
T
I
 
R
A
 
A
D
 
V
L
 
N
S
 
V
T
 
A
D
 
K
T
 
E
P
 
N
L
 
L
H
 
N
E
 
D
Q
 
V
I
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
L

3gfbA L-threonine dehydrogenase (tktdh) from the hyperthermophilic archaeon thermococcus kodakaraensis (see paper)
36% identity, 49% coverage: 37:231/399 of query aligns to 30:210/347 of 3gfbA

query
sites
3gfbA
V
 
V
I
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
V
 
L
S
 
A
T
 
T
N
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
Q
 
L
H
|
H
M
 
I
V
 
Y
R
 
E
G
 
W
R
 
N
T
 
E
T
 
W
A
 
A
Q
 
Q
T
 
S
G
 
R
L
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
P
-
 
Q
V
 
I
L
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
V
T
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
K
 
V
G
 
G
S
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
E
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
Y
V
 
I
S
 
S
V
 
V
P
 
E
F
 
T
N
 
H
V
 
I
A
 
V
C
|
C
G
 
G
R
 
K
C
|
C
R
 
Y
S
 
A
C
|
C
K
 
K
E
 
H
Q
 
N
H
 
R
T
 
Y
G
 
H
V
 
V
C
|
C
L
 
Q
S
 
N
V
 
T
N
x
K
P
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
I
Y
 
F
G
 
G
Y
 
-
V
 
V
D
 
D
M
 
M
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
D
G
 
G
G
 
V
Q
 
F
A
 
A
E
 
H
Y
 
Y
A
 
A
F
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
 
A
A
 
K
D
 
-
F
 
-
N
 
N
L
 
A
L
 
W
K
 
K
L
 
N
P
 
P
D
 
-
R
 
K
D
 
D
R
 
M
A
 
P
M
 
P
E
 
E
K
 
Y
I
 
A
R
 
A
D
 
L
L
 
Q
T
 
E
C
x
P
L
 
L
S
 
G
D
 
N
I
x
A
L
 
V
P
 
D
T
 
T
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
T
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
P
G
 
I
P
 
A
G
 
G
S
 
R
T
 
S
V
 
T
Y
 
L
V
 
I
A
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
V
x
L
G
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
I
A
 
A
S
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
Y
V
 
P
V
 
V
I
 
I
I
 
V
G
x
S
D
x
E
V
x
P
N
 
S
P
 
E
I
 
F
R
|
R
L
 
R
A
 
K
H
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
K
Q
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q5JI69 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) (Pyrococcus kodakaraensis (strain KOD1)) (see paper)
36% identity, 49% coverage: 37:231/399 of query aligns to 32:212/350 of Q5JI69

query
sites
Q5JI69
V
 
V
I
 
L
L
 
I
R
 
K
V
 
V
V
 
L
S
 
A
T
 
T
N
 
S
I
 
I
C
 
C
G
 
G
S
 
T
D
 
D
Q
 
L
H
 
H
M
 
I
V
 
Y
R
 
E
G
 
W
R
 
N
T
 
E
T
 
W
A
 
A
Q
 
Q
T
 
S
G
 
R
L
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
P
-
 
Q
V
 
I
L
 
M
G
 
G
H
 
H
E
 
E
I
 
V
T
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
K
 
V
G
 
G
S
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
E
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
Y
V
 
I
S
 
S
V
 
V
P
 
E
F
 
T
N
 
H
V
 
I
A
 
V
C
 
C
G
 
G
R
 
K
C
 
C
R
 
Y
S
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
H
Q
 
N
H
 
R
T
 
Y
G
 
H
V
 
V
C
 
C
L
 
Q
S
 
N
V
 
T
N
 
K
P
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
I
Y
 
F
G
 
G
Y
 
-
V
 
V
D
 
D
M
 
M
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
D
G
 
G
G
 
V
Q
 
F
A
 
A
E
 
H
Y
 
Y
A
 
A
F
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
 
A
A
 
K
D
 
-
F
 
-
N
 
N
L
 
A
L
 
W
K
 
K
L
 
N
P
 
P
D
 
-
R
 
K
D
 
D
R
 
M
A
 
P
M
 
P
E
 
E
K
 
Y
I
 
A
R
 
A
D
 
L
L
 
Q
T
 
E
C
 
P
L
 
L
S
 
G
D
 
N
I
 
A
L
 
V
P
 
D
T
 
T
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
T
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
P
G
 
I
P
 
A
G
 
G
S
 
R
T
 
S
V
 
T
Y
 
L
V
 
I
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
x
L
G
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
I
A
 
A
S
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
Y
V
 
P
V
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
S
D
x
E
V
 
P
N
 
S
P
 
E
I
 
F
R
|
R
L
 
R
A
 
K
H
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
K
Q
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7y9pA Xylitol dehydrogenase s96c/s99c/y102c mutant(thermostabilized form) from pichia stipitis (see paper)
30% identity, 66% coverage: 2:263/399 of query aligns to 1:260/357 of 7y9pA

query
sites
7y9pA
S
 
T
G
 
A
N
 
N
R
 
P
G
 
S
V
 
L
V
 
V
Y
 
L
L
 
N
G
 
K
A
 
I
G
 
D
K
 
D
V
 
I
E
 
S
V
 
F
Q
 
E
K
 
T
I
 
Y
D
 
D
Y
 
A
P
 
P
K
 
E
M
 
I
Q
 
S
D
 
E
P
 
P
R
 
T
G
 
D
R
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
V
I
 
L
L
 
V
R
 
Q
V
 
V
V
 
K
S
 
K
T
 
T
N
 
G
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
S
D
 
D
Q
 
I
H
 
H
M
 
F
V
 
Y
R
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
I
G
 
G
R
 
N
T
 
F
T
 
V
A
 
L
Q
 
T
T
 
K
G
 
P
L
 
M
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
S
T
 
A
G
 
G
E
 
T
V
 
V
I
 
V
E
 
Q
K
 
V
G
 
G
S
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
T
N
 
S
L
 
L
Q
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
N
V
 
V
S
 
A
V
 
I
P
 
E
F
 
P
N
 
G
V
 
I
A
 
P
C
|
C
G
 
R
R
 
F
C
|
C
R
 
D
S
 
E
C
|
C
K
 
K
E
 
S
Q
 
G
H
 
H
T
 
Y
G
 
N
V
 
L
C
|
C
-
 
P
-
 
H
-
 
M
-
 
A
L
 
F
S
 
A
V
 
A
N
 
T
P
 
P
A
 
N
R
 
E
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
N
W
 
P
T
 
P
G
 
G
G
 
T
Q
 
L
A
 
C
E
 
K
Y
 
Y
A
 
F
F
 
K
V
 
S
P
 
P
Y
 
-
A
 
E
D
 
D
F
 
F
N
 
-
L
 
L
L
 
V
K
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
R
 
H
D
 
V
R
 
S
A
 
-
M
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
-
R
 
L
D
 
E
L
 
L
T
 
G
C
 
A
L
 
L
S
 
V
D
 
E
I
 
P
L
 
L
P
 
S
T
 
V
G
 
G
Y
 
V
H
 
H
G
 
A
A
 
S
V
 
K
T
 
L
A
 
G
G
 
S
V
 
V
G
 
A
P
 
F
G
 
G
S
 
D
T
 
Y
V
 
V
Y
 
A
V
 
V
A
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
G
V
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
V
D
 
D
V
 
I
N
 
F
P
 
D
I
 
N
R
 
K
L
 
L
A
 
K
H
 
M
A
 
A
K
 
K
A
 
D
Q
 
I
G
 
G
F
 
A
E
 
A
I
 
T
A
 
H
D
 
T
L
 
F
S
 
N
T
 
S
D
 
K
T
 
T
P
 
G
L
 
G
H
 
S
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
I
A
 
K
L
 
A
L
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
C
-
 
T
-
 
G
-
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
C
V
 
I
D
 
K
C
 
L
A
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I

3fplA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of c. Beijerinckii adh by t. Brockii adh (see paper)
34% identity, 57% coverage: 38:264/399 of query aligns to 28:244/351 of 3fplA

query
sites
3fplA
I
 
I
L
 
V
R
 
R
V
 
P
V
 
L
S
 
A
T
 
V
N
 
S
I
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
Q
 
I
H
|
H
M
 
T
V
 
V
-
 
F
R
 
E
G
 
G
R
 
A
T
 
L
T
 
G
A
 
D
Q
 
R
T
 
K
G
 
N
L
 
M
V
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
A
T
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
K
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
E
V
 
V
E
 
K
N
 
D
L
 
F
Q
 
K
I
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
R
V
 
V
S
 
I
V
 
V
P
 
P
F
 
C
N
 
T
V
 
T
A
 
P
C
x
D
G
 
W
R
 
R
C
x
S
R
 
L
S
 
E
C
x
V
K
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
F
E
 
Q
Q
 
Q
H
 
H
T
x
S
G
 
N
V
 
G
C
 
M
L
 
L
S
 
A
V
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
G
Y
 
W
G
 
K
Y
 
F
V
 
S
D
 
N
M
 
F
G
 
K
D
 
D
W
 
G
T
 
V
G
 
F
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
Y
 
Y
A
 
F
F
 
H
V
 
V
P
 
N
Y
 
D
A
 
A
D
 
D
F
 
M
N
 
N
L
 
L
L
 
A
K
 
I
L
 
L
P
 
P
D
 
-
R
 
K
D
 
D
R
 
M
A
 
P
M
 
L
E
 
E
K
 
-
I
 
-
R
 
-
D
 
N
L
 
A
T
 
V
C
 
M
L
 
I
S
 
T
D
|
D
I
 
M
L
 
M
P
 
T
T
|
T
G
 
G
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
E
T
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
I
G
 
E
P
 
L
G
 
G
S
 
A
T
 
T
V
 
V
Y
 
A
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
M
A
 
A
A
 
V
A
 
A
S
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
G
V
 
R
V
 
I
I
 
I
I
 
A
G
 
V
D
 
G
V
 
S
N
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
C
L
 
V
A
 
D
H
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
Y
Q
 
Y
G
 
G
F
 
A
E
 
T
I
 
D
A
 
I
D
 
V
L
 
N
S
 
Y
T
 
K
D
 
D
T
 
G
P
 
P
L
 
I
H
 
E
E
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
M
A
 
N
L
 
L
L
 
T
G
 
E
E
 
G
P
 
K
E
 
G
V
 
V
D
 
D
C
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
I
A
 
A
V
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7xy9A Cryo-em structure of secondary alcohol dehydrogenases tbsadh after carrier-free immobilization based on weak intermolecular interactions
34% identity, 57% coverage: 38:264/399 of query aligns to 29:245/344 of 7xy9A

query
sites
7xy9A
I
 
I
L
 
V
R
 
R
V
 
P
V
 
L
S