SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS00580 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS00580 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4xckA Vibrio cholerae o395 ribokinase complexed with adp, ribose and cesium ion. (see paper)
40% identity, 65% coverage: 101:361/403 of query aligns to 3:262/306 of 4xckA

query
sites
4xckA
K
 
K
V
 
L
C
 
V
V
 
V
F
 
L
G
 
G
S
 
S
F
 
V
N
|
N
V
 
A
D
|
D
I
 
H
V
 
V
A
 
L
K
 
Q
V
 
V
E
 
P
R
 
S
F
 
F
P
 
P
R
 
R
G
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
M
 
H
A
 
G
L
 
R
G
 
N
S
 
Y
S
 
Q
L
 
V
G
 
I
P
 
P
G
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
M
G
 
Q
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
H
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
A
K
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
D
D
 
D
Q
 
S
F
 
F
S
 
G
H
 
I
L
 
N
A
 
I
A
 
R
D
 
E
H
 
S
L
 
F
T
 
K
R
 
L
S
 
D
A
 
G
I
 
I
H
 
N
S
 
T
Y
 
A
T
 
G
L
 
V
Y
 
K
Q
 
L
S
 
Q
E
 
P
S
 
N
E
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
I
A
|
A
I
 
M
I
 
I
Y
 
Q
V
 
V
S
 
S
Q
 
-
E
 
D
N
 
S
G
 
G
E
 
E
N
 
N
M
 
S
I
|
I
A
 
C
I
|
I
Y
 
S
S
 
A
G
 
E
A
 
A
N
 
N
T
 
A
T
 
K
I
 
L
T
 
T
Y
 
A
S
 
A
E
 
A
I
 
I
Q
 
E
K
 
P
I
 
D
I
 
L
P
 
A
E
 
A
L
 
I
S
 
R
S
 
D
S
 
A
D
 
R
V
 
Y
L
 
L
L
 
L
V
 
M
Q
 
Q
L
 
L
E
|
E
N
 
T
N
 
P
F
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
I
H
 
L
S
 
K
L
 
A
I
 
A
K
 
Q
I
 
E
A
 
A
H
 
K
E
 
T
L
 
A
G
 
K
K
 
T
Q
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
-
S
 
-
A
 
A
E
 
R
I
 
E
I
 
L
P
 
P
S
 
D
-
 
E
-
 
L
I
 
L
P
 
K
F
 
C
V
 
V
D
 
D
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
T
I
 
V
S
 
Y
D
 
D
F
 
D
D
 
S
T
 
S
A
 
A
K
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
D
R
 
A
I
 
L
A
 
H
R
 
C
L
 
K
G
 
G
A
 
I
K
 
E
K
 
I
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
|
S
R
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
L
 
S
D
 
Q
N
 
N
R
 
G
Q
 
R
F
 
G
S
 
Q
H
 
R
I
 
I
R
 
P
A
 
G
F
 
F
P
 
V
A
x
V
V
 
K
T
 
A
V
 
T
D
 
D
T
|
T
T
|
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
N
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
T
S
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P0A9J6 Ribokinase; RK; EC 2.7.1.15 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
38% identity, 65% coverage: 100:361/403 of query aligns to 5:265/309 of P0A9J6

query
sites
P0A9J6
G
 
G
K
 
S
V
 
L
C
 
V
V
 
V
F
 
L
G
 
G
S
 
S
F
 
I
N
|
N
V
x
A
D
|
D
I
 
H
V
 
I
A
 
L
K
 
N
V
 
L
E
 
Q
R
 
S
F
 
F
P
 
P
R
 
T
G
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
V
M
 
T
A
 
G
L
 
N
G
 
H
S
 
Y
S
 
Q
L
 
V
G
 
A
P
 
F
G
 
G
G
|
G
K
|
K
G
|
G
A
|
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
R
A
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
H
 
A
F
 
F
V
 
I
A
 
A
K
 
C
V
 
T
G
 
G
K
 
D
D
 
D
Q
 
S
F
 
I
S
 
G
H
 
E
L
 
S
A
 
V
A
 
R
D
 
Q
H
 
Q
L
 
L
T
 
A
R
 
T
S
 
D
A
 
N
I
 
I
H
 
D
S
 
I
Y
 
T
T
 
P
L
 
V
Y
 
S
Q
 
V
S
 
I
E
 
K
S
 
G
E
 
E
P
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
Y
 
F
V
 
V
S
 
N
Q
 
G
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
E
N
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
G
I
 
I
Y
 
H
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
A
T
 
A
I
 
L
T
 
S
Y
 
P
S
 
A
E
 
L
I
 
V
Q
 
E
K
 
A
I
 
Q
I
 
R
P
 
E
E
 
R
L
 
I
S
 
A
S
 
N
S
 
A
D
 
S
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
M
Q
 
Q
L
 
L
E
|
E
N
 
S
N
 
P
F
 
L
D
 
E
A
 
S
T
 
V
H
 
M
S
 
A
L
 
A
I
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
L
 
N
G
 
K
K
 
T
Q
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
-
S
 
-
A
 
A
E
 
R
I
 
E
I
 
L
P
 
P
S
 
D
-
 
E
-
 
L
I
 
L
P
 
A
F
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
 
T
P
 
P
N
|
N
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
K
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
R
I
 
V
S
 
E
D
 
N
F
 
D
D
 
E
T
 
D
A
 
A
K
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
R
 
V
I
 
L
A
 
H
R
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
I
K
 
R
K
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
|
T
M
x
L
G
|
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
A
 
V
L
 
W
L
 
A
L
 
S
D
 
V
N
 
N
R
 
G
Q
 
E
F
 
G
S
 
Q
H
 
R
I
 
V
R
 
P
A
 
G
F
 
F
P
 
R
A
 
V
V
 
Q
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
I
G
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
T
S
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1gqtB Activation of ribokinase by monovalent cations (see paper)
38% identity, 65% coverage: 100:361/403 of query aligns to 4:264/307 of 1gqtB

query
sites
1gqtB
G
 
G
K
 
S
V
 
L
C
 
V
V
 
V
F
 
L
G
 
G
S
 
S
F
 
I
N
|
N
V
 
A
D
|
D
I
 
H
V
 
I
A
 
L
K
 
N
V
 
L
E
 
Q
R
 
S
F
 
F
P
 
P
R
 
T
G
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
V
M
 
T
A
 
G
L
 
N
G
 
H
S
 
Y
S
 
Q
L
 
V
G
 
A
P
 
F
G
 
G
G
|
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
R
A
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
H
 
A
F
 
F
V
 
I
A
 
A
K
 
C
V
 
T
G
 
G
K
 
D
D
 
D
Q
 
S
F
 
I
S
 
G
H
 
E
L
 
S
A
 
V
A
 
R
D
 
Q
H
 
Q
L
 
L
T
 
A
R
 
T
S
 
D
A
 
N
I
 
I
H
 
D
S
 
I
Y
 
T
T
 
P
L
 
V
Y
 
S
Q
 
V
S
 
I
E
 
K
S
 
G
E
 
E
P
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
Y
 
F
V
 
V
S
 
N
Q
 
G
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
E
N
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
G
I
 
I
Y
 
H
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
A
T
 
A
I
 
L
T
 
S
Y
 
P
S
 
A
E
 
L
I
 
V
Q
 
E
K
 
A
I
 
Q
I
 
R
P
 
E
E
 
R
L
 
I
S
 
A
S
 
N
S
 
A
D
 
S
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
M
Q
 
Q
L
 
L
E
|
E
N
 
S
N
 
P
F
 
L
D
 
E
A
 
S
T
 
V
H
 
M
S
 
A
L
 
A
I
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
L
 
N
G
 
K
K
 
T
Q
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
-
S
 
-
A
 
A
E
 
R
I
 
E
I
 
L
P
 
P
S
 
D
-
 
E
-
 
L
I
 
L
P
 
A
F
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
 
T
P
 
P
N
|
N
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
K
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
R
I
 
V
S
 
E
D
 
N
F
 
D
D
 
E
T
 
D
A
 
A
K
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
R
 
V
I
 
L
A
 
H
R
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
I
K
 
R
K
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
|
S
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
A
L
 
S
D
 
V
N
 
N
R
 
G
Q
 
E
F
 
G
S
 
Q
H
 
R
I
 
V
R
 
P
A
 
G
F
 
F
P
 
R
A
 
V
V
 
Q
T
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
x
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
T
S
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1rk2A E. Coli ribokinase complexed with ribose and adp, solved in space group p212121 (see paper)
38% identity, 65% coverage: 100:361/403 of query aligns to 2:262/305 of 1rk2A

query
sites
1rk2A
G
 
G
K
 
S
V
 
L
C
 
V
V
 
V
F
 
L
G
 
G
S
 
S
F
 
I
N
|
N
V
 
A
D
|
D
I
 
H
V
 
I
A
 
L
K
 
N
V
 
L
E
 
Q
R
 
S
F
 
F
P
 
P
R
 
T
G
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
V
M
 
T
A
 
G
L
 
N
G
 
H
S
 
Y
S
 
Q
L
 
V
G
 
A
P
 
F
G
|
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
R
A
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
H
 
A
F
 
F
V
 
I
A
 
A
K
 
C
V
 
T
G
 
G
K
 
D
D
 
D
Q
 
S
F
 
I
S
 
G
H
 
E
L
 
S
A
 
V
A
 
R
D
 
Q
H
 
Q
L
 
L
T
 
A
R
 
T
S
 
D
A
 
N
I
 
I
H
 
D
S
 
I
Y
 
T
T
 
P
L
 
V
Y
 
S
Q
 
V
S
 
I
E
 
K
S
 
G
E
 
E
P
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
V
A
 
A
I
 
L
I
 
I
Y
 
F
V
 
V
S
 
N
Q
 
G
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
E
N
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
G
I
 
I
Y
 
H
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
A
T
 
A
I
 
L
T
 
S
Y
 
P
S
 
A
E
 
L
I
 
V
Q
 
E
K
 
A
I
 
Q
I
 
R
P
 
E
E
 
R
L
 
I
S
 
A
S
 
N
S
 
A
D
 
S
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
M
Q
 
Q
L
 
L
E
|
E
N
 
S
N
 
P
F
 
L
D
 
E
A
 
S
T
 
V
H
 
M
S
 
A
L
 
A
I
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
L
 
N
G
 
K
K
 
T
Q
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
-
S
 
-
A
 
A
E
 
R
I
 
E
I
 
L
P
 
P
S
 
D
-
 
E
-
 
L
I
 
L
P
 
A
F
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
 
T
P
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
K
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
R
I
 
V
S
 
E
D
 
N
F
 
D
D
 
E
T
 
D
A
 
A
K
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
R
 
V
I
 
L
A
 
H
R
 
E
L
 
K
G
|
G
A
 
I
K
x
R
K
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
|
S
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
A
L
 
S
D
 
V
N
 
N
R
 
G
Q
 
E
F
 
G
S
 
Q
H
 
R
I
 
V
R
 
P
A
 
G
F
 
F
P
 
R
A
 
V
V
 
Q
T
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
 
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
T
S
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6wk0B Crystal structure of human ribokinase in complex with amppcp and ribose
36% identity, 65% coverage: 102:362/403 of query aligns to 5:267/311 of 6wk0B

query
sites
6wk0B
V
 
V
C
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
M
V
 
T
D
|
D
I
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
L
V
 
T
E
 
S
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
H
G
 
K
S
 
F
S
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
F
G
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
C
T
 
V
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
T
H
 
S
F
 
M
V
 
V
A
 
C
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
Q
 
S
F
 
F
S
 
G
H
 
N
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
E
H
 
N
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
S
 
N
A
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
T
Y
 
E
T
 
F
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
T
E
 
K
S
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
A
|
A
I
 
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
V
S
 
N
Q
 
N
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
L
T
 
L
I
 
L
T
 
N
Y
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
A
P
 
N
E
 
V
L
 
I
S
 
S
S
 
R
S
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
V
 
C
Q
 
Q
L
 
L
E
|
E
N
 
I
N
 
T
F
 
P
D
 
A
A
 
T
T
 
S
H
 
L
S
 
E
L
 
A
I
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
A
H
 
R
E
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
V
Q
 
K
V
 
T
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
P
 
P
S
 
Q
I
 
F
-
 
Y
P
 
T
F
 
L
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
C
P
 
C
N
|
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
L
D
 
T
I
 
V
S
 
G
D
 
S
F
 
A
D
 
A
T
 
D
A
 
A
K
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
C
K
 
Q
K
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
L
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
S
N
 
Q
R
 
T
-
 
E
-
 
P
Q
 
E
F
 
P
S
 
K
H
 
H
I
 
I
R
 
P
A
x
T
F
 
E
P
 
K
A
x
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
S
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5c41A Crystal structure of human ribokinase in complex with amppcp in p21 spacegroup and with 4 protomers
36% identity, 65% coverage: 102:362/403 of query aligns to 5:267/317 of 5c41A

query
sites
5c41A
V
 
V
C
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
M
V
 
T
D
 
D
I
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
L
V
 
T
E
 
S
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
H
G
 
K
S
 
F
S
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
C
T
 
V
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
T
H
 
S
F
 
M
V
 
V
A
 
C
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
Q
 
S
F
 
F
S
 
G
H
 
N
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
E
H
 
N
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
S
 
N
A
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
T
Y
 
E
T
 
F
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
T
E
 
K
S
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
A
 
A
I
 
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
V
S
 
N
Q
 
N
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
L
T
 
L
I
 
L
T
 
N
Y
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
A
P
 
N
E
 
V
L
 
I
S
 
S
S
 
R
S
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
V
 
C
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
N
 
I
N
 
T
F
 
P
D
 
A
A
 
T
T
 
S
H
 
L
S
 
E
L
 
A
I
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
A
H
 
R
E
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
V
Q
 
K
V
 
T
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
P
 
P
S
 
Q
I
 
F
-
 
Y
P
 
T
F
 
L
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
C
P
 
C
N
|
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
L
D
 
T
I
 
V
S
 
G
D
 
S
F
 
A
D
 
A
T
 
D
A
 
A
K
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
C
K
 
Q
K
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
L
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
S
N
 
Q
R
 
T
-
 
E
-
 
P
Q
 
E
F
 
P
S
 
K
H
 
H
I
 
I
R
 
P
A
 
T
F
 
E
P
 
K
A
x
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
S
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2fv7A Crystal structure of human ribokinase
36% identity, 65% coverage: 102:362/403 of query aligns to 4:266/308 of 2fv7A

query
sites
2fv7A
V
 
V
C
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
M
V
 
T
D
 
D
I
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
L
V
 
T
E
 
S
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
H
G
 
K
S
 
F
S
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
C
T
 
V
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
T
H
 
S
F
 
M
V
 
V
A
 
C
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
Q
 
S
F
 
F
S
 
G
H
 
N
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
E
H
 
N
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
S
 
N
A
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
T
Y
 
E
T
 
F
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
T
E
 
K
S
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
A
 
A
I
 
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
V
S
 
N
Q
 
N
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
L
T
 
L
I
 
L
T
 
N
Y
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
A
P
 
N
E
 
V
L
 
I
S
 
S
S
 
R
S
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
V
 
C
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
N
 
I
N
 
T
F
 
P
D
 
A
A
 
T
T
 
S
H
 
L
S
 
E
L
 
A
I
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
A
H
 
R
E
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
V
Q
 
K
V
 
T
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
P
 
P
S
 
Q
I
 
F
-
 
Y
P
 
T
F
 
L
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
C
P
 
C
N
|
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
L
D
 
T
I
 
V
S
 
G
D
 
S
F
 
A
D
 
A
T
 
D
A
 
A
K
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
C
K
 
Q
K
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
 
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
L
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
S
N
 
Q
R
 
T
-
 
E
-
 
P
Q
 
E
F
 
P
S
 
K
H
 
H
I
 
I
R
 
P
A
x
T
F
 
E
P
 
K
A
x
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
S
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5c3yA Structure of human ribokinase crystallized with amppnp
36% identity, 65% coverage: 102:362/403 of query aligns to 4:266/306 of 5c3yA

query
sites
5c3yA
V
 
V
C
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
M
V
 
T
D
 
D
I
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
L
V
 
T
E
 
S
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
H
G
 
K
S
 
F
S
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
C
T
 
V
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
T
H
 
S
F
 
M
V
 
V
A
 
C
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
Q
 
S
F
 
F
S
 
G
H
 
N
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
E
H
 
N
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
S
 
N
A
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
T
Y
 
E
T
 
F
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
T
E
 
K
S
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
A
 
A
I
 
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
V
S
 
N
Q
 
N
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
L
T
 
L
I
 
L
T
 
N
Y
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
A
P
 
N
E
 
V
L
 
I
S
 
S
S
 
R
S
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
V
 
C
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
N
 
I
N
 
T
F
 
P
D
 
A
A
 
T
T
 
S
H
 
L
S
 
E
L
 
A
I
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
A
H
 
R
E
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
V
Q
 
K
V
 
T
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
P
 
P
S
 
Q
I
 
F
-
 
Y
P
 
T
F
 
L
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
C
P
 
C
N
 
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
L
D
 
T
I
 
V
S
 
G
D
 
S
F
 
A
D
 
A
T
 
D
A
 
A
K
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
C
K
 
Q
K
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
S
N
 
Q
R
 
T
-
 
E
-
 
P
Q
 
E
F
 
P
S
 
K
H
 
H
I
 
I
R
 
P
A
 
T
F
 
E
P
 
K
A
x
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
S
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6wjzA Crystal structure of human ribokinase in complex with ampcp
36% identity, 65% coverage: 102:362/403 of query aligns to 5:267/315 of 6wjzA

query
sites
6wjzA
V
 
V
C
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
M
V
 
T
D
 
D
I
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
L
V
 
T
E
 
S
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
H
G
 
K
S
 
F
S
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
C
T
 
V
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
T
H
 
S
F
 
M
V
 
V
A
 
C
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
Q
 
S
F
 
F
S
 
G
H
 
N
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
E
H
 
N
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
S
 
N
A
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
T
Y
 
E
T
 
F
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
T
E
 
K
S
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
A
 
A
I
 
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
V
S
 
N
Q
 
N
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
L
T
 
L
I
 
L
T
 
N
Y
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
A
P
 
N
E
 
V
L
 
I
S
 
S
S
 
R
S
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
V
 
C
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
N
 
I
N
 
T
F
 
P
D
 
A
A
 
T
T
 
S
H
 
L
S
 
E
L
 
A
I
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
A
H
 
R
E
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
V
Q
 
K
V
 
T
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
P
 
P
S
 
Q
I
 
F
-
 
Y
P
 
T
F
 
L
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
C
P
 
C
N
|
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
L
D
 
T
I
 
V
S
 
G
D
 
S
F
 
A
D
 
A
T
 
D
A
 
A
K
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
C
K
 
Q
K
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
L
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
S
N
 
Q
R
 
T
-
 
E
-
 
P
Q
 
E
F
 
P
S
 
K
H
 
H
I
 
I
R
 
P
A
x
T
F
 
E
P
 
K
A
x
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
A
 
S
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q9H477 Ribokinase; RK; EC 2.7.1.15 from Homo sapiens (Human)
36% identity, 64% coverage: 106:362/403 of query aligns to 22:280/322 of Q9H477

query
sites
Q9H477
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
M
V
 
T
D
 
D
I
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
L
V
 
T
E
 
S
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
H
G
 
K
S
 
F
S
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
C
T
 
V
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
T
H
 
S
F
 
M
V
 
V
A
 
C
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
Q
 
S
F
 
F
S
 
G
H
 
N
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
E
H
 
N
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
S
 
N
A
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
T
Y
 
E
T
 
F
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
T
E
 
K
S
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
A
 
A
I
 
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
V
S
 
N
Q
 
N
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
L
T
 
L
I
 
L
T
 
N
Y
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
A
P
 
N
E
 
V
L
 
I
S
 
S
S
 
R
S
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
V
 
C
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
N
 
I
N
 
T
F
 
P
D
 
A
A
 
T
T
 
S
H
 
L
S
 
E
L
 
A
I
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
A
H
 
R
E
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
V
Q
 
K
V
 
T
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
P
 
P
S
 
Q
I
 
F
-
 
Y
P
 
T
F
 
L
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
C
P
 
C
N
|
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
L
D
 
T
I
 
V
S
 
G
D
 
S
F
 
A
D
 
A
T
 
D
A
 
A
K
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
C
K
 
Q
K
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
M
x
L
G
|
G
S
x
A
R
x
E
G
|
G
A
 
C
L
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
S
N
 
Q
R
 
T
-
 
E
-
 
P
Q
 
E
F
 
P
S
 
K
H
 
H
I
 
I
R
 
P
A
x
T
F
 
E
P
 
K
A
 
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
S
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5byfA Crystal structure of human ribokinase in complex with amp
36% identity, 64% coverage: 106:362/403 of query aligns to 10:268/313 of 5byfA

query
sites
5byfA
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
M
V
 
T
D
 
D
I
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
L
V
 
T
E
 
S
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
H
G
 
K
S
 
F
S
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
C
T
 
V
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
T
H
 
S
F
 
M
V
 
V
A
 
C
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
Q
 
S
F
 
F
S
 
G
H
 
N
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
E
H
 
N
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
S
 
N
A
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
T
Y
 
E
T
 
F
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
T
E
 
K
S
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
A
 
A
I
 
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
V
S
 
N
Q
 
N
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
L
T
 
L
I
 
L
T
 
N
Y
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
A
P
 
N
E
 
V
L
 
I
S
 
S
S
 
R
S
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
V
 
C
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
N
 
I
N
 
T
F
 
P
D
 
A
A
 
T
T
 
S
H
 
L
S
 
E
L
 
A
I
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
A
H
 
R
E
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
V
Q
 
K
V
 
T
I
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
I
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
D
P
 
P
S
 
Q
I
 
F
-
 
Y
P
 
T
F
 
L
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
C
P
 
C
N
 
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
L
D
 
T
I
 
V
S
 
G
D
 
S
F
 
A
D
 
A
T
 
D
A
 
A
K
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
L
R
 
K
L
 
R
G
 
G
A
 
C
K
 
Q
K
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
L
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
S
N
 
Q
R
 
T
-
 
E
-
 
P
Q
 
E
F
 
P
S
 
K
H
 
H
I
 
I
R
 
P
A
 
T
F
 
E
P
 
K
A
 
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
S
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6ilsB Structure of arabidopsis thaliana ribokinase complexed with ribose and atp (see paper)
34% identity, 73% coverage: 98:392/403 of query aligns to 1:301/313 of 6ilsB

query
sites
6ilsB
M
 
M
Q
 
A
G
 
P
K
 
P
V
 
L
C
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
A
N
|
N
V
 
A
D
|
D
I
 
I
V
 
Y
A
 
V
K
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
S
A
 
A
L
 
K
G
 
T
S
 
G
S
 
Q
L
 
T
G
 
L
P
 
A
G
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
A
 
C
A
 
G
S
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
M
A
 
Y
Q
 
P
V
 
T
H
 
Y
F
 
F
V
 
V
A
 
G
K
 
R
V
 
L
G
 
G
K
 
E
D
 
D
Q
 
A
F
 
H
S
 
G
H
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
A
D
 
E
H
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
D
-
 
D
-
 
G
S
 
C
A
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
L
Y
 
D
T
 
Y
L
 
V
Y
 
R
Q
 
S
S
 
V
E
 
N
S
 
N
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
H
A
 
A
I
 
V
I
 
V
Y
 
M
V
 
L
S
 
-
Q
 
Q
E
 
S
N
 
D
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
S
I
 
I
A
 
I
I
 
I
Y
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
-
T
 
-
I
 
-
T
 
-
Y
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
M
K
 
K
I
 
A
I
 
W
P
 
P
E
 
E
L
 
I
S
 
M
S
 
S
S
 
D
D
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
V
-
 
R
-
 
N
-
 
A
-
 
G
V
 
I
L
 
V
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
L
 
R
E
|
E
N
 
I
N
 
P
F
 
D
D
 
S
A
 
I
T
 
N
H
 
I
S
 
Q
L
 
V
I
 
A
K
 
K
I
 
A
A
 
V
H
 
K
E
 
K
L
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
P
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
M
P
 
D
A
 
T
P
 
P
Y
 
I
S
 
P
A
 
N
E
 
E
I
 
L
I
 
L
P
 
D
S
 
S
I
 
I
P
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
D
V
 
I
I
 
L
T
 
S
P
 
P
N
|
N
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
L
S
 
S
L
 
R
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
M
D
 
P
I
 
T
S
 
E
D
 
T
F
 
F
D
 
E
T
 
Q
A
 
I
K
 
S
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
A
R
 
K
I
 
C
A
 
H
R
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
V
K
 
K
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
T
x
K
M
 
L
G
|
G
S
 
S
R
 
K
G
 
G
-
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
I
D
 
Q
N
 
G
R
 
E
Q
 
K
F
 
P
S
 
I
H
 
Q
I
 
Q
R
 
S
A
 
I
F
x
I
P
 
P
A
|
A
V
 
A
-
 
Q
T
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
N
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
V
S
 
A
L
 
M
A
 
V
A
 
E
G
 
G
N
 
K
S
 
S
L
 
H
V
 
E
Q
 
E
A
 
C
A
 
L
T
 
R
W
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
A
F
 
A
A
|
A
S
|
S
L
 
L
A
 
C
V
 
V
E
 
Q
L
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
A
-
 
I
S
 
P
N
 
S
M
 
M
P
 
P
E
 
D

A1A6H3 Ribokinase; AtRBSK; RK; EC 2.7.1.15 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
34% identity, 72% coverage: 102:392/403 of query aligns to 71:367/379 of A1A6H3

query
sites
A1A6H3
V
x
L
C
x
V
V
|
V
F
x
V
G
 
G
S
 
S
F
 
A
N
 
N
V
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
Y
A
 
V
K
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
S
A
 
A
L
 
K
G
 
T
S
 
G
S
 
Q
L
 
T
G
 
L
P
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
A
 
C
A
 
G
S
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
M
A
 
Y
Q
 
P
V
 
T
H
 
Y
F
 
F
V
 
V
A
 
G
K
 
R
V
 
L
G
 
G
K
 
E
D
 
D
Q
 
A
F
 
H
S
 
G
H
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
A
D
 
E
H
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
D
-
 
D
-
 
G
S
 
C
A
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
L
Y
 
D
T
 
Y
L
 
V
Y
 
R
Q
 
S
S
 
V
E
 
N
S
 
N
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
H
A
 
A
I
 
V
I
 
V
Y
 
M
V
 
L
S
 
-
Q
 
Q
E
 
S
N
 
D
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
S
I
 
I
A
 
I
I
 
I
Y
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
-
T
 
-
I
 
-
T
 
-
Y
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
M
K
 
K
I
 
A
I
 
W
P
 
P
E
 
E
L
 
I
S
 
M
S
 
S
S
 
D
D
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
V
-
 
R
-
 
N
-
 
A
-
 
G
V
 
I
L
 
V
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
L
 
R
E
 
E
N
 
I
N
 
P
F
 
D
D
 
S
A
 
I
T
 
N
H
 
I
S
 
Q
L
 
V
I
 
A
K
 
K
I
 
A
A
 
V
H
 
K
E
 
K
L
 
A
G
 
G
K
 
V
Q
 
P
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
M
P
 
D
A
 
T
P
 
P
Y
 
I
S
 
P
A
 
N
E
 
E
I
 
L
I
 
L
P
 
D
S
 
S
I
 
I
P
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
D
V
 
I
I
 
L
T
 
S
P
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
L
S
 
S
L
 
R
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
M
D
 
P
I
 
T
S
 
E
D
 
T
F
 
F
D
 
E
T
 
Q
A
 
I
K
 
S
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
A
R
 
K
I
 
C
A
 
H
R
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
V
K
 
K
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
K
M
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
K
G
 
G
-
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
I
D
 
Q
N
 
G
R
 
E
Q
 
K
F
 
P
S
 
I
H
 
Q
I
 
Q
R
 
S
A
 
I
F
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
A
-
 
Q
T
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
T
F
 
F
N
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
V
S
 
A
L
 
M
A
 
V
A
 
E
G
 
G
N
 
K
S
 
S
L
 
H
V
 
E
Q
 
E
A
 
C
A
 
L
T
 
R
W
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
A
F
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
C
V
 
V
E
 
Q
L
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
A
-
 
I
S
 
P
N
 
S
M
 
M
P
 
P
E
 
D

Sites not aligning to the query:

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
35% identity, 71% coverage: 102:387/403 of query aligns to 2:284/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
V
 
I
C
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
L
N
 
N
V
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
V
A
 
L
K
 
R
V
 
V
E
 
K
R
 
R
F
 
L
P
 
P
R
 
R
G
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
V
M
 
L
A
 
G
L
 
E
G
 
D
S
 
Y
S
 
Q
L
 
T
G
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
I
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
G
Q
 
K
V
 
V
H
 
R
F
 
M
V
 
L
A
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
 
D
Q
 
P
F
 
F
S
 
G
H
 
Q
L
 
A
A
 
L
A
 
K
D
 
S
H
 
G
L
 
L
T
 
A
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
I
 
V
H
 
D
S
 
V
Y
 
A
T
 
W
L
 
V
Y
 
L
Q
 
E
S
 
T
E
 
P
S
 
G
E
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
G
N
 
T
A
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
L
V
 
V
S
 
D
Q
 
P
E
 
E
N
 
-
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
Q
I
 
I
A
 
A
I
 
V
Y
 
A
S
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
A
T
 
R
I
 
L
T
 
V
Y
 
P
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
P
K
 
A
I
 
T
I
 
-
P
 
-
E
 
A
L
 
F
S
 
Q
S
 
G
S
 
V
D
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
N
 
I
N
 
P
F
 
L
D
 
E
A
 
T
T
 
V
H
 
V
S
 
R
L
 
A
I
 
A
K
 
A
I
 
L
A
 
G
H
 
R
E
 
K
L
 
A
G
 
G
K
 
A
Q
 
R
V
 
I
I
 
L
L
 
L
N
 
N
P
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
H
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
L
P
 
Q
S
 
S
I
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
V
D
 
D
V
 
L
I
 
L
T
 
L
P
 
V
N
|
N
E
 
E
T
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
A
L
 
Q
L
 
L
S
 
T
G
 
-
I
 
-
D
 
E
I
 
A
S
 
S
D
 
P
F
 
P
D
 
R
T
 
T
A
 
P
K
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
R
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
-
A
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
P
A
 
Q
K
 
A
K
 
Q
V
 
V
L
 
V
I
 
L
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
V
L
 
W
L
 
S
D
 
G
N
 
T
R
 
E
Q
 
E
F
 
-
S
 
S
H
 
H
I
 
F
R
 
P
A
 
A
F
 
F
P
 
P
A
 
V
V
 
R
T
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
|
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
F
|
F
N
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
L
S
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
S
 
N
L
 
M
V
 
R
Q
 
A
A
 
A
A
 
L
T
 
R
W
 
F
A
 
A
S
x
N
A
 
A
F
 
A
A
x
G
S
x
A
L
 
L
A
|
A
V
x
T
E
 
T
L
 
R
E
 
P
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6a8cA Ribokinase from leishmania donovani with adp (see paper)
32% identity, 71% coverage: 102:386/403 of query aligns to 16:311/327 of 6a8cA

query
sites
6a8cA
V
 
I
C
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
F
V
 
L
D
|
D
I
 
Y
V
 
V
A
 
G
K
 
Y
V
 
V
E
 
D
R
 
H
F
 
M
P
 
P
R
 
Q
G
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
M
M
 
H
A
x
S
L
 
V
G
x
S
S
 
F
S
 
H
L
 
K
G
 
G
P
 
F
G
|
G
G
|
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
A
F
 
M
V
 
V
A
 
S
K
 
M
V
 
V
G
 
G
K
 
T
D
 
D
Q
 
G
F
 
D
S
 
G
H
 
S
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
K
H
 
E
L
 
L
T
 
E
R
 
R
S
 
N
A
 
G
I
 
V
H
 
D
S
 
T
Y
 
A
T
 
Y
L
 
M
Y
 
F
Q
 
R
S
 
T
E
 
G
S
 
K
E
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
L
A
 
A
I
 
M
I
 
I
Y
 
L
V
 
V
S
 
D
Q
 
T
E
 
K
N
 
S
G
 
S
E
 
N
N
 
N
M
 
E
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
C
S
 
P
G
 
N
A
 
A
N
 
T
T
 
N
T
 
H
I
 
F
T
 
T
Y
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
H
S
 
T
S
 
G
S
 
L
D
 
K
V
 
Y
L
 
L
L
 
I
V
 
C
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
N
 
I
N
 
P
F
 
L
D
 
P
A
 
T
T
 
T
H
 
L
S
 
D
L
 
T
I
 
I
K
 
K
I
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
S
L
 
R
G
 
G
K
 
V
Q
 
Y
V
 
T
I
 
V
L
 
F
N
 
N
-
 
S
-
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
K
S
 
P
A
 
A
E
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
I
 
I
I
 
K
P
 
P
S
 
F
I
 
L
P
 
P
F
 
Y
V
 
V
D
 
S
V
 
L
I
 
F
T
 
C
P
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
T
L
 
L
L
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
K
I
 
V
S
 
T
D
 
D
F
 
T
D
 
E
T
 
S
A
 
A
K
 
F
E
 
S
A
 
A
A
 
I
L
 
K
R
 
A
I
 
L
A
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
V
K
 
R
K
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
M
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
A
G
 
G
A
 
F
L
 
V
L
 
L
L
 
S
D
 
E
N
 
N
-
 
G
R
 
A
Q
 
E
F
 
P
S
 
V
H
 
H
I
 
V
R
 
T
A
 
G
F
 
K
P
 
H
A
 
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
A
 
C
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
S
L
 
M
A
 
V
A
 
Y
S
 
F
L
 
M
A
 
S
A
 
R
G
 
G
N
 
R
S
 
N
L
 
L
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
C
T
 
K
W
 
R
A
 
A
S
x
N
A
 
E
F
 
C
A
|
A
S
 
A
L
 
I
A
 
S
V
 
V
E
 
T
L
 
R
E
 
K
G
 
G

6a8bA Ribokinase from leishmania donovani with amppcp (see paper)
32% identity, 71% coverage: 102:386/403 of query aligns to 16:311/327 of 6a8bA

query
sites
6a8bA
V
 
I
C
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
F
V
 
L
D
|
D
I
 
Y
V
 
V
A
 
G
K
 
Y
V
 
V
E
 
D
R
 
H
F
 
M
P
 
P
R
 
Q
G
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
M
M
 
H
A
 
S
L
 
V
G
 
S
S
 
F
S
 
H
L
 
K
G
 
G
P
 
F
G
|
G
G
|
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
A
F
 
M
V
 
V
A
 
S
K
 
M
V
 
V
G
 
G
K
 
T
D
 
D
Q
 
G
F
 
D
S
 
G
H
 
S
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
K
H
 
E
L
 
L
T
 
E
R
 
R
S
 
N
A
 
G
I
 
V
H
 
D
S
 
T
Y
 
A
T
 
Y
L
 
M
Y
 
F
Q
 
R
S
 
T
E
 
G
S
 
K
E
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
L
A
 
A
I
 
M
I
 
I
Y
 
L
V
 
V
S
 
D
Q
 
T
E
 
K
N
 
S
G
 
S
E
 
N
N
 
N
M
 
E
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
C
S
 
P
G
 
N
A
 
A
N
 
T
T
 
N
T
 
H
I
 
F
T
 
T
Y
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
H
S
 
T
S
 
G
S
 
L
D
 
K
V
 
Y
L
 
L
L
 
I
V
 
C
Q
 
Q
L
x
N
E
 
E
N
x
I
N
 
P
F
 
L
D
 
P
A
 
T
T
 
T
H
 
L
S
 
D
L
 
T
I
 
I
K
 
K
I
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
S
L
 
R
G
 
G
K
 
V
Q
 
Y
V
 
T
I
 
V
L
 
F
N
 
N
-
 
S
-
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
K
S
 
P
A
 
A
E
|
E
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
I
 
I
I
 
K
P
 
P
S
 
F
I
 
L
P
 
P
F
 
Y
V
 
V
D
 
S
V
 
L
I
 
F
T
 
C
P
 
P
N
 
N
E
 
E
T
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
T
L
 
L
L
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
K
I
 
V
S
 
T
D
 
D
F
 
T
D
 
E
T
 
S
A
 
A
K
 
F
E
 
S
A
 
A
A
 
I
L
 
K
R
 
A
I
 
L
A
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
V
K
 
R
K
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
M
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
A
G
 
G
A
 
F
L
 
V
L
 
L
L
 
S
D
 
E
N
 
N
-
 
G
R
 
A
Q
 
E
F
 
P
S
 
V
H
 
H
I
 
V
R
 
T
A
 
G
F
 
K
P
 
H
A
 
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
A
 
C
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
S
L
 
M
A
 
V
A
 
Y
S
 
F
L
 
M
A
 
S
A
 
R
G
 
G
N
 
R
S
 
N
L
 
L
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
C
T
 
K
W
 
R
A
 
A
S
x
N
A
 
E
F
 
C
A
|
A
S
 
A
L
 
I
A
 
S
V
|
V
E
 
T
L
 
R
E
 
K
G
 
G

6a8aA Ribokinase from leishmania donovani with atp (see paper)
32% identity, 71% coverage: 102:386/403 of query aligns to 16:311/327 of 6a8aA

query
sites
6a8aA
V
 
I
C
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
C
N
 
F
V
 
L
D
|
D
I
 
Y
V
 
V
A
 
G
K
 
Y
V
 
V
E
 
D
R
 
H
F
 
M
P
 
P
R
 
Q
G
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
M
M
 
H
A
 
S
L
 
V
G
 
S
S
 
F
S
 
H
L
 
K
G
 
G
P
 
F
G
|
G
G
|
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
A
F
 
M
V
 
V
A
 
S
K
 
M
V
 
V
G
 
G
K
 
T
D
 
D
Q
 
G
F
 
D
S
 
G
H
 
S
L
 
D
A
 
Y
A
 
I
D
 
K
H
 
E
L
 
L
T
 
E
R
 
R
S
 
N
A
 
G
I
 
V
H
 
D
S
 
T
Y
 
A
T
 
Y
L
 
M
Y
 
F
Q
 
R
S
 
T
E
 
G
S
 
K
E
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
L
A
 
A
I
 
M
I
 
I
Y
 
L
V
 
V
S
 
D
Q
 
T
E
 
K
N
 
S
G
 
S
E
 
N
N
 
N
M
 
E
I
 
I
A
 
V
I
 
I
Y
 
C
S
 
P
G
 
N
A
 
A
N
 
T
T
 
N
T
 
H
I
 
F
T
 
T
Y
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
H
S
 
T
S
 
G
S
 
L
D
 
K
V
 
Y
L
 
L
L
 
I
V
 
C
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
N
 
I
N
 
P
F
 
L
D
 
P
A
 
T
T
 
T
H
 
L
S
 
D
L
 
T
I
 
I
K
 
K
I
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
S
L
 
R
G
 
G
K
 
V
Q
 
Y
V
 
T
I
 
V
L
 
F
N
 
N
-
 
S
-
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
K
S
 
P
A
 
A
E
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
I
 
I
I
 
K
P
 
P
S
 
F
I
 
L
P
 
P
F
 
Y
V
 
V
D
 
S
V
 
L
I
 
F
T
 
C
P
 
P
N
|
N
E
 
E
T
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
T
L
 
L
L
 
I
S
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
K
I
 
V
S
 
T
D
 
D
F
 
T
D
 
E
T
 
S
A
 
A
K
 
F
E
 
S
A
 
A
A
 
I
L
 
K
R
 
A
I
 
L
A
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
V
K
 
R
K
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
|
T
M
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
A
G
|
G
A
 
F
L
 
V
L
 
L
L
 
S
D
 
E
N
 
N
-
 
G
R
 
A
Q
 
E
F
 
P
S
 
V
H
 
H
I
 
V
R
 
T
A
 
G
F
 
K
P
 
H
A
 
V
V
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
A
 
C
F
 
F
N
 
V
G
 
G
A
 
S
L
 
M
A
 
V
A
 
Y
S
 
F
L
 
M
A
 
S
A
 
R
G
 
G
N
 
R
S
 
N
L
 
L
V
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
C
T
 
K
W
 
R
A
 
A
S
x
N
A
 
E
F
 
C
A
|
A
S
 
A
L
 
I
A
 
S
V
|
V
E
 
T
L
 
R
E
 
K
G
 
G

6znxC Ribokinase from thermus species
31% identity, 71% coverage: 102:387/403 of query aligns to 2:249/265 of 6znxC

query
sites
6znxC
V
 
I
C
 
L
V
 
V
F
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
L
N
 
N
V
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
V
A
 
L
K
 
R
V
 
E
E
 
D
R
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
Y
S
 
Q
L
 
T
G
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
I
S
 
A
K
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
G
Q
 
K
V
 
V
H
 
R
F
 
M
V
 
L
A
 
G
K
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
 
D
Q
 
P
F
 
F
S
 
G
H
 
Q
L
 
A
A
 
L
A
 
K
D
 
S
H
 
G
L
 
L
T
 
A
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
I
 
V
H
 
D
S
 
V
Y
 
A
T
 
W
L
 
V
Y
 
L
Q
 
E
S
 
T
E
 
P
S
 
G
E
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
G
N
 
T
A
 
A
I
 
F
I
 
V
Y
 
-
V
 
-
S
 
-
Q
 
D
E
 
P
N
 
E
G
 
G
E
 
Q
N
 
N
M
 
Q
I
 
I
A
 
A
I
 
V
Y
 
A
S
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
N
T
 
A
T
 
R
I
 
L
T
 
V
Y
 
P
S
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
P
K
 
A
I
 
T
I
 
-
P
 
-
E
 
A
L
 
F
S
 
Q
S
 
G
S
 
V
D
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
N
 
I
N
 
P
F
 
L
D
 
E
A
 
T
T
 
V
H
 
V
S
 
R
L
 
A
I
 
A
K
 
A
I
 
L
A
 
G
H
 
R
E
 
K
L
 
A
G
 
G
K
 
A
Q
 
R
V
 
I
I
 
L
L
 
L
N
 
N
P
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
 
A
S
 
H
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
L
P
 
Q
S
 
S
I
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
V
D
 
D
V
 
L
I
 
L
T
 
L
P
 
V
N
|
N
E
 
E
T
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
A
L
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
Q
A
 
A
A
 
L
L
 
A
R
 
R
I
 
Q
A
 
L
R
 
R
L
 
-
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
K
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
-
T
 
-
M
x
L
G
|
G
S
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
W
L
 
-
D
 
-
N
 
S
R
 
G
Q
 
E
F
 
E
S
 
S
H
 
H
I
 
F
R
 
P
A
 
A
F
 
F
P
 
P
A
 
V
V
 
R
T
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
F
|
F
N
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
L
S
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
S
 
N
L
 
M
V
 
R
Q
 
A
A
 
A
A
 
L
T
 
R
W
 
F
A
 
A
S
x
N
A
 
A
F
 
A
A
x
G
S
x
A
L
 
L
A
 
A
V
x
T
E
 
T
L
 
R
E
 
P
G
 
G
A
 
A

3i3yD Crystal structure of ribokinase in complex with d-ribose from klebsiella pneumoniae
28% identity, 65% coverage: 101:360/403 of query aligns to 2:241/285 of 3i3yD

query
sites
3i3yD
K
 
R
V
 
V
C
 
Y
V
 
V
F
 
T
G
 
G
S
 
N
F
 
I
N
 
T
V
 
V
D
|
D
I
 
E
V
 
T
A
 
W
K
 
S
V
 
I
E
 
P
R
 
D
F
 
I
P
 
P
R
 
K
G
 
K
G
 
G
E
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
V
G
 
K
S
 
V
S
 
S
L
 
Q
G
 
D
P
 
I
G
|
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
I
A
 
L
S
 
S
K
 
R
A
 
C
G
 
G
A
 
I
Q
 
E
V
 
T
H
 
R
F
 
L
V
 
I
A
 
A
K
 
A
V
 
T
G
 
G
K
 
N
D
 
D
Q
 
S
F
 
N
S
 
G
H
 
A
L
 
W
A
 
I
A
 
R
D
 
Q
H
 
Q
L
 
I
T
 
K
R
 
N
S
 
E
A
 
P
I
 
L
H
 
-
S
 
-
Y
 
M
T
 
L
L
 
L
Y
 
P
Q
 
D
S
 
G
E
 
H
S
 
F
E
 
N
P
 
Q
T
 
H
G
 
S
N
 
D
A
 
T
I
x
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
S
E
 
A
N
 
D
G
 
G
E
 
D
N
 
N
M
 
A
I
 
I
A
 
I
I
 
T
Y
 
T
S
 
T
G
 
A
A
 
A
N
 
A
T
 
D
T
 
T
I
 
F
T
 
S
Y
 
L
S
 
D
E
 
E
I
 
M
Q
 
I
K
 
P
I
 
H
I
 
M
P
 
A
E
 
D
L
 
A
S
 
V
S
 
A
S
 
G
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
Q
Q
 
Q
L
 
G
E
 
N
N
 
F
N
 
S
F
 
L
D
 
D
A
 
K
T
 
T
H
 
R
S
 
A
L
 
L
I
 
F
K
 
Q
I
 
Y
A
 
A
H
 
R
E
 
S
L
 
R
G
 
G
K
 
M
Q
 
T
V
 
T
I
 
V
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
S
P
 
P
Y
 
V
S
 
N
A
 
P
E
 
D
I
 
F
I
 
C
P
 
H
S
 
L
I
 
W
P
 
P
F
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
I
I
 
A
T
 
V
P
 
V
N
 
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
G
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
V
K
 
K
K
 
T
V
 
L
L
 
V
I
 
I
T
 
T
M
 
Q
G
 
G
S
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
L
L
 
V
D
 
Q
N
 
E
R
 
G
Q
 
Q
F
 
R
S
 
Q
H
 
F
I
 
C
R
 
P
A
 
A
F
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
E
T
 
A
V
 
L
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
 
F
N
 
L
G
 
A
A
 
V
L
 
M
A
 
L
A
 
A
S
 
S

3ikhA Crystal structure of ribokinase in complex with atp and glycerol in the active site from klebsiella pneumoniae
28% identity, 65% coverage: 101:360/403 of query aligns to 3:242/286 of 3ikhA

query
sites
3ikhA
K
 
R
V
 
V
C
 
Y
V
 
V
F
 
T
G
 
G
S
 
N
F
 
I
N
 
T
V
 
V
D
 
D
I
 
E
V
 
T
A
 
W
K
 
S
V
 
I
E
 
P
R
 
D
F
 
I
P
 
P
R
 
K
G
 
K
G
 
G
E
 
A
S
 
S
L
 
I
M
 
H
A
 
G
L
 
V
G
 
K
S
 
V
S
 
S
L
 
Q
G
 
D
P
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
I
A
 
L
S
 
S
K
 
R
A
 
C
G
 
G
A
 
I
Q
 
E
V
 
T
H
 
R
F
 
L
V
 
I
A
 
A
K
 
A
V
 
T
G
 
G
K
 
N
D
 
D
Q
 
S
F
 
N
S
 
G
H
 
A
L
 
W
A
 
I
A
 
R
D
 
Q
H
 
Q
L
 
I
T
 
K
R
 
N
S
 
E
A
 
P
I
 
L
H
 
-
S
 
-
Y
 
M
T
 
L
L
 
L
Y
 
P
Q
 
D
S
 
G
E
 
H
S
 
F
E
 
N
P
 
Q
T
 
H
G
 
S
N
 
D
A
 
T
I
 
S
I
 
I
Y
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
S
E
 
A
N
 
D
G
 
G
E
 
D
N
 
N
M
 
A
I
 
I
A
 
I
I
 
T
Y
 
T
S
 
T
G
 
A
A
 
A
N
 
A
T
 
D
T
 
T
I
 
F
T
 
S
Y
 
L
S
 
D
E
 
E
I
 
M
Q
 
I
K
 
P
I
 
H
I
 
M
P
 
A
E
 
D
L
 
A
S
 
V
S
 
A
S
 
G
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
Q
Q
 
Q
L
 
G
E
 
N
N
 
F
N
 
S
F
 
L
D
 
D
A
 
K
T
 
T
H
 
R
S
 
A
L
 
L
I
 
F
K
 
Q
I
 
Y
A
 
A
H
 
R
E
 
S
L
 
R
G
 
G
K
 
M
Q
 
T
V
 
T
I
 
V
L
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
S
P
 
P
Y
 
V
S
 
N
A
 
P
E
 
D
I
 
F
I
 
C
P
 
H
S
 
L
I
 
W
P
 
P
F
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
I
I
 
A
T
 
V
P
 
V
N
|
N
E
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
G
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
V
K
 
K
K
 
T
V
 
L
L
 
V
I
 
I
T
|
T
M
 
Q
G
|
G
S
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
L
L
 
V
D
 
Q
N
 
E
R
 
G
Q
 
Q
F
 
R
S
 
Q
H
 
F
I
 
C
R
 
P
A
 
A
F
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
E
T
 
A
V
 
L
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
F
|
F
N
 
L
G
 
A
A
 
V
L
 
M
A
 
L
A
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BWI76_RS00580 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS00580
MFLEERRKSILRYLDEHERGYVNYFSAHFNVTKETIRSDLNTLAAMGLVQRCYGGAIISR
RSLQAELISETGDSFEVLLQPLNHRKSPGDERQKGKVMQGKVCVFGSFNVDIVAKVERFP
RGGESLMALGSSLGPGGKGANQATAASKAGAQVHFVAKVGKDQFSHLAADHLTRSAIHSY
TLYQSESEPTGNAIIYVSQENGENMIAIYSGANTTITYSEIQKIIPELSSSDVLLVQLEN
NFDATHSLIKIAHELGKQVILNPAPYSAEIIPSIPFVDVITPNETEASLLSGIDISDFDT
AKEAALRIARLGAKKVLITMGSRGALLLDNRQFSHIRAFPAVTVDTTGAGDAFNGALAAS
LAAGNSLVQAATWASAFASLAVELEGASNMPEFEQANARLRTL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory