SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS11025 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS11025 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2d1cA Crystal structure of tt0538 protein from thermus thermophilus hb8
44% identity, 98% coverage: 7:479/481 of query aligns to 21:489/495 of 2d1cA

query
sites
2d1cA
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
C
T
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
T
L
 
L
H
 
K
V
 
V
M
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
L
K
 
A
V
 
Y
E
 
E
E
 
V
V
 
R
P
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
A
Q
 
S
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
R
 
R
G
 
G
H
 
I
L
 
A
G
 
S
G
 
G
L
 
V
D
 
P
A
 
Q
A
 
E
G
 
T
W
 
I
G
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
R
R
 
K
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
|
P
I
x
L
T
x
E
T
|
T
P
 
P
Q
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
K
 
K
S
 
S
L
 
A
N
|
N
V
 
V
T
 
T
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
L
L
 
F
G
 
E
L
 
T
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
-
V
 
V
S
 
R
H
 
E
H
 
F
P
 
P
Y
 
N
V
 
V
R
 
P
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
A
R
 
G
-
 
R
-
 
G
M
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
V
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
M
Q
 
Q
T
 
T
D
 
P
D
 
S
V
 
V
I
 
A
Q
 
Q
S
 
T
V
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
S
R
 
W
P
 
K
G
 
G
S
 
S
E
 
E
R
 
K
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
E
H
 
G
R
 
R
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
H
A
 
C
F
 
A
V
 
T
K
|
K
D
 
S
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
K
M
 
L
T
 
A
D
 
E
G
 
G
L
 
T
F
 
L
L
 
K
K
 
R
I
 
A
F
 
F
N
 
E
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
E
 
D
I
 
I
K
 
E
A
 
A
D
 
V
H
 
H
L
 
I
I
|
I
V
 
V
D
|
D
I
x
N
G
 
A
A
 
A
A
 
H
R
x
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
K
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
R
 
Q
F
 
F
D
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
T
N
 
N
L
 
M
Y
 
N
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
T
A
 
S
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
x
L
G
|
G
L
 
F
A
 
A
G
 
P
S
 
S
A
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
N
A
 
E
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
A
I
 
V
H
|
H
G
|
G
S
|
S
A
|
A
P
 
P
M
x
K
I
x
Y
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
N
I
 
V
A
x
I
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
R
H
 
Y
I
 
L
G
 
E
Q
 
E
G
 
F
D
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
D
R
 
L
I
 
I
H
 
E
N
 
N
A
 
A
W
 
L
L
 
L
K
 
Y
T
 
T
I
 
L
E
 
E
D
 
E
G
 
G
-
 
R
V
 
V
H
 
L
T
 
T
V
 
G
D
|
D
I
 
V
-
 
V
-
 
G
F
 
Y
N
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
A
S
 
K
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
T
H
 
T
A
 
E
F
 
Y
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
I
E
 
Q
R
 
N
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
M
 
T
P
 
P
V
 
R
T
 
K
L
 
T
P
 
Q
T
 
V
V
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
K
V
 
P
T
 
F
A
 
R
R
 
L
P
 
P
A
 
Q
Y
 
V
E
 
D
S
 
G
G
 
A
V
 
I
R
 
A
-
 
P
L
 
I
S
 
V
P
 
P
R
 
R
R
 
S
K
 
R
A
 
R
V
 
V
K
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
F
 
F
L
 
V
H
 
E
W
 
T
P
 
-
G
 
N
G
 
L
N
 
L
P
 
P
D
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
K
L
 
A
V
 
L
-
 
E
-
 
D
L
 
L
P
 
A
V
 
A
A
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
-
L
 
F
R
 
R
L
 
L
S
 
K
S
 
M
I
 
I
S
 
S
N
 
N
R
 
R
S
 
G
Q
 
T
K
 
Q
V
 
V
W
 
Y
P
 
P
E
 
P
G
 
T
N
 
G
I
 
G
G
 
L
V
 
T
F
 
D
C
 
L
T
 
V
D
 
D
H
 
H
W
 
Y
R
 
R
C
 
C
R
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
Y
P
 
T
E
 
G
G
 
E
V
 
G
A
 
E
V
 
A
G
 
K
H
 
D
P
 
P
D
 
E
I
 
I
V
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
S
G
 
R
L
 
V
A
 
A
R
 
-
A
 
S
G
 
R
L
 
F
D
 
R
F
 
W
T
 
M
Q
 
H
T
 
L
E
 
E
N
 
K
L
 
L
C
 
Q
N
 
E
F
 
F
D
 
D
G
 
G
K
 
E
S
 
P
G
 
G
F
 
F
S
 
T

6lkyA Crystal structure of isocitrate dehydrogenase from methylococcus capsulatus
48% identity, 70% coverage: 7:343/481 of query aligns to 4:339/339 of 6lkyA

query
sites
6lkyA
I
 
I
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
S
I
 
I
T
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
V
H
 
K
V
 
V
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
L
 
V
K
 
Q
V
 
W
E
 
D
E
 
T
V
 
Q
P
 
S
A
 
A
G
 
G
E
 
M
Q
 
A
V
 
A
Y
 
V
R
 
E
R
 
K
G
 
-
H
 
-
L
 
F
G
 
G
G
 
T
-
 
P
L
 
L
D
 
P
A
 
D
A
 
A
G
 
T
W
 
L
G
 
D
S
 
S
I
 
I
R
 
R
R
 
A
T
 
N
R
 
R
V
 
I
F
 
C
L
 
F
K
 
K
G
 
G
P
|
P
I
x
L
T
 
T
T
|
T
P
 
P
Q
 
V
G
 
G
Y
 
G
G
 
G
N
 
Y
K
 
R
S
 
S
L
 
V
N
|
N
V
 
V
T
 
T
A
 
L
R
 
R
T
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
N
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
A
V
 
I
S
 
S
H
 
F
H
 
E
P
 
G
Y
 
-
V
 
T
R
 
D
T
 
T
R
 
A
H
 
F
P
 
S
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
L
V
 
V
I
 
T
I
 
V
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
F
Q
 
I
T
 
K
D
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
I
V
 
A
I
 
A
Q
 
E
S
 
S
V
 
I
K
 
A
L
 
V
I
 
V
S
 
T
R
 
R
P
 
K
G
 
G
S
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
R
N
 
A
H
 
R
R
 
R
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
L
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
L
K
 
K
M
 
C
T
 
T
D
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
E
I
 
I
F
 
G
N
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
E
 
D
I
 
I
K
 
E
A
 
F
D
 
D
H
 
D
L
 
R
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
A
G
 
C
A
 
S
A
 
M
R
 
Q
L
 
M
A
 
V
D
 
M
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
T
G
 
A
S
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
T
A
 
D
C
 
A
A
 
A
M
 
L
F
 
F
E
 
E
A
 
A
I
 
V
H
|
H
G
|
G
S
|
S
A
|
A
P
 
P
M
x
D
I
|
I
A
 
A
G
 
D
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
M
L
 
I
M
 
M
A
 
A
A
 
G
V
 
A
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
E
H
 
H
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
G
 
P
D
 
D
V
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
R
I
 
I
H
 
E
N
 
R
A
 
A
W
 
V
L
 
R
K
 
E
T
 
V
I
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
G
V
 
R
H
 
S
T
 
V
V
 
T
D
 
P
I
 
D
F
 
L
N
 
A
R
 
K
G
 
D
V
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
S
R
 
P
V
 
C
G
 
G
T
 
T
H
 
A
A
 
Q
F
 
M
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
V
G
 
R
Q
 
Q

6m3sB Dimeric isocitrate dehydrogenase from xanthomonas campestris pv. Campestris 8004
47% identity, 70% coverage: 4:341/481 of query aligns to 5:338/338 of 6m3sB

query
sites
6m3sB
T
 
T
T
 
Q
P
 
T
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
I
R
 
R
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
T
L
 
L
H
 
F
V
 
V
M
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
L
G
 
Q
A
 
A
R
 
G
L
 
L
K
 
T
V
 
Y
E
 
E
E
 
Y
V
 
A
P
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
-
Q
 
L
V
 
V
Y
 
A
R
 
L
R
 
E
G
 
K
H
 
H
L
 
G
G
 
D
G
 
L
L
 
L
D
 
P
A
 
E
A
 
S
G
 
T
W
 
L
G
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
T
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
V
F
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
S
P
|
P
I
x
L
T
 
T
T
|
T
P
 
P
Q
 
V
G
 
G
Y
 
E
G
 
G
N
 
F
K
 
S
S
|
S
L
 
I
N
|
N
V
 
V
T
 
A
A
 
M
R
|
R
T
 
R
T
 
K
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
|
R
P
 
P
C
 
A
V
 
K
S
 
S
H
 
F
H
 
-
P
 
P
Y
 
N
V
 
T
R
 
K
T
 
S
R
 
R
H
 
F
P
 
A
R
 
D
-
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
I
I
 
T
I
 
V
R
|
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
A
Y
|
Y
-
 
L
-
 
S
A
 
E
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
H
 
V
R
 
S
Q
 
A
T
 
D
D
 
G
D
 
E
V
 
V
I
 
A
Q
 
V
S
 
S
V
 
G
K
 
A
L
 
R
I
 
V
S
 
T
R
 
R
P
 
K
G
 
G
S
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
T
H
 
G
R
 
R
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
I
K
 
K
M
 
S
T
 
T
D
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
K
I
 
V
F
 
A
N
 
R
E
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
T
E
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
I
 
I
K
 
E
A
 
F
D
 
Q
H
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
N
G
 
T
A
 
C
A
 
M
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
M
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
I
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
P
S
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
V
A
 
D
C
 
A
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
A
I
 
V
H
|
H
G
|
G
S
|
S
A
|
A
P
 
P
M
x
D
I
|
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
K
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
C
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
G
A
 
A
V
 
A
M
 
Q
M
 
M
L
 
L
V
 
D
H
 
H
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
P
D
 
Q
V
 
N
A
 
A
A
 
E
R
 
R
I
 
L
H
 
R
N
 
E
A
 
A
W
 
I
L
 
V
K
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
K
D
 
D
G
 
S
V
 
L
H
 
-
T
 
T
V
 
P
D
 
D
I
 
L
F
 
G
N
 
G
R
 
T
G
 
G
V
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
N
T
 
T
H
 
M
A
 
G
F
 
F
A
 
A
D
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
S
R
 
R
L
 
L

6kdyA Crystal structure of the alpha bata heterodimer of human idh3 in complex with NAD. (see paper)
45% identity, 64% coverage: 7:312/481 of query aligns to 5:309/335 of 6kdyA

query
sites
6kdyA
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
I
K
 
Q
V
 
W
E
 
E
E
 
E
V
 
R
P
 
N
A
 
V
G
 
-
E
 
T
Q
 
A
V
 
I
Y
 
Q
R
 
G
R
 
P
G
 
G
H
 
G
L
 
K
G
 
W
G
 
M
L
 
I
D
 
P
A
 
S
A
 
E
G
 
A
W
 
K
G
 
E
S
 
S
I
 
M
R
 
D
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
M
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
|
P
I
x
L
T
 
K
T
|
T
P
 
P
Q
 
I
G
 
A
Y
 
A
G
 
G
N
 
H
K
 
P
S
 
S
L
 
M
N
|
N
V
 
L
T
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
C
V
 
V
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
T
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
I
V
 
V
I
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
V
Q
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
E
P
 
G
G
 
A
S
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
N
N
 
N
H
 
H
R
 
R
R
 
S
K
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
K
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
S
Y
 
C
P
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
N
H
 
E
L
 
M
I
 
Y
V
 
L
D
|
D
I
 
T
G
 
V
A
 
C
A
 
L
R
 
N
L
 
M
A
 
V
D
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
A
D
 
N
A
 
G
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
S
I
 
V
H
|
H
G
|
G
S
x
T
A
|
A
P
 
P
M
x
D
I
|
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
R
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
F
D
 
D
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
E
N
 
A
A
 
A
W
 
C
L
 
F
K
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6kdeA Crystal structure of the alpha beta heterodimer of human idh3 in complex with ca(2+) (see paper)
45% identity, 64% coverage: 7:312/481 of query aligns to 5:309/336 of 6kdeA

query
sites
6kdeA
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
I
K
 
Q
V
 
W
E
 
E
E
 
E
V
 
R
P
 
N
A
 
V
G
 
-
E
 
T
Q
 
A
V
 
I
Y
 
Q
R
 
G
R
 
P
G
 
G
H
 
G
L
 
K
G
 
W
G
 
M
L
 
I
D
 
P
A
 
S
A
 
E
G
 
A
W
 
K
G
 
E
S
 
S
I
 
M
R
 
D
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
M
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
P
I
 
L
T
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
I
G
 
A
Y
 
A
G
 
G
N
 
H
K
 
P
S
 
S
L
 
M
N
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
C
V
 
V
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
T
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
I
V
 
V
I
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
V
Q
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
E
P
 
G
G
 
A
S
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
N
N
 
N
H
 
H
R
 
R
R
 
S
K
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
K
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
S
Y
 
C
P
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
N
H
 
E
L
 
M
I
 
Y
V
 
L
D
|
D
I
 
T
G
 
V
A
 
C
A
 
L
R
 
N
L
 
M
A
 
V
D
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
A
D
 
N
A
 
G
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
S
I
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
R
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
F
D
 
D
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
E
N
 
A
A
 
A
W
 
C
L
 
F
K
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
G

P50213 Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial; Isocitric dehydrogenase subunit alpha; NAD(+)-specific ICDH subunit alpha; EC 1.1.1.41 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
45% identity, 64% coverage: 7:312/481 of query aligns to 34:338/366 of P50213

query
sites
P50213
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
I
K
 
Q
V
 
W
E
 
E
E
 
E
V
 
R
P
 
N
A
 
V
G
 
-
E
 
T
Q
 
A
V
 
I
Y
 
Q
R
 
G
R
 
P
G
 
G
H
 
G
L
 
K
G
 
W
G
 
M
L
 
I
D
 
P
A
 
S
A
 
E
G
 
A
W
 
K
G
 
E
S
 
S
I
 
M
R
 
D
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
M
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
P
I
 
L
T
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
I
G
 
A
Y
 
A
G
 
G
N
 
H
K
 
P
S
 
S
L
 
M
N
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
L
R
|
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
|
A
N
 
N
V
 
V
R
|
R
P
 
P
C
 
C
V
 
V
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
T
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
I
V
 
V
I
 
T
I
 
I
R
|
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
x
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
V
Q
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
K
|
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
E
P
 
G
G
x
A
S
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
N
N
 
N
H
 
H
R
 
R
R
 
S
K
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
|
N
V
 
I
M
|
M
K
 
R
M
 
M
T
 
S
D
|
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
K
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
S
Y
 
C
P
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
N
H
 
E
L
 
M
I
 
Y
V
 
L
D
|
D
I
 
T
G
 
V
A
 
C
A
 
L
R
 
N
L
x
M
A
 
V
D
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
A
D
 
N
A
 
G
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
S
I
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
 
N
P
|
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
|
M
M
 
M
L
 
L
V
x
R
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
F
D
 
D
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
E
N
 
A
A
 
A
W
 
C
L
 
F
K
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
G

Q9D6R2 Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial; Isocitric dehydrogenase subunit alpha; NAD(+)-specific ICDH subunit alpha; EC 1.1.1.41 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
44% identity, 64% coverage: 7:312/481 of query aligns to 34:338/366 of Q9D6R2

query
sites
Q9D6R2
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
A
A
 
S
V
 
V
L
 
M
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
I
K
 
Q
V
 
W
E
 
E
E
 
E
V
 
R
P
 
N
A
 
V
G
 
-
E
 
T
Q
 
A
V
 
I
Y
 
Q
R
 
G
R
 
P
G
 
G
H
 
G
L
 
K
G
 
W
G
 
M
L
 
I
D
 
P
A
 
P
A
 
E
G
 
A
W
 
K
G
 
E
S
 
S
I
 
M
R
 
D
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
M
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
P
I
 
L
T
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
I
G
 
A
Y
 
A
G
 
G
N
 
H
K
 
P
S
 
S
L
 
M
N
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
C
V
 
V
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
T
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
I
V
 
V
I
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
V
Q
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
E
P
 
E
G
 
A
S
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
N
N
 
N
H
 
H
R
 
R
R
 
S
K
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
 
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
K
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
N
Y
 
C
P
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
N
H
x
E
L
 
M
I
 
Y
V
 
L
D
 
D
I
 
T
G
 
V
A
 
C
A
 
L
R
 
N
L
 
M
A
 
V
D
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
A
D
 
N
A
 
G
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
S
I
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
R
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
F
D
 
D
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
I
H
 
E
N
 
A
A
 
A
W
 
C
L
 
F
K
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
G

5yvtA Crystal structure of the alpha gamma heterodimer of human idh3 in complex with mg(2+) and nadh (see paper)
45% identity, 64% coverage: 7:312/481 of query aligns to 4:306/332 of 5yvtA

query
sites
5yvtA
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
I
K
 
Q
V
 
W
E
 
E
E
 
E
V
 
R
P
 
N
A
 
V
G
 
-
E
 
T
Q
 
A
V
 
I
Y
 
Q
R
 
G
R
 
P
G
 
G
H
 
G
L
 
K
G
 
W
G
 
M
L
 
I
D
 
P
A
 
S
A
 
E
G
 
A
W
 
K
G
 
E
S
 
S
I
 
M
R
 
D
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
M
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
P
I
x
L
T
 
K
T
|
T
P
 
P
Q
 
-
G
 
-
Y
 
I
G
 
A
N
 
A
K
 
P
S
 
S
L
 
M
N
|
N
V
 
L
T
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
C
V
 
V
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
T
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
I
V
 
V
I
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
V
Q
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
E
P
 
G
G
 
A
S
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
N
N
 
N
H
 
H
R
 
R
R
 
S
K
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
|
N
V
 
I
M
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
K
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
S
Y
 
C
P
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
N
H
 
E
L
 
M
I
 
Y
V
 
L
D
|
D
I
 
T
G
 
V
A
 
C
A
 
L
R
 
N
L
 
M
A
 
V
D
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
A
D
 
N
A
 
G
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
|
E
A
 
S
I
x
V
H
|
H
G
|
G
S
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
D
I
|
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
R
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
F
D
 
D
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
E
N
 
A
A
 
A
W
 
C
L
 
F
K
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6l59A Crystal structure of the alpha gamma heterodimer of human idh3 in complex with cit, mg and atp binding at allosteric site and mg, atp binding at active site. (see paper)
45% identity, 64% coverage: 7:312/481 of query aligns to 4:297/325 of 6l59A

query
sites
6l59A
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
I
K
 
Q
V
 
W
E
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
N
V
 
V
P
 
T
A
 
A
G
 
I
E
 
Q
Q
 
W
V
 
M
Y
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
I
D
 
P
A
 
S
A
 
E
G
 
A
W
 
K
G
 
E
S
 
S
I
 
M
R
 
D
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
M
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
P
I
 
L
T
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
-
S
 
S
L
 
M
N
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
C
V
 
V
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
T
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
I
V
 
V
I
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
V
Q
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
E
P
 
G
G
 
A
S
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
N
N
 
N
H
 
H
R
 
R
R
 
S
K
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
K
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
S
Y
 
C
P
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
N
H
 
E
L
 
M
I
 
Y
V
 
L
D
|
D
I
 
T
G
 
V
A
 
C
A
 
L
R
 
N
L
 
M
A
 
V
D
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
A
D
 
N
A
 
G
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
S
I
 
V
H
|
H
G
|
G
S
x
T
A
|
A
P
 
P
M
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
R
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
F
D
 
D
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
E
N
 
A
A
 
A
W
 
C
L
 
F
K
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5greA Crystal structure of the alpha gamma heterodimer of human idh3 in complex with mg(2+), citrate and adp (see paper)
45% identity, 64% coverage: 7:312/481 of query aligns to 4:298/325 of 5greA

query
sites
5greA
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
I
K
 
Q
V
 
W
E
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
N
V
 
V
P
 
T
A
 
A
G
 
I
E
 
Q
Q
 
W
V
 
M
Y
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
I
D
 
P
A
 
S
A
 
E
G
 
A
W
 
K
G
 
E
S
 
S
I
 
M
R
 
D
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
M
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
P
I
 
L
T
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
P
S
 
S
L
 
M
N
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
C
V
 
V
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
T
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
I
V
 
V
I
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
V
Q
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
E
P
 
G
G
 
A
S
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
N
N
 
N
H
 
H
R
 
R
R
 
S
K
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
K
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
S
Y
 
C
P
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
N
H
 
E
L
 
M
I
 
Y
V
 
L
D
|
D
I
 
T
G
 
V
A
 
C
A
 
L
R
 
N
L
 
M
A
 
V
D
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
A
D
 
N
A
 
G
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
S
I
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
R
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
F
D
 
D
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
E
N
 
A
A
 
A
W
 
C
L
 
F
K
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
G

8grdA Crystal structure of a constitutively active mutant of the alpha beta heterodimer of human idh3 in complex with adp and mg (see paper)
44% identity, 64% coverage: 7:312/481 of query aligns to 4:299/325 of 8grdA

query
sites
8grdA
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
M
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
A
R
 
P
L
 
I
K
 
Q
V
 
W
E
 
E
E
 
E
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
R
E
 
N
Q
 
V
V
 
T
Y
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
H
 
W
L
 
M
G
 
-
G
 
-
L
 
I
D
 
P
A
 
S
A
 
E
G
 
A
W
 
K
G
 
E
S
 
S
I
 
M
R
 
D
R
 
K
T
 
N
R
 
K
V
 
M
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
P
I
 
L
T
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
P
S
 
S
L
 
M
N
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
C
V
 
V
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
P
H
 
Y
P
 
T
R
 
D
M
 
V
D
 
N
V
 
I
V
 
V
I
 
T
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
V
Q
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
A
S
 
S
V
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
E
P
 
G
G
 
A
S
 
S
E
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
N
N
 
N
H
 
H
R
 
R
R
 
S
K
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
 
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
R
M
 
M
T
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
K
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
S
Y
 
C
P
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
F
D
 
N
H
 
E
L
 
M
I
x
Y
V
 
L
D
 
D
I
x
T
G
 
V
A
 
C
A
 
L
R
 
N
L
 
M
A
 
V
D
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
A
D
 
N
A
 
G
C
 
V
A
 
A
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
S
I
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
T
A
 
A
P
 
P
M
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
R
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
F
D
 
D
V
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
E
N
 
A
A
 
A
W
 
C
L
 
F
K
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
G

3blwF Yeast isocitrate dehydrogenase with citrate and amp bound in the regulatory subunits (see paper)
42% identity, 70% coverage: 7:341/481 of query aligns to 21:347/347 of 3blwF

query
sites
3blwF
I
 
V
T
 
S
V
 
F
A
 
I
R
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
K
A
 
S
V
 
V
L
 
K
H
 
K
V
 
I
M
 
F
E
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
V
R
 
P
L
 
I
K
 
E
V
 
W
E
 
E
E
 
S
V
 
C
P
 
D
A
 
V
G
 
S
E
 
-
Q
 
P
V
 
I
Y
 
F
R
 
V
R
 
N
G
 
G
H
 
-
L
 
L
G
 
T
G
 
T
L
 
I
D
 
P
A
 
D
A
 
P
G
 
A
W
 
V
G
 
Q
S
 
S
I
 
I
R
 
T
R
 
K
T
 
N
R
 
L
V
 
V
F
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
P
I
 
L
T
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
H
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
R
S
 
S
L
 
L
N
 
N
V
 
L
T
 
T
A
 
L
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
F
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
R
P
 
P
C
 
A
V
 
K
S
 
S
H
 
I
H
 
E
P
 
G
Y
 
F
V
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
T
H
 
Y
P
 
E
R
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
I
Q
 
V
T
 
C
D
 
P
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
R
 
R
P
 
D
G
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
I
H
 
G
R
 
R
R
 
P
K
 
R
V
 
V
T
 
I
A
 
V
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
S
N
x
T
V
 
I
M
 
Q
K
 
R
M
 
L
T
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
V
K
 
N
I
 
V
F
 
A
N
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
S
A
 
K
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
E
 
D
I
 
L
K
 
T
A
 
L
D
 
E
H
 
T
L
 
E
I
 
L
V
 
I
D
|
D
I
 
N
G
 
S
A
 
V
A
 
L
R
 
K
L
 
V
A
 
V
D
 
T
Q
 
N
P
 
P
E
 
S
R
 
A
F
 
Y
D
 
T
-
 
D
-
 
A
V
 
V
I
 
S
V
 
V
T
 
C
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
N
A
 
S
Q
 
G
I
 
L
T
 
S
-
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
T
G
 
P
S
 
S
A
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
H
A
 
K
C
 
I
A
 
S
M
 
I
F
 
F
E
 
E
A
 
A
I
 
V
H
 
H
G
 
G
S
 
S
A
 
A
P
 
P
M
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
D
I
 
K
A
 
A
N
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
N
H
 
H
I
 
M
G
 
G
Q
 
L
G
 
T
D
 
N
V
 
H
A
 
A
A
 
D
R
 
Q
I
 
I
H
 
Q
N
 
N
A
 
A
W
 
V
L
 
L
K
 
S
T
 
T
I
 
I
E
 
A
D
 
S
G
 
G
V
 
P
H
 
E
T
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
F
 
-
N
 
N
R
 
R
-
 
T
G
 
G
V
 
D
S
 
L
R
 
A
Q
 
G
R
 
T
V
 
A
G
 
T
T
 
T
H
 
S
A
 
S
F
 
F
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
K
R
 
R
L
 
L

P51553 Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial; Isocitric dehydrogenase subunit gamma; NAD(+)-specific ICDH subunit gamma from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
40% identity, 67% coverage: 7:328/481 of query aligns to 57:376/393 of P51553

query
sites
P51553
I
 
V
T
 
T
V
 
M
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
L
T
 
M
D
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
K
H
 
S
V
 
V
M
 
F
E
 
R
A
 
H
A
 
A
G
 
C
A
 
V
R
 
P
L
 
V
K
 
D
V
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
H
-
 
V
-
 
S
-
 
S
P
 
N
A
 
A
G
 
D
E
 
E
Q
 
E
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
R
 
N
G
 
A
H
 
I
L
 
M
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
T
 
N
R
 
R
V
 
V
F
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
x
N
I
 
I
T
 
E
T
|
T
P
 
N
Q
 
H
G
 
N
Y
 
L
-
 
P
-
 
P
G
 
S
N
 
H
K
 
K
S
|
S
L
 
R
N
 
N
V
x
N
T
 
I
A
 
L
R
|
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
I
P
 
H
C
 
C
V
 
K
S
 
S
H
 
L
H
 
-
P
 
P
Y
 
G
V
 
V
R
 
V
T
 
T
R
 
R
H
 
H
P
 
K
R
 
D
M
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
I
I
 
V
R
|
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
x
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
S
I
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
E
Q
 
S
T
 
V
D
 
A
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
S
V
 
L
K
|
K
L
 
I
I
 
I
S
 
T
R
 
K
P
 
A
G
 
K
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
N
 
S
H
 
G
R
 
R
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
 
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
K
M
 
L
T
 
G
D
|
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
C
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
P
 
P
E
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
F
D
 
E
H
 
N
L
 
M
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
N
G
 
T
A
 
T
A
 
M
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
S
Q
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
M
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
D
 
N
I
 
I
V
 
V
S
 
N
D
 
N
I
 
V
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
G
 
G
S
 
G
V
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
V
G
 
A
S
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
Y
G
 
G
D
 
H
A
 
V
C
 
Y
A
 
A
M
 
V
F
 
F
E
 
E
-
 
T
A
 
A
I
 
T
H
x
R
G
x
N
S
x
T
A
 
G
P
x
K
M
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
N
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
C
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
D
H
 
H
I
 
L
G
 
K
Q
 
L
G
 
H
D
 
S
V
 
Y
A
 
A
A
 
T
R
 
S
I
 
I
H
 
R
N
 
K
A
 
A
W
 
V
L
 
L
K
 
A
T
 
S
I
 
M
E
 
D
-
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
M
H
 
H
T
 
T
V
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
G
N
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
T
S
 
T
R
 
S
Q
 
E
R
 
A
V
 
I

5yvtB Crystal structure of the alpha gamma heterodimer of human idh3 in complex with mg(2+) and nadh (see paper)
40% identity, 67% coverage: 7:328/481 of query aligns to 4:323/333 of 5yvtB

query
sites
5yvtB
I
 
V
T
 
T
V
 
M
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
L
T
 
M
D
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
K
H
 
S
V
 
V
M
 
F
E
 
R
A
 
H
A
 
A
G
 
C
A
 
V
R
 
P
L
 
V
K
 
D
V
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
H
-
 
V
-
 
S
-
 
S
P
 
N
A
 
A
G
 
D
E
 
E
Q
 
E
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
R
 
N
G
 
A
H
 
I
L
 
M
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
T
 
N
R
 
R
V
 
V
F
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
x
E
T
|
T
P
 
N
Q
 
H
G
 
N
Y
 
L
-
 
P
-
 
P
G
 
S
N
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
R
N
 
N
V
 
N
T
 
I
A
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
I
P
 
H
C
 
C
V
 
K
S
 
S
H
 
L
H
 
-
P
 
P
Y
 
G
V
 
V
R
 
V
T
 
T
R
 
R
H
 
H
P
 
K
R
 
D
M
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
I
I
 
V
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
S
I
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
E
Q
 
S
T
 
V
D
 
A
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
S
V
 
L
K
 
K
L
 
I
I
 
I
S
 
T
R
 
K
P
 
A
G
 
K
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
N
 
S
H
 
G
R
 
R
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
K
M
 
L
T
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
C
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
P
 
P
E
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
F
D
 
E
H
 
N
L
 
M
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
N
G
 
T
A
 
T
A
 
M
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
S
Q
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
M
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
x
N
I
 
I
V
 
V
S
 
N
D
x
N
I
 
V
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
G
 
G
S
 
G
V
x
P
G
|
G
L
 
L
A
 
V
G
 
A
S
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
Y
G
 
G
D
 
H
A
 
V
C
 
Y
A
 
A
M
 
V
F
 
F
E
 
E
-
 
T
A
 
A
I
 
T
H
x
R
G
x
N
S
x
T
A
x
G
P
 
K
M
x
S
I
|
I
A
 
A
G
 
N
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
A
|
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
C
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
D
H
 
H
I
 
L
G
 
K
Q
 
L
G
 
H
D
 
S
V
 
Y
A
 
A
A
 
T
R
 
S
I
 
I
H
 
R
N
 
K
A
 
A
W
 
V
L
 
L
K
 
A
T
 
S
I
 
M
E
 
D
-
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
M
H
 
H
T
 
T
V
 
P
D
|
D
I
 
I
F
 
G
N
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
T
S
 
T
R
 
S
Q
 
E
R
 
A
V
 
I

6l57B Crystal structure of the alpha gamma heterodimer of human idh3 in complex with cit , mg and atp binding at allosteric site. (see paper)
40% identity, 67% coverage: 7:328/481 of query aligns to 4:323/332 of 6l57B

query
sites
6l57B
I
 
V
T
 
T
V
 
M
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
L
T
 
M
D
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
K
H
 
S
V
 
V
M
 
F
E
 
R
A
 
H
A
 
A
G
 
C
A
 
V
R
 
P
L
 
V
K
 
D
V
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
H
-
 
V
-
 
S
-
 
S
P
 
N
A
 
A
G
 
D
E
 
E
Q
 
E
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
R
 
N
G
 
A
H
 
I
L
 
M
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
T
 
N
R
 
R
V
 
V
F
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
x
N
I
 
I
T
 
E
T
 
T
P
 
N
Q
 
H
G
 
N
Y
 
L
-
 
P
-
 
P
G
 
S
N
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
R
N
 
N
V
 
N
T
 
I
A
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
I
P
 
H
C
 
C
V
 
K
S
 
S
H
 
L
H
 
-
P
 
P
Y
 
G
V
 
V
R
 
V
T
 
T
R
 
R
H
 
H
P
 
K
R
 
D
M
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
I
I
 
V
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
S
I
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
E
Q
 
S
T
 
V
D
 
A
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
S
V
 
L
K
 
K
L
 
I
I
 
I
S
 
T
R
 
K
P
 
A
G
 
K
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
N
 
S
H
 
G
R
 
R
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
K
M
 
L
T
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
C
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
P
 
P
E
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
F
D
 
E
H
 
N
L
 
M
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
N
G
 
T
A
 
T
A
 
M
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
S
Q
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
M
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
x
N
I
 
I
V
 
V
S
 
N
D
 
N
I
 
V
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
G
 
G
S
 
G
V
x
P
G
 
G
L
 
L
A
 
V
G
 
A
S
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
Y
G
 
G
D
 
H
A
 
V
C
 
Y
A
 
A
M
 
V
F
 
F
E
 
E
-
 
T
A
 
A
I
 
T
H
x
R
G
x
N
S
x
T
A
x
G
P
x
K
M
x
S
I
|
I
A
 
A
G
 
N
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
C
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
D
H
 
H
I
 
L
G
 
K
Q
 
L
G
 
H
D
 
S
V
 
Y
A
 
A
A
 
T
R
 
S
I
 
I
H
 
R
N
 
K
A
 
A
W
 
V
L
 
L
K
 
A
T
 
S
I
 
M
E
 
D
-
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
M
H
 
H
T
 
T
V
 
P
D
|
D
I
 
I
F
 
G
N
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
T
S
 
T
R
 
S
Q
 
E
R
 
A
V
 
I

3blvC Yeast isocitrate dehydrogenase with citrate bound in the regulatory subunits (see paper)
37% identity, 70% coverage: 7:344/481 of query aligns to 20:344/344 of 3blvC

query
sites
3blvC
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
S
V
 
V
L
 
R
H
 
T
V
 
I
M
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
E
G
 
N
A
 
I
R
 
P
L
 
I
K
 
D
V
 
W
E
 
E
E
 
T
V
 
I
P
 
N
A
 
I
G
 
K
E
 
E
Q
 
G
V
 
V
Y
 
Y
R
 
E
R
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
A
W
 
V
G
 
E
S
 
S
I
 
L
R
 
K
R
 
R
T
 
N
R
 
K
V
 
I
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
L
I
 
W
T
 
H
T
|
T
P
 
P
-
 
A
Q
 
D
G
 
Q
Y
 
T
G
 
G
N
 
H
K
 
G
S
|
S
L
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
A
A
 
L
R
|
R
T
 
K
T
 
Q
L
 
L
G
 
D
L
 
I
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
A
P
 
L
C
 
F
V
 
K
S
 
S
H
 
L
H
 
K
P
 
G
Y
 
-
V
 
V
R
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
I
P
 
P
R
 
D
M
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
I
I
 
V
I
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
x
F
A
 
S
G
 
G
I
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
E
Q
 
S
T
 
V
D
 
P
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
S
V
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
M
S
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
K
S
 
T
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
R
 
K
A
 
K
N
 
Y
H
 
N
R
 
R
R
 
K
K
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
K
M
 
L
T
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
R
K
 
N
I
 
I
F
 
I
N
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
G
-
 
Q
A
 
K
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
E
 
D
I
 
I
K
 
D
A
 
V
D
 
S
H
 
S
L
 
I
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
N
G
 
A
A
 
S
A
 
M
R
 
Q
L
 
A
A
 
V
D
 
A
Q
 
K
P
 
P
E
 
H
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
P
N
 
S
L
 
M
Y
 
Y
G
 
G
D
x
T
I
 
I
V
 
L
S
 
G
D
x
N
I
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
V
G
 
A
S
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
F
G
 
G
D
 
R
A
 
D
C
 
Y
A
 
A
M
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
P
I
 
-
H
 
-
G
 
G
S
 
S
A
x
R
P
 
H
M
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
D
I
 
I
A
 
K
G
 
G
Q
 
Q
G
 
N
I
 
V
A
 
A
N
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
M
L
 
I
M
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
T
M
 
L
M
 
M
L
 
L
V
 
N
H
 
H
I
 
L
G
 
G
Q
 
L
G
 
N
D
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
T
R
 
R
I
 
I
H
 
S
N
 
K
A
 
A
W
 
V
L
 
H
K
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
K
H
 
H
T
 
T
V
 
T
D
 
R
I
 
D
F
 
I
N
 
G
R
 
G
G
 
S
V
 
S
S
 
S
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
T
H
 
T
A
 
D
F
 
F
A
 
T
D
 
N
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
N
R
 
K
L
 
L
G
 
S
Q
 
T
M
 
M

3blwA Yeast isocitrate dehydrogenase with citrate and amp bound in the regulatory subunits (see paper)
37% identity, 70% coverage: 7:344/481 of query aligns to 5:329/329 of 3blwA

query
sites
3blwA
I
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
S
V
 
V
L
 
R
H
 
T
V
 
I
M
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
E
G
 
N
A
 
I
R
 
P
L
 
I
K
 
D
V
 
W
E
 
E
E
 
T
V
 
I
P
 
N
A
 
I
G
 
K
E
 
E
Q
 
G
V
 
V
Y
 
Y
R
 
E
R
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
A
W
 
V
G
 
E
S
 
S
I
 
L
R
 
K
R
 
R
T
 
N
R
 
K
V
 
I
F
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
L
I
 
W
T
 
H
T
|
T
P
 
P
-
 
A
Q
 
D
G
 
Q
Y
 
T
G
 
G
N
 
H
K
 
G
S
|
S
L
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
A
A
 
L
R
|
R
T
 
K
T
 
Q
L
 
L
G
 
D
L
 
I
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
A
P
 
L
C
 
F
V
 
K
S
 
S
H
 
L
H
 
K
P
 
G
Y
 
-
V
 
V
R
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
I
P
 
P
R
 
D
M
 
I
D
 
D
V
 
L
V
 
I
I
 
V
I
 
I
R
|
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
x
F
A
 
S
G
 
G
I
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
E
Q
 
S
T
 
V
D
 
P
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
S
V
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
M
S
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
K
S
 
T
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
R
 
K
A
 
K
N
 
Y
H
 
N
R
 
R
R
 
K
K
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
K
M
 
L
T
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
R
K
 
N
I
 
I
F
 
I
N
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
G
-
 
Q
A
 
K
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
E
 
D
I
 
I
K
 
D
A
 
V
D
 
S
H
 
S
L
 
I
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
N
G
 
A
A
 
S
A
 
M
R
 
Q
L
 
A
A
 
V
D
 
A
Q
 
K
P
 
P
E
 
H
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
P
N
 
S
L
 
M
Y
 
Y
G
 
G
D
x
T
I
 
I
V
 
L
S
 
G
D
x
N
I
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
V
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
V
G
 
A
S
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
F
G
 
G
D
 
R
A
 
D
C
 
Y
A
 
A
M
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
P
I
 
-
H
 
-
G
 
G
S
 
S
A
x
R
P
 
H
M
 
V
-
x
G
-
 
L
-
 
D
I
 
I
A
 
K
G
 
G
Q
 
Q
G
 
N
I
 
V
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
M
L
 
I
M
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
T
M
 
L
M
 
M
L
 
L
V
 
N
H
 
H
I
 
L
G
 
G
Q
 
L
G
 
N
D
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
T
R
 
R
I
 
I
H
 
S
N
 
K
A
 
A
W
 
V
L
 
H
K
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
K
H
 
H
T
 
T
V
 
T
D
 
R
I
x
D
F
 
I
N
 
G
R
 
G
G
 
S
V
 
S
S
 
S
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
T
H
 
T
A
 
D
F
 
F
A
 
T
D
 
N
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
N
R
 
K
L
 
L
G
 
S
Q
 
T
M
 
M

5grfB Crystal structure of the alpha gamma mutant (gamma-k151a) of human idh3 in complex with mg(2+), citrate and adp (see paper)
39% identity, 67% coverage: 7:328/481 of query aligns to 4:323/335 of 5grfB

query
sites
5grfB
I
 
V
T
 
T
V
 
M
A
 
I
R
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
I
 
L
T
 
M
D
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
K
H
 
S
V
 
V
M
 
F
E
 
R
A
 
H
A
 
A
G
 
C
A
 
V
R
 
P
L
 
V
K
 
D
V
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
H
-
 
V
-
 
S
-
 
S
P
 
N
A
 
A
G
 
D
E
 
E
Q
 
E
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
R
 
N
G
 
A
H
 
I
L
 
M
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
T
 
N
R
 
R
V
 
V
F
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
x
N
I
 
I
T
 
E
T
 
T
P
 
N
Q
 
H
G
 
N
Y
 
L
-
 
P
-
 
P
G
 
S
N
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
R
N
 
N
V
 
N
T
 
I
A
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
 
I
P
 
H
C
 
C
V
 
K
S
 
S
H
 
L
H
 
-
P
 
P
Y
 
G
V
 
V
R
 
V
T
 
T
R
 
R
H
 
H
P
 
K
R
 
D
M
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
I
 
I
I
 
V
R
 
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
E
Y
|
Y
A
 
S
G
 
S
I
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
E
Q
 
S
T
 
V
D
 
A
D
 
G
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
S
V
 
L
K
 
A
L
 
I
I
 
I
S
 
T
R
 
K
P
 
A
G
 
K
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
I
V
 
A
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
K
Y
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
N
 
S
H
 
G
R
 
R
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
I
M
 
M
K
 
K
M
 
L
T
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
I
 
C
F
 
C
N
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
P
 
P
E
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
F
D
 
E
H
 
N
L
 
M
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
N
G
 
T
A
 
T
A
 
M
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
S
Q
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
M
V
 
V
T
 
M
L
 
P
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
x
N
I
 
I
V
 
V
S
 
N
D
x
N
I
 
V
A
 
C
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
G
 
G
S
 
G
V
x
P
G
 
G
L
 
L
A
 
V
G
 
A
S
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
Y
G
 
G
D
 
H
A
 
V
C
 
Y
A
 
A
M
 
V
F
 
F
E
 
E
-
 
T
A
 
A
I
 
T
H
x
R
G
x
N
S
x
T
A
x
G
P
x
K
M
 
S
I
|
I
A
 
A
G
 
N
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
T
L
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
C
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
D
H
 
H
I
 
L
G
 
K
Q
 
L
G
 
H
D
 
S
V
 
Y
A
 
A
A
 
T
R
 
S
I
 
I
H
 
R
N
 
K
A
 
A
W
 
V
L
 
L
K
 
A
T
 
S
I
 
M
E
 
D
-
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
M
H
 
H
T
 
T
V
 
P
D
|
D
I
 
I
F
 
G
N
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
T
S
 
T
R
 
S
Q
 
E
R
 
A
V
 
I

4yb4A Crystal structure of homoisocitrate dehydrogenase from thermus thermophilus in complex with homoisocitrate, magnesium ion (ii) and nadh
40% identity, 70% coverage: 7:344/481 of query aligns to 4:333/333 of 4yb4A

query
sites
4yb4A
I
 
I
T
 
C
V
 
L
A
 
I
R
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
H
E
 
E
I
 
V
T
 
I
D
 
P
A
 
A
V
 
A
L
 
R
H
 
R
V
 
V
M
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
L
R
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
F
E
 
V
E
 
E
V
 
A
P
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
W
Q
 
E
V
 
T
Y
 
F
-
 
E
R
 
R
R
 
R
G
 
G
H
 
T
L
 
-
G
 
-
G
 
S
L
 
V
D
 
P
A
 
E
A
 
E
G
 
T
W
 
V
G
 
E
S
 
K
I
 
I
R
 
L
R
 
S
T
 
C
R
 
H
V
 
A
F
 
T
L
 
L
K
 
F
G
 
G
P
 
A
I
x
A
T
|
T
T
x
S
P
 
P
-
 
T
-
 
R
Q
 
K
G
 
V
Y
 
P
G
 
G
N
 
F
K
 
F
S
 
G
L
 
A
N
 
I
V
x
R
T
 
Y
A
 
L
R
|
R
T
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
|
R
P
 
P
C
 
A
V
 
K
S
 
S
H
 
R
H
 
P
P
 
-
Y
 
-
V
 
V
R
 
P
T
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
P
R
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
V
R
|
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
L
Y
|
Y
A
 
V
G
 
E
I
 
Q
E
 
E
H
 
R
R
 
R
Q
 
Y
T
 
L
D
 
D
D
 
V
V
 
A
I
 
I
Q
 
A
S
 
D
V
 
A
K
 
-
L
 
V
I
 
I
S
 
S
R
 
K
P
 
K
G
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
G
R
 
R
Y
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
G
N
 
R
H
 
P
R
 
R
R
 
K
K
 
T
V
 
L
T
 
H
A
 
I
F
 
A
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
V
M
 
L
K
 
P
M
 
L
T
 
T
D
 
Q
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
D
I
 
T
F
 
V
N
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
D
Y
 
F
P
 
P
E
 
L
I
 
V
K
 
N
A
 
V
D
 
Q
H
 
D
L
 
I
I
|
I
V
 
V
D
|
D
I
x
N
G
 
C
A
 
A
A
 
M
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
M
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
G
 
G
S
 
G
V
x
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
T
C
 
T
A
 
A
M
 
V
F
 
F
E
|
E
A
 
P
I
 
V
H
|
H
G
|
G
S
|
S
A
|
A
P
 
P
M
x
D
I
|
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
|
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
A
L
 
I
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
A
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
D
H
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
G
 
K
D
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
I
 
V
H
 
E
N
 
K
A
 
A
W
 
V
L
 
D
K
 
L
T
 
V
I
 
L
E
 
E
D
 
R
G
 
G
V
 
P
H
 
R
T
 
T
V
 
P
D
|
D
I
 
L
F
 
G
N
 
G
R
 
D
G
 
A
V
 
T
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
T
H
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
K
Q
 
S
M
 
L

3asjB Crystal structure of homoisocitrate dehydrogenase in complex with a designed inhibitor (see paper)
40% identity, 70% coverage: 7:344/481 of query aligns to 4:333/333 of 3asjB

query
sites
3asjB
I
 
I
T
 
C
V
 
L
A
 
I
R
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
H
E
 
E
I
 
V
T
 
I
D
 
P
A
 
A
V
 
A
L
 
R
H
 
R
V
 
V
M
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
L
R
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
F
E
 
V
E
 
E
V
 
A
P
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
W
Q
 
E
V
 
T
Y
 
F
-
 
E
R
 
R
R
 
R
G
 
G
H
 
T
L
 
-
G
 
-
G
 
S
L
 
V
D
 
P
A
 
E
A
 
E
G
 
T
W
 
V
G
 
E
S
 
K
I
 
I
R
 
L
R
 
S
T
 
C
R
 
H
V
 
A
F
 
T
L
 
L
K
 
F
G
 
G
P
 
A
I
 
A
T
 
T
T
 
S
P
 
P
-
 
T
-
 
R
Q
 
K
G
 
V
Y
 
P
G
 
G
N
 
F
K
 
F
S
 
G
L
 
A
N
 
I
V
x
R
T
 
Y
A
 
L
R
 
R
T
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
D
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
R
|
R
P
 
P
C
 
A
V
 
K
S
 
S
H
 
R
H
 
P
P
 
-
Y
 
-
V
 
V
R
 
P
T
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
P
R
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
V
R
|
R
E
 
E
N
 
N
E
 
T
E
 
E
D
 
G
L
 
L
Y
|
Y
A
 
V
G
 
E
I
 
Q
E
 
E
H
 
R
R
 
R
Q
 
Y
T
 
L
D
 
D
D
 
V
V
 
A
I
 
I
Q
 
A
S
 
D
V
 
A
K
 
-
L
 
V
I
 
I
S
 
S
R
 
K
P
 
K
G
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
G
R
 
R
Y
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
G
N
 
R
H
 
P
R
 
R
R
 
K
K
 
T
V
 
L
T
 
H
A
 
I
F
 
A
V
 
H
K
|
K
D
 
A
N
 
N
V
 
V
M
 
L
K
 
P
M
 
L
T
 
T
D
 
Q
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
K
 
D
I
 
T
F
 
V
N
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
D
Y
 
F
P
 
P
E
 
L
I
 
V
K
 
N
A
 
V
D
 
Q
H
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
N
G
 
C
A
 
A
A
 
M
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
D
 
M
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
D
|
D
I
 
I
V
 
L
S
 
S
D
|
D
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
T
 
V
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
P
S
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
T
C
 
T
A
 
A
M
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
P
I
x
V
H
 
H
G
 
G
S
 
S
A
 
A
P
 
P
M
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
A
L
 
A
L
 
I
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
A
M
 
M
M
 
M
L
 
L
V
 
D
H
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
G
 
K
D
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
I
 
V
H
 
E
N
 
K
A
 
A
W
 
V
L
 
D
K
 
L
T
 
V
I
 
L
E
 
E
D
 
R
G
 
G
V
 
P
H
 
R
T
 
T
V
 
P
D
 
D
I
 
L
F
 
G
N
 
G
R
 
D
G
 
A
V
 
T
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
T
H
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
K
Q
 
S
M
 
L

Query Sequence

>AZOBR_RS11025 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS11025
MRETTPITVARGDGIGPEITDAVLHVMEAAGARLKVEEVPAGEQVYRRGHLGGLDAAGWG
SIRRTRVFLKGPITTPQGYGNKSLNVTARTTLGLFANVRPCVSHHPYVRTRHPRMDVVII
RENEEDLYAGIEHRQTDDVIQSVKLISRPGSERIVRYAFDYARANHRRKVTAFVKDNVMK
MTDGLFLKIFNEIAAEYPEIKADHLIVDIGAARLADQPERFDVIVTLNLYGDIVSDIAAQ
ITGSVGLAGSANIGDACAMFEAIHGSAPMIAGQGIANPSGLLMAAVMMLVHIGQGDVAAR
IHNAWLKTIEDGVHTVDIFNRGVSRQRVGTHAFADAVVERLGQMPVTLPTVGYAVTARPA
YESGVRLSPRRKAVKELVGVDVFLHWPGGNPDELAGLVLPVATPALRLSSISNRSQKVWP
EGNIGVFCTDHWRCRFLAPEGVAVGHPDIVELLSGLARAGLDFTQTENLCNFDGKSGFSA
T

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory