SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_21305 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_21305 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7qh2C Cryo-em structure of ldh-etfab complex from acetobacterium woodii (see paper)
30% identity, 56% coverage: 9:205/352 of query aligns to 53:253/467 of 7qh2C

query
sites
7qh2C
A
 
S
S
 
T
A
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
S
E
 
K
Q
 
I
I
 
M
N
 
K
Q
 
Y
A
 
A
R
 
Y
E
 
E
N
 
H
A
 
N
T
 
I
P
 
P
L
 
V
R
 
V
I
x
V
Q
 
R
G
|
G
A
 
-
S
|
S
S
x
G
K
x
T
A
x
G
F
x
L
L
 
V
G
 
G
R
x
A
E
x
C
V
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
F
A
 
G
G
 
G
E
 
I
V
 
M
L
 
L
D
 
E
T
 
T
R
 
T
V
 
L
H
 
M
R
 
N
G
 
N
I
 
I
V
 
L
S
 
E
Y
 
L
D
 
D
P
 
T
T
 
E
E
 
N
L
 
L
V
 
T
I
 
V
T
 
T
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
L
L
 
L
R
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
S
A
 
K
A
 
F
L
 
V
D
 
E
A
 
E
A
 
N
G
 
D
Q
 
L
M
 
F
L
 
Y
P
 
P
C
 
P
E
 
D
P
|
P
P
x
G
S
x
E
F
 
-
G
 
-
E
 
K
D
 
S
A
|
A
T
|
T
V
 
I
G
 
A
G
|
G
M
x
N
I
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
N
L
x
A
S
x
G
G
 
G
P
 
M
R
 
R
R
 
A
P
 
V
W
 
K
A
 
Y
G
 
G
S
 
V
A
 
T
R
 
R
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
L
 
R
G
 
G
T
 
L
R
 
T
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
A
N
 
N
G
 
G
K
 
E
Q
 
I
L
 
I
R
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
V
 
I
M
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
L
 
L
S
 
K
R
 
D
L
 
L
L
 
V
T
 
I
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
C
V
 
V
I
|
I
T
 
T
E
 
K
V
 
A
S
 
I
L
 
L
K
 
K
V
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
L
P
 
P
R
 
K
Q
 
M
C
 
T
L
 
L
S
 
S
I
 
L
S
 
L
L
 
I
E
 
P
L
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
S
D
 
D
S
 
A
A
 
A
H
 
G
A
 
I
L
 
V
S
 
P
K
 
K
L
 
I
A
 
I
E
 
K
W
 
S
G
 
K
Q
 
A
Q
 
I
P
 
P
L
 
T
P
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8jdvA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketohexanoic acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:453/454 of 8jdvA

query
sites
8jdvA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
T
-
 
Q
-
 
D
-
 
N
G
 
G
G
 
G
E
 
S
V
 
H
L
 
F
D
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
N
Q
 
E
F
 
L
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
x
R
N
 
H
E
 
N
-
 
A
-
x
W
-
x
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
Q
 
S
Q
 
K
L
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
x
H
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdpA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisovaleric acid (see paper)
24% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:454/455 of 8jdpA

query
sites
8jdpA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
H
-
 
F
-
 
S
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
R
A
 
N
Q
 
E
F
 
L
W
 
W
E
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
 
W
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
S
E
 
P
Q
 
S
Q
 
K
L
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
 
A
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdzA Crystal structure of mldhd in complex with 2-keto-3-methylvaleric acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:453/454 of 8jdzA

query
sites
8jdzA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
-
 
A
-
 
C
-
 
N
-
 
R
-
 
H
S
 
S
A
 
L
A
 
N
C
 
C
H
 
P
D
 
V
G
 
A
R
 
P
Q
 
T
L
 
L
H
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
x
W
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
x
H
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
-
 
P
W
 
D
A
 
A
G
 
E
A
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdyA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisocaproic acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:453/454 of 8jdyA

query
sites
8jdyA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
-
 
A
-
 
C
-
 
N
-
 
R
-
 
H
S
 
S
A
 
L
A
 
N
C
 
C
H
 
P
D
 
V
G
 
A
R
 
P
Q
 
T
L
 
L
H
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
x
W
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
x
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
x
H
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
-
 
P
W
 
D
A
 
A
G
 
E
A
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdrA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxy-3-methyl- valeric acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:455/456 of 8jdrA

query
sites
8jdrA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
x
W
-
x
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
 
A
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdqA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisocaproic acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:455/456 of 8jdqA

query
sites
8jdqA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
x
W
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
 
A
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdoA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyhexanoic acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:455/456 of 8jdoA

query
sites
8jdoA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
x
W
-
x
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
 
A
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdnA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyvaleric acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:455/456 of 8jdnA

query
sites
8jdnA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
x
W
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
 
A
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdgA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxybutanoic acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:455/456 of 8jdgA

query
sites
8jdgA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
 
W
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
 
A
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdbA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyoctanoic acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:455/456 of 8jdbA

query
sites
8jdbA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
x
W
-
x
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
 
A
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdxA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisovaleric acid (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:454/455 of 8jdxA

query
sites
8jdxA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
-
 
A
-
 
C
-
 
N
-
 
R
-
 
H
S
 
S
A
 
L
A
 
N
C
 
C
H
 
P
D
 
V
G
 
A
R
 
P
Q
 
T
L
 
L
H
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
S
E
 
Q
G
 
Q
S
 
T
V
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
Q
H
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
G
 
E
G
 
A
E
 
I
V
 
T
L
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
S
Q
 
H
F
 
F
-
 
S
W
 
W
E
 
A
A
 
A
L
 
E
N
 
K
E
 
R
Q
 
N
Q
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
-
 
A
-
x
W
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
T
 
Y
F
 
S
F
 
T
D
 
D
E
 
V
G
 
C
L
 
V
P
 
P
L
 
I
W
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
S
 
A
L
 
I
P
 
V
N
 
G
N
x
H
I
 
V
G
 
G
P
 
D
L
 
G
T
 
N
L
 
F
P
x
H
G
 
C
E
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
Q
R
 
R
W
 
R
L
 
V
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
P
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
G
S
 
R
L
 
R
A
 
A
A
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
C
Y
 
T
-
 
G
S
x
E
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
G
D
 
L
T
 
G
P
 
K
F
 
R
Q
 
Q
P
 
L
L
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
V
L
 
G
L
 
V
R
 
E
Y
 
T
H
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
N
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
M
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdsA Crystal structure of mldhd in complex with pyruvate (see paper)
25% identity, 84% coverage: 55:348/352 of query aligns to 96:455/456 of 8jdsA

query
sites
8jdsA
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
D
 
N
P
 
T
T
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
I
 
V
T
 
V
A
 
V
R
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
R
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
R
A
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
L
M
 
W
L
 
F
P
 
P
C
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
|
G
E
x
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
I
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
R
 
N
R
 
A
P
 
V
W
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
M
R
 
R
D
 
D
F
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
N
T
 
L
R
 
E
L
 
V
I
 
V
T
 
L
G
 
P
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
E
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
T
 
V
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
C
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
K
 
A
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
S
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
C
E
 
A
L
 
F
D
 
P
S
 
S
A
 
V
H
 
Q
-
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
D
K
 
S
L
 
T
A
 
V
E
 
Q
W
 
I
G
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
P
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
M
-
 
M
-
 
D
A
 
A
C
 
C
H
 
N
D
 
R
G
 
H
R
 
S
Q
 
K
L
 
L
H
 
N
-
 
C
-
 
P
-
<