SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2519 FitnessBrowser__psRCH2:GFF2519 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

4lsbB Crystal structure of a putative lyase/mutase from burkholderia cenocepacia j2315
48% identity, 97% coverage: 3:272/278 of query aligns to 2:270/278 of 4lsbB

query
sites
4lsbB
D
 
D
S
 
L
S
 
Q
V
 
A
S
 
R
H
 
H
K
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
-
F
 
F
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
H
-
 
T
Q
 
R
S
 
P
G
 
G
C
 
A
F
 
F
V
 
I
L
 
I
P
 
P
N
 
N
P
 
P
W
 
W
D
 
D
A
 
A
G
 
G
S
 
T
A
 
A
A
 
R
V
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
M
M
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
E
A
 
A
L
 
L
A
|
A
T
 
T
T
 
T
S
|
S
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
F
S
 
S
C
 
K
A
 
G
R
 
Q
A
 
P
D
|
D
G
 
-
Q
 
N
M
 
I
A
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
M
L
 
L
A
 
D
H
 
H
M
 
I
R
 
A
G
 
D
M
 
L
V
 
V
Q
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
S
G
 
A
D
|
D
F
 
L
E
|
E
S
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
G
E
 
D
T
 
A
P
 
P
E
 
G
G
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
T
V
 
I
R
 
R
M
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
T
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
V
G
 
G
I
 
G
S
|
S
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
R
P
 
A
R
 
D
E
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
Y
E
 
A
I
 
R
S
 
D
Q
 
A
A
 
S
T
 
V
E
 
E
R
 
R
M
 
I
Y
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
V
E
 
D
A
 
A
I
 
A
D
 
R
A
 
A
T
 
L
G
 
P
G
 
F
E
 
P
T
 
F
L
 
T
L
 
L
I
 
T
G
 
A
R
|
R
A
 
C
E
 
E
N
 
N
F
 
Y
F
 
L
V
 
H
G
 
G
R
 
R
P
 
R
D
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
T
I
 
I
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Y
 
Y
A
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
V
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
D
R
 
A
E
 
D
Q
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
-
K
 
A
P
 
P
V
 
V
N
|
N
V
 
V
L
 
V
I
 
M
G
 
G
W
 
L
D
 
Q
S
 
G
D
 
G
-
 
L
L
 
L
T
 
S
V
 
L
Q
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
R
 
R
I
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
W
 
L
A
 
G
G
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
T
S
 
E
I
 
M
A
 
R
E
 
R
H
 
D
G
 
G
R
 
T
F
 
F
D
 
T
G
 
F
F
 
T
S
 
Q
N
 
A
A
 
A
A
 
V
S
 
P
G
 
G
A
 
R
E
 
D
L
 
I
D
 
N
A
 
R
L
 
W
F
 
F

2ze3A Crystal structure of dfa0005 complexed with alpha-ketoglutarate: a novel member of the icl/pepm superfamily from alkali-tolerant deinococcus ficus (see paper)
38% identity, 83% coverage: 4:235/278 of query aligns to 2:235/275 of 2ze3A

query
sites
2ze3A
S
 
T
S
 
H
V
 
A
S
 
D
H
 
H
K
 
A
R
 
R
A
 
S
V
 
-
F
 
F
R
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
C
 
-
F
 
F
V
 
L
L
 
L
P
 
P
N
|
N
P
 
A
W
 
W
D
 
D
A
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
R
V
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
G
T
 
T
T
|
T
S
|
S
S
x
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
W
 
H
S
 
A
C
 
R
A
 
G
R
 
R
A
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
-
 
T
M
 
L
A
 
T
R
 
R
D
 
D
A
 
E
V
 
M
L
 
G
A
 
R
H
 
E
M
 
V
R
 
E
G
 
A
M
 
I
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
A
D
|
D
F
 
I
E
 
E
S
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
E
 
H
T
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
D
V
 
V
A
 
R
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
E
M
 
H
A
 
F
V
 
A
E
 
A
T
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
x
N
I
 
L
E
 
E
D
 
D
S
 
A
T
 
T
G
 
G
D
 
L
P
 
T
R
 
P
E
 
T
P
 
E
L
 
L
R
 
Y
E
 
D
I
 
L
S
 
D
Q
 
S
A
 
Q
T
 
L
E
 
R
R
 
R
M
 
I
Y
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
S
G
 
G
G
 
V
E
 
P
T
 
V
L
 
F
L
 
L
I
 
N
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
T
F
 
F
F
 
L
V
 
K
G
 
G
R
 
H
P
 
G
D
 
A
L
 
T
D
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
A
D
 
E
T
 
T
I
 
V
Q
 
R
R
 
R
L
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
G
L
 
I
Y
x
F
A
 
V
P
 
P
G
 
L
I
 
A
R
 
L
T
 
Q
R
 
S
E
 
Q
Q
 
D
I
 
I
S
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
R
P
 
-
K
 
V
P
 
P
V
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
M
I
 
-
G
 
A
W
 
F
D
 
P
S
 
G
D
 
S
L
 
P
T
 
V
V
 
P
Q
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
L
D
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
A
R
 
R
I
 
V
S
|
S
V
 
F
G
|
G
G
 
Q
A
 
S
L
 
L

4iqdA Crystal structure of carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase from bacillus anthracis
26% identity, 92% coverage: 13:268/278 of query aligns to 13:272/290 of 4iqdA

query
sites
4iqdA
F
 
F
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
V
Q
 
E
S
 
A
G
 
N
-
 
E
C
 
I
F
 
L
V
 
Q
L
 
I
P
 
P
N
 
G
P
 
A
W
 
H
D
 
D
A
 
A
G
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
R
A
 
N
M
 
T
G
 
G
F
 
F
K
 
L
A
 
A
L
 
L
A
x
Y
T
 
L
T
x
S
S
x
G
S
x
A
G
 
A
Y
 
Y
A
 
T
W
 
A
S
 
S
C
 
K
A
 
G
R
 
L
A
 
P
D
|
D
-
 
L
G
 
G
Q
 
I
M
 
V
A
 
T
R
 
S
D
 
T
A
 
E
V
 
V
L
 
A
A
x
E
H
x
R
M
 
A
R
 
R
G
x
D
M
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
L
G
 
V
D
|
D
F
 
I
E
x
D
S
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
G
E
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
L
E
 
N
S
 
V
V
 
A
R
 
R
M
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
M
-
 
V
-
 
E
-
 
A
G
 
K
I
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
S
x
Q
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
Q
G
 
L
D
 
P
P
x
K
R
 
K
-
x
C
-
x
G
-
x
H
-
 
L
-
 
N
-
 
G
E
 
K
P
 
K
L
 
L
R
 
V
E
 
T
I
 
T
S
 
E
Q
 
E
A
 
L
T
 
V
E
 
Q
R
 
K
M
 
I
Y
 
K
A
 
A
A
 
I
R
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
A
D
 
P
A
 
S
T
 
L
G
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
Y
F
 
I
V
 
V
G
 
A
R
|
R
P
 
T
D
 
D
-
 
A
-
x
R
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
x
G
L
|
L
D
|
D
D
 
E
T
 
A
I
 
I
Q
 
E
R
 
R
L
 
A
Q
 
N
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
A
L
 
I
Y
 
F
A
 
P
P
x
E
G
 
A
I
 
L
R
 
Q
T
 
S
R
 
E
E
 
E
Q
 
E
I
 
F
S
 
R
A
 
L
V
 
F
V
 
N
A
 
S
A
 
K
V
 
V
-
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
L
P
 
L
V
 
A
N
|
N
V
 
M
L
 
T
-
 
E
I
 
F
G
 
G
W
 
K
D
 
T
S
 
P
D
x
Y
L
x
Y
T
 
S
V
 
A
Q
 
E
D
x
E
L
 
F
A
 
A
D
 
N
L
 
M
G
 
G
V
 
F
R
 
Q
R
 
M
I
 
V
S
 
I
V
 
Y
G
x
P
G
x
V
A
 
T
L
 
S
A
 
L
R
 
R
A
 
V
A
 
A
W
 
A
A
 
K
G
 
A
F
 
Y
L
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
F
R
 
T
S
 
L
I
 
I
A
 
K
E
 
E
H
 
T
G
 
G
-
 
S
R
 
Q
F
 
K
D
 
D
G
 
A
F
 
L
S
 
S
N
 
N
A
 
M
A
 
Q
S
 
T
G
 
R
A
 
S
E
 
E
L
 
L

P77541 2-methylisocitrate lyase; 2-MIC; MICL; (2R,3S)-2-methylisocitrate lyase; EC 4.1.3.30 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 63% coverage: 13:188/278 of query aligns to 10:190/296 of P77541

query
sites
P77541
F
 
F
R
 
R
A
 
A
-
 
A
L
 
L
H
 
T
Q
 
K
S
 
E
G
 
N
C
 
P
F
 
L
V
 
Q
L
 
I
P
 
V
N
 
G
P
 
T
W
 
I
D
 
N
A
 
A
G
 
N
S
 
H
A
 
A
A
 
L
V
 
L
L
 
A
A
 
Q
A
 
R
M
 
A
G
 
G
F
 
Y
K
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
Y
T
 
L
T
x
S
S
x
G
S
x
G
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
W
 
A
-
 
G
S
 
S
C
 
L
A
 
G
R
 
L
A
 
P
D
 
D
-
 
L
G
 
G
Q
 
I
M
 
S
A
 
T
R
 
L
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
T
H
 
D
M
 
I
R
 
R
G
 
R
M
 
I
V
 
T
Q
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
L
N
 
L
G
 
V
D
|
D
F
 
A
E
x
D
S
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
S
P
 
A
E
 
F
G
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
K
M
 
S
A
 
M
V
 
I
E
 
K
T
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
S
 
H
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
V
G
 
G
D
 
A
P
 
K
R
 
R
-
x
C
-
x
G
-
 
H
E
 
R
P
 
P
L
 
N
R
 
K
E
 
A
I
 
I
S
 
V
Q
 
S
A
 
K
T
 
E
E
 
E
R
 
M
M
 
V
Y
 
D
A
 
R
A
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
-
 
K
T
 
T
G
 
D
G
 
P
E
 
D
T
 
F
L
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
A
F
 
L
F
 
A
V
 
V
G
 
-
R
 
-
P
 
E
D
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
A
T
 
A
I
 
I
Q
 
E
R
 
R
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
E
C
 
M
L
 
L
Y
 
F
A
 
P
P
x
E
G
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1mumA Structure of the 2-methylisocitrate lyase (prpb) from escherichia coli (see paper)
31% identity, 63% coverage: 13:188/278 of query aligns to 8:188/289 of 1mumA

query
sites
1mumA
F
 
F
R
 
R
A
 
A
-
 
A
L
 
L
H
 
T
Q
 
K
S
 
E
G
 
N
C
 
P
F
 
L
V
 
Q
L
 
I
P
 
V
N
 
G
P
 
T
W
 
I
D
 
N
A
 
A
G
 
N
S
 
H
A
 
A
A
 
L
V
 
L
L
 
A
A
 
Q
A
 
R
M
 
A
G
 
G
F
 
Y
K
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
x
Y
T
 
L
T
x
S
S
x
G
S
x
G
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
W
 
A
-
 
G
S
 
S
C
 
L
A
 
G
R
 
L
A
 
P
D
|
D
-
 
L
G
 
G
Q
 
I
M
 
S
A
 
T
R
 
L
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
T
H
 
D
M
 
I
R
 
R
G
 
R
M
 
I
V
 
T
Q
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
L
N
 
L
G
 
V
D
|
D
F
 
A
E
x
D
S
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
S
P
 
A
E
 
F
G
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
K
M
 
S
A
 
M
V
 
I
E
 
K
T
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
S
x
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
V
G
 
G
D
 
A
P
x
K
R
 
R
-
x
C
-
x
G
-
x
H
E
 
R
P
 
P
L
 
N
R
 
K
E
 
A
I
 
I
S
 
V
Q
 
S
A
 
K
T
 
E
E
 
E
R
 
M
M
 
V
Y
 
D
A
 
R
A
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
-
 
K
T
 
T
G
 
D
G
 
P
E
 
D
T
 
F
L
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
A
F
 
L
F
 
A
V
 
V
G
 
-
R
 
-
P
 
E
D
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
A
T
 
A
I
 
I
Q
 
E
R
 
R
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
E
C
 
M
L
 
L
Y
 
F
A
 
P
P
x
E
G
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3m0kA Structure of oxaloacetate acetylhydrolase in complex with the product oxalate (see paper)
27% identity, 84% coverage: 22:254/278 of query aligns to 21:258/289 of 3m0kA

query
sites
3m0kA
F
 
I
V
 
V
L
 
C
P
 
P
N
 
G
P
 
V
W
 
Y
D
 
D
A
 
G
G
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
R
V
 
T
L
 
A
A
 
M
A
 
E
M
 
L
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
x
Y
T
 
M
T
|
T
S
x
G
S
x
A
G
 
G
Y
 
T
A
 
T
W
 
A
S
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
D
C
 
L
A
 
A
R
 
I
A
 
A
D
 
Q
G
 
L
Q
 
H
M
 
D
A
 
M
R
 
R
D
 
D
A
 
N
V
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
D
M
 
M
R
 
I
G
 
A
M
 
N
V
 
L
Q
 
D
A
 
P
T
 
F
A
 
G
L
 
P
P
 
P
V
 
L
N
 
I
G
 
A
D
|
D
F
 
M
E
 
D
S
 
T
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
E
 
-
T
 
G
P
 
P
E
 
I
G
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
E
M
 
H
A
 
Y
V
 
I
E
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
A
S
x
H
I
 
L
E
 
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
I
G
 
L
D
 
T
P
 
K
R
 
R
E
 
-
P
 
-
L
 
C
R
 
K
E
 
K
I
 
V
S
 
V
Q
 
S
A
 
R
T
 
D
E
 
E
R
 
Y
M
 
L
Y
 
V
A
 
R
A
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
-
A
 
A
T
 
T
G
 
K
G
 
R
E
 
R
T
 
L
L
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
S
E
 
D
N
 
F
F
 
V
F
 
L
V
 
I
G
 
A
R
|
R
P
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
L
 
Y
D
 
E
D
 
E
T
 
C
I
 
I
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
Y
 
A
A
 
R
E
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
V
L
 
G
Y
 
L
A
 
L
P
 
E
G
 
G
I
 
F
R
 
R
T
 
S
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
W
P
 
P
V
 
L
-
 
L
-
 
L
-
x
N
N
 
S
V
 
V
L
x
E
I
x
N
G
 
G
W
 
H
D
 
S
S
 
P
D
 
L
L
 
I
T
 
T
V
 
V
Q
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
K
D
 
A
L
 
M
G
 
G
V
 
F
R
 
R
R
 
I
I
 
M
S
 
I
V
 
F
G
x
S
G
 
F
A
 
A
L
 
T
A
 
L
R
 
A
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
A
 
A
G
 
A
F
 
I
L
 
R
S
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
V
S
 
R
I
 
L
A
 
R
E
 
D
H
 
H
G
 
G

3fa3B Crystal structure of 2,3-dimethylmalate lyase, a pep mutase/isocitrate lyase superfamily member, trigonal crystal form (see paper)
27% identity, 72% coverage: 6:206/278 of query aligns to 3:210/302 of 3fa3B

query
sites
3fa3B
V
 
V
S
 
T
H
 
A
K
 
A
R
 
T
A
 
S
V
 
L
F
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
E
Q
 
N
S
 
P
G
 
D
C
 
S
F
 
F
V
 
I
L
 
V
-
 
A
P
 
P
N
 
G
P
 
V
W
 
Y
D
 
D
A
 
G
G
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
R
V
 
V
L
 
A
A
 
L
A
 
S
M
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
D
A
 
A
L
 
L
A
x
Y
T
 
M
T
|
T
S
x
G
S
x
A
G
 
G
Y
 
T
A
 
A
W
 
A
S
 
S
C
 
V
-
 
H
A
 
G
R
 
Q
A
 
A
D
|
D
G
 
L
Q
 
G
M
 
I
A
 
C
R
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
A
M
 
N
V
 
A
Q
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
I
A
 
S
T
 
P
A
 
S
L
 
T
P
 
P
V
 
V
N
 
I
G
 
A
D
|
D
F
 
A
E
x
D
S
 
T
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
E
 
-
T
 
G
P
 
P
E
 
I
G
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
T
R
 
E
M
 
Q
A
 
Y
V
 
S
E
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
F
S
x
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
V
G
 
Q
D
 
T
P
x
K
R
 
R
-
x
C
-
x
G
-
x
H
-
 
L
-
 
A
-
 
G
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
V
E
 
D
I
 
T
S
 
D
Q
 
T
A
 
Y
T
 
V
E
 
T
R
 
R
M
 
I
Y
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
I
 
R
D
 
Q
A
 
R
T
 
I
G
 
G
G
 
S
E
 
D
T
 
I
L
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
S
F
 
L
F
 
Q
V
 
T
G
 
-
R
 
-
P
 
H
D
 
G
L
 
Y
D
 
E
D
 
E
T
 
S
I
 
V
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
Y
 
A
A
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
V
L
 
G
Y
 
F
A
 
L
P
x
E
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
S
R
 
R
E
 
E
Q
 
M
I
 
A
S
 
R
A
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
Q
A
 
D
V
 
L
A
 
A
P
 
G
K
 
W
P
 
P
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3fa4A Crystal structure of 2,3-dimethylmalate lyase, a pep mutase/isocitrate lyase superfamily member, triclinic crystal form (see paper)
28% identity, 72% coverage: 6:206/278 of query aligns to 3:203/284 of 3fa4A

query
sites
3fa4A
V
 
V
S
 
T
H
 
A
K
 
A
R
 
T
A
 
S
V
 
L
F
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
E
Q
 
N
S
 
P
G
 
D
C
 
S
F
 
F
V
 
I
L
 
V
-
 
A
P
 
P
N
 
G
P
 
V
W
 
Y
D
 
D
A
 
G
G
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
R
V
 
V
L
 
A
A
 
L
A
 
S
M
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
D
A
 
A
L
 
L
A
x
Y
T
 
M
T
|
T
S
x
G
S
x
A
G
 
G
Y
 
T
A
 
A
W
 
A
S
 
S
C
 
V
-
 
H
A
 
G
R
 
Q
A
 
A
D
|
D
G
 
L
Q
 
G
M
 
I
A
 
C
R
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
D
M
 
M
R
 
R
G
 
A
M
 
N
V
 
A
Q
 
E
-
 
M
-
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
I
A
 
S
T
 
P
A
 
S
L
 
T
P
 
P
V
 
V
N
 
I
G
 
A
D
|
D
F
 
A
E
x
D
S
 
T
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
E
 
-
T
 
G
P
 
P
E
 
I
G
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
T
R
 
E
M
 
Q
A
 
Y
V
 
S
E
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
F
S
x
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
Q
-
 
V
-
 
Q
T
 
T
G
 
G
D
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
V
E
 
D
I
 
T
S
 
D
Q
 
T
A
 
Y
T
 
V
E
 
T
R
 
R
M
 
I
Y
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
A
 
A
I
 
R
D
 
Q
A
 
R
T
 
I
G
 
G
G
 
S
E
 
D
T
 
I
L
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
S
F
 
L
F
 
Q
V
 
T
G
 
H
R
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
Y
D
 
E
D
 
E
T
 
S
I
 
V
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
Y
 
A
A
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
V
L
 
G
Y
 
F
A
 
L
P
x
E
G
 
G
I
 
I
R
 
T
T
 
S
R
 
R
E
 
E
Q
 
M
I
 
A
S
 
R
A
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
Q
A
 
D
V
 
L
A
 
A
P
 
G
K
 
W
P
 
P
V
 
L

Sites not aligning to the query:

Q56062 2-methylisocitrate lyase; 2-MIC; MICL; (2R,3S)-2-methylisocitrate lyase; EC 4.1.3.30 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
31% identity, 45% coverage: 65:188/278 of query aligns to 65:190/295 of Q56062

query
sites
Q56062
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
T
H
 
D
M
 
I
R
 
R
G
 
R
M
 
I
V
 
T
Q
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
L
N
 
L
G
 
V
D
|
D
F
 
A
E
 
D
S
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
S
P
 
A
E
 
F
G
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
K
M
 
S
A
 
I
V
 
A
E
 
K
T
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
L
S
 
H
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
V
G
 
G
D
 
A
P
x
K
R
|
R
-
x
C
-
 
G
-
x
H
E
 
R
P
 
P
L
 
N
R
 
K
E
 
A
I
 
I
S
 
V
Q
 
S
A
 
K
T
 
E
E
 
E
R
 
M
M
 
V
Y
 
D
A
 
R
A
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
-
 
R
T
 
T
G
 
D
G
 
P
E
 
N
T
 
F
L
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
A
F
 
L
F
 
A
V
 
V
G
 
-
R
 
-
P
 
E
D
 
G
L
 
L
D
 
E
D
 
A
T
 
A
I
 
L
Q
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
M
L
 
L
Y
 
F
A
 
P
P
 
E
G
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3m0jA Structure of oxaloacetate acetylhydrolase in complex with the inhibitor 3,3-difluorooxalacetate (see paper)
27% identity, 84% coverage: 22:254/278 of query aligns to 21:263/297 of 3m0jA

query
sites
3m0jA
F
 
I
V
 
V
L
 
C
P
 
P
N
 
G
P
 
V
W
 
Y
D
 
D
A
 
G
G
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
R
V
 
T
L
 
A
A
 
M
A
 
E
M
 
L
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
x
Y
T
 
M
T
|
T
S
x
G
S
x
A
G
 
G
Y
 
T
A
 
T
W
 
A
S
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
D
C
 
L
A
 
A
R
 
I
A
 
A
D
 
Q
G
 
L
Q
 
H
M
 
D
A
 
M
R
 
R
D
 
D
A
 
N
V
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
D
M
 
M
R
 
I
G
 
A
M
 
N
V
 
L
Q
 
D
A
 
P
T
 
F
A
 
G
L
 
P
P
 
P
V
 
L
N
 
I
G
 
A
D
|
D
F
 
M
E
 
D
S
 
T
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
E
 
-
T
 
G
P
 
P
E
 
I
G
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
E
M
 
H
A
 
Y
V
 
I
E
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
A
S
x
H
I
 
L
E
 
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
I
G
 
L
D
 
T
P
 
K
R
 
R
-
x
C
-
x
G
-
 
H
E
 
L
P
 
S
L
 
G
R
 
K
E
 
K
I
 
V
S
 
V
Q
 
S
A
 
R
T
 
D
E
 
E
R
 
Y
M
 
L
Y
 
V
A
 
R
A
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
-
A
 
A
T
 
T
G
 
K
G
 
R
E
 
R
T
 
L
L
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
S
E
 
D
N
 
F
F
 
V
F
 
L
V
 
I
G
 
A
R
|
R
P
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
L
 
Y
D
 
E
D
 
E
T
 
C
I
 
I
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
Y
 
A
A
 
R
E
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
V
L
 
G
Y
 
L
A
 
L
P
x
E
G
 
G
I
 
F
R
 
R
T
 
S
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
W
P
 
P
V
 
L
-
 
L
-
 
L
-
x
N
N
 
S
V
|
V
L
x
E
I
x
N
G
 
G
W
 
H
D
 
S
S
 
P
D
 
L
L
 
I
T
 
T
V
 
V
Q
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
K
D
 
A
L
 
M
G
 
G
V
 
F
R
 
R
R
 
I
I
 
M
S
 
I
V
 
F
G
x
S
G
x
F
A
 
A
L
 
T
A
 
L
R
 
A
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
A
 
A
G
 
A
F
 
I
L
 
R
S
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
V
S
 
R
I
 
L
A
 
R
E
 
D
H
 
H
G
 
G

P96074 Fosfomycin biosynthesis bifunctional protein Fom1; EC 2.7.7.104; EC 5.4.2.9 from Streptomyces wedmorensis (see paper)
24% identity, 68% coverage: 68:255/278 of query aligns to 216:412/435 of P96074

query
sites
P96074
L
 
L
A
 
Q
H
 
M
M
 
V
R
 
N
G
 
E
M
 
L
V
 
F
Q
 
E
A
 
V
T
 
T
A
 
T
L
 
K
P
 
P
V
 
L
N
 
V
G
 
F
D
 
D
F
 
G
E
 
D
S
 
T
G
 
G
F
 
-
A
 
-
E
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
G
 
H
V
 
F
A
 
G
E
 
F
S
 
T
V
 
V
R
 
R
M
 
S
A
 
L
V
 
E
E
 
R
T
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
S
G
 
A
I
 
V
S
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
D
S
 
K
T
 
E
G
 
G
D
 
L
P
 
K
R
 
R
E
 
N
P
 
S
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
Q
R
 
S
E
 
S
I
 
V
S
 
E
Q
 
D
A
 
F
T
 
S
E
 
E
R
 
R
M
 
I
Y
 
R
A
 
I
A
 
G
R
 
K
E
 
R
A
 
A
I
 
-
D
 
-
A
 
Q
T
 
I
G
 
T
G
 
D
E
 
D
T
 
F
L
 
M
L
 
V
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
I
E
 
E
N
 
S
F
 
L
F
 
I
V
 
L
G
 
E
R
 
K
P
 
-
D
 
G
L
 
M
D
 
A
D
 
D
T
 
A
I
 
V
Q
 
H
R
 
R
L
 
A
Q
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
G
L
 
I
Y
 
M
A
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
R
 
H
T
 
S
R
 
R
E
 
Q
Q
 
S
I
 
D
S
 
P
A
 
A
V
 
E
V
 
I
A
 
F
A
 
E
V
 
F
A
 
C
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
D
-
 
K
-
 
L
P
 
P
K
 
R
P
 
R
V
 
V
N
 
P
V
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
V
W
 
P
D
 
T
S
 
S
D
 
Y
L
 
S
T
 
S
V
 
V
Q
 
R
D
 
E
-
 
S
-
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
N
R
 
M
I
 
V
S
 
I
V
 
Y
G
 
A
G
 
N
A
 
H
L
 
L
A
 
M
R
 
R
A
 
A
A
 
V
W
 
Y
A
 
P
G
 
Q
F
 
V
L
 
T
S
 
K
A
 
V
A
 
V
R
 
Q
S
 
S
I
 
I
A
 
L
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q9HUU1 Oxaloacetate decarboxylase; EC 4.1.1.112 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
29% identity, 84% coverage: 1:234/278 of query aligns to 1:236/287 of Q9HUU1

query
sites
Q9HUU1
M
 
M
I
 
H
D
 
R
S
 
A
S
 
S
V
 
H
S
 
H
H
 
E
K
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
M
F
 
F
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
L
Q
 
D
S
 
S
G
 
S
-
 
R
C
 
C
F
 
Y
V
 
H
L
 
T
P
 
A
N
 
S
P
 
V
W
 
F
D
 
D
A
 
P
G
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
R
V
 
I
L
 
A
A
 
A
A
 
D
M
 
L
G
 
G
F
 
F
K
 
E
A
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
S
 
C
S
 
G
G
 
I
Y
 
L
A
 
G
W
 
G
S
 
S
C
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
L
D
 
Q
G
 
V
Q
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
P
D
 
D
A
 
F
V
 
A
L
 
L
A
 
I
H
 
T
M
 
L
R
 
S
G
 
E
M
 
F
V
 
V
-
 
E
Q
 
Q
A
 
A
T
 
T
A
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
I
G
 
A
D
|
D
F
 
A
E
 
D
S
 
H
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
E
 
N
T
 
A
P
 
L
E
 
-
G
 
N
V
 
V
A
 
M
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
V
M
 
E
A
 
L
V
 
E
E
 
R
T
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
A
I
 
L
S
 
T
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
T
T
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
F
G
 
G
D
 
R
P
 
K
R
 
S
E
 
T
P
 
D
L
 
L
R
 
I
E
 
C
I
 
V
S
 
E
Q
 
E
A
 
G
T
 
V
E
 
G
R
 
K
M
 
I
Y
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
A
 
A
-
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
P
T
 
A
G
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
L
L
 
T
L
 
I
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
T
E
 
N
N
 
A
F
 
E
F
 
L
V
 
I
G
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
L
 
V
D
 
D
D
 
A
T
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
Q
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
G
L
 
I
Y
 
C
A
 
L
P
 
V
G
 
G
I
 
V
R
 
R
T
 
D
R
 
F
E
 
A
Q
 
H
I
 
L
S
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
A
A
 
E
A
 
H
V
 
L
A
 
H
P
 
I
K
 
P
P
 
L
V
 
M
N
 
L
V
 
V
L
 
T
I
x
Y
G
 
G
W
 
N
D
 
P
S
 
Q
D
 
L
L
 
R
T
 
D
V
 
D
Q
 
A
D
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
V
I
 
V
S
 
V
V
 
N
G
 
G
G
x
H
A
 
A

3b8iA Crystal structure of oxaloacetate decarboxylase from pseudomonas aeruginosa (pa4872) in complex with oxalate and mg2+. (see paper)
29% identity, 81% coverage: 10:234/278 of query aligns to 8:234/284 of 3b8iA

query
sites
3b8iA
R
 
R
A
 
A
V
 
M
F
 
F
R
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
L
Q
 
D
S
 
S
G
 
S
-
 
R
C
 
C
F
 
Y
V
 
H
L
 
T
P
 
A
N
 
S
P
 
V
W
 
F
D
 
D
A
 
P
G
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
R
V
 
I
L
 
A
A
 
A
A
 
D
M
 
L
G
 
G
F
 
F
K
 
E
A
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
S
 
C
S
 
G
G
x
I
Y
 
L
A
x
G
W
x
G
S
|
S
C
 
V
A
 
A
R
 
S
A
 
L
D
 
Q
G
 
V
Q
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
P
D
|
D
A
 
F
V
 
A
L
 
L
A
 
I
H
 
T
M
 
L
R
 
S
G
 
E
M
 
F
V
 
V
-
 
E
Q
 
Q
A
 
A
T
 
T
A
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
I
G
 
A
D
|
D
F
 
A
E
x
D
S
 
H
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
E
 
N
T
 
A
P
 
L
E
 
-
G
 
N
V
 
V
A
 
M
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
V
M
 
E
A
 
L
V
 
E
E
 
R
T
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
A
I
 
L
S
x
T
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
T
T
 
L
-
 
L
-
 
P
-
x
A
-
 
Q
-
x
F
G
|
G
D
 
R
P
 
K
R
 
S
E
 
T
P
 
D
L
 
L
R
 
I
E
 
C
I
 
V
S
 
E
Q
 
E
A
 
G
T
 
V
E
 
G
R
 
K
M
 
I
Y
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
A
 
A
-
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
P
T
 
A
G
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
L
L
 
T
L
 
I
I
 
I
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
N
N
 
A
F
 
E
F
 
L
V
 
I
G
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
L
 
V
D
 
D
D
 
A
T
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
L
 
T
Q
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
G
L
 
I
Y
 
C
A
 
L
P
x
V
G
 
G
I
 
V
R
 
R
T
 
D
R
 
F
E
 
A
Q
 
H
I
 
L
S
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
A
A
 
E
A
 
H
V
 
L
A
 
H
P
 
I
K
 
P
P
 
L
V
x
M
N
 
L
V
 
V
L
 
T
I
x
Y
G
 
G
W
 
N
D
 
P
S
 
Q
D
 
L
L
 
R
T
 
D
V
 
D
Q
 
A
D
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
V
I
 
V
S
 
V
V
 
N
G
 
G
G
x
H
A
 
A

6t4vC Crystal structure of 2-methylisocitrate lyase (prpb) from pseudomonas aeruginosa in apo form.
29% identity, 60% coverage: 40:206/278 of query aligns to 36:194/277 of 6t4vC

query
sites
6t4vC
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
I
A
x
Y
T
 
L
T
x
S
S
x
G
S
x
G
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
W
 
A
-
 
G
S
 
S
C
 
L
A
 
G
R
 
L
A
 
P
D
|
D
-
 
L
G
 
G
Q
x
I
M
 
S
A
x
G
R
x
L
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
T
H
 
D
M
 
V
R
 
R
G
 
R
M
 
I
V
 
T
Q
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
N
 
L
G
 
V
D
|
D
F
 
V
E
x
D
S
 
T
G
 
G
F
|
F
A
 
G
E
 
S
T
 
S
P
 
A
E
 
F
G
x
N
V
 
V
A
 
A
E
x
R
S
 
T
V
 
V
R
 
K
M
 
S
A
 
M
V
 
I
E
 
K
T
 
F
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
M
S
x
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
V
G
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
E
I
 
I
S
 
V
Q
 
S
A
 
Q
T
 
Q
E
 
E
R
 
M
M
 
V
Y
 
D
A
 
R
A
 
I
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
T
 
R
G
 
S
G
 
D
E
 
D
T
 
S
L
 
F
L
 
V
I
 
I
-
 
M
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
A
F
 
L
F
 
A
V
 
V
G
 
-
R
 
-
P
 
E
D
 
G
L
 
L
D
 
Q
D
 
A
T
 
A
I
 
I
Q
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
C
A
 
A
Y
 
C
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
M
L
 
I
Y
 
F
A
 
-
P
 
P
G
x
E
I
 
A
R
 
M
T
 
T
R
 
E
E
 
L
Q
 
A
I
 
M
S
 
Y
A
 
K
V
 
E
V
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
V
P
 
K
K
 
V
P
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6t5mD Crystal structure of 2-methylisocitrate lyase (prpb) from pseudomonas aeruginosa in complex with mg(ii)-pyruvate.
29% identity, 60% coverage: 40:206/278 of query aligns to 35:193/276 of 6t5mD

query
sites
6t5mD
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
I
A
x
Y
T
 
L
T
x
S
S
x
G
S
x
G
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
W
 
A
-
 
G
S
 
S
C
 
L
A
 
G
R
 
L
A
 
P
D
|
D
-
 
L
G
 
G
Q
 
I
M
 
S
A
 
G
R
 
L
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
T
H
 
D
M
 
V
R
 
R
G
 
R
M
 
I
V
 
T
Q
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
N
 
L
G
 
V
D
|
D
F
 
V
E
x
D
S
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
S
P
 
A
E
 
F
G
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
K
M
 
S
A
 
M
V
 
I
E
 
K
T
 
F
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
M
S
x
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
V
G
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
E
I
 
I
S
 
V
Q
 
S
A
 
Q
T
 
Q
E
 
E
R
 
M
M
 
V
Y
 
D
A
 
R
A
 
I
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
T
 
R
G
 
S
G
 
D
E
 
D
T
 
S
L
 
F
L
 
V
I
 
I
-
 
M
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
A
F
 
L
F
 
A
V
 
V
G
 
-
R
 
-
P
 
E
D
 
G
L
 
L
D
 
Q
D
 
A
T
 
A
I
 
I
Q
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
C
A
 
A
Y
 
C
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
M
L
 
I
Y
 
F
A
 
-
P
 
P
G
x
E
I
 
A
R
 
M
T
 
T
R
 
E
E
 
L
Q
 
A
I
 
M
S
 
Y
A
 
K
V
 
E
V
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
V
P
 
K
K
 
V
P
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1o5qA Crystal structure of pyruvate and mg2+ bound 2- methylisocitrate lyase (prpb) from salmonella typhimurium (see paper)
30% identity, 45% coverage: 65:188/278 of query aligns to 61:175/271 of 1o5qA

query
sites
1o5qA
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
T
H
 
D
M
 
I
R
 
R
G
 
R
M
 
I
V
 
T
Q
 
D
A
 
V
T
 
C
A
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
L
N
 
L
G
 
V
D
|
D
F
 
A
E
x
D
S
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
S
P
 
A
E
 
F
G
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
K
M
 
S
A
 
I
V
 
A
E
 
K
T
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
L
S
x
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
S
 
Q
T
 
V
G
 
A
D
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
I
 
I
S
 
V
Q
 
S
A
 
K
T
 
E
E
 
E
R
 
M
M
 
V
Y
 
D
A
 
R
A
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
-
 
R
T
 
T
G
 
D
G
 
P
E
 
N
T
 
F
L
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
A
R
|
R
A
 
T
E
 
D
N
 
A
F
 
L
F
 
A
V
 
V
G
 
-
R
 
-
P
 
E
D
 
G
L
 
L
D
 
E
D
 
A
T
 
A
I
 
L
Q
 
D
R
 
R
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
M
L
 
L
Y
 
F
A
 
P
P
x
E
G
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF2519 FitnessBrowser__psRCH2:GFF2519
MIDSSVSHKRAVFRALHQSGCFVLPNPWDAGSAAVLAAMGFKALATTSSGYAWSCARADG
QMARDAVLAHMRGMVQATALPVNGDFESGFAETPEGVAESVRMAVETGIAGISIEDSTGD
PREPLREISQATERMYAAREAIDATGGETLLIGRAENFFVGRPDLDDTIQRLQAYAEAGA
DCLYAPGIRTREQISAVVAAVAPKPVNVLIGWDSDLTVQDLADLGVRRISVGGALARAAW
AGFLSAARSIAEHGRFDGFSNAASGAELDALFGKLEKP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory