SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS31690 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS31690 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6bfgA Crystal structure of monotopic membrane protein (s)-mandelate dehydrogenase (see paper)
35% identity, 97% coverage: 1:370/383 of query aligns to 6:372/373 of 6bfgA

query
sites
6bfgA
M
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
R
E
 
K
P
 
L
A
 
R
R
 
Q
K
 
K
H
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
M
A
 
V
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
E
N
 
D
D
 
E
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
K
E
 
H
N
 
N
E
 
R
A
 
D
A
 
V
F
 
F
G
 
Q
R
 
Q
R
 
W
F
 
R
F
 
F
V
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
R
F
 
L
A
 
V
P
 
D
A
 
V
S
 
S
T
 
R
D
 
R
Q
 
S
-
 
L
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
K
S
 
R
Y
 
Q
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
L
G
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
M
x
T
G
|
G
L
 
L
A
 
N
N
 
G
L
 
A
F
 
L
Y
 
W
P
 
P
G
 
K
A
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
K
G
 
A
N
 
G
F
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
S
 
S
T
 
T
A
 
A
A
 
S
S
 
N
T
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
T
 
A
K
 
R
V
 
Q
A
 
C
P
 
D
D
 
G
V
 
D
S
 
L
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
V
L
 
I
S
 
H
D
 
R
D
 
E
R
 
I
L
 
A
N
 
Q
A
 
G
E
 
M
L
 
V
L
 
L
S
 
-
R
 
K
V
 
A
A
 
L
G
 
H
C
 
T
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
|
D
V
 
V
P
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
R
 
Y
R
 
R
N
 
E
S
 
R
A
 
D
I
 
L
R
 
H
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
S
W
 
Y
T
 
S
S
 
A
A
 
K
L
 
V
L
 
V
A
 
L
D
 
D
V
 
G
M
 
C
R
 
L
R
 
H
P
 
P
Q
 
R
W
 
W
A
 
S
L
 
L
G
 
D
M
 
F
L
 
V
R
 
R
H
 
H
G
 
G
A
 
M
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
E
 
A
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
P
 
S
H
 
-
A
 
S
G
 
Q
T
 
T
A
 
S
D
 
S
V
 
L
G
 
E
A
 
M
A
 
Q
S
 
A
R
 
A
H
 
L
I
 
M
A
 
S
S
 
R
V
 
Q
M
 
M
K
 
D
M
 
A
G
 
S
L
 
F
E
 
N
W
 
W
D
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
D
M
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
H
 
S
P
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
D
R
 
R
S
 
C
V
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
W
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
C
A
 
A
I
 
I
A
 
S
S
 
P
L
 
M
D
 
E
A
 
V
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
I
 
S
R
 
V
R
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
K
D
 
-
T
 
-
A
 
P
V
 
V
F
 
L
L
 
I
D
|
D
G
x
S
G
|
G
V
 
F
R
|
R
T
 
R
G
 
G
E
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
E
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
L
G
|
G
R
|
R
S
 
A
F
 
T
A
 
L
F
 
Y
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
T
I
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
A
E
 
D
I
 
I
R
 
D
V
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
V
 
C
Q
 
P
S
 
D
L
 
I
S
 
T
A
 
S
L
 
L
T
 
S
S
 
P
D
 
D
S
 
Y
L
 
L
S
 
Q
N
 
N

P20932 (S)-mandelate dehydrogenase; MDH; L(+)-mandelate dehydrogenase; EC 1.1.99.31 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 3 papers)
35% identity, 97% coverage: 1:370/383 of query aligns to 8:374/393 of P20932

query
sites
P20932
M
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
R
E
 
K
P
 
L
A
 
R
R
 
Q
K
 
K
H
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
M
A
 
V
F
 
Y
N
 
D
T
 
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
E
N
 
D
D
 
E
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
K
E
 
H
N
 
N
E
 
R
A
 
D
A
 
V
F
 
F
G
 
Q
R
 
Q
R
 
W
F
 
R
F
 
F
V
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
R
F
 
L
A
 
V
P
 
D
A
 
V
S
 
S
T
 
R
D
 
R
Q
 
S
-
 
L
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
K
S
 
R
Y
 
Q
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
L
G
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
M
x
T
G
|
G
L
 
L
A
 
N
N
 
G
L
 
A
F
 
L
Y
 
W
P
 
P
G
 
K
A
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
K
G
 
A
N
 
G
F
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
S
|
S
T
 
T
A
 
A
A
 
S
S
 
N
T
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
T
 
A
K
 
R
V
 
Q
A
 
C
P
 
D
D
 
G
V
 
D
S
 
L
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
L
 
I
S
 
H
D
 
R
D
 
E
R
 
I
L
 
A
N
 
Q
A
 
G
E
 
M
L
 
V
L
 
L
S
 
-
R
 
K
V
 
A
A
 
L
G
 
H
C
 
T
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
 
D
V
 
V
P
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
R
 
Y
R
 
R
N
 
E
S
 
R
A
 
D
I
 
L
R
 
H
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
S
W
 
Y
T
 
S
S
 
A
A
 
K
L
 
V
L
 
V
A
 
L
D
 
D
V
 
G
M
 
C
R
 
L
R
 
H
P
 
P
Q
 
R
W
 
W
A
 
S
L
 
L
G
 
D
M
 
F
L
 
V
R
 
R
H
 
H
G
 
G
A
 
M
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
E
 
A
N
 
N
Y
 
F
A
 
V
P
 
S
H
 
-
A
 
S
G
 
Q
T
 
T
A
 
S
D
 
S
V
 
L
G
 
E
A
 
M
A
 
Q
S
 
A
R
 
A
H
 
L
I
 
M
A
 
S
S
 
R
V
 
Q
M
 
M
K
 
D
M
 
A
G
 
S
L
 
F
E
 
N
W
 
W
D
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
D
M
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
H
 
S
P
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
D
R
 
R
S
 
C
V
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
W
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
C
A
 
A
I
 
I
A
 
S
S
 
P
L
 
M
D
 
E
A
 
V
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
I
 
S
R
 
V
R
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
K
D
 
-
T
 
-
A
 
P
V
 
V
F
 
L
L
 
I
D
|
D
G
x
S
G
|
G
V
x
F
R
|
R
T
 
R
G
 
G
E
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
E
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
L
G
|
G
R
|
R
S
 
A
F
 
T
A
 
L
F
 
Y
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
T
I
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
A
E
 
D
I
 
I
R
 
D
V
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
V
 
C
Q
 
P
S
 
D
L
 
I
S
 
T
A
 
S
L
 
L
T
 
S
S
 
P
D
 
D
S
 
Y
L
 
L
S
 
Q
N
 
N

6a24A The crystal structure of mandelate oxidase with 3-fluoropyruvate (see paper)
37% identity, 94% coverage: 3:362/383 of query aligns to 6:344/354 of 6a24A

query
sites
6a24A
D
 
D
F
 
L
V
 
E
E
 
R
P
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
E
A
 
I
F
 
F
N
 
D
T
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
N
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
S
V
 
L
A
 
V
E
 
A
N
 
N
E
 
R
A
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
E
R
 
R
R
 
V
F
 
F
F
 
V
V
 
I
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
D
A
 
L
S
 
T
T
 
D
D
 
V
Q
 
T
T
 
T
A
 
E
T
 
I
-
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
R
S
 
R
Y
 
A
A
 
A
S
 
L
P
 
P
F
 
M
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
M
x
V
G
x
A
L
 
Y
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
F
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
E
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
D
G
 
A
N
 
G
F
 
V
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
S
 
C
T
 
T
A
 
L
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
G
D
 
R
V
 
-
S
 
P
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
W
L
 
L
S
 
R
D
 
D
D
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
S
A
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
E
G
 
D
C
 
A
G
 
G
V
 
C
A
 
E
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
V
P
 
P
V
 
W
A
 
M
G
 
G
R
 
R
R
|
R
N
 
L
S
 
R
A
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
F
T
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
E
W
 
W
T
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
N
A
 
F
D
 
D
V
 
A
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
G
Y
 
T
A
 
A
P
 
A
H
 
H
A
 
R
G
 
R
T
 
T
A
 
Q
D
 
G
V
 
V
G
 
S
A
 
A
A
 
V
S
 
A
R
 
D
H
 
H
I
 
T
A
 
A
S
 
R
V
 
E
M
 
F
K
 
A
M
 
P
G
 
A
L
 
-
E
 
T
W
 
W
D
 
E
D
 
S
L
 
V
K
 
E
K
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
H
W
 
T
P
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
A
P
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
R
S
 
A
V
 
V
A
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
E
A
 
M
L
 
L
S
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
C
A
 
E
V
 
V
F
 
L
L
 
V
D
|
D
G
|
G
G
|
G
V
 
I
R
|
R
T
 
S
G
 
G
E
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
V
A
 
M
F
 
W
P
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
A
L
 
M
A
 
G
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
C
Q
 
E
S
 
S
L
 
V
S
 
G
A
 
A

5zzqA The crystal structure of mandelate oxidase with (s)-4-hydroxymandelic acid (see paper)
37% identity, 94% coverage: 3:362/383 of query aligns to 6:344/355 of 5zzqA

query
sites
5zzqA
D
 
D
F
 
L
V
 
E
E
 
R
P
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
E
A
 
I
F
 
F
N
 
D
T
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
N
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
S
V
 
L
A
 
V
E
 
A
N
 
N
E
 
R
A
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
E
R
 
R
R
 
V
F
 
F
F
 
V
V
 
I
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
D
A
 
L
S
 
T
T
 
D
D
 
V
Q
 
T
T
 
T
A
 
E
T
 
I
-
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
R
S
 
R
Y
 
A
A
 
A
S
 
L
P
 
P
F
 
M
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
M
x
V
G
x
A
L
 
Y
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
F
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
E
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
D
G
 
A
N
 
G
F
 
V
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
S
 
C
T
 
T
A
x
L
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
G
D
 
R
V
 
-
S
 
P
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
W
L
 
L
S
 
R
D
 
D
D
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
S
A
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
E
G
 
D
C
 
A
G
 
G
V
 
C
A
 
E
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
V
P
 
P
V
 
W
A
x
M
G
 
G
R
 
R
R
|
R
N
 
L
S
 
R
A
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
F
T
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
E
W
 
W
T
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
N
A
 
F
D
 
D
V
 
A
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
G
Y
 
T
A
 
A
P
 
A
H
 
H
A
 
R
G
 
R
T
 
T
A
 
Q
D
 
G
V
 
V
G
 
S
A
 
A
A
 
V
S
 
A
R
 
D
H
 
H
I
x
T
A
 
A
S
 
R
V
 
E
M
x
F
K
 
A
M
 
P
G
 
A
L
 
-
E
 
T
W
 
W
D
 
E
D
 
S
L
 
V
K
 
E
K
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
H
W
 
T
P
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
A
P
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
R
S
 
A
V
 
V
A
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
E
A
 
M
L
 
L
S
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
C
A
 
E
V
 
V
F
 
L
L
 
V
D
|
D
G
 
G
G
|
G
V
 
I
R
|
R
T
 
S
G
 
G
E
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
V
A
 
M
F
 
W
P
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
A
L
 
M
A
 
G
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
C
Q
 
E
S
 
S
L
 
V
S
 
G
A
 
A

6a08A The crystal structure of mandelate oxidase with benzoyl-formic acid (see paper)
35% identity, 94% coverage: 3:362/383 of query aligns to 7:324/335 of 6a08A

query
sites
6a08A
D
 
D
F
 
L
V
 
E
E
 
R
P
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
E
A
 
I
F
 
F
N
 
D
T
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
N
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
S
V
 
L
A
 
V
E
 
A
N
 
N
E
 
R
A
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
E
R
 
R
R
 
V
F
 
F
F
 
V
V
 
I
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
D
A
 
L
S
 
T
T
 
D
D
 
V
Q
 
T
T
 
T
A
 
E
T
 
I
-
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
R
S
 
R
Y
 
A
A
 
A
S
 
L
P
 
P
F
 
M
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
M
x
V
G
x
A
L
 
Y
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
F
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
E
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
D
G
 
A
N
 
G
F
 
V
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
S
 
C
T
 
T
A
 
L
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
G
D
 
R
V
 
-
S
 
P
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
W
L
 
L
S
 
R
D
 
D
D
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
S
A
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
E
G
 
D
C
 
A
G
 
G
V
 
C
A
 
E
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
|
V
P
 
P
V
x
W
A
x
M
G
 
G
R
 
R
R
 
R
N
 
L
S
 
R
A
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
F
T
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
E
W
 
W
T
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
A
K
 
N
L
 
F
E
 
D
N
 
E
Y
x
F
A
 
A
P
 
P
H
 
A
A
 
T
G
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
D
 
E
D
 
S
L
 
V
K
 
E
K
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
H
W
 
T
P
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
A
P
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
R
S
 
A
V
 
V
A
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
E
A
 
M
L
 
L
S
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
C
A
 
E
V
 
V
F
 
L
L
 
V
D
|
D
G
|
G
G
|
G
V
x
I
R
|
R
T
 
S
G
 
G
E
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
A
C
 
V
F
x
L
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
V
A
 
M
F
 
W
P
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
A
L
 
M
A
 
G
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
C
Q
 
E
S
 
S
L
 
V
S
 
G
A
 
A

6a1aA Mandelate oxidase mutant-y128f with 4-hydroxymandelic acid (see paper)
35% identity, 94% coverage: 3:362/383 of query aligns to 7:324/335 of 6a1aA

query
sites
6a1aA
D
 
D
F
 
L
V
 
E
E
 
R
P
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
E
A
 
I
F
 
F
N
 
D
T
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
N
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
S
V
 
L
A
 
V
E
 
A
N
 
N
E
 
R
A
 
T
A
|
A
F
 
L
G
 
E
R
|
R
R
 
V
F
 
F
F
 
V
V
 
I
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
D
A
 
L
S
 
T
T
 
D
D
 
V
Q
 
T
T
 
T
A
 
E
T
 
I
-
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
R
S
 
R
Y
 
A
A
 
A
S
 
L
P
 
P
F
 
M
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
M
x
V
G
x
A
L
 
Y
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
F
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
E
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
D
G
 
A
N
 
G
F
 
V
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
S
 
C
T
 
T
A
x
L
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
G
D
 
R
V
 
-
S
 
P
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
x
F
L
 
W
L
 
L
S
 
R
D
 
D
D
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
S
A
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
E
G
 
D
C
 
A
G
 
G
V
 
C
A
 
E
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
|
V
P
 
P
V
 
W
A
x
M
G
 
G
R
 
R
R
|
R
N
 
L
S
 
R
A
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
F
T
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
E
W
 
W
T
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
A
K
 
N
L
 
F
E
 
D
N
 
E
Y
x
F
A
 
A
P
 
P
H
 
A
A
 
T
G
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
D
 
E
D
 
S
L
 
V
K
 
E
K
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
H
W
 
T
P
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
A
P
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
R
S
 
A
V
 
V
A
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
P
S
 
G
L
 
I
D
x
E
A
 
M
L
 
L
S
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
C
A
 
E
V
 
V
F
 
L
L
 
V
D
|
D
G
 
G
G
|
G
V
 
I
R
|
R
T
 
S
G
 
G
E
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
V
A
 
M
F
 
W
P
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
A
L
 
M
A
 
G
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
C
Q
 
E
S
 
S
L
 
V
S
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6a01A The crystal structure of mandelate oxidase y128f with 3,3-difluoro-2, 2-dihydroxy-3-phenylpropionic acid (see paper)
35% identity, 94% coverage: 3:362/383 of query aligns to 6:323/333 of 6a01A

query
sites
6a01A
D
 
D
F
 
L
V
 
E
E
 
R
P
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
E
A
 
I
F
 
F
N
 
D
T
x
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
N
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
S
V
 
L
A
 
V
E
 
A
N
 
N
E
 
R
A
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
E
R
 
R
R
 
V
F
 
F
F
 
V
V
 
I
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
D
A
 
L
S
 
T
T
 
D
D
 
V
Q
 
T
T
 
T
A
 
E
T
 
I
-
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
R
S
 
R
Y
 
A
A
 
A
S
 
L
P
 
P
F
 
M
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
M
x
V
G
x
A
L
 
Y
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
F
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
E
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
D
G
 
A
N
 
G
F
 
V
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
S
 
C
T
 
T
A
 
L
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
G
D
 
R
V
 
-
S
 
P
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
x
F
L
 
W
L
 
L
S
 
R
D
 
D
D
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
S
A
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
E
G
 
D
C
 
A
G
 
G
V
 
C
A
 
E
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
V
P
 
P
V
 
W
A
x
M
G
 
G
R
 
R
R
|
R
N
 
L
S
 
R
A
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
F
T
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
E
W
 
W
T
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
A
K
 
N
L
 
F
E
 
D
N
 
E
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
H
 
A
A
 
T
G
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
D
 
E
D
 
S
L
 
V
K
 
E
K
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
H
W
 
T
P
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
A
P
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
R
S
 
A
V
 
V
A
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
E
A
 
M
L
 
L
S
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
C
A
 
E
V
 
V
F
 
L
L
 
V
D
|
D
G
 
G
G
|
G
V
 
I
R
|
R
T
 
S
G
 
G
E
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
V
A
 
M
F
 
W
P
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
A
L
 
M
A
 
G
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
C
Q
 
E
S
 
S
L
 
V
S
 
G
A
 
A

6gmcA 1.2 a resolution structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with fmn and 4-carboxy-5-[(4-chlorophenyl)sulfanyl]-1,2,3-thiadiazole
33% identity, 95% coverage: 1:363/383 of query aligns to 8:353/360 of 6gmcA

query
sites
6gmcA
M
 
I
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
E
E
 
Q
P
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
S
A
 
I
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
x
Y
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
N
N
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
N
 
N
E
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
R
 
R
R
 
W
F
 
K
F
 
L
V
 
Y
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
N
-
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
T
 
S
A
 
T
T
 
S
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
S
 
R
Y
 
V
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
I
G
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
M
x
T
G
x
A
L
x
M
A
 
Q
N
 
R
L
 
M
F
 
A
Y
 
H
P
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
C
Q
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
F
 
T
P
 
G
F
 
M
V
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
A
x
W
A
 
A
S
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
E
-
 
A
V
 
L
S
 
R
W
 
W
Y
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
I
L
 
Y
S
 
K
D
 
D
D
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
T
A
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
G
 
K
C
 
M
G
 
G
V
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
T
P
 
P
V
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
N
R
|
R
N
 
L
S
 
D
A
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
Q
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
R
H
 
M
G
 
K
A
 
N
P
 
F
K
 
S
L
 
T
E
 
L
N
 
S
Y
x
F
A
 
S
P
 
P
H
 
E
A
 
E
G
 
N
T
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
D
G
 
S
A
 
G
A
x
L
S
 
A
R
 
A
H
x
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
K
V
 
A
M
 
I
K
 
D
M
 
P
G
 
S
L
 
I
E
 
S
W
 
W
D
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
R
M
 
L
W
 
T
P
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
R
P
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
K
L
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
W
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
K
T
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
D
|
D
G
|
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
T
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
I
A
 
V
F
 
W
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
F
Y
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
S
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
V
L
 
I

5qigA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z1407672867
33% identity, 95% coverage: 1:363/383 of query aligns to 5:352/359 of 5qigA

query
sites
5qigA
M
 
I
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
E
E
 
Q
P
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
S
A
 
I
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
x
Y
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
N
N
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
N
 
N
E
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
R
 
R
R
 
W
F
 
K
F
 
L
V
 
Y
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
N
-
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
T
 
S
A
 
T
T
 
S
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
S
 
R
Y
 
V
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
I
G
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
M
x
T
G
x
A
L
 
M
A
 
Q
N
 
R
L
 
M
F
 
A
Y
 
H
P
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
C
Q
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
F
 
T
P
 
G
F
 
M
V
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
A
 
W
A
 
A
S
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
E
-
 
A
V
 
L
S
 
R
W
 
W
Y
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
I
L
 
Y
S
 
K
D
 
D
D
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
T
A
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
G
 
K
C
 
M
G
 
G
V
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
T
P
 
P
V
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
N
R
 
R
N
 
L
S
 
D
A
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
Q
W
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
R
M
 
M
L
 
K
R
 
N
H
 
F
G
 
E
A
 
T
P
 
S
K
 
T
L
 
L
E
 
-
N
 
S
Y
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
E
A
 
E
G
 
N
T
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
D
G
 
S
A
 
G
A
 
L
S
 
A
R
 
A
H
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
K
V
 
A
M
 
I
K
 
D
M
 
P
G
 
S
L
 
I
E
 
S
W
 
W
D
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
W
V
 
L
R
|
R
A
 
R
M
 
L
W
 
T
P
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
R
P
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
K
L
 
H
G
|
G
A
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
W
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
K
T
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
D
|
D
G
|
G
G
|
G
V
 
V
R
|
R
T
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
I
A
 
V
F
 
W
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
x
F
Y
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
x
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
x
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
S
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5qifA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z31792168
33% identity, 95% coverage: 1:363/383 of query aligns to 5:352/359 of 5qifA

query
sites
5qifA
M
 
I
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
E
E
 
Q
P
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
S
A
 
I
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
x
Y
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
N
N
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
N
 
N
E
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
R
 
R
R
 
W
F
 
K
F
 
L
V
 
Y
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
N
-
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
T
 
S
A
 
T
T
 
S
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
S
 
R
Y
 
V
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
I
G
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
M
x
T
G
x
A
L
 
M
A
 
Q
N
 
R
L
 
M
F
 
A
Y
 
H
P
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
C
Q
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
F
 
T
P
 
G
F
 
M
V
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
A
 
W
A
 
A
S
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
E
-
 
A
V
 
L
S
 
R
W
 
W
Y
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
I
L
 
Y
S
 
K
D
 
D
D
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
T
A
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
G
 
K
C
 
M
G
 
G
V
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
V
 
V
D
|
D
V
 
T
P
 
P
V
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
N
R
 
R
N
 
L
S
 
D
A
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
Q
W
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
R
M
 
M
L
 
K
R
 
N
H
 
F
G
 
E
A
 
T
P
 
S
K
 
T
L
 
L
E
 
-
N
 
S
Y
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
E
A
 
E
G
 
N
T
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
D
G
 
S
A
 
G
A
 
L
S
 
A
R
 
A
H
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
K
V
 
A
M
 
I
K
 
D
M
 
P
G
 
S
L
 
I
E
 
S
W
 
W
D
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
W
V
 
L
R
|
R
A
x
R
M
 
L
W
 
T
P
x
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
R
P
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
K
L
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
W
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
K
T
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
D
|
D
G
|
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
T
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
I
A
 
V
F
 
W
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
F
Y
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
S
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
V
L
 
I

2rdwA Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with sulfate (see paper)
33% identity, 95% coverage: 1:363/383 of query aligns to 5:352/359 of 2rdwA

query
sites
2rdwA
M
 
I
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
E
E
 
Q
P
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
S
A
 
I
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
x
Y
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
N
N
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
N
 
N
E
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
R
 
R
R
 
W
F
 
K
F
 
L
V
 
Y
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
N
-
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
T
 
S
A
 
T
T
 
S
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
S
 
R
Y
 
V
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
I
G
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
M
x
T
G
x
A
L
 
M
A
 
Q
N
 
R
L
 
M
F
 
A
Y
 
H
P
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
C
Q
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
F
 
T
P
 
G
F
 
M
V
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
A
x
W
A
 
A
S
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
E
-
 
A
V
 
L
S
 
R
W
 
W
Y
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
I
L
 
Y
S
 
K
D
 
D
D
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
T
A
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
G
 
K
C
 
M
G
 
G
V
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
T
P
 
P
V
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
N
R
|
R
N
 
L
S
 
D
A
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
Q
W
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
R
M
 
M
L
 
K
R
 
N
H
 
F
G
 
E
A
 
T
P
 
S
K
 
T
L
 
L
E
 
-
N
 
S
Y
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
E
A
 
E
G
 
N
T
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
D
G
 
S
A
 
G
A
 
L
S
 
A
R
 
A
H
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
K
V
 
A
M
 
I
K
 
D
M
 
P
G
 
S
L
 
I
E
 
S
W
 
W
D
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
R
M
 
L
W
 
T
P
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
R
P
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
K
L
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
W
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
K
T
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
D
|
D
G
|
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
T
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
I
A
 
V
F
 
W
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
F
Y
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
S
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
V
L
 
I

2rduA Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with glyoxylate (see paper)
33% identity, 95% coverage: 1:363/383 of query aligns to 6:353/360 of 2rduA

query
sites
2rduA
M
 
I
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
E
E
 
Q
P
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
S
A
 
I
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
x
Y
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
N
N
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
N
 
N
E
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
R
 
R
R
 
W
F
 
K
F
 
L
V
 
Y
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
N
-
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
T
 
S
A
 
T
T
 
S
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
S
 
R
Y
 
V
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
I
G
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
M
x
T
G
x
A
L
 
M
A
 
Q
N
 
R
L
 
M
F
 
A
Y
 
H
P
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
C
Q
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
F
 
T
P
 
G
F
 
M
V
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
A
x
W
A
 
A
S
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
E
-
 
A
V
 
L
S
 
R
W
 
W
Y
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
I
L
 
Y
S
 
K
D
 
D
D
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
T
A
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
G
 
K
C
 
M
G
 
G
V
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
T
P
 
P
V
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
N
R
|
R
N
 
L
S
 
D
A
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
Q
W
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
R
M
 
M
L
 
K
R
 
N
H
 
F
G
 
E
A
 
T
P
 
S
K
 
T
L
 
L
E
 
-
N
 
S
Y
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
E
A
 
E
G
 
N
T
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
D
G
 
S
A
 
G
A
 
L
S
 
A
R
 
A
H
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
K
V
 
A
M
 
I
K
 
D
M
 
P
G
 
S
L
 
I
E
 
S
W
 
W
D
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
R
M
 
L
W
 
T
P
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
R
P
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
K
L
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
W
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
K
T
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
D
|
D
G
|
G
G
|
G
V
 
V
R
|
R
T
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
I
A
 
V
F
 
W
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
F
Y
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
S
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
V
L
 
I

Q9UJM8 2-Hydroxyacid oxidase 1; HAOX1; Glycolate oxidase; GO; GOX; Glyoxylate oxidase; EC 1.1.3.15; EC 1.2.3.5 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
33% identity, 95% coverage: 1:363/383 of query aligns to 8:355/370 of Q9UJM8

query
sites
Q9UJM8
M
 
I
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
E
E
 
Q
P
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
S
A
 
I
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
 
Y
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
N
N
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
N
 
N
E
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
R
 
R
R
 
W
F
 
K
F
 
L
V
 
Y
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
N
-
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
T
 
S
A
 
T
T
 
S
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
S
 
R
Y
 
V
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
I
G
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
M
x
T
G
x
A
L
 
M
A
 
Q
N
 
R
L
 
M
F
 
A
Y
 
H
P
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
C
Q
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
F
 
T
P
 
G
F
 
M
V
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
A
 
W
A
 
A
S
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
E
-
 
A
V
 
L
S
 
R
W
 
W
Y
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
I
L
 
Y
S
 
K
D
 
D
D
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
T
A
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
G
 
K
C
 
M
G
 
G
V
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
 
D
V
 
T
P
 
P
V
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
N
R
|
R
N
 
L
S
 
D
A
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
Q
W
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
R
M
 
M
L
 
K
R
 
N
H
 
F
G
 
E
A
 
T
P
 
S
K
 
T
L
 
L
E
 
-
N
 
S
Y
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
E
A
 
E
G
 
N
T
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
D
G
 
S
A
 
G
A
 
L
S
 
A
R
 
A
H
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
K
V
 
A
M
 
I
K
 
D
M
 
P
G
 
S
L
 
I
E
 
S
W
 
W
D
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
R
M
 
L
W
 
T
P
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
R
P
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
K
L
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
W
 
L
V
 
V
S
|
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
K
T
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
D
|
D
G
|
G
G
|
G
V
|
V
R
|
R
T
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
I
A
 
V
F
 
W
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
F
Y
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
S
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
V
L
 
I

1huvA Crystal structure of a soluble mutant of the membrane-associated (s)- mandelate dehydrogenase from pseudomonas putida at 2.15a resolution (see paper)
33% identity, 97% coverage: 1:370/383 of query aligns to 5:348/349 of 1huvA

query
sites
1huvA
M
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
R
E
 
K
P
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
H
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
M
A
 
V
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
E
N
 
D
D
 
E
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
K
E
 
H
N
 
N
E
 
R
A
 
D
A
 
V
F
 
F
G
 
Q
R
 
Q
R
 
W
F
 
R
F
 
F
V
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
R
F
 
L
A
 
V
P
 
D
A
 
V
S
 
S
T
 
R
D
 
R
Q
 
S
-
 
L
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
K
S
 
R
Y
 
Q
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
L
G
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
M
x
T
G
|
G
L
 
L
A
 
N
N
 
G
L
 
A
F
 
L
Y
 
W
P
 
P
G
 
K
A
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
K
G
 
A
N
 
G
F
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
S
|
S
T
 
T
A
 
A
A
 
S
S
 
N
T
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
T
 
A
K
 
R
V
 
Q
A
 
C
P
 
D
D
 
G
V
 
D
S
 
L
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
V
L
 
I
S
 
H
D
 
R
D
 
E
R
 
I
L
 
A
N
 
Q
A
 
G
E
 
M
L
 
V
L
 
L
S
 
-
R
 
K
V
 
A
A
 
L
G
 
H
C
 
T
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
|
D
V
 
V
P
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
R
 
Y
R
 
R
N
 
E
S
 
R
A
 
D
I
 
L
R
 
H
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
P
R
 
F
W
 
L
T
 
T
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
L
E
 
K
N
 
N
Y
 
F
A
 
E
P
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
G
A
 
I
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
K
A
 
M
S
 
D
R
 
E
H
 
M
I
 
Q
A
 
A
S
 
A
V
 
L
M
 
M
K
 
S
M
 
R
G
 
Q
L
 
M
E
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
N
W
 
W
D
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
D
M
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
H
 
S
P
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
D
R
 
R
S
 
C
V
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
W
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
C
A
 
A
I
 
I
A
 
S
S
 
P
L
 
M
D
 
E
A
 
V
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
I
 
S
R
 
V
R
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
K
D
 
-
T
 
-
A
 
P
V
 
V
F
 
L
L
 
I
D
|
D
G
x
S
G
|
G
V
 
F
R
|
R
T
 
R
G
 
G
E
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
E
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
L
G
|
G
R
|
R
S
 
A
F
 
T
A
 
L
F
 
Y
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
T
I
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
A
E
 
D
I
 
I
R
 
D
V
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
V
 
C
Q
 
P
S
 
D
L
 
I
S
 
T
A
 
S
L
 
L
T
 
S
S
 
P
D
 
D
S
 
Y
L
 
L
S
 
Q
N
 
N

6gmbA Structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with fmn and glycolate
33% identity, 95% coverage: 1:363/383 of query aligns to 8:355/362 of 6gmbA

query
sites
6gmbA
M
 
I
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
E
E
 
Q
P
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
S
A
 
I
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
x
Y
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
N
N
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
N
 
N
E
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
R
 
R
R
 
W
F
 
K
F
 
L
V
 
Y
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
N
-
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
T
 
S
A
 
T
T
 
S
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
S
 
R
Y
 
V
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
I
G
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
M
x
T
G
x
A
L
 
M
A
 
Q
N
 
R
L
 
M
F
 
A
Y
 
H
P
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
C
Q
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
F
 
T
P
 
G
F
 
M
V
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
A
x
W
A
 
A
S
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
E
-
 
A
V
 
L
S
 
R
W
 
W
Y
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
I
L
 
Y
S
 
K
D
 
D
D
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
T
A
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
G
 
K
C
 
M
G
 
G
V
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
V
 
V
D
|
D
V
 
T
P
 
P
V
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
N
R
|
R
N
 
L
S
 
D
A
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
Q
W
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
R
M
 
M
L
 
K
R
 
N
H
 
F
G
 
E
A
 
T
P
 
S
K
 
T
L
 
L
E
 
-
N
 
S
Y
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
E
A
 
E
G
 
N
T
 
F
A
 
G
D
 
D
V
 
D
G
 
S
A
 
G
A
 
L
S
 
A
R
 
A
H
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
K
V
 
A
M
 
I
K
 
D
M
 
P
G
 
S
L
 
I
E
 
S
W
 
W
D
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
R
M
 
L
W
 
T
P
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
R
P
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
K
L
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
W
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
K
T
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
D
|
D
G
|
G
G
|
G
V
 
V
R
|
R
T
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
I
A
 
V
F
 
W
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
F
Y
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
S
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
V
L
 
I

7bsrA Mandelate oxidase with the 2-hydroxy-3-oxosuccinic acid (see paper)
35% identity, 94% coverage: 3:362/383 of query aligns to 4:320/330 of 7bsrA

query
sites
7bsrA
D
 
D
F
 
L
V
 
E
E
 
R
P
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
E
A
 
I
F
 
F
N
 
D
T
 
F
L
|
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
N
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
S
V
 
L
A
 
V
E
 
A
N
 
N
E
 
R
A
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
E
R
 
R
R
 
V
F
 
F
F
 
V
V
 
I
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
D
A
 
L
S
 
T
T
 
D
D
 
V
Q
 
T
T
 
T
A
 
E
T
 
I
-
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
R
S
 
R
Y
 
A
A
 
A
S
 
L
P
 
P
F
 
M
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
M
x
V
G
 
A
L
 
Y
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
F
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
E
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
D
G
 
A
N
 
G
F
 
V
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
S
 
C
T
 
T
A
 
L
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
G
D
 
R
V
 
-
S
 
P
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
x
F
L
 
W
L
 
L
S
 
R
D
 
D
D
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
S
A
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
E
G
 
D
C
 
A
G
 
G
V
 
C
A
 
E
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
V
P
 
P
V
 
W
A
 
M
G
 
G
R
 
R
R
|
R
N
 
L
S
 
R
A
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
F
T
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
E
W
 
W
T
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
N
A
 
F
D
 
D
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
H
 
A
A
 
T
G
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
D
 
E
D
 
S
L
 
V
K
 
E
K
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
H
W
 
T
P
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
A
P
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
R
S
 
A
V
 
V
A
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
E
A
 
M
L
 
L
S
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
C
A
 
E
V
 
V
F
 
L
L
 
V
D
|
D
G
 
G
G
 
G
V
 
I
R
|
R
T
 
S
G
 
G
E
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
V
A
 
M
F
 
W
P
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
A
L
 
M
A
 
G
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
C
Q
 
E
S
 
S
L
 
V
S
 
G
A
 
A

6a4hA Mandelate oxidase mutant-y128f with the peroxide fmn adduct (see paper)
35% identity, 94% coverage: 3:362/383 of query aligns to 3:319/329 of 6a4hA

query
sites
6a4hA
D
 
D
F
 
L
V
 
E
E
 
R
P
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
E
A
 
I
F
 
F
N
 
D
T
 
F
L
|
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
N
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
S
V
 
L
A
 
V
E
 
A
N
 
N
E
 
R
A
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
E
R
 
R
R
 
V
F
 
F
F
 
V
V
 
I
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
D
A
 
L
S
 
T
T
 
D
D
 
V
Q
 
T
T
 
T
A
 
E
T
 
I
-
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
R
S
 
R
Y
 
A
A
 
A
S
 
L
P
 
P
F
 
M
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
M
 
V
G
 
A
L
 
Y
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
F
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
E
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
D
G
 
A
N
 
G
F
 
V
P
 
P
F
 
Y
V
 
T
L
 
I
S
x
C
T
 
T
A
 
L
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
T
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
G
D
 
R
V
 
-
S
 
P
W
 
W
Y
 
F
Q
 
Q
L
 
L
Y
x
F
L
 
W
L
 
L
S
 
R
D
 
D
D
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
S
A
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
E
G
 
D
C
 
A
G
 
G
V
 
C
A
 
E
V
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
V
 
V
P
 
P
V
 
W
A
 
M
G
 
G
R
 
R
R
 
R
N
 
L
S
 
R
A
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
F
T
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
E
W
 
W
T
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
A
L
 
N
A
 
F
D
 
D
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
H
 
A
A
 
T
G
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
W
 
W
D
 
E
D
 
S
L
 
V
K
 
E
K
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
 
H
W
 
T
P
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
A
P
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
R
S
 
A
V
 
V
A
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
W
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
V
A
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
E
A
 
M
L
 
L
S
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
D
 
G
T
 
C
A
 
E
V
 
V
F
 
L
L
 
V
D
|
D
G
|
G
G
|
G
V
 
I
R
|
R
T
 
S
G
 
G
E
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
S
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
V
G
 
G
R
|
R
S
 
P
F
 
V
A
 
M
F
 
W
P
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
V
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
A
L
 
M
A
 
G
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
C
Q
 
E
S
 
S
L
 
V
S
 
G
A
 
A

5qieA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z2856434894
33% identity, 95% coverage: 1:363/383 of query aligns to 5:346/353 of 5qieA

query
sites
5qieA
M
 
I
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
E
E
 
Q
P
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
S
H
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
S
A
 
I
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
x
Y
A
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
N
N
 
D
D
 
E
A
 
E
G
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
N
 
N
E
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
R
 
R
R
 
W
F
 
K
F
 
L
V
 
Y
S
 
P
R
 
R
R
 
M
F
 
L
A
 
R
P
 
N
-
 
V
A
 
A
S
 
E
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
T
 
S
A
 
T
T
 
S
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
S
 
R
Y
 
V
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
I
G
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
M
x
T
G
x
A
L
 
M
A
 
Q
N
 
R
L
 
M
F
 
A
Y
 
H
P
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
C
Q
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
F
 
T
P
 
G
F
 
M
V
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
A
 
W
A
 
A
S
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
E
-
 
A
V
 
L
S
 
R
W
 
W
Y
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
I
L
 
Y
S
 
K
D
 
D
D
 
R
R
 
E
L
 
V
N
 
T
A
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
V
S
 
R
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
G
 
K
C
 
M
G
 
G
V
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
V
 
V
D
|
D
V
 
T
P
 
P
V
 
Y
A
 
L
G
 
G
R
 
N
R
 
R
N
 
L
S
 
D
A
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
Q
W
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
R
M
 
M
L
 
K
R
 
N
H
 
F
G
 
E
A
 
T
P
 
S
K
 
T
L
 
L
E
 
-
N
 
S
Y
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
D
A
 
S
G
 
G
T
 
L
A
 
A
D
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
A
H
 
Y
I
 
V
A
 
A
S
 
K
V
 
A
M
 
I
K
 
D
M
 
P
G
 
S
L
 
I
E
 
S
W
 
W
D
 
E
D
 
D
L
 
I
K
 
K
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
R
M
 
L
W
 
T
P
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
R
P
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
K
L
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
W
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
S
 
P
E
 
E
I
 
I
R
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
K
T
 
V
A
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
D
|
D
G
|
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
T
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
V
G
|
G
R
|
R
S
 
P
F
 
I
A
 
V
F
 
W
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
F
Y
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
x
D
A
 
V
V
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
L
L
 
S
G
 
G
V
 
C
Q
 
Q
S
 
N
L
 
V
S
 
K
A
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2a85A Crystal structure of the g81a mutant of the active chimera of (s)- mandelate dehydrogenase in complex with its substrate 2- hydroxyoctanoate (see paper)
33% identity, 97% coverage: 1:370/383 of query aligns to 5:352/353 of 2a85A

query
sites
2a85A
M
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
R
E
 
K
P
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
H
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
M
A
 
V
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
E
N
 
D
D
 
E
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
K
E
 
H
N
 
N
E
 
R
A
 
D
A
 
V
F
 
F
G
 
Q
R
 
Q
R
 
W
F
 
R
F
 
F
V
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
R
F
 
L
A
 
V
P
 
D
A
 
V
S
 
S
T
 
R
D
 
R
Q
 
S
-
 
L
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
K
S
 
R
Y
 
Q
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
L
G
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
M
x
T
G
x
A
L
 
L
A
 
N
N
 
G
L
 
A
F
 
L
Y
 
W
P
 
P
G
 
K
A
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
K
G
 
A
N
 
G
F
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
S
|
S
T
 
T
A
 
A
A
 
S
S
 
N
T
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
T
 
A
K
 
R
V
 
Q
A
 
C
P
 
D
D
 
G
V
 
D
S
 
L
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
V
L
 
I
S
 
H
D
 
R
D
 
E
R
 
I
L
 
A
N
 
Q
A
 
G
E
 
M
L
 
V
L
 
L
S
 
-
R
 
K
V
 
A
A
 
L
G
 
H
C
 
T
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
|
D
V
 
V
P
 
A
V
 
V
A
x
N
G
|
G
R
 
Y
R
|
R
N
 
E
S
 
R
A
 
D
I
 
L
R
 
H
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
P
R
 
F
W
 
L
T
 
T
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
L
E
 
K
N
 
N
Y
 
F
A
 
E
P
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
G
H
 
K
A
 
M
G
 
D
T
 
K
A
 
A
D
 
N
V
 
L
G
 
E
A
 
M
A
 
Q
S
 
A
R
 
A
H
 
L
I
 
M
A
 
S
S
 
R
V
 
Q
M
 
M
K
 
D
M
 
A
G
 
S
L
 
F
E
 
N
W
 
W
D
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
D
M
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
H
 
S
P
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
D
R
 
R
S
 
C
V
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
W
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
C
A
 
A
I
 
I
A
 
S
S
 
P
L
 
M
D
 
E
A
 
V
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
I
 
S
R
 
V
R
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
K
D
 
-
T
 
-
A
 
P
V
 
V
F
 
L
L
 
I
D
|
D
G
x
S
G
|
G
V
 
F
R
|
R
T
 
R
G
 
G
E
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
E
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
L
G
|
G
R
|
R
S
 
A
F
 
T
A
 
L
F
 
Y
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
T
I
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
A
E
 
D
I
 
I
R
 
D
V
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
V
 
C
Q
 
P
S
 
D
L
 
I
S
 
T
A
 
S
L
 
L
T
 
S
S
 
P
D
 
D
S
 
Y
L
 
L
S
 
Q
N
 
N

2a7pA Crystal structure of the g81a mutant of the active chimera of (s)- mandelate dehydrogenase in complex with its substrate 3-indolelactate (see paper)
33% identity, 97% coverage: 1:370/383 of query aligns to 5:352/353 of 2a7pA

query
sites
2a7pA
M
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
Y
V
 
R
E
 
K
P
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
H
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
K
F
 
M
A
 
V
F
 
Y
N
 
D
T
x
Y
L
 
L
A
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
E
N
 
D
D
 
E
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
K
E
 
H
N
 
N
E
 
R
A
 
D
A
 
V
F
 
F
G
 
Q
R
 
Q
R
 
W
F
 
R
F
 
F
V
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
R
F
 
L
A
 
V
P
 
D
A
 
V
S
 
S
T
 
R
D
 
R
Q
 
S
-
 
L
T
 
Q
A
 
A
T
 
E
V
 
V
F
 
L
G
 
G
H
 
K
S
 
R
Y
 
Q
A
 
S
S
 
M
P
 
P
F
 
L
G
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
M
x
T
G
x
A
L
 
L
A
 
N
N
 
G
L
 
A
F
 
L
Y
 
W
P
 
P
G
 
K
A
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
K
G
 
A
N
 
G
F
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
S
|
S
T
 
T
A
 
A
A
 
S
S
 
N
T
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
T
 
A
K
 
R
V
 
Q
A
 
C
P
 
D
D
 
G
V
 
D
S
 
L
W
 
W
Y
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
L
 
V
L
 
I
S
 
H
D
 
R
D
 
E
R
 
I
L
 
A
N
 
Q
A
 
G
E
 
M
L
 
V
L
 
L
S
 
-
R
 
K
V
 
A
A
 
L
G
 
H
C
 
T
G
 
G
V
 
Y
A
 
T
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
|
D
V
 
V
P
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
R
 
Y
R
|
R
N
 
E
S
 
R
A
 
D
I
 
L
R
 
H
D
 
N
G
 
R
V
 
F
T
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
P
R
 
F
W
 
L
T
 
T
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
K
 
-
L
 
L
E
 
K
N
 
N
Y
 
F
A
 
E
P
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
G
H
 
K
A
 
M
G
 
D
T
 
K
A
 
A
D
 
N
V
 
L
G
 
E
A
 
M
A
 
Q
S
 
A
R
 
A
H
 
L
I
 
M
A
 
S
S
 
R
V
 
Q
M
 
M
K
 
D
M
 
A
G
 
S
L
 
F
E
 
N
W
 
W
D
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
D
M
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
H
 
S
P
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
D
R
 
R
S
 
C
V
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
W
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
G
 
C
A
 
A
I
 
I
A
 
S
S
 
P
L
 
M
D
 
E
A
 
V
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
I
 
S
R
 
V
R
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
R
 
K
D
 
-
T
 
-
A
 
P
V
 
V
F
 
L
L
 
I
D
|
D
G
x
S
G
|
G
V
 
F
R
|
R
T
 
R
G
 
G
E
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
E
L
 
A
C
 
V
F
 
L
S
 
L
G
|
G
R
|
R
S
 
A
F
 
T
A
 
L
F
 
Y
P
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
T
I
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
A
E
 
D
I
 
I
R
 
D
V
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
V
 
C
Q
 
P
S
 
D
L
 
I
S
 
T
A
 
S
L
 
L
T
 
S
S
 
P
D
 
D
S
 
Y
L
 
L
S
 
Q
N
 
N

Query Sequence

>BPHYT_RS31690 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS31690
MRDFVEPARKHLPAFAFNTLAGGAGNDAGVAENEAAFGRRFFVSRRFAPASTDQTATVFG
HSYASPFGVAPMGLANLFYPGADLLLAQAAQAGNFPFVLSTAASTSIERITKVAPDVSWY
QLYLLSDDRLNAELLSRVAGCGVAVLVLTVDVPVAGRRNSAIRDGVTLPLRWTSALLADV
MRRPQWALGMLRHGAPKLENYAPHAGTADVGAASRHIASVMKMGLEWDDLKKVRAMWPGK
LVIKGILHPDDAARSVALGADGIWVSNHGGRQLEGAIASLDALSEIRRAVGRDTAVFLDG
GVRTGEDILKACALGAGLCFSGRSFAFPVAAYGERGVRAAVEILKEEIRVGLAQLGVQSL
SALTSDSLSNVTRASTPGDPFES

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory