SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Dsui_2116 FitnessBrowser__PS:Dsui_2116 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1vljB Crystal structure of nadh-dependent butanol dehydrogenase a (tm0820) from thermotoga maritima at 1.78 a resolution
48% identity, 93% coverage: 1:357/382 of query aligns to 6:366/400 of 1vljB

query
sites
1vljB
M
 
M
D
 
E
N
 
N
F
 
F
T
 
V
F
 
F
F
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
Q
 
K
V
 
I
E
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
D
 
G
K
 
T
E
 
I
Q
 
P
A
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
E
L
 
I
A
 
K
E
 
N
H
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
R
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
F
C
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
x
G
E
 
G
R
x
S
I
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
G
 
D
V
 
Q
V
 
V
S
 
V
K
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
K
E
 
K
Q
 
H
G
 
G
I
 
I
T
 
E
F
 
W
V
 
V
E
 
E
C
 
V
G
 
S
G
 
G
I
 
V
V
 
K
S
x
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
S
 
S
K
 
K
V
 
V
R
 
H
E
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
K
D
 
K
H
 
E
Q
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
L
 
L
S
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
D
|
D
S
 
S
S
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
A
P
 
L
Y
 
Y
A
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
W
 
W
D
 
D
L
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
Y
R
 
Q
I
 
I
E
 
E
S
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
A
 
S
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
x
T
E
 
E
M
 
M
N
|
N
N
 
G
G
x
N
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
N
 
N
E
 
E
A
 
K
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
|
K
F
 
Y
A
 
G
I
 
V
T
 
S
S
 
S
V
 
K
H
 
A
T
 
L
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
V
M
 
Q
K
 
F
T
|
T
V
x
L
S
 
P
R
 
K
D
 
E
Y
x
Q
L
 
T
V
 
V
Y
 
Y
S
 
G
A
 
A
A
 
V
D
|
D
V
 
A
I
 
I
A
 
S
H
|
H
A
 
I
I
 
L
E
 
E
G
 
Y
Y
 
Y
F
 
F
T
 
D
A
 
G
K
 
-
D
 
S
E
 
S
P
 
P
R
 
E
F
 
I
Q
 
S
S
 
N
R
 
E
L
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
G
I
 
T
I
 
I
N
 
R
T
 
T
V
 
I
I
 
M
E
 
K
T
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
E
D
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
D
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
N
F
 
L
A
 
A
W
 
W
A
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
T
L
 
M
Y
 
A
A
 
V
G
 
G
I
 
R
S
 
R
G
 
G
Y
 
G
S
 
E
Y
 
W
P
 
A
N
 
C
H
|
H
M
 
R
I
 
I
E
 
E
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
D
V
 
I
P
 
A
H
|
H
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
M
 
F
P
 
P
A
 
A
W
 
W
M
 
M
K
 
K
W
 
Y
Y
 
V
H
 
Y
S
 
R
R
 
K
N
 
N
P
 
P
V
 
A
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
K
 
K
Y
 
K
V
 
I
F
 
F
G
 
G
V
 
F
E
 
E
T
 
G
A
 
E
E
 
G
Q
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
F
E
 
K
K
 
N
W
 
W
F
 
L
D
 
K
K
 
K
I
 
V
G
 
G
T
 
A
P
 
P
T
 
V
R
 
S
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
L
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
P
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
D
K
 
K
T
 
I
I
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
M

7w9yA Crystal structure of bacillus subtilis yugj in complex with NADP and nickel (see paper)
39% identity, 100% coverage: 1:382/382 of query aligns to 3:389/389 of 7w9yA

query
sites
7w9yA
M
 
M
D
 
H
N
 
N
F
 
F
T
 
T
F
 
Y
F
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
T
Q
 
K
V
 
L
E
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
R
D
 
G
K
 
E
E
 
V
Q
 
E
A
 
R
I
 
L
G
 
P
R
 
E
H
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
S
H
 
Y
G
 
G
I
 
-
K
 
K
K
 
N
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
V
Y
 
Y
G
|
G
S
x
G
E
 
G
R
x
S
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
G
 
D
V
 
Q
V
 
V
S
 
I
K
 
E
S
 
Q
L
 
L
A
 
N
E
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
H
E
 
E
C
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
E
S
x
P
N
|
N
P
 
P
V
 
R
I
 
V
S
 
S
K
 
T
V
 
V
R
 
N
E
 
K
A
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
C
R
 
K
D
 
E
H
 
H
Q
 
H
V
 
I
E
 
D
A
 
F
I
 
L
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
C
S
 
T
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
A
P
 
K
Y
 
Y
A
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
I
F
 
V
I
 
T
G
 
K
K
 
K
G
 
H
R
 
Q
I
 
P
E
 
K
S
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
F
F
 
G
D
 
T
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
A
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
S
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
I
T
 
T
N
 
N
E
 
W
A
 
E
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
|
K
F
 
Y
A
 
G
I
 
W
T
 
G
S
 
S
V
 
P
H
 
L
T
 
V
Y
 
F
P
 
P
K
 
K
V
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
L
N
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
N
M
 
T
K
 
F
T
|
T
V
|
V
S
x
P
R
 
K
D
 
N
Y
x
H
L
 
T
V
 
I
Y
 
Y
S
 
G
A
 
M
A
 
V
D
 
D
V
 
M
I
 
M
A
 
S
H
 
H
A
 
V
I
 
F
E
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
T
 
H
A
 
H
K
 
V
D
 
S
E
 
N
P
 
T
R
 
P
F
 
Y
Q
 
Q
S
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
C
E
 
E
A
 
S
I
 
L
I
 
L
N
 
R
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
T
 
T
T
 
A
E
 
P
T
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
N
D
 
D
P
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
T
F
 
I
A
 
L
W
 
Y
A
 
T
A
 
G
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
L
Y
 
S
A
 
M
G
 
G
I
 
A
S
 
R
G
 
G
Y
 
-
S
 
D
Y
 
W
P
 
A
N
 
T
H
 
H
M
 
N
I
 
I
E
 
E
H
 
H
S
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
V
F
 
Y
N
 
D
V
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
A
A
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
L
M
 
F
P
 
P
A
 
N
W
 
W
M
 
M
K
 
R
W
 
H
Y
 
T
H
 
L
S
 
S
R
 
E
N
 
N
P
 
P
V
 
A
Q
 
R
F
 
M
Q
 
K
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
K
 
V
Y
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
D
-
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
A
E
 
L
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
D
A
 
K
L
 
L
E
 
S
K
 
A
W
 
F
F
 
W
D
 
T
K
 
S
I
 
L
G
 
G
T
 
A
P
 
P
T
 
N
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
D
L
 
Y
G
 
D
I
 
I
S
 
N
E
 
D
A
 
E
D
 
Q
L
 
L
P
 
D
K
 
T
T
 
I
I
 
A
D
 
D
N
 
K
V
 
A
L
 
M
G
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
T
H
 
-
F
 
F
G
 
G
V
 
Q
A
 
F
E
 
K
T
 
S
Y
 
L
P
 
N
R
 
K
D
 
E
V
 
D
V
 
V
A
 
L
T
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
K
S
 
A
A
 
S
L
 
L

7w9zA Crystal structure of bacillus subtilis yugj in complex with NADP and nitrate (see paper)
39% identity, 99% coverage: 3:382/382 of query aligns to 2:381/381 of 7w9zA

query
sites
7w9zA
N
 
N
F
 
F
T
 
T
F
 
Y
F
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
T
Q
 
K
V
 
L
E
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
R
D
 
G
K
 
E
E
 
V
Q
 
E
A
 
R
I
 
L
G
 
P
R
 
E
H
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
S
H
 
Y
G
 
G
I
 
-
K
 
K
K
 
N
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
V
Y
 
Y
G
|
G
S
x
G
E
 
G
R
x
S
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
G
 
D
V
 
Q
V
 
V
S
 
I
K
 
E
S
 
Q
L
 
L
A
 
N
E
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
H
E
 
E
C
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
E
S
x
P
N
 
N
P
 
P
V
x
R
I
x
V
S
|
S
K
 
T
V
 
V
R
 
N
E
 
K
A
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
C
R
 
K
D
 
E
H
 
H
Q
 
H
V
 
I
E
 
D
A
 
F
I
 
L
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
L
 
I
D
|
D
S
 
C
S
 
T
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
A
P
 
K
Y
 
Y
A
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
A
W
 
W
D
 
D
L
 
I
F
 
V
I
 
T
G
 
K
K
 
K
G
 
H
R
 
Q
I
 
P
E
 
K
S
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
F
F
 
G
D
 
T
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
A
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
|
N
N
 
S
G
|
G
A
 
S
V
|
V
V
 
I
T
 
T
N
|
N
E
x
W
A
x
E
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
|
K
F
 
Y
A
 
G
I
 
W
T
 
G
S
 
S
V
 
P
H
 
L
T
 
V
Y
 
F
P
 
P
K
 
K
V
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
L
N
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
N
M
 
T
K
 
F
T
|
T
V
|
V
S
x
P
R
 
K
D
 
N
Y
x
H
L
 
T
V
 
I
Y
 
Y
S
 
G
A
 
M
A
 
V
D
 
D
V
 
M
I
 
M
A
 
S
H
 
H
A
 
V
I
 
F
E
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
T
 
H
A
 
H
K
 
V
D
 
S
E
 
N
P
 
T
R
 
P
F
 
Y
Q
 
Q
S
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
C
E
 
E
A
 
S
I
 
L
I
 
L
N
 
R
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
T
 
T
T
 
A
E
 
P
T
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
N
D
 
D
P
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
T
F
 
I
A
 
L
W
 
Y
A
 
T
A
 
G
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
L
Y
 
S
A
 
M
G
 
G
I
 
A
S
 
R
G
 
G
Y
 
-
S
 
D
Y
x
W
P
 
A
N
 
T
H
 
H
M
 
N
I
 
I
E
 
E
H
|
H
S
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
V
F
 
Y
N
 
D
V
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
A
A
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
L
M
 
F
P
 
P
A
 
N
W
 
W
M
 
M
K
 
R
W
 
H
Y
 
T
H
 
L
S
 
S
R
 
E
N
 
N
P
 
P
V
 
A
Q
 
R
F
 
M
Q
 
K
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
K
 
V
Y
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
D
-
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
A
E
 
L
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
D
A
 
K
L
 
L
E
 
S
K
 
A
W
 
F
F
 
W
D
 
T
K
 
S
I
 
L
G
 
G
T
 
A
P
 
P
T
 
N
R
 
R
L
 
L
S
 
A
Q
 
D
L
 
Y
G
 
D
I
 
I
S
 
N
E
 
D
A
 
E
D
 
Q
L
 
L
P
 
D
K
 
T
T
 
I
I
 
A
D
 
D
N
 
K
V
 
A
L
 
M
G
 
A
N
 
Q
A
 
-
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
F
E
 
K
T
 
S
Y
 
L
P
 
N
R
 
K
D
 
E
V
 
D
V
 
V
A
 
L
T
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
K
S
 
A
A
 
S
L
 
L

8i29A Crystal structure of butanol dehydrogenase a (yqdh) in complex with nadh from fusobacterium nucleatum
34% identity, 99% coverage: 2:381/382 of query aligns to 1:383/384 of 8i29A

query
sites
8i29A
D
 
D
N
 
N
F
 
F
T
 
N
F
 
Y
F
 
K
N
 
N
P
 
D
T
 
T
Q
 
K
V
 
I
E
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
D
K
 
N
E
 
Y
Q
 
S
A
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
K
H
 
N
L
 
I
A
 
K
E
 
I
H
 
F
G
 
S
I
 
K
K
 
K
-
 
T
-
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
H
Y
 
Y
G
 
E
S
 
A
-
 
D
-
 
G
E
 
E
R
 
L
I
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
L
G
 
G
L
 
I
F
 
Y
G
 
E
V
 
K
V
 
V
S
 
I
K
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
F
G
 
D
I
 
I
T
 
E
F
 
F
V
 
I
E
 
E
C
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
R
I
 
L
S
 
S
K
 
L
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
A
 
G
I
 
I
A
 
K
L
 
I
A
 
C
R
 
K
D
 
E
H
 
E
Q
 
N
V
 
I
E
 
T
A
 
F
I
 
I
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
x
A
S
 
S
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
S
S
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
V
Y
 
D
A
 
N
G
 
G
D
 
D
V
 
V
W
 
W
D
 
D
L
 
F
F
 
F
I
 
T
G
 
A
K
 
K
G
 
R
R
 
I
I
 
P
E
 
Q
S
 
D
A
 
T
L
 
L
P
 
G
V
 
I
F
 
G
D
 
V
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
A
 
P
A
 
G
T
x
A
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
M
N
x
S
N
 
E
G
x
S
A
 
S
V
x
I
V
 
I
T
 
T
N
 
D
E
 
E
A
 
N
T
 
K
Q
 
K
E
 
Q
K
 
K
F
 
A
A
 
V
I
 
C
T
 
D
S
 
T
V
 
E
H
 
V
T
 
N
Y
 
F
P
 
P
K
 
K
V
 
F
S
 
A
I
 
I
V
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
V
M
 
C
K
 
Y
T
|
T
V
x
I
S
 
P
R
 
D
D
 
R
Y
x
L
L
 
M
V
 
A
Y
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
S
H
 
H
A
 
L
I
 
M
E
|
E
G
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
T
A
 
K
K
 
S
D
 
I
E
 
D
P
 
T
R
 
A
F
 
L
Q
 
S
S
 
D
R
 
S
L
 
L
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
T
I
 
M
N
 
K
T
 
I
V
 
V
I
 
I
E
 
K
T
 
Y
T
 
G
E
 
P
T
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
D
 
D
P
 
R
E
 
K
N
 
N
Y
 
Y
E
 
N
A
 
Y
R
 
C
A
 
S
E
 
Q
F
 
I
A
 
M
W
 
W
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
M
A
 
A
L
 
H
N
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
I
Y
 
A
A
 
C
G
 
G
I
 
R
S
 
V
G
 
A
Y
 
-
S
 
D
Y
 
W
P
 
A
N
 
S
H
|
H
M
 
R
I
 
I
E
 
E
H
 
H
S
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
G
L
 
I
F
 
Y
N
 
D
V
 
L
P
 
T
H
|
H
G
 
G
A
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
A
V
 
I
V
 
I
M
 
F
P
 
P
A
 
A
W
 
W
M
 
M
K
 
K
W
 
Y
Y
 
T
H
 
K
S
 
N
R
 
I
N
 
R
P
 
P
V
 
Q
Q
 
I
F
 
F
Q
 
E
R
 
K
F
 
F
A
 
F
K
 
K
Y
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
N
V
 
T
E
 
V
T
 
N
A
 
I
E
 
D
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
N
A
 
K
L
 
L
E
 
E
K
 
E
W
 
F
F
 
F
D
 
K
K
 
S
I
 
L
G
 
G
T
 
I
P
 
N
T
 
L
R
 
K
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
T
E
 
E
A
 
E
D
 
Y
L
 
F
P
 
S
K
 
L
T
 
M
I
 
A
D
 
E
N
 
K
V
 
A
L
 
L
G
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
E
H
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
R
A
 
F
E
 
M
T
 
Q
Y
 
L
P
 
N
R
 
K
D
 
Q
V
 
D
V
 
I
A
 
I
T
 
N
I
 
I
L
 
L
K
 
N
S
 
L
A
 
A

7fjgA Crystal structure of butanol dehydrogenase a (yqdh) in complex with partial nadh from fusobacterium nucleatum
34% identity, 99% coverage: 2:381/382 of query aligns to 1:383/384 of 7fjgA

query
sites
7fjgA
D
 
D
N
 
N
F
 
F
T
 
N
F
 
Y
F
 
K
N
 
N
P
 
D
T
 
T
Q
 
K
V
 
I
E
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
D
K
 
N
E
 
Y
Q
 
S
A
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
K
H
 
N
L
 
I
A
 
K
E
 
I
H
 
F
G
 
S
I
 
K
K
 
K
-
 
T
-
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
H
Y
 
Y
G
 
E
S
 
A
-
 
D
-
 
G
E
 
E
R
 
L
I
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
L
G
 
G
L
 
I
F
 
Y
G
 
E
V
 
K
V
 
V
S
 
I
K
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
F
G
 
D
I
 
I
T
 
E
F
 
F
V
 
I
E
 
E
C
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
R
I
 
L
S
 
S
K
 
L
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
A
 
G
I
 
I
A
 
K
L
 
I
A
 
C
R
 
K
D
 
E
H
 
E
Q
 
N
V
 
I
E
 
T
A
 
F
I
 
I
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
x
A
S
 
S
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
S
S
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
V
Y
 
D
A
 
N
G
 
G
D
 
D
V
 
V
W
 
W
D
 
D
L
 
F
F
 
F
I
 
T
G
 
A
K
 
K
G
 
R
R
 
I
I
 
P
E
 
Q
S
 
D
A
 
T
L
 
L
P
 
G
V
 
I
F
 
G
D
 
V
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
A
 
P
A
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
S
N
 
E
G
 
S
A
 
S
V
 
I
V
 
I
T
 
T
N
 
D
E
 
E
A
 
N
T
 
K
Q
 
K
E
 
Q
K
 
K
F
 
A
A
 
V
I
 
C
T
 
D
S
 
T
V
 
E
H
 
V
T
 
N
Y
 
F
P
 
P
K
 
K
V
 
F
S
 
A
I
 
I
V
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
V
M
 
C
K
 
Y
T
|
T
V
x
I
S
 
P
R
 
D
D
 
R
Y
 
L
L
 
M
V
 
A
Y
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
L
A
 
S
H
 
H
A
 
L
I
 
M
E
|
E
G
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
T
A
 
K
K
 
S
D
 
I
E
 
D
P
 
T
R
 
A
F
 
L
Q
 
S
S
 
D
R
 
S
L
 
L
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
T
I
 
M
N
 
K
T
 
I
V
 
V
I
 
I
E
 
K
T
 
Y
T
 
G
E
 
P
T
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
D
 
D
P
 
R
E
 
K
N
 
N
Y
 
Y
E
 
N
A
 
Y
R
 
C
A
 
S
E
 
Q
F
 
I
A
 
M
W
 
W
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
M
A
 
A
L
 
H
N
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
I
Y
 
A
A
 
C
G
 
G
I
 
R
S
 
V
G
 
A
Y
 
-
S
 
D
Y
 
W
P
 
A
N
 
S
H
|
H
M
 
R
I
 
I
E
 
E
H
 
H
S
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
G
L
 
I
F
 
Y
N
 
D
V
 
L
P
 
T
H
|
H
G
 
G
A
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
A
V
 
I
V
 
I
M
 
F
P
 
P
A
 
A
W
 
W
M
 
M
K
 
K
W
 
Y
Y
 
T
H
 
K
S
 
N
R
 
I
N
 
R
P
 
P
V
 
Q
Q
 
I
F
 
F
Q
 
E
R
 
K
F
 
F
A
 
F
K
 
K
Y
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
N
V
 
T
E
 
V
T
 
N
A
 
I
E
 
D
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
N
A
 
K
L
 
L
E
 
E
K
 
E
W
 
F
F
 
F
D
 
K
K
 
S
I
 
L
G
 
G
T
 
I
P
 
N
T
 
L
R
 
K
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
T
E
 
E
A
 
E
D
 
Y
L
 
F
P
 
S
K
 
L
T
 
M
I
 
A
D
 
E
N
 
K
V
 
A
L
 
L
G
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
E
H
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
R
A
 
F
E
 
M
T
 
Q
Y
 
L
P
 
N
R
 
K
D
 
Q
V
 
D
V
 
I
A
 
I
T
 
N
I
 
I
L
 
L
K
 
N
S
 
L
A
 
A

Q46856 Alcohol dehydrogenase YqhD; EC 1.1.1.2 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 92% coverage: 1:350/382 of query aligns to 1:354/387 of Q46856

query
sites
Q46856
M
 
M
D
 
N
N
 
N
F
 
F
T
 
N
F
 
L
F
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
Q
 
R
V
 
I
E
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
G
K
 
A
E
 
I
Q
 
A
A
 
G
I
 
L
G
 
R
R
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
E
 
H
H
 
D
G
 
A
I
 
-
K
 
-
K
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
I
C
 
T
Y
 
Y
G
 
G
S
x
G
E
x
G
R
x
S
I
 
V
K
 
K
R
 
K
D
 
T
G
 
G
L
 
V
F
 
L
G
 
D
V
 
Q
V
 
V
S
 
L
K
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
-
E
 
-
Q
 
K
G
 
G
I
 
M
T
 
D
F
 
V
V
 
L
E
 
E
C
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
E
S
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
S
 
E
K
 
T
V
 
L
R
 
M
E
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
V
R
 
R
D
 
E
H
 
Q
Q
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
F
I
 
L
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
|
V
L
|
L
D
|
D
S
 
G
S
 
T
K
 
K
A
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
A
P
 
N
Y
 
Y
A
 
P
G
 
E
D
 
N
V
 
I
-
 
D
-
 
P
W
 
W
D
 
H
L
 
I
F
 
L
I
 
Q
G
 
T
K
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
E
I
 
I
E
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
M
F
 
G
D
 
C
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
L
A
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
S
N
|
N
N
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
S
N
 
R
E
 
K
A
 
T
T
 
T
Q
 
G
E
 
D
K
|
K
F
 
Q
A
 
A
I
 
F
T
 
H
S
 
S
V
 
A
H
 
H
T
 
V
Y
 
Q
P
 
P
K
 
V
V
 
F
S
 
A
I
 
V
V
 
L
N
 
D
P
 
P
A
 
V
L
x
Y
M
x
T
K
x
Y
T
|
T
V
 
L
S
 
P
R
 
P
D
 
R
Y
 
Q
L
 
V
V
 
A
Y
 
N
S
 
G
A
 
V
A
 
V
D
|
D
V
 
A
I
 
F
A
 
V
H
|
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
F
 
V
T
 
T
A
 
K
K
 
P
D
 
V
E
 
D
P
 
A
R
 
K
F
 
I
Q
 
Q
S
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
A
E
 
E
A
 
G
I
 
I
I
 
L
N
 
L
T
 
T
V
 
L
I
 
I
E
 
E
T
 
D
T
 
G
E
 
P
T
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
P
 
P
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
D
A
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
N
F
 
V
A
 
M
W
 
W
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
P
G
 
-
Y
 
Q
S
 
D
Y
 
W
P
 
A
N
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
E
 
G
H
 
H
S
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
M
F
 
H
N
 
G
V
 
L
P
 
D
H
|
H
G
 
A
A
 
Q
G
 
T
L
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
A
W
 
L
M
 
W
K
 
N
W
 
E
Y
 
K
H
 
R
S
 
D
R
 
T
N
 
K
P
 
R
V
 
A
Q
 
K
F
 
L
Q
 
L
R
 
Q
F
 
Y
A
 
A
K
 
E
Y
 
R
V
 
V
F
 
W
G
 
N
V
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
D
E
 
E
T
 
R
A
 
I
E
 
D
Q
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
T
E
 
R
K
 
N
W
 
F
F
 
F
D
 
E
K
 
Q
I
 
L
G
 
G
T
 
V
P
 
P
T
 
T
R
 
H
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
S
 
D
E
 
G
A
 
S
D
 
S
L
 
I
P
 
P

1oj7B Structural genomics, unknown function crystal structure of e. Coli k-12 yqhd (see paper)
34% identity, 92% coverage: 1:350/382 of query aligns to 4:357/390 of 1oj7B

query
sites
1oj7B
M
 
L
D
 
N
N
 
N
F
 
F
T
 
N
F
 
L
F
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
Q
 
R
V
 
I
E
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
G
K
 
A
E
 
I
Q
 
A
A
 
G
I
 
L
G
 
R
R
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
E
 
H
H
 
D
G
 
A
I
 
-
K
 
-
K
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
I
C
 
T
Y
 
Y
G
 
G
S
x
G
E
 
G
R
x
S
I
 
V
K
 
K
R
 
K
D
 
T
G
 
G
L
 
V
F
 
L
G
 
D
V
 
Q
V
 
V
S
 
L
K
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
-
E
 
-
Q
 
K
G
 
G
I
 
M
T
 
D
F
 
V
V
 
L
E
 
E
C
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
E
S
x
P
N
|
N
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
S
 
E
K
 
T
V
 
L
R
 
M
E
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
V
R
 
R
D
 
E
H
 
Q
Q
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
F
I
 
L
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
L
 
L
D
|
D
S
 
G
S
 
T
K
 
K
A
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
A
P
 
N
Y
 
Y
A
 
P
G
 
E
-
 
N
-
 
I
D
 
D
V
 
P
W
 
W
D
 
H
L
 
I
F
 
L
I
 
Q
G
 
T
K
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
E
I
 
I
E
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
M
F
 
G
D
 
C
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
A
 
P
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
S
N
 
N
N
 
A
G
|
G
A
 
A
V
|
V
V
 
I
T
 
S
N
 
R
E
 
K
A
 
T
T
 
T
Q
 
G
E
 
D
K
|
K
F
 
Q
A
 
A
I
 
F
T
 
H
S
 
S
V
 
A
H
 
H
T
 
V
Y
 
Q
P
 
P
K
 
V
V
 
F
S
 
A
I
 
V
V
 
L
N
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
Y
M
 
T
K
 
Y
T
|
T
V
x
L
S
x
P
R
 
P
D
 
R
Y
x
Q
L
 
V
V
 
A
Y
 
N
S
 
G
A
 
V
A
 
V
D
|
D
V
 
A
I
 
F
A
 
V
H
|
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
F
 
V
T
 
T
A
 
K
K
 
P
D
 
V
E
 
D
P
 
A
R
 
K
F
 
I
Q
 
H
S
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
A
E
 
E
A
 
G
I
 
I
I
 
L
N
 
L
T
 
T
V
 
L
I
 
I
E
 
E
T
 
D
T
 
G
E
 
P
T
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
P
 
P
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
D
A
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
N
F
 
V
A
 
M
W
 
W
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
P
G
 
-
Y
 
Q
S
 
D
Y
 
W
P
 
A
N
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
E
 
G
H
 
H
S
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
M
F
 
H
N
 
G
V
 
L
P
 
D
H
|
H
G
 
A
A
 
Q
G
 
T
L
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
A
W
 
L
M
 
W
K
 
N
W
 
E
Y
 
K
H
 
R
S
 
D
R
 
T
N
 
K
P
 
R
V
 
A
Q
 
K
F
 
L
Q
 
L
R
 
Q
F
 
Y
A
 
A
K
 
E
Y
 
R
V
 
V
F
 
W
G
 
N
V
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
D
E
 
E
T
 
R
A
 
I
E
 
D
Q
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
T
E
 
R
K
 
N
W
 
F
F
 
F
D
 
E
K
 
Q
I
 
L
G
 
G
T
 
V
P
 
P
T
 
T
R
 
H
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
S
 
D
E
 
G
A
 
S
D
 
S
L
 
I
P
 
P

1oj7A Structural genomics, unknown function crystal structure of e. Coli k-12 yqhd (see paper)
34% identity, 92% coverage: 1:350/382 of query aligns to 4:357/390 of 1oj7A

query
sites
1oj7A
M
 
L
D
 
N
N
 
N
F
 
F
T
 
N
F
 
L
F
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
Q
 
R
V
 
I
E
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
G
K
 
A
E
 
I
Q
 
A
A
 
G
I
 
L
G
 
R
R
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
E
 
H
H
 
D
G
 
A
I
 
-
K
 
-
K
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
I
C
 
T
Y
 
Y
G
 
G
S
x
G
E
 
G
R
x
S
I
 
V
K
 
K
R
 
K
D
 
T
G
 
G
L
 
V
F
 
L
G
 
D
V
 
Q
V
 
V
S
 
L
K
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
-
E
 
-
Q
 
K
G
 
G
I
 
M
T
 
D
F
 
V
V
 
L
E
 
E
C
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
E
S
x
P
N
|
N
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
S
 
E
K
 
T
V
 
L
R
 
M
E
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
V
R
 
R
D
 
E
H
 
Q
Q
 
K
V
 
V
E
 
T
A
 
F
I
 
L
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
L
 
L
D
|
D
S
 
G
S
 
T
K
 
K
A
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
A
P
 
N
Y
 
Y
A
 
P
G
 
E
-
 
N
-
 
I
D
 
D
V
 
P
W
 
W
D
 
H
L
 
I
F
 
L
I
 
Q
G
 
T
K
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
E
I
 
I
E
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
M
F
 
G
D
 
C
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
A
 
P
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
S
N
|
N
N
 
A
G
|
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
S
N
 
R
E
 
K
A
 
T
T
 
T
Q
 
G
E
 
D
K
|
K
F
 
Q
A
 
A
I
 
F
T
 
H
S
 
S
V
 
A
H
 
H
T
 
V
Y
 
Q
P
 
P
K
 
V
V
 
F
S
 
A
I
 
V
V
 
L
N
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
Y
M
 
T
K
 
Y
T
|
T
V
x
L
S
 
P
R
 
P
D
 
R
Y
x
Q
L
 
V
V
 
A
Y
 
N
S
 
G
A
 
V
A
 
V
D
|
D
V
 
A
I
 
F
A
 
V
H
|
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
F
 
V
T
 
T
A
 
K
K
 
P
D
 
V
E
 
D
P
 
A
R
 
K
F
 
I
Q
 
H
S
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
A
E
 
E
A
 
G
I
 
I
I
 
L
N
 
L
T
 
T
V
 
L
I
 
I
E
 
E
T
 
D
T
 
G
E
 
P
T
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
P
 
P
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
E
 
D
A
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
N
F
 
V
A
 
M
W
 
W
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
P
G
 
-
Y
 
Q
S
 
D
Y
 
W
P
 
A
N
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
E
 
G
H
 
H
S
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
M
F
 
H
N
 
G
V
 
L
P
 
D
H
|
H
G
 
A
A
 
Q
G
 
T
L
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
M
 
L
P
 
P
A
 
A
W
 
L
M
 
W
K
 
N
W
 
E
Y
 
K
H
 
R
S
 
D
R
 
T
N
 
K
P
 
R
V
 
A
Q
 
K
F
 
L
Q
 
L
R
 
Q
F
 
Y
A
 
A
K
 
E
Y
 
R
V
 
V
F
 
W
G
 
N
V
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
D
E
 
E
T
 
R
A
 
I
E
 
D
Q
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
T
E
 
R
K
 
N
W
 
F
F
 
F
D
 
E
K
 
Q
I
 
L
G
 
G
T
 
V
P
 
P
T
 
T
R
 
H
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
S
 
D
E
 
G
A
 
S
D
 
S
L
 
I
P
 
P

3bfjA Crystal structure analysis of 1,3-propanediol oxidoreductase (see paper)
28% identity, 99% coverage: 4:382/382 of query aligns to 3:382/382 of 3bfjA

query
sites
3bfjA
F
 
F
T
 
D
F
 
Y
F
 
L
N
 
V
P
 
P
T
 
N
Q
 
V
V
 
N
E
 
F
F
 
F
G
 
G
K
 
P
D
 
N
K
 
A
E
 
I
Q
 
S
A
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
E
H
 
R
L
 
C
A
 
Q
E
 
L
H
 
L
G
 
G
I
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
V
Y
 
T
G
 
-
S
 
D
E
 
K
R
 
G
I
 
L
K
 
R
R
 
K
D
 
D
G
 
G
L
 
A
F
 
V
G
 
D
V
 
K
V
 
T
S
 
L
K
 
H
S
 
Y
L
 
L
A
 
R
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
E
F
 
V
V
 
A
E
 
I
C
 
F
G
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
E
S
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
K
I
 
D
S
 
T
K
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
D
A
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
F
R
 
R
D
 
R
H
 
E
Q
 
Q
V
 
C
E
 
D
A
 
I
I
 
I
L
 
V
S
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
L
 
H
D
 
D
S
 
C
S
 
G
K
 
K
A
 
G
I
 
I
A
 
G
A
 
I
G
 
A
V
 
A
P
 
T
Y
 
H
A
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
L
W
 
Y
D
 
Q
L
 
-
F
 
Y
I
 
A
G
 
G
K
 
I
G
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
T
S
 
N
A
 
P
L
 
L
P
 
P
-
 
P
V
 
I
F
 
V
D
 
A
I
 
V
L
 
N
T
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
V
N
 
T
N
 
R
G
 
H
A
 
C
V
 
V
V
 
L
T
 
T
N
 
N
E
 
T
A
 
E
T
 
T
Q
 
K
E
 
V
K
 
K
F
 
F
A
 
V
I
 
I
T
 
V
S
 
S
V
 
W
H
 
R
T
 
N
Y
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
V
S
 
S
I
 
I
V
 
N
N
 
D
P
 
P
A
 
L
L
 
L
M
 
M
K
 
I
T
 
G
V
 
K
S
 
P
R
 
A
D
 
A
Y
 
L
L
 
T
V
 
A
Y
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
M
D
|
D
V
 
A
I
 
L
A
 
T
H
|
H
A
 
A
I
 
V
E
 
E
G
 
A
Y
 
Y
F
 
I
T
 
S
A
 
K
K
 
D
D
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
V
F
 
T
Q
 
D
S
 
A
R
 
A
L
 
A
V
 
M
E
 
Q
A
 
A
I
 
-
I
 
I
N
 
R
T
 
L
V
 
I
I
 
A
E
 
R
T
 
N
T
 
L
E
 
R
T
 
Q
L
 
A
L
 
V
A
 
A
D
 
L
P
 
G
E
 
S
N
 
N
Y
 
L
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
E
E
 
Y
F
 
M
A
 
A
W
 
Y
A
 
A
A
 
S
T
 
L
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
N
 
A
G
 
G
L
 
M
L
 
A
Y
 
F
A
 
N
G
 
N
I
 
A
S
 
N
-
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
Y
 
-
P
 
-
N
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
M
E
 
A
H
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
G
A
 
G
L
 
L
F
 
Y
N
 
D
V
 
M
P
 
P
H
|
H
G
 
G
A
 
V
G
 
A
L
 
N
S
 
A
V
 
V
V
 
L
M
 
L
P
 
P
A
 
H
W
 
V
M
 
A
K
 
R
W
 
Y
Y
 
N
H
 
L
S
 
I
R
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
E
Q
 
K
F
 
F
Q
 
A
R
 
D
F
 
I
A
 
A
K
 
E
Y
 
L
-
 
M
-
 
G
-
 
E
-
 
N
V
 
I
F
 
T
G
 
G
V
 
L
E
 
S
T
 
T
-
 
L
-
 
D
-
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
T
K
 
R
W
 
L
F
 
S
D
 
M
K
 
D
I
 
I
G
 
G
T
 
I
P
 
P
T
 
Q
R
 
H
L
 
L
S
 
R
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
K
E
 
E
A
 
T
D
 
D
L
 
F
P
 
P
K
 
Y
T
 
M
I
 
A
D
 
E
N
 
M
V
 
A
L
 
L
G
 
K
N
 
D
A
 
G
V
 
N
H
 
A
F
 
F
G
 
S
V
 
N
A
 
P
E
 
R
T
 
K
Y
 
G
P
 
N
R
 
E
D
 
Q
V
 
E
V
 
I
A
 
A
T
 
A
I
 
I
L
 
F
K
 
R
S
 
Q
A
 
A
L
 
F

P0DJA2 Alcohol dehydrogenase 2; Alcohol dehydrogenase II; ADH II; EC 1.1.1.1 from Zymomonas mobilis subsp. mobilis (strain ATCC 31821 / ZM4 / CP4) (see 2 papers)
28% identity, 97% coverage: 1:371/382 of query aligns to 1:368/383 of P0DJA2

query
sites
P0DJA2
M
|
M
D
 
A
N
 
S
F
 
S
T
 
T
F
 
F
F
 
Y
N
 
I
P
 
P
T
 
F
Q
 
V
V
 
N
E
 
E
F
 
M
G
 
G
K
 
E
D
 
G
K
 
S
E
 
L
Q
 
E
A
 
K
I
 
A
G
 
I
R
 
K
H
 
D
L
 
L
A
 
N
E
 
G
H
 
S
G
 
G
I
 
F
K
 
K
K
 
N
V
 
A
L
 
L
L
 
I
C
 
-
Y
 
V
G
 
S
S
x
D
E
 
A
R
 
F
I
 
M
K
 
N
R
 
K
D
 
S
G
 
G
L
 
V
F
 
V
G
 
K
V
 
Q
V
 
V
S
 
A
K
 
D
S
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
N
F
 
S
V
 
A
E
 
V
C
 
Y
G
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
M
S
 
P
N
|
N
P
 
P
V
 
T
I
 
V
S
 
T
K
 
A
V
 
V
R
 
L
E
 
E
A
 
G
I
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
L
R
 
K
D
 
D
H
 
N
Q
 
N
V
 
S
E
 
D
A
 
F
I
 
V
L
 
I
S
 
S
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
H
D
 
D
S
 
C
S
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
L
G
 
V
V
 
A
P
 
T
Y
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
E
V
 
V
W
 
K
D
 
D
L
 
Y
-
 
E
F
 
G
I
 
I
G
 
D
K
 
K
G
 
S
R
 
K
I
 
-
E
 
K
S
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
L
F
 
M
D
 
S
I
 
I
L
 
N
T
|
T
L
x
T
A
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
x
T
N
 
R
G
x
F
A
 
C
V
 
I
V
 
I
T
 
T
N
 
D
E
 
E
A
 
V
T
 
R
Q
 
H
E
 
V
K
|
K
F
 
M
A
 
A
I
 
I
T
 
V
S
 
D
V
 
R
H
 
H
T
 
V
Y
 
T
P
 
P
K
 
M
V
 
V
S
 
S
I
 
V
V
 
N
N
 
D
P
 
P
A
 
L
L
|
L
M
 
M
K
 
V
T
x
G
V
x
M
S
 
P
R
 
K
D
 
G
Y
 
L
L
 
T
V
 
A
Y
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
M
D
|
D
V
 
A
I
 
L
A
 
T
H
|
H
A
 
A
I
 
F
E
 
E
G
 
A
Y
 
Y
F
 
S
T
 
S
A
 
T
K
 
A
D
 
A
E
 
T
P
 
P
R
 
I
F
 
T
Q
 
D
S
 
A
R
 
C
L
 
A
V
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
-
I
 
A
N
 
S
T
 
M
V
 
I
I
 
A
E
 
K
T
 
N
T
 
L
E
 
K
T
 
T
L
 
A
L
 
C
A
 
D
D
 
N
P
 
G
E
 
K
N
 
D
Y
 
M
E
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
E
E
 
A
F
 
M
A
 
A
W
 
Y
A
 
A
A
 
-
T
 
-
Q
 
Q
A
 
F
L
 
L
N
 
A
G
 
G
L
 
M
L
 
A
Y
 
F
A
 
N
G
 
N
I
 
A
S
 
S
-
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
Y
 
-
P
 
-
N
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
M
E
 
A
H
|
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
G
A
 
G
L
 
Y
F
 
Y
N
 
N
V
 
L
P
 
P
H
|
H
G
 
G
A
 
V
G
 
C
L
 
N
S
 
A
V
 
V
V
 
L
M
 
L
P
 
P
A
 
H
W
 
V
M
 
L
K
 
A
W
 
Y
Y
 
N
H
 
A
S
 
S
R
 
V
N
 
V
P
 
A
V
 
G
Q
 
R
F
 
L
Q
 
K
R
 
D
F
 
V
A
 
G
K
 
-
Y
 
V
V
 
A
F
 
M
G
 
G
V
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
E
 
E
T
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
A
G
 
T
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
R
K
 
D
W
 
L
F
 
A
D
 
A
K
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
I
P
 
P
T
 
A
R
 
N
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
K
E
 
K
A
 
E
D
 
D
L
 
V
P
 
P
K
 
L
T
 
L
I
 
A
D
 
D
N
 
H
V
 
A
L
 
L
G
 
K
N
 
D
A
 
A
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
C
A
 
A
E
 
L
T
 
T
Y
 
N
P
 
P
R
 
R

3ox4A Structures of iron-dependent alcohol dehydrogenase 2 from zymomonas mobilis zm4 complexed with NAD cofactor (see paper)
28% identity, 96% coverage: 5:371/382 of query aligns to 4:367/382 of 3ox4A

query
sites
3ox4A
T
 
T
F
 
F
F
 
Y
N
 
I
P
 
P
T
 
F
Q
 
V
V
 
N
E
 
E
F
 
M
G
 
G
K
 
E
D
 
G
K
 
S
E
 
L
Q
 
E
A
 
K
I
 
A
G
 
I
R
 
K
H
 
D
L
 
L
A
 
N
E
 
G
H
 
S
G
 
G
I
 
F
K
 
K
K
 
N
V
 
A
L
 
L
L
 
I
C
 
-
Y
 
V
G
 
S
S
x
D
E
 
A
R
x
F
I
x
M
K
 
N
R
 
K
D
 
S
G
 
G
L
 
V
F
 
V
G
 
K
V
 
Q
V
 
V
S
 
A
K
 
D
S
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
N
F
 
S
V
 
A
E
 
V
C
 
Y
G
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
M
S
 
P
N
|
N
P
 
P
V
 
T
I
 
V
S
 
T
K
 
A
V
 
V
R
 
L
E
 
E
A
 
G
I
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
L
R
 
K
D
 
D
H
 
N
Q
 
N
V
 
S
E
 
D
A
 
F
I
 
V
L
 
I
S
 
S
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
L
 
H
D
 
D
S
 
C
S
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
L
G
 
V
V
 
A
P
 
T
Y
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
E
V
 
V
W
 
K
D
 
D
L
 
Y
-
 
E
F
 
G
I
 
I
G
 
D
K
 
K
G
 
S
R
 
K
I
 
-
E
 
K
S
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
L
F
 
M
D
 
S
I
 
I
L
 
N
T
|
T
L
x
T
A
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
T
N
 
R
G
x
F
A
 
C
V
x
I
V
 
I
T
 
T
N
 
D
E
 
E
A
 
V
T
 
R
Q
 
H
E
 
V
K
 
K
F
 
M
A
 
A
I
 
I
T
 
V
S
 
D
V
 
R
H
 
H
T
 
V
Y
 
T
P
 
P
K
 
M
V
 
V
S
 
S
I
 
V
V
 
N
N
 
D
P
 
P
A
 
L
L
 
L
M
 
M
K
 
V
T
x
G
V
x
M
S
 
P
R
 
K
D
 
G
Y
x
L
L
 
T
V
 
A
Y
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
M
D
|
D
V
 
A
I
 
L
A
 
T
H
|
H
A
 
A
I
 
F
E
 
E
G
 
A
Y
 
Y
F
 
S
T
 
S
A
 
T
K
 
A
D
 
A
E
 
T
P
 
P
R
 
I
F
 
T
Q
 
D
S
 
A
R
 
C
L
 
A
V
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
-
I
 
A
N
 
S
T
 
M
V
 
I
I
 
A
E
 
K
T
 
N
T
 
L
E
 
K
T
 
T
L
 
A
L
 
C
A
 
D
D
 
N
P
 
G
E
 
K
N
 
D
Y
 
M
E
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
E
E
 
A
F
 
M
A
 
A
W
 
Y
A
 
A
A
 
-
T
 
-
Q
 
Q
A
 
F
L
 
L
N
 
A
G
 
G
L
 
M
L
 
A
Y
 
F
A
 
N
G
 
N
I
 
A
S
 
S
-
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
Y
 
-
P
 
-
N
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
M
E
 
A
H
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
G
A
 
G
L
 
Y
F
 
Y
N
 
N
V
 
L
P
 
P
H
|
H
G
 
G
A
 
V
G
 
C
L
 
N
S
 
A
V
 
V
V
 
L
M
 
L
P
 
P
A
 
H
W
 
V
M
 
L
K
 
A
W
 
Y
Y
 
N
H
 
A
S
 
S
R
 
V
N
 
V
P
 
A
V
 
G
Q
 
R
F
 
L
Q
 
K
R
 
D
F
 
V
A
 
G
K
 
-
Y
 
V
V
 
A
F
 
M
G
 
G
V
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
E
 
E
T
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
A
G
 
T
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
R
K
 
D
W
 
L
F
 
A
D
 
A
K
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
I
P
 
P
T
 
A
R
 
N
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
K
E
 
K
A
 
E
D
 
D
L
 
V
P
 
P
K
 
L
T
 
L
I
 
A
D
 
D
N
 
H
V
 
A
L
 
L
G
 
K
N
 
D
A
 
A
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
C
A
 
A
E
 
L
T
 
T
Y
 
N
P
 
P
R
 
R

3owoA Structures of iron-dependent alcohol dehydrogenase 2 from zymomonas mobilis zm4 with and without NAD cofactor (see paper)
28% identity, 96% coverage: 5:371/382 of query aligns to 4:367/382 of 3owoA

query
sites
3owoA
T
 
T
F
 
F
F
 
Y
N
 
I
P
 
P
T
 
F
Q
 
V
V
 
N
E
 
E
F
 
M
G
 
G
K
 
E
D
 
G
K
 
S
E
 
L
Q
 
E
A
 
K
I
 
A
G
 
I
R
 
K
H
 
D
L
 
L
A
 
N
E
 
G
H
 
S
G
 
G
I
 
F
K
 
K
K
 
N
V
 
A
L
 
L
L
 
I
C
 
-
Y
 
V
G
 
S
S
 
D
E
 
A
R
 
F
I
 
M
K
 
N
R
 
K
D
 
S
G
 
G
L
 
V
F
 
V
G
 
K
V
 
Q
V
 
V
S
 
A
K
 
D
S
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
N
F
 
S
V
 
A
E
 
V
C
 
Y
G
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
M
S
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
V
S
 
T
K
 
A
V
 
V
R
 
L
E
 
E
A
 
G
I
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
L
R
 
K
D
 
D
H
 
N
Q
 
N
V
 
S
E
 
D
A
 
F
I
 
V
L
 
I
S
 
S
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
L
 
H
D
 
D
S
 
C
S
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
L
G
 
V
V
 
A
P
 
T
Y
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
E
V
 
V
W
 
K
D
 
D
L
 
Y
-
 
E
F
 
G
I
 
I
G
 
D
K
 
K
G
 
S
R
 
K
I
 
-
E
 
K
S
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
L
F
 
M
D
 
S
I
 
I
L
 
N
T
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
T
N
 
R
G
 
F
A
 
C
V
 
I
V
 
I
T
 
T
N
 
D
E
 
E
A
 
V
T
 
R
Q
 
H
E
 
V
K
 
K
F
 
M
A
 
A
I
 
I
T
 
V
S
 
D
V
 
R
H
 
H
T
 
V
Y
 
T
P
 
P
K
 
M
V
 
V
S
 
S
I
 
V
V
 
N
N
 
D
P
 
P
A
 
L
L
 
L
M
 
M
K
 
V
T
 
G
V
 
M
S
 
P
R
 
K
D
 
G
Y
 
L
L
 
T
V
 
A
Y
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
M
D
|
D
V
 
A
I
 
L
A
 
T
H
|
H
A
 
A
I
 
F
E
 
E
G
 
A
Y
 
Y
F
 
S
T
 
S
A
 
T
K
 
A
D
 
A
E
 
T
P
 
P
R
 
I
F
 
T
Q
 
D
S
 
A
R
 
C
L
 
A
V
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
-
I
 
A
N
 
S
T
 
M
V
 
I
I
 
A
E
 
K
T
 
N
T
 
L
E
 
K
T
 
T
L
 
A
L
 
C
A
 
D
D
 
N
P
 
G
E
 
K
N
 
D
Y
 
M
E
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
E
E
 
A
F
 
M
A
 
A
W
 
Y
A
 
A
A
 
-
T
 
-
Q
 
Q
A
 
F
L
 
L
N
 
A
G
 
G
L
 
M
L
 
A
Y
 
F
A
 
N
G
 
N
I
 
A
S
 
S
-
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
Y
 
-
P
 
-
N
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
M
E
 
A
H
 
H
S
 
Q