SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS22155 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS22155 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4iztA The e41q mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 showing covalent addition of the acetamide moiety of fluoroacetamide at the active site cysteine
33% identity, 87% coverage: 6:259/291 of query aligns to 2:255/263 of 4iztA

query
sites
4iztA
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
P
Q
 
R
T
 
G
S
 
S
-
 
H
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
M
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
A
 
A
Q
 
R
P
 
P
I
 
L
S
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
P
T
 
Q
G
 
H
N
 
N
I
 
L
A
 
D
R
 
L
T
 
I
V
 
D
E
 
D
L
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
 
Q
K
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
 
Y
E
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
Q
I
 
I
A
 
C
G
 
A
D
 
Q
P
 
V
A
 
S
K
 
A
Y
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
A
 
A
H
 
A
D
 
R
A
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
G
I
 
I
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
R
E
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
L
V
 
P
G
 
G
A
 
P
A
 
E
T
 
G
R
 
P
G
 
E
E
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
-
H
 
-
I
 
I
S
 
T
S
 
A
L
 
E
V
 
L
F
 
A
S
 
D
R
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
E
Q
 
V
L
 
L
D
 
A
S
 
S
Y
 
Y
H
 
Q
K
 
K
Q
 
V
Y
 
Q
L
 
L
Y
|
Y
S
 
G
S
 
P
E
 
E
T
 
E
R
 
K
I
 
A
-
 
A
Y
 
F
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
G
 
P
R
 
P
-
 
P
M
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
W
D
 
G
G
 
G
W
 
R
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
L
V
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
S
 
V
G
x
E
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
M
A
 
V
R
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
-
 
P
S
 
T
A
|
A
L
|
L
F
 
A
S
 
G
V
 
D
Q
 
E
T
 
T
G
 
S
Y
 
V
H
 
-
Q
 
-
S
 
P
R
 
G
I
 
I
W
 
L
F
 
L
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
E
N
 
N
T
 
G
M
 
I
Y
 
T
A
 
L
L
 
A
L
 
Y
S
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
C
G
 
G
T
 
P
T
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
L
A
 
V
T
 
F
C
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
S
A
 
V
I
 
V
W
 
V
S
 
G
P
 
P
S
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
S
 
G
R
 
V
E
 
E
R
 
P
E
 
G
E
 
L
V
 
L
I
 
V
T
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
P
D
 
D
P
 
A
A
 
D
V
 
Y
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
V
 
R
R
 
R

5nybA A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to adipamide
33% identity, 87% coverage: 6:259/291 of query aligns to 1:254/262 of 5nybA

query
sites
5nybA
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
P
Q
 
R
T
 
G
S
 
S
-
 
H
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
M
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
A
 
A
Q
 
R
P
 
P
I
 
L
S
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
P
T
 
Q
G
 
H
N
 
N
I
 
L
A
 
D
R
 
L
T
 
I
V
 
D
E
 
D
L
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
 
Y
E
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
Q
I
 
I
A
 
C
G
 
A
D
 
Q
P
 
V
A
 
S
K
 
A
Y
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
A
 
A
H
 
A
D
 
R
A
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
G
I
 
I
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
R
E
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
L
V
 
P
G
 
G
A
 
P
A
 
E
T
 
G
R
 
P
G
 
E
E
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
-
H
 
-
I
 
I
S
 
T
S
 
A
L
 
E
V
 
L
F
 
A
S
 
D
R
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
E
Q
 
V
L
 
L
D
 
A
S
 
S
Y
 
Y
H
 
Q
K
|
K
Q
 
V
Y
 
Q
L
 
L
Y
|
Y
S
 
G
S
 
P
E
 
E
T
x
E
R
 
K
I
 
A
-
 
A
Y
 
F
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
G
 
P
R
 
P
-
 
P
M
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
W
D
 
G
G
 
G
W
 
R
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
L
V
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
S
 
V
G
x
E
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
M
A
 
V
R
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
-
 
P
S
 
T
A
|
A
L
 
L
F
 
A
S
 
G
V
 
D
Q
 
E
T
 
T
G
 
S
Y
 
V
H
 
-
Q
 
-
S
 
P
R
 
G
I
 
I
W
 
L
F
 
L
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
E
N
 
N
T
 
G
M
 
I
Y
 
T
A
 
L
L
 
A
L
 
Y
S
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
C
G
 
G
T
 
P
T
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
L
A
 
V
T
 
F
C
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
S
A
 
V
I
 
V
W
 
V
S
 
G
P
 
P
S
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
S
 
G
R
 
V
E
 
E
R
 
P
E
 
G
E
 
L
V
 
L
I
 
V
T
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
P
D
 
D
P
 
A
A
 
D
V
 
Y
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
V
 
R
R
 
R

5ny7A A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to nicotinamide
33% identity, 87% coverage: 6:259/291 of query aligns to 1:254/262 of 5ny7A

query
sites
5ny7A
A
 
G
L
|
L
L
x
V
P
 
P
Q
 
R
T
 
G
S
 
S
-
 
H
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
M
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
A
 
A
Q
 
R
P
 
P
I
 
L
S
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
P
T
 
Q
G
 
H
N
 
N
I
 
L
A
 
D
R
 
L
T
 
I
V
 
D
E
 
D
L
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
 
E
K
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
 
Y
E
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
Q
I
 
I
A
 
C
G
 
A
D
 
Q
P
 
V
A
 
S
K
 
A
Y
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
A
 
A
H
 
A
D
x
R
A
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
G
I
 
I
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
R
E
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
L
V
 
P
G
 
G
A
x
P
A
 
E
T
 
G
R
 
P
G
 
E
E
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
-
H
 
-
I
 
I
S
x
T
S
 
A
L
x
E
V
 
L
F
 
A
S
 
D
R
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
E
Q
 
V
L
 
L
D
 
A
S
|
S
Y
 
Y
H
 
Q
K
|
K
Q
 
V
Y
 
Q
L
 
L
Y
|
Y
S
 
G
S
 
P
E
 
E
T
 
E
R
 
K
I
 
A
-
 
A
Y
 
F
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
G
 
P
R
 
P
-
 
P
M
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
W
D
 
G
G
 
G
W
 
R
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
L
V
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
S
 
V
G
x
E
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
M
A
 
V
R
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
-
 
P
S
 
T
A
|
A
L
|
L
F
 
A
S
 
G
V
 
D
Q
 
E
T
 
T
G
 
S
Y
 
V
H
 
-
Q
 
-
S
 
P
R
 
G
I
 
I
W
 
L
F
 
L
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
E
N
 
N
T
 
G
M
 
I
Y
 
T
A
 
L
L
 
A
L
 
Y
S
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
C
G
 
G
T
 
P
T
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
L
A
 
V
T
 
F
C
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
S
A
 
V
I
 
V
W
 
V
S
 
G
P
 
P
S
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
S
 
G
R
 
V
E
 
E
R
 
P
E
 
G
E
 
L
V
 
L
I
 
V
T
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
P
D
 
D
P
 
A
A
 
D
V
 
Y
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
V
 
R
R
 
R

4izuA The e41q mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 showing the result of michael addition of acrylamide at the active site cysteine
34% identity, 79% coverage: 13:241/291 of query aligns to 2:229/254 of 4izuA

query
sites
4izuA
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
M
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
A
 
A
Q
 
R
P
 
P
I
 
L
S
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
P
T
x
Q
G
 
H
N
 
N
I
 
L
A
 
D
R
 
L
T
 
I
V
 
D
E
 
D
L
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
x
Q
K
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
|
Y
E
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
Q
I
 
I
A
x
C
G
 
A
D
 
Q
P
 
V
A
 
S
K
 
A
Y
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
A
 
A
H
x
A
D
 
R
A
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
G
I
 
I
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
R
E
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
L
V
 
P
G
 
G
A
 
P
A
 
E
T
 
G
R
x
P
G
x
E
E
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
-
H
 
-
I
 
I
S
 
T
S
 
A
L
 
E
V
 
L
F
 
A
S
 
D
R
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
E
Q
 
V
L
 
L
D
 
A
S
 
S
Y
 
Y
H
 
Q
K
|
K
Q
 
V
Y
 
Q
L
 
L
Y
|
Y
S
 
G
S
 
P
E
 
E
T
 
E
R
 
K
I
 
A
-
 
A
Y
 
F
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
G
 
P
R
 
P
-
 
P
M
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
W
D
 
G
G
 
G
W
 
R
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
L
V
 
V
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
S
 
V
G
 
E
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
M
A
 
V
R
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
-
 
P
S
 
T
A
 
A
L
 
L
F
 
A
S
 
G
V
 
D
Q
 
E
T
 
T
G
 
S
Y
 
V
H
 
-
Q
 
-
S
 
P
R
 
G
I
 
I
W
 
L
F
 
L
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
E
N
 
N
T
 
G
M
 
I
Y
 
T
A
 
L
L
 
A
L
 
Y
S
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
C
G
 
G
T
 
P
T
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
L
A
 
V
T
 
F
C
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
S
A
 
V
I
 
V
W
 
V
S
 
G
P
 
P
S
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
S
 
G
R
 
V
E
 
E

3klcB Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
26% identity, 85% coverage: 13:259/291 of query aligns to 1:243/261 of 3klcB

query
sites
3klcB
L
 
V
R
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
V
Q
 
Q
A
 
M
Q
 
N
P
 
P
I
 
Q
S
 
I
G
 
L
D
 
E
V
 
P
T
 
D
G
 
K
N
 
N
I
 
Y
A
 
S
R
 
K
T
 
A
V
 
E
E
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
S
D
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
E
 
N
P
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
A
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
E
R
 
V
L
 
F
E
 
E
P
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
F
I
 
L
R
 
M
D
 
D
I
 
V
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
T
E
 
G
I
 
V
A
 
Y
V
 
I
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
A
T
 
E
R
 
K
G
 
D
E
 
G
R
 
D
G
 
V
L
 
L
H
 
Y
I
x
N
S
 
S
S
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
V
S
 
G
R
 
P
S
 
R
G
 
G
A
x
F
Q
 
-
L
 
I
D
 
G
S
x
K
Y
 
Y
H
 
R
K
|
K
Q
 
I
Y
 
H
L
 
L
Y
 
F
S
 
Y
S
 
R
E
|
E
T
 
K
R
 
F
I
 
F
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
R
M
 
V
L
 
F
E
 
D
L
 
L
D
 
G
G
 
F
W
 
M
R
 
K
L
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
M
V
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
S
 
W
G
 
F
F
 
F
A
 
P
E
|
E
H
 
S
A
 
A
R
 
R
H
 
T
A
 
L
A
 
A
V
 
L
N
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
D
A
 
-
Y
 
-
L
 
V
V
 
I
S
 
A
A
 
H
L
 
P
F
 
A
S
x
N
V
x
L
Q
 
V
T
x
M
G
 
P
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
P
S
 
R
R
 
A
I
 
M
W
 
-
F
 
-
P
 
P
A
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
N
T
 
K
M
 
V
Y
 
Y
A
 
T
L
 
V
L
 
T
S
 
A
N
 
D
H
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
T
 
E
G
 
R
G
 
G
W
 
L
A
 
K
T
 
F
C
 
I
G
 
G
A
 
K
S
 
S
A
 
L
I
 
I
W
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
K
G
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
S
 
S
R
 
E
E
 
T
R
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
G
T
 
V
A
 
A
L
 
E
L
 
I
D
 
D
P
 
L
A
 
S
V
 
L
L
 
V
A
 
R
D
 
N
V
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3klcA Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
26% identity, 85% coverage: 13:259/291 of query aligns to 1:243/261 of 3klcA

query
sites
3klcA
L
 
V
R
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
V
Q
 
Q
A
 
M
Q
 
N
P
 
P
I
 
Q
S
 
I
G
 
L
D
x
E
V
 
P
T
x
D
G
x
K
N
 
N
I
 
Y
A
 
S
R
 
K
T
 
A
V
 
E
E
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
S
D
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
E
 
N
P
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
A
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
E
R
 
V
L
 
F
E
 
E
P
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
F
I
 
L
R
 
M
D
 
D
I
 
V
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
T
E
 
G
I
 
V
A
 
Y
V
 
I
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
A
T
 
E
R
 
K
G
 
D
E
 
G
R
 
D
G
 
V
L
 
L
H
 
Y
I
x
N
S
 
S
S
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
V
S
x
G
R
x
P
S
x
R
G
 
G
A
x
F
Q
 
-
L
x
I
D
x
G
S
x
K
Y
 
Y
H
 
R
K
|
K
Q
 
I
Y
 
H
L
 
L
Y
 
F
S
 
Y
S
 
R
E
|
E
T
 
K
R
 
F
I
 
F
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
R
M
 
V
L
 
F
E
 
D
L
 
L
D
 
G
G
 
F
W
 
M
R
 
K
L
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
M
V
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
S
 
W
G
 
F
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
S
A
 
A
R
 
R
H
 
T
A
 
L
A
 
A
V
 
L
N
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
D
A
 
-
Y
 
-
L
 
V
V
 
I
S
 
A
A
 
H
L
 
P
F
 
A
S
x
N
V
x
L
Q
 
V
T
x
M
G
 
P
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
P
S
 
R
R
 
A
I
 
M
W
 
-
F
 
-
P
 
P
A
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
N
T
 
K
M
 
V
Y
 
Y
A
 
T
L
 
V
L
 
T
S
 
A
N
 
D
H
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
T
 
E
G
 
R
G
 
G
W
 
L
A
 
K
T
 
F
C
 
I
G
 
G
A
 
K
S
 
S
A
 
L
I
 
I
W
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
K
G
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
S
 
S
R
 
E
E
 
T
R
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
G
T
 
V
A
 
A
L
 
E
L
 
I
D
 
D
P
 
L
A
 
S
V
 
L
L
 
V
A
 
R
D
 
N
V
 
K
R
 
R

5nycA A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to propionitrile
34% identity, 81% coverage: 6:241/291 of query aligns to 1:236/261 of 5nycA

query
sites
5nycA
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
P
Q
 
R
T
 
G
S
 
S
-
 
H
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
M
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
A
 
A
Q
 
R
P
 
P
I
 
L
S
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
P
T
 
Q
G
 
H
N
 
N
I
 
L
A
 
D
R
 
L
T
 
I
V
 
D
E
 
D
L
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
 
E
K
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
 
Y
E
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
Q
I
 
I
A
 
C
G
 
A
D
 
Q
P
 
V
A
 
S
K
 
A
Y
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
A
 
A
H
x
A
D
 
R
A
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
G
I
 
I
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
R
E
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
L
V
 
P
G
 
G
A
 
P
A
 
E
T
 
G
R
 
P
G
 
E
E
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
-
H
 
-
I
 
I
S
 
T
S
 
A
L
 
E
V
 
L
F
 
A
S
 
D
R
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
E
Q
 
V
L
 
L
D
 
A
S
 
S
Y
 
Y
H
 
Q
K
 
K
Q
 
V
Y
 
Q
L
 
L
Y
|
Y
S
 
G
S
 
P
E
 
E
T
 
E
R
 
K
-
 
A
I
 
A
Y
 
F
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
-
 
P
G
 
P
R
 
P
M
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
W
D
 
G
G
 
G
W
 
R
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
L
V
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
S
 
V
G
x
E
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
M
A
 
V
R
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
-
 
P
S
 
T
A
|
A
L
|
L
F
 
A
S
 
G
V
 
D
Q
 
E
T
 
T
G
 
S
Y
 
V
H
 
-
Q
 
-
S
 
P
R
 
G
I
 
I
W
 
L
F
 
L
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
E
N
 
N
T
 
G
M
 
I
Y
 
T
A
 
L
L
 
A
L
 
Y
S
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
C
G
 
G
T
 
P
T
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
L
A
 
V
T
 
F
C
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
S
A
 
V
I
 
V
W
 
V
S
 
G
P
 
P
S
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
S
 
G
R
 
V
E
 
E

4izsA The c145a mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 in complex with butyramide
34% identity, 81% coverage: 6:241/291 of query aligns to 1:236/261 of 4izsA

query
sites
4izsA
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
P
Q
 
R
T
 
G
S
 
S
-
 
H
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
M
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
A
 
A
Q
 
R
P
 
P
I
 
L
S
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
P
T
 
Q
G
 
H
N
 
N
I
 
L
A
 
D
R
 
L
T
 
I
V
 
D
E
 
D
L
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
 
Y
E
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
Q
I
 
I
A
 
C
G
 
A
D
 
Q
P
 
V
A
 
S
K
 
A
Y
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
D
A
 
A
H
 
A
D
 
R
A
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
G
I
 
I
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
R
E
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
L
I
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
L
V
 
P
G
 
G
A
 
P
A
 
E
T
 
G
R
 
P
G
 
E
E
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
-
H
 
-
I
 
I
S
 
T
S
 
A
L
 
E
V
 
L
F
 
A
S
 
D
R
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
E
Q
 
V
L
 
L
D
 
A
S
 
S
Y
 
Y
H
 
Q
K
|
K
Q
 
V
Y
 
Q
L
 
L
Y
|
Y
S
 
G
S
 
P
E
 
E
T
x
E
R
 
K
-
 
A
I
 
A
Y
 
F
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
-
 
P
G
 
P
R
 
P
M
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
W
D
 
G
G
 
G
W
 
R
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
L
V
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
S
 
V
G
x
E
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
M
A
 
V
R
 
R
H
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
A
 
L
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
-
 
P
S
 
T
A
|
A
L
 
L
F
 
A
S
 
G
V
 
D
Q
 
E
T
 
T
G
 
S
Y
 
V
H
 
-
Q
 
-
S
 
P
R
 
G
I
 
I
W
 
L
F
 
L
P
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
E
N
 
N
T
 
G
M
 
I
Y
 
T
A
 
L
L
 
A
L
 
Y
S
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
C
G
 
G
T
 
P
T
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
L
A
 
V
T
 
F
C
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
S
A
 
V
I
 
V
W
 
V
S
 
G
P
 
P
S
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
S
 
G
R
 
V
E
 
E

Q9UYV8 Nitrilase; PaNit; EC 3.5.5.1 from Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) (see paper)
26% identity, 85% coverage: 13:259/291 of query aligns to 2:244/262 of Q9UYV8

query
sites
Q9UYV8
L
 
V
R
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
V
Q
 
Q
A
 
M
Q
 
N
P
 
P
I
 
Q
S
 
I
G
 
L
D
 
E
V
 
P
T
 
D
G
 
K
N
 
N
I
 
Y
A
 
S
R
 
K
T
 
A
V
 
E
E
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
S
D
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
L
 
L
V
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
E
 
N
P
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
A
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
E
R
 
V
L
 
F
E
 
E
P
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
F
I
 
L
R
 
M
D
 
D
I
 
V
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
T
E
 
G
I
 
V
A
 
Y
V
 
I
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
A
T
 
E
R
 
K
G
 
D
E
 
G
R
 
D
G
 
V
L
 
L
H
 
Y
I
 
N
S
 
S
S
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
V
S
 
G
R
 
P
S
 
R
G
 
G
A
 
F
Q
 
-
L
 
I
D
 
G
S
 
K
Y
 
Y
H
 
R
K
 
K
Q
 
I
Y
 
H
L
 
L
Y
 
F
S
 
Y
S
 
R
E
 
E
T
 
K
R
 
F
I
 
F
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
R
M
 
V
L
 
F
E
 
D
L
 
L
D
 
G
G
 
F
W
 
M
R
 
K
L
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
M
V
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
S
 
W
G
 
F
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
S
A
 
A
R
 
R
H
 
T
A
 
L
A
 
A
V
 
L
N
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
D
A
 
-
Y
 
-
L
 
V
V
 
I
S
 
A
A
 
H
L
 
P
F
 
A
S
 
N
V
 
L
Q
 
V
T
 
M
G
 
P
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
P
S
 
R
R
 
A
I
 
M
W
 
-
F
 
-
P
 
P
A
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
N
T
 
K
M
 
V
Y
 
Y
A
 
T
L
 
V
L
 
T
S
 
A
N
 
D
H
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
T
 
E
G
 
R
G
 
G
W
 
L
A
 
K
T
 
F
C
 
I
G
 
G
A
 
K
S
 
S
A
 
L
I
 
I
W
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
K
G
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
S
 
S
R
 
E
E
 
T
R
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
G
T
 
V
A
 
A
L
 
E
L
 
I
D
 
D
P
 
L
A
 
Y
V
 
L
L
 
V
A
 
R
D
 
N
V
 
K
R
 
R

Q9NQR4 Omega-amidase NIT2; Nitrilase homolog 2; EC 3.5.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
27% identity, 93% coverage: 11:282/291 of query aligns to 2:275/276 of Q9NQR4

query
sites
Q9NQR4
T
 
T
S
 
S
L
 
F
R
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
L
A
 
I
Q
 
Q
A
 
L
Q
 
Q
P
 
-
I
 
I
S
 
S
G
 
S
D
 
I
V
 
K
T
 
S
G
 
D
N
 
N
I
 
V
A
 
T
R
 
R
T
 
A
V
 
C
E
 
S
L
 
F
T
 
I
A
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
T
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
V
 
S
F
 
L
P
 
P
E
|
E
K
 
C
F
 
F
L
 
N
T
 
S
G
 
P
Y
 
Y
E
 
G
P
 
A
D
 
K
L
 
Y
I
 
F
A
 
P
G
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
E
Y
 
Y
A
 
A
F
 
E
D
 
K
A
 
I
H
 
P
D
 
G
A
 
E
R
 
S
L
 
T
E
 
Q
P
 
K
I
 
L
R
 
S
D
 
E
I
 
V
C
 
A
R
 
K
Q
 
E
R
 
C
E
 
S
I
 
I
A
 
Y
V
 
L
I
 
I
V
 
G
G
 
G
A
 
S
A
 
I
T
 
P
R
 
E
G
 
E
E
 
D
R
 
A
G
 
G
-
 
K
L
 
L
H
 
Y
I
 
N
S
 
T
S
 
C
L
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
G
R
 
P
S
 
D
G
 
G
A
 
T
Q
 
L
L
 
L
D
 
A
S
 
K
Y
 
Y
H
 
R
K
|
K
Q
 
I
Y
 
H
L
 
L
Y
x
F
S
x
D
-
x
I
-
x
D
-
x
V
-
x
P
-
x
G
-
x
K
-
x
I
-
x
T
-
x
F
S
x
Q
E
|
E
T
 
S
R
 
K
I
 
T
Y
 
L
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
S
G
 
F
R
 
S
M
 
T
L
 
F
E
 
D
L
 
T
D
 
P
G
 
Y
W
 
C
R
 
R
L
 
V
A
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
S
 
M
G
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
I
A
 
Y
A
 
A
V
 
Q
N
 
R
G
 
G
A
 
C
H
 
Q
A
 
L
Y
 
L
L
 
V
V
 
Y
S
 
P
A
 
G
L
 
A
F
 
F
S
 
N
V
 
L
Q
 
T
T
 
T
G
 
G
Y
 
P
H
 
A
Q
 
H
S
 
W
R
 
E
I
 
L
W
 
L
F
 
Q
P
 
R
A
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
D
N
 
N
T
 
Q
M
 
V
Y
 
Y
-
 
V
A
 
A
L
 
T
L
 
A
S
 
S
N
 
P
H
 
A
V
 
R
G
 
D
T
 
D
T
 
K
G
 
A
G
 
S
W
 
Y
A
 
V
T
 
A
C
 
W
G
 
G
A
 
H
S
 
S
A
 
T
I
 
V
W
 
V
S
 
N
P
 
P
S
 
W
G
 
G
D
 
E
V
|
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
S
 
G
R
 
T
E
 
E
R
 
-
E
 
E
E
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
Y
A
 
S
L
 
D
L
 
I
D
 
D
P
 
L
A
 
K
V
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
Q
R
 
Q
E
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
I
A
 
P
D
 
V
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
R
 
K
D
 
R
E
 
S
A
 
D
V
 
L
H
 
Y
A
 
A
I
 
V
R
 
E
Y
 
M
N
 
K
E
 
K

6ypaB The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound glutaramide
26% identity, 93% coverage: 7:276/291 of query aligns to 1:267/269 of 6ypaB

query
sites
6ypaB
L
 
L
L
 
V
P
 
P
Q
 
R
T
 
G
S
 
S
-
 
H
-
 
M
L
 
V
R
 
K
I
 
V
A
 
G
A
 
Y
A
 
I
Q
 
Q
A
 
M
Q
 
E
P
 
P
I
 
K
S
 
I
G
 
L
D
 
E
V
 
L
T
 
D
G
 
K
N
 
N
I
 
Y
A
 
S
R
 
K
T
 
A
V
 
E
E
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
-
 
N
-
 
F
E
 
E
P
 
S
D
 
R
L
 
E
I
 
E
A
 
V
G
 
F
D
 
D
P
 
V
A
 
A
K
 
Q
Y
 
Q
A
 
I
F
 
P
D
 
E
A
 
G
H
 
E
D
 
T
A
 
T
R
 
T
L
 
F
E
 
-
P
 
-
I
 
L
R
 
M
D
 
E
I
 
L
C
 
A
R
 
R
Q
 
E
R
 
L
E
 
G
I
 
L
A
 
Y
V
 
I
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
A
T
 
E
R
 
K
G
 
S
E
 
G
R
 
N
G
 
Y
L
 
L
H
 
Y
I
 
N
S
 
S
S
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
V
S
 
G
R
 
P
S
 
R
G
 
G
A
 
-
Q
 
Y
L
 
I
D
 
G
S
 
K
Y
 
Y
H
 
R
K
|
K
Q
 
I
Y
 
H
L
 
L
Y
x
F
S
 
Y
S
 
R
E
|
E
T
 
K
R
 
V
I
 
F
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
K
M
 
V
L
 
F
E
 
D
L
 
I
D
 
G
G
 
F
W
 
A
R
 
K
L
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
M
V
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
S
x
W
G
 
F
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
S
A
 
A
R
 
R
H
 
T
A
 
L
A
 
A
V
 
L
N
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
E
A
 
-
Y
 
-
L
 
I
V
 
I
S
 
A
A
 
H
L
 
P
F
 
A
S
x
N
V
x
L
Q
x
V
T
x
M
G
 
P
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
P
S
 
R
R
 
A
I
 
M
W
 
-
F
 
-
P
 
P
A
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
N
T
 
R
M
 
V
Y
 
Y
A
 
T
L
 
I
L
 
T
S
 
A
N
 
D
H
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
T
 
E
G
 
R
G
 
G
W
 
L
A
 
K
T
 
F
C
 
I
G
 
G
A
 
K
S
 
S
A
 
L
I
 
I
W
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
K
G
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
S
 
S
R
 
E
E
 
T
R
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
I
I
 
G
T
 
V
A
 
V
L
 
E
L
 
I
D
 
D
P
 
-
A
 
L
V
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
R
V
 
N
R
 
K
E
 
R
R
 
L
E
 
N
T
 
D
M
 
M
L
 
N
A
 
D
D
 
I
F
 
F
R
 
K
E
 
D
R
 
R
D
 
R
E
 
E
A
 
E
V
 
Y
H
 
Y

7ovgA The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound acetamide (see paper)
25% identity, 91% coverage: 13:276/291 of query aligns to 3:261/263 of 7ovgA

query
sites
7ovgA
L
 
V
R
 
K
I
 
V
A
 
G
A
 
Y
A
 
I
Q
 
Q
A
 
M
Q
 
E
P
 
P
I
 
K
S
 
I
G
 
L
D
 
E
V
 
L
T
 
D
G
 
K
N
 
N
I
 
Y
A
 
S
R
 
K
T
 
A
V
 
E
E
 
K
L
 
L
T
 
I
A
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
S
D
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
-
 
N
-
 
F
E
 
E
P
 
S
D
 
R
L
 
E
I
 
E
A
 
V
G
 
F
D
 
D
P
 
V
A
 
A
K
 
Q
Y
 
Q
A
 
I
F
 
P
D
 
E
A
 
G
H
 
E
D
 
T
A
 
T
R
 
T
L
 
F
E
 
-
P
 
-
I
 
L
R
 
M
D
 
E
I
 
L
C
 
A
R
 
R
Q
 
E
R
 
L
E
 
G
I
 
L
A
 
Y
V
 
I
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
A
T
 
E
R
 
K
G
 
S
E
 
G
R
 
N
G
 
Y
L
 
L
H
 
Y
I
 
N
S
 
S
S
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
V
S
 
G
R
 
P
S
 
R
G
 
G
A
 
-
Q
 
Y
L
 
I
D
 
G
S
 
K
Y
 
Y
H
 
R
K
|
K
Q
 
I
Y
 
H
L
 
L
Y
x
F
S
 
Y
S
 
R
E
 
E
T
 
K
R
 
V
I
 
F
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
K
M
 
V
L
 
F
E
 
D
L
 
I
D
 
G
G
 
F
W
 
A
R
 
K
L
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
M
V
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
S
 
W
G
 
F
F
 
F
A
 
P
E
 
E
H
 
S
A
 
A
R
 
R
H
 
T
A
 
L
A
 
A
V
 
L
N
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
E
A
 
-
Y
 
-
L
 
I
V
 
I
S
 
A
A
 
H
L
 
P
F
 
A
S
x
N
V
 
L
Q
 
V
T
 
M
G
 
P
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
P
S
 
R
R
 
A
I
 
M
W
 
-
F
 
-
P
 
P
A
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
N
T
 
R
M
 
V
Y
 
Y
A
 
T
L
 
I
L
 
T
S
 
A
N
 
D
H
 
R
V
 
V
G
 
G
T
 
E
T
 
E
G
 
R
G
 
G
W
 
L
A
 
K
T
 
F
C
 
I
G
 
G
A
 
K
S
 
S
A
 
L
I
 
I
W
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
K
G
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
S
 
S
R
 
E
E
 
T
R
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
I
I
 
G
T
 
V
A
 
V
L
 
E
L
 
I
D
 
D
P
 
-
A
 
L
V
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
R
V
 
N
R
 
K
E
 
R
R
 
L
E
 
N
T
 
D
M
 
M
L
 
N
A
 
D
D
 
I
F
 
F
R
 
K
E
 
D
R
 
R
D
 
R
E
 
E
A
 
E
V
 
Y
H
 
Y

Q94JV5 Deaminated glutathione amidase, chloroplastic/cytosolic; dGSH amidase; Nitrilase-like protein 2; Protein nitrilase 1 homolog; AtNit1; Protein Nit1 homolog; EC 3.5.1.128 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
26% identity, 86% coverage: 12:261/291 of query aligns to 36:295/307 of Q94JV5

query
sites
Q94JV5
S
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
M
Q
 
T
P
 
S
I
 
V
S
 
N
G
 
-
D
 
D
V
 
L
T
 
M
G
 
T
N
 
N
I
 
F
A
 
A
R
 
T
T
 
C
V
 
S
E
 
R
L
 
L
T
 
V
A
 
Q
L
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
C
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
 
N
F
 
F
-
 
S
L
 
F
T
 
V
G
 
G
Y
 
D
E
 
K
P
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
E
G
 
G
D
 
E
P
 
S
A
 
V
K
 
K
Y
 
I
A
 
A
F
 
E
D
 
P
A
 
L
H
 
D
D
 
G
A
 
P
R
 
V
L
 
M
E
 
E
P
 
R
I
 
Y
R
 
C
D
 
S
I
 
L
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
S
E
 
N
I
 
I
A
 
W
V
 
L
I
 
S
V
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
F
T
 
Q
R
 
E
G
 
R
E
 
F
R
 
D
G
 
D
L
 
T
H
 
H
I
 
L
S
 
C
S
 
N
-
 
T
-
 
H
L
 
V
V
 
V
F
 
I
S
 
D
R
 
D
S
 
A
G
 
G
A
 
M
Q
 
I
L
 
R
D
 
D
S
 
T
Y
 
Y
H
 
Q
K
 
K
Q
 
M
Y
 
H
L
 
L
Y
 
F
S
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
S
 
K
E
 
E
T
 
S
R
 
S
I
 
F
Y
 
T
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
G
 
I
R
 
V
M
 
S
L
 
V
E
 
D
L
 
S
D
 
P
G
 
V
W
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
S
 
L
G
 
R
F
 
F
A
 
P
E
 
K
H
 
I
A
 
Y
R
 
Q
H
 
Q
A
 
L
A
 
R
V
 
F
-
 
E
N
 
Q
G
 
K
A
 
A
H
 
Q
A
 
V
Y
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
P
A
 
S
L
 
A
F
 
F
S
 
T
V
 
K
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
 
E
H
 
A
Q
 
H
S
 
W
R
 
E
I
 
I
W
 
L
F
 
L
P
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
I
D
 
E
N
 
T
T
 
Q
M
 
C
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
L
 
A
S
 
A
N
 
A
H
 
Q
V
 
A
G
 
G
T
 
K
-
 
H
T
 
N
G
 
E
G
 
K
W
 
R
A
 
E
T
 
S
C
 
Y
G
 
G
A
 
D
S
 
T
A
 
L
I
 
I
W
 
I
S
 
D
P
 
P
S
 
W
G
 
G
D
 
T
V
 
V
I
 
V
A
 
G
Q
 
R
-
 
L
A
 
P
S
 
D
R
 
R
E
 
V
R
 
S
E
 
T
E
 
G
V
 
I
I
 
V
T
 
V
A
 
A
L
 
D
L
 
I
D
 
D
P
 
F
A
 
S
V
 
L
L
 
I
A
 
D
D
 
S
V
 
V
R
 
R
E
 
T
R
 
K

Sites not aligning to the query:

Q03217 Aliphatic nitrilase; EC 3.5.5.7 from Rhodococcus rhodochrous (see paper)
30% identity, 45% coverage: 11:140/291 of query aligns to 6:146/366 of Q03217

query
sites
Q03217
T
 
N
S
 
T
L
 
F
R
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
S
 
W
G
 
F
D
 
D
V
 
A
T
 
A
G
 
K
N
 
T
I
 
V
A
 
D
R
 
K
T
 
T
V
 
V
E
 
S
L
 
I
T
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
R
A
 
N
G
 
G
A
 
C
K
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
A
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
 
V
F
 
F
L
 
I
T
 
P
G
 
G
Y
 
Y
E
 
P
P
 
Y
D
 
H
L
 
I
I
 
W
A
 
V
G
 
D
D
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
M
A
 
A
K
 
K
Y
 
F
A
 
A
F
 
V
D
 
R
A
 
Y
H
 
H
D
 
E
A
 
N
R
 
S
L
 
L
-
 
T
-
 
M
-
 
D
-
 
S
-
 
P
-
 
H
-
 
V
E
 
Q
P
 
R
I
 
L
R
 
L
D
 
D
I
 
A
C
 
A
R
 
R
Q
 
D
R
 
H
E
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
I
A
 
S
T
 
E
R
 
R
G
 
D
E
 
G
R
 
G
G
 
S
L
 
L
H
 
Y
I
 
M
S
 
T
S
 
Q
L
 
L
V
 
V
F
 
I
S
 
D
R
 
A
S
 
D
G
 
G
A
 
Q
Q
 
L
L
 
V
D
 
A
S
 
R
Y
 
R
H
 
R
K
 
K
Q
 
L
Y
 
K
L
 
P
Y
 
T
S
 
H
S
 
V
E
 
E
T
 
R
R
 
S
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
G
P
 
E
G
 
G
T
 
N

Sites not aligning to the query:

Q44185 N-carbamoyl-D-amino acid hydrolase; D-N-alpha-carbamilase; EC 3.5.1.77 from Rhizobium radiobacter (Agrobacterium tumefaciens) (Agrobacterium radiobacter) (see paper)
24% identity, 90% coverage: 15:276/291 of query aligns to 7:297/304 of Q44185

query
sites
Q44185
I
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
Q
 
G
P
 
P
I
 
I
S
 
A
G
 
R
D
 
A
V
 
E
T
 
T
G
 
R
N
 
E
-
 
Q
-
 
V
I
 
V
A
 
G
R
 
R
T
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
M
T
 
L
A
 
T
L
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
S
A
 
R
G
 
G
A
 
V
K
 
N
L
 
F
V
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
 
L
F
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
Y
 
F
E
 
F
P
 
P
D
 
R
L
 
W
I
 
H
A
 
F
G
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
A
K
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
Y
 
Y
A
 
E
F
 
T
D
 
E
A
 
M
H
 
P
D
 
G
A
 
P
R
 
V
L
 
V
E
 
R
P
 
P
I
 
L
R
 
F
D
 
E
I
 
T
C
 
A
R
 
A
Q
 
E
R
 
L
E
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
F
I
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
T
 
E
R
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
G
 
G
E
 
V
R
 
K
G
 
R
L
 
R
H
 
F
I
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
I
V
 
L
F
 
V
S
 
D
R
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
K
Q
 
I
L
 
V
D
 
G
S
 
K
Y
 
Y
-
 
R
-
 
K
-
 
I
-
x
H
-
 
L
-
 
P
-
 
G
H
 
H
K
 
K
Q
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
L
 
F
Y
 
Q
S
x
H
S
 
L
E
 
E
T
 
K
R
 
R
I
 
Y
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
P
M
 
V
L
 
Y
E
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
A
W
 
A
R
 
K
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
F
V
 
I
C
 
C
Y
 
N
D
 
D
S
 
R
G
 
R
F
 
W
A
 
P
E
 
E
H
 
T
A
 
W
R
 
R
H
 
V
A
 
M
A
 
G
V
 
L
N
 
K
G
 
G
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
H
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
H
 
H
A
 
D
Y
 
H
L
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
F
-
x
H
-
 
H
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
M
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
Y
 
S
H
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
R
 
G
I
 
A
W
 
W
F
 
S
P
 
A
A
 
A
R
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
N
 
-
T
 
-
M
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
G
H
 
K
V
 
V
G
 
G
T
 
M
T
 
E
G
 
E
G
 
G
W
 
C
A
 
M
T
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
H
S
 
S
A
 
C
I
 
I
W
 
V
S
 
A
P
 
P
S
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
R
 
T
E
 
L
R
 
E
E
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
V
D
 
D
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
A
 
D
D
 
R
V
 
C
R
 
R
E
 
E
R
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
H
L
 
I
A
 
F
D
 
N
F
 
F
R
 
K
E
 
A
R
 
H
D
 
R
E
 
Q
A
 
P
V
 
Q
H
 
H

8hpcC Crystal structure of c171a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-hydroxyphenylglycine
24% identity, 90% coverage: 15:276/291 of query aligns to 6:296/303 of 8hpcC

query
sites
8hpcC
I
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
Q
 
G
P
 
P
I
 
I
S
 
A
G
 
R
D
 
A
V
 
E
T
 
T
G
 
R
N
 
E
-
 
Q
-
 
V
I
 
V
A
 
V
R
 
R
T
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
M
T
 
L
A
 
T
L
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
S
A
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
F
V
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
Y
 
F
E
 
F
P
 
P
D
 
R
L
 
W
I
 
H
A
 
F
G
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
A
K
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
Y
 
Y
A
 
E
F
 
T
D
 
E
A
 
M
H
 
P
D
 
G
A
 
P
R
 
V
L
 
V
E
 
R
P
 
P
I
 
L
R
 
F
D
 
E
I
 
K
C
 
A
R
 
A
Q
 
E
R
 
L
E
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
F
I
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
T
 
E
R
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
G
 
G
E
 
V
R
 
K
G
 
R
L
 
R
H
 
F
I
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
I
V
 
L
F
 
V
S
 
D
R
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
K
Q
 
I
L
 
V
D
 
G
S
 
K
Y
 
Y
-
 
R
-
x
K
-
 
I
-
 
H
-
 
L
-
x
P
-
 
G
H
 
H
K
 
K
Q
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
L
 
F
Y
 
Q
S
x
H
S
 
L
E
|
E
T
 
K
R
 
R
I
 
Y
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
P
M
 
V
L
 
Y
E
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
A
W
 
A
R
 
K
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
F
V
 
I
C
x
A
Y
x
N
D
 
D
S
 
R
G
x
R
F
 
W
A
 
P
E
 
E
H
 
A
A
 
W
R
 
R
H
 
V
A
 
M
A
 
G
V
 
L
N
 
R
G
 
G
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
x
N
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
H
-
x
N
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
H
 
H
A
 
D
Y
 
H
L
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
F
-
 
H
-
 
H
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
M
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
Y
 
S
H
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
R
 
G
I
 
A
W
 
W
F
 
S
P
 
A
A
 
A
R
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
N
 
-
T
 
-
M
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
N
 
G
H
 
K
V
 
V
G
 
G
T
 
M
T
 
E
G
 
E
G
 
N
W
 
C
A
 
M
T
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
H
S
 
S
A
 
C
I
 
I
W
 
V
S
 
A
P
 
P
S
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
R
 
T
E
 
L
R
 
E
E
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
V
D
 
D
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
A
 
D
D
 
R
V
 
C
R
 
R
E
 
E
R
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
H
L
 
I
A
 
F
D
 
N
F
 
F
R
 
K
E
 
Q
R
 
H
D
 
R
E
 
Q
A
 
P
V
 
Q
H
 
H

5khaA Structure of glutamine-dependent NAD+ synthetase from acinetobacter baumannii in complex with adenosine diphosphate (adp)
23% identity, 82% coverage: 12:251/291 of query aligns to 2:241/526 of 5khaA

query
sites
5khaA
S
 
S
L
 
F
R
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
F
Q
 
S
P
 
P
I
 
H
S
 
I
G
 
G
D
 
N
V
 
I
T
 
D
G
 
S
N
 
N
I
 
T
A
 
Q
R
 
K
T
 
M
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
T
 
A
A
 
N
L
 
Q
A
 
A
A
 
K
D
 
K
A
 
Q
G
 
D
A
 
A
K
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
I
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
 
L
F
 
S
L
 
V
T
 
I
G
 
G
Y
 
Y
E
 
P
-
 
A
P
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
L
G
 
R
D
 
P
P
 
N
A
 
L
K
 
N
Y
 
K
A
 
R
F
 
M
D
 
Q
A
 
K
H
 
A
D
 
F
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
E
 
S
P
 
E
I
 
V
R
 
K
D
 
D
I
 
I
C
 
V
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
M
I
 
V
V
 
F
G
 
G
A
 
F
A
 
V
T
 
N
R
 
Q
G
 
T
E
 
E
R
 
D
G
 
G
L
 
Q
H
 
R
I
 
Y
S
 
N
S
 
S
L
 
A
V
 
A
F
 
V
S
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
Q
Q
 
V
L
 
L
D
 
G
S
 
V
Y
 
F
H
 
N
K
 
K
Q
 
H
Y
 
N
L
 
L
Y
 
P
S
 
N
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
-
 
F
S
 
D
E
 
E
T
 
K
R
 
R
I
 
Y
Y
 
F
Q
 
Q
P
 
K
G
 
G
T
 
H
Q
 
Q
G
 
H
R
 
L
M
 
V
L
 
F
E
 
E
L
 
Y
D
 
L
G
 
G
W
 
H
R
 
K
L
 
F
A
 
G
L
 
V
G
 
L
V
 
I
C
 
C
Y
 
E
D
 
D
S
 
I
G
 
W
F
 
S
A
 
I
E
 
N
H
 
T
A
 
V
R
 
K
H
 
Q
A
 
L
A
 
S
V
 
Q
N
 
L
G
 
N
A
 
V
H
 
D
A
 
T
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
-
 
L
-
 
N
S
 
S
A
 
S
L
 
P
F
 
Y
S
 
E
V
 
V
Q
 
G
T
 
K
G
 
P
Y
 
Q
H
 
H
Q
 
R
S
 
K
R
 
Q
I
 
T
W
 
L
-
 
S
-
 
E
F
 
L
P
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
L
F
 
H
D
 
L
N
 
N
T
 
I
M
 
V
Y
 
Y
A
 
V
L
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
N
H
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
G
T
 
Q
G
 
D
G
 
D
W
 
L
A
 
I
T
 
F
C
 
D
G
 
G
A
 
T
S
 
S
A
 
F
I
 
V
W
 
S
S
 
N
P
 
Q
S
 
N
G
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
A
A
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
P
R
 
S
E
 
F
R
 
K
E
 
E
E
 
D
V
 
L
I
 
Y
T
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
F
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1uf8A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-phenylalanine
24% identity, 90% coverage: 15:276/291 of query aligns to 6:296/303 of 1uf8A

query
sites
1uf8A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
Q
 
G
P
 
P
I
 
I
S
 
A
G
 
R
D
 
A
V
 
E
T
 
T
G
 
R
N
 
E
-
 
Q
-
 
V
I
 
V
A
 
V
R
 
R
T
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
M
T
 
L
A
 
T
L
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
S
A
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
F
V
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
Y
 
F
E
 
F
P
 
P
D
 
R
L
 
W
I
 
H
A
 
F
G
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
A
K
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
Y
 
Y
A
 
E
F
 
T
D
 
E
A
 
M
H
 
P
D
 
G
A
 
P
R
 
V
L
 
V
E
 
R
P
 
P
I
 
L
R
 
F
D
 
E
I
 
K
C
 
A
R
 
A
Q
 
E
R
 
L
E
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
F
I
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
T
 
E
R
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
G
 
G
E
 
V
R
 
K
G
 
R
L
 
R
H
 
F
I
x
N
S
 
T
S
 
S
L
 
I
V
 
L
F
 
V
S
 
D
R
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
K
Q
 
I
L
 
V
D
 
G
S
 
K
Y
 
Y
-
 
R
-
x
K
-
 
I
-
 
H
-
 
L
-
 
P
-
 
G
H
 
H
K
 
K
Q
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
L
 
F
Y
 
Q
S
x
H
S
 
L
E
|
E
T
 
K
R
 
R
I
 
Y
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
P
M
 
V
L
 
Y
E
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
A
W
 
A
R
 
K
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
F
V
 
I
C
x
A
Y
x
N
D
 
D
S
x
R
G
x
R
F
 
W
A
 
P
E
 
E
H
 
A
A
 
W
R
 
R
H
 
V
A
 
M
A
 
G
V
 
L
N
 
R
G
 
G
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
x
N
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
H
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
H
 
H
A
 
D
Y
 
H
L
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
F
-
 
H
-
 
H
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
M
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
Y
 
S
H
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
R
 
G
I
 
A
W
 
W
F
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
N
 
-
T
 
-
M
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
S
N
 
A
H
 
A
V
 
A
G
 
G
T
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
M
W
 
E
A
 
E
T
 
N
C
 
C
-
 
M
-
 
L
-
 
L
G
 
G
A
 
H
S
 
S
A
 
C
I
 
I
W
 
V
S
 
A
P
 
P
S
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
R
 
T
E
 
L
R
 
E
E
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
V
D
 
D
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
A
 
D
D
 
R
V
 
C
R
 
R
E
 
E
R
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
H
L
 
I
A
 
F
D
 
N
F
 
F
R
 
K
E
 
Q
R
 
H
D
 
R
E
 
Q
A
 
P
V
 
Q
H
 
H

1uf7A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-valine
24% identity, 90% coverage: 15:276/291 of query aligns to 6:296/303 of 1uf7A

query
sites
1uf7A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
Q
 
G
P
 
P
I
 
I
S
 
A
G
 
R
D
 
A
V
 
E
T
 
T
G
 
R
N
 
E
-
 
Q
-
 
V
I
 
V
A
 
V
R
 
R
T
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
M
T
 
L
A
 
T
L
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
S
A
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
F
V
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
Y
 
F
E
 
F
P
 
P
D
 
R
L
 
W
I
 
H
A
 
F
G
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
A
K
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
Y
 
Y
A
 
E
F
 
T
D
 
E
A
 
M
H
 
P
D
 
G
A
 
P
R
 
V
L
 
V
E
 
R
P
 
P
I
 
L
R
 
F
D
 
E
I
 
K
C
 
A
R
 
A
Q
 
E
R
 
L
E
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
F
I
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
T
 
E
R
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
G
 
G
E
 
V
R
 
K
G
 
R
L
 
R
H
 
F
I
x
N
S
 
T
S
 
S
L
 
I
V
 
L
F
 
V
S
 
D
R
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
K
Q
 
I
L
 
V
D
 
G
S
 
K
Y
 
Y
-
 
R
-
x
K
-
 
I
-
 
H
-
 
L
-
x
P
-
 
G
H
 
H
K
 
K
Q
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
L
 
F
Y
 
Q
S
 
H
S
 
L
E
|
E
T
 
K
R
 
R
I
 
Y
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
P
M
 
V
L
 
Y
E
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
A
W
 
A
R
 
K
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
F
V
 
I
C
x
A
Y
x
N
D
 
D
S
 
R
G
x
R
F
 
W
A
 
P
E
 
E
H
 
A
A
 
W
R
 
R
H
 
V
A
 
M
A
 
G
V
 
L
N
 
R
G
 
G
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
x
N
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
H
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
H
 
H
A
 
D
Y
 
H
L
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
F
-
 
H
-
 
H
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
M
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
Y
 
S
H
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
R
 
G
I
 
A
W
 
W
F
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
N
 
-
T
 
-
M
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
S
N
 
A
H
 
A
V
 
A
G
 
G
T
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
M
W
 
E
A
 
E
T
 
N
C
 
C
-
 
M
-
 
L
-
 
L
G
 
G
A
 
H
S
 
S
A
 
C
I
 
I
W
 
V
S
 
A
P
 
P
S
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
R
 
T
E
 
L
R
 
E
E
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
V
D
 
D
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
A
 
D
D
 
R
V
 
C
R
 
R
E
 
E
R
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
H
L
 
I
A
 
F
D
 
N
F
 
F
R
 
K
E
 
Q
R
 
H
D
 
R
E
 
Q
A
 
P
V
 
Q
H
 
H

1uf5A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-methionine
24% identity, 90% coverage: 15:276/291 of query aligns to 6:296/303 of 1uf5A

query
sites
1uf5A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
G
Q
 
Q
A
 
Q
Q
 
G
P
 
P
I
 
I
S
 
A
G
 
R
D
 
A
V
 
E
T
 
T
G
 
R
N
 
E
-
 
Q
-
 
V
I
 
V
A
 
V
R
 
R
T
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
M
T
 
L
A
 
T
L
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
S
A
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
F
V
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
K
 
L
F
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
Y
 
F
E
 
F
P
 
P
D
 
R
L
 
W
I
 
H
A
 
F
G
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
A
K
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
Y
 
Y
A
 
E
F
 
T
D
 
E
A
 
M
H
 
P
D
 
G
A
 
P
R
 
V
L
 
V
E
 
R
P
 
P
I
 
L
R
 
F
D
 
E
I
 
K
C
 
A
R
 
A
Q
 
E
R
 
L
E
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
F
I
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
T
 
E
R
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
G
 
G
E
 
V
R
 
K
G
 
R
L
 
R
H
 
F
I
x
N
S
 
T
S
 
S
L
 
I
V
 
L
F
 
V
S
 
D
R
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
K
Q
 
I
L
 
V
D
 
G
S
 
K
Y
 
Y
-
 
R
-
x
K
-
 
I
-
 
H
-
 
L
-
x
P
-
 
G
H
 
H
K
 
K
Q
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
L
 
F
Y
 
Q
S
 
H
S
 
L
E
|
E
T
 
K
R
 
R
I
 
Y
Y
 
F
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
D
Q
 
L
G
 
G
-
 
F
R
 
P
M
 
V
L
 
Y
E
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
A
W
 
A
R
 
K
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
F
V
 
I
C
x
A
Y
x
N
D
 
D
S
 
R
G
x
R
F
 
W
A
 
P
E
 
E
H
 
A
A
 
W
R
 
R
H
 
V
A
 
M
A
 
G
V
 
L
N
 
R
G
 
G
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
x
N
-
x
T
-
 
P
-
 
T
-
 
H
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
H
 
H
A
 
D
Y
 
H
L
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
F
-
 
H
-
 
H
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
M
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
Y
 
S
H
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
R
 
G
I
 
A
W
 
W
F
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
N
 
-
T
 
-
M
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
S
N
 
A
H
 
A
V
 
A
G
 
G
T
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
M
W
 
E
A
 
E
T
 
N
C
 
C
-
 
M
-
 
L
-
 
L
G
 
G
A
 
H
S
 
S
A
 
C
I
 
I
W
 
V
S
 
A
P
 
P
S
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
R
 
T
E
 
L
R
 
E
E
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
V
D
 
D
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
A
 
D
D
 
R
V
 
C
R
 
R
E
 
E
R
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
H
L
 
I
A
 
F
D
 
N
F
 
F
R
 
K
E
 
Q
R
 
H
D
 
R
E
 
Q
A
 
P
V
 
Q
H
 
H

Query Sequence

>BPHYT_RS22155 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS22155
MNHIQALLPQTSLRIAAAQAQPISGDVTGNIARTVELTALAADAGAKLVVFPEKFLTGYE
PDLIAGDPAKYAFDAHDARLEPIRDICRQREIAVIVGAATRGERGLHISSLVFSRSGAQL
DSYHKQYLYSSETRIYQPGTQGRMLELDGWRLALGVCYDSGFAEHARHAAVNGAHAYLVS
ALFSVQTGYHQSRIWFPARAFDNTMYALLSNHVGTTGGWATCGASAIWSPSGDVIAQASR
EREEVITALLDPAVLADVRERETMLADFRERDEAVHAIRYNEAHYPSGDSL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory