SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_3348 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3348 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
54% identity, 98% coverage: 1:181/184 of query aligns to 28:208/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
V
 
L
I
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
A
D
 
E
V
 
K
L
 
I
L
 
K
A
 
Q
E
 
E
I
 
V
Q
 
D
R
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
V
T
 
T
L
 
L
S
 
M
Q
 
Q
I
 
I
W
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
A
 
G
H
 
H
I
 
L
D
|
D
H
|
H
A
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
A
G
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
L
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
E
P
 
K
G
 
E
D
 
D
Q
 
E
F
 
F
W
 
W
I
 
L
D
 
Q
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
Q
 
Q
S
 
S
A
 
R
M
 
M
F
 
F
G
 
G
F
 
L
P
 
D
P
 
E
A
 
C
Q
 
Q
H
 
P
F
 
L
T
 
T
P
 
P
T
 
D
R
 
R
W
 
W
L
 
L
A
 
N
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
R
V
 
V
Q
 
S
I
 
V
G
 
G
D
 
N
E
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
R
 
L
H
 
H
C
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
V
V
 
V
F
 
F
H
 
F
A
 
D
P
 
E
Q
 
Q
I
 
S
D
 
Q
R
 
L
A
 
L
F
 
I
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
L
 
I
F
 
F
A
 
K
G
 
G
S
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
S
D
 
D
F
 
F
P
 
P
M
 
R
G
 
G
N
 
D
H
 
H
Q
 
T
D
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
A
I
 
I
T
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
W
 
L
P
 
P
M
 
L
G
 
G
D
 
D
Q
 
D
T
 
V
V
 
T
F
 
F
I
 
I
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
E
 
L
S
 
S
T
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
R
 
R
K
 
L
S
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
V
 
L

7ev5A Crystal structure of bleg-1 b3 metallo-beta-lactamase (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:183/184 of query aligns to 26:209/209 of 7ev5A

query
sites
7ev5A
V
 
I
I
 
F
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
A
D
 
E
V
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
T
E
 
W
I
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
E
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
L
 
P
S
 
L
Q
 
A
I
 
I
W
 
L
L
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
A
H
|
H
I
 
F
D
|
D
H
|
H
A
 
I
G
 
G
G
 
A
T
 
V
G
 
D
E
 
A
L
 
V
A
 
R
T
 
D
R
 
T
L
 
F
G
 
S
L
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
Y
G
 
-
P
 
L
H
 
H
P
 
T
G
 
K
D
 
E
Q
 
R
F
 
H
W
 
W
I
 
L
D
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
A
L
 
L
P
 
N
Q
 
G
Q
 
S
S
 
S
A
 
R
M
 
L
F
 
T
G
 
G
F
 
R
P
 
P
P
 
I
A
 
T
Q
 
T
H
 
A
F
 
K
T
 
P
P
 
A
T
 
D
R
 
H
W
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
N
G
 
E
D
 
K
T
 
S
V
 
L
Q
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
T
E
 
F
T
 
T
L
 
F
A
 
S
V
 
V
R
 
F
H
 
H
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
S
V
 
V
V
 
S
F
 
Y
H
 
Y
A
 
Y
P
 
Q
Q
 
K
I
 
E
D
 
A
R
 
V
A
 
L
F
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
Q
G
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
L
P
 
R
M
 
G
G
 
G
N
 
D
H
 
H
Q
 
T
D
 
L
L
 
L
I
 
L
D
 
A
S
 
S
I
 
I
T
 
H
Q
 
N
R
 
K
L
 
I
W
 
L
P
 
P
M
 
L
G
 
P
D
 
E
Q
 
R
T
 
T
V
 
I
F
 
V
I
 
A
P
 
S
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
E
 
L
S
 
T
T
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
Q
E
 
E
R
 
M
K
 
D
S
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
V
 
L
G
 
T
G
 
G

2zwrB Crystal structure of ttha1623 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
39% identity, 99% coverage: 1:183/184 of query aligns to 26:202/207 of 2zwrB

query
sites
2zwrB
V
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
D
D
 
E
L
 
P
D
 
E
V
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
L
I
 
F
Q
 
Q
R
 
T
L
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
I
L
 
P
S
 
L
Q
 
A
I
 
I
W
 
L
L
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
A
H
|
H
I
 
F
D
|
D
H
|
H
A
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
V
G
 
A
E
 
P
L
 
L
A
 
V
T
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
Y
G
 
L
P
 
-
H
 
H
P
 
P
G
 
L
D
 
D
Q
 
L
F
 
P
W
 
L
I
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
A
P
 
D
Q
 
L
Q
 
A
S
 
A
A
 
R
M
 
A
F
 
W
G
 
G
F
 
L
P
 
A
P
 
I
A
 
P
Q
 
K
H
 
P
F
 
P
T
 
L
P
 
P
T
 
V
R
 
R
W
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
M
T
 
R
V
 
L
Q
 
-
I
 
F
G
 
G
D
 
F
E
 
Q
T
 
V
L
 
L
A
 
-
V
 
-
R
 
-
H
 
H
C
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
V
V
 
A
F
 
F
H
 
Y
A
 
D
P
 
P
Q
 
E
I
 
G
D
 
A
R
 
Q
A
 
V
F
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
F
 
L
P
 
P
M
 
G
G
 
A
N
 
D
H
 
P
Q
 
K
D
 
A
L
 
L
I
 
F
D
 
A
S
 
S
I
 
L
T
 
-
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
W
 
L
P
 
S
M
 
L
G
 
P
D
 
P
Q
 
E
T
 
T
V
 
R
F
 
V
I
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
E
 
G
S
 
T
T
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
L
E
 
E
R
 
A
K
 
R
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
V
 
L
G
 
T
G
 
G

2zziA Crystal structure of ttha1623 in a di-iron-bound form (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:181/184 of query aligns to 24:198/198 of 2zziA

query
sites
2zziA
V
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
D
D
 
E
L
 
P
D
 
E
V
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
L
I
 
F
Q
 
Q
R
 
T
L
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
I
L
 
P
S
 
L
Q
 
A
I
 
I
W
 
L
L
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
A
H
|
H
I
 
F
D
|
D
H
|
H
A
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
V
G
 
A
E
 
P
L
 
L
A
 
V
T
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
Y
G
 
L
P
 
-
H
 
H
P
 
P
G
 
L
D
 
D
Q
 
L
F
 
P
W
 
L
I
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
A
P
 
D
Q
 
L
Q
 
A
S
 
A
A
 
R
M
 
A
F
 
W
G
 
G
F
 
L
P
 
A
P
 
I
A
 
P
Q
 
K
H
 
P
F
 
P
T
 
L
P
 
P
T
 
V
R
 
R
W
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
M
T
 
R
V
 
L
Q
 
-
I
 
F
G
 
G
D
 
F
E
 
Q
T
 
V
L
 
L
A
 
-
V
 
-
R
 
-
H
 
H
C
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
V
V
 
A
F
 
F
H
 
Y
A
 
D
P
 
P
Q
 
E
I
 
G
D
 
A
R
 
Q
A
 
V
F
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
F
 
L
P
 
P
M
 
G
G
 
A
N
 
D
H
 
P
Q
 
K
D
 
A
L
 
L
I
 
F
D
 
A
S
 
S
I
 
L
T
 
-
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
W
 
L
P
 
S
M
 
L
G
 
P
D
 
P
Q
 
E
T
 
T
V
 
R
F
 
V
I
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
E
 
G
S
 
T
T
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
L
E
 
E
R
 
A
K
 
R
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
V
 
L

7l0bA Crystal structure of hydroxyacyl glutathione hydrolase (glob) from staphylococcus aureus, apoenzyme (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:183/184 of query aligns to 27:202/202 of 7l0bA

query
sites
7l0bA
V
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
G
D
 
E
L
 
S
D
 
E
V
 
K
L
 
I
L
 
I
A
 
K
E
 
K
I
 
L
Q
 
N
R
 
Q
L
 
I
G
 
N
L
 
K
T
 
P
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
I
 
I
W
 
L
L
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
A
H
|
H
I
 
F
D
|
D
H
|
H
A
 
I
G
 
G
G
 
A
T
 
V
G
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
V
T
 
D
R
 
R
L
 
F
G
 
D
L
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
Y
G
 
M
P
 
H
H
 
E
P
 
A
G
 
E
D
 
F
Q
 
D
F
 
F
W
 
L
I
 
K
D
 
D
G
 
-
L
 
-
P
 
P
Q
 
V
Q
 
K
S
 
N
A
 
G
M
 
A
F
 
D
G
 
K
F
 
L
P
 
P
P
 
I
A
 
T
Q
 
S
H
 
K
F
 
V
T
 
T
P
 
P
T
 
E
R
 
K
W
 
-
L
 
L
A
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
S
T
 
T
V
 
-
Q
 
E
I
 
I
G
 
E
D
 
G
E
 
F
T
 
K
L
 
F
A
 
N
V
 
V
R
 
L
H
 
H
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
S
V
 
L
V
 
T
F
 
Y
H
 
V
A
 
F
P
 
D
Q
 
E
I
 
F
D
 
-
R
 
-
A
 
A
F
 
V
V
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
T
L
 
L
F
 
F
A
 
N
G
 
N
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
L
P
 
Y
M
 
K
G
 
G
N
 
D
H
 
Y
Q
 
E
D
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
D
S
 
S
I
 
I
T
 
Q
Q
 
D
R
 
K
L
 
I
W
 
F
P
 
E
M
 
L
G
 
E
D
 
G
Q
 
D
T
 
L
V
 
P
F
 
L
I
 
F
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
E
 
Y
S
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
D
R
 
D
E
 
E
R
 
Q
K
 
-
S
 
L
N
 
N
P
 
P
Y
 
F
V
 
L
G
 
H
G
 
G

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
31% identity, 99% coverage: 1:183/184 of query aligns to 28:192/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
V
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
L
D
 
E
-
 
Q
L
 
V
D
 
D
V
 
R
L
 
D
L
 
L
A
 
Q
E
 
M
I
 
V
Q
 
A
R
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
T
Q
 
H
I
 
V
W
 
F
L
 
D
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
A
 
I
G
 
T
G
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
A
 
R
T
 
E
R
 
R
L
 
T
G
 
Q
L
 
A
P
 
T
I
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
S
H
 
V
P
 
N
G
 
G
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
W
 
-
I
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
A
M
 
S
F
 
C
G
 
A
F
 
N
P
 
V
P
 
Q
A
 
V
Q
 
R
H
 
H
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
D
 
D
T
 
E
V
 
V
Q
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
Q
E
 
L
T
 
V
L
 
F
A
 
Q
V
 
V
R
 
L
H
 
A
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
D
H
 
S
V
 
I
V
 
S
F
 
Y
H
 
L
A
 
L
P
 
G
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
R
 
R
A
 
V
F
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
V
G
 
R
S
 
G
I
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
M
 
N
G
 
G
N
 
N
H
 
A
Q
 
S
D
 
Q
L
 
L
I
 
Y
D
 
D
S
 
S
I
 
L
T
 
T
Q
 
R
R
 
V
L
 
L
W
 
F
P
 
T
M
 
L
G
 
P
D
 
D
Q
 
E
T
 
T
V
 
L
F
 
V
I
 
Y
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
D
P
 
Y
E
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
I
G
 
A
R
 
E
E
 
E
R
 
K
K
 
R
S
 
H
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
V
 
V
G
 
A
G
 
G

2gcuA X-ray structure of gene product from arabidopsis thaliana at1g53580 (see paper)
34% identity, 97% coverage: 1:179/184 of query aligns to 32:201/244 of 2gcuA

query
sites
2gcuA
V
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
G
 
D
G
 
K
D
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
R
L
 
D
L
 
L
A
 
K
E
 
L
I
 
I
Q
 
D
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
L
S
 
I
Q
 
Y
I
 
A
W
 
M
L
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
A
 
V
G
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
L
 
L
A
 
K
T
 
T
R
 
K
L
 
L
G
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
G
D
 
V
Q
 
K
F
 
S
W
 
V
I
 
I
D
 
S
G
 
K
L
 
A
P
 
S
Q
 
G
Q
 
S
S
 
K
A
 
A
M
 
D
F
 
L
G
 
F
F
 
L
P
 
E
P
 
P
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
D
 
D
T
 
K
V
 
V
Q
 
S
I
 
I
G
 
G
D
 
D
E
 
I
T
 
Y
L
 
L
A
 
E
V
 
V
R
 
R
H
 
A
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
H
 
C
V
 
V
V
 
T
F
 
Y
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
H
 
D
A
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
I
 
P
D
 
R
R
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
A
L
 
V
F
 
L
A
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
M
 
E
G
 
G
N
 
S
H
 
S
Q
 
D
D
 
Q
L
 
L
I
 
Y
D
 
E
S
 
S
I
 
V
T
 
H
Q
 
S
R
 
Q
L
 
I
W
 
F
P
 
T
M
 
L
G
 
P
D
 
K
Q
 
D
T
 
T
V
 
L
F
 
I
I
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
P
 
Y
E
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
V
S
 
S
T
 
T
F
 
V
G
 
G
R
 
E
E
 
E
R
 
M
K
 
Q
S
 
H
N
 
N
P
 
P

Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
34% identity, 97% coverage: 1:179/184 of query aligns to 81:250/294 of Q9C8L4

query
sites
Q9C8L4
V
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
G
 
D
G
 
K
D
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
R
L
 
D
L
 
L
A
 
K
E
 
L
I
 
I
Q
 
D
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
L
S
 
I
Q
 
Y
I
 
A
W
 
M
L
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
 
H
I
 
A
D
 
D
H
 
H
A
 
V
G
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
L
L
 
L
A
 
K
T
 
T
R
 
K
L
 
L
G
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
G
D
 
V
Q
 
K
F
 
S
W
 
V
I
 
I
D
 
S
G
 
K
L
 
A
P
 
S
Q
 
G
Q
 
S
S
 
K
A
 
A
M
 
D
F
 
L
G
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
F
L
 
L
A
 
E
D
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
K
V
 
V
Q
 
S
I
 
I
G
 
G
D
 
D
E
 
I
T
 
Y
L
 
L
A
 
E
V
 
V
R
 
R
H
 
A
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
H
 
C
V
 
V
V
 
T
F
 
Y
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
H
 
D
A
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
I
 
P
D
 
R
R
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
A
L
 
V
F
 
L
A
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
M
 
E
G
 
G
N
 
S
H
 
S
Q
 
D
D
 
Q
L
 
L
I
 
Y
D
 
E
S
 
S
I
 
V
T
 
H
Q
 
S
R
 
Q
L
 
I
W
 
F
P
 
T
M
 
L
G
 
P
D
 
K
Q
 
D
T
 
T
V
 
L
F
 
I
I
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
D
P
 
Y
E
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
V
S
 
S
T
 
T
F
 
V
G
 
G
R
 
E
E
 
E
R
 
M
K
 
Q
S
 
H
N
 
N
P
 
P

6sg9FL uS3m (see paper)
28% identity, 86% coverage: 20:178/184 of query aligns to 99:294/320 of 6sg9FL

query
sites
6sg9FL
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
T
Q
 
H
I
 
V
W
 
F
L
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
C
H
|
H
I
 
I
D
|
D
H
 
N
A
 
I
G
 
I
G
 
N
T
 
L
G
 
N
E
 
A
L
 
F
A
 
L
T
 
T
R
 
I
L
 
C
G
 
G
L
 
S
P
 
R
I
 
Q
-
 
K
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
G
V
 
V
G
 
M
P
 
W
H
 
C
P
 
P
G
 
A
D
 
E
Q
 
E
F
 
C
W
 
W
I
 
V
D
 
Q
G
 
N
L
 
F
P
 
K
Q
 
R
Q
 
S
S
 
C
A
 
E
M
 
R
F
 
Y
G
 
G
F
 
R
P
 
F
P
 
E
A
 
E
Q
 
M
H
 
H
-
 
Q
-
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
M
-
 
C
-
 
R
-
 
S
-
 
L
F
 
Y
T
 
T
P
 
P
-
 
Q
-
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
N
T
 
A
R
 
R
W
 
H
L
 
L
A
 
R
D
 
R
G
 
N
D
 
D
T
 
V
V
 
L
Q
 
L
I
 
S
G
 
A
D
 
A
E
 
T
T
 
N
L
 
R
A
 
A
V
 
T
R
 
S
H
 
F
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
Y
-
 
Y
-
 
I
-
 
F
C
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
M
V
 
M
F
 
L
H
 
H
A
 
I
P
 
P
Q
 
T
I
 
E
D
 
R
R
 
I
A
 
L
F
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
F
G
 
N
S
x
K
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
V
D
 
D
F
 
L
P
 
P
M
 
W
G
 
A
N
 
T
H
 
G
Q
 
V
D
 
R
L
 
L
I
 
A
D
 
E
S
 
S
I
 
L
T
 
-
Q
 
R
R
 
L
L
 
L
W
 
E
P
 
A
M
 
L
G
 
P
D
 
D
Q
 
N
T
 
T
V
 
V
F
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
|
G
P
x
R
E
 
M
S
 
T
T
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
E
R
 
R
K
 
R
S
 
E
N
 
N

Sites not aligning to the query:

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
32% identity, 91% coverage: 15:181/184 of query aligns to 65:215/254 of O95571

query
sites
O95571
I
 
I
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
R
L
 
L
S
 
L
Q
 
Y
I
 
A
W
 
V
L
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
C
H
 
H
I
 
A
D
 
D
H
 
H
A
 
I
G
 
T
G
 
G
T
 
S
G
 
G
E
 
L
L
 
L
A
 
R
T
 
S
R
 
L
L
 
L
G
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
G
D
 
C
Q
 
Q
F
 
S
W
 
V
I
 
I
D
 
S
G
 
R
L
 
L
P
 
S
Q
 
G
Q
 
A
S
 
Q
A
 
A
M
 
D
F
 
L
G
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
H
L
 
I
A
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
S
V
 
I
Q
 
R
I
 
F
G
 
G
D
 
R
E
 
F
T
 
A
L
 
L
A
 
E
V
 
T
R
 
R
H
 
A
C
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
 
C
V
 
V
V
 
T
F
 
F
H
 
V
A
 
L
P
 
N
Q
 
D
I
 
H
D
 
S
R
 
M
A
 
A
F
 
F
V
x
T
G
 
G
D
|
D
V
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
|
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
M
 
Q
G
 
G
N
 
C
H
 
A
Q
 
K
D
 
T
L
 
L
I
 
Y
D
 
H
S
 
S
I
 
V
T
 
H
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
W
 
F
P
 
T
M
 
L
G
 
P
D
 
G
Q
 
D
T
 
C
V
 
L
F
 
I
I
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
x
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
G
-
 
F
P
 
T
E
 
V
S
 
S
T
 
T
F
 
V
G
 
E
R
 
E
E
 
E
R
 
R
K
 
T
S
 
L
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
V
 
L

Sites not aligning to the query:

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
33% identity, 90% coverage: 15:179/184 of query aligns to 49:197/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
I
 
I
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
R
L
 
L
S
 
L
Q
 
Y
I
 
A
W
 
V
L
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
C
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
A
 
I
G
 
T
G
 
G
T
 
S
G
 
G
E
 
L
L
 
L
A
 
R
T
 
S
R
 
L
L
 
L
G
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
G
 
G
D
 
C
Q
 
Q
F
 
S
W
 
V
I
 
I
D
 
S
G
 
R
L
 
L
P
 
S
Q
 
G
Q
 
A
S
 
Q
A
 
A
M
 
D
F
 
L
G
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
H
L
 
I
A
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
S
V
 
I
Q
 
R
I
 
F
G
 
G
D
 
R
E
 
F
T
 
A
L
 
L
A
 
E
V
 
T
R
 
R
H
 
A
C
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
 
C
V
 
V
V
 
T
F
 
F
H
 
V
A
 
L
P
 
N
Q
 
D
I
 
H
D
 
S
R
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
M
 
Q
G
 
G
N
 
C
H
 
A
Q
 
K
D
 
T
L
 
L
I
 
Y
D
 
H
S
 
S
I
 
V
T
 
H
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
W
 
F
P
 
T
M
 
L
G
 
P
D
 
G
Q
 
D
T
 
C
V
 
L
F
 
I
I
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
P
 
Y
E
 
H
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
V
S
 
S
T
 
T
F
 
V
G
 
E
R
 
E
E
 
E
R
 
R
K
 
T
S
 
L
N
 
N
P
 
P

5ve5A Crystal structure of persulfide dioxygenase rhodanese fusion protein with rhodanese domain inactivating mutation (c314s) from burkholderia phytofirmans in complex with glutathione (see paper)
31% identity, 93% coverage: 13:183/184 of query aligns to 44:198/350 of 5ve5A

query
sites
5ve5A
A
 
A
E
 
L
I
 
I
Q
 
E
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
H
L
 
L
S
 
L
Q
 
Y
I
 
T
W
 
I
L
 
D
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
A
 
V
G
 
T
G
 
G
T
 
A
G
 
W
E
 
M
L
 
L
A
 
N
T
 
R
R
 
R
L
 
I
G
 
G
L
 
S
P
 
R
I
 
I
V
 
A
G
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
W
 
-
I
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
Q
 
I
S
 
S
A
 
A
M
 
A
F
 
S
G
 
G
F
 
A
P
 
E
P
 
G
A
 
A
Q
 
D
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
R
W
 
Y
L
 
L
A
 
S
D
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
K
V
 
V
Q
 
E
I
 
F
G
 
G
D
 
T
E
 
R
T
 
Y
L
 
L
A
 
T
V
 
V
R
 
R
H
 
A
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
G
H
 
C
V
 
I
V
 
T
F
 
L
H
 
V
A
 
L
P
 
D
Q
 
N
I
 
E
D
 
T
R
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
C
L
 
L
F
 
L
A
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
T
G
|
G
R
|
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
P
 
Q
M
 
R
G
 
G
N
 
D
H
 
A
Q
 
H
D
 
T
L
 
M
I
 
F
D
 
R
S
 
A
I
 
V
T
 
H
Q
 
G
R
 
Q
L
 
I
W
 
F
P
 
T
M
 
L
G
 
P
D
 
T
Q
 
A
T
 
C
V
 
L
F
 
L
I
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
P
x
Y
E
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
V
G
 
G
R
 
E
E
 
E
R
 
R
K
 
R
S
 
F
N
 
N
P
 
P
Y
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3tp9A Crystal structure of alicyclobacillus acidocaldarius protein with beta-lactamase and rhodanese domains
29% identity, 97% coverage: 1:179/184 of query aligns to 30:212/473 of 3tp9A

query
sites
3tp9A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
G
 
R
D
 
D
L
 
V
D
 
E
V
 
P
L
 
Y
L
 
L
A
 
L
E
 
T
I
 
A
Q
 
K
R
 
R
L
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
R
L
 
I
S
 
V
Q
 
A
I
 
A
W
 
L
L
 
E
T
 
T
H
|
H
A
 
I
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
x
F
A
 
V
G
 
S
G
 
G
T
 
A
G
 
R
E
 
E
L
 
M
A
 
A
T
 
D
R
 
R
L
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
A
I
 
I
V
 
C
G
 
V
P
 
S
H
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
P
Q
 
P
F
 
E
W
 
W
I
 
K
D
 
S
G
 
E
L
 
Y
P
 
V
Q
 
K
Q
 
A
S
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
Y
P
 
P
T
 
H
R
 
R
W
 
L
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
E
V
 
L
Q
 
H
I
 
F
G
 
G
D
 
N
E
 
V
T
 
R
L
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
M
H
 
H
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
S
F
 
Y
-
 
L
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
-
 
K
H
 
T
A
 
S
P
 
P
Q
 
D
I
 
V
D
 
P
R
 
M
A
 
A
-
 
L
F
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
F
L
 
V
F
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
F
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
P
 
E
M
 
S
G
 
G
N
 
S
H
 
S
Q
 
E
D
 
A
L
 
L
I
 
A
D
 
R
S
 
Q
I
 
M
-
 
F
-
 
R
-
 
S
T
 
L
Q
 
R
R
 
K
L
 
F
W
 
E
P
 
A
M
 
L
G
 
P
D
 
D
Q
 
H
T
 
V
V
 
Q
F
 
V
I
 
L
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
G
P
 
A
E
 
G
S
 
S
T
 
A
F
 
C
G
 
G
R
 
K
E
 
A
R
 
L
K
 
G
S
 
A
N
 
V
P
 
P

3r2uB 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
28% identity, 97% coverage: 1:178/184 of query aligns to 32:210/336 of 3r2uB

query
sites
3r2uB
V
 
I
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
I
G
 
R
D
 
D
L
 
L
D
 
S
V
 
S
L
 
Y
L
 
I
A
 
R
E
 
V
I
 
A
Q
 
D
R
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
I
S
 
T
Q
 
H
I
 
A
W
 
A
L
 
E
T
 
T
H
|
H
A
 
I
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
x
F
A
 
A
G
 
S
G
 
G
T
 
I
G
 
R
E
 
D
L
 
V
A
 
A
T
 
I
R
 
K
L
 
L
G
 
N
L
 
A
P
 
N
I
 
I
-
 
Y
V
 
V
G
 
S
P
 
G
H
 
E
P
 
S
G
 
D
D
 
D
Q
 
T
F
 
L
W
 
G
I
 
Y
D
 
K
G
 
N
L
 
M
P
 
P
Q
 
N
Q
 
H
S
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
T
R
 
H
W
 
F
L
 
V
A
 
Q
D
 
H
G
 
N
D
 
D
T
 
D
V
 
I
Q
 
Y
I
 
V
G
 
G
D
 
N
E
 
I
T
 
K
L
 
L
A
 
K
V
 
V
R
 
L
H
 
H
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
H
 
S
V
 
I
V
 
S
F
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
G
H
 
A
A
 
G
P
 
A
Q
 
Q
I
 
V
D
 
P
R
 
M
A
 
G
-
 
L
F
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
F
L
 
I
F
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
D
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
F
 
L
P
 
S
M
 
E
G
 
I
N
 
G
H
 
A
Q
 
K
D
 
Q
L
 
M
I
 
F
D
 
K
S
 
S
I
 
I
T
 
-
Q
 
E
R
 
S
L
 
I
W
 
K
P
 
D
M
 
L
G
 
P
D
 
D
Q
 
Y
T
 
I
V
 
Q
F
 
I
I
 
W
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
P
 
P
E
 
T
S
 
S
T
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
R
 
K
K
 
Q
S
 
T
N
 
N

Sites not aligning to the query:

6aufB Crystal structure of metalo beta lactamases mim-1 from novosphingobium pentaromativorans
28% identity, 98% coverage: 4:183/184 of query aligns to 56:247/273 of 6aufB

query
sites
6aufB
P
 
P
G
 
A
G
 
D
D
 
A
L
 
A
D
 
P
V
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
N
I
 
I
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
F
T
 
D
L
 
P
S
 
A
Q
 
D
I
 
V
-
 
R
W
 
W
L
 
I
-
 
L
-
 
T
T
 
S
H
|
H
A
 
E
H
|
H
I
 
H
D
|
D
H
|
H
A
 
A
G
 
G
G
 
S
T
 
I
G
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
T
 
K
R
 
A
L
 
T
G
 
G
L
 
A
P
 
Q
I
 
I
V
 
A
G
 
A
P
 
V
H
 
A
P
 
S
G
 
A
D
 
R
Q
 
Q
F
 
V
W
 
L
I
 
E
D
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
P
Q
 
Q
Q
 
S
S
 
G
A
 
L
M
 
I
F
 
E
G
 
G
F
 
F
P
 
P
P
 
P
A
 
V
Q
 
H
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
V
T
 
A
R
 
R
W
 
V
L
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
S
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
G
 
G
D
 
R
E
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
T
V
 
V
R
 
R
H
 
E
C
 
T
P
 
P
G
 
A
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
S
V
 
A
V
 
S
F
 
W
H
 
T
A
 
W
P
 
Q
Q
 
A
I
 
C
D
 
D
R
 
E
A
 
A
F
 
F
V
 
T
G
 
C
D
 
R
V
 
M
L
 
I
F
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
S
A
 
A
G
 
T
S
 
T
I
 
I
G
 
S
R
 
A
T
 
D
D
 
D
F
x
Y
P
 
R
M
 
F
G
 
S
N
 
D
H
 
H
Q
 
P
D
 
D
L
 
R
I
 
I
D
 
A
S
 
R
I
 
I
T
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
S
R
 
R
L
 
I
W
 
A
P
 
Q
M
 
L
G
 
P
D
 
C
Q
 
D
T
 
I
V
 
L
F
 
V
I
 
T
P
 
P
G
x
H
H
 
P
G
 
S
P
 
A
E
 
S
S
 
N
T
 
L
F
 
F
G
 
D
R
 
R
E
 
L
R
 
S
K
 
G
S
 
K
N
 
A
P
 
P
Y
 
L
V
 
V
G
 
N
G
 
A

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
28% identity, 90% coverage: 1:165/184 of query aligns to 27:169/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
V
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
-
D
 
E
L
 
A
D
 
E
V
 
P
L
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
S
I
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
R
T
 
N
L
 
L
S
 
T
Q
 
Y
I
 
I
W
 
L
L
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
H
H
|
H
I
 
Y
D
|
D
H
|
H
A
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
K
T
 
D
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
L
 
A
P
 
K
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
S
H
 
-
P
 
A
G
 
M
D
 
D
Q
 
K
F
 
D
W
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
L
 
I
P
 
D
Q
 
M
Q
 
A
S
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
K
V
 
W
Q
 
M
I
 
F
G
 
A
D
 
G
E
 
H
T
 
E
L
 
V
A
 
H
V
 
V
R
 
M
H
 
D
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
H
 
H
V
 
I
V
 
S
F
 
L
H
 
Y
A
 
F
P
 
P
Q
 
G
I
 
S
D
 
R
R
 
A
A
 
I
F
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
T
L
 
M
F
 
F
A
 
S
G
 
L
S
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
-
D
 
-
F
 
L
P
 
F
M
 
E
G
 
G
N
 
T
H
 
P
Q
 
K
D
 
Q
L
 
M
I
 
L
D
 
A
S
 
S
I
 
L
T
 
-
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
W
 
T
P
 
S
M
 
L
G
 
P
D
 
D
Q
 
D
T
 
T
V
 
S
F
 
I
I
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
28% identity, 90% coverage: 1:165/184 of query aligns to 97:239/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
V
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
-
D
 
E
L
 
A
D
 
E
V
 
P
L
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
S
I
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
R
T
 
N
L
 
L
S
 
T
Q
 
Y
I
 
I
W
 
L
L
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
H
H
|
H
I
 
Y
D
|
D
H
|
H
A
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
K
T
 
D
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
L
 
A
P
 
K
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
S
H
 
-
P
 
A
G
 
M
D
 
D
Q
 
K
F
 
D
W
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
L
 
I
P
 
D
Q
 
M
Q
 
A
S
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
K
V
 
W
Q
 
M
I
 
F
G
 
A
D
 
G
E
 
H
T
 
E
L
 
V
A
 
H
V
 
V
R
 
M
H
 
D
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
H
 
H
V
 
I
V
 
S
F
 
L
H
 
Y
A
 
F
P
 
P
Q
 
G
I
 
S
D
 
R
R
 
A
A
 
I
F
 
F
V
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
T
L
 
M
F
 
F
A
 
S
G
 
L
S
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
-
D
 
-
F
 
L
P
 
F
M
 
E
G
 
G
N
 
T
H
 
P
Q
 
K
D
 
Q
L
 
M
I
 
L
D
 
A
S
 
S
I
 
L
T
 
-
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
W
 
T
P
 
S
M
 
L
G
 
P
D
 
D
Q
 
D
T
 
T
V
 
S
F
 
I
I
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H

3r2uA 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
27% identity, 97% coverage: 1:178/184 of query aligns to 30:222/348 of 3r2uA

query
sites
3r2uA
V
 
I
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
I
G
 
R
D
 
D
L
 
L
D
 
S
V
 
S
L
 
Y
L
 
I
A
 
R
E
 
V
I
 
A
Q
 
D
R
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
I
S
 
T
Q
 
H
I
 
A
W
 
A
L
 
E
T
 
T
H
|
H
A
 
I
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
x
F
A
 
A
G
 
S
G
 
G
T
 
I
G
 
R
E
 
D
L
 
V
A
 
A
T
 
I
R
 
K
L
 
L
G
 
N
L
 
A
P
 
N
I
 
I
-
 
Y
V
 
V
G
 
S
P
 
G
H
 
E
P
 
S
G
 
D
D
 
D
Q
 
T
F
 
L
W
 
G
I
 
Y
D
 
K
G
 
N
L
 
M
P
 
P
Q
 
N
Q
 
H
S
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
T
R
 
H
W
 
F
L
 
V
A
 
Q
D
 
H
G
 
N
D
 
D
T
 
D
V
 
I
Q
 
Y
I
 
V
G
 
G
D
 
N
E
 
I
T
 
K
L
 
L
A
 
K
V
 
V
R
 
L
H
 
H
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
H
 
S
V
 
I
V
 
S
F
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
G
H
 
A
A
 
G
P
 
A
Q
 
Q
I
 
V
D
 
P
R
 
M
A
 
G
-
 
L
F
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
F
L
 
I
F
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
D
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
F
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
S
P
 
E
M
 
I
G
 
G
N
 
A
H
 
K
Q
 
Q
D
 
-
L
 
M
I
 
F
D
 
K
S
 
S
I
 
I
T
 
-
Q
 
E
R
 
S
L
 
I
W
 
K
P
 
D
M
 
L
G
 
P
D
 
D
Q
 
Y
T
 
I
V
 
Q
F
 
I
I
 
W
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
C
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
P
 
P
E
 
T
S
 
S
T
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
R
 
K
K
 
Q
S
 
T
N
 
N

4efzA Crystal structure of a hypothetical metallo-beta-lactamase from burkholderia pseudomallei
30% identity, 94% coverage: 9:181/184 of query aligns to 52:238/295 of 4efzA

query
sites
4efzA
D
 
D
V
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
R
I
 
V
Q
 
A
R
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
R
L
 
V
S
 
R
Q
 
W
I
 
L
W
 
L
L
 
E
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
A
 
L
G
 
S
G
 
A
T
 
A
G
 
P
E
 
Y
L
 
L
A
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
G
P
 
E
I
 
I
-
 
A
V
 
I
G
 
G
P
 
R
H
 
H
P
 
V
G
 
T
D
 
R
-
 
V
Q
 
Q
F
 
D
W
 
V
I
 
F
D
 
G
G
 
K
L
 
L
P
 
F
Q
 
N
Q
 
A
S
 
G
A
 
P
M
 
A
F
 
F
G
 
A
F
 
H
P
 
D
P
 
G
A
 
S
Q
 
Q
H
 
F
F
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
D
R
 
R
W
 
L
L
 
L
A
 
D
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
L
Q
 
A
I
 
L
G
 
G
D
 
A
E
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
R
V
 
A
R
 
M
H
 
H
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
H
 
C
V
 
M
V
 
T
F
 
Y
H
 
V
A
 
V
P
 
T
Q
 
E
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
D
-
 
A
-
 
R
I
 
D
D
 
A
R
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
T
L
 
L
F
 
F
A
 
M
G
 
P
S
 
D
I
 
Y
G
 
G
-
 
T
-
 
A
R
 
R
T
 
C
D
 
D
F
 
F
P
 
P
M
 
G
G
 
G
N
 
D
H
 
A
Q
 
R
D
 
S
L
 
L
I
 
Y
D
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
R
Q
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
T
R
 
R
L
 
L
W
 
Y
P
 
M
M
 
C
G
 
H
D
 
D
Q
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
Y
I
 
Q
P
 
P
G
 
A
H
 
I
G
 
Q
P
 
Y
E
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
V
G
 
A
R
 
D
E
 
E
R
 
L
K
 
R
S
 
E
N
 
N
P
 
V
Y
 
H
V
 
I

4ad9A Crystal structure of human lactb2. (see paper)
26% identity, 87% coverage: 8:167/184 of query aligns to 56:201/288 of 4ad9A

query
sites
4ad9A
L
 
I
D
 
S
V
 
C
L
 
L
L
 
K
A
 
Q
E
 
A
I
 
L
Q
 
T
R
 
E
L
 
F
G
 
N
L
 
T
T
 
A
L
 
I
S
 
Q
Q
 
E
I
 
I
W
 
V
L
 
V
T
 
T
H
|
H
A
 
W
H
|
H
I
 
R
D
|
D
H
|
H
A
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
I
G
 
G
E
 
D
L
 
I
A
 
C
T
 
K
R
 
S
L
 
I
G
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
H
 
N
P
 
N
G
 
D
D
 
T
Q
 
T
F
 
Y
W
 
C
I
 
I
D
 
K
G
 
K
L
 
L
P
 
P
-
 
R
-
 
N
-
 
P
Q
 
Q
Q
 
R
S
 
E
A
 
E
M
 
I
F
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
G
P
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
H
 
Y
F
 
V
T
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
Y
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
V
V
 
I
Q
 
K
I
 
T
G
 
E
D
 
G
E
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
R
V
 
V
R
 
L
H
 
Y
C
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
D
H
 
H
V
 
M
V
 
A
F
 
L
H
 
L
A
 
L
P
 
E
Q
 
E
I
 
E
D
 
N
R
 
A
A
 
I
F
 
F
V
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
C
L
 
I
F
 
L
A
 
G
G
 
E
S
 
-
I
 
-
G
 
G
R
 
T
T
 
T
D
 
V
F
 
F
P
 
E
M
 
-
G
 
-
N
 
D
H
 
L
Q
 
Y
D
 
D
L
 
Y
I
 
M
D
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
K
Q
 
E
R
 
L
L
 
L
W
 
K
P
 
I
M
 
K
G
 
A
D
 
D
Q
 
-
T
 
-
V
 
I
F
 
I
I
 
Y
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P

Query Sequence

>Ac3H11_3348 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3348
VIDPGGDLDVLLAEIQRLGLTLSQIWLTHAHIDHAGGTGELATRLGLPIVGPHPGDQFWI
DGLPQQSAMFGFPPAQHFTPTRWLADGDTVQIGDETLAVRHCPGHTPGHVVFHAPQIDRA
FVGDVLFAGSIGRTDFPMGNHQDLIDSITQRLWPMGDQTVFIPGHGPESTFGRERKSNPY
VGGT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory