SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_1123 FitnessBrowser__Cola:Echvi_1123 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3e18A Crystal structure of NAD-binding protein from listeria innocua
29% identity, 97% coverage: 9:342/343 of query aligns to 8:347/348 of 3e18A

query
sites
3e18A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
F
 
Y
G
|
G
R
x
G
V
x
M
A
 
G
Q
 
-
T
 
S
M
 
Y
H
 
H
A
 
V
P
 
T
L
 
L
I
 
A
H
 
S
Q
 
A
E
 
A
P
 
D
L
 
N
L
 
L
D
 
E
L
 
V
T
 
H
A
 
G
V
 
V
V
x
F
E
x
D
R
x
I
H
 
L
H
 
A
Q
 
E
K
|
K
S
 
R
K
 
E
E
 
A
K
 
A
-
 
A
Y
 
Q
P
 
K
A
 
G
V
 
L
T
 
K
V
 
I
Y
 
Y
R
 
E
S
 
S
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
E
D
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
A
I
 
V
V
 
L
I
 
I
C
x
A
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
D
Y
 
S
H
|
H
F
 
K
S
 
E
Q
 
L
A
 
A
K
 
I
M
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
V
T
 
T
V
 
M
S
 
T
S
 
S
S
 
E
E
 
D
A
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
M
S
 
D
L
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
R
K
 
V
G
 
N
K
 
K
L
 
H
L
 
F
S
 
M
A
 
V
F
 
H
Q
 
Q
N
|
N
R
 
R
R
 
R
W
 
W
D
 
D
G
 
E
D
 
D
F
 
F
Q
 
L
T
 
I
I
 
I
T
 
K
K
 
E
L
 
M
L
 
F
H
 
E
E
 
Q
G
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
R
 
E
I
 
M
V
 
F
H
 
H
F
 
L
E
 
E
S
 
S
H
 
R
F
 
V
D
 
H
R
 
G
F
 
A
R
 
N
P
 
G
E
 
I
P
 
P
T
 
G
E
 
D
N
 
-
W
|
W
R
|
R
E
 
H
Q
 
L
Q
 
K
V
 
A
P
 
H
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
M
L
 
V
Y
 
L
D
 
D
L
 
W
G
 
G
A
 
V
H
|
H
L
 
L
I
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
L
 
F
L
 
L
F
 
V
G
 
D
K
 
S
P
 
N
E
 
V
W
 
K
V
 
S
Y
 
V
A
 
S
E
 
A
I
 
N
L
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
A
S
 
L
G
 
G
V
 
D
E
 
E
A
 
V
D
 
D
D
 
D
F
 
G
F
 
F
D
 
V
L
 
T
T
 
F
L
 
I
M
 
T
Y
 
F
P
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
I
T
 
T
T
 
A
K
 
Q
V
 
I
R
 
E
L
 
V
S
 
G
A
 
T
S
 
T
I
 
N
L
 
F
M
 
I
N
 
K
A
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
P
K
 
R
F
 
W
L
 
Y
V
 
V
L
 
K
G
 
G
D
 
T
K
 
E
G
 
G
S
 
T
Y
 
G
S
 
I
K
 
I
Y
 
H
G
 
D
L
 
W
D
 
D
V
 
L
Q
 
S
E
 
G
A
 
E
A
 
I
F
 
V
K
 
K
A
 
P
G
 
T
I
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
K
S
 
T
D
 
-
H
 
-
W
 
-
G
 
S
E
 
E
E
 
P
D
 
T
P
 
P
S
 
I
S
 
K
Y
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
-
Y
 
G
L
 
L
E
 
T
G
 
K
T
 
T
S
 
M
Y
 
A
P
 
P
Y
 
P
P
 
S
T
 
E
V
 
E
K
 
A
G
 
T
N
 
N
Y
 
T
L
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
P
A
 
S
Y
 
F
Y
 
Y
E
 
N
N
 
N
I
 
F
A
 
V
E
 
D
T
 
V
I
 
L
L
 
N
G
 
N
K
 
T
A
 
S
T
 
E
L
 
P
K
 
I
V
 
V
K
 
Q
P
 
N
E
 
E
E
 
E
A
 
V
I
 
Y
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
K
 
K
V
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
I
Q
 
F
K
 
E
S
 
A
H
 
A
A
 
E
E
 
T
G
 
N
K
 
R
R
 
T
V
 
V
Y
 
H

3q2iA Crystal structure of the wlba dehydrognase from chromobactrium violaceum in complex with nadh and udp-glcnaca at 1.50 a resolution (see paper)
26% identity, 99% coverage: 3:343/343 of query aligns to 10:341/345 of 3q2iA

query
sites
3q2iA
Q
 
R
P
 
K
L
 
I
K
 
R
T
 
F
G
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
F
x
C
G
|
G
R
|
R
V
x
I
A
 
A
Q
 
N
T
 
N
M
 
H
H
 
F
A
 
G
P
 
A
L
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
H
I
 
A
H
 
D
Q
 
R
E
 
A
P
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
V
T
 
C
A
x
D
V
x
I
V
 
D
E
 
P
R
 
A
H
 
A
H
 
L
Q
 
K
K
 
A
S
 
A
K
 
V
E
 
E
K
 
R
Y
 
T
P
 
G
A
 
A
V
 
R
T
 
G
V
 
-
Y
 
H
R
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
D
 
D
V
 
A
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
I
I
 
L
C
 
T
T
|
T
P
|
P
N
x
S
E
 
G
Y
 
L
H
|
H
F
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
S
K
 
I
M
 
E
A
 
C
L
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
F
H
 
H
V
 
V
V
 
M
V
 
T
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
T
S
 
R
S
 
W
S
 
E
E
 
D
A
 
G
E
 
L
A
 
E
L
 
M
L
 
V
S
 
K
L
 
A
A
 
A
-
 
D
K
 
K
S
 
A
K
 
K
G
 
K
K
 
H
L
 
L
L
 
F
S
 
V
A
 
V
F
 
K
Q
|
Q
N
|
N
R
 
R
R
 
R
W
 
-
D
 
N
G
 
A
D
 
T
F
 
L
Q
 
Q
T
 
L
I
 
L
T
 
K
K
 
R
L
 
A
L
 
M
H
 
Q
E
 
E
G
 
K
T
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
Y
H
 
M
F
 
V
E
 
N
S
 
V
H
 
N
F
 
V
D
 
F
R
 
W
F
x
T
R
|
R
P
 
P
E
 
Q
-
 
E
-
x
Y
-
 
Y
P
 
D
T
 
A
E
 
A
N
 
G
W
|
W
R
|
R
E
 
G
Q
 
T
Q
 
W
V
 
E
P
 
F
G
 
D
S
 
G
G
 
G
I
 
A
L
 
F
Y
 
M
D
x
N
L
x
Q
G
 
A
A
 
S
H
|
H
L
 
Y
I
 
V
D
 
D
Q
 
L
A
 
L
L
 
D
L
 
W
L
 
L
F
 
I
G
 
G
K
 
P
P
 
V
E
 
E
W
 
S
V
 
V
Y
 
Q
A
 
A
E
 
Y
I
 
T
L
 
A
T
 
T
Q
 
L
R
 
A
S
 
R
G
 
N
V
 
I
E
 
E
A
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
T
F
 
G
D
 
T
L
 
V
T
 
S
L
 
V
M
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
T
 
-
K
 
K
V
 
W
R
 
R
L
 
S
S
 
G
A
 
A
S
 
L
I
 
G
L
 
S
M
 
M
N
 
N
A
 
V
P
 
T
L
 
M
-
 
L
-
 
T
-
 
Y
P
 
P
K
|
K
F
x
N
L
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
E
K
 
K
G
 
G
S
 
S
Y
 
V
S
 
R
K
 
V
Y
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
A
V
 
V
Q
 
N
E
 
E
A
 
I
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
Q
H
 
H
W
 
W
G
 
E
E
 
F
E
 
S
D
 
E
P
 
P
S
 
H
S
 
A
Y
 
M
G
 
D
K
 
E
V
 
E
Y
 
I
L
 
K
E
 
D
G
 
A
T
 
S
S
 
G
Y
 
F
P
 
G
Y
 
H
P
 
P
T
 
L
V
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
I
 
V
A
 
I
E
 
K
T
 
T
I
 
M
L
 
R
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
T
L
 
P
K
 
E
V
 
T
K
 
D
P
 
G
E
 
R
E
 
E
A
 
G
I
 
L
E
 
K
V
 
S
L
 
L
K
 
E
V
 
L
I
 
L
E
 
I
A
 
A
A
 
M
Q
 
Y
K
 
L
S
 
S
H
 
A
A
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
S
L
 
L

3q2kC Crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis in complex with nadh and udp-glcnaca (see paper)
23% identity, 99% coverage: 3:343/343 of query aligns to 6:344/347 of 3q2kC

query
sites
3q2kC
Q
 
R
P
 
K
L
 
I
K
 
R
T
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
F
 
C
G
|
G
R
|
R
V
x
I
A
 
S
Q
 
K
T
 
N
M
 
H
H
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
I
I
 
A
H
 
Q
Q
 
H
E
 
G
P
 
D
L
 
R
L
 
A
D
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
E
V
 
I
V
 
C
E
x
D
R
x
T
H
 
N
H
 
P
Q
 
E
-
 
A
-
 
L
K
 
Q
S
 
A
K
 
A
E
 
E
K
 
A
Y
 
A
P
 
T
A
 
G
V
 
A
T
 
R
V
 
P
Y
 
F
R
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
S
A
 
D
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
G
D
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
A
I
 
L
V
 
V
I
 
L
C
x
A
T
|
T
P
 
P
N
x
S
E
 
G
Y
 
L
H
|
H
F
 
P
S
 
W
Q
|
Q
A
 
A
K
 
I
M
 
E
A
 
V
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
K
 
R
H
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
S
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
T
S
 
R
S
 
W
S
 
E
E
 
D
A
 
G
E
 
K
A
 
R
L
 
M
L
 
V
S
 
K
L
 
A
A
 
C
K
 
D
S
 
E
K
 
A
G
 
G
-
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
V
A
 
V
F
 
K
Q
|
Q
N
 
N
R
 
R
R
 
R
W
 
-
D
 
N
G
 
A
D
 
T
F
 
L
Q
 
Q
T
 
L
I
 
V
T
 
K
K
 
K
L
 
A
L
 
I
H
 
E
E
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
Y
H
 
M
F
 
V
E
 
T
S
 
V
H
 
N
F
 
V
D
 
F
R
x
W
F
x
T
R
|
R
P
 
P
E
 
Q
-
 
E
-
x
Y
-
 
Y
P
 
D
T
 
A
E
 
A
N
 
R
W
|
W
R
|
R
E
 
G
Q
 
K
Q
 
W
V
 
E
P
 
W
G
 
D
S
 
G
G
 
G
I
 
A
L
 
F
Y
 
M
D
x
N
L
x
Q
G
 
A
A
 
S
H
|
H
L
 
Y
I
 
V
D
 
D
Q
 
L
A
 
L
L
 
D
L
 
W
L
 
L
F
 
V
G
 
G
K
 
P
P
 
V
E
 
E
W
 
S
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Y
I
 
T
L
 
A
T
 
T
Q
 
L
R
 
A
S
 
R
G
 
R
V
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
E
D
 
D
F
 
T
F
 
G
D
 
V
L
 
A
T
 
A
L
 
L
M
 
R
Y
 
W
P
 
R
T
 
H
T
 
G
K
 
A
V
 
M
R
 
G
L
 
S
S
 
I
A
 
N
S
 
V
I
 
T
L
 
M
M
 
L
N
 
T
A
 
Y
P
 
P
L
x
Q
P
x
N
-
 
L
-
 
E
-
 
G
K
 
S
F
 
I
L
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
E
K
 
K
G
 
G
S
 
T
Y
 
V
S
 
R
K
 
V
Y
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
A
V
 
V
Q
 
N
E
 
R
A
 
I
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
E
W
 
W
G
 
K
E
 
F
E
 
A
D
 
E
P
 
P
S
 
H
S
 
P
Y
 
D
G
 
D
K
 
D
V
 
K
Y
 
I
L
 
R
E
 
E
G
 
-
T
 
A
S
 
N
Y
 
Y
P
 
E
Y
 
T
P
 
T
T
 
S
V
 
V
K
 
Y
G
 
G
-
 
F
N
 
G
Y
 
H
L
 
P
A
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
I
 
V
A
 
I
E
 
N
T
 
C
I
 
L
L
 
R
G
 
G
K
 
D
A
 
C
T
 
E
L
 
P
K
 
E
V
 
T
K
 
D
P
 
G
E
 
R
E
 
E
A
 
G
I
 
L
E
 
Q
V
 
S
L
 
L
K
 
A
V
 
L
I
 
L
E
 
T
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
R
S
 
S
H
 
A
A
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
V
R
 
R
V
 
I
Y
 
P
L
 
L

B3TMR8 dTDP-3,4-didehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose 3-reductase; 3-ketoreductase; NADPH-dependent C3-ketoreductase; EC 1.1.1.384 from Actinomadura kijaniata (see paper)
30% identity, 63% coverage: 2:218/343 of query aligns to 7:240/332 of B3TMR8

query
sites
B3TMR8
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
L
 
I
K
 
R
T
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
x
C
G
x
A
R
x
D
V
x
I
A
|
A
Q
x
W
T
x
R
M
 
R
H
 
A
A
 
L
P
 
P
L
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
T
D
 
E
L
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
x
S
R
|
R
H
 
R
H
 
W
Q
 
D
K
 
R
S
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
T
E
 
E
K
 
R
Y
 
F
P
 
G
A
 
G
V
 
E
T
 
P
V
 
V
Y
 
-
R
 
E
S
 
G
L
x
Y
E
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
R
A
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
A
I
 
V
V
 
Y
I
 
V
C
 
P
T
x
L
P
 
P
N
 
A
E
 
V
Y
 
L
H
|
H
F
 
A
S
 
E
Q
 
W
A
 
I
K
 
D
M
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
L
V
 
A
D
 
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
T
 
T
V
 
T
S
 
D
S
 
R
S
 
P
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
S
 
E
K
 
R
G
 
G
K
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
M
A
 
E
F
 
N
Q
 
F
N
 
M
R
 
F
R
 
L
W
 
H
D
 
H
G
 
P
D
 
Q
F
 
H
Q
 
R
T
 
Q
I
 
V
T
 
A
K
 
D
L
 
M
L
 
L
H
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
V
L
 
I
G
 
G
R
 
E
I
 
I
V
 
R
H
 
S
F
 
F
E
 
A
S
 
A
H
 
S
F
 
F
D
 
T
R
 
-
F
 
I
R
 
P
P
 
P
E
 
K
P
 
P
T
 
Q
E
 
G
N
 
D
W
 
I
R
|
R
E
 
Y
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
D
P
 
V
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
|
D
L
 
I
G
 
G
A
 
V
H
x
Y
L
 
P
I
 
I
D
 
R
Q
 
A
A
 
A
L
 
G
L
 
L
L
 
F
F
 
L
G
 
G
K
 
A
P
 
D
-
 
L
E
 
E
W
 
F
V
 
V
Y
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
H
-
 
E
-
 
R
-
 
D
-
 
R
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
N
E
 
A
I
 
L
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
T
A
 
A
D
 
Q
D
 
L
F
 
T
F
 
F
D
 
G
L
 
M
T
 
E
L
 
H
M
 
A
Y
 
Y

3rc1A Crystal structure of kijd10, a 3-ketoreductase from actinomadura kijaniata incomplex with NADP and tdp-benzene (see paper)
30% identity, 63% coverage: 3:218/343 of query aligns to 1:233/325 of 3rc1A

query
sites
3rc1A
Q
 
N
P
 
P
L
 
I
K
 
R
T
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
F
x
C
G
x
A
R
x
D
V
x
I
A
 
A
Q
 
W
T
x
R
M
x
R
H
 
A
A
 
L
P
 
P
L
 
A
I
 
L
H
 
E
Q
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
T
D
 
E
L
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
x
S
R
|
R
H
 
R
H
 
W
Q
 
D
K
 
R
S
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
T
E
 
E
K
 
R
Y
 
F
P
 
G
A
 
G
V
 
E
T
 
P
V
 
V
Y
 
-
R
 
E
S
 
G
L
x
Y
E
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
R
A
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
A
I
 
V
V
 
Y
I
 
V
C
x
P
T
x
L
P
|
P
N
 
A
E
 
V
Y
 
L
H
|
H
F
 
A
S
 
E
Q
 
W
A
 
I
K
 
D
M
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
L
V
 
A
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
T
 
T
V
 
T
S
 
D
S
 
R
S
 
P
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
S
 
E
K
 
R
G
 
G
K
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
M
A
 
E
F
 
N
Q
 
F
N
 
M
R
 
F
R
 
L
W
 
H
D
 
H
G
 
P
D
 
Q
F
 
H
Q
 
R
T
 
Q
I
 
V
T
 
A
K
 
D
L
 
M
L
 
L
H
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
V
L
 
I
G
 
G
R
 
E
I
 
I
V
 
R
H
 
S
F
 
F
E
 
A
S
 
A
H
 
S
F
|
F
D
 
T
R
 
-
F
x
I
R
x
P
P
 
P
E
 
K
P
 
P
T
 
Q
E
 
G
N
 
D
W
x
I
R
|
R
E
 
Y
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
D
P
x
V
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
|
D
L
 
I
G
 
G
A
 
V
H
x
Y
L
 
P
I
 
I
D
 
R
Q
 
A
A
 
A
L
 
G
L
 
L
L
 
F
F
 
L
G
 
G
K
 
A
P
 
D
-
 
L
E
 
E
W
 
F
V
 
V
Y
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
H
-
 
E
-
 
R
-
 
D
-
 
R
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
N
E
 
A
I
 
L
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
T
A
 
A
D
 
Q
D
 
L
F
 
T
F
 
F
D
 
G
L
 
M
T
 
E
L
 
H
M
 
A
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

Q53TZ2 L-arabinose 1-dehydrogenase (NAD(P)(+)); D-galactose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.376; EC 1.1.1.120; EC 1.1.1.48 from Azospirillum brasilense (see paper)
33% identity, 52% coverage: 1:178/343 of query aligns to 1:171/309 of Q53TZ2

query
sites
Q53TZ2
M
|
M
T
 
S
Q
 
D
P
 
Q
L
 
V
K
 
S
T
 
L
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
I
G
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
T
 
D
M
 
Q
H
 
H
A
 
L
P
 
P
L
 
A
I
 
I
H
 
D
Q
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
G
L
 
F
D
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
C
V
 
A
E
 
S
R
 
R
H
 
H
H
 
A
Q
 
E
K
 
V
S
 
T
K
 
-
E
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
V
T
 
R
V
 
N
Y
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
A
E
 
E
A
 
R
D
 
E
V
 
L
D
 
D
L
 
A
I
 
V
V
 
S
I
 
L
C
 
C
T
 
A
P
 
P
N
 
P
E
 
Q
Y
 
V
H
 
R
F
 
Y
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
R
M
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
M
V
 
L
D
 
E
K
 
K
P
 
P
I
 
P
T
 
G
V
 
A
S
 
T
S
 
L
S
 
G
E
 
E
A
 
V
E
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
S
 
E
K
 
R
G
 
G
K
 
L
L
 
T
L
 
L
S
 
F
A
 
A
F
 
T
Q
 
W
N
 
H
R
 
S
R
 
R
W
 
C
D
 
A
G
 
S
D
 
A
F
 
V
Q
 
E
T
 
P
I
 
A
T
 
R
K
 
E
L
 
W
L
 
L
H
 
A
E
 
T
G
 
R
T
 
A
L
 
I
G
 
-
R
 
R
I
 
A
V
 
V
H
 
Q
F
 
V
E
 
R
S
 
W
H
 
K
F
 
E
D
 
D
R
 
V
F
 
R
R
 
R
P
 
W
E
 
H
P
 
P
T
 
G
E
 
Q
N
 
Q
W
 
W
R
 
I
E
 
W
Q
 
E
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
G
 
G
S
 
G
G
 
L
I
 
G
L
 
V
Y
 
F
D
|
D
L
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5a06A Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with sorbitol (see paper)
27% identity, 85% coverage: 53:343/343 of query aligns to 59:336/336 of 5a06A

query
sites
5a06A
Y
|
Y
R
 
E
S
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
R
L
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
N
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
|
D
L
 
I
I
 
V
V
 
Y
I
 
V
C
x
I
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
S
Y
x
L
H
|
H
F
 
R
S
 
P
Q
 
F
A
 
T
K
 
E
M
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
|
H
V
 
V
V
 
M
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
N
S
 
T
S
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
I
S
 
A
L
 
A
A
 
C
K
 
K
S
 
K
K
 
A
G
 
G
-
x
R
K
 
K
L
|
L
L
 
M
S
 
I
A
 
G
F
 
Y
Q
x
R
N
 
S
R
 
R
R
 
F
W
 
Q
D
 
A
G
 
H
D
 
N
F
 
I
Q
 
E
T
 
A
I
 
I
T
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
V
H
 
R
E
 
D
G
 
G
T
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
V
H
 
V
F
 
T
E
 
D
S
 
H
H
 
G
F
|
F
D
 
T
R
 
I
F
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
-
P
 
-
T
 
-
E
 
K
N
 
Q
W
|
W
R
|
R
-
 
L
E
 
N
Q
 
R
Q
 
A
V
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
S
L
 
L
Y
 
M
D
|
D
L
 
I
G
 
G
A
 
I
H
x
Y
L
 
S
I
 
L
D
 
N
Q
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
Y
L
 
L
F
 
T
G
 
G
-
 
E
K
 
E
P
 
P
E
 
V
W
 
A
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
E
 
V
I
 
E
L
 
S
T
 
T
Q
 
D
R
 
R
S
 
S
G
 
D
V
 
P
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
A
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
I
F
 
I
D
 
N
L
 
F
T
 
Q
L
 
L
M
 
L
Y
 
F
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
A
T
 
T
T
 
A
K
 
N
V
 
C
R
 
V
L
 
S
S
 
A
A
 
Y
S
 
S
I
 
V
L
 
N
M
 
C
N
 
N
A
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
R
F
 
Y
L
 
R
V
 
V
L
 
S
G
 
G
D
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
W
Y
 
V
S
 
E
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
L
 
D
P
 
P
G
 
A
S
 
T
D
 
S
H
x
Y
W
 
Q
G
 
G
E
 
Q
E
 
A
D
 
M
P
 
R
S
 
A
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
K
 
G
V
 
P
Y
 
-
L
 
-
E
 
P
G
 
A
T
 
P
S
 
R
Y
 
E
P
 
P
Y
 
A
P
 
P
T
 
Q
V
 
P
K
|
K
G
 
N
N
 
Q
Y
 
F
L
 
S
A
 
A
Y
 
Q
Y
 
L
E
 
D
N
x
H
I
 
L
A
 
S
E
|
E
T
 
C
I
 
I
L
 
L
G
 
T
K
 
G
A
 
R
T
x
E
L
 
P
K
 
I
V
 
V
K
x
G
P
x
G
E
 
D
E
 
D
A
 
G
I
 
L
E
 
K
V
 
D
L
 
L
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
R
S
 
A
H
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
T
V
 
V
Y
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5a05A Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with maltotriose (see paper)
27% identity, 85% coverage: 53:343/343 of query aligns to 58:335/335 of 5a05A

query
sites
5a05A
Y
|
Y
R
 
E
S
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
R
L
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
N
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
Y
I
 
V
C
x
I
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
S
Y
x
L
H
|
H
F
 
R
S
 
P
Q
 
F
A
 
T
K
 
E
M
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
M
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
N
S
 
T
S
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
I
S
 
A
L
 
A
A
 
C
K
 
K
S
 
K
K
 
A
G
 
G
-
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
M
S
 
I
A
 
G
F
 
Y
Q
x
R
N
 
S
R
 
R
R
 
F
W
 
Q
D
 
A
G
 
H
D
 
N
F
 
I
Q
 
E
T
 
A
I
 
I
T
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
V
H
 
R
E
 
D
G
 
G
T
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
V
H
 
V
F
 
T
E
 
D
S
 
H
H
 
G
F
|
F
D
 
T
R
 
I
F
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
-
P
 
-
T
 
-
E
 
K
N
 
Q
W
|
W
R
|
R
-
 
L
E
 
N
Q
 
R
Q
 
A
V
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
S
L
 
L
Y
 
M
D
|
D
L
 
I
G
 
G
A
 
I
H
x
Y
L
 
S
I
 
L
D
 
N
Q
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
Y
L
 
L
F
 
T
G
 
G
-
 
E
K
 
E
P
 
P
E
 
V
W
 
A
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
E
 
V
I
 
E
L
 
S
T
 
T
Q
 
D
R
 
R
S
 
S
G
 
D
V
 
P
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
A
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
I
F
 
I
D
 
N
L
 
F
T
 
Q
L
 
L
M
 
L
Y
 
F
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
A
T
 
T
T
 
A
K
 
N
V
 
C
R
 
V
L
 
S
S
 
A
A
 
Y
S
 
S
I
 
V
L
 
N
M
 
C
N
 
N
A
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
R
F
 
Y
L
 
R
V
 
V
L
 
S
G
 
G
D
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
W
Y
 
V
S
 
E
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
L
 
D
P
|
P
G
 
A
S
 
T
D
x
S
H
x
Y
W
 
Q
G
 
G
E
 
Q
E
 
A
D
 
M
P
 
R
S
 
A
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
K
 
G
V
 
P
Y
 
-
L
 
-
E
 
P
G
 
A
T
 
P
S
 
R
Y
 
E
P
 
P
Y
 
A
P
 
P
T
 
Q
V
 
P
K
 
K
G
 
N
N
 
Q
Y
 
F
L
 
S
A
 
A
Y
 
Q
Y
 
L
E
 
D
N
 
H
I
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
C
I
 
I
L
 
L
G
 
T
K
 
G
A
 
R
T
 
E
L
 
P
K
 
I
V
 
V
K
 
G
P
 
G
E
 
D
E
 
D
A
 
G
I
 
L
E
 
K
V
 
D
L
 
L
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
R
S
 
A
H
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
T
V
 
V
Y
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5a04A Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with glucose (see paper)
27% identity, 85% coverage: 53:343/343 of query aligns to 58:335/335 of 5a04A

query
sites
5a04A
Y
|
Y
R
 
E
S
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
R
L
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
N
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
Y
I
 
V
C
x
I
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
S
Y
x
L
H
|
H
F
 
R
S
 
P
Q
 
F
A
 
T
K
 
E
M
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
M
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
N
S
 
T
S
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
I
S
 
A
L
 
A
A
 
C
K
 
K
S
 
K
K
 
A
G
 
G
-
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
M
S
 
I
A
 
G
F
 
Y
Q
x
R
N
 
S
R
 
R
R
 
F
W
 
Q
D
 
A
G
 
H
D
 
N
F
 
I
Q
 
E
T
 
A
I
 
I
T
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
V
H
 
R
E
 
D
G
 
G
T
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
V
H
 
V
F
 
T
E
 
D
S
 
H
H
 
G
F
|
F
D
 
T
R
 
I
F
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
-
P
 
-
T
 
-
E
 
K
N
 
Q
W
|
W
R
|
R
-
 
L
E
 
N
Q
 
R
Q
 
A
V
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
S
L
 
L
Y
 
M
D
|
D
L
 
I
G
 
G
A
 
I
H
x
Y
L
 
S
I
 
L
D
 
N
Q
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
Y
L
 
L
F
 
T
G
 
G
-
 
E
K
 
E
P
 
P
E
 
V
W
 
A
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
E
 
V
I
 
E
L
 
S
T
 
T
Q
 
D
R
 
R
S
 
S
G
 
D
V
 
P
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
A
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
I
F
 
I
D
 
N
L
 
F
T
 
Q
L
 
L
M
 
L
Y
 
F
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
A
T
 
T
T
 
A
K
 
N
V
 
C
R
 
V
L
 
S
S
 
A
A
 
Y
S
 
S
I
 
V
L
 
N
M
 
C
N
 
N
A
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
R
F
 
Y
L
 
R
V
 
V
L
 
S
G
 
G
D
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
W
Y
 
V
S
 
E
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
L
 
D
P
 
P
G
 
A
S
 
T
D
 
S
H
x
Y
W
 
Q
G
 
G
E
 
Q
E
 
A
D
 
M
P
 
R
S
 
A
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
K
 
G
V
 
P
Y
 
-
L
 
-
E
 
P
G
 
A
T
 
P
S
 
R
Y
 
E
P
 
P
Y
 
A
P
 
P
T
 
Q
V
 
P
K
 
K
G
 
N
N
 
Q
Y
 
F
L
 
S
A
 
A
Y
 
Q
Y
 
L
E
 
D
N
 
H
I
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
C
I
 
I
L
 
L
G
 
T
K
 
G
A
 
R
T
 
E
L
 
P
K
 
I
V
 
V
K
 
G
P
 
G
E
 
D
E
 
D
A
 
G
I
 
L
E
 
K
V
 
D
L
 
L
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
R
S
 
A
H
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
T
V
 
V
Y
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5a03E Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with xylose (see paper)
27% identity, 85% coverage: 53:343/343 of query aligns to 58:335/335 of 5a03E

query
sites
5a03E
Y
|
Y
R
 
E
S
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
R
L
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
N
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
Y
I
 
V
C
x
I
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
S
Y
 
L
H
|
H
F
 
R
S
 
P
Q
 
F
A
 
T
K
 
E
M
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
M
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
N
S
 
T
S
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
I
S
 
A
L
 
A
A
 
C
K
 
K
S
 
K
K
 
A
G
 
G
-
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
M
S
 
I
A
 
G
F
 
Y
Q
x
R
N
 
S
R
 
R
R
 
F
W
 
Q
D
 
A
G
x
H
D
 
N
F
 
I
Q
 
E
T
 
A
I
 
I
T
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
V
H
 
R
E
 
D
G
 
G
T
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
V
H
 
V
F
 
T
E
 
D
S
 
H
H
 
G
F
|
F
D
 
T
R
 
I
F
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
-
P
 
-
T
 
-
E
 
K
N
 
Q
W
|
W
R
|
R
-
 
L
E
 
N
Q
 
R
Q
 
A
V
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
S
L
 
L
Y
 
M
D
|
D
L
 
I
G
 
G
A
 
I
H
x
Y
L
 
S
I
 
L
D
 
N
Q
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
Y
L
 
L
F
 
T
G
 
G
-
 
E
K
 
E
P
 
P
E
 
V
W
 
A
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
E
 
V
I
x
E
L
 
S
T
|
T
Q
 
D
R
|
R
S
 
S
G
 
D
V
 
P
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
A
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
I
F
 
I
D
 
N
L
 
F
T
 
Q
L
 
L
M
 
L
Y
 
F
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
A
T
 
T
T
 
A
K
 
N
V
 
C
R
 
V
L
 
S
S
 
A
A
 
Y
S
 
S
I
 
V
L
 
N
M
 
C
N
 
N
A
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
R
F
 
Y
L
 
R
V
 
V
L
 
S
G
 
G
D
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
W
Y
 
V
S
 
E
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
L
 
D
P
 
P
G
 
A
S
 
T
D
 
S
H
x
Y
W
 
Q
G
 
G
E
 
Q
E
 
A
D
x
M
P
 
R
S
 
A
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
K
 
G
V
 
P
Y
 
-
L
 
-
E
 
P
G
 
A
T
 
P
S
x
R
Y
x
E
P
 
P
Y
 
A
P
 
P
T
 
Q
V
 
P
K
 
K
G
 
N
N
 
Q
Y
 
F
L
 
S
A
 
A
Y
 
Q
Y
 
L
E
 
D
N
 
H
I
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
C
I
 
I
L
 
L
G
 
T
K
 
G
A
 
R
T
 
E
L
 
P
K
 
I
V
 
V
K
 
G
P
 
G
E
 
D
E
 
D
A
 
G
I
 
L
E
 
K
V
 
D
L
 
L
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
R
S
 
A
H
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
T
V
 
V
Y
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5a03C Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with xylose (see paper)
27% identity, 85% coverage: 53:343/343 of query aligns to 59:336/336 of 5a03C

query
sites
5a03C
Y
|
Y
R
 
E
S
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
R
L
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
N
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
Y
I
 
V
C
x
I
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
S
Y
x
L
H
|
H
F
 
R
S
 
P
Q
 
F
A
 
T
K
 
E
M
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
M
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
N
S
 
T
S
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
I
S
 
A
L
 
A
A
 
C
K
 
K
S
 
K
K
 
A
G
 
G
-
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
M
S
 
I
A
 
G
F
 
Y
Q
x
R
N
 
S
R
 
R
R
 
F
W
 
Q
D
 
A
G
 
H
D
 
N
F
 
I
Q
 
E
T
 
A
I
 
I
T
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
V
H
 
R
E
 
D
G
 
G
T
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
V
H
 
V
F
 
T
E
 
D
S
 
H
H
 
G
F
|
F
D
 
T
R
 
I
F
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
-
P
 
-
T
 
-
E
 
K
N
 
Q
W
|
W
R
|
R
-
 
L
E
 
N
Q
 
R
Q
 
A
V
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
S
L
 
L
Y
 
M
D
|
D
L
 
I
G
 
G
A
 
I
H
x
Y
L
 
S
I
 
L
D
 
N
Q
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
Y
L
 
L
F
 
T
G
 
G
-
 
E
K
 
E
P
 
P
E
 
V
W
 
A
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
E
 
V
I
 
E
L
 
S
T
 
T
Q
 
D
R
 
R
S
 
S
G
 
D
V
 
P
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
A
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
I
F
 
I
D
 
N
L
 
F
T
 
Q
L
 
L
M
 
L
Y
 
F
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
A
T
 
T
T
 
A
K
 
N
V
 
C
R
 
V
L
 
S
S
 
A
A
 
Y
S
 
S
I
 
V
L
 
N
M
 
C
N
 
N
A
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
R
F
 
Y
L
 
R
V
 
V
L
 
S
G
 
G
D
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
W
Y
 
V
S
 
E
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
L
 
D
P
 
P
G
 
A
S
 
T
D
 
S
H
x
Y
W
 
Q
G
 
G
E
 
Q
E
 
A
D
 
M
P
 
R
S
 
A
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
K
 
G
V
 
P
Y
 
-
L
 
-
E
 
P
G
 
A
T
 
P
S
 
R
Y
 
E
P
 
P
Y
 
A
P
 
P
T
 
Q
V
 
P
K
 
K
G
 
N
N
 
Q
Y
 
F
L
 
S
A
 
A
Y
 
Q
Y
 
L
E
 
D
N
 
H
I
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
C
I
 
I
L
 
L
G
 
T
K
 
G
A
 
R
T
 
E
L
 
P
K
 
I
V
 
V
K
 
G
P
 
G
E
 
D
E
 
D
A
 
G
I
 
L
E
 
K
V
 
D
L
 
L
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
R
S
 
A
H
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
T
V
 
V
Y
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5a02A Crystal structure of aldose-aldose oxidoreductase from caulobacter crescentus complexed with glycerol (see paper)
27% identity, 85% coverage: 53:343/343 of query aligns to 58:335/335 of 5a02A

query
sites
5a02A
Y
|
Y
R
 
E
S
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
R
L
 
I
L
 
I
A
 
D
E
 
N
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
Y
I
 
V
C
x
I
T
|
T
P
|
P
N
 
N
E
 
S
Y
x
L
H
|
H
F
 
R
S
 
P
Q
 
F
A
 
T
K
 
E
M
 
R
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
M
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
N
S
 
T
S
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
I
S
 
A
L
 
A
A
 
C
K
 
K
S
 
K
K
 
A
G
 
G
-
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
M
S
 
I
A
 
G
F
 
Y
Q
x
R
N
 
S
R
 
R
R
 
F
W
 
Q
D
 
A
G
 
H
D
 
N
F
 
I
Q
 
E
T
 
A
I
 
I
T
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
V
H
 
R
E
 
D
G
 
G
T
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
V
H
 
V
F
 
T
E
 
D
S
 
H
H
 
G
F
 
F
D
 
T
R
 
I
F
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
-
P
 
-
T
 
-
E
 
K
N
 
Q
W
|
W
R
|
R
-
 
L
E
 
N
Q
 
R
Q
 
A
V
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
S
L
 
L
Y
 
M
D
 
D
L
 
I
G
 
G
A
 
I
H
x
Y
L
 
S
I
 
L
D
 
N
Q
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
Y
L
 
L
F
 
T
G
 
G
-
 
E
K
 
E
P
 
P
E
 
V
W
 
A
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
E
 
V
I
 
E
L
 
S
T
 
T
Q
 
D
R
 
R
S
 
S
G
 
D
V
 
P
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
A
 
V
D
 
E
D
 
D
F
 
I
F
 
I
D
 
N
L
 
F
T
 
Q
L
 
L
M
 
L
Y
 
F
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
A
T
 
T
T
 
A
K
 
N
V
 
C
R
 
V
L
 
S
S
 
A
A
 
Y
S
 
S
I
 
V
L
 
N
M
 
C
N
 
N
A
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
R
F
 
Y
L
 
R
V
 
V
L
 
S
G
 
G
D
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
W
Y
 
V
S
 
E
K
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
L
 
D
P
 
P
G
 
A
S
 
T
D
 
S
H
x
Y
W
 
Q
G
 
G
E
 
Q
E
 
A
D
 
M
P
 
R
S
 
A
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
K
 
G
V
 
P
Y
 
-
L
 
-
E
 
P
G
 
A
T
 
P
S
 
R
Y
 
E
P
 
P
Y
 
A
P
 
P
T
 
Q
V
 
P
K
 
K
G
 
N
N
 
Q
Y
 
F
L
 
S
A
 
A
Y
 
Q
Y
 
L
E
 
D
N
 
H
I
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
C
I
 
I
L
 
L
G
 
T
K
 
G
A
 
R
T
 
E
L
 
P
K
 
I
V
 
V
K
 
G
P
 
G
E
 
D
E
 
D
A
 
G
I
 
L
E
 
K
V
 
D
L
 
L
K
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
R
S
 
A
H
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
T
V
 
V
Y
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7cgqA Crystal structure of azospirillum brasilense l-arabinose 1- dehydrogenase e147a mutant (NADP and l-arabinose bound form)
34% identity, 50% coverage: 8:178/343 of query aligns to 5:168/306 of 7cgqA

query
sites
7cgqA
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
I
G
|
G
R
x
K
V
x
I
A
 
A
Q
 
R
T
 
D
M
 
Q
H
 
H
A
 
L
P
 
P
L
 
A
I
 
I
H
 
D
Q
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
G
L
 
F
D
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
C
V
 
A
E
x
S
R
|
R
H
|
H
H
 
A
Q
 
E
K
 
V
S
 
T
K
 
-
E
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
V
T
 
R
V
 
N
Y
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
A
E
 
E
A
 
R
D
 
E
V
 
L
D
 
D
L
 
A
I
 
V
V
 
S
I
 
L
C
|
C
T
x
A
P
|
P
N
 
P
E
 
Q
Y
x
V
H
 
R
F
 
Y
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
R
M
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
M
V
 
L
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
P
T
 
G
V
 
A
S
 
T
S
 
L
S
 
G
E
 
E
A
 
V
E
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
S
 
E
K
 
R
G
 
G
K
 
L
L
 
T
L
 
L
S
 
F
A
 
A
F
 
T
Q
 
W
N
x
H
R
 
S
R
 
R
W
 
C
D
 
A
G
 
S
D
 
A
F
 
V
Q
 
E
T
 
P
I
 
A
T
 
R
K
 
E
L
 
W
L
 
L
H
 
A
E
 
T
G
 
R
T
 
A
L
 
I
G
 
-
R
 
R
I
 
A
V
 
V
H
 
Q
F
 
V
E
 
R
S
 
W
H
 
K
F
 
A
D
 
D
R
 
V
F
 
R
R
 
R
P
 
W
E
x
H
P
 
P
T
 
G
E
x
Q
N
 
Q
W
|
W
R
 
I
E
 
W
Q
 
E
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
G
 
G
S
 
G
G
 
L
I
 
G
L
 
V
Y
 
F
D
|
D
L
x
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3q2kK Crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis in complex with nadh and udp-glcnaca (see paper)
22% identity, 99% coverage: 3:343/343 of query aligns to 1:319/322 of 3q2kK

query
sites
3q2kK
Q
 
R
P
 
K
L
 
I
K
 
R
T
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
|
G
F
 
C
G
|
G
R
|
R
V
x
I
A
 
S
Q
 
K
T
 
N
M
 
H
H
 
I
A
 
G
P
 
A
L
 
I
I
 
A
H
 
Q
Q
 
H
E
 
G
P
 
D
L
 
R
L
 
A
D
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
E
V
 
I
V
 
C
E
x
D
R
x
T
H
 
N
H
 
P
Q
 
E
-
 
A
-
 
L
K
 
Q
S
 
A
K
 
A
E
 
E
K
 
A
Y
 
A
P
 
T
A
 
G
V
 
A
T
 
R
V
 
P
Y
 
F
R
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
S
A
 
D
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
G
D
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
A
I
 
L
V
 
V
I
 
L
C
 
A
T
|
T
P
|
P
N
x
S
E
 
G
Y
x
L
H
|
H
F
 
P
S
 
W
Q
 
Q
A
 
A
K
 
I
M
 
E
A
 
V
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
K
 
R
H
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
S
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
T
 
A
V
 
T
S
 
R
S
 
W
S
 
E
E
 
D
A
 
G
E
 
K
A
 
R
L
 
M
L
 
V
S
 
K
L
 
A
A
 
C
K
 
D
S
 
E
K
 
A
G
 
G
-
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
F
S
 
V
A
 
V
F
 
K
Q
|
Q
N
 
N
R
 
R
R
 
R
W
 
-
D
 
N
G
 
A
D
 
T
F
 
L
Q
 
Q
T
 
L
I
 
V
T
 
K
K
 
K
L
 
A
L
 
I
H
 
E
E
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
Y
H
 
M
F
 
V
E
 
T
S
 
V
H
 
N
F
 
V
D
 
F
R
 
W
F
x
T
R
|
R
P
 
P
E
 
Q
-
 
E
-
x
Y
-
 
Y
P
 
D
T
 
A
E
 
A
N
 
R
W
|
W
R
|
R
E
 
G
Q
 
K
Q
 
W
V
 
E
P
 
W
G
 
D
S
 
G
G
 
G
I
 
A
L
 
F
Y
 
M
D
x
N
L
x
Q
G
 
A
A
 
S
H
|
H
L
 
Y
I
 
V
D
 
D
Q
 
L
A
 
L
L
 
D
L
 
W
L
 
L
F
 
V
G
 
G
K
 
P
P
 
V
E
 
E
W
 
S
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Y
I
 
T
L
 
A
T
 
T
Q
 
L
R
 
A
S
 
R
G
 
R
V
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
E
D
 
D
F
 
T
F
 
G
D
 
V
L
 
A
T
 
A
L
 
L
M
 
R
Y
 
W
P
 
R
T
 
H
T
 
G
K
 
A
V
 
M
R
 
G
L
 
S
S
 
I
A
 
N
S
 
V
I
 
T
L
 
M
M
 
L
N
 
T
A
 
Y
P
 
P
L
 
Q
P
x
N
-
 
L
-
 
E
-
 
G
K
 
S
F
 
I
L
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
E
K
 
K
G
 
G
S
 
T
Y
 
V
S
 
R
K
 
V
Y
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
A
V
 
V
Q
 
N
E
 
R
A
 
I
A
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
D
H
 
E
W
 
W
G
 
K
E
 
F
E
 
A
D
 
E
P
 
P
S
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
G
Y
 
H
P
 
P
Y
 
L
P
 
-
T
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
I
 
V
A
 
I
E
 
N
T
 
C
I
 
L
L
 
R
G
 
G
K
 
D
A
 
C
T
 
E
L
 
P
K
 
E
V
 
T
K
 
D
P
 
G
E
 
R
E
 
E
A
 
G
I
 
L
E
 
Q
V
 
S
L
 
L
K
 
A
V
 
L
I
 
L
E
 
T
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
R
S
 
S
H
 
A
A
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
V
R
 
R
V
 
I
Y
 
P
L
 
L

7x2yA Crystal structure of cis-4,5-dihydrodiol phthalate dehydrogenase in complex with NAD+ and 3-hydroxybenzoate (see paper)
29% identity, 54% coverage: 5:190/343 of query aligns to 4:186/342 of 7x2yA

query
sites
7x2yA
L
 
L
K
 
R
T
 
L
G
 
G
L
 
V
V
 
A
G
|
G
F
 
L
G
|
G
R
|
R
V
 
-
A
|
A
Q
 
F
T
 
T
M
 
L
H
 
M
A
 
L
P
 
P
L
 
T
I
 
L
H
 
Q
Q
 
Q
E
 
D
P
 
P
L
 
R
L
 
I
D
 
K
L
 
L
T
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
C
E
x
D
-
x
P
-
x
R
-
 
G
-
 
S
-
 
A
R
 
R
H
 
A
H
 
Q
Q
 
F
K
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
F
K
 
R
Y
 
A
P
 
P
A
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
V
Y
 
Y
R
 
P
S
 
D
L
 
I
E
 
E
A
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
S
E
 
N
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
E
L
 
A
I
 
I
V
 
Y
I
 
I
C
x
A
T
x
S
P
|
P
N
 
H
E
 
Q
Y
x
F
H
 
H
F
 
A
S
 
Q
Q
|
Q
A
 
A
K
 
R
M
 
I
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
H
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
L
V
 
V
D
x
E
K
|
K
P
|
P
I
 
M
T
 
A
V
 
L
S
 
S
S
 
L
S
 
G
E
 
D
A
 
C
E
 
D
A
 
E
L
 
M
L
 
I
S
 
Q
L
 
H
A
 
C
K
 
R
S
 
D
K
 
A
G
 
G
K
 
V
L
 
H
L
 
L
S
 
I
A
 
V
F
 
G
Q
x
H
N
 
C
R
 
H
R
 
S
W
 
F
D
 
D
G
 
T
D
 
P
F
 
Y
Q
 
L
T
 
S
I
 
A
T
 
R
K
 
E
L
 
I
L
 
V
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
T
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
V
R
 
R
I
 
M
V
 
V
H
 
H
F
 
A
E
 
L
S
 
N
H
 
Y
F
 
T
D
 
D
-
 
F
R
 
L
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
E
x
R
P
 
R
T
x
P
E
|
E
N
 
E
W
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
V
Y
 
F
D
 
S
L
x
Q
G
 
A
A
 
A
H
|
H
L
 
Q
I
 
V
D
 
D
Q
 
I
A
 
V
L
 
R
L
 
L
L
 
L
F
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7xr9A Crystal structure of dgpa with glucose (see paper)
27% identity, 80% coverage: 59:334/343 of query aligns to 55:336/344 of 7xr9A

query
sites
7xr9A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
E
V
 
V
D
 
E
L
 
V
I
 
V
V
 
H
I
 
V
C
|
C
T
|
T
P
|
P
N
 
N
E
 
V
Y
 
S
H
|
H
F
 
S
S
 
E
Q
 
I
A
 
T
K
 
I
M
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
Y
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
|
P
I
 
M
T
 
S
V
 
H
S
 
S
S
 
T
S
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
M
L
 
V
S
 
E
L
 
A
A
 
W
K
 
K
S
 
K
K
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
Q
L
 
F
S
 
T
A
 
I
F
 
G
Q
 
Y
N
x
Q
R
 
N
R
 
R
W
 
F
D
 
R
G
 
E
D
 
E
F
 
V
Q
 
M
T
 
N
I
 
L
T
 
K
K
 
K
L
 
S
L
 
C
H
 
D
E
 
K
G
 
G
T
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
E
I
 
I
V
 
Y
H
 
Y
F
 
G
E
 
K
S
 
A
H
 
H
F
 
A
D
 
V
R
|
R
F
 
R
R
 
R
P
 
A
E
 
V
P
 
P
T
 
T
E
 
-
N
 
-
W
|
W
-
 
G
-
x
V
-
x
F
R
 
M
E
 
D
Q
 
K
Q
 
E
V
 
A
P
x
Q
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
P
L
 
L
Y
 
I
D
|
D
L
 
I
G
 
G
A
 
T
H
|
H
L
 
A
I
 
L
D
 
D
Q
 
I
A
 
T
L
 
L
L
 
W
L
 
C
F
 
M
G
 
N
K
 
N
P
 
Y
E
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
G
W
 
S
V
 
V
Y
 
F
A
 
Y
E
 
K
I
 
L
L
 
G
T
 
Q
Q
 
K
R
 
E
S
 
N
G
 
G
V
 
P
E
 
E
A
 
G
D
 
N
D
 
L
F
 
F
-
 
G
-
 
P
F
 
W
D
 
D
L
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
Y
 
-
P
 
P
T
 
K
T
 
T
K
 
-
V
 
F
R
 
E
L
 
V
S
 
E
A
 
D
S
 
S
I
 
A
L
 
V
M
 
G
N
 
F
A
 
V
P
 
K
L
 
M
P
 
K
K
 
N
F
 
G
L
 
A
V
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
L
K
 
E
G
 
A
S
 
S
Y
 
W
S
 
A
K
 
I
Y
 
N
G
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
S
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
T
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
T
L
 
L
P
 
C
G
 
G
S
 
T
D
 
E
H
 
-
W
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
Y
 
A
G
 
G
K
 
A
V
 
E
Y
 
I
L
 
H
E
 
S
G
 
G
T
 
M
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
K
P
 
N
T
 
E
V
 
L
K
 
I
G
 
Y
N
 
N
Y
 
R
L
 
A
A
 
R
Y
 
N
Y
 
N
E
 
Q
N
 
L
I
 
M
A
 
E
E
 
E
T
 
T
I
 
L
L
 
S
G
 
E
K
 
E
A
 
G
T
 
T
L
 
V
K
 
D
-
 
N
-
 
R
-
 
Q
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
P
-
 
L
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
V
 
V
L
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
K
S
 
S

Sites not aligning to the query:

7xreC Crystal structure of dgpa
27% identity, 80% coverage: 59:334/343 of query aligns to 65:355/363 of 7xreC

query
sites
7xreC
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
P
D
 
E
V
 
V
D
 
E
L
 
V
I
 
V
V
 
H
I
 
V
C
 
C
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
V
Y
 
S
H
|
H
F
 
S
S
 
E
Q
 
I
A
 
T
K
 
I
M
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
Y
V
 
C
D
x
E
K
|
K
P
|
P
I
 
M
T
 
S
V
 
H
S
 
S
S
 
T
S
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
K
L
 
M
L
 
V
S
 
E
L
 
A
A
 
W
K
 
K
S
 
K
K
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
Q
L
 
F
S
 
T
A
 
I
F
 
G
Q
 
Y
N
 
Q
R
 
N
R
 
R
W
 
F
D
 
R
G
 
E
D
 
E
F
 
V
Q
 
M
T
 
N
I
 
L
T
 
K
K
 
K
L
 
S
L
 
C
H
 
D
E
 
K
G
 
G
T
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
E
I
 
I
V
 
Y
H
 
Y
F
 
G
E
 
K
S
 
A
H
 
H
F
 
A
D
 
V
R
 
R
F
 
R
R
 
R
P
 
A
E
 
V
P
 
P
T
 
T
E
 
W
N
 
G
-
 
V
W
x
F
R
 
M
E
 
D
Q
 
K
Q
 
E
V
 
A
P
x
Q
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
P
L
 
L
Y
 
I
D
 
D
L
 
I
G
 
G
A
 
T
H
|
H
L
 
A
I
 
L
D
 
D
Q
 
I
A
 
T
L
 
L
L
 
W
L
 
C
F
 
M
G
 
N
K
 
N
P
 
Y
E
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
G
W
 
S
V
 
V
Y
 
F
A
 
Y
E
 
K
I
 
L
L
 
G
T
 
Q
Q
 
K
R
 
E
S
 
N
G
 
G
V
 
P
E
 
E
A
 
G
D
 
N
D
 
L
F
 
F
-
 
G
-
 
P
F
 
W
D
 
D
L
 
-
T
 
-
L
 
-
M
 
-
Y
 
-
P
 
P
T
 
K
T
 
T
K
 
-
V
 
F
R
 
E
L
 
V
S
 
E
A
 
D
S
 
S
I
 
A
L
 
V
M
 
G
N
 
F
A
 
V
P
 
K
L
 
M
P
 
K
K
 
N
F
 
G
L
 
A
V
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
L
K
 
E
G
 
A
S
 
S
Y
 
W
S
 
A
K
 
I
Y
 
N
G
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
S
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
T
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
T
L
 
L
P
 
C
G
 
G
S
 
T
D
 
E
H
 
A
W
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
G
K
 
A
V
 
E
Y
 
I
L
 
H
E
 
S
G
 
G
T
 
M
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
-
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
I
Y
 
Y
P
 
N
T
 
R
V
 
A
K
 
R
G
 
N
N
 
N
Y
 
Q
L
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
I
A
 
A
Y
|
Y
Y
x
F
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
N
E
 
R
N
 
Q
I
 
W
A
 
L
E
 
E
T
 
A
I
 
I
L
 
Q
G
 
N
K
 
G
A
 
T
T
 
E
L
 
P
K
 
L
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
V
 
V
L
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
I
Q
 
Y
K
 
K
S
 
S

Sites not aligning to the query:

6norA Crystal structure of gend2 from gentamicin a biosynthesis in complex with NAD (see paper)
23% identity, 94% coverage: 20:343/343 of query aligns to 27:347/349 of 6norA

query
sites
6norA
H
 
H
A
 
A
P
 
E
L
 
V
I
 
L
H
 
T
Q
 
A
E
 
D
P
 
P
L
 
R
L
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
R
A
 
W
V
 
V
V
 
V
E
x
D
R
|
R
H
 
D
H
 
E
Q
 
R
K
 
V
S
 
G
K
 
T
E
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
T
K
 
R
Y
 
F
P
 
G
A
 
A
V
 
-
T
 
R
V
 
V
Y
 
T
R
 
T
S
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
D
D
 
T
V
 
V
D
 
R
L
 
F
I
 
V
V
 
V
I
 
V
C
x
A
T
|
T
P
|
P
N
 
A
E
 
A
Y
 
T
H
|
H
F
 
E
S
 
P
Q
 
I
A
 
A
K
 
A
M
 
Q
A
 
V
L
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
R
H
 
N
V
 
V
V
 
L
V
 
V
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
T
 
V
V
 
L
S
 
S
S
 
T
S
 
G
E
 
H
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
L
 
L
L
 
A
S
 
A
L
 
A
A
 
A
K
 
H
S
 
E
K
 
R
G
 
G
K
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
A
A
 
H
F
 
G
Q
 
G
N
|
N
R
 
F
R
 
V
W
 
Y
D
 
A
G
 
P
D
 
K
F
 
F
Q
 
V
T
 
R
I
 
A
T
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
A
H
 
A
E
 
D
G
 
R
-
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
T
I
 
V
V
 
H
H
 
S
F
 
V
E
 
R
S
 
V
H
 
A
F
 
F
D
 
R
R
 
T
F
 
S
R
 
G
P
 
P
E
 
D
P
 
-
T
|
T
E
 
D
N
x
W
W
 
F
R
 
R
E
 
S
Q
 
K
Q
 
A
V
 
T
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
A
L
 
L
Y
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
W
H
 
H
L
 
A
I
 
V
D
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
R
L
 
W
L
 
M
F
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
A
W
 
-
V
 
I
Y
 
R
A
 
A
E
 
V
I
 
T
L
 
A
T
 
C
Q
 
T
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
V
 
S
E
 
A
A
 
A
D
 
G
D
 
D
F
 
V
F
 
E
D
 
D
L
 
Q
T
 
G
L
 
V
M
 
V
Y
 
L
P
 
-
T
 
-
T
 
-
K
 
-
V
 
I
R
 
E
L
 
F
S
 
A
A
 
D
S
 
G
I
 
A
L
 
I
M
 
G
N
 
Q
A
 
C
P
 
D
L
 
V
P
 
S
K
 
W
F
 
A
L
 
C
V
 
P
L
 
G
G
 
G
D
 
E
K
 
Q
G
 
L
S
 
T
Y
 
V
S
 
E
K
 
V
Y
 
I
G
 
G
L
 
-
D
 
-
V
 
-
Q
 
T
E
 
E
A
 
G
A
 
L
F
 
V
K
 
T
A
 
A
G
 
D
I
 
L
L
 
W
P
 
Q
G
 
G
S
 
M
D
 
-
H
 
-
W
 
-
G
 
G
E
 
V
E
 
E
-
 
A
-
 
Y
D
 
T
P
 
N
S
 
T
S
 
K
Y
 
F
G
 
G
K
 
A
V
 
V
Y
 
W
L
 
E
E
 
P
G
 
N
T
 
Q
S
 
G
Y
 
W
P
 
L
Y
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
W
T
 
I
V
 
R
K
 
N
G
 
S
N
 
G
Y
|
Y
L
 
V
A
 
H
Y
 
Q
Y
 
D
E
 
R
N
 
Q
I
 
V
A
 
V
E
 
D
T
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
D
K
 
G
A
 
R
T
 
P
L
 
M
K
 
T
V
 
H
K
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
A
V
 
V
L
 
V
K
 
E
V
 
T
I
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
K
 
R
S
 
S
H
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
K
V
 
V
Y
 
E
L
 
M

Sites not aligning to the query:

6jw8A The crystal structure of kand2 in complex with nadh and 3"-deamino-3"- hydroxykanamycin b (see paper)
30% identity, 54% coverage: 4:189/343 of query aligns to 1:188/342 of 6jw8A

query
sites
6jw8A
P
 
P
L
 
V
K
 
R
T
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
A
G
|
G
R
x
F
V
x
M
A
 
G
Q
 
-
T
 
G
M
 
V
H
 
H
A
 
A
P
 
E
L
 
V
I
 
V
H
 
A
Q
 
A
E
 
H
P
 
P
L
 
G
L
 
A
D
 
R
L
 
L
T
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
H
E
x
D
R
x
L
H
 
D
H
 
P
Q
 
A
K
 
A
S
 
A
K
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
A
E
 
E
K
 
R
Y
 
F
P
 
R
A
 
A
V
 
E
T
 
R
V
 
A
Y
 
E
R
 
P
S
 
S
L
 
W
E
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
P
D
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
I
I
 
I
C
x
T
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
G
Y
x
L
H
|
H
F
 
H
S
 
R
Q
|
Q
A
 
A
K
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
L
V
 
V
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
T
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
P
S
 
E
E
 
Q
A
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
G
S
 
R
K
 
H
G
 
D
K
 
R
L
 
V
L
 
L
S
 
A
A
 
H
F
 
G
Q
 
S
N
|
N
R
 
F
R
 
V
W
 
H
D
 
S
G
 
P
D
 
K
F
 
F
Q
 
V
T
 
R
I
 
A
T
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
H
 
A
E
 
D
G
 
T
-
 
E
T
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
P
V
 
H
H
 
L
F
 
V
E
 
R
S
 
V
H
 
V
F
|
F
D
 
R
R
x
N
F
 
S
R
 
G
P
 
P
E
 
E
P
 
A
T
 
A
E
 
-
N
 
-
W
|
W
-
 
A
R
 
A
E
 
S
Q
 
K
Q
 
D
V
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
|
D
L
|
L
G
 
G
A
 
C
H
|
H
L
 
A
I
 
V
D
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
R
L
 
W
L
 
L
F
 
L

Sites not aligning to the query:

6jw7A The crystal structure of kand2 in complex with nadh and 3"-deamino-3"- hydroxykanamycin a (see paper)
30% identity, 54% coverage: 4:189/343 of query aligns to 1:188/342 of 6jw7A

query
sites
6jw7A
P
 
P
L
 
V
K
 
R
T
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
|
G
F
 
A
G
|
G
R
x
F
V
x
M
A
 
G
Q
 
-
T
 
G
M
 
V
H
 
H
A
 
A
P
 
E
L
 
V
I
 
V
H
 
A
Q
 
A
E
 
H
P
 
P
L
 
G
L
 
A
D
 
R
L
 
L
T
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
H
E
x
D
R
x
L
H
 
D
H
 
P
Q
 
A
K
 
A
S
 
A
K
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
A
E
 
E
K
 
R
Y
 
F
P
 
R
A
 
A
V
 
E
T
 
R
V
 
A
Y
 
E
R
 
P
S
 
S
L
 
W
E
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
P
D
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
I
I
 
I
C
x
T
T
|
T
P
|
P
N
|
N
E
 
G
Y
x
L
H
|
H
F
 
H
S
 
R
Q
|
Q
A
 
A
K
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
V
 
L
V
 
V
D
x
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
T
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
P
S
 
E
E
 
Q
A
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
G
S
 
R
K
 
H
G
 
D
K
 
R
L
 
V
L
 
L
S
 
A
A
 
H
F
 
G
Q
 
S
N
|
N
R
 
F
R
 
V
W
 
H
D
 
S
G
 
P
D
 
K
F
 
F
Q
 
V
T
 
R
I
 
A
T
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
H
 
A
E
 
D
G
 
T
-
 
E
T
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
P
V
 
H
H
 
L
F
 
V
E
 
R
S
 
V
H
 
V
F
 
F
D
 
R
R
x
N
F
 
S
R
 
G
P
 
P
E
 
E
P
 
A
T
 
A
E
 
-
N
 
-
W
|
W
-
 
A
R
 
A
E
 
S
Q
 
K
Q
 
D
V
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
|
D
L
 
L
G
 
G
A
 
C
H
|
H
L
 
A
I
 
V
D
 
E
Q
 
L
A
 
C
L
 
R
L
 
W
L
 
L
F
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Echvi_1123 FitnessBrowser__Cola:Echvi_1123
MTQPLKTGLVGFGRVAQTMHAPLIHQEPLLDLTAVVERHHQKSKEKYPAVTVYRSLEALL
AEADVDLIVICTPNEYHFSQAKMALEAGKHVVVDKPITVSSSEAEALLSLAKSKGKLLSA
FQNRRWDGDFQTITKLLHEGTLGRIVHFESHFDRFRPEPTENWREQQVPGSGILYDLGAH
LIDQALLLFGKPEWVYAEILTQRSGVEADDFFDLTLMYPTTKVRLSASILMNAPLPKFLV
LGDKGSYSKYGLDVQEAAFKAGILPGSDHWGEEDPSSYGKVYLEGTSYPYPTVKGNYLAY
YENIAETILGKATLKVKPEEAIEVLKVIEAAQKSHAEGKRVYL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory