SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS34470 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS34470 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
59% identity, 96% coverage: 10:282/285 of query aligns to 1:275/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
A
 
A
A
 
A
P
 
P
T
 
A
G
 
A
-
 
G
-
 
S
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
Q
 
A
D
 
K
Q
 
N
H
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
P
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
Q
D
 
D
I
 
Y
A
 
S
N
 
N
L
 
A
I
 
I
I
 
V
D
 
E
R
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
K
 
N
Q
 
K
G
 
P
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
N
 
N
R
|
R
I
 
I
S
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
F
D
 
D
F
 
F
E
 
E
C
 
C
T
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
A
 
V
A
 
E
R
|
R
A
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
D
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
T
F
 
I
F
 
F
D
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
K
N
 
G
S
 
G
G
 
D
I
 
I
H
 
K
D
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
K
 
V
S
 
L
I
 
L
R
 
N
N
 
K
M
 
L
N
 
N
V
 
E
E
 
E
K
 
Q
S
 
K
M
 
M
G
 
N
M
 
M
N
 
R
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
S
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
L
 
R
M
 
T
L
 
L
S
 
E
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
V
A
 
A
M
 
F
M
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
A
S
 
K
R
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
N
Y
 
W
A
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Q
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
L
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
P
Q
 
Q
L
 
F
K
 
K
A
 
K
L
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
D
A
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
E
 
Q
R
 
T
S
 
S
G
 
G
V
 
E
A
 
A
T
 
E
A
 
K
I
 
W
Y
 
F
K
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
A
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
M
N
 
N
F
 
F
P
 
E
M
 
L
S
 
S
T
 
D
R
 
E
M
 
M
Q
 
K
T
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
K
H
 
E
P
 
P
N
 
N
D
 
D
K
 
K

2vhaA Debp (see paper)
58% identity, 95% coverage: 11:282/285 of query aligns to 3:274/276 of 2vhaA

query
sites
2vhaA
A
 
A
P
 
A
T
 
G
G
 
S
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
Q
 
A
D
 
K
Q
 
N
H
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
P
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
Q
D
 
D
I
 
Y
A
 
S
N
 
N
L
 
A
I
 
I
I
 
V
D
 
E
R
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
K
 
N
Q
 
K
G
 
P
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
N
 
N
R
|
R
I
 
I
S
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
F
D
 
D
F
 
F
E
 
E
C
 
C
T
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
A
 
V
A
 
E
R
|
R
A
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
D
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
T
F
 
I
F
 
F
D
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
K
N
 
G
S
 
G
G
 
D
I
 
I
H
 
K
D
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
K
 
V
S
 
L
I
 
L
R
 
N
N
 
K
M
 
L
N
 
N
V
 
E
E
 
E
K
 
Q
S
 
K
M
 
M
G
 
N
M
 
M
N
 
R
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
S
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
L
 
R
M
 
T
L
 
L
S
 
E
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
V
A
 
A
M
 
F
M
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
A
S
 
K
R
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
N
Y
 
W
A
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Q
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
L
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
P
Q
 
Q
L
 
F
K
 
K
A
 
K
L
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
D
A
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
E
 
Q
R
 
T
S
 
S
G
 
G
V
 
E
A
 
A
T
 
E
A
 
K
I
 
W
Y
 
F
K
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
A
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
M
N
 
N
F
 
F
P
 
E
M
 
L
S
 
S
T
 
D
R
 
E
M
 
M
Q
 
K
T
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
K
H
 
E
P
 
P
N
 
N
D
 
D
K
 
K

8ovoA X-ray structure of the sf-iglusnfr-s72a in complex with l-aspartate
57% identity, 87% coverage: 11:257/285 of query aligns to 1:247/503 of 8ovoA

query
sites
8ovoA
A
 
A
P
 
A
T
 
G
G
 
S
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
Q
 
A
D
 
K
Q
 
N
H
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
P
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
Q
D
 
D
I
 
Y
A
 
S
N
 
N
L
 
A
I
 
I
I
 
V
D
 
E
R
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
K
 
N
Q
 
K
G
 
P
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
T
S
 
A
Q
 
Q
N
 
N
R
|
R
I
 
I
S
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
F
D
 
D
F
 
F
E
 
E
C
 
C
T
 
G
S
|
S
T
 
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
A
 
V
A
 
E
R
|
R
A
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
D
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
T
F
 
I
F
 
F
D
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
T
R
 
K
Q
 
K
N
 
G
S
 
G
G
 
D
I
 
I
H
 
K
D
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
K
T
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
K
 
V
S
 
L
I
 
L
R
 
N
N
 
K
M
 
L
N
 
N
V
 
E
E
 
E
K
 
Q
S
 
K
M
 
M
G
 
N
M
 
M
N
 
R
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
S
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
L
 
R
M
 
T
L
 
L
S
 
E
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
V
A
 
A
M
 
F
M
 
M
M
 
M
D
|
D
D
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
T
 
A
S
 
K
R
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
N
Y
 
W
A
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Q
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
L
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
P
Q
 
Q
L
 
F
K
 
K
A
 
K
L
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
D
A
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
E
 
Q
R
 
T
S
 
S
G
 
G
V
 
E
A
 
A
T
 
E
A
 
K
I
 
W
Y
 
F
K
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
A
 
N
P
 
P
I
 
I

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
32% identity, 77% coverage: 35:253/285 of query aligns to 16:225/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
Y
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
N
Q
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
K
L
 
A
I
 
I
I
 
A
D
 
K
R
 
K
I
 
L
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
G
L
 
V
Q
 
K
V
 
V
R
 
E
L
 
F
I
 
K
P
 
P
I
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
D
N
 
G
R
 
I
I
 
I
S
 
P
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
V
E
 
V
C
 
I
T
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
D
 
E
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
A
L
 
I
L
 
V
V
 
V
R
 
K
Q
 
K
-
 
G
N
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
I
H
 
K
D
 
S
F
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
K
V
 
V
V
 
G
V
 
V
G
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
H
I
 
V
R
 
K
N
 
-
M
 
-
N
 
K
V
 
V
E
 
A
K
 
K
S
 
D
M
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
K
I
 
V
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
D
D
 
N
H
 
F
S
 
S
E
 
E
S
 
A
F
 
F
L
 
Q
M
 
E
L
 
L
S
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
L
E
 
A
R
 
Y
A
 
V
K
 
K
T
 
Q
S
 
N
R
 
P
P
 
N
E
 
A
D
 
G
Y
 
V
A
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
E
P
 
T
Q
 
F
S
 
S
F
 
G
E
 
E
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
L
 
V
R
 
R
K
 
K
N
 
G
D
 
N
A
 
S
Q
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
E
L
 
K
M
 
I
D
 
N
A
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
E
D
 
E
A
 
M
E
 
K
R
 
K
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
I
Y
 
Y
K
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
31% identity, 77% coverage: 35:253/285 of query aligns to 16:223/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
Y
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
N
Q
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
K
L
 
A
I
 
I
I
 
A
D
 
K
R
 
K
I
 
L
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
G
L
 
V
Q
 
K
V
 
V
R
 
E
L
 
F
I
 
K
P
 
P
I
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
D
N
 
G
R
 
I
I
 
I
S
 
P
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
V
E
 
V
C
 
I
T
 
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
D
 
E
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
A
L
 
I
L
 
V
V
 
V
R
 
K
Q
 
K
-
 
G
N
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
I
H
 
K
D
 
S
F
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
K
V
 
V
V
 
G
V
 
V
G
 
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
H
I
 
V
R
 
K
N
 
K
M
 
V
N
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
A
M
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
K
I
 
V
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
D
D
 
N
H
 
F
S
 
S
E
 
E
S
 
A
F
 
F
L
 
Q
M
 
E
L
 
L
S
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
L
E
 
A
R
 
Y
A
 
V
K
 
K
T
 
Q
S
 
N
R
 
P
P
 
N
E
 
A
D
 
G
Y
 
V
A
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
E
P
 
T
Q
 
F
S
 
S
F
 
G
E
 
E
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
L
 
V
R
 
R
K
 
K
N
 
G
D
 
N
A
 
S
Q
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
E
L
 
K
M
 
I
D
 
N
A
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
E
D
 
E
A
 
M
E
 
K
R
 
K
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
I
Y
 
Y
K
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
31% identity, 76% coverage: 36:253/285 of query aligns to 26:234/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
F
 
F
S
 
G
Y
 
M
Y
 
M
D
 
D
A
 
I
Q
 
E
Q
 
S
K
 
R
P
 
T
I
 
V
-
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
K
L
 
A
I
 
I
I
 
T
D
 
K
R
 
K
I
 
I
K
 
L
A
 
G
Q
 
D
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
N
L
 
G
Q
 
K
V
 
T
R
 
E
L
 
F
I
 
V
P
 
E
I
 
V
T
 
T
S
|
S
Q
 
K
N
 
T
R
|
R
I
 
I
S
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
I
D
 
D
F
 
A
E
 
I
C
 
I
T
 
A
S
x
T
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
V
F
 
Y
F
 
F
D
 
D
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
K
N
 
G
S
 
S
G
 
Q
I
 
I
H
 
K
D
 
S
F
 
V
A
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
A
K
 
S
T
 
T
V
 
T
V
 
V
V
 
L
G
 
A
A
 
V
-
 
K
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
A
K
 
A
S
 
N
I
 
I
R
 
R
N
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
Q
K
 
H
S
 
A
M
 
P
G
 
D
M
 
A
N
 
K
I
 
I
I
 
L
S
 
E
A
 
L
K
 
E
D
 
N
H
x
Y
S
 
A
E
 
E
S
 
A
F
 
F
L
 
T
M
 
A
L
 
L
S
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
M
M
 
T
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
I
K
 
A
T
 
D
S
 
E
R
 
N
P
 
P
E
 
E
D
 
-
Y
 
Y
A
 
E
I
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
G
P
 
T
Q
 
F
S
 
T
F
 
N
E
 
E
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
L
 
I
R
 
N
K
 
K
N
 
G
D
 
Q
A
 
E
Q
 
N
L
 
F
K
 
L
A
 
K
L
 
A
M
 
V
D
 
N
A
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
E
D
 
E
A
 
M
E
 
H
R
 
A
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
I
Y
 
Y
K
 
Q
K
 
K
W
 
W
F
 
F

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
29% identity, 77% coverage: 35:253/285 of query aligns to 22:227/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
Y
 
V
D
 
D
A
 
E
Q
 
N
Q
 
G
K
 
N
P
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
K
L
 
E
I
 
I
I
 
A
D
 
R
R
 
R
I
 
L
K
 
G
A
 
V
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
I
I
 
V
P
 
D
I
 
M
T
 
T
S
x
F
Q
 
D
N
 
G
R
 
L
I
 
I
S
 
P
L
 
S
L
 
L
Q
 
L
N
 
T
G
 
K
T
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
V
E
 
I
C
 
I
T
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
E
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
K
Q
 
V
V
 
V
D
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
D
 
D
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
V
V
 
V
R
 
R
Q
 
K
N
 
D
S
 
S
G
 
D
I
 
F
H
 
R
-
 
P
-
 
K
D
 
T
F
 
Y
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
A
V
 
V
G
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
G
E
 
-
K
 
-
S
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
D
M
 
I
N
 
E
V
 
V
E
 
S
K
 
K
S
 
Y
M
 
D
G
 
G
M
 
I
N
 
K
I
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
F
K
 
D
D
 
K
H
 
F
S
 
T
E
 
D
S
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
E
L
 
L
S
 
K
T
 
R
G
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
V
M
 
L
D
|
D
D
 
S
A
 
A
L
 
T
L
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
F
T
 
V
S
 
A
R
 
K
P
 
N
E
 
P
D
 
D
Y
 
L
A
 
V
I
 
I
V
 
S
G
 
S
T
 
G
P
 
V
Q
 
L
S
 
S
F
 
S
E
 
E
A
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
L
 
V
R
 
R
K
 
K
N
 
E
D
 
D
A
 
T
Q
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
E
L
 
F
M
 
I
D
 
N
A
 
S
A
 
V
I
 
L
A
 
R
D
 
E
A
 
L
E
 
K
R
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
Y
T
 
D
A
 
V
I
 
L
Y
 
I
K
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
28% identity, 84% coverage: 15:253/285 of query aligns to 2:228/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
E
I
 
I
Q
 
M
D
 
K
Q
 
R
H
 
G
V
 
T
V
 
L
T
 
R
I
 
V
G
 
G
Y
 
T
R
x
D
D
 
A
A
 
D
S
x
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
Y
 
K
D
 
D
A
 
K
Q
 
N
Q
 
G
K
 
Q
P
 
Y
I
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
-
L
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
A
Q
 
L
L
 
A
K
 
K
Q
 
E
G
 
L
D
 
G
L
 
V
Q
 
K
V
 
V
R
 
E
L
 
F
I
 
V
P
 
P
I
 
T
T
 
T
S
x
W
Q
 
D
N
 
G
R
 
I
I
 
I
S
 
P
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
F
D
 
D
F
 
I
E
 
V
C
 
M
T
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
P
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
K
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
M
D
 
T
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
K
N
 
D
S
 
N
G
 
A
-
 
D
-
 
K
I
 
I
H
 
K
D
 
S
F
 
F
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
K
K
 
P
T
 
D
V
 
V
V
 
K
V
 
V
G
 
A
A
 
V
-
x
Q
-
 
L
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
A
I
 
A
R
 
K
N
 
E
M
 
F
N
 
-
V
 
L
E
 
P
K
 
K
S
 
A
M
 
-
G
 
-
M
 
-
N
 
K
I
 
I
I
 
R
S
 
T
A
 
F
K
 
E
D
 
N
H
 
N
S
 
A
E
 
E
S
 
A
F
 
F
L
 
Q
M
 
E
L
 
V
S
 
V
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
D
A
 
A
M
 
M
M
 
V
M
 
T
D
 
-
D
|
D
A
 
S
L
 
P
L
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
Y
R
 
Y
A
 
A
K
 
K
T
 
L
S
 
A
R
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
Y
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
D
T
 
E
P
 
P
Q
 
F
S
 
T
F
 
H
E
 
E
A
 
P
Y
 
L
G
 
G
C
 
F
M
 
A
L
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
G
D
 
D
A
 
P
Q
 
E
L
 
L
K
 
L
A
 
N
L
 
W
M
 
V
D
 
N
A
 
N
A
 
W
I
 
L
A
 
K
D
 
Q
A
 
M
E
 
K
R
 
K
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
L
Y
 
Y
K
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

2q2cA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
29% identity, 80% coverage: 25:253/285 of query aligns to 3:220/231 of 2q2cA

query
sites
2q2cA
V
 
V
T
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
T
R
 
D
D
 
A
A
 
A
S
x
F
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
Y
 
M
D
 
Q
A
 
-
Q
 
K
Q
 
G
K
 
K
P
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
L
K
 
D
A
 
A
Q
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
A
G
 
A
D
 
G
L
 
L
Q
 
D
V
 
Y
R
 
E
L
 
L
I
 
K
P
 
N
I
 
I
T
 
G
S
x
W
Q
 
D
N
 
P
R
 
L
I
 
F
S
 
A
L
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
K
T
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
M
E
 
G
C
 
I
T
x
S
S
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
D
 
E
I
 
A
G
 
T
T
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
N
 
G
S
 
S
G
 
P
I
 
V
H
 
K
D
 
N
F
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
G
V
 
V
G
x
Q
A
 
N
G
 
A
T
|
T
T
|
T
S
 
G
E
 
Q
K
 
E
S
 
A
I
 
A
R
 
E
N
 
K
M
 
L
N
 
F
V
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
G
M
 
K
G
 
G
M
 
P
N
 
H
I
 
I
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
E
D
 
T
H
 
T
S
 
V
E
 
V
S
 
A
F
 
I
L
 
M
M
 
E
L
 
L
S
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
G
A
 
V
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
I
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
N
E
 
E
R
 
Y
A
 
V
K
 
K
T
 
N
S
 
N
R
 
P
P
 
N
E
 
K
D
 
K
Y
 
L
A
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
E
T
 
D
P
 
P
Q
 
K
S
 
N
F
 
F
-
 
A
-
 
S
E
 
E
A
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
C
 
M
M
 
I
L
 
F
R
 
P
K
 
K
N
 
N
D
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
K
D
 
N
A
 
V
E
 
I
R
 
N
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
Y
T
 
T
A
 
E
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F

2pvuA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
29% identity, 80% coverage: 25:253/285 of query aligns to 7:224/235 of 2pvuA

query
sites
2pvuA
V
 
V
T
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
T
R
 
D
D
 
A
A
 
A
S
x
F
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
Y
 
M
D
 
Q
A
 
-
Q
 
K
Q
 
G
K
 
K
P
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
L
K
 
D
A
 
A
Q
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
A
G
 
A
D
 
G
L
 
L
Q
 
D
V
 
Y
R
 
E
L
 
L
I
 
K
P
 
N
I
 
I
T
 
G
S
x
W
Q
 
D
N
 
P
R
 
L
I
 
F
S
 
A
L
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
K
T
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
M
E
 
G
C
 
I
T
 
S
S
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
D
 
E
I
 
A
G
 
T
T
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
N
 
G
S
 
S
G
 
P
I
 
V
H
 
K
D
 
N
F
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
G
V
 
V
G
x
Q
A
 
N
G
 
A
T
|
T
T
|
T
S
 
G
E
 
Q
K
 
E
S
 
A
I
 
A
R
 
E
N
 
K
M
 
L
N
 
F
V
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
G
M
 
K
G
 
G
M
 
P
N
 
H
I
 
I
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
E
D
 
T
H
 
T
S
 
V
E
 
V
S
 
A
F
 
I
L
 
M
M
 
E
L
 
L
S
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
G
A
 
V
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
I
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
N
E
 
E
R
 
Y
A
 
V
K
 
K
T
 
N
S
 
N
R
 
P
P
 
N
E
 
K
D
 
K
Y
 
L
A
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
E
T
 
D
P
 
P
Q
 
K
S
 
N
F
 
F
-
 
A
-
 
S
E
 
E
A
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
C
 
M
M
 
I
L
 
F
R
 
P
K
 
K
N
 
N
D
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
K
D
 
N
A
 
V
E
 
I
R
 
N
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
Y
T
 
T
A
 
E
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F

2q2aA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
29% identity, 80% coverage: 25:253/285 of query aligns to 13:230/241 of 2q2aA

query
sites
2q2aA
V
 
V
T
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
T
R
x
D
D
 
A
A
 
A
S
x
F
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
Y
 
M
D
 
Q
A
 
-
Q
 
K
Q
 
G
K
 
K
P
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
L
K
 
D
A
 
A
Q
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
A
G
 
A
D
 
G
L
 
L
Q
 
D
V
 
Y
R
 
E
L
 
L
I
 
K
P
 
N
I
 
I
T
 
G
S
x
W
Q
 
D
N
 
P
R
 
L
I
 
F
S
 
A
L
 
S
L
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
K
T
 
E
I
 
V
D
 
D
F
 
M
E
 
G
C
 
I
T
x
S
S
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
D
 
E
I
 
A
G
 
T
T
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
N
 
G
S
 
S
G
 
P
I
 
V
H
 
K
D
 
N
F
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
G
V
 
V
G
x
Q
A
 
N
G
 
A
T
|
T
T
|
T
S
 
G
E
 
Q
K
 
E
S
 
A
I
 
A
R
 
E
N
 
K
M
 
L
N
 
F
V
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
G
M
 
K
G
 
G
M
 
P
N
 
H
I
 
I
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
E
D
 
T
H
 
T
S
 
V
E
 
V
S
 
A
F
 
I
L
 
M
M
 
E
L
 
L
S
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
G
A
 
V
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
I
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
N
E
 
E
R
 
Y
A
 
V
K
 
K
T
 
N
S
 
N
R
 
P
P
 
N
E
 
K
D
 
K
Y
 
L
A
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
E
T
 
D
P
 
P
Q
 
K
S
 
N
F
 
F
-
 
A
-
 
S
E
 
E
A
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
C
 
M
M
 
I
L
 
F
R
 
P
K
 
K
N
 
N
D
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
K
M
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
K
D
 
N
A
 
V
E
 
I
R
 
N
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
Y
T
 
T
A
 
E
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F

2yjpA Crystal structure of the solute receptors for l-cysteine of neisseria gonorrhoeae (see paper)
27% identity, 83% coverage: 15:251/285 of query aligns to 3:229/247 of 2yjpA

query
sites
2yjpA
T
 
T
L
 
V
K
 
A
K
 
A
I
 
I
Q
 
K
D
 
E
Q
 
K
H
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
V
R
x
F
D
 
G
A
 
D
S
x
K
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
Q
 
G
K
 
K
P
 
N
I
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
K
L
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
D
R
 
L
I
 
A
K
 
K
A
 
D
Q
 
L
L
 
L
K
 
G
Q
 
S
G
 
P
D
 
D
L
 
-
Q
 
K
V
 
V
R
 
E
L
 
F
I
 
V
P
 
L
I
 
T
T
x
E
S
 
A
Q
 
A
N
 
N
R
|
R
I
 
V
S
 
E
L
 
Y
L
 
V
Q
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
V
D
 
D
F
 
L
E
 
I
C
 
L
T
 
A
S
x
N
T
x
F
T
|
T
N
 
Q
N
 
T
A
 
P
A
 
E
R
|
R
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
A
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
M
D
 
K
I
 
V
G
 
A
T
 
L
R
 
G
L
 
V
L
 
V
V
 
S
R
 
P
Q
 
K
N
 
N
S
 
K
G
 
P
I
 
I
H
 
T
D
 
D
F
 
M
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
Q
T
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
V
G
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
A
E
 
D
K
 
A
S
 
F
I
 
F
R
 
T
N
 
K
M
 
S
N
x
H
V
 
P
E
|
E
K
 
-
S
 
-
M
 
-
G
 
-
M
 
V
N
 
K
I
 
L
I
 
L
S
 
K
A
 
F
K
x
D
D
 
Q
H
 
N
S
 
T
E
 
E
S
 
T
F
 
F
L
 
D
M
 
A
L
 
L
S
 
K
T
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
G
K
 
V
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
x
H
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
W
G
 
A
E
 
-
R
 
W
A
 
A
K
 
K
T
 
E
S
 
N
R
 
-
P
 
P
E
 
N
D
 
F
Y
 
E
A
 
V
I
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
N
P
 
L
Q
 
G
S
 
P
F
 
A
E
 
E
A
 
F
Y
 
I
G
 
A
C
 
P
M
 
A
L
 
V
R
 
Q
K
 
K
N
 
G
D
 
N
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
K
 
L
A
 
N
L
 
W
M
 
V
D
 
N
A
 
G
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
A
A
 
M
E
 
K
R
 
K
S
 
D
G
 
G
V
 
R
A
 
L
T
 
K
A
 
A
I
 
A
Y
 
Y
K
 
E
K
 
K

4ymxA Crystal structure of the substrate binding protein of an amino acid abc transporter (see paper)
27% identity, 77% coverage: 35:253/285 of query aligns to 13:222/224 of 4ymxA

query
sites
4ymxA
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
Y
 
H
D
 
K
A
 
V
Q
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
K
Q
 
D
K
 
E
P
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
L
 
A
I
 
I
I
 
A
D
 
K
R
 
K
I
 
L
K
 
G
A
 
V
Q
 
K
L
 
L
K
 
E
Q
 
I
G
 
K
D
 
D
L
 
M
Q
 
D
V
x
F
R
 
K
-
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
-
N
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
A
G
 
G
T
 
R
I
 
V
D
 
D
F
 
M
E
 
V
C
 
I
T
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
P
N
 
T
A
 
A
A
 
E
R
|
R
A
 
K
Q
 
K
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
L
F
 
Y
F
 
Y
D
 
D
I
 
S
G
 
R
T
 
Q
R
 
V
L
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
K
Q
 
N
N
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
H
 
S
D
 
K
F
 
F
A
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
V
K
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
A
V
 
V
G
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
K
 
E
S
 
A
I
 
A
R
 
K
N
 
K
M
 
I
N
 
P
V
 
N
E
 
V
K
 
K
S
 
L
M
 
K
G
 
Q
M
 
L
N
 
N
I
 
R
I
 
V
S
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
-
S
 
S
E
 
D
S
 
E
F
 
F
L
 
M
M
 
D
L
 
L
S
 
Q
T
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
C
K
 
D
A
 
A
M
 
I
M
 
V
M
 
V
D
x
E
D
 
D
A
 
T
L
 
V
L
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
Y
T
 
L
S
 
K
R
 
E
P
 
Y
E
 
K
D
 
D
Y
 
M
A
 
K
I
 
I
V
 
L
G
 
Y
T
 
M
P
 
D
Q
 
E
-
 
I
-
 
N
-
 
N
S
 
V
F
 
E
E
 
N
A
 
G
Y
 
S
G
 
A
C
 
V
M
 
A
L
 
V
R
 
A
K
 
K
N
 
G
D
 
N
A
 
K
Q
 
S
L
 
L
K
 
L
A
 
D
L
 
V
M
 
V
D
 
N
A
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
K
D
 
E
A
 
L
E
 
K
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
E
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
L
Y
 
V
K
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
25% identity, 88% coverage: 8:259/285 of query aligns to 41:282/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
Q
 
R
D
 
A
Q
 
R
H
 
G
V
 
R
V
 
L
T
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
Y
 
R
D
 
D
A
 
P
Q
 
I
Q
 
T
K
 
G
P
 
E
I
 
I
-
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
R
R
 
D
I
 
I
K
 
F
A
 
G
Q
 
V
L
 
P
K
 
S
Q
 
H
G
 
V
D
 
E
L
 
Y
Q
 
R
V
 
I
R
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
-
I
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
N
 
E
R
|
R
I
 
V
S
 
T
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
I
 
V
D
 
D
F
 
I
E
 
V
C
 
V
T
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
C
A
 
E
R
|
R
A
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
F
S
 
S
N
 
T
S
 
V
F
 
Y
F
 
L
D
 
D
I
 
A
G
 
N
T
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
R
 
P
Q
 
R
N
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
H
 
T
D
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
V
 
V
V
 
C
V
 
V
G
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
K
 
R
S
 
R
I
 
I
R
 
R
N
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
I
S
 
A
M
 
P
G
 
P
M
 
P
N
 
V
I
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
S
 
A
E
 
D
S
 
C
F
 
L
L
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
Q
T
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
R
 
V
A
 
E
K
 
E
T
 
D
S
 
P
R
 
Y
P
 
-
E
 
-
D
 
-
Y
 
L
A
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
Q
 
M
S
 
A
F
 
D
E
 
Q
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
L
 
I
R
 
N
K
 
L
N
 
D
D
 
N
A
 
T
Q
 
G
L
 
L
K
 
V
A
 
R
L
 
F
M
 
V
D
 
N
A
 
G
A
 
T
I
 
L
A
 
E
D
 
R
A
 
I
E
 
R
R
 
N
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
W
T
 
N
A
 
T
I
 
L
Y
 
Y
K
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
25% identity, 91% coverage: 2:259/285 of query aligns to 30:281/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
S
 
S
L
 
L
P
 
R
V
 
P
I
 
F
A
 
A
A
 
T
D
 
K
A
 
A
A
 
E
P
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
Q
 
R
D
 
A
Q
 
R
H
 
G
V
 
R
V
 
L
T
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
Y
 
R
D
 
D
A
 
P
Q
 
I
Q
 
T
K
 
G
P
 
E
I
 
I
-
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
R
R
 
D
I
 
I
K
 
F
A
 
G
Q
 
V
L
 
P
K
 
S
Q
 
H
G
 
V
D
 
E
L
 
Y
Q
 
R
V
 
I
R
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
-
I
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
N
 
E
R
|
R
I
 
V
S
 
T
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
I
 
V
D
 
D
F
 
I
E
 
V
C
 
V
T
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
C
A
 
E
R
|
R
A
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
F
S
 
S
N
 
T
S
 
V
F
 
Y
F
 
L
D
 
D
I
 
A
G
 
N
T
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
R
 
P
Q
 
R
N
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
H
 
T
D
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
V
 
V
V
 
C
V
 
V
G
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
K
 
R
S
 
R
I
 
I
R
 
R
N
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
I
S
 
A
M
 
P
G
 
P
M
 
P
N
 
V
I
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
S
 
A
E
 
D
S
 
C
F
 
L
L
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
Q
T
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
R
 
V
A
 
E
K
 
E
T
 
D
S
 
P
R
 
Y
P
 
-
E
 
-
D
 
-
Y
 
L
A
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
Q
 
M
S
 
A
F
 
D
E
 
Q
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
L
 
I
R
 
N
K
 
L
N
 
D
D
 
N
A
 
T
Q
 
G
L
 
L
K
 
V
A
 
R
L
 
F
M
 
V
D
 
N
A
 
G
A
 
T
I
 
L
A
 
E
D
 
R
A
 
I
E
 
R
R
 
N
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
W
T
 
N
A
 
T
I
 
L
Y
 
Y
K
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
25% identity, 91% coverage: 2:259/285 of query aligns to 30:281/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
S
 
S
L
 
L
P
 
R
V
 
P
I
 
F
A
 
A
A
 
T
D
 
K
A
 
A
A
 
E
P
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
Q
 
R
D
 
A
Q
 
R
H
 
G
V
 
R
V
 
L
T
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
Y
 
R
D
 
D
A
 
P
Q
 
I
Q
 
T
K
 
G
P
 
E
I
 
I
-
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
G
L
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
R
R
 
D
I
 
I
K
 
F
A
 
G
Q
 
V
L
 
P
K
 
S
Q
 
H
G
 
V
D
 
E
L
 
Y
Q
 
R
V
 
I
R
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
-
I
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
N
 
E
R
|
R
I
 
V
S
 
T
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
I
 
V
D
 
D
F
 
I
E
 
V
C
 
V
T
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
C
A
 
E
R
|
R
A
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
F
S
 
S
N
 
T
S
 
V
F
 
Y
F
 
L
D
 
D
I
 
A
G
 
N
T
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
R
 
P
Q
 
R
N
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
H
 
T
D
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
V
 
V
V
 
C
V
 
V
G
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
K
 
R
S
 
R
I
 
I
R
 
R
N
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
I
S
 
A
M
 
P
G
 
P
M
 
P
N
 
V
I
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
S
 
A
E
 
D
S
 
C
F
 
L
L
 
V
M
 
A
L
 
L
S
 
Q
T
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
K
 
D
A
 
A
M
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
x
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
R
 
V
A
 
E
K
 
E
T
 
D
S
 
P
R
 
Y
P
 
-
E
 
-
D
 
-
Y
 
L
A
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
Q
 
M
S
 
A
F
 
D
E
 
Q
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
L
 
I
R
 
N
K
 
L
N
 
D
D
 
N
A
 
T
Q
 
G
L
 
L
K
 
V
A
 
R
L
 
F
M
 
V
D
 
N
A
 
G
A
 
T
I
 
L
A
 
E
D
 
R
A
 
I
E
 
R
R
 
N
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
W
T
 
N
A
 
T
I
 
L
Y
 
Y
K
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

5owfA Structure of a lao-binding protein mutant with glutamine (see paper)
28% identity, 81% coverage: 23:253/285 of query aligns to 1:228/235 of 5owfA

query
sites
5owfA
H
 
Q
V
 
T
V
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
 
D
D
 
T
A
 
T
S
x
Y
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
S
Y
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
G
K
 
E
P
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
G
N
 
N
L
 
E
I
 
M
I
 
C
D
 
K
R
 
R
I
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
M
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
L
 
C
I
 
T
P
 
W
I
 
V
T
 
A
S
 
S
Q
 
D
-
x
F
-
 
D
N
 
A
R
 
L
I
 
I
S
 
P
L
 
S
L
 
L
Q
 
K
N
 
A
G
 
K
T
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
A
E
 
I
C
 
I
T
x
S
S
|
S
T
 
L
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
K
R
|
R
A
 
Q
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
K
F
 
L
F
 
Y
D
 
A
I
 
A
G
 
D
T
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
A
R
 
A
Q
 
K
N
 
G
S
 
S
G
 
P
I
 
I
H
 
Q
-
 
P
D
 
T
F
 
L
A
 
E
D
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
H
V
 
V
V
 
G
V
 
V
G
x
K
A
 
Q
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
Q
E
 
E
K
 
-
S
 
A
I
 
Y
R
 
A
N
 
N
M
 
D
N
 
N
V
 
W
E
 
-
K
 
R
S
 
T
M
 
K
G
 
G
M
 
V
N
 
D
I
 
V
I
 
V
S
 
A
A
 
Y
K
 
A
D
 
N
H
 
Q
S
 
D
E
 
L
S
 
I
F
 
Y
L
 
S
M
 
D
L
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
K
 
D
A
 
A
M
 
A
M
 
L
M
 
Q
D
|
D
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
A
A
 
S
G
 
E
E
 
G
R
 
F
A
 
L
K
 
K
T
 
Q
S
 
P
R
 
A
P
 
G
E
 
K
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
I
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
P
P
 
S
Q
 
V
S
 
K
F
 
D
E
 
K
A
 
K
Y
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
G
 
G
C
 
V
M
 
G
L
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
M
 
F
D
 
D
A
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
L
E
 
R
R
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
M
Y
 
A
K
 
K
K
 
K
W
 
Y
F
 
F

1lstA Three-dimensional structures of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein with and without a ligand (see paper)
28% identity, 81% coverage: 23:253/285 of query aligns to 4:231/238 of 1lstA

query
sites
1lstA
H
 
Q
V
 
T
V
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
 
D
D
 
T
A
 
T
S
x
Y
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
S
Y
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
G
K
 
E
P
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
G
N
 
N
L
 
E
I
 
M
I
 
C
D
 
K
R
 
R
I
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
M
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
L
 
C
I
 
T
P
 
W
I
 
V
T
 
A
S
 
S
Q
 
D
-
x
F
-
 
D
N
 
A
R
 
L
I
 
I
S
 
P
L
 
S
L
 
L
Q
 
K
N
 
A
G
 
K
T
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
A
E
 
I
C
 
I
T
 
S
S
|
S
T
 
L
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
K
R
|
R
A
 
Q
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
K
F
 
L
F
 
Y
D
 
A
I
 
A
G
 
D
T
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
A
R
 
A
Q
 
K
N
 
G
S
 
S
G
 
P
I
 
I
H
 
Q
-
 
P
D
 
T
F
 
L
A
 
E
D
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
H
V
 
V
V
 
G
V
 
V
G
x
L
A
 
Q
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
x
Q
E
 
E
K
 
-
S
 
A
I
 
Y
R
 
A
N
 
N
M
 
D
N
 
N
V
 
W
E
 
-
K
 
R
S
 
T
M
 
K
G
 
G
M
 
V
N
 
D
I
 
V
I
 
V
S
 
A
A
 
Y
K
 
A
D
 
N
H
 
Q
S
 
D
E
 
L
S
 
I
F
 
Y
L
 
S
M
 
D
L
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
K
 
D
A
 
A
M
 
A
M
 
L
M
 
Q
D
|
D
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
A
A
 
S
G
 
E
E
 
G
R
 
F
A
 
L
K
 
K
T
 
Q
S
 
P
R
 
A
P
 
G
E
 
K
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
I
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
P
P
 
S
Q
 
V
S
 
K
F
 
D
E
 
K
A
 
K
Y
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
G
 
G
C
 
V
M
 
G
L
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
M
 
F
D
 
D
A
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
L
E
 
R
R
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
M
Y
 
A
K
 
K
K
 
K
W
 
Y
F
 
F

1lahE Structural bases for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein (see paper)
28% identity, 81% coverage: 23:253/285 of query aligns to 4:231/238 of 1lahE

query
sites
1lahE
H
 
Q
V
 
T
V
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
 
D
D
 
T
A
 
T
S
x
Y
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
S
Y
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
G
K
 
E
P
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
G
N
 
N
L
 
E
I
 
M
I
 
C
D
 
K
R
 
R
I
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
M
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
L
 
C
I
 
T
P
 
W
I
 
V
T
 
A
S
 
S
Q
 
D
-
x
F
-
 
D
N
 
A
R
 
L
I
 
I
S
 
P
L
 
S
L
 
L
Q
 
K
N
 
A
G
 
K
T
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
A
E
 
I
C
 
I
T
 
S
S
|
S
T
 
L
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
K
R
|
R
A
 
Q
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
K
F
 
L
F
 
Y
D
 
A
I
 
A
G
 
D
T
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
A
R
 
A
Q
 
K
N
 
G
S
 
S
G
 
P
I
 
I
H
 
Q
-
 
P
D
 
T
F
 
L
A
 
E
D
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
H
V
 
V
V
 
G
V
 
V
G
 
L
A
 
Q
G
 
G
T
x
S
T
 
T
S
x
Q
E
 
E
K
 
-
S
 
A
I
 
Y
R
 
A
N
 
N
M
 
D
N
 
N
V
 
W
E
 
-
K
 
R
S
 
T
M
 
K
G
 
G
M
 
V
N
 
D
I
 
V
I
 
V
S
 
A
A
 
Y
K
 
A
D
 
N
H
 
Q
S
 
D
E
 
L
S
 
I
F
 
Y
L
 
S
M
 
D
L
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
K
 
D
A
 
A
M
 
A
M
 
L
M
 
Q
D
|
D
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
A
A
 
S
G
 
E
E
 
G
R
 
F
A
 
L
K
 
K
T
 
Q
S
 
P
R
 
A
P
 
G
E
 
K
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
I
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
P
P
 
S
Q
 
V
S
 
K
F
 
D
E
 
K
A
 
K
Y
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
G
 
G
C
 
V
M
 
G
L
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
M
 
F
D
 
D
A
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
L
E
 
R
R
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
M
Y
 
A
K
 
K
K
 
K
W
 
Y
F
 
F

1lagE Structural bases for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein (see paper)
28% identity, 81% coverage: 23:253/285 of query aligns to 4:231/238 of 1lagE

query
sites
1lagE
H
 
Q
V
 
T
V
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
 
D
D
 
T
A
 
T
S
x
Y
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
S
Y
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
G
K
 
E
P
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
I
 
I
D
 
D
I
 
L
A
 
G
N
 
N
L
 
E
I
 
M
I
 
C
D
 
K
R
 
R
I
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
M
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
L
 
C
I
 
T
P
 
W
I
 
V
T
 
A
S
 
S
Q
 
D
-
x
F
-
 
D
N
 
A
R
 
L
I
 
I
S
 
P
L
 
S
L
 
L
Q
 
K
N
 
A
G
 
K
T
 
K
I
 
I
D
 
D
F
 
A
E
 
I
C
 
I
T
x
S
S
|
S
T
x
L
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
K
R
|
R
A
 
Q
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
I
D
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
K
F
 
L
F
 
Y
D
 
A
I
 
A
G
 
D
T
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
A
R
 
A
Q
 
K
N
 
G
S
 
S
G
 
P
I
 
I
H
 
Q
-
 
P
D
 
T
F
 
L
A
 
E
D
 
S
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
H
V
 
V
V
 
G
V
 
V
G
x
L
A
 
Q
G
 
G
T
x
S
T
 
T
S
x
Q
E
 
E
K
 
-
S
 
A
I
 
Y
R
 
A
N
 
N
M
 
D
N
 
N
V
 
W
E
 
-
K
 
R
S
 
T
M
 
K
G
 
G
M
 
V
N
 
D
I
 
V
I
 
V
S
 
A
A
 
Y
K
 
A
D
 
N
H
 
Q
S
 
D
E
 
L
S
 
I
F
 
Y
L
 
S
M
 
D
L
 
L
S
 
T
T
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
K
 
D
A
 
A
M
 
A
M
 
L
M
 
Q
D
|
D
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
A
A
 
S
G
 
E
E
 
G
R
 
F
A
 
L
K
 
K
T
 
Q
S
 
P
R
 
A
P
 
G
E
 
K
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
I
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
P
P
 
S
Q
 
V
S
 
K
F
 
D
E
 
K
A
 
K
Y
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
G
 
G
C
 
V
M
 
G
L
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
M
 
F
D
 
D
A
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
L
E
 
R
R
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
T
A
 
Y
T
 
D
A
 
K
I
 
M
Y
 
A
K
 
K
K
 
K
W
 
Y
F
 
F

Query Sequence

>BPHYT_RS34470 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS34470
MSLPVIAADAAPTGTLKKIQDQHVVTIGYRDASIPFSYYDAQQKPIGYSIDIANLIIDRI
KAQLKQGDLQVRLIPITSQNRISLLQNGTIDFECTSTTNNAARAQQVDFSNSFFDIGTRL
LVRQNSGIHDFADLKGKTVVVGAGTTSEKSIRNMNVEKSMGMNIISAKDHSESFLMLSTG
RAKAMMMDDALLAGERAKTSRPEDYAIVGTPQSFEAYGCMLRKNDAQLKALMDAAIADAE
RSGVATAIYKKWFMAPIPPKGINLNFPMSTRMQTLFAHPNDKPAS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory