SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_3400 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3400 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7qh2C Cryo-em structure of ldh-etfab complex from acetobacterium woodii (see paper)
29% identity, 50% coverage: 4:189/375 of query aligns to 53:236/467 of 7qh2C

query
sites
7qh2C
S
 
S
L
 
T
A
 
E
P
 
E
I
 
V
A
 
S
E
 
K
R
 
I
V
 
M
R
 
K
A
 
Y
A
 
A
A
 
Y
A
 
E
D
 
H
Q
 
N
T
 
I
P
 
P
L
 
V
R
 
V
I
x
V
R
 
R
G
|
G
G
x
S
G
|
G
T
|
T
K
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
-
G
|
G
L
|
L
A
 
V
-
 
G
-
x
A
-
x
C
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
F
H
 
G
G
 
G
E
 
I
V
 
M
L
 
L
D
 
E
T
 
T
R
 
T
G
 
L
L
 
M
R
 
N
G
 
N
I
 
I
V
 
L
S
 
E
Y
 
L
E
 
D
P
 
T
S
 
E
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
V
T
 
T
V
 
V
R
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
L
L
 
L
A
 
M
E
 
E
L
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
F
L
 
V
A
 
E
E
 
E
K
 
N
G
 
D
Q
 
L
C
 
F
L
 
Y
P
 
P
F
 
P
E
 
D
P
|
P
P
x
G
H
x
E
F
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
K
A
 
S
A
|
A
T
|
T
V
 
I
G
 
A
G
|
G
M
x
N
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
N
L
x
A
S
x
G
G
 
G
P
 
M
A
 
R
R
 
A
A
 
V
S
 
K
V
 
Y
G
 
G
A
 
V
V
 
T
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
V
L
 
R
G
 
G
V
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
V
N
 
L
G
 
A
K
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
I
T
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
M
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
V
 
L
S
 
K
R
 
D
L
 
L
M
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
C
L
 
V
L
x
I
T
 
T
E
 
K
V
 
A
S
 
I
L
 
L
K
 
K
V
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
P
P
 
K
G
 
M
E
 
T
A
 
L
T
 
S
L
 
L
R
 
L
-
 
I
-
 
P
F
 
F
D
 
E
D
 
N
I
 
I
T
 
S
Q
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

O00116 Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal; Alkyl-DHAP synthase; Aging-associated gene 5 protein; Alkylglycerone-phosphate synthase; EC 2.5.1.26 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
30% identity, 40% coverage: 26:174/375 of query aligns to 236:384/658 of O00116

query
sites
O00116
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
 
S
D
 
V
F
 
S
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
 
P
P
 
D
H
 
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
 
S
T
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
M
 
W
V
 
V
A
 
S
A
 
T
G
 
R
L
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
I
T
 
K
V
 
M
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
I
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
L
 
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3pm9A Crystal structure of a putative dehydrogenase (rpa1076) from rhodopseudomonas palustris cga009 at 2.57 a resolution
25% identity, 93% coverage: 25:371/375 of query aligns to 70:464/465 of 3pm9A

query
sites
3pm9A
R
x
Q
G
|
G
G
|
G
G
x
N
T
|
T
K
x
G
D
x
L
F
 
V
H
 
G
G
|
G
L
x
Q
A
 
T
L
 
P
H
 
H
-
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
V
-
 
V
L
 
I
D
 
S
T
x
L
R
 
K
G
 
R
L
 
M
R
 
D
G
 
K
I
 
I
V
 
R
S
 
E
Y
 
I
E
 
D
P
 
T
S
 
S
E
 
S
L
 
N
V
 
T
V
 
I
T
 
T
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
A
P
 
I
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
L
 
V
E
 
Q
A
 
E
L
 
K
L
 
A
A
 
A
E
 
E
K
 
V
G
 
D
Q
 
R
C
 
L
L
 
F
P
 
P
F
 
L
E
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
F
 
-
A
 
S
K
x
L
T
x
G
P
x
A
S
 
Q
D
 
G
A
 
S
A
x
C
T
|
T
V
 
I
G
|
G
G
|
G
M
 
N
V
 
L
A
x
S
A
x
T
G
 
N
L
x
A
S
x
G
G
 
G
P
 
T
A
 
A
R
 
A
A
 
L
S
 
A
V
 
Y
G
 
G
A
x
L
V
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
M
L
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
V
N
 
L
G
 
A
K
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
V
L
 
M
T
 
N
F
 
L
G
 
L
G
 
S
Q
 
K
V
 
L
M
 
K
K
 
K
N
 
D
V
 
N
A
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
S
 
R
R
 
D
L
 
L
M
 
F
A
 
I
G
 
G
A
 
A
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
I
L
x
I
T
 
T
E
 
A
V
 
A
S
 
T
L
 
L
K
 
K
V
 
L
L
 
F
P
 
P
V
 
K
-
 
P
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
A
 
S
P
 
P
G
 
D
E
 
D
A
 
A
T
 
-
L
 
L
R
 
K
F
 
L
D
 
L
D
 
G
I
 
I
T
 
A
Q
 
Q
A
 
G
N
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
N
L
 
L
R
 
T
Q
 
S
L
 
F
H
 
E
A
 
L
W
 
I
G
 
A
G
 
E
Q
 
T
P
 
P
L
 
L
P
 
D
L
 
F
N
 
S
A
 
V
S
 
R
C
 
H
W
 
A
V
 
N
Q
 
N
D
 
R
G
 
D
G
 
P
V
 
L
G
 
E
T
 
A
L
 
R
Y
 
Y
-
 
P
-
 
W
-
 
Y
-
 
V
-
 
L
V
 
I
R
 
E
L
 
L
R
 
S
G
 
S
A
 
P
V
 
R
A
 
D
A
 
D
V
 
A
E
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
L
K
 
E
T
 
S
M
 
I
G
 
L
G
 
E
T
 
R
R
 
G
M
 
F
D
 
E
N
 
D
A
 
G
T
 
I
V
 
V
-
 
V
-
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
I
W
 
A
T
 
N
A
 
S
C
 
V
R
 
Q
E
 
Q
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
A
P
 
F
W
 
W
F
 
K
A
 
L
D
 
R
R
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
S
-
 
P
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
P
 
P
D
 
E
H
 
G
A
 
G
L
 
S
W
 
I
R
 
K
-
 
H
-
 
D
L
 
I
S
 
S
V
 
V
P
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
Q
A
 
A
T
 
N
A
 
A
P
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
I
G
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
R
P
 
P
L
 
V
V
 
P
E
 
F
W
 
G
H
 
H
-
 
L
-
 
G
-
 
D
G
 
G
A
 
N
L
 
I
R
 
H
W
 
Y
-
 
N
V
 
V
Q
 
S
A
 
Q
P
 
P
E
 
V
S
 
G
A
 
A
G
 
D
E
 
K
A
 
A
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
V
L
 
V
R
 
F
E
 
E
A
 
V
A
 
V
Q
 
L
A
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
-
A
 
-
S
 
S
V
 
I
F
 
S
V
 
A
A
x
E
A
 
H
S
 
G
A
 
I
G
 
G
G
 
V
T
 
M
G
 
K
A
 
R
K
 
D
G
 
E
L
 
L
F
 
A
D
 
E
L
 
V
K
 
K
S
 
D
T
 
K
A
 
T
L
 
A
E
 
I
Q
 
E
I
 
L
H
 
M
T
 
R
R
 
S
L
 
I
K
 
K
H
 
A
S
 
L
F
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
H
G
 
G
I
 
I
F
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6gouA Development of alkyl glycerone phosphate synthase inhibitors: complex with inhibitor 2i (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 156:303/554 of 6gouA

query
sites
6gouA
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
x
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
 
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P97275 Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal; Alkyl-DHAP synthase; Alkylglycerone-phosphate synthase; EC 2.5.1.26 from Cavia porcellus (Guinea pig) (see 4 papers)
29% identity, 40% coverage: 26:174/375 of query aligns to 236:384/658 of P97275

query
sites
P97275
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
 
V
F
 
S
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
x
H
E
 
E
P
 
P
P
x
D
H
x
S
F
x
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
x
E
A
x
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
M
 
W
V
 
I
A
 
S
A
x
T
G
x
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
x
S
W
x
E
G
|
G
T
|
T
L
|
L
G
|
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P
V
 
T

Sites not aligning to the query:

4bc9B Mammalian alkyldihydroxyacetonephosphate synthase: wild-type, adduct with cyanoethyl (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 142:289/542 of 4bc9B

query
sites
4bc9B
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
x
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
|
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5adzC Ether lipid-generating enzyme agps in complex with inhibitor 1a (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 156:303/557 of 5adzC

query
sites
5adzC
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
 
V
F
 
S
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5ae1B Ether lipid-generating enzyme agps in complex with inhibitor zinc69435460 (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 142:289/539 of 5ae1B

query
sites
5ae1B
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
 
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
|
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5ae2B Ether lipid-generating enzyme agps in complex with inhibitor 1e (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 142:289/542 of 5ae2B

query
sites
5ae2B
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
 
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
|
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4bc7B Mammalian alkyldihydroxyacetonephosphate synthase: arg419his mutant (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 142:289/543 of 4bc7B

query
sites
4bc7B
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
x
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
|
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
 
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5ae3A Ether lipid-generating enzyme agps in complex with antimycin a (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 142:289/539 of 5ae3A

query
sites
5ae3A
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
x
V
F
 
S
H
 
Y
G
 
G
L
|
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4bc9A Mammalian alkyldihydroxyacetonephosphate synthase: wild-type, adduct with cyanoethyl (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 147:294/555 of 4bc9A

query
sites
4bc9A
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
x
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
|
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5ae2A Ether lipid-generating enzyme agps in complex with inhibitor 1e (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 147:294/561 of 5ae2A

query
sites
5ae2A
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
 
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
|
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5ae1A Ether lipid-generating enzyme agps in complex with inhibitor zinc69435460 (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 141:288/560 of 5ae1A

query
sites
5ae1A
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
x
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
|
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
|
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5adzA Ether lipid-generating enzyme agps in complex with inhibitor 1a (see paper)
29% identity, 39% coverage: 26:173/375 of query aligns to 144:291/566 of 5adzA

query
sites
5adzA
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
|
T
K
x
S
D
 
V
F
 
S
H
 
Y
G
|
G
L
 
L
A
 
M
L
 
C
H
 
P
G
 
A
E
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
I
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
N
G
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
W
Y
 
V
E
 
D
P
 
E
S
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
A
T
 
H
V
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
T
L
 
G
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Q
 
Y
C
 
C
L
 
T
P
 
G
F
 
H
E
 
E
P
|
P
P
x
D
H
x
S
F
 
L
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
E
A
 
F
A
x
S
T
|
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
M
x
W
V
 
I
A
x
S
A
x
T
G
 
R
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
M
A
 
K
R
 
K
A
 
N
S
 
I
V
 
Y
G
 
G
A
 
N
V
 
I
R
 
E
D
 
D
Y
 
L
L
 
V
L
 
V
G
 
H
V
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
V
N
 
T
G
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
-
L
 
V
L
 
I
T
 
E
F
 
K
G
 
S
G
 
C
Q
 
Q
V
 
G
M
 
P
K
 
R
N
 
M
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
H
R
 
H
L
 
F
M
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
x
V
L
x
I
T
 
T
E
 
E
V
 
A
S
 
T
L
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P9WIT1 Uncharacterized FAD-linked oxidoreductase Rv2280; EC 1.-.-.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
28% identity, 44% coverage: 8:173/375 of query aligns to 52:213/459 of P9WIT1

query
sites
P9WIT1
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
R
 
L
V
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
E
D
 
N
Q
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
V
R
 
T
I
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
S
G
 
G
T
 
C
K
 
G
D
 
-
F
 
L
H
 
S
G
 
G
L
 
A
A
 
A
L
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
E
H
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
L
L
 
I
D
 
S
T
 
F
R
 
D
G
 
R
L
 
M
R
 
N
G
 
K
I
 
V
V
 
L
S
 
E
Y
 
V
E
 
D
P
 
T
S
 
A
E
 
N
L
 
Q
V
 
V
V
 
A
T
 
V
V
 
V
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
A
L
 
T
A
 
A
E
 
D
K
 
T
G
 
G
Q
 
L
C
 
R
L
 
Y
P
 
T
F
 
V
E
 
Y
P
 
P
P
 
G
H
 
E
F
 
L
A
 
S
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
S
T
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
M
 
N
V
 
V
A
 
G
A
 
T
G
 
N
L
 
A
S
 
G
G
 
G
P
 
M
A
 
R
R
 
A
A
 
V
S
 
K
V
 
Y
G
 
G
A
 
V
V
 
A
R
 
R
D
 
H
Y
 
N
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
Q
V
 
A
L
 
V
N
 
L
G
 
P
K
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
I
T
 
R
F
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
V
 
M
M
 
A
K
 
K
N
 
V
V
 
S
A
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
S
 
T
R
 
Q
L
 
L
M
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
S
W
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
I
L
 
V
K
 
K
V
 
L
L
 
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8jdpA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisovaleric acid (see paper)
23% identity, 89% coverage: 39:371/375 of query aligns to 85:454/455 of 8jdpA

query
sites
8jdpA
G
 
G
E
 
V
V
 
C
L
 
I
D
 
N
T
x
L
R
 
T
G
 
H
L
 
M
R
 
D
G
 
Q
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
E
 
N
P
 
T
S
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
L
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
C
 
W
L
 
F
P
 
P
F
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
x
G
D
x
A
A
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
A
 
N
R
 
A
A
 
V
S
 
R
V
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
Y
 
N
L
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
T
 
E
V
 
V
L
 
V
N
 
L
G
 
P
K
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
M
 
F
A
 
V
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
V
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
P
 
T
G
 
V
E
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
C
R
 
A
F
 
F
D
 
P
D
 
S
I
 
V
T
 
Q
Q
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
D
N
 
S
A
 
T
L
 
V
R
 
Q
Q
 
I
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
V
N
 
A
A
 
R
S
 
I
C
 
E
W
 
F
V
 
L
Q
 
D
D
 
D
G
 
V
G
 
M
V
 
M
G
 
D
-
 
A
-
 
C
-
 
N
-
 
R
-
 
H
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
T
 
T
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
R
 
E
L
 
F
R
 
H
G
 
G
A
 
S
V
 
Q
A
 
Q
A
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
E
A
 
Q
C
 
L
K
 
Q
T
 
R
M
 
T
G
 
E
G
 
A
T
 
I
R
 
T
M
 
Q
D
 
D
N
 
N
A
 
G
T
 
G
V
 
S
A
 
H
A
 
F
D
 
S
W
 
W
T
 
A
A
 
A
C
 
E
R
 
K
E
 
R
Q
 
N
T
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
P
 
A
W
 
W
F
 
Y
A
 
A
D
 
A
R
 
L
A
 
A
Q
 
L
R
 
S
P
 
P
D
 
S
H
 
K
A
 
A
L
 
-
W
 
-
R
 
-
L
 
Y
S
 
S
V
 
T
P
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
S
A
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
W
 
T
H
 
K
G
 
E
A
 
E
L
 
I
R
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
x
H
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
A
-
 
C
-
 
I
W
 
L
V
 
L
Q
 
V
A
 
D
P
 
P
E
 
D
S
 
D
A
 
A
G
 
E
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
R
 
R
E
 
V
A
 
K
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
V
 
E
G
 
N
-
 
L
G
 
G
N
 
R
A
 
R
S
 
A
V
 
L
F
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
T
A
 
C
G
 
T
G
 
G
T
x
E
G
x
H
A
 
G
K
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
G
D
 
K
L
 
R
K
 
Q
S
 
L
T
 
L
A
 
Q
L
 
E
E
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
V
Q
 
E
I
 
T
H
 
M
T
 
R
R
 
Q
L
 
L
K
 
K
H
 
N
S
 
T
F
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
R
G
 
G
I
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdxA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisovaleric acid (see paper)
23% identity, 89% coverage: 39:371/375 of query aligns to 85:454/455 of 8jdxA

query
sites
8jdxA
G
 
G
E
 
V
V
 
C
L
 
I
D
 
N
T
x
L
R
 
T
G
 
H
L
 
M
R
 
D
G
 
Q
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
E
 
N
P
 
T
S
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
L
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
C
 
W
L
 
F
P
 
P
F
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
x
G
D
x
A
A
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
A
 
N
R
 
A
A
 
V
S
 
R
V
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
Y
 
N
L
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
T
 
E
V
 
V
L
 
V
N
 
L
G
 
P
K
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
M
 
F
A
 
V
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
V
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
P
 
T
G
 
V
E
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
C
R
 
A
F
 
F
D
 
P
D
 
S
I
 
V
T
 
Q
Q
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
D
N
 
S
A
 
T
L
 
V
R
 
Q
Q
 
I
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
V
N
 
A
A
 
R
S
 
I
C
 
E
W
 
F
V
 
L
Q
 
D
D
 
D
G
 
V
G
 
M
V
 
M
G
 
D
-
 
A
-
 
C
-
 
N
-
 
R
-
 
H
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
T
 
T
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
R
 
E
L
 
F
R
 
H
G
 
G
A
 
S
V
 
Q
A
 
Q
A
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
E
A
 
Q
C
 
L
K
 
Q
T
 
R
M
 
T
G
 
E
G
 
A
T
 
I
R
 
T
M
 
Q
D
 
D
N
 
N
A
 
G
T
 
G
V
 
S
A
 
H
A
 
F
D
 
S
W
 
W
T
 
A
A
 
A
C
 
E
R
 
K
E
 
R
Q
 
N
T
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
P
 
A
W
|
W
F
 
Y
A
 
A
D
 
A
R
 
L
A
 
A
Q
 
L
R
 
S
P
 
P
D
 
G
H
 
S
A
 
K
L
 
A
W
 
Y
R
 
-
L
 
-
S
 
S
V
 
T
P
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
S
A
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
W
 
T
H
 
K
G
 
E
A
 
E
L
 
I
R
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
x
H
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
x
H
-
 
C
-
 
I
W
 
L
V
 
L
Q
 
V
A
 
D
P
 
P
E
 
D
S
 
D
A
 
A
G
 
E
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
R
 
R
E
 
V
A
 
K
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
V
 
E
G
 
N
-
 
L
G
 
G
N
 
R
A
 
R
S
 
A
V
 
L
F
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
T
A
 
C
G
 
T
G
 
G
T
x
E
G
x
H
A
 
G
K
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
G
D
 
K
L
 
R
K
 
Q
S
 
L
T
 
L
A
 
Q
L
 
E
E
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
V
Q
 
E
I
 
T
H
 
M
T
 
R
R
 
Q
L
 
L
K
 
K
H
 
N
S
 
T
F
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
R
G
 
G
I
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdrA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxy-3-methyl- valeric acid (see paper)
22% identity, 89% coverage: 39:371/375 of query aligns to 85:455/456 of 8jdrA

query
sites
8jdrA
G
 
G
E
 
V
V
 
C
L
 
I
D
 
N
T
x
L
R
 
T
G
 
H
L
 
M
R
 
D
G
 
Q
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
E
 
N
P
 
T
S
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
L
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
C
 
W
L
 
F
P
 
P
F
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
x
G
D
x
A
A
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
A
 
N
R
 
A
A
 
V
S
 
R
V
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
Y
 
N
L
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
T
 
E
V
 
V
L
 
V
N
 
L
G
 
P
K
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
M
 
F
A
 
V
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
V
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
P
 
T
G
 
V
E
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
C
R
 
A
F
 
F
D
 
P
D
 
S
I
 
V
T
 
Q
Q
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
D
N
 
S
A
 
T
L
 
V
R
 
Q
Q
 
I
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
V
N
 
A
A
 
R
S
 
I
C
 
E
W
 
F
V
 
L
Q
 
D
D
 
D
G
 
V
G
 
M
V
 
M
G
 
D
-
 
A
-
 
C
-
 
N
-
 
R
-
 
H
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
T
 
T
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
R
 
E
L
 
F
R
 
H
G
 
G
A
 
S
V
 
Q
A
 
Q
A
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
E
A
 
Q
C
 
L
K
 
Q
T
 
R
M
 
T
G
 
E
G
 
A
T
 
I
R
 
T
M
 
Q
D
 
D
N
 
N
A
 
G
T
 
G
V
 
S
A
 
H
A
 
F
D
 
S
W
 
W
T
 
A
A
 
A
C
 
E
R
 
K
E
 
R
Q
 
N
T
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
P
 
A
W
|
W
F
x
Y
A
 
A
D
 
A
R
 
L
A
 
A
Q
 
L
R
 
S
P
 
P
D
 
G
H
 
S
A
 
K
L
 
A
W
 
Y
R
 
-
L
 
-
S
 
S
V
 
T
P
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
S
A
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
W
 
T
H
 
K
G
 
E
A
 
E
L
 
I
R
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
x
H
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
A
-
 
C
-
 
I
W
 
L
V
 
L
Q
 
V
A
 
D
P
 
P
E
 
D
S
 
D
A
 
A
G
 
E
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
R
 
R
E
 
V
A
 
K
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
V
 
E
G
 
N
-
 
L
G
 
G
N
 
R
A
 
R
S
 
A
V
 
L
F
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
T
A
 
C
G
 
T
G
 
G
T
x
E
G
x
H
A
 
G
K
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
G
D
 
K
L
 
R
K
 
Q
S
 
L
T
 
L
A
 
Q
L
 
E
E
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
V
Q
 
E
I
 
T
H
 
M
T
 
R
R
 
Q
L
 
L
K
 
K
H
 
N
S
 
T
F
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
R
G
 
G
I
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8jdqA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisocaproic acid (see paper)
22% identity, 89% coverage: 39:371/375 of query aligns to 85:455/456 of 8jdqA

query
sites
8jdqA
G
 
G
E
 
V
V
 
C
L
 
I
D
 
N
T
x
L
R
 
T
G
 
H
L
 
M
R
 
D
G
 
Q
I
 
I
V
 
T
S
 
E
Y
 
L
E
 
N
P
 
T
S
 
E
E
 
D
L
 
F
V
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
T
L
 
R
A
 
K
E
 
A
L
 
L
E
 
N
A
 
T
L
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
L
C
 
W
L
 
F
P
 
P
F
 
V
E
 
D
P
|
P
P
 
-
H
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
x
G
D
x
A
A
 
D
A
 
A
T
 
S
V
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
V
 
A
A
|
A
A
x
T
G
 
G
L
x
A
S
|
S
G
 
G
P
 
T
A
 
N
R
 
A
A
 
V
S
 
R
V
 
Y
G
 
G
A
 
T
V
 
M
R
 
R
D
 
D
Y
 
N
L
 
V
L
 
I
G
 
N
V
 
L
T
 
E
V
 
V
L
 
V
N
 
L
G
 
P
K
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
H
F
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
H
V
 
Y
M
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
L
M
 
F
A
 
V
G
 
G
A
 
S
W
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
T
 
T
E
 
S
V
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
L
L
 
H
P
 
P
V
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
P
 
T
G
 
V
E
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
C
R
 
A
F
 
F
D
 
P
D
 
S
I
 
V
T
 
Q
Q
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
D
N
 
S
A
 
T
L
 
V
R
 
Q
Q
 
I
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
V
N
 
A
A
 
R
S
 
I
C
 
E
W
 
F
V
 
L
Q
 
D
D
 
D
G
 
V
G
 
M
V
 
M
G
 
D
-
 
A
-
 
C
-
 
N
-
 
R
-
 
H
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
P
T
 
T
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
R
 
E
L
 
F
R
 
H
G
 
G
A
 
S
V
 
Q
A
 
Q
A
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
E
A
 
Q
C
 
L
K
 
Q
T
 
R
M
 
T
G
 
E
G
 
A
T
 
I
R
 
T
M
 
Q
D
 
D
N
 
N
A
 
G
T
 
G
V
 
S
A
 
H
A
 
F
D
 
S
W
 
W
T
 
A
A
 
A
C
 
E
R
 
K
E
 
R
Q
 
N
T
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
A
-
x
R
-
 
H
-
 
N
P
 
A
W
|
W
F
 
Y
A
 
A
D
 
A
R
 
L
A
 
A
Q
 
L
R
 
S
P
 
P
D
 
G
H
 
S
A
 
K
L
 
A
W
 
Y
R
 
-
L
 
-
S
 
S
V
 
T
P
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
S
A
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
W
 
T
H
 
K
G
 
E
A
 
E
L
 
I
R
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
x
H
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
A
-
 
C
-
 
I
W
 
L
V
 
L
Q
 
V
A
 
D
P
 
P
E
 
D
S
 
D
A
 
A
G
 
E
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
R
 
R
E
 
V
A
 
K
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
V
 
E
G
 
N
-
 
L
G
 
G
N
 
R
A
 
R
S
 
A
V
 
L
F
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
T
A
 
C
G
 
T
G
 
G
T
x
E
G
x
H
A
 
G
K
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
G
D
 
K
L
 
R
K
 
Q
S
 
L
T
 
L
A
 
Q
L
 
E
E
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
V
Q
 
E
I
 
T
H
 
M
T
 
R
R
 
Q
L
 
L
K
 
K
H
 
N
S
 
T
F
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
R
G
 
G
I
 
L
F
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
R
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ac3H11_3400 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3400
MDFSLAPIAERVRAAAADQTPLRIRGGGTKDFHGLALHGEVLDTRGLRGIVSYEPSELVV
TVRAGTPLAELEALLAEKGQCLPFEPPHFAKTPSDAATVGGMVAAGLSGPARASVGAVRD
YLLGVTVLNGKGELLTFGGQVMKNVAGYDVSRLMAGAWGTLGLLTEVSLKVLPVAPGEAT
LRFDDITQANALRQLHAWGGQPLPLNASCWVQDGGVGTLYVRLRGAVAAVEAACKTMGGT
RMDNATVAADWTACREQTLPWFADRAQRPDHALWRLSVPATAPVLALPGGAEPLVEWHGA
LRWVQAPESAGEALREAAQAVGGNASVFVAASAGGTGAKGLFDLKSTALEQIHTRLKHSF
DPAGIFNPGRVARAW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory