SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_21000 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_21000 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3jynA Crystal structures of pseudomonas syringae pv. Tomato dc3000 quinone oxidoreductase complexed with NADPH (see paper)
49% identity, 100% coverage: 1:325/326 of query aligns to 1:324/325 of 3jynA

query
sites
3jynA
M
 
M
A
 
A
K
 
K
A
 
R
V
 
I
R
 
Q
F
 
F
Y
 
S
E
 
T
T
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
E
Y
 
Y
E
 
V
E
 
D
V
 
F
D
 
E
V
 
P
G
 
E
E
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
Q
Q
 
A
V
 
V
R
 
V
L
 
V
R
 
R
H
 
N
V
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
N
|
N
Y
x
F
A
x
I
D
|
D
T
|
T
Y
|
Y
F
 
Y
R
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
A
P
 
P
-
 
F
M
 
L
P
 
P
N
 
S
G
 
G
M
 
L
G
 
G
V
x
A
E
|
E
A
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
E
V
 
V
T
 
T
N
 
R
V
 
F
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
A
Y
 
Y
-
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
E
E
 
V
R
 
H
L
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
E
A
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
V
K
 
K
L
 
L
P
 
A
E
 
D
T
 
S
I
 
V
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
M
M
x
L
R
 
K
G
 
G
L
 
L
T
|
T
S
 
V
S
 
Q
Y
|
Y
L
 
L
M
 
L
R
 
R
R
 
Q
I
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
F
 
V
K
 
K
A
 
P
G
 
G
D
 
E
S
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
|
A
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
S
I
 
L
V
 
A
S
 
C
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
K
V
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
|
S
T
 
S
E
 
P
V
 
E
K
|
K
G
 
A
E
 
A
I
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
A
H
 
L
G
 
G
C
 
A
D
 
W
H
 
E
V
 
T
I
 
I
N
 
D
Y
|
Y
S
 
S
H
 
H
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
V
 
V
R
 
L
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
C
N
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
S
x
G
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
T
 
T
F
 
W
M
 
L
G
 
T
S
 
S
L
 
L
D
 
D
S
 
S
L
 
V
K
 
A
R
 
P
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
V
V
 
V
C
 
S
V
x
F
G
|
G
T
 
N
A
|
A
S
|
S
G
 
G
P
 
P
I
 
V
P
 
S
A
 
G
F
 
V
D
 
N
P
 
L
V
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
G
 
D
S
 
S
L
 
V
F
 
Y
M
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
P
A
x
T
L
|
L
A
 
G
D
 
S
Y
 
Y
I
 
A
A
 
N
D
 
N
P
 
A
A
 
Q
E
 
N
K
 
L
A
 
Q
A
 
T
L
 
M
A
 
A
G
 
D
E
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
M
V
 
L
G
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
L
K
 
K
I
 
V
E
 
D
I
 
G
N
 
I
Q
 
E
H
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
A
Q
 
K
A
 
A
H
 
Q
R
 
I
D
 
E
L
 
L
E
 
S
S
 
A
R
|
R
K
 
R
T
 
T
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
 
T
I
 
I
F
 
L
V
 
I

P28304 Quinone oxidoreductase 1; NADPH:quinone reductase 1; Zeta-crystallin homolog protein; EC 1.6.5.5 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:325/326 of query aligns to 1:326/327 of P28304

query
sites
P28304
M
 
M
A
 
A
K
 
T
A
 
R
V
 
I
R
 
E
F
 
F
Y
 
H
E
 
K
T
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
Y
 
A
E
 
V
E
 
E
V
 
F
D
 
T
V
 
P
G
 
A
E
 
D
P
 
P
G
 
A
P
 
E
G
 
N
Q
 
E
V
 
I
R
 
Q
L
 
V
R
 
E
H
 
N
V
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
N
Y
x
F
A
x
I
D
|
D
T
|
T
Y
|
Y
F
 
I
R
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
P
P
 
P
-
 
S
M
 
L
P
 
P
N
 
S
G
 
G
M
 
L
G
 
G
V
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
Q
 
S
A
 
K
I
 
V
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
K
N
 
H
V
 
I
Q
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
V
Y
 
Y
T
 
A
G
 
Q
F
 
-
L
 
-
N
 
S
T
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
S
E
 
V
R
 
H
L
 
N
I
 
I
P
 
I
A
 
A
A
 
D
P
 
K
L
 
A
I
 
A
K
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
A
T
 
A
I
 
I
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
S
T
 
F
M
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
V
S
 
Y
Y
|
Y
L
 
L
M
 
L
R
 
R
R
 
K
I
 
T
Y
 
Y
D
 
E
F
 
I
K
 
K
A
 
P
G
 
D
D
 
E
S
 
Q
I
 
F
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
A
S
 
C
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
K
V
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
x
G
T
|
T
E
x
A
V
x
Q
K
|
K
G
 
A
E
 
Q
I
 
S
A
 
A
R
 
L
A
 
K
H
 
A
G
 
G
C
 
A
D
 
W
H
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
N
Y
|
Y
S
 
R
H
 
E
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
V
Q
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
G
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
V
N
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
S
|
S
V
 
V
G
 
G
K
 
R
N
 
D
T
 
T
F
 
W
M
 
E
G
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
D
S
 
C
L
 
L
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
M
V
 
V
C
 
S
V
x
F
G
|
G
T
x
N
A
x
S
S
 
S
G
 
G
P
 
A
I
 
V
P
 
T
A
 
G
F
 
V
D
 
N
P
 
L
V
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
N
M
 
Q
K
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
F
 
Y
M
 
V
T
 
T
R
 
R
P
|
P
A
x
S
L
|
L
A
 
Q
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
T
D
 
T
P
 
R
A
 
E
E
 
E
K
 
L
A
 
T
A
 
E
L
 
A
A
 
S
G
 
N
E
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
S
L
 
L
V
 
I
G
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
V
I
 
I
K
 
K
I
 
V
E
 
D
I
 
V
-
 
A
-
 
E
N
 
Q
Q
 
Q
H
 
K
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
Q
Q
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
E
D
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
R
|
R
K
 
A
T
 
T
T
 
Q
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
L
F
 
L
V
 
I

1qorA Crystal structure of escherichia coli quinone oxidoreductase complexed with NADPH (see paper)
46% identity, 99% coverage: 2:325/326 of query aligns to 1:325/326 of 1qorA

query
sites
1qorA
A
 
A
K
 
T
A
 
R
V
 
I
R
 
E
F
 
F
Y
 
H
E
 
K
T
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
Y
 
A
E
 
V
E
 
E
V
 
F
D
 
T
V
 
P
G
 
A
E
 
D
P
 
P
G
 
A
P
 
E
G
 
N
Q
 
E
V
 
I
R
 
Q
L
 
V
R
 
E
H
 
N
V
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
I
N
|
N
Y
x
F
A
x
I
D
 
D
T
 
T
Y
|
Y
F
 
I
R
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
P
P
 
P
-
 
S
M
 
L
P
 
P
N
 
S
G
 
G
M
 
L
G
 
G
V
x
T
E
|
E
A
 
A
S
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
Q
 
S
A
 
K
I
 
V
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
K
N
 
H
V
 
I
Q
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
V
Y
 
Y
T
 
A
G
 
Q
F
 
-
L
 
-
N
 
S
T
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
S
E
 
V
R
 
H
L
 
N
I
 
I
P
 
I
A
 
A
A
 
D
P
 
K
L
 
A
I
 
A
K
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
A
T
 
A
I
 
I
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
S
T
 
F
M
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
L
T
|
T
S
 
V
S
 
Y
Y
|
Y
L
 
L
M
 
L
R
 
R
R
 
K
I
 
T
Y
 
Y
D
 
E
F
 
I
K
 
K
A
 
P
G
 
D
D
 
E
S
 
Q
I
 
F
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
A
S
 
C
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
K
V
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
|
V
S
x
G
T
 
T
E
 
A
V
 
Q
K
|
K
G
 
A
E
 
Q
I
 
S
A
 
A
R
 
L
A
 
K
H
 
A
G
 
G
C
 
A
D
 
W
H
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
N
Y
|
Y
S
 
R
H
 
E
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
V
Q
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
G
G
 
G
V
 
K
G
 
K
V
 
V
N
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
S
|
S
V
 
V
G
 
G
K
 
R
N
 
D
T
 
T
F
 
W
M
 
E
G
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
D
S
 
C
L
 
L
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
M
V
 
V
C
 
S
V
x
F
G
 
G
T
 
N
A
x
S
S
|
S
G
 
G
P
 
A
I
 
V
P
 
T
A
 
G
F
 
V
D
 
N
P
 
L
V
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
N
M
 
Q
K
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
F
 
Y
M
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
P
A
x
S
L
 
L
A
 
Q
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
T
D
 
T
P
 
R
A
 
E
E
 
E
K
 
L
A
 
T
A
 
E
L
 
A
A
 
S
G
 
N
E
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
S
L
 
L
V
 
I
G
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
V
I
 
I
K
 
K
I
 
V
E
 
D
I
 
V
-
 
A
-
 
E
N
 
Q
Q
 
Q
H
 
K
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
Q
Q
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
E
D
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
R
|
R
K
 
A
T
 
T
T
 
Q
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
L
F
 
L
V
 
I

4rvuA The native structure of mycobacterial rv1454c complexed with NADPH (see paper)
44% identity, 99% coverage: 4:325/326 of query aligns to 4:328/329 of 4rvuA

query
sites
4rvuA
A
 
A
V
 
I
R
 
E
F
 
V
Y
 
T
E
 
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
Y
 
H
E
 
V
E
 
D
V
 
Q
D
 
P
V
 
Q
G
 
P
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
P
 
H
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
R
 
L
L
 
I
R
 
K
H
 
A
V
 
E
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
V
N
 
N
Y
x
F
A
 
I
D
 
D
T
 
T
Y
|
Y
F
 
F
R
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
I
 
R
P
 
E
M
 
L
P
 
P
N
 
F
G
 
V
M
 
I
G
 
G
V
 
S
E
 
E
A
 
V
S
 
C
G
 
G
V
 
T
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
N
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
A
V
 
I
Q
 
S
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
V
Y
 
S
T
 
A
G
 
-
F
 
-
L
 
-
N
 
S
T
 
A
L
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
T
 
E
E
 
F
R
 
C
L
 
T
I
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
S
P
 
L
L
 
T
I
 
A
K
 
K
L
 
V
P
 
P
E
 
D
T
 
D
I
 
V
S
 
T
F
 
S
E
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
A
T
 
L
M
x
L
R
 
K
G
 
G
L
 
L
T
|
T
S
 
A
S
 
H
Y
|
Y
L
 
L
M
 
L
R
 
K
R
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
P
F
 
V
K
 
K
A
 
R
G
 
G
D
 
D
S
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
V
H
 
H
A
|
A
A
 
G
A
 
A
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
S
 
T
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
K
 
T
L
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
V
T
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
T
T
 
T
V
 
V
S
|
S
T
 
T
E
 
A
V
 
E
K
|
K
G
 
A
E
 
K
I
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
D
H
 
A
G
 
G
C
 
A
D
 
D
H
 
V
V
 
V
I
 
L
N
 
D
Y
|
Y
S
 
P
H
 
-
E
 
E
D
 
D
V
 
A
A
 
W
Q
 
Q
-
 
F
-
 
A
-
 
G
R
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
G
G
 
G
V
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
Q
V
 
A
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
S
x
G
V
 
V
G
 
G
K
 
A
N
 
T
T
 
T
F
 
F
M
 
D
G
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
A
R
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
T
M
 
L
V
 
A
C
 
L
V
x
F
G
|
G
T
 
A
A
|
A
S
|
S
G
 
G
P
 
P
I
 
V
P
 
P
A
 
P
F
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
Q
L
 
R
L
 
L
A
 
N
M
 
A
K
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
V
F
 
Y
M
 
L
T
 
T
R
 
R
P
 
P
A
 
S
L
|
L
A
 
F
D
 
H
Y
 
F
I
 
T
A
 
R
D
 
T
P
 
G
A
 
E
E
 
E
K
 
F
A
 
S
A
 
W
L
 
R
A
 
A
G
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
A
V
 
I
G
 
N
S
 
S
G
 
E
R
 
A
I
 
I
K
 
T
I
 
V
E
 
A
I
 
V
N
 
G
Q
 
G
H
 
R
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
Q
 
R
A
 
A
H
 
H
R
 
Q
D
 
D
L
 
L
E
|
E
S
 
A
R
|
R
K
 
K
T
 
T
T
 
V
G
 
G
S
 
S
S
 
V
I
 
V
F
 
L
V
 
L

3qwbA Crystal structure of saccharomyces cerevisiae zeta-crystallin-like quinone oxidoreductase zta1 complexed with NADPH (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:326/326 of query aligns to 6:328/330 of 3qwbA

query
sites
3qwbA
K
 
K
A
 
V
V
 
I
R
 
L
F
 
I
Y
 
D
E
 
E
T
 
I
G
 
G
G
 
G
P
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
K
Y
 
Y
E
 
E
E
 
D
V
 
Y
D
 
P
V
 
V
G
 
P
E
 
S
P
 
I
G
 
S
P
 
E
G
 
E
Q
 
E
V
 
L
R
 
L
L
 
I
R
 
K
H
 
N
V
 
K
A
 
Y
V
 
T
G
 
G
L
 
V
N
|
N
Y
|
Y
A
x
I
D
 
E
T
 
S
Y
|
Y
F
 
F
R
 
R
N
 
K
G
 
G
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
I
 
C
P
 
E
M
 
K
P
 
P
N
 
Y
G
 
V
M
 
L
G
 
G
V
x
R
E
|
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
T
V
 
V
Q
 
V
A
 
A
I
 
K
G
 
G
E
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
N
 
N
V
 
F
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Q
V
 
V
T
 
A
Y
 
Y
T
 
I
G
 
S
F
 
N
L
 
-
N
 
S
T
 
T
L
 
F
G
 
A
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
T
 
-
E
 
-
R
 
K
L
 
I
I
 
S
P
 
S
A
 
Q
A
 
G
P
 
P
L
 
V
I
 
M
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
K
T
 
G
I
 
T
S
 
S
F
 
D
E
 
E
T
 
E
A
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
A
 
A
A
 
A
M
 
G
T
 
L
M
 
L
R
x
Q
G
 
V
L
 
L
T
|
T
S
 
A
S
 
L
Y
 
S
L
x
F
M
 
T
R
 
N
R
 
E
I
 
A
Y
 
Y
D
 
H
F
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
G
D
 
D
S
 
Y
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
F
A
|
A
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
Q
W
 
L
A
 
L
K
 
K
L
 
M
L
 
K
G
 
G
L
 
A
T
 
H
V
 
T
I
 
I
G
 
A
T
 
V
V
x
A
S
|
S
T
 
T
E
 
D
V
 
E
K
|
K
G
 
L
E
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
E
H
 
Y
G
 
G
C
 
A
D
 
E
H
 
Y
V
 
L
I
 
I
N
 
N
Y
 
A
S
 
S
H
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
L
Q
 
R
R
 
Q
V
 
V
R
 
L
E
 
K
L
 
F
T
 
T
D
 
N
G
 
G
V
 
K
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
A
V
 
S
F
 
F
D
 
D
S
|
S
V
|
V
G
 
G
K
 
K
N
 
D
T
 
T
F
 
F
M
 
E
G
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
A
S
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
V
M
 
F
V
 
V
C
 
S
V
x
F
G
 
G
T
 
N
A
|
A
S
 
S
G
 
G
P
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
P
F
 
F
D
 
S
P
 
I
V
 
T
L
 
R
L
 
L
A
 
S
M
 
P
K
 
K
G
 
-
S
 
N
L
 
I
F
 
T
M
 
L
T
 
V
R
 
R
P
 
P
A
x
Q
L
 
L
A
 
Y
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
E
K
 
W
A
 
K
A
 
Y
L
 
Y
A
 
S
G
 
D
E
 
E
L
 
F
F
 
F
D
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
N
S
 
S
G
 
K
R
 
K
I
 
L
K
 
N
I
 
I
E
 
K
I
 
I
N
 
Y
Q
 
K
H
 
T
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
R
D
 
D
A
 
Y
V
 
R
Q
 
T
A
 
A
H
 
A
R
 
A
D
 
D
L
 
I
E
 
E
S
 
S
R
|
R
K
 
K
T
 
T
T
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
L
I
 
V
F
 
L
V
 
E
I
 
I

O74489 Probable quinone oxidoreductase; NADPH:quinone reductase; EC 1.6.5.5 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:325/326 of query aligns to 6:321/329 of O74489

query
sites
O74489
V
 
V
R
 
Q
F
 
V
Y
 
S
E
 
K
T
 
T
G
 
G
G
 
P
P
 
S
D
 
S
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
Y
 
V
E
 
I
E
 
T
V
 
K
D
 
E
V
 
I
G
 
P
E
 
K
P
 
P
G
 
A
P
 
P
G
 
N
Q
 
G
V
 
L
R
 
V
L
 
I
R
 
K
H
 
N
V
 
A
A
 
Y
V
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
I
D
 
D
T
 
T
Y
 
Y
F
 
L
R
 
R
N
 
T
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
P
 
T
I
 
A
P
 
P
M
 
L
P
 
P
N
 
Y
G
 
I
M
 
P
G
 
G
V
 
K
E
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
K
V
 
V
-
 
E
T
 
A
N
 
D
V
 
F
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
V
Y
 
Y
T
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
L
N
 
T
T
 
P
L
 
F
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
T
 
Q
E
 
Y
R
 
T
L
 
N
I
 
V
P
 
P
A
 
T
A
 
T
P
 
L
L
 
V
I
 
S
K
 
K
L
 
V
P
 
S
E
 
E
T
 
K
I
 
I
S
 
P
F
 
L
E
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
M
 
A
T
 
L
M
 
L
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
A
S
 
Y
Y
 
T
L
 
L
M
 
I
R
 
E
R
 
E
I
 
A
Y
 
Y
D
 
P
F
 
V
K
 
K
A
 
T
G
 
G
D
 
D
S
 
T
I
 
V
L
 
V
L
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
L
S
 
C
Q
 
Q
W
 
M
A
 
L
K
 
R
L
 
A
L
 
R
G
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
V
I
 
I
G
 
A
T
 
T
V
 
A
S
 
S
T
 
T
E
 
A
V
 
A
K
 
K
G
 
R
E
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
I
A
 
K
H
 
N
G
 
G
C
 
A
D
 
E
H
 
-
V
 
-
I
 
I
N
 
A
Y
 
C
S
|
S
H
 
Y
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
T
Q
 
K
R
 
V
V
 
V
R
 
A
E
 
D
L
 
Y
T
 
T
D
 
N
G
 
G
V
 
K
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
A
V
 
A
F
 
Y
D
 
D
S
 
S
V
 
V
G
 
G
K
 
I
N
 
D
T
 
T
F
 
L
M
 
S
G
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
N
R
 
G
G
 
G
L
 
T
M
 
M
V
 
V
C
 
S
V
 
F
G
 
G
T
 
N
A
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
A
I
 
I
P
 
D
A
 
A
F
 
I
D
 
-
P
 
P
V
 
L
L
 
K
L
 
F
A
 
L
M
 
S
K
 
A
G
 
R
S
 
C
L
 
L
F
 
K
M
 
F
T
 
V
R
 
R
P
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
F
D
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
T
D
 
G
P
 
H
A
 
A
E
 
V
K
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
Y
A
 
V
G
 
S
E
 
R
L
 
L
F
 
W
D
 
K
L
 
E
V
 
I
G
 
L
S
 
D
G
 
N
R
 
N
I
 
L
K
 
N
I
 
I
E
 
A
I
 
I
N
 
H
Q
 
H
H
 
I
Y
 
F
A
 
K
L
 
L
Q
 
S
D
 
E
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
R
 
D
D
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
S
R
 
R
K
 
A
T
 
T
T
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
L
I
 
L
F
 
L
V
 
L

2eihA Crystal structure of NAD-dependent alcohol dehydrogenase
30% identity, 99% coverage: 3:326/326 of query aligns to 2:342/343 of 2eihA

query
sites
2eihA
K
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
V
F
 
M
Y
 
R
E
 
A
T
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
E
Y
 
V
E
 
A
E
 
D
V
 
L
D
 
P
V
 
V
G
 
P
E
 
E
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
K
Q
 
E
V
 
V
R
 
R
L
 
V
R
 
R
H
 
L
V
 
K
A
 
A
V
 
A
G
 
A
L
 
L
N
|
N
Y
x
H
A
x
L
D
 
D
T
 
V
Y
x
W
F
 
V
R
 
R
N
 
K
G
 
G
-
 
V
-
 
A
T
 
S
Y
 
P
P
 
K
I
 
L
P
 
P
M
 
L
P
 
P
N
 
H
G
 
V
M
 
L
G
 
G
V
x
A
E
x
D
A
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
E
N
 
G
V
 
F
Q
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
E
V
 
V
T
 
V
Y
 
I
T
 
N
G
 
P
F
 
G
L
 
L
N
 
S
T
x
C
-
 
G
-
 
R
-
x
C
-
 
E
-
 
R
-
x
C
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
x
C
-
 
P
-
 
R
-
 
Y
-
x
Q
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
R
L
 
H
G
 
G
A
 
T
Y
 
Y
S
 
A
T
 
E
E
 
Y
R
 
V
L
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
E
A
 
A
P
 
N
L
 
L
I
 
A
K
 
P
L
 
K
P
 
P
E
 
K
T
 
N
I
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
I
T
 
P
M
x
L
R
 
T
G
 
F
L
 
L
T
|
T
S
 
A
S
 
W
Y
 
Q
L
 
M
M
 
V
R
 
V
R
 
D
I
 
K
Y
 
L
D
 
G
F
 
V
K
 
R
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
D
I
 
V
L
 
L
L
 
V
H
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
G
G
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
S
L
 
V
I
 
A
V
 
A
S
 
I
Q
 
Q
W
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
L
 
A
T
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
A
T
 
T
V
 
A
S
 
G
T
 
S
E
 
E
V
 
D
K
 
K
G
 
L
E
 
R
I
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
A
H
 
L
G
 
G
C
 
A
D
 
D
H
 
E
V
 
T
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
S
 
T
H
 
H
E
 
P
D
 
D
V
 
W
A
 
P
Q
 
K
R
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
R
L
 
L
T
 
T
D
 
G
G
 
G
V
 
K
G
 
G
V
 
A
N
 
D
V
 
K
V
 
V
F
 
V
D
 
D
S
 
H
V
 
T
G
 
G
K
 
A
N
 
L
T
 
Y
F
 
F
M
 
E
G
 
G
S
 
V
L
 
I
D
 
K
S
 
A
L
 
T
K
 
A
R
 
N
R
 
G
G
 
G
L
 
R
M
 
I
V
 
A
C
 
I
V
 
A
G
 
G
T
 
A
A
 
S
S
 
S
G
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
P
 
P
I
 
F
P
 
A
A
 
H
F
 
V
D
 
F
P
 
Y
V
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
S
M
 
I
K
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
T
F
 
M
M
 
A
T
 
S
R
 
K
P
 
S
A
 
R
L
 
L
A
 
F
D
 
P
Y
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
I
F
 
L
D
 
R
L
 
F
V
 
V
G
 
E
S
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
L
K
 
K
I
 
P
E
 
V
I
 
V
N
 
G
Q
 
Q
H
 
V
Y
 
L
A
 
P
L
 
L
Q
 
E
D
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
E
A
 
G
H
 
H
R
 
R
D
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
E
R
 
R
K
 
R
T
 
V
T
 
F
G
 
G
S
x
K
S
 
V
I
 
V
F
 
L
V
 
Q
I
 
V

1yb5A Crystal structure of human zeta-crystallin with bound NADP
28% identity, 96% coverage: 1:313/326 of query aligns to 2:310/324 of 1yb5A

query
sites
1yb5A
M
 
L
A
 
M
K
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
F
 
V
Y
 
F
E
 
E
T
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
E
 
R
E
 
S
V
 
-
D
 
D
V
 
I
G
 
A
E
 
V
P
 
P
G
 
I
P
 
P
G
 
K
-
 
D
-
 
H
Q
 
Q
V
 
V
R
 
L
L
 
I
R
 
K
H
 
V
V
 
H
A
 
A
V
 
C
G
 
G
L
 
V
N
|
N
Y
x
P
A
x
V
D
 
E
T
 
T
Y
|
Y
F
 
I
R
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
-
 
S
-
 
R
-
 
K
P
 
P
I
 
L
P
 
-
M
 
L
P
 
P
N
 
Y
G
 
T
M
 
P
G
 
G
V
x
S
E
x
D
A
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
N
V
 
A
T
 
S
N
 
A
V
 
F
Q
 
K
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
F
Y
 
T
T
 
S
G
 
S
F
 
T
L
 
I
N
 
S
T
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
S
 
A
T
 
E
E
 
Y
R
 
A
L
 
L
I
 
A
P
 
A
A
 
D
A
 
H
P
 
T
L
 
V
I
 
Y
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
K
I
 
L
S
 
D
F
 
F
E
 
K
T
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
M
 
I
T
 
G
M
x
I
R
 
P
G
 
Y
L
 
F
T
|
T
S
 
A
S
 
Y
Y
 
R
L
 
A
M
 
L
R
 
I
R
 
H
I
 
S
Y
 
A
D
 
C
F
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
E
S
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
H
|
H
A
x
G
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
I
 
A
V
 
A
S
 
C
Q
 
Q
W
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
K
V
 
I
I
 
L
G
 
G
T
 
T
V
x
A
S
x
G
T
 
T
E
 
E
V
 
E
K
 
G
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
A
 
V
R
 
L
A
 
Q
H
 
N
G
 
G
C
 
A
D
 
H
H
 
E
V
 
V
I
 
F
N
 
N
Y
x
H
S
 
R
H
 
E
E
 
V
D
 
N
V
 
Y
A
 
I
Q
 
D
R
 
K
V
 
I
R
 
K
E
 
K
L
 
Y
T
 
V
D
 
G
G
 
E
V
 
K
G
 
G
V
 
I
N
 
D
V
 
I
V
 
I
F
 
I
D
 
E
S
 
M
V
x
L
G
 
A
K
 
N
N
 
V
T
x
N
F
 
L
M
 
S
G
 
K
S
 
D
L
 
L
D
 
S
S
 
L
L
 
L
K
 
S
R
 
H
R
 
G
G
 
G
L
 
R
M
 
V
V
 
I
C
 
V
V
|
V
G
 
G
T
 
S
A
 
-
S
 
R
G
 
G
P
 
T
I
 
I
P
 
E
A
 
I
F
 
N
D
 
P
P
 
R
V
 
D
L
 
T
L
 
M
A
 
A
M
 
K
K
 
E
G
 
S
S
 
S
L
 
I
F
 
I
M
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
G
L
 
V
A
x
T
D
 
L
Y
 
F
I
 
S
A
 
S
D
 
T
P
 
K
A
 
E
E
 
E
K
 
F
A
 
Q
A
 
Q
L
 
Y
A
 
A
G
 
A
E
 
A
L
 
L
F
 
Q
D
 
A
L
 
G
V
 
M
G
 
E
S
 
I
G
 
G
R
 
W
I
 
L
K
 
K
I
 
P
E
 
V
I
 
I
N
 
G
Q
 
S
H
 
Q
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
E
D
 
K
A
 
V
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
R
 
E
D
 
N
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Q08257 Quinone oxidoreductase; NADPH:quinone reductase; Zeta-crystallin; EC 1.6.5.5 from Homo sapiens (Human) (see paper)
28% identity, 96% coverage: 1:313/326 of query aligns to 7:315/329 of Q08257

query
sites
Q08257
M
 
L
A
 
M
K
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
F
 
V
Y
 
F
E
 
E
T
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
E
 
R
E
 
S
V
 
-
D
 
D
V
 
I
G
 
A
E
 
V
P
 
P
G
 
I
P
 
P
G
 
K
-
 
D
-
 
H
Q
 
Q
V
 
V
R
 
L
L
 
I
R
 
K
H
 
V
V
 
H
A
 
A
V
 
C
G
 
G
L
 
V
N
 
N
Y
 
P
A
 
V
D
 
E
T
 
T
Y
|
Y
F
 
I
R
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
-
 
S
-
 
R
-
 
K
P
 
P
I
 
L
P
 
-
M
 
L
P
|
P
N
 
Y
G
 
T
M
 
P
G
 
G
V
 
S
E
 
D
A
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
N
V
 
A
T
 
S
N
 
A
V
 
F
Q
 
K
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
F
Y
 
T
T
 
S
G
 
S
F
 
T
L
 
I
N
 
S
T
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
S
 
A
T
 
E
E
 
Y
R
 
A
L
 
L
I
 
A
P
 
A
A
 
D
A
 
H
P
 
T
L
 
V
I
 
Y
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
K
I
 
L
S
 
D
F
 
F
E
 
K
T
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
M
 
I
T
 
G
M
 
I
R
 
P
G
 
Y
L
 
F
T
 
T
S
 
A
S
 
Y
Y
 
R
L
 
A
M
 
L
R
 
I
R
 
H
I
 
S
Y
 
A
D
 
C
F
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
E
S
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
H
 
H
A
 
G
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
I
 
A
V
 
A
S
 
C
Q
 
Q
W
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
K
V
x
I
I
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
A
S
x
G
T
 
T
E
 
E
V
 
E
K
 
G
G
 
Q
E
 
K
I
 
I
A
 
V
R
 
L
A
 
Q
H
 
N
G
 
G
C
 
A
D
 
H
H
 
E
V
 
V
I
 
F
N
 
N
Y
x
H
S
 
R
H
 
E
E
 
V
D
 
N
V
 
Y
A
 
I
Q
 
D
R
 
K
V
 
I
R
 
K
E
 
K
L
 
Y
T
 
V
D
 
G
G
 
E
V
 
K
G
 
G
V
 
I
N
 
D
V
 
I
V
 
I
F
 
I
D
 
E
S
 
M
V
 
L
G
 
A
K
 
N
N
 
V
T
x
N
F
 
L
M
 
S
G
 
K
S
 
D
L
 
L
D
 
S
S
 
L
L
 
L
K
 
S
R
 
H
R
 
G
G
 
G
L
 
R
M
 
V
V
 
I
C
 
V
V
|
V
G
|
G
T
x
S
A
 
-
S
x
R
G
 
G
P
 
T
I
 
I
P
 
E
A
 
I
F
 
N
D
 
P
P
 
R
V
 
D
L
 
T
L
 
M
A
 
A
M
 
K
K
 
E
G
 
S
S
 
S
L
 
I
F
 
I
M
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
G
L
x
V
A
x
T
D
x
L
Y
 
F
I
 
S
A
 
S
D
 
T
P
 
K
A
 
E
E
 
E
K
 
F
A
 
Q
A
 
Q
L
 
Y
A
 
A
G
 
A
E
 
A
L
 
L
F
 
Q
D
 
A
L
 
G
V
 
M
G
 
E
S
 
I
G
 
G
R
 
W
I
 
L
K
 
K
I
 
P
E
 
V
I
 
I
N
 
G
Q
 
S
H
 
Q
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
E
D
 
K
A
 
V
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
R
 
E
D
 
N
L
 
I

6lhrC Crystal structure of the complex between vesicle amine transport-1 and NADP (see paper)
29% identity, 91% coverage: 30:325/326 of query aligns to 33:341/344 of 6lhrC

query
sites
6lhrC
Q
 
Q
V
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
L
V
 
R
A
 
A
V
 
C
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Y
x
F
A
 
A
D
 
D
T
 
L
Y
 
M
F
 
A
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
P
 
D
-
 
R
-
 
L
I
 
P
P
 
P
M
 
L
P
 
P
N
 
V
G
 
T
M
 
P
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
I
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
S
N
 
D
V
 
R
Q
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
M
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
V
L
 
L
N
 
N
T
 
R
L
 
S
G
 
G
A
 
M
Y
 
W
S
 
Q
T
 
E
E
 
E
R
 
V
L
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
V
P
 
Q
L
 
T
I
 
F
K
 
L
L
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
A
I
 
M
S
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
L
M
 
V
R
 
N
G
 
Y
L
 
I
T
|
T
S
 
A
S
 
Y
Y
 
M
L
 
V
M
 
L
R
 
F
R
 
D
I
 
F
Y
 
G
D
 
N
F
 
L
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
H
S
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
H
 
H
A
x
M
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
M
I
 
A
V
 
A
S
 
V
Q
 
Q
W
 
L
A
 
C
K
 
R
L
 
T
L
 
V
-
 
E
G
 
N
L
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
F
G
 
G
T
 
T
V
x
A
S
|
S
T
 
A
E
 
S
V
 
-
K
|
K
G
 
H
E
 
E
I
 
A
A
 
L
R
 
K
A
 
E
H
 
N
G
 
G
C
 
V
D
 
T
H
 
H
V
 
P
I
 
I
N
 
D
Y
|
Y
S
 
H
H
 
T
E
 
T
D
 
D
V
 
Y
A
 
V
Q
 
D
R
 
E
V
 
I
R
 
K
E
 
K
L
 
I
T
 
S
D
 
P
G
 
K
V
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
M
D
 
D
S
 
P
V
 
L
G
 
G
K
 
G
N
 
S
T
 
D
F
 
T
M
 
A
G
 
K
S
 
G
L
 
Y
D
 
N
S
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
P
R
 
M
G
 
G
L
 
K
M
 
V
V
 
V
C
 
T
V
x
Y
G
 
G
T
 
M
A
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
L
S
 
T
G
 
G
P
 
P
I
 
K
P
 
R
A
 
N
F
 
L
D
 
M
P
 
A
V
 
L
L
 
A
L
 
R
A
 
T
M
 
W
K
 
W
G
 
N
S
 
Q
L
 
F
F
 
S
M
 
V
T
 
T
R
 
A
P
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
D
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
G
-
x
F
-
x
H
-
x
L
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
A
 
D
D
 
G
P
 
E
A
 
V
E
 
E
K
 
L
A
 
V
A
 
S
-
 
G
L
 
V
A
 
V
G
 
A
E
 
R
L
 
L
F
 
L
D
 
A
L
 
L
V
 
Y
G
 
N
S
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
I
K
 
K
I
 
P
E
 
H
I
 
I
N
 
D
Q
 
S
H
 
V
Y
 
W
A
 
P
L
 
F
Q
 
E
D
 
K
A
 
V
V
 
A
Q
 
D
A
 
A
H
 
M
R
 
K
D
 
Q
L
 
M
E
 
Q
S
 
E
R
x
K
K
 
K
T
x
N
T
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
V
I
 
L
F
 
L
V
 
V

Q99536 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog; EC 1.-.-.- from Homo sapiens (Human)
29% identity, 91% coverage: 30:325/326 of query aligns to 78:386/393 of Q99536

query
sites
Q99536
Q
 
Q
V
 
L
R
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
L
V
 
R
A
 
A
V
 
C
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
F
A
 
A
D
 
D
T
 
L
Y
 
M
F
 
A
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
P
 
D
-
 
R
-
 
L
I
 
P
P
 
P
M
 
L
P
 
P
N
 
V
G
 
T
M
 
P
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
I
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
S
N
 
D
V
 
R
Q
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
M
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
V
L
 
L
N
 
N
T
 
R
L
 
S
G
 
G
A
 
M
Y
 
W
S
 
Q
T
 
E
E
 
E
R
 
V
L
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
V
P
 
Q
L
 
T
I
 
F
K
 
L
L
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
A
I
 
M
S
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
L
T
 
L
M
 
V
R
 
N
G
 
Y
L
 
I
T
 
T
S
 
A
S
 
Y
Y
 
M
L
 
V
M
 
L
R
 
F
R
 
D
I
 
F
Y
 
G
D
 
N
F
 
L
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
H
S
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
H
 
H
A
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
M
I
 
A
V
 
A
S
 
V
Q
 
Q
W
 
L
A
 
C
K
 
R
L
 
T
L
 
V
-
 
E
G
 
N
L
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
A
S
 
S
T
 
A
E
 
S
V
 
-
K
 
K
G
 
H
E
 
E
I
 
A
A
 
L
R
 
K
A
 
E
H
 
N
G
 
G
C
 
V
D
 
T
H
 
H
V
 
P
I
 
I
N
 
D
Y
 
Y
S
 
H
H
 
T
E
 
T
D
 
D
V
 
Y
A
 
V
Q
 
D
R
 
E
V
 
I
R
 
K
E
 
K
L
 
I
T
 
S
D
 
P
G
 
K
V
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
M
D
 
D
S
 
P
V
 
L
G
 
G
K
 
G
N
 
S
T
 
D
F
 
T
M
 
A
G
 
K
S
 
G
L
 
Y
D
 
N
S
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
P
R
 
M
G
 
G
L
 
K
M
 
V
V
 
V
C
 
T
V
 
Y
G
 
G
T
 
M
A
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
L
S
 
T
G
 
G
P
 
P
I
 
K
P
 
R
A
 
N
F
 
L
D
 
M
P
 
A
V
 
L
L
 
A
L
 
R
A
 
T
M
 
W
K
 
W
G
 
N
S
 
Q
L
 
F
F
 
S
M
 
V
T
 
T
R
 
A
P
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
D
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
G
-
 
F
-
 
H
-
 
L
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
A
 
D
D
 
G
P
 
E
A
 
V
E
 
E
K
 
L
-
 
V
A
 
S
A
 
G
L
 
V
A
 
V
G
 
A
E
 
R
L
 
L
F
 
L
D
 
A
L
 
L
V
 
Y
G
 
N
S
 
Q
G
 
G
R
 
H
I
 
I
K
 
K
I
 
P
E
 
H
I
 
I
N
 
D
Q
 
S
H
 
V
Y
 
W
A
 
P
L
 
F
Q
 
E
D
 
K
A
 
V
V
 
A
Q
 
D
A
 
A
H
 
M
R
 
K
D
 
Q
L
 
M
E
 
Q
S
 
E
R
 
K
K
 
K
T
 
N
T
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
V
I
 
L
F
 
L
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q53FA7 Quinone oxidoreductase PIG3; NADPH:quinone reductase PIG3; Tumor protein p53-inducible protein 3; Protein PIG3; p53-induced gene 3 protein; EC 1.6.5.5 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
29% identity, 98% coverage: 4:324/326 of query aligns to 3:328/332 of Q53FA7

query
sites
Q53FA7
A
 
A
V
 
V
R
 
H
F
 
F
Y
 
D
E
 
K
T
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
N
L
 
L
R
 
Y
Y
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
A
V
 
K
G
 
P
E
 
S
P
 
P
G
 
G
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
R
 
L
L
 
L
R
 
K
H
 
V
V
 
A
A
 
A
V
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
N
Y
x
R
A
 
A
D
 
D
T
 
L
Y
 
M
F
 
Q
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
T
 
Q
Y
|
Y
P
 
D
I
 
P
P
 
P
-
 
P
-
 
G
M
 
A
P
 
S
N
 
N
G
 
I
M
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
H
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
Q
-
 
G
N
 
H
V
 
W
Q
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
-
V
 
-
T
 
T
Y
 
A
T
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
L
N
 
P
T
 
G
L
 
-
G
 
G
A
 
G
Y
 
Q
S
 
A
T
 
Q
E
 
Y
R
 
V
L
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
G
P
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
P
L
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
G
I
 
L
S
 
T
F
 
L
E
 
T
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
I
T
 
P
M
 
E
R
 
A
G
 
W
L
 
L
T
 
T
S
 
A
S
 
F
Y
 
Q
L
 
L
M
 
L
R
 
H
R
 
L
I
 
V
Y
 
G
D
 
N
F
 
V
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
Y
I
 
V
L
 
L
L
 
I
H
 
H
A
|
A
A
x
G
A
x
L
G
x
S
G
|
G
V
|
V
G
|
G
L
 
T
I
 
A
V
 
A
S
 
I
Q
 
Q
W
 
L
A
 
T
K
 
R
L
 
M
L
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
I
V
 
P
I
 
L
G
 
V
T
 
T
V
 
A
S
x
G
T
x
S
E
x
Q
V
x
K
K
|
K
G
 
L
E
 
Q
I
x
M
A
 
A
R
 
E
A
 
K
H
 
L
G
 
G
C
 
A
D
 
A
H
 
A
V
 
G
I
 
F
N
 
N
Y
|
Y
S
 
K
H
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
F
A
 
S
Q
 
E
R
 
A
V
 
T
R
 
L
E
 
K
L
 
F
T
 
T
D
 
K
G
 
G
V
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
C
V
 
I
G
 
G
K
 
G
N
 
S
T
 
Y
F
 
W
M
 
E
G
 
K
S
 
N
L
 
V
D
 
N
S
 
C
L
 
L
K
 
A
R
 
L
R
 
D
G
 
G
L
 
R
M
 
W
V
 
V
C
 
L
V
 
Y
G
 
G
T
 
L
A
 
M
S
 
G
G
 
G
P
 
G
I
 
D
-
 
I
-
 
N
-
 
G
P
 
P
A
 
L
F
 
F
D
 
S
P
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
K
M
 
-
K
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
L
F
 
I
M
 
T
T
x
S
R
x
L
P
x
L
A
 
R
L
 
S
A
 
R
D
 
D
Y
 
N
I
 
K
A
 
Y
D
 
K
P
 
Q
A
 
M
E
 
L
K
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
F
A
 
T
G
 
E
E
 
Q
L
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
H
F
 
F
D
 
S
L
 
T
V
 
E
G
 
G
S
 
P
G
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
L
I
 
P
E
 
V
I
 
L
N
 
D
Q
 
R
H
 
I
Y
 
Y
A
 
P
L
 
V
Q
 
T
D
 
E
A
 
I
V
 
Q
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
R
 
K
D
 
Y
L
 
M
E
 
E
S
 
A
R
 
N
K
 
K
T
x
N
T
 
I
G
 
G
S
 
K
S
 
I
I
 
V
F
 
L

Sites not aligning to the query:

2obyA Crystal structure of human p53 inducible oxidoreductase (tp53i3,pig3)
29% identity, 98% coverage: 4:324/326 of query aligns to 5:330/334 of 2obyA

query
sites
2obyA
A
 
A
V
 
V
R
 
H
F
 
F
Y
 
D
E
 
K
T
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
N
L
 
L
R
 
Y
Y
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
A
V
 
K
G
 
P
E
 
S
P
 
P
G
 
G
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
R
 
L
L
 
L
R
 
K
H
 
V
V
 
A
A
 
A
V
 
S
G
 
A
L
 
L
N
|
N
Y
x
R
A
 
A
D
 
D
T
 
L
Y
 
M
F
 
Q
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
T
 
Q
Y
 
Y
P
 
D
I
 
P
P
 
P
-
 
P
-
 
G
M
 
A
P
 
S
N
 
N
G
 
I
M
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
H
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
Q
-
 
G
N
 
H
V
 
W
Q
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
-
V
 
-
T
 
T
Y
 
A
T
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
L
N
 
P
T
 
G
L
 
-
G
 
G
A
 
G
Y
 
Q
S
 
A
T
 
Q
E
 
Y
R
 
V
L
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
G
P
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
P
L
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
G
I
 
L
S
 
T
F
 
L
E
 
T
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
I
T
 
P
M
x
E
R
 
A
G
 
W
L
 
L
T
|
T
S
 
A
S
 
F
Y
 
Q
L
 
L
M
 
L
R
 
H
R
 
L
I
 
V
Y
 
G
D
 
N
F
 
V
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
Y
I
 
V
L
 
L
L
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
L
G
x
S
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
T
I
 
A
V
 
A
S
 
I
Q
 
Q
W
 
L
A
 
T
K
 
R
L
 
M
L
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
I
V
 
P
I
 
L
G
 
V
T
 
T
V
x
A
S
x
G
T
 
S
E
 
Q
V
 
K
K
|
K
G
 
L
E
 
Q
I
 
M
A
 
A
R
 
E
A
 
K
H
 
L
G
 
G
C
 
A
D
 
A
H
 
A
V
 
G
I
 
F
N
 
N
Y
|
Y
S
 
K
H
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
F
A
 
S
Q
 
E
R
 
A
V
 
T
R
 
L
E
 
K
L
 
F
T
 
T
D
 
K
G
 
G
V
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
C
V
x
I
G
 
G
K
 
G
N
 
S
T
 
Y
F
 
W
M
 
E
G
 
K
S
 
N
L
 
V
D
 
N
S
 
C
L
 
L
K
 
A
R
 
L
R
 
D
G
 
G
L
 
R
M
 
W
V
 
V
C
 
L
V
x
Y
G
 
G
T
 
L
A
x
M
S
 
G
G
 
G
P
 
G
I
 
D
-
 
I
-
 
N
-
 
G
P
 
P
A
 
L
F
 
F
D
 
S
P
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
K
M
 
-
K
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
L
F
 
I
M
 
T
T
 
S
R
x
L
P
x
L
A
 
R
L
 
S
A
 
R
D
 
D
Y
 
N
I
 
K
A
 
Y
D
 
K
P
 
Q
A
 
M
E
 
L
K
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
F
A
 
T
G
 
E
E
 
Q
L
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
H
F
 
F
D
 
S
L
 
T
V
 
E
G
 
G
S
 
P
G
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
L
I
 
P
E
 
V
I
 
L
N
 
D
Q
 
R
H
 
I
Y
 
Y
A
 
P
L
 
V
Q
 
T
D
 
E
A
 
I
V
 
Q
Q
 
E
A
 
A
H
 
H
R
 
K
D
 
Y
L
x
M
E
 
E
S
 
A
R
 
N
K
 
K
T
 
N
T
 
I
G
 
G
S
 
K
S
 
I
I
 
V
F
 
L

3tqhA Structure of the quinone oxidoreductase from coxiella burnetii (see paper)
31% identity, 99% coverage: 3:326/326 of query aligns to 4:316/317 of 3tqhA

query
sites
3tqhA
K
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
F
 
F
Y
 
D
E
 
Q
T
 
F
G
 
G
G
 
P
P
 
P
D
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
E
 
V
E
 
D
V
 
T
D
 
P
V
 
T
G
 
P
E
 
E
P
 
Y
G
 
R
P
 
K
G
 
N
Q
 
Q
V
 
M
R
 
L
L
 
I
R
 
K
H
 
V
V
 
H
A
 
A
V
 
A
G
 
S
L
 
L
N
 
N
Y
x
P
A
 
I
D
 
D
T
 
Y
Y
x
K
F
 
T
R
 
R
N
 
N
G
 
G
T
 
S
Y
 
G
P
 
F
I
 
V
P
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
N
M
 
L
P
 
P
N
 
S
G
 
G
M
 
L
G
 
G
V
 
Y
E
 
D
A
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
E
V
 
V
Q
 
I
A
 
E
I
 
L
G
 
G
E
 
S
G
 
D
V
 
V
T
 
N
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
V
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
T
 
M
-
 
G
Y
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
P
N
 
D
T
 
H
L
 
P
G
 
C
A
 
C
Y
 
Y
S
 
A
T
 
E
E
 
Y
R
 
V
L
 
C
I
 
A
P
 
S
A
 
P
A
 
D
P
 
T
L
 
I
I
 
I
K
 
Q
L
 
K
P
 
L
E
 
E
T
 
K
I
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
L
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
P
M
 
T
R
 
A
G
 
G
L
 
L
T
|
T
S
 
A
S
 
L
Y
 
Q
L
 
A
M
 
L
R
 
N
R
 
Q
I
 
A
Y
 
-
D
 
E
F
 
V
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
S
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
I
H
 
H
A
|
A
A
 
G
A
|
A
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
H
I
 
L
V
 
A
S
 
I
Q
 
Q
W
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
Q
L
 
K
G
 
G
L
 
T
T
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
T
T
 
T
V
x
A
S
|
S
T
 
K
E
 
R
V
 
-
K
x
N
G
 
H
E
 
A
I
 
F
A
 
L
R
 
K
A
 
A
H
 
L
G
 
G
C
 
A
D
 
E
H
 
Q
V
 
C
I
 
I
N
 
N
Y
|
Y
S
 
H
H
 
E
E
 
E
D
 
D
V
 
F
A
 
L
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
L
T
 
A
D
 
I
G
 
S
V
 
T
G
 
P
V
 
V
N
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
I
D
 
D
S
x
L
V
|
V
G
 
G
K
 
G
N
 
D
T
 
V
F
 
G
M
 
I
G
 
Q
S
 
S
L
 
I
D
 
D
S
 
C
L
 
L
K
 
K
R
 
E
R
 
T
G
 
G
L
 
C
M
 
I
V
 
V
C
 
S
V
|
V
G
 
P
T
 
T
A
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
I
 
I
P
 
T
A
 
A
F
 
G
D
 
R
P
 
V
V
 
I
L
 
E
L
 
V
A
 
A
M
 
K
K
 
Q
G
 
K
S
 
H
L
 
-
F
 
-
M
 
-
T
 
-
R
 
R
P
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
G
D
x
L
Y
x
L
I
x
K
A
 
Q
D
 
F
P
 
N
A
 
I
E
 
E
K
 
E
A
 
L
A
 
H
L
 
Y
A
 
L
G
 
G
E
 
K
L
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
L
V
 
V
G
 
S
S
 
E
G
 
D
R
 
K
I
 
L
K
 
R
I
 
I
E
 
E
I
 
I
N
 
S
Q
 
R
H
 
I
Y
 
F
A
 
Q
L
 
L
Q
 
S
D
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
E
D
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
T
R
x
G
K
x
H
T
x
V
T
 
R
G
 
G
S
 
K
S
 
L
I
 
V
F
 
F
V
 
K
I
 
V

P12311 Alcohol dehydrogenase; ADH-T; EC 1.1.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
30% identity, 80% coverage: 16:276/326 of query aligns to 13:301/337 of P12311

query
sites
P12311
L
 
L
R
 
Q
Y
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
E
V
 
K
G
 
P
E
 
K
P
 
I
G
 
S
P
 
Y
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
R
 
L
L
 
V
R
 
R
H
 
I
V
 
K
A
 
A
V
 
C
G
 
G
L
 
V
N
x
C
Y
 
H
A
x
T
D
 
D
T
 
L
Y
x
H
F
 
A
R
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
D
Y
 
W
P
 
P
I
 
V
P
 
K
-
 
P
-
 
K
M
 
L
P
 
P
N
 
L
G
 
I
M
 
P
G
 
G
V
 
H
E
 
E
A
 
G
S
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
I
Q
 
E
A
 
E
I
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
N
 
H
V
 
L
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
G
Y
 
I
T
 
P
G
 
W
F
 
L
L
 
Y
N
 
S
T
 
A
L
 
C
G
 
G
-
 
H
-
 
C
-
 
D
-
 
Y
-
 
C
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
C
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
Q
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
A
 
G
Y
 
Y
S
 
A
T
 
E
E
 
Y
R
 
C
L
 
R
I
 
A
P
 
A
A
 
A
A
 
D
P
 
Y
L
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
D
T
 
N
I
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
P
M
 
I
T
 
F
M
 
C
R
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
T
S
 
T
S
 
-
Y
 
Y
L
 
K
M
 
A
R
 
L
R
 
K
I
 
V
Y
 
T
D
 
G
F
 
A
K
 
K
A
 
P
G
 
G
D
 
E
S
 
W
I
 
V
L
 
A
L
 
I
H
 
Y
A
 
G
A
 
I
A
 
-
G
 
G
G
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
V
V
 
A
S
 
V
Q
 
Q
W
 
Y
A
 
A
K
 
K
L
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
L
T
 
N
V
 
V
I
 
V
G
 
A
T
 
V
V
 
D
S
 
L
T
 
G
E
 
D
V
 
E
K
 
K
G
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
H
 
L
G
 
G
C
 
A
D
 
D
H
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
N
Y
 
P
S
 
K
H
 
H
E
 
D
D
 
D
V
 
A
A
 
A
Q
 
Q
R
 
W
V
 
I
R
 
K
E
 
E
L
 
K
T
 
V
D
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
V
 
A
N
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
-
D
 
T
S
 
A
V
 
V
G
 
S
K
 
K
N
 
A
T
 
A
F
 
F
M
 
E
G
 
S
S
 
A
L
 
Y
D
 
K
S
 
S
L
 
I
K
 
R
R
 
R
R
 
G
G
 
G
L
 
A
M
 
C
V
 
V
C
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
P
S
 
P
G
 
E
-
 
E
-
 
I
P
 
P
I
 
I
P
 
P
A
 
I
F
 
F
D
 
D
P
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
N
A
 
G
M
 
V
K
 
K
-
 
I
-
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
I
F
 
V
M
 
G
T
 
T
R
 
R
P
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
Q
D
 
E
Y
 
A
I
 
L
A
 
Q
D
 
F
P
 
A
A
 
A
E
 
E

5k1sA Crystal structure of aibc (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:325/326 of query aligns to 16:355/358 of 5k1sA

query
sites
5k1sA
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
V
F
 
L
Y
 
R
E
 
S
T
 
F
G
 
G
G
 
E
P
 
A
D
 
G
V
 
N
L
 
L
R
 
K
Y
 
M
E
 
E
E
 
T
V
 
M
D
 
P
V
 
M
G
 
P
E
 
R
P
 
P
G
 
G
P
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
R
 
L
L
 
L
R
 
R
H
 
V
V
 
H
A
 
A
V
 
C
G
 
G
L
 
V
N
x
C
Y
|
Y
A
x
H
D
 
D
T
 
V
Y
x
I
F
 
N
R
 
R
N
 
R
G
 
G
T
 
N
Y
 
L
P
 
P
-
 
R
I
 
T
P
 
S
M
 
V
P
 
P
N
 
A
G
 
I
M
 
L
G
 
G
V
x
H
E
|
E
A
 
A
S
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
V
Q
 
I
A
 
E
I
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
D
V
 
T
T
 
P
N
 
G
V
 
W
Q
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
A
T
 
A
Y
 
T
T
 
L
G
 
Q
F
 
R
L
 
M
-
 
S
-
x
C
-
 
G
-
 
D
-
x
C
-
 
A
-
 
L
-
x
C
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
R
N
 
N
T
 
S
L
 
L
-
x
C
-
 
K
-
 
T
-
 
D
-
x
N
-
 
R
-
 
F
-
 
F
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
P
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
S
 
A
T
 
Q
E
 
F
R
 
M
L
 
V
I
 
A
P
 
P
A
 
V
A
 
G
P
 
G
L
 
L
I
 
G
K
 
R
L
 
V
P
 
P
E
 
A
T
 
S
I
 
L
S
 
P
F
 
W
E
 
N
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
V
T
 
C
M
x
C
R
 
T
G
 
T
L
 
G
T
|
T
S
 
A
S
 
V
Y
 
H
L
 
T
M
 
V
R
 
R
R
 
T
I
 
R
Y
 
G
D
 
K
F
 
V
K
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
E
S
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
I
H
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
S
V
 
S
S
 
V
Q
 
Q
W
 
L
A
 
A
K
 
R
L
 
L
L
 
D
G
 
G
L
 
A
T
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
A
T
 
V
V
 
T
S
 
S
T
 
S
E
 
E
V
 
A
K
 
K
G
 
V
E
 
Q
I
 
A
A
 
L
R
 
K
A
 
E
H
 
A
G
 
G
C
 
A
D
 
D
H
 
E
V
 
V
I
 
I
N
 
V
Y
 
S
S
 
R
H
 
G
E
 
L
D
 
D
V
 
F
A
 
A
Q
 
S
R
 
D
V
 
V
R
 
R
E
 
K
L
 
R
T
 
T
D
 
Q
G
 
G
V
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
A
F
 
V
D
 
E
S
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
S
N
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
D
G
 
Q
S
 
T
L
 
L
D
 
K
S
 
S
L
 
M
K
 
A
R
 
P
R
 
G
G
 
G
L
 
R
M
 
V
V
 
V
C
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
L
S
 
E
G
 
S
P
 
G
I
 
M
P
 
V
A
 
Q
F
 
L
D
 
N
P
 
P
V
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
I
M
 
V
K
 
K
G
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
M
 
-
T
 
E
R
 
L
P
 
E
A
 
I
L
 
L
A
 
G
D
 
A
Y
 
Y
I
 
A
A
 
T
D
 
T
P
 
Q
A
 
A
E
 
E
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
L
G
 
D
E
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
R
L
 
L
V
 
T
G
 
A
S
 
T
G
 
G
R
 
G
I
 
V
K
 
R
I
 
Q
E
 
F
I
 
V
N
 
T
Q
 
D
H
 
A
Y
 
V
A
 
P
L
 
L
Q
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
A
Q
 
K
A
 
A
H
 
H
R
 
F
D
 
R
L
 
L
E
 
E
S
 
N
R
 
R
K
 
E
T
 
V
T
 
A
G
 
G
S
x
R
S
 
L
I
 
V
F
 
L
V
 
V

P96202 Phenolphthiocerol/phthiocerol polyketide synthase subunit C; (Phenol)carboxyphthiodiolenone synthase subunit C; Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I; Phthiocerol synthesis polyketide synthase type I PpsC; EC 2.3.1.292 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
29% identity, 99% coverage: 4:326/326 of query aligns to 1458:1780/2188 of P96202

query
sites
P96202
A
 
A
V
 
V
R
 
R
F
 
L
Y
 
Q
-
 
I
-
 
D
E
 
Q
T
 
P
G
 
G
G
 
R
P
 
L
D
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
N
Y
 
V
E
 
H
E
 
E
V
 
V
D
 
K
V
 
R
G
 
G
E
 
R
P
 
P
G
 
Q
P
 
G
G
 
D
Q
 
Q
V
 
V
R
 
E
L
 
V
R
 
R
H
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
V
Y
 
L
F
 
K
R
 
A
N
 
M
G
 
G
T
 
V
Y
 
Y
P
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
A
I
 
A
P
 
P
M
 
V
P
 
-
N
 
-
G
 
-
M
 
I
G
 
G
V
 
G
E
 
E
A
 
C
S
 
V
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
Q
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
E
V
 
V
T
 
D
N
 
G
V
 
V
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
T
 
I
Y
 
A
T
 
F
G
 
G
F
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
P
G
 
G
A
 
T
Y
 
F
S
 
G
T
 
T
E
 
H
R
 
L
L
 
G
I
 
T
P
 
I
A
 
A
A
 
D
P
 
L
L
 
V
I
 
V
K
 
P
L
 
I
P
 
P
E
 
D
T
 
T
I
 
L
S
 
A
F
 
D
E
 
N
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
F
T
 
G
M
 
V
R
 
A
G
 
Y
L
 
L
T
 
T
S
 
A
S
 
W
Y
 
H
L
 
S
M
 
L
R
 
C
R
 
E
I
 
V
Y
 
G
D
 
R
F
 
L
K
 
S
A
 
P
G
 
G
D
 
E
S
 
R
I
 
V
L
 
L
L
 
I
H
 
H
A
 
S
A
 
A
A
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
M
I
 
A
V
 
A
S
 
V
Q
 
S
W
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
I
G
 
G
L
 
A
T
 
R
V
 
I
I
 
Y
G
 
T
T
 
T
V
 
A
S
 
G
T
 
S
E
 
D
V
 
A
K
 
K
G
 
R
E
 
E
I
 
M
A
 
L
R
 
S
A
 
R
H
 
L
G
 
G
C
 
V
D
 
E
H
 
Y
V
 
V
I
 
G
N
 
D
Y
 
S
S
 
R
H
 
S
E
 
V
D
 
D
V
 
F
A
 
A
Q
 
D
R
 
E
V
 
I
R
 
L
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
Y
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
L
D
 
N
S
 
S
V
 
L
G
 
A
K
 
G
N
 
E
T
 
A
F
 
I
M
 
Q
G
 
R
S
 
G
L
 
V
D
 
Q
S
 
I
L
 
L
K
 
A
R
 
P
R
 
G
G
 
G
L
 
R
M
 
F
V
 
I
C
 
E
V
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
K
S
 
D
G
 
V
P
 
Y
I
 
A
P
 
D
A
 
A
F
 
S
D
 
L
P
 
G
V
 
L
L
 
A
L
 
A
A
 
L
M
 
A
K
 
K
G
 
S
S
 
A
L
 
S
F
 
F
M
 
S
T
 
V
R
 
V
P
 
D
A
 
L
L
 
D
A
 
L
D
 
N
Y
 
L
I
 
K
A
 
L
D
 
Q
P
 
P
A
 
A
E
 
R
K
 
Y
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
Q
E
 
H
L
 
I
F
 
L
D
 
Q
L
 
H
V
 
V
G
 
A
S
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
L
K
 
E
I
 
V
E
 
L
I
 
P
N
 
V
Q
 
T
H
 
A
Y
 
F
A
 
S
L
 
L
Q
 
H
D
 
D
A
 
A
V
 
A
Q
 
D
A
 
A
H
 
F
R
 
R
D
 
L
L
 
M
E
 
A
S
 
S
R
 
G
K
 
K
T
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
I
I
 
V
F
 
I
V
 
S
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5bp4R Mycocerosic acid synthase (see paper)
30% identity, 93% coverage: 24:326/326 of query aligns to 320:621/637 of 5bp4R

query
sites
5bp4R
G
 
G
E
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
E
L
 
V
R
 
A
H
 
V
V
 
K
A
 
A
V
 
S
G
 
S
L
 
I
N
 
N
Y
x
F
A
 
A
D
 
D
T
 
V
Y
 
L
F
 
V
R
 
A
N
 
F
G
 
G
T
x
R
Y
 
C
P
 
P
I
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
G
P
 
R
M
 
L
P
 
P
N
 
E
G
 
-
M
 
L
G
 
G
V
 
S
E
 
E
A
 
F
S
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
N
 
T
V
 
H
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
G
F
 
G
L
 
V
N
 
S
T
 
A
L
 
N
G
 
G
A
 
C
Y
 
W
S
 
S
T
 
N
E
 
F
R
 
V
L
 
T
I
 
C
P
 
E
A
 
A
A
 
D
P
 
L
L
 
A
I
 
T
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
G
I
 
I
S
 
S
F
 
E
E
 
H
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
V
T
 
G
M
 
L
R
 
A
G
 
Y
L
 
G
T
|
T
S
 
V
S
 
W
Y
 
L
L
 
G
M
 
L
R
 
T
R
 
E
I
 
L
Y
 
A
D
 
R
F
 
M
K
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
K
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
A
x
S
A
 
A
A
 
T
G
|
G
G
|
G
V
|
V
G
 
G
L
 
Q
I
 
A
V
 
A
S
 
I
Q
 
A
W
 
V
A
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
E
V
 
I
I
 
Y
G
 
A
T
 
T
V
 
A
S
x
G
T
 
S
E
 
E
V
 
K
K
x
R
G
 
R
E
 
Q
I
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
D
H
 
W
G
 
G
C
 
I
D
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
Y
N
 
D
Y
x
S
S
x
R
H
 
T
E
 
T
D
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
D
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
E
 
T
L
 
D
T
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
Y
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
N
S
 
S
V
 
V
G
 
T
K
 
G
N
 
P
T
 
A
F
 
Q
M
 
R
G
 
A
S
 
G
L
 
L
D
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
A
R
 
F
R
 
G
G
 
G
L
 
R
M
 
F
V
 
V
C
 
E
V
x
I
G
 
G
T
x
K
A
 
R
S
 
D
G
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
I
L
 
Y
L
 
A
A
 
D
M
 
T
K
 
R
G
 
L
S
 
G
L
 
L
F
 
F
M
 
P
T
 
F
R
 
R
P
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
S
D
 
F
Y
 
Y
I
 
A
A
 
V
D
|
D
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
H
P
 
P
A
 
Q
E
 
K
K
 
I
A
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
L
G
 
A
E
 
T
L
 
V
F
 
Y
D
 
R
L
 
L
V
 
I
G
 
A
S
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
L
K
 
P
I
 
L
E
 
P
I
 
E
N
 
I
Q
 
T
H
 
H
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
A
Q
 
T
A
 
A
H
 
I
R
 
R
D
 
I
L
 
M
E
x
G
S
 
G
R
 
A
K
 
Q
T
x
H
T
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
L
I
 
V
F
 
I
V
 
D
I
 
I

5bp4L Mycocerosic acid synthase (see paper)
30% identity, 93% coverage: 24:326/326 of query aligns to 342:643/897 of 5bp4L

query
sites
5bp4L
G
 
G
E
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
E
L
 
V
R
 
A
H
 
V
V
 
K
A
 
A
V
 
S
G
 
S
L
 
I
N
 
N
Y
x
F
A
 
A
D
 
D
T
 
V
Y
 
L
F
 
V
R
 
A
N
 
F
G
 
G
T
x
R
Y
 
C
P
 
P
I
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
G
P
 
R
M
 
L
P
 
P
N
 
E
G
 
-
M
 
L
G
 
G
V
 
S
E
 
E
A
 
F
S
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
N
 
T
V
 
H
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
G
F
 
G
L
 
V
N
 
S
T
 
A
L
 
N
G
 
G
A
 
C
Y
 
W
S
 
S
T
 
N
E
 
F
R
 
V
L
 
T
I
 
C
P
 
E
A
 
A
A
 
D
P
 
L
L
 
A
I
 
T
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
G
I
 
I
S
 
S
F
 
E
E
 
H
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
V
T
 
G
M
 
L
R
 
A
G
 
Y
L
 
G
T
|
T
S
 
V
S
 
W
Y
 
L
L
 
G
M
 
L
R
 
T
R
 
E
I
 
L
Y
 
A
D
 
R
F
 
M
K
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
K
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
A
x
S
A
 
A
A
 
T
G
|
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
Q
I
 
A
V
 
A
S
 
I
Q
 
A
W
 
V
A
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
E
V
 
I
I
 
Y
G
 
A
T
 
T
V
 
A
S
x
G
T
 
S
E
 
E
V
 
K
K
x
R
G
 
R
E
 
Q
I
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
D
H
 
W
G
 
G
C
 
I
D
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
Y
N
 
D
Y
x
S
S
x
R
H
 
T
E
 
T
D
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
D
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
E
 
T
L
 
D
T
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
Y
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
N
S
 
S
V
 
V
G
 
T
K
 
G
N
 
P
T
 
A
F
 
Q
M
 
R
G
 
A
S
 
G
L
 
L
D
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
A
R
 
F
R
 
G
G
 
G
L
 
R
M
 
F
V
 
V
C
 
E
V
x
I
G
 
G
T
 
K
A
 
R
S
 
D
G
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
I
L
 
Y
L
 
A
A
 
D
M
 
T
K
 
R
G
 
L
S
 
G
L
 
L
F
 
F
M
 
P
T
 
F
R
 
R
P
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
S
D
 
F
Y
 
Y
I
 
A
A
x
V
D
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
H
P
 
P
A
 
Q
E
 
K
K
 
I
A
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
L
G
 
A
E
 
T
L
 
V
F
 
Y
D
 
R
L
 
L
V
 
I
G
 
A
S
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
L
K
 
P
I
 
L
E
 
P
I
 
E
N
 
I
Q
 
T
H
 
H
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
A
Q
 
T
A
 
A
H
 
I
R
 
R
D
 
I
L
 
M
E
x
G
S
 
G
R
 
A
K
 
Q
T
x
H
T
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
L
I
 
V
F
 
I
V
 
D
I
 
I

5bp4A Mycocerosic acid synthase (see paper)
30% identity, 93% coverage: 24:326/326 of query aligns to 547:848/1102 of 5bp4A

query
sites
5bp4A
G
 
G
E
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
E
L
 
V
R
 
A
H
 
V
V
 
K
A
 
A
V
 
S
G
 
S
L
 
I
N
 
N
Y
x
F
A
 
A
D
 
D
T
 
V
Y
 
L
F
 
V
R
 
A
N
 
F
G
 
G
T
 
R
Y
 
C
P
 
P
I
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
G
P
 
R
M
 
L
P
 
P
N
 
E
G
 
-
M
 
L
G
 
G
V
 
S
E
 
E
A
 
F
S
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
V
Q
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
N
 
T
V
 
H
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
G
F
 
G
L
 
V
N
 
S
T
 
A
L
 
N
G
 
G
A
 
C
Y
 
W
S
 
S
T
 
N
E
 
F
R
 
V
L
 
T
I
 
C
P
 
E
A
 
A
A
 
D
P
 
L
L
 
A
I
 
T
K
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
G
I
 
I
S
 
S
F
 
E
E
 
H
T
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
V
T
 
G
M
 
L
R
 
A
G
 
Y
L
 
G
T
 
T
S
 
V
S
 
W
Y
 
L
L
 
G
M
 
L
R
 
T
R
 
E
I
 
L
Y
 
A
D
 
R
F
 
M
K
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
K
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
A
x
S
A
 
A
A
 
T
G
|
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
Q
I
 
A
V
 
A
S
 
I
Q
 
A
W
 
V
A
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
E
V
 
I
I
 
Y
G
 
A
T
 
T
V
x
A
S
x
G
T
 
S
E
 
E
V
 
K
K
x
R
G
 
R
E
 
Q
I
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
D
H
 
W
G
 
G
C
 
I
D
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
Y
N
 
D
Y
x
S
S
x
R
H
 
T
E
 
T
D
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
D
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
E
 
T
L
 
D
T
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
Y
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
N
S
 
S
V
 
V
G
 
T
K
 
G
N
 
P
T
 
A
F
 
Q
M
 
R
G
 
A
S
 
G
L
 
L
D
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
A
R
 
F
R
 
G
G
 
G
L
 
R
M
 
F
V
 
V
C
 
E
V
x
I
G
 
G
T
 
K
A
 
R
S
 
D
G
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
I
L
 
Y
L
 
A
A
 
D
M
 
T
K
 
R
G
 
L
S
 
G
L
 
L
F
 
F
M
 
P
T
 
F
R
 
R
P
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
S
D
 
F
Y
 
Y
I
 
A
A
x
V
D
 
D
-
x
L
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
H
P
 
P
A
 
Q
E
 
K
K
 
I
A
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
L
G
 
A
E
 
T
L
 
V
F
 
Y
D
 
R
L
 
L
V
 
I
G
 
A
S
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
L
K
 
P
I
 
L
E
 
P
I
 
E
N
 
I
Q
 
T
H
 
H
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
Q
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
A
Q
 
T
A
 
A
H
 
I
R
 
R
D
 
I
L
 
M
E
x
G
S
 
G
R
 
A
K
 
Q
T
x
H
T
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
L
I
 
V
F
 
I
V
 
D
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AO353_21000 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_21000
MAKAVRFYETGGPDVLRYEEVDVGEPGPGQVRLRHVAVGLNYADTYFRNGTYPIPMPNGM
GVEASGVVQAIGEGVTNVQVGDRVTYTGFLNTLGAYSTERLIPAAPLIKLPETISFETAA
AMTMRGLTSSYLMRRIYDFKAGDSILLHAAAGGVGLIVSQWAKLLGLTVIGTVSTEVKGE
IARAHGCDHVINYSHEDVAQRVRELTDGVGVNVVFDSVGKNTFMGSLDSLKRRGLMVCVG
TASGPIPAFDPVLLAMKGSLFMTRPALADYIADPAEKAALAGELFDLVGSGRIKIEINQH
YALQDAVQAHRDLESRKTTGSSIFVI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory