SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1479 FitnessBrowser__Phaeo:GFF1479 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q92R43 Aquaglyceroporin AqpS from Rhizobium meliloti (strain 1021) (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
53% identity, 99% coverage: 3:218/218 of query aligns to 7:220/233 of Q92R43

query
sites
Q92R43
T
 
T
Q
 
R
K
 
R
L
 
C
I
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
A
G
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
M
 
M
A
 
A
E
 
D
T
 
A
L
 
L
S
 
T
G
 
A
G
 
D
N
 
D
I
 
-
G
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
T
V
 
I
A
 
A
T
|
T
G
 
G
A
 
A
M
 
I
L
 
L
Y
 
V
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
T
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
S
L
 
L
A
 
V
F
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
S
G
 
G
D
 
R
H
 
L
S
 
T
W
 
R
A
 
R
A
 
D
V
 
C
P
 
A
P
 
A
Y
 
Y
V
 
V
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
W
 
A
A
 
L
S
 
A
H
 
H
V
 
L
M
 
M
F
 
F
D
 
D
L
 
L
T
 
P
I
 
P
L
 
L
Q
 
D
T
 
M
S
 
S
T
 
M
T
 
K
M
 
V
H
 
-
R
 
R
T
 
T
G
 
G
G
 
P
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
F
 
L
S
 
S
E
 
E
I
 
G
L
 
V
A
 
A
T
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
V
F
 
A
V
 
T
I
 
I
F
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
F
R
 
H
P
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
W
L
 
L
V
 
V
A
 
G
F
 
L
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
A
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
T
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
|
V
T
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
S
F
 
F
S
 
T
D
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
S
G
 
G
I
 
I
Y
 
R
P
 
P
G
 
G
H
 
D
I
 
L
L
 
P
M
 
G
F
 
F
I
 
V
V
 
I
M
 
A
Q
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
G
V
 
A
G
 
V
L
 
C
A
 
A
H
 
L
L
 
A
I
 
L
L
 
M
P
 
R
R
 
W
L
 
L
F
 
L
R
 
Q
P
 
P
S
 
A

P08995 Nodulin-26; N-26 from Glycine max (Soybean) (Glycine hispida) (see paper)
39% identity, 63% coverage: 4:141/218 of query aligns to 38:173/271 of P08995

query
sites
P08995
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
Y
F
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
F
G
 
A
V
 
G
V
 
C
G
 
A
S
 
S
G
 
L
I
 
V
M
 
V
A
 
N
E
 
E
T
 
N
L
 
Y
S
 
Y
G
 
N
G
 
M
N
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
I
A
 
T
L
 
F
L
 
P
A
 
G
N
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
V
T
 
W
G
 
G
A
 
L
M
 
V
L
 
L
Y
 
T
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
Y
T
 
T
L
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
S
R
 
T
G
 
R
D
 
R
H
 
F
S
 
P
W
 
L
A
 
I
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
A
Y
 
Y
V
 
V
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
I
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
A
V
 
S
W
 
G
A
 
T
S
 
L
H
 
R
V
 
L
M
 
L
F
 
F
D
 
M
L
 
G
T
 
N
I
 
H
L
 
D
Q
 
Q
T
 
F
S
 
S
T
 
G
T
 
T
M
 
V
H
 
P
R
 
N
T
 
G
G
 
T
G
 
N
A
 
L
Q
 
Q
W
 
A
F
 
F
S
 
V
-
 
F
E
 
E
I
 
F
L
 
I
A
 
M
T
 
T
F
 
F
G
 
F
L
 
L
L
 
M
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9SAI4 Aquaporin NIP6-1; NOD26-like intrinsic protein 6-1; AtNIP6;1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
33% identity, 62% coverage: 4:139/218 of query aligns to 80:212/305 of Q9SAI4

query
sites
Q9SAI4
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
F
L
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
L
F
 
I
L
 
L
L
 
I
I
 
F
G
 
A
V
 
G
V
 
T
G
 
A
S
 
T
G
 
A
I
 
I
M
 
V
A
 
N
E
 
Q
T
 
K
L
 
T
S
 
D
G
 
G
G
 
A
N
 
E
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
G
N
 
C
A
 
A
V
 
A
A
 
S
T
x
A
G
 
G
A
 
L
M
 
A
L
 
V
Y
 
M
V
 
I
I
 
V
I
 
I
T
 
L
T
 
S
L
 
T
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
A
R
 
L
G
 
K
D
 
H
H
 
F
S
 
P
W
 
W
A
 
K
A
 
H
V
 
V
P
 
P
P
 
V
Y
 
Y
V
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
I
 
M
G
 
A
G
 
S
I
 
V
L
 
S
G
 
A
V
 
A
W
 
F
A
 
A
S
 
L
H
 
K
V
 
A
M
 
V
F
 
F
D
 
E
L
 
P
T
 
T
I
 
-
L
 
M
Q
 
S
T
 
G
S
 
G
T
 
V
T
 
T
M
 
V
H
 
P
R
 
T
T
 
V
G
 
G
G
 
L
A
 
S
Q
 
Q
W
 
A
F
 
F
S
 
A
-
 
L
E
 
E
I
 
F
L
 
I
A
 
I
T
 
S
F
 
F
G
 
N
L
 
L
L
 
M
F
 
F
V
 
V
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Q6Z2T3 Aquaporin NIP2-1; Low silicon protein 1; NOD26-like intrinsic protein 2-1; OsNIP2;1; Silicon influx transporter LSI1 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
31% identity, 85% coverage: 4:189/218 of query aligns to 49:237/298 of Q6Z2T3

query
sites
Q6Z2T3
Q
 
K
K
 
K
L
 
V
I
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
V
L
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
F
F
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
F
G
 
M
V
 
T
V
 
C
G
 
G
S
 
-
G
 
-
I
 
-
M
 
-
A
 
A
E
 
A
T
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
S
N
 
D
I
 
L
G
 
S
-
 
R
L
 
I
A
 
S
L
 
Q
L
 
L
A
 
G
N
 
Q
A
 
S
V
 
I
A
 
A
T
 
G
G
 
G
A
 
L
M
 
I
L
 
V
Y
 
T
V
 
V
I
 
M
I
 
I
T
 
Y
T
 
A
L
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
R
 
F
G
 
R
D
 
H
H
 
F
S
 
P
W
 
W
A
 
I
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
F
Y
 
Y
V
 
W
A
 
A
A
|
A
Q
 
Q
I
 
F
I
 
T
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
A
V
 
S
W
 
F
A
 
V
-
 
L
S
 
K
H
 
A
V
 
V
M
 
I
F
 
H
D
 
P
L
 
V
T
 
D
I
 
V
L
 
I
Q
 
G
T
 
T
S
 
T
T
 
T
T
 
P
M
 
V
H
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
P
Q
 
H
W
 
W
F
 
H
S
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
V
E
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
T
F
 
F
G
 
N
L
 
M
L
 
M
F
 
F
V
 
V
I
 
T
F
 
L
G
 
-
G
 
A
L
 
V
R
 
A
S
 
T
R
 
D
P
 
T
E
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
G
F
 
L
Y
 
A
I
 
V
T
 
G
G
 
S
A
 
A
Y
 
V
W
 
C
F
 
I
T
 
T
A
 
S
-
 
I
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
I
S
 
S
T
 
G
S
 
G
F
 
S
A
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
R
T
 
T
V
 
L
A
 
G
R
 
P
G
 
A
F
 
L
-
 
A
S
 
S
D
 
N
T
 
K
F
 
F
A
 
D
G
 
G
I
 
L
Y
 
W

O94778 Aquaporin-8; AQP-8 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
43% identity, 44% coverage: 4:98/218 of query aligns to 36:124/261 of O94778

query
sites
O94778
Q
 
Q
K
 
P
L
x
C
I
 
L
A
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
S
G
 
A
-
 
L
F
|
F
L
 
I
L
 
F
I
 
I
G
 
G
V
x
C
V
 
L
G
 
-
S
 
S
G
 
V
I
 
I
M
 
E
A
 
N
E
 
G
T
 
T
L
 
D
S
 
T
G
 
G
G
 
-
N
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
N
 
P
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
x
H
G
 
G
A
 
L
M
 
A
L
 
L
Y
 
G
V
 
L
I
 
V
I
 
I
T
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
A
A
 
M
L
 
L
R
 
I
G
 
G
D
 
G
H
 
L
S
 
N
W
 
L
A
 
V
A
 
M
V
 
L
P
 
L
P
 
P
Y
 
Y
V
 
W
A
 
V
A
 
S
Q
 
Q
I
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3nkaA Crystal structure of aqpz h174g,t183f (see paper)
37% identity, 43% coverage: 4:97/218 of query aligns to 5:96/230 of 3nkaA

query
sites
3nkaA
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
C
L
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
F
F
 
W
L
 
L
L
 
V
I
 
F
G
 
G
V
 
G
V
 
C
G
 
G
S
 
S
G
x
A
I
 
V
M
 
L
A
 
A
E
 
A
T
 
G
L
 
F
S
 
P
G
 
-
G
 
-
N
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
F
L
 
A
A
 
G
N
x
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
L
M
 
T
L
 
V
Y
 
L
V
 
T
I
 
M
I
 
A
T
 
F
T
 
A
L
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
G
F
 
L
A
 
W
L
 
A
R
 
G
G
 
G
D
 
R
H
 
F
S
 
P
W
 
A
A
 
K
A
 
E
V
 
V
P
 
V
P
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
V

Sites not aligning to the query:

P60844 Aquaporin Z; Bacterial nodulin-like intrinsic protein; Water channel AqpZ from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
37% identity, 43% coverage: 4:97/218 of query aligns to 3:94/231 of P60844

query
sites
P60844
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
E
A
x
C
L
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
F
F
 
W
L
 
L
L
 
V
I
 
F
G
 
G
V
 
G
V
x
C
G
 
G
S
 
S
G
 
A
I
 
V
M
 
L
A
 
A
E
 
A
T
 
G
L
 
F
S
 
P
G
 
-
G
 
-
N
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
F
L
 
A
A
 
G
N
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
L
M
 
T
L
 
V
Y
 
L
V
 
T
I
 
M
I
 
A
T
 
F
T
 
A
L
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
G
F
 
L
A
 
W
L
 
A
R
 
G
G
 
G
D
 
R
H
 
F
S
 
P
W
 
A
A
 
K
A
 
E
V
 
V
P
 
V
P
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
V

Sites not aligning to the query:

2o9eA Crystal structure of aqpz mutant t183c complexed with mercury (see paper)
37% identity, 43% coverage: 4:97/218 of query aligns to 5:96/232 of 2o9eA

query
sites
2o9eA
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
F
G
 
G
T
 
T
G
 
F
F
 
W
L
 
L
L
 
V
I
 
F
G
 
G
V
 
G
V
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
A
I
 
V
M
 
L
A
 
A
E
 
A
T
 
G
L
 
F
S
 
P
G
 
-
G
 
-
N
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
F
L
 
A
A
 
G
N
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
L
M
 
T
L
 
V
Y
 
L
V
 
T
I
 
M
I
 
A
T
 
F
T
 
A
L
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
G
F
 
L
A
 
W
L
 
A
R
 
G
G
 
G
D
 
R
H
 
F
S
 
P
W
 
A
A
 
K
A
 
E
V
 
V
P
 
V
P
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
V

Sites not aligning to the query:

P30302 Aquaporin PIP2-3; Plasma membrane intrinsic protein 2-3; AtPIP2;3; Plasma membrane intrinsic protein 2c; PIP2c; RD28-PIP; TMP2C; Water stress-induced tonoplast intrinsic protein; WSI-TIP from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
29% identity, 69% coverage: 4:153/218 of query aligns to 37:201/285 of P30302

query
sites
P30302
Q
 
R
K
 
A
L
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
F
L
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
L
F
 
L
L
 
F
L
 
L
-
 
Y
-
 
V
-
 
T
-
 
V
I
 
L
G
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
Y
G
 
K
I
 
I
M
 
Q
A
 
S
E
 
D
T
 
T
L
 
K
S
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
V
I
 
D
-
 
C
-
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
G
N
 
I
A
 
A
V
 
W
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
M
L
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
L
I
 
V
T
 
Y
T
 
C
L
 
T
G
 
A
P
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
F
A
 
G
F
 
L
A
 
F
L
 
L
R
 
A
G
 
R
D
 
K
H
 
V
S
 
S
W
 
L
A
 
I
A
 
R
V
 
A
P
 
V
P
 
L
Y
 
Y
V
 
M
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
I
 
C
I
 
L
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
G
V
 
V
W
 
G
A
 
F
S
 
-
H
 
-
V
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
V
T
 
K
I
 
A
L
 
F
Q
 
Q
T
 
S
S
 
S
T
 
H
T
 
Y
M
 
V
H
 
N
R
 
Y
T
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
W
 
F
F
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
A
S
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
I
A
 
G
T
 
T
F
 
F
G
 
V
L
 
L
L
 
V
F
 
Y
V
 
T
I
 
V
F
 
F
G
 
S
G
 
A
L
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
R
R
 
N
S
 
A
R
 
R
P
 
D
E
 
S
A
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

I1CR68 Aquaporin-1 from Rhizopus delemar (strain RA 99-880 / ATCC MYA-4621 / FGSC 9543 / NRRL 43880) (Mucormycosis agent) (Rhizopus arrhizus var. delemar) (see paper)
27% identity, 62% coverage: 4:138/218 of query aligns to 59:191/306 of I1CR68

query
sites
I1CR68
Q
 
R
K
 
E
L
 
F
I
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
V
F
 
I
L
 
L
L
 
V
I
 
L
G
 
-
V
 
-
V
 
L
G
 
T
S
 
C
G
 
G
I
 
F
M
 
C
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
L
 
T
S
 
L
G
 
H
G
 
I
N
 
E
I
 
E
G
 
S
L
 
K
A
 
S
L
 
W
L
 
L
A
 
T
N
 
S
A
 
S
V
 
F
A
 
G
T
 
S
G
 
G
A
 
L
M
 
S
L
 
V
Y
 
L
V
 
I
I
 
G
I
 
I
T
 
C
T
 
V
L
 
S
G
 
G
P
 
H
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
C
L
 
I
R
 
F
G
 
S
D
 
G
H
 
F
S
 
P
W
 
I
A
 
R
A
 
K
V
 
V
P
 
P
P
 
S
Y
 
Y
V
 
I
A
 
T
A
 
A
Q
 
Q
I
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
A
I
 
F
L
 
A
G
 
G
V
 
A
W
 
A
A
 
L
S
 
L
H
 
Y
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
E
L
 
P
T
 
A
I
 
I
L
 
V
Q
 
Q
T
 
F
S
 
D
T
 
G
T
 
G
M
 
Q
H
 
R
R
 
Y
T
 
I
G
 
L
G
 
G
A
 
E
Q
 
K
W
 
S
F
 
T
S
 
A
E
 
G
I
 
I
L
 
F
A
 
G
T
 
T
F
 
Y
G
 
P
L
 
P
L
 
L
F
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P43287 Aquaporin PIP2-2; Plasma membrane intrinsic protein 2-2; AtPIP2;2; Plasma membrane intrinsic protein 2b; PIP2b; TMP2b from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
29% identity, 69% coverage: 4:153/218 of query aligns to 37:201/285 of P43287

query
sites
P43287
Q
 
R
K
 
A
L
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
F
L
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
L
F
 
L
L
 
F
L
 
L
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
V
I
 
L
G
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
Y
G
 
K
I
 
I
M
 
Q
A
 
S
E
 
D
T
 
T
L
 
K
S
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
V
I
 
D
-
 
C
-
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
G
N
 
I
A
 
A
V
 
W
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
M
L
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
L
I
 
V
T
 
Y
T
 
C
L
 
T
G
 
A
P
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
F
A
 
G
F
 
L
A
 
F
L
 
L
R
 
A
G
 
R
D
 
K
H
 
V
S
 
S
W
 
L
A
 
I
A
 
R
V
 
A
P
 
V
P
 
L
Y
 
Y
V
 
M
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
I
 
C
I
 
L
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
G
V
 
V
W
 
G
A
 
F
S
 
-
H
 
-
V
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
V
T
 
K
I
 
A
L
 
F
Q
 
Q
T
 
S
S
 
S
T
 
Y
T
 
Y
M
 
D
H
 
R
R
 
Y
T
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
W
 
S
F
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
-
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
A
S
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
I
A
 
G
T
 
T
F
 
F
G
 
V
L
 
L
L
 
V
F
 
Y
V
 
T
I
 
V
F
 
F
G
 
S
G
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
K
L
 
R
R
 
N
S
 
A
R
|
R
P
x
D
E
 
S
A
x
H
V
 
V
P
 
P
A
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P43286 Aquaporin PIP2-1; Plasma membrane intrinsic protein 2-1; AtPIP2;1; Plasma membrane intrinsic protein 2a; PIP2a from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
29% identity, 69% coverage: 4:153/218 of query aligns to 39:203/287 of P43286

query
sites
P43286
Q
 
R
K
 
A
L
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
F
L
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
L
F
 
L
L
 
F
L
 
L
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
V
I
 
L
G
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
Y
G
 
K
I
 
I
M
 
Q
A
 
S
E
 
D
T
 
T
L
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
V
I
 
D
-
 
C
-
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
G
N
 
I
A
 
A
V
 
W
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
M
L
 
I
Y
 
F
V
 
I
I
 
L
I
 
V
T
 
Y
T
 
C
L
 
T
G
 
A
P
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
F
A
 
G
F
 
L
A
 
F
L
 
L
R
 
A
G
 
R
D
 
K
H
 
V
S
 
S
W
 
L
A
 
P
A
 
R
V
 
A
P
 
L
P
 
L
Y
 
Y
V
 
I
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
C
I
 
L
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
G
V
 
V
W
 
G
A
 
F
S
 
-
H
 
-
V
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
V
T
 
K
I
 
A
L
 
F
Q
 
Q
T
 
S
S
 
S
T
 
Y
T
 
Y
M
 
T
H
 
R
R
 
Y
T
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
W
 
S
F
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
A
S
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
I
A
 
G
T
 
T
F
 
F
G
 
V
L
 
L
L
 
V
F
 
Y
V
 
T
I
 
V
F
 
F
G
 
S
G
 
A
L
 
T
R
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
R
-
 
S
S
 
A
R
 
R
P
 
D
E
 
S
A
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P55064 Aquaporin-5; AQP-5 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
31% identity, 65% coverage: 39:179/218 of query aligns to 42:198/265 of P55064

query
sites
P55064
L
 
I
L
 
L
A
 
Q
N
x
I
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
L
M
 
A
L
 
I
Y
 
G
V
 
T
I
 
L
I
 
A
T
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
L
L
 
V
R
 
G
G
 
N
D
 
Q
H
 
I
S
 
S
W
 
L
A
 
L
A
 
R
V
 
A
P
 
F
P
 
F
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
A
H
 
G
V
 
I
M
 
L
F
 
Y
D
 
G
L
 
V
T
 
A
I
 
P
L
 
L
Q
 
N
T
 
A
S
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
A
T
 
L
T
x
N
M
 
N
H
 
N
R
 
T
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
A
 
Q
Q
 
A
W
 
M
F
 
V
S
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
Q
L
 
L
L
 
A
F
 
L
V
 
C
I
 
I
F
 
F
G
 
A
G
 
S
L
 
T
R
 
D
S
 
S
R
 
R
-
 
R
-
 
T
-
x
S
P
 
P
E
 
V
A
 
G
V
 
S
P
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
H
L
 
L
V
 
V
A
 
G
F
x
I
Y
 
Y
I
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
C
Y
 
S
W
 
-
F
 
M
T
 
N
A
 
P
S
 
A
T
x
R
S
 
S
F
 
F
A
 
-
N
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
V
V
 
M
A
 
N
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5dyeD Crystal structure of the full length s156e mutant of human aquaporin 5 (see paper)
31% identity, 65% coverage: 39:179/218 of query aligns to 41:197/253 of 5dyeD

query
sites
5dyeD
L
 
I
L
 
L
A
 
Q
N
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
L
M
 
A
L
 
I
Y
 
G
V
 
T
I
 
L
I
 
A
T
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
L
L
 
V
R
 
G
G
 
N
D
 
Q
H
 
I
S
 
S
W
 
L
A
 
L
A
 
R
V
 
A
P
 
F
P
 
F
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
A
H
 
G
V
 
I
M
 
L
F
 
Y
D
 
G
L
 
V
T
 
A
I
 
P
L
 
L
Q
 
N
T
 
A
S
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
A
T
 
L
T
 
N
M
 
N
H
 
N
R
 
T
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
A
 
Q
Q
 
A
W
 
M
F
 
V
S
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
Q
L
 
L
L
 
A
F
 
L
V
 
C
I
 
I
F
 
F
G
 
A
G
 
S
L
 
T
R
 
D
S
 
S
R
 
R
-
 
R
-
 
T
-
 
E
P
 
P
E
 
V
A
x
G
V
x
S
P
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
H
L
 
L
V
 
V
A
 
G
F
 
I
Y
 
Y
I
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
C
Y
 
S
W
 
-
F
 
M
T
 
N
A
 
P
S
 
A
T
 
R
S
 
S
F
 
F
A
 
-
N
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
V
V
 
M
A
 
N
R
 
R

P47863 Aquaporin-4; AQP-4; Mercurial-insensitive water channel; MIWC; WCH4 from Rattus norvegicus (Rat) (see 4 papers)
32% identity, 51% coverage: 47:158/218 of query aligns to 78:193/323 of P47863

query
sites
P47863
G
 
G
A
 
L
M
 
S
L
 
I
Y
 
A
V
 
T
I
 
M
I
 
V
T
 
Q
T
 
C
L
 
F
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
V
A
 
A
F
 
M
A
 
V
L
 
C
R
 
T
G
 
R
D
 
K
H
 
I
S
 
S
W
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
S
P
 
V
P
 
F
Y
 
Y
V
 
I
A
 
T
A
 
A
Q
 
Q
I
 
C
I
 
L
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
A
W
 
G
A
 
I
S
 
L
H
 
Y
V
 
L
M
 
V
F
 
T
D
 
P
L
 
P
T
 
S
I
 
V
L
 
V
Q
 
G
-
 
G
-
 
L
T
 
G
S
 
V
T
 
T
T
 
T
M
 
V
H
 
H
-
 
G
-
 
N
R
 
L
T
 
T
G
 
A
G
 
G
A
 
H
Q
 
G
W
 
L
F
 
L
S
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
I
T
 
T
F
 
F
G
 
Q
L
 
L
L
 
V
F
 
F
V
 
T
I
 
I
F
 
F
G
 
A
G
 
S
L
 
C
R
 
D
S
|
S
R
 
K
P
 
R
E
 
T
A
 
D
V
 
V
P
 
T
A
 
G
L
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
L
Y
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P09011 Lens fiber major intrinsic protein; Aquaporin-0; MIP26; MP26 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
44% identity, 28% coverage: 37:98/218 of query aligns to 37:98/261 of P09011

query
sites
P09011
L
 
L
A
 
H
L
 
V
L
 
L
A
 
Q
N
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
F
G
 
G
A
 
L
M
 
A
L
 
L
Y
 
A
V
 
T
I
 
L
I
 
V
T
 
Q
T
 
T
L
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
L
L
 
V
R
 
G
G
 
S
D
 
Q
H
 
M
S
 
S
W
 
L
A
 
L
A
 
R
V
 
A
P
 
F
P
 
C
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
A
I
 
V
L
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P55088 Aquaporin-4; AQP-4; Mercurial-insensitive water channel; MIWC; WCH4 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
31% identity, 51% coverage: 47:158/218 of query aligns to 78:193/323 of P55088

query
sites
P55088
G
 
G
A
 
L
M
 
S
L
 
I
Y
 
A
V
 
T
I
 
M
I
 
V
T
 
Q
T
 
C
L
 
F
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
V
A
 
A
F
 
M
A
 
V
L
 
C
R
 
T
G
 
R
D
 
K
H
 
I
S
|
S
W
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
S
P
 
V
P
 
F
Y
 
Y
V
 
I
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
C
I
 
L
G
 
G
G
 
A
I
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
A
W
 
G
A
 
I
S
 
L
H
 
Y
V
 
L
M
 
V
F
 
T
D
 
P
L
 
P
T
 
S
I
 
V
L
 
V
Q
 
G
-
 
G
-
 
L
T
 
G
S
 
V
T
 
T
T
 
T
M
 
V
H
 
H
-
 
G
-
 
N
R
 
L
T
 
T
G
 
A
G
 
G
A
 
H
Q
 
G
W
 
L
F
 
L
S
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
I
T
 
T
F
 
F
G
 
Q
L
 
L
L
 
V
F
 
F
V
 
T
I
 
I
F
 
F
G
 
A
G
 
S
L
 
C
R
 
D
S
 
S
R
 
K
P
 
R
E
 
T
A
 
D
V
 
V
P
 
T
A
 
G
L
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
L
Y
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P23645 Neurogenic protein big brain from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 3 papers)
33% identity, 46% coverage: 39:139/218 of query aligns to 99:196/696 of P23645

query
sites
P23645
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
L
M
 
A
L
 
M
Y
 
A
V
 
T
I
 
L
I
 
T
T
 
Q
T
 
C
L
 
F
G
 
L
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
C
L
 
V
R
 
V
G
 
R
D
 
S
H
 
I
S
 
S
W
 
P
A
 
I
A
 
R
V
 
A
P
 
A
P
 
M
Y
 
Y
V
 
I
A
 
T
A
 
A
Q
 
Q
I
 
C
I
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
A
H
 
A
V
 
L
M
 
L
F
 
Y
D
 
G
L
 
V
T
 
T
I
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
S
 
A
T
 
I
T
 
S
M
 
-
H
 
H
R
 
S
T
 
A
G
 
A
G
 
L
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
F
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
E
T
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
V
L
 
E
F
 
F
V
 
I
I
 
L

Sites not aligning to the query:

6f7hC Crystal structure of human aqp10 (see paper)
27% identity, 60% coverage: 4:133/218 of query aligns to 7:134/253 of 6f7hC

query
sites
6f7hC
Q
 
R
K
 
Q
L
 
C
I
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
F
L
 
L
G
 
G
T
 
V
G
 
F
F
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
L
G
 
L
V
 
T
V
 
Q
G
 
G
S
 
A
G
 
V
I
 
A
M
 
Q
A
 
A
E
 
V
T
 
T
-
 
S
-
 
G
L
 
E
S
 
T
G
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
F
G
 
F
L
 
T
A
 
M
L
 
F
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
L
A
 
A
T
 
V
G
 
T
A
 
I
M
 
A
L
x
I
Y
 
Y
V
 
V
I
 
G
I
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
N
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
F
T
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
C
L
 
I
R
 
V
G
 
G
D
 
R
H
 
L
S
 
P
W
 
W
A
 
V
A
 
K
V
 
L
P
 
P
P
 
I
Y
 
Y
V
 
I
A
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
L
I
 
L
G
 
S
G
 
A
I
 
F
L
 
C
G
 
A
V
 
S
W
 
G
A
 
A
S
 
T
H
 
Y
V
 
V
M
 
L
F
 
Y
D
 
H
L
 
D
T
 
A
I
 
L
L
 
Q
Q
 
N
T
 
Y
S
 
T
T
 
G
T
 
G
M
 
N
H
 
L
R
 
T
T
 
V
G
 
T
G
 
G
A
 
P
Q
 
K
W
 
E
F
 
T
S
 
A
E
 
S
I
 
I
L
 
F
A
 
A
T
 
T
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

P37451 Propanediol uptake facilitator PduF from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
33% identity, 53% coverage: 8:123/218 of query aligns to 11:123/264 of P37451

query
sites
P37451
A
 
A
E
 
E
A
 
F
L
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
L
L
 
F
L
 
L
I
 
F
G
 
F
V
 
G
V
 
I
G
 
G
S
 
C
G
 
-
I
 
L
M
 
S
A
 
A
E
 
L
T
 
K
L
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
A
N
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
W
L
 
E
L
 
I
A
 
C
N
 
I
A
 
I
V
 
W
A
 
G
T
 
L
G
 
G
A
 
I
M
 
S
L
 
L
Y
 
A
V
 
V
I
 
Y
I
 
L
T
 
T
T
 
A
L
 
-
G
 
-
P
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
L
N
|
N
P
|
P
A
|
A
V
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
A
F
 
L
A
 
W
L
 
L
R
 
F
G
 
A
D
 
C
H
 
F
S
 
P
W
 
K
A
 
Q
A
 
K
V
 
V
P
 
L
P
 
P
Y
 
Y
V
 
I
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
I
 
F
I
 
A
G
 
G
G
 
A
I
 
F
L
 
G
G
 
G
V
 
A
W
 
L
A
 
L
S
 
A
H
 
Y
V
 
V
M
 
L
F
 
Y
D
 
S
L
 
S
T
 
L
I
 
F
L
 
T
Q
 
E
T
 
F
S
 
E
T
 
T
T
 
A
M
 
H
H
 
H
R
 
M
T
 
V
G
 
R
G
 
G
A
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF1479 FitnessBrowser__Phaeo:GFF1479
MTTQKLIAEALGTGFLLIGVVGSGIMAETLSGGNIGLALLANAVATGAMLYVIITTLGPI
SGAHFNPAVTLAFALRGDHSWAAVPPYVAAQIIGGILGVWASHVMFDLTILQTSTTMHRT
GGAQWFSEILATFGLLFVIFGGLRSRPEAVPALVAFYITGAYWFTASTSFANPAVTVARG
FSDTFAGIYPGHILMFIVMQFIGVGLAHLILPRLFRPS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory