SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_4481 Echvi_4481 mercuric reductase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

D9J041 Mercuric reductase; Hg(II) reductase; EC 1.16.1.1 from Lysinibacillus sphaericus (Bacillus sphaericus) (see paper)
39% identity, 83% coverage: 109:646/647 of query aligns to 7:545/546 of D9J041

query
sites
D9J041
S
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
M
 
M
T
 
T
C
 
C
D
 
T
H
 
G
C
 
C
A
 
E
T
 
K
S
 
H
I
 
V
E
 
E
K
 
S
R
 
A
F
 
L
E
 
E
G
 
K
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
I
I
 
G
S
 
A
K
 
K
S
 
N
V
 
I
S
 
E
Y
 
S
A
 
S
D
 
Y
E
 
R
K
 
R
G
 
G
T
 
E
F
 
A
I
 
V
F
 
F
N
 
E
-
 
L
P
 
P
D
 
D
K
 
D
I
 
I
S
 
E
R
 
V
Q
 
E
E
 
S
I
 
A
I
 
I
E
 
K
T
 
A
I
 
I
N
 
D
K
 
-
E
 
E
G
 
A
N
 
N
Y
 
Y
K
 
Q
V
 
A
Q
 
G
K
 
E
-
 
I
-
 
E
E
 
E
I
 
V
G
 
S
G
 
S
N
 
L
G
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
A
R
 
L
A
 
I
D
 
N
P
 
E
G
 
D
Q
 
N
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
S
A
 
A
T
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
I
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
L
 
A
T
 
K
V
 
V
L
 
G
M
 
M
V
 
I
N
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
-
D
 
T
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
C
|
C
V
 
V
N
 
N
V
 
I
G
 
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
 
S
K
 
K
H
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
G
E
 
E
Q
 
I
V
 
I
H
 
H
R
 
L
A
 
S
Q
 
K
H
 
D
S
 
N
P
 
P
F
 
F
N
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
Q
G
 
T
A
 
S
N
 
A
P
 
G
T
 
E
F
 
V
D
 
D
F
 
L
K
 
A
A
 
S
T
 
L
I
 
I
Q
 
T
Q
 
Q
K
 
K
K
 
D
E
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
L
Q
 
R
K
 
N
K
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
L
 
M
G
 
D
V
 
L
V
 
I
G
 
-
D
 
D
L
 
E
D
 
Y
N
 
N
I
 
F
T
 
D
I
 
L
L
 
I
E
 
K
G
 
G
W
 
E
A
 
A
R
 
K
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
H
 
S
T
 
T
I
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
A
P
 
K
Y
 
L
K
 
S
G
 
A
M
 
K
K
 
R
Y
 
F
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
T
 
P
N
 
S
V
 
L
P
 
P
D
 
Q
L
 
I
P
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
K
V
 
M
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
S
E
 
T
T
 
T
L
 
L
F
 
L
D
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
K
Q
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
I
 
T
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
G
L
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
L
Y
 
F
H
 
H
R
 
H
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
T
M
 
L
L
 
M
H
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
E
Q
 
Y
A
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
E
D
 
S
L
 
V
T
 
E
S
 
K
H
 
A
F
 
L
T
 
I
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
N
V
 
L
H
 
V
T
 
K
N
 
G
V
 
A
S
 
T
I
 
F
Q
 
E
K
 
R
F
 
V
E
 
E
K
 
Q
N
 
S
G
 
G
D
 
E
A
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
V
-
 
Y
I
 
V
V
 
T
A
 
V
H
 
N
T
 
G
N
 
S
E
 
R
G
 
E
T
 
V
F
 
I
E
 
E
A
 
S
S
 
D
H
 
Q
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
R
R
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
D
G
 
S
L
 
L
A
 
N
I
 
L
E
 
S
N
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
E
L
 
T
N
 
G
K
 
K
T
 
N
G
 
N
H
 
E
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
D
K
 
F
Q
 
G
E
 
Q
T
 
T
N
 
S
V
 
N
G
 
E
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
V
T
 
T
D
 
L
T
 
G
P
 
P
A
 
Q
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
Y
E
 
E
G
 
G
K
 
G
V
 
I
A
 
I
V
 
T
L
 
D
N
 
N
A
 
A
F
 
I
Q
 
G
S
 
G
T
 
L
G
 
N
D
 
K
M
 
K
V
 
I
D
 
D
Y
 
L
T
 
S
G
 
V
L
 
V
P
 
P
W
 
A
V
 
V
V
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
N
P
 
P
Q
 
T
I
 
V
A
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
K
E
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
Y
P
 
D
Y
 
V
E
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
D
E
 
A
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
I
A
 
V
A
 
N
L
 
R
D
 
E
T
 
T
R
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
F
K
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
A
N
 
D
S
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
I
I
 
V
A
 
S
P
 
E
E
 
N
G
 
A
G
 
G
E
 
D
L
 
V
A
 
I
M
 
Y
Q
 
A
V
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
T
F
 
L
H
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
T
 
T
F
 
F
N
 
D
K
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
W
E
 
K
L
 
L
S
 
S
C
 
C
C
 
C
A
 
A

P16171 Mercuric reductase; Hg(II) reductase; EC 1.16.1.1 from Bacillus cereus (see paper)
34% identity, 96% coverage: 27:646/647 of query aligns to 6:630/631 of P16171

query
sites
P16171
L
 
V
E
 
N
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
M
 
M
T
 
T
C
 
C
D
 
S
H
 
G
C
 
C
A
 
E
T
 
Q
G
 
H
I
 
V
E
 
A
K
 
V
K
 
A
V
 
L
G
 
E
H
 
N
L
 
M
V
 
-
G
 
G
T
 
A
A
 
K
S
 
A
Q
 
I
K
 
E
V
 
V
N
 
D
Y
 
F
P
 
R
E
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
A
I
 
V
F
 
F
S
 
E
Y
 
L
D
 
-
P
 
P
E
 
D
K
 
D
V
 
V
S
 
K
K
 
V
K
 
E
E
 
D
I
 
A
I
 
K
D
 
N
T
 
A
I
 
I
N
 
A
G
 
D
M
 
A
G
 
N
N
 
Y
Y
 
H
S
 
P
V
 
G
K
 
E
K
 
A
E
 
E
L
 
E
P
 
F
A
 
Q
S
 
S
S
 
E
N
 
Q
G
 
K
Q
 
T
G
 
N
T
 
L
E
 
L
E
 
K
E
 
K
V
 
Y
T
 
R
F
 
L
S
 
N
I
 
V
S
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
C
 
C
D
 
T
H
 
G
C
 
C
A
 
E
T
 
E
S
 
H
I
 
I
E
 
A
K
 
V
R
 
A
F
 
L
E
 
E
G
 
N
H
 
A
E
 
G
G
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
A
K
 
K
S
 
G
V
 
I
S
 
E
Y
 
V
A
 
D
D
 
F
E
 
R
K
 
R
G
 
G
T
 
E
F
 
A
I
 
L
F
 
F
N
 
E
P
 
L
D
 
P
K
 
Y
I
 
D
S
 
V
R
 
D
Q
 
I
E
 
D
I
 
I
I
 
A
E
 
K
T
 
T
I
 
A
N
 
I
K
 
T
E
 
D
G
 
A
N
 
Q
Y
 
Y
K
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
K
 
S
E
 
E
I
 
K
G
 
R
G
 
T
N
 
D
G
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
N
R
 
D
A
 
E
D
 
G
P
 
N
G
 
Y
Q
 
D
H
 
Y
D
 
D
L
 
Y
I
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
S
A
 
A
T
 
I
T
 
E
A
 
A
N
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
N
L
 
A
T
 
K
V
 
V
L
 
A
M
 
M
V
 
I
N
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
-
D
 
T
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
 
C
V
 
V
P
 
P
S
 
S
K
 
K
H
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
G
E
 
E
Q
 
I
V
 
N
H
 
H
R
 
L
A
 
A
Q
 
K
H
 
N
S
 
N
P
 
P
F
 
F
N
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
H
G
 
T
A
 
S
N
 
A
P
 
S
T
 
N
F
 
V
D
 
D
F
 
L
K
 
A
A
 
P
T
 
L
I
 
V
Q
 
K
Q
 
Q
K
 
K
K
 
N
E
 
D
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
E
L
 
M
Q
 
R
K
 
N
K
 
E
K
 
K
Y
|
Y
L
 
V
G
 
N
V
 
L
V
 
I
G
 
D
D
 
D
L
 
Y
D
 
-
N
 
G
I
 
F
T
 
E
I
 
L
L
 
I
E
 
K
G
 
G
W
 
E
A
 
S
R
 
K
F
 
F
V
 
V
D
 
N
A
 
E
H
 
N
T
 
T
I
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
N
P
 
Q
Y
 
I
K
 
T
G
 
A
M
 
K
K
 
R
Y
 
F
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
T
 
S
N
 
T
V
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
E
V
 
V
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
S
E
 
T
T
 
S
L
 
L
F
 
L
D
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
K
Q
 
V
P
 
P
E
 
N
H
 
R
L
 
L
I
 
T
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
G
L
 
M
E
 
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
L
Y
 
F
H
 
H
R
 
N
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
L
L
 
I
H
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
E
Q
 
Y
A
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
E
D
 
A
L
 
I
T
 
T
S
 
K
H
 
A
F
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
N
V
 
L
H
 
V
T
 
T
N
 
G
V
 
A
S
 
T
I
 
Y
Q
 
E
K
 
R
F
 
V
E
 
E
K
 
Q
N
 
D
G
 
G
D
 
D
A
 
I
I
 
K
V
 
K
A
 
V
H
 
H
T
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
N
-
 
G
N
 
K
E
 
K
G
 
R
T
 
I
F
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
V
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
R
R
 
K
P
 
P
N
 
I
T
 
Q
S
 
T
G
 
S
L
 
L
A
 
N
I
 
L
E
 
H
N
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
E
L
 
V
N
 
G
K
 
S
T
 
R
G
 
G
H
 
E
I
 
I
L
 
V
V
 
I
N
 
D
T
 
D
K
 
Y
Q
 
L
E
 
K
T
 
T
N
 
T
V
 
N
G
 
S
H
 
R
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
V
T
 
T
D
 
P
T
 
G
P
 
P
A
 
Q
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
Y
E
 
E
G
 
G
K
 
G
V
 
L
A
 
A
V
 
A
L
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
I
Q
 
G
S
 
G
T
 
L
G
 
N
D
 
Q
M
 
K
V
 
V
D
 
N
Y
 
L
T
 
E
G
 
V
L
 
V
P
 
P
W
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
S
P
 
P
Q
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
Q
E
 
Q
A
 
A
E
 
K
E
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
Y
P
 
E
Y
 
V
E
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
D
E
 
A
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
A
 
V
A
 
N
L
 
R
D
 
E
T
 
T
R
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
F
K
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
A
N
 
D
S
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
H
I
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
E
E
 
N
G
 
A
G
 
G
E
 
D
L
 
V
A
 
I
M
 
Y
Q
 
A
V
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
G
E
 
D
L
 
L
A
 
R
D
 
E
A
 
T
F
 
M
H
 
A
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
V
I
 
L
T
 
T
F
 
F
N
 
D
K
 
K
D
 
D
V
 
V
S
 
S
E
 
K
L
 
L
S
 
S
C
 
C
C
 
C
A
 
A

5x1yB Structure of mercuric reductase from lysinibacillus sphaericus (see paper)
40% identity, 69% coverage: 188:636/647 of query aligns to 4:454/454 of 5x1yB

query
sites
5x1yB
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
L
I
 
I
I
|
I
G
 
G
G
 
S
G
|
G
S
x
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
S
A
 
A
T
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
I
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
L
 
A
T
 
K
V
 
V
L
 
G
M
 
M
V
x
I
N
x
E
A
x
R
G
 
G
L
 
-
D
 
T
I
x
V
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
V
N
 
N
V
 
I
G
|
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
G
E
 
E
Q
 
I
V
 
I
H
 
H
R
 
L
A
 
S
Q
 
K
H
 
D
S
 
N
P
 
P
F
 
F
N
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
Q
G
 
T
A
 
S
N
x
A
P
x
G
T
 
E
F
 
V
D
 
D
F
 
L
K
 
A
A
 
S
T
 
L
I
 
I
Q
 
T
Q
 
Q
K
 
K
K
 
D
E
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
L
Q
 
R
K
 
N
K
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
L
 
M
G
 
D
V
 
L
V
 
I
G
 
-
D
 
D
L
 
E
D
 
Y
N
 
N
I
 
F
T
 
D
I
 
L
L
 
I
E
 
K
G
 
G
W
 
E
A
|
A
R
 
K
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
H
 
S
T
 
T
I
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
A
P
 
K
Y
 
L
K
 
S
G
 
A
M
 
K
K
 
R
Y
 
F
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
T
 
P
N
 
S
V
 
L
P
 
P
D
 
Q
L
 
I
P
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
K
V
 
M
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
S
E
 
T
T
 
T
L
 
L
F
 
L
D
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
K
Q
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
I
 
T
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
Y
|
Y
I
 
I
A
 
G
L
 
M
E
|
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
L
Y
 
F
H
 
H
R
 
H
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
T
M
 
L
L
 
M
H
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
E
Q
 
Y
A
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
I
T
 
S
D
 
E
D
 
S
L
 
V
T
 
E
S
 
K
H
 
A
F
 
L
T
 
I
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
N
V
 
L
H
 
V
T
 
K
N
 
G
V
 
A
S
 
T
I
 
F
Q
 
E
K
 
R
F
 
V
E
 
E
K
 
Q
N
 
S
G
 
G
D
 
E
A
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
V
-
 
Y
I
 
V
V
 
T
A
 
V
H
 
N
T
 
G
N
 
S
E
 
R
G
 
E
T
 
V
F
 
I
E
 
E
A
 
S
S
 
D
H
 
Q
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
x
R
R
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
D
G
 
S
L
 
L
A
 
N
I
 
L
E
 
S
N
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
E
L
 
T
N
 
G
K
 
K
T
 
N
G
 
N
H
 
E
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
D
K
 
F
Q
 
G
E
 
Q
T
 
T
N
 
S
V
 
N
G
 
E
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
T
 
T
D
 
L
T
 
G
P
 
P
A
 
Q
F
|
F
V
|
V
Y
 
Y
T
 
V
A
|
A
A
|
A
K
 
Y
E
 
E
G
 
G
K
 
G
V
 
I
A
 
I
V
 
T
L
 
D
N
 
N
A
 
A
F
 
I
Q
 
G
S
 
G
T
 
L
G
 
N
D
 
K
M
 
K
V
 
I
D
 
D
Y
 
L
T
 
S
G
 
V
L
 
V
P
 
P
W
 
A
V
 
V
V
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
N
P
 
P
Q
 
T
I
 
V
A
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
K
E
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
Y
P
 
D
Y
 
V
E
 
K
T
 
T
S
 
S
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
D
E
 
A
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
I
A
 
V
A
 
N
L
 
R
D
 
E
T
 
T
R
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
F
K
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
A
N
 
D
S
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
I
I
 
V
A
 
S
P
 
E
E
 
N
G
 
A
G
 
G
E
 
D
L
 
V
A
 
I
M
 
Y
Q
 
A
V
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
T
D
 
E
A
 
T
F
 
L
H
x
A
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
A
E
|
E
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
T
 
T
F
 
F
N
 
D

P00392 Mercuric reductase; Hg(II) reductase; EC 1.16.1.1 from Pseudomonas aeruginosa (see 2 papers)
41% identity, 83% coverage: 108:646/647 of query aligns to 4:560/561 of P00392

query
sites
P00392
F
 
L
S
 
K
I
 
I
S
 
T
G
 
G
M
 
M
T
 
T
C
 
C
D
 
D
H
 
S
C
 
C
A
 
A
T
 
A
S
 
H
I
 
V
E
 
K
K
 
E
R
 
A
F
 
L
E
 
E
G
 
K
H
 
V
E
 
P
G
 
G
L
 
V
I
 
Q
S
 
S
K
 
A
S
 
L
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
A
 
-
D
 
-
E
 
P
K
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
A
I
 
Q
F
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
T
N
 
S
P
 
P
D
 
D
K
 
A
I
 
L
S
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
R
 
K
Q
 
A
E
 
T
I
 
L
I
 
A
E
 
D
T
 
A
I
 
P
N
 
L
K
 
A
E
 
D
G
 
N
N
 
R
Y
 
V
K
 
G
V
 
L
Q
 
L
K
 
D
E
 
K
I
 
V
G
 
R
G
 
G
N
 
W
G
 
M
N
 
A
L
 
A
E
 
A
R
 
E
A
 
K
D
 
H
P
 
S
G
 
G
Q
 
N
H
 
E
-
 
P
-
 
P
-
 
V
D
 
Q
L
 
V
I
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
G
A
 
A
A
|
A
F
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
L
T
 
K
A
 
A
N
 
V
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
Q
V
 
V
L
 
T
M
 
L
V
 
I
N
 
E
A
 
R
G
|
G
L
 
-
D
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
T
|
T
C
|
C
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
 
S
K
|
K
H
 
I
L
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
H
Q
 
I
V
 
A
H
 
H
R
 
L
A
 
R
Q
 
R
H
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
N
 
D
G
 
G
-
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
A
A
 
T
N
 
V
P
 
P
T
 
T
F
 
I
D
 
D
F
 
R
K
 
S
A
 
K
T
 
L
I
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
K
 
Q
K
 
Q
E
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
R
K
 
H
K
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
G
L
 
N
D
 
P
N
 
A
I
 
I
T
 
T
I
 
V
L
 
V
E
 
H
G
 
G
W
 
E
A
|
A
R
 
R
F
 
F
V
 
K
D
 
D
A
 
D
H
 
Q
T
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
N
D
 
E
G
 
G
K
 
G
P
 
E
Y
 
R
K
 
V
G
 
V
M
 
M
-
 
F
-
 
D
K
 
R
Y
 
C
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
T
 
P
N
 
A
V
 
V
P
 
P
D
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
E
V
 
S
G
 
P
Y
 
Y
L
 
W
T
 
T
N
 
S
E
 
T
T
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
S
E
 
D
E
 
T
Q
 
I
P
 
P
E
 
E
H
 
R
L
 
L
I
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
S
Y
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
H
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
L
H
 
A
R
 
R
S
 
N
E
 
T
R
 
L
I
 
F
L
 
F
R
 
R
T
 
E
Q
 
D
A
 
P
A
 
A
D
 
-
I
 
I
T
 
G
D
 
E
D
 
A
L
 
V
T
 
T
S
 
A
H
 
A
F
 
F
T
 
R
E
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
E
H
 
H
T
 
T
N
 
Q
V
 
A
S
 
S
I
 
-
Q
 
Q
K
 
V
F
 
A
E
 
H
K
 
M
N
 
D
G
 
G
D
 
E
A
 
-
I
 
F
V
 
V
A
 
L
H
 
T
T
 
T
N
 
T
E
 
H
G
 
G
T
 
E
F
 
L
E
 
R
A
 
A
S
 
D
H
 
K
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
R
R
 
T
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
D
N
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
A
T
 
Q
G
 
G
H
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
I
N
 
D
T
 
Q
K
 
G
Q
 
M
E
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
N
G
 
P
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
|
D
C
 
C
T
 
T
D
 
D
T
 
Q
P
 
P
A
 
Q
F
 
F
V
|
V
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
A
E
 
A
G
 
G
K
 
T
V
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
I
N
 
N
A
 
-
F
 
-
Q
 
M
S
 
T
T
 
G
G
 
G
D
 
D
M
 
A
-
 
A
V
 
L
D
 
D
Y
 
L
T
 
T
G
 
A
L
 
M
P
 
P
W
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
S
E
 
E
K
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
H
E
 
H
A
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
E
Y
 
T
E
 
D
T
 
S
S
 
R
V
 
T
M
 
L
P
 
T
L
 
L
T
 
D
E
 
N
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
F
D
 
D
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
F
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
I
N
 
E
S
 
E
E
 
G
T
 
S
D
 
H
K
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
V
R
 
Q
I
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
I
M
 
Q
Q
 
T
V
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
N
G
 
R
M
 
M
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
Q
F
 
L
H
 
F
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
Q
T
 
T
F
 
F
N
 
N
K
 
K
D
 
D
V
 
V
S
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
C
|
C
C
|
C
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4k7zA Crystal structure of the c136(42)a/c141(47)a double mutant of tn501 mera in complex with NADP and hg2+
45% identity, 70% coverage: 192:646/647 of query aligns to 9:466/467 of 4k7zA

query
sites
4k7zA
I
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
S
x
G
A
|
A
A
 
A
F
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
L
T
 
K
A
 
A
N
 
V
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
Q
V
 
V
L
 
T
M
 
L
V
 
I
N
x
E
A
x
R
G
 
G
L
 
-
D
 
T
I
|
I
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
x
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
x
A
V
 
V
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
I
L
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
H
Q
 
I
V
 
A
H
 
H
R
 
L
A
 
R
Q
 
R
H
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
N
 
D
G
 
G
-
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
A
A
 
T
N
x
V
P
|
P
T
 
T
F
 
I
D
 
D
F
 
R
K
 
S
A
 
K
T
 
L
I
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
K
 
Q
K
 
Q
E
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
R
K
 
H
K
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
G
L
 
N
D
 
P
N
 
A
I
 
I
T
 
T
I
 
V
L
 
V
E
 
H
G
 
G
W
x
E
A
|
A
R
 
R
F
 
F
V
 
K
D
 
D
A
 
D
H
 
Q
T
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
N
D
 
E
G
 
G
K
 
G
P
 
E
Y
 
R
K
 
V
G
 
V
M
 
M
-
 
F
-
 
D
K
 
R
Y
 
C
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
T
 
P
N
 
A
V
 
V
P
 
P
D
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
E
V
 
S
G
 
P
Y
 
Y
L
 
W
T
 
T
N
 
S
E
 
T
T
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
S
E
 
D
E
 
T
Q
 
I
P
 
P
E
 
E
H
 
R
L
 
L
I
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
x
S
G
x
S
Y
x
V
I
x
V
A
 
A
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
H
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
L
H
 
A
R
|
R
S
x
N
E
 
T
R
 
L
I
 
F
L
 
F
R
|
R
T
 
E
Q
 
D
A
 
P
A
 
A
D
 
-
I
 
I
T
 
G
D
 
E
D
 
A
L
 
V
T
 
T
S
 
A
H
 
A
F
 
F
T
 
R
E
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
E
H
 
H
T
 
T
N
 
Q
V
 
A
S
 
S
I
 
-
Q
 
Q
K
 
V
F
 
A
E
 
H
K
 
M
N
 
D
G
 
G
D
 
E
A
 
-
I
 
F
V
 
V
A
 
L
H
 
T
T
 
T
N
 
T
E
 
H
G
 
G
T
 
E
F
 
L
E
 
R
A
 
A
S
 
D
H
 
K
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
T
x
R
R
 
T
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
D
N
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
A
T
 
Q
G
 
G
H
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
I
N
 
D
T
 
Q
K
 
G
Q
 
M
E
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
N
G
 
P
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
C
T
 
T
D
 
D
T
 
Q
P
 
P
A
x
Q
F
|
F
V
|
V
Y
|
Y
T
 
V
A
 
A
A
|
A
K
 
A
E
 
A
G
 
G
K
 
T
V
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
I
N
 
N
A
 
-
F
 
-
Q
 
M
S
 
T
T
 
G
G
 
G
D
 
D
M
 
A
-
 
A
V
 
L
D
 
D
Y
 
L
T
 
T
G
 
A
L
 
M
P
 
P
W
 
A
V
|
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
S
E
 
E
K
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
H
E
 
H
A
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
E
Y
 
T
E
 
D
T
 
S
S
 
R
V
 
T
M
 
L
P
 
T
L
 
L
T
 
D
E
 
N
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
F
D
 
D
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
F
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
I
N
 
E
S
 
E
E
 
G
T
 
S
D
 
H
K
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
V
R
 
Q
I
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
I
M
 
Q
Q
 
T
V
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
N
G
 
R
M
 
M
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
Q
F
 
L
H
x
F
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
V
E
|
E
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
Q
T
 
T
F
 
F
N
 
N
K
 
K
D
 
D
V
 
V
S
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
C
|
C
C
|
C
A
 
A

4k8dA Crystal structure of the c558(464)a/c559(465)a double mutant of tn501 mera in complex with NADPH and hg2+
45% identity, 70% coverage: 192:646/647 of query aligns to 8:465/466 of 4k8dA

query
sites
4k8dA
I
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
S
x
G
A
|
A
A
 
A
F
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
L
T
 
K
A
 
A
N
 
V
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
L
 
A
T
 
Q
V
 
V
L
 
T
M
 
L
V
 
I
N
x
E
A
x
R
G
 
G
L
 
-
D
 
T
I
|
I
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
I
L
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
H
Q
 
I
V
 
A
H
 
H
R
 
L
A
 
R
Q
 
R
H
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
N
 
D
G
 
G
-
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
A
A
 
T
N
x
V
P
|
P
T
 
T
F
 
I
D
 
D
F
 
R
K
 
S
A
 
K
T
 
L
I
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
K
 
Q
K
 
Q
E
 
A
L
 
R
V
 
V
A
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
R
K
 
H
K
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
G
L
 
N
D
 
P
N
 
A
I
 
I
T
 
T
I
 
V
L
 
V
E
 
H
G
 
G
W
x
E
A
|
A
R
 
R
F
 
F
V
 
K
D
 
D
A
 
D
H
 
Q
T
 
S
I
 
L
E
 
T
V
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
N
D
 
E
G
 
G
K
 
G
P
 
E
Y
 
R
K
 
V
G
 
V
M
 
M
-
 
F
-
 
D
K
 
R
Y
 
C
L
 
L
L
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
T
 
P
N
 
A
V
 
V
P
 
P
D
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
E
V
 
S
G
 
P
Y
 
Y
L
 
W
T
 
T
N
 
S
E
 
T
T
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
S
E
 
D
E
 
T
Q
 
I
P
 
P
E
 
E
H
 
R
L
 
L
I
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
x
S
G
x
S
Y
x
V
I
x
V
A
 
A
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
H
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
L
H
 
A
R
|
R
S
x
N
E
 
T
R
 
L
I
 
F
L
 
F
R
|
R
T
 
E
Q
 
D
A
 
P
A
 
A
D
 
-
I
 
I
T
 
G
D
 
E
D
 
A
L
 
V
T
 
T
S
 
A
H
 
A
F
 
F
T
 
R
E
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
E
H
 
H
T
 
T
N
 
Q
V
 
A
S
 
S
I
 
-
Q
 
Q
K
 
V
F
 
A
E
 
H
K
 
M
N
 
D
G
 
G
D
 
E
A
 
-
I
 
F
V
 
V
A
 
L
H
 
T
T
 
T
N
 
T
E
 
H
G
 
G
T
 
E
F
 
L
E
 
R
A
 
A
S
 
D
H
 
K
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
T
x
R
R
 
T
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
D
N
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
A
T
 
Q
G
 
G
H
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
I
N
 
D
T
 
Q
K
 
G
Q
 
M
E
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
N
G
 
P
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
C
T
 
T
D
 
D
T
 
Q
P
 
P
A
x
Q
F
|
F
V
|
V
Y
|
Y
T
 
V
A
 
A
A
|
A
K
 
A
E
 
A
G
 
G
K
 
T
V
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
I
N
 
N
A
 
-
F
 
-
Q
 
M
S
 
T
T
 
G
G
 
G
D
 
D
M
 
A
-
 
A
V
 
L
D
 
D
Y
 
L
T
 
T
G
 
A
L
 
M
P
 
P
W
 
A
V
|
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
S
E
 
E
K
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
H
E
 
H
A
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
E
Y
 
T
E
 
D
T
 
S
S
 
R
V
 
T
M
 
L
P
 
T
L
 
L
T
 
D
E
 
N
V
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
F
D
 
D
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
F
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
I
N
 
E
S
 
E
E
 
G
T
 
S
D
 
H
K
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
V
R
 
Q
I
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
I
M
 
Q
Q
 
T
V
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
N
G
 
R
M
 
M
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
Q
F
 
L
H
x
F
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
V
E
|
E
G
 
G
V
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
Q
T
 
T
F
 
F
N
 
N
K
 
K
D
 
D
V
 
V
S
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
C
x
A
C
x
A
A
 
A

4ywoA Mercuric reductase from metallosphaera sedula (see paper)
34% identity, 70% coverage: 184:638/647 of query aligns to 3:444/444 of 4ywoA

query
sites
4ywoA
D
 
D
P
 
P
G
 
-
Q
 
M
H
 
H
D
 
K
L
 
L
I
 
A
I
 
I
I
 
I
G
|
G
G
 
Y
G
|
G
S
x
A
A
 
A
A
 
G
F
 
F
S
 
A
A
 
A
A
 
M
T
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
N
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
V
T
 
K
V
 
P
L
 
V
M
 
L
V
 
I
N
 
G
A
x
K
G
 
G
L
 
-
D
 
E
I
|
I
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
R
L
 
M
I
 
L
R
 
Y
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
I
V
 
Y
H
 
K
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
H
 
E
S
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
-
G
 
-
V
 
V
S
 
T
G
 
G
A
 
S
N
 
E
-
 
V
-
 
Y
P
 
P
T
 
P
F
 
F
D
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
S
T
 
S
I
 
F
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
K
 
D
E
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
A
 
E
L
 
M
Q
 
R
K
 
K
K
 
T
K
 
K
Y
 
Y
L
 
E
G
 
D
V
 
L
V
 
L
G
 
S
D
 
Y
L
 
Y
D
 
D
N
 
-
I
 
V
T
 
E
I
 
L
L
 
I
E
 
Q
G
 
G
W
 
E
A
|
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I
D
 
S
A
 
P
H
 
H
T
 
A
I
 
V
E
 
K
V
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
P
 
V
Y
 
I
K
 
E
G
 
A
M
 
E
K
 
K
Y
 
F
L
 
V
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
S
T
 
S
T
 
P
N
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
R
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
K
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
L
 
W
T
 
T
N
|
N
E
 
R
T
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
S
L
 
P
E
 
D
E
 
R
Q
 
R
P
 
I
E
 
D
H
 
S
L
 
L
I
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
R
Y
x
A
I
x
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
I
 
F
A
 
A
Q
 
Q
A
 
M
Y
 
Y
H
 
S
R
 
R
F
 
M
G
 
K
T
 
V
K
 
E
V
 
V
T
 
A
M
 
I
L
 
L
H
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
P
R
 
V
I
 
L
L
 
I
R
 
P
T
 
D
Q
 
W
A
 
E
A
 
P
D
 
E
I
 
A
T
 
S
D
 
V
D
 
E
L
 
A
T
 
R
S
 
R
H
 
I
F
 
M
T
 
E
E
 
N
E
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
A
V
 
V
H
 
V
T
 
T
N
 
G
V
 
V
S
 
N
I
 
V
Q
 
K
K
 
E
F
 
V
E
 
R
K
 
K
N
 
G
G
 
A
D
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
I
H
 
-
T
 
T
N
 
D
E
 
K
G
 
G
T
 
E
F
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
D
H
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
R
R
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
V
S
 
D
G
 
-
L
|
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
R
L
 
L
N
 
N
K
 
E
T
 
R
G
 
G
H
 
G
I
 
I
L
 
K
V
 
V
N
 
D
T
 
D
K
 
E
Q
 
L
E
 
R
T
 
T
N
 
D
V
 
N
G
 
P
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
T
 
L
D
 
G
T
 
G
P
 
K
A
x
M
F
x
L
V
x
E
Y
 
A
T
 
L
A
|
A
A
x
G
K
 
R
E
 
Q
G
 
G
K
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
T
L
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
L
Q
 
T
S
 
G
T
 
S
G
 
H
D
 
K
M
 
R
V
 
V
D
 
D
Y
 
E
T
 
N
G
 
A
L
 
V
P
 
P
W
 
Q
V
 
V
V
 
I
F
 
F
T
 
T
D
 
Q
P
 
P
Q
 
N
I
 
L
A
 
A
G
 
R
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
R
E
 
A
A
 
K
G
 
E
I
 
G
P
 
E
Y
 
V
E
 
E
T
 
A
S
 
R
V
 
V
M
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
S
E
 
S
V
 
V
P
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
A
 
I
A
 
I
L
 
N
D
 
S
T
 
R
R
 
L
G
 
G
V
 
F
I
 
V
K
 
K
L
 
M
I
 
V
R
 
-
N
 
-
S
 
T
E
 
M
T
 
N
D
 
G
K
 
R
L
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
A
I
 
V
A
 
G
P
 
E
E
 
N
G
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
I
M
 
G
Q
 
E
V
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
F
G
 
G
M
 
A
T
 
T
I
 
V
Q
 
H
E
 
D
L
 
L
A
 
I
D
 
D
A
 
T
F
 
V
H
|
H
P
 
M
Y
x
F
L
 
P
T
 
T
L
 
I
S
 
A
E
|
E
G
 
S
V
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
A
I
 
L
T
 
A
F
 
F
N
 
R
K
 
S
D
 
D

2eq6A Crystal structure of lipoamide dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
36% identity, 70% coverage: 188:638/647 of query aligns to 4:454/460 of 2eq6A

query
sites
2eq6A
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
I
I
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
T
G
|
G
S
x
P
A
x
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
H
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
R
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
K
V
 
V
L
 
L
M
 
A
V
 
V
N
x
E
A
|
A
G
 
G
L
 
-
D
 
E
I
x
V
G
 
G
G
|
G
T
x
V
C
|
C
V
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
x
T
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
H
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
V
 
L
H
 
H
R
 
H
A
 
L
Q
 
K
H
 
V
S
 
A
P
 
E
F
 
G
N
 
F
G
 
G
V
 
L
S
 
K
G
 
-
A
 
A
N
 
K
P
 
P
T
 
E
F
 
L
D
 
D
F
 
L
K
 
K
A
 
K
T
 
L
I
 
G
Q
 
G
Q
 
W
K
 
R
K
 
D
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
-
K
 
K
K
 
K
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
V
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
T
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
G
D
 
N
N
 
G
I
 
V
T
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
R
G
 
G
W
x
F
A
|
A
R
 
R
F
 
L
V
 
V
D
 
G
A
 
P
H
 
K
T
 
E
I
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
G
G
 
G
K
 
E
P
 
R
Y
 
Y
K
 
G
G
 
A
M
 
K
K
 
S
Y
 
L
L
 
I
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
S
-
 
E
T
 
P
T
 
L
N
 
E
V
 
L
P
 
K
D
 
G
L
 
F
P
 
P
G
 
F
L
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
G
 
-
Y
 
W
L
 
D
T
x
S
N
 
T
E
 
R
T
 
A
L
 
L
F
 
K
D
 
V
L
 
E
E
 
E
E
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
x
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
H
 
R
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
L
L
 
I
H
 
E
R
 
Y
S
 
M
E
 
P
R
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
P
T
 
Q
Q
 
G
A
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
T
T
 
A
D
 
A
D
 
L
L
 
L
T
 
R
S
 
R
H
 
A
F
 
L
T
 
E
E
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
R
V
 
V
H
 
R
T
 
T
N
 
K
V
 
T
S
 
K
I
 
A
Q
 
V
K
 
G
F
 
Y
E
 
E
K
 
K
N
 
K
G
 
K
D
 
D
A
 
G
I
 
L
-
 
H
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
P
V
 
A
A
 
E
H
 
G
T
 
G
N
 
E
E
 
G
G
 
E
T
 
E
F
 
V
E
 
V
A
 
V
S
 
D
H
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
T
 
R
R
 
K
P
 
P
N
x
R
T
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
N
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
K
L
 
V
N
 
D
K
 
E
T
 
R
G
 
G
H
 
F
I
 
I
L
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
A
K
 
R
Q
 
M
E
 
E
T
 
T
N
 
S
V
 
V
G
 
P
H
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
A
T
 
A
D
 
R
T
 
P
P
 
P
A
x
L
F
x
L
V
x
A
Y
x
H
T
 
K
A
 
A
A
 
M
K
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
A
L
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
-
Q
 
A
S
 
G
T
 
K
G
 
D
D
 
S
M
 
A
V
 
F
D
 
D
Y
 
Y
T
 
Q
G
 
-
L
 
V
P
 
P
W
 
S
V
 
V
V
 
V
F
x
Y
T
 
T
D
 
S
P
 
P
Q
 
E
I
 
W
A
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
K
E
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
Y
P
 
K
Y
 
V
E
 
K
T
 
V
S
 
G
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
A
E
 
A
V
 
S
P
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
A
 
L
L
 
G
D
 
G
T
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
M
I
 
V
K
 
K
L
 
V
I
 
V
R
 
G
N
 
D
S
 
E
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
L
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
G
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
I
M
 
A
Q
 
E
V
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
K
 
E
A
 
M
G
 
G
M
 
A
T
 
T
I
 
L
Q
 
T
E
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
L
A
 
T
F
 
V
H
|
H
P
 
P
Y
x
H
L
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
|
E
G
 
S
V
 
L
K
 
M
L
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
E
T
 
A
F
 
F
N
 
H
K
 
K
D
 
Q

Sites not aligning to the query:

P11959 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of pyruvate complex; EC 1.8.1.4 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
36% identity, 68% coverage: 187:626/647 of query aligns to 9:451/470 of P11959

query
sites
P11959
Q
 
E
H
 
T
D
 
E
L
 
T
I
 
L
I
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
P
A
 
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
R
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
T
 
K
V
 
V
L
 
T
M
 
I
V
 
V
N
x
E
A
x
K
G
|
G
L
 
-
D
x
N
I
x
L
G
|
G
G
|
G
T
x
V
C
|
C
V
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
 
C
V
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
H
Q
 
R
V
 
Y
H
 
E
R
 
Q
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
S
 
S
P
 
E
F
 
E
N
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
K
G
 
A
A
 
E
N
 
N
P
 
V
T
 
T
F
 
I
D
 
D
F
 
F
K
 
-
A
 
A
T
 
K
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
W
K
 
K
E
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
S
L
 
V
Q
 
V
K
 
K
K
 
K
K
 
L
Y
 
T
L
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
E
G
 
G
D
 
L
L
 
L
-
 
K
-
 
G
D
 
N
N
 
K
I
 
V
T
 
E
I
 
I
L
 
V
E
 
K
G
 
G
W
 
E
A
 
A
R
 
Y
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
H
 
N
T
 
T
I
 
V
E
 
R
V
 
V
-
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
D
P
 
S
Y
 
A
K
 
Q
G
 
T
M
 
Y
K
 
T
Y
 
F
L
 
K
L
 
N
A
 
A
T
 
I
G
 
I
A
 
A
T
 
T
T
 
G
N
 
S
V
 
R
P
 
P
-
 
I
D
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
N
L
 
F
E
 
K
D
 
F
V
 
S
G
 
N
Y
 
R
L
 
I
T
 
L
N
 
D
E
 
S
T
 
T
-
 
G
L
 
A
F
 
L
D
 
N
L
 
L
E
 
G
E
 
E
Q
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
G
L
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
T
A
 
A
Y
 
Y
H
 
A
R
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
I
L
 
L
H
 
E
R
 
G
S
 
A
E
 
G
R
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
T
 
G
Q
 
F
A
 
E
A
 
K
D
 
Q
I
 
M
T
 
A
D
 
A
D
 
I
L
 
I
T
 
K
S
 
K
H
 
R
F
 
L
T
 
K
E
 
K
E
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
V
T
 
T
N
 
N
V
 
A
S
 
L
I
 
A
Q
 
K
K
 
G
F
 
A
E
 
E
K
 
E
N
 
R
G
 
E
D
 
D
A
 
G
I
 
V
V
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
Y
-
 
E
A
 
A
H
 
N
T
 
G
N
 
E
E
 
T
G
 
K
T
 
T
F
 
I
E
 
D
A
 
A
S
 
D
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
T
T
 
V
G
 
G
T
 
R
R
 
R
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
D
G
 
E
L
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
N
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
K
L
 
M
N
 
T
K
 
N
T
 
R
G
 
G
H
 
L
I
 
I
L
 
E
V
 
V
N
 
D
T
 
Q
K
 
Q
Q
 
C
E
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
V
G
 
P
H
 
N
I
 
I
Y
 
F
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
I
T
 
V
D
 
P
T
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
L
V
x
A
Y
 
H
T
 
K
A
 
A
A
 
S
K
 
Y
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
-
N
 
E
A
 
A
F
 
I
Q
 
A
S
 
G
T
 
H
G
 
P
D
 
S
M
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
T
 
V
G
 
A
L
 
I
P
 
P
W
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
S
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
I
 
C
A
 
A
G
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
F
E
 
E
K
 
Q
E
 
Q
A
 
A
E
 
K
E
 
D
A
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
D
Y
 
V
E
 
I
T
 
A
S
 
A
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
F
T
 
A
E
 
A
V
 
N
P
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
A
 
L
L
 
N
D
 
D
T
 
T
R
 
D
G
 
G
V
 
F
I
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
V
N
 
R
S
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
G
K
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
I
 
I
I
 
I
A
 
G
P
 
P
E
 
N
G
 
A
G
 
S
E
 
D
L
 
M
A
 
I
M
 
A
Q
 
E
V
 
L
S
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
E
A
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
A
Q
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
L
A
 
T
F
 
I
H
 
H
P
 
A
Y
 
H
L
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
G
E
 
E

1ebdA Dihydrolipoamide dehydrogenase complexed with the binding domain of the dihydrolipoamide acetylase (see paper)
36% identity, 68% coverage: 187:626/647 of query aligns to 3:445/455 of 1ebdA

query
sites
1ebdA
Q
 
E
H
 
T
D
 
E
L
 
T
I
 
L
I
 
V
I
 
V
G
|
G
G
 
A
G
|
G
S
x
P
A
 
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
R
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
T
 
K
V
 
V
L
 
T
M
 
I
V
|
V
N
x
E
A
x
K
G
 
G
L
 
-
D
 
N
I
x
L
G
 
G
G
|
G
T
x
V
C
|
C
V
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
H
Q
 
R
V
 
Y
H
 
E
R
 
Q
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
S
 
S
P
 
E
F
 
E
N
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
K
G
 
A
A
 
E
N
|
N
P
x
V
T
 
T
F
 
I
D
 
D
F
 
F
K
 
-
A
 
A
T
 
K
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
W
K
 
K
E
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
S
L
 
V
Q
 
V
K
 
K
K
 
K
K
 
L
Y
 
T
L
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
E
G
 
G
D
 
L
L
 
L
-
 
K
-
 
G
D
 
N
N
 
K
I
 
V
T
 
E
I
 
I
L
 
V
E
 
K
G
 
G
W
x
E
A
|
A
R
 
Y
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
H
 
N
T
 
T
I
 
V
E
 
R
V
 
V
-
 
V
D
 
N
G
 
G
K
 
D
P
 
S
Y
 
A
K
 
Q
G
 
T
M
 
Y
K
 
T
Y
 
F
L
 
K
L
 
N
A
 
A
T
 
I
G
 
I
A
 
A
T
|
T
T
x
G
N
 
S
V
 
R
P
 
P
-
 
I
D
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
N
L
 
F
E
 
K
D
 
F
V
 
S
G
 
N
Y
 
R
L
 
I
T
 
L
N
 
D
E
 
S
T
 
T
-
 
G
L
 
A
F
 
L
D
 
N
L
 
L
E
 
G
E
 
E
Q
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
|
Y
I
|
I
A
 
G
L
 
I
E
|
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
T
A
 
A
Y
 
Y
H
 
A
R
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
I
L
 
L
H
 
E
R
 
G
S
 
A
E
 
G
R
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
T
 
G
Q
 
F
A
 
E
A
 
K
D
 
Q
I
 
M
T
 
A
D
 
A
D
 
I
L
 
I
T
 
K
S
 
K
H
 
R
F
 
L
T
 
K
E
 
K
E
 
K
G
 
G
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
V
T
 
T
N
 
N
V
 
A
S
 
L
I
 
A
Q
 
K
K
 
G
F
 
A
E
 
E
K
 
E
N
 
R
G
 
E
D
 
D
A
 
G
I
 
V
V
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
Y
-
 
E
A
 
A
H
 
N
T
 
G
N
 
E
E
 
T
G
 
K
T
 
T
F
 
I
E
 
D
A
 
A
S
 
D
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
T
T
 
V
G
 
G
T
x
R
R
 
R
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
D
G
 
E
L
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
N
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
K
L
 
M
N
 
T
K
 
N
T
 
R
G
 
G
H
 
L
I
 
I
L
 
E
V
 
V
N
 
D
T
 
Q
K
 
Q
Q
 
C
E
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
V
G
 
P
H
 
N
I
 
I
Y
 
F
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
I
T
 
V
D
 
P
T
 
G
P
 
P
A
|
A
F
x
L
V
x
A
Y
 
H
T
 
K
A
 
A
A
x
S
K
 
Y
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
-
N
 
E
A
 
A
F
 
I
Q
 
A
S
 
G
T
 
H
G
 
P
D
 
S
M
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
T
 
V
G
 
A
L
 
I
P
 
P
W
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
S
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
I
 
C
A
 
A
G
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
F
E
 
E
K
 
Q
E
 
Q
A
 
A
E
 
K
E
 
D
A
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
D
Y
 
V
E
 
I
T
 
A
S
 
A
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
F
T
 
A
E
 
A
V
 
N
P
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
A
 
L
L
 
N
D
 
D
T
 
T
R
 
D
G
 
G
V
 
F
I
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
V
N
 
R
S
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
G
K
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
I
 
I
I
 
I
A
 
G
P
 
P
E
 
N
G
 
A
G
 
S
E
 
D
L
 
M
A
 
I
M
 
A
Q
 
E
V
 
L
S
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
E
A
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
A
Q
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
L
A
 
T
F
 
I
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
L
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
G
E
|
E

P31023 Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase; Glycine cleavage system L protein; Pyruvate dehydrogenase complex E3 subunit; E3; PDC-E3; EC 1.8.1.4 from Pisum sativum (Garden pea) (Lathyrus oleraceus) (see 2 papers)
33% identity, 70% coverage: 187:639/647 of query aligns to 37:499/501 of P31023

query
sites
P31023
Q
 
E
H
 
N
D
 
D
L
 
V
I
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
P
A
 
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
T
 
K
V
 
T
L
 
T
M
 
C
V
 
I
N
x
E
A
x
K
G
x
R
L
x
G
D
x
A
I
x
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
 
S
K
 
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
H
A
 
S
A
 
S
E
 
H
Q
 
M
V
 
Y
H
 
H
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
S
 
S
P
 
F
F
 
A
N
 
N
-
 
H
G
 
G
V
 
V
S
 
K
G
 
V
A
 
S
N
 
N
P
 
V
T
 
E
F
 
I
D
 
D
F
 
L
K
 
A
A
 
A
T
 
M
I
 
M
Q
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
D
E
 
K
L
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
N
L
 
L
Q
 
T
K
 
R
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
I
V
 
E
G
 
G
D
 
L
L
 
F
-
 
K
-
 
K
D
 
N
N
 
K
I
 
V
T
 
T
I
 
Y
L
 
V
E
 
K
G
 
G
W
 
Y
A
x
G
R
 
K
F
 
F
V
 
V
D
 
S
A
 
P
H
 
S
T
 
E
I
 
I
E
 
S
V
 
V
D
 
D
-
 
T
-
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
E
G
 
N
K
 
T
P
 
V
Y
 
V
K
 
K
G
 
G
M
 
K
K
 
H
Y
 
I
L
 
I
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
-
T
 
-
T
 
S
N
 
D
V
 
V
P
 
K
D
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
T
L
 
I
E
 
D
D
 
E
V
 
K
G
 
K
Y
 
I
L
 
V
T
 
S
N
 
S
E
 
T
T
 
G
L
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
L
E
 
S
E
 
E
Q
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
M
A
 
G
Q
 
S
A
 
V
Y
 
W
H
 
G
R
 
R
F
 
I
G
 
G
T
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
V
H
 
E
R
 
F
S
 
A
E
 
S
R
 
E
I
 
I
L
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
M
A
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
I
T
 
R
D
 
K
D
 
Q
L
 
F
T
 
Q
S
 
R
H
 
S
F
 
L
T
 
E
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
I
 
M
E
 
K
V
 
F
H
 
K
T
 
L
N
 
K
V
 
T
S
 
K
I
 
V
Q
 
V
K
 
G
F
 
V
E
 
D
K
 
T
N
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
G
I
 
V
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
P
V
 
S
A
 
A
H
 
G
T
 
G
N
 
E
E
 
Q
G
 
T
T
 
I
F
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
D
H
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
A
G
 
G
T
 
R
R
 
T
P
 
P
N
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
N
I
 
L
E
 
D
N
 
K
A
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
E
L
 
T
N
 
D
K
 
K
T
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
E
K
 
R
Q
 
F
E
 
S
T
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
S
H
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
T
 
I
D
 
P
T
 
G
P
 
P
A
x
M
F
x
L
V
x
A
Y
x
H
T
 
K
A
 
A
A
 
E
K
 
E
E
 
D
G
 
G
K
 
-
V
 
V
A
 
A
V
 
C
L
 
V
N
 
E
A
 
Y
F
 
L
Q
 
A
S
 
G
T
 
K
G
 
V
D
 
G
M
 
H
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
T
 
D
G
 
K
L
 
V
P
 
P
W
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
Q
A
 
V
E
 
K
E
 
E
A
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
E
Y
 
Y
E
 
R
T
 
V
S
 
G
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
F
T
 
M
E
 
A
V
 
N
P
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
D
D
 
N
T
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
V
K
 
K
L
 
I
I
 
I
R
 
A
N
 
E
S
 
K
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
K
L
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
I
I
 
M
A
 
A
P
 
P
E
 
N
G
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
I
M
 
H
Q
 
E
V
 
A
S
 
A
L
 
I
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
A
 
Y
G
 
D
M
 
A
T
 
S
I
 
S
Q
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
R
A
 
V
F
 
C
H
 
H
P
 
A
Y
 
H
L
 
P
T
 
T
L
 
M
S
 
S
E
 
E
G
 
A
V
 
I
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
M
-
 
A
T
 
T
F
 
Y
N
 
D
K
 
K
D
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1dxlA Dihydrolipoamide dehydrogenase of glycine decarboxylase from pisum sativum (see paper)
33% identity, 70% coverage: 187:639/647 of query aligns to 3:465/467 of 1dxlA

query
sites
1dxlA
Q
 
E
H
 
N
D
 
D
L
 
V
I
 
V
I
 
I
I
|
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
x
P
A
x
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
T
 
K
V
 
T
L
 
T
M
 
C
V
 
I
N
x
E
A
x
K
G
x
R
L
 
G
D
 
A
I
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
H
A
 
S
A
 
S
E
 
H
Q
 
M
V
 
Y
H
 
H
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
S
 
S
P
 
F
F
 
A
N
 
N
-
 
H
G
 
G
V
 
V
S
 
K
G
 
V
A
 
S
N
 
N
P
 
V
T
 
E
F
 
I
D
 
D
F
 
L
K
 
A
A
 
A
T
 
M
I
 
M
Q
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
D
E
 
K
L
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
N
L
 
L
Q
 
T
K
 
R
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
I
V
 
E
G
 
G
D
 
L
L
 
F
-
 
K
-
 
K
D
 
N
N
 
K
I
 
V
T
 
T
I
 
Y
L
 
V
E
 
K
G
 
G
W
x
Y
A
x
G
R
 
K
F
 
F
V
 
V
D
 
S
A
 
P
H
 
S
T
 
E
I
 
I
E
 
S
V
 
V
D
 
D
-
 
T
-
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
E
G
 
N
K
 
T
P
 
V
Y
 
V
K
 
K
G
 
G
M
 
K
K
 
H
Y
 
I
L
 
I
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
-
T
 
-
T
 
S
N
 
D
V
 
V
P
 
K
D
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
T
L
 
I
E
 
D
D
 
E
V
 
K
G
 
K
Y
 
I
L
 
V
T
 
S
N
 
S
E
 
T
T
 
G
L
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
L
E
 
S
E
 
E
Q
 
I
P
 
P
E
 
K
H
 
K
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y
I
|
I
A
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
M
A
 
G
Q
 
S
A
 
V
Y
 
W
H
 
G
R
 
R
F
 
I
G
 
G
T
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
V
H
 
E
R
 
F
S
 
A
E
 
S
R
 
E
I
 
I
L
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
M
A
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
I
T
 
R
D
 
K
D
 
Q
L
 
F
T
 
Q
S
 
R
H
 
S
F
 
L
T
 
E
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
I
 
M
E
 
K
V
 
F
H
 
K
T
 
L
N
 
K
V
 
T
S
 
K
I
 
V
Q
 
V
K
 
G
F
 
V
E
 
D
K
 
T
N
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
G
I
 
V
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
P
V
 
S
A
 
A
H
 
G
T
 
G
N
 
E
E
 
Q
G
 
T
T
 
I
F
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
D
H
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
A
G
 
G
T
x
R
R
 
T
P
 
P
N
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
N
I
 
L
E
 
D
N
 
K
A
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
E
L
 
T
N
 
D
K
 
K
T
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
E
K
 
R
Q
 
F
E
 
S
T
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
S
H
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
T
 
I
D
 
P
T
 
G
P
 
P
A
x
M
F
x
L
V
x
A
Y
x
H
T
 
K
A
 
A
A
 
E
K
 
E
E
 
D
G
 
G
K
 
-
V
 
V
A
 
A
V
 
C
L
 
V
N
 
E
A
 
Y
F
 
L
Q
 
A
S
 
G
T
 
K
G
 
V
D
 
G
M
 
H
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
T
 
D
G
 
K
L
 
V
P
 
P
W
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
Q
A
 
V
E
 
K
E
 
E
A
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
E
Y
 
Y
E
 
R
T
 
V
S
 
G
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
F
T
 
M
E
 
A
V
 
N
P
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
D
D
 
N
T
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
L
I
 
V
K
 
K
L
 
I
I
 
I
R
 
A
N
 
E
S
 
K
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
K
L
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
I
I
 
M
A
 
A
P
 
P
E
 
N
G
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
I
M
 
H
Q
 
E
V
 
A
S
 
A
L
 
I
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
A
 
Y
G
 
D
M
 
A
T
 
S
I
 
S
Q
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
R
A
 
V
F
 
C
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
L
 
P
T
 
T
L
 
M
S
 
S
E
|
E
G
 
A
V
 
I
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
M
-
 
A
T
 
T
F
 
Y
N
 
D
K
 
K
D
 
P
V
 
I

6uziC Crystal structure of dihydrolipoyl dehydrogenase from elizabethkingia anophelis nuhp1
31% identity, 69% coverage: 187:633/647 of query aligns to 6:460/470 of 6uziC

query
sites
6uziC
Q
 
Q
H
 
F
D
 
D
L
 
V
I
 
A
I
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
S
x
P
A
x
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
R
A
 
C
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
T
 
K
V
 
T
L
 
V
M
 
I
V
 
I
N
x
E
A
x
K
G
 
Y
L
 
S
D
 
T
I
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
D
A
 
S
A
 
S
E
 
E
Q
 
H
V
 
F
H
 
E
R
 
N
A
 
A
Q
 
K
H
 
H
S
 
T
-
 
F
P
 
A
F
 
T
N
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
L
G
 
I
A
 
D
N
 
E
P
 
P
T
 
K
F
 
V
D
 
D
F
 
I
K
 
A
A
 
Q
T
 
M
I
 
I
Q
 
S
Q
 
R
K
 
K
K
 
N
E
 
D
L
 
V
V
 
V
A
 
D
A
 
-
L
 
-
Q
 
Q
K
 
T
K
 
T
K
 
K
Y
 
G
L
 
I
G
 
N
V
 
F
V
 
L
G
 
M
D
 
D
L
 
K
D
 
N
N
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
W
x
V
A
x
G
R
 
S
F
 
F
V
 
E
D
 
S
A
 
A
H
 
T
T
 
Q
I
 
I
E
 
K
V
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
S
P
 
S
-
 
E
-
 
V
Y
 
I
K
 
E
G
 
A
M
 
K
K
 
N
Y
 
T
L
 
I
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
S
T
 
K
T
 
P
N
 
S
V
 
S
P
 
L
D
 
P
L
 
F
P
 
I
G
 
T
L
 
L
E
 
D
D
 
K
V
 
E
G
 
R
Y
 
V
L
 
I
T
 
T
N
 
S
E
 
T
T
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
N
L
 
L
E
 
K
E
 
E
Q
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
H
L
 
L
I
 
I
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
x
V
I
|
I
A
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
S
A
 
V
Y
 
Y
H
 
L
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
D
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
V
H
 
E
R
 
Y
S
 
L
E
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
I
R
 
P
T
 
G
Q
 
M
A
 
D
A
 
G
D
 
T
I
 
L
T
 
S
D
 
K
D
 
E
L
 
L
T
 
Q
S
 
K
H
 
T
F
 
L
T
 
K
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
I
 
M
E
 
K
V
 
F
H
 
M
T
 
L
N
 
S
V
 
T
S
 
A
I
 
V
Q
 
S
K
 
G
F
 
V
E
 
E
K
 
R
N
 
N
G
 
G
D
 
D
A
 
T
I
 
V
-
 
K
-
 
V
V
 
T
A
 
A
H
 
K
T
 
D
N
 
K
E
 
K
G
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
V
T
 
V
F
 
V
E
 
E
A
 
G
S
 
D
H
 
Y
V
 
C
L
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
V
G
 
G
T
x
R
R
 
R
P
 
P
N
 
Y
T
 
T
S
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
N
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
E
L
 
L
N
 
D
K
 
E
T
 
R
G
 
G
H
 
R
I
 
V
L
 
K
V
 
T
N
 
N
T
 
D
K
 
H
Q
 
L
E
 
Q
T
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
P
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
T
 
V
D
 
K
T
 
G
P
 
A
A
x
M
F
x
L
V
x
A
Y
 
H
T
 
K
A
 
A
A
 
E
K
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
-
V
 
V
A
 
F
V
 
V
L
 
A
N
 
E
A
 
T
F
 
L
Q
 
A
S
 
G
T
 
E
G
 
K
D
 
P
M
 
H
V
 
V
D
 
N
Y
 
Y
T
 
N
G
 
L
L
 
I
P
 
P
W
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
W
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
Q
A
 
L
E
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
A
Y
 
Y
E
 
K
T
 
T
S
 
G
V
 
S
M
 
F
P
 
P
L
 
M
T
 
R
E
 
A
V
 
L
P
 
G
R
 
R
A
 
S
Q
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
M
D
 
D
T
 
T
R
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
I
K
 
K
L
 
I
I
 
L
R
 
A
N
 
D
S
 
E
E
 
K
T
 
T
D
 
D
K
 
E
L
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
M
I
 
I
A
 
G
P
 
A
E
 
R
G
 
A
G
 
A
E
 
D
L
 
M
A
 
I
M
 
A
Q
 
E
V
 
A
S
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
M
K
 
E
A
 
F
G
 
R
M
 
A
T
 
S
I
 
A
Q
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
R
A
 
I
F
 
S
H
 
H
P
 
A
Y
x
H
L
 
P
T
 
T
L
 
Y
S
 
T
E
|
E
G
 
A
V
 
I
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L

2eq7A Crystal structure of lipoamide dehydrogenase from thermus thermophilus hb8 with psbdo
33% identity, 69% coverage: 188:634/647 of query aligns to 2:447/452 of 2eq7A

query
sites
2eq7A
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
L
I
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
|
G
S
x
P
A
x
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
R
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
G
M
 
V
V
 
V
N
x
E
A
x
K
G
 
E
L
 
K
D
 
A
I
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
x
R
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
E
A
 
T
A
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
H
 
Y
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
H
 
-
S
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
K
G
 
G
V
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
K
P
 
V
T
 
K
-
x
G
-
x
V
-
 
E
F
 
L
D
 
D
F
 
L
K
 
P
A
 
A
T
 
L
I
 
M
Q
 
A
Q
 
H
K
 
K
K
 
D
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
Q
A
 
A
-
 
N
L
 
T
Q
 
Q
K
 
G
K
 
V
K
 
E
Y
 
F
L
 
L
G
 
F
V
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
K
L
 
K
D
 
N
N
 
G
I
 
I
T
 
A
I
 
R
L
 
H
E
 
Q
G
 
G
W
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
V
 
L
D
 
S
A
 
E
H
 
R
T
 
K
I
 
V
E
 
L
V
 
V
D
 
E
-
 
E
-
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
E
Y
 
L
K
 
E
G
 
A
M
 
R
K
 
Y
Y
 
I
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
S
T
 
A
T
 
P
N
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
P
L
x
W
P
 
A
G
 
Q
L
 
V
E
 
D
D
 
Y
V
 
E
G
 
R
Y
 
V
L
 
V
T
 
T
N
x
S
E
 
T
T
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
S
L
 
F
E
 
P
E
 
E
Q
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
Y
x
V
I
|
I
A
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
V
A
 
V
Y
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
I
M
 
V
L
 
L
H
x
E
R
x
Y
S
 
M
E
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
P
T
 
T
Q
 
M
A
 
D
A
 
L
D
 
E
I
 
V
T
 
S
D
 
R
D
 
A
L
 
A
T
 
E
S
 
R
H
 
V
F
 
F
T
 
K
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
T
V
 
I
H
 
R
T
 
T
N
 
G
V
 
V
S
 
R
I
x
V
Q
 
T
K
 
A
F
 
V
-
 
V
-
 
P
E
 
E
K
 
A
N
 
K
G
 
G
D
 
A
A
 
R
I
 
V
V
 
E
A
 
L
H
 
E
T
 
G
N
 
G
E
 
E
G
 
-
T
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
D
H
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
x
V
G
|
G
T
x
R
R
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
I
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
N
 
S
L
 
T
N
 
D
K
 
E
T
 
R
G
 
G
H
 
R
I
 
I
L
 
P
V
 
V
N
 
D
T
 
E
K
 
H
Q
 
L
E
 
R
T
 
T
N
 
R
V
 
V
G
 
P
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
C
 
V
T
 
V
D
 
R
T
 
G
P
 
P
A
x
M
F
x
L
V
x
A
Y
x
H
T
 
K
A
 
A
A
x
S
K
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
I
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
E
N
 
H
A
 
M
F
 
V
Q
 
R
S
 
G
T
 
F
G
 
G
D
 
H
M
 
-
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
T
 
Q
G
 
A
L
 
I
P
 
P
W
 
S
V
|
V
V
 
V
F
x
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
E
A
 
L
E
 
K
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
E
 
K
T
 
V
S
 
G
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
Y
T
 
S
E
 
A
V
 
S
P
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
M
L
 
G
D
 
E
T
 
T
R
 
E
G
 
G
V
 
F
I
 
I
K
 
K
L
 
V
I
 
L
R
 
A
N
 
H
S
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
K
 
R
L
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
G
I
 
I
A
 
G
P
 
A
E
 
R
G
 
V
G
 
G
E
 
D
L
 
V
A
 
L
M
 
A
Q
 
E
V
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
K
 
F
A
 
F
G
 
K
M
 
A
T
 
S
I
 
A
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
G
D
 
R
A
 
A
F
 
P
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
L
 
P
T
 
S
L
 
L
S
 
S
E
|
E
G
 
I
V
 
L
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L
T
 
A

2yquB Crystal structures and evolutionary relationship of two different lipoamide dehydrogenase(e3s) from thermus thermophilus
33% identity, 69% coverage: 188:634/647 of query aligns to 2:447/455 of 2yquB

query
sites
2yquB
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
L
I
 
V
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
S
x
P
A
x
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
R
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
G
M
 
V
V
 
V
N
x
E
A
x
K
G
 
E
L
 
K
D
 
A
I
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
x
R
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
E
A
 
T
A
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
H
 
Y
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
H
 
-
S
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
K
G
 
G
V
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
K
P
 
V
T
 
K
-
x
G
-
x
V
-
 
E
F
 
L
D
 
D
F
 
L
K
 
P
A
 
A
T
 
L
I
 
M
Q
 
A
Q
 
H
K
 
K
K
 
D
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
Q
A
 
A
-
 
N
L
 
T
Q
 
Q
K
 
G
K
 
V
K
 
E
Y
 
F
L
 
L
G
 
F
V
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
K
L
 
K
D
 
N
N
 
G
I
 
I
T
 
A
I
 
R
L
 
H
E
 
Q
G
 
G
W
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
V
 
L
D
 
S
A
 
E
H
 
R
T
 
K
I
 
V
E
 
L
V
 
V
D
 
E
-
 
E
-
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
E
Y
 
L
K
 
E
G
 
A
M
 
R
K
 
Y
Y
 
I
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
S
T
 
A
T
 
P
N
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
P
L
 
W
P
 
A
G
 
Q
L
 
V
E
 
D
D
 
Y
V
 
E
G
 
R
Y
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
S
E
 
T
T
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
S
L
 
F
E
 
P
E
 
E
Q
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
x
V
I
|
I
A
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
V
A
 
V
Y
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
I
M
 
V
L
 
L
H
 
E
R
 
Y
S
 
M
E
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
P
T
 
T
Q
 
M
A
 
D
A
 
L
D
 
E
I
 
V
T
 
S
D
 
R
D
 
A
L
 
A
T
 
E
S
 
R
H
 
V
F
 
F
T
 
K
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
T
V
 
I
H
 
R
T
 
T
N
 
G
V
 
V
S
 
R
I
 
V
Q
 
T
K
 
A
F
 
V
-
 
V
-
 
P
E
 
E
K
 
A
N
 
K
G
 
G
D
 
A
A
 
R
I
 
V
V
 
E
A
 
L
H
 
E
T
 
G
N
 
G
E
 
E
G
 
-
T
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
D
H
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
T
 
R
R
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
I
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
N
 
S
L
 
T
N
 
D
K
 
E
T
 
R
G
 
G
H
 
R
I
 
I
L
 
P
V
 
V
N
 
D
T
 
E
K
 
H
Q
 
L
E
 
R
T
 
T
N
 
R
V
 
V
G
 
P
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
V
T
 
V
D
 
R
T
 
G
P
 
P
A
x
M
F
x
L
V
x
A
Y
x
H
T
 
K
A
 
A
A
x
S
K
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
I
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
E
N
 
H
A
 
M
F
 
V
Q
 
R
S
 
G
T
 
F
G
 
G
D
 
H
M
 
-
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
T
 
Q
G
 
A
L
 
I
P
 
P
W
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
E
A
 
L
E
 
K
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
E
 
K
T
 
V
S
 
G
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
Y
T
 
S
E
 
A
V
 
S
P
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
M
L
 
G
D
 
E
T
 
T
R
 
E
G
 
G
V
 
F
I
 
I
K
 
K
L
 
V
I
 
L
R
 
A
N
 
H
S
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
K
 
R
L
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
G
I
 
I
A
 
G
P
 
A
E
 
R
G
 
V
G
 
G
E
 
D
L
 
V
A
 
L
M
 
A
Q
 
E
V
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
K
 
F
A
 
F
G
 
K
M
 
A
T
x
S
I
 
A
Q
 
E
E
x
D
L
 
L
A
 
G
D
 
R
A
 
A
F
 
P
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
L
 
P
T
 
S
L
 
L
S
 
S
E
|
E
G
 
I
V
 
L
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L
T
 
A

2yquA Crystal structures and evolutionary relationship of two different lipoamide dehydrogenase(e3s) from thermus thermophilus
33% identity, 69% coverage: 188:634/647 of query aligns to 2:447/455 of 2yquA

query
sites
2yquA
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
L
I
 
V
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
S
x
P
A
x
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
R
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
G
M
 
V
V
 
V
N
x
E
A
x
K
G
 
E
L
 
K
D
 
A
I
x
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
x
R
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
E
A
 
T
A
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
I
H
 
Y
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
H
 
-
S
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
K
G
 
G
V
 
L
S
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
K
P
 
V
T
 
K
-
x
G
-
x
V
-
 
E
F
 
L
D
 
D
F
 
L
K
 
P
A
 
A
T
 
L
I
 
M
Q
 
A
Q
 
H
K
 
K
K
 
D
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
Q
A
 
A
-
 
N
L
 
T
Q
 
Q
K
 
G
K
 
V
K
 
E
Y
 
F
L
 
L
G
 
F
V
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
K
L
 
K
D
 
N
N
 
G
I
 
I
T
 
A
I
 
R
L
 
H
E
 
Q
G
 
G
W
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
V
 
L
D
 
S
A
 
E
H
 
R
T
 
K
I
 
V
E
 
L
V
 
V
D
 
E
-
 
E
-
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
E
Y
 
L
K
 
E
G
 
A
M
 
R
K
 
Y
Y
 
I
L
 
L
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
S
T
 
A
T
 
P
N
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
P
L
 
W
P
 
A
G
 
Q
L
 
V
E
 
D
D
 
Y
V
 
E
G
 
R
Y
 
V
L
 
V
T
 
T
N
x
S
E
 
T
T
 
E
L
 
A
F
 
L
D
 
S
L
 
F
E
 
P
E
 
E
Q
 
V
P
 
P
E
 
K
H
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
x
V
I
|
I
A
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
V
A
 
V
Y
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
E
V
 
V
T
 
I
M
 
V
L
 
L
H
 
E
R
 
Y
S
 
M
E
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
P
T
 
T
Q
 
M
A
 
D
A
 
L
D
 
E
I
 
V
T
 
S
D
 
R
D
 
A
L
 
A
T
 
E
S
 
R
H
 
V
F
 
F
T
 
K
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
T
V
 
I
H
 
R
T
 
T
N
 
G
V
 
V
S
 
R
I
 
V
Q
 
T
K
 
A
F
 
V
-
 
V
-
 
P
E
 
E
K
 
A
N
 
K
G
 
G
D
 
A
A
 
R
I
 
V
V
 
E
A
 
L
H
 
E
T
 
G
N
 
G
E
 
E
G
 
-
T
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
D
H
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
T
 
R
R
 
R
P
 
P
N
x
Y
T
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
I
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
N
 
S
L
 
T
N
 
D
K
 
E
T
 
R
G
 
G
H
 
R
I
 
I
L
 
P
V
 
V
N
 
D
T
 
E
K
 
H
Q
 
L
E
 
R
T
 
T
N
 
R
V
 
V
G
 
P
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
V
T
 
V
D
 
R
T
 
G
P
 
P
A
x
M
F
x
L
V
x
A
Y
 
H
T
 
K
A
 
A
A
x
S
K
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
I
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
E
N
 
H
A
 
M
F
 
V
Q
 
R
S
 
G
T
 
F
G
 
G
D
 
H
M
 
-
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
T
 
Q
G
 
A
L
 
I
P
 
P
W
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
E
A
 
L
E
 
K
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
E
 
K
T
 
V
S
 
G
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
Y
T
 
S
E
 
A
V
 
S
P
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
M
L
 
G
D
 
E
T
 
T
R
 
E
G
 
G
V
 
F
I
 
I
K
 
K
L
 
V
I
 
L
R
 
A
N
 
H
S
 
A
E
 
K
T
 
T
D
 
D
K
 
R
L
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
V
R
 
H
I
 
G
I
 
I
A
 
G
P
 
A
E
 
R
G
 
V
G
 
G
E
 
D
L
 
V
A
 
L
M
 
A
Q
 
E
V
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
K
 
F
A
 
F
G
 
K
M
 
A
T
 
S
I
 
A
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
G
D
 
R
A
 
A
F
 
P
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
L
 
P
T
 
S
L
 
L
S
 
S
E
|
E
G
 
I
V
 
L
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L
T
 
A

3urhB Crystal structure of a dihydrolipoamide dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021
31% identity, 70% coverage: 188:639/647 of query aligns to 1:464/465 of 3urhB

query
sites
3urhB
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
I
I
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
S
x
P
A
x
G
A
 
G
F
 
Y
S
 
V
A
 
C
A
 
A
T
 
I
T
 
K
A
 
A
N
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
K
V
 
V
L
 
A
M
 
V
V
 
V
N
x
E
A
x
K
G
 
R
L
 
S
D
 
T
I
x
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
H
A
 
A
A
 
S
E
 
E
Q
 
M
V
 
F
H
 
H
R
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
S
 
G
-
 
L
P
 
E
F
 
A
N
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
E
G
 
V
A
 
A
N
 
N
P
 
P
T
 
K
F
 
L
D
 
N
F
 
L
K
 
Q
-
 
K
-
 
M
-
 
M
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
V
Q
 
K
Q
 
S
K
 
N
K
 
V
E
 
D
L
 
G
V
 
V
A
 
S
A
 
F
L
 
L
Q
 
F
K
 
K
K
 
K
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
N
N
 
K
I
 
I
T
 
D
I
 
G
L
 
F
E
 
Q
G
 
G
W
x
T
A
x
G
R
 
K
F
 
V
V
 
L
D
 
G
A
 
Q
H
 
G
T
 
K
I
 
V
E
 
S
V
 
V
-
 
T
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
G
D
 
E
G
 
E
K
 
Q
P
 
V
Y
 
L
K
 
E
G
 
A
M
 
K
K
 
N
Y
 
V
L
 
V
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
-
T
 
-
T
 
S
N
 
D
V
 
V
P
 
A
D
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
V
E
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
F
-
 
D
D
 
E
V
 
K
G
 
T
Y
 
I
L
 
V
T
 
S
N
 
S
E
 
T
T
 
G
L
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
Q
 
V
P
 
P
E
 
A
H
 
S
L
 
M
I
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
x
V
I
|
I
A
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
G
Q
 
S
A
 
V
Y
 
W
H
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
V
H
 
E
R
 
F
S
 
L
E
 
D
R
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
G
T
 
G
Q
 
M
A
 
D
A
 
G
D
 
E
I
 
V
T
 
A
D
 
K
D
 
Q
L
 
L
T
 
Q
S
 
R
H
 
M
F
 
L
T
 
T
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
D
V
 
F
H
 
K
T
 
L
N
 
G
V
 
A
S
 
K
I
 
V
Q
 
T
K
 
G
F
 
A
E
 
V
K
 
K
N
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
G
I
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
P
V
 
V
A
 
K
H
 
G
T
 
G
N
 
E
E
 
A
G
 
T
T
 
T
F
 
L
E
 
D
A
 
A
S
 
E
H
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
x
R
R
 
K
P
 
P
N
 
S
T
 
T
S
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
A
N
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
V
L
 
L
N
 
D
K
 
S
T
 
R
G
 
G
H
 
R
I
 
V
L
 
E
V
 
I
N
 
D
T
 
R
K
 
H
Q
 
F
E
 
Q
T
 
T
N
 
S
V
 
I
G
 
A
H
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
V
T
 
V
D
 
R
T
 
G
P
 
P
A
x
M
F
x
L
V
x
A
Y
x
H
T
 
K
A
 
A
A
 
E
K
 
D
E
 
E
G
 
G
K
 
-
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
A
N
 
E
A
 
I
F
 
I
Q
 
A
S
 
G
T
 
Q
G
 
A
D
 
G
M
 
H
V
 
V
D
 
N
Y
 
Y
T
 
D
G
 
V
L
 
I
P
 
P
W
 
G
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
Q
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
E
 
E
K
 
E
E
 
E
A
 
L
E
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
A
Y
 
Y
E
 
K
T
 
I
S
 
G
V
 
K
M
 
F
P
 
P
L
 
F
T
 
T
E
 
A
V
 
N
P
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
M
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
R
 
D
G
 
G
V
 
F
I
 
V
K
 
K
L
 
I
I
 
L
R
 
A
N
 
D
S
 
K
E
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
R
L
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
I
I
 
I
A
 
G
P
 
F
E
 
G
G
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
M
A
 
I
M
 
H
Q
 
E
V
 
I
S
 
A
L
 
V
A
 
L
I
 
M
K
 
E
A
 
F
G
 
G
M
 
G
T
 
S
I
 
S
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
G
D
 
R
A
 
T
F
 
C
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
L
 
P
T
 
T
L
 
M
S
 
S
E
|
E
G
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
L
-
 
S
T
 
T
F
 
F
N
 
F
K
 
K
D
 
P
V
 
I

8ajjA Crystal structure of the disulfide reductase mera from staphylococcus aureus (see paper)
31% identity, 68% coverage: 188:626/647 of query aligns to 2:430/442 of 8ajjA

query
sites
8ajjA
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
I
I
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
F
G
|
G
S
 
K
A
 
A
A
 
G
F
 
K
S
 
T
A
 
L
A
 
A
T
 
K
T
 
Y
A
 
A
N
 
A
E
 
S
L
 
T
G
 
G
L
 
Q
T
 
H
V
 
V
L
 
A
M
 
V
V
 
I
N
x
E
A
x
Q
G
 
S
L
 
P
D
 
K
I
x
M
-
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
V
 
I
N
 
N
V
 
I
G
 
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
H
 
T
L
 
L
I
 
V
R
 
H
A
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
E
G
 
G
A
 
K
N
 
S
P
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
F
 
F
K
 
E
A
 
A
T
 
S
I
 
Y
Q
 
N
Q
 
R
K
 
K
K
 
N
E
 
D
L
 
V
V
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
N
K
 
K
K
 
N
Y
 
Y
L
 
-
G
 
H
V
 
L
V
 
L
G
 
A
D
 
D
L
 
D
D
 
N
N
 
N
I
 
I
T
 
D
I
 
V
L
 
L
E
 
D
G
 
F
W
 
K
A
|
A
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
S
-
 
N
-
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
Q
H
 
H
T
 
D
I
 
D
E
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
S
K
 
-
P
 
-
Y
 
I
K
 
T
G
 
A
M
 
P
K
 
H
Y
 
I
L
 
I
L
 
I
A
x
N
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
T
T
 
S
N
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
N
L
 
I
P
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
Q
V
 
A
G
 
K
Y
 
H
L
 
V
T
 
F
N
 
D
E
 
S
T
 
T
-
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
N
L
 
I
E
 
S
E
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
K
H
 
H
L
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
I
|
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
F
A
 
A
Q
 
S
A
 
M
Y
 
F
H
 
A
R
 
N
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
L
H
 
E
R
 
R
S
 
G
E
 
E
R
 
S
I
 
F
L
 
M
R
 
P
T
 
R
Q
 
E
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
V
T
 
V
D
 
A
D
 
Y
L
 
G
T
 
I
S
 
T
H
 
D
F
 
L
T
 
E
E
 
N
E
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
A
V
 
L
H
 
H
T
 
T
N
 
N
V
 
V
S
 
E
I
 
T
Q
 
T
K
 
E
F
 
L
E
 
S
K
 
S
N
 
D
G
 
N
D
 
H
A
 
H
I
 
T
V
 
T
A
 
V
H
 
H
T
 
T
N
 
N
E
 
V
G
 
D
T
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
D
H
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
T
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
K
P
 
P
N
|
N
T
 
T
S
 
D
G
 
-
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
T
G
 
D
V
 
I
N
 
E
L
 
L
N
 
G
K
 
D
T
 
R
G
 
G
H
 
E
I
 
I
L
 
K
V
 
V
N
 
N
T
 
A
K
 
H
Q
 
L
E
 
Q
T
 
T
N
 
T
V
 
V
G
 
P
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
T
 
K
D
 
G
T
 
G
P
 
L
A
x
Q
F
|
F
V
x
T
Y
|
Y
T
 
I
A
x
S
A
 
L
K
 
D
E
 
D
G
 
Y
K
 
R
V
 
I
A
 
I
V
 
K
L
 
S
N
 
A
A
 
L
F
 
Y
Q
 
G
S
 
N
T
 
Q
G
 
S
D
 
R
M
 
T
V
 
T
D
 
D
Y
 
N
T
 
R
G
 
G
-
 
S
L
 
V
P
 
P
W
 
Y
V
 
T
V
 
V
F
 
F
T
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
P
I
 
L
A
 
S
G
 
R
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
T
E
 
S
K
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
A
E
 
A
A
 
Q
G
 
H
I
 
Y
P
x
D
Y
|
Y
E
 
T
T
 
E
S
 
H
V
 
Q
M
 
L
P
 
L
L
 
V
T
 
S
E
 
A
V
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
H
Q
 
K
A
 
I
A
 
N
L
 
N
D
 
D
T
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
L
I
 
F
K
 
K
L
 
V
I
 
V
R
 
I
N
 
N
S
 
N
E
 
E
T
 
N
D
 
N
K
 
M
L
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
T
I
 
L
I
 
Y
A
 
G
P
 
K
E
 
Q
G
 
S
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
I
M
 
N
Q
 
I
V
 
I
S
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
Q
G
 
N
M
 
I
T
 
P
I
 
Y
Q
 
T
E
 
V
L
 
L
A
 
R
D
 
D
A
 
N
F
 
I
H
 
Y
P
 
T
Y
 
H
L
 
P
T
 
T
L
 
M
S
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8ajkB Crystal structure of a c43s variant from the disulfide reductase mera from staphylococcus aureus (see paper)
31% identity, 68% coverage: 188:626/647 of query aligns to 5:433/447 of 8ajkB

query
sites
8ajkB
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
I
I
 
V
I
 
I
G
|
G
G
 
F
G
|
G
S
 
K
A
 
A
A
 
G
F
 
K
S
 
T
A
 
L
A
 
A
T
 
K
T
 
Y
A
 
A
N
 
A
E
 
S
L
 
T
G
 
G
L
 
Q
T
 
H
V
 
V
L
 
A
M
 
V
V
 
I
N
x
E
A
x
Q
G
 
S
L
 
P
D
 
K
I
x
M
-
 
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
I
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
H
 
T
L
 
L
I
 
V
R
 
H
A
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
S
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
E
G
 
G
A
 
K
N
 
S
P
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
F
 
F
K
 
E
A
 
A
T
 
S
I
 
Y
Q
 
N
Q
 
R
K
 
K
K
 
N
E
 
D
L
 
V
V
 
V
A
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
N
K
 
K
K
 
N
Y
 
Y
L
 
-
G
 
H
V
 
L
V
 
L
G
 
A
D
 
D
L
 
D
D
 
N
N
 
N
I
 
I
T
 
D
I
 
V
L
 
L
E
 
D
G
 
F
W
x
K
A
|
A
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
S
-
 
N
-
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
Q
H
 
H
T
 
D
I
 
D
E
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
S
K
 
-
P
 
-
Y
 
I
K
 
T
G
 
A
M
 
P
K
 
H
Y
 
I
L
 
I
L
 
I
A
x
N
T
|
T
G
|
G
A
 
A
T
 
T
T
 
S
N
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
N
L
 
I
P
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
Q
V
 
A
G
 
K
Y
 
H
L
 
V
T
 
F
N
 
D
E
 
S
T
 
T
-
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
N
L
 
I
E
 
S
E
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
K
H
 
H
L
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
F
A
 
A
Q
 
S
A
 
M
Y
 
F
H
 
A
R
 
N
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
L
 
L
H
 
E
R
 
R
S
 
G
E
 
E
R
 
S
I
 
F
L
 
M
R
 
P
T
 
R
Q
 
E
A
 
D
A
 
Q
D
 
D
I
 
V
T
 
V
D
 
A
D
 
Y
L
 
G
T
 
I
S
 
T
H
 
D
F
 
L
T
 
E
E
 
N
E
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
A
V
 
L
H
 
H
T
 
T
N
 
N
V
 
V
S
 
E
I
 
T
Q
 
T
K
 
E
F
 
L
E
 
S
K
 
S
N
 
D
G
 
N
D
 
H
A
 
H
I
 
T
V
 
T
A
 
V
H
 
H
T
 
T
N
 
N
E
 
V
G
 
D
T
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
D
H
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
T
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
D
G
 
-
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
T
G
 
D
V
 
I
N
 
E
L
 
L
N
 
G
K
 
D
T
 
R
G
 
G
H
 
E
I
 
I
L
 
K
V
 
V
N
 
N
T
 
A
K
 
H
Q
 
L
E
 
Q
T
 
T
N
 
T
V
 
V
G
 
P
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
T
 
K
D
 
G
T
 
G
P
 
L
A
x
Q
F
|
F
V
x
T
Y
|
Y
T
 
I
A
x
S
A
 
L
K
 
D
E
 
D
G
 
Y
K
 
R
V
 
I
A
 
I
V
 
K
L
 
S
N
 
A
A
 
L
F
 
Y
Q
 
G
S
 
N
T
 
Q
G
 
S
D
 
R
M
 
T
V
 
T
D
 
D
Y
 
N
T
 
R
G
 
G
-
 
S
L
 
V
P
 
P
W
 
Y
V
 
T
V
 
V
F
 
F
T
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
P
I
 
L
A
 
S
G
 
R
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
T
E
 
S
K
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
A
E
 
A
A
 
Q
G
 
H
I
 
Y
P
 
D
Y
 
Y
E
 
T
T
 
E
S
 
H
V
 
Q
M
 
L
P
 
L
L
 
V
T
 
S
E
 
A
V
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
H
Q
 
K
A
 
I
A
 
N
L
 
N
D
 
D
T
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
L
I
 
F
K
 
K
L
 
V
I
 
V
R
 
I
N
 
N
S
 
N
E
 
E
T
 
N
D
 
N
K
 
M
L
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
T
I
 
L
I
 
Y
A
 
G
P
 
K
E
 
Q
G
 
S
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
I
M
 
N
Q
 
I
V
 
I
S
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
Q
G
 
N
M
 
I
T
 
P
I
 
Y
Q
 
T
E
 
V
L
 
L
A
 
R
D
 
D
A
 
N
F
 
I
H
 
Y
P
 
T
Y
 
H
L
 
P
T
 
T
L
 
M
S
 
A
E
 
E

4jdrA Dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase from escherichia coli (see paper)
30% identity, 70% coverage: 190:642/647 of query aligns to 8:465/471 of 4jdrA

query
sites
4jdrA
L
 
V
I
 
V
I
 
V
I
 
L
G
|
G
G
 
A
G
|
G
S
x
P
A
|
A
A
 
G
F
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
T
 
F
T
 
R
A
 
C
N
 
A
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
E
V
 
T
L
 
V
M
 
I
V
 
V
N
x
E
A
x
R
G
x
Y
L
 
N
D
 
T
I
x
L
G
 
G
G
 
G
T
x
V
C
|
C
V
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
H
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
H
A
 
V
A
 
A
E
 
K
Q
 
V
V
 
I
H
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
H
 
A
S
 
L
P
 
A
F
 
E
N
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
V
G
 
F
A
 
G
N
x
E
P
|
P
T
 
K
F
 
T
D
 
D
F
 
I
K
 
D
A
 
K
T
 
I
I
 
R
Q
 
T
Q
 
W
K
 
K
K
 
E
E
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
N
A
 
Q
L
 
L
Q
 
T
K
 
G
K
 
G
K
 
-
Y
 
-
L
 
L
G
 
A
V
 
G
V
 
M
G
 
A
D
 
K
L
 
G
D
 
R
N
 
K
I
 
V
T
 
K
I
 
V
L
 
V
E
 
N
G
 
G
W
x
L
A
x
G
R
 
K
F
 
F
V
 
T
D
 
G
A
 
A
H
 
N
T
 
T
I
 
L
E
 
E
V
 
V
D
 
E
G
 
G
K
 
E
P
 
N
Y
 
G
K
 
K
G
 
T
M
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
F
-
 
D
K
 
N
Y
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A
T
x
A
G
|
G
A
 
S
T
 
R
-
 
P
T
 
I
N
 
Q
V
 
L
P
 
P
D
 
F
L
 
I
P
 
P
G
 
H
L
 
-
E
 
E
D
 
D
V
 
P
G
 
R
Y
 
I
L
 
W
T
 
D
N
 
S
E
 
T
T
 
D
L
 
A
F
 
L
D
 
E
L
 
L
E
 
K
E
 
E
Q
 
V
P
 
P
E
 
E
H
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
G
G
 
G
Y
x
I
I
|
I
A
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
M
A
 
G
Q
 
T
A
 
V
Y
 
Y
H
 
H
R
 
A
F
 
L
G
 
G
T
 
S
K
 
Q
V
 
I
T
 
D
M
 
V
L
 
V
H
 
E
R
 
M
S
 
F
E
 
D
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
R
 
P
T
 
A
Q
 
A
A
 
D
A
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
V
D
 
K
D
 
V
L
 
F
T
 
T
S
 
K
H
 
R
F
 
I
T
 
S
E
 
K
E
 
K
-
 
F
G
 
N
I
 
L
E
 
M
V
 
L
H
 
E
T
 
T
N
 
K
V
 
V
S
 
T
I
 
A
Q
 
V
K
 
E
F
 
A
E
 
K
K
 
E
N
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
Y
I
 
V
V
 
T
A
 
M
H
 
E
T
 
G
N
 
K
E
 
K
G
 
A
T
 
P
F
 
A
E
 
E
A
 
P
S
 
Q
H
 
R
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
T
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
V
P
 
P
N
 
N
T
 
G
S
 
K
G
 
N
L
 
L
A
 
D
I
 
A
E
 
G
N
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
E
L
 
V
N
 
D
K
 
D
T
 
R
G
 
G
H
 
F
I
 
I
L
 
R
V
 
V
N
 
D
T
 
K
K
 
Q
Q
 
L
E
 
R
T
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
P
H
 
H
I
 
I
Y
 
F
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
C
 
I
T
 
V
D
 
G
T
 
Q
P
 
P
A
x
M
F
x
L
V
x
A
Y
x
H
T
 
K
A
 
G
A
x
V
K
 
H
E
 
E
G
 
G
K
 
H
V
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
-
N
 
E
A
 
V
F
 
I
Q
 
A
S
 
G
T
 
K
G
 
K
D
 
H
M
 
Y
V
 
F
D
 
D
Y
 
P
T
 
K
G
 
V
L
 
I
P
 
P
W
 
S
V
 
I
V
 
A
F
 
Y
T
 
T
D
 
E
P
 
P
Q
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
W
A
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
T
E
 
E
K
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
K
E
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
S
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
S
 
A
V
 
T
M
 
F
P
 
P
L
 
W
T
 
A
E
 
A
V
 
S
P
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
D
D
 
C
T
 
A
R
 
D
G
 
G
V
 
M
I
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
F
N
 
D
S
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
H
K
 
R
L
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
I
 
V
A
 
G
P
 
T
E
 
N
G
 
G
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
L
M
 
G
Q
 
E
V
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
E
A
 
M
G
 
G
M
 
C
T
 
D
I
 
A
Q
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
L
A
 
T
F
 
I
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
L
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
H
E
|
E
G
 
S
V
 
V
K
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
E
T
 
V
F
 
F
N
 
E
K
 
G
D
 
S
V
 
I
S
 
T
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Echvi_4481 Echvi_4481 mercuric reductase
MVKIRNMFTPKSNKIGEGQKSLSEVVLEIEGMTCDHCATGIEKKVGHLVGTASQKVNYPE
GKGIFSYDPEKVSKKEIIDTINGMGNYSVKKELPASSNGQGTEEEVTFSISGMTCDHCAT
SIEKRFEGHEGLISKSVSYADEKGTFIFNPDKISRQEIIETINKEGNYKVQKEIGGNGNL
ERADPGQHDLIIIGGGSAAFSAATTANELGLTVLMVNAGLDIGGTCVNVGCVPSKHLIRA
AEQVHRAQHSPFNGVSGANPTFDFKATIQQKKELVAALQKKKYLGVVGDLDNITILEGWA
RFVDAHTIEVDGKPYKGMKYLLATGATTNVPDLPGLEDVGYLTNETLFDLEEQPEHLIVL
GAGYIALEIAQAYHRFGTKVTMLHRSERILRTQAADITDDLTSHFTEEGIEVHTNVSIQK
FEKNGDAIVAHTNEGTFEASHVLVATGTRPNTSGLAIENAGVNLNKTGHILVNTKQETNV
GHIYAAGDCTDTPAFVYTAAKEGKVAVLNAFQSTGDMVDYTGLPWVVFTDPQIAGAGLDE
KEAEEAGIPYETSVMPLTEVPRAQAALDTRGVIKLIRNSETDKLIGGRIIAPEGGELAMQ
VSLAIKAGMTIQELADAFHPYLTLSEGVKLAAITFNKDVSELSCCAS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory