SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS07260 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS07260 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

2b33B Crystal structure of a putative endoribonuclease (tm0215) from thermotoga maritima msb8 at 2.30 a resolution
36% identity, 85% coverage: 17:138/143 of query aligns to 11:122/126 of 2b33B

query
sites
2b33B
K
 
K
P
 
A
R
 
I
G
 
G
R
 
P
F
 
Y
P
 
S
H
 
Q
V
 
A
T
 
V
R
 
V
A
 
V
G
 
G
D
 
N
F
 
M
L
 
M
F
 
F
V
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
Q
S
 
I
S
 
P
R
 
I
R
x
D
P
 
P
D
x
E
N
 
T
S
 
G
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
-
T
 
-
V
 
V
Q
 
Q
L
 
G
D
 
T
I
 
I
R
 
E
E
 
E
Q
 
K
T
 
T
R
 
E
V
 
R
V
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
K
D
 
A
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
S
 
A
E
 
G
G
 
G
A
 
F
D
 
S
L
 
L
S
 
K
N
 
D
L
 
V
V
 
V
E
 
K
I
 
V
S
 
T
S
 
V
F
 
F
L
 
T
V
 
T
N
 
S
M
 
M
N
 
D
D
 
Y
F
 
F
G
 
Q
G
 
R
Y
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
E
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
G
E
 
D
T
 
H
G
 
R
P
 
P
T
 
A
R
 
R
T
 
S
T
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
H
 
R
P
 
-
H
 
N
L
 
V
L
 
E
I
 
I
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

2uynA Crystal structure of e. Coli tdcf with bound 2-ketobutyrate (see paper)
29% identity, 90% coverage: 10:138/143 of query aligns to 2:124/127 of 2uynA

query
sites
2uynA
R
 
K
I
 
I
V
 
I
P
 
E
G
 
T
K
 
Q
A
 
R
K
 
A
P
 
P
R
 
G
G
 
A
R
 
I
F
 
G
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
-
 
Q
-
 
G
T
 
V
R
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
S
F
 
M
L
 
V
F
 
F
V
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
Q
S
 
I
S
 
P
R
 
V
R
 
C
P
 
P
D
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
Q
L
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
I
Q
 
P
L
 
A
D
 
D
I
 
V
R
 
Q
E
 
D
Q
 
Q
T
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
S
I
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
K
D
 
A
I
 
I
L
 
V
Q
 
V
S
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
L
D
 
S
L
 
V
S
 
G
N
 
D
L
 
I
V
 
I
E
 
K
I
 
M
S
 
T
S
 
V
F
 
F
L
 
I
V
 
T
N
 
D
M
 
L
N
 
N
D
 
D
F
|
F
G
 
A
G
 
T
Y
 
I
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
K
E
 
Q
Y
 
F
F
 
F
D
 
D
E
 
E
-
 
H
-
 
Q
-
 
A
T
 
T
G
 
Y
P
 
P
T
 
T
R
|
R
T
x
S
T
x
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
H
 
A
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
-
H
 
D
L
 
V
L
 
K
I
 
L
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

2uykC Crystal structure of e. Coli tdcf with bound serine (see paper)
29% identity, 90% coverage: 10:138/143 of query aligns to 2:124/127 of 2uykC

query
sites
2uykC
R
 
K
I
 
I
V
 
I
P
 
E
G
 
T
K
 
Q
A
 
R
K
 
A
P
 
P
R
 
G
G
 
A
R
 
I
F
 
G
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
-
 
Q
-
 
G
T
 
V
R
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
S
F
 
M
L
 
V
F
 
F
V
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
Q
S
 
I
S
 
P
R
 
V
R
 
C
P
 
P
D
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
Q
L
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
I
Q
 
P
L
 
A
D
 
D
I
 
V
R
 
Q
E
 
D
Q
 
Q
T
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
S
I
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
K
D
 
A
I
 
I
L
 
V
Q
 
V
S
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
L
D
 
S
L
 
V
S
 
G
N
 
D
L
 
I
V
 
I
E
 
K
I
 
M
S
 
T
S
 
V
F
 
F
L
 
I
V
 
T
N
 
D
M
 
L
N
 
N
D
 
D
F
 
F
G
 
A
G
 
T
Y
 
I
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
K
E
 
Q
Y
 
F
F
 
F
D
 
D
E
 
E
-
 
H
-
 
Q
-
 
A
T
 
T
G
 
Y
P
 
P
T
 
T
R
|
R
T
x
S
T
x
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
H
 
A
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
-
H
 
D
L
 
V
L
 
K
I
 
L
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

7cd4A Crystal structure of the s103f mutant of bacillus subtilis (natto) yabj protein. (see paper)
39% identity, 55% coverage: 60:138/143 of query aligns to 44:121/124 of 7cd4A

query
sites
7cd4A
D
 
D
I
 
I
R
 
K
E
|
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
H
V
 
Q
V
 
V
I
 
F
E
 
S
N
 
N
I
 
L
R
 
K
D
 
A
I
 
V
L
 
L
Q
 
E
S
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
S
L
 
F
S
 
E
N
 
T
L
 
V
V
 
V
E
 
K
I
 
A
S
 
T
S
 
V
F
 
F
L
 
I
V
 
A
N
 
D
M
 
M
N
 
E
D
 
Q
F
 
F
G
 
A
G
 
E
Y
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
T
T
 
H
G
 
K
P
 
P
T
 
A
R
 
R
T
 
F
T
 
C
V
 
V
A
 
E
V
 
V
H
 
A
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
-
H
 
D
L
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3vczB 1.80 angstrom resolution crystal structure of a putative translation initiation inhibitor from vibrio vulnificus cmcp6
36% identity, 59% coverage: 55:138/143 of query aligns to 39:125/127 of 3vczB

query
sites
3vczB
G
 
G
T
 
E
V
 
V
Q
 
P
L
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
A
E
 
A
Q
 
Q
T
 
A
R
 
R
V
 
Q
V
 
S
I
 
L
E
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
K
D
 
A
I
 
V
L
 
V
Q
 
E
S
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
L
D
 
T
L
 
V
S
 
G
N
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
K
I
 
M
S
 
T
S
 
V
F
 
F
L
 
V
V
 
K
N
x
D
M
 
L
N
|
N
D
 
D
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Y
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
E
 
N
Y
 
F
F
 
F
D
 
D
E
 
E
T
 
H
G
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
Y
P
 
P
T
 
A
R
 
R
T
 
S
T
 
C
V
 
V
A
 
E
V
 
V
H
 
A
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
-
H
 
D
L
 
V
L
 
G
I
 
I
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

Q94JQ4 Reactive Intermediate Deaminase A, chloroplastic; 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; EC 3.5.99.10 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 83% coverage: 20:138/143 of query aligns to 77:185/187 of Q94JQ4

query
sites
Q94JQ4
G
 
G
R
 
P
F
 
Y
P
 
S
H
 
Q
V
 
A
T
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
N
D
 
N
F
 
L
L
 
V
F
 
F
V
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
V
S
 
L
S
 
G
R
 
L
R
 
I
P
 
P
D
 
E
N
 
T
S
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
K
S
 
F
A
 
V
D
 
S
E
 
E
L
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
S
I
 
V
R
 
E
E
 
D
Q
 
Q
T
 
T
R
 
E
V
 
Q
V
 
V
I
 
L
E
 
K
N
 
N
I
 
M
R
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
Y
S
 
S
N
 
S
L
 
V
V
 
V
E
 
K
I
 
T
S
 
T
S
 
I
F
 
M
L
 
L
V
 
A
N
 
D
M
 
L
N
 
A
D
 
D
F
 
F
G
 
K
G
 
T
Y
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
Y
 
Y
F
 
F
D
 
P
E
 
A
T
 
P
G
 
S
P
 
P
T
 
A
R
|
R
T
 
S
T
 
T
V
 
Y
A
 
Q
V
 
V
H
 
A
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
L
P
 
-
H
 
N
L
 
A
L
 
K
I
 
I
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
A

Q7CP78 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Enamine/imine deaminase; EC 3.5.99.10 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
36% identity, 59% coverage: 55:138/143 of query aligns to 40:125/128 of Q7CP78

query
sites
Q7CP78
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Q
 
A
L
 
E
D
 
D
I
 
V
R
 
S
E
 
A
Q
 
Q
T
 
A
R
 
R
V
 
Q
V
 
S
I
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
K
D
 
A
I
 
I
L
 
V
Q
 
E
S
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
L
D
 
K
L
 
V
S
 
G
N
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
K
I
 
T
S
 
T
S
 
V
F
 
F
L
 
V
V
 
K
N
 
D
M
 
L
N
 
N
D
 
D
F
 
F
G
 
A
G
 
T
Y
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
T
Y
 
Y
G
 
E
E
 
A
Y
 
F
F
 
F
D
 
T
E
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
A
T
 
T
G
 
F
P
 
P
T
 
A
R
|
R
T
 
S
T
 
C
V
 
V
A
 
E
V
 
V
H
 
A
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
-
H
 
D
L
 
V
L
 
K
I
 
I
E
|
E
M
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5hp8A Crystal structures of rida in complex with pyruvate (see paper)
31% identity, 78% coverage: 27:138/143 of query aligns to 5:106/108 of 5hp8A

query
sites
5hp8A
R
 
K
A
 
A
G
 
N
D
 
N
F
 
L
L
 
V
F
 
F
V
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
V
S
 
L
S
 
G
R
 
L
R
 
I
P
 
P
D
 
E
N
 
T
S
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
K
S
 
F
A
 
V
D
 
S
E
 
E
L
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
S
I
 
V
R
 
E
E
 
D
Q
 
Q
T
 
T
R
 
E
V
 
Q
V
 
V
I
 
L
E
 
K
N
 
N
I
 
M
R
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
Y
S
 
S
N
 
S
L
 
V
V
 
V
E
 
K
I
 
T
S
 
T
S
 
I
F
 
M
L
 
L
V
 
A
N
 
D
M
 
L
N
 
A
D
 
D
F
 
F
G
 
K
G
 
T
Y
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
Y
 
Y
F
 
F
D
 
P
E
 
A
T
 
P
G
 
S
P
 
P
T
 
A
R
|
R
T
 
S
T
|
T
V
 
Y
A
 
Q
V
 
V
H
 
A
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
L
P
 
-
H
 
N
L
 
A
L
 
K
I
 
I
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
A

A0A1J1DL12 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Allergen Der f 34; Enamine/imine deaminase; Allergen Der f 34.0101; EC 3.5.99.10 from Dermatophagoides farinae (American house dust mite) (see paper)
26% identity, 87% coverage: 13:137/143 of query aligns to 10:124/128 of A0A1J1DL12

query
sites
A0A1J1DL12
P
 
P
G
 
L
K
 
A
A
 
P
K
 
Q
P
 
P
R
 
I
G
 
G
R
 
P
F
x
Y
P
 
S
H
 
Q
V
 
A
T
 
V
R
 
Q
A
 
V
G
 
G
D
 
N
F
 
T
L
 
V
F
 
Y
V
 
L
S
 
S
G
|
G
T
 
Q
S
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
I
G
 
G
A
 
M
S
 
N
A
 
V
D
 
R
E
 
T
L
 
N
G
 
E
T
 
M
V
 
V
Q
 
T
L
 
G
D
 
P
I
 
I
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
T
 
A
R
 
Q
V
 
Q
V
 
A
I
 
F
E
 
T
N
|
N
I
 
M
R
 
K
D
 
A
I
 
V
L
 
V
Q
 
E
S
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
M
S
 
S
N
 
D
L
 
V
V
 
V
E
 
K
I
 
V
S
 
N
S
 
I
F
 
F
L
 
I
V
 
R
N
 
N
M
 
F
N
 
N
D
 
D
F
 
F
G
 
P
G
 
A
Y
 
I
N
|
N
A
 
D
V
 
V
Y
 
M
G
 
K
E
 
E
Y
 
F
F
 
F
D
 
Q
E
 
S
T
 
P
G
 
F
P
 
P
T
 
A
R
|
R
T
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
G
V
 
V
H
 
A
Q
 
E
L
 
L
P
|
P
H
 
K
P
 
-
H
 
N
L
 
A
L
 
R
I
 
V
E
|
E
M
 
I
K
 
E
A
 
S
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P52759 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Liver perchloric acid-soluble protein; L-PSP; Reactive intermediate imine deaminase A homolog; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen homolog; rp14.5; EC 3.5.99.10 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
35% identity, 55% coverage: 61:138/143 of query aligns to 51:127/137 of P52759

query
sites
P52759
I
 
V
R
 
A
E
 
E
Q
 
E
T
 
A
R
 
K
V
 
Q
V
 
A
I
 
L
E
 
K
N
 
N
I
 
L
R
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
C
D
 
D
L
 
F
S
 
T
N
 
N
L
 
V
V
 
V
E
 
K
I
 
T
S
 
T
S
 
V
F
 
L
L
 
L
V
 
A
N
 
D
M
 
I
N
 
N
D
 
D
F
 
F
G
 
G
G
 
T
Y
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
G
 
K
E
 
T
Y
 
Y
F
 
F
D
 
Q
E
 
G
T
 
N
G
 
L
P
 
P
T
 
A
R
 
R
T
 
A
T
 
A
V
 
Y
A
 
Q
V
 
V
H
 
A
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
G
H
 
S
L
 
-
L
 
R
I
 
I
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P80601 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; 14.3 kDa perchloric acid soluble protein; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen; EC 3.5.99.10; EC 3.1.-.- from Capra hircus (Goat) (see paper)
35% identity, 55% coverage: 61:138/143 of query aligns to 51:127/137 of P80601

query
sites
P80601
I
 
V
R
 
V
E
 
E
Q
 
E
T
 
A
R
 
K
V
 
Q
V
 
A
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
I
R
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
C
D
 
D
L
 
F
S
 
T
N
 
N
L
 
V
V
 
V
E
 
K
I
 
A
S
 
T
S
 
V
F
 
L
L
 
L
V
 
A
N
 
D
M
 
I
N
 
N
D
 
D
F
 
F
G
 
S
G
 
A
Y
 
V
N
 
N
A
 
D
V
 
V
Y
 
Y
G
 
K
E
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
D
 
Q
E
 
S
T
 
S
G
 
F
P
 
P
T
 
A
R
 
R
T
 
A
T
 
A
V
 
Y
A
 
Q
V
 
V
H
 
A
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
G
H
 
G
L
 
-
L
 
R
I
 
V
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3lybB Structure of putative endoribonuclease(kp1_3112) from klebsiella pneumoniae
27% identity, 80% coverage: 27:141/143 of query aligns to 6:137/137 of 3lybB

query
sites
3lybB
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
F
V
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
I
S
 
I
S
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
D
 
V
N
 
N
S
 
P
I
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
T
S
 
I
A
 
V
D
x
N
E
 
G
L
 
F
G
 
Q
T
x
D
V
 
V
Q
 
P
L
 
E
D
 
P
I
 
V
R
 
R
E
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
G
-
 
P
-
 
I
-
 
L
-
 
A
Q
 
Q
T
 
S
R
 
W
V
 
Y
V
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
R
I
 
T
L
 
V
Q
 
A
S
 
S
E
 
A
G
 
G
A
 
G
D
 
Q
L
 
M
S
 
S
N
 
D
L
 
V
V
 
I
E
 
K
I
 
L
S
 
V
S
 
Q
F
 
Y
L
 
F
V
 
R
N
 
N
M
 
L
N
 
D
D
 
H
F
 
F
G
 
P
G
 
Y
Y
 
Y
N
 
S
A
 
R
V
 
V
Y
 
R
G
 
K
E
 
L
Y
 
F
F
 
Y
D
 
P
E
 
D
T
 
Q
G
 
P
P
 
P
T
 
V
R
 
S
T
 
T
T
 
V
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
H
 
S
Q
 
E
-
 
M
L
 
L
P
 
P
H
 
D
P
 
A
H
 
T
L
 
V
L
 
L
I
 
I
E
 
E
M
 
V
K
 
E
A
 
A
I
 
T
A
 
V
Y
 
W
A
 
L
P
 
P

P0AFQ5 3-aminoacrylate deaminase RutC; 3-AA deaminase; EC 3.5.-.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 90% coverage: 11:139/143 of query aligns to 6:125/128 of P0AFQ5

query
sites
P0AFQ5
I
 
I
V
 
I
P
 
P
-
 
A
G
 
G
K
 
S
A
 
S
K
 
A
P
 
P
R
 
L
G
 
A
R
 
P
F
 
F
P
 
V
H
 
P
V
 
G
T
 
T
R
 
L
A
 
A
G
 
D
D
 
G
F
 
V
L
 
V
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
L
S
 
A
R
 
F
R
 
D
P
 
Q
D
 
H
N
 
N
S
 
N
I
 
V
A
 
L
G
 
F
A
 
A
S
 
D
A
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
D
I
 
P
R
 
K
E
 
A
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
H
V
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
T
I
 
I
R
 
R
D
 
K
I
 
V
L
 
I
Q
 
E
S
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
G
D
 
T
L
 
M
S
 
A
N
 
D
L
 
V
V
 
T
E
 
F
I
 
N
S
 
S
S
 
I
F
 
F
L
 
I
V
 
T
N
 
D
M
 
W
N
 
K
D
 
N
F
 
Y
G
 
A
G
 
A
Y
 
I
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
G
 
A
E
 
E
Y
 
F
F
 
F
D
 
P
E
 
G
T
 
D
G
 
K
P
 
P
T
 
A
R
|
R
T
 
F
T
 
C
V
 
I
A
 
Q
V
 
C
H
 
-
Q
 
G
L
 
L
P
 
V
H
 
K
P
 
P
H
 
D
L
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
E
M
 
I
K
 
A
A
 
T
I
 
I
A
 
A
Y
 
H

5v4dA Crystal structure of the protein of unknown function of the conserved rid protein family yyfa from yersinia pestis
37% identity, 57% coverage: 57:138/143 of query aligns to 44:125/127 of 5v4dA

query
sites
5v4dA
V
 
V
Q
 
E
L
 
N
D
 
D
I
 
I
R
 
E
E
 
K
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
Q
V
 
V
I
 
L
E
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
D
D
 
A
I
 
V
L
 
L
Q
 
L
S
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
T
D
 
T
L
 
K
S
 
D
N
 
K
L
 
I
V
 
V
E
 
K
I
 
T
S
 
T
S
 
I
F
 
F
L
 
I
V
 
T
N
 
N
M
 
I
N
 
N
D
 
N
F
 
S
G
 
S
G
 
Q
Y
 
V
N
 
N
A
x
D
V
 
I
Y
 
Y
G
 
A
E
x
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
K
E
 
G
T
 
T
-
 
I
G
 
F
P
 
P
T
 
A
R
 
R
T
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
E
V
 
V
H
 
S
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
K
P
 
-
H
 
G
L
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
E
M
 
I
K
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
A

3k0tC Crystal structure of pspto -psp protein in complex with d-beta-glucose from pseudomonas syringae pv. Tomato str. Dc3000 (see paper)
27% identity, 83% coverage: 20:137/143 of query aligns to 14:120/124 of 3k0tC

query
sites
3k0tC
G
 
G
R
 
P
F
x
Y
P
 
S
H
 
Q
V
 
A
T
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
N
F
 
T
L
 
V
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
G
|
G
T
 
Q
S
x
I
S
 
P
R
 
L
R
 
D
P
 
P
D
 
S
N
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
T
V
 
M
Q
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
G
I
 
I
R
 
E
E
 
A
Q
 
Q
T
 
I
R
 
T
V
 
Q
V
 
V
I
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
K
D
 
S
I
 
V
L
 
A
Q
 
Q
S
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
G
D
 
S
L
 
F
S
 
K
N
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
K
I
 
L
S
 
N
S
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
T
N
 
D
M
 
L
N
 
G
D
 
H
F
|
F
G
 
A
G
 
K
Y
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
M
G
 
G
E
 
S
Y
 
Y
F
 
F
D
 
S
E
 
Q
T
 
P
G
 
Y
P
 
P
T
 
A
R
|
R
T
 
A
T
 
A
V
 
I
A
 
G
V
 
V
H
 
A
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
H
x
R
P
 
-
H
 
G
L
 
A
L
 
Q
I
 
V
E
|
E
M
 
M
K
 
D
A
 
A
I
 
I

Query Sequence

>BPHYT_RS07260 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS07260
MTNDSTIQGRIVPGKAKPRGRFPHVTRAGDFLFVSGTSSRRPDNSIAGASADELGTVQLD
IREQTRVVIENIRDILQSEGADLSNLVEISSFLVNMNDFGGYNAVYGEYFDETGPTRTTV
AVHQLPHPHLLIEMKAIAYAPQK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory