SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2493 FitnessBrowser__WCS417:GFF2493 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ryaA Crystal structure of abc transporter solute binding protein avi_3567 from agrobacterium vitis s4, target efi-510645, with bound d-mannitol
65% identity, 94% coverage: 27:440/440 of query aligns to 1:417/417 of 4ryaA

query
sites
4ryaA
A
 
A
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
N
S
 
G
D
 
D
M
 
M
I
 
I
R
 
R
M
 
M
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
T
K
 
D
T
 
D
F
 
F
E
 
T
A
 
K
E
 
K
H
 
N
P
 
P
E
 
G
I
 
I
K
 
D
L
 
V
N
 
K
W
 
W
V
 
V
V
 
T
L
 
L
E
 
E
E
|
E
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
|
R
Q
 
Q
R
 
K
L
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
I
 
V
A
 
A
T
 
T
Q
 
K
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
D
 
D
V
 
V
L
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
I
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
P
L
 
I
W
 
W
G
 
G
A
 
K
K
 
Q
G
 
G
W
 
W
L
 
L
E
 
A
P
 
P
M
 
L
K
 
D
D
 
K
L
 
L
P
 
S
A
 
A
S
 
D
Y
 
K
D
 
D
L
 
Y
D
 
D
-
 
A
-
 
A
D
 
D
V
 
L
F
 
L
P
 
P
S
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
K
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
L
 
A
P
 
P
F
 
F
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
S
 
S
S
 
S
I
 
M
T
 
V
Y
 
M
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
F
K
 
E
D
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
K
M
 
M
P
 
P
E
 
E
H
 
A
P
 
P
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
F
I
 
I
G
 
K
E
 
E
F
 
A
A
 
A
S
 
D
K
 
K
L
 
I
T
 
T
D
 
D
K
 
K
T
 
S
K
 
K
E
 
E
Q
 
V
Y
 
Y
G
 
G
L
 
I
C
 
C
L
 
L
R
|
R
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
W
 
W
G
|
G
E
 
E
N
 
N
M
 
I
A
 
A
L
 
F
I
 
L
T
 
S
T
 
A
L
 
M
A
 
S
N
 
N
G
 
S
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
R
 
R
W
 
W
F
 
F
D
 
D
E
 
E
K
 
Q
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
E
 
Q
F
 
F
N
 
D
G
 
Q
P
 
P
E
 
E
W
 
W
K
 
K
D
 
K
A
 
T
L
 
L
N
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
N
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
K
S
 
N
G
 
G
P
 
P
P
 
P
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
G
 
G
F
|
F
N
 
N
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
Q
S
 
T
G
 
G
K
 
K
C
 
C
A
 
G
I
 
M
W
 
W
V
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
T
V
 
V
A
 
A
G
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
T
 
T
D
 
N
K
 
P
T
 
K
Q
 
E
S
 
S
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
Q
V
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
A
F
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
D
E
 
N
K
 
G
T
 
L
D
 
G
K
 
K
G
 
R
T
 
G
S
 
N
W
 
W
L
 
L
Y
x
W
S
 
S
W
|
W
S
 
N
L
 
L
A
 
A
I
 
I
P
 
P
T
 
A
S
 
G
S
 
S
K
 
K
A
 
K
K
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
E
V
 
K
F
 
F
T
 
I
S
 
A
W
 
W
A
 
A
T
 
T
S
 
S
K
 
K
E
 
D
Y
 
Y
G
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
K
 
E
T
 
K
D
 
D
G
 
G
I
 
W
A
 
A
N
 
N
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
T
R
 
R
K
 
T
S
 
S
T
 
L
Y
 
Y
-
 
A
N
 
N
D
 
A
E
 
D
Y
 
Y
M
 
Q
K
 
K
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
K
 
K
V
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
D
S
 
S
L
 
I
K
 
N
V
 
S
A
 
A
D
 
D
P
 
P
T
 
K
K
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
E
G
 
G
I
 
V
Q
|
Q
L
 
Y
V
 
V
T
 
A
I
 
I
P
 
P
E
 
E
F
 
F
Q
 
Q
A
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
F
 
Q
F
 
F
S
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
T
T
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
K
A
 
T
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
T
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
M
K
 
K
R
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K

5iaiA Crystal structure of abc transporter solute binding protein arad_9887 from agrobacterium radiobacter k84, target efi-510945 in complex with ribitol
27% identity, 92% coverage: 29:431/440 of query aligns to 7:397/399 of 5iaiA

query
sites
5iaiA
T
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
S
V
 
Q
N
 
N
N
x
D
S
 
P
D
 
F
M
 
G
I
 
A
R
 
V
M
 
L
Q
 
T
K
 
K
L
 
L
S
 
A
K
 
A
T
 
E
F
 
F
E
 
K
A
 
-
E
 
Q
H
 
D
P
 
T
E
 
G
I
 
A
K
 
D
L
 
L
N
 
K
W
 
V
V
 
E
V
 
V
L
 
M
E
 
D
E
 
Y
N
 
G
V
 
T
L
 
L
R
 
L
Q
 
T
R
 
K
L
 
T
T
 
T
T
 
A
D
 
D
I
 
F
A
 
V
T
 
G
Q
 
K
G
 
T
G
 
K
Q
 
G
F
 
Y
D
 
D
V
 
L
L
 
V
T
 
T
I
 
M
G
x
D
M
 
I
Y
 
V
E
 
W
A
 
A
A
 
G
L
 
A
W
 
Y
G
 
Q
A
 
A
K
 
N
G
 
G
W
 
Y
L
 
S
E
 
V
P
 
D
M
 
L
K
 
T
D
 
D
L
 
W
-
 
V
-
 
K
-
 
R
-
 
D
P
 
A
A
 
A
S
 
E
Y
 
L
D
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
P
 
P
S
 
V
V
 
I
R
 
L
D
 
Q
G
 
S
L
 
L
-
 
G
S
 
Q
V
 
Y
K
 
K
G
 
G
S
 
H
L
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
F
P
 
P
F
 
F
Y
 
A
A
 
A
E
 
Y
S
 
A
S
 
N
I
 
V
T
 
L
Y
 
A
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
F
K
 
Q
D
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
P
M
 
V
P
 
P
E
 
T
H
 
-
P
 
-
T
 
T
W
 
V
T
 
E
Q
 
E
I
 
L
G
 
V
E
 
S
F
 
D
A
 
A
S
 
K
K
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
D
K
 
P
T
 
S
K
 
K
E
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
L
 
F
C
 
V
L
 
A
R
 
N
G
 
G
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
W
 
P
G
 
A
E
 
V
N
 
A
M
x
Q
A
 
D
L
 
W
I
 
M
T
 
Q
T
 
-
L
 
Y
A
 
N
N
 
N
G
 
Q
Y
 
M
G
 
G
A
 
G
R
 
S
W
 
I
F
 
L
D
 
D
E
 
N
K
 
D
W
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
A
F
 
L
N
 
N
G
 
S
P
 
P
E
 
E
W
 
N
K
 
V
D
 
K
A
 
S
L
 
L
N
 
T
F
 
V
Y
 
Y
V
 
K
D
 
Q
N
 
L
M
 
F
K
 
V
K
 
E
S
 
T
G
 
A
P
 
P
P
 
P
G
 
G
A
 
A
S
 
I
S
 
E
N
 
Y
G
 
D
F
x
W
N
 
G
E
 
G
N
 
R
L
 
E
A
 
E
L
 
S
F
 
F
N
 
R
S
 
Q
G
 
G
K
 
A
C
 
A
A
 
A
I
 
M
W
 
M
V
 
Q
D
 
T
A
x
W
S
 
S
V
 
V
A
 
G
G
 
A
S
 
P
F
 
G
V
 
Y
T
 
S
D
 
D
K
 
P
T
 
A
Q
 
S
S
 
S
K
 
N
V
 
V
A
 
V
D
 
G
H
 
K
V
 
V
G
 
G
F
 
I
T
 
T
F
 
T
A
 
A
P
 
P
H
 
V
E
 
G
K
 
K
T
 
G
D
 
V
K
 
P
G
 
P
T
 
Q
S
 
Y
W
 
G
L
 
V
Y
 
G
S
x
G
W
|
W
S
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
-
 
N
-
 
A
P
 
D
T
 
I
S
 
D
S
 
P
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
D
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
W
V
 
T
F
 
F
T
 
I
S
 
K
W
 
W
A
 
L
T
 
V
S
 
S
K
 
K
E
 
K
Y
 
I
G
 
H
E
 
K
L
 
E
V
 
F
A
 
-
K
 
N
T
 
M
D
 
D
G
 
G
I
 
A
A
 
G
N
 
S
V
 
F
P
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
M
R
 
R
K
 
K
S
 
S
T
 
Q
Y
 
M
N
 
T
D
 
D
E
 
P
Y
 
D
M
 
L
K
 
T
A
 
A
A
 
K
-
 
F
P
 
D
F
 
F
A
 
L
K
 
P
V
 
V
T
 
V
L
 
A
E
 
K
S
 
T
L
 
Y
K
 
E
V
 
N
A
 
G
D
 
N
P
 
-
T
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
I
 
-
G
 
G
I
 
E
Q
 
Y
L
x
R
V
 
P
T
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
E
F
 
Y
Q
 
P
A
 
E
I
 
I
G
 
Q
T
 
D
Q
 
I
V
 
L
G
 
G
K
 
S
F
 
A
F
 
V
S
 
N
G
 
S
A
 
V
L
 
L
T
 
A
G
 
G
Q
 
A
Q
 
A
T
 
E
V
 
P
D
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
A
 
E
A
 
A
Q
 
Q
T
 
V
T
 
E
T
 
A
E
 
K
R
 
K

1eu8A Structure of trehalose maltose binding protein from thermococcus litoralis (see paper)
27% identity, 88% coverage: 50:435/440 of query aligns to 27:407/407 of 1eu8A

query
sites
1eu8A
F
 
F
E
 
E
A
 
K
E
 
K
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
I
 
V
K
 
T
L
 
V
N
 
E
W
 
L
V
 
K
V
 
R
L
 
Q
E
 
A
E
x
T
N
 
D
V
x
T
L
 
E
R
 
Q
Q
x
R
R
 
R
L
 
L
T
 
D
T
 
L
D
 
V
I
 
N
A
 
A
T
 
L
Q
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
S
G
 
S
Q
 
D
F
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
F
T
 
L
I
 
M
G
x
D
M
 
V
Y
 
A
E
 
W
A
 
L
A
 
G
L
 
Q
W
 
F
G
 
I
A
 
A
K
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
L
E
 
E
P
 
P
M
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
Y
-
 
V
-
 
Q
P
 
K
A
 
D
S
 
N
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
V
V
 
F
F
 
F
P
 
Q
S
 
S
V
 
V
R
 
I
D
 
N
G
 
-
L
 
L
S
 
A
V
 
D
K
 
K
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
S
 
K
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
V
Y
|
Y
A
 
I
E
x
D
S
 
A
S
 
G
I
 
L
T
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
E
D
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
S
M
 
K
P
 
P
E
 
P
H
 
E
P
 
-
T
 
T
W
 
W
T
 
Q
Q
 
E
I
 
L
G
 
V
E
 
E
F
 
M
A
 
A
S
 
Q
K
 
K
L
 
I
T
 
Q
D
 
S
K
 
G
T
 
E
K
 
R
E
 
E
Q
 
T
-
 
N
-
 
P
-
 
N
-
 
F
Y
 
W
G
 
G
L
 
F
C
 
V
L
 
W
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
G
 
Y
W
 
E
G
|
G
E
 
L
N
 
V
M
 
C
A
 
D
L
 
F
I
 
V
T
 
E
T
 
Y
L
 
V
A
 
Y
N
 
S
G
 
N
Y
 
G
G
 
G
A
 
S
-
 
L
-
 
G
R
 
E
W
 
F
F
 
K
D
 
D
E
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
V
P
 
P
E
 
T
F
 
L
N
 
N
G
 
K
P
 
P
E
 
E
W
 
N
K
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
F
 
F
Y
 
M
V
 
V
D
 
D
N
 
L
M
 
I
K
 
H
K
 
K
S
 
Y
-
 
K
-
 
I
G
 
S
P
 
P
P
 
P
G
 
N
A
 
T
S
 
Y
S
 
T
N
 
E
G
 
M
F
 
T
N
x
E
E
 
E
N
 
P
L
 
V
A
 
R
L
 
L
-
 
M
F
 
F
N
 
Q
S
 
Q
G
 
G
K
 
N
C
 
A
A
 
A
I
 
F
W
 
E
V
 
R
D
 
N
A
x
W
S
 
P
V
x
Y
A
 
A
G
 
W
S
 
G
F
 
-
V
 
L
T
 
H
D
 
N
K
 
A
T
 
D
Q
 
D
S
 
S
K
 
P
V
 
V
A
 
K
D
 
G
H
 
K
V
 
V
G
 
G
F
 
V
T
 
A
F
 
P
A
 
L
P
 
P
H
 
H
E
 
F
K
 
P
T
 
G
D
 
H
K
 
K
G
 
S
T
 
A
S
 
A
W
 
T
L
 
L
Y
x
G
S
x
G
W
|
W
S
 
H
L
 
I
A
 
G
I
 
I
P
 
S
T
 
K
S
 
Y
S
 
S
K
 
D
A
 
N
K
 
K
D
 
A
A
 
L
A
 
A
K
 
W
V
 
E
F
 
F
T
 
V
S
 
K
W
 
F
A
 
V
T
 
E
S
 
S
K
 
Y
E
 
S
Y
 
V
G
 
Q
E
 
K
L
 
G
V
 
F
A
 
A
K
 
M
T
 
N
D
 
L
G
 
G
I
 
W
A
 
N
N
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
-
R
 
R
K
 
V
S
 
D
T
 
V
Y
 
Y
N
 
D
D
 
D
E
 
P
-
 
A
Y
 
V
M
 
V
K
 
S
A
 
K
A
 
S
P
 
P
F
 
H
A
 
L
K
 
K
V
 
E
T
 
L
L
 
R
E
 
A
S
 
V
L
 
F
K
 
E
V
 
N
A
 
A
D
 
V
P
 
P
T
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
K
x
R
P
 
P
V
 
I
P
 
-
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
V
P
 
P
E
 
Y
F
 
Y
Q
 
P
A
 
Q
I
 
L
G
 
S
T
 
E
Q
 
I
V
 
I
G
 
Q
K
 
K
F
 
Y
F
 
V
S
 
N
G
 
S
A
 
A
L
 
L
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
I
T
 
S
V
 
P
D
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
D
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
T
 
K
T
 
E
T
 
A
E
 
E
R
 
E
E
 
L
M
 
V
K
 
K
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q7LYW7 Trehalose/maltose-binding protein MalE; TMBP from Thermococcus litoralis (strain ATCC 51850 / DSM 5473 / JCM 8560 / NS-C) (see paper)
26% identity, 98% coverage: 7:435/440 of query aligns to 19:448/450 of Q7LYW7

query
sites
Q7LYW7
A
 
A
L
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
T
 
G
C
 
C
M
 
I
M
 
G
T
 
G
C
 
Q
M
 
Q
T
 
T
L
 
S
S
 
T
A
 
V
V
 
T
S
 
S
F
 
T
G
 
P
A
 
T
Q
 
E
T
 
T
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
L
 
I
T
 
V
I
 
F
A
 
A
T
 
V
V
 
G
N
 
G
N
 
A
S
 
P
D
 
N
M
x
E
I
 
I
R
 
E
M
 
Y
Q
 
W
K
 
K
-
 
G
L
 
V
S
 
I
K
 
A
T
 
E
F
 
F
E
 
E
A
 
K
E
 
K
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
I
 
V
K
 
T
L
 
V
N
 
E
W
 
L
V
 
K
V
 
R
L
 
Q
E
 
A
E
x
T
N
 
D
V
 
T
L
 
E
R
 
Q
Q
x
R
R
 
R
L
 
L
T
 
D
T
 
L
D
 
V
I
 
N
A
 
A
T
 
L
Q
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
S
G
 
S
Q
 
D
F
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
F
T
 
L
I
 
M
G
x
D
M
 
V
Y
 
A
E
 
W
A
 
L
A
 
G
L
 
Q
W
 
F
G
 
I
A
 
A
K
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
L
E
 
E
P
 
P
M
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
Y
-
 
V
-
 
Q
P
 
K
A
 
D
S
 
N
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
V
V
 
F
F
 
F
P
 
Q
S
 
S
V
 
V
R
 
I
D
 
N
G
 
-
L
 
L
S
 
A
V
 
D
K
 
K
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
S
 
K
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
V
Y
|
Y
A
 
I
E
x
D
S
 
A
S
 
G
I
 
L
T
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
E
D
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
Y
T
 
S
M
 
K
P
 
P
E
 
P
H
 
E
P
 
-
T
 
T
W
 
W
T
 
Q
Q
 
E
I
 
L
G
 
V
E
 
E
F
 
M
A
 
A
S
 
Q
K
 
K
L
 
I
T
 
Q
D
 
S
K
 
G
T
 
E
K
 
R
E
 
E
Q
 
T
-
 
N
-
 
P
-
 
N
-
 
F
Y
 
W
G
 
G
L
 
F
C
 
V
L
 
W
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
G
x
Y
W
 
E
G
 
S
E
 
L
N
 
V
M
 
C
A
 
D
L
 
F
I
 
V
T
 
E
T
 
Y
L
 
V
A
 
Y
N
 
S
G
 
N
Y
 
G
G
 
G
A
 
S
-
 
L
-
 
G
R
 
E
W
 
F
F
 
K
D
 
D
E
 
G
K
 
K
W
 
W
Q
 
V
P
 
P
E
 
T
F
 
L
N
 
N
G
 
K
P
 
P
E
 
E
W
 
N
K
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
F
 
F
Y
 
M
V
 
V
D
 
D
N
 
L
M
 
I
K
 
H
K
 
K
S
 
Y
-
 
K
-
 
I
G
 
S
P
 
P
P
 
P
G
 
N
A
 
T
S
 
Y
S
 
T
N
 
E
G
 
M
F
 
T
N
x
E
E
 
E
N
 
P
L
 
V
A
 
R
L
 
L
-
 
M
F
 
F
N
 
Q
S
 
Q
G
 
G
K
 
N
C
 
A
A
 
A
I
 
F
W
 
E
V
 
R
D
 
N
A
x
W
S
 
P
V
x
Y
A
 
A
G
 
W
S
 
G
F
 
-
V
 
L
T
 
H
D
 
N
K
 
A
T
 
D
Q
 
D
S
 
S
K
 
P
V
 
V
A
 
K
D
 
G
H
 
K
V
 
V
G
 
G
F
 
V
T
 
A
F
 
P
A
 
L
P
 
P
H
 
H
E
 
F
K
 
P
T
 
G
D
 
H
K
 
K
G
 
S
T
 
A
S
 
A
W
 
T
L
 
L
Y
 
G
S
x
G
W
|
W
S
 
H
L
 
I
A
 
G
I
 
I
P
 
S
T
 
K
S
 
Y
S
 
S
K
 
D
A
 
N
K
 
K
D
 
A
A
 
L
A
 
A
K
 
W
V
 
E
F
 
F
T
 
V
S
 
K
W
 
F
A
 
V
T
 
E
S
 
S
K
 
Y
E
 
S
Y
 
V
G
 
Q
E
 
K
L
 
G
V
 
F
A
 
A
K
 
M
T
 
N
D
 
L
G
 
G
I
x
W
A
 
N
N
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
-
R
 
R
K
 
V
S
 
D
T
 
V
Y
 
Y
N
 
D
D
 
D
-
 
P
E
 
A
Y
 
V
M
 
V
K
 
S
A
 
K
A
 
S
P
 
P
F
 
H
A
 
L
K
 
K
V
 
E
T
 
L
L
 
R
E
 
A
S
 
V
L
 
F
K
 
E
V
 
N
A
 
A
D
 
V
P
 
P
T
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
K
x
R
P
 
P
V
 
I
P
 
-
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
V
P
 
P
E
 
Y
F
 
Y
Q
 
P
A
 
Q
I
 
L
G
 
S
T
 
E
Q
 
I
V
 
I
G
 
Q
K
 
K
F
 
Y
F
 
V
S
 
N
G
 
S
A
 
A
L
 
L
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
I
T
 
S
V
 
P
D
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
D
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
T
 
K
T
 
E
T
 
A
E
 
E
R
 
E
E
 
L
M
 
V
K
 
K
R
 
Q

A9CEY9 Sulfoquinovosyl glycerol-binding protein SmoF; SQGro-binding protein SmoF; SQ monooxygenase cluster protein F from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see 2 papers)
27% identity, 75% coverage: 6:336/440 of query aligns to 9:335/416 of A9CEY9

query
sites
A9CEY9
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
G
S
 
A
T
 
A
C
 
L
M
 
C
M
 
A
T
 
T
C
 
M
M
 
L
T
 
T
L
 
F
S
 
S
A
 
G
V
 
Q
S
 
A
F
 
F
G
 
A
A
 
D
Q
 
A
T
 
E
L
 
L
T
 
K
I
 
I
A
 
F
T
 
V
V
 
S
N
 
S
N
x
Q
S
x
H
D
 
Q
M
 
P
I
 
D
R
 
I
M
 
W
Q
 
R
K
 
K
L
 
A
S
 
L
K
 
D
T
 
Q
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
K
 
K
L
 
-
N
 
-
W
 
-
V
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
T
E
x
S
N
 
E
V
 
M
L
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
V
I
 
M
A
 
S
T
 
A
Q
 
K
G
 
D
G
 
S
Q
 
S
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
M
I
 
L
G
x
D
M
 
V
Y
 
I
E
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
Q
W
 
F
G
 
A
A
 
T
K
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
E
 
S
P
 
D
M
 
F
K
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
S
S
 
G
Y
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
A
V
 
Y
F
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
Y
R
 
A
D
 
E
G
 
A
L
 
N
S
 
T
V
 
V
K
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
I
Y
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
A
Y
 
F
A
 
A
E
x
D
S
 
S
S
 
M
I
 
F
T
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
D
D
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
I
T
 
K
M
 
P
P
 
P
E
 
-
H
 
-
P
 
T
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
M
-
 
E
-
 
G
D
 
E
K
 
K
T
 
N
K
 
P
E
 
E
Q
 
L
Y
 
Q
G
 
G
L
 
L
C
 
S
L
 
F
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
I
W
 
E
G
|
G
E
 
-
N
 
-
M
 
-
A
 
A
L
 
V
I
 
C
T
 
T
T
 
F
L
 
L
A
 
L
N
 
P
G
 
Y
Y
 
W
G
 
S
-
 
E
A
 
G
R
 
K
W
 
S
F
 
L
D
 
V
E
 
E
K
 
N
W
 
G
Q
 
K
P
 
L
E
 
N
F
 
F
N
 
D
G
 
N
P
 
K
E
 
A
W
 
A
K
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
N
 
K
F
 
L
-
 
W
-
 
K
-
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
N
 
D
-
 
G
-
 
I
M
 
S
K
 
K
K
 
K
S
 
N
G
 
I
P
 
S
P
 
E
G
 
V
A
 
A
S
x
T
S
 
D
N
 
D
G
 
T
F
 
R
N
 
K
E
 
E
N
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
N
 
Q
S
 
A
G
 
G
K
 
K
C
 
V
A
 
L
I
 
F
W
 
A
V
 
V
D
 
N
A
 
W
S
 
S
V
 
Y
A
 
A
G
 
W
S
 
T
F
 
H
V
 
F
T
 
Q
D
 
G
K
 
K
T
 
-
Q
 
E
S
 
S
K
 
Q
V
 
V
A
 
N
D
 
D
H
 
K
V
 
V
G
 
G
F
 
V
T
 
A
F
 
R
A
 
L
P
 
P
H
 
A
E
 
V
K
 
K
T
 
G
D
 
G
K
 
E
G
 
Q
T
 
T
S
 
T
W
 
C
L
 
L
Y
 
G
S
x
G
W
|
W
S
 
E
L
 
F
A
 
G
I
 
V
P
 
S
T
 
A
S
 
Y
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
K
F
 
L
T
 
V
S
 
E
W
 
Y
A
 
L
T
 
S
S
 
S
K
 
Q
E
 
D
Y
 
V
G
 
S
E
 
K
L
 
F
V
 
M
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7qhvAAA Sulfoquinovosyl binding protein (see paper)
28% identity, 65% coverage: 50:336/440 of query aligns to 24:305/390 of 7qhvAAA

query
sites
7qhvAAA
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
K
 
K
L
 
-
N
 
-
W
 
-
V
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
x
N
-
x
T
E
x
S
N
 
E
V
 
M
L
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
V
I
 
M
A
 
S
T
 
A
Q
 
K
G
 
D
G
 
S
Q
 
S
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
M
I
 
L
G
x
D
M
 
V
Y
 
I
E
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
Q
W
 
F
G
 
A
A
 
T
K
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
E
 
S
P
 
D
M
 
F
K
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
S
Y
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
A
V
 
Y
F
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
Y
R
 
A
D
 
E
G
 
A
L
 
N
S
 
T
V
 
V
K
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
I
Y
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
A
Y
x
F
A
 
A
E
x
D
S
 
S
S
 
M
I
 
F
T
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
D
D
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
I
T
 
K
M
 
P
P
 
P
E
 
-
H
 
-
P
 
T
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
M
-
 
E
-
 
G
D
 
E
K
 
K
T
 
N
K
 
P
E
 
E
Q
 
L
Y
 
Q
G
 
G
L
 
L
C
 
S
L
 
F
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
I
W
x
E
G
|
G
E
 
-
N
 
-
M
 
-
A
 
A
L
 
V
I
 
C
T
 
T
T
 
F
L
 
L
A
 
L
N
 
P
G
 
Y
Y
 
W
G
 
S
-
 
E
A
 
G
R
 
K
W
 
S
F
 
L
D
 
V
E
 
E
K
 
N
W
 
G
Q
 
K
P
 
L
E
 
N
F
 
F
N
 
D
G
 
N
P
 
K
E
 
A
W
 
A
K
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
N
 
K
F
 
L
-
 
W
-
 
K
-
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
N
 
D
-
 
G
-
 
I
M
 
S
K
 
K
K
 
K
S
 
N
G
 
I
P
 
S
P
 
E
G
 
V
A
|
A
S
x
T
S
x
D
N
 
D
G
 
T
F
 
R
N
 
K
E
 
E
N
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
N
 
Q
S
 
A
G
 
G
K
 
K
C
 
V
A
 
L
I
 
F
W
 
A
V
 
V
D
 
N
A
x
W
S
 
S
V
 
Y
A
 
A
G
 
W
S
 
T
F
 
H
V
 
F
T
 
Q
D
 
G
K
 
K
T
 
-
Q
 
E
S
 
S
K
 
Q
V
 
V
A
 
N
D
 
D
H
 
K
V
 
V
G
 
G
F
 
V
T
 
A
F
 
R
A
 
L
P
 
P
H
 
A
E
 
V
K
 
K
T
 
G
D
 
G
K
 
E
G
 
Q
T
 
T
S
 
T
W
 
C
L
 
L
Y
x
G
S
x
G
W
|
W
S
 
E
L
 
F
A
 
G
I
 
V
P
 
S
T
 
A
S
 
Y
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
K
F
 
L
T
 
V
S
 
E
W
 
Y
A
 
L
T
 
S
S
 
S
K
 
Q
E
 
D
Y
 
V
G
 
S
E
 
K
L
 
F
V
 
M
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7ofyA Crystal structure of sq binding protein from agrobacterium tumefaciens in complex with sulfoquinovosyl glycerol (sqgro) (see paper)
27% identity, 65% coverage: 50:336/440 of query aligns to 25:307/389 of 7ofyA

query
sites
7ofyA
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
K
 
K
L
 
-
N
 
-
W
 
-
V
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
x
T
E
x
S
N
 
E
V
 
M
L
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
V
I
 
M
A
 
S
T
 
A
Q
 
K
G
 
D
G
 
S
Q
 
S
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
M
I
 
L
G
x
D
M
 
V
Y
 
I
E
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
Q
W
 
F
G
 
A
A
 
T
K
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
E
 
S
P
 
D
M
 
F
K
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
S
S
 
G
Y
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
A
V
 
Y
F
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
Y
R
 
A
D
 
E
G
 
A
L
 
N
S
 
T
V
 
V
K
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
I
Y
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
A
Y
 
F
A
 
A
E
x
D
S
 
S
S
 
M
I
 
F
T
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
D
D
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
I
T
 
K
M
 
P
P
 
P
E
 
-
H
 
-
P
 
T
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
M
-
 
E
-
 
G
D
 
E
K
 
K
T
 
N
K
 
P
E
 
E
Q
 
L
Y
 
Q
G
 
G
L
 
L
C
 
S
L
 
F
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
I
W
 
E
G
|
G
E
 
-
N
 
-
M
 
-
A
 
A
L
 
V
I
 
C
T
 
T
T
 
F
L
 
L
A
 
L
N
 
P
G
 
Y
Y
 
W
G
 
S
-
 
E
A
 
G
R
 
K
W
 
S
F
 
L
D
 
V
E
 
E
K
 
N
W
 
G
Q
 
K
P
 
L
E
 
N
F
 
F
N
 
D
G
 
N
P
 
K
E
 
A
W
 
A
K
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
N
 
K
F
 
L
-
 
W
-
 
K
-
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
N
 
D
-
 
G
-
 
I
M
 
S
K
 
K
K
 
K
S
 
N
G
 
I
P
 
S
P
 
E
G
 
V
A
 
A
S
x
T
S
 
D
N
 
D
G
 
T
F
 
R
N
 
K
E
 
E
N
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
N
 
Q
S
 
A
G
 
G
K
 
K
C
 
V
A
 
L
I
 
F
W
 
A
V
 
V
D
 
N
A
x
W
S
 
S
V
x
Y
A
 
A
G
 
W
S
 
T
F
 
H
V
 
F
T
 
Q
D
 
G
K
 
K
T
 
-
Q
 
E
S
 
S
K
 
Q
V
 
V
A
 
N
D
 
D
H
 
K
V
 
V
G
 
G
F
 
V
T
 
A
F
 
R
A
 
L
P
 
P
H
 
A
E
 
V
K
 
K
T
 
G
D
 
G
K
 
E
G
 
Q
T
 
T
S
 
T
W
 
C
L
 
L
Y
x
G
S
x
G
W
|
W
S
 
E
L
 
F
A
 
G
I
 
V
P
 
S
T
 
A
S
 
Y
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
K
F
 
L
T
 
V
S
 
E
W
 
Y
A
 
L
T
 
S
S
 
S
K
 
Q
E
 
D
Y
 
V
G
 
S
E
 
K
L
 
F
V
 
M
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7yzsAAA Sulfoquinovosyl binding protein (see paper)
27% identity, 65% coverage: 50:336/440 of query aligns to 23:305/384 of 7yzsAAA

query
sites
7yzsAAA
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
K
 
K
L
 
-
N
 
-
W
 
-
V
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
x
T
E
x
S
N
 
E
V
 
M
L
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
V
I
 
M
A
 
S
T
 
A
Q
 
K
G
 
D
G
 
S
Q
 
S
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
M
I
 
L
G
x
D
M
 
V
Y
 
I
E
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
Q
W
 
F
G
 
A
A
 
T
K
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
E
 
S
P
 
D
M
 
F
K
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
S
S
 
G
Y
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
A
V
 
Y
F
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
Y
R
 
A
D
 
E
G
 
A
L
 
N
S
 
T
V
 
V
K
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
I
Y
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
A
Y
 
F
A
 
A
E
x
D
S
 
S
S
 
M
I
 
F
T
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
D
D
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
I
T
 
K
M
 
P
P
 
P
E
 
-
H
 
-
P
 
T
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
M
-
 
E
-
 
G
D
 
E
K
 
K
T
 
N
K
 
P
E
 
E
Q
 
L
Y
 
Q
G
 
G
L
 
L
C
 
S
L
 
F
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
I
W
x
E
G
|
G
E
 
-
N
 
-
M
 
-
A
 
A
L
 
V
I
 
C
T
 
T
T
 
F
L
 
L
A
 
L
N
 
P
G
 
Y
Y
 
W
G
 
S
-
 
E
A
 
G
R
 
K
W
 
S
F
 
L
D
 
V
E
 
E
K
 
N
W
 
G
Q
 
K
P
 
L
E
 
N
F
 
F
N
 
D
G
 
N
P
 
K
E
 
A
W
 
A
K
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
N
 
K
F
 
L
-
 
W
-
 
K
-
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
N
 
D
-
 
G
-
 
I
M
 
S
K
 
K
K
 
K
S
 
N
G
 
I
P
 
S
P
 
E
G
 
V
A
 
A
S
x
T
S
 
D
N
 
D
G
 
T
F
 
R
N
 
K
E
 
E
N
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
N
 
Q
S
 
A
G
 
G
K
 
K
C
 
V
A
 
L
I
 
F
W
 
A
V
 
V
D
 
N
A
x
W
S
 
S
V
 
Y
A
 
A
G
 
W
S
 
T
F
 
H
V
 
F
T
 
Q
D
 
G
K
 
K
T
 
-
Q
 
E
S
 
S
K
 
Q
V
 
V
A
 
N
D
 
D
H
 
K
V
 
V
G
 
G
F
 
V
T
 
A
F
 
R
A
 
L
P
 
P
H
 
A
E
 
V
K
 
K
T
 
G
D
 
G
K
 
E
G
 
Q
T
 
T
S
 
T
W
 
C
L
 
L
Y
x
G
S
x
G
W
|
W
S
 
E
L
 
F
A
 
G
I
 
V
P
 
S
T
 
A
S
 
Y
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
K
F
 
L
T
 
V
S
 
E
W
 
Y
A
 
L
T
 
S
S
 
S
K
 
Q
E
 
D
Y
 
V
G
 
S
E
 
K
L
 
F
V
 
M
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7yzuA Crystal structure of the sulfoquinovosyl binding protein smof complexed with sqme (see paper)
26% identity, 65% coverage: 50:336/440 of query aligns to 22:302/382 of 7yzuA

query
sites
7yzuA
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
K
 
K
L
 
-
N
 
-
W
 
-
V
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
x
T
E
x
S
N
 
E
V
 
M
L
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
V
I
 
M
A
 
S
T
 
A
Q
 
K
G
 
D
G
 
S
Q
 
S
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
M
I
 
L
G
x
D
M
 
V
Y
 
I
E
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
Q
W
 
F
G
 
A
A
 
T
K
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
E
 
S
P
 
D
M
 
F
K
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
S
S
 
G
Y
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
S
D
 
A
V
 
Y
F
 
L
P
 
P
S
 
T
V
 
Y
R
 
A
D
 
E
G
 
A
L
 
N
S
 
T
V
 
V
K
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
I
Y
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
A
Y
 
F
A
 
A
E
x
D
S
 
S
S
 
M
I
 
F
T
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
T
 
K
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
D
D
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
I
T
 
K
M
 
P
P
 
P
E
 
-
H
 
-
P
 
T
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
A
A
 
S
S
 
K
K
 
K
L
 
V
T
 
M
-
 
E
-
 
G
D
 
E
K
 
K
T
 
N
K
 
P
E
 
E
Q
 
L
Y
 
Q
G
 
G
L
 
L
C
 
S
L
 
F
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
A
-
 
I
-
x
E
-
x
G
-
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
T
-
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
P
G
 
Y
W
 
W
G
 
S
E
 
E
N
 
G
M
 
K
A
 
S
L
 
L
I
 
V
T
 
G
T
 
K
L
 
L
A
 
N
N
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
F
D
 
D
E
 
N
K
 
K
W
 
A
Q
 
A
P
 
V
E
 
D
F
 
-
N
 
S
G
 
L
P
 
K
E
 
L
W
 
W
K
 
K
D
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
S
F
 
F
Y
 
V
V
 
D
D
 
D
N
 
G
M
 
I
K
 
S
K
 
K
S
 
K
G
 
N
P
 
I
P
 
S
G
 
E
A
 
V
S
 
A
S
x
T
N
 
D
G
 
D
F
 
T
N
 
R
E
 
K
N
 
E
L
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
N
 
Q
S
 
A
G
 
G
K
 
K
C
 
V
A
 
L
I
 
F
W
 
A
V
 
V
D
 
N
A
x
W
S
 
S
V
 
Y
A
 
A
G
 
W
S
 
T
F
 
H
V
 
F
T
 
Q
D
 
G
K
 
K
T
 
-
Q
 
E
S
 
S
K
 
Q
V
 
V
A
 
N
D
 
D
H
 
K
V
 
V
G
 
G
F
 
V
T
 
A
F
 
R
A
 
L
P
 
P
H
 
A
E
 
V
K
 
K
T
 
G
D
 
G
K
 
E
G
 
Q
T
 
T
S
 
T
W
 
C
L
 
L
Y
x
G
S
x
G
W
|
W
S
 
E
L
 
F
A
 
G
I
 
V
P
 
S
T
 
A
S
 
Y
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
K
F
 
L
T
 
V
S
 
E
W
 
Y
A
 
L
T
 
S
S
 
S
K
 
Q
E
 
D
Y
 
V
G
 
S
E
 
K
L
 
F
V
 
M
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5ysdB Crystal structure of beta-1,2-glucooligosaccharide binding protein in complex with sophorotriose (see paper)
25% identity, 83% coverage: 70:435/440 of query aligns to 42:381/389 of 5ysdB

query
sites
5ysdB
R
 
H
Q
 
D
R
 
K
L
 
L
T
 
L
T
 
T
D
 
A
I
 
V
A
 
A
T
 
S
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
Q
 
P
F
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
V
T
 
Q
I
 
M
G
|
G
-
x
T
-
x
T
-
x
W
M
 
M
Y
 
P
E
 
E
A
 
F
A
 
V
L
 
E
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
W
 
L
L
 
L
E
 
D
P
 
I
M
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
V
P
 
E
A
 
K
S
 
S
Y
 
K
D
 
N
L
 
M
-
 
N
-
 
S
D
 
D
D
 
L
V
 
F
F
 
F
P
 
P
S
 
G
V
 
S
R
 
V
D
 
K
G
 
T
L
 
T
S
 
Q
V
 
F
K
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
W
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
S
 
T
S
 
R
I
 
V
T
 
L
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
K
D
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
T
 
N
M
 
-
P
 
-
E
 
E
H
 
A
P
 
P
-
 
K
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
S
E
 
D
F
 
A
A
 
A
S
 
L
K
 
K
L
 
L
T
 
S
D
 
K
K
 
R
T
 
G
K
 
K
E
 
D
Q
 
M
Y
 
Y
G
 
G
L
 
F
C
 
A
L
 
I
R
x
D
G
 
P
K
 
N
A
 
E
G
 
-
W
 
-
G
 
-
E
x
Q
N
 
T
M
 
T
A
 
G
L
 
F
I
 
I
T
 
F
T
 
G
L
 
R
A
 
Q
N
 
N
G
 
-
Y
 
-
G
 
G
A
 
S
R
 
P
W
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
K
K
 
D
W
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
V
F
 
F
N
 
N
G
 
K
P
 
K
E
 
P
W
 
F
K
 
V
D
 
D
A
 
T
L
 
V
N
 
T
F
 
-
Y
 
Y
V
 
L
D
 
D
N
 
S
M
 
F
K
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
G
P
 
S
P
 
A
G
 
P
A
 
D
S
 
T
S
 
D
N
 
L
G
 
G
F
 
L
N
 
D
E
 
A
N
 
S
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
F
 
G
N
 
G
S
 
D
G
 
G
K
 
I
C
 
V
A
 
P
I
 
M
W
 
F
V
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
S
G
 
G
S
 
P
F
x
W
V
 
M
T
 
V
D
 
N
K
 
T
T
 
L
Q
 
K
S
 
D
K
 
T
V
 
A
A
 
P
D
 
D
H
 
I
V
 
D
G
 
G
-
 
K
F
 
W
T
 
A
F
 
T
A
 
A
P
 
V
H
 
L
E
 
P
K
 
K
T
 
K
D
 
E
K
 
N
G
 
N
T
 
E
S
 
S
W
 
S
L
 
L
Y
 
G
S
x
G
W
 
A
S
 
N
L
 
L
A
 
S
I
 
I
P
 
F
T
 
K
S
 
Y
S
 
S
K
 
N
A
 
K
K
 
K
D
 
D
A
 
D
A
 
A
K
 
L
V
 
K
F
 
F
T
 
M
S
 
D
W
 
Y
A
 
M
T
 
S
S
 
Q
K
 
P
E
 
D
Y
 
V
G
 
-
E
 
Q
L
 
L
V
 
S
A
 
W
K
 
L
T
 
K
D
 
D
G
 
-
I
 
-
A
 
T
N
 
N
V
 
S
P
 
M
P
 
P
G
 
A
T
 
-
R
 
R
K
 
M
S
 
D
T
 
A
Y
 
W
N
 
E
D
 
D
E
 
D
Y
 
M
M
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
D
P
 
P
F
 
Y
A
 
Y
K
 
K
V
 
V
T
 
F
L
 
G
E
 
E
S
 
Q
L
 
M
K
 
K
V
 
T
A
 
A
D
 
E
P
 
P
T
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
L
 
M
V
 
P
T
 
L
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
F
 
F
Q
 
E
A
 
E
I
 
I
G
 
A
T
 
Q
Q
 
L
V
 
Y
G
 
G
K
 
K
F
 
S
F
 
W
S
 
E
G
 
Q
A
 
I
L
 
Y
T
 
R
G
 
G
Q
 
G
Q
 
A
T
 
D
V
 
V
D
 
Q
A
 
T
A
 
Q
L
 
M
T
 
D
A
 
T
A
 
F
Q
 
N
T
 
D
T
 
Q
T
 
V
E
 
E
R
 
A
E
 
L
M
 
L
K
 
K
R
 
K

Sites not aligning to the query:

5ysbA Crystal structure of beta-1,2-glucooligosaccharide binding protein in ligand-free form (see paper)
25% identity, 83% coverage: 70:435/440 of query aligns to 41:380/386 of 5ysbA

query
sites
5ysbA
R
x
H
Q
 
D
R
 
K
L
 
L
T
 
L
T
 
T
D
 
A
I
 
V
A
 
A
T
 
S
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
Q
 
P
F
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
V
T
 
Q
I
 
M
G
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
W
M
 
M
Y
 
P
E
|
E
A
 
F
A
 
V
L
x
E
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
W
 
L
L
 
L
E
 
D
P
 
I
M
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
V
P
 
E
A
 
K
S
 
S
Y
 
K
D
 
N
L
 
M
-
 
N
-
 
S
D
 
D
D
 
L
V
 
F
F
 
F
P
 
P
S
 
G
V
 
S
R
 
V
D
 
K
G
 
T
L
 
T
S
 
Q
V
 
F
K
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
W
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
S
 
T
S
 
R
I
 
V
T
 
L
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
K
D
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
T
 
N
M
 
-
P
 
-
E
 
E
H
 
A
P
 
P
-
 
K
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
S
E
 
D
F
 
A
A
 
A
S
 
L
K
 
K
L
 
L
T
 
S
D
 
K
K
 
R
T
 
G
K
 
K
E
 
D
Q
 
M
Y
 
Y
G
 
G
L
 
F
C
 
A
L
 
I
R
 
D
G
 
P
K
 
N
A
 
E
G
 
-
W
 
-
G
 
-
E
 
Q
N
 
T
M
 
T
A
 
G
L
 
F
I
 
I
T
 
F
T
 
G
L
 
R
A
 
Q
N
 
N
G
 
-
Y
 
-
G
 
G
A
 
S
R
 
P
W
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
K
K
 
D
W
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
V
F
 
F
N
 
N
G
 
K
P
 
K
E
 
P
W
 
F
K
 
V
D
 
D
A
 
T
L
 
V
N
 
T
F
 
-
Y
 
Y
V
 
L
D
 
D
N
 
S
M
 
F
K
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
G
P
 
S
P
 
A
G
 
P
A
 
D
S
 
T
S
 
D
N
 
L
G
 
G
F
 
L
N
 
D
E
 
A
N
 
S
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
F
 
G
N
 
G
S
 
D
G
 
G
K
 
I
C
 
V
A
 
P
I
 
M
W
 
F
V
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
S
G
 
G
S
 
P
F
 
W
V
 
M
T
 
V
D
x
N
K
 
T
T
 
L
Q
 
K
S
x
D
K
 
T
V
 
A
A
 
P
D
 
D
H
 
I
V
 
D
G
 
G
-
 
K
F
 
W
T
 
A
F
 
T
A
 
A
P
 
V
H
 
L
E
 
P
K
 
K
T
 
K
D
 
E
K
 
N
G
 
N
T
 
E
S
 
S
W
 
S
L
 
L
Y
 
G
S
 
G
W
 
A
S
 
N
L
 
L
A
 
S
I
 
I
P
 
F
T
 
K
S
 
Y
S
 
S
K
 
N
A
 
K
K
 
K
D
 
D
A
 
D
A
 
A
K
 
L
V
 
K
F
 
F
T
 
M
S
 
D
W
 
Y
A
 
M
T
 
S
S
 
Q
K
 
P
E
 
D
Y
 
V
G
 
-
E
 
Q
L
 
L
V
 
S
A
 
W
K
 
L
T
 
K
D
|
D
G
 
-
I
 
-
A
 
T
N
 
N
V
 
S
P
 
M
P
 
P
G
 
A
T
 
-
R
 
R
K
 
M
S
 
D
T
 
A
Y
 
W
N
 
E
D
 
D
E
 
D
Y
 
M
M
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
D
P
 
P
F
 
Y
A
 
Y
K
 
K
V
 
V
T
 
F
L
 
G
E
 
E
S
 
Q
L
 
M
K
 
K
V
 
T
A
 
A
D
 
E
P
 
P
T
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
L
 
M
V
 
P
T
 
L
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
F
 
F
Q
 
E
A
 
E
I
 
I
G
 
A
T
 
Q
Q
 
L
V
 
Y
G
 
G
K
 
K
F
 
S
F
 
W
S
 
E
G
 
Q
A
 
I
L
 
Y
T
 
R
G
 
G
Q
 
G
Q
 
A
T
 
D
V
 
V
D
 
Q
A
 
T
A
 
Q
L
 
M
T
 
D
A
 
T
A
 
F
Q
 
N
T
 
D
T
 
Q
T
 
V
E
 
E
R
 
A
E
 
L
M
 
L
K
 
K
R
 
K

Sites not aligning to the query:

5ci5A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein from thermotoga lettingae tmo (tlet_1705, target efi-510544) bound with alpha-d-tagatose
24% identity, 75% coverage: 100:431/440 of query aligns to 75:389/393 of 5ci5A

query
sites
5ci5A
K
 
K
G
 
G
W
 
W
L
 
L
E
 
E
P
 
P
M
 
M
K
 
E
D
 
E
L
 
H
P
 
L
A
 
K
S
 
N
Y
 
W
D
 
E
-
 
G
L
 
T
D
 
A
D
 
Q
V
 
I
F
 
W
P
 
P
S
 
N
V
 
L
R
 
W
D
 
P
G
 
T
L
 
V
S
 
T
V
 
Y
K
 
K
G
 
K
S
 
I
L
 
R
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
W
Y
|
Y
A
 
T
E
x
D
S
 
C
S
x
R
I
 
L
T
 
L
Y
 
L
Y
 
Y
R
 
N
T
 
K
D
 
A
L
 
M
F
 
F
K
 
E
D
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
N
M
 
-
P
 
P
E
 
D
H
 
N
P
 
P
-
 
P
-
 
K
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
L
E
 
D
F
 
A
A
 
A
S
 
L
K
 
K
L
 
I
T
 
T
D
 
D
K
 
T
T
 
K
K
 
N
E
 
R
Q
 
I
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
C
 
G
L
 
V
R
 
S
G
 
G
K
 
T
A
 
K
G
 
T
W
 
E
G
 
H
E
 
T
N
 
T
M
 
L
A
 
G
L
 
Y
I
 
M
T
 
M
T
 
F
L
 
L
A
 
Y
N
 
A
G
 
A
Y
 
G
G
 
G
A
 
K
R
 
L
W
 
L
F
 
T
D
 
D
E
 
D
K
 
Y
W
 
S
Q
 
K
P
 
A
E
 
A
F
 
F
N
 
D
G
 
S
P
 
P
E
 
E
W
 
G
K
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
K
F
 
F
Y
 
Y
V
 
T
D
 
D
N
 
L
M
 
A
K
 
K
K
 
K
S
 
Y
G
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
N
A
 
V
S
 
S
S
 
P
N
 
N
G
 
A
F
 
I
N
 
Q
E
 
Y
N
 
H
L
 
E
A
 
D
L
 
D
F
 
Y
N
 
R
S
 
N
G
 
M
K
 
M
C
 
A
A
 
Q
I
 
N
W
 
R
V
 
V
D
 
A
A
 
M
S
 
A
V
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
P
F
x
W
V
 
S
T
 
F
D
 
P
K
 
L
T
 
I
Q
 
E
S
 
A
K
 
A
V
 
N
A
 
P
D
 
D
H
 
I
V
 
A
G
 
G
-
 
K
F
 
Y
T
 
S
F
 
V
A
 
A
P
 
L
H
 
H
E
 
P
K
 
Y
T
 
D
D
 
A
K
 
K
G
 
P
T
 
A
S
 
S
W
 
V
L
 
L
Y
x
G
S
x
G
W
|
W
S
 
A
L
 
L
A
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
S
S
 
S
S
 
S
K
 
P
A
 
N
K
 
K
D
 
E
A
 
D
A
 
A
K
 
W
V
 
K
F
 
L
T
 
A
S
 
E
W
 
Y
A
 
L
T
 
T
S
 
S
K
 
F
E
 
D
-
 
V
Y
 
W
G
 
M
E
 
K
L
 
W
V
 
V
A
 
E
K
 
E
T
 
K
D
 
G
G
 
G
I
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
P
 
P
P
 
M
G
 
P
T
 
T
R
 
R
K
 
M
S
 
D
T
 
V
Y
 
C
N
 
K
D
 
K
E
 
S
Y
 
K
M
 
L
K
 
A
A
 
N
A
 
D
P
 
V
F
 
K
A
 
W
K
 
Q
V
 
I
T
 
I
L
 
F
E
 
E
S
 
T
L
 
F
K
 
P
V
 
H
A
 
A
D
 
V
P
 
A
T
x
R
K
 
P
P
 
P
T
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
F
 
Y
Q
 
P
A
 
Q
I
 
I
G
 
S
T
 
E
Q
 
Q
V
 
I
G
 
Q
K
 
T
F
 
M
F
 
V
S
 
Q
G
 
R
A
 
V
L
 
L
T
 
L
G
 
G
Q
 
E
Q
 
L
T
 
T
V
 
P
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
I
T
 
K
A
 
I
A
 
A
Q
 
A
T
 
E
T
 
N
T
 
V
E
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

5ysdA Crystal structure of beta-1,2-glucooligosaccharide binding protein in complex with sophorotriose (see paper)
25% identity, 83% coverage: 70:435/440 of query aligns to 42:381/387 of 5ysdA

query
sites
5ysdA
R
 
H
Q
 
D
R
 
K
L
 
L
T
 
L
T
 
T
D
 
A
I
 
V
A
 
A
T
 
S
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
Q
 
P
F
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
V
T
 
Q
I
 
M
G
|
G
-
x
T
-
x
T
-
x
W
M
 
M
Y
 
P
E
 
E
A
 
F
A
 
V
L
 
E
W
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
W
 
L
L
 
L
E
 
D
P
 
I
M
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
V
P
 
E
A
 
K
S
 
S
Y
 
K
D
 
N
L
 
M
-
 
N
-
 
S
D
 
D
D
 
L
V
 
F
F
 
F
P
 
P
S
 
G
V
 
S
R
 
V
D
 
K
G
 
T
L
 
T
S
 
Q
V
 
F
K
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
W
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
S
 
T
S
 
R
I
 
V
T
 
L
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
K
 
K
D
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
T
 
N
M
 
-
P
 
-
E
 
E
H
 
A
P
 
P
-
 
K
T
 
T
W
 
W
T
 
D
Q
 
E
I
 
L
G
 
S
E
 
D
F
 
A
A
 
A
S
 
L
K
 
K
L
 
L
T
x
S
D
 
K
K
 
R
T
x
G
K
 
K
E
 
D
Q
x
M
Y
 
Y
G
 
G
L
 
F
C
 
A
L
 
I
R
x
D
G
 
P
K
x
N
A
x
E
G
 
-
W
 
-
G
 
-
E
x
Q
N
 
T
M
 
T
A
 
G
L
 
F
I
 
I
T
 
F
T
 
G
L
 
R
A
 
Q
N
 
N
G
 
-
Y
 
-
G
 
G
A
 
S
R
 
P
W
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
K
K
 
D
W
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
V
F
 
F
N
 
N
G
 
K
P
 
K
E
 
P
W
 
F
K
 
V
D
 
D
A
 
T
L
 
V
N
 
T
F
 
-
Y
 
Y
V
 
L
D
 
D
N
 
S
M
 
F
K
 
I
K
 
K
S
 
N
G
 
G
P
 
S
P
 
A
G
 
P
A
 
D
S
 
T
S
 
D
N
 
L
G
 
G
F
 
L
N
 
D
E
 
A
N
 
S
L
 
Q
A
 
S
L
 
F
F
 
G
N
 
G
S
 
D
G
 
G
K
 
I
C
 
V
A
 
P
I
 
M
W
 
F
V
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
S
G
 
G
S
 
P
F
x
W
V
 
M
T
 
V
D
 
N
K
 
T
T
 
L
Q
 
K
S
 
D
K
 
T
V
 
A
A
 
P
D
 
D
H
 
I
V
 
D
G
 
G
-
 
K
F
 
W
T
 
A
F
 
T
A
 
A
P
 
V
H
 
L
E
 
P
K
 
K
T
 
K
D
 
E
K
 
N
G
 
N
T
 
E
S
 
S
W
 
S
L
 
L
Y
 
G
S
x
G
W